View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3083_low_2 (Length: 638)

Name: NF3083_low_2
Description: NF3083
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3083_low_2
NF3083_low_2
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-638)||(10034590-10035225)
chr3 (1-638)||(9841445-9842080)
chr3 (1-627)||(10430898-10431523)
chr3 (1-638)||(10263288-10263923)
chr3 (1-638)||(10520072-10520707)
chr3 (1-627)||(10360658-10361283)
chr3 (1-560)||(10129509-10130068)
chr3 (18-638)||(9980070-9980688)
chr3 (1-416)||(10503169-10503584)
chr3 (1-410)||(10666053-10666462)
chr3 (1-409)||(10372916-10373324)
chr3 (1-421)||(9852326-9852746)
chr3 (78-612)||(11771898-11772429)
chr3 (78-612)||(11778856-11779387)
chr3 (367-638)||(9852830-9853099)
chr3 (1-467)||(10583100-10583566)
chr3 (366-623)||(10666487-10666742)
chr3 (194-625)||(10531561-10531989)
chr3 (200-591)||(10192882-10193272)
chr3 (194-566)||(10680359-10680731)
chr3 (200-591)||(10085962-10086352)
chr3 (1-410)||(10091381-10091784)
chr3 (74-410)||(10198339-10198666)
chr3 (367-638)||(10583535-10583805)
chr3 (433-627)||(10372768-10372961)
chr3 (367-565)||(10091948-10092146)
chr3 (367-565)||(10198830-10199028)
chr3 (444-623)||(10503681-10503857)
chr3 (13-173)||(10531260-10531420)
chr3 (13-122)||(10680059-10680167)
chr3 (13-122)||(13852822-13852931)
chr3 (227-338)||(13852588-13852699)
chr3 (367-407)||(10091810-10091850)
chr3 (367-407)||(10198692-10198732)
chr3 (529-576)||(8585531-8585578)
chr3 (367-466)||(9852761-9852860)
chr3 (66-103)||(10085907-10085944)
chr3 (372-417)||(10091884-10091929)
chr3 (66-103)||(10192827-10192864)
chr3 (372-417)||(10198766-10198811)
chr3 (213-325)||(13163782-13163894)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-638)||(54449-55084)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (1-575)||(26909475-26910049)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (71-591)||(17849815-17850338)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (247-591)||(44954552-44954896)
chr8 (13-421)||(11487628-11488036)
chr8 (76-118)||(44955024-44955066)
chr8 (367-404)||(11488052-11488089)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (213-325)||(143094-143206)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Original strand, 10034590 - 10035225
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10034590 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 10034689  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||      
T  10034690 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaagccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccaacttgagt 10034789  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| || ||||||||||||    
T  10034790 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtatctatatatcagggatttcgatgaaatgaagt 10034889  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||    |||   |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10034890 cctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaaactctctgtttttggaattgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttc 10034989  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||  |||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||   |||||  |  ||     
T  10034990 ctcgctgaaatcacttagattgtgggattgtaaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctcactgactctcttagggaactctgcatttggaattgc 10035089  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaac 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| || || ||    
T  10035090 ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgat-ag-ac 10035187  T
Q  601 aagttgtgttccagtttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10035188 aagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcct 10035225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Original strand, 9841445 - 9842080
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9841445 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaatgttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 9841544  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||  |||  | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||  |    
T  9841545 acctcccaaattacaatcaattgctatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtcaccaatatttgacggcactttcctacttgcga 9841644  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||||    
T  9841645 attgataagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtctctaaatatcagggatctctctgaaatgaagt 9841744  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| || |||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9841745 cctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaatatctcgatttttcgttttgtccacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 9841844  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||   |||||   |||||    
T  9841845 ctcgctgaaatcacttatattgtttcaatgtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgagcgtctgaacatttggggatgt 9841944  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaac 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||| ||||| || || ||    
T  9841945 ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattgctccaaaattgctcacatccctgtcatatggataaaccaccaagtcagaatatgat-ag-ac 9842042  T
Q  601 aagttgtgttccagtttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9842043 aagttgtgttcccgtttcaggtatgttccacagttcct 9842080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 10431523 - 10430898
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  10431523 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcaccgctcttgaaaagttgcatatgaaatgtcaaaagctgtcattttgtgaaggagtttgtct 10431424  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||| ||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10431423 acctcccaaattacaatcaatttggttttcatctcgaagaataactccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 10431324  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||    
T  10431323 attcaaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcactgatctctctgaaatgaagt 10431224  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatct-tgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctccctt 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| ||| ||  |||  |  ||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10431223 cctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaaactctctgtttttggt-tttgtgatcaacttgagacattgccagaaaactgcctccctt 10431125  T
Q  400 cctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatg 499  Q
    |||||||||||| |||| | ||||    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||     |||    
T  10431124 cctcgctgaaatcacttgatttgtggaaatgtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactgagaattagggaatg 10431025  T
Q  500 tccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaa 599  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |    
T  10431024 tccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatagatataaatgatgaagtcacaatatgat-ag-a 10430927  T
Q  600 caagttgtgttccag-tttcaggtatgtt 627  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10430926 caagttgtgttccagttttcaggtatgtt 10430898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Original strand, 10263288 - 10263923
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10263288 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggaaatgctcaccgctcttgaaaggttgtttctaacatgtgcagagttgtcattttctgaaggagtttgtct 10263387  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  10263388 acctcccaaattacaatcaattgagatttctacccaaaaaacaacaccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagcactttcctacttgact 10263487  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   | ||  |||||||  |||||||||||    
T  10263488 attcaaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttttgtatctacgtgtctttgatctctctgaaatgaagt 10263587  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||    ||| |   |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10263588 cctttgatggaaatgggcttcaacacctctcctctctccaatatctctgttttttcttttgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttc 10263687  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |  ||       ||     
T  10263688 ctcgctgaaatcacttctattgcttggatgtgaaaagctagagtcattaccagaagacagcctcccttcctctcttaaactactcgctatcgagttttgc 10263787  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaac 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  10263788 ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattagtccaaaattgctcacatccctttcataagaataaatgatgaagtcacaatatgat-ag-ac 10263885  T
Q  601 aagttgtgttccagtttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10263886 aagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcct 10263923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Original strand, 10520072 - 10520707
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10520072 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgactctagattgtgtagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 10520171  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||       
T  10520172 acctcccaaattgcaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccgacttgggt 10520271  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||  |||||||||||    
T  10520272 attgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgactctaactatcagggatctctctgaaatgaagt 10520371  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||  |||    |||    |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10520372 cctttgatggaaaagggcttcgtcacctctcctctctccaacgtctccgtttttgggattgtgaacaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttc 10520471  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    |||||||||||||||| | ||||    |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    ||||    
T  10520472 ctcgctgaaattacttgatttgtggaaatgtgaaaagcttaaatcattaccagaagacagcctccctgactctctgaagagactgctcatttgggaatgt 10520571  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaac 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||| || || ||    
T  10520572 ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatcccagtcatatcaataaattaccaagtcacaatatgat-ag-ac 10520669  T
Q  601 aagttgtgttccagtttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10520670 aagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcct 10520707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 10361283 - 10360658
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10361283 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacacgcttgccgctcttgaacggttgactctagattggccagagttgtcgttttgtgaaggagtttgtct 10361184  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||    ||| ||||||||  ||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||       
T  10361183 acctcccaaattacaatcaattatgatacagtccaaaagaacagcactgcctgtgacagaatggggtctccaatatttgacagcactttccaacttgggt 10361084  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||    
T  10361083 attggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccgtctcccttgtgtctctggaaatccatcatctctctgaaatgaagt 10360984  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| | |||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10360983 cctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaacatctcgtattttttgaatgtcgacagcttgagtcattaccagaaaactgcctcccttc 10360884  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||  ||| | | | ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |   ||     
T  10360883 ctcgctgaaatcacttacattttatggttgtgaaaagcttaaatcattaccagaagacagcctccctgactctcttaaggaactggacatctatgattgc 10360784  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaac 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||| || || ||    
T  10360783 ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattgctccaaaattgctcacatccccgtcataaaaataaacgaccaagtcacaatatgat-ag-ac 10360686  T
Q  601 aagttgtgttccag-tttcaggtatgtt 627  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  10360685 aagttgtgttcccgttttcaggtatgtt 10360658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 560
Target Start/End: Original strand, 10129509 - 10130068
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10129509 ttgaattatttgaagtcaagcttaagattgacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 10129608  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||    ||| ||||||||  |||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||| || |||||   |||||      
T  10129609 acctcccaaattacaatcaattgagatacagtccaaaagaacagcaccgcctgtgacagaatggggtcttcaagatttgaccgctctttcaagattgagt 10129708  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| || ||||||||||||    
T  10129709 attggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtatctatatatcagggatttcgatgaaatgaagt 10129808  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||    |||   |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10129809 cctttgatggaaatgggcttcgacacctcttctctctccaacatctcttcttttggaattgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttc 10129908  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcga-tgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatg 499  Q
    ||||||||||| |||| | || ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||    ||||    
T  10129909 ctcgctgaaatcacttgactt-ttgggattgtgaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgattctcttatgcaactgtgcattcaaggatg 10130007  T
Q  500 tccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccct 560  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10130008 tccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattgctccaaaattgctcacatccct 10130068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 638
Target Start/End: Original strand, 9980070 - 9980688
Alignment:
Q  18 aagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaat 117  Q
    |||||||||||||| |||||| | || |||||||  ||| || | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9980070 aagcttaagatggaaatgctctccgcccttgaaaatttgcatatgaaatgccaaaagttgtcattttctgaaggagtttgtctacctctcaaattacaat 9980169  T
Q  118 caattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgacaattgaaaagggtgatga 217  Q
    |||||  ||||||  || ||| ||||  |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||| ||||||||||||    
T  9980170 caattgtgatttctaccaaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagcacttttcgacttgagaattgtaaagggtgatga 9980269  T
Q  218 tatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatggg 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9980270 tatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgcatctacgtatctgtgatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatggg 9980369  T
Q  318 cttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttc 417  Q
    || |||||  ||||||||||| ||| |||    ||| |   ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9980370 ctgcgacacctctcctctctccaaagtctctgttttttgttttgtcaacaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttg 9980469  T
Q  418 aattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaag 517  Q
    |||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||   | | || |||||||||| ||||||    
T  9980470 aattttatgattgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgaatctcttaaggaactgtacatcgatggttgcccattgttagaagaaag 9980569  T
Q  518 gtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttccagttt 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||    
T  9980570 gtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatatcaataaattacaaagtcacaatatgat-ag-acaagttgtgttcccattt 9980667  T
Q  618 caggtatgttccacagttcct 638  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9980668 caggtatgttccacagttcct 9980688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Original strand, 10503169 - 10503584
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||  |||| |  |  | |||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10503169 ttgaatcatttgaagtcaagcttcagatgaacacgctcacggctcttgaagagttggacttggattgtcaggagttatcattttgtgaaggagtttgtct 10503268  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
     |||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||| | |  || ||| | ||||||||||  || || |||| || |||||   | ||| |    
T  10503269 tcctcccaaattacaatcaattgatatttggtcccaaagaacaacaactcctataatgaaatggggtcttgaagatctgaccgctctttcaagactgaaa 10503368  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10503369 attggagcaggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgcttcccatctcccttgcatctctatatatcagtgatctctatgaaatgaagt 10503468  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10503469 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 10503568  T
Q  401 ctcgctgaaattactt 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  10503569 ctcgctgaaattactt 10503584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 10666053 - 10666462
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10666053 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcactgctcttgaaaagttgattctaagatgtgcacagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 10666152  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||      
T  10666153 acctcccaaattacaaacaattgtgatttcatctcaaagaataactccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagcactttcctacttgagt 10666252  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     |||  | ||||    |  ||||||    
T  10666253 attgaaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatatcccttgtgtctctaacgttcagagctctctgcaatttgaagt 10666352  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||||||    |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10666353 cctttaatggaaatgggcttctacacctctcctctctcaaacgtcttgaatttgagtattgtcaacagctggagtcattaccagaaaactacctcccttc 10666452  T
Q  401 ctcgctgaaa 410  Q
     || ||||||    
T  10666453 atctctgaaa 10666462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10373324 - 10372916
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10373324 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcaccgctcttgaaaggttgagtttgggatgtcgagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 10373225  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| || |||  | || |||||||||||||||||| || | ||||| || ||    ||||      
T  10373224 acctctcaaattacaatcaatttggatttcatctcgaagaataacaccgccggttacggaatggggtctccaagatctaacagctctgtcaagcttgagt 10373125  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||||||| |||||  |||||||||||    
T  10373124 attagaaaggatgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgcatctacgtatcaattatctctctgaaatgaagt 10373025  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  10373024 cctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcaaaaatctctatttttttaattgtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctcccttc 10372925  T
Q  401 ctcgctgaa 409  Q
    ||| |||||    
T  10372924 ctctctgaa 10372916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 9852326 - 9852746
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9852326 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcaccgctcttgaagatttgcatatgaaatgccaaaagttgtcattttctgaaggagtttgtct 9852425  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    |||||||||||||  | |||||  ||||||  || ||| ||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||       
T  9852426 acctcccaaattaagaacaattgtgatttctaccaaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagctctttcatcattgtgg 9852525  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||  |||||||||||    
T  9852526 attgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctaaatatcatggttctctctgaaatgaagt 9852625  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||  | |||     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9852626 cctttgatggaaatgggcttcgacacctcttctctctccaatatctctattttgcgggttgtcaacagcttgggtcattgccagaaaactgcttcccttc 9852725  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaatt 421  Q
    ||| ||||||| |||| ||||    
T  9852726 ctcactgaaatcacttaaatt 9852746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 78 - 612
Target Start/End: Original strand, 11771898 - 11772429
Alignment:
Q  78 tcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||  ||||||| ||||| |||| | || || ||||||||||||||| |      
T  11771898 tcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaacttacaatcaattgtgagtttttcccaaataacaacaccaccagttacagaatggggtctccaaaacc 11771997  T
Q  178 tgacagcactttccttattgacaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatat 277  Q
      ||  | |||||   ||||   |||| ||| | |||| ||||||| | |||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||   |||  |||    
T  11771998 aaaccactctttcgaaattggttattggaaatgatgataatatagtcaccaccttgatgaaagagttgttgctgcctatctcccttgtggacctgtctat 11772097  T
Q  278 caatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtca 377  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||  | |||   ||||||| |||||| ||||||    
T  11772098 cattgatctctatgaaatgaagtcttttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaatatctctatttttggaattgtcaacagctcgagtca 11772197  T
Q  378 ttgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctctta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||       ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11772198 ttgccagaaaactgcctcccttcctcgttgaaatcactttcatttcaaatgtgtgaggagcttgagtcattaccggaagacagcctccccgactctctta 11772297  T
Q  478 agcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatga 577  Q
    |||||||   |||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11772298 agcaactgaccatttggggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaagaacattggtccaaaatcgctcacatccctgtcatagatataaatga 11772397  T
Q  578 cgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttcc 612  Q
      ||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  11772398 aaaagtcacaat---atgagaacaagctgtgttcc 11772429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 78 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 11779387 - 11778856
Alignment:
Q  78 tcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatt 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||| ||||| |||| | || || ||||||||||||||| |      
T  11779387 tcattttgtgaaagagtttgtctacctcccaaattacaatcaattgtgagtttttcccaaataacaacaccaccagttacagaatggggtctccaaaacc 11779288  T
Q  178 tgacagcactttccttattgacaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatat 277  Q
      ||  | |||||   | ||   |||| ||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||   |||  |||    
T  11779287 aaaccactctttcagaactggttattggaaatgatgataatatagtcaccaccttgatgaaggatttgttgctacctatctcccttgtggacctgtctat 11779188  T
Q  278 caatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtca 377  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  | |||   ||||||| |||||| ||||||    
T  11779187 cattgatctctatgaaatgaagtccttcgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaatatctctatttttggaattgtcaacagctcgagtca 11779088  T
Q  378 ttgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctctta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||       ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11779087 ttgccagaaaactgcctcccttcctcgttgaaatcactttcatttcaaatgtgtgaggagcttgagtcattaccggaagacagcctccccgactctctta 11778988  T
Q  478 agcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatga 577  Q
    |||||||   |||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11778987 agcaactgaccatttggggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaagaacattggtccaaaatcgctcacatccctgtcatagaaataaatga 11778888  T
Q  578 cgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttcc 612  Q
      ||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  11778887 aaaagtcacaat---atgagaacaagctgtgttcc 11778856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 367 - 638
Target Start/End: Original strand, 9852830 - 9853099
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9852830 agcttgagtcattaccagaaaactgcctcccatcatcgctgaaatcacttgaattgtggaaatgtgaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 9852929  T
Q  467 tgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcata 566  Q
    |||||| || |||  ||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9852930 tgactcactgaagagactggacatttatggatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcata 9853029  T
Q  567 tatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttccagtttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
     | ||||||||| | || ||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9853030 gaaataaatgaccaggttacaatatgat-ag-acaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcct 9853099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 467
Target Start/End: Original strand, 10583100 - 10583566
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| || | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10583100 ttgaattatttgaagtcaagtttaagatggaaatgctcaccgctcttgaaaatttgcatatgaaatgccaaaagttgtcattttctgaaggagtttgtct 10583199  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||   |||||| ||||  |||  | || ||||||||||||||| || || | ||||| |||||    | ||      
T  10583200 acctctcaaattacgatcaattgtgatttttacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcaaagatctaacagctctttcaagctggagt 10583299  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||    |||||  |||||||||||    
T  10583300 attggaaaggatgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatctggaatctctctgaaatgaagt 10583399  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||    ||| | | |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10583400 cctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaatatctctgttttttcatttgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttc 10583499  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcga-tgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccct 467  Q
    ||| ||||||| ||||  ||| | | || ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10583500 ctcactgaaatcactttcatt-tatggattgtgaaaagcttgggtcattaccagaagacagcctccct 10583566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 366 - 623
Target Start/End: Original strand, 10666487 - 10666742
Alignment:
Q  366 cagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctcc 465  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10666487 cagcttaagtcattaccagaagacagcctcccttcctcgctgaaatcacttgaattgtttgaatgtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctcc 10666586  T
Q  466 ctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcat 565  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10666587 ctgactctcttaaggaactgcacattgaggaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcat 10666686  T
Q  566 atatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttccagtttcaggta 623  Q
    ||  |||||| || |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  10666687 atcaataaattacaaagtcacaatatgat-ag-acgagttgtgttcctgtttcaggta 10666742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 625
Target Start/End: Original strand, 10531561 - 10531989
Alignment:
Q  194 attgacaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaa 293  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||   | |||||  ||||    
T  10531561 attgacagttggaacggttgatgatatagttaacaccgtgctgaacgagtcattgcttcccatctcccttgtgtctctatctattggtcatctctctgaa 10531660  T
Q  294 atgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcc 393  Q
    || ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10531661 ataaagtcatttgaaggaaatggacttcgacacctctcctctctcaaaaatcttcactttcttaattgcttggagcttgagtcattgccagaaaattgcc 10531760  T
Q  394 tcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtca-ttt 492  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |   | |||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||| | |    
T  10531761 tcccttcctcgctgaagtcacttcaattttcgagttgtgtaagacttgagtcattaccagaagacagcctcccttcctctctta---aactactcactat 10531857  T
Q  493 ttag--atgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaata 590  Q
      ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||  |  |||| |||||     
T  10531858 cgagttttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaaaattggtccaaaatttctcacatccctgtcataataataaacaagcaagttacaat- 10531956  T
Q  591 tcatgagaacaagttgtgttccagtttcaggtatg 625  Q
      ||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10531957 --atgaagacaagttgtgttcccgtttcaggtatg 10531989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 591
Target Start/End: Original strand, 10192882 - 10193272
Alignment:
Q  200 aattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaag 299  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || | ||||||    
T  10192882 aattgaaaaggatggtgatatagttaacaccttggtaaaagagccgttgctacccatctcccttgtgtctctgaatattggtgatctctataacatgaag 10192981  T
Q  300 tcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctccctt 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||| | ||||    
T  10192982 tcctttgatggaaatgggcttcaacacctctcctttctcg-aaatcttcactttcgtaattgtcaacaacttgagccatttcctgaaaattgcgttcctt 10193080  T
Q  400 cctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatg 499  Q
    |||||||||||| |||| || | |   | ||| |||  || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||  |||  |||  |    |     
T  10193081 cctcgctgaaatcacttgaaatttggagttgtgaaagacttgaatcattaccggaagactgcctccctgattctctgaagcgtctaagcatcgtattttt 10193180  T
Q  500 tccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatat 591  Q
     || ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  10193181 ccctttgttaaaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctctcattcctgtcataaaaataaatggcgaaatcacaatat 10193272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 566
Target Start/End: Original strand, 10680359 - 10680731
Alignment:
Q  194 attgacaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaa 293  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||   | |||||  ||||    
T  10680359 attgacagttggaacggttgatgatatagttaacaccgtgctgaacgagtcattgcttcccatctcccttgtgtctctatctattggtcatctctctgaa 10680458  T
Q  294 atgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcc 393  Q
    || |||||  |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||     ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10680459 ataaagtcacttgaaggaaatggacttcgacacctctcctctctcaaaaatcttaactttcttaattgctcggagcttgagtcatttccagaaaattgcc 10680558  T
Q  394 tcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttt 493  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||  ||  || ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||| | |    
T  10680559 tcccttcctcgctgaaatcacttcaatttttgagttgtgtaagacttgagttgttaccagaagacagcctcccttcctctctta---aactactcactat 10680655  T
Q  494 ta---gatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcata 566  Q
     |     || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10680656 caagttttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaatgaacatcggtccaaaatttctcacatccctgtcata 10680731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 591
Target Start/End: Original strand, 10085962 - 10086352
Alignment:
Q  200 aattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaag 299  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || | ||||||    
T  10085962 aattgaaaaggatggtgatatagttaacaccttggtaaaagagccgttgctaaccatctcccttgtgtctctgaatattggtgatctctataacatgaag 10086061  T
Q  300 tcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctccctt 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||| | ||||    
T  10086062 tcctttgatggaaatgggcttcaacacctctcctttctcg-aaatcttcactttcgtaattgtcaacaacttgagccatttcctgaaaattgcgttcctt 10086160  T
Q  400 cctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatg 499  Q
    |||||||||||| |||| || | |   | ||| |||  || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||  ||   |||  |    |     
T  10086161 cctcgctgaaatcacttgaaatttggagttgtgaaagacttgaatcattaccggaagactgcctccctgattctctgaagcgtctgagcatcgtattttt 10086260  T
Q  500 tccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatat 591  Q
     || ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  10086261 ccctttgttaaaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctctcattcctgtcataaaaataaatggcgaaatcacaatat 10086352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 10091381 - 10091784
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgt---gcagagttgtcattttgtgaaggagtttg 97  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||  |||||| || ||||| | ||||  ||| ||||||   | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10091381 ttgaattgtttaaagtcaagcttcagatgaactcgctcaccgcccttgagaagttgtttctgaaatgtcgaggagtgttgtcattttgtgaaggagtttg 10091480  T
Q  98 tctacctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattg 197  Q
    |||||||||||||||||||   |||   ||||  ||| ||| || || |||  | || |||||||||||||||||| || | ||  | ||||||  ||||    
T  10091481 tctacctcccaaattacaaaagattgttattttttccaaaaaaataacaccgccggttacggaatggggtctccaagatctaaccactctttccgaattg 10091580  T
Q  198 acaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatga 297  Q
    |  ||| || |||  | |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||| || | ||||    
T  10091581 atgattaaagaggcaggtgatatagttaacaacttggtgacggagtcgttgctacccatctcccttgtgtctctg---------gatctctataagatga 10091671  T
Q  298 agtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttct-taattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| | |||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10091672 agtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaacgtctcg-atttctgtcaatgtcgacagcttcagtcattgccagaaaactgcctcc 10091770  T
Q  397 cttcctcgctgaaa 410  Q
    ||||||||||||||    
T  10091771 cttcctcgctgaaa 10091784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 410
Target Start/End: Original strand, 10198339 - 10198666
Alignment:
Q  74 gttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||   ||||  ||| ||| || || |||  | || ||||||||||||||||||    
T  10198339 gttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaaaagattgttattttttccaaaaaaataacaccgccggttacggaatggggtctccaa 10198438  T
Q  174 tatttgacagcactttccttattgacaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctgg 273  Q
     || | ||  | ||||||  |||||  ||| || |||  | |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  10198439 gatctaaccactctttccgaattgatgattaaagaggcaggtgatatagttaacaacttggtgacggagtcgttgctacccatctcccttgtgtctctg- 10198537  T
Q  274 atatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttct-taattgtctacagcttg 372  Q
            |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| | |||||| | | |||| |||||||     
T  10198538 --------gatctctataagatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaacgtctcg-atttctgtcaatgtcgacagcttc 10198628  T
Q  373 agtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10198629 agtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaa 10198666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 367 - 638
Target Start/End: Original strand, 10583535 - 10583805
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 466  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | |||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10583535 agcttgggtcattaccagaagacagcctcccttcctcgctgaaatcacttcaatttgtgggttgtgtaagactcgagtcattaccagaagacagcctccc 10583634  T
Q  467 tgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcata 566  Q
    |||||||||| ||| |||   |||       || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10583635 tgactctcttgagcgactgaccatccaattttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaatgaatattggtccaaaattgctcacatccctgtcata 10583734  T
Q  567 tatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttccag-tttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
     | |||||| || |||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10583735 caaataaatcacaaagtcacaatatgat-ag-acaagttgtgttcccgttttcaggtatgttccacatttcct 10583805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 10372961 - 10372768
Alignment:
Q  433 aaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaagga 532  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||| |||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10372961 aaaagcttgagtcattaccagaagacagcctcccttcctctctgaagagactggtcattatgggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaagga 10372862  T
Q  533 acagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttccag-tttcaggtatgtt 627  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| || ||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10372861 acattggtccaaaattgctcacatccccgtcataaaaataaacgaccaaatcacaatatgat-ag-acaagttgtgttcccgttttcaggtatgtt 10372768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 565
Target Start/End: Original strand, 10091948 - 10092146
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 466  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  |   ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10091948 agcttgagtcatttccagacaactgcctcccgtcctcgctgaaatcacttagattgagtgattgtaaaatgcttgattcattaccagaagacagcctccc 10092047  T
Q  467 tgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcat 565  Q
    |   |||||||     ||   |||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10092048 ttcatctcttatcactctgtacattatgggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctcacatccctgtcat 10092146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 565
Target Start/End: Original strand, 10198830 - 10199028
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 466  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  |   ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10198830 agcttgagtcatttccagacaactgcctcccgtcctcgctgaaatcacttagattgagtgattgtaaaatgcttgattcattaccagaagacagcctccc 10198929  T
Q  467 tgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcat 565  Q
    |   |||||||     ||   |||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10198930 ttcatctcttatcactctgtacattatgggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctcacatccctgtcat 10199028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 444 - 623
Target Start/End: Original strand, 10503681 - 10503857
Alignment:
Q  444 tcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtcca 543  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||   ||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10503681 tcattaccagaagacagccttcctgattctcttaagctactgatcattcaaagatgcccaacattagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtcca 10503780  T
Q  544 aaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaacaagttgtgttccagtttcaggta 623  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||   ||||||||||   ||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  10503781 aaatttctcacatccctgtcatagaaatagatggacaagtcacaat---atgaggacaggctgtgttcccgtttcaggta 10503857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Original strand, 10531260 - 10531420
Alignment:
Q  13 aagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaatt 112  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||   |||| |||| | ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10531260 aagtcaagcttcggatggacacgctcactgctcttgaacaattgactctagattgtcccgagttgttattttgtgaaggaatttgtctacctcccaaatt 10531359  T
Q  113 acaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaa 173  Q
    ||||||||||  ||| || | ||||||| |||  ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10531360 acaatcaattgtgatatctttccaaagagcaacgccgcctgtaacagaatggggtctccaa 10531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 10680059 - 10680167
Alignment:
Q  13 aagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaatt 112  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||   | || |||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10680059 aagtcaagcttcggatggacacgctcactgctcttgaacaatagactctagattgtccagagttgttattt-gtgaaggagtttgtctacctcccaaatt 10680157  T
Q  113 acaatcaatt 122  Q
    ||||||||||    
T  10680158 acaatcaatt 10680167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13852931 - 13852822
Alignment:
Q  13 aagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaatt 112  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||| || ||||||||| ||||| |  |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13852931 aagtgaagcttcggatggacacgcttaccgctcttgaacggttggacttggaatgtcgagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcctaaatt 13852832  T
Q  113 acaatcaatt 122  Q
    ||||||||||    
T  13852831 acaatcaatt 13852822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13852699 - 13852588
Alignment:
Q  227 caccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaa 326  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||     ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  13852699 caccttgatgaaggagctgttgatacccatctcccttttgtctctgtttatcggcagtctctctgaaatgaagtctttcgatggaaatgggcttcgacat 13852600  T
Q  327 atctcctctctc 338  Q
     |||||||||||    
T  13852599 ctctcctctctc 13852588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 407
Target Start/End: Original strand, 10091810 - 10091850
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10091810 agcttgagtcattgccagaaaactgtctcccttcctcgctg 10091850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 407
Target Start/End: Original strand, 10198692 - 10198732
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10198692 agcttgagtcattgccagaaaactgtctcccttcctcgctg 10198732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 8585578 - 8585531
Alignment:
Q  529 aggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatg 576  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8585578 aggaacattggtccaacattgctcacatacctgtcataaatataaatg 8585531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Original strand, 9852761 - 9852860
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 466  Q
    ||||||||| | | |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  9852761 agcttgagttaattccagtaaactgcctcccatcatcgctgaaatcacttaaatttgttgattgtaagaagcttgagtcattaccagaaaactgcctccc 9852860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Original strand, 10085907 - 10085944
Alignment:
Q  66 tgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10085907 tgtggagagttgtcattttgtgaaggagtttgcctacc 10085944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 417
Target Start/End: Original strand, 10091884 - 10091929
Alignment:
Q  372 gagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttc 417  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  10091884 gagtcattaccagaaaactgcctccctttgtcgctgaaatcacttc 10091929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Original strand, 10192827 - 10192864
Alignment:
Q  66 tgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10192827 tgtggagagttgtcattttgtgaaggagtttgcctacc 10192864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 417
Target Start/End: Original strand, 10198766 - 10198811
Alignment:
Q  372 gagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttc 417  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  10198766 gagtcattaccagaaaactgcctccctttgtcgctgaaatcacttc 10198811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Original strand, 13163782 - 13163894
Alignment:
Q  213 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaa 312  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| || || || ||||||||| || ||||   | |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  13163782 gatgatattgttaacaccttgctgaaggagcggttgctgccaatttcacttgtgtctttgtatatttctaatctctgtgaaataaaatcctttgatggaa 13163881  T
Q  313 atgggcttcgaca 325  Q
    |||| || |||||    
T  13163882 atggactccgaca 13163894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 55084 - 54449
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||  ||| || | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  55084 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggaaatgctctccgcccttgaaaatttgcatatgaaatgccaaaagttgtcattttctgaaggagtttgtct 54985  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||  || ||| ||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||       
T  54984 acctctcaaattacaatcaattgtgatttctaccaaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaatatttgacagctcttttttttttgtgt 54885  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||  |||||||  |||||||||||    
T  54884 attgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgcatctacgtatctgtgatctctctgaaatgaagt 54785  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||    ||| |   ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54784 cctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaaagtctctgttttttgttttgtcaacaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttc 54685  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||   | | ||     
T  54684 ctcgctgaaatcacttgaattttatgattgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgaatctcttaaggaactgtacatcgatggttgc 54585  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatatcatgagaac 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || || ||    
T  54584 ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatatcaataaattacaaagtcacaatatgat-ag-ac 54487  T
Q  601 aagttgtgttccagtttcaggtatgttccacagttcct 638  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54486 aagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcct 54449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 26909475 - 26910049
Alignment:
Q  1 ttgaattatttgaagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtct 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||  | |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26909475 ttgaattatttaaagtgaagcttcggatggacacgctcacagatcttgaacagttgtatctggactgtcgagagttgtcattttgtgaaggtgtttgtct 26909574  T
Q  101 acctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||    |||  || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || | ||  | |||||   ||||||     
T  26909575 acctcccaacttacaatcaattgacctttggtctcaaataacaacaccgtctgttacggaatggtgtctccaagatctaaccactctttcagaattgact 26909674  T
Q  201 attgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagt 300  Q
    ||  || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||    
T  26909675 atcaaagagggtcatgatacatttaacaccttgatgaaggagttgttgctacccatctcccttgtttctctacaaatcatggatctctatgaaatgaagt 26909774  T
Q  301 cctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26909775 cctttgatggaaatgggcttcgacgcctctcctctctccaaaatcttcactttattaattgtgaacaactcaagtcatttccagaaaactgcctcccttc 26909874  T
Q  401 ctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgt 500  Q
    |||||||||||  |||||||| | | | ||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   || |  || |     ||     
T  26909875 ctcgctgaaatatcttcaattttatggctgtgagaaacttgagtcattaccagaagacagcctccccgactctcttgagatgctggaaatgtcatcttgc 26909974  T
Q  501 ccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatatatataaat 575  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26909975 ccattgttagaagaaaggtacaaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatacaaataaat 26910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 17850338 - 17849815
Alignment:
Q  71 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaa---ccatctgtaacggaatggggt 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||   |||| |||||||| |   ||  ||||||| |||||||||    
T  17850338 agagttgtcattttgtggaggagtttccctacctcccaagttacaatcaattgatattcattcccgaagaacaacagccccgcctgtaacagaatggggt 17850239  T
Q  168 ctccaatatttgacagcactttccttattgacaattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgt 267  Q
    ||||||    | || || ||||| | |||||   ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  17850238 ctccaaggcctaactgctctttcatcattgagtcttggaaaggatgatgatatagtgaacaccttgatgaaggagtcgttgctcccaatatccctcgtgt 17850139  T
Q  268 ctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctaca 367  Q
    |||||  ||||  | ||||| || |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||    
T  17850138 ctctgactatctgtcatctctataatctgaactcctttgatggaaatggacttcgacatctttcctctcttgaaagtcttgactttcttaactgtcaaca 17850039  T
Q  368 gcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccct 467  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| | |   |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17850038 acttgagtcattgccacaaaactgcctcccttcctcactgaaatcgcttgaattttgttattgtaaaagacttgagtcgttaccagaagacagcctccct 17849939  T
Q  468 gactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaaattgctcacatccctgtcatat 567  Q
      ||||||||||| ||| |||||||   |||| ||  | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17849938 tcctctcttaagcgactggtcatttggcgatgccctatattagaagaaaggtataaaaggcaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatag 17849839  T
Q  568 atataaatgacgaagtcacaatat 591  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||    
T  17849838 aaattgaggaccaagtcacaatat 17849815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 247 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 44954896 - 44954552
Alignment:
Q  247 tgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaat-ctcctctctcgaaaatc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  44954896 tgctacccatctcccttgtgtctctgactatcagttatctggatgaaatgaagtcctttcaaggaaatgggcttcaacacctactcctctctcgaaaatc 44954797  T
Q  346 ttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattacttcaattgtttcgatgtaaaaagctagagtc 445  Q
    |  | |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||    ||| || | || |||||    
T  44954796 tccactttcgtaactgtcaacagcttgagtcatttccagaaaactgtcttccttcctcgctgaaatcacttcaatttttgttttgtgaaga-cttgagtc 44954698  T
Q  446 attaccagaagacagcctccctgactctcttaagcaactagtcatttttagatgtccattgttagtagaaaggtataaaaggaaggaacagtggtccaaa 545  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| |||||||   |||| ||  | | || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44954697 gttaccagaagaaagcctccccaactctcttaatcgactggtcatttggcgatgccctgtatcagaagaaaggtatagaaggaaggaacattggtccaaa 44954598  T
Q  546 attgctcacatccctgtcatatatataaatgacgaagtcacaatat 591  Q
    |||||| | || | ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||    
T  44954597 attgctaaaattcatgtcatagaaatagatggccaagtcacaatat 44954552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 421
Target Start/End: Original strand, 11487628 - 11488036
Alignment:
Q  13 aagtcaagcttaagatggacatgctcacagctcttgaaaggttgaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaatt 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||   |||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  11487628 aagtcaaacttcggatggacatgctcactgctcttgaagttttgtctctgaattgtccagagttgtcattttgtgaagatgtttctctacctcccaaatt 11487727  T
Q  113 acaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaaaccatctgtaacggaatggggtctccaatatttgacagcactttccttattgacaattgaaaagggt 212  Q
    | ||||||||  |||||  ||  ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||| || || |||| || |||||    ||||| |||| |  ||||    
T  11487728 agaatcaattgagattttgtcggaaagatcaacgccgcctgttacggaatggggtctcaaagatctgaccgctctttcacggttgactattggagtgggt 11487827  T
Q  213 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  || | |  |||||||| ||| ||||||||    
T  11487828 gatgatatacttaacaccttgatgaagcagtcgttgctacccatctcccttgtgtctctgactatcgattgtcgctacaaaatgaagccctatgatggaa 11487927  T
Q  313 atgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatt 412  Q
     |||||||||| |  ||||||||||| || |||||  ||||     | ||  |||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||     
T  11487928 gtgggcttcgatacctctcctctctcaaagatctttcattttggtgtagtgaacactttgagtcattaccagaaaacttcctcccatcctcgctgatatc 11488027  T
Q  413 acttcaatt 421  Q
    |||| ||||    
T  11488028 acttaaatt 11488036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44955066 - 44955024
Alignment:
Q  76 tgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatc 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44955066 tgtcattttgtgaaggtgtttgcctacctcccaaattacaatc 44955024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 404
Target Start/End: Original strand, 11488052 - 11488089
Alignment:
Q  367 agcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcg 404  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11488052 agctcgagtcattgcctgaaaactgcctcccttcctcg 11488089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 143206 - 143094
Alignment:
Q  213 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctctggatatcaatgatctcaatgaaatgaagtcctttgatggaa 312  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| || || || ||||||||| || ||||   | |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  143206 gatgatattgttaacaccttgctgaaggagcggttgctgccaatttcacttgtgtctttgtatatttctaatctctgtgaaataaaatcctttgatggaa 143107  T
Q  313 atgggcttcgaca 325  Q
    |||| || |||||    
T  143106 atggactccgaca 143094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University