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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3071_high_9 (Length: 381)
Name: NF3071_high_9
Description: NF3071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3071_high_9 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35488483 - 35488189
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
35488483 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
35488384 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
35488383 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
35488284 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35488283 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
35488189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 11329770 - 11330064
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11329770 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
11329869 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
11329870 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
11329969 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
11329970 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
11330064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 45045403 - 45045697
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
45045403 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
45045502 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
45045503 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaa |
45045602 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45045603 |
ataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacaccc |
45045697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Original strand, 40212666 - 40212963
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212666 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataga |
40212765 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
40212766 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccccgga |
40212865 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212866 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgcgaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
40212963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45265342 - 45265049
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265342 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
45265243 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
45265242 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaa |
45265143 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265142 |
ataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
45265049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27214149 - 27213855
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27214149 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaacagggattataatagg |
27214050 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27214049 |
taaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
27213950 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27213949 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
27213855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8419883 - 8419589
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419883 |
aatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
8419784 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8419783 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctggga |
8419684 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419683 |
ataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
8419589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 27248070 - 27248364
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248070 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataatagg |
27248169 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27248170 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagtaacattttatacctggga |
27248269 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248270 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
27248364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 43949022 - 43949315
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949022 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
43949121 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43949122 |
taaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactaagga |
43949221 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949222 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
43949315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 39553959 - 39554254
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa-tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39553959 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaaatatttttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
39554058 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39554059 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaagg |
39554158 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39554159 |
aataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39554254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 25097846 - 25098140
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25097846 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataatagg |
25097945 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
25097946 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaa |
25098045 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25098046 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatgggcatatacattcctatcattttattcccgaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
25098140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 33378611 - 33378913
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33378611 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
33378710 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaa--------cattttat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
33378711 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttat |
33378810 |
T |
 |
| Q |
209 |
acccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33378811 |
acccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
33378910 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccc |
311 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
33378911 |
ccc |
33378913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 44565822 - 44566123
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
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44565921 |
T |
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117 |
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216 |
Q |
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| T |
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T |
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316 |
Q |
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44566121 |
T |
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at |
318 |
Q |
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44566122 |
at |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27419518 - 27419224
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17 |
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116 |
Q |
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T |
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216 |
Q |
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| T |
27419418 |
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27419319 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
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|
|
| T |
27419318 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcagcaattataacttgaaacaaacacaccc |
27419224 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 48341141 - 48341430
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116 |
Q |
| |
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| T |
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48341239 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
48341240 |
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48341338 |
T |
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217 |
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308 |
Q |
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| T |
48341339 |
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48341430 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25924931 - 25924637
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17 |
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116 |
Q |
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T |
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117 |
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216 |
Q |
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| T |
25924831 |
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25924732 |
T |
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217 |
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311 |
Q |
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25924731 |
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25924637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 48313899 - 48314193
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
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aatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataatagg |
48313998 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
48313999 |
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48314098 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
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48314193 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41632658 - 41632365
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17 |
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116 |
Q |
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| T |
41632658 |
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41632559 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
41632558 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcctaagaacattttataccaagga |
41632459 |
T |
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| Q |
217 |
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310 |
Q |
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| T |
41632458 |
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41632365 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9947285 - 9946990
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| Q |
17 |
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
9947185 |
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9947086 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
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| T |
9947085 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataactttaaacaaacacaccc |
9946990 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34930761 - 34930466
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| Q |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
34930661 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
34930562 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaac-aaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataac-ttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
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| T |
34930561 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaaacataggcatatacatttctatcattttattcccaggaatcaacaattataactttgaaacaaacacacc |
34930466 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 38543971 - 38544266
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| Q |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
38543971 |
aatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
38544070 |
T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
38544071 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgagaaattttttctattcccagaaacattttatacccggga |
38544170 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
312 |
Q |
| |
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|
| T |
38544171 |
ataaaatttagtaaacctgtaataaacataggcatatacattcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
38544266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 45448719 - 45449009
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116 |
Q |
| |
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| T |
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aatataaagatgggaattttattctaaagaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataga |
45448818 |
T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
45448819 |
taaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
45448918 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
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| T |
45448919 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatctacattcctatcattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaacac |
45449009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9814508 - 9814218
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
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taaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
9814309 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
9814308 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaaca----catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38396654 - 38396370
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23 |
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122 |
Q |
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38396555 |
T |
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123 |
atttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaa |
222 |
Q |
| |
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| T |
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atttatgaatttattcccatctccgtgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaa |
38396455 |
T |
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| Q |
223 |
tttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
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| T |
38396454 |
tttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttggaacaaacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 44820031 - 44820323
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aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggactataatagg |
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T |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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44820131 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctgttccgaggaacattttataccaagga |
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T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
||||| |||| | ||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44820231 |
ataaattttaataaacatgtaacaaacacatacaaatacatttctatcattttattcctgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
44820323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28904480 - 28904186
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28904480 |
aatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataatagg |
28904381 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28904380 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttataaatttttttctattcccagaaacattttataccaagga |
28904281 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28904280 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacaccc |
28904186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 72 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16825593 - 16825354
Alignment:
| Q |
72 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactctttt |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16825593 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
16825494 |
T |
 |
| Q |
172 |
ccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16825493 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
16825394 |
T |
 |
| Q |
272 |
tcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825393 |
tcctaggaattaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
16825354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48160867 - 48160591
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160867 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
48160768 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
48160767 |
taaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttcctt-ggaaattttttctctt-----------------cccagga |
48160686 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160685 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
48160591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30686285 - 30685993
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
30686285 |
aatataaagatgaaaattttattgcaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagcgattataataag |
30686186 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
30686185 |
taa-ctatttatgaatttattcccatctccctaggaactttattcccacctttttccttggaattttttttctattcccatgaacattttatacccggga |
30686087 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30686086 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttattccaacgaatctacaattataacttgaaacaaacacacc |
30685993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37534396 - 37534105
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37534396 |
aatataaagatgagaattttatttcaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcttaggaactataataatagggattataataag |
37534297 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |
|
|
| T |
37534296 |
taa-ctatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccataaatattttatacccggaa |
37534198 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37534197 |
ataaaagttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttatttccaggaatctacaattataacatgaaacaaacacac |
37534105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 18823939 - 18824217
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18823939 |
aatataaagatgagaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattc---------------atagggattataatagg |
18824023 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18824024 |
taat-tatttatgaatttattcccatctccat-ggaactttattcccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaaaaacattttatacccggga |
18824121 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatataca-ttcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18824122 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatatattttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatacaacttgaaacaaacacaccc |
18824217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045618
Alignment:
| Q |
89 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttc |
188 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
25045838 |
gaaccatgaaaatatggattataatatgtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttacgaaaatttttc |
25045740 |
T |
 |
| Q |
189 |
tattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaat |
288 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25045739 |
tattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatatattcctatcttttta-tccccagaatcaacaaa |
25045641 |
T |
 |
| Q |
289 |
tataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25045640 |
tataacttgaaacaaacacaccc |
25045618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6656764 - 6656476
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6656764 |
aatagaaatatgagaattttattccaaggtatttggaaaaaatatgttttgttaactttataatatttctaagaaccaaaaaaatatagattataatagg |
6656665 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | | |
|
|
| T |
6656664 |
t-aactatttatgactttattcccatctccatgggaactttattcccatatttttcattgggaaaacttttctattcccagaaacattttatactc-gaa |
6656567 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656566 |
aataaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcatatca-tttatttccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
6656476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41684278 - 41684022
Alignment:
| Q |
54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
41684278 |
aaaaatatgtttggttaattttataatatttataggaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctacatataaatttattttcatctccatgagaa |
41684180 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatat |
253 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41684179 |
ctttattcccactcttttctttgggcaaaattttctattcccaagaacatcttatatccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatat |
41684080 |
T |
 |
| Q |
254 |
acattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41684079 |
atatttctatcatattattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
41684022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 11000483 - 11000774
Alignment:
| Q |
26 |
atgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaa-------ccataaaaatagggattataataggta |
118 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11000483 |
atggaaattttattccaagatatttaagaaaa-tatgttaggttaactttataatattcctaagaagtaagaaccataaaaatagggattataataggcg |
11000581 |
T |
 |
| Q |
119 |
aactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaat |
218 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11000582 |
a-cttcatatgaatttattctcatatgcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaaatttttctattcccaagaatattttatacccgggaat |
11000680 |
T |
 |
| Q |
219 |
aaaatttagtgaacttgtaacaaacataggc-atatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11000681 |
aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggctatatatatttatatcattttatttccaggaatcaacatatataacttgaaacaaacacaccc |
11000774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Original strand, 45722964 - 45723170
Alignment:
| Q |
54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||| |||| |
|
|
| T |
45722964 |
aaaaatatgtttaattaactttataatattcctagaaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctatttatgaatttatttctattttcatgggaa |
45723062 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatat |
253 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
45723063 |
ctttattcccaccatttttcttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataggcatat |
45723162 |
T |
 |
| Q |
254 |
acattcct |
261 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
| T |
45723163 |
atattcct |
45723170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 45440700 - 45440982
Alignment:
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31 |
aattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatga |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
45440700 |
aattttattccaagatatttaa-aaaaagatgtttgattaacattataatattccaagtaaccttaaaactagggattataataggtaat-tatacatga |
45440797 |
T |
 |
| Q |
131 |
atttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtga |
230 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |
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|
| T |
45440798 |
tttttttcccatctccatgagaactttattcccactactttctttgggaaaatttttatattccgaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaa |
45440897 |
T |
 |
| Q |
231 |
acttgtaacaaacataggcatata-cattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45440898 |
acttgtaacaaacatatgcatgtatgttttttatgattttattcccaagaatctacaattataacttgaaacaaacacacccata |
45440982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31922005 - 31921811
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30 |
gaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatg |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31922005 |
gaattttattccaaggtatttagaaaaaatatgtatggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagacattataatagg---actatatatg |
31921909 |
T |
 |
| Q |
130 |
aatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttag |
227 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31921908 |
aatttattctcatctctatgggaactttattcccacccttttctttggaaatttttttctattcccacaaacattttatactcaggaataaaatttag |
31921811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6656457 - 6656226
Alignment:
| Q |
76 |
ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcctt |
175 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || |
|
|
| T |
6656457 |
ataatattcttaggaaccaaaaaaatacagattataataggtaa-ctatttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttatt |
6656359 |
T |
 |
| Q |
176 |
gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
6656358 |
gggaaaacttttctatttccagaaatattttatactcgaaaataaa-tttagtaaacttataacaaacataggtatatatattcatatcattttatttcc |
6656260 |
T |
 |
| Q |
276 |
gagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656259 |
aaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
6656226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5543421 - 5543126
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5543421 |
ataaagatgagaattttattc-aaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataatgttcccgggaaccataaaaatatggattataataggtaa |
5543323 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcctt-gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaat |
218 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
5543322 |
t-tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcccactatttttctttgggaaaaaatttctattcccaagaaagttttatacgagagaat |
5543224 |
T |
 |
| Q |
219 |
aaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccatataa |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
5543223 |
aaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtatatttatatcgttttattcccaagaatctacgaaaataacttg-aacaaacgcacccttataa |
5543126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43446175 - 43445890
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
43446175 |
aatataaagataggaattttattttaaggtatttag-aaaaatatgtttggttaacattataatattctaaagaacattaaagataggaaatataatagg |
43446077 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| || || | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
43446076 |
taat-tacacataattttattctcatctccatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaacttttttattctcatgaacattttatattcgaga |
43445978 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaa |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445977 |
ataaaatttagtaaacttataacaaatataggcatatacatttttataattttattcgcaagaatctataaatataacttgaaacaaa |
43445890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40385921 - 40385692
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40385921 |
aatataaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaagatatttggttaacattataatattcctaagaaccataaaaatatggattataatagg |
40385822 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttt-tccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
| | || |||| |||||| |||||| || |||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40385821 |
t-agttacacatgagtttatttccatcttaatgggaactttattcccaccatttctttttgggatattttttctattcccagaaacattttatagacagg |
40385723 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40385722 |
aataaaattcagtaaacttctaacaaacata |
40385692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38528961 - 38528713
Alignment:
| Q |
54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
38528961 |
aaaaaaatgtttggttaacattataatattctgagaaactttaaaaatagggattataatatgcaat-tacacataaatttattctcatcttcatgagaa |
38528863 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatat |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38528862 |
ctttattctcacctttttctttg--atatttattctattcccaataacattttatacccaagaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataagcatat |
38528765 |
T |
 |
| Q |
254 |
acattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
|
| ||| ||| |||||||| | | ||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38528764 |
atatt--tatgattttattttcaaaaatatataaatataacttgaaacaaacac |
38528713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22156472 - 22156248
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
22156472 |
aatataaagataagaattttattctaaggtatatagaaaaaa-atgtttgtttaacagtataatattcacgagaaccataaaaatatggattataatatg |
22156374 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaatttttt-ctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
||| || |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |
|
|
| T |
22156373 |
taat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaatttttttctattcccaggaacgttttatacgcggg |
22156275 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaa |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22156274 |
attaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22156248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22212387 - 22212163
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
22212387 |
aatataaagataagaattttattctaaggtatatagaaaaaa-atgtttgtttaacagtataatattcacgagaaccataaaaatatggattataatatg |
22212289 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaatttttt-ctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
||| || |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |
|
|
| T |
22212288 |
taat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaatttttttctattcccaggaacgttttatacgcggg |
22212190 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaa |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22212189 |
attaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22212163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47246357 - 47246061
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat-atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||| | | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47246357 |
aatataaa-atgtgaattttattcaaaagtatttagaaaaaaagatgtttggtcaacattataatactcctag--accttaaaaatagggattataatag |
47246261 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| || | ||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47246260 |
atagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttcttttaaaaaaaatt-caattcctaagaacattttatacctgag |
47246162 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcc--tatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccat |
313 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47246161 |
aataaaattcagtaaacttgtaacaaacatagaaatatatatttctatatcattttatttctaagaatctacaaatataatttgaaacaaacgcacccat |
47246062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43569966 - 43569773
Alignment:
| Q |
31 |
aattttattccaaggaatttaggaaaaatat--gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttat |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
43569966 |
aattttattctaaggtatttaacaaaaatatatgtttgattaactttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagat-aattatttat |
43569868 |
T |
 |
| Q |
129 |
gaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaat |
223 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| ||||| ||| || || ||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43569867 |
gaatttatttacatcctcatgtgaattttattcccaccctttttcttaggtaaatttttatatttcgaagaatattttatacccgggaataaaat |
43569773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10902779 - 10902689
Alignment:
| Q |
182 |
ttttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10902779 |
ttttttctattcccaaaaacattttatatccaaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt |
10902689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 310
Target Start/End: Original strand, 45723211 - 45723277
Alignment:
| Q |
244 |
ataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45723211 |
ataggcatatatattcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
45723277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10902965 - 10902822
Alignment:
| Q |
18 |
atataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggt |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
10902965 |
atataaagatgtgaattttagcccaaggtatttatgaaaaagatgtttggttaacattataatattcattggaaccttaaaaatatgaatcataataggc |
10902866 |
T |
 |
| Q |
118 |
aaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattc |
161 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10902865 |
agtttacacatgaatttattctcatcttcatgtgaactttattc |
10902822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Original strand, 31598500 - 31598598
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31598500 |
aatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgtttgtttaacattataatatacctgggaatcataaaaataggatttataatag |
31598598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31921813 - 31921748
Alignment:
| Q |
245 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31921813 |
taggcatatatatttctatcattttatttccga-aatgaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
31921748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttgg-ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
114 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17276453 |
aatatatagatgtaaattttattccaagatatttagaaaaaagatgtttggtttaacattataatattccaagaaaccttaaaaataaggattacaata |
17276355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Original strand, 19156613 - 19156685
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| Q |
236 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19156613 |
taacaaacattggaatgtacatttctatcattttattcttgaaaatatacaaatataacttgaaacaaacaca |
19156685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Original strand, 20756012 - 20756084
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| Q |
236 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20756012 |
taacaaacattggaatgtacatttctatcattttattcttgaaaatatacaaatataacttgaaacaaacaca |
20756084 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
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202 |
attttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcc |
274 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||| | || || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20601283 |
attttacacctagaaataaaatttaataaatttataacaaacattagaatgtacattcctatcattttattcc |
20601355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 35999467 - 35999761
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
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35999566 |
T |
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117 |
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35999666 |
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311 |
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35999761 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27763193 - 27762896
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
27763193 |
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27763094 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
27763093 |
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27762994 |
T |
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| Q |
217 |
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314 |
Q |
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| T |
27762993 |
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27762896 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13230283 - 13229989
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
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13230184 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
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13230084 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
13230083 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
13229989 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48519185 - 48518890
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
48519085 |
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48518986 |
T |
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| Q |
217 |
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312 |
Q |
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| T |
48518985 |
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48518890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 45596049 - 45596343
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
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45596148 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
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| T |
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45596248 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
45596249 |
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45596343 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 48879106 - 48879400
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
48879106 |
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48879205 |
T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
48879206 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
48879305 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
48879306 |
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48879400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 25932222 - 25932516
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
25932222 |
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25932321 |
T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
25932322 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
25932421 |
T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
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| T |
25932422 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
25932516 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 40435681 - 40435975
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
40435681 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatagg |
40435780 |
T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
40435781 |
taaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
40435880 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
40435881 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
40435975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 43723045 - 43723339
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
43723045 |
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43723144 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
43723145 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
43723244 |
T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
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| T |
43723245 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
43723339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 42773731 - 42774023
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| Q |
19 |
tataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
118 |
Q |
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| T |
42773731 |
tataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
42773830 |
T |
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| Q |
119 |
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218 |
Q |
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42773831 |
aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttttatccccaggaacattttatacccgggaat |
42773930 |
T |
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| Q |
219 |
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311 |
Q |
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| T |
42773931 |
aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
42774023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39730587 - 39730293
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
39730587 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataatagg |
39730488 |
T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
39730487 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
39730388 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
39730387 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
39730293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34049891 - 34049594
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
34049891 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataatagg |
34049792 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
34049791 |
aaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccctgga |
34049692 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
314 |
Q |
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| T |
34049691 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
34049594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45748089 - 45747796
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
45748089 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataat-gg |
45747991 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
45747990 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccccccttttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccggga |
45747891 |
T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Q |
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| T |
45747890 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
45747796 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55968294 - 55968000
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116 |
Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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|
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| T |
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55968095 |
T |
 |
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217 |
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311 |
Q |
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55968094 |
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55968000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 23686568 - 23686867
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17 |
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116 |
Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagttttataatattcctaggaaccataaaaatatgaattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
23686668 |
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T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccatata |
316 |
Q |
| |
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ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccttata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6280215 - 6279921
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Q |
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aatataaaaataggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatatttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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taaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
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T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41859340 - 41859047
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Q |
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T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
41859240 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaat-ttttctattcccaggaacattttatacctggga |
41859142 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
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ataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41744515 - 41744222
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Q |
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T |
 |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacc-cagg |
215 |
Q |
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41744415 |
taaactaattatgaatttattctcatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaaga |
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T |
 |
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309 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18405527 - 18405234
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Q |
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T |
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcacccttttcctt-ggaaattttttttattcccaggaacattttataccaagga |
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T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
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ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctataattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
18405234 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39835601 - 39835307
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Q |
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T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 32953304 - 32953599
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T |
 |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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aaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgaga |
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T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
312 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50673198 - 50672908
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|
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T |
 |
| Q |
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgaga |
50673000 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 47670143 - 47670436
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 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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taaactatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
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T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
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| T |
47670343 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttatttccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 935907 - 936201
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
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taaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccaccctttttcttgtgaaattttttctattcccaggaacattttatgcccggga |
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T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
936107 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagggatatatattccaatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Original strand, 8322026 - 8322308
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 |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 39498606 - 39498900
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 |
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
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| |
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ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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ataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39498900 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 39501945 - 39502239
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
39501945 |
aatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
39502044 |
T |
 |
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117 |
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216 |
Q |
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| T |
39502045 |
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39502144 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39502145 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39502239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25916295 - 25916035
Alignment:
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
25916295 |
ttagaaaaaatatgtttgattagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcat |
25916196 |
T |
 |
| Q |
149 |
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248 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
25916195 |
gggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
25916096 |
T |
 |
| Q |
249 |
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311 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916095 |
c--atacattcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
25916035 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 27555208 - 27555485
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27555208 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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|
| T |
27555307 |
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27555390 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
27555391 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
27555485 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 27942518 - 27942814
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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aatataaatatgagaattttatttcaaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagg |
27942617 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
27942618 |
taaattatttatgaatttattctcatttcaatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
27942717 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgta------acaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
27942718 |
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27942814 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34238248 - 34238007
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
34238248 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaacaaaaaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
34238148 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattgtttctattcccaagaacattttataccaagga |
34238049 |
T |
 |
| Q |
217 |
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258 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
34238048 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt |
34238007 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 18931534 - 18931826
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17 |
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116 |
Q |
| |
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18931534 |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
18931634 |
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18931733 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18931734 |
ataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
18931826 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 48873802 - 48873978
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17 |
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116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48873802 |
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48873901 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattc |
193 |
Q |
| |
|
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|
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48873902 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattc |
48873978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31938159 - 31937870
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| Q |
21 |
taaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa |
120 |
Q |
| |
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taaagatgaaaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggt-aa |
31938061 |
T |
 |
| Q |
121 |
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219 |
Q |
| |
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| T |
31938060 |
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31937961 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| ||||||||||| |||| || || ||| |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
31937960 |
aaatttaataaacttctaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttattttcaaaaatctacaattataacttgaaacaaacacacc |
31937870 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 311
Target Start/End: Original strand, 30415743 - 30415977
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76 |
ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcctt |
175 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || | || ||||||| ||| ||||| || |
|
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30415841 |
T |
 |
| Q |
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275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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gggaaattttttctattccaaagaacattttatatttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatatatattcctatcattttattatc |
30415941 |
T |
 |
| Q |
276 |
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311 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30415942 |
gggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 310
Target Start/End: Original strand, 38414032 - 38414278
Alignment:
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159 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38414032 |
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38414130 |
T |
 |
| Q |
160 |
tctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
259 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
38414131 |
tcccacccttttccttgggaaattttttatattcccggaaacattttata-catggaataaaatttagtaaacttattacaaacatagacatgtatattt |
38414229 |
T |
 |
| Q |
260 |
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310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
38414230 |
ctatcattttattccc--gaatcaacaaatataactttagacaaacacacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 7258745 - 7259036
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116 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |
|
|
| T |
7258745 |
aatataaatatgggaattttattccaaggtatttgaataaaagatgtttggttaacattttaatattccaaggaaccataaaaattaggactataataag |
7258844 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | |
|
|
| T |
7258845 |
tagt-tacaaatgaatttattcccatattcatgggaactttattcccactcttttcttttggaaattttttctattcccaggaacattttatacgcggaa |
7258943 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7258944 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacaaagacatgtatatt-ctatcattttattctaaggaatctaccaatataacttgaaacaaacgcacc |
7259036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47426520 - 47426278
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25 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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47426520 |
gatgggaattttattcaaaggtatttagaaaaaatatatttggttaactttataatattcctaggaacc-------tagggattataataggt-aactat |
47426429 |
T |
 |
| Q |
125 |
ttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactc-ttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaat |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| | |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||| |
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|
| T |
47426428 |
ttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgccacccttttttcttgataatatttttctatttccaggaacattttatatcaagaaataaaat |
47426329 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttagtgaacttgtaacaaacataggcatat-acattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47426328 |
ttagtaaacttgtaacaaacatagacatataatattcatatcattttattc |
47426278 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
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120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
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| T |
51968564 |
taaagatgagaattttattccaaggtatatagaaaaaagatgtttgtttaacattataatatttctgagaaccataaaaataaggattataat--gtaat |
51968661 |
T |
 |
| Q |
121 |
ctatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcctt-gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaata |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
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|
| T |
51968662 |
-tacatatgaaattatttccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaaacattttctattcccaggaacgttttatactcaagaata |
51968760 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaatttagcaaacttgtaacaaacataggcatgcatatttctatctttttattcccagaaatttacgaatataacttgaaacaaacacaccc |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 52469479 - 52469734
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Q |
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||||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
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| T |
52469479 |
aatataaagattgaaattttataccaaaatatttagaaaaaaacatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaatatagagattataatag |
52469578 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
52469579 |
gtaa-ctatattggaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccaatttccttggaaaaaaatttctattcctagaaacattttattgccgga |
52469677 |
T |
 |
| Q |
216 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
52469678 |
aataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatgcaattctatcattttatt |
52469734 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10400947 - 10400810
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169 |
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268 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10400947 |
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10400848 |
T |
 |
| Q |
269 |
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306 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10400847 |
tattcccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaaca |
10400810 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 38394691 - 38394943
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| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
38394691 |
ataaatatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaatattataatatttttgggaaccataaaaataggaattataatagg-aa |
38394789 |
T |
 |
| Q |
120 |
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218 |
Q |
| |
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| || | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||| |||| ||| || |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
38394790 |
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38394888 |
T |
 |
| Q |
219 |
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273 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
38394889 |
aaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatgtatattcccatcgttttattc |
38394943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 36858196 - 36858351
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| Q |
24 |
agatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaacta |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
36858196 |
agatgggaatttcattc-aaggtatttaagaaaaatatgtttggataactttgtaatattcctaggaaccataaaaataaggattataacaggt-aacta |
36858293 |
T |
 |
| Q |
124 |
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181 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
36858294 |
tatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcccacccttttctttgggaaa |
36858351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36858634 - 36858378
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| Q |
53 |
gaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatagga |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||| ||| ||| |
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|
| T |
36858634 |
gaaaaatatgtttgtttaacattataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgtaat-tacatatgaaattattctcatcttcatggga |
36858536 |
T |
 |
| Q |
153 |
actttattctcactcttttccttgggaaatttttt---ctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggc |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |
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|
| T |
36858535 |
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36858438 |
T |
 |
| Q |
250 |
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311 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| |||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858437 |
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36858378 |
T |
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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Original strand, 18405592 - 18405830
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74 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcc |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18405592 |
ttataatatttctaggaaccataaaaatagagattataataggtaat-tacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttct |
18405690 |
T |
 |
| Q |
174 |
ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
18405691 |
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18405790 |
T |
 |
| Q |
274 |
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313 |
Q |
| |
|
|| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405791 |
tcggaaatctctgaatataacttaaaacaaacacacccat |
18405830 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 26165155 - 26165439
Alignment:
| Q |
29 |
ggaattttattccaaggaatttaggaaaaat-atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata---ggtaaactat |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
26165155 |
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26165253 |
T |
 |
| Q |
125 |
ttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatt |
224 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
26165254 |
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26165352 |
T |
 |
| Q |
225 |
tagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165353 |
tagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacatgaaacaaacacaccc |
26165439 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37014677 - 37014451
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || | |||||||| | |||||| || | |
|
|
| T |
37014677 |
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37014579 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
37014578 |
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37014480 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
37014479 |
ataaaatttaataaactcataacaaacat |
37014451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10401072 - 10400973
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| Q |
19 |
tataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
118 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10401072 |
tataaaaatgagaattttattccaagatatatagaaaaaacatgtttggttag-tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggta |
10400974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12276048 - 12275953
Alignment:
| Q |
174 |
ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttt |
269 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
12276048 |
ttgggaaaatatttctttttccaagaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatcatttt |
12275953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 48059836 - 48060065
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa-tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
48059836 |
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48059935 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||| || | || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |
|
|
| T |
48059936 |
gtaat-tatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttatttgggaaattttttctattcccataaatattttatatccaaa |
48060034 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48060035 |
aataaaatttaataaactcgtaacaaacata |
48060065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24805382 - 24805150
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa-------aatagggattataa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
24805382 |
ataaagatgtgaattttactttaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataatattactgggaaccataaaccataaaaatagggaatataa |
24805283 |
T |
 |
| Q |
113 |
taggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctc-actcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacc |
211 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
24805282 |
taggtaat-tacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaattttttctattcccaa-aatgttttattcc |
24805185 |
T |
 |
| Q |
212 |
caggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
24805184 |
cgaaaataaaatttagtaaatttgtaacaaacata |
24805150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34237480 - 34237424
Alignment:
| Q |
251 |
tatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34237480 |
tatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
34237424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22654610 - 22654515
Alignment:
| Q |
178 |
gaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22654610 |
gaaagtttttctattcgcaataacattttttacccgagaataaaaattagttaacttgtaataaacataggcatgtatatttctatcattttattc |
22654515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 305
Target Start/End: Original strand, 44309545 - 44309829
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
44309545 |
ataaagatgagaatttaatttcaaagtgtttaggaaaaatatgtatggttaacattataatattctcgagaatactaaaaatagggattataacagataa |
44309644 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaatttttt-ctattcccaagaacattttatacccaggaat |
218 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
44309645 |
t-tacacattaataaattttcatattcatgggaactttattcccacccttttctttaggaaatttttttctattctctagaacgttttatact-aggaat |
44309742 |
T |
 |
| Q |
219 |
aaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||| | |||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44309743 |
aaaatttagtaaccttgtaacaaacatagacatgcatatttctatcgttttattttcagaaatctacgaatataacttgaaacaaac |
44309829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 30790328 - 30790519
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30790328 |
aatataaagatgagaaatttattccaaagtatttaaaaaaaagatgtttggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagaatttataataat |
30790427 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttataccca |
213 |
Q |
| |
|
|| || || | |||||| |||||| ||| | |||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30790428 |
tacac-----ataattttatttccatcttcatggaaactttattcccatccttttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttataccca |
30790519 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32384650 - 32384491
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54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||| || |||| |
|
|
| T |
32384650 |
aaaagtatgtttgcttaacattataatattcctggaaaccataaaattagggattataataggt-aattgcacataaatttgttccaatctttatgggaa |
32384552 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaa-ttttttctattcccaagaacattttataccca |
213 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
32384551 |
ttttattcccacccttttctttgggaaatttttttctgtttccatgaacgttttataccca |
32384491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 18094073 - 18094285
Alignment:
| Q |
60 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttat |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
18094073 |
atgtttagttaacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttat |
18094171 |
T |
 |
| Q |
160 |
tctcactcttttccttggga--aattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacat |
257 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| | | || || |
|
|
| T |
18094172 |
tctcaccattttctttggaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacataagaaggtatat |
18094270 |
T |
 |
| Q |
258 |
tcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18094271 |
ttctatcattttatt |
18094285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 36860106 - 36860191
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| Q |
224 |
ttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36860106 |
ttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttatatcattttatttaaga-aatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
36860191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Original strand, 38413957 - 38414015
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagcttt |
75 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38413957 |
aatataaagatgagaatttaattccaaggtatttagaaaaaatatgtttggttaacttt |
38414015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 54478495 - 54478555
Alignment:
| Q |
186 |
ttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478495 |
ttctatttccaataacattttatacccatgaatgaaatttagtaaacttataacaaacata |
54478555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9327342 - 9327245
Alignment:
| Q |
215 |
gaataaaatttagtgaacttgtaa-caaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9327342 |
gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacaccc |
9327245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9374101 - 9374004
Alignment:
| Q |
215 |
gaataaaatttagtgaacttgtaa-caaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9374101 |
gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacaccc |
9374004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Original strand, 14796344 - 14796439
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataa |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14796344 |
aatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgtttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa |
14796439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 52414008 - 52414061
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggtta |
70 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52414008 |
aatataaagatgtgaattttatttcaagcgaattagaaaaaatatgtttggtta |
52414061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 54478384 - 54478437
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggtta |
70 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478384 |
aatataaatatgtgaattttattctaaggtatttagaaaaaagatgtttggtta |
54478437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 346639 - 346345
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346639 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
346540 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
346539 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
346440 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346439 |
ataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
346345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 6171568 - 6171862
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171568 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
6171667 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6171668 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
6171767 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171768 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
6171862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 2521452 - 2521751
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521452 |
aatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
2521551 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521552 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccagga |
2521651 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccatata |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2521652 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccttata |
2521751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9734140 - 9733846
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9734140 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
9734041 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9734040 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttttattcccaggaacattttataccaagga |
9733941 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9733940 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9733846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14777792 - 14777498
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777792 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataatagg |
14777693 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14777692 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
14777593 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777592 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataaattgaaacaaacacaccc |
14777498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 4559336 - 4559630
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559336 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
4559435 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4559436 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
4559535 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559536 |
ataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcttgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
4559630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 11071382 - 11071676
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11071382 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataatagg |
11071481 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11071482 |
taaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
11071581 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071582 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
11071676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42674955 - 42674661
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674955 |
aatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
42674856 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
42674855 |
taaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatgcccggga |
42674756 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674755 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
42674661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 2050643 - 2050944
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2050643 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaataggaattataatagg |
2050742 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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2050943 |
at |
2050944 |
T |
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Target: chr2; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 41750306 - 41750599
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
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216 |
Q |
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| T |
41750406 |
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41750505 |
T |
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310 |
Q |
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41750506 |
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41750599 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 37192299 - 37192591
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17 |
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116 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
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T |
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309 |
Q |
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| T |
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37192591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21737702 - 21737400
Alignment:
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Q |
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T |
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117 |
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208 |
Q |
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21737503 |
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308 |
Q |
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21737403 |
T |
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309 |
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311 |
Q |
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| T |
21737402 |
ccc |
21737400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 17965760 - 17966054
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Q |
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Q |
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| T |
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17965959 |
T |
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311 |
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| T |
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17966054 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41729424 - 41729130
Alignment:
| Q |
17 |
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Q |
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T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
41729324 |
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41729225 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
41729224 |
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41729130 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5770404 - 5770110
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| Q |
17 |
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Q |
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T |
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| Q |
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216 |
Q |
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5770304 |
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5770205 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
5770204 |
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5770110 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 37533730 - 37534023
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
37533829 |
taaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttttttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccagga |
37533928 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
37533929 |
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37534023 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39995433 - 39995131
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
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117 |
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208 |
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39995234 |
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308 |
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39995134 |
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| T |
39995133 |
ccc |
39995131 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40951153 - 40950859
Alignment:
| Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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Q |
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T |
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117 |
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216 |
Q |
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| T |
40951053 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggaaatttttttgtattcccaggaacattttataccaagga |
40950954 |
T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
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| T |
40950953 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
40950859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28311990 - 28311701
Alignment:
| Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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Q |
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T |
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| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
28311890 |
taa-ctatttatgaatttattcccatctccacgggaactttattcccacccttttccttgggaaagattttctattcccaggaacattttatacccggga |
28311792 |
T |
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| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
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| T |
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ataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 638371 - 638660
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Q |
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T |
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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taaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattc-cccccttttccttgggaaattttttatattcctaggaacattttatacccggaa |
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T |
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217 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 37233207 - 37233496
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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Q |
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| T |
37233207 |
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T |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
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| T |
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taa-ctatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaacgattttctattcccaggaacattttatacccggga |
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T |
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ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 26310044 - 26310335
Alignment:
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
26310044 |
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26310143 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
26310144 |
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26310243 |
T |
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| Q |
217 |
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306 |
Q |
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| T |
26310244 |
ataaattttaataaacttctaacaaacatatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataactttaaacaaaca |
26310335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34356987 - 34356700
Alignment:
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23 |
aagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaact |
122 |
Q |
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| T |
34356987 |
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34356888 |
T |
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| Q |
123 |
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222 |
Q |
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| T |
34356887 |
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34356789 |
T |
 |
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223 |
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311 |
Q |
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| T |
34356788 |
tttagtaaacttataccaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
34356700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20426776 - 20426483
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
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| T |
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20426677 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
20426676 |
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20426578 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
20426577 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataaattcctatcattttattcccgggaatcaacaaatataatttgaaacaaacacaccc |
20426483 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 45409028 - 45409321
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
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| T |
45409028 |
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45409127 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
45409128 |
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45409226 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
45409227 |
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45409321 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27358256 - 27357963
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
27358256 |
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27358157 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
27358156 |
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27358058 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
27358057 |
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27357963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18713950 - 18713660
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
18713950 |
aatataaagatgagaatattattccaagatatttagaaaaaatatgtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaatagggtttataatagg |
18713851 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
18713850 |
tta-ctacgtataaatttatttccatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaaattttttttattaccaagaacattttatacccggga |
18713752 |
T |
 |
| Q |
217 |
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308 |
Q |
| |
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|
| T |
18713751 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttatatcattttattaccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
18713660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 13760744 - 13760938
Alignment:
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116 |
Q |
| |
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| T |
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13760843 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacc |
211 |
Q |
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| T |
13760844 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccataaacattttatacc |
13760938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 1988089 - 1988383
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
1988089 |
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1988188 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
1988189 |
taa-ctatataagaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaaatttttctattcccaagaacattttatatccggaa |
1988287 |
T |
 |
| Q |
217 |
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312 |
Q |
| |
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| T |
1988288 |
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1988383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 14832588 - 14832877
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14832588 |
aatataaagatgataattttattcctagatatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaataaggattataatagg |
14832687 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
14832688 |
-aaattacgtataaatttattctcatctcaatgagaactttattcccacccttttctttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatacctggga |
14832786 |
T |
 |
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217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14832787 |
ataaaatttagtaaacttttaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcctaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
14832877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 3902234 - 3902521
Alignment:
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
3902234 |
aatataaagatgggaattttattccaagatatttagaaaaaatatgtttggttaactttataatattcacaggaaccataaaaatagggattataatagg |
3902333 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
3902334 |
taa-ctatatatgaatttattctcatctccaagggaactttattcccaccattttctttgggaatttttttctattcccaggaacattttaaacctgaga |
3902432 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3902433 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtctatatatttctatcattttattctcaggaaagaacaaatataacttgaaacaaac |
3902521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 23943940 - 23944165
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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Q |
| |
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|
| T |
23943940 |
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23944039 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
23944040 |
taaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttcgttgagaaattttttctattcccaggaacattttatatccgaga |
23944139 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaa |
242 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
23944140 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 45693969 - 45694259
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| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
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| T |
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ataaagatgagaattttattccaaggcattttaaaaaaaaatgtttgcttaacattataatattcctgggaaccataaaaataggaattataattgc-aa |
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T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaata |
219 |
Q |
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| T |
45694068 |
attactcatgaatttattttcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaaaattttctattcccatgaacgttttatacccgggaata |
45694167 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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aaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttattcccagaaatctacgaatataacttgaaacaaacgcaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 40569809 - 40570091
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130 |
Q |
| |
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 |
| Q |
131 |
atttattcccatctccataggaactt---tattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttag |
227 |
Q |
| |
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| T |
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ttttattcccatttccatgggaacttctttattcccaccattttctttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaa |
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T |
 |
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228 |
tgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
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| |
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|
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caaacttgtaacaaacataggcatgtatgtttttatgattttattcccaggaatctacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 39819467 - 39819763
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
39819467 |
aatataaagatggaaattttattcccaggtatttagaaaaaatatgtttggttgactttataatattccaaggaaccttaaaaataaggattatattagg |
39819566 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaac---tatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaac---attttatac |
210 |
Q |
| |
|
||||| || ||| | |||| || ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
39819567 |
taaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaactttattcccaccattttctttggaaatttttttcaattcccaggaacattattatatac |
39819666 |
T |
 |
| Q |
211 |
ccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39819667 |
ccgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgtattttcatgattttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacac |
39819763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 7007362 - 7007644
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7007362 |
aatataaagatgagaattttattctaaagtatttagaaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccattaaaatagggagtataatagg |
7007461 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | |
|
|
| T |
7007462 |
t-aactacatatgaatttattctcatctccatggtaattttattcccaccattttctttgggaa--tttttttattatcaataacatttt---------a |
7007549 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||| | || ||| ||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7007550 |
gtaaaatttagtaaacttgtatgaaacattgacaaatatatttccatcattttatccccaagaatcaacaaatataacttgaaataaacacaccc |
7007644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763374
Alignment:
| Q |
104 |
ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacat |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
11763577 |
ggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaattttttctattcccagaaatat |
11763479 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaa |
303 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
11763478 |
tttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatagacatatatattcctatcatttcattcccgaaaaacaacaaatataacttgaaa-aa |
11763380 |
T |
 |
| Q |
304 |
acacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
11763379 |
acacac |
11763374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 296
Target Start/End: Original strand, 14253412 - 14253578
Alignment:
| Q |
130 |
aatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtg |
229 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14253412 |
aatttattctcatcttcatgaaaattttattcacacccttttctttgagaaattttttctattcccataaacattttatactcgggaataaaatttagta |
14253511 |
T |
 |
| Q |
230 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataactt |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14253512 |
aacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatataactt |
14253578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 6571614 - 6571758
Alignment:
| Q |
167 |
cttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcat |
266 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6571614 |
ctttttcttgggaaattttttatattccccggaacattttatacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcat |
6571713 |
T |
 |
| Q |
267 |
tttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
6571714 |
tttatttccggaaatcaacaaatataactttaaacaaatacaccc |
6571758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 4875553 - 4875846
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa-atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4875553 |
aatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaaaaaaatatgttttcttaacattataatatgccgaggaaccataaaaatagggattataatat |
4875652 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||| | |
|
|
| T |
4875653 |
gt-aattacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccgtttctttgggattttttttttattctcgagaacgttttatattga-a |
4875750 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || | || | |||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
4875751 |
aataaaatttagcaaacttgtaacaaacataaacaaatttatttctatcattttatttccaaaaagctacaaatataacttaaaacaaacgcaccc |
4875846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41298174 - 41297983
Alignment:
| Q |
54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
41298174 |
aaaaagatgtttgtttaacattataatattccaaggaaccataagaatagagattataataggtaat-tataaatgaatatattctcatcttcatgagaa |
41298076 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41298075 |
ctttattcacaccctttgctttgggaaattttttttatttctaaaaacattttatatccgggaataaaatttaataaacttgtaacatacata |
41297983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5003129 - 5002837
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5003129 |
aatataaagatgcgaattttattccaaggtatttggataaaagatgtttggttaacattttaatattttcaggaaccataaaaatatggattataatagg |
5003030 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
| | || ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
5003029 |
t-agttacacatgaattgattcatatcttcatggaaactttattcccaccatattctttggaattttttttctattcccagaaacattttata-cttgga |
5002932 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5002931 |
ataaaatttagcaaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctatcattttattcttagaaatctacaaatataacttgaaacaaacgcaccc |
5002837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11763694 - 11763597
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11763694 |
aatataaagatgagaattttattccaaggtatctagaaaaaatatgtttgattaattttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataata |
11763597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Original strand, 13539449 - 13539675
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13539449 |
ataaagatgagaattttattctaaaatatttagaaaaaagatgtttgcttaacattatagtattctcagaaaccataaaaataaggattataatagataa |
13539548 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaata |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13539549 |
t-tacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccactagtttctgtgagaaattttttccattcccataaacattttatacctgcgaata |
13539647 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacatag |
247 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539648 |
aaatttaataaatttgtaacaaacatag |
13539675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 311
Target Start/End: Original strand, 25454968 - 25455095
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| Q |
184 |
ttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatca |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
25454968 |
ttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatct |
25455067 |
T |
 |
| Q |
284 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25455068 |
acaaatataacttgaaacaaacacaccc |
25455095 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 311
Target Start/End: Original strand, 25724918 - 25725097
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| Q |
133 |
ttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaa-tttagtgaa |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | || |
|
|
| T |
25724918 |
ttattctcatcttcatgagaactttattcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttatacccagcaataaaattttaataaa |
25725017 |
T |
 |
| Q |
232 |
cttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25725018 |
cctgcaacaaacataggaatacgtatttctatcattttgttcccaagaatttccaaagataacttgaaacaaacgcaccc |
25725097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 374
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| Q |
311 |
catataatctaacaattatataattccgtactaaaactaaagtcacaactgatatgaatagaag |
374 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31935516 |
catataatctaacaattatataattccgtactaaaactaaagtcacaactgatatgagtagaag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 17 - 119
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |
|
|
| T |
3254386 |
aatataaaaatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgtttggttaacttcataatattcctagaaaccataaaaataagggttataataag |
3254287 |
T |
 |
| Q |
117 |
taa |
119 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
3254286 |
taa |
3254284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 309
Target Start/End: Original strand, 24499399 - 24499509
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197 |
agaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataactt |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24499399 |
agaacattttataccatggaataaaatttagtaaacttataacaaacatag--atatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataactt |
24499496 |
T |
 |
| Q |
297 |
gaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
24499497 |
gaaacaaacacac |
24499509 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat-atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13790067 |
aatatatagatgtaaattttattctaaggtatttaaaaaaaaagatgtttgattaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggattataatag |
13790166 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatt-tatgaatttattcccatctccataggaactttattc |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13790167 |
gtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattc |
13790211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 311
Target Start/End: Original strand, 1623206 - 1623453
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gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattc |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
1623206 |
gtttgattaactttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggt-aactacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattc |
1623304 |
T |
 |
| Q |
162 |
tcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
261 |
Q |
| |
|
| | | ||| |||| ||| ||| ||| | | || |||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
1623305 |
ccgccatgttctttggaaaaatttctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaac-aacatagacatatatatttct |
1623403 |
T |
 |
| Q |
262 |
atcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1623404 |
attattttactcttaggaatcaacaaatataatttaaaacaaacataccc |
1623453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Original strand, 13760941 - 13761013
Alignment:
| Q |
236 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13760941 |
taacaaacataggtacatatattcctatcattttattcccgaaaatcaataattataacttgaaacaaacaca |
13761013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8868842 - 8868664
Alignment:
| Q |
130 |
aatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtg |
229 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
8868842 |
aatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaatattc-ctat-cccaggaacattttctacctaggaataaaatttacta |
8868745 |
T |
 |
| Q |
230 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8868744 |
atcctgtaacaaacataagaatatgtatttctatcaatttattcctaggaatctacaa-aataacttgaaacaaacgcaccc |
8868664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Original strand, 4684962 - 4685249
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||| | |||||||| || | ||| ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4684962 |
ataaagatgagaattttattcctaggtatttagtaaaaatatatttgcttaacattataata-tcttcggatccataaaaatatgaattataataggt-- |
4685058 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttg-ggaaattttttctattcccaag-aacattttatacccaggaa |
217 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||| | | || |
|
|
| T |
4685059 |
--tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttctttgatttttttttttctattgccaggaaacgttttatactctgaaa |
4685156 |
T |
 |
| Q |
218 |
taaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| || | ||| | | ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4685157 |
taaaatttaataaatttataacaaacataaacatgtatatttctatcattttatttccaaaaatatgcgaatatcacttgaaacaaacacacc |
4685249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 14253340 - 14253413
Alignment:
| Q |
26 |
atgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaa |
99 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
14253340 |
atggaaattttattccaaaatatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatatttttaggaaacataaaa |
14253413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14403346 - 14403233
Alignment:
| Q |
198 |
gaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttg |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
14403346 |
gaacattttatacctgagaataaaatttattaaacttgtaataaatgtaggcatgtatatttttatcattttatttccaggaatcaacaaatacaacttc |
14403247 |
T |
 |
| Q |
298 |
aaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
14403246 |
aaacaaacacaccc |
14403233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 516572 - 516477
Alignment:
| Q |
130 |
aatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaattta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
516572 |
aatttattctcatcttcacgggaattttattctcaccattttctttgg-aatttttttatattcccaaaaacattttatacccagaaataaaattta |
516477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 37851678 - 37851890
Alignment:
| Q |
60 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttat |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
37851678 |
atgtttagttaacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttat |
37851776 |
T |
 |
| Q |
160 |
tctcactcttttccttggga--aattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacat |
257 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| | | || || |
|
|
| T |
37851777 |
tctcaccattttctttggaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacataagaaggtatat |
37851875 |
T |
 |
| Q |
258 |
tcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37851876 |
ttctatcattttatt |
37851890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 272
Target Start/End: Original strand, 25625328 - 25625418
Alignment:
| Q |
182 |
ttttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25625328 |
ttttttctattcccatgaacattttatacctcagaataaaatctagtaaatttgcaacaaacctagacattcatatttctatcattttatt |
25625418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14403493 - 14403431
Alignment:
| Q |
22 |
aaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattc |
84 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14403493 |
aaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaatatttttggttaactttataatattc |
14403431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 1623129 - 1623188
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttat |
77 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1623129 |
aatataaagatgagaattttatttcaa-gtatttagaaaatatatgtttggttaactttat |
1623188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35818718 - 35818424
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818718 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
35818619 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35818618 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
35818519 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818518 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
35818424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37392840 - 37392546
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392840 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
37392741 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37392740 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
37392641 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37392640 |
ataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaatacaccc |
37392546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 38363858 - 38364152
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363858 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
38363957 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38363958 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
38364057 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364058 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
38364152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 18297889 - 18298183
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18297889 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
18297988 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18297989 |
taaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
18298088 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18298089 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaacaaaccc |
18298183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26602228 - 26601941
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26602228 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattccttggaaccataaaaatagggattataatagctaa |
26602129 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaata |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26602128 |
actatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttata-ccaggaata |
26602030 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26602029 |
aaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataatttgaaacaaacaca |
26601941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32661228 - 32660933
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661228 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatagg |
32661129 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactctttt-ccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32661128 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggg |
32661029 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661028 |
aataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
32660933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18726914 - 18726619
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726914 |
aatataaagatgaaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
18726815 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaatt-ttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
18726814 |
taaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttatacctggg |
18726715 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726714 |
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18726619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38133032 - 38132737
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
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38132933 |
T |
 |
| Q |
117 |
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215 |
Q |
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| T |
38132932 |
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38132833 |
T |
 |
| Q |
216 |
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311 |
Q |
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| T |
38132832 |
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38132737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 12710422 - 12710716
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
12710522 |
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12710621 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
12710716 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 25837688 - 25837982
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataatagg |
25837787 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
25837788 |
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25837887 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
25837888 |
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25837982 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 26061921 - 26062215
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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| T |
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26062020 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
26062021 |
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26062120 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
26062121 |
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26062215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 7931016 - 7931306
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17 |
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116 |
Q |
| |
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7931016 |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
7931116 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaagga |
7931215 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
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|
| T |
7931216 |
ataaattttagtaaacttataacaaacatatacatatacatttctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
7931306 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16313801 - 16313507
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
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| |
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|
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T |
 |
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
16313701 |
aaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
16313602 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
16313601 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
16313507 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1554643 - 1554354
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22 |
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121 |
Q |
| |
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|
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aaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatggttggttagttttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaat |
1554544 |
T |
 |
| Q |
122 |
tatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaa |
221 |
Q |
| |
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tatgtatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaa |
1554444 |
T |
 |
| Q |
222 |
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311 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1554443 |
atttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 42755644 - 42755937
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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aatatgaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
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taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|
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| T |
42755744 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaagga |
42755843 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
42755844 |
ataaattttagtaaacttgtaactaacataggcatatacatttctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
42755937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 3049786 - 3050074
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| Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049786 |
aatataaagatgggaattttattcgaaggaatttagaaaaaatatgtttggttatctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataatagg |
3049885 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
3049886 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacccggga |
3049985 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
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|
| T |
3049986 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41228990 - 41228714
Alignment:
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34 |
tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt |
133 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt |
41228891 |
T |
 |
| Q |
134 |
tattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaact |
233 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattct-atctccataggaactttattcccacccttttcctcgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaact |
41228792 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41228791 |
tgtaacaaacgtaggcatatacattcctaccattttattcccgggaattaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10896510 - 10896216
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
10896510 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataatagg |
10896411 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
10896410 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttctt-gatttttttttctattcccaggaacattttataccaagga |
10896312 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
312 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10896311 |
ataaattttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
10896216 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 7317156 - 7317444
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Q |
| |
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7317156 |
tataaagatgtgaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctag-aaccatgaaaatagggattataataggta |
7317254 |
T |
 |
| Q |
119 |
aactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaat |
218 |
Q |
| |
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7317255 |
a-ctatttacgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaaatttttctat-cctaggaacactttatatcc-ggaat |
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T |
 |
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219 |
aaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttatttttgaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 35394168 - 35394461
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| |
|
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| T |
35394168 |
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35394267 |
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 |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
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Q |
| |
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35394268 |
taa-ctatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccatttttcttggaaatttttttctattacgtagaacattttatacccggga |
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 |
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217 |
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311 |
Q |
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35394461 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5020785 - 5020492
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
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| T |
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T |
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216 |
Q |
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| T |
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5020588 |
T |
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| Q |
217 |
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309 |
Q |
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| T |
5020587 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21137425 - 21137134
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
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T |
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117 |
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216 |
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| T |
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309 |
Q |
| |
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| T |
21137226 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29421766 - 29421493
Alignment:
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33 |
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132 |
Q |
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| T |
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T |
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133 |
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232 |
Q |
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| T |
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29421568 |
T |
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| Q |
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307 |
Q |
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| T |
29421567 |
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29421493 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33444916 - 33444627
Alignment:
| Q |
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116 |
Q |
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| T |
33444916 |
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33444817 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
33444816 |
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33444720 |
T |
 |
| Q |
217 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6805920 - 6805698
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112 |
Q |
| |
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| T |
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212 |
Q |
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| T |
6805820 |
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213 |
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236 |
Q |
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| T |
6805721 |
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T |
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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40197347 - 40197223
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116 |
Q |
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| T |
40197347 |
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T |
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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40197247 |
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T |
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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19161035 - 19160778
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115 |
Q |
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116 |
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215 |
Q |
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| T |
19160935 |
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19160837 |
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274 |
Q |
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| T |
19160836 |
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19160778 |
T |
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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
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Target Start/End: Complemental strand, 43872259 - 43871971
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116 |
Q |
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| T |
43872259 |
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43872160 |
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 |
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117 |
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| T |
43872159 |
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43872061 |
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306 |
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| |
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| T |
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43871971 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 15226743 - 15227029
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116 |
Q |
| |
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| T |
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 |
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| |
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| T |
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15226940 |
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305 |
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| |
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| T |
15226941 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 41432519 - 41432804
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20 |
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117 |
Q |
| |
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| T |
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41432617 |
T |
 |
| Q |
118 |
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216 |
Q |
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| T |
41432618 |
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41432716 |
T |
 |
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217 |
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304 |
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| T |
41432717 |
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41432804 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16219231 - 16218979
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21 |
taaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa |
120 |
Q |
| |
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| T |
16219231 |
taaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagatgtttggttaacattataatattcttgggaaccatgaaaatggggattataataggt-aa |
16219133 |
T |
 |
| Q |
121 |
ctatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataa |
220 |
Q |
| |
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| T |
16219132 |
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16219034 |
T |
 |
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221 |
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275 |
Q |
| |
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| T |
16219033 |
aatctagtaaacttgtaacaaacataggcatacatatttctatcgttttattccc |
16218979 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31117820 - 31117594
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113 |
Q |
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31117820 |
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31117721 |
T |
 |
| Q |
114 |
aggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttataccca |
213 |
Q |
| |
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| T |
31117720 |
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31117628 |
T |
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| Q |
214 |
ggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacatag |
247 |
Q |
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| T |
31117627 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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| |
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| T |
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T |
 |
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282 |
caacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
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caacaattataacttgaaacaaacataccc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 273
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Q |
| |
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14764060 |
ttttttctattctcatgaacattttatacccgtgaataaaatttagtaaacttgaaacaaacatatgcatgtatatttctatcattttattc |
14763969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 25899548 - 25899702
Alignment:
| Q |
155 |
tttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatata |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
25899548 |
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25899646 |
T |
 |
| Q |
255 |
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310 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899647 |
catttttatgattttattcccaggaatctacaaatataatttgaaacaaacacacc |
25899702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37982079 - 37981857
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaatttt-attccaaggaatttaggaaaaata--tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
37982079 |
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37981980 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| || || ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |
|
|
| T |
37981979 |
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37981883 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaac |
243 |
Q |
| |
|
|| |||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
37981882 |
at-aaattttgtaaacttgaaacaaac |
37981857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 305
Target Start/End: Original strand, 38437381 - 38437519
Alignment:
| Q |
167 |
cttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcat |
266 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
38437381 |
cttttctttgggaaaaattttctattctcaggaacgttttatacccgaaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatatgtattcctatcgt |
38437480 |
T |
 |
| Q |
267 |
tttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38437481 |
tttattttcaggaatatacaaatataacttaaaacaaac |
38437519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33533686 - 33533585
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||| ||| | |||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33533686 |
aatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaataaagatgtttgattaacattatgatattctcaagaaccttaaaaataggaattataatagg |
33533587 |
T |
 |
| Q |
117 |
ta |
118 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
33533586 |
ta |
33533585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 242
Target Start/End: Original strand, 12649951 - 12650137
Alignment:
| Q |
54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||| | ||| |||| |
|
|
| T |
12649951 |
aaaaagatgtttgattaacattataatattcttaggaacttaaaaaatagagattataataggtagt-tacatgtgaatttattttcattttcatgggaa |
12650049 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| ||| | || |||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
12650050 |
ctttattcccactattttctttgcgtaaatttt-ctatttccatgaatattttatacacagaaataaaatttaataatcttgtaacaaa |
12650137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Original strand, 25899436 - 25899532
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
25899436 |
aatataaagataggaattttattctaaggtatttagaaaaaagatgtttggttgacattata--attccaaggaaccttaaaaatatggaatataatag |
25899532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 38437254 - 38437353
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| | || | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38437254 |
aatataaggatgagaattttattccaagatatttagaaaaaagatgtttgtttaacactacagtatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg |
38437353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Original strand, 34672292 - 34672405
Alignment:
| Q |
198 |
gaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttg |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
34672292 |
gaacattttatatctgagaataaaatttattaaacttgtaataaatgtaagcatatatatttttatcattttattttcaggaatcaacaaatacaacttc |
34672391 |
T |
 |
| Q |
298 |
aaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
34672392 |
aaacaaacacaccc |
34672405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 309
Target Start/End: Original strand, 8635672 - 8635703
Alignment:
| Q |
278 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8635672 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
8635703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Original strand, 34672145 - 34672207
Alignment:
| Q |
22 |
aaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattc |
84 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34672145 |
aaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaatatttttggttaactttataatattc |
34672207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31117579 - 31117546
Alignment:
| Q |
276 |
gagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31117579 |
gagaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
31117546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4765854 - 4765560
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765854 |
aatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
4765755 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4765754 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
4765655 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765654 |
ataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
4765560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19065799 - 19065505
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065799 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaatatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataatagg |
19065700 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
19065699 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaa |
19065600 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065599 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
19065505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22936206 - 22935912
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936206 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
22936107 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22936106 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctggga |
22936007 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936006 |
ataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
22935912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12970824 - 12970530
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12970824 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaatagg |
12970725 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12970724 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttaagaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
12970625 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970624 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
12970530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 18411986 - 18412280
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18411986 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
18412085 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18412086 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacctttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgaga |
18412185 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412186 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccaggaatcaataattataacttgaaacaaacacaccc |
18412280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11855949 - 11855658
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855949 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
11855850 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
11855849 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccggga |
11855750 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855749 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
11855658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 556000 - 555706
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17 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
556000 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaattagggattataatagg |
555901 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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555900 |
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555801 |
T |
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217 |
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311 |
Q |
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| T |
555800 |
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555706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 6091492 - 6091782
Alignment:
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
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| T |
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6091591 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
6091592 |
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6091691 |
T |
 |
| Q |
217 |
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307 |
Q |
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| T |
6091692 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
6091782 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14207115 - 14206821
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
14207115 |
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14207016 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
14207015 |
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14206916 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
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||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
14206915 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
14206821 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 28602333 - 28602626
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
28602433 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcagaaacattttata-ccggga |
28602531 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
28602532 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
28602626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29543309 - 29543015
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
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29543210 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
29543209 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
29543110 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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|
| T |
29543109 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
29543015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 36703654 - 36703946
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| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
36703654 |
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36703753 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
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| T |
36703754 |
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36703853 |
T |
 |
| Q |
220 |
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312 |
Q |
| |
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| T |
36703854 |
aattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgataatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
36703946 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 8406671 - 8406959
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
8406671 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccaaaaaaatagggattataatagg |
8406770 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|
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| T |
8406771 |
aaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
8406870 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
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|
| T |
8406871 |
ataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtacattcctatcattttattctcgaaaatcaacaattataacttgaaacaaac |
8406959 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 27481134 - 27481428
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
27481134 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatg |
27481233 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
27481234 |
taaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatattttttattctcaggaatattttatacccggga |
27481333 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27481334 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatttccaaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
27481428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 32535714 - 32536006
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32535714 |
aatataaagatgggaattttaatccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattctcaggaaccataaaaataggggttataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
32535814 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttaggaaattttttctattcccaataacattttataccaagaa |
32535913 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
32535914 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttattcctgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
32536006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8646684 - 8646412
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
8646684 |
aatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaattatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
8646586 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
8646585 |
taaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataaccggga |
8646486 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaatta |
290 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8646485 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaatta |
8646412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Original strand, 27480788 - 27481069
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
27480788 |
aatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgcttggttaactttataatatttctatgaaccataaaaatagaaattataatagg |
27480887 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
27480888 |
tag-ctatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattctcac-cttttccttggaaaaaattttctattcccatgaacattttatacacagga |
27480985 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaa |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27480986 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatacatattcctatcattttattctcaaaaatcaacaaatataacttgaaa |
27481069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 20962373 - 20962664
Alignment:
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22 |
aaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaac |
121 |
Q |
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| T |
20962373 |
aaagatgggaattttattccaaggcatttaaaaaaaatatgtttgcttaacattataatatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaat |
20962471 |
T |
 |
| Q |
122 |
tatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaa |
221 |
Q |
| |
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| T |
20962472 |
tactcattaatttattctcatctccatgagaactttactcccacccttttccttgggaaaaattttctattcccagaaacgttttatatccgagaataaa |
20962571 |
T |
 |
| Q |
222 |
atttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
314 |
Q |
| |
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| T |
20962572 |
atttagtaaacttgtaacaaacataggcacgtgtattcctatcattttattcccaagaatctacgaatataacttgaaacaaacacactcata |
20962664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 75 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42012414 - 42012179
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75 |
tataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcct |
174 |
Q |
| |
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| T |
42012414 |
tataatactccttggaaccataaaaatatggattataataggtaa-ctatataagaatttattctgatctccatgtgaactttattcccacccttttcct |
42012316 |
T |
 |
| Q |
175 |
tgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcc |
274 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |
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| T |
42012315 |
tcggaaattttttctattcctaggaacattttatactcgagaataaaatttagtaaatttgtaacaaacatagacatatgtatttctatcattttattcc |
42012216 |
T |
 |
| Q |
275 |
cgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
42012215 |
cgagaatcaacaaatatagcttcaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Original strand, 1664508 - 1664754
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17 |
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Q |
| |
|
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| T |
1664508 |
aatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgtttggttaactttataatattcttatgaaccataaaaatagggattataatagg |
1664607 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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|
| T |
1664608 |
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1664706 |
T |
 |
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217 |
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264 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1664707 |
ataaaatttagtcaatttgtaacaaacataagcatatagatttctatc |
1664754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 6930419 - 6930714
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6930419 |
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6930518 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || | |
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|
| T |
6930519 |
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6930616 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggc----atatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6930617 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatatatttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaataaacacacc |
6930714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26637315 - 26637045
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccata-aaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26637315 |
aatataaagatgggaattttattccaaggtatttagaaaaaatgtgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaaatatggattataatag |
26637216 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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|| | || | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26637215 |
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26637139 |
T |
 |
| Q |
216 |
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309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26637138 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatataattctatcattttattcccattaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
26637045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35348760 - 35348534
Alignment:
| Q |
74 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcc |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
35348760 |
ttataatattcccgggaaccataaaaatatgaattataataggtaat-tacatgtgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttct |
35348662 |
T |
 |
| Q |
174 |
ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
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|
| T |
35348661 |
ttgggaaa-attttctattcccaaaaacattttataccca-aaatacaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatt-ctatctttttattc |
35348565 |
T |
 |
| Q |
274 |
ccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
|||| |||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35348564 |
ccgaaaatctacgattataa-ttgaaacaaac |
35348534 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 36703563 - 36703656
Alignment:
| Q |
21 |
taaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
114 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703563 |
taaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
36703656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43347188 - 43346895
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
43347188 |
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43347089 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| || || | ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |
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|
| T |
43347088 |
taat-tacgcataattttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttcattggaaaaacttttctattgccagaaacaatttatacctggga |
43346990 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43346989 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacacatacatatgtatttttatgattttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
43346895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 17251590 - 17251845
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttagg-aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17251590 |
aatataaggataggaatttttttccaaggtatttagataaaaagatgtttggttaacattttaatattcctag-aaccataaaaatagggattataatat |
17251688 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | |
|
|
| T |
17251689 |
atagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccatcattttctttgggaaattttttctattatcatgaacattttatactcgag |
17251787 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17251788 |
aataaaatttagtaaaattataacaaacataaacatgtatatttctatcattttattc |
17251845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40276017 - 40275766
Alignment:
| Q |
48 |
tttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctcca |
147 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
40276017 |
tttagaaaaaagatgtttggttaatattataatattccatggaaccttaaaaatagggattttaataggttat-tagagataattttattcccatcttca |
40275919 |
T |
 |
| Q |
148 |
taggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacatag |
247 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40275918 |
tgggaactttattcccatcattttctttgggaaaacttttctattcccaggaatatttcatatctgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacatag |
40275819 |
T |
 |
| Q |
248 |
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300 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40275818 |
acatatgtatttttataattttattcccaaaaatctacaaatataacttgaaa |
40275766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31583350 - 31583102
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| || || | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31583350 |
ataaagatggaaatattatttcaagatatttagaaaaaa-atattggtttaacattataatattctcaggaaccgtaaaaatagggattataataggtac |
31583252 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaata |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31583251 |
t-tacatatgaatt-atttccatctttgtgggaactttattcccacctttttctttggaaaattttttctattcctgggaacgttttatactcgggaata |
31583154 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31583153 |
aaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca-atatatttctatcgttttatt |
31583102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 304
Target Start/End: Original strand, 30899470 - 30899618
Alignment:
| Q |
155 |
tttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatata |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
30899470 |
tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttatatccaggaataaaatttagaaaacttgtaacatacataagcatgta |
30899569 |
T |
 |
| Q |
255 |
cattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaa |
304 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30899570 |
tattaatatcatttg-ttcctaggaatctacgaatataacttgaaacaaa |
30899618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19089860 - 19089782
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| Q |
168 |
ttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19089860 |
ttttctttgggaaattttttctattcccaaaaacgttttatactcaagaataaaatttaataaacttataacaaacata |
19089782 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 247
Target Start/End: Original strand, 28023719 - 28023840
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| Q |
127 |
atgaatttattcccatctccat-aggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaattt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28023719 |
atgaatttattctcatcttcgtgagaaactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttatatgtgagaataaaattt |
28023818 |
T |
 |
| Q |
226 |
agtgaacttgtaacaaacatag |
247 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28023819 |
aatgaacttgtaacaaatatag |
28023840 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3913327 - 3913201
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ttttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaat |
281 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3913327 |
ttttttctattcctaa-aacattttatacct-ggaataaaatttagtaaatttgtaataaacatacacatgtatatttctatcgttttattcccaagaat |
3913230 |
T |
 |
| Q |
282 |
caacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
3913229 |
ctacgaatataacttgaaataaacgcacc |
3913201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41783749 - 41783624
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| Q |
182 |
ttttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaat |
281 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
41783749 |
ttttttctattttcagaaacattttatatccgagaataaaatttagtaaacttataacaaacatatgcgtgtacatttttatgattttaatcccaagaat |
41783650 |
T |
 |
| Q |
282 |
caacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41783649 |
ctataaatataacttgaaataaacac |
41783624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
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214 |
ggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttga |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
28429675 |
ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatgtatatttctatcattttatttctaagaatctacgaatataacttga |
28429759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
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147 |
ataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacata |
246 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||||||||| |
|
|
| T |
15200707 |
ataggaattttattcccac-ctgttctttgggaa-ttttttctat-cccagaaacattttatgcctgagaataaaatttaataaatttataacaaacata |
15200611 |
T |
 |
| Q |
247 |
ggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||||||| | | |||| | || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15200610 |
gacatatatatttatatcattttattttcaaaaatctataaatataacttgaaacaaacgcacc |
15200547 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
35603068 |
aatataaagatagaaattttattctaaagtattta--aaaaaaatgtttggttaacattttaatattccaaggaaccttaaaaatatggtatataatagg |
35602971 |
T |
 |
| Q |
117 |
taa |
119 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
35602970 |
taa |
35602968 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
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| Q |
174 |
ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
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16720348 |
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16720251 |
T |
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311 |
Q |
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| T |
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16720213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35602935 - 35602824
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298 |
Q |
| |
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| T |
35602935 |
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35602836 |
T |
 |
| Q |
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310 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
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|
| T |
35602835 |
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35602824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Original strand, 28429505 - 28429591
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaattt-aggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata |
102 |
Q |
| |
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| T |
28429505 |
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28429591 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36978268 - 36978210
Alignment:
| Q |
214 |
ggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
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36978268 |
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36978210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Original strand, 30899379 - 30899463
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata |
102 |
Q |
| |
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30899463 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8476602 - 8476308
Alignment:
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116 |
Q |
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T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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311 |
Q |
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| T |
8476402 |
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8476308 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11239414 - 11239120
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
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| T |
11239414 |
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11239315 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
11239314 |
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11239215 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
11239214 |
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11239120 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 26848799 - 26849093
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
26848799 |
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26848898 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
26848899 |
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26848998 |
T |
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| Q |
217 |
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311 |
Q |
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| T |
26848999 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
26849093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 40908043 - 40908336
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
40908142 |
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40908241 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
40908242 |
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40908336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47115151 - 47114855
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
47115151 |
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47115052 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
47115051 |
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47114952 |
T |
 |
| Q |
217 |
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313 |
Q |
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| T |
47114951 |
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47114855 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48340051 - 48339760
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
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| T |
48340051 |
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48339952 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
48339951 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccatgaacattttataccaagga |
48339852 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
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| T |
48339851 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
48339760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28124730 - 28124436
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
28124730 |
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28124631 |
T |
 |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
28124630 |
taaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttatattccgaggaacattttatacccggga |
28124531 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
28124530 |
ataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
28124436 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6231795 - 6231501
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
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aatataaagataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
6231695 |
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6231596 |
T |
 |
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217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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| T |
6231595 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
6231501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33218207 - 33217917
Alignment:
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
33218207 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
33218108 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
33218107 |
taaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatactcggga |
33218008 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
307 |
Q |
| |
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| T |
33218007 |
ataaaatttaataaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
33217917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 1098976 - 1099267
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
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| T |
1099076 |
taaa-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
1099174 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
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| T |
1099175 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacatagggatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31611279 - 31611004
Alignment:
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31611279 |
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T |
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117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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31611179 |
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31611080 |
T |
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| Q |
217 |
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292 |
Q |
| |
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|
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| T |
31611079 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattata |
31611004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 44952085 - 44952379
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
44952085 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattccttaggaa-cataaaaatagggattataatag |
44952183 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
44952184 |
gtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaagg |
44952283 |
T |
 |
| Q |
216 |
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311 |
Q |
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| T |
44952284 |
aataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
44952379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 20297570 - 20297864
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
20297570 |
aatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgtttggttgactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
20297669 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
20297670 |
taaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaagga |
20297769 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
20297770 |
ataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
20297864 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20414759 - 20414465
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
20414759 |
aatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgtttgattagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatagg |
20414660 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
20414659 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaatttttttttatttccaagaacattttatacccggga |
20414560 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
20414559 |
ataaaatttagtaaatttataacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
20414465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9320743 - 9320448
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattcc-aaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
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| T |
9320743 |
aatataaagatgagaattttattcctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatcataataa |
9320644 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
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| T |
9320643 |
gtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccacctttttccttaggaaattttttctattcccaggaatattttatacccggg |
9320544 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
9320543 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagtatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9320448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 24574344 - 24574646
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24574344 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagg |
24574443 |
T |
 |
| Q |
117 |
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208 |
Q |
| |
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| T |
24574444 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaattttttctatttccagaaacattttatcattttat |
24574543 |
T |
 |
| Q |
209 |
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308 |
Q |
| |
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|
| T |
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24574643 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccc |
311 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
24574644 |
ccc |
24574646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Original strand, 46359729 - 46359986
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46359729 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataatagg |
46359828 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
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| T |
46359829 |
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46359928 |
T |
 |
| Q |
217 |
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274 |
Q |
| |
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| T |
46359929 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcc |
46359986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43132450 - 43132157
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43132450 |
aatataaagatgagaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataatagg |
43132351 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||| | |
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| T |
43132350 |
t-aactatttatgaatttaatctcatctccgtgggaactctattcccacccttttccttgggaaaaaatttatattctcaggtacattttatacatgaaa |
43132252 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43132251 |
ataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatattcctattattttattctcgagaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
43132157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53166018 - 53165733
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53166018 |
aatataaagatgggtattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaaccttataatattcctaggaatcataaaaatagatattataatagg |
53165919 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
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|
| T |
53165918 |
taa-ctatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttcttggaaaaaattttctattcccagaaacattttatatccggga |
53165820 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaa |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53165819 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatattcctatcattttatttatgggaatcaacaaatataacttgaaacaa |
53165733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10823012 - 10822733
Alignment:
| Q |
16 |
caatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10823012 |
caatataaagatgagaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcttaggaaccatacaaatagggattattatag |
10822913 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
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| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
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| T |
10822912 |
at-aactatttatgattttattcccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggg |
10822814 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataactt |
296 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10822813 |
aattttttttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacacttctatcattttattcccggaaatcaacaaatataactt |
10822733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31436216 - 31435923
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31436216 |
aatataaagataggaattttattccaaggtatatagaaaaaacatgtttggttagttttataatatttcttggaatcataaaaataaggattataatagg |
31436117 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31436116 |
taa-ctacattagaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccaatttctttgggaaaatttttctattttcaggaacattttatacccagga |
31436018 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31436017 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
31435923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43719219 - 43718994
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
43719219 |
aatataaagttgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataag |
43719120 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| |
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|
| T |
43719119 |
taaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttatgccaagga |
43719025 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacatag |
247 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43719024 |
ataaattttaataaacttgtaacaaacatag |
43718994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12228548 - 12228254
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
12228548 |
aatataaagatgagaattttattctaaggtatttaaaaaaaatatgtttggttagttttatgatattcttaggaatcataaaaataagtattataataga |
12228449 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |
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|
| T |
12228448 |
taa-ctacatatgattttattctcatctccatgggaactttattctcac-cttttctttggaaatttttttctattcccagaaacattttgtacccgaga |
12228351 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12228350 |
ataaaatttagtaaacttgtaataaacataggcatatatatttctatcattttattcgcaggaattaacaactatattttaaaacaaacacacccat |
12228254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Original strand, 19532939 - 19533130
Alignment:
| Q |
34 |
tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt |
133 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
19532939 |
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19533037 |
T |
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226 |
Q |
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19533038 |
tattcccatctccaaggaaactttattcccacccttttccttggaaaaaaatttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta |
19533130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 29512377 - 29512546
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29512377 |
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29512476 |
T |
 |
| Q |
117 |
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187 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29512477 |
taaactatttatgaatttatt-ccatctctatgggaactttatttccacccttttccttgggaaatttttt |
29512546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1247186 - 1246912
Alignment:
| Q |
24 |
agatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaacta |
123 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |
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| T |
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1247088 |
T |
 |
| Q |
124 |
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223 |
Q |
| |
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| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |
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| T |
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1246990 |
T |
 |
| Q |
224 |
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301 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
1246989 |
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1246912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26849439 - 26849194
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26849439 |
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26849340 |
T |
 |
| Q |
117 |
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215 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| | | ||||||||||||||| ||| |||||||||| || |
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| T |
26849339 |
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26849241 |
T |
 |
| Q |
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272 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
26849240 |
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26849194 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28770500 - 28770210
Alignment:
| Q |
20 |
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119 |
Q |
| |
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|||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
28770500 |
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28770401 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
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| T |
28770400 |
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28770302 |
T |
 |
| Q |
220 |
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311 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||| |
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| T |
28770301 |
aaatttagtaaacttgtaccaaacatagacatgcatatttctatctttttattcccaggaatctacgaatataacttgaaagaaacacaccc |
28770210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Original strand, 32071256 - 32071472
Alignment:
| Q |
49 |
ttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccat |
148 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |
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| T |
32071256 |
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32071354 |
T |
 |
| Q |
149 |
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248 |
Q |
| |
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| |||||||||||| | |||||| || |||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
32071355 |
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32071449 |
T |
 |
| Q |
249 |
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272 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||||||||||| |
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| T |
32071450 |
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32071472 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2565744 - 2565453
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2565744 |
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2565656 |
T |
 |
| Q |
117 |
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214 |
Q |
| |
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||| |||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |
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| T |
2565655 |
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2565556 |
T |
 |
| Q |
215 |
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314 |
Q |
| |
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|||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |
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| T |
2565555 |
aaataaa-tttaacaaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataacttaaaacgaacacaccctta |
2565457 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12931119 - 12930945
Alignment:
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132 |
tttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaa |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |
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| T |
12931119 |
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12931021 |
T |
 |
| Q |
232 |
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308 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12931020 |
cttgtaacaaacatagccatatgcatttttatgattttattcccaacaatctacaa-tataacttgaaacaaacaca |
12930945 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33647886 - 33647703
Alignment:
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647886 |
tgaatttattctcatcttcaaggaaactttatttccactcttttctttggaaatttttttatattctcagaaacgttttatacccaggaataaaatttag |
33647787 |
T |
 |
| Q |
228 |
tgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647786 |
taaacttgtaacaaacatagagatgtatatttctaacgttttattcccgagaatctacgaatattacttgaaacaaacacaccc |
33647703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 309
Target Start/End: Original strand, 27823109 - 27823343
Alignment:
| Q |
74 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcc |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
27823109 |
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27823207 |
T |
 |
| Q |
174 |
ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| | | |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |
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|
| T |
27823208 |
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27823307 |
T |
 |
| Q |
274 |
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309 |
Q |
| |
|
|| ||| | | ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27823308 |
ccataaatttatgaatataacttgaaacaaacacac |
27823343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 24783986 - 24784276
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggtt-agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
24783986 |
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24784085 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
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|| || || || | ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||| | ||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||| |
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| T |
24784086 |
gt-aattacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcatacactttt-ctttgaaaaaactttatattcttatgaatattttata-ttagg |
24784182 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24784183 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaac--tgacatatgtatttttataattttattccaaaaaatctacaattataacttaaaacaaacacaccc |
24784276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6832216 - 6832114
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6832216 |
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6832117 |
T |
 |
| Q |
117 |
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119 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
6832116 |
taa |
6832114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Original strand, 49216077 - 49216179
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49216077 |
aatataaagatgggaattttattccaaggtatttagaaaaaatatgtttggttaaccttataaaattccaaagaaccttaaaaatatagattataatagg |
49216176 |
T |
 |
| Q |
117 |
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119 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
49216177 |
taa |
49216179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 40584388 - 40584669
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
40584388 |
aatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgtttggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaataggaaatataatagg |
40584487 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
| | || || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | |
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|
| T |
40584488 |
t-gattacacataattttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaacttttctat----------attttatatccgaaa |
40584576 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
40584577 |
ataaaatttaataaacttgtagaaaacatagacatatgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacttaaaacaaatacac |
40584669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38140662 - 38140425
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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||||||||| || |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
38140662 |
aatataaaggtgtgaattttattccaaggtatatagaaaaaagatgtttgattaacattataatattcctgggaacctaaaaaataaggattataatagg |
38140563 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaac--attttatacccag |
214 |
Q |
| |
|
||| || ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| | |
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|
| T |
38140562 |
-aaattacacatgaacttattctcatcttcat-ggaactttattctcacccttttctttggaaaaaaatttctattcctaggaacatattttatactcgt |
38140465 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatata |
254 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||||| |||||||||| | |||||| |
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| T |
38140464 |
caataaattatagtaaacttataacaaacattgacatata |
38140425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Original strand, 18460827 - 18460953
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128 |
tgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttag |
227 |
Q |
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|||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18460827 |
tgaatttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaacattttataccaaagaataaaatttag |
18460926 |
T |
 |
| Q |
228 |
tgaacttgtaacaaacataggcatata |
254 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18460927 |
taaacttgtaacaaacatagacatata |
18460953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 18460630 - 18460750
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
18460630 |
aatataaagatgagaatttgattacaaggtatttaaaagaaatatatttggttaactttataatattcata-gaaccataaaaacagggattataatcgg |
18460728 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcc |
139 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18460729 |
t-aactacatatgaatttattcc |
18460750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 253
Target Start/End: Original strand, 29512631 - 29512705
Alignment:
| Q |
179 |
aaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatat |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29512631 |
aaattttttctattccgatgaacattttatactcaggaataaaatttagtaaacttgaaacaaacgtaggcatat |
29512705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28139846 - 28139720
Alignment:
| Q |
185 |
tttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
28139846 |
tttctattcccaagaacgttttatatccgaaaataaaatttactaatcttgtaacaaacataagcatgtatatttctatctttttattcctaagaatata |
28139747 |
T |
 |
| Q |
285 |
caattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28139746 |
cgaatataacttgaaacaaacgcaccc |
28139720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43715370 - 43715308
Alignment:
| Q |
249 |
catatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43715370 |
catatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
43715308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 311
Target Start/End: Original strand, 45826723 - 45826847
Alignment:
| Q |
186 |
ttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaac |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || | ||| |||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
45826723 |
ttctattcccaggaacattttatatcatgaaataaaatttaataaacttgtaa-aaacatatgaatgcagatttctatcattttattccctggaatctac |
45826821 |
T |
 |
| Q |
286 |
aattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45826822 |
aacgataacttgaaacaaacacaccc |
45826847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 269
Target Start/End: Original strand, 27093957 - 27094044
Alignment:
| Q |
182 |
ttttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttt |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
27093957 |
ttttttctattcccataaacattttatacccgagaataagatatagtaaacttataacaaacataggcatatatatttcaatcatttt |
27094044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28693571 - 28693428
Alignment:
| Q |
166 |
tcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| ||||||||||| || || | |||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
28693571 |
tcttttctttgagaaaatttttctattctcaggatcgttttatactcatgaataaaatttaattgacttataacaaacataagcatacatatttttattt |
28693472 |
T |
 |
| Q |
266 |
ttttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28693471 |
ttttattctcgggaatctatgaatataacttgaaacaaacacac |
28693428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9320446 - 9320405
Alignment:
| Q |
245 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaaca |
286 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9320446 |
taggtatatacattcctatcattttattcccgagaatcaaca |
9320405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6832079 - 6832020
Alignment:
| Q |
187 |
tctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacatag |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6832079 |
tctattcccaggaatattttatacct-ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
6832020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 13642886 - 13643083
Alignment:
| Q |
54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||||| || | || | ||||||| ||| | ||| | || |
|
|
| T |
13642886 |
aaaaatctgtttggttaactttataatatt-caaggaaccttacaaatagagattataataggt-aattccacataattttattctcattttcatggaaa |
13642983 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaattta-gtgaacttgtaacaaacataggcata |
252 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13642984 |
ctttattc-caccattttttttggaaaaacttttctattcctaagaacattttataatcaagaacaaaaattaggttaacttgtaacaaacatagacata |
13643082 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39932631 - 39932529
Alignment:
| Q |
205 |
ttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggc--atatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaaca |
302 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
39932631 |
ttatatccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacatatatacatttctatcattttattcccatgaatttatgaatataacttgaaaca |
39932532 |
T |
 |
| Q |
303 |
aac |
305 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
39932531 |
aac |
39932529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 272
Target Start/End: Original strand, 33497768 - 33497889
Alignment:
| Q |
152 |
aactttattctcactcttttccttgggaaattttttct-attcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||| |||||| | |||| || ||||||||| || || |||||||||||| | || |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
33497768 |
aactttattctcacccttttctttaggatttttttttttattctcatgaacattttgtatcctagaataaaatttaataaatttgtaacaaatataagca |
33497867 |
T |
 |
| Q |
251 |
tatacattcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33497868 |
tgtatatttctatcattttatt |
33497889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55435488 - 55435392
Alignment:
| Q |
215 |
gaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
55435488 |
gaataaaatttaacaaacttgtaacaaacatgagaatgcatattcctatcattttattcccaggtatctacaaaaataacttgaaacaaatacaccc |
55435392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 27093806 - 27093892
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagg |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27093806 |
aatataaagatgtgaattttatttcaaggta-ttaagaaaaagatgtttgattaacaatataatattccaaggaacattaaaaatagg |
27093892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Original strand, 12108229 - 12108298
Alignment:
| Q |
155 |
tttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaattt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
12108229 |
tttattctcactattttt-ttgggaaattttttctattcctaaaaatattttatatccgagaataaaattt |
12108298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31267641 - 31267540
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||| || | | |||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31267641 |
aatataaagatgtgaatttcattttaaggtatttagaaaaaagatgtttagtcaacattataatatttccataaactttaaaaataaggattataatagg |
31267542 |
T |
 |
| Q |
117 |
ta |
118 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
31267541 |
ta |
31267540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 26085678 - 26085750
Alignment:
| Q |
202 |
attttatacccaggaataaaatttagtgaacttgt-aacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
26085678 |
attttatacccaaaaataaaatttagtaaacttgtaaaaaaacatagtcatgtatatttctatcactttattc |
26085750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 9115615 - 9115909
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115615 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
9115714 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9115715 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaagga |
9115814 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115815 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9115909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 46666486 - 46666780
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666486 |
aatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
46666585 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46666586 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
46666685 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666686 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
46666780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20260380 - 20260083
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260380 |
aatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttgcttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
20260281 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20260280 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
20260181 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260180 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccata |
20260083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25789541 - 25789834
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789541 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
25789640 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
25789641 |
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25789740 |
T |
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217 |
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310 |
Q |
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| T |
25789741 |
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25789834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 2430275 - 2430568
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
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| T |
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2430373 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
2430374 |
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2430473 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
2430474 |
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2430568 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12190471 - 12190177
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
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| T |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataatagg |
12190372 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
12190371 |
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12190272 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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|
| T |
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ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattcctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
12190177 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3572841 - 3572565
Alignment:
| Q |
35 |
ttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt |
134 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt |
3572742 |
T |
 |
| Q |
135 |
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234 |
Q |
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| T |
3572741 |
attcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaactt |
3572642 |
T |
 |
| Q |
235 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
3572641 |
gtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
3572565 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9832164 - 9831872
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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| T |
9832164 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
9832065 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
9832064 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttataccaagga |
9831965 |
T |
 |
| Q |
217 |
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309 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9831964 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
9831872 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 14788501 - 14788796
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14788501 |
aatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggcaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
14788600 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
14788601 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
14788700 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
312 |
Q |
| |
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| T |
14788701 |
atataatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctattattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccca |
14788796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 39930235 - 39930529
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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39930334 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
39930335 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaagga |
39930434 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
39930435 |
ataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39930529 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 52630551 - 52630845
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
52630551 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataatagg |
52630650 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
52630651 |
taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgaga |
52630750 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
52630751 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
52630845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 6911263 - 6911565
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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208 |
Q |
| |
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| T |
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6911462 |
T |
 |
| Q |
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308 |
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| T |
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6911562 |
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| T |
6911563 |
ccc |
6911565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 36361561 - 36361851
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
36361561 |
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36361660 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
36361661 |
taaactatttatgaatttactctcatctccatgggaactttattc-cccccttttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacctggga |
36361759 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
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| T |
36361760 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
36361851 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1597636 - 1597342
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataatagg |
1597537 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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| T |
1597536 |
taaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttcttggaaaaatttttctattcccaggaacattttatatccggga |
1597437 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
1597436 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 8331792 - 8332086
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17 |
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Q |
| |
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| T |
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8331891 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
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taaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgaaattttttttctattcccaggaacattttatacccggga |
8331991 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
8331992 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 32824699 - 32824992
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| |
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| T |
32824699 |
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32824798 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcc-ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
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| T |
32824799 |
taaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttcctttgggaaattttttctattcccaggaacaatttatacccgga |
32824898 |
T |
 |
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216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
309 |
Q |
| |
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| T |
32824899 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctattattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
32824992 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 2632631 - 2632924
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Q |
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2632631 |
aatataaatatgggaattttattccagcgaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
2632730 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
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311 |
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2632924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
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Target Start/End: Original strand, 39329406 - 39329680
Alignment:
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37 |
attccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttat |
136 |
Q |
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| T |
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39329505 |
T |
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| Q |
137 |
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236 |
Q |
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T |
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311 |
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39329680 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 6978550 - 6978842
Alignment:
| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
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| T |
6978550 |
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6978649 |
T |
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| Q |
119 |
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218 |
Q |
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T |
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311 |
Q |
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| T |
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6978842 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51445373 - 51445083
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
51445273 |
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51445175 |
T |
 |
| Q |
217 |
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308 |
Q |
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| T |
51445174 |
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51445083 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4683667 - 4683374
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| Q |
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116 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
4683567 |
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4683469 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
4683468 |
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4683374 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38964973 - 38964683
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
38964873 |
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38964774 |
T |
 |
| Q |
217 |
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307 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38964773 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5518797 - 5518504
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
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5518698 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
5518697 |
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5518599 |
T |
 |
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217 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
5518598 |
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5518504 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 35187234 - 35187528
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
35187334 |
taaactatttatgaacttattcttatctccatgggaactttattcccacccttctccttgggaaattttttctattcccacgaacattttataccaagga |
35187433 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35187434 |
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35187528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5806570 - 5806291
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
5806570 |
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5806471 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
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|
| T |
5806470 |
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5806382 |
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217 |
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311 |
Q |
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|
| T |
5806381 |
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5806291 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50191058 - 50190767
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| Q |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
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50190959 |
T |
 |
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117 |
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216 |
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| T |
50190958 |
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50190860 |
T |
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217 |
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309 |
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| |
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| T |
50190859 |
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50190767 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48916316 - 48916017
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa-tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
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| T |
48916316 |
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48916217 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
48916216 |
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48916118 |
T |
 |
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216 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
48916117 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattctctggaatcaacaaatataacttgaaataaacacacccttat |
48916018 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32202607 - 32202331
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
32202607 |
aatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
32202508 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
32202507 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccataaacattttataccaagga |
32202408 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
32202407 |
ttaaattttagt------------------agcatatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
32202331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49823190 - 49822917
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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| T |
49823190 |
aatataaagatgggaattttattccatggaatttagaaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
49823091 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
49823090 |
taaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctc-agaa---------------- |
49823008 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
49823007 |
----aatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
49822917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 106 - 311
Target Start/End: Original strand, 47037324 - 47037529
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106 |
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205 |
Q |
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| T |
47037324 |
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47037423 |
T |
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206 |
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305 |
Q |
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47037523 |
T |
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311 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
47037524 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37436913 - 37436630
Alignment:
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116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37436913 |
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37436814 |
T |
 |
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216 |
Q |
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| T |
37436813 |
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37436716 |
T |
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217 |
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302 |
Q |
| |
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|
| T |
37436715 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 13653629 - 13653917
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
13653729 |
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13653827 |
T |
 |
| Q |
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305 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| |
|
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| T |
13653828 |
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13653917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52699759 - 52699466
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116 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
52699659 |
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52699561 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
52699560 |
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52699466 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 29091450 - 29091738
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| Q |
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116 |
Q |
| |
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|
| T |
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29091549 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
29091550 |
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29091643 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
|
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| T |
29091644 |
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29091738 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 30240791 - 30241075
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| Q |
17 |
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Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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aatataaaaatggaaattttattccaaatatttaa--aaaaatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccataaaagtagggattataatagg |
30240888 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || ||| |
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|
| T |
30240889 |
taat-tacatataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcactcttttctttgggaatttttttctattcccaataactttttattccg-gga |
30240986 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30240987 |
ataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattaccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaac |
30241075 |
T |
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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Original strand, 47031637 - 47031758
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
47031736 |
T |
 |
| Q |
117 |
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47031737 |
taaactatttatgaatttattc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
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254 |
Q |
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|
||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |
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tttattctcaccctttttcttggtaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacctagacatata |
1007762 |
T |
 |
| Q |
255 |
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311 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tattcatatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 46960406 - 46960646
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
46960406 |
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T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
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|||| || | | |||||| | |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |
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| T |
46960506 |
gtaat-tacacacaattttatttc-atcttcatgggaactttattcccacccttttcattgggaaaacttttctattcccaggaacattttatacccggg |
46960603 |
T |
 |
| Q |
216 |
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258 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
46960604 |
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46960646 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 47677422 - 47677714
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| || || || | ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |
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| T |
47677522 |
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47677620 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
47677621 |
ataaaatttagtaaatttataacaaacacaaacatatgtatttttatgattttattcccg-gaatccacaaatataacgggaaacaaacacaccc |
47677714 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38519340 - 38519064
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130 |
Q |
| |
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|
| T |
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aattttattccaatgtatttagaaaaaagatgtttgtttaacattataatattcttggaaaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatga |
38519241 |
T |
 |
| Q |
131 |
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229 |
Q |
| |
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| T |
38519240 |
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38519144 |
T |
 |
| Q |
230 |
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309 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38519143 |
aacttgtaacaaacataagcatctgtatttctattgatttatttccaaaaatctacaaatataacttgaaacaaacacac |
38519064 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1228173 - 1227879
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa--tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1228173 |
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1228074 |
T |
 |
| Q |
115 |
ggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccag |
214 |
Q |
| |
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||| || | | || | ||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |
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| T |
1228073 |
ggt-aattctacataattttattctaatcttcatgggaactttattcccgaccttttctttcggaaatcttttctattccaagaaacattttatacctga |
1227975 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| || | |||||||| ||| |||||||||| |
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|
| T |
1227974 |
aaataaaatttaataaacttgtaacaagcataggcatatgtatttttatgattttattttcaagaatctacgaatataactt-aaaaaaacacaccc |
1227879 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17475502 - 17475360
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aatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtg |
229 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17475502 |
aatttactcccatctctattggaactttattcccactcttttctttgggaaattttatttattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
17475403 |
T |
 |
| Q |
230 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17475402 |
aacttataacaaacataaacatatatatttctatcgttttatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24116628 - 24116338
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Q |
| |
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| T |
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aatataaagatgagaattttatttcaaggtatatagaaaaaagatgtttgcttaacattaaaatatttttggaaaccataaaaataggaattataatagg |
24116529 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| || || ||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||| | | |||||| ||||||| | |||| |||| || |||| |||||||||| ||| |
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| T |
24116528 |
taat-tacacataaatatattctcatcttcatgggagctttattccctcccttttctttgggaattcttttttatttacaggaacgttttatacccggga |
24116430 |
T |
 |
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ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
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|
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24116429 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
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| Q |
19 |
tataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
118 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48462312 |
tataaagatgagaattatattccaaata-tttagaaaaaatatgtttggttaactttataatatttgtaggaaccataaaaataaggattataataggt- |
48462409 |
T |
 |
| Q |
119 |
aactatttatgaatttattcccatctccataggaactttat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48462410 |
aactatttatgaatttattcccaattccatgggaactttat |
48462450 |
T |
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tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1007566 |
tttattccaaagtatttaggaaaaatatgtttgattaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatt |
1007664 |
T |
 |
| Q |
134 |
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138 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
1007665 |
tattc |
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T |
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251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
13521234 |
aactttatttccacccttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacat |
13521333 |
T |
 |
| Q |
252 |
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311 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| || |||| | |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13521334 |
gtatatttctatcattgta-tcccaaaaatctacaaatataattagaaacaaacacaccc |
13521392 |
T |
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aactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19083264 |
aactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttataacaaacatagacat |
19083165 |
T |
 |
| Q |
252 |
atacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||| | |||| || | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083164 |
gtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccc |
19083105 |
T |
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152 |
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251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19131152 |
aactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttataacaaacatagacat |
19131053 |
T |
 |
| Q |
252 |
atacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||| | |||| || | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131052 |
gtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccc |
19130993 |
T |
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20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
31807038 |
ataaagatgaaaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgtttgcttaacattataatatttgcgggaaccataaaaat------tataatagataa |
31806945 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
31806944 |
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31806846 |
T |
 |
| Q |
220 |
aaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31806845 |
aaatttagtaaac--gtaacaaacataagcatgtatatttctatcattttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacaca |
31806759 |
T |
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tatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaattt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
11014626 |
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11014527 |
T |
 |
| Q |
226 |
agtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaa |
304 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11014526 |
attaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattcccaggaatctacatatataacttgaaacaaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #51
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54 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaa |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| | | || |||| |
|
|
| T |
9011416 |
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9011319 |
T |
 |
| Q |
154 |
ctttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaa-cattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcata |
252 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||| || ||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
9011318 |
ctttattccgacccttttctttgggaaaaattttcgattctcacgaaaccttttataccgaa-aataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatg |
9011220 |
T |
 |
| Q |
253 |
tacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9011219 |
tatattcctatcattttattttcaagaatctacgaatataacttgaaacaaac |
9011167 |
T |
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91 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25474033 |
aatataaagatgagaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaa |
25474107 |
T |
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249 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13932044 |
ggaaatttattcccacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc |
13931946 |
T |
 |
| Q |
250 |
atatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13931945 |
atatgtatttttatgattttattcctaggaatctacaaatataacttcaaacaaacacacc |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
13440186 |
gaattttatttcaagatatttagaaaaaaggtgttcggtgaacattataatattccatggaactttaagaatatggattataataggtagt-tacatatg |
13440284 |
T |
 |
| Q |
130 |
aatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaatttt-ttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagt |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| |||||| |||| | |||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13440285 |
aatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttctttggaatttttttttctattctcaggaacattttatactcgtgaataaaatttagt |
13440384 |
T |
 |
| Q |
229 |
gaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
275 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13440385 |
aaaattctaacaaacatagtcatttatatttctatcattgtattccc |
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T |
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tttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaa |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
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52186172 |
tttctattcccagaaacattttatcgtcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataagaaatcaa |
52186073 |
T |
 |
| Q |
285 |
caattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52186072 |
caaatataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Target: chr1; HSP #56
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89 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttc |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| | | ||||||| |||| ||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
20505213 |
gaaccataaaaatagggattataatatgtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaagctttattttcacctttttctttggtaatttttttt |
20505115 |
T |
 |
| Q |
189 |
t---attcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaac |
285 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
20505114 |
tcttattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctac |
20505015 |
T |
 |
| Q |
286 |
aattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
20505014 |
aaatataatttaaaacaaacgcacc |
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T |
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tttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatata |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
37261764 |
tttattctcaaccttttttttgggaaattttttctattcccaaaaagattttatgtcg-ggaataaaatttaataaacttgtaacaaacatatgcatgta |
37261862 |
T |
 |
| Q |
255 |
cattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||| | ||||| | | ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37261863 |
tatttctataattttattctcaggaatctatgaatataatttgaaacaaacgcacc |
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113 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||| | |||||||||| | ||||||| || ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
29769287 |
aatataaagatgtgaattttatttcaagatatttagaagaaaaaaaatgtttagttaacattataatatttcaaggaaccttagaaacatagattataat |
29769386 |
T |
 |
| Q |
114 |
aggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttg-ggaaattttttctattcccaagaacattttataccc |
212 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
29769387 |
aggtaat-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccctttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacattttatgtca |
29769485 |
T |
 |
| Q |
213 |
aggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatat |
253 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29769486 |
aagaataaaatttagtaattttgtaacaaacatagacatat |
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119 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19923754 |
ataaagatgagaattttattctaagatatttagaaaaaatatgtttgtttaacattataatgtttttgagaaccaaaaaagtagggattataataggtaa |
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T |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3939279 |
aatataaaaaagtgaattttattttaagatatttaaaaaaaacatgtttgattaacattataatattttaaggaact-taaaaatatagattataatagg |
3939377 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||| ||||| || | ||||| |||| || |||||| |||| || |||||||||||||||| || |||| || |||||| |
|
|
| T |
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taacc-atgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttgattcctacacttttctttgg-aatttttttctattcccaataatatttcatttccagga |
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T |
 |
| Q |
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ataaaatttag |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
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ataaaatttag |
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| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
37261597 |
aatataaatatgtgaattttattcttagatatttagaaaaaagatgtttggttaatattataatattccaaagaacgttaaaaatatggattataatagg |
37261696 |
T |
 |
| Q |
117 |
taa |
119 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
37261697 |
taa |
37261699 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
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Target Start/End: Complemental strand, 37336699 - 37336514
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154 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | | ||| |
|
|
| T |
37336699 |
aaaacatgtttggttaacattttaatattttaagaaaccataaaaatagagattataataggtaat-tatacatgaatttattctctccttcgtgaaaac |
37336601 |
T |
 |
| Q |
155 |
tttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaa |
241 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37336600 |
tttattcccactctattctttggaaagaaatttctattcccaataatattttatatctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
37336514 |
T |
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17 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
49627352 |
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49627451 |
T |
 |
| Q |
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gta |
118 |
Q |
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49627452 |
gta |
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T |
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Target: chr1; HSP #64
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297 |
Q |
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T |
 |
| Q |
298 |
aaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |
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| T |
19094172 |
aaacaaacacaccc |
19094185 |
T |
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Target: chr1; HSP #65
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202 |
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273 |
Q |
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|||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||| |
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3939503 |
atttcatacctaggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataagcatgtatatttctatcattctattc |
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T |
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Target: chr1; HSP #66
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20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
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ataaagaaaggaattttatgctaaggtatttaaagaaaatatgtttgcttaacatgataatattctcaggaacactaaaaataaggattataataggtaa |
13048461 |
T |
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Target: chr1; HSP #67
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| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13053557 |
ataaagaaaggaattttatgctaaggtatttaaagaaaatatgtttgcttaacatgataatattctcaggaacactaaaaataaggattataataggtaa |
13053458 |
T |
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Target: chr1; HSP #68
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Target Start/End: Original strand, 11077993 - 11078051
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| Q |
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235 |
Q |
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||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||| |
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| T |
11077993 |
ggaaaatttttctattcccaaaaacatgttatatccagaaataaaatttaataaacttg |
11078051 |
T |
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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 251
Target Start/End: Original strand, 52276879 - 52276930
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| Q |
198 |
gaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcat |
251 |
Q |
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|
|||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52276879 |
gaacattttatatcc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcat |
52276930 |
T |
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Target: chr1; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 13521102 - 13521198
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| || | | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13521102 |
aatataaagatgtgaattttatttcaagta-tttagaaaaaaggtgtttcgtgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataata |
13521198 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17475600 - 17475511
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttag-gaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
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|
| T |
17475600 |
ataaaaatggaaattttattccaaggtatttagaaaaaaagatgtttgcttaacattatgatattcccgggaactataaaaataggtatt |
17475511 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Original strand, 28735058 - 28735199
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133 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || || |||||||| || ||||||||||| | || |
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|
| T |
28735058 |
ttattctcatctttattggaactttattctcactcttttctttgagtttttttttcctattcctaaaaatattttatattcaaaaataaaatttaataaa |
28735157 |
T |
 |
| Q |
232 |
cttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28735158 |
cgtgtaaaaaatagaggaatacacatttatatcattttattc |
28735199 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52186262 - 52186175
Alignment:
| Q |
77 |
taatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcac |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
52186262 |
taatattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggt-aactatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccac |
52186175 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 1316796 - 1317096
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316796 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
1316895 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1316896 |
taaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaa-tttttctattcccaggaacattttatacctggga |
1316994 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccatata |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316995 |
ataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccatata |
1317094 |
T |
 |
| Q |
317 |
at |
318 |
Q |
| |
|
|| |
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|
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1317095 |
at |
1317096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 2657477 - 2657771
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| Q |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2657577 |
aaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
2657676 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657677 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
2657771 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 14170792 - 14171084
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14170792 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaatagg |
14170891 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14170892 |
taaactatttatgaatttatt-ccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-ggaaattttttctattcccaggaacattttatatccagga |
14170989 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170990 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatagattcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
14171084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7053872 - 7053570
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053872 |
aatataaatatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
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T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacatt--------ttat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
7053772 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttat |
7053673 |
T |
 |
| Q |
209 |
acccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7053672 |
acccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
7053573 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccc |
311 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
7053572 |
ccc |
7053570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 18897698 - 18897989
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataatagg |
18897797 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18897798 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaagga |
18897897 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897898 |
ataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcactttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
18897989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 16968702 - 16968989
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16968702 |
aatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataatagg |
16968801 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
16968802 |
taaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgaga |
16968901 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaa |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968902 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatagattcctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
16968989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 74 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7344320 - 7344083
Alignment:
| Q |
74 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttcc |
173 |
Q |
| |
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| T |
7344320 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
7344221 |
T |
 |
| Q |
174 |
ttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
273 |
Q |
| |
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|
| T |
7344220 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattc |
7344121 |
T |
 |
| Q |
274 |
ccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7344120 |
tcggaaatttacaattataatttgaaacgaacacaccc |
7344083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 8029080 - 8029297
Alignment:
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17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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8029179 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
8029180 |
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8029279 |
T |
 |
| Q |
217 |
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234 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||| |
|
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| T |
8029280 |
ataaattttagtaaactt |
8029297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10246410 - 10246266
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246410 |
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10246311 |
T |
 |
| Q |
117 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10246310 |
taaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
10246266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6706046 - 6705765
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
6706046 |
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6705959 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6705958 |
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6705860 |
T |
 |
| Q |
217 |
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311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6705859 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctaccattttattccaatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
6705765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 346126 - 345833
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| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcct-aggaa-ccataaaaatagggattataata |
114 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
346126 |
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346027 |
T |
 |
| Q |
115 |
ggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccag |
214 |
Q |
| |
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|| ||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |
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|
| T |
346026 |
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345928 |
T |
 |
| Q |
215 |
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308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | ||||| || | |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
345927 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttatttcctaggaatctacgaatataacttaaaacaaacaca |
345833 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14781901 - 14781626
Alignment:
| Q |
20 |
ataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | |
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|
| T |
14781901 |
ataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataatattcctgggaaccataaaagtaggatttataataggt-a |
14781803 |
T |
 |
| Q |
120 |
actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaata |
219 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14781802 |
attactcatgaatttattcccatctcc----taactt-----ccacccttttcttttggaaaaaatttctattcccatgagcattttatacctaggaata |
14781712 |
T |
 |
| Q |
220 |
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305 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| || | ||||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14781711 |
aaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtatgtatattcctattgttttaatcgcaggaatctacgaatataatttgaaacaaac |
14781626 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 8029316 - 8029404
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| Q |
223 |
tttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029316 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
8029404 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849784
Alignment:
| Q |
134 |
tattcccatctccataggaactttattctcactcttttcctt-gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaac |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||| |
|
|
| T |
10849961 |
tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac |
10849862 |
T |
 |
| Q |
233 |
ttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| | ||| | | |||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10849861 |
ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataacttgaaacaaacacacc |
10849784 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008035
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| Q |
126 |
tatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaattt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
21008208 |
tatgaatttattcccatctctatgagaactttattcccac-ctttttgtttgaattttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaattt |
21008110 |
T |
 |
| Q |
226 |
agtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaa |
300 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21008109 |
agtaaacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttgaaa |
21008035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7344788 - 7344723
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatat |
82 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344788 |
aatataaatatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatat |
7344723 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21008273 - 21008208
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatat |
82 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21008273 |
aatataaagatgagaattttattccaaggcatttagaaaaaatatgtttggttaactttataatat |
21008208 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 311
Target Start/End: Original strand, 3869391 - 3869576
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| Q |
125 |
ttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactc---ttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaa |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3869391 |
ttatgaatttattctcatcttcgtgggaactttattctcaccaccattttctttgggaaaacttttctattccattgaacattttatgcc----aataaa |
3869486 |
T |
 |
| Q |
222 |
atttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3869487 |
atttaatgaacatttaacaaacgtagtaatacatatttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataacttgaaacaaacacaccc |
3869576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9760497 - 9760376
Alignment:
| Q |
184 |
ttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatca |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || | | | |||||||||||| | ||| || |
|
|
| T |
9760497 |
ttttctattctcatgaacattttatatcctgaaataaaatttagtaaacttataacaaaaataggcatgtataattcgatcattttattctcaagagtct |
9760398 |
T |
 |
| Q |
284 |
acaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9760397 |
acaaagataacttgaaacaaac |
9760376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 8314685 - 8314773
Alignment:
| Q |
31 |
aattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| | |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314685 |
aattttattctaagatatttagaaaaaaaatgtttagttaacattataataattcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa |
8314773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 311
Target Start/End: Original strand, 8314874 - 8314984
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| Q |
201 |
cattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314874 |
cattttatatacgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgaatgtatgtttttatgattttattctcatgaatctagaattataacttgaaa |
8314973 |
T |
 |
| Q |
301 |
caaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |
|
|
| T |
8314974 |
caaacataccc |
8314984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10246255 - 10246220
Alignment:
| Q |
278 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246255 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccat |
10246220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9762332 - 9762232
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| Q |
19 |
tataaagatgggaattttattccaaggaatttagg-aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggt |
117 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9762332 |
tataaatatgtgaattttattcaaaggtatttagataaaaagatgattgggtaacattataatattctcatgaaccttaaaaataaagattataataggt |
9762233 |
T |
 |
| Q |
118 |
a |
118 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
9762232 |
a |
9762232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 201703 - 201996
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201703 |
aatataaagatgggaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
201801 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |
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|
| T |
201802 |
taaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaatattttatacccggaa |
201901 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201902 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
201996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 143390 - 143678
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaatttt-attccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
143390 |
aatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataatag |
143489 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
|
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|
| T |
143490 |
gtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccggg |
143588 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaac |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
143589 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcattttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
143678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 119100 - 119392
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119100 |
aatataaagatgtgaattttatttca-gatatttagaaaaaaggtgtttggtgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataatagg |
119198 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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|| || |||| ||||||| ||||| | | ||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || |
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| T |
119199 |
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119296 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc-gagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| T |
119297 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaaatctacaaatataatcagaaacaaacacaccc |
119392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29246 - 28957
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29246 |
aatataaagataggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataatagg |
29147 |
T |
 |
| Q |
117 |
taaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagga |
216 |
Q |
| |
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| T |
29146 |
aaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccggga |
29047 |
T |
 |
| Q |
217 |
ataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
306 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29046 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
28957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 4243 - 4539
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaata-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4243 |
aatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaaaatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataatag |
4342 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaa----actatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacc |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4343 |
gtaattacactattaat---tttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatact |
4439 |
T |
 |
| Q |
212 |
caggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4440 |
cgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
4539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3859 - 3565
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaata-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3859 |
aatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaaaatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataatag |
3760 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccagg |
215 |
Q |
| |
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| T |
3759 |
gtaat-tacacataattttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcggg |
3661 |
T |
 |
| Q |
216 |
aataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3660 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
3565 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23297
Alignment:
| Q |
89 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttc |
188 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
23517 |
gaaccttaaaaatagggattataataggtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccgttttctttggaaaaaaattta |
23419 |
T |
 |
| Q |
189 |
tattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaat |
288 |
Q |
| |
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| T |
23418 |
tattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctataattttattctcagaaatctacaaa |
23319 |
T |
 |
| Q |
289 |
tataacttgaaacaaacacacc |
310 |
Q |
| |
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||||| || |||||||| |||| |
|
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| T |
23318 |
tataatttaaaacaaacgcacc |
23297 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 385
Alignment:
| Q |
140 |
catctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaac |
239 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
556 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaatgttatttcattcccaggaacattttatatttaggaataaaatttaataaacttgcaac |
457 |
T |
 |
| Q |
240 |
aaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
456 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaagataacttgaaacaaacacaccc |
385 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0069 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:
Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21961 - 21853
Alignment:
| Q |
140 |
catctccataggaactttattctcactcttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttatacccaggaataaaatttagtgaacttgtaac |
239 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| || || || |||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |
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| T |
21961 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttttttgggaatgttatttcatacccaggaacattttatatctaggaataaaatttaataaacttgcaac |
21862 |
T |
 |
| Q |
240 |
aaacatagg |
248 |
Q |
| |
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||||||||| |
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| T |
21861 |
aaacatagg |
21853 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43387 - 43292
Alignment:
| Q |
17 |
aatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataa |
112 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |
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| T |
43387 |
aatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgtttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa |
43292 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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