View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3086_high_1 (Length: 2580)
Name: NF3086_high_1
Description: NF3086
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3086_high_1 |
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| [»] scaffold0070 (7 HSPs) |
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| [»] scaffold0830 (2 HSPs) |
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| [»] scaffold1415 (1 HSPs) |
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 872; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 872; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 1744
Target Start/End: Complemental strand, 25324470 - 25322792
Alignment:
| Q |
63 |
tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca |
162 |
Q |
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| T |
25324470 |
tcatagatgacaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatctagacttatccgggaatca |
25324371 |
T |
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| Q |
163 |
tatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgga |
262 |
Q |
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| T |
25324370 |
tatac---ccaatcttcctaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggcaaaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttgga |
25324274 |
T |
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| Q |
263 |
aacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatc |
362 |
Q |
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| T |
25324273 |
aacatgagcaacttgctacaattttctctttctgggaataatataactggaccaatacctcctacattcaaaaggttgcagaaacttcaggttttgaatc |
25324174 |
T |
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| Q |
363 |
ttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtctt |
462 |
Q |
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| T |
25324173 |
ttagcaacaatggactacaaggatcatttattgaggaactttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctacaaaataataagctctctggagtttt |
25324074 |
T |
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| Q |
463 |
accaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagac |
562 |
Q |
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| T |
25324073 |
accaacatgtttgggaaatatgatttctcttataaggatacatgtaggatctaacagtttgaactctagaatacctttatctctttggaggcttagagat |
25323974 |
T |
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| Q |
563 |
atcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatc |
662 |
Q |
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| T |
25323973 |
atattagagataaatttttcatcaaattctttaattggtattcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtactattagaactatcaagaaatc |
25323874 |
T |
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| Q |
663 |
atatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcact |
762 |
Q |
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| T |
25323873 |
agatttcaagcaacattccaacaaccattaattccttattaacattgcagaatctctccttagcagataataaactgaatggttcaattcccaaatcact |
25323774 |
T |
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| Q |
763 |
tggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatc |
862 |
Q |
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| T |
25323773 |
tggtgaaatggtaagattaatctctttggacttgtccaaaaatatgttaacaggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatc |
25323674 |
T |
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| Q |
863 |
aacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggca |
962 |
Q |
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| T |
25323673 |
aacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacatttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgaagcactttgcggtg |
25323574 |
T |
|
| Q |
963 |
atcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaac |
1062 |
Q |
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| T |
25323573 |
atcctcgccttcaagtacctacatgtggtaagcaagttaagaaatggtccatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtcagc |
25323474 |
T |
|
| Q |
1063 |
cactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaaga |
1162 |
Q |
| |
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| T |
25323473 |
cattttggttgttgcatgcatcatacttttaaaacataataaaaggagaaagaatgaaaatactcttgaaaggggtttgtcaactttaggagctccaaga |
25323374 |
T |
|
| Q |
1163 |
agaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttc |
1262 |
Q |
| |
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| T |
25323373 |
agaatatcatattatgaacttttgcaagcaactaatggattaaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcagggaaagcttc |
25323274 |
T |
|
| Q |
1263 |
ctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgaca |
1362 |
Q |
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| T |
25323273 |
ttgatggtgagatgattgcagttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgtagaatgcaatgcaatgagaaatctacgaca |
25323174 |
T |
|
| Q |
1363 |
tcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatat |
1462 |
Q |
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| T |
25323173 |
tcgaaatctggtaaagattatcagtagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgttgacaaatggttatat |
25323074 |
T |
|
| Q |
1463 |
tcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtgg |
1562 |
Q |
| |
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| T |
25323073 |
tcaaataactattgtctaaatttcttacaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatacctgtgg |
25322974 |
T |
|
| Q |
1563 |
ttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatc |
1662 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25322973 |
ttcattgtgatctaaagccttccaatgtcttattggataaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaagctcatggatgaaggacaatc |
25322874 |
T |
|
| Q |
1663 |
taaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttctt |
1744 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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| T |
25322873 |
tcaaactcatacacaaactttggctactattggatatcttgcaccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattatctt |
25322792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 842; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 1730
Target Start/End: Complemental strand, 25697177 - 25695510
Alignment:
| Q |
63 |
tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca |
162 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |
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| T |
25697177 |
tcatatatgacaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcaaggaatca |
25697078 |
T |
|
| Q |
163 |
t-atactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgg |
261 |
Q |
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| T |
25697077 |
tcata-tatccaatcttcctaagtcaattggaaacctaacttcagaatactttacggcagaatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagttgg |
25696979 |
T |
|
| Q |
262 |
aaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattgga- |
360 |
Q |
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| T |
25696978 |
aaacatgagcaacttgctaactttggatctgtctgacaataatataaatggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaacttca-gcatttgag |
25696880 |
T |
|
| Q |
361 |
tcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtc |
460 |
Q |
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|||| | | ||||| | |||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
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| T |
25696879 |
tcttagcaacaatggattacaaggaccatttattgaagagctttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatcttgaaaataataagctttctggagtt |
25696780 |
T |
|
| Q |
461 |
ttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatag |
560 |
Q |
| |
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| T |
25696779 |
ttaccaacatgtttaggaaatatgatttctcttataaggataaatgtaggatctaacagtttaaactctagaatacctttatctctttggagtcttagag |
25696680 |
T |
|
| Q |
561 |
acatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaa |
660 |
Q |
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|
| T |
25696679 |
atatattagagataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaa |
25696580 |
T |
|
| Q |
661 |
tcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttca |
760 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25696579 |
tcagatttcaagcaacattccaacaaccattaattccttattaacattgcagaatctctccttagcagataataaactgaatggttcagttcccaaatca |
25696480 |
T |
|
| Q |
761 |
cttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaaca |
860 |
Q |
| |
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| T |
25696479 |
cttggtgaaatggtaagcttgatctctttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaaca |
25696380 |
T |
|
| Q |
861 |
tcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcgg |
960 |
Q |
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| T |
25696379 |
tcaacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacggttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgatgcactttgcgg |
25696280 |
T |
|
| Q |
961 |
caatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtca |
1060 |
Q |
| |
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| T |
25696279 |
tgatcctcgccttcaagtacctacatgtggtaagcaagttaagaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtca |
25696180 |
T |
|
| Q |
1061 |
accactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaa |
1160 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
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|
| T |
25696179 |
gccattttggttgttgcgtgcatcatacttttaaaacataataaaaggagaaagaatgaaaatactcttgaaaggggtttgtcaactttgggagctccaa |
25696080 |
T |
|
| Q |
1161 |
gaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagct |
1260 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25696079 |
gaagaatatcctattatgaacttgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcaggggaagct |
25695980 |
T |
|
| Q |
1261 |
tcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacga |
1360 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25695979 |
tcttgatggtgagatgattgccgttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaatctacga |
25695880 |
T |
|
| Q |
1361 |
catcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttat |
1460 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25695879 |
catcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttat |
25695780 |
T |
|
| Q |
1461 |
attcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagt |
1560 |
Q |
| |
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|
| T |
25695779 |
attcaaataactattgtctaagtttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccatcatggttcctcaataccagt |
25695680 |
T |
|
| Q |
1561 |
ggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaa |
1660 |
Q |
| |
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| T |
25695679 |
ggttcattgtgatctaaagccttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgcaaagctgatggatgaaggacaa |
25695580 |
T |
|
| Q |
1661 |
tctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttactt |
1730 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25695579 |
tctaaaactcatacacaaactttggctactgttggatacctcgcaccaggtcatttcttttcttttactt |
25695510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 825; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25454787 - 25453117
Alignment:
| Q |
72 |
acaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatc |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
25454787 |
acaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcagggaatcatata---tc |
25454691 |
T |
|
| Q |
172 |
caatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagc |
271 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25454690 |
caatcttcctaagtcaattggaaacctaacttcagaattcttcagggcagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatgagc |
25454591 |
T |
|
| Q |
272 |
aatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtatt-ggatcttggaacc |
370 |
Q |
| |
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|| || ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| | | | |
|
|
| T |
25454590 |
aacttgctatcttttgatctgtattacaataatataaatggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaatttca-gtatttggatcttagcagc |
25454492 |
T |
|
| Q |
371 |
aatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacat |
470 |
Q |
| |
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|
| T |
25454491 |
aatggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataagctctctggagttttaccaacat |
25454392 |
T |
|
| Q |
471 |
gtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttaga |
570 |
Q |
| |
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| T |
25454391 |
gtttgggaaatatgacttctattataaggataaatgtaggatctaacagtttaaactctagaatacctttatctctttggagtcttagagatatattaga |
25454292 |
T |
|
| Q |
571 |
actagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttca |
670 |
Q |
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| T |
25454291 |
gataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaatcagatttca |
25454192 |
T |
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Target: chr8; HSP #9
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Q |
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1440 |
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23258644 |
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1540 |
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T |
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1640 |
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1727 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 101 - 1434
Target Start/End: Complemental strand, 25312775 - 25311445
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T |
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300 |
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T |
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400 |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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1000 |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 855 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25801303 - 25800413
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 874 - 1744
Target Start/End: Complemental strand, 25686656 - 25685783
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|
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Q |
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|
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Q |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1029 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25647863 - 25647147
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| |
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|
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Q |
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| Q |
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1328 |
Q |
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| T |
25647663 |
ggagcatttggatctgtttatcaggggaagcttcttgatggtgagatgattgcagttaaagtaattgatttacaatcagaggcaaaatcaaagagctttg |
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T |
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| Q |
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atgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagtt |
1428 |
Q |
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| T |
25647563 |
atgcagaatgtaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaatctggtaaagattatcagaagttgatcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagtt |
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T |
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catgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattg |
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Q |
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25647364 |
T |
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1529 |
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1628 |
Q |
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25647363 |
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T |
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| Q |
1629 |
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1728 |
Q |
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25647263 |
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T |
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1729 |
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1745 |
Q |
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| T |
25647163 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 410 - 1520
Target Start/End: Original strand, 24874054 - 24875157
Alignment:
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T |
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609 |
Q |
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| T |
24874154 |
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T |
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Q |
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24874353 |
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710 |
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809 |
Q |
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24874354 |
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T |
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909 |
Q |
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T |
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1009 |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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1207 |
Q |
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| T |
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24874844 |
T |
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| Q |
1208 |
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1307 |
Q |
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| T |
24874845 |
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T |
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| Q |
1308 |
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1407 |
Q |
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| T |
24874945 |
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24875044 |
T |
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| Q |
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1507 |
Q |
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| T |
24875045 |
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24875144 |
T |
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| Q |
1508 |
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1520 |
Q |
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atagatgctgcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1182 - 1725
Target Start/End: Original strand, 24912446 - 24912988
Alignment:
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1381 |
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| T |
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1481 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
1482 |
atttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcc |
1581 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 63 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 25393106 - 25392331
Alignment:
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262 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
|
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462 |
Q |
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| T |
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25392710 |
T |
|
| Q |
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562 |
Q |
| |
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| T |
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accaacatgtttgggaaatatgatttctcttataaggataaatgtaggatctaacagtttcaactctagaatacctttatctctttggagtctaagagat |
25392610 |
T |
|
| Q |
563 |
atcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatc |
662 |
Q |
| |
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| T |
25392609 |
ttattagagataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattatacgattagacctatcaagaaatc |
25392510 |
T |
|
| Q |
663 |
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762 |
Q |
| |
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| T |
25392509 |
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25392410 |
T |
|
| Q |
763 |
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Q |
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| T |
25392409 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2393
Target Start/End: Complemental strand, 25322718 - 25322075
Alignment:
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1864 |
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| |
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T |
|
| Q |
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1964 |
Q |
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| T |
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25322519 |
T |
|
| Q |
1965 |
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2064 |
Q |
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| T |
25322518 |
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T |
|
| Q |
2065 |
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2164 |
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| T |
25322418 |
ttgatgatctatcgactcacatatcatctatttttagtttagccctgagttgttgtgaagattcacctaaagcaagaatcaatatggcagatgttattgc |
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T |
|
| Q |
2165 |
gtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttc---atttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatg |
2261 |
Q |
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| T |
25322318 |
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T |
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| Q |
2262 |
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2348 |
Q |
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25322218 |
tcttgctacttctggtttgtcctttcaactgt-cttcattgttgtatgagaatgaagttggctatctccttaatatatttccttttgcttttaaagaaat |
25322120 |
T |
|
| Q |
2349 |
cgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgt |
2393 |
Q |
| |
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cgactagtgaataaggatcatcacagaagcatgtaaattgtgtgt |
25322075 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2316
Target Start/End: Complemental strand, 25452978 - 25452503
Alignment:
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1939 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
1940 |
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2039 |
Q |
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| T |
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25452779 |
T |
|
| Q |
2040 |
ttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaa |
2139 |
Q |
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| T |
25452778 |
ttagtccaacaaattggggaacaaattgatgacatattgacttacatgtcatctatttttggtttagccctgaattgttgtgaagattcacctgaagcaa |
25452679 |
T |
|
| Q |
2140 |
gaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgtgtgggatgtttt |
2239 |
Q |
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| T |
25452678 |
gaattaatattgcagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggttcttagcgcaagcagggtctagttagtttcatttgtgtgggatgtttt |
25452579 |
T |
|
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2240 |
caatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattga |
2316 |
Q |
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25452578 |
caatatggtttcttgattaatgtcttgcttcttctggtttgtccattcaatttt-cttcatcgttgtatgagattga |
25452503 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1811 - 2322
Target Start/End: Original strand, 24875468 - 24875976
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1910 |
Q |
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24875564 |
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2010 |
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2110 |
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24875764 |
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2210 |
Q |
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24875865 |
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2308 |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 1765 - 2322
Target Start/End: Complemental strand, 25685709 - 25685152
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1964 |
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2064 |
Q |
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2165 |
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2260 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2221
Target Start/End: Complemental strand, 25715255 - 25714799
Alignment:
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1864 |
Q |
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1964 |
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Q |
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2164 |
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2221 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1803 - 2222
Target Start/End: Original strand, 24913108 - 24913527
Alignment:
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1902 |
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2002 |
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24913307 |
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24913407 |
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2103 |
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2202 |
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24913408 |
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24913507 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 1765 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25490264 - 25489800
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1962 |
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2162 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 1838 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25647031 - 25646642
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2037 |
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| T |
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2137 |
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2227 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 1765 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25604699 - 25604237
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1964 |
Q |
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T |
|
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gttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaa |
2064 |
Q |
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|
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ttgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgc |
2164 |
Q |
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T |
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gtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt |
2227 |
Q |
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ttcactaatcaaaatcaagactttggttgttggcgcaaacgcagtctagttattttcatttgt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25569878 - 25569506
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Q |
| |
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T |
|
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tgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaatt |
2054 |
Q |
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25569778 |
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2055 |
ggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaag |
2154 |
Q |
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| T |
25569678 |
ggggaacaaattgatgacatattgatttacatgtcatctatttttggtttagccctgaattgttgcgaagattcacctgaagcaagaattaatattgcag |
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T |
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2155 |
atgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt |
2227 |
Q |
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atgttattgcgtcgttaatcaaaatcaagactttgattcttagcgcaagcagggtctagttattttcatttgt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1811 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25341012 - 25340599
Alignment:
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1910 |
Q |
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| T |
25341012 |
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25340916 |
T |
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| Q |
1911 |
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2010 |
Q |
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| T |
25340915 |
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25340816 |
T |
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| Q |
2011 |
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2110 |
Q |
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| T |
25340815 |
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25340716 |
T |
|
| Q |
2111 |
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2210 |
Q |
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| T |
25340715 |
gaaatgttgagaagattcacctgaagcaagaattaatattgcagatgttattgcgtcgttaatcaaaatcaagactttgattcttagcgcaagcagggtc |
25340616 |
T |
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| Q |
2211 |
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2227 |
Q |
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|
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| T |
25340615 |
tagttattttcatttgt |
25340599 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25695426 - 25694960
Alignment:
| Q |
1765 |
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1860 |
Q |
| |
|
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|
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acatgttatattagtaattgatgtgtacacagtatggatctaagctttattttttaagaatatttatttataaatagtagtaactattattaacatgcag |
25695327 |
T |
|
| Q |
1861 |
aatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatat |
1960 |
Q |
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| T |
25695326 |
agtatggttctagaggaattgtttctgtgaaaggagacgtgttcagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatat |
25695227 |
T |
|
| Q |
1961 |
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2060 |
Q |
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| T |
25695226 |
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25695127 |
T |
|
| Q |
2061 |
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2160 |
Q |
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| T |
25695126 |
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25695027 |
T |
|
| Q |
2161 |
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2227 |
Q |
| |
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| T |
25695026 |
ttgcgacgctaatcaaaatcaacactttggttgttcgcgcaaacacagtctagttattttcatttgt |
25694960 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25475247 - 25474875
Alignment:
| Q |
1855 |
atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga |
1954 |
Q |
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| T |
25475247 |
atgcagagtatggatctaaaggaattgtttctgtgaaaggagatgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatcttaacaagaaaaaagccaacaga |
25475148 |
T |
|
| Q |
1955 |
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2054 |
Q |
| |
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| T |
25475147 |
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25475048 |
T |
|
| Q |
2055 |
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2154 |
Q |
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| T |
25475047 |
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25474948 |
T |
|
| Q |
2155 |
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2227 |
Q |
| |
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| T |
25474947 |
atgttattaagtcgctaatcaaaatcaagactttggttcttagagcaaacagggtatagttattttcatttgt |
25474875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25800273 - 25799886
Alignment:
| Q |
1840 |
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1939 |
Q |
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| T |
25800273 |
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25800174 |
T |
|
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1940 |
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2039 |
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| T |
25800173 |
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25800074 |
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| Q |
2040 |
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2139 |
Q |
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| T |
25800073 |
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25799974 |
T |
|
| Q |
2140 |
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2227 |
Q |
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| T |
25799973 |
gaatcaatatggcagatgttattgcgacgctaatcaaaatcaagactttggttgttggtgcaaacacagtctagttattttcgtttgt |
25799886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2189
Target Start/End: Complemental strand, 23257908 - 23257574
Alignment:
| Q |
1855 |
atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga |
1954 |
Q |
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| T |
23257908 |
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23257809 |
T |
|
| Q |
1955 |
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2054 |
Q |
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| T |
23257808 |
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23257709 |
T |
|
| Q |
2055 |
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2154 |
Q |
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| T |
23257708 |
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23257609 |
T |
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| Q |
2155 |
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2189 |
Q |
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| T |
23257608 |
atgttattgcgtcactcatcaaaatcaagactttg |
23257574 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1483 - 1719
Target Start/End: Complemental strand, 25490594 - 25490358
Alignment:
| Q |
1483 |
tttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcct |
1582 |
Q |
| |
|
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| T |
25490594 |
tttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatgcctgtggttcattgtgatctaaagcct |
25490495 |
T |
|
| Q |
1583 |
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1682 |
Q |
| |
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| T |
25490494 |
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25490395 |
T |
|
| Q |
1683 |
tggctactattggataccttgccccaggtcatttctt |
1719 |
Q |
| |
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| T |
25490394 |
tggctactgttggatacctcgcaccaggtcatttctt |
25490358 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2225
Target Start/End: Original strand, 22901228 - 22901598
Alignment:
| Q |
1855 |
atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga |
1954 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22901228 |
atgcagagtacggaactaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtatacagctatgggattatgctaatggaaatctttacaagaagaaagccaacaga |
22901327 |
T |
|
| Q |
1955 |
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2054 |
Q |
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| T |
22901328 |
tgatatgtttgtagaagacctaactttgaagacatggatcagtgaatcattgcctaattcaattatggatgtcttggattctaggttagtccaacaaaat |
22901427 |
T |
|
| Q |
2055 |
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2154 |
Q |
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| T |
22901428 |
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22901527 |
T |
|
| Q |
2155 |
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2225 |
Q |
| |
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| T |
22901528 |
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22901598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 63 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 25653118 - 25652552
Alignment:
| Q |
63 |
tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca |
162 |
Q |
| |
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| T |
25653118 |
tcatagatgacaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttcattgacaaattgtagatatttgacatatcttgacttatcaggtaatca |
25653019 |
T |
|
| Q |
163 |
tatactatcca---atcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagtt |
259 |
Q |
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| T |
25653018 |
tatactacccaccaatcttcctaagtcaattggaaatataacttcagaatacatcagggcagaatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagtt |
25652919 |
T |
|
| Q |
260 |
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359 |
Q |
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| T |
25652918 |
ggaaacatgagcaacttgttatattttaatcttcatgggaataatataactggaccaatacctggtacattcaaagagttgcagaaacttca-gtatttg |
25652820 |
T |
|
| Q |
360 |
a-tcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggag |
458 |
Q |
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| T |
25652819 |
aatcttggcaacaatggactacaaggatcatttattgaggaactttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctacaaaataataagctctctggag |
25652720 |
T |
|
| Q |
459 |
tcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcat |
558 |
Q |
| |
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| T |
25652719 |
ttttaccaacatgtatgggaaatatgatttctcttagaagaataaatgtaggatctaacagtttaaactctagaatacctttatctctttggagtcttag |
25652620 |
T |
|
| Q |
559 |
agacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatt |
626 |
Q |
| |
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| T |
25652619 |
agatatattagagataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatt |
25652552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1547 - 1741
Target Start/End: Original strand, 24875157 - 24875351
Alignment:
| Q |
1547 |
tcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactca |
1646 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24875157 |
tcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagccttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgcaaagctca |
24875256 |
T |
|
| Q |
1647 |
tggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacatttt |
1741 |
Q |
| |
|
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| T |
24875257 |
tggatgaaggacaatctgaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgcaccaagtcatttcttctctttaacttcctgacatttt |
24875351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1947 - 2222
Target Start/End: Complemental strand, 25385937 - 25385662
Alignment:
| Q |
1947 |
ccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtcc |
2046 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |
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| T |
25385937 |
ccaacagatgatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtcgatcattgcctaattccattatggaggtcatggattcaaatttagtcc |
25385838 |
T |
|
| Q |
2047 |
aacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaa |
2146 |
Q |
| |
|
|| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||| || |||||| | ||| |||||| || |
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|
| T |
25385837 |
aaataactggggaccaaattgattatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagccttgagttgttgtgaagattcacttgaagcaagaatcaa |
25385738 |
T |
|
| Q |
2147 |
catggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttca |
2222 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25385737 |
tatggcagatgttattgcgacgctaatcaaaatcaacactttggttgttggcgcaaacacagtctagttattttca |
25385662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25807063 - 25806843
Alignment:
| Q |
63 |
tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca |
162 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||| |
|
|
| T |
25807063 |
tcatatatgacaacaatttgacaatatatgattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaagtatctagacttatcagggaatca |
25806964 |
T |
|
| Q |
163 |
tatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgga |
262 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25806963 |
tatac---ccaatcttcctaagtcaattggaaacataagttcagaatacatcagggcagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttgga |
25806867 |
T |
|
| Q |
263 |
aacatgagcaatttactatctttt |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
25806866 |
aacatgagcaaattgctatttttt |
25806843 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 24872813 - 24873026
Alignment:
| Q |
73 |
caacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatcc |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || |
|
|
| T |
24872813 |
caacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacgaattgtagatatttgaaatatcttgacttatcagggaatcatgtactaccc |
24872912 |
T |
|
| Q |
173 |
aatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24872913 |
aatcttccaaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggcaaaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatgacca |
24873012 |
T |
|
| Q |
273 |
atttactatctttt |
286 |
Q |
| |
|
| || |||| |||| |
|
|
| T |
24873013 |
acttgctatatttt |
24873026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 2080 - 2322
Target Start/End: Original strand, 24885571 - 24885813
Alignment:
| Q |
2080 |
ctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaat |
2179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24885571 |
ctcacatgtcatctatttttagtttagccctgagttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatacggcagatgttattgcgtcgctaatcaaaat |
24885670 |
T |
|
| Q |
2180 |
caagactttggctcttggcacaaacacagtctagttatttt-catttgtgt--gggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttg |
2276 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| | | | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
24885671 |
caaggctttggttcttggcgcaaacagggtctagttattttccttttgtataagtggagttttcaatattgtttttgaattgatggcttgct-ctt-ttg |
24885768 |
T |
|
| Q |
2277 |
tttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca |
2322 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24885769 |
tttgtcctttcaatttt-ctttgttgttgtatgagattggagtaca |
24885813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 2011 - 2189
Target Start/End: Complemental strand, 29429348 - 29429171
Alignment:
| Q |
2011 |
attcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctct |
2110 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
29429348 |
attcaattatggaggtcttagactctaattgagtccaacagaatggggaacaaattgatgacatattgacatacatgccttctatttttggtttagtcct |
29429249 |
T |
|
| Q |
2111 |
gaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttg |
2189 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29429248 |
gaattgttgtgaatgttcgcctaaaacaagaattaatatggtggatgttattgggt-gctaatcaaaatcaagactttg |
29429171 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2393
Target Start/End: Complemental strand, 25799854 - 25799672
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca |
2322 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
25799854 |
tttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcctttcaactgt-cttcattgttgtatgagaatgaagttgg |
25799756 |
T |
|
| Q |
2323 |
ctatttc-------------ctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgt |
2393 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25799755 |
ctatttccttaacatattttcttttgcttttaaagaaatcgactagtgaataaggatgatcacagaagcatgtaaatggtgtgt |
25799672 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2429
Target Start/End: Complemental strand, 25694841 - 25694738
Alignment:
| Q |
2324 |
tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgtgatgttttcatgtatatgttgtatcccttc |
2423 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
25694841 |
tatttccttttgcttttaaagaaatcgactagtgaataaggatcatcacagaagcatgtaaatcgtgtgtactgtatcca--tttatgttgtatcccctc |
25694744 |
T |
|
| Q |
2424 |
tcaatt |
2429 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
25694743 |
tcaatt |
25694738 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 25340535 - 25340434
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca |
2322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25340535 |
tttgtgtgggatgttttcaatatggtttttggatttatgtcttgcttcttctggtttgtcttttcaatttt-cttcatcgtt---tgagattgaagtaca |
25340440 |
T |
|
| Q |
2323 |
ctattt |
2328 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
25340439 |
ccattt |
25340434 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 25569442 - 25569338
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca |
2322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25569442 |
tttgtgtgggatgttttcaatatggtttttggatttatgtcttgcttcttctggtttgttctttcaatttt-cttcatcgttgtttgagattgaagtaca |
25569344 |
T |
|
| Q |
2323 |
ctattt |
2328 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
25569343 |
ccattt |
25569338 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2326 - 2429
Target Start/End: Complemental strand, 25489687 - 25489586
Alignment:
| Q |
2326 |
tttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgtgatgttttcatgtatatgttgtatcccttctc |
2425 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25489687 |
tttccttttgcttttaaagaaatcgactagtgaataaggatcaacacagaagcatgtaaatcgtgtgtattgtatcca--tttatgttgtatcccctctc |
25489590 |
T |
|
| Q |
2426 |
aatt |
2429 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
25489589 |
aatt |
25489586 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2282
Target Start/End: Complemental strand, 25489767 - 25489708
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtc |
2282 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25489767 |
tttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtc |
25489708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2393
Target Start/End: Complemental strand, 25604099 - 25604030
Alignment:
| Q |
2324 |
tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgt |
2393 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25604099 |
tatttccttttgcgtttaaagaaatcaactagtgaataaggatcatcacagaagcatgtaaatcgtgtgt |
25604030 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2232 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 25646600 - 25646505
Alignment:
| Q |
2232 |
gatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtacactattt |
2328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25646600 |
gatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttctggtttgtcctttcaaccgt-cttcgttgttgtatgagatggaagtacattattt |
25646505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2274
Target Start/End: Complemental strand, 25694929 - 25694878
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttct |
2274 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25694929 |
tttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttct |
25694878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2236 - 2282
Target Start/End: Original strand, 24913522 - 24913568
Alignment:
| Q |
2236 |
ttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtc |
2282 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24913522 |
ttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcctgtttgtc |
24913568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 29429070 - 29428965
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttgga-ttgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtac |
2321 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||| || ||| |||||||||| |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
29429070 |
tttgtatgggatgttttcaatattgcttttggatttgatgtcttgctccttttagtttgttctttcaaattt-cttcattgttgcatgaaattgtagtac |
29428972 |
T |
|
| Q |
2322 |
actattt |
2328 |
Q |
| |
|
| ||||| |
|
|
| T |
29428971 |
attattt |
29428965 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2404
Target Start/End: Complemental strand, 25474725 - 25474645
Alignment:
| Q |
2324 |
tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgtgatgttttcat |
2404 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25474725 |
tatttcctttaactgttaaaagaatcaactagtgcataaggatcatatcacaagcatgtaaatcatgtgtgatgttttcat |
25474645 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25477475 - 25477406
Alignment:
| Q |
78 |
atttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctaga |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | ||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25477475 |
atttaacaatagatgattcacatcagttctttaactccttgacaagttgtagatatttgaaatatctaga |
25477406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2286
Target Start/End: Complemental strand, 25604205 - 25604143
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtctttt |
2286 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
25604205 |
tttgtgtttgatgttttcaatattg-ttttgtattgatgtcttgctacttctggttggtccttt |
25604143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2361
Target Start/End: Complemental strand, 25385579 - 25385542
Alignment:
| Q |
2324 |
tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaata |
2361 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25385579 |
tatttccttttgcttttaaagaaatcgactagtgaata |
25385542 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2268
Target Start/End: Complemental strand, 25474811 - 25474766
Alignment:
| Q |
2223 |
tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgct |
2268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25474811 |
tttgtgtgggatgttttcaatatgctttttggatttatgtcttgct |
25474766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 810; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0070
Description:
Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 810; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 1725
Target Start/End: Original strand, 15293 - 16948
Alignment:
| Q |
69 |
atgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatact |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
15293 |
atgacaacaaattgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatcttgacttatcagggaatcatgtact |
15392 |
T |
|
| Q |
169 |
atccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatg |
268 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15393 |
atccaatattccaaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggtagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatg |
15492 |
T |
|
| Q |
269 |
agcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtatt-ggatcttgga |
367 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15493 |
agtaacttattgcatttttctctttctaggaataatataactggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaacttca-gtatttggatcttggc |
15591 |
T |
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| Q |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: scaffold0830; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 4506 - 4929
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T |
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Target: chr4 (Bit Score: 713; Significance: 0; HSPs: 2)
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Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 713; E-Value: 0
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1071 |
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T |
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T |
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Q |
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Target: chr4; HSP #2
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1415 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1415
Description:
Target: scaffold1415; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
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173 |
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272 |
Q |
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743 |
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T |
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371 |
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643 |
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545 |
T |
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Q |
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T |
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571 |
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345 |
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671 |
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T |
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771 |
Q |
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244 |
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145 |
T |
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772 |
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871 |
Q |
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144 |
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45 |
T |
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| Q |
872 |
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Q |
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44 |
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8 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 755 - 1667
Target Start/End: Original strand, 16885380 - 16886292
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
16885380 |
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16885479 |
T |
|
| Q |
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954 |
Q |
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| T |
16885480 |
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16885579 |
T |
|
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955 |
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1054 |
Q |
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| T |
16885580 |
ttgtggaagtgctaggttagaagtgcctccatgtgataaacaaagtaggaaaaagtcaatgaaaaagatgttattaatcaaaatcttattgcctataatt |
16885679 |
T |
|
| Q |
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1151 |
Q |
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| T |
16885680 |
gtgatagccattttggttgtcctatgcataattcttctaa---tgcataaaaagaaaaaagttgaaaatccacttgaaatgggtttatcaactgatttag |
16885776 |
T |
|
| Q |
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gagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatca |
1251 |
Q |
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| T |
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gggttccaagaaggatttcatattatgaacttgtgcaagcaactaatggatttagcgagagtaacttacttggaaaggggggcttcggctctgtgtatca |
16885876 |
T |
|
| Q |
1252 |
gggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgaga |
1351 |
Q |
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| T |
16885877 |
gggaatgctttctaccgggaagatggtagcaattaaagtacttgacttgaatatggaagcaacatcaagaagttttgacgcagaatgcaatgcaatgcgc |
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T |
|
| Q |
1352 |
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1451 |
Q |
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| T |
16885977 |
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16886076 |
T |
|
| Q |
1452 |
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1551 |
Q |
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| T |
16886077 |
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16886176 |
T |
|
| Q |
1552 |
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1651 |
Q |
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| T |
16886177 |
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16886276 |
T |
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| Q |
1652 |
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1667 |
Q |
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16886277 |
gaaggacattctaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 16886728 - 16886836
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1957 |
Q |
| |
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| T |
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cagagtatggatctaagggagtcatttctattaaaggagatgtgtacagttatggagtaatgctaatggaaatcttcacaggaaagaagccaacaaatga |
16886827 |
T |
|
| Q |
1958 |
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1966 |
Q |
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| T |
16886828 |
aatgtttgt |
16886836 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
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Target Start/End: Original strand, 16885227 - 16885309
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684 |
Q |
| |
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|
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| T |
16885227 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1101 - 1675
Target Start/End: Original strand, 5119004 - 5119578
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1200 |
Q |
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| T |
5119004 |
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5119103 |
T |
|
| Q |
1201 |
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1300 |
Q |
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| T |
5119104 |
attcagtgacagtaatttacttggaagaggtggttttggatccgtgtataatggaatgctttctagtgggaagatgatagcaattaaagtacttgacttg |
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T |
|
| Q |
1301 |
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1400 |
Q |
| |
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| T |
5119204 |
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5119303 |
T |
|
| Q |
1401 |
ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaag |
1500 |
Q |
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| T |
5119304 |
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5119403 |
T |
|
| Q |
1501 |
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1600 |
Q |
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| T |
5119404 |
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5119503 |
T |
|
| Q |
1601 |
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1675 |
Q |
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| T |
5119504 |
gaagatatggttgcacatgttagtgattttgggatttccaagctcttggatgaaggacaatcaaaaactcataca |
5119578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1101 - 1675
Target Start/End: Original strand, 5101445 - 5102019
Alignment:
| Q |
1101 |
ataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtgg |
1200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |
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|
| T |
5101445 |
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5101544 |
T |
|
| Q |
1201 |
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1300 |
Q |
| |
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| T |
5101545 |
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5101644 |
T |
|
| Q |
1301 |
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1400 |
Q |
| |
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| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||| ||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| |
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| T |
5101645 |
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5101744 |
T |
|
| Q |
1401 |
ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaag |
1500 |
Q |
| |
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| T |
5101745 |
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5101844 |
T |
|
| Q |
1501 |
tatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggat |
1600 |
Q |
| |
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| T |
5101845 |
cataatgatagatgtggcatcagcattggagtatctccatcatggttctttaataccagtggttcattgtgacttgaagcctgctaatgtgttattggat |
5101944 |
T |
|
| Q |
1601 |
gaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcataca |
1675 |
Q |
| |
|
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| T |
5101945 |
gaaaatatgattgcacatgttagtgattttgggatttccaagctcttggatgaaggacaatcaaaaactcataca |
5102019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1166 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 5080464 - 5079906
Alignment:
| Q |
1166 |
atttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctg |
1265 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||| |||| |||| || |
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|
| T |
5080464 |
atttcctattctgaacttgtgcaagcaactaatggatttagtgagactaatttactaggaaagggtggctttggatctgtgtatcaaggaatgctttcta |
5080365 |
T |
|
| Q |
1266 |
atggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcg |
1365 |
Q |
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| T |
5080364 |
gtgggaagatggtagcaattaaagtacttgacttgaaattggaagcaacaacaaaaagctttaatgcagaatgcaatgctatgcgcaatcttcggcatcg |
5080265 |
T |
|
| Q |
1366 |
aaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattca |
1465 |
Q |
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| T |
5080264 |
aaatcttgttgagatcatcaccagttgttcaaatgttaatttcaggtctttggtaatggagttaatgtcaaatggaagcttggaaaaatggttatacact |
5080165 |
T |
|
| Q |
1466 |
gattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttc |
1565 |
Q |
| |
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| T |
5080164 |
gataactattttttaggtttcttgcaaagattgactataatgatagatgtggcatctgcattggagtatcttcatcatggttcttcaataccagtggttc |
5080065 |
T |
|
| Q |
1566 |
attgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaa |
1665 |
Q |
| |
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| T |
5080064 |
attgtgatttgaagcctagcaatgtgttactggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttgggatttcaaagctcttggatgatggacaatctaa |
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T |
|
| Q |
1666 |
aactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctctt |
1724 |
Q |
| |
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| T |
5079964 |
agctcatactcagactttagctacaattggttatgttgcaccaggtaatttcttctctt |
5079906 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 957
Target Start/End: Original strand, 5118215 - 5118869
Alignment:
| Q |
303 |
atttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaact |
402 |
Q |
| |
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| T |
5118215 |
atttaaatggatcaatccctggtgtaattaaagggttacataaacttcaatatttagatcttggttacaatggactgcaaggatccatgattgatgagct |
5118314 |
T |
|
| Q |
403 |
ttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggta |
502 |
Q |
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602 |
Q |
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Q |
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Q |
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902 |
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5118814 |
T |
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5118815 |
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5118869 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 299 - 979
Target Start/End: Original strand, 5100652 - 5101332
Alignment:
| Q |
299 |
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398 |
Q |
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| T |
5100652 |
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497 |
Q |
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5100850 |
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Q |
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5100950 |
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697 |
Q |
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5100951 |
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5101050 |
T |
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| Q |
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797 |
Q |
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5101051 |
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5101150 |
T |
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| Q |
798 |
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897 |
Q |
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5101151 |
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5101250 |
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| T |
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taatggaggacctttcaaaaaattcacatctcaatctttcatgcataatgaagcactttgtggcagttctcacttacaagta |
5101332 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 5081303 - 5080676
Alignment:
| Q |
330 |
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429 |
Q |
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| T |
5081303 |
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5081204 |
T |
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| Q |
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528 |
Q |
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| T |
5081203 |
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5081105 |
T |
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| Q |
529 |
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628 |
Q |
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| T |
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5081005 |
T |
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| Q |
629 |
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728 |
Q |
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| T |
5081004 |
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5080905 |
T |
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| Q |
729 |
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828 |
Q |
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| T |
5080904 |
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5080805 |
T |
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| Q |
829 |
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928 |
Q |
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| T |
5080804 |
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5080705 |
T |
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| Q |
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957 |
Q |
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| T |
5080704 |
gaatctttcatgaataatgaagcactttg |
5080676 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1890 - 1965
Target Start/End: Complemental strand, 5079794 - 5079719
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| Q |
1890 |
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1965 |
Q |
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| T |
5079794 |
aaaggagatgtgtatagctttggaataatgctaatggaaatcttcacaggaaagaagccaacagatgaaatgtttg |
5079719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1890 - 1964
Target Start/End: Original strand, 5120124 - 5120198
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| Q |
1890 |
aaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt |
1964 |
Q |
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| T |
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aaaggagatgtgtacagctatgggataatgctaatggaaatgttcaccggaaagaagccaacaaatgaaatgttt |
5120198 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1890 - 1936
Target Start/End: Original strand, 5102499 - 5102545
Alignment:
| Q |
1890 |
aaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcac |
1936 |
Q |
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5102499 |
aaaggagatgtgtacagctatgggataatgctaatggaaatgttcac |
5102545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 3e-93; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1101 - 1675
Target Start/End: Complemental strand, 14412840 - 14412266
Alignment:
| Q |
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1200 |
Q |
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| T |
14412840 |
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14412741 |
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1300 |
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14412740 |
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14412641 |
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1301 |
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1400 |
Q |
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| T |
14412640 |
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14412541 |
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1500 |
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14412540 |
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14412441 |
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1501 |
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1600 |
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| T |
14412440 |
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14412341 |
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1675 |
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| T |
14412340 |
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14412266 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 741 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 14413197 - 14413021
Alignment:
| Q |
741 |
atggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatc |
840 |
Q |
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| T |
14413197 |
atggatctattccaaaatcacttggtgaaatgttaagcttaagtttcttggacttgtctcaaaatcttttaaccggtgtgatcccaaaatccttagagct |
14413098 |
T |
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| Q |
841 |
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917 |
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| T |
14413097 |
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14413021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1858 - 1964
Target Start/End: Complemental strand, 14412033 - 14411927
Alignment:
| Q |
1858 |
cagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatga |
1957 |
Q |
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| T |
14412033 |
cagagtatggatctaaaggagtcatttctgttaaaggagatgtgtacagctatgggataatgctaatggaactgttcaccggaaagaagccaacaaatga |
14411934 |
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1958 |
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1964 |
Q |
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14411933 |
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14411927 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14413635 - 14413439
Alignment:
| Q |
303 |
atttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaact |
402 |
Q |
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| T |
14413635 |
atttaaatggatcaatccctggttcaattaaagggttacataaacttcaatctttagaacttggttacaatagactacaaggatccatgattgatgagct |
14413536 |
T |
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| Q |
403 |
ttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaag |
499 |
Q |
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| T |
14413535 |
ttgtgaaattaagagtttgagtgagttatatttaataagcaataagctttttggagtgttaccaacatgtttgggaaatatgacttcacttagaaag |
14413439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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