View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3096-Insertion-5 (Length: 877)

Name: NF3096-Insertion-5
Description: NF3096
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3096-Insertion-5
NF3096-Insertion-5
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (8-876)||(1047715-1048589)
chr7 (8-838)||(22135791-22136626)
chr7 (8-838)||(40550818-40551653)
chr7 (8-876)||(7350079-7350951)
chr7 (8-841)||(31156747-31157585)
chr7 (8-787)||(7092979-7093761)
chr7 (8-787)||(38394972-38395770)
chr7 (263-764)||(20298222-20298725)
chr7 (341-876)||(43560-44101)
chr7 (266-764)||(7470859-7471359)
chr7 (384-751)||(28486628-28486996)
chr7 (8-339)||(36438-36769)
chr7 (12-421)||(44725567-44725984)
chr7 (12-418)||(24816253-24816659)
chr7 (384-787)||(44725982-44726407)
chr7 (392-764)||(21679130-21679523)
chr7 (384-841)||(9679721-9680200)
chr7 (384-586)||(24749650-24749853)
chr7 (12-418)||(26213711-26214115)
chr7 (12-416)||(6047476-6047874)
chr7 (266-421)||(28486475-28486630)
chr7 (263-421)||(24749494-24749652)
chr7 (12-418)||(48490320-48490732)
chr7 (391-787)||(24815833-24816245)
chr7 (266-421)||(4293940-4294095)
chr7 (263-421)||(21678966-21679124)
chr7 (263-421)||(9679565-9679723)
chr7 (385-595)||(44011524-44011736)
chr7 (12-270)||(13289539-13289795)
chr7 (384-524)||(4293803-4293942)
chr7 (12-418)||(6593372-6593786)
chr7 (12-418)||(18391010-18391424)
chr7 (12-418)||(47674978-47675390)
chr7 (690-787)||(38395768-38395866)
chr7 (177-415)||(1560808-1561045)
chr7 (690-787)||(20298844-20298942)
chr7 (358-418)||(44011738-44011798)
chr7 (690-787)||(7470739-7470837)
chr7 (690-764)||(20298747-20298822)
chr7 (691-787)||(21679546-21679643)
chr7 (690-787)||(7092883-7092981)
chr7 (390-540)||(18390856-18391003)
chr7 (387-588)||(47674775-47674974)
chr7 (387-553)||(48490736-48490899)
chr7 (9-84)||(18412835-18412910)
chr7 (9-84)||(21645202-21645277)
chr7 (33-84)||(21988097-21988148)
chr7 (690-764)||(28487032-28487106)
chr7 (39-84)||(5818051-5818096)
chr7 (39-84)||(9186022-9186067)
chr7 (390-514)||(6593244-6593365)
chr7 (689-787)||(7349981-7350080)
chr7 (27-72)||(7070686-7070731)
chr7 (689-787)||(1047617-1047716)
chr7 (9-80)||(16884108-16884179)
chr7 (689-787)||(22136664-22136763)
chr7 (9-80)||(24262158-24262229)
chr7 (689-787)||(40551691-40551790)
chr7 (27-72)||(3324032-3324077)
chr7 (27-72)||(25352243-25352288)
chr7 (27-72)||(25406305-25406350)
chr7 (636-677)||(48490999-48491040)
chr7 (39-84)||(49090854-49090899)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (8-861)||(43080636-43081494)
chr8 (8-841)||(27828019-27828843)
chr8 (8-631)||(18811742-18812365)
chr8 (12-375)||(15069605-15069971)
chr8 (384-764)||(15071868-15072267)
chr8 (391-817)||(41383768-41384217)
chr8 (12-418)||(31577192-31577590)
chr8 (384-728)||(21481605-21481949)
chr8 (13-418)||(17848565-17848970)
chr8 (12-418)||(34255346-34255758)
chr8 (275-421)||(41383618-41383763)
chr8 (250-421)||(21481439-21481607)
chr8 (12-278)||(29542943-29543218)
chr8 (406-590)||(31574584-31574767)
chr8 (299-418)||(41365853-41365972)
chr8 (13-146)||(41366109-41366245)
chr8 (12-146)||(4732573-4732710)
chr8 (292-418)||(4732831-4732957)
chr8 (371-421)||(15071820-15071870)
chr8 (392-588)||(34255142-34255337)
chr8 (387-590)||(41365653-41365849)
chr8 (690-810)||(15072289-15072412)
chr8 (387-553)||(4732961-4733125)
chr8 (385-460)||(17848972-17849046)
chr8 (9-84)||(18853998-18854073)
chr8 (659-787)||(41384246-41384375)
chr8 (9-84)||(26300515-26300590)
chr8 (689-787)||(27828878-27828977)
chr8 (12-58)||(5591800-5591846)
chr8 (796-876)||(18812374-18812456)
chr8 (9-80)||(10685099-10685170)
chr8 (9-80)||(35744571-35744642)
chr8 (27-72)||(4819484-4819529)
chr8 (27-72)||(16756505-16756550)
chr8 (43-84)||(23800386-23800427)
chr8 (27-72)||(28328799-28328844)
chr8 (27-72)||(28891655-28891700)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (8-876)||(22781163-22782037)
chr4 (8-861)||(11007009-11007868)
chr4 (8-861)||(16932587-16933448)
chr4 (8-876)||(22045142-22046015)
chr4 (8-841)||(9174933-9175772)
chr4 (8-421)||(22133504-22133917)
chr4 (263-784)||(22801576-22802118)
chr4 (266-777)||(36920344-36920876)
chr4 (12-420)||(12399706-12400118)
chr4 (12-421)||(12401980-12402392)
chr4 (90-421)||(5099598-5099929)
chr4 (384-776)||(22133112-22133506)
chr4 (409-787)||(14788234-14788633)
chr4 (384-751)||(16454413-16454800)
chr4 (390-764)||(24879626-24880019)
chr4 (384-751)||(12401595-12401982)
chr4 (29-563)||(26558641-26559173)
chr4 (384-832)||(5099927-5100397)
chr4 (384-764)||(47563863-47564264)
chr4 (384-764)||(36379334-36379734)
chr4 (358-586)||(18535863-18536092)
chr4 (263-420)||(14788657-14788814)
chr4 (384-590)||(36770559-36770767)
chr4 (266-421)||(47563710-47563865)
chr4 (12-418)||(12740573-12740985)
chr4 (263-421)||(16454255-16454415)
chr4 (12-418)||(12748779-12749191)
chr4 (265-421)||(36379180-36379336)
chr4 (390-525)||(12399566-12399701)
chr4 (12-415)||(5137007-5137418)
chr4 (12-421)||(8394333-8394750)
chr4 (403-590)||(47565735-47565923)
chr4 (385-590)||(10113952-10114157)
chr4 (12-417)||(7123623-7124036)
chr4 (543-751)||(12396653-12396880)
chr4 (299-418)||(3577934-3578053)
chr4 (12-224)||(52094394-52094615)
chr4 (261-417)||(34571440-34571593)
chr4 (291-414)||(10113823-10113946)
chr4 (356-421)||(36770496-36770561)
chr4 (12-77)||(5872730-5872795)
chr4 (24-416)||(5206506-5206904)
chr4 (690-791)||(12396515-12396617)
chr4 (690-791)||(12401457-12401559)
chr4 (246-362)||(18536787-18536900)
chr4 (390-588)||(34571238-34571431)
chr4 (690-793)||(3825227-3825331)
chr4 (33-146)||(4588888-4589003)
chr4 (387-553)||(12740406-12740569)
chr4 (387-553)||(12748612-12748775)
chr4 (359-421)||(47565621-47565683)
chr4 (690-793)||(16454836-16454940)
chr4 (390-540)||(5137428-5137575)
chr4 (385-563)||(54881913-54882088)
chr4 (635-751)||(18535675-18535798)
chr4 (390-514)||(7124044-7124165)
chr4 (384-540)||(8394748-8394901)
chr4 (9-84)||(5147078-5147153)
chr4 (27-72)||(4559097-4559142)
chr4 (40-84)||(16624871-16624915)
chr4 (688-744)||(35371380-35371436)
chr4 (689-787)||(9174799-9174898)
chr4 (9-72)||(9225239-9225302)
chr4 (351-402)||(10451216-10451267)
chr4 (689-787)||(22045044-22045143)
chr4 (384-418)||(47565681-47565715)
chr4 (691-745)||(54882237-54882290)
chr4 (688-745)||(3577500-3577557)
chr4 (692-745)||(3577695-3577748)
chr4 (636-677)||(12740265-12740306)
chr4 (636-677)||(12748471-12748512)
chr4 (27-84)||(15313209-15313266)
chr4 (27-84)||(21549542-21549599)
chr4 (689-787)||(22781064-22781164)
chr4 (636-677)||(34571134-34571175)
chr4 (525-585)||(35371562-35371623)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (8-876)||(47178341-47179215)
chr1 (8-841)||(16227147-16227987)
chr1 (8-841)||(51751016-51751854)
chr1 (8-876)||(20301110-20301984)
chr1 (12-787)||(27337649-27338429)
chr1 (263-764)||(31736354-31736857)
chr1 (12-421)||(28202584-28202995)
chr1 (432-787)||(28841760-28842117)
chr1 (12-414)||(13126631-13127033)
chr1 (384-785)||(14098727-14099150)
chr1 (384-815)||(50077565-50078019)
chr1 (384-787)||(28202162-28202586)
chr1 (8-224)||(28841401-28841617)
chr1 (384-841)||(25249396-25249877)
chr1 (384-814)||(31423808-31424259)
chr1 (13-339)||(8348039-8348366)
chr1 (385-764)||(16430002-16430401)
chr1 (384-590)||(6996638-6996845)
chr1 (266-421)||(6996485-6996640)
chr1 (263-421)||(31424257-31424415)
chr1 (263-421)||(29003194-29003352)
chr1 (267-421)||(50078017-50078171)
chr1 (12-416)||(50168193-50168603)
chr1 (255-404)||(28841615-28841764)
chr1 (274-421)||(28997478-28997625)
chr1 (263-418)||(16429846-16430000)
chr1 (12-417)||(28222266-28222674)
chr1 (12-234)||(3805202-3805427)
chr1 (394-590)||(13126421-13126616)
chr1 (43-414)||(776019-776396)
chr1 (590-787)||(25127086-25127285)
chr1 (669-787)||(6996886-6997005)
chr1 (263-357)||(25250568-25250662)
chr1 (12-146)||(31658119-31658256)
chr1 (252-417)||(31658305-31658467)
chr1 (387-588)||(50167987-50168187)
chr1 (690-787)||(31736234-31736332)
chr1 (690-778)||(25127283-25127372)
chr1 (387-588)||(776404-776604)
chr1 (389-588)||(13548320-13548517)
chr1 (387-588)||(28222060-28222260)
chr1 (718-787)||(14098629-14098699)
chr1 (393-585)||(31928915-31929104)
chr1 (384-448)||(28997416-28997480)
chr1 (384-448)||(29003132-29003196)
chr1 (387-588)||(28221689-28221889)
chr1 (391-553)||(31658477-31658635)
chr1 (380-421)||(14099148-14099189)
chr1 (636-745)||(13548147-13548257)
chr1 (39-84)||(19359703-19359748)
chr1 (659-787)||(31423648-31423776)
chr1 (659-764)||(50077429-50077534)
chr1 (689-787)||(20301983-20302082)
chr1 (689-787)||(51751889-51751988)
chr1 (355-421)||(25249875-25249941)
chr1 (636-787)||(13126208-13126359)
chr1 (385-564)||(28242914-28243090)
chr1 (9-80)||(41397420-41397491)
chr1 (691-745)||(31928734-31928788)
chr1 (27-73)||(45654899-45654945)
chr1 (636-677)||(776667-776708)
chr1 (385-418)||(13548523-13548556)
chr1 (636-677)||(28221585-28221626)
chr1 (39-84)||(47099683-47099728)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (8-876)||(26066824-26067695)
chr6 (8-861)||(33309868-33310726)
chr6 (263-787)||(15533435-15533983)
chr6 (384-838)||(3395366-3395844)
chr6 (409-590)||(3630961-3631143)
chr6 (12-418)||(30444276-30444677)
chr6 (263-421)||(3631166-3631324)
chr6 (298-421)||(3395245-3395368)
chr6 (12-225)||(12158234-12158450)
chr6 (618-841)||(3630668-3630894)
chr6 (12-418)||(5407917-5408322)
chr6 (12-418)||(5412242-5412647)
chr6 (12-418)||(16553591-16554005)
chr6 (12-418)||(16630147-16630561)
chr6 (12-418)||(16651852-16652267)
chr6 (12-415)||(34165799-34166210)
chr6 (637-787)||(30729465-30729616)
chr6 (12-163)||(25462608-25462762)
chr6 (394-590)||(11137472-11137667)
chr6 (291-403)||(26944450-26944562)
chr6 (177-418)||(16568055-16568293)
chr6 (303-418)||(11137346-11137461)
chr6 (12-84)||(16567901-16567973)
chr6 (385-585)||(30444679-30444878)
chr6 (390-540)||(16652274-16652421)
chr6 (390-563)||(16568300-16568470)
chr6 (390-540)||(16554012-16554159)
chr6 (390-540)||(16630568-16630715)
chr6 (712-787)||(15533339-15533415)
chr6 (9-80)||(14738407-14738478)
chr6 (526-590)||(26944599-26944665)
chr6 (687-761)||(26944709-26944783)
chr6 (390-540)||(34166220-34166367)
chr6 (436-484)||(17012956-17013004)
chr6 (27-72)||(17694096-17694141)
chr6 (27-72)||(22350216-22350261)
chr6 (689-787)||(3395882-3395981)
chr6 (502-585)||(24543505-24543587)
chr6 (689-787)||(33310740-33310839)
chr6 (9-80)||(33331281-33331352)
chr6 (351-416)||(10456494-10456559)
chr6 (688-745)||(11137783-11137840)
chr6 (27-72)||(13879630-13879675)
chr6 (43-84)||(24432196-24432237)
chr6 (27-72)||(25942560-25942605)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (8-876)||(15355279-15356149)
chr5 (8-876)||(23666025-23666895)
chr5 (8-861)||(31543712-31544571)
chr5 (8-861)||(34477860-34478719)
chr5 (12-764)||(6746051-6746808)
chr5 (8-408)||(10750677-10751077)
chr5 (404-861)||(10756269-10756731)
chr5 (12-421)||(18467667-18468079)
chr5 (12-421)||(20505090-20505502)
chr5 (384-841)||(27911486-27911967)
chr5 (384-764)||(18468077-18468459)
chr5 (374-832)||(18510166-18510649)
chr5 (384-764)||(659072-659474)
chr5 (384-764)||(20504691-20505092)
chr5 (12-588)||(16408250-16408831)
chr5 (263-421)||(27911330-27911488)
chr5 (384-776)||(20044026-20044439)
chr5 (263-420)||(31467117-31467274)
chr5 (285-421)||(25806350-25806486)
chr5 (266-421)||(658919-659074)
chr5 (263-421)||(18510637-18510795)
chr5 (263-421)||(20043870-20044028)
chr5 (606-841)||(41586752-41586990)
chr5 (12-418)||(29721290-29721700)
chr5 (18-418)||(26173701-26174107)
chr5 (12-418)||(40381031-40381445)
chr5 (12-418)||(16545355-16545769)
chr5 (13-417)||(42427276-42427683)
chr5 (488-764)||(31466735-31467031)
chr5 (384-487)||(25806484-25806587)
chr5 (12-418)||(13486940-13487352)
chr5 (31-418)||(534672-535062)
chr5 (16-146)||(9788337-9788470)
chr5 (404-577)||(13294988-13295160)
chr5 (690-780)||(659496-659587)
chr5 (710-787)||(18468501-18468579)
chr5 (692-787)||(31466615-31466711)
chr5 (390-588)||(13487359-13487555)
chr5 (710-787)||(6746850-6746928)
chr5 (390-540)||(16545776-16545923)
chr5 (710-787)||(20044468-20044546)
chr5 (390-462)||(31467036-31467112)
chr5 (390-540)||(29721707-29721855)
chr5 (689-787)||(34477747-34477846)
chr5 (9-80)||(43596302-43596373)
chr5 (9-80)||(43629096-43629167)
chr5 (387-553)||(535066-535229)
chr5 (39-80)||(27449003-27449044)
chr5 (27-72)||(28788613-28788658)
chr5 (8-84)||(32584767-32584843)
chr5 (659-747)||(41586661-41586748)
chr5 (9-80)||(31397827-31397898)
chr5 (9-80)||(33790496-33790567)
chr5 (9-80)||(37557459-37557530)
chr5 (391-514)||(40381453-40381573)
chr5 (390-540)||(26174114-26174261)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (8-861)||(35216411-35217270)
chr2 (8-861)||(36559586-36560441)
chr2 (8-876)||(19502762-19503636)
chr2 (12-421)||(21519581-21519990)
chr2 (384-742)||(6263002-6263379)
chr2 (390-764)||(21519182-21519577)
chr2 (384-785)||(31733685-31734104)
chr2 (30-421)||(28569310-28569701)
chr2 (263-421)||(31734102-31734260)
chr2 (263-421)||(6263377-6263535)
chr2 (384-492)||(22402362-22402470)
chr2 (115-416)||(14634841-14635145)
chr2 (323-421)||(22402266-22402364)
chr2 (487-590)||(22404969-22405074)
chr2 (384-585)||(28569109-28569312)
chr2 (687-787)||(22405155-22405256)
chr2 (692-787)||(21519062-21519158)
chr2 (306-416)||(41304109-41304219)
chr2 (387-563)||(14634662-14634835)
chr2 (9-84)||(25402827-25402902)
chr2 (297-416)||(42018734-42018853)
chr2 (27-72)||(17933012-17933057)
chr2 (689-787)||(36559473-36559572)
chr2 (476-585)||(41303969-41304079)
chr2 (39-84)||(10446302-10446347)
chr2 (12-84)||(42019070-42019142)
chr2 (9-80)||(19348458-19348529)
chr2 (689-787)||(19502664-19502763)
chr2 (636-677)||(14634531-14634572)
chr2 (27-72)||(39680937-39680982)
[»] chr3 (101 HSPs)
chr3 (8-861)||(456865-457723)
chr3 (8-876)||(6064219-6065093)
chr3 (8-861)||(11169059-11169918)
chr3 (12-764)||(43227039-43227796)
chr3 (12-841)||(5898371-5899210)
chr3 (12-764)||(4309054-4309806)
chr3 (8-540)||(10957091-10957623)
chr3 (12-421)||(18098055-18098467)
chr3 (384-764)||(42991332-42991714)
chr3 (384-841)||(53916418-53916899)
chr3 (384-764)||(18097656-18098057)
chr3 (384-841)||(43422215-43422695)
chr3 (384-787)||(3315715-3316139)
chr3 (12-421)||(23634407-23634798)
chr3 (8-216)||(5192608-5192816)
chr3 (384-764)||(28100832-28101233)
chr3 (409-751)||(28138079-28138441)
chr3 (390-817)||(890674-891126)
chr3 (561-876)||(10956775-10957095)
chr3 (263-421)||(53916897-53917055)
chr3 (263-421)||(3315559-3315717)
chr3 (24-263)||(15830240-15830482)
chr3 (12-418)||(23198979-23199391)
chr3 (263-421)||(42991176-42991334)
chr3 (263-421)||(43422693-43422851)
chr3 (12-418)||(7763186-7763597)
chr3 (12-418)||(27421600-27422004)
chr3 (384-590)||(23634796-23635004)
chr3 (263-421)||(28101231-28101389)
chr3 (263-420)||(891131-891288)
chr3 (17-418)||(29811789-29812197)
chr3 (8-114)||(5192839-5192945)
chr3 (12-418)||(5259163-5259575)
chr3 (385-563)||(25634865-25635043)
chr3 (590-764)||(35918722-35918897)
chr3 (12-416)||(32892005-32892414)
chr3 (12-415)||(10057160-10057571)
chr3 (12-415)||(10061604-10062015)
chr3 (12-415)||(10063826-10064237)
chr3 (12-415)||(10066048-10066459)
chr3 (12-418)||(4599558-4599972)
chr3 (12-418)||(10210116-10210527)
chr3 (12-415)||(10059382-10059793)
chr3 (12-210)||(15821741-15821938)
chr3 (12-414)||(6717428-6717834)
chr3 (12-209)||(7769517-7769719)
chr3 (291-418)||(25634739-25634863)
chr3 (688-787)||(35918602-35918702)
chr3 (12-84)||(9635304-9635376)
chr3 (12-84)||(37407604-37407676)
chr3 (690-787)||(4308934-4309032)
chr3 (127-205)||(35918939-35919017)
chr3 (387-563)||(29812201-29812374)
chr3 (692-787)||(43227820-43227916)
chr3 (290-415)||(1619735-1619860)
chr3 (394-590)||(1619543-1619721)
chr3 (690-787)||(28100712-28100810)
chr3 (690-787)||(42991736-42991834)
chr3 (690-787)||(18097536-18097634)
chr3 (690-787)||(28137945-28138043)
chr3 (385-588)||(4599354-4599556)
chr3 (390-588)||(23198775-23198972)
chr3 (387-588)||(5258959-5259159)
chr3 (390-540)||(6717845-6717993)
chr3 (303-418)||(7769763-7769878)
chr3 (390-540)||(10057581-10057728)
chr3 (390-540)||(10059803-10059950)
chr3 (390-540)||(10062025-10062172)
chr3 (390-540)||(10064247-10064394)
chr3 (390-540)||(10066469-10066616)
chr3 (590-664)||(23635023-23635097)
chr3 (39-84)||(9602711-9602756)
chr3 (303-416)||(15824698-15824811)
chr3 (39-84)||(16263540-16263585)
chr3 (363-416)||(27900223-27900276)
chr3 (390-553)||(7763604-7763763)
chr3 (390-514)||(10210534-10210655)
chr3 (9-80)||(28490009-28490080)
chr3 (12-58)||(22834215-22834261)
chr3 (27-72)||(10612022-10612067)
chr3 (363-416)||(27882632-27882685)
chr3 (27-72)||(29913200-29913245)
chr3 (659-787)||(53916286-53916414)
chr3 (27-72)||(54189401-54189446)
chr3 (478-550)||(9635175-9635247)
chr3 (9-84)||(3324383-3324458)
chr3 (689-787)||(6064121-6064220)
chr3 (9-80)||(8516275-8516346)
chr3 (353-416)||(31116505-31116568)
chr3 (9-80)||(32479521-32479592)
chr3 (659-780)||(3306275-3306397)
chr3 (385-563)||(32892418-32892593)
chr3 (691-745)||(43402886-43402940)
chr3 (27-72)||(6304202-6304247)
chr3 (428-489)||(7769922-7769982)
chr3 (27-72)||(10204936-10204981)
chr3 (27-72)||(10897896-10897941)
chr3 (27-72)||(22625224-22625269)
chr3 (671-787)||(23636401-23636518)
chr3 (391-512)||(43403172-43403290)
chr3 (27-72)||(47882133-47882178)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (8-876)||(23105-23976)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (8-660)||(603-1256)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (263-764)||(330-833)
scaffold1674 (690-787)||(210-308)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (351-751)||(70084-70485)
scaffold0025 (12-356)||(72466-72813)
scaffold0025 (690-787)||(69949-70048)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (27-421)||(34553-34950)
scaffold0011 (384-787)||(34948-35373)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (409-787)||(51097-51496)
scaffold0005 (263-420)||(50916-51073)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (263-421)||(80764-80922)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-411)||(115518-115920)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (24-418)||(293-690)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (512-779)||(3966-4259)
scaffold0133 (436-484)||(26228-26276)
scaffold0133 (718-764)||(4293-4339)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (394-588)||(9553-9746)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (9-84)||(4029-4104)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (12-84)||(26597-26669)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (9-84)||(18774-18849)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (796-876)||(189154-189236)
scaffold0006 (39-84)||(1684-1729)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (15-72)||(17204-17261)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (799-876)||(2348-2427)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (9-80)||(15144-15215)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 691; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 691; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 1048589 - 1047715
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1048589 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 1048490  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048489 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 1048390  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1048389 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 1048290  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048289 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 1048190  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048189 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 1048090  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1048089 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtatagc 1047990  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  1047989 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtga 1047890  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1047889 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 1047790  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  1047789 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 1047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 838
Target Start/End: Original strand, 22135791 - 22136626
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22135791 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 22135890  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22135891 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgggtcacttca 22135990  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22135991 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 22136090  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136091 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 22136190  T
Q  407 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136191 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 22136290  T
Q  507 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22136291 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagc 22136390  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  22136391 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtga 22136490  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22136491 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 22136590  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggta 838  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  22136591 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggta 22136626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 838
Target Start/End: Original strand, 40550818 - 40551653
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  40550818 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 40550917  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40550918 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgggtcacttca 40551017  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40551018 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 40551117  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551118 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 40551217  T
Q  407 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551218 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 40551317  T
Q  507 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40551318 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagc 40551417  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  40551418 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtga 40551517  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  40551518 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 40551617  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggta 838  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  40551618 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggta 40551653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 670; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 7350951 - 7350079
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7350951 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 7350852  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350851 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 7350752  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7350751 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 7350652  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350651 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 7350552  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350551 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 7350452  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7350451 ggagttgaac-cactggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgttgca 7350353  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  7350352 cggcttgcgagattactctaaaagaataccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaa 7350253  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacggg-ttga-gtgtatact 804  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||    
T  7350252 agcttgtgggactacctaaaacttctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccaagggctgaagggattgaggtgtatact 7350153  T
Q  805 tgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  7350152 tgtggattactctaaaagtcaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 7350079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 31157585 - 31156747
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  31157585 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaactaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgatggccta 31157486  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31157485 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaacatgggtcacttca 31157386  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31157385 aaaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 31157286  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157285 agaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagatgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 31157186  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157185 gaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 31157086  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  31157085 ggacttgaacacacctgtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaaggaatttcttcatgaagttggagaatgtgtagcg 31156986  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  31156985 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaa 31156886  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  31156885 agcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagagtgcggaagatattccgatggctgaaggggttgaggtgtatac 31156786  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31156785 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaa 31156747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 7093761 - 7092979
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||    
T  7093761 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgacccatgaacatggtgaaggccta 7093662  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093661 agtgtctcaagagggaacggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaaacctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 7093562  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7093561 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 7093462  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7093461 agaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaa 7093362  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7093361 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggt 7093262  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  7093261 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagc 7093162  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  7093161 acggcttgcgggattactctaaaaggaggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagtgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtga 7093062  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa-agcgaagacattccgagggctga 787  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  7093061 atgcttgtgggactacctaaaaatcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagaccgaagacgttccgatggctga 7092979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 787
Target Start/End: Original strand, 38394972 - 38395770
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  38394972 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaaggccta 38395071  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38395072 agtgtctcaagagggaatggtggaggtataggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaattgtcacaagatgggtcacttca 38395171  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38395172 agaaggattgtccagaggttaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 38395271  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38395272 agaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagaagttaaacactcaacatcagcctggagagacggtggtaa 38395371  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38395372 gaatactcatgatctacctgttgaggtggggtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagggtacgctcagcgtgaggt 38395471  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa----------------- 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                     
T  38395472 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagcgatttcttcatgaagacggaaggcattccgg 38395571  T
Q  590 --gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctat 687  Q
      |||| ||||||| || ||||||||| | |||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||| | |    
T  38395572 aggttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaaggccaagcatgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcatgt 38395671  T
Q  688 gttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa-agcgaagacattccgagggct 785  Q
    ||||||||   | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  38395672 gttgaaga---tgtggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagagagaagacgttccgatggct 38395768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 263 - 764
Target Start/End: Original strand, 20298222 - 20298725
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  20298222 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcgtctg 20298321  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 462  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20298322 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaacaatactcatgatctacctgttgatgtggagtttcaaggtggaagacatagtgag 20298421  T
Q  463 atgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctc 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20298422 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctc 20298521  T
Q  562 tatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgat 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20298522 tatggtgagcaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagagtgattggatgcaaggtgat 20298621  T
Q  662 ctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcg 760  Q
    ||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20298622 cttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcg 20298721  T
Q  761 agaa 764  Q
    ||||    
T  20298722 agaa 20298725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 341 - 876
Target Start/End: Original strand, 43560 - 44101
Alignment:
Q  341 ctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtt 440  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43560 ctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctgcagaggcggtggtaagaataatcatgatctacctgttgaggttgagtt 43659  T
Q  441 tcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43660 tcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagatggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 43759  T
Q  541 aa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaa 639  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  43760 aaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtatatcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaa 43859  T
Q  640 gagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgta 739  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43860 gggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgta 43959  T
Q  740 gttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgg 835  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  43960 gttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgg 44059  T
Q  836 gtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  44060 gtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 44101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 266 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 7471359 - 7470859
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  7471359 ggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggag 7471260  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7471259 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgtggtggagtttcaaggttgaagacaaagtgggatg 7471160  T
Q  466 tacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctat 564  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7471159 tacgcatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgaggtggggttgaacacaccggtaatgatacgattatggaagaccttgggtgctatgctctat 7471060  T
Q  565 ggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctt 664  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7471059 ggggagcaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaagtccaagggtgattggatgcaaagtgatctt 7470960  T
Q  665 taacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgaga 763  Q
     || | ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  7470959 caagggagcaggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagcatagttgaagtgcaaggactcttcgaga 7470860  T
Q  764 a 764  Q
    |    
T  7470859 a 7470859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 384 - 751
Target Start/End: Original strand, 28486628 - 28486996
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28486628 atcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 28486727  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28486728 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 28486827  T
Q  583 tcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgt 682  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  28486828 tcatgaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgt 28486927  T
Q  683 cctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaa 751  Q
     ||  |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28486928 tctgcgttgaagatgttttggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctggtgtagttggaccgcaa 28486996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 339
Target Start/End: Original strand, 36438 - 36769
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  36438 caaggaaggcactgttaccttggaagaaattcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaactccaaggacttgactcatgaacacgatgaaggccta 36537  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36538 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagcggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 36637  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36638 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctatgagggttatgaggatgtaggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatga 36737  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36738 agaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatg 36769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 44725567 - 44725984
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  44725567 gaaggcactgttatcttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaa 44725666  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |  |    
T  44725667 gtgtcttaagagggaatgatggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgtcacaagatggtggaggtaga 44725766  T
Q  209 gaaggatt-----gtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggagg 303  Q
    ||| | ||     |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44725767 gaatgctttaactgtctagagattaatggtaactccgcacaaattgtctcagagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagg 44725866  T
Q  304 atgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtg 403  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44725867 acgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaagcggtg 44725966  T
Q  404 gtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44725967 gtaagaatactcatgatc 44725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24816659 - 24816253
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   || ||||| |||| || |   |||    
T  24816659 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgacccagtccaagaacttgaaagctgatgaaaacggggaaggcataa 24816560  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24816559 gtgtttcaagagggaacggtggaggtagaggtaatcgtagaaaaagtggtaacaagtcaaggtttaaatgatttaactgtaacaagatggatcacttcat 24816460  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||   ||||||||||||||||||    
T  24816459 gaaagattgttcggagattaatggtaactccgcacaaatagtctctgagggttatgaggattcaaatgctttggtggtg---tgttgtttggaggatgaa 24816363  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24816362 gaatgtgatgtgtctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctgaagagacggtggtaag 24816263  T
Q  409 aatactcatg 418  Q
    ||||||||||    
T  24816262 aatactcatg 24816253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 384 - 787
Target Start/End: Original strand, 44725982 - 44726407
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44725982 atcagtcttgagaggcggaggcaatgatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 44726081  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44726082 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgttatgctctagtggtgagcaagggatttc 44726181  T
Q  582 ttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    ||||||||                   |||| |||||||  | ||||||||||| |||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||| || |    
T  44726182 ttcatgaagatggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggagacc 44726281  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgag 762  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44726282 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaatgaccttcgag 44726381  T
Q  763 aaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  44726382 aaggcggaagacattccgagggctga 44726407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 392 - 764
Target Start/End: Original strand, 21679130 - 21679523
Alignment:
Q  392 ggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagt 491  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21679130 ggagaggcggaggaaccaatactcatgatctacttgttaagatggagtttcaaggttgaagacataatgggatatacacattttctagttgaggtagagt 21679229  T
Q  492 acgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa- 589  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21679230 acactcagcgtgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaag 21679329  T
Q  590 ------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaa 671  Q
                      |||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  21679330 acggaagatattccgaaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaa 21679429  T
Q  672 gcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
    |||| | |||| || ||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21679430 gcggaagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtcgaactacataaaattcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 21679523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 384 - 841
Target Start/End: Original strand, 9679721 - 9680200
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||| || || || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9679721 atcagtctggagaggtggaggcaacaatactcatgatcaacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 9679820  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  9679821 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttga--acaccggtaatggtactgctatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagaaagagattttt 9679918  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || |||  |||||  |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| || || ||    
T  9679919 tcatgaagacggaatgcatttcggaggttgaagaatgtataacactacttgcaggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcatggagacct 9680018  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  9680019 tcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaacatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagcgtagtctgactgcaaggaccttcgaga 9680118  T
Q  764 aag-cgaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    | |  ||||||||| ||||||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  9680119 aggtggaagacattacgagggccgaaggggttaaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggcacaa 9680200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 384 - 586
Target Start/End: Original strand, 24749650 - 24749853
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  24749650 atcagtctggagaggcggatgcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttaa 24749749  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24749750 ggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgtctatggaggaccttggatgctatgctctatggtgagcaagagatttct 24749849  T
Q  583 tcat 586  Q
    ||||    
T  24749850 tcat 24749853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 26213711 - 26214115
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||   || ||||| | ||||| |  || |    
T  26213711 gaaggcactgtcaccatggaagaagttcaagtggctttaagaaccaatgagctgaccaagtccaaggacttgagagcttatgaaaatggtgaaggcctta 26213810  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26213811 gtgtttcaagaggtaatggtggaggtagaggtaatcggggaaagagtggtaacaagttaaattttaagtgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 26213910  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||   | ||||  ||  ||||||    
T  26213911 gaaggattatccggagaacaatggtaactcctcacaaattgtctctgagggttatgaggatgtgggtgctttggcggtg---tcttgtcggggagatgaa 26214007  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||||  || ||  ||||||||| || ||  |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||     
T  26214008 gaaggtgatgtttctcacctcggtaatgattccttgtagagcggtggttgtatg--gagatgttaaacagttaacatcagcttggagaggcggtgagaat 26214105  T
Q  409 aatactcatg 418  Q
    ||||||||||    
T  26214106 aatactcatg 26214115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Original strand, 6047476 - 6047874
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||   || ||||| |||||||    ||||    
T  6047476 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttgagaatcaacgagtttaccaagtccaagaacttgagaactgatgaaaacggtgaacgcctaa 6047575  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| || || |      ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6047576 gtgtctcgagagggactagtggaggtaaaggtaatcggggaaagagtggtaacaagttaaagtgt------tttaactgtcacaagatgggtcagttcaa 6047669  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||   | |  || ||  ||||||    
T  6047670 gaaggattgtctggagaacaatggtaactccgcacaaattgtctttgagggttatgaggatgaagttgctttggtggtg---tctcattggggagatgaa 6047766  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    | ||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6047767 gtaggtgatgtttctcgccttgtgaatgatgtcttgtagagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggaaag 6047866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 266 - 421
Target Start/End: Original strand, 28486475 - 28486630
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  28486475 ggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagaatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgccttgtggagcggtggtcgtctggag 28486574  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28486575 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 28486630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 24749494 - 24749652
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  24749494 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggttgtcatctg 24749593  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24749594 gagagacattaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 24749652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 48490320 - 48490732
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  48490320 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 48490419  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||      ||||  | |||||   || || | | |||||||| ||||||||| | |||||    
T  48490420 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtaaaggaaaccgaggaagctcaaagagaagtaacaaaaaaaagtataagtgctttaagtgtcacaagtttggtca 48490519  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||  || ||||| | | || | || ||||  |||||||||||||||||| || ||||| | |||||   | ||    
T  48490520 cttcaagagggattgtccggaggacaatgagaactccgcgctagttgtgtccgaggagtatgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---gcag 48490616  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48490617 gatgatgaaggtgaggtttctcaccttagtattgatgccttgtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggt 48490716  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    || |||||||||||||    
T  48490717 gggaagaatactcatg 48490732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 391 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 24816245 - 24815833
Alignment:
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagag 490  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24816245 tggagaggcggaggtaacaatacccatgatctacat-ttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaagtagag 24816147  T
Q  491 tacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta-tgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24816146 tacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgagaatggtacgactacggtggacctcgggtgctatgctctagtggtgagcaaggga-ttcttcatga 24816048  T
Q  589 a-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacg 669  Q
    |                   |||| ||||||| || ||  ||||||| |||||| |||||||   ||||||  |||||||||| |||| |||||| |  |    
T  24816047 agaaggaaggtatttcggaggttgaagaatgtatagcatagcttgcgggattaccctaaaag---gccaaggttgattggatgaaaggagatcttcatgg 24815951  T
Q  670 aagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-g 768  Q
    ||||||||  | |||  ||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |    
T  24815950 aagcgggagttatcccgtgttgaagacgttattgtgaatacttgtagaactacctaaaattcctagtgtagttgg-gtgcaaggaccttcgagaaggcgg 24815852  T
Q  769 aagacattccgagggctga 787  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  24815851 aatacattccgatggctga 24815833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 266 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4294095 - 4293940
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  4294095 ggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaacttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 4293996  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4293995 agacattaaacactcaacatcagcctggagaggtggtgacaagaatactcatgatc 4293940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 21678966 - 21679124
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21678966 tgaggatgcgggtactctgatggcgtagtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcatctg 21679065  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21679066 gagagacgctaaacactcaacatcatccaggagacgcggtggtaagaatactcatgatc 21679124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 9679565 - 9679723
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  9679565 tgaggatgtgagtgttcttatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttaggagtgatacctagtggagcggtggttgtctg 9679664  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679665 gagagacgttaaaaactcaacatcatcctgaagaggcggtggtaagaatactcatgatc 9679723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 385 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44011736 - 44011524
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagtt--g 482  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  |    
T  44011736 tcagtctggagaggcggaggtaacagtactcatgatctacctattgaagtggagtttcaaggtggaagatatagtgtgatgtacgtatttgctagttaag 44011637  T
Q  483 aggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggattt 580  Q
    |||||||  | |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||    
T  44011636 aggtaga--aagctctgcttgaggtggagtcgaacacaccggaaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctgtagttgtgagcaagggaatt 44011539  T
Q  581 cttcatgaagttgga 595  Q
    |||||||||| ||||    
T  44011538 cttcatgaagatgga 44011524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13289795 - 13289539
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||| ||  ||| |  | |     
T  13289795 gaaggcactgtcacattggaagaagttcaaacaactttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagatgatgaaaactttgaaggcccat 13289696  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13289695 gtgtttcaagagggaatggtggag----aggtaaccggggaaagagtggtaacaagtaaaagtttaagttctttaactgtcacaagatgt-tcacttcaa 13289601  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatg 270  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  13289600 gaaggattgtccggagaacaatggtaactccgcgcaaattgtctttgagggttttgaggatg 13289539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 4293942 - 4293803
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |    
T  4293942 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagctggagtttcaaggttgaagacatagtacgat-tacgcatttgctagttta 4293844  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccgg 524  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4293843 ggtagagtacgctaagcttgaggtggagttgaacacaccgg 4293803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6593786 - 6593372
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  6593786 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 6593687  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  6593686 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccgaggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 6593587  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| |||     
T  6593586 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggaa 6593490  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6593489 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagacggtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 6593390  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  6593389 gtggtgagaatactcatg 6593372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18391424 - 18391010
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  18391424 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 18391325  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||| || | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  18391324 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtaggggcagccgaggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 18391225  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||| ||    |||||| ||||    
T  18391224 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatgatg---agttgttgggag 18391128  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-ga-agcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || || ||    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18391127 gaaggtgaaggtgaggggtctcaccttggtattgattccttgtagacagtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 18391028  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  18391027 gtggtgagaatactcatg 18391010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47675390 - 47674978
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |   |||| || |||| |  || |    
T  47675390 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccagggagttgaccaagtctaaggacttgagagcgggtgaaaacagtgaagttctta 47675291  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||   | ||||||   |  | | | || ||||| ||||||||| | || ||    
T  47675290 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagaacagtaacaaggataattataagtgttttaagtgtcacaagtttggcca 47675191  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| ||||||| |||||   ||||  || ||||  ||| || | || ||||  ||| ||||||  |||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  47675190 cttcaagagggattgttcggaggacaatgagaactccgtgcaagttgtgtccgaggagtataaggatgaaggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 47675094  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  || ||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47675093 gatgaagaaggtgaggtctctcaacttggtattgattccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcatggagaggcggt 47674994  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    || |||||||||||||    
T  47674993 gggaagaatactcatg 47674978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Original strand, 38395768 - 38395866
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38395768 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 38395866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1561045 - 1560808
Alignment:
Q  177 tgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtg 276  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  ||||||||||    
T  1561045 tgctttaagtgtcacaagttgggacacttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtg 1560946  T
Q  277 ctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtggt-cgtctgaagagacgttaa 374  Q
    || |||||||| | |||||   |||||| |  |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || || |  ||||| |||||| |||||||||||    
T  1560945 ctttgatggtgagttgttg---ggaggaaggtgaaggtgaggggtctcaccttggtattgattccttgtagacggtgtggttcgtctggagagacgttaa 1560849  T
Q  375 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1560848 acactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 1560808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Original strand, 20298844 - 20298942
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20298844 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 20298942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44011798 - 44011738
Alignment:
Q  358 gtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44011798 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 44011738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 7470837 - 7470739
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7470837 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggtactacctaaaattcctaatgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 7470739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 764
Target Start/End: Original strand, 20298747 - 20298822
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20298747 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 20298822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 691 - 787
Target Start/End: Original strand, 21679546 - 21679643
Alignment:
Q  691 gaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  21679546 gaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacaatccgatggctga 21679643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 7092981 - 7092883
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  7092981 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagagctga 7092883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18391003 - 18390856
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  18391003 ctggagaggcggtgtgaacaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagtgg-atgtacgcatttggaagttgaggtaga 18390907  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  18390906 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatg 18390856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 47674974 - 47674775
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||   |||||||||    
T  47674974 agcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttaaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtacgcatttggaagttgaggt 47674878  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca 585  Q
    |||| | ||||| | | ||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||  | ||||| ||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||    
T  47674877 agagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacacctggaatggtacaactatggtggccttgagtgatatgctctagttgtgagcatgtgaattcttca 47674778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 48490736 - 48490899
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||  ||  || ||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||   |||||||||    
T  48490736 agcctggagaggcactgtgaataatacttgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtacgcatttggaagttgaggt 48490832  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  48490833 agagaaagctcaacttgaggtggagtagatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgggtg 48490899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18412910 - 18412835
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18412910 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 18412835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21645277 - 21645202
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21645277 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 21645202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21988148 - 21988097
Alignment:
Q  33 gaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21988148 gaagtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 21988097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 764
Target Start/End: Original strand, 28487032 - 28487106
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaa 764  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28487032 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaaggaccttcgagaa 28487106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 5818051 - 5818096
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5818051 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 5818096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 9186022 - 9186067
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9186022 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 9186067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 6593365 - 6593244
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  6593365 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagtgg-atgtacgcatttggaagttgaggtaga 6593269  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttg 514  Q
    | | ||||| | |||||||||||||    
T  6593268 gaaagctcaacttgaggtggagttg 6593244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 7350080 - 7349981
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7350080 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 7349981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 7070686 - 7070731
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7070686 ttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttaaccaagt 7070731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 1047716 - 1047617
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1047716 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 1047617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16884179 - 16884108
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  16884179 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 16884108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 22136664 - 22136763
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  22136664 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 22136763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 24262158 - 24262229
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  24262158 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 24262229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 40551691 - 40551790
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40551691 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 40551790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3324077 - 3324032
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3324077 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 3324032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 25352243 - 25352288
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25352243 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 25352288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 25406305 - 25406350
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25406305 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 25406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Original strand, 48490999 - 48491040
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48490999 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaagaagcggga 48491040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 49090899 - 49090854
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  49090899 caagcggctttgagaaacaaggaattgaccaagttcaatgacttga 49090854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 667; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Original strand, 43080636 - 43081494
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  43080636 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgatggccta 43080735  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43080736 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaaggcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgagtcacttca 43080835  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  43080836 agaaggattgtccggagattaatggtagctccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 43080935  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080936 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 43081035  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081036 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 43081135  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43081136 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatatgtagca 43081235  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  43081236 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaa 43081335  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgtatact 804  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| || |||||| | |||||| |||||||||    
T  43081336 agcttgtgggtctacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttgaggtgtatact 43081435  T
Q  805 tgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  43081436 tgttgattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 841
Target Start/End: Original strand, 27828019 - 27828843
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27828019 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 27828118  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27828119 agtgtctcaagagggaatggtgcaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtttgaatgctttaactatcacaagatgggtcacttca 27828218  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27828219 agaaggattgtccgaaggttaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 27828318  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  27828319 agaagatgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggtggtagtaa 27828418  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828419 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 27828518  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  27828519 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaaccttgggtgctatgctctatggtgagtaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagc 27828618  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||                ||||| |||||||| |    
T  27828619 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcg----------------gaagatgttatggtaa 27828702  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacgggttga----gtgtat 801  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |    ||||||    
T  27828703 atgcttgtgggactacctaaaattcctagtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcagaagacattccgagggctgaaggggttatgaggtgtat 27828802  T
Q  802 acttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  27828803 acttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaa 27828843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 631
Target Start/End: Original strand, 18811742 - 18812365
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18811742 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagagccta 18811841  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811842 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 18811941  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18811942 agaaggattgtccagagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 18812041  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18812042 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaa 18812141  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812142 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 18812241  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18812242 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtatagca 18812341  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaag 631  Q
    |  |||||| ||||||||||||||    
T  18812342 caacttgcgggattactctaaaag 18812365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 15069605 - 15069971
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  15069605 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaa 15069704  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069705 gtgtctcaagagggaacggtggagatagaggtaaccagagaaagagtggtaataagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 15069804  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15069805 gaaggattgtctggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 15069904  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaa 375  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15069905 gaaggtgatggatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcatctgaagagacgttaaa 15069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Original strand, 15071868 - 15072267
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15071868 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 15071967  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071968 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgacaatggaagaccttgagtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 15072067  T
Q  583 tcatgaa-----------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatcttt 665  Q
    |||||||                 |||| ||||||| || ||||||  ||  |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||     
T  15072068 tcatgaagacggaaggcattccgggttgaagaatgtatagcacggcaagcaggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttc 15072167  T
Q  666 aacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15072168 aaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtagaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 15072267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 391 - 817
Target Start/End: Original strand, 41383768 - 41384217
Alignment:
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagag 490  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  41383768 tggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtgcacatttgctagttgaggtagag 41383867  T
Q  491 tacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa 589  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383868 tacgctcatcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa 41383967  T
Q  590 -------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacga 670  Q
                       |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| || ||| |||||||||||| ||| || ||    
T  41383968 gacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggttatttgatgcaaggtgaccttcaagga 41384067  T
Q  671 agcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-ga 769  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| || ||    
T  41384068 agcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagacttcaaggaccttcgagaaggcgga 41384167  T
Q  770 agacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatacttgtggattactct 817  Q
    |||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41384168 agacattctgaggactgaaggggttgaggtgtatacttgtggattactct 41384217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31577590 - 31577192
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    | || || | ||||| |  ||||    
T  31577590 gaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaatgagttaaccaagtccaaggacttgagaattgattaaaatggtgaaggcctaa 31577491  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||      ||||   |||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  31577490 gtgtttcaagagtgaatggtggaggtagaggtaatcgg-----gagt---aacaagtcaaagtttaagtgctttaattgtcagaagatgggtcacttcat 31577399  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||   | ||||| ||||||||||    
T  31577398 gaaggattgtccgaagaataatggtaactccgcacaaattttctctgagggttatgaggatgcgggtgcttcagtggtg---tcttgttgggaggatgaa 31577302  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || | ||| || ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31577301 gaatgtgatgtttctcaccttgtgaattatgccttgtagagcggtgttcttctggagagacgttaaacactcaacctcagcctggagaggcggttgtaag 31577202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 384 - 728
Target Start/End: Original strand, 21481605 - 21481949
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21481605 atcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatttacacatttgctagttga 21481704  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg-aagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    |     | | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21481705 gaggttggaagctcaacttgaggtggatttgaacacatcggaaatggtacgactatggaagaccttgggagctatgctctagtggtgagcaatggatttc 21481804  T
Q  582 ttcatgaagttggag-aatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatat 680  Q
    |||||||||  |||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||    
T  21481805 ttcatgaagacggaggaatgtataacacggcttgctagattaccctaaaaa---gccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagat 21481901  T
Q  681 gtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaa 728  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||| || |||||||||||    
T  21481902 gtcctgtgttgaagaggttatggtggatacttgcggaactacctaaaa 21481949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 418
Target Start/End: Original strand, 17848565 - 17848970
Alignment:
Q  13 aaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaag 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |   ||      
T  17848565 aaggcactgtcaccttggaagaagttcaagctgctttgagaaccaaggagcaaaccaagtccaaggacttgagagctgatgaaaacggtgaaggcatatc 17848664  T
Q  110 tgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaag 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17848665 tgtttcaagagggaatggtggaggtataggtaaccaaggaaagagtggtaacaagtcaaagtttaattgctttaattatcacaagatgggtcacttcaag 17848764  T
Q  210 aaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaag 309  Q
    | |||||||||  |||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||||   | | ||| ||  ||| |||    
T  17848765 atggattgtccatagaacaatggtaactccgcacaaattgtctccgagggtgatgagaacacgggtgctttgatggtg---tctcgttggggtgataaag 17848861  T
Q  310 aaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaga 409  Q
    || ||||||| ||||||||||||| | ||| || ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  17848862 aaagtgatgtttctcaccttgggaattatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacattcaacatcaccctggagaggcggtcgaaaga 17848961  T
Q  410 atactcatg 418  Q
    ||| |||||    
T  17848962 atagtcatg 17848970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34255758 - 34255346
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  34255758 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagtggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 34255659  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  34255658 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 34255559  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| ||||||| |||||   ||||  |  ||||| ||| || | ||  |||  |||| ||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  34255558 cttcaagagggattgttcggaggacaatgagagctccgcgcaagttgtgtccaaggagtatggggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 34255462  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || || |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34255461 gaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtggagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggt 34255362  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||||||    
T  34255361 ggtaagaatactcatg 34255346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 41383618 - 41383763
Alignment:
Q  275 tgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaa 374  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41383618 tgctctgatggtgtggt-ttgtttggaggatgatgaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaa 41383716  T
Q  375 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383717 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 41383763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 421
Target Start/End: Original strand, 21481439 - 21481607
Alignment:
Q  250 tctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||| |   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||  |  ||    
T  21481439 tctctgagggttatgaggatgcatgtgttttggtggtgcg---ttgtatggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgttgcctgatagag 21481535  T
Q  350 cggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21481536 cggtggtcgtcaagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggtaagaatactcatgatc 21481607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 29542943 - 29543218
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| || |||| |  ||||    
T  29542943 gaaggcactgtcaccatggaggaagttcaagcggctttaagacccaaggagttgaccaagtccaagaacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctaa 29543042  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||   |||||| || ||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  29543043 gtgtttcaagaggaaatggtggtggtagaggtaaccacggaagctcaaagagaggcaacaagttaaagtataaatgctttaagtgtcacaagatggatca 29543142  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgct 278  Q
    |||||| | |||||||||||||   | || ||| ||| | ||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  29543143 cttcaaaagggattgtccggaggacattgataactccacgcaagttgtctctgaggattaggaggatgcaggtgct 29543218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 406 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 31574767 - 31574584
Alignment:
Q  406 aagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgag 505  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||    
T  31574767 aagaatactcgtgatcagcct-ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcattgtgg-atgtacgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaacttgag 31574670  T
Q  506 gtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
    |||||||| |  ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||    
T  31574669 gtggagtttatgacatcgggaatgatacgactatggagaccttgggtgctatgctctagttatgagaaagggaattcttcatgaag 31574584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41365972 - 41365853
Alignment:
Q  299 ggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagagg 398  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | || ||  || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365972 ggaggatgaagaaggtgaagtctctcaccttggtattgaggccttgtagagtggtgattgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagagg 41365873  T
Q  399 cggtggtaagaatactcatg 418  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  41365872 cggtgggaagaatactcatg 41365853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41366245 - 41366109
Alignment:
Q  13 aaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaag 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |  ||||| || |||| |  || ||    
T  41366245 aaggcaccgtcaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttag 41366146  T
Q  110 tgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccga 146  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41366145 tgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaaccga 41366109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 4732573 - 4732710
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||| || |||| || || |    
T  4732573 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaaaaaccaaggagttgaccaagtccaaggacatgagagcggatgaaaacagtgaagacctta 4732672  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccga 146  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4732673 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtggaggtaaccga 4732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 418
Target Start/End: Original strand, 4732831 - 4732957
Alignment:
Q  292 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcct 391  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4732831 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtttagagagacgttaaacactcatcatcagcct 4732930  T
Q  392 ggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4732931 ggagaggcggtgggaagaatactcatg 4732957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 421
Target Start/End: Original strand, 15071820 - 15071870
Alignment:
Q  371 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071820 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 15071870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 34255337 - 34255142
Alignment:
Q  392 ggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagt 491  Q
    |||||||||||   || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||| |||||   |||||||||||||     
T  34255337 ggagaggcggtatgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttacaaggtggaag-catagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtagaga 34255241  T
Q  492 acgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
    | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  34255240 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 34255142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 41365849 - 41365653
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||||||| | |||| ||||||   |||||||      
T  41365849 agcctggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggcaaaaggcatagtgtg-tgtatgcatttggaagttgagaa 41365752  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca 585  Q
    ||      |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  41365751 ag------ctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgggaattcttca 41365658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 810
Target Start/End: Original strand, 15072289 - 15072412
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaa-agcgaagacattccgagggctgac 788  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||     
T  15072289 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaagacggaagatattccgatggctgaa 15072388  T
Q  789 ggg--ttgagtgtatacttgtgga 810  Q
    |||  | ||||||| |||||||||    
T  15072389 ggggttagagtgtaaacttgtgga 15072412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 4732961 - 4733125
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |||  ||||||| | |||||||||||   | |||||||    
T  4732961 agcctggagaggcagtgtgaagagtactcatgatcaacct-ttgaggtggagttgcaagggagaaagcatagtgtg-tgtacgcatttggaaattgaggt 4733058  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
    |||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  4733059 agagaaatctcaacttgaggtggagttgatgacaccgaaaatggtacgactatggaggtcttgggtg 4733125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 460
Target Start/End: Original strand, 17848972 - 17849046
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtg 460  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  17848972 tcagtctgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtg 17849046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 18853998 - 18854073
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18853998 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 18854073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 659 - 787
Target Start/End: Original strand, 41384246 - 41384375
Alignment:
Q  659 gatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagacctt 758  Q
    |||||| || |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||| | |||    
T  41384246 gatcttcaaggaagcgggatatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaatttctagcgtagttggactacaaacatctt 41384345  T
Q  759 cgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  41384346 cgagaaggcggaagacattccgatggctga 41384375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26300590 - 26300515
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  26300590 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaatgaattgaccaagttcaaggacttga 26300515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 27828878 - 27828977
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  27828878 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 27828977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 5591800 - 5591846
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 58  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5591800 gaaggcaccgtcaccttggaagaaattcaagcggctttgagaaccaa 5591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 796 - 876
Target Start/End: Original strand, 18812374 - 18812456
Alignment:
Q  796 gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  18812374 gtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 18812456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 10685099 - 10685170
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  10685099 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 10685170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 35744642 - 35744571
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  35744642 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 35744571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 4819529 - 4819484
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  4819529 ttggaggaagttcaagcggctttaagaaccaaagagttaaccaagt 4819484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16756550 - 16756505
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16756550 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 16756505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 84
Target Start/End: Original strand, 23800386 - 23800427
Alignment:
Q  43 cggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  23800386 cggctttgagaaccaagaaattgaccaagttcaaggacttga 23800427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 28328799 - 28328844
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28328799 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 28328844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 28891655 - 28891700
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28891655 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 28891700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 667; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 22782037 - 22781163
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22782037 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 22781938  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781937 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 22781838  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22781837 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 22781738  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781737 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 22781638  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781637 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 22781538  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22781537 ggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtatagca 22781438  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  22781437 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaa 22781338  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacggg-ttga-gtgtatac 803  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  22781337 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagggattgaggtgtatac 22781238  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  22781237 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgagtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 22781163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 640; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 11007868 - 11007009
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11007868 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagtggctttgagaaccaaggagttgactaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 11007769  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007768 agtgtctcaagagggaatggtgaaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 11007669  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11007668 agaaggattttccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttgaaggatga 11007569  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11007568 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtaa 11007469  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007468 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 11007369  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11007368 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaaaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 11007269  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  11007268 cggcttgcgagattactctaaaagaatgtcaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaaccaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaa 11007169  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgtatac 803  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| || |||||| | |||||| ||||||||    
T  11007168 agcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttgaggtgtatac 11007069  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  11007068 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 11007009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 16933448 - 16932587
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  16933448 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgatggccta 16933349  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16933348 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggcttgaatgctttaactttcacaagatgggtcgcttca 16933249  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16933248 agaaggattgtccggagattaatggtagctccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 16933149  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16933148 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacattagcttggagaggcggtggtaa 16933049  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933048 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggctgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 16932949  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16932948 ggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaaaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 16932849  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16932848 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaa 16932749  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggt--tga-gtgtat 801  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||| | |||  ||| ||||||    
T  16932748 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttatgaggtgtat 16932649  T
Q  802 acttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  16932648 acttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 16932587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 22046015 - 22045142
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22046015 caaggaaggcattgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 22045916  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22045915 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgggtcacttca 22045816  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22045815 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattatctcagagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 22045716  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045715 agaaggtgatgtatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggttcgtctggagacacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 22045616  T
Q  407 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22045615 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagatagagtacgctcagcgtgagg 22045516  T
Q  507 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtac 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  22045515 tggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttgaagaatatatag 22045416  T
Q  606 cacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtg 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  | |||||| |||||||||    
T  22045415 cacggcttgcgagattactctaaa--aattccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcggtgaagatgttatggtg 22045318  T
Q  706 aaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtata 802  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22045317 aatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtata 22045218  T
Q  803 cttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  22045217 cttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 22045142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 9175772 - 9174933
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  9175772 caaggaaggcactgctaccttggaagaagttcaagcggctttgagaatcaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacaaggtgagggccta 9175673  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9175672 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaattgtcacaa-atgggtcacttca 9175574  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  9175573 agaaggattgtccggagattaatggaaactccgcacaaattatctctaagggttatgaggatgcgggttctctaatggtgtggtgttgcttggaggatga 9175474  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9175473 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 9175374  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9175373 gaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggt 9175274  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||     
T  9175273 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtactatgctctatggtgagcaagggatttattcatgaagttgaagaatgtataca 9175174  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaa--gagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggt 704  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||    
T  9175173 acggcttgcaggattatcctaaaagaaggccaagggggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggt 9175074  T
Q  705 gaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtat 801  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | |  ||||||    
T  9175073 gaatgcttgtgggactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttaaggtgtat 9174974  T
Q  802 acttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9174973 acttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaa 9174933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22133917 - 22133504
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22133917 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaagcagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 22133818  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133817 agtgtctcaagagggaatggtgttggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 22133718  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133717 agaaggattgtccgggggttaatggtaactccgcacaaattgtctcaaggggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 22133618  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133617 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 22133518  T
Q  408 gaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||    
T  22133517 gaatactcatgatc 22133504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 263 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 22802118 - 22801576
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  22802118 tgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtggtcgtctg 22802019  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 462  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802018 gagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 22801919  T
Q  463 atgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctc 561  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22801918 atgtacacatttgctagttgaggtagaatacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctc 22801819  T
Q  562 tatggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagag 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| |    
T  22801818 tatggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaaggg 22801719  T
Q  643 tgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagtt 742  Q
    |||||||||||||||  | ||| || ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22801718 tgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt 22801619  T
Q  743 ggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggc 784  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22801618 ggactgcaaggacattcgagaaggcggaagacattccgagggc 22801576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 266 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 36920876 - 36920344
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  36920876 ggatgcgggtgctctgatggtgtggtgatgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggag 36920777  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36920776 agacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatattcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatg 36920677  T
Q  466 tacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctat 564  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  36920676 tacgcatttgctagttgaggtagagtacgttcagcgtgaggtgcatttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgcaatgctctat 36920577  T
Q  565 ggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtga 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||                   |||| ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||    
T  36920576 ggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtga 36920477  T
Q  646 ttggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    |||||||||||| || ||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36920476 ttggatgcaaggagaccttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagagattatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttgga 36920377  T
Q  746 ctgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattc 777  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36920376 ctgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattc 36920344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12400118 - 12399706
Alignment:
Q  12 gaaggcact-gttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    | ||||| ||||||| |  |||    
T  12400118 gaaggcacttgttaccttggaaaaagttcaagcggctttgagaaccaggaagttgaccaagtccaaggacttgagaatttatgaaaacggtgaaggccta 12400019  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  12400018 aatgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcataagatgggtgacttcc 12399919  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  12399918 tgaaggattgtctggagataaatggtaactccgcacaaattgtctctaagggttatgaggatgcaggtgcactgatggtgtggtgttttttgctggatga 12399819  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12399818 agaaggtgatgcgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaa 12399719  T
Q  408 gaatactcatgat 420  Q
    |||||||||||||    
T  12399718 gaatactcatgat 12399706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12402392 - 12401980
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    | ||||| | ||||| |  ||||    
T  12402392 gaaggcactattacctttgaagaagttcaagcggatttgagaaccaagaagttgaccaagtccaaggatttcatattttatgaaaatggtgaaggcctaa 12402293  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12402292 atgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcct 12402193  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  |||||||    
T  12402192 gaaggattttctagagataaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgcactgatggtgtagtgttttttgctggatgaa 12402093  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12402092 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaagcggtggtaag 12401993  T
Q  409 aatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||    
T  12401992 aatactcatgatc 12401980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Original strand, 5099598 - 5099929
Alignment:
Q  90 gaacacggtgaggaactaagtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtc 189  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5099598 gaacacggtgaaggtctaagtgtctcaagagggaatgatggaggtacaggtaaccggagaaagagtggtaaaaagtcaacgtttgaaagctttaactgtc 5099697  T
Q  190 acaagatgggtcacttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtg 289  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5099698 ataagatgggtcacttcatgaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggctatgaggatgcgggtgctctgatggtgtg 5099797  T
Q  290 ctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagc 389  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  5099798 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacattagc 5099897  T
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5099898 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 5099929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 384 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 22133506 - 22133112
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22133506 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 22133407  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133406 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 22133307  T
Q  583 tcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgt 682  Q
    |||||| | || ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  22133306 tcatgaggatgaagaatgtatagcacggcttgcgggattatcctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgt 22133207  T
Q  683 cctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacatt 776  Q
    |   | ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || |||||||||    
T  22133206 ctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacatt 22133112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 409 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 14788633 - 14788234
Alignment:
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788633 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 14788534  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa------------------ 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                      
T  14788533 gagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccgga 14788434  T
Q  590 -gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatg 688  Q
     |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  14788433 ggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtg 14788334  T
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  14788333 ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgaggtctga 14788234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 384 - 751
Target Start/End: Original strand, 16454413 - 16454800
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16454413 atcagactggagaggtggaagcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggtgtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttga 16454512  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16454513 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatacgctatggtgagcaagggatttct 16454612  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16454613 tcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatct 16454712  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaa 751  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454713 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaa 16454800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 390 - 764
Target Start/End: Original strand, 24879626 - 24880019
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24879626 ctggagaggtggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtaga 24879725  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879726 gtacgctcagcgagaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatga 24879825  T
Q  589 a-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacg 669  Q
    |                   |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||  || | |    
T  24879826 agacggaatgcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccgtaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtaat-attcagg 24879924  T
Q  670 aagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaa 764  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24879925 aagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatgatgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagagtagttggactgcaaggaccttcgagaa 24880019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 384 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 12401982 - 12401595
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12401982 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacgcatttgctagttga 12401883  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401882 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaactcaccggtaatggtacagctatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 12401783  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12401782 tcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatct 12401683  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaa 751  Q
    | || |||||  || ||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401682 tcaaggaagcatgagatgtcctgtggtgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactgcctaaaactcctagtgtagttggactgcaa 12401595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 563
Target Start/End: Original strand, 26558641 - 26559173
Alignment:
Q  29 ggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagagggaat 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||| || |||| || ||||||||  |||||||||||    
T  26558641 ggaagaagttcaaacgactttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttgatgaaaacagtgaagacctaagtgtttcaagagggaat 26558740  T
Q  126 ggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccggaga 225  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  26558741 gatggaggtagaggtaaccgtggaaataatggtaacaagtcaaagtttaagtactttaactatcacaagatgggttacttcgagcaggattgtccagaga 26558840  T
Q  226 ttaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 325  Q
      |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| || | ||||  |||||   ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26558841 acaatggtaactccgcacaaattgtcttcgagggttatgaggatgtgggtgctttggttgtgtcttgttg---gggtgatgaagaaggtgatgtctctca 26558937  T
Q  326 ccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacc 425  Q
    |||| ||| ||||| ||  |  ||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| |||    
T  26558938 cctttggactgatgccttatagagcggcggtcgtttgtacagacattaaacactcaacatcagcctgaagagttgacggtaagaatactcatgatcaacc 26559037  T
Q  426 tgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggt 525  Q
    | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |||||       
T  26559038 t-ttgaggtggagtttcaaagtgaaagtcatagtgg-atgcacgcatttgcaagttgatgtagagaaagctcatcgtaaggtggagttgatgacaccata 26559135  T
Q  526 aatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26559136 aatggtacaactatggagaccttgggtgctaggctcta 26559173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 384 - 832
Target Start/End: Original strand, 5099927 - 5100397
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5099927 atcagtctggagaggtggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttga 5100026  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100027 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt--aaacaccggtaatagtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 5100124  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5100125 tcatgaagacagaagacattccggaggttgaagaatgtataacacagcttgcgggattaccctaaaaaatagccaagagtgattggatgcaaggagatct 5100224  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||  |||||  || || || ||||| |||||||||||    
T  5100225 tcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgttgaactacctaaaatacctagcataattagattgcaaggaccttcgaga 5100324  T
Q  764 a-agcgaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgat 832  Q
    | |   |||| |||||||||||||| ||| | |  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  5100325 agacacaagatattccgagggctgaagggattaaggtgtatacttgttgattactctaaaagccaagggtgat 5100397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Original strand, 47563863 - 47564264
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47563863 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctaccggttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 47563962  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47563963 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgactatggacgaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttc 47564062  T
Q  582 ttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    ||||||||                   |||| ||||||| || ||||  ||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||     
T  47564063 ttcatgaagacggaaggcattatggaggttgaagaatgtatagcacgaattgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggaaatt 47564162  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgag 762  Q
    || || ||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47564163 ttcaaggaagcgggaaatgtattgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtgaaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgag 47564262  T
Q  763 aa 764  Q
    ||    
T  47564263 aa 47564264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Original strand, 36379334 - 36379734
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36379334 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtac-catttgctagttga 36379432  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  36379433 ggtagagtacgctcagtttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggaggaccttggatgctatgctctagtggtgagcaatgaatttc 36379532  T
Q  582 ttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    ||||||||                    ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36379533 ttcatgaaaacggaaggcattccagagattgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattgaatgcaaggtgatc 36379632  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgag 762  Q
    || || ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36379633 ttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattgccagcgtagttggactgcaaggaccttcgag 36379732  T
Q  763 aa 764  Q
    ||    
T  36379733 aa 36379734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 358 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18536092 - 18535863
Alignment:
Q  358 gtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacata 457  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18536092 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatgatctacct-ttgaggtggagttttaaggttgaagacata 18535994  T
Q  458 gtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgcta 556  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    |  | ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18535993 gtgcgatgtacgcattttctagttgagaggtaaaaagctcagcttgaggtggagtttaacacaccaggaatggtacgactatggaggaccttgggtgcta 18535894  T
Q  557 tgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 586  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18535893 tgctctagtggtgagcaatggatttcttcat 18535863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 263 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14788814 - 14788657
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14788814 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 14788715  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788714 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 14788657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 384 - 590
Target Start/End: Original strand, 36770559 - 36770767
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36770559 atcagtctggagaggcagaggcaacaatactcatgatctatttgttgagttggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtgcgcatttgctagttga 36770658  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  36770659 ggtagagtaagcttagcttgaggtggagttgaacagaccgataatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggaattc 36770758  T
Q  582 ttcatgaag 590  Q
    |||||||||    
T  36770759 ttcatgaag 36770767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 421
Target Start/End: Original strand, 47563710 - 47563865
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| ||    
T  47563710 ggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggattgatacatagtagagcggtggtcgtctggag 47563809  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47563810 agacgttaaacactcaacatcagtctagagatgcggtggtaagaatactcatgatc 47563865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12740985 - 12740573
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  12740985 gaaggcactgtcacctttgaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 12740886  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      ||||  | || |||   | || | | |||||||| ||||| ||| | |||||    
T  12740885 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcagtaaaaaggataagtataagtgctttaagtgtcataagtttggtca 12740786  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||   ||||  || ||||| ||| || | |||||||  |||| || |||||||||| ||  |||| | |||||   ||||    
T  12740785 cttcaagagggattgtctggaggacaatgagaactccgcgcaagttgtgtctgaggagtatgggggtgcgggtgctttggcggtgagttgttg---ggag 12740689  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12740688 gatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggataggcggt 12740589  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    |  |||||||||||||    
T  12740588 gagaagaatactcatg 12740573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 16454255 - 16454415
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |  ||||||||| ||||     
T  16454255 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctgttagagcggtggttgtcta 16454354  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaac--atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454355 gagagacgttagacactcaacagatcagcctggagaggcggtggcaagaatactcatgatc 16454415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12749191 - 12748779
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactc---atgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| || |||| |  || |    
T  12749191 gaaggcactgtcacctttgaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagtggatgaaaacagtgaaggcctta 12749092  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      ||||  | || |||   | || | | |||||||| ||||| ||| | |||||    
T  12749091 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcagtaaaaaggataagtataagtgctttaagtgtcataagtttggtca 12748992  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||   ||||  || ||||| ||| || | |||||||  |||| || |||||||||| ||  |||| | |||||   ||||    
T  12748991 cttcaagagggattgtctggaggacaatgagaactccgcgcaagttgtgtctgaggagtatgggggtgcgggtgctttggcggtgagttgttg---ggag 12748895  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12748894 gatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggataggcggt 12748795  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    |  |||||||||||||    
T  12748794 gagaagaatactcatg 12748779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 421
Target Start/End: Original strand, 36379180 - 36379336
Alignment:
Q  265 aggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaa 364  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  36379180 aggatgtgggtggtctgacggtgtaatgttgtttggaggatgaagaagacgatttttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctgga 36379279  T
Q  365 gagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36379280 gagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaataatactcatgatc 36379336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 390 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12399701 - 12399566
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12399701 ctggagaggcggagggaacaatactcatgatctacatgttaaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 12399602  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggt 525  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12399601 gtacgctcagcttgaggtggagttgaaatcaccggt 12399566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 5137007 - 5137418
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  5137007 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 5137106  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  5137107 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 5137206  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  5137207 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 5137303  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || | ||||||||| | |||||| ||||| ||||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5137304 gaaggagaaggtgaggggtctcatcttggtattgattccttgtagatggtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 5137403  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  5137404 gtggtgagaatactc 5137418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 8394333 - 8394750
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  8394333 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 8394432  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  |||  ||||||||||| |||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  8394433 gtgtttcaaaggggaatggtggtggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 8394532  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  8394533 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 8394629  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||   | || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8394630 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattcattgtagacggtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 8394729  T
Q  401 gtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  8394730 gtggtgagaatactcatgatc 8394750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 403 - 590
Target Start/End: Original strand, 47565735 - 47565923
Alignment:
Q  403 ggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgt 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    || | ||| ||  |    
T  47565735 ggtaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggtggaagacataatgggatgtacatatttgctagttgagaggtagaaagcttagttt 47565834  T
Q  503 gaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  47565835 gaggtgaagttgaactcaccgggaatggtatgactatggagaaccttgagtgatatgctctattgtgagcaagggaattcttcatgaag 47565923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 590
Target Start/End: Original strand, 10113952 - 10114157
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| | |||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10113952 tcagtctgaagaggcgggagtaagaatacttgtgatcaacct-ttgaggtggtgttttagggtgaaagacaaagtgtgatgtacgcattttctagttgag 10114050  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttctt 583  Q
    || ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  10114051 gttgacaacgctcagcttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggagaccttgggtgttattctttagttgtgagcaatggaattctt 10114150  T
Q  584 catgaag 590  Q
    |||||||    
T  10114151 catgaag 10114157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 417
Target Start/End: Original strand, 7123623 - 7124036
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||  | |||| |  || |    
T  7123623 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaagcagtgaaggcctta 7123722  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  7123723 gtgtgtcaaaaggaaatggtgaaggtagaggcagccgaggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 7123822  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  7123823 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 7123919  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7123920 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagacggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 7124019  T
Q  401 gtggtaagaatactcat 417  Q
    ||||| |||||||||||    
T  7124020 gtggtgagaatactcat 7124036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 543 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 12396880 - 12396653
Alignment:
Q  543 gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattac 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  12396880 gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattac 12396781  T
Q  624 tctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacc 723  Q
     |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  || ||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  12396780 cctaaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactgcc 12396681  T
Q  724 taaaactcctagtgtagttggactgcaa 751  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396680 taaaactcctagtgtagttggactgcaa 12396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3578053 - 3577934
Alignment:
Q  299 ggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagagg 398  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3578053 ggagaatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaataatgccttacaacgcggtgatcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcatggagagg 3577954  T
Q  399 cggtggtaagaatactcatg 418  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  3577953 cggtagtaagaatactcatg 3577934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52094615 - 52094394
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  52094615 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaatgacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 52094516  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |      ||||||  | ||||||   | || | |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  52094515 gtgtttcaagagaaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcagtaacaaggataagtataaatgctttaagtgtcacaagttgggtca 52094416  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggag 224  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  52094415 cttcaagagggattgcccggag 52094394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34571593 - 34571440
Alignment:
Q  261 tatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtc 360  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| |||||    
T  34571593 tatgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggatgatgaaggtggggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtc 34571497  T
Q  361 tgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 417  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34571496 tagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtgtgaagaatactcat 34571440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 414
Target Start/End: Original strand, 10113823 - 10113946
Alignment:
Q  291 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcc 390  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||  |||||| || ||||| |||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10113823 tgttgttgggagaatgaagaaggtaatgtttccaaccttgtgaatgatgcctagtagagcggtgatcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 10113922  T
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatact 414  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  10113923 tggagaggtggtgggaagaatact 10113946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 356 - 421
Target Start/End: Original strand, 36770496 - 36770561
Alignment:
Q  356 tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36770496 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatc 36770561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 5872730 - 5872795
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaag 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5872730 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaacaagtccaag 5872795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 5206904 - 5206506
Alignment:
Q  24 accttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatg-aacacggtgaggaactaagtgtcacaaga 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||| || |  |||| |  ||||| ||  |||||    
T  5206904 accttggaggaagtccaagcagctttaagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttgagagcgaatgaaaaatagtgaaggcctaagcgtttcaaga 5206805  T
Q  120 gggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaagg 213  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |      ||| ||||| |||||| ||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5206804 gggaatgacggaggtagaggtaactgaggaagctaaaacagtggtaacaagacaaagtataagtgctataagtgtcacaagatgggtcacttcaagaggg 5206705  T
Q  214 attgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaagg 313  Q
    ||||  ||||||  |||   || ||  | ||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   |  |||| || |||||| |||||    
T  5206704 attggacggagaacaataaaaactctacgcaagttgtctttgagcattatgaggatgcgggtgatctgatggtg---tcatgttagggggatgaggaagg 5206608  T
Q  314 tgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatac 413  Q
    ||| || |||||||| || | ||||  || ||  | ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  5206607 tgacgtttctcacctaggtaatgattccttgtagatcggtggtagtctg-atagacagtaaacactcaacatcagcttggaaagacggtgggaagaatac 5206509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 12396617 - 12396515
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgac 788  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  12396617 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtttagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattcagatggctgac 12396518  T
Q  789 ggg 791  Q
    |||    
T  12396517 ggg 12396515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 12401559 - 12401457
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgac 788  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  12401559 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtttagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctgac 12401460  T
Q  789 ggg 791  Q
    |||    
T  12401459 ggg 12401457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18536900 - 18536787
Alignment:
Q  246 attatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| | || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||    
T  18536900 attatctctgagggttttgaggatgcaagtgttttggtggtgtg---ttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgagtgatgcctggt 18536804  T
Q  346 gaagcggtggtcgtctg 362  Q
     ||||| ||||||||||    
T  18536803 aaagcgttggtcgtctg 18536787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 34571431 - 34571238
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||      
T  34571431 ctggagaggtggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaagacatagtgt-atgtacgcatttggaagttgaggta-- 34571337  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
     || ||||| | |||||||||||||   ||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  34571336 -taagctcaacttgaggtggagttggtgacaccgagaatgatacaactatgaaggccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 34571238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 3825331 - 3825227
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgac 788  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||     
T  3825331 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtatagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaa 3825232  T
Q  789 gggtt 793  Q
    |||||    
T  3825231 gggtt 3825227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 4588888 - 4589003
Alignment:
Q  33 gaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggactt--gactcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagagggaatggtgg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| |  |||| || || |||||  ||||||| | ||||||    
T  4588888 gaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagagggatgaaaatagtgaagaccttagtgtttcaagaggaagtggtgg 4588987  T
Q  131 aggtagaggtaaccga 146  Q
    ||||||||||||||||    
T  4588988 aggtagaggtaaccga 4589003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12740569 - 12740406
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||   |||||||||    
T  12740569 agcctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtggaag-catagtgtg-tgtactcatttggaagttgaggt 12740473  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
    |||| | ||||| | |||||| |||||||  | ||||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  12740472 agagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggaggccttgggtg 12740406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12748775 - 12748612
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||   |||||||||    
T  12748775 agcctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtggaag-catagtgtg-tgtactcatttggaagttgaggt 12748679  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
    |||| | ||||| | |||||| |||||||  | ||||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  12748678 agagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggaggccttgggtg 12748612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 359 - 421
Target Start/End: Original strand, 47565621 - 47565683
Alignment:
Q  359 tctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47565621 tctggagagacgttaaacactcaacatcaacctgaagaggcagtggtaagaatactcatgatc 47565683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 690 - 793
Target Start/End: Original strand, 16454836 - 16454940
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgac 788  Q
    |||||| |||| ||||||   |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||     
T  16454836 tgaagaggttaaggtgaatgtttgtggaactacctaaaattcttagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcagaagacattccgatgactgaa 16454935  T
Q  789 gggtt 793  Q
    |||||    
T  16454936 gggtt 16454940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 5137428 - 5137575
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  5137428 ctggagaggcggtggtaacaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 5137524  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  5137525 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatg 5137575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 563
Target Start/End: Original strand, 54881913 - 54882088
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| || |||||||||  ||||||  ||| ||||||| | ||||| |||||   |||||||    
T  54881913 tcagcttggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct-ttaaggtggagtgacaaggtgaaag-catagtgtg-tgtacacatttggaagttgag 54882009  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  54882010 gtagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccgagaatggtacgactatggaggccttgggtgttatgctcta 54882088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 635 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 18535798 - 18535675
Alignment:
Q  635 gccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatct-------tgtgggactacctaaa 727  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |  ||       ||||| ||||| ||||    
T  18535798 gccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagtgggagatgtcccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaatgtggaactacataaa 18535699  T
Q  728 actcctagtgtagttggactgcaa 751  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  18535698 attcctagtgtagttggactgcaa 18535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 514
Target Start/End: Original strand, 7124044 - 7124165
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  7124044 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagtgg-atgtacgcatttggaagttgaggtaga 7124140  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttg 514  Q
    | | ||||| | |||||||||||||    
T  7124141 gaaagctcaacttgaggtggagttg 7124165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 540
Target Start/End: Original strand, 8394748 - 8394901
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||    
T  8394748 atcagtctggagaggcggtgtgaataatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttga 8394844  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    ||||| | | ||||| | |||||||||||||   || |||| |||||||||||||||    
T  8394845 ggtagcgaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacgactatg 8394901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5147153 - 5147078
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||    
T  5147153 aaggagggcactactactttggaggaagtccaagcggctttgagaaccaaacaattgaccaagttcaaggacttga 5147078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 4559097 - 4559142
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4559097 ttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttaaccaagt 4559142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 16624871 - 16624915
Alignment:
Q  40 aagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16624871 aagcggctttgagagccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 16624915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 688 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 35371436 - 35371380
Alignment:
Q  688 gttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgg 744  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35371436 gttgaagatgttatggtgtaaacttgtggaactacctaaaagtcctagtatagttgg 35371380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 9174898 - 9174799
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9174898 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactccaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctga 9174799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 9225239 - 9225302
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9225239 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 9225302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Original strand, 10451216 - 10451267
Alignment:
Q  351 ggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  10451216 ggtggtcgtatgaagaaacgttaaacactcaacatcaatttggagaggcggt 10451267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 22045143 - 22045044
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  22045143 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 22045044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 418
Target Start/End: Original strand, 47565681 - 47565715
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47565681 atcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatg 47565715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 745
Target Start/End: Original strand, 54882237 - 54882290
Alignment:
Q  691 gaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54882237 gaagaagttatggtgtagtcttgtggaactacctaaaa-tcctagtgtagttgga 54882290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 3577557 - 3577500
Alignment:
Q  688 gttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3577557 gttgaagaggttatggtgtagacttatggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 3577500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 692 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 3577748 - 3577695
Alignment:
Q  692 aagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3577748 aagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 3577695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12740306 - 12740265
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12740306 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggga 12740265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12748512 - 12748471
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12748512 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggga 12748471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 84
Target Start/End: Original strand, 15313209 - 15313266
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  15313209 ttggaggaagttcaagcaactttgataaccaaagagttgaccaagttcaaagacttga 15313266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 84
Target Start/End: Original strand, 21549542 - 21549599
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  21549542 ttggaggaggttcaagcacctttgagaaccaaggagttaaccaagttcaaggatttga 21549599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 22781164 - 22781064
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc--gaagacattccgagggctg 786  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  22781164 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcgggaagacattccgatggctg 22781065  T
Q  787 a 787  Q
    |    
T  22781064 a 22781064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 34571175 - 34571134
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34571175 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggga 34571134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 525 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 35371623 - 35371562
Alignment:
Q  525 taatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca 585  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  35371623 taatggtacgactatggaaaccatgggttctatgctctagttgtgagcaagggagttcttca 35371562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 667; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Original strand, 47178341 - 47179215
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47178341 caaggaaggcactgttacattggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 47178440  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47178441 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 47178540  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47178541 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 47178640  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47178641 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacctagagaggcggtggtaa 47178740  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47178741 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 47178840  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  47178841 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtatagc 47178940  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  47178941 acggcttgcgagataactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtga 47179040  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgtatac 803  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  47179041 aagcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgtatac 47179140  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||  || |||||||||    
T  47179141 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcggaagatatctcgtatt 47179215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 662; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 841
Target Start/End: Original strand, 16227147 - 16227987
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16227147 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 16227246  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227247 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 16227346  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16227347 agaaggattgtccggagattaatgataactccgcaaaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 16227446  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16227447 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacacttaacatcagcctggagaggcggtggtaa 16227546  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227547 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagatatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 16227646  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16227647 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 16227746  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16227747 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaa 16227846  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggt--tga-gtgtat 801  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| |||| || |||||| | |||  ||| ||||||    
T  16227847 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttatgaggtgtat 16227946  T
Q  802 acttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16227947 acttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaa 16227987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 841
Target Start/End: Original strand, 51751016 - 51751854
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  51751016 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 51751115  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751116 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 51751215  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51751216 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 51751315  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751316 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 51751415  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751416 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 51751515  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  51751516 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtatagc 51751615  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  51751616 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtga 51751715  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  ||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  51751716 atgcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttgaggtgtatac 51751815  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    || |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  51751816 ttatggattactctaaaagccaatggtgattgggtacaa 51751854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Original strand, 20301110 - 20301984
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  20301110 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaaggccta 20301209  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301210 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 20301309  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20301310 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctcagagggttatgaggatgcgggtgctctgatgatgtggtgttgtttggaggatga 20301409  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301410 agaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 20301509  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301510 gaatactcatgatctacctgtcgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 20301609  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  20301610 ggagttgaacacaccagtaatggtacggctatgaaggaccttgagtgctatgctctatcgtgagcaaaggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagc 20301709  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |   ||||||| ||||||||||    
T  20301710 acggcttgcggaattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatctttaaggaagcgggagatgttttgcattgaagatgttatggtga 20301809  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||    
T  20301810 atgcttgtgggactaactaaaattcctagcgtagttgggctgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtatac 20301909  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  20301910 ttgtgaattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 20301984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 27338429 - 27337649
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||| |  ||||    
T  27338429 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagaattcaagaacacggtgaaggcctaa 27338330  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27338329 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagcctgaatgctttaactgtcacaagatggatcagttcaa 27338230  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27338229 gaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctcagagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 27338130  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27338129 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaag 27338030  T
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27338029 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgcgaggtg 27337930  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  27337929 gagttgaacacaccggtaatgtttcgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaatggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagca 27337830  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27337829 cggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaa 27337730  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27337729 tgcttgtaggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 27337649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 263 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 31736857 - 31736354
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  31736857 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtgaagcggtggtcgtttg 31736758  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 462  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736757 gagagacgttaaacactcaacattagcctggagaggcggttgtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 31736658  T
Q  463 atgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctc 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  31736657 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctc 31736558  T
Q  562 tatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgat 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31736557 tatggtgagcaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaagaaggccaagggtgataggatgcaaggtgat 31736458  T
Q  662 ctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcg 760  Q
    ||| || ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31736457 cttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcg 31736358  T
Q  761 agaa 764  Q
    ||||    
T  31736357 agaa 31736354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28202995 - 28202584
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  28202995 gaaggcactgt-accttggatgaaattcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaagaacttgagaattcatgaacacggtgaaggcctaa 28202897  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28202896 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatggatcacttcat 28202797  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28202796 gaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctaagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 28202697  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28202696 taagttgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgatcttctggagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaag 28202597  T
Q  409 aatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||    
T  28202596 aatactcatgatc 28202584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 432 - 787
Target Start/End: Original strand, 28841760 - 28842117
Alignment:
Q  432 ggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggt 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28841760 ggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggt 28841859  T
Q  532 acgactatgaaga-ccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaa 630  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||  | ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28841860 acgactatgaaaaaccttgggtgctatgctctatggtgagcaaggaatttcttcatgaggttgaagaatgtaaagcacagcttgcgggattacactaaaa 28841959  T
Q  631 gaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaact 730  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |    
T  28841960 gaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgtacgcttgtggaactacctaaaatt 28842059  T
Q  731 cctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28842060 cctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 28842117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13127033 - 13126631
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||| | ||||| |   |||    
T  13127033 gaaggtactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaaccaaggagttgaccaaatccaaggacttgagagctgatgaaaatggtgaaggcgtaa 13126934  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13126933 gtgtttcaagagggaatggtggaggtagatgtaaccggggaaagactgataacaagtcaaagtttaaatgctttaactgtaacaagatgggtcacttcag 13126834  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||| ||||||||||    
T  13126833 gaaggattgtccagagatcaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctttggtggtg---tgttgttgggaggatgaa 13126737  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13126736 gaaggcgatgtttctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagatgataaacactcaacatcaacttggagaggcggtggtaag 13126637  T
Q  409 aatact 414  Q
    ||||||    
T  13126636 aatact 13126631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 384 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 14099150 - 14098727
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14099150 atcagtctgaagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttga 14099051  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14099050 ggcagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtatgtctatggaggaccttgggtgttatgctctatggtgagcaagggatttct 14098951  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || || |||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  14098950 tcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcatggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagacct 14098851  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgag 762  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14098850 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgag 14098751  T
Q  763 aaagc-gaagacattccgagggct 785  Q
    ||| | |||||| |||||| ||||    
T  14098750 aaaacggaagacgttccgatggct 14098727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 384 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 50078019 - 50077565
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  50078019 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagcttcaaggttgaagacataataggatgtatgcatttgctagttga 50077920  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50077919 ggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgactatggagaaccttggatgctatgctctatggtgagcaagggatttct 50077820  T
Q  583 tcatgaag------------ttgg-------agaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    ||||||||            ||||       ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||| || | |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  50077819 tcatgaagacggaaggcattttggaggttaaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggtggcct 50077720  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  50077719 tcaaggaagcgggagatgtcccgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggattgcaaggaccttcgaga 50077620  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctgacggg--ttgagtgtatacttgtggattact 815  Q
    | || |||||||||| ||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||    
T  50077619 aggcggaagacattctgagggctgaaggggttaaagtgtatacttgtggattact 50077565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 384 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 28202586 - 28202162
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28202586 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgttcgcatttgctagttga 28202487  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28202486 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggcacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggttttct 28202387  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||||||   || |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||  || ||    
T  28202386 tcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatatcacggcgctcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaagaagacct 28202287  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28202286 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaaaatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgaga 28202187  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    | || |||||||||||| |||||||    
T  28202186 aggcggaagacattccgtgggctga 28202162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 28841401 - 28841617
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  28841401 caaggaagacactgttaccttggaagaagttcaagaggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaaggccta 28841500  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28841501 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagataggtcacttta 28841600  T
Q  208 agaaggattgtccggag 224  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28841601 agaaggattgttcggag 28841617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 384 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 25249877 - 25249396
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  25249877 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagttggagttttaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctaattga 25249778  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25249777 ggtagagtacactctacttgaggtggagttgaacacaccggaaatcgtatgactatggaggaccttgggtgctatgatctagtggtgagcaagggatttc 25249678  T
Q  582 ttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    ||||||||                   |||| | ||||| || || | |||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25249677 ttcatgaagacagaaggcattctggaggttgaataatgtatagcatgacttgcgggattaccctaaaa-aaggccaagggtgattggatgcaagatgatc 25249579  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgag 762  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25249578 ttcaaagaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaacgaccttcgag 25249479  T
Q  763 aaagcg-aagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    || | | ||||||||||||||||||| ||||| |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  25249478 aaggtgaaagacattccgagggctgaagggtttaaggtgcgtacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggcacaa 25249396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 384 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 31424259 - 31423808
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31424259 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtagagtttcaaggttgaacacataatgggatgtacgcatttgctagttga 31424160  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |     | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31424159 gaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatagtacgactatgggggaccttgggtgctatgctcta-ggtgagcaagggatttct 31424061  T
Q  583 tcatgaag-------------------ttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    ||||||||                   ||| ||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31424060 tcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtattgcacggcttgcgggattaccctaaaa-aaggccaagggtgattggatgcaaggtgatct 31423962  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31423961 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagagattatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagtgtagttggactgtaaggaccttcgaga 31423862  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattac 814  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||||||||    
T  31423861 aggcggaagacattccgagggctgaaggggttatggtgtgtacttgtggattac 31423808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8348366 - 8348039
Alignment:
Q  13 aaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaag 109  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |  |||| || |||| |  |||||    
T  8348366 aaggcactattatcttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttaaccaagtccaagaacttgatagttggtgaaaacagtgaaggcctaag 8348267  T
Q  110 tgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaag 209  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||      
T  8348266 tgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccagagaaagagtggtaacaagtcaaagtttaaatgctttaattgtaacaagatggatcacttcatc 8348167  T
Q  210 aaggattgtccggagattaa-tggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||   ||||||||||||||||||    
T  8348166 aaggattgtccggagattaattggtaactccgcacaaattgtttctgagggttatgaggacgcgggtgcttttgtggtg---tgttgtttggaggatgaa 8348070  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatg 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8348069 gaaggtgatgtttctcaccttgggagtgatg 8348039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 385 - 764
Target Start/End: Original strand, 16430002 - 16430401
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16430002 tcagtctggagaggcggatgtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggtatgtacgctttt-ctagttgag 16430100  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttct 582  Q
         | | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16430101 aggatggaagctcagcttaaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctctagtggtgagcaagggatttct 16430200  T
Q  583 tcatgaag-------------------ttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    ||||||||                   ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16430201 tcatgaagacggaaggcattccgaaggttggagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagatct 16430300  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  16430301 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttagactgcaaggaccttcgaga 16430400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 384 - 590
Target Start/End: Original strand, 6996638 - 6996845
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| || ||||||||| || || | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6996638 atcagtctagagaggcggaggcaacagtactcatgatctacattttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 6996737  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996738 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 6996837  T
Q  583 tcatgaag 590  Q
    ||||||||    
T  6996838 tcatgaag 6996845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 266 - 421
Target Start/End: Original strand, 6996485 - 6996640
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  6996485 ggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacatttggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 6996584  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996585 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 6996640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31424415 - 31424257
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31424415 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtattgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcatcttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctg 31424316  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31424315 gagagacgttaaacacttaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 31424257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29003352 - 29003194
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  29003352 tgaggatgtgagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctg 29003253  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29003252 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatc 29003194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 267 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 50078171 - 50078017
Alignment:
Q  267 gatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaaga 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||| ||| |||| |||    
T  50078171 gatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctattggagtggttgtcttctggaga 50078072  T
Q  367 gacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078071 gacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 50078017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 50168603 - 50168193
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |  ||||| || |||| |  ||      
T  50168603 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaaacggctttgagaaccaaggagttgatcaagtccaatgacttgagagcaaatgaaaacagtgaaggccttt 50168504  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||  ||||| | | |||||||| ||||||||| | |||||    
T  50168503 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggaaaggtataagtgctttaagtgtcacaagtttggtca 50168404  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||||  || ||||| ||| || | || ||||  ||||| |||||||||||  || |||| || |||||   ||||    
T  50168403 cttcaagagggattgtccgaaggacaatgagaactccgcgcaagttgtgtccgaggagtatgaagatgcgggtgcattggtggtttgttgttg---ggag 50168307  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50168306 gataaagaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggt 50168207  T
Q  403 ggtaagaatactca 416  Q
     | |||||||||||    
T  50168206 aggaagaatactca 50168193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 255 - 404
Target Start/End: Original strand, 28841615 - 28841764
Alignment:
Q  255 gagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||    
T  28841615 gagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcgtagtggagcgatg 28841714  T
Q  355 gtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 404  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28841715 gtcgtctggcgagacgttaaacacccaacatcagcctggagaggcggtgg 28841764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 274 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28997625 - 28997478
Alignment:
Q  274 gtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgtta 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28997625 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgtta 28997526  T
Q  374 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28997525 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatc 28997478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 16429846 - 16430000
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  16429846 tgaggatgcgg-tgctctggtggtgtggtgttgtttggaggatgaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcttctg 16429944  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16429945 gagagaagttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatg 16430000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28222674 - 28222266
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  28222674 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaggcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 28222575  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |      ||||||  | ||||||   | || | | ||||| || ||||||||| | |||||    
T  28222574 gtgtttcaagaggaaatggtggacgtagagataaccgaggaagctcaaagagcagtaacaaggataagtataagtgcttcaaatgtcacaagtttggtca 28222475  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| | |||||||||||   ||||  || ||||| ||| || | || ||||  |||||||||| ||||||| || |||||   ||||||| ||||    
T  28222474 cttcaagaggtattgtccggaggacaatgagaactccgcgcaagttgtgtccgaggagtatgaggatgtgggtgctttggtggtg---tgttgttgggag 28222378  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    |||   |||||||| || ||||||||||| | ||||| || ||  || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28222377 gat---gaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagtggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcagt 28222281  T
Q  403 ggtaagaatactcat 417  Q
    |  ||||||||||||    
T  28222280 gtgaagaatactcat 28222266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3805427 - 3805202
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttg---actcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| ||||| | ||||| |   | |    
T  3805427 gaagacactgtcaccttagaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcctatgacttgagaactgatgaaaatggtgaaggcttga 3805328  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  3805327 gtgtttcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgggaaaatagtgataacaagttaaagtttaagtgctttaactgtcataagatagatcacttcaa 3805228  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggta 234  Q
     ||||||| |||||||| || |||||    
T  3805227 aaaggattatccggagaatagtggta 3805202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 394 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 13126616 - 13126421
Alignment:
Q  394 agaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtac 493  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |     
T  13126616 agaggcggaggtaagaatacttgtaatctacct-ttaaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaa 13126518  T
Q  494 gctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  13126517 gctcagctagaggtggagttgaacacactgaaaatggtacgactatagaggacctt--gtgttatgctctagttgtgagcaaggaaattcttcatgaag 13126421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 414
Target Start/End: Original strand, 776019 - 776396
Alignment:
Q  43 cggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagagggaatggtggaggtagagg 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  776019 cggctttgagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttgagagcgaatgaaaacagtgaaggcctttgtgtttcaagaggaaatggtggaggtagagg 776118  T
Q  140 taaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccggagattaatggt 233  Q
    ||||||| |||      |||| || ||||||  ||||| | | |||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| | |||||   ||||      
T  776119 taaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggaaaggtataagtgctttaagtgtcacaagtttggtcactttaagagggatttttcggaggacaatgag 776218  T
Q  234 aattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttggga 333  Q
    || | ||| ||| || | || ||||  |||||||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||||  |    
T  776219 aacttcgcgcaagttgtgtccgaggagtatgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgata 776315  T
Q  334 ttgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatact 414  Q
    |||||| || ||  || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  776316 ttgatgccttgtagagtggtgttcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggggaggcggtgggaagaatact 776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 787
Target Start/End: Original strand, 25127086 - 25127285
Alignment:
Q  590 gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgt 689  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| | |||||| |||||| || |||||| || |||||||| |||| || ||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  25127086 gttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaaggccaagggtaattggatggaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctttgt 25127185  T
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||| |||||| ||||||    
T  25127186 tgaagatgttatggtgaatgattgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcaagaaggcggaagacgttccgatggctga 25127285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 669 - 787
Target Start/End: Original strand, 6996886 - 6997005
Alignment:
Q  669 gaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc- 767  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  6996886 gaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtaaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcg 6996985  T
Q  768 gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6996986 gaagacattccgagggctga 6997005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25250662 - 25250568
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  25250662 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagggtgaagaatgtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtc 25250568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 31658119 - 31658256
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  31658119 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggaattgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 31658218  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccga 146  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31658219 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaaccga 31658256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 417
Target Start/End: Original strand, 31658305 - 31658467
Alignment:
Q  252 tctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcg 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || | |||    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||  || |    
T  31658305 tctgaggagtatgaggatgcgggtgctttggttgtg---agttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtg 31658401  T
Q  352 gtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 417  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  31658402 gtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcattctggagatgcagtggaaagaatactcat 31658467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 50168187 - 50167987
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||   |||||||||    
T  50168187 agcctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtacacatttggaagttgaggt 50168091  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 584  Q
    |||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  50168090 agagaaaactcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 50167991  T
Q  585 atga 588  Q
    ||||    
T  50167990 atga 50167987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 31736332 - 31736234
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31736332 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctaacgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 31736234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 690 - 778
Target Start/End: Original strand, 25127283 - 25127372
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattcc 778  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25127283 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaggcggaagacattcc 25127372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 588
Target Start/End: Original strand, 776404 - 776604
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||||||   |||||||||    
T  776404 agcctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tatacgcatttggaagttgaggt 776500  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 584  Q
    |||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  776501 agataaagctcaacttgaggtggagttgataacaccggaaatggtaccactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 776600  T
Q  585 atga 588  Q
    ||||    
T  776601 atga 776604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 389 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13548517 - 13548320
Alignment:
Q  389 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtag 488  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||   |||| ||||||    
T  13548517 cctggagagacggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtacgcatttggaagttaaggtag 13548421  T
Q  489 agtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 587  Q
    || | ||||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||| | ||||||| | || |||||||||    
T  13548420 agaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgagtgctatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 13548321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 28222260 - 28222060
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||   |||||||||    
T  28222260 agcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtacgcatttggaagttgaggt 28222164  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 584  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||| || |||| ||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  28222163 agagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtataactatggaggccttaggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 28222064  T
Q  585 atga 588  Q
    ||||    
T  28222063 atga 28222060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 718 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 14098699 - 14098629
Alignment:
Q  718 actacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  14098699 actacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 14098629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31929104 - 31928915
Alignment:
Q  393 gagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagta 492  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | |||||| ||||   ||||||||||||| |    
T  31929104 gagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaatgcatagtgtg-tgtacg-atttggaagttgaggtagagaa 31929009  T
Q  493 cgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca 585  Q
     | ||  | |||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  31929008 agttcgacttgaggtggagttggtgacaccaggaatggtacgactatggagaccttgggtgatatgctctagttgtgagcaagagaattcttca 31928915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28997480 - 28997416
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtt 448  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28997480 atcagtctggagaggcggaggcaacaatacgcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtt 28997416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29003196 - 29003132
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtt 448  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003196 atcagtctggagaggcggaggcaacaatacgcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtt 29003132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 28221889 - 28221689
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||| ||||||   |||||||||    
T  28221889 agcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtatgcatttggaagttgaggt 28221793  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 584  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||| || |||| ||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  28221792 agagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtataactatggaggcctttggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 28221693  T
Q  585 atga 588  Q
    ||||    
T  28221692 atga 28221689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 391 - 553
Target Start/End: Original strand, 31658477 - 31658635
Alignment:
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagag 490  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | |||| ||||||    ||||||||||||    
T  31658477 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatc-acct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatggtgtg-tgtaagcatttggacgttgaggtagag 31658572  T
Q  491 tacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
     | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  31658573 aaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtg 31658635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14099189 - 14099148
Alignment:
Q  380 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14099189 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 14099148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 13548257 - 13548147
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatg-ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactccta 734  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| | || | ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  13548257 ccaagggtgatcggatgcaagatgatcttcaaggaagcgggagacgttccatggttgaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatccta 13548158  T
Q  735 gtgtagttgga 745  Q
    || ||||||||    
T  13548157 gtttagttgga 13548147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 19359703 - 19359748
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19359703 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 19359748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 659 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 31423776 - 31423648
Alignment:
Q  659 gatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagacctt 758  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||  | |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||    
T  31423776 gatcttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaaggatctt 31423678  T
Q  759 cgagaaag-cgaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  31423677 cgagaatgtggaagacattccgatggctga 31423648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 659 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 50077534 - 50077429
Alignment:
Q  659 gatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagacctt 758  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||  | |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||    
T  50077534 gatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtatttaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaaggatctt 50077435  T
Q  759 cgagaa 764  Q
    ||||||    
T  50077434 cgagaa 50077429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 20301983 - 20302082
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  20301983 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 20302082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 51751889 - 51751988
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  51751889 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaatttctagcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctga 51751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25249941 - 25249875
Alignment:
Q  355 gtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25249941 gtcgtttggagagacgttaaatactaaacatcattctggagaggtggtggtaagaatactaatgatc 25249875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 13126359 - 13126208
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatg-ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactccta 734  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||| |||| |||| |  || ||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||    
T  13126359 ccaagggtgattagatgcaaggagatcttcaaggaag-gggagatgttccgtggttgaagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattctta 13126261  T
Q  735 gtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||||| || ||||||    
T  13126260 gtgtagttgga-tgcaaggatcttcgacaaggcggaagacattctgatggctga 13126208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 564
Target Start/End: Original strand, 28242914 - 28243090
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||||| | ||||| |||||   |||||||    
T  28242914 tcagcttgaagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggtgaaag-catagtgtg-tgtacacatttggaagttgag 28243010  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctat 564  Q
    |||||| | ||||| |  |||||||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||    
T  28243011 gtagagaaagctcaactagaggtggagttagtgacaccgggaatggtacgactatggaggtattgggtgttatgctctat 28243090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41397491 - 41397420
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  41397491 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 41397420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 31928788 - 31928734
Alignment:
Q  691 gaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31928788 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagttgga 31928734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 45654945 - 45654899
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtc 73  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45654945 ttggaagaagttcaaaaggctttgagaaccaaggagttaatcaagtc 45654899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Original strand, 776667 - 776708
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  776667 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggga 776708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13548556 - 13548523
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13548556 tcagcctggagaggcggtgggaagaatactcatg 13548523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 28221626 - 28221585
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28221626 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggga 28221585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 47099683 - 47099728
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  47099683 caagcgactttgagaaccaaggaattaaccaagttcaaggacttga 47099728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 663; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 26067695 - 26066824
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  26067695 caaggaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgatggccta 26067596  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26067595 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgcttcaactgtcacaagatgggtcacttca 26067496  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26067495 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 26067396  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26067395 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctactggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 26067296  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26067295 gaatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagac--agtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 26067198  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26067197 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 26067098  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  26067097 cagcttgcgggattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaa 26066998  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaa-agcgaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatact 804  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  26066997 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaagacggaagacattccgatggctgaaggggttgaggtgtatact 26066898  T
Q  805 tgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  26066897 tgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 26066824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Original strand, 33309868 - 33310726
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  33309868 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcgtgaatacggtgagggccta 33309967  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309968 agtgttacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaatgtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 33310067  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33310068 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatacgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 33310167  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310168 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 33310267  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310268 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 33310367  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33310368 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctaggctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 33310467  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| | |||||||||    
T  33310468 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatggtatggtgaa 33310567  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatact 804  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  33310568 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatact 33310667  T
Q  805 tgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  33310668 tgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 33310726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 263 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 15533983 - 15533435
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15533983 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccatgagagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 15533884  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 462  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15533883 gagagacgttatacactcaacatcagcctagagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttaaggtagagtttcaaggttgaagacatagtggg 15533784  T
Q  463 atgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctc 561  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  15533783 atgtacacattttctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgttatgctc 15533684  T
Q  562 ta-tggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaaga 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||                   |||| ||||||| || |||  |||||| |||||| |||||| || ||||||     
T  15533683 tagtggtgagcacgggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaaggttgaagaatgtatagcacaacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagg 15533584  T
Q  642 gtga-ttggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtag 740  Q
    |||| |||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15533583 gtgatttggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgtcatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtag 15533484  T
Q  741 ttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15533483 ttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacgttccgagggctga 15533435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 384 - 838
Target Start/End: Original strand, 3395366 - 3395844
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3395366 atcagtctggagaggcggagacaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgtagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 3395465  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3395466 gctagagtaccctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggttagcaagggatttct 3395565  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||| | || |||| ||| |  |||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||  || ||    
T  3395566 tcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatttatatcacgtctttctggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaagaagacct 3395665  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3395666 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgtttgtggaactacctaaaattcctattgtagttggactgcaaggaccttcgaga 3395765  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggta 838  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  3395766 aggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggta 3395844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 409 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 3631143 - 3630961
Alignment:
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3631143 aatactcatgatctacctgttgaggtggactttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacttgaggtg 3631044  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631043 gagttgaacacaccggtaatggtatgactttggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaag 3630961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 30444276 - 30444677
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||| ||||||| |  ||||    
T  30444276 gaaggcactgtcacctaggaagaagttcaagtggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaagggcttgagagccgatgaaaacggtgaaggcctaa 30444375  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||   | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||      |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30444376 gtgttttatgagggaatggtagaggtagaggtaactgaggaaagagcggtaacaa------gtttaagtgctttaactgtcacaagataggtcgcttcaa 30444469  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctga-gggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |  |||||   | | ||| ||  |||||    
T  30444470 gaaggattgcctggagaacaatggtaactccgtgcaaattgtctctgaggggttatgaggatgcgagtgttttagtggtg---tctcgttggggagatga 30444566  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||  |||  |||||||| |||||  | ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30444567 agaaggtgatgattcttgccttgggagtgatgctttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcatggagaggcggtgggaa 30444666  T
Q  408 gaatactcatg 418  Q
    ||||| |||||    
T  30444667 gaatattcatg 30444677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3631324 - 3631166
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  3631324 tgaggatgtggatgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggggtgatgcctagtggagcggtggttgtctg 3631225  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3631224 gagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggcggtggtaagaatagtcatgatc 3631166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Original strand, 3395245 - 3395368
Alignment:
Q  298 tggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagag 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395245 tggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagag 3395344  T
Q  398 gcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3395345 gcggtggtaagaatactcatgatc 3395368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 12158234 - 12158450
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||||| |  ||||    
T  12158234 gaaggcactgtcaccttagaagatgttcaaacggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggatttgatagctgatgaaaacggtgaaggtctaa 12158333  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| | || || |||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12158334 gtgtttcaagagggcatggtggaggtagaggtaatcagagaaagggcggtaaaaagtcaaaatttaagtgctttaactgtcacatgatgggtcacttcaa 12158433  T
Q  209 gaaggattgtccggaga 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  12158434 gaaggattgtccggaga 12158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 618 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 3630894 - 3630668
Alignment:
Q  618 gattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtggg 717  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||     
T  3630894 gattaccctaaaa-aaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggatatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgga 3630796  T
Q  718 actacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattac 814  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||    
T  3630795 actacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacatttcgagggctgaaggggttaaggtgtatagttgtggattac 3630696  T
Q  815 tct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    |||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  3630695 tctaaaagccaagggtgattgggcacaa 3630668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5408322 - 5407917
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| | |        || |    
T  5408322 gaaggcactatcaccttggaagaagttcaagcggatttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaaggc-------ctta 5408230  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5408229 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggacaagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 5408130  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    | |||||| |||||||||||||   || |  |  ||||| ||| || | || ||||  |||| |||||| |||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  5408129 cctcaagagggattgtccggaggacaacgagagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggggatgcaggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 5408033  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || || |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5408032 gaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 5407933  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||||||    
T  5407932 ggtaagaatactcatg 5407917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5412647 - 5412242
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| | |        || |    
T  5412647 gaaggcactatcaccttggaagaagttcaagcggatttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaaggc-------ctta 5412555  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5412554 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggacaagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 5412455  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    | |||||| |||||||||||||   || |  |  ||||| ||| || | || ||||  |||| |||||| |||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  5412454 cctcaagagggattgtccggaggacaacgagagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggggatgcaggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 5412358  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || || |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5412357 gaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 5412258  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||||||    
T  5412257 ggtaagaatactcatg 5412242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 16553591 - 16554005
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  16553591 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccagggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 16553690  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  16553691 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccgaggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 16553790  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| |||||||| | | |||   ||||    
T  16553791 cttcaagaaggattgtctggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtgaggttttg---ggag 16553887  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16553888 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagacggagtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 16553987  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  16553988 gtggtgagaatactcatg 16554005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 16630147 - 16630561
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  16630147 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccagggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 16630246  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  16630247 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccgaggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 16630346  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| |||||||| | | |||   ||||    
T  16630347 cttcaagaaggattgtctggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtgaggttttg---ggag 16630443  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16630444 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagacggagtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 16630543  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  16630544 gtggtgagaatactcatg 16630561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 16651852 - 16652267
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  16651852 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagtggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 16651951  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgc-tttaactgtcacaagatgggtc 201  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | ||| ||||| ||| ||||| |||| |    
T  16651952 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccgaggaaggtcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgcttttaagtgttacaagttgggac 16652051  T
Q  202 acttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttgga 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| |||    
T  16652052 acttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttggga 16652148  T
Q  302 ggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggc 399  Q
    ||| |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16652149 ggaaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagacggagtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggc 16652248  T
Q  400 ggtggtaagaatactcatg 418  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16652249 ggtggtgagaatactcatg 16652267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 34165799 - 34166210
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  34165799 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 34165898  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  34165899 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttggggca 34165998  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  34165999 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 34166095  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34166096 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagatggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 34166195  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  34166196 gtggtgagaatactc 34166210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 637 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 30729616 - 30729465
Alignment:
Q  637 caagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagt 736  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  30729616 caagggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagacgtcctgtgttaaagatgttatggtgaatgcttgtgtaactacctaaaattcctagt 30729517  T
Q  737 gtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  30729516 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 30729465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25462762 - 25462608
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttg---actcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | | ||||| || |||| |  ||||    
T  25462762 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcgactttgagaaccaaggagttgaccgagttcaaggacttgagaattgatgaaaacagtgaaggcctaa 25462663  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaa 163  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  25462662 gtgtttcaagagggaatggtgaaggtagaggtaatcggggaaagagtggtaacaa 25462608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 394 - 590
Target Start/End: Original strand, 11137472 - 11137667
Alignment:
Q  394 agaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtac 493  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |     
T  11137472 agaggcggatgtaagaatactcatgttcaacct-ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagtgg-atgtacgcgtttgctagttcaggtagagaaa 11137569  T
Q  494 gctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
     |||||| || |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||| ||||    
T  11137570 actcagcttgtggtggagttgatgacatcgggaatggtacgacgatggagaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaagagaattcttcaagaag 11137667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 403
Target Start/End: Original strand, 26944450 - 26944562
Alignment:
Q  291 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcc 390  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26944450 tgttgtttaaaggatgaagaaggtgatgtttttcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 26944549  T
Q  391 tggagaggcggtg 403  Q
    | |||||||||||    
T  26944550 tagagaggcggtg 26944562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 418
Target Start/End: Original strand, 16568055 - 16568293
Alignment:
Q  177 tgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtg 276  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||   ||||  |  ||||| ||| ||   || ||||  |||| |||||||||||    
T  16568055 tgctttaagtgtcacaagttgggtcacttcaagagagattgtccagaggacaatgagagctccgcgcaagttgcgtccgaggagtatggggatgcgggtg 16568154  T
Q  277 ctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaac 376  Q
    || || | ||| | |||||   |||||| || |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||  ||||||| || |||| | |||||||||||    
T  16568155 ctttggttgtgagttgttg---ggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgttcatctggaaagacgttaaac 16568251  T
Q  377 actcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16568252 actcaacatcagcctggagaggcggtggtaacaatactcatg 16568293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 418
Target Start/End: Original strand, 11137346 - 11137461
Alignment:
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  11137346 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgccttatagagcggtgatcgtctatagagacgttaaacactcaacatcattctggaaaggcggt 11137445  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    || |||||||||||||    
T  11137446 gggaagaatactcatg 11137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Original strand, 16567901 - 16567973
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16567901 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttga 16567973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 30444679 - 30444878
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||  ||||   | |||||    
T  30444679 tcagtctgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaatct-ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagt-ggatatacatatttggaacttgag 30444776  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttctt 583  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||||||||  || | | || ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||| || |||||    
T  30444777 gtagagaaaggtcagcttgaggtggagttgatgacgctgatagtggtacgactatggagacattgggtgctagtctctagttgtgagcaagagaattctt 30444876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 16652274 - 16652421
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  16652274 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtaga 16652370  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16652371 gaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatg 16652421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 563
Target Start/End: Original strand, 16568300 - 16568470
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||  ||||   ||||||||||||    
T  16568300 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttacaaggtggaag-catagtgtg-tgtactaatttggaagttgaggtaga 16568396  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
    | |  |||| | |||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  16568397 gaaatctcaacttgaggtggagttggtgacaccgggaatggtacaactatggagaccttgggagttatgctcta 16568470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 16554012 - 16554159
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  16554012 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtaga 16554108  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  16554109 gaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatg 16554159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 16630568 - 16630715
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  16630568 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtaga 16630664  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  16630665 gaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatg 16630715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 712 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 15533415 - 15533339
Alignment:
Q  712 tgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  15533415 tgtggaactacctaaaattccaagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctga 15533339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 14738407 - 14738478
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14738407 aaggagggcactgctactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggac 14738478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 590
Target Start/End: Original strand, 26944599 - 26944665
Alignment:
Q  526 aatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26944599 aatggtacgactgtggaggaccttgggggctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 26944665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 761
Target Start/End: Original strand, 26944709 - 26944783
Alignment:
Q  687 tgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcga 761  Q
    ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  26944709 tgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacctaaaattcctagcatagttggactgcaaggaccttcga 26944783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 34166220 - 34166367
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  34166220 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 34166316  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  34166317 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatg 34166367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Original strand, 17012956 - 17013004
Alignment:
Q  436 gagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17012956 gagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgag 17013004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17694141 - 17694096
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17694141 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 17694096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22350261 - 22350216
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22350261 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 22350216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 3395882 - 3395981
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  3395882 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctga 3395981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24543587 - 24543505
Alignment:
Q  502 tgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttca 585  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||| |||||||    
T  24543587 tgaggtggagttgatgacactggaaatggtacaactatggagaccttgggttctaggctc-gttgtgagcaagggagttcttca 24543505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Original strand, 33310740 - 33310839
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  33310740 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 33310839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 33331281 - 33331352
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  33331281 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 33331352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10456559 - 10456494
Alignment:
Q  351 ggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 416  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||  |||||||||||    
T  10456559 ggtgttcgtctggagagacattaaacactcaacatcatcctagagaagtggtgcgaagaatactca 10456494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 745
Target Start/End: Original strand, 11137783 - 11137840
Alignment:
Q  688 gttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    |||||||  ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11137783 gttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 11137840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 13879630 - 13879675
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13879630 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 13879675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 84
Target Start/End: Original strand, 24432196 - 24432237
Alignment:
Q  43 cggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  24432196 cggctttgagaaccaaggaatcgaccaagttcaaggacttga 24432237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 25942560 - 25942605
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25942560 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 25942605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 658; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 658; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 15356149 - 15355279
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  15356149 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaatacggtgatggccta 15356050  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15356049 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgggtcacttca 15355950  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15355949 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 15355850  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355849 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 15355750  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355749 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 15355650  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaa-gggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15355649 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaaggggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagc 15355550  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||| || ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  15355549 acggcttgtgaaattactctaaaa----gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtga 15355454  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15355453 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 15355354  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  15355353 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 15355279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 658; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Original strand, 23666025 - 23666895
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  23666025 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaatacggtgatggccta 23666124  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23666125 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgggtcacttca 23666224  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23666225 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 23666324  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggt-ggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666325 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 23666424  T
Q  407 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666425 agaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 23666524  T
Q  507 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23666525 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagc 23666624  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||| || ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  23666625 acggcttgtgaaattactctaaaa----gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtga 23666720  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23666721 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 23666820  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  23666821 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 23666895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 648; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Original strand, 31543712 - 31544571
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  31543712 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacagtgagggccta 31543811  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31543812 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcgcaagatgggtcacttca 31543911  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31543912 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctcagagggttgtgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 31544011  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544012 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctatagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 31544111  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544112 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 31544211  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31544212 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagc 31544311  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31544312 acgtcttgcgagattactctaaaagaagaccaatggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtga 31544411  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgtatac 803  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  31544412 aagcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgtatac 31544511  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  31544512 ttgtagattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 31544571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 648; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 34478719 - 34477860
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34478719 caaggaaggcattgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 34478620  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478619 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 34478520  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34478519 agaaggattgtccggagattaatggtaactccacacaaattgtctctaagggttatgaggatgctggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 34478420  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478419 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 34478320  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478319 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 34478220  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34478219 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 34478120  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||  |  |||||||| |||||||||||    
T  34478119 cgacttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttatgcgttgaagatgttatggtgaa 34478020  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgtatac 803  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| ||  ||||| | |||||| ||||||||    
T  34478019 agcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatagctgaagtggttgaggtgtatac 34477920  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  34477919 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 34477860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 764
Target Start/End: Original strand, 6746051 - 6746808
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || |||||||| ||| |  ||||    
T  6746051 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaatgacttgagagttcgtgaacacgatgaaggcctaa 6746150  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746151 gtgtctcaagaggaaatggtggaggtagaggtaatcggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 6746250  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6746251 gaaggattgtccggagattgatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 6746350  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6746351 gaaggtgatgtgtctcaccttaggattgatgcctagtggagcggtgttcgtcttgagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaag 6746450  T
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6746451 aatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcaccgtgaggtg 6746550  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||    
T  6746551 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcaggaggttgaagaatgtatagca 6746650  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  6746651 cggcttgcgggattaccctaaaagaagaccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaagaagcaggagatgtcctgcgttgaagatgttgtggtgaa 6746750  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6746751 tgcttgtgggactacctaaaaatcctagcgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 6746808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 408
Target Start/End: Original strand, 10750677 - 10751077
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  10750677 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaatacggtgatggccta 10750776  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750777 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 10750876  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10750877 agaaggattgtccggaggttaatggtaactcagcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 10750976  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750977 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 10751076  T
Q  408 g 408  Q
    |    
T  10751077 g 10751077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 404 - 861
Target Start/End: Original strand, 10756269 - 10756731
Alignment:
Q  404 gtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10756269 gtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcagcgtg 10756368  T
Q  504 aggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgt 603  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756369 aggtggagttgaactcaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgt 10756468  T
Q  604 accacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatgg 703  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||  |  |||||||||| |||||    
T  10756469 agcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttatgcgttgaagacggtatgg 10756568  T
Q  704 tgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgta 800  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  10756569 tgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgta 10756668  T
Q  801 tacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  10756669 tacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 10756731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 18467667 - 18468079
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  18467667 gaagggactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaatcaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaa 18467766  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467767 gtgtttcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagcctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 18467866  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18467867 gaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggacacaggtgctatgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 18467966  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467967 gaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaaactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 18468066  T
Q  409 aatactcatgatc 421  Q
    ||||| |||||||    
T  18468067 aatacccatgatc 18468079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20505502 - 20505090
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |   |||    
T  20505502 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaactaaggagttgaccaagtccaaggacttgagaattcatgaacacggtgaagtcttaa 20505403  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20505402 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaaatctgaatgttttaactgtcacaagatgggtcacttcat 20505303  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20505302 gaaggattgtccggagattaatggtaactctgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 20505203  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20505202 gaaggtgatgtgtctcaccttgaggttgatgcctagtggagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaag 20505103  T
Q  409 aatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||    
T  20505102 aatactcatgatc 20505090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 384 - 841
Target Start/End: Original strand, 27911486 - 27911967
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| || ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27911486 atcagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaa 27911585  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911586 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 27911685  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  27911686 tcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagacct 27911785  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || |||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27911786 tcaaggaactgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttagactgcaaggaccttcgaga 27911885  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  27911886 aggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggcacaa 27911967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Original strand, 18468077 - 18468459
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18468077 atcagtctggagaggcggaggcaacaacaatcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagctga 18468176  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18468177 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggcacggctatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaatggatttct 18468276  T
Q  583 tcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgt 682  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||    
T  18468277 tcatgaggttgaagaatgtatagcacggcttgcaggattaccctaaaagaaggccaagggtgattagatgcaaggtgatcttcaaggaagcgagagatgt 18468376  T
Q  683 cctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
      |   ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18468377 tttgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 18468459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 374 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 18510649 - 18510166
Alignment:
Q  374 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatt 473  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510649 aacactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcataatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatt 18510550  T
Q  474 tactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagca 572  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510549 tgctagttgaggtagagtactctcagtgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagca 18510450  T
Q  573 agggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgc 653  Q
    |||||||||||||||||                   |||  ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  18510449 agggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttaaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggaggc 18510350  T
Q  654 aaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaag 753  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |    
T  18510349 aaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactgcaagg 18510250  T
Q  754 accttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgat 832  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18510249 accttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggtttaaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgat 18510166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Original strand, 659072 - 659474
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  659072 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagatggagtttcaagattgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttta 659171  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  659172 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctttgctctatgatgagcaagggatttct 659271  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactct-aaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||| || |    
T  659272 tcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagacc 659371  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcga 761  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  659372 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgtttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggactcttcga 659471  T
Q  762 gaa 764  Q
    |||    
T  659472 gaa 659474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 20505092 - 20504691
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20505092 atcagtctcgagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 20504993  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20504992 gttagagtacactcagcgtgaggtggagtggaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctctatggtgagcaagggatttgt 20504893  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactc-taaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  20504892 tcatgaagacggaaggcattacggaggttgaagaatgtatagcacggcttacgggattacccttaaaaaaatgccaagggggattggatgcaaggagacc 20504793  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgag 762  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20504792 tttaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgag 20504693  T
Q  763 aa 764  Q
    ||    
T  20504692 aa 20504691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 588
Target Start/End: Original strand, 16408250 - 16408831
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| ||  ||| |  || |    
T  16408250 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaagacaatgaaggcctta 16408349  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16408350 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 16408449  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||  |  ||||||||| || | || ||||  || |  |||||||||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  16408450 cttcaagagggattgtccggaggacaatgagagctccgcacaagttgtgtccgaggagtacggagatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 16408546  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || || |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || ||  || |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408547 gaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 16408646  T
Q  403 ggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgt 502  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||| | ||||| | |    
T  16408647 ggtgagaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaactt 16408743  T
Q  503 gaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
     ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  16408744 aaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagactttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 16408831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 27911330 - 27911488
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27911330 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgacgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 27911429  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911430 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 27911488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 384 - 776
Target Start/End: Original strand, 20044026 - 20044439
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  20044026 atcagtctggagaggcgaagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagcgggatgtacacatttgctagttga 20044125  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    |     | | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20044126 gaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaagac--cagtaatgttgcgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagagatttc 20044223  T
Q  582 ttcatgaag-------------------ttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    |||||||||                   ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || | |||| ||||||||||||||||  | |    
T  20044224 ttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggaaacc 20044323  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcga 761  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20044324 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaacttctagtgtagttggactgcaaggactcttcga 20044423  T
Q  762 gaaagc-gaagacatt 776  Q
    ||| || |||||||||    
T  20044424 gaaggcggaagacatt 20044439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 263 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31467274 - 31467117
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  31467274 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtttg 31467175  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 420  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31467174 gagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 31467117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 285 - 421
Target Start/End: Original strand, 25806350 - 25806486
Alignment:
Q  285 gtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25806350 gtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaaca 25806449  T
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806450 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 25806486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 266 - 421
Target Start/End: Original strand, 658919 - 659074
Alignment:
Q  266 ggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  658919 ggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 659018  T
Q  366 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  659019 agacgttaaacactcaccatcagcctagagaggcggtcgtaagaataatcatgatc 659074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18510795 - 18510637
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  18510795 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggacgatgaataagatgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 18510696  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18510695 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaacactcatgatc 18510637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 20043870 - 20044028
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20043870 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctg 20043969  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20043970 gagagacgttaaacactcaacatcatcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 20044028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 606 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 41586990 - 41586752
Alignment:
Q  606 cacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtg 705  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41586990 cacggcttgtgggattactctaaaaagaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 41586891  T
Q  706 aaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtata 802  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |  |||| ||    
T  41586890 aatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtgta 41586791  T
Q  803 cttgtggattactctcaagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  41586790 cttgtggattactctaaagacaagggtgattgggcacaa 41586752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 29721290 - 29721700
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |  ||||| || |||| |  || |    
T  29721290 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttaagagcagatgaaaacagtgaaggcctta 29721389  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |      |||||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  29721390 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 29721489  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||  |  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| || |||||    |||||| ||||    
T  29721490 cttcaagagggattgtccggaggacgatgagagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttggtggtg---agttgttgggag 29721586  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || ||  || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29721587 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtggt--tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 29721684  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29721685 ggtgagaatactcatg 29721700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 418
Target Start/End: Original strand, 26173701 - 26174107
Alignment:
Q  18 actgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |||||      
T  26173701 actgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgttt 26173800  T
Q  115 caagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |      |||||| || ||||||   | || | | || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26173801 caaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgttttaagtgtcacaagttgggtcacttcaa 26173900  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    || ||||| |||||||   ||||  |  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| || |||||    |||||| | |||| ||     
T  26173901 gagggattttccggaggacaatgagagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttggtggtg---agttgttggaaggaagat 26173997  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    || ||||| |  ||||||||||| ||||||  || ||  || |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26173998 gagggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggtgag 26174097  T
Q  409 aatactcatg 418  Q
    ||||||||||    
T  26174098 aatactcatg 26174107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 40381031 - 40381445
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  40381031 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 40381130  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |      |||||| |||||||||   | || | | || ||||| ||||||||| |||| ||    
T  40381131 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccgaggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgttttaagtgtcacaagttgggaca 40381230  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  40381231 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 40381327  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40381328 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagacggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 40381427  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  40381428 gtggtgagaatactcatg 40381445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 16545355 - 16545769
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  16545355 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 16545454  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  16545455 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 16545554  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||||    |||||| ||||    
T  16545555 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgtgggtgctttgacggtg---agttgttgggag 16545651  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-ga-agcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || || || |  | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16545652 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagacagtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 16545751  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  16545752 gtggtgagaatactcatg 16545769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42427683 - 42427276
Alignment:
Q  13 aaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaag 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |  ||||| || |||| |  || ||    
T  42427683 aaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcgactttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttcagagcggatgaaaacagtgaaggccttag 42427584  T
Q  110 tgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcac 203  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| |      |||||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| | | ||||    
T  42427583 tgtttcaagaagaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagtttgatcac 42427484  T
Q  204 ttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggagg 303  Q
    ||||||| ||||| |||||||   ||||  ||  |||| ||| || | || || |  |||||||||||| ||||| || | |||    |||||| |||||    
T  42427483 ttcaagagggattttccggaggacaatgagaaccccgcgcaagttgtgtccgaagagtatgaggatgcgagtgctttggttgtg---agttgttgggagg 42427387  T
Q  304 atgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtg 403  Q
    ||   |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42427386 at---gaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcgatg 42427290  T
Q  404 gtaagaatactcat 417  Q
    | ||||||| ||||    
T  42427289 ggaagaatattcat 42427276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 488 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 31467031 - 31466735
Alignment:
Q  488 gagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcat 586  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31467031 gagtacgcttagcttgaggtggagttaaacacaccgataatggtacgactatggaggaccttggttgctatgctctatggtgagcaagagatttcttcat 31466932  T
Q  587 gaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaa 667  Q
    |||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||| ||    
T  31466931 gaagacggaagacatttcagaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaa-aaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaa 31466833  T
Q  668 cgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
      ||| |||| ||||||| |||||||||  | ||||||||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  31466832 gaaagtgggagatgtcctgtgttgaagatttcatggtgaatgcttgtggaactacataattctcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaa 31466735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 384 - 487
Target Start/End: Original strand, 25806484 - 25806587
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25806484 atcagtctagagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggaagtacgcatttgctagttga 25806583  T
Q  484 ggta 487  Q
    ||||    
T  25806584 ggta 25806587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 13486940 - 13487352
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |   |  ||||| ||  ||| |   | |    
T  13486940 gaaggcactgtcaccttggaatatgttcaagcggctttaaaaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttaagagcggatgaaaacaatgaaggcatta 13487039  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |      |||||| || ||||||   | || | | | |||||| ||||| ||| | |||||    
T  13487040 gtgtttcaagagggaatggtgaaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtcctttaagtgtcaaaagtttggtca 13487139  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||  || ||||| ||| || | || ||||  ||||||||||||||| || ||||||||    |||||| ||||    
T  13487140 cttcaagagggattgtccggaggacaatgagaactccgcgcaagttgtgtccgaggagtatgaggatgcgggtactttgatggtg---agttgttgggag 13487236  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||   |||||| || ||  || |||| |||| |  |||||||||||||||| || |||||| || ||| |||||    
T  13487237 gatgatgaaggtgaggtttctcaccttgcttttgatgccttgtagagtggtgttcgtatagagagacgttaaacacttaatatcagcttgcagaagcggt 13487336  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    || |||||||||||||    
T  13487337 gggaagaatactcatg 13487352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 418
Target Start/End: Original strand, 534672 - 535062
Alignment:
Q  31 aagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagagggaatgg 127  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || ||||    || |||||  ||||| | |||||    
T  534672 aagaagttcaagcggatttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaatgccttagtgtttcaagaagaaatgg 534771  T
Q  128 tggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccg 221  Q
    ||||||||||||||||||| |      |||||| |  ||||||   | || | | || ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  534772 tggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcgataacaaggataagtataagtgttttaagtgtcacaagtttggtcacttcaagagggattgtccg 534871  T
Q  222 gagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgt 321  Q
     ||   ||||  || ||||  ||| || | || |||   |||||||||||||||||| || |||||    |||||| |||||||   |||||||| || |    
T  534872 aaggacaatgagaactccgtgcaagttctgtccgagaagtatgaggatgcgggtgctttggtggtg---agttgttgggaggat---gaaggtgaggttt 534965  T
Q  322 ctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    || ||||||| | ||||| || ||  || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  534966 cttaccttggtaatgatgccttgtagagtggtgatcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctcgagaggcgctgggaataatactcatg 535062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9788470 - 9788337
Alignment:
Q  16 gcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgt 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |||||    
T  9788470 gcactgtcaccttgaaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgacggccttagtgt 9788371  T
Q  113 cacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccga 146  Q
      ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9788370 ttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccga 9788337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 404 - 577
Target Start/End: Original strand, 13294988 - 13295160
Alignment:
Q  404 gtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtg 503  Q
    |||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||| | ||||||| ||    
T  13294988 gtaagaatactcgtgatcagcct-tagaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttg 13295085  T
Q  504 aggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggga 577  Q
    |||||||| |||  |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13295086 aggtggagatgatgacaccaaaaatggtacgactatggagaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaaggga 13295160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 780
Target Start/End: Original strand, 659496 - 659587
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccga 780  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  659496 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccga 659587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 710 - 787
Target Start/End: Original strand, 18468501 - 18468579
Alignment:
Q  710 cttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18468501 cttgtgggactacctaaaactcctagtgttgttggactacaaggacctttgagaaggcggaagacattccgagggctga 18468579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 692 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 31466711 - 31466615
Alignment:
Q  692 aagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  31466711 aagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctattgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctga 31466615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 588
Target Start/End: Original strand, 13487359 - 13487555
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||    
T  13487359 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 13487455  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  13487456 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 13487555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 710 - 787
Target Start/End: Original strand, 6746850 - 6746928
Alignment:
Q  710 cttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  6746850 cttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactgtaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctga 6746928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 16545776 - 16545923
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | |||| |||||   |||||||||||     
T  16545776 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtagc 16545872  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  16545873 gaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacggctatg 16545923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 710 - 787
Target Start/End: Original strand, 20044468 - 20044546
Alignment:
Q  710 cttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  20044468 cttgtggaactacctaaaattcctggtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagtcattccgatggctga 20044546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 31467112 - 31467036
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttg----aggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 462  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31467112 ctggacaggcggaggcaacaatactcataatctacctgttgcatgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 31467036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 29721707 - 29721855
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||| || |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  29721707 ctggagaggcggtgataacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaagtggaag-catagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtaga 29721803  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccgg-taatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||    
T  29721804 gaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaaatggtatgactatg 29721855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 34477846 - 34477747
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  34477846 ttgaagaggttatggtatagtcttgtaggactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 34477747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 43596373 - 43596302
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43596373 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggac 43596302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 43629167 - 43629096
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43629167 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggac 43629096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 535066 - 535229
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||  | |||||||||||   |||||||||    
T  535066 agcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggaggtgcaaggt-gaaggcatagtatg-tgtacgcatttggaagttgaggt 535162  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
    |||| | ||||| | | ||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  535163 agagaaagctcaacttaaggtggagttgaggatatcgggaatggtacaactatggaggccttgggtg 535229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27449044 - 27449003
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27449044 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggac 27449003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 28788613 - 28788658
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28788613 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 28788658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 32584767 - 32584843
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  32584767 caaggaaggaactatcacctttgaggaagtccaagcggaattgagaaccaaagagttaaccaagtccatggacttga 32584843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 659 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 41586748 - 41586661
Alignment:
Q  659 gatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggact 747  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  41586748 gatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaag-tatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggact 41586661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 31397827 - 31397898
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31397827 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 31397898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 33790567 - 33790496
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  33790567 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 33790496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 37557459 - 37557530
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  37557459 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 37557530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 514
Target Start/End: Original strand, 40381453 - 40381573
Alignment:
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagag 490  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| ||||||||||   |||||||| ||||    
T  40381453 tggagaggcggtgataacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtacgcatttggaagttgaggcagag 40381549  T
Q  491 tacgctcagcgtgaggtggagttg 514  Q
     | ||||| | |||||||||||||    
T  40381550 aaagctcaacttgaggtggagttg 40381573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174261
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||  | |||| |||||   ||||||||||||    
T  26174114 ctggagaggaggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggtggaag-catagtgcaa-gtactcatttggaagttgaggtaga 26174210  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  26174211 gaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatg 26174261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 656; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 656; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 35217270 - 35216411
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  35217270 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaaccaaggatttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 35217171  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217170 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 35217071  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35217070 agaaggattgtccgaagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 35216971  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216970 aaaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 35216871  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216870 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 35216771  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |    
T  35216770 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttaaagaatgtatagc 35216671  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  35216670 acgacttgcgagattattctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaatgaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtga 35216571  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  35216570 atgcttgtgggactacctgaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 35216471  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  35216470 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 35216411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 36560441 - 36559586
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  36560441 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaatacggtgatggccta 36560342  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36560341 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaaggcaaggtttgaatgctttaactatcacaagatgggtcacttca 36560242  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36560241 agaaggattgtccggagg---atggtagctccgcacaaattgtctctgagggttatgagcatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 36560145  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36560144 agaaggtgatgtgtctcgccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaa 36560045  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560044 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 36559945  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36559944 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 36559845  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  36559844 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaa 36559745  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatact 804  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  36559744 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatact 36559645  T
Q  805 tgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  36559644 tgtggattactctgaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 36559586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 19503636 - 19502762
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19503636 caagtaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 19503537  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503536 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 19503437  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19503436 agaaggattgtccagagattaatggtaactccacacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 19503337  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19503336 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcagtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaa 19503237  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19503236 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgcacgcatttgctagctgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 19503137  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  19503136 ggagttgaatacaccggtaatggtacggctattaaggaccttgggtgctatgcgctatggtgaccaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagc 19503037  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  19503036 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtga 19502937  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatac 803  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19502936 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaagaaccttcaagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatac 19502837  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  19502836 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 19502762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21519990 - 21519581
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | || ||||| |||| |  ||||    
T  21519990 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgacccagtccaaggacttgagagtttattaacacagtgaaggcctaa 21519891  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519890 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagaat---aacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 21519794  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21519793 gaaggattgtctggatattattggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 21519694  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21519693 gaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaag 21519594  T
Q  409 aatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||    
T  21519593 aatactcatgatc 21519581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 384 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 6263379 - 6263002
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6263379 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctgcctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 6263280  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6263279 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-ggtgagcaagggatttct 6263181  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6263180 tcatgaagacagaagacattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagtgtgattggatgcaaggtgatct 6263081  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagtt 742  Q
    | || ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6263080 tcaaggaagcgggagatatcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagcgtagtt 6263002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 390 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 21519577 - 21519182
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21519577 ctggagagccggaggcaaaaatactcatgatctacttgttgaggtgaagcttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 21519478  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519477 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatga 21519378  T
Q  589 a-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacg 669  Q
    |                   |||| ||||| | || ||||||||||| |||||   ||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||| || |    
T  21519377 agacggaaggcattccggaggttgaagaatatatagcacggcttgcgggattatcttaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaagg 21519278  T
Q  670 aagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21519277 aagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 21519182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 384 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 31734104 - 31733685
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31734104 atcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 31734005  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31734004 ggtagagtacactcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagtgatttct 31733905  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||   || |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  31733904 tcatgaagacgaaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgctagattaccctaa---aaagccaaaggtgattggatgcaaggagatct 31733808  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||| |  ||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31733807 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttaaagattttatggtggatacttgtggaactacctcaaatttctagcgtagttggactgcaaggacctttgaga 31733708  T
Q  764 aag-cgaagacattccgagggct 785  Q
    | |  ||||||||||||| ||||    
T  31733707 aggaggaagacattccgatggct 31733685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28569701 - 28569310
Alignment:
Q  30 gaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagagggaatg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||| || ||||||||  ||| |||||||     
T  28569701 gaagaagttcaagtgactttgagaaccaaggagatgaccaagtccaaggacttgagagctgatgaaaacggtgaagacctaagtgtttcaacagggaatt 28569602  T
Q  127 gtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccggagat 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | | ||| | || ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  28569601 gtggaggtagaggtaaccggggaaagagtagtaccaaattaaagtttaggtgctttaactgtcacaagatgagtcacttcaagaaggattgtccggagaa 28569502  T
Q  227 taatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcac 326  Q
     |||||||| |||||||||||  |||| || | |||||||||| | |||||| ||||||||   | | ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28569501 caatggtaactccgcacaaatcgtctccgaagattatgaggattcaggtgctttgatggtg---tctcgttggggtgatgaagaaggtgatgtttctcac 28569405  T
Q  327 cttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||| || ||||| || ||  || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28569404 cttgtgaatgatgacttgtagagtggtggtcgtctagagagatgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggtgggaaaaatactcatgatc 28569310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31734260 - 31734102
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31734260 tgagaatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggataaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 31734161  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31734160 gagagacgttaaacactcaacatcaacctggagatgtggtgataagaatactcatgatc 31734102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6263535 - 6263377
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||    
T  6263535 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtccctcaccttgggattgatacctggtggagtggtggtcgtctg 6263436  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6263435 gagaaacgttaaacactcaacatcaacctgaagagacgatggtaagaatactcatgatc 6263377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 492
Target Start/End: Original strand, 22402362 - 22402470
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22402362 atcagtctggagaggtggaggcaataatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggaatgtacgcattttctagttga 22402461  T
Q  484 ggtagagta 492  Q
    |||||||||    
T  22402462 ggtagagta 22402470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14635145 - 14634841
Alignment:
Q  115 caagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  14635145 caagaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagtttggtcacttcaa 14635046  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    || |||||||||||||   ||||  || ||||| ||  || | || || |  ||| |||||||||||||| || | || || |||||   ||||||||||    
T  14635045 gagggattgtccggaggacaatgagaactccgcgcatgttgtgtccgaagagtataaggatgcgggtgctttggtagtatgttgttg---ggaggatgaa 14634949  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    || ||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14634948 gagggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtgggaag 14634849  T
Q  409 aatactca 416  Q
    ||||||||    
T  14634848 aatactca 14634841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Original strand, 22402266 - 22402364
Alignment:
Q  323 tcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22402266 tcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatattcatgatc 22402364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 487 - 590
Target Start/End: Original strand, 22404969 - 22405074
Alignment:
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 584  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22404969 agagtacgctcagcttgaggtggaattgaacacaccggtaatggtatggctatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttc 22405068  T
Q  585 atgaag 590  Q
    ||||||    
T  22405069 atgaag 22405074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 28569312 - 28569109
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  28569312 atcagtctgaagaggtggaggtaagaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggatttgcaaggtgaaagccatagtggg-tgtacgcatttggaagttga 28569215  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaat---ggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatt 579  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||| | |||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | |    
T  28569214 ggtagagaaagctcagcttaaggtggagttgatgacacctggaatattggtacgactatggagacctagggtgctattctctagttgtgagcaaggtaat 28569115  T
Q  580 tcttca 585  Q
    ||||||    
T  28569114 tcttca 28569109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 687 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 22405256 - 22405155
Alignment:
Q  687 tgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggct 785  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  22405256 tgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggacttcaaggatcttcgagaaggcggaagccattccgatggct 22405157  T
Q  786 ga 787  Q
    ||    
T  22405156 ga 22405155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 692 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 21519158 - 21519062
Alignment:
Q  692 aagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  21519158 aagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctga 21519062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41304219 - 41304109
Alignment:
Q  306 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 405  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||  |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||     
T  41304219 gaagaaggtgatgcctttcaccttgtgactgatgccttatagagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaaaatcagcttggagatgcggtggg 41304120  T
Q  406 aagaatactca 416  Q
    |||||||||||    
T  41304119 aagaatactca 41304109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14634835 - 14634662
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| ||   ||||| |||    
T  14634835 agcctggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacct-ttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttggggt 14634740  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
    |||| |  |||| | ||||||||||||    ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||    
T  14634739 agagaaatctcaacttgaggtggagttagtgacaccggaaatggtacgactatggagggccttgggtgttatgctcta 14634662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25402902 - 25402827
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25402902 aaggagggcactactactttggaagaggtccaagcggctttaagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 25402827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42018853 - 42018734
Alignment:
Q  297 ttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggaga 396  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||  | ||    || || |||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42018853 ttgggggatgaagaaggtgatgtttctcaccttggaaatgatgccttataaatgaatgatcatcttgaaagacattaaacactcaacatcatcctggaga 42018754  T
Q  397 ggcggtggtaagaatactca 416  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  42018753 ggcggtgggaagaatactca 42018734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 17933012 - 17933057
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17933012 ttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttgaccaagt 17933057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 36559572 - 36559473
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  36559572 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagtgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 36559473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 41304079 - 41303969
Alignment:
Q  476 ctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaag 574  Q
    |||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| ||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  41304079 ctagttgaggtagagatagcatagcttgaggtggaattgatgacatcgggaatggtacaactatggagatcttgggtgctaggctctagttgtgagcaag 41303980  T
Q  575 ggatttcttca 585  Q
    ||| |||||||    
T  41303979 ggaattcttca 41303969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 10446302 - 10446347
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10446302 caagcggctttgagaatcaaggaattgaccaagttcaaggacttga 10446347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 42019142 - 42019070
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| | ||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42019142 gaaggcattgtcaccttggaggaattccaatcgacttttagaaccaagaagttaaccaagtccaaggacttga 42019070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19348529 - 19348458
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  19348529 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 19348458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 19502763 - 19502664
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  19502763 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagagctacctgaaactcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 19502664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 14634572 - 14634531
Alignment:
Q  636 ccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcggga 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14634572 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggga 14634531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 39680937 - 39680982
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39680937 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 39680982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Original strand, 456865 - 457723
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  456865 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcgagcggctttgagaaccaatgagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 456964  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456965 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 457064  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  457065 agaaggattgtccggagattaatggtagctccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 457164  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457165 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 457264  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457265 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgccagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 457364  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  457365 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtagca 457464  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  457465 cggcttgcaagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaa 457564  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctgacg-ggttga-gtgtatact 804  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| | | |||| |||||||||    
T  457565 agcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtgtttgaggtgtatact 457664  T
Q  805 tgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  457665 tgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgg 457723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 6065093 - 6064219
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  6065093 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacgttgagggccta 6064994  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6064993 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaactggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 6064894  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6064893 agaaggattgtccagagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 6064794  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6064793 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 6064694  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6064693 gaatactc-tgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 6064595  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6064594 ggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatgatgagcaagggatttcttcatgaggttggagaatgtgtagc 6064495  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  6064494 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtga 6064395  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtata 802  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||    
T  6064394 aagcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaaggggttgaggtgtata 6064295  T
Q  803 cttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagc-ggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  6064294 cttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcaggag-atgtctcgtatt 6064219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 608; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 861
Target Start/End: Original strand, 11169059 - 11169918
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  11169059 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaaccggttttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaaggccta 11169158  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11169159 agtgtctcaatagggaatggtggaagtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 11169258  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11169259 agaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtcttagagggttatgaggatgcgggagctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 11169358  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11169359 agaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 11169458  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11169459 gaatactcatgatctacctgttgcggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacactcaacgtgaggt 11169558  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  11169559 ggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggagcttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagc 11169658  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  11169659 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttttgtgttgaagatgttatggtga 11169758  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggct-gacgggttg-agtgtatac 803  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||    
T  11169759 atgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctaaaggggttgaagtgtatac 11169858  T
Q  804 ttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcgg 861  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||    
T  11169859 ttgtggattactctaaaagccaagggtgattggctacaagtagatcttcaaggaaagcgg 11169918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 764
Target Start/End: Original strand, 43227039 - 43227796
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  43227039 gaagacactgttaccttggaagaagttcaagaggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaa 43227138  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43227139 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcatttcaa 43227238  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43227239 gaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 43227338  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43227339 gaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagggacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 43227438  T
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43227439 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggta 43227538  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatg-aagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||    
T  43227539 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtatagca 43227638  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  43227639 cggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaa 43227738  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43227739 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 43227796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 841
Target Start/End: Original strand, 5898371 - 5899210
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  || |    
T  5898371 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagatcatgaacacggtgaaggcctta 5898470  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898471 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaggtcaaagcctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 5898570  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5898571 gaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctcagagagttatgaggatgcaagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 5898670  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898671 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtagtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 5898770  T
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5898771 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtg 5898870  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||    
T  5898871 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgtgtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtttagca 5898970  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtga-tctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtga 706  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || || | | |||||||  | |||||| ||||||||||    
T  5898971 cggcttgtgagattatcctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgattcttcaaggaggcagaagatgtcctgcgctgaagatgttatggtga 5899070  T
Q  707 aatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga--cgggttga-gtgtata 802  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   ||||| | |||||||    
T  5899071 atgcttgtgggactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaagggggttaaggtgtata 5899170  T
Q  803 cttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  5899171 cttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggaacaa 5899210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4309806 - 4309054
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  4309806 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaa 4309707  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309706 gtgtttcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtagtaacaagtcaaagtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 4309607  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4309606 gaaggattgtccgaagattaatgataactccgcacaaattgtctctgagggttaaaaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 4309507  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309506 gaaggtgatgtgtctcactttgggagtgatgcctagtggagtagtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 4309407  T
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4309406 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtg 4309307  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||    
T  4309306 gagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtatagca 4309207  T
Q  608 cggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaa 707  Q
    ||||||||| ||||||||     ||| |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||   ||||||| |||||||||||    
T  4309206 cggcttgcgggattactc-----gaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagatgttctgcattgaagatgttatggtgaa 4309112  T
Q  708 atcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4309111 tgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 4309054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10957623 - 10957091
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  10957623 caaggaaggcattgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaaggtcta 10957524  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957523 agtgtctcaagagggaatggtggcggtagaggtaatcggagaaagagtggtaacaagtaaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 10957424  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10957423 agaaggattgtccggaggttaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 10957324  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957323 agaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 10957224  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10957223 gaatactcatgatctaccagttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggt 10957124  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957123 gaaaatgaacacaccggtaatggtacgactatg 10957091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18098467 - 18098055
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  18098467 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagatcatgaacacggtgaaggcctaa 18098368  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18098367 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcatttcaa 18098268  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18098267 gaaggattgtccggagattaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 18098168  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18098167 gaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgtctagtggagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtagtaag 18098068  T
Q  409 aatactcatgatc 421  Q
    |||||||||||||    
T  18098067 aatactcatgatc 18098055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Original strand, 42991332 - 42991714
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42991332 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttaaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 42991431  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991432 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttaggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 42991531  T
Q  583 tcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgt 682  Q
    |||| | |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  42991532 tcataaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaaaaaggccaagggtgattggatacaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgt 42991631  T
Q  683 cctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
    | |  |||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42991632 catgcgttgaagatgttatggtaaatgcttgtgggagtacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 42991714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 384 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 53916899 - 53916418
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53916899 atcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttga 53916800  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916799 gttagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 53916700  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || |||| |||||| |||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  53916699 tcatgaagatggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattatcctaaaaaaaggccaacggtgattggatgcaaggtaatct 53916600  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53916599 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggttaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactgcaaggaccttcgaga 53916500  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    | || |||||||||| ||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  53916499 aggcggaagacattctgagggctgaaggggttaaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggcacaa 53916418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 18098057 - 18097656
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18098057 atcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttgaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttga 18097958  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18097957 ggtagagtacgctcagcatgaggtggaatttaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgccatgctctatggtgagcaagggatttct 18097858  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18097857 tcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggcgatct 18097758  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgag 762  Q
    | || | ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18097757 tcaagggagcgggagatgtcctgtgttgaagatattatggtgaatgcttgtggaactacataaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgag 18097658  T
Q  763 aa 764  Q
    ||    
T  18097657 aa 18097656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 384 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 43422695 - 43422215
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  43422695 atcagtctggagatgcggaggtaacaatactcattatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgtatttgctaattga 43422596  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  43422595 ggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacactagtaatggtaagactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagaaagggattt-t 43422497  T
Q  583 tcat-------------------gaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    ||||                   || |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43422496 tcattaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaatgccaagggtgattggatgctaggtgatct 43422397  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43422396 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagcgtagttggactgcaaggacattcgaga 43422297  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctgacgggttga--gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa 841  Q
    | || |||||||||| ||| ||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  43422296 aggcggaagacattctgagagctgaaggggttaaggtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggcacaa 43422215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 384 - 787
Target Start/End: Original strand, 3315715 - 3316139
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3315715 atcagtctggagaggcggaggcaagaatactcatgatcttcctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 3315814  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315815 ggtagagtacgctcagcttgagctggagtttaaaacaccggtaatggtatgactatggaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 3315914  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||| | || |||| |||||| |||||| |||||| || | |||| ||||||| |||||||  || ||    
T  3315915 tcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatatatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattgaatgcaagaagacct 3316014  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgaga 763  Q
    | || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3316015 tcaaggaagtgggagatgtcctatgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcttagcgtagttggactgcaaggaccttcgaga 3316114  T
Q  764 aagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  3316115 aggcggaagacattccgagggctga 3316139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 23634407 - 23634798
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaactaagtg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||           ||    ||| ||||| ||||||| |  |||||||    
T  23634407 gaaggaactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaatgacttga-----------ga----actgatgaaaacggtgaaggcctaagtg 23634491  T
Q  112 tcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaa 211  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23634492 tttcaagaggtaatggtggaggtagaggtaactagagaaagagtggtaacaagtcaaagtctaaatgctttaactgtcacaagatggatcacttcatgaa 23634591  T
Q  212 ggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||    
T  23634592 ggattgtccggagattaatggcaactccacacaaattgtctctgagggttatgaggatgcatgtgctctggtggtg---tgttttttggaggatgaagaa 23634688  T
Q  312 ggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23634689 ggtgatgtgtctcaccttgggattgatgtatggtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcatggagaagaggtggtaagaat 23634788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 5192608 - 5192816
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  5192608 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcacgaacacggtgagggccta 5192707  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192708 agtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggataaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 5192807  T
Q  208 agaaggatt 216  Q
    |||||||||    
T  5192808 agaaggatt 5192816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 384 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 28101233 - 28100832
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| ||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  28101233 atcagtctggagaggcggatgcaataatattcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttaa 28101134  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttct 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101133 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgttatgctctatggtgagcaagggatttct 28101034  T
Q  583 tcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatct 663  Q
    |||||||                   |||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  28101033 tcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagactt 28100934  T
Q  664 ttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgag 762  Q
    | || |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  28100933 tcaaggaagtggaagatgtcctatgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaacacctagtgtcgttggactgtaaggactcttcgag 28100834  T
Q  763 aa 764  Q
    ||    
T  28100833 aa 28100832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 409 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 28138441 - 28138079
Alignment:
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28138441 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtg 28138342  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa------------------ 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                      
T  28138341 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatggatgaccttgggtgctatgctctatggcgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcattccgga 28138242  T
Q  590 -gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatg 688  Q
     |||| ||||||| || | |  |||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||  || || ||||||| | ||||| | ||    
T  28138241 ggttgaagaatgtatagcgcaacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggaagcaaggagactttcaaggaagcggaagatgtcatgtg 28138142  T
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaa 751  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28138141 ttgaagaggttatggtgaatgcttgtgaaactacctaaaacacctaatgtagttggactgcaa 28138079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 390 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 891126 - 890674
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  891126 ctggagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacacattttctcgttgatgtaga 891027  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 587  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  891026 gcactctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 890927  T
Q  588 aa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaac 668  Q
    ||                   |||| ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||| ||     
T  890926 aagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagagtgattggatgcaagaagaccttcaag 890827  T
Q  669 gaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc- 767  Q
     || ||||| || |||| |||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||||||| ||     
T  890826 aaaacgggagatatcctgtgttaaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagtctgactgcaaggatcttcgagaaggcg 890727  T
Q  768 gaagacattccgagggctga--cgggttga-gtgtatacttgtggattactct 817  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  890726 gaagacattccgatggctgaagggggttaaggtgtttacttgtggattactct 890674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 561 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 10957095 - 10956775
Alignment:
Q  561 ctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtga 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10957095 ctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagcacggcttacgggattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtga 10956996  T
Q  661 tctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcg 760  Q
    |||| || ||||||||| |||| ||  |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10956995 tcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttgtggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttagactgcaaggaccttcg 10956896  T
Q  761 agaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaaga 855  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||    
T  10956895 agaaggcggaagatattccgatggctgaaggggttgaggtgtatacttgtggattactctaaaaaccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaagga 10956796  T
Q  856 aagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||   ||||||||||||    
T  10956795 aagcgggagatgtctcgtatt 10956775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 53917055 - 53916897
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53917055 tgaggatgcgagtgctctgatggtgtggtgttgtttgtaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 53916956  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916955 gagagacgttaaacactctacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 53916897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 3315559 - 3315717
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||    
T  3315559 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggaatgatgcttagtggagaggtggtcgtctg 3315658  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315659 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 3315717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15830482 - 15830240
Alignment:
Q  24 accttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagag 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||   || ||||| ||||||| |  |||||||   ||||||    
T  15830482 accttggaaaaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttaacacagtccaaggacttgagagctgatgaaaacggtgaaggtctaagtgcttcaagag 15830383  T
Q  121 ggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15830382 ggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtttaagtgctttagttgtcccaagatgggtcacttcaagaaggattaccc 15830283  T
Q  221 ggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttat 263  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||| |||| |||||||||    
T  15830282 ggagaataatggtaactctgcgcaaattgtctccgagggttat 15830240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23199391 - 23198979
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  23199391 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 23199292  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| | ||||||| |||||||    
T  23199291 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaactgaggaagctcatagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtttcacaagttgggtca 23199192  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  23199191 cttcaagagggattgtccggaggattatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 23199095  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || || |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23199094 gaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 23198995  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23198994 ggtgagaatactcatg 23198979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 42991176 - 42991334
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||| || |||     
T  42991176 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttggaagtgatgcctaatggagcggtgatcatcta 42991275  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42991276 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcagtggtaagaatactcatgatc 42991334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43422851 - 43422693
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  43422851 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatctgtctcaccttgagagtgatgcctagtggaacggtggtcgtatg 43422752  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43422751 gagagacgataaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43422693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 7763186 - 7763597
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |  ||||| ||||||| |  || |    
T  7763186 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttaaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacggtgaaggcctta 7763285  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    |||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  7763286 gtgcttcaagaggaaatgatggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 7763385  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||  |  ||||| ||| || | || || |  |||| ||||||||||||| || ||||| |    |||| ||||    
T  7763386 cttcaagagggattgtccggaggacaatgagagctccgcgcaagttgtgtccgaagagtatggggatgcgggtgctttggtggtgag----tgttgggag 7763481  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7763482 gatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagccaggagaggcggt 7763581  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||    
T  7763582 ggtaacaatactcatg 7763597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 27421600 - 27422004
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||   || || || | ||| | |  ||||    
T  27421600 gaaggcattgtcactttgaaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcaagggaattgagagctgataaaaatggtaaaggtctaa 27421699  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||| ||||||| || |||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27421700 gcgtttcaagagggaatggtggagatagaggtaaccgg-gaaaaattggtaacaagttaaagtttaagtgcattaattgtcacatgatgggtcacttcaa 27421798  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    |||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||| || ||||  ||  ||||| ||  ||||||    
T  27421799 gaag-atcctccggagaacaatggtaactccgcacaaattgtctccgaggtttatgaggatgtaagtgctttggtggt-agc--ttgttggggagatgaa 27421894  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 408  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||    
T  27421895 gaaggtgttgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggcggtcgtctggagagactttaaacactcaacatcagcatgaaaaggcggtgagaag 27421994  T
Q  409 aatactcatg 418  Q
    ||||||||||    
T  27421995 aatactcatg 27422004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 384 - 590
Target Start/End: Original strand, 23634796 - 23635004
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  23634796 atcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgagggggagttttaaggttgaagacatagtgaggtgtacacattttctagttga 23634895  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    |     | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23634896 gaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttcggtgttatgctctactggtgagcaagggatttc 23634995  T
Q  582 ttcatgaag 590  Q
    |||||||||    
T  23634996 ttcatgaag 23635004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28101389 - 28101231
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||     
T  28101389 tgaggatgcgggttctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgaaaatgatgcctagtggagcggtggtcatcta 28101290  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101289 gagggaagttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 28101231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 891288 - 891131
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  891288 tgaggatgagggtgctctggtggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcgcctttggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtttg 891189  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 420  Q
     ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  891188 gagagacgttaaacactcgacatcatcttggagaggcggtggtaagaatactcatgat 891131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 418
Target Start/End: Original strand, 29811789 - 29812197
Alignment:
Q  17 cactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtc 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |||||     
T  29811789 cactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaagagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtt 29811888  T
Q  114 acaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || ||||||   | || | | |||||||| ||||||||| | |||||| |||    
T  29811889 tcaagagaaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagtttggtcacatca 29811988  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaatta-tctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatg 306  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||  || ||||| ||| ||  | || ||||  |||||||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||| ||    
T  29811989 agagggattgtccggaggtcgatgagaactccgcgcaagtttgtgtccgaggagtatgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggctg 29812085  T
Q  307 aagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 406  Q
    | |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  29812086 aggaaggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtacagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtttggagaggcggtcgga 29812185  T
Q  407 agaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||    
T  29812186 agaatactcatg 29812197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 5192839 - 5192945
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5192839 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgagggccta 5192938  T
Q  108 agtgtca 114  Q
    |||||||    
T  5192939 agtgtca 5192945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5259575 - 5259163
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| || || |    
T  5259575 gaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaagacctta 5259476  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| || |      |||||| ||||||||    | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5259475 gtgtttcagaaggaaatggtggaggtagaggtaactgaggaagctcaaagagcggaaacaatgataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 5259376  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||||  |  | ||| ||| || | || || |  |||| ||||||||||||| || |||||    |||||| ||||    
T  5259375 cttcaagagggattgtccgaaggacaatgagagcttcgcgcaagttgtgtccgacgagtatggggatgcgggtgctttggtggtg---agttgttgggag 5259279  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    || || |||||||| |  ||| ||||||| ||||||| || ||  |  |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5259278 gaagatgaaggtgagggttctgaccttggtattgatgccttgtagaatggtgttcatctggagagacattaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 5259179  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||||||||||||||    
T  5259178 ggtaagaatactcatg 5259163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 385 - 563
Target Start/End: Original strand, 25634865 - 25635043
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25634865 tcagtctggagagacggaggtaacaatactcatgatctacct-ttgacgtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgag 25634963  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
        || | | ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25634964 aggtagaaagttcagtttgaggtggagttgaacacagcggaaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta 25635043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 590 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 35918897 - 35918722
Alignment:
Q  590 gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgt 689  Q
    |||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||   |    
T  35918897 gttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgggagatgtcctgcat 35918798  T
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcgagaa 764  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35918797 tgaagatgttatggtgaatgcgtgtgggactacctaaaacttctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaa 35918722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Original strand, 32892005 - 32892414
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| |  |||| |  || |    
T  32892005 gaaggcactgccaccttggaagaagttcaaccggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaa-aaagtgaaggcctta 32892103  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaac---cgaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    ||||   |||| | || ||||||   | || | | |||||||| ||||| ||| | |||||    
T  32892104 gtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaacttaggaagctcaaagggcggtaacaagaataagtataagtgctttaagtgtcaaaagtttggtca 32892203  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||  ||||||   ||| || |||   |||  |||||||||||||||||| || ||||    |||||||  ||     
T  32892204 cttcaagagggattgtccggaggacaatgagaattccatgcaagttgtcttcaaggaatatgaggatgcgggtgctttggtggt---ttgttgttgagat 32892300  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| || ||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  32892301 gatgaagaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagcggtgctcatctggagagacgttaaacactcaacatcagtcaggagaagcggt 32892400  T
Q  403 ggtaagaatactca 416  Q
    || |||||||||||    
T  32892401 gggaagaatactca 32892414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 10057160 - 10057571
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  10057160 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 10057259  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10057260 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttggggca 10057359  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | |||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  10057360 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtctgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 10057456  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10057457 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagatggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 10057556  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  10057557 gtggtgagaatactc 10057571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 10061604 - 10062015
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  10061604 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 10061703  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10061704 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttggggca 10061803  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | |||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  10061804 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtctgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 10061900  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10061901 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagatggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 10062000  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  10062001 gtggtgagaatactc 10062015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 10063826 - 10064237
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  10063826 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 10063925  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10063926 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttggggca 10064025  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | |||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  10064026 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtctgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 10064122  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10064123 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagatggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 10064222  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  10064223 gtggtgagaatactc 10064237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 10066048 - 10066459
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  10066048 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 10066147  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10066148 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttggggca 10066247  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | |||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  10066248 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtctgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 10066344  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10066345 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagatggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 10066444  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  10066445 gtggtgagaatactc 10066459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4599972 - 4599558
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  4599972 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 4599873  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  4599872 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 4599773  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  4599772 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 4599676  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |   ||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4599675 gaaggtaaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagacggtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 4599576  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  4599575 gtggtgataatactcatg 4599558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 418
Target Start/End: Original strand, 10210116 - 10210527
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  10210116 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 10210215  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10210216 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggacaagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 10210315  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||       ||| ||||    
T  10210316 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg------agttgggag 10210409  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || || |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10210410 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagacggagtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 10210509  T
Q  401 gtggtaagaatactcatg 418  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  10210510 gtggtgagaatactcatg 10210527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 10059382 - 10059793
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  10059382 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 10059481  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaacc---gaag---aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | ||   ||||   |||||| |||||||||   | || | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10059482 gtgtgtcaaaaggaaatggtggaggtagaggcagccggggaagctcaaagagcggaaacaaggataagtataagtgctttaagtgtcacaagttggggca 10059581  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| ||  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  10059582 cttcaagagggattgtccggaggaagatgatagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgcgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 10059678  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagt-gaagcggtgg-tcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 400  Q
    || |  |||||||| |  |||||||||||  |||||  || || || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10059679 gaaggtgaaggtgagggttctcaccttggagttgattccttgtagatggtatggttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcg 10059778  T
Q  401 gtggtaagaatactc 415  Q
    ||||| |||||||||    
T  10059779 gtggtgagaatactc 10059793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15821938 - 15821741
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaactaagtg 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||  |  |||| |  |||||||    
T  15821938 gaaggcaccgtcaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccgagtccaaggacttgagagttgatta-agtgatggtctaagtg 15821840  T
Q  112 tcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaaga 210  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  15821839 cttcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccagggaataagtggtaacaagtcaaagtttaagtgctttaattgtgacaagatgggtcacctcaaga 15821741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Original strand, 6717428 - 6717834
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| || |||| |  || |    
T  6717428 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagtggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcctta 6717527  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaag------aaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||| |      |||||| |||||||||   |  | | | |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  6717528 gtgtttcaaaggggaatggtggaggtagaggcaaccgaggaggctcaaagagaggaaacaaggataattataagtgctttaagtgtcacaagttgggaca 6717627  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||  |  ||||| ||| || | || ||||  ||||  |||| ||||||| ||||||||    |||||| ||||    
T  6717628 cttcaagagggattgtccggaggaagatgagagctccgcgcaagttgtgtccgaggagtatggagatgtgggtgctttgatggtg---agttgttgggag 6717724  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    |  |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||  || ||  || |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6717725 ggaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtggt--tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcagt 6717822  T
Q  403 ggtaagaatact 414  Q
    ||| ||||||||    
T  6717823 ggtgagaatact 6717834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 7769517 - 7769719
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    | ||||| ||||||| |  ||||    
T  7769517 gaaggcaatgttatctaggaagaagttcaagtggctttgagaaccaaggagtaggcaaagtctaaggacttgagagatgatgaaaacggtgaaggcctaa 7769616  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagt--caaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttc 206  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||   || |||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7769617 gtgttttaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggggaaagagtggtaacaagttataaagtttaagtgttttaactgtaacaagatgggtcgcttc 7769716  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  7769717 aag 7769719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 418
Target Start/End: Original strand, 25634739 - 25634863
Alignment:
Q  291 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  25634739 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgcctagtg---cggtggtcgtctagagagttgttaaatactcaacatcagcc 25634835  T
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatactcatg 418  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25634836 tagagaggcggtgctaagaatactcatg 25634863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 688 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 35918702 - 35918602
Alignment:
Q  688 gttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg 786  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35918702 gttgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactttcgagaaggcggaagacattccgagggctg 35918603  T
Q  787 a 787  Q
    |    
T  35918602 a 35918602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 9635376 - 9635304
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9635376 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaatgagttgaccaagtccaaggacttga 9635304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Original strand, 37407604 - 37407676
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407604 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaaccggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 37407676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 4309032 - 4308934
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  4309032 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggattacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctga 4308934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35919017 - 35918939
Alignment:
Q  127 gtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcactt 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919017 gtggaggtagaggtaaccggggaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcactt 35918939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 563
Target Start/End: Original strand, 29812201 - 29812374
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||   |||||||||    
T  29812201 agcctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggt-gaaggcatagtgtg-tgtacgcatttggaagttgaggt 29812297  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
    |||| | ||||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  29812298 agagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggatgccttgagtgctatgctcta 29812374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 692 - 787
Target Start/End: Original strand, 43227820 - 43227916
Alignment:
Q  692 aagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43227820 aagaggttaaggtgaatgcttgtggaactaactaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 43227916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1619860 - 1619735
Alignment:
Q  290 ctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagc 389  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  || || ||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1619860 ctgttgctgggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgattccttgtaaagtggtagttttctagagagacgttaaacactcaacatcagc 1619761  T
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactc 415  Q
    |  ||||||| || ||||||||||||    
T  1619760 ccagagaggcagttgtaagaatactc 1619735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 1619721 - 1619543
Alignment:
Q  394 agaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtac 493  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||  ||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |     
T  1619721 agaggcggaggtaagaatacttgtgatcagcctttt-aggtggagtttcaaggtgaaagacatggtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaa 1619623  T
Q  494 gctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 590  Q
    | ||||| |||||||||                  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1619622 gttcagcttgaggtgga------------------ggtacgactatggagaccttgggtgctatgctctagtggtgaccaagggaattcttcatgaag 1619543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 28100810 - 28100712
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28100810 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctga 28100712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Original strand, 42991736 - 42991834
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  42991736 tgaagaggttaaggtgaatgcatgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacatttcgagggctga 42991834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 18097634 - 18097536
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaag-cgaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  18097634 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcctagttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattccgatggctga 18097536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 28138043 - 28137945
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaag-cgaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  28138043 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagtgtagttggactgcaaggacctttgagaaggaggaagacattccgatggctga 28137945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 4599556 - 4599354
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   |||||||    
T  4599556 tcagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgag 4599460  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttct 582  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || | ||||| |  ||||||||| ||||||||| | || ||||    
T  4599459 gtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtgaattct 4599360  T
Q  583 tcatga 588  Q
    ||||||    
T  4599359 tcatga 4599354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 23198972 - 23198775
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  23198972 ctggagaggtggtggtaacaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggtaaggtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 23198876  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 587  Q
    | | ||||| | | ||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||| || | |||||||  ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  23198875 gaaagctcaacttaaggtggagttgatgacatcgggaatggtatgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 23198776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5259159 - 5258959
Alignment:
Q  387 agcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggt 486  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |  ||| |||||   |||||||||    
T  5259159 agcctagagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaaccc-ttgaggtggagttacaaggtggaag-catagtggaaa-tactcatttggaagttgaggt 5259063  T
Q  487 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 584  Q
    |||| | ||||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  5259062 agagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 5258963  T
Q  585 atga 588  Q
    ||||    
T  5258962 atga 5258959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 6717845 - 6717993
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  6717845 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 6717941  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacacc-ggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||    
T  6717942 gaaagttcaacttgaggtggagttgatgacaccggggaatggtatgactatg 6717993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 418
Target Start/End: Original strand, 7769763 - 7769878
Alignment:
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||  |||||||    |||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||    
T  7769763 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggtgtctatctggagagacgttaaacagtcaagatcatcctagagagtctgt 7769862  T
Q  403 ggtaagaatactcatg 418  Q
    || |||||||||||||    
T  7769863 gggaagaatactcatg 7769878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 10057581 - 10057728
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  10057581 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 10057677  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  10057678 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatg 10057728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 10059803 - 10059950
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  10059803 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 10059899  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  10059900 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatg 10059950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 10062025 - 10062172
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  10062025 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 10062121  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  10062122 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatg 10062172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 10064247 - 10064394
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  10064247 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 10064343  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  10064344 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatg 10064394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 540
Target Start/End: Original strand, 10066469 - 10066616
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  10066469 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtaga 10066565  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatg 540  Q
    | | ||||| | |||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  10066566 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatg 10066616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 664
Target Start/End: Original strand, 23635023 - 23635097
Alignment:
Q  590 gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctt 664  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23635023 gttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatacaaggtgatctt 23635097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 9602711 - 9602756
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9602711 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 9602756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15824811 - 15824698
Alignment:
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || ||  || | | |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  15824811 gatgaagaaggtgatatttctcacctttggagtgatgccttgtagagagatagtcgtctagagagacattaaacactcaacatcatcttggaggggcgat 15824712  T
Q  403 ggtaagaatactca 416  Q
    || |||||||||||    
T  15824711 gggaagaatactca 15824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16263585 - 16263540
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16263585 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 16263540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 416
Target Start/End: Original strand, 27900223 - 27900276
Alignment:
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27900223 aagagacgttaaacacccaacatcagtctggagaggcggtgcaaagaatactca 27900276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 553
Target Start/End: Original strand, 7763604 - 7763763
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||  |||||||||| | |||||| |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  7763604 ctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct--tgaggtggagctgcaaggt-gaaggcatagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtaga 7763699  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg 553  Q
    | | ||||| | ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||| || |||||||||    
T  7763700 gaaagctcaacttgaggtggagtttgtgacaccgagaatggtacgactatggaggccttgggtg 7763763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 514
Target Start/End: Original strand, 10210534 - 10210655
Alignment:
Q  390 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  10210534 ctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtacccatttggaagttgaggtaga 10210630  T
Q  490 gtacgctcagcgtgaggtggagttg 514  Q
    | | ||||| | |||||||||||||    
T  10210631 gaaagctcaacttgaggtggagttg 10210655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 28490009 - 28490080
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28490009 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggac 28490080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22834261 - 22834215
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 58  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22834261 gaaggcaccgtcaccttggaagaaattcaagcggctttgagaaccaa 22834215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10612067 - 10612022
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10612067 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 10612022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27882685 - 27882632
Alignment:
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27882685 aagagacgttaaacactcagcatcagtttggagaggcggtgcaaagaatactca 27882632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29913245 - 29913200
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29913245 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 29913200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 659 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 53916414 - 53916286
Alignment:
Q  659 gatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagacctt 758  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||  || || |||    
T  53916414 gatcttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactataaggatctt 53916316  T
Q  759 cgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  53916315 cgagaaggcggaagacattccgatggctga 53916286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 54189401 - 54189446
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  54189401 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 54189446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 478 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9635247 - 9635175
Alignment:
Q  478 agttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgg 550  Q
    ||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  9635247 agttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgg 9635175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 3324383 - 3324458
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    |||||||||||   ||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3324383 aaggaaggcaccactactttggaggaggtccaagaggcgttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 3324458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 6064220 - 6064121
Alignment:
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  6064220 ttgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagtgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagatattccgatggctga 6064121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8516346 - 8516275
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8516346 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 8516275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 416
Target Start/End: Original strand, 31116505 - 31116568
Alignment:
Q  353 tggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 416  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||  |||||| |||||    
T  31116505 tggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctagaaaggaggttctaagaagactca 31116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 32479592 - 32479521
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  32479592 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 32479521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 659 - 780
Target Start/End: Original strand, 3306275 - 3306397
Alignment:
Q  659 gatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagacctt 758  Q
    |||||| || ||||||||| |||||   | ||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | |||    
T  3306275 gatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagagtagttggactacaagcatctt 3306374  T
Q  759 cgagaaagc-gaagacattccga 780  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  3306375 cgagaaggcggaagacattccga 3306397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 563
Target Start/End: Original strand, 32892418 - 32892593
Alignment:
Q  385 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| | |||||||||||   |||||||    
T  32892418 tcagcatggagaggcggtgtgaataatacttgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtgaaag-catggtgtg-tgtacgcatttgaaagttgag 32892514  T
Q  485 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 563  Q
    | |||| | ||||| | ||||||||||||    ||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  32892515 gcagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccgaaaatggtacaactatggagatcttgggtgttaggctcta 32892593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 43402940 - 43402886
Alignment:
Q  691 gaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttgga 745  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43402940 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagttgga 43402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 6304202 - 6304247
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6304202 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 6304247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 489
Target Start/End: Original strand, 7769922 - 7769982
Alignment:
Q  428 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 489  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7769922 ttgaggtggagttgcaaggtgaaaatcatagtgg-atgtacgcatttcctagttgaggtaga 7769982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10204981 - 10204936
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10204981 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 10204936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 10897896 - 10897941
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  10897896 ttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaagagttgaccaagt 10897941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22625269 - 22625224
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22625269 ttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 22625224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 671 - 787
Target Start/End: Original strand, 23636401 - 23636518
Alignment:
Q  671 agcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-ga 769  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||| ||| |||||| ||||||    | ||| || ||||||||| || ||    
T  23636401 agcgggaggtgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgctagtggaactacctgaaattcctagcgtagtttcgatacaaggatcttcgagaaggcgga 23636500  T
Q  770 agacattccgagggctga 787  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  23636501 agacattccgatggctga 23636518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 43403290 - 43403172
Alignment:
Q  391 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagag 490  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||   ||||||||| |||    
T  43403290 tggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacct-ttgaggtgaagttgcaagg-tgaaggcatagtgtg-tgtacgcgtttggaagttgaggtggag 43403194  T
Q  491 tacgctcagcgtgaggtggagt 512  Q
     |  |||||| |||||||||||    
T  43403193 aaatctcagcttgaggtggagt 43403172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 47882178 - 47882133
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47882178 ttggaggaagttcaagcaactttgagaaccaaagagttgaccaagt 47882133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 647; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 876
Target Start/End: Original strand, 23105 - 23976
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  23105 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaatacggtgatggccta 23204  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23205 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgggtcacttca 23304  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23305 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaaga 23404  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggt-ggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23405 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 23504  T
Q  407 agaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgagg 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23505 agaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagcacgctcagcgtgagg 23604  T
Q  507 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtac 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23605 tggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtag 23704  T
Q  606 cacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtg 705  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  | |||||||| |||||||    
T  23705 cacggcttgcgaaattactctaaaa----gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtg 23800  T
Q  706 aaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctg-acgggttga-gtgtata 802  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  23801 aatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtata 23900  T
Q  803 cttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  23901 cttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 23976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 550; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 660
Target Start/End: Original strand, 603 - 1256
Alignment:
Q  8 caaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactcatgaacacggtgaggaacta 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  603 caaggaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcaaaggacttgactcatgaacacggtgaaggccta 702  T
Q  108 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  703 agtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttca 802  T
Q  208 agaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatga 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  803 agaaggattgtccggaggttaatggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatga 902  T
Q  308 agaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  903 agaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 1002  T
Q  408 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1003 gaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctaattgaggtagagtacgctcagcgtgaggt 1102  T
Q  508 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtacc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  1103 ggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttgaagaatgtatagc 1202  T
Q  607 acggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtga 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1203 acggcttgcgagattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtga 1256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 263 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 833 - 330
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  833 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 734  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 462  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  733 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 634  T
Q  463 atgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaa-gaccttgggtgctatgctc 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  633 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctc 534  T
Q  562 tatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgat 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  533 tatggtgagcaagggatttcttcttgaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaaggccaatggtgattggatgcaaggtggt 434  T
Q  662 ctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagac-cttcg 760  Q
    ||| || ||||||||| |||| ||   ||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  433 cttcaaggaagcgggagatgttctgcattgaagatgttatggtgaatgcaagtgggactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggactcttcg 334  T
Q  761 agaa 764  Q
    ||||    
T  333 agaa 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 210
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  308 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 351 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 70485 - 70084
Alignment:
Q  351 ggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttga 450  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70485 ggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagttgcggtggtaataatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttga 70386  T
Q  451 agacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttg 549  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70385 agacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcatcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatggaagaccttg 70286  T
Q  550 ggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaagttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattgg 649  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  70285 ggtgctatgctctatggtgaggaagggatttcttcatgaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattactctaaaagaaggccaagggtgattgg 70186  T
Q  650 atgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgc 749  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  70185 atgcaaggtgaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagcgtagttggactgc 70086  T
Q  750 aa 751  Q
    ||    
T  70085 aa 70084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 72813 - 72466
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  72813 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaa 72714  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72713 gtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaa 72614  T
Q  209 gaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaa 308  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  72613 gaaggattgtctggatattattggtaactccgcacaaattgtctctgagggttatgaggattcttgtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 72514  T
Q  309 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  72513 gaaggtgatgtgtctcaccttgggatggatgcctagtggagcggtggt 72466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 70048 - 69949
Alignment:
Q  690 tgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagacc-ttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  70048 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggagctacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggacctttcgagaaggcggaagacattccgagggctga 69949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 421
Target Start/End: Original strand, 34553 - 34950
Alignment:
Q  27 ttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgac---tcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagaggga 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  34553 ttggaagaagttcaagtggctttgagaaccaaggggttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagaggga 34652  T
Q  124 atggtggaggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccgga 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34653 atggtggaggtagaagtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtcataatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaaggattgtccaga 34752  T
Q  224 gattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtct 323  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753 gattaatggtaactctgcacaaattgtctctgagggttatgaggatgcaggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtct 34852  T
Q  324 caccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34853 cacgttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggaaagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 34950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 384 - 787
Target Start/End: Original strand, 34948 - 35373
Alignment:
Q  384 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 483  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34948 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 35047  T
Q  484 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35048 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 35147  T
Q  582 ttcatgaa-------------------gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatc 662  Q
    ||||||||                   |||| |||||||  | ||||||||||| |||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||| || |    
T  35148 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaaaagggccaagggtgattggatgcaaggagacc 35247  T
Q  663 tttaacgaagcgggatatgtcctatgttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgag 762  Q
    || || ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  35248 ttcaaggaaacgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactacaaggaccttcgag 35347  T
Q  763 aaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  35348 aaggcggaagacattccgagggctga 35373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 409 - 787
Target Start/End: Original strand, 51097 - 51496
Alignment:
Q  409 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51097 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 51196  T
Q  509 gagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcatgaa------------------ 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                      
T  51197 gagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctctatggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccgga 51296  T
Q  590 -gttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatg 688  Q
     |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  51297 ggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtg 51396  T
Q  689 ttgaagacgttatggtgaaatcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccgagggctga 787  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  51397 ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgaggtctga 51496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 263 - 420
Target Start/End: Original strand, 50916 - 51073
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  50916 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 51015  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51016 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 51073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 263 - 421
Target Start/End: Original strand, 80764 - 80922
Alignment:
Q  263 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctg 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  80764 tgaggatgcgggtgttctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 80863  T
Q  363 aagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 421  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  80864 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 80922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 411
Target Start/End: Original strand, 115518 - 115920
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgactca---tgaacacggtgaggaactaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   |||| ||  ||| |  || |    
T  115518 gaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagaggatgaaaacaatgaaggcctta 115617  T
Q  109 gtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtca 202  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||| || |||||    | || | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  115618 gtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagcggtaacaat---aagtataagtgctttaagtgtcacaagttgggtca 115714  T
Q  203 cttcaagaaggattgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||  |  ||||| ||| || | ||  |||  |||| ||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||    
T  115715 cttcaagagggattgtccggaggacaatgagagatccgctcaagttgtgtccaaggagtatggggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggag 115811  T
Q  303 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 402  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  115812 gatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcagt 115911  T
Q  403 ggtaagaat 411  Q
    || ||||||    
T  115912 gggaagaat 115920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 418
Target Start/End: Original strand, 293 - 690
Alignment:
Q  24 accttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaggaactaagtgtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    |  || || || || | |  || |||||  |||| |    
T  293 accttggaagaagttcaatcaactttgagaaccaaagagttgaccaggtccaaggacttgggagcggataaaaacagttaaggtcttagtgtttcaaggg 392  T
Q  121 ggaatggtggaggtagaggtaaccgaagaa------agagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgggtcacttcaagaagga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||| ||||  ||||  ||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  393 ggaatggtggaggtagaggtaaccgaggaagctcaaagagtggtaacacatcaaattttaagtgctttaagtgtcacaagtttggtcacttcaagaggga 492  T
Q  215 ttgtccggagattaatggtaattccgcacaaattatctctgagggttatgaggatgcgggtgctctgatggtgtgctgttgtttggaggatgaagaaggt 314  Q
    ||||| ||||   ||||  || | | | ||| || | || ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||   ||    
T  493 ttgtctggaggacaatgagaactacacgcaagttgtgtcagaggagtatgaggatgtgggtgctttgatggtgtgttgttg---ggaggatgaag---gt 586  T
Q  315 gatgtgtctcaccttgggattgatggctagtgaagcggtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatact 414  Q
    || || ||||||||||| ||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  587 gaggtctctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggcggtgggaagaatact 686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 512 - 779
Target Start/End: Original strand, 3966 - 4259
Alignment:
Q  512 ttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag------------------- 590  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                       
T  3966 ttgaacacaccagaaatggtacgactatggaggaccttgggtgatatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaagt 4065  T
Q  591 ttggagaatgtgtaccacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatctttaacgaagcgggatatgtcctatgtt 690  Q
    ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| ||||   || |||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  4066 ttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggatgtaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgtt 4162  T
Q  691 gaagacgttatggtgaaatcttg-------tgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaagc-gaagacattccg 779  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||       ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||    
T  4163 gaagaggttatggtggatacttgtggaatatggaactacctaaaatttctagtgtagttggactgcaaggctcttcgagaaggcggaagacattccg 4259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26276 - 26228
Alignment:
Q  436 gagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgag 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26276 gagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgag 26228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 718 - 764
Target Start/End: Original strand, 4293 - 4339
Alignment:
Q  718 actacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaa 764  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4293 actacctcaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaa 4339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 9746 - 9553
Alignment:
Q  394 agaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtac 493  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||||||| |     
T  9746 agaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggtggaag-catagtggaa-gtactcatttgaaagttgaggtagagaaa 9650  T
Q  494 gctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtg-ctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 588  Q
    ||||| | ||| ||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||| || | |||||||  ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  9649 gctcaacttgatgtggagttgatgacaccgagaatggtatgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 9553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4104
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4029 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 4104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26669 - 26597
Alignment:
Q  12 gaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||||||||  |||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26669 gaaggcactgccaccttgaaggacgtccaagcggatttgagaaccaaggagttaactaagtccaaggacttga 26597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 18774 - 18849
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  18774 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaacgaattgaccaagttcaaggacttga 18849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 796 - 876
Target Start/End: Original strand, 189154 - 189236
Alignment:
Q  796 gtgtatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  189154 gtgtatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 189236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1684
Alignment:
Q  39 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 84  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  1729 caagcggcttagagaaccaatgaattgaccaagttcaaggacttga 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 72
Target Start/End: Original strand, 17204 - 17261
Alignment:
Q  15 ggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  17204 ggcactattactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagaattgaccaagt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 799 - 876
Target Start/End: Original strand, 2348 - 2427
Alignment:
Q  799 tatacttgtggattactct-caagccaagggtgatcgggtacaa-tacatcttccaagaaagcggagcatgtctcgtatt 876  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||    
T  2348 tatacttgtggattactctaaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtatt 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 15144 - 15215
Alignment:
Q  9 aaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggac 80  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  15144 aaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagttcaaggac 15215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University