View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3086_low_1 (Length: 2580)

Name: NF3086_low_1
Description: NF3086
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3086_low_1
NF3086_low_1
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (63-1744)||(25322792-25324470)
chr8 (63-1730)||(25695510-25697177)
chr8 (72-1745)||(25453117-25454787)
chr8 (63-1744)||(25604773-25606451)
chr8 (72-1744)||(25715329-25716998)
chr8 (73-1741)||(25341119-25342784)
chr8 (19-1719)||(22899003-22900709)
chr8 (72-1741)||(25570025-25571691)
chr8 (160-1745)||(25475796-25477381)
chr8 (45-1727)||(23258357-23260027)
chr8 (101-1434)||(25311445-25312775)
chr8 (855-1745)||(25800413-25801303)
chr8 (874-1744)||(25685783-25686656)
chr8 (1029-1745)||(25647147-25647863)
chr8 (410-1520)||(24874054-24875157)
chr8 (1182-1725)||(24912446-24912988)
chr8 (63-841)||(25392331-25393106)
chr8 (1765-2393)||(25322075-25322718)
chr8 (1840-2316)||(25452503-25452978)
chr8 (1811-2322)||(24875468-24875976)
chr8 (1765-2322)||(25685152-25685709)
chr8 (1765-2221)||(25714799-25715255)
chr8 (1803-2222)||(24913108-24913527)
chr8 (1765-2227)||(25489800-25490264)
chr8 (1838-2227)||(25646642-25647031)
chr8 (1765-2227)||(25604237-25604699)
chr8 (1855-2227)||(25569506-25569878)
chr8 (1811-2227)||(25340599-25341012)
chr8 (1765-2227)||(25694960-25695426)
chr8 (1855-2227)||(25474875-25475247)
chr8 (1840-2227)||(25799886-25800273)
chr8 (1855-2189)||(23257574-23257908)
chr8 (1483-1719)||(25490358-25490594)
chr8 (1855-2225)||(22901228-22901598)
chr8 (63-626)||(25652552-25653118)
chr8 (1547-1741)||(24875157-24875351)
chr8 (1947-2222)||(25385662-25385937)
chr8 (63-286)||(25806843-25807063)
chr8 (73-286)||(24872813-24873026)
chr8 (2080-2322)||(24885571-24885813)
chr8 (2011-2189)||(29429171-29429348)
chr8 (2223-2393)||(25799672-25799854)
chr8 (2324-2429)||(25694738-25694841)
chr8 (2223-2328)||(25340434-25340535)
chr8 (2223-2328)||(25569338-25569442)
chr8 (2326-2429)||(25489586-25489687)
chr8 (2223-2282)||(25489708-25489767)
chr8 (2324-2393)||(25604030-25604099)
chr8 (2232-2328)||(25646505-25646600)
chr8 (2223-2274)||(25694878-25694929)
chr8 (2236-2282)||(24913522-24913568)
chr8 (2223-2328)||(29428965-29429070)
chr8 (2324-2404)||(25474645-25474725)
chr8 (78-147)||(25477406-25477475)
chr8 (2223-2286)||(25604143-25604205)
chr8 (2324-2361)||(25385542-25385579)
chr8 (2223-2268)||(25474766-25474811)
[»] scaffold0070 (7 HSPs)
scaffold0070 (69-1725)||(15293-16948)
scaffold0070 (220-1224)||(48966-49966)
scaffold0070 (1856-2227)||(17148-17519)
scaffold0070 (80-723)||(35347-35987)
scaffold0070 (2223-2328)||(17552-17656)
scaffold0070 (72-153)||(48800-48881)
scaffold0070 (1765-1842)||(17041-17118)
[»] scaffold0830 (2 HSPs)
scaffold0830 (73-1745)||(2786-4455)
scaffold0830 (1765-2187)||(4506-4929)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (72-1745)||(10323988-10325652)
chr4 (1855-2198)||(10323499-10323839)
[»] scaffold1415 (1 HSPs)
scaffold1415 (73-908)||(8-840)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (755-1667)||(16885380-16886292)
chr3 (1858-1966)||(16886728-16886836)
chr3 (602-684)||(16885227-16885309)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1101-1675)||(5119004-5119578)
chr2 (1101-1675)||(5101445-5102019)
chr2 (1166-1724)||(5079906-5080464)
chr2 (303-957)||(5118215-5118869)
chr2 (299-979)||(5100652-5101332)
chr2 (330-957)||(5080676-5081303)
chr2 (1890-1965)||(5079719-5079794)
chr2 (1890-1964)||(5120124-5120198)
chr2 (1890-1936)||(5102499-5102545)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (1101-1675)||(14412266-14412840)
chr6 (741-917)||(14413021-14413197)
chr6 (1858-1964)||(14411927-14412033)
chr6 (303-499)||(14413439-14413635)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 872; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 872; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 1744
Target Start/End: Complemental strand, 25324470 - 25322792
Alignment:
Q  63 tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||  | |||||    
T  25324470 tcatagatgacaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatctagacttatccgggaatca 25324371  T
Q  163 tatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgga 262  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   |  ||||| | |||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||    
T  25324370 tatac---ccaatcttcctaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggcaaaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttgga 25324274  T
Q  263 aacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatc 362  Q
    ||||||||||| || |||   ||||||||   |||||||||| ||| ||| |||||||||  || ||| ||| |||| || |||||||| || ||| |||    
T  25324273 aacatgagcaacttgctacaattttctctttctgggaataatataactggaccaatacctcctacattcaaaaggttgcagaaacttcaggttttgaatc 25324174  T
Q  363 ttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtctt 462  Q
    || | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||    
T  25324173 ttagcaacaatggactacaaggatcatttattgaggaactttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctacaaaataataagctctctggagtttt 25324074  T
Q  463 accaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagac 562  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||  ||||| ||||   | | |||     
T  25324073 accaacatgtttgggaaatatgatttctcttataaggatacatgtaggatctaacagtttgaactctagaatacctttatctctttggaggcttagagat 25323974  T
Q  563 atcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatc 662  Q
    || |||||  || |||| || |  ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  25323973 atattagagataaatttttcatcaaattctttaattggtattcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtactattagaactatcaagaaatc 25323874  T
Q  663 atatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcact 762  Q
    | ||||||||||||||||| || | |||   |||||||  ||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||| ||||||||||  |||||    
T  25323873 agatttcaagcaacattccaacaaccattaattccttattaacattgcagaatctctccttagcagataataaactgaatggttcaattcccaaatcact 25323774  T
Q  763 tggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatc 862  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25323773 tggtgaaatggtaagattaatctctttggacttgtccaaaaatatgttaacaggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatc 25323674  T
Q  863 aacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggca 962  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||      
T  25323673 aacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacatttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgaagcactttgcggtg 25323574  T
Q  963 atcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaac 1062  Q
    |||||||||| |||||| ||   |||| || | || ||||||||  ||| |||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25323573 atcctcgccttcaagtacctacatgtggtaagcaagttaagaaatggtccatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtcagc 25323474  T
Q  1063 cactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaaga 1162  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25323473 cattttggttgttgcatgcatcatacttttaaaacataataaaaggagaaagaatgaaaatactcttgaaaggggtttgtcaactttaggagctccaaga 25323374  T
Q  1163 agaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttc 1262  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25323373 agaatatcatattatgaacttttgcaagcaactaatggattaaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcagggaaagcttc 25323274  T
Q  1263 ctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgaca 1362  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25323273 ttgatggtgagatgattgcagttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgtagaatgcaatgcaatgagaaatctacgaca 25323174  T
Q  1363 tcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatat 1462  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25323173 tcgaaatctggtaaagattatcagtagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgttgacaaatggttatat 25323074  T
Q  1463 tcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtgg 1562  Q
    ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25323073 tcaaataactattgtctaaatttcttacaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatacctgtgg 25322974  T
Q  1563 ttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatc 1662  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25322973 ttcattgtgatctaaagccttccaatgtcttattggataaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaagctcatggatgaaggacaatc 25322874  T
Q  1663 taaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttctt 1744  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25322873 tcaaactcatacacaaactttggctactattggatatcttgcaccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattatctt 25322792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 842; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 1730
Target Start/End: Complemental strand, 25697177 - 25695510
Alignment:
Q  63 tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||    
T  25697177 tcatatatgacaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcaaggaatca 25697078  T
Q  163 t-atactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgg 261  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||  |||  |||||| |||||||||||||| ||   |||||||  |||||||||    
T  25697077 tcata-tatccaatcttcctaagtcaattggaaacctaacttcagaatactttacggcagaatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagttgg 25696979  T
Q  262 aaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattgga- 360  Q
    |||||||||||| || ||| ||||   |||   ||  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| | ||| ||     
T  25696978 aaacatgagcaacttgctaactttggatctgtctgacaataatataaatggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaacttca-gcatttgag 25696880  T
Q  361 tcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtc 460  Q
    |||| | | ||||| | |||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||     
T  25696879 tcttagcaacaatggattacaaggaccatttattgaagagctttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatcttgaaaataataagctttctggagtt 25696780  T
Q  461 ttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatag 560  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||| | ||| |||||||  |||||||  ||||| |||| | | | ||    
T  25696779 ttaccaacatgtttaggaaatatgatttctcttataaggataaatgtaggatctaacagtttaaactctagaatacctttatctctttggagtcttagag 25696680  T
Q  561 acatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaa 660  Q
    | || |||||  || |||| || |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||    
T  25696679 atatattagagataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaa 25696580  T
Q  661 tcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttca 760  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | |||   |||||||  ||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||| ||| ||||||  |||    
T  25696579 tcagatttcaagcaacattccaacaaccattaattccttattaacattgcagaatctctccttagcagataataaactgaatggttcagttcccaaatca 25696480  T
Q  761 cttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaaca 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25696479 cttggtgaaatggtaagcttgatctctttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaaca 25696380  T
Q  861 tcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcgg 960  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  25696379 tcaacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacggttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgatgcactttgcgg 25696280  T
Q  961 caatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtca 1060  Q
      |||||||||| |||||| ||   |||| || | || ||||||||  |||||||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25696279 tgatcctcgccttcaagtacctacatgtggtaagcaagttaagaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtca 25696180  T
Q  1061 accactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaa 1160  Q
     ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25696179 gccattttggttgttgcgtgcatcatacttttaaaacataataaaaggagaaagaatgaaaatactcttgaaaggggtttgtcaactttgggagctccaa 25696080  T
Q  1161 gaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagct 1260  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  25696079 gaagaatatcctattatgaacttgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcaggggaagct 25695980  T
Q  1261 tcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacga 1360  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  25695979 tcttgatggtgagatgattgccgttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaatctacga 25695880  T
Q  1361 catcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttat 1460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25695879 catcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttat 25695780  T
Q  1461 attcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagt 1560  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25695779 attcaaataactattgtctaagtttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccatcatggttcctcaataccagt 25695680  T
Q  1561 ggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaa 1660  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25695679 ggttcattgtgatctaaagccttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgcaaagctgatggatgaaggacaa 25695580  T
Q  1661 tctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttactt 1730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  25695579 tctaaaactcatacacaaactttggctactgttggatacctcgcaccaggtcatttcttttcttttactt 25695510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 825; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25454787 - 25453117
Alignment:
Q  72 acaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatc 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||   ||    
T  25454787 acaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcagggaatcatata---tc 25454691  T
Q  172 caatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagc 271  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||  ||||||| |||||||||||||  ||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25454690 caatcttcctaagtcaattggaaacctaacttcagaattcttcagggcagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatgagc 25454591  T
Q  272 aatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtatt-ggatcttggaacc 370  Q
    || || |||||||||  |||  ||   |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| | | |    
T  25454590 aacttgctatcttttgatctgtattacaataatataaatggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaatttca-gtatttggatcttagcagc 25454492  T
Q  371 aatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacat 470  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  25454491 aatggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataagctctctggagttttaccaacat 25454392  T
Q  471 gtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttaga 570  Q
    || | ||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||| | ||| |||||||  |||||||  ||||| |||| | | | ||| || |||||    
T  25454391 gtttgggaaatatgacttctattataaggataaatgtaggatctaacagtttaaactctagaatacctttatctctttggagtcttagagatatattaga 25454292  T
Q  571 actagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttca 670  Q
      || |||| || |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  25454291 gataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaatcagatttca 25454192  T
Q  671 agcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaa 770  Q
    ||||||||||| || |  ||| |||||||| |||  ||||||||||||  |||||| || ||||||||   ||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  25454191 agcaacattccaacaataatcagttccttacaaacattgcagaatctcgtcttagcacaaaataaactgattggatcaattcccaaatcacttggtcaaa 25454092  T
Q  771 tggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctc 870  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25454091 tggtaagcttgatctctttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctc 25453992  T
Q  871 atgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgc 970  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25453991 atataatagattacaaggagagaatcctaatggtggacaattcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgatgcactttgcggcgatcctcgc 25453892  T
Q  971 ctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctgg 1070  Q
    || |  ||| ||   |||| || | || ||||||||  |||||||  ||| || ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||    
T  25453891 ctccttgtacctacatgtggtaagcaagttaagaaatggtcaatggaaaaaaaacttatattgaaatgcatactttccatagttgtgtcggccattttgg 25453792  T
Q  1071 ttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttc 1170  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  25453791 ttgttgcgtgcatcatacttttaaagcataataaaaggaaaaagaacgaaacttctcttgaaaggggtttgtcaactttgggaactccaagaagaatatc 25453692  T
Q  1171 atattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggt 1270  Q
     |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||    
T  25453691 ctattatgaacttttgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcaggggaagcttcttgatggt 25453592  T
Q  1271 gagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatc 1370  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25453591 gagatgattgcagttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgaagaatgcaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaatc 25453492  T
Q  1371 tggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagatta 1470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  25453491 tggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtaatggaattcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttatattcaaataa 25453392  T
Q  1471 ctattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgt 1570  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25453391 ctattgtctcagtttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatgcctgtggttcattgt 25453292  T
Q  1571 gatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactc 1670  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  25453291 gatctaaagccttctaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaagctcatggatgaaggacaatctcaaactt 25453192  T
Q  1671 atacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttcttc 1745  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25453191 acacacaaactttagctactattggataccttgcaccaggtcatttattctcttttacttcataacattttcttc 25453117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 1744
Target Start/End: Complemental strand, 25606451 - 25604773
Alignment:
Q  63 tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||    
T  25606451 tcatatatgacaacaatttgacaatagatgattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaagtatctagacttatcaggtaatca 25606352  T
Q  163 tatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgga 262  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   |  ||||||| |||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||    
T  25606351 tatac---ccaatcttcctaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggcagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttgga 25606255  T
Q  263 aacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatc 362  Q
    ||||||||||| || |||| ||||  | |  |||  |||||| ||||||| ||||||||| ||  | | ||||||||||| |||||||||   |||  ||    
T  25606254 aacatgagcaacttgctattttttgatatgtatgacaataatataaatggaccaatacctcgttcagtcaaagggttacagaaacttcaacatttgagtc 25606155  T
Q  363 ttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtctt 462  Q
    || | |  |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||    
T  25606154 ttagcaagaatggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctaaacaataaaaagctctctggagtttt 25606055  T
Q  463 accaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagac 562  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| |||||| | || | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||     
T  25606054 accaacatgtttgggaaatatgagttctattataaggttatacataggatctaacagtctgaactctaagataccttcctctctttggagtgtcatagat 25605955  T
Q  563 atcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatc 662  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||    
T  25605954 atcttacaggtagatttgtcctctaatgcgttcatcggtaatctgccacctgagattgggaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaatc 25605855  T
Q  663 atatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcact 762  Q
    | ||||||||||||||||| || | |||| || ||||| |||  |||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||    |||||    
T  25605854 agatttcaagcaacattccaacaaccatcagtcccttacaaacattgcagaagctctccttagcagataataaactgaatggatcaattcctgaatcact 25605755  T
Q  763 tggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatc 862  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25605754 tggtcaaatgataagcttgatctctttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttgtgtatctccaaaacatc 25605655  T
Q  863 aacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggca 962  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||| |||||||||||      
T  25605654 aacttctcatataatagattacaaggagagattcctaatgatggacatttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgatgcactttgcggag 25605555  T
Q  963 atcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaac 1062  Q
    |||||| | | |||||| ||   |||  || | || ||||||||  |||||||  ||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25605554 atcctcacttccaagtacctacatgtagtaagcaagttaagaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatacatacttcccatagttgtgtcagc 25605455  T
Q  1063 cactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaaga 1162  Q
    || | |||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25605454 cattttggttgttgcttgcatcatagttttaaaacataataaaacgagaaagaatgaaaatactcttggaaggggtttgtcaactttgggagctccaaga 25605355  T
Q  1163 agaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttc 1262  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||    
T  25605354 agaatatcatattatgaacttgtgcaagcaacaaatggattcaatgagagtaatttccttggaaggggagcatttggatctgtttatcagggcaagcttc 25605255  T
Q  1263 ctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgaca 1362  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  25605254 ttgatggtgaaatgattgccgttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaatctacgaca 25605155  T
Q  1363 tcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatat 1462  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25605154 tcggaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagaaaaatggttatat 25605055  T
Q  1463 tcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtgg 1562  Q
    ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25605054 tcaaataactattgtctaaatttcttacaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatacctgtgg 25604955  T
Q  1563 ttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatc 1662  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25604954 ttcattgagatctaaagccttcaaatgtcttattggataaaaatatggtagcacatgttagcgattttggtattgccaagctcatggatgaaggacaatc 25604855  T
Q  1663 taaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttctt 1744  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25604854 tcaaactcatacacaaactttggctactattggatatcttgcaccaggtcatttcttatcttttacttcttaacattatctt 25604773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 804; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 1744
Target Start/End: Complemental strand, 25716998 - 25715329
Alignment:
Q  72 acaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatc 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||   ||    
T  25716998 acaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaagtatctagacttatcagggaatcatata---tc 25716902  T
Q  172 caatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagc 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||  | ||||  |||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25716901 caatcttcctaagtcaattggaaacataacatcagaattcttccgagcagcatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagttggaaacatgacc 25716802  T
Q  272 aatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattgga-tcttggaacc 370  Q
    || || |||  | ||||| |   |||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||| ||||| || |||||| | |    
T  25716801 aacttgctacttctttctatttttgggaataatataactggacgaatacctggtacattcaaagagttgcagaaacttca-gtatttgaatcttggcaac 25716703  T
Q  371 aatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacat 470  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  25716702 aatggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctggaaaataataagctctctggagttttaccaacat 25716603  T
Q  471 gtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttaga 570  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||   |  | || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| ||| ||||||      
T  25716602 gtttgggaaatatgacttctcttagaatattgaacattggatctaatgatttgaactctaagataccgtcctctctttggagtctcaaagatatcttact 25716503  T
Q  571 actagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttca 670  Q
    | || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25716502 agtaaatttgttctctaatgctctcattggtgatcttccacctgaggttgggaatttgagacaaattgtagtattagatctatcaagaaatcatatttca 25716403  T
Q  671 agcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaa 770  Q
    || |||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |  |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  25716402 agaaacattcccacaaccatcagttccttacaaaatttgcagactctgtccttagctcataacaaattgaatggatcaattccctcatcacttagtgaaa 25716303  T
Q  771 tggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctc 870  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25716302 tggtaagcttggtctctttggacttgtcccaaaatatgctagatggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtaccttcaaaacatcaacttctc 25716203  T
Q  871 atgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgc 970  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||  | |||||||| |||||||||||  |||||||     
T  25716202 atataatagattacaaggagagattcctgatggtggacatttcaaaaacttcacagctcaatcattcatgcataatgatgcactttgcggtgatcctcga 25716103  T
Q  971 ctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctgg 1070  Q
    ||   |||| |||  |||| || | || |||| |||  |||||||  ||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  | ||     
T  25716102 ctcatagtacctccatgtgataagcaagttaaaaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcctatagttgtgtcagtcgttttga 25716003  T
Q  1071 ttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttc 1170  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25716002 ttgttgcgtgcatcatacttttaaaacataataaagggaaaaagaacgaaactactcttgaaaggggtttttcaactttaggagctccaagaagaatatc 25715903  T
Q  1171 atattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggt 1270  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  25715902 ctattatgaaattgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcaaggaaagcttcatgatggt 25715803  T
Q  1271 gagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatc 1370  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25715802 gagatgattgcagtaaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaatctacgacatcggaatc 25715703  T
Q  1371 tggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagatta 1470  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |    
T  25715702 tggtaaagattatcagaagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagaaaaatggttatattcaaataa 25715603  T
Q  1471 ctattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgt 1570  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25715602 atattgtctaagtttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccatcgtggttcttcaataccagtggttcattgt 25715503  T
Q  1571 gatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactc 1670  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25715502 gatctaaagccttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgcaaagctcatggatgaaggacaatctcaaactc 25715403  T
Q  1671 atacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttctt 1744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25715402 atacacaaactttggctactattggatatcttgcaccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattatctt 25715329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 799; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 1741
Target Start/End: Complemental strand, 25342784 - 25341119
Alignment:
Q  73 caacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatcc 172  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||   ||    
T  25342784 caacaatttgacaattgaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcaggtaatcatatac---cc 25342688  T
Q  173 aatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagca 272  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25342687 aatcttccaaagtcaattggaaacataacttcagaattcttctgggcaaaatcatgtggaattgagggtaatattcccgtagaagttggaaacatgagca 25342588  T
Q  273 atttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaa 372  Q
    |||| ||||   |||||||  |||  |||||| ||||||| ||||||||| ||  | | |||||| || | || ||||||||||||  |||||    |||    
T  25342587 atttgctattactttctctgtatgacaataatataaatggaccaatacctcgttcactcaaagggctagagaagcttcaagtattgtctcttgcttacaa 25342488  T
Q  373 tgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgt 472  Q
    || |||  | |||||||| ||||| || || |||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  25342487 tgcactcaaaggatcattcattgatgagctctgtctaattaagagtttaggtgagttgtatctagaaaataataagctttctggtgttttaccaacatgt 25342388  T
Q  473 gtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaac 572  Q
       ||||||||||||||||||| |||  |  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||  || || |||        
T  25342387 tcgggaaatatgacttctcttagaaaattgaacgtaggatctaacaatttgaactctaagataccttcatctctttggggtctcactgatatattaatgt 25342288  T
Q  573 tagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaag 672  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25342287 tagatttgtcctccaatgcttttattggtgattttccacccgatattgggaatttgagagaacttgtaatattagatctatcaagaaatcaaatttcaag 25342188  T
Q  673 caacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatg 772  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| | |||||   || ||||    
T  25342187 caacattccaacaaccatcagttccttacaaaatttgcagaatctctccttagctcataataaattgaatgggtcaattcccgcatcactgaatggaatg 25342088  T
Q  773 gtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcat 872  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25342087 gtaagcttgatctctttggacttgtctcaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtaccttcaaaacatcaacttctcat 25341988  T
Q  873 gtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcct 972  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  25341987 ataatagattacaaggagagattcctaatggtggacatttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgaagcactttgcggtgatcctcacct 25341888  T
Q  973 acaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggtt 1072  Q
     |||||| ||   |||| || | || ||||||||  |||||||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  25341887 tcaagtacctacatgtggtaagcaagttaagaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtcatccattttggtt 25341788  T
Q  1073 gttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcat 1172  Q
    ||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  25341787 gttgcgtgcatcatacttttaaagcataataaaaggaaaaagaacaaaacttctcttgaaaggggtttgtcaactttgggagctccaagaagaatatcct 25341688  T
Q  1173 attatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtga 1272  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  25341687 attatgaaattgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcagggcaagcttcttgatggtga 25341588  T
Q  1273 gatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctg 1372  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25341587 gatgattgccgttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaatatg 25341488  T
Q  1373 gtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattact 1472  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||     
T  25341487 gttaagattatcagcagttgttcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaattggttatattcaaataaca 25341388  T
Q  1473 attgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtga 1572  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25341387 attgaataaatttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccatcatggttcttcagtaccagtggttcattgcga 25341288  T
Q  1573 tctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcat 1672  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25341287 tctaaagccttctaatgtcttattggatgaaaatatggttgcacatgtaagcgattttggtattgccaagctcatggatgaaggacaatctaaaactcat 25341188  T
Q  1673 acacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacatttt 1741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25341187 acacaaactttggctactattggataccttgcaccaggtcatttcttctctttaacttcctgacatttt 25341119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 785; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1719
Target Start/End: Original strand, 22899003 - 22900709
Alignment:
Q  19 aactctaccccattttgcttttggagg------gttcctcgaaacattgatcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttact 112  Q
    |||||||||| || |||||||||||||      ||||||| ||||| |  ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22899003 aactctacccaatattgcttttggaggtttaaggttcctcaaaacaattttcatacaggacaacaacttgataatagaagattctcttcagttctttact 22899102  T
Q  113 tctttgacaagttgtagaaatttgaaatat-ctagatctatcacgaaatcatatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccatta 211  Q
    || ||||| | ||||||| |||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |      
T  22899103 tccttgacgaattgtagatattt-aaatattctagacttatcaggaaatcatatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataactttaatgtac 22899201  T
Q  212 ttttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatg 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22899202 tttttggcagattcatgtggaattgatggtaatattcctctagaggttggaaacatgagtaacttgctatctttttctgtgaatgggaataatataaatg 22899301  T
Q  312 ggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacat 411  Q
    |  |||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||| | ||    
T  22899302 gatcaatacctggcacatttaaagatttacataaacttcagggattggatcttagaaacaatggactacaaggatcatttgttaaggagctttgtcaaat 22899401  T
Q  412 taagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatatagga 511  Q
    | | | ||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||  || | ||||||    
T  22899402 tgacaatttggatgagttgtatttagaaagtaataagctttttggtgttttaccaacatgtttgggaaacatgacttctctaagaaaattatacatagga 22899501  T
Q  512 tctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccac 611  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22899502 tataacaatttgaactctacgataccttcctctctttggagtctcagagatatcttacaagtagatttgtcctctaatgctttcattggtaatattccac 22899601  T
Q  612 ctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgca 711  Q
     ||||||||| ||||| | ||||||| ||||  |||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||||    
T  22899602 ttgagattggaaatttcaaagcaattatactattagacctatctagaaatcatatatcaagcaacatacctacatccatcagttccttaagaaatttgca 22899701  T
Q  712 gaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgtta 811  Q
     ||||| ||||||||||| || ||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22899702 aaatctgtccttagctcataacaaattgtatggagaaattcccacatcacttggtgaaatgattaacttgttctctttggacttgtcccaaaatatgata 22899801  T
Q  812 actggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctt 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22899802 actggtgttattccaaaatccttagcatcgcttttgtatcttcgaaacatcaatttatcatataatagactacaaggagagattcctgatggtggacctt 22899901  T
Q  912 tcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtc 1011  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||   ||  ||| |||| |||    
T  22899902 tcaaaaatttcacagctgaatcatatttgcataatgaagcactttgtggcgatcctcgcctacaagtccctctgtgtgataaacaagctaaaaaaatgtc 22900001  T
Q  1012 aatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaa 1111  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  22900002 aatgaaaaagaatctattactcaaatgcatacttcccatacttgtgtcaaccatttttgttgttgcatgcataatacttgtaaaacttaataaaaggaaa 22900101  T
Q  1112 aaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgaga 1211  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  22900102 atggttgaaaatactcttgaaagaaatttatcaactcttggagctccaagaagaatttcttattatgagcttgtgcaagcaacaaatggatttaatgaga 22900201  T
Q  1212 gtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagagga 1311  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| |||||| |  ||||||||||  |||||||||||||  |||||||| | |  |||||    
T  22900202 gtaatttgcttggaaggggaggatttgggtctgtgtatgaggggaagctttcaaatggtgagatatttgcggttaaagtgattgatttgaactcggagga 22900301  T
Q  1312 aaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaa 1411  Q
    ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22900302 aaaattacggagctttgatcgagaatgcaatgcattgagaaatctacggcatcgaaatctggttaagattatcagcagttgttcaaatattgatttcaaa 22900401  T
Q  1412 tcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatag 1511  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22900402 gcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcaaataattgttgtttaaatttcttgcaaaggttaaatataatgatag 22900501  T
Q  1512 atgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggt 1611  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||    
T  22900502 atgttgcatatgcattggaatatctccatcatggttcttcaatacctgtggtccattgtgatctaaagcctagtaatgtcttgctggacgaagatatggt 22900601  T
Q  1612 tgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggt 1711  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22900602 tgcacatgttagtgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcatacagagactttggctactattggatatcttgcaccaggt 22900701  T
Q  1712 catttctt 1719  Q
     |||||||    
T  22900702 aatttctt 22900709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 728; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 1741
Target Start/End: Complemental strand, 25571691 - 25570025
Alignment:
Q  72 acaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatc 171  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |    
T  25571691 acaacaatttgacaatcgaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtaggcatttgaaatatctagacttatcagggaatcatgtactacc 25571592  T
Q  172 caatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagc 271  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||||| | |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25571591 caatcttcctaagtcaattggaaacataacttcagaattcttccgggcacagtcatgtggaattgagggtaatattcccgtagaagttggaaacatgagc 25571492  T
Q  272 aatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaacca 371  Q
    || || ||||   |||||||| |||  |||||| ||||||  |||||||||  |  | | |||||| || | || ||||||||||||  |||||    ||    
T  25571491 aacttgctattactttctctatatgacaataatataaatgaaccaatacctcattcactcaaagggctagagaagcttcaagtattgtctcttgcttaca 25571392  T
Q  372 atgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatg 471  Q
    ||| |||  | |||||||| ||||| || || |||   ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  25571391 atgcactcaaaggatcattcattgatgagctctgtctaattaagagtttaggtgagttgtatatagaaaataataagctttctggtgttttaccaacatg 25571292  T
Q  472 tgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaa 571  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||  |  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||  | |||  || || |||       
T  25571291 ttagggaaatatgacttctcttagaaaattgaacgtaggatctaacaatttgaactctaagatacctacatctctttggggtctcactgatatattaatg 25571192  T
Q  572 ctagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaa 671  Q
     ||||||||||||  |||||| | |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25571191 ttagatttgtcctccaatgcttttattggtgattttccacccgatattgggaatttgagagaacttgtaatattagatctatcaagaaatcaaatttcaa 25571092  T
Q  672 gcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaat 771  Q
    |||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25571091 gcaacattccaacaaccatcagttccttacaaaatttgcagaatctctccttagctcataacaaattgaatgggtcaattcccacatcacttggtgaaat 25570992  T
Q  772 ggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctca 871  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25570991 ggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgctagctggtgttattccaaagtcattagaatcacttttgtaccttcagaacatcaacttctca 25570892  T
Q  872 tgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcc 971  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||| | ||||||| | ||||||| || |||  |||||    
T  25570891 tataatagattacaaggagagattcctgatggtggacctttcaagaactgcacaactcaatcttttatgcataatggaccactttgtggaaatattcgcc 25570792  T
Q  972 tacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggt 1071  Q
    | |||||| | |  |||| ||   ||  ||| |||| ||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25570791 tccaagtaccaccttgtggtaaacaagataacaaaatgtcaatggcggagaagatattactcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaacctttctggt 25570692  T
Q  1072 tgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttca 1171  Q
    ||||||||||||||||  ||| | | ||||   ||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  25570691 tgttgcatgcatcatatgttttagacttaa---aaggaaaagaattaaaagtactcttgaaaggggtttatcagctttaggagctctaagaagaatatca 25570595  T
Q  1172 tattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtg 1271  Q
    |||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  25570594 tattatgaacttttgaaagcaacaaatggattcaatgagagaaaattacttggaagggggagctttggctctgtgtatcaaggggagcttcctgatggtg 25570495  T
Q  1272 agatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatct 1371  Q
    |||| ||||| || |||||| |||||||  | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25570494 agattattgcagtcaaagtatttgatttacaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaatct 25570395  T
Q  1372 ggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattac 1471  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  25570394 ggtaaagattatcagtagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttatattcaaataac 25570295  T
Q  1472 tattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtg 1571  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  25570294 tattgtctaagtttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattgaaatatcttcatcatggttcttcaatgcctgtggttcactgtg 25570195  T
Q  1572 atctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactca 1671  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25570194 atctaaagccctccaatgtcatgttggatgaaaatatggttgcacgtgttagtgattttggtattgctaagctcatggatgaaggtcaatctaaaactca 25570095  T
Q  1672 tacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacatttt 1741  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  25570094 tacacagactttagctactattggataccttgcaccaagtcatttcttctcattaacttcttgacatttt 25570025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 714; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 160 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25477381 - 25475796
Alignment:
Q  160 tcatatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagtt 259  Q
    ||||||| |||| | | |||| || ||||| ||||||||| || ||  ||| ||||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |     
T  25477381 tcatatattatctagttttccaaattcaattggaaacatatctgcagaattcttttggttggattcatgtcgaattgaaggtaatattcccatagaaatc 25477282  T
Q  260 ggaaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattgg 359  Q
    ||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||||  |||||| || ||||  ||||||||||||   | |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  25477281 ggaaacatgagcaacatgatatttttttctataaatgataataatatatatggatcaatacctggtactatcaaagagttacagaatcttcaagtgttgg 25477182  T
Q  360 atcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagt 459  Q
    ||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  25477181 atcttggcaacaatcgactacaaggatcatttattgaggagctttgtgaacttcagaaattaggtgagttgtatctagaaaataataagctctctggtgt 25477082  T
Q  460 cttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcata 559  Q
     |||||||||||  | | ||||||||||||||||| || | || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  25477081 tttaccaacatgcttggaaaatatgacttctcttagaatgatagacataggatctaatagtctgaactctaagataccttcctctctttggagtgtcata 25476982  T
Q  560 gacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaa 659  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25476981 gatatcttagaggtagatttgtcttataatgccttcattgggaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtagttttagatctatcaggaa 25476882  T
Q  660 atcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttc 759  Q
    || |||||||||| ||||||||| | | |||  ||||||||  || |||||| || || || ||||| || || |||||  |||||||||||||  | ||    
T  25476881 ataatatttcaagaaacattccttcaaccattagttccttagtaactttgcaaaacctatcattagcgcataacaaactgaatggatcaattccatcatc 25476782  T
Q  760 acttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaac 859  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25476781 acttggtgaaatggtgagcttgacctccttggacttgtcccaaaatatgctaaccggtattattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttgaaaac 25476682  T
Q  860 atcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcg 959  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||| | || |||| ||| |||||||    
T  25476681 atcaacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtgggcctttcaaaaattttatggctgaatcttttattcacaatggagctctttgcg 25476582  T
Q  960 gcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtc 1059  Q
    | ||||||||||||||  ||  || ||||| |    || |||| |||  |||||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25476581 gaaatcctcgcctacatatacatccgtgtggtgaacaagttaaaaaatggtcaatgggaaagaagttgttattcaaatgcatcattcccttagttgtgtc 25476482  T
Q  1060 aaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctcca 1159  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25476481 aaccattttggttgttgcatgcatcatacttttaaagcataataaaaggaaaaagattcaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctcta 25476382  T
Q  1160 agaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagc 1259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||| || |    
T  25476381 agaagaatttcctattatgaacttgtgcaagcaactaatggattcaatgagtgtaatttacttggacgggggggctttggctctgtatatcgggggaatc 25476282  T
Q  1260 ttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacg 1359  Q
    | |   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  25476281 tccgcaatgatgagatgattgcggttaaagtaattgatttgcagtcagaggcaaaagcaaagagctttgatgtagaatgcaatgcaacgagaaatctacg 25476182  T
Q  1360 acatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggtta 1459  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476181 acatcgaaatcttgttaagattatttgtagttgttcaaatctcgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggtta 25476082  T
Q  1460 tattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccag 1559  Q
    |||| | || | | |||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25476081 tatttaaataattgttgtttgagtttcttgcaaaggttgaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccatcatggttcttcaatacctg 25475982  T
Q  1560 tggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggaca 1659  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  25475981 tggttcattgcgatctaaagccttctaatgtcatgttggataaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgccaagctcatcgatgaaggccg 25475882  T
Q  1660 atctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttcttc 1745  Q
    |||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25475881 atctaaatgccatacacaaacttttcctactattggatacattgcaccaggtcatttcttctcttttactttgtaacattttcttc 25475796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 674; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 1727
Target Start/End: Complemental strand, 23260027 - 23258357
Alignment:
Q  45 ggttcctcgaaacattgatcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatct 144  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||    
T  23260027 ggttcctcagaacacttatcataaataacaatgattttacaatagatgattctcttcaattctttacttctttgggaaattgcagacatttgaaatatct 23259928  T
Q  145 agatctatcacgaaatcatatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggt 244  Q
    ||| ||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||   |||   |||||||  ||||||||||  ||        
T  23259927 agaacttgcaagaaatcatataccatccaatcttccaaagtcaattggaaacataacttcgtcaaagtttattgcagatttgtgtggaattgttggtaaa 23259828  T
Q  245 attcccatagaagttggaaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaa 344  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||| |   |||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  23259827 attcccctagaagtcggaaacatgagtaaattgctatatttttctgtttttgggaataatatgactggaccaatacctggtacattcaaagggttgcaga 23259728  T
Q  345 aac---ttcaagtatt-ggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagaca 440  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23259727 aacaacttca-gtatttggatcttggaataaataaattacaaggatcatttattgaggagctttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtctctagaca 23259629  T
Q  441 ataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttc 540  Q
     ||||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||   ||||||     
T  23259628 gtaataagctttctggagctttaccaacatgtttcggaaatatgacttctcttataagagtacacataggatataacagtttcaactctagagtaccttt 23259529  T
Q  541 ctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgta 640  Q
     ||||| |||| | | | ||| || |||||| || ||||  | | ||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23259528 atctctttggagtcttagagatatattagaagtaaattttacttctaatgctttaatcggtaatcttcctcccgagattgggaatctgaaagcaattata 23259429  T
Q  641 cttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactat 740  Q
     | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||   |||| ||||  |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||  |||     
T  23259428 atactcgatctatcaagaaatcaaatttcaagcaacattccaacgtccatcagttcgctaaatactttgcaaaatctctccttagcacacaatatgctaa 23259329  T
Q  741 atggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatc 840  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23259328 atggatcaattcccacatcacttggtaacatgataagcttgatatccttagacatgtccgaaaatatgctaatcggtattattccaaaatcattagaatc 23259229  T
Q  841 acttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgta 940  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| || |||| ||| |     
T  23259228 acttttgtaccttcaaaacattaacttatcgtataatagattacaaggagagattcctgatggcggaccttttaggaatttcacagctcaatcttttatg 23259129  T
Q  941 cataatgaagcactttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgca 1040  Q
    ||||||| || |||||| || |||| |||| | |||||||| |  |||  ||   |   |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23259128 cataatggagaactttgtggaaatcttcgcttccaagtatcgctttgtcgtaaacatgataagaaaatgtcaatggcaaagaagatattactcaaatgca 23259029  T
Q  1041 tacttcccatagttgtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggttt 1140  Q
    || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||| | | | || | ||   |||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  23259028 taattcccatagttgtgtcagccattttggttgttgcatgcatcatatattttagactcaagagaa---aaaatgttgaaaatattgttgaaaggggttt 23258932  T
Q  1141 atcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggc 1240  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  23258931 atcaaccttaggagttccaagaagaatatcatattatgaacttgtgcaagcaacaaatggattcaatgagagcaatttacttggaacggggggctttggc 23258832  T
Q  1241 tcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgca 1340  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |            | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23258831 tctgtgtatcaagggaagcttcctgatggtgagatgattgcagttaaagtatttgatttgca------------aacaaagagctttgatgcagaatgca 23258744  T
Q  1341 atgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatgg 1440  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23258743 atgcaatgagaaatctacggcatcgaaatctggttaagattatcagcagttgttccaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatgg 23258644  T
Q  1441 aagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcat 1540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23258643 aagtgtggacaaatggttatattcagataaccattgcttaaatttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccat 23258544  T
Q  1541 catggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgcca 1640  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  23258543 catggttcttcaatacccgtggttcattgcgatctaaaaccttctaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtatttcaa 23258444  T
Q  1641 aactcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctctttta 1727  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  23258443 agctcatggatgaaggacaatctgaaactcatacacaaactttagctactcttggataccttgcaccaggtaatttgttctctttta 23258357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 1434
Target Start/End: Complemental strand, 25312775 - 25311445
Alignment:
Q  101 caattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataa 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25312775 caattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaagtatctagacttatcaggtaatcatatac---ccaatcttcctaagtcaattggaaacataa 25312679  T
Q  201 cttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaa 300  Q
     ||||  ||   |  ||||||| |||||||||||||  ||   |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||   ||||||    
T  25312678 gttcagaatacatcagggcagaatcatgtggaattggtggttatattccccaagaagttggaaacatgaccaacttgctaactttttctctttttgggaa 25312579  T
Q  301 taatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaa 400  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||  | | |||||||| || |||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  25312578 taatataactggaccaatacctcgttcagtcaaagggttgcagaaacttcaaggattgtctcttggctacaatgaactccaaggatcatttattgaagag 25312479  T
Q  401 ctttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaagg 500  Q
     ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||      
T  25312478 ttttgtgaaatgaagagtttgggtgaattgtatctagaaaataataagctttctggagttttaccaacatgtttgggaaatatgacttctcttagaaaat 25312379  T
Q  501 tacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattgg 600  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||  |||||  | |||||    
T  25312378 tgtatataggatctaacaattttaactctatgataccttcctctctttggagtctcatagatatcttaatggtagatttatcctccaatgcatttattgg 25312279  T
Q  601 taatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttcctta 700  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  25312278 tgatcttccactcgagattgggaatttgagagaacttgtaatattagatctatcaagaaatcaaatttcaagcaacattcctacaaccatcagttcctta 25312179  T
Q  701 aaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtccc 800  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| | |||||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25312178 caaaatttgcagaatctctccttagctcataataaattgaatgggtcaattcccgcatcactgaatggaatgttaagcttgatctctttggacttgtctc 25312079  T
Q  801 aaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctga 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25312078 aaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtaccttcaaaacatcaacttctcatataatagattacaaggagagattcctaa 25311979  T
Q  901 tggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaactt 1000  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||   |||| || | || ||    
T  25311978 tggtggacatttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgaagcactttgcggtgatcctcaccttcaagtacctacatgtggtaagcaagtt 25311879  T
Q  1001 aagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagtta 1100  Q
    ||||||  |||||||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||    
T  25311878 aagaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtcatccattttggttgttgcgtgcatcatacttttaaagcata 25311779  T
Q  1101 ataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtgg 1200  Q
    ||||||||||||||    ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  25311778 ataaaaggaaaaagaacaaaacttctcttgaaaggggtttgtcaactttgggagctccaagaagaatatcctattatgaaattgtgcaagcaactaatgg 25311679  T
Q  1201 attcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttg 1300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25311678 attcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcagggcaagcttcttgatggtgagatgattgccgttaaagtaattgatttg 25311579  T
Q  1301 gagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatc 1400  Q
     | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25311578 caatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaatctggttaagattatcagcagttgttcaaatc 25311479  T
Q  1401 ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtc 1434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25311478 ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtc 25311445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 855 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25801303 - 25800413
Alignment:
Q  855 aaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcact 954  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||    
T  25801303 aaaacatcaacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacatttcaaaaatttcacagctcaatcatttatgcataatgaagcact 25801204  T
Q  955 ttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagtt 1054  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||   |||| || | || |||| |||  |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25801203 ttgcggcgatcctcgccttcaagtacctacatgtggtaagcaagttaaaaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattcaaatgcatacttcccatagtt 25801104  T
Q  1055 gtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggag 1154  Q
    ||||||  || | |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25801103 gtgtcagtcattttggttgttgcgtgcatcatacttttaaaacataataaaaggaaaaagaatgaaactactcttgaaaggggtttgtcaactttaggag 25801004  T
Q  1155 ctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcaggg 1254  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  25801003 ctccaagaagaatatcgtattatgaacttgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcaggg 25800904  T
Q  1255 aaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaat 1354  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25800903 gaagcttcctgatggtgagatgattgcagtcaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaat 25800804  T
Q  1355 ttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaat 1454  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25800803 ctacgtcatcgaaatttggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaat 25800704  T
Q  1455 ggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaat 1554  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  25800703 ggttatattcaaataactattgtctaaatttcttacaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcagtagaatatctccatcatggttcttcaat 25800604  T
Q  1555 accagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaa 1654  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25800603 accagtggttcattgcgatctaaagccttctaatgtcttattggatgaaaatatggttgcacatgtaagcgattttggtattgccaagctcatggatgaa 25800504  T
Q  1655 ggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttcttc 1745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25800503 ggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactgttggatatcttgcaccaggtaatttcttctgttttacttcttatcattttcttc 25800413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 874 - 1744
Target Start/End: Complemental strand, 25686656 - 25685783
Alignment:
Q  874 taatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgccta 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  25686656 taatagattacaaggagagattgttgatggtggacctttcaagagtttcacatctcaatcttttatgcataatgaagcactttgcggcgatccttgcctt 25686557  T
Q  974 caagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggttg 1073  Q
    |||||| ||   |||| || | ||||||| |||  ||||||   ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25686556 caagtacctacatgtggtaagcaacttaaaaaatggtcaatcgaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttttgtcagccattttggttg 25686457  T
Q  1074 ttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcata 1173  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| |   |||| ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  25686456 ttgcttgcatcatacttttaaaacataataaaaggaaaaggaacgaaactactcatgaaaagggtttgtcaacttggggagctccaagaagaatatccta 25686357  T
Q  1174 ttatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgag 1273  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  25686356 ttatgaacttgttcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcatgggaagcttcttgatggtgag 25686257  T
Q  1274 atgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctgg 1373  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25686256 atgattgcagttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaatgagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaatctacgacatcgaaatctag 25686157  T
Q  1374 taaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattca---gatta 1470  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    || |    
T  25686156 taaagattatcggtagttgctcaaatcttgattttaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttatattcaaataataa 25686057  T
Q  1471 ctattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgt 1570  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25686056 ctattgtctaaatttcttacaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatacctgtggttcattgc 25685957  T
Q  1571 gatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactc 1670  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25685956 gatctaaagccttcgaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaagctcctggatgaaggacaatctcaaactc 25685857  T
Q  1671 atacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttctt 1744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25685856 atacacaaactttggctactattggatatcttgcaccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattatctt 25685783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1029 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 25647863 - 25647147
Alignment:
Q  1029 tattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactct 1128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  25647863 tattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcagtcattttggttgttgcatgcatcatacttttaaaacataataaaaggaaaatgaatgaaactactct 25647764  T
Q  1129 tgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcagg 1228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25647763 tgaaaggggtttgtcaactttaggagctccaagaagaatatcctattatgaacttgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagg 25647664  T
Q  1229 ggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttg 1328  Q
    ||||  ||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | | ||||| |||||||| ||||||||    
T  25647663 ggagcatttggatctgtttatcaggggaagcttcttgatggtgagatgattgcagttaaagtaattgatttacaatcagaggcaaaatcaaagagctttg 25647564  T
Q  1329 atgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagtt 1428  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25647563 atgcagaatgtaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaatctggtaaagattatcagaagttgatcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagtt 25647464  T
Q  1429 catgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattg 1528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||    
T  25647463 catgtcaaatggaagtgtagacaaatggttatattcaaataactattgtctaaatttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatcagaattg 25647364  T
Q  1529 gaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgatt 1628  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25647363 gaatatctccatcatggttcatcaataccagtggttcaatgagatctaaagccttcaaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgatt 25647264  T
Q  1629 ttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttac 1728  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25647263 ttggtattgctaagctcatgggtgaaggacaatctaaaactcatacacagactttggctactattggatatcttgcaccaggtcatttcttctgttttac 25647164  T
Q  1729 ttcttaacattttcttc 1745  Q
    |||||||||||||||||    
T  25647163 ttcttaacattttcttc 25647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 410 - 1520
Target Start/End: Original strand, 24874054 - 24875157
Alignment:
Q  410 attaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatatag 509  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |  |  |||    
T  24874054 attaagagtttaggtgagttgtatctagaaaataataagctttctggtgttttaccaacatgtttgggaaatatgacttctcttagaaaattgaacgtag 24874153  T
Q  510 gatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttcc 609  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||  || || |||    ||||||||||||  |||||| | |||||| || ||||    
T  24874154 gatctaacaatttgaactctaagataccttcatctctttggggtctcactgatatattaatgttagatttgtcctccaatgcttttattggtgattttcc 24874253  T
Q  610 acctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttg 709  Q
    ||| || ||||||||||||| || | ||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||    
T  24874254 acccgatattgggaatttgatagaacttgtaatattagatctatcaagaaatcaaatttcaagcaacattcctacaaccatcagttccttacaaaatttg 24874353  T
Q  710 cagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgt 809  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24874354 cagaatctctccttggctcataataaattgaatgggccaattcccacatcacttggtaaaatgataagcttaatctccttggacttgtcccaaaatatgc 24874453  T
Q  810 taactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacc 909  Q
    |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24874454 taacaggtgctgttcccaaatccttagaatcacttgtgtatcttcaaaacatcaacttctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacc 24874553  T
Q  910 tttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaag 1009  Q
    |||||| || | |||| ||  ||| ||| | |||| || | ||||||| || |||| ||||||||||||| | |  ||||  |  ||||     | || |    
T  24874554 tttcaagaactgcacagctatatcttttatgcatagtggaccactttgtggaaatcttcgcctacaagtaccaccttgtggcaa-aaac-----agaatg 24874647  T
Q  1010 tcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccata--gttgtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaag 1107  Q
    |||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||   |||    
T  24874648 tcaatggcgaagaagatataactcaaatgcatacttcccatatagttgtgtcaacctttctggttgttgcatgcatcatatgttttagacttaa---aag 24874744  T
Q  1108 gaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaat 1207  Q
    |||||   || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||    
T  24874745 gaaaagaattaaaattactcttgaaaggggtttatcagctttaggagctctaagaagaatatcatattatgaacttttgtaagcaacaaatggattcaat 24874844  T
Q  1208 gagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttag 1307  Q
    ||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||  | | ||    
T  24874845 gagagaaaattacttggaagggggagctttggctctgtgtatcaaggggagcttcctgatggtgagattattgcagtcaaagtatttgatttacaatcag 24874944  T
Q  1308 aggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgattt 1407  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24874945 aggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcaatgagaaatctacgtcatcgaaatctggtaaagattatcagtagttgctcaaatcttgattt 24875044  T
Q  1408 caaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatg 1507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  24875045 caaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacagttggttatattcaaataactattgtctaagtttcttgcaaaggttaaatataatg 24875144  T
Q  1508 atagatgttgcat 1520  Q
    ||||||| |||||    
T  24875145 atagatgctgcat 24875157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1182 - 1725
Target Start/End: Original strand, 24912446 - 24912988
Alignment:
Q  1182 ttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgc 1281  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24912446 ttgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagggggggatttggctctgtttatcatgggaagcttcttgatggtgagatgattgc 24912545  T
Q  1282 ggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagatt 1381  Q
     ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24912546 agttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgtagaatgcaatgcgatgagaaatctacgacatcgaaatctggtaaagatt 24912645  T
Q  1382 atcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaa 1481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  24912646 atcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttatattcaaataactattgtctaa 24912745  T
Q  1482 atttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcc 1581  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24912746 gtttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcttggttcttcaatgcctgtggttcattgtgatctaaagcc 24912845  T
Q  1582 tactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaact 1681  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24912846 ttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgcaaagctcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacagact 24912945  T
Q  1682 ttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttt 1725  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24912946 ttagctactgttggataccttgcaccaggtca-ttcttctcttt 24912988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 63 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 25393106 - 25392331
Alignment:
Q  63 tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||    
T  25393106 tcatatatgacaacaatttgacaattgaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcagggaatca 25393007  T
Q  163 tatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgga 262  Q
    ||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| || |  ||||| |||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||    
T  25393006 tata---tctaatcttcctaagtcaattggaaacataacttcggaattcttctccgcagaatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagttgga 25392910  T
Q  263 aacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatc 362  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||  | |||  ||    
T  25392909 aacatgagcaacttgctaactttttctctttttaggaataatataactggaccaatacctggtacattcaaaaagttgcaaaaacttcagtttttgagtc 25392810  T
Q  363 ttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtctt 462  Q
    || | | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||    
T  25392809 ttagcaacaatggactacaaggatcatttattgaggagatttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctaaaaaataataagctctctggagtttt 25392710  T
Q  463 accaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagac 562  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||| | ||| |||||||  |||||||  ||||| |||| | | | |||     
T  25392709 accaacatgtttgggaaatatgatttctcttataaggataaatgtaggatctaacagtttcaactctagaatacctttatctctttggagtctaagagat 25392610  T
Q  563 atcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatc 662  Q
     | |||||  || |||| || |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||| ||||||    
T  25392609 ttattagagataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattatacgattagacctatcaagaaatc 25392510  T
Q  663 atatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcact 762  Q
    | ||||||||||||||||| || | |||   |||||||  ||  |||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||  ||| |    
T  25392509 agatttcaagcaacattccaacaaccattaattccttactaacattgcagaaactctccttagcagataataaactgaatggatcaattcccaaatcaat 25392410  T
Q  763 tggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatca 841  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25392409 tggtcaaatggtaagcttgatctctttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatca 25392331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2393
Target Start/End: Complemental strand, 25322718 - 25322075
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaata 1864  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||  ||| | |||||| ||||  |||||||||| ||  |||  ||||||| ||    
T  25322718 acatgttatattagtaattaatgtgtacattgtatggatctaatccttaactttaataatattcgataactagtaataactagacttaacatgcagagta 25322619  T
Q  1865 tggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 1964  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25322618 tggttctagaggaattgtttctgtcaaaggagacgtgtacagctatgggataatgataatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 25322519  T
Q  1965 gttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaa 2064  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||  |||    
T  25322518 gttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtcaatcattgcctaattccattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataactggggaccaaa 25322419  T
Q  2065 ttgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgc 2164  Q
    |||||||| ||| | ||||||| || ||||||||| | ||||| |||| ||||||  || |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  25322418 ttgatgatctatcgactcacatatcatctatttttagtttagccctgagttgttgtgaagattcacctaaagcaagaatcaatatggcagatgttattgc 25322319  T
Q  2165 gtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttc---atttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatg 2261  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25322318 gacgctaatcaaaatcaacactttggttgttggcgcaaacacagtctagttattttcaatatttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatg 25322219  T
Q  2262 tcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaag-------------tacactatttcctttttcttttaaaggaat 2348  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || | | |||||||||| ||||||| |||||             ||   ||||||||||| ||||||||| |||    
T  25322218 tcttgctacttctggtttgtcctttcaactgt-cttcattgttgtatgagaatgaagttggctatctccttaatatatttccttttgcttttaaagaaat 25322120  T
Q  2349 cgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgt 2393  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25322119 cgactagtgaataaggatcatcacagaagcatgtaaattgtgtgt 25322075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2316
Target Start/End: Complemental strand, 25452978 - 25452503
Alignment:
Q  1840 ataacaagtattattatgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaag 1939  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  25452978 ataactagtattaacatgcagagtatggatctaaaggaattgtttccgtcaaaggagatgtgtacagctatgggatcatgttaatggaaatctttacaag 25452879  T
Q  1940 aagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaat 2039  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  25452878 aagaaagccaacagatgatatgtttgttccagaactaagcctgaagacatggatcagtggatcatttcctaattcaattatggagatcttggattcaaat 25452779  T
Q  2040 ttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaa 2139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  25452778 ttagtccaacaaattggggaacaaattgatgacatattgacttacatgtcatctatttttggtttagccctgaattgttgtgaagattcacctgaagcaa 25452679  T
Q  2140 gaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgtgtgggatgtttt 2239  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25452678 gaattaatattgcagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggttcttagcgcaagcagggtctagttagtttcatttgtgtgggatgtttt 25452579  T
Q  2240 caatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattga 2316  Q
    |||||| | || | |||| |||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  25452578 caatatggtttcttgattaatgtcttgcttcttctggtttgtccattcaatttt-cttcatcgttgtatgagattga 25452503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1811 - 2322
Target Start/End: Original strand, 24875468 - 24875976
Alignment:
Q  1811 ttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctat 1910  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24875468 ttatgtttaagaatatttgataaatagtaataaa---tattaacatgcagagtatggatctaaaggaattgtttctgtcaaaggagatgtgtacagctat 24875564  T
Q  1911 gggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctc 2010  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||     
T  24875565 gggattatgctaatggaaatcttcacaagaaaaaggccaacagatgatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtggatcattgccta 24875664  T
Q  2011 attcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctct 2110  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  24875665 attcaattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataactggggaccaaattgatgatatatcgactcacatgtcatctatttttagtttagccct 24875764  T
Q  2111 gaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtc 2210  Q
    || ||||||  || |||||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||    
T  24875765 gagttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatacggcagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaaggctttggttcttggcgcaaacagggtc 24875864  T
Q  2211 tagttatttt-catttgtgt--gggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttcta 2307  Q
    |||||||||| | ||||| |  | |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||  ||||| ||    
T  24875865 tagttattttccttttgtataagtggagttttcaatattgtttttgaattgatggcttgct-ctt-ttgtttgtcctttcaatttt-ctttgttgttgta 24875961  T
Q  2308 tgagattgaagtaca 2322  Q
    |||||||| ||||||    
T  24875962 tgagattggagtaca 24875976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2322
Target Start/End: Complemental strand, 25685709 - 25685152
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaata 1864  Q
    |||||||||| ||||||||| | | |||||  || |||||||||| |||  ||| |||||||||||||  | |||||||| ||  |||  ||||||| ||    
T  25685709 acatgttatattagtaattactgtgtacattgtatggatctaagcattaactttaagaatatttgataactggtaataactagacttaacatgcagagta 25685610  T
Q  1865 tggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 1964  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25685609 tggatctaaaggaattgtttcggtcaaaggagatgtgtacagctatgggattatgctaatggaaattttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 25685510  T
Q  1965 gttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaa 2064  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||    
T  25685509 gttgcagaactaagcttgaagacatggatcattggatcattgcctaattcaattatggaggtcctggattcaaatttagtccaactaactggggacacaa 25685410  T
Q  2065 ttgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgc 2164  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||  || | |||||| | | |||||| || |||| |||||||||||     
T  25685409 ttgatgatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagcattgaattgttgtgaagaatcacctgatgcaagaatcaatatggcagatgttattgt 25685310  T
Q  2165 gtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgtgt----gggatgttttcaatattgcttttggattgat 2260  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| | ||| |||    | |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25685309 gtcgctaatgaaaataaaggctttggttcttggcgcaaacagggtctagttatttcccttt-tgtactagtggcgttttcaatattg-ttttggattgat 25685212  T
Q  2261 gtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca 2322  Q
    | |||||| ||| ||||||||  ||| |||||| |||  || || |||||||||||||||||    
T  25685211 ggcttgct-ctttttgtttgttctttcaatttt-ctttgtttttgtatgagattgaagtaca 25685152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2221
Target Start/End: Complemental strand, 25715255 - 25714799
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaata 1864  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| ||  |||  ||||||| ||    
T  25715255 acatgttatattagtaattaatgtgtacattgtatggatctaagccttaactttaagaatatttgataactggtaataactagacttaacatgcagagta 25715156  T
Q  1865 tggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 1964  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25715155 tggttctagaggaattgtttctgtcaaaggagacgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatcttaacaagaaaaaagccaacagatgatatgttt 25715056  T
Q  1965 gttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaa 2064  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||  |||    
T  25715055 gttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtgaatcattgcctaattcaattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataactggggaccaaa 25714956  T
Q  2065 ttgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgc 2164  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||  || |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25714955 ttgatgatatatcgactcacatgtcatctatttttagtttagccctgagttgttgtgaaaattcacctgaagcaagaattaatatggcagatgttattgc 25714856  T
Q  2165 gtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttc 2221  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  25714855 gtcgctaatgaaaataaaggctttggttcttggcgcaaacagggtctagttattttc 25714799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1803 - 2222
Target Start/End: Original strand, 24913108 - 24913527
Alignment:
Q  1803 tctaagccttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtct 1902  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  24913108 tctaagctttatttttaagaatattttataaatagtaataactagtactaacttgcagagtatggatctaagggaattgtttctgtgaaaggagatgtgt 24913207  T
Q  1903 acagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatc 2002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  24913208 acagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaataatgccaacagatgatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtggatc 24913307  T
Q  2003 attgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttgga 2102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || | ||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |     
T  24913308 attgcctaattcaattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataacttgggaccaaattgattatatattgactcacatgtcatctatttttagt 24913407  T
Q  2103 ttagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaa 2202  Q
    ||||| |||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  24913408 ttagccctgatttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatatggcagatgttattgcgacgctaatcaaaatcaagactttggttgttggcgcaa 24913507  T
Q  2203 acacagtctagttattttca 2222  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24913508 acacaatctagttattttca 24913527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25490264 - 25489800
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttatttttt--agaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaa 1862  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || | | || |||||||||||||| |||||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||  |||||||     
T  25490264 acatgttatattagtaattaatgtgtagacagtatggatctaagccttaattttttaaaaatatttgataactcgtaataactagtattaacatgcagag 25490165  T
Q  1863 tatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgt 1962  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  25490164 tatggatctaaaggaattgtttctgtcaaaggagatgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatctttacaaggagaaaaccaatagatgatatgt 25490065  T
Q  1963 ttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaa 2062  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||  |    
T  25490064 ttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtcgatcattgcctaattccattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataactggggacca 25489965  T
Q  2063 aattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttatt 2162  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  ||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  25489964 aattgataatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagccatgagttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatatggcagatgttatt 25489865  T
Q  2163 gcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25489864 gcgacactaatcaaaatcaagactttagttgctggcgcaaacacagtctagttattttcatttgt 25489800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25647031 - 25646642
Alignment:
Q  1838 taataacaagtattattatgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcaca 1937  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25647031 taataactagtattaacatgcagagtatggatcgaaaggaattgtttctgtgaaaggagatgtgtacaactatgggattatgctaatggaaatctttaca 25646932  T
Q  1938 agaagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaa 2037  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25646931 aggagaaagccaatagatgatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtagatcattgcctaattcaattatggaggtcatggattcaa 25646832  T
Q  2038 atttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaaga 2137  Q
    |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||| |||     
T  25646831 atttagtccaaagaactggggaccaaattgatgatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagccctgaattgttgtgaagattcacctgaagc 25646732  T
Q  2138 aagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25646731 aagaatcaatatggcagatgttattgcgacgctaaacaaaatcaagactttggttgttggcgcaaacacagtctagttattttcatttgt 25646642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25604699 - 25604237
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaata 1864  Q
    |||||||||| |||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||   |||||||||| ||  |||  ||||||| ||    
T  25604699 acatgttatattagtaaataatgtgtacattgtatggatctaagccttaactttaagaatatttgattactagtaataactaggcttaacatgcagagta 25604600  T
Q  1865 tggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 1964  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  25604599 tggttctagaggaattgtttctgtcaaaggagatgtgtacagctatggaattatgctaatggaaatctttacaaagagaaagccaatagatgatatgttt 25604500  T
Q  1965 gttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaa 2064  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||  |||    
T  25604499 gttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtcgatcattgcctaattccattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataactggggacgaaa 25604400  T
Q  2065 ttgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgc 2164  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |||| ||| ||||||||    
T  25604399 ttgatgatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagctctgagttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatatggcagaagttattgc 25604300  T
Q  2165 gtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
     || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25604299 ttcactaatcaaaatcaagactttggttgttggcgcaaacgcagtctagttattttcatttgt 25604237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25569878 - 25569506
Alignment:
Q  1855 atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 1954  Q
    ||||||| | |||| |||| || ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25569878 atgcagagtgtggaactaaggggattgtttctgtgaaaggagatatttacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 25569779  T
Q  1955 tgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaatt 2054  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25569778 tgatatatttgttgcagaactaagtttgaagacatggatcagtgaatcattgccaaattcaattatggaggtcttggattcaaatttagtccaacaaatt 25569679  T
Q  2055 ggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaag 2154  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||    
T  25569678 ggggaacaaattgatgacatattgatttacatgtcatctatttttggtttagccctgaattgttgcgaagattcacctgaagcaagaattaatattgcag 25569579  T
Q  2155 atgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  25569578 atgttattgcgtcgttaatcaaaatcaagactttgattcttagcgcaagcagggtctagttattttcatttgt 25569506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1811 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25341012 - 25340599
Alignment:
Q  1811 ttattttttagaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctat 1910  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||    |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25341012 ttatgtttaagaatatttgataaatagtaataaa---tattaagatgcagagtatggatctaagggaattgtttctgtcaaaggagatgtgtacagctat 25340916  T
Q  1911 gggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctc 2010  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||| |||     
T  25340915 gggatcatgttaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgtttgttgctgaactaaacttgaagacatggatcagtggatcatttccta 25340816  T
Q  2011 attcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctct 2110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  25340815 attcaattatggaggtcttggattcaaatttagtccaacaaattggagaacaaattgatgacatattgaattacatgtcatctatttttggtttagccct 25340716  T
Q  2111 gaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtc 2210  Q
    ||| |||||  || |||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||  |||    
T  25340715 gaaatgttgagaagattcacctgaagcaagaattaatattgcagatgttattgcgtcgttaatcaaaatcaagactttgattcttagcgcaagcagggtc 25340616  T
Q  2211 tagttattttcatttgt 2227  Q
    |||||||||||||||||    
T  25340615 tagttattttcatttgt 25340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25695426 - 25694960
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttatttttta-gaatatttg---ataggtagtaataacaagtattattatgcag 1860  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||| | || |||||||||| |||||||||| ||||||||    |||  ||||| |||| | |||||  ||||||    
T  25695426 acatgttatattagtaattgatgtgtacacagtatggatctaagctttattttttaagaatatttatttataaatagtagtaactattattaacatgcag 25695327  T
Q  1861 aatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatat 1960  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25695326 agtatggttctagaggaattgtttctgtgaaaggagacgtgttcagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatat 25695227  T
Q  1961 gtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaa 2060  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||     
T  25695226 gtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtcgatcattgcctaattccattatggaggtcatggattcaaatttagtccaaataactggggac 25695127  T
Q  2061 aaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgtta 2160  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||  |  |||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||    
T  25695126 caaattgataatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagctctaagttgttgtgaggattcacctgaagcaagaatcaatatggcagatgtta 25695027  T
Q  2161 ttgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25695026 ttgcgacgctaatcaaaatcaacactttggttgttcgcgcaaacacagtctagttattttcatttgt 25694960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25475247 - 25474875
Alignment:
Q  1855 atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 1954  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25475247 atgcagagtatggatctaaaggaattgtttctgtgaaaggagatgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatcttaacaagaaaaaagccaacaga 25475148  T
Q  1955 tgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaatt 2054  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||| |    
T  25475147 tgatatgtttgttgcagaactaaaattgaagacatggatcaatggatcattgcctaattcaattatagaagtcatggattcaaatttagtccaaaaaaat 25475048  T
Q  2055 ggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaag 2154  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || ||||  | ||||||||||| ||||| || | ||||||  || ||| |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  25475047 ggggaacaaattgatgacatattgactaacataacatctatttttggtttagccctcagttgttgtgaagatttacctaaagcaagaattaatatggcag 25474948  T
Q  2155 atgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||  || |||||||||||||||||    
T  25474947 atgttattaagtcgctaatcaaaatcaagactttggttcttagagcaaacagggtatagttattttcatttgt 25474875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2227
Target Start/End: Complemental strand, 25800273 - 25799886
Alignment:
Q  1840 ataacaagtattattatgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaag 1939  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25800273 ataactagtattaacatgcagagtatggatctaaaggaattgtttccgtcaaaggagatgtgtacagctatgggatcatgttaatggaaatcttcacaag 25800174  T
Q  1940 aagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaat 2039  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  25800173 aagaaagccaacagatgatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtggatcattgcctaattcaatcatggaggtcatggattcaaat 25800074  T
Q  2040 ttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaa 2139  Q
    |||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||  ||||||| ||  || | |||||| | |  |    
T  25800073 ttagtccaaataactggggaccaaattgatgatatattgactcacatgtcatatatttttagtttagcattgaattgctgtgaagaatcacctgatgcca 25799974  T
Q  2140 gaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25799973 gaatcaatatggcagatgttattgcgacgctaatcaaaatcaagactttggttgttggtgcaaacacagtctagttattttcgtttgt 25799886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2189
Target Start/End: Complemental strand, 23257908 - 23257574
Alignment:
Q  1855 atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 1954  Q
    ||||||| |||||||| || |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23257908 atgcagagtatggatcaaagggaactatttctgtcaaaggagatgtatacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaaggagaaagccaacaga 23257809  T
Q  1955 tgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaatt 2054  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23257808 tgatatgttcgttgaagaactaagtttgaagacatggatcgatggatcattgcctaattcaattatggaggtcttagattctaatttagtccaacaattt 23257709  T
Q  2055 ggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaag 2154  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  || ||  ||||||||| |||  ||    
T  23257708 ggggaacaacttgatgatattttgactcacatgtcatctatttttggtttagccctgcattgttgcgaatattcttctgaatcaagaattaatatgacag 23257609  T
Q  2155 atgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttg 2189  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23257608 atgttattgcgtcactcatcaaaatcaagactttg 23257574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1483 - 1719
Target Start/End: Complemental strand, 25490594 - 25490358
Alignment:
Q  1483 tttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcct 1582  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25490594 tttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatgcctgtggttcattgtgatctaaagcct 25490495  T
Q  1583 actaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactt 1682  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25490494 tccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgctaagctcatggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactt 25490395  T
Q  1683 tggctactattggataccttgccccaggtcatttctt 1719  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  25490394 tggctactgttggatacctcgcaccaggtcatttctt 25490358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2225
Target Start/End: Original strand, 22901228 - 22901598
Alignment:
Q  1855 atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 1954  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22901228 atgcagagtacggaactaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtatacagctatgggattatgctaatggaaatctttacaagaagaaagccaacaga 22901327  T
Q  1955 tgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaatt 2054  Q
    |||||||||||| | |||  ||| |||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |    
T  22901328 tgatatgtttgtagaagacctaactttgaagacatggatcagtgaatcattgcctaattcaattatggatgtcttggattctaggttagtccaacaaaat 22901427  T
Q  2055 ggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaag 2154  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22901428 ggggggaaaattgatgacatattgagttgcatgtcatctatttttggtttagccctgaattgttgcaaagattcacctgaagaaagaattaatatggaag 22901527  T
Q  2155 atgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcattt 2225  Q
    |||||||   |  ||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||  ||||||||||||| ||||    
T  22901528 atgttatcaagatgctaatcaaaatcaagactatggttcttgatgaaaacatggtctagttattttaattt 22901598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 63 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 25653118 - 25652552
Alignment:
Q  63 tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||| | |||||    
T  25653118 tcatagatgacaacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttcattgacaaattgtagatatttgacatatcttgacttatcaggtaatca 25653019  T
Q  163 tatactatcca---atcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagtt 259  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||   |  ||||||| |||||||||||||| ||   |||||||  |||||||    
T  25653018 tatactacccaccaatcttcctaagtcaattggaaatataacttcagaatacatcagggcagaatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagtt 25652919  T
Q  260 ggaaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattgg 359  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||| ||||| |    
T  25652918 ggaaacatgagcaacttgttatattttaatcttcatgggaataatataactggaccaatacctggtacattcaaagagttgcagaaacttca-gtatttg 25652820  T
Q  360 a-tcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggag 458  Q
    | |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  25652819 aatcttggcaacaatggactacaaggatcatttattgaggaactttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctacaaaataataagctctctggag 25652720  T
Q  459 tcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcat 558  Q
    | |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||   || || |||||||||| | ||| |||||||  |||||||  ||||| |||| | | |     
T  25652719 ttttaccaacatgtatgggaaatatgatttctcttagaagaataaatgtaggatctaacagtttaaactctagaatacctttatctctttggagtcttag 25652620  T
Q  559 agacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatt 626  Q
    ||| || |||||  || |||| || |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25652619 agatatattagagataaatttttcttcaaattctttaattggtaatcttccacctgagattgggaatt 25652552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1547 - 1741
Target Start/End: Original strand, 24875157 - 24875351
Alignment:
Q  1547 tcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactca 1646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24875157 tcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagccttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgcaaagctca 24875256  T
Q  1647 tggatgaaggacaatctaaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacatttt 1741  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  24875257 tggatgaaggacaatctgaaactcatacacaaactttggctactattggataccttgcaccaagtcatttcttctctttaacttcctgacatttt 24875351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1947 - 2222
Target Start/End: Complemental strand, 25385937 - 25385662
Alignment:
Q  1947 ccaacagatgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtcc 2046  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  25385937 ccaacagatgatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtcgatcattgcctaattccattatggaggtcatggattcaaatttagtcc 25385838  T
Q  2047 aacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaa 2146  Q
    ||  || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  ||| ||||||  || |||||| | ||| |||||| ||    
T  25385837 aaataactggggaccaaattgattatatattgactcacatgtcatctatttttagtttagccttgagttgttgtgaagattcacttgaagcaagaatcaa 25385738  T
Q  2147 catggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttca 2222  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25385737 tatggcagatgttattgcgacgctaatcaaaatcaacactttggttgttggcgcaaacacagtctagttattttca 25385662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25807063 - 25806843
Alignment:
Q  63 tcataaatgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatca 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||    
T  25807063 tcatatatgacaacaatttgacaatatatgattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaagtatctagacttatcagggaatca 25806964  T
Q  163 tatactatccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttgga 262  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||   |  ||||||| |||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||    
T  25806963 tatac---ccaatcttcctaagtcaattggaaacataagttcagaatacatcagggcagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttgga 25806867  T
Q  263 aacatgagcaatttactatctttt 286  Q
    ||||||||||| || |||| ||||    
T  25806866 aacatgagcaaattgctatttttt 25806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 24872813 - 24873026
Alignment:
Q  73 caacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatcc 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||| ||    
T  24872813 caacaatttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacgaattgtagatatttgaaatatcttgacttatcagggaatcatgtactaccc 24872912  T
Q  173 aatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagca 272  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||   |  ||||| | |||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  24872913 aatcttccaaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggcaaaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatgacca 24873012  T
Q  273 atttactatctttt 286  Q
    | || |||| ||||    
T  24873013 acttgctatatttt 24873026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 2080 - 2322
Target Start/End: Original strand, 24885571 - 24885813
Alignment:
Q  2080 ctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaat 2179  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24885571 ctcacatgtcatctatttttagtttagccctgagttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatacggcagatgttattgcgtcgctaatcaaaat 24885670  T
Q  2180 caagactttggctcttggcacaaacacagtctagttatttt-catttgtgt--gggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttg 2276  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |  | |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  24885671 caaggctttggttcttggcgcaaacagggtctagttattttccttttgtataagtggagttttcaatattgtttttgaattgatggcttgct-ctt-ttg 24885768  T
Q  2277 tttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca 2322  Q
    |||||| ||| |||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  24885769 tttgtcctttcaatttt-ctttgttgttgtatgagattggagtaca 24885813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 2011 - 2189
Target Start/End: Complemental strand, 29429348 - 29429171
Alignment:
Q  2011 attcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctct 2110  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| | ||||||||||| ||||  ||    
T  29429348 attcaattatggaggtcttagactctaattgagtccaacagaatggggaacaaattgatgacatattgacatacatgccttctatttttggtttagtcct 29429249  T
Q  2111 gaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttg 2189  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29429248 gaattgttgtgaatgttcgcctaaaacaagaattaatatggtggatgttattgggt-gctaatcaaaatcaagactttg 29429171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2393
Target Start/End: Complemental strand, 25799854 - 25799672
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca 2322  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||| ||||||| ||||||       
T  25799854 tttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcctttcaactgt-cttcattgttgtatgagaatgaagttgg 25799756  T
Q  2323 ctatttc-------------ctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgt 2393  Q
    |||||||             ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25799755 ctatttccttaacatattttcttttgcttttaaagaaatcgactagtgaataaggatgatcacagaagcatgtaaatggtgtgt 25799672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2429
Target Start/End: Complemental strand, 25694841 - 25694738
Alignment:
Q  2324 tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgtgatgttttcatgtatatgttgtatcccttc 2423  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||  | ||||||||||||| ||    
T  25694841 tatttccttttgcttttaaagaaatcgactagtgaataaggatcatcacagaagcatgtaaatcgtgtgtactgtatcca--tttatgttgtatcccctc 25694744  T
Q  2424 tcaatt 2429  Q
    ||||||    
T  25694743 tcaatt 25694738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 25340535 - 25340434
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca 2322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||||||    
T  25340535 tttgtgtgggatgttttcaatatggtttttggatttatgtcttgcttcttctggtttgtcttttcaatttt-cttcatcgtt---tgagattgaagtaca 25340440  T
Q  2323 ctattt 2328  Q
    | ||||    
T  25340439 ccattt 25340434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 25569442 - 25569338
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca 2322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25569442 tttgtgtgggatgttttcaatatggtttttggatttatgtcttgcttcttctggtttgttctttcaatttt-cttcatcgttgtttgagattgaagtaca 25569344  T
Q  2323 ctattt 2328  Q
    | ||||    
T  25569343 ccattt 25569338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2326 - 2429
Target Start/End: Complemental strand, 25489687 - 25489586
Alignment:
Q  2326 tttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgtgatgttttcatgtatatgttgtatcccttctc 2425  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| | ||  | ||||||||||||| ||||    
T  25489687 tttccttttgcttttaaagaaatcgactagtgaataaggatcaacacagaagcatgtaaatcgtgtgtattgtatcca--tttatgttgtatcccctctc 25489590  T
Q  2426 aatt 2429  Q
    ||||    
T  25489589 aatt 25489586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2282
Target Start/End: Complemental strand, 25489767 - 25489708
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtc 2282  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25489767 tttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtc 25489708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2393
Target Start/End: Complemental strand, 25604099 - 25604030
Alignment:
Q  2324 tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgt 2393  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25604099 tatttccttttgcgtttaaagaaatcaactagtgaataaggatcatcacagaagcatgtaaatcgtgtgt 25604030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2232 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 25646600 - 25646505
Alignment:
Q  2232 gatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtacactattt 2328  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||   | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  25646600 gatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttctggtttgtcctttcaaccgt-cttcgttgttgtatgagatggaagtacattattt 25646505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2274
Target Start/End: Complemental strand, 25694929 - 25694878
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttct 2274  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25694929 tttgtgtttgatgttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttct 25694878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2236 - 2282
Target Start/End: Original strand, 24913522 - 24913568
Alignment:
Q  2236 ttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtc 2282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24913522 ttttcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcctgtttgtc 24913568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 29429070 - 29428965
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttgga-ttgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtac 2321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||  ||| || ||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  29429070 tttgtatgggatgttttcaatattgcttttggatttgatgtcttgctccttttagtttgttctttcaaattt-cttcattgttgcatgaaattgtagtac 29428972  T
Q  2322 actattt 2328  Q
    | |||||    
T  29428971 attattt 29428965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2404
Target Start/End: Complemental strand, 25474725 - 25474645
Alignment:
Q  2324 tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaatatggatcatcgcagaagcatgtaaatcgtgtgtgatgttttcat 2404  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25474725 tatttcctttaactgttaaaagaatcaactagtgcataaggatcatatcacaagcatgtaaatcatgtgtgatgttttcat 25474645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25477475 - 25477406
Alignment:
Q  78 atttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctaga 147  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| || ||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25477475 atttaacaatagatgattcacatcagttctttaactccttgacaagttgtagatatttgaaatatctaga 25477406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2286
Target Start/End: Complemental strand, 25604205 - 25604143
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtctttt 2286  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  25604205 tttgtgtttgatgttttcaatattg-ttttgtattgatgtcttgctacttctggttggtccttt 25604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2324 - 2361
Target Start/End: Complemental strand, 25385579 - 25385542
Alignment:
Q  2324 tatttcctttttcttttaaaggaatcgactagtgaata 2361  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25385579 tatttccttttgcttttaaagaaatcgactagtgaata 25385542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2268
Target Start/End: Complemental strand, 25474811 - 25474766
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgct 2268  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  25474811 tttgtgtgggatgttttcaatatgctttttggatttatgtcttgct 25474766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 810; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 810; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 1725
Target Start/End: Original strand, 15293 - 16948
Alignment:
Q  69 atgacaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatact 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||    
T  15293 atgacaacaaattgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatcttgacttatcagggaatcatgtact 15392  T
Q  169 atccaatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatg 268  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||   |  ||| ||| |||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  15393 atccaatattccaaagtcaattggaaacataacttcagaatacatcagggtagaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatg 15492  T
Q  269 agcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtatt-ggatcttgga 367  Q
    || || ||| |   |||||||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||     
T  15493 agtaacttattgcatttttctctttctaggaataatataactggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaacttca-gtatttggatcttggc 15591  T
Q  368 accaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaa 467  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||| |    
T  15592 aacaatggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaagagtttgggtgagttgtatctaaacaataataagctctcgggagttttaccga 15691  T
Q  468 catgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatctt 567  Q
    ||||| | |||||||||| |||| |||||| | || | || |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  15692 catgtttgggaaatatgagttctattataaggttatacattggatctaacagtctgaactctaagataccttcctctctttggagtgtcatagatatctt 15791  T
Q  568 agaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatt 667  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  15792 agagctagatttgtcctctaatgccttcattggtaatcttccgcctgagattgggaatttgagagcaattatagctttagatctatcaggaaataatatt 15891  T
Q  668 tcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtg 767  Q
    ||||| ||||||||| | | ||| ||||  || || | |||  | | ||||||||||||  | || |||||  ||| |||||||||  | ||||||||||    
T  15892 tcaagaaacattccttcaaccattggtttattgaagactttagaaactctctccttagcaaataacaaactgaatgaatcaattccatcatcacttggtg 15991  T
Q  768 aaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaactt 867  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992 aaatgttgagcttgacctccttggacttgtctcagaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaactt 16091  T
Q  868 ctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcct 967  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16092 ctcatataatagattacaaggagagattcctgatggtggacatttcaaaaacttcacagctcaatcatttattcataatggtgcactttgcggcaatcct 16191  T
Q  968 cgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactc 1067  Q
    | ||| |||||| || | |||  || | || ||||||||  |||||||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  16192 ctcctccaagtacctaaatgtcgtaagcaagttaagaaatggtcaatggaaaaaaagcttatattgaaatgcatacttcccatagttgtgtcagccattt 16291  T
Q  1068 tggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaat 1167  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16292 tggttgttgcttgcatcatacttttaaaacataataaaaggagaaagaatgaaaatactcttgaaaggggtttgtcaactctaggagctccaagaagaat 16391  T
Q  1168 ttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgat 1267  Q
     || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  16392 atcctattatgaacttgtgcaagcaactaatggattcaatgagagtaatttccttggaagtgggggatttggctctgtttatcaggggaagcttcttgat 16491  T
Q  1268 ggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaa 1367  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16492 ggtgagatgattgccgttaaagtaattgatttgcaatcagaggcaaaatcaaagagctttgatgcagaatgcaatgcgatgagaaatctacgacatcgaa 16591  T
Q  1368 atctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcaga 1467  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |    
T  16592 atttggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacagttggttatattcaaa 16691  T
Q  1468 ttactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcat 1567  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16692 taactattgtctaagtttcttgcaaaggttaaatataatgatagaagttgcatctgcattggaatatcttcatcatggttcttcaatgcctgtggttcat 16791  T
Q  1568 tgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaa 1667  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16792 tgtgatctaaagccttccaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgctaagctcatggatgaaggtcaatctaaaa 16891  T
Q  1668 ctcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttt 1725  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16892 ctcatacacagactttagctactgttggataccttgcaccaggtca-ttcttctcttt 16948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 220 - 1224
Target Start/End: Original strand, 48966 - 49966
Alignment:
Q  220 agattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagcaatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaata 319  Q
    |||||||||| |||| |||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||  |||||| |||| || ||||||    
T  48966 agattcatgtcgaatagaaggtaatattcccatagaaatcggaaacatgagcaacatgctaattttttctataaatgataataatataaaaggaccaata 49065  T
Q  320 cctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtt 419  Q
    |||||||   | |||  |||| |||| |||||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||    
T  49066 cctggtaccatcaaaaagttaaaaaatcttcaaatgttggatcttggcaacaatggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaagagtt 49165  T
Q  420 tgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataa 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| | || | || |||||||| |     
T  49166 tgggtgagttgtatctagaaaataataagctctctggtggtttaccaacatgtttgggaaatatgagttctattataaggttatacattggatctaacag 49265  T
Q  520 tttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagatt 619  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49266 tctgaactctaagatgccttcctctctttggagtgtcatagatatcttagagatagatttgtcctctaatgccttcattggtaatcttccacctgagatt 49365  T
Q  620 gggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctct 719  Q
    || ||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || | ||||  ||||||| |||  |||||||  ||||    
T  49366 ggcaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaatcagatttcaag-aacattccaacaaccatcaattccttacaaacattgcagatgctct 49464  T
Q  720 ccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgt 819  Q
    | |||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49465 cattagcagataataaactgtatggatcaattcccacatcacttggtgaaatggtaagcttggtctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgt 49564  T
Q  820 tattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaat 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49565 tattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacattaacttctcatataatagattaaaaggagagattcctgatggtggacctttaaaaaat 49664  T
Q  920 ttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaa 1019  Q
    ||||   | ||||| ||    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||||    || |||| |||| ||||||   |     
T  49665 ttcatggccgaatctttcactcataatggagccctttgtggcaatccccgcctacatatacctcagtgtgttgaacaagttaaaaaaaggtcaat---ag 49761  T
Q  1020 agaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttga 1119  Q
      ||| | ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||| || |    
T  49762 gaaagttgttattcaaatgcatcattcccttaggtgtgtcaaccattttggttgttgcatgcatcatacttttaaagcataataaaaggtaaaagattca 49861  T
Q  1120 aaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaattta 1219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  49862 aaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctctaagaagaatttcctattatgaacttgtgcaagcaactaatggatttagtgagtgtaattta 49961  T
Q  1220 cttgg 1224  Q
    |||||    
T  49962 cttgg 49966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1856 - 2227
Target Start/End: Original strand, 17148 - 17519
Alignment:
Q  1856 tgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagat 1955  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17148 tgcagagtatggatctaagggaattgtttctgtcaaaggagacgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatctttacaagaagaaagccaacagat 17247  T
Q  1956 gatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattg 2055  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  17248 gatatgtttgttgcagaactaagcttgaagacatggatcagtggatcattgcctaattcaattatggagctcttggattcaaatttagtccaaataactg 17347  T
Q  2056 gggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaaga 2155  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |||| |||    
T  17348 gggaccaaattgatgatatatcgactcacatgtcatctatttttagtttagccctgagttgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatatggcaga 17447  T
Q  2156 tgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggcacaaacacagtctagttattttcatttgt 2227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17448 tgttattgcgacgctaatcaaaatcaagactttggttgttggcgcaaacacagtctagttattttcatttgt 17519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 723
Target Start/End: Original strand, 35347 - 35987
Alignment:
Q  80 ttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatccaatcttc 179  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||   ||||||||||||    
T  35347 ttgacaatagaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatcttgacttatcaggtaatcata---tatccaatcttc 35443  T
Q  180 ctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagcaatttact 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||||| | |||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  35444 ctaagtcaattggaaacataacttcagaatacttcagggcaaaatcatgtggaattggtggttatattcccctagaagttggaaacatgagcaccttgct 35543  T
Q  280 atctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaacta 379  Q
    |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||||||| ||  | | |||||| || | || ||||||||||||  |||||    ||||| |||     
T  35544 atcttttgatctgtatgacaataatataaatggaccaatacctcgttcaatcaaagggctagagaagcttcaagtattgtctcttgcttacaatgcactc 35643  T
Q  380 catggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaa 479  Q
     | |||||||| ||||| || || |||   ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||    
T  35644 aaaggatcattcattgatgagctctgtctaattaagagtttaggtgagttgtatatagaaaataataagctttctggtgttttaccaacatgtttgggaa 35743  T
Q  480 atatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagattt 579  Q
    ||||||||||||||| |||  |  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||  || || |||    |||||||    
T  35744 atatgacttctcttagaaaattgaacgtaggatctaacaatttgaactctaagataccttcatctctttggggtctcactgatatattaatgttagattt 35843  T
Q  580 gtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacatt 679  Q
    |||||  |||||| | |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35844 gtcctccaatgcttttattggtgattttccacccgatattgggaatttgagagaacttgtaatattagatctatcaagaaatcaaatttcaagcaacatt 35943  T
Q  680 cctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctcctt 723  Q
    ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35944 cctacaaccatcagttccttacaaaatttgcagaatctctcctt 35987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2328
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17656
Alignment:
Q  2223 tttgtgtgggatgttttcaatattgcttttggattgatgtcttgctacttcttgtttgtcttttgaattttacttcattgttctatgagattgaagtaca 2322  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | | |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  17552 tttgtgtttgatgtattcaatattgtttttggattgatgtcttgctacttcctgtttgtcctttcaactgt-cttcgttgttgtatgagaatgaagtaca 17650  T
Q  2323 ctattt 2328  Q
     |||||    
T  17651 ttattt 17656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 48800 - 48881
Alignment:
Q  72 acaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatc 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48800 acaactatttgacaatagatgattcacatcagttctttaattccttgacaagttgtagatatttgaaatatctagatttatc 48881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1765 - 1842
Target Start/End: Original strand, 17041 - 17118
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttattttttagaatatttgataggtagtaata 1842  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||  || || ||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  17041 acatgttatattagtaattaatgtgtacatggtatgggtctaagctttatttttaagaatattttataaatagtaata 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0830 (Bit Score: 731; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0830
Description:

Target: scaffold0830; HSP #1
Raw Score: 731; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 1745
Target Start/End: Original strand, 2786 - 4455
Alignment:
Q  73 caacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatcc 172  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||  |||||| ||||  |||     
T  2786 caacaatttgacaatcgacgatcctcttcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaaattctagacatatcgagaaatcctatatcatca 2885  T
Q  173 aatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggca--gattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgag 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2886 aatcttcctaagtcaattggaaacataacttcaac-ttattttga-catggatttatgtggaattgatggtagtattcccctagaagttggaaacatgag 2983  T
Q  271 caatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtatt-ggatcttggaac 369  Q
    ||| || |||    ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |     
T  2984 caacttgctacaactttctctacctgggaataatataaatggaccaataccggtcacattaaaaggattacaaaaacttca-gtatttggatcttagcaa 3082  T
Q  370 caatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaaca 469  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||  ||| |||| ||| ||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| || ||  || ||    
T  3083 caatggactacaaggatcatttattaaagagctttgtggaattgagaggttgagtgagttatatctacaaaataataagctatctggtgttttgtcacca 3182  T
Q  470 tgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttag 569  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||| |||  |  | ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||| | | | | | ||||||     
T  3183 tgtttgggaaatatgacttttcttagaaatttggacataggatctaacaattttaactctaggattccttcgtctctttggagtcttacatatatcttaa 3282  T
Q  570 aactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttc 669  Q
    |  || ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |  ||||||||||  |||||||||||||    
T  3283 agttaaatttgtcctctaatggtttcagtggtaatcttccacctgagattgcaaatttgagagcaattacattattagatctatctagaaatcatatttc 3382  T
Q  670 aagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaa 769  Q
    |||||||||||||   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3383 aagcaacattcctgaaaccatcagttccttaaaaactttgcagaatctctccttagccgataacaaactgtatggatcaattcccacatcacttgatgaa 3482  T
Q  770 atggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttct 869  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3483 atggtaagcttgatctccttggacttgtctcaaaatatgctaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtaccttcaaaacatcaacttct 3582  T
Q  870 catgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcg 969  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || | || ||| | ||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  3583 catacaatagattgcaaggagagattccttatggtggagctttccaaaatttgacagctcattcttttatgcataatttagcactttgcggaaatccccg 3682  T
Q  970 cctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctg 1069  Q
    ||| |||||| | |  |||| ||   ||  | |||||| |||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  3683 cctccaagtaccaccttgtggtaaacaagatcagaaaatgtcaatgacaaagaagataatactcaaattcatacttcccatagttgtgtcagccattttg 3782  T
Q  1070 gttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaattt 1169  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| | |    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  3783 gttgttgcatgcatcatatgttttaaactcag---aagaaaaaatgttgaaaatacttttgaaaggggtttatcagcattaggagctccaagaagaatat 3879  T
Q  1170 catattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatgg 1269  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3880 catattatgaacttgtggaagcaacaaatggattcgaagagagcaaattacttggaagggggagctttggttctgtgtatgaggggaagcttcctaatgg 3979  T
Q  1270 tgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaat 1369  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |  |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3980 tgagatgattgcagttaaagtaattgatttgcaatctgaggcaaaatcaaagagttttgatgtagaatgcaatgcaatgagaaatctacgacatcgaaat 4079  T
Q  1370 ctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagatt 1469  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  4080 ctggttaagattatcagcagttgttcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtagacaaatggttatattcaaata 4179  T
Q  1470 actattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattg 1569  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4180 aataatgtataaatttcttgcaaaggttaaatataatgatagatgttgcatcagcattggaatatctacatcatggttcttcaatacctgtggttcattg 4279  T
Q  1570 tgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaact 1669  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  4280 agatctaaagccttcaaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttggtattgccaagctcatggacgaaggacattctaaaact 4379  T
Q  1670 catacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttcttc 1745  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  4380 catacacaaactttggcaactatcggataccttgcaccaggtaatttcttttcttatactccttaacattttcttc 4455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0830; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1765 - 2187
Target Start/End: Original strand, 4506 - 4929
Alignment:
Q  1765 acatgttataatagtaattaatatttacataatacggatctaagccttatttttta-gaatatttgataggtagtaataacaagtattattatgcagaat 1863  Q
    |||||||||| ||||||||| |   |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| |    
T  4506 acatgttatattagtaattattgcgtacatagtatggatctaagccttatttttttcgaatatttgatagctagtaataactagtatttaaatgcagagt 4605  T
Q  1864 atggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgtt 1963  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4606 atggatctaaaggaattgtttctgtcaaaggagatgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatcttcaccagaagaaagccaacagatgatatgtt 4705  T
Q  1964 tgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaattggggaaaaa 2063  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4706 tgttgcagaactaagtttgaaatcatggatcaatgaatcattgcctaattcaattatgaaggtcttggattcaaatttagtccaacaaattgaggaagaa 4805  T
Q  2064 attgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaagatgttattg 2163  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  4806 actgatgatatattgattcatatgtcatctatttttggtttagctttgaattgttgcgaatattcaccggaagcaagaattaatatgacagatgttattg 4905  T
Q  2164 cgtcgctaatcaaaatcaagactt 2187  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  4906 cgtcgctaataaaaatcaagactt 4929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 713; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 713; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 1745
Target Start/End: Complemental strand, 10325652 - 10323988
Alignment:
Q  72 acaacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatc 171  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||| |    
T  10325652 acaacaatttcacaattgaagattctcatcaattctttacttccttgtcaaattgtagaaatttgaaatttctagacttatcaaggaatcatatactacc 10325553  T
Q  172 caatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagc 271  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||  ||| || |||||||  |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10325552 aaatcttcctaaatcaattggaaacctaacagcagaattcttctgggcagcatcatgtggaattgatggtaatattcccctagaagttggaaacatgagc 10325453  T
Q  272 aatttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaacca 371  Q
    || || |||  |||||||||   || ||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | | ||    
T  10325452 aacttgctacgtttttctctttctgtgaataatataactggaccaatacctagtacattcaaagggttgcagaaacttcaaattttgaatcttagcagca 10325353  T
Q  372 atgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatg 471  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  10325352 atggactacaaggatcatttattgaagaattttgtgaaatgaagagtttgggtgacttgtatcttgaaaagaataagctctctggagttttaccaacatg 10325253  T
Q  472 tgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaa 571  Q
    | | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | | |  || || |||||     
T  10325252 tatgggaaatatgacttctcttataaggatacatgtaggatccaacaatttgaactctaaaatacctttatctctttggagtcttagggatatattagag 10325153  T
Q  572 ctagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaa 671  Q
     || |||| || |  ||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  10325152 ataaatttttcttcaaattctttaagtggtaatcttccacctcagattgagaatttgagagcaattatattgttagacctatcaagaaatcatatttcaa 10325053  T
Q  672 gcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaat 771  Q
    |||||||||| || | ||||   |||||||  |  ||||||| ||||||||||||  | ||| ||||  |||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  10325052 gcaacattccaacaaccatcaactccttaatcacattgcagattctctccttagcagaaaatgaactgaatggatcaattcccaaattacttggtcaaat 10324953  T
Q  772 ggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctca 871  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10324952 ggcaggcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactagtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttgaaaacatcaacttatca 10324853  T
Q  872 tgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcc 971  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||| ||| | || |||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  10324852 tataatagattagaaggagagattcctgatggtggatctttcaagaaattcacagctcaatcttttttgcacaatggagtactctgcggaaatcctcgcc 10324753  T
Q  972 tacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagttgtgtcaaccactctggt 1071  Q
    | |||||| | |  ||||  |   ||  |||||||| ||||||| |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |    
T  10324752 tccaagtaccaccctgtgggaaagaagataagaaaatgtcaatggcaaagatgataatactgaaatgcatacttcccatagttgtgtcagccattttaat 10324653  T
Q  1072 tgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttca 1171  Q
    |||||||| |||||||  ||| | | | || |   ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  10324652 tgttgcattcatcatatgttttagaatcaaga---ggaaaaacgttgaaaatactcttgaaagggaattatcagttttaggagctacaagaagaatatca 10324556  T
Q  1172 tattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtg 1271  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10324555 tattatgaacttgtggaagcaacaaatggtttcaatgagagtaaattacttggaagggggagctttggctctgtgtatcaggggatgcttcctgacggtg 10324456  T
Q  1272 agatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatct 1371  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||       ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10324455 agatgattgcagtcaaagtaattgattc------agaggcaaaatcaacaagctttgatgcagaatgcaatgtaatgagaaatctacgacatcgaaatct 10324362  T
Q  1372 ggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattac 1471  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  10324361 ggttaagattatcagtagttgttcaaatcatgatttcaaagcattggtgctggagttcatgtcaaatggaagtgtggacgattggttatattcagataac 10324262  T
Q  1472 tattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtg 1571  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10324261 tattgcttaaatttcttgcataggttaaatataatgatagatgttgcatctgcattggaatatctccatcatggttcttcaatacccgtggttcattgtg 10324162  T
Q  1572 atctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactca 1671  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10324161 atctaaagccttctaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaagctcatggatgaaggacaatcaaaaactca 10324062  T
Q  1672 tacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctcttttacttcttaacattttcttc 1745  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10324061 tacacagactttagctactattggataccttgcaccaggtcatttcttctcttttacttcttaccattatcttc 10323988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1855 - 2198
Target Start/End: Complemental strand, 10323839 - 10323499
Alignment:
Q  1855 atgcagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 1954  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10323839 atgcagagtatggatctaaaggaattgtttctgtcaaaggagacgtgtacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacaga 10323740  T
Q  1955 tgatatgtttgttgcagaaataagtttgataacatggatcaatggatcattgcctcattcaattatggacgtcttagattcaaatttagtccaacaaatt 2054  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  10323739 tgatatgtttgctgcagaactaagcttgaagacatggatcagtggatcattgcctaatgcaattatggaggtcttggattctaatttagtccaactaaat 10323640  T
Q  2055 ggggaaaaaattgatgatatattgcctcacatgtcctctatttttggattagctctgaattgttgcaaatattcacctaaagaaagaattaacatggaag 2154  Q
    |||||  ||||   |||| ||| |  ||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||  || |||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  10323639 ggggatgaaat---tgatctatcgtttcacatgtcatctatttttagtttatccctgaattgttgtgaagattcacctgaagcaagaatcaatatggaag 10323543  T
Q  2155 atgttattgcgtcgctaatcaaaatcaagactttggctcttggc 2198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10323542 atgttattgcgtctctaatcaaaataaagactttggttcttggc 10323499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1415 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1415
Description:

Target: scaffold1415; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 840 - 8
Alignment:
Q  73 caacaatttgacaatagatgattctcttcaattttttacttctttgacaagttgtagaaatttgaaatatctagatctatcacgaaatcatatactatcc 172  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||   |||    
T  840 caacaatttgacaattgaagattctcatcaattctttacttccttgacaaattgtagatatttgaaatatttagagctatcagggaatcatata---tcc 744  T
Q  173 aatcttcctaagtcaatcggaaacataacttcaccattattttgggcagattcatgtggaattgaaggcggtattcccatagaagttggaaacatgagca 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  743 aatcttcctaagtcaattggaaacctaacttcagaattcttttctgcagaatcatgtggaattgatggtaatattccccaagaagttggaaacatgacca 644  T
Q  273 atttactatctttttctctaaatgggaataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtatt-ggatcttggaacca 371  Q
    | || |||  | ||||| |   |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||| | | ||    
T  643 acttgctacttctttctatttttgggaataatataagtggaccaatacctggtacattcaaagggttgcagaaacttca-gtatttggatcttagcagca 545  T
Q  372 atgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatg 471  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  544 atggactacaaggatcatttattgaagagttttgtgaaatgaaaagtgtgggtgagttgtatctagacaataataagctctctggagttttaccaacatg 445  T
Q  472 tgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaa 571  Q
    | | ||||||||||||||| |||||| | || | || |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||     
T  444 tttgggaaatatgacttctattataaggttatacattggatctaacagtctcaactctaagataccttcctctctttggagtgtcatagatatcttagag 345  T
Q  572 ctagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaa 671  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  344 ctagatttgtcctctaatgccttcattggtaatcttccaactgagattgggaatttgagagcaattatactattagacctatcaagaaatcagatttcaa 245  T
Q  672 gcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaat 771  Q
    |||||||||| || | |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| | ||||    
T  244 gcaacattccaacaaccatcagttccttacaaacattgcagaatctctccttagcagataataaactgaatggatcaattcccaaatcacttgctcaaat 145  T
Q  772 ggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctca 871  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144 ggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctca 45  T
Q  872 tgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggac 908  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44 tataatagattacaaggagagattcctaatggtggac 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 755 - 1667
Target Start/End: Original strand, 16885380 - 16886292
Alignment:
Q  755 acttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttc 854  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |  | |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||  ||||||     
T  16885380 acttcaattggtgaaatgttaagcctcaatttcttggacttgtctcaaaattttataactggtgtgattccagaatccttagtgtcactttcttatctta 16885479  T
Q  855 aaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcact 954  Q
    |  |||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| || |||| ||  | ||||||||||||||    
T  16885480 agtacatgaatttgtcatacaatagattgcaaggagagattcctgatggaggacctttcaacaaatttacagctcaatctttcatgcataatgaagcact 16885579  T
Q  955 ttgcggcaatcctcgcctacaagtatctcagtgtgttatgaaacttaagaaaaagtcaatgacaaagaagctattattcaaatgcatacttcccatagtt 1054  Q
    ||| || | | || |  || ||||  |||  |||| ||   ||  || |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  | || | || ||| ||    
T  16885580 ttgtggaagtgctaggttagaagtgcctccatgtgataaacaaagtaggaaaaagtcaatgaaaaagatgttattaatcaaaatcttattgcctataatt 16885679  T
Q  1055 gtgtcaaccactctggttgttgcatgcatcatacttttgaaagttaataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaact---ttag 1151  Q
    |||  | ||| | |||||||   |||||| || ||| | |   |  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||   ||||    
T  16885680 gtgatagccattttggttgtcctatgcataattcttctaa---tgcataaaaagaaaaaagttgaaaatccacttgaaatgggtttatcaactgatttag 16885776  T
Q  1152 gagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatca 1251  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16885777 gggttccaagaaggatttcatattatgaacttgtgcaagcaactaatggatttagcgagagtaacttacttggaaaggggggcttcggctctgtgtatca 16885876  T
Q  1252 gggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgaga 1351  Q
    ||||| |||| ||   ||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |  | || | || |||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |     
T  16885877 gggaatgctttctaccgggaagatggtagcaattaaagtacttgacttgaatatggaagcaacatcaagaagttttgacgcagaatgcaatgcaatgcgc 16885976  T
Q  1352 aatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggaca 1451  Q
    | | | |||||||||||||| ||  || |||| |  ||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16885977 attcttcgacatcgaaatcttgttgaggttattacaagttgttcaaataaagatttcaagtcattggtgatggagtttatgtcaaatggaagtgttgaaa 16886076  T
Q  1452 aatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttc 1551  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16886077 aatggttatactcggataactattgtttagatttcttgcaaaggttgaatataatgatagatgttgcatctgcattggagtatctccatcatggttcttc 16886176  T
Q  1552 aataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggat 1651  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | || ||| |||||    
T  16886177 aataccagtggttcattgtgatttgaagcctagtaatgtgttactagatgaaaatatggttgcacatgtcagtgattttggaatttctaagctcttggat 16886276  T
Q  1652 gaaggacaatctaaaa 1667  Q
    |||||||| |||||||    
T  16886277 gaaggacattctaaaa 16886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1858 - 1966
Target Start/End: Original strand, 16886728 - 16886836
Alignment:
Q  1858 cagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatga 1957  Q
    |||| ||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  16886728 cagagtatggatctaagggagtcatttctattaaaggagatgtgtacagttatggagtaatgctaatggaaatcttcacaggaaagaagccaacaaatga 16886827  T
Q  1958 tatgtttgt 1966  Q
     ||||||||    
T  16886828 aatgtttgt 16886836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 684
Target Start/End: Original strand, 16885227 - 16885309
Alignment:
Q  602 aatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctac 684  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| |  ||||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16885227 aatcttccacttgagatcaagaatttgagagctattgtaatattagatttatcaagaaatcaattttcaagcaatattcctac 16885309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1101 - 1675
Target Start/End: Original strand, 5119004 - 5119578
Alignment:
Q  1101 ataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtgg 1200  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||| ||| |||||||  || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5119004 ataaaaggaaaaaggttgacagtccacttgagaggagtttatccgctctaggagttccaagaaggatttcctattatgaacttgtgcaagcaactaatgg 5119103  T
Q  1201 attcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttg 1300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||| | |||| |||| ||  |||  ||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  5119104 attcagtgacagtaatttacttggaagaggtggttttggatccgtgtataatggaatgctttctagtgggaagatgatagcaattaaagtacttgacttg 5119203  T
Q  1301 gagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatc 1400  Q
        | |  |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  | |||||| ||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  5119204 acaatggcagaagcatcaagaagctttgatgcagaatgcaatgcaatgcgcaaccttcgacatagaaatctagttcaaattatgagtagttgttcaaatc 5119303  T
Q  1401 ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaag 1500  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| |||||| |||  |||||||||||||||| |     
T  5119304 ctgatttcaaatctctagtgatggagtttatgtcaaatggaagtgtggaaagatggttatactctgataactattttttggatttcttgcaaaggttgaa 5119403  T
Q  1501 tatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggat 1600  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||    
T  5119404 cataatgatagatgtggcatctgcattggagtatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatttgaagcctagtaatgtgttgctggat 5119503  T
Q  1601 gaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcataca 1675  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5119504 gaagatatggttgcacatgttagtgattttgggatttccaagctcttggatgaaggacaatcaaaaactcataca 5119578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1101 - 1675
Target Start/End: Original strand, 5101445 - 5102019
Alignment:
Q  1101 ataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtgg 1200  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||    
T  5101445 ataaaaggagaaagggtaaaaattcacttgaaaggggtttacacactataggagttccaaaaaggatttcctattatgaactagtgcaagcaactaatgg 5101544  T
Q  1201 attcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttg 1300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| |||| ||  |||  ||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  5101545 attcagtgagagtaatttacttggaaggggtggctttggatccgtgtatcaaggaatgctttctagtgggaagatgatagcaattaaagtacttgacttg 5101644  T
Q  1301 gagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatc 1400  Q
        | |  |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  | |||||| ||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  5101645 acaatggcagaagcatcaagaagctttgatgcagaatgcaatgcaatgcgcaaccttcgacatagaaatctagttcaaattatgagtagttgttcaaatc 5101744  T
Q  1401 ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaag 1500  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| |||||| |||  |||||||||||||||| |     
T  5101745 ctgatttcaaatctctagtgatggagtttatgtcaaatggaagtgtggaaagatggttatactctgataactattttttggatttcttgcaaaggttgaa 5101844  T
Q  1501 tatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggat 1600  Q
     || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| || ||||||    
T  5101845 cataatgatagatgtggcatcagcattggagtatctccatcatggttctttaataccagtggttcattgtgacttgaagcctgctaatgtgttattggat 5101944  T
Q  1601 gaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcataca 1675  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5101945 gaaaatatgattgcacatgttagtgattttgggatttccaagctcttggatgaaggacaatcaaaaactcataca 5102019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1166 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 5080464 - 5079906
Alignment:
Q  1166 atttcatattatgaacttgtacaagcaactagtggattcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctg 1265  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||| |||| |||| ||     
T  5080464 atttcctattctgaacttgtgcaagcaactaatggatttagtgagactaatttactaggaaagggtggctttggatctgtgtatcaaggaatgctttcta 5080365  T
Q  1266 atggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttggagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcg 1365  Q
     |||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| | || || | || | |||  |||||| ||||||| |||||||| ||| | ||| | || |||||    
T  5080364 gtgggaagatggtagcaattaaagtacttgacttgaaattggaagcaacaacaaaaagctttaatgcagaatgcaatgctatgcgcaatcttcggcatcg 5080265  T
Q  1366 aaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatcttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattca 1465  Q
    |||||| ||  |||| |||| |||||| |||||| || ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||  |     
T  5080264 aaatcttgttgagatcatcaccagttgttcaaatgttaatttcaggtctttggtaatggagttaatgtcaaatggaagcttggaaaaatggttatacact 5080165  T
Q  1466 gattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaagtatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttc 1565  Q
    ||| |||||| ||||  |||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5080164 gataactattttttaggtttcttgcaaagattgactataatgatagatgtggcatctgcattggagtatcttcatcatggttcttcaataccagtggttc 5080065  T
Q  1566 attgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggatgaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaa 1665  Q
    |||||||| | |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||||| |||||||||||    
T  5080064 attgtgatttgaagcctagcaatgtgttactggatgaaaatatggttgcacatgttagtgattttgggatttcaaagctcttggatgatggacaatctaa 5079965  T
Q  1666 aactcatacacaaactttggctactattggataccttgccccaggtcatttcttctctt 1724  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  5079964 agctcatactcagactttagctacaattggttatgttgcaccaggtaatttcttctctt 5079906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 957
Target Start/End: Original strand, 5118215 - 5118869
Alignment:
Q  303 atttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaact 402  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||   || ||||||||   ||||| ||| || |||||  | ||||| || ||    
T  5118215 atttaaatggatcaatccctggtgtaattaaagggttacataaacttcaatatttagatcttggttacaatggactgcaaggatccatgattgatgagct 5118314  T
Q  403 ttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggta 502  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||| ||   |  |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |     
T  5118315 ttgtgaaattaagagtttgagtgtattgtatttatcaagcaataagctttctggagtgttaccaacatgtttgggaaatatgacttctcttagaaagttt 5118414  T
Q  503 catataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggta 602  Q
    || |||||||||||||  || | ||||  ||||||||||||  | |||||| ||  ||| || |||||  || |  | ||||  |||||| | ||||| |    
T  5118415 cacataggatctaataggttaacctctgcgataccttcctcattttggaatctcggagatattttagaggtaaacgtatcctccaatgctttaattggaa 5118514  T
Q  603 atcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaa 702  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||  | ||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||   |||  ||| ||| |     
T  5118515 aacttccacctgagattaagaatttgagagctgttatactgttggacttgtcaagaaatcaaatttcaagcaacattccaacattcataagtttcttgac 5118614  T
Q  703 aaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaa 802  Q
    || |||  | | | | ||||||||  | || ||| |  | ||  | || || || ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||    
T  5118615 aactttagaaactttttccttagcatataacaaattgaaagggcctatcccgacatcacttggtgaaatgctaagcttgagtttcttggacttgtctcaa 5118714  T
Q  803 aatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatg 902  Q
    ||| |  | |||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| || || | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5118715 aatcttcttactggtgtgatcccaaaatccttagagtcactttcttatcttaaatacgttaacttttcatacaatagattgcaaggagagattcctaatg 5118814  T
Q  903 gtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttg 957  Q
    | || || |||||||| ||||||  |||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  5118815 gagggccattcaaaaaattcacatttgaatctttcatgaataatgaagcactttg 5118869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 299 - 979
Target Start/End: Original strand, 5100652 - 5101332
Alignment:
Q  299 aataatttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgagg 398  Q
    |||| |||||||||  |||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||   |||||  || || |||||  | ||||| |    
T  5100652 aatagtttaaatggagcaatccctagtacaattaaagggttacataaacttcaatctttgaatcttggctacaatgggctgcaaggatccatgattgatg 5100751  T
Q  399 aactttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaat-aataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataa 497  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  | | |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  5100752 agctttgtgaaattaggagtttgagtgagttgggttt-gacaagcaataagctttttggagtgttaccaacatgtttgggaaatatgacttctcttagaa 5100850  T
Q  498 aggtacatataggatctaataatttgaactctaagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcat 597  Q
    || | || |||||||||||||  || | |||| |||||||||| ||  | |||||| ||  ||| || |||||  ||||  | || | ||||||| | ||    
T  5100851 agtttcacataggatctaataggttaacctctgagataccttcttccttttggaatctcgaagatattttagaggtagacctatcttctaatgctttaat 5100950  T
Q  598 tggtaatcttccacctgagattgggaatttgagagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttcc 697  Q
    ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||  ||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||   |||  |||      
T  5100951 tgcaaatcttccacctgagattaagaatttgagagttcttgtactattagacttgtcaagaaatcaaatttcaagaaacattccaacagccataagttta 5101050  T
Q  698 ttaaaaaatttgcagaatctctccttagctcacaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgt 797  Q
    || || | |||  | | ||||||||| ||    || ||| |   |||  | || || || ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  5101051 ttgaacactttagaaactctctccttggcagctaacaaattgagtgggcctatcccaacatcacttggtgaaatgttaagcttgagtttcttggacttgt 5101150  T
Q  798 cccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcc 897  Q
    | |||||| |  | |||||||  || |||||||||||||| |||||||  |||||| || |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5101151 ctcaaaatcttcttactggtgcgatcccaaaatccttagagtcactttcttatcttaaatacattaacttttcatacaatagattgcaaggagagattcc 5101250  T
Q  898 tgatggtggacctttcaaaaatttcacaactgaatcctttgtacataatgaagcactttgcggcaatcctcgcctacaagta 979  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||  | ||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||    
T  5101251 taatggaggacctttcaaaaaattcacatctcaatctttcatgcataatgaagcactttgtggcagttctcacttacaagta 5101332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 5081303 - 5080676
Alignment:
Q  330 ttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaactttgtgacattaagagtttgggtgagtt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||    |||||| || || |||||  | ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5081303 ttaaagggttacaaaaacttcagtctttggatcttgactacaatgacctgcaaggatccatcattgatgagctttgtgacattacgagtttgagtgagtt 5081204  T
Q  430 gtatctagacaat-aataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaaggtacatataggatctaataatttgaactc 528  Q
    | || || ||||  |||| ||||   ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||  ||   |||    
T  5081203 gaattta-acaagcaataagcttgtaggagtgttaccgacatgtttgggaaatatgacttctcttagaaagttttacataggatctaataggttagcctc 5081105  T
Q  529 taagataccttcctctctatggaatatcatagacatcttagaactagatttgtcctataatgctctcattggtaatcttccacctgagattgggaatttg 628  Q
    | |||||||||||||  | |||||| |||  || ||||||||  || | |||||||  |||||| | | ||| | | ||||||||||||||  ||||||     
T  5081104 tgagataccttcctcattttggaatctcaatgatatcttagaggtaaacttgtcctccaatgctttaactggaattattccacctgagattaagaatttt 5081005  T
Q  629 agagcaattgtacttctagatctatcaggaaatcatatttcaagcaacattcctactaacatcggttccttaaaaaatttgcagaatctctccttagctc 728  Q
    |||||  || ||||  ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||  ||| ||| | || |||  | | ||| ||||| ||      
T  5081004 agagctcttatactgttagatttgtcaagaaatcaaatttcaagcaacattccggcaaccataagtttcttgagaactttagaaactctgtccttggcag 5080905  T
Q  729 acaataaactatatggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaa 828  Q
    | || ||| |  | ||   ||||||    |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||| |  | |||||||| || |||||    
T  5080904 ataacaaattgaaagggctaattccagaatcacttggtgaaatggtaggcttgagtttcttggacttgtctcaaaatcttcttactggtgtgatcccaaa 5080805  T
Q  829 atccttagaatcacttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaaatttcacaact 928  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| || |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||||||  |    
T  5080804 atccttagagtcactttcttatcttaaatacattaacttttcatacaatagattgcaaggagagattcctaatggagggccattcaaaaaattcacattt 5080705  T
Q  929 gaatcctttgtacataatgaagcactttg 957  Q
    ||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  5080704 gaatctttcatgaataatgaagcactttg 5080676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1890 - 1965
Target Start/End: Complemental strand, 5079794 - 5079719
Alignment:
Q  1890 aaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgtttg 1965  Q
    ||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  5079794 aaaggagatgtgtatagctttggaataatgctaatggaaatcttcacaggaaagaagccaacagatgaaatgtttg 5079719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1890 - 1964
Target Start/End: Original strand, 5120124 - 5120198
Alignment:
Q  1890 aaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatgatatgttt 1964  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||| |||| ||||||    
T  5120124 aaaggagatgtgtacagctatgggataatgctaatggaaatgttcaccggaaagaagccaacaaatgaaatgttt 5120198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1890 - 1936
Target Start/End: Original strand, 5102499 - 5102545
Alignment:
Q  1890 aaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcac 1936  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5102499 aaaggagatgtgtacagctatgggataatgctaatggaaatgttcac 5102545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 3e-93; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1101 - 1675
Target Start/End: Complemental strand, 14412840 - 14412266
Alignment:
Q  1101 ataaaaggaaaaaggttgaaaatactcttgaaaggggtttatcaactttaggagctccaagaagaatttcatattatgaacttgtacaagcaactagtgg 1200  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||    
T  14412840 ataaaaggaaaaaggttgaaagtccacgtgaaaggggtttatccactgtaggagttccaataaggatttcctattatgaactcgtccaagcaactaatgg 14412741  T
Q  1201 attcaatgagagtaatttacttggcaggggaggctttggctcggtgtatcagggaaagcttcctgatggtgagatgattgcggttaaagtacttgatttg 1300  Q
    |||||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| | |||| |||| ||  |||  ||||||| || |||||||||||||| ||     
T  14412740 attcagcgagactaatttacttggaaggggtggttttggatcagtgtataaaggaatgctttctattgggaagatgatagcagttaaagtacttgactta 14412641  T
Q  1301 gagttagaggaaaaatcaaggagctttgatgcagagtgcaatgcaatgagaaatttacgacatcgaaatctggtaaagattatcagcagttgctcaaatc 1400  Q
        | || |  |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  | || ||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||    
T  14412640 acaatggaagctacttcaagaagctttgatgcagaatgcaatgcaatgcgcaacctccggcatagaaatctcgtccaaattatcagtagttgttcaaatc 14412541  T
Q  1401 ttgatttcaaatcattggtgatggagttcatgtcaaatggaagtgtggacaaatggttatattcagattactattgtttaaatttcttgcaaaggttaag 1500  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||  || || ||| |||  |||||||||||||||| |     
T  14412540 ctgatttcaaatctctagtgatggagtttatgtcaaacggaagtttggaaaaatggttatactctaataacaattttttggatttcttgcaaaggttgaa 14412441  T
Q  1501 tatcatgatagatgttgcatatgcattggaatatcttcatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgatctaaagcctactaatgtcttgttggat 1600  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||  | |||    
T  14412440 cataatgatagatgtggcatctgcattggagtatctccatcatggttcttcaataccagtggttcattgtgacttgaagcctagtaatgtgttactagat 14412341  T
Q  1601 gaaaatatggttgcacatgttagcgattttggtattgccaaactcatggatgaaggacaatctaaaactcataca 1675  Q
    |||  |||| |||||||||| || |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14412340 gaagctatgattgcacatgtgagtgattttggcatttccaagctcttggatgaaggacaatcaaaaactcataca 14412266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 741 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 14413197 - 14413021
Alignment:
Q  741 atggatcaattcccacttcacttggtgaaatggtaagcttgatctccttggacttgtcccaaaatatgttaactggtgttattccaaaatccttagaatc 840  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||       
T  14413197 atggatctattccaaaatcacttggtgaaatgttaagcttaagtttcttggacttgtctcaaaatcttttaaccggtgtgatcccaaaatccttagagct 14413098  T
Q  841 acttttgtatcttcaaaacatcaacttctcatgtaatagattgcaaggagagattcctgatggtggacctttcaaaa 917  Q
    |||||   ||||| || |||| || || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14413097 actttctgatcttaaatacataaatttgtcatacaatatattgcaaggagagattcctgatggaggacctttcaaaa 14413021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1858 - 1964
Target Start/End: Complemental strand, 14412033 - 14411927
Alignment:
Q  1858 cagaatatggatctaaaggaattgtttctatcaaaggagatgtctacagctatgggattatgctaatggaaatcttcacaagaagaaagccaacagatga 1957  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| ||||    
T  14412033 cagagtatggatctaaaggagtcatttctgttaaaggagatgtgtacagctatgggataatgctaatggaactgttcaccggaaagaagccaacaaatga 14411934  T
Q  1958 tatgttt 1964  Q
     ||||||    
T  14411933 aatgttt 14411927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14413635 - 14413439
Alignment:
Q  303 atttaaatgggccaatacctggtatatttaaagggttacaaaaacttcaagtattggatcttggaaccaatgaactacatggatcatttattgaggaact 402  Q
    ||||||||||  |||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||   || || |||||   ||||  |||||| |||||  | ||||| || ||    
T  14413635 atttaaatggatcaatccctggttcaattaaagggttacataaacttcaatctttagaacttggttacaatagactacaaggatccatgattgatgagct 14413536  T
Q  403 ttgtgacattaagagtttgggtgagttgtatctagacaataataggctttctggagtcttaccaacatgtgtaggaaatatgacttctcttataaag 499  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||   |  |||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  14413535 ttgtgaaattaagagtttgagtgagttatatttaataagcaataagctttttggagtgttaccaacatgtttgggaaatatgacttcacttagaaag 14413439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University