View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3113_low_10 (Length: 267)

Name: NF3113_low_10
Description: NF3113
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3113_low_10
NF3113_low_10
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (81-265)||(15314-15501)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (39-267)||(18875731-18875961)
chr7 (80-267)||(43277631-43277821)
chr7 (39-169)||(46387021-46387151)
chr7 (80-267)||(37785171-37785361)
chr7 (20-211)||(8852081-8852273)
chr7 (20-211)||(11066412-11066604)
chr7 (20-201)||(36686127-36686308)
chr7 (80-254)||(4070777-4070952)
chr7 (80-254)||(11053682-11053857)
chr7 (42-211)||(59308-59478)
chr7 (80-267)||(3286978-3287162)
chr7 (20-140)||(13150524-13150644)
chr7 (20-140)||(20619229-20619349)
chr7 (20-211)||(32434505-32434697)
chr7 (80-234)||(15281313-15281468)
chr7 (84-254)||(17130569-17130740)
chr7 (20-254)||(48811845-48812075)
chr7 (39-201)||(30821133-30821295)
chr7 (80-226)||(33001010-33001157)
chr7 (80-225)||(36705526-36705672)
chr7 (20-201)||(38480031-38480212)
chr7 (82-211)||(12128080-12128210)
chr7 (80-224)||(17071146-17071290)
chr7 (80-225)||(10660117-10660257)
chr7 (80-169)||(12371282-12371371)
chr7 (82-202)||(18075454-18075574)
chr7 (80-143)||(14183611-14183674)
chr7 (80-203)||(14219925-14220049)
chr7 (40-193)||(15096572-15096727)
chr7 (39-154)||(8136014-8136131)
chr7 (80-154)||(13133465-13133539)
chr7 (81-193)||(32301019-32301129)
chr7 (81-125)||(130985-131029)
chr7 (43-146)||(20253545-20253649)
chr7 (81-125)||(38519281-38519325)
chr7 (201-267)||(20585534-20585602)
chr7 (80-146)||(19558243-19558309)
chr7 (80-125)||(19282134-19282179)
chr7 (80-193)||(48213815-48213928)
chr7 (201-267)||(19282270-19282338)
chr7 (82-125)||(44373990-44374033)
chr7 (82-125)||(44382855-44382898)
chr7 (201-267)||(46386893-46386961)
chr7 (80-123)||(48809489-48809532)
chr7 (56-169)||(6170404-6170522)
chr7 (80-125)||(13699710-13699756)
chr7 (84-146)||(47094138-47094200)
chr7 (201-265)||(12466068-12466134)
chr7 (80-125)||(12466225-12466270)
chr7 (82-123)||(15576925-15576966)
chr7 (80-125)||(20585398-20585443)
chr7 (84-125)||(42461861-42461902)
chr7 (81-169)||(11769039-11769126)
chr7 (81-121)||(16996131-16996171)
chr7 (39-123)||(22001196-22001283)
chr7 (72-123)||(14153885-14153936)
chr7 (131-237)||(15139225-15139332)
chr7 (56-142)||(17232330-17232422)
chr7 (39-123)||(24270776-24270862)
chr7 (39-123)||(25941350-25941436)
chr7 (56-142)||(37727865-37727957)
chr7 (20-63)||(38479966-38480009)
chr7 (39-115)||(43747414-43747492)
chr7 (201-267)||(44374124-44374192)
chr7 (201-267)||(44382989-44383057)
chr7 (56-142)||(45847951-45848043)
chr7 (131-254)||(709370-709489)
chr7 (56-169)||(9389998-9390116)
chr7 (80-146)||(16077417-16077483)
chr7 (80-125)||(14161835-14161880)
chr7 (39-103)||(2282516-2282579)
chr7 (39-123)||(4691765-4691849)
chr7 (81-125)||(9177834-9177878)
chr7 (80-123)||(9744092-9744136)
chr7 (104-188)||(11772397-11772480)
chr7 (81-125)||(16091668-16091712)
chr7 (81-125)||(17017623-17017667)
chr7 (38-109)||(1868217-1868287)
chr7 (85-124)||(9033517-9033556)
chr7 (72-123)||(13745970-13746021)
chr7 (39-123)||(15139104-15139190)
chr7 (81-140)||(18203722-18203781)
chr7 (72-121)||(15120235-15120285)
chr7 (39-100)||(16056120-16056180)
chr7 (146-223)||(16462169-16462246)
chr7 (81-125)||(11525732-11525776)
chr7 (39-103)||(12256087-12256150)
chr7 (41-109)||(14044541-14044608)
chr7 (81-140)||(14044655-14044715)
chr7 (41-109)||(14354571-14354638)
chr7 (81-140)||(14354685-14354745)
chr7 (39-103)||(15008765-15008828)
chr7 (39-103)||(16219984-16220047)
chr7 (39-103)||(22072785-22072848)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (80-251)||(36509638-36509810)
chr5 (80-234)||(25250737-25250892)
chr5 (80-234)||(25314522-25314677)
chr5 (82-254)||(20469951-20470124)
chr5 (8-201)||(31454860-31455052)
chr5 (20-201)||(21555257-21555438)
chr5 (13-169)||(31455478-31455633)
chr5 (39-201)||(12122398-12122560)
chr5 (20-143)||(19920659-19920782)
chr5 (20-201)||(21557922-21558103)
chr5 (84-265)||(21406495-21406665)
chr5 (20-169)||(17875008-17875157)
chr5 (84-223)||(16227393-16227534)
chr5 (80-225)||(10953023-10953168)
chr5 (82-169)||(25743632-25743719)
chr5 (39-106)||(21309011-21309078)
chr5 (80-140)||(15796329-15796389)
chr5 (39-123)||(20198711-20198797)
chr5 (56-169)||(5889461-5889579)
chr5 (82-179)||(25578146-25578242)
chr5 (39-123)||(26749001-26749086)
chr5 (80-123)||(8504700-8504743)
chr5 (72-154)||(8834106-8834189)
chr5 (80-123)||(14026867-14026910)
chr5 (80-146)||(20565466-20565533)
chr5 (80-123)||(25742880-25742923)
chr5 (72-123)||(26761474-26761525)
chr5 (56-169)||(21741843-21741961)
chr5 (82-188)||(25575764-25575869)
chr5 (80-146)||(29914343-29914409)
chr5 (111-208)||(33895855-33895949)
chr5 (38-103)||(22143838-22143902)
chr5 (201-267)||(19920812-19920880)
chr5 (81-140)||(21731612-21731671)
chr5 (81-140)||(21809732-21809791)
chr5 (82-188)||(25574571-25574676)
chr5 (131-223)||(29447839-29447929)
chr5 (39-103)||(20027207-20027270)
chr5 (86-146)||(21618958-21619018)
chr5 (133-220)||(22107632-22107717)
chr5 (149-225)||(23200414-23200490)
chr5 (131-220)||(17010849-17010937)
chr5 (81-124)||(21330512-21330555)
chr5 (80-122)||(16605390-16605432)
chr5 (82-120)||(23469713-23469751)
chr5 (79-125)||(26733000-26733046)
chr5 (39-100)||(15796214-15796273)
chr5 (72-125)||(21401897-21401950)
chr5 (81-122)||(23202699-23202740)
chr5 (82-125)||(6551462-6551506)
chr5 (215-254)||(8952875-8952915)
chr5 (81-125)||(26740813-26740857)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (21-267)||(17318928-17319177)
chr6 (13-211)||(18708437-18708636)
chr6 (20-124)||(23017094-23017198)
chr6 (20-201)||(20734323-20734504)
chr6 (20-123)||(19444250-19444354)
chr6 (20-115)||(16133649-16133744)
chr6 (80-239)||(16245243-16245402)
chr6 (80-251)||(31735752-31735915)
chr6 (81-220)||(19656210-19656347)
chr6 (80-188)||(20136577-20136685)
chr6 (80-188)||(22196184-22196292)
chr6 (85-225)||(19829807-19829948)
chr6 (74-169)||(27323577-27323672)
chr6 (80-169)||(23528226-23528315)
chr6 (80-223)||(20411639-20411783)
chr6 (80-223)||(23083140-23083282)
chr6 (83-179)||(15895839-15895935)
chr6 (80-193)||(18260102-18260216)
chr6 (84-226)||(22212363-22212506)
chr6 (81-186)||(17105602-17105707)
chr6 (140-267)||(31733825-31733954)
chr6 (85-169)||(23538580-23538664)
chr6 (81-187)||(17743109-17743213)
chr6 (80-151)||(18203987-18204058)
chr6 (80-167)||(22376811-22376897)
chr6 (80-163)||(23492219-23492302)
chr6 (80-163)||(23497817-23497900)
chr6 (102-169)||(31733740-31733807)
chr6 (108-211)||(23151182-23151286)
chr6 (81-144)||(27573248-27573311)
chr6 (81-220)||(15705641-15705779)
chr6 (80-151)||(18177813-18177884)
chr6 (201-267)||(27126283-27126351)
chr6 (56-169)||(25956923-25957041)
chr6 (80-125)||(17229823-17229868)
chr6 (148-225)||(24551136-24551213)
chr6 (81-154)||(20078307-20078382)
chr6 (82-146)||(23500700-23500764)
chr6 (201-267)||(7825824-7825892)
chr6 (201-267)||(15891509-15891577)
chr6 (80-121)||(27126446-27126487)
chr6 (32-80)||(27326767-27326815)
chr6 (32-80)||(27387507-27387555)
chr6 (81-125)||(33442956-33443000)
chr6 (86-125)||(7825694-7825733)
chr6 (81-140)||(16493057-16493116)
chr6 (39-123)||(21680805-21680891)
chr6 (39-123)||(25920659-25920745)
chr6 (131-223)||(18913780-18913871)
chr6 (131-223)||(18937038-18937129)
chr6 (80-121)||(22556241-22556282)
chr6 (81-138)||(23076640-23076697)
chr6 (20-72)||(31733692-31733744)
chr6 (131-220)||(15174295-15174383)
chr6 (72-123)||(18458110-18458161)
chr6 (81-124)||(19362335-19362378)
chr6 (80-123)||(28947500-28947543)
chr6 (41-123)||(6083714-6083799)
chr6 (81-154)||(18453091-18453166)
chr6 (81-138)||(20223853-20223910)
chr6 (81-138)||(22117837-22117894)
chr6 (81-138)||(35008058-35008115)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (80-265)||(19734349-19734538)
chr4 (80-267)||(19435583-19435773)
chr4 (20-211)||(19609268-19609460)
chr4 (20-169)||(15042086-15042236)
chr4 (20-169)||(15112188-15112338)
chr4 (20-169)||(35812396-35812545)
chr4 (80-239)||(50160061-50160220)
chr4 (84-251)||(20614-20783)
chr4 (39-225)||(32467149-32467334)
chr4 (86-254)||(21061582-21061752)
chr4 (78-169)||(10357399-10357490)
chr4 (184-265)||(3485074-3485158)
chr4 (20-161)||(33185896-33186037)
chr4 (30-146)||(3484975-3485091)
chr4 (80-254)||(15364971-15365140)
chr4 (108-251)||(15612054-15612199)
chr4 (80-223)||(13036620-13036764)
chr4 (80-225)||(9871424-9871570)
chr4 (121-267)||(10357242-10357391)
chr4 (80-220)||(19738149-19738288)
chr4 (80-223)||(27995813-27995955)
chr4 (80-225)||(51992573-51992717)
chr4 (80-169)||(16042922-16043011)
chr4 (80-203)||(9637868-9637992)
chr4 (82-220)||(53631454-53631590)
chr4 (34-115)||(46642570-46642655)
chr4 (80-146)||(40229495-40229562)
chr4 (39-100)||(10357533-10357593)
chr4 (201-267)||(42874977-42875045)
chr4 (39-154)||(19566919-19567036)
chr4 (80-154)||(40906820-40906894)
chr4 (80-154)||(46740138-46740212)
chr4 (80-125)||(11424996-11425041)
chr4 (201-254)||(11425132-11425184)
chr4 (80-125)||(16027039-16027084)
chr4 (80-125)||(16997569-16997614)
chr4 (195-267)||(33244061-33244135)
chr4 (203-267)||(37018778-37018844)
chr4 (80-123)||(12622441-12622484)
chr4 (201-267)||(16997705-16997773)
chr4 (81-188)||(32307098-32307204)
chr4 (206-267)||(14548809-14548872)
chr4 (201-239)||(25090831-25090869)
chr4 (80-137)||(33244129-33244187)
chr4 (56-211)||(15099050-15099211)
chr4 (80-125)||(25090695-25090740)
chr4 (70-123)||(25512571-25512624)
chr4 (80-125)||(42874841-42874886)
chr4 (80-125)||(55582286-55582331)
chr4 (81-124)||(13592273-13592316)
chr4 (56-131)||(13844304-13844384)
chr4 (81-140)||(14853026-14853085)
chr4 (81-124)||(15791593-15791636)
chr4 (81-124)||(15791682-15791725)
chr4 (80-123)||(26444879-26444921)
chr4 (39-123)||(26922680-26922766)
chr4 (56-169)||(361956-362074)
chr4 (82-140)||(14825379-14825437)
chr4 (131-220)||(17048332-17048419)
chr4 (56-169)||(19857283-19857401)
chr4 (72-125)||(17958367-17958420)
chr4 (80-124)||(2425563-2425607)
chr4 (39-103)||(12288477-12288540)
chr4 (104-152)||(14650637-14650685)
chr4 (39-103)||(14928004-14928067)
chr4 (39-103)||(46640684-46640747)
chr4 (39-102)||(14118-14180)
chr4 (80-123)||(46225559-46225601)
chr4 (39-117)||(44024454-44024532)
chr4 (82-115)||(14507624-14507657)
chr4 (84-125)||(17333189-17333230)
chr4 (131-210)||(13592133-13592210)
chr4 (80-123)||(35659731-35659775)
chr4 (93-125)||(37018653-37018685)
chr4 (39-103)||(52243462-52243525)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (20-254)||(5214862-5215095)
chr3 (20-267)||(41173177-41173427)
chr3 (20-254)||(5206476-5206711)
chr3 (20-267)||(14507848-14508097)
chr3 (82-267)||(45531427-45531616)
chr3 (80-267)||(16728339-16728529)
chr3 (20-239)||(15932343-15932562)
chr3 (80-267)||(14153276-14153466)
chr3 (20-169)||(17519864-17520013)
chr3 (20-169)||(17534726-17534875)
chr3 (20-169)||(40811755-40811904)
chr3 (20-211)||(40806940-40807132)
chr3 (80-239)||(50348939-50349099)
chr3 (48-251)||(13516366-13516565)
chr3 (85-223)||(42353459-42353598)
chr3 (39-211)||(22307499-22307672)
chr3 (20-211)||(30175430-30175622)
chr3 (39-169)||(17538070-17538200)
chr3 (80-254)||(20417130-20417305)
chr3 (20-169)||(15447906-15448055)
chr3 (20-201)||(31224831-31225012)
chr3 (80-245)||(16044424-16044590)
chr3 (80-245)||(16059283-16059449)
chr3 (21-123)||(17044041-17044143)
chr3 (86-267)||(10562772-10562949)
chr3 (78-242)||(16049898-16050063)
chr3 (80-251)||(19569151-19569320)
chr3 (80-223)||(37427614-37427757)
chr3 (80-225)||(12512676-12512821)
chr3 (80-225)||(14642408-14642552)
chr3 (20-201)||(31415203-31415379)
chr3 (80-237)||(17693131-17693290)
chr3 (32-125)||(13031727-13031821)
chr3 (41-125)||(13026638-13026723)
chr3 (20-123)||(17548519-17548623)
chr3 (84-251)||(11886502-11886670)
chr3 (80-225)||(37037868-37038012)
chr3 (86-225)||(6158453-6158591)
chr3 (80-169)||(46751959-46752049)
chr3 (80-193)||(6155694-6155807)
chr3 (42-142)||(12269265-12269371)
chr3 (81-184)||(15565533-15565634)
chr3 (201-264)||(19884332-19884397)
chr3 (81-154)||(9577534-9577609)
chr3 (201-267)||(35065386-35065454)
chr3 (80-154)||(11192007-11192081)
chr3 (81-193)||(323966-324076)
chr3 (68-211)||(1465669-1465818)
chr3 (201-254)||(2842274-2842326)
chr3 (201-254)||(44269707-44269759)
chr3 (81-137)||(18700651-18700707)
chr3 (82-125)||(2842417-2842460)
chr3 (56-142)||(20630417-20630509)
chr3 (201-267)||(35353777-35353845)
chr3 (201-239)||(11258645-11258683)
chr3 (80-122)||(14519411-14519453)
chr3 (84-146)||(17259170-17259232)
chr3 (81-193)||(43889905-43890016)
chr3 (80-125)||(19884488-19884533)
chr3 (86-163)||(24545691-24545768)
chr3 (80-125)||(35065545-35065590)
chr3 (84-164)||(42327236-42327316)
chr3 (39-103)||(17661141-17661204)
chr3 (161-225)||(42325079-42325143)
chr3 (81-140)||(316029-316088)
chr3 (81-124)||(15206844-15206887)
chr3 (80-125)||(17207190-17207236)
chr3 (13-63)||(31415131-31415181)
chr3 (128-220)||(324067-324157)
chr3 (80-125)||(11258481-11258526)
chr3 (128-220)||(12469733-12469823)
chr3 (204-267)||(17519679-17519745)
chr3 (204-267)||(17534541-17534607)
chr3 (84-125)||(44269575-44269616)
chr3 (131-223)||(6805803-6805895)
chr3 (81-125)||(13919238-13919282)
chr3 (149-225)||(14250973-14251048)
chr3 (39-103)||(42386211-42386274)
chr3 (81-124)||(15245926-15245969)
chr3 (81-124)||(15265047-15265090)
chr3 (81-124)||(23318883-23318926)
chr3 (131-220)||(35961728-35961816)
chr3 (80-123)||(50756324-50756367)
chr3 (85-123)||(53646864-53646903)
chr3 (39-109)||(1644933-1645002)
chr3 (181-242)||(13179294-13179356)
chr3 (80-125)||(11562513-11562558)
chr3 (80-125)||(35353613-35353658)
chr3 (128-220)||(43889824-43889914)
chr3 (80-125)||(45804361-45804406)
chr3 (42-123)||(9512016-9512098)
chr3 (42-123)||(9519991-9520073)
chr3 (81-140)||(43925867-43925927)
chr3 (80-123)||(54331374-54331418)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (39-254)||(20084455-20084670)
chr8 (21-267)||(24713166-24713414)
chr8 (80-267)||(22259175-22259365)
chr8 (39-251)||(23947210-23947423)
chr8 (20-211)||(39936926-39937118)
chr8 (39-146)||(19127973-19128080)
chr8 (20-201)||(21580084-21580265)
chr8 (80-251)||(22244453-22244626)
chr8 (80-251)||(23888776-23888948)
chr8 (80-254)||(17907795-17907970)
chr8 (82-251)||(22584563-22584734)
chr8 (13-146)||(18760367-18760500)
chr8 (80-251)||(17217638-17217811)
chr8 (80-254)||(19699116-19699292)
chr8 (80-194)||(19929708-19929822)
chr8 (80-225)||(39695386-39695531)
chr8 (80-225)||(42266451-42266595)
chr8 (81-220)||(5760467-5760604)
chr8 (66-201)||(41680998-41681133)
chr8 (80-248)||(13665303-13665466)
chr8 (80-248)||(13724578-13724741)
chr8 (80-178)||(23669474-23669573)
chr8 (80-193)||(25849328-25849441)
chr8 (81-254)||(18302802-18302970)
chr8 (78-201)||(29763744-29763867)
chr8 (84-209)||(18833351-18833474)
chr8 (80-226)||(6102612-6102755)
chr8 (39-123)||(22318883-22318969)
chr8 (80-188)||(31723692-31723800)
chr8 (82-144)||(2419018-2419081)
chr8 (81-188)||(20502206-20502313)
chr8 (80-123)||(45471426-45471469)
chr8 (82-188)||(17086257-17086362)
chr8 (80-145)||(39695550-39695616)
chr8 (81-125)||(22253332-22253376)
chr8 (56-226)||(38550235-38550411)
chr8 (201-267)||(42818713-42818781)
chr8 (82-125)||(20179486-20179529)
chr8 (82-125)||(22381899-22381942)
chr8 (80-138)||(23418395-23418454)
chr8 (41-123)||(17979457-17979541)
chr8 (80-125)||(42818863-42818908)
chr8 (30-74)||(41681680-41681724)
chr8 (80-147)||(9225-9292)
chr8 (80-123)||(20025250-20025293)
chr8 (201-267)||(20179327-20179395)
chr8 (80-123)||(21513354-21513397)
chr8 (72-146)||(22207271-22207346)
chr8 (80-123)||(22473595-22473638)
chr8 (81-124)||(22995751-22995794)
chr8 (81-124)||(28397458-28397501)
chr8 (80-163)||(36728242-36728325)
chr8 (81-124)||(37515435-37515478)
chr8 (56-169)||(13428344-13428462)
chr8 (86-123)||(36733581-36733618)
chr8 (84-125)||(38988406-38988447)
chr8 (84-125)||(39019503-39019544)
chr8 (57-169)||(39833687-39833804)
chr8 (72-123)||(6573986-6574038)
chr8 (149-225)||(23418447-23418523)
chr8 (81-188)||(22963517-22963623)
chr8 (39-105)||(25849492-25849557)
chr8 (56-142)||(27472616-27472708)
chr8 (80-123)||(36405975-36406018)
chr8 (82-125)||(40493179-40493222)
chr8 (56-98)||(1323453-1323495)
chr8 (81-122)||(5083324-5083365)
chr8 (39-104)||(19698999-19699063)
chr8 (80-123)||(18815925-18815969)
chr8 (80-123)||(18819845-18819889)
chr8 (86-138)||(19155042-19155094)
chr8 (39-103)||(20498354-20498417)
chr8 (82-138)||(22419567-22419623)
chr8 (81-140)||(24352930-24352990)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (20-267)||(57744-57994)
[»] chr1 (69 HSPs)
chr1 (13-267)||(20634441-20634689)
chr1 (85-265)||(7052860-7053045)
chr1 (32-267)||(20587686-20587924)
chr1 (32-267)||(20592224-20592462)
chr1 (86-265)||(38887932-38888107)
chr1 (20-211)||(48300807-48300999)
chr1 (20-145)||(35088461-35088586)
chr1 (80-242)||(51476027-51476191)
chr1 (86-250)||(45754513-45754678)
chr1 (30-201)||(51274465-51274636)
chr1 (80-225)||(38057509-38057653)
chr1 (82-234)||(13301841-13301994)
chr1 (80-254)||(42696771-42696947)
chr1 (13-146)||(14238484-14238617)
chr1 (84-225)||(24726379-24726520)
chr1 (80-223)||(8276850-8276993)
chr1 (20-123)||(13528762-13528866)
chr1 (184-265)||(14238417-14238501)
chr1 (78-169)||(41227653-41227744)
chr1 (81-193)||(23967625-23967735)
chr1 (81-193)||(48520243-48520353)
chr1 (80-187)||(22349647-22349753)
chr1 (128-254)||(11809358-11809485)
chr1 (84-140)||(16381096-16381152)
chr1 (39-123)||(18120566-18120652)
chr1 (201-267)||(19675929-19675997)
chr1 (129-243)||(23073050-23073165)
chr1 (56-169)||(41305889-41306007)
chr1 (80-125)||(4596810-4596855)
chr1 (80-125)||(20241871-20241916)
chr1 (201-267)||(21046855-21046923)
chr1 (81-125)||(22124194-22124238)
chr1 (201-267)||(42912228-42912296)
chr1 (80-225)||(1642490-1642635)
chr1 (201-239)||(16059150-16059188)
chr1 (81-154)||(20316365-20316439)
chr1 (56-169)||(28194751-28194869)
chr1 (80-154)||(44891633-44891707)
chr1 (80-125)||(42912092-42912137)
chr1 (41-119)||(51323326-51323406)
chr1 (206-254)||(4596667-4596714)
chr1 (84-188)||(52954432-52954535)
chr1 (80-146)||(17903995-17904062)
chr1 (131-210)||(20316470-20316549)
chr1 (86-125)||(21240189-21240228)
chr1 (80-123)||(24720763-24720806)
chr1 (41-125)||(28477678-28477764)
chr1 (56-142)||(43542819-43542911)
chr1 (84-125)||(16059279-16059320)
chr1 (80-125)||(19675793-19675838)
chr1 (67-131)||(20636617-20636686)
chr1 (56-139)||(35982010-35982099)
chr1 (39-123)||(7321900-7321986)
chr1 (80-123)||(14793392-14793435)
chr1 (131-220)||(29764478-29764566)
chr1 (131-193)||(7321803-7321865)
chr1 (81-115)||(14800438-14800472)
chr1 (81-115)||(14809312-14809346)
chr1 (39-109)||(21753839-21753908)
chr1 (56-169)||(46382857-46382975)
chr1 (39-109)||(50614377-50614446)
chr1 (39-109)||(50622205-50622274)
chr1 (128-220)||(48520344-48520434)
chr1 (72-123)||(12709631-12709683)
chr1 (41-109)||(41050296-41050363)
chr1 (42-123)||(45495995-45496078)
chr1 (82-125)||(50614285-50614329)
chr1 (82-125)||(50622113-50622157)
chr1 (41-105)||(51475951-51476014)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (80-267)||(47374-47564)
scaffold0042 (80-265)||(28329-28519)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (85-265)||(1078-1263)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (39-254)||(145750-145966)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (86-254)||(10897613-10897779)
chr2 (20-211)||(24781756-24781948)
chr2 (20-211)||(5032240-5032432)
chr2 (39-226)||(6576176-6576364)
chr2 (21-211)||(22689625-22689816)
chr2 (21-211)||(22694221-22694412)
chr2 (20-169)||(24883406-24883555)
chr2 (20-169)||(9974869-9975018)
chr2 (20-142)||(24435997-24436119)
chr2 (20-140)||(19202127-19202247)
chr2 (80-233)||(19357996-19358142)
chr2 (80-265)||(14693275-14693451)
chr2 (80-254)||(27851630-27851805)
chr2 (80-254)||(44071543-44071718)
chr2 (80-225)||(25045054-25045199)
chr2 (30-125)||(26896264-26896360)
chr2 (20-138)||(7672436-7672555)
chr2 (20-123)||(6478254-6478358)
chr2 (80-251)||(5985141-5985306)
chr2 (39-112)||(356978-357051)
chr2 (20-226)||(21367797-21367996)
chr2 (80-225)||(18389155-18389299)
chr2 (20-103)||(24865786-24865869)
chr2 (80-203)||(25140948-25141071)
chr2 (121-265)||(9975026-9975172)
chr2 (80-223)||(24815536-24815679)
chr2 (80-254)||(27860345-27860511)
chr2 (78-169)||(22500841-22500932)
chr2 (78-169)||(22508775-22508866)
chr2 (80-223)||(24834937-24835080)
chr2 (20-89)||(20913051-20913120)
chr2 (86-223)||(20915115-20915252)
chr2 (81-178)||(34136849-34136946)
chr2 (201-267)||(28653308-28653376)
chr2 (201-266)||(24515364-24515431)
chr2 (80-201)||(24865647-24865768)
chr2 (80-125)||(3538816-3538861)
chr2 (82-123)||(18391268-18391309)
chr2 (201-254)||(36839352-36839404)
chr2 (32-100)||(23969684-23969752)
chr2 (201-267)||(17306665-17306733)
chr2 (78-125)||(21316759-21316806)
chr2 (81-179)||(26392292-26392389)
chr2 (78-123)||(21336663-21336708)
chr2 (80-125)||(36839216-36839261)
chr2 (195-239)||(23969459-23969502)
chr2 (81-140)||(21115649-21115708)
chr2 (78-113)||(23969606-23969641)
chr2 (81-124)||(43947534-43947577)
chr2 (81-154)||(22252625-22252700)
chr2 (190-251)||(27485295-27485356)
chr2 (72-125)||(22685900-22685953)
chr2 (80-125)||(28653467-28653511)
chr2 (39-103)||(18787169-18787232)
chr2 (72-123)||(25085506-25085558)
chr2 (80-123)||(1384735-1384778)
chr2 (81-124)||(18547115-18547158)
chr2 (81-140)||(21237664-21237723)
chr2 (31-154)||(22258963-22259087)
chr2 (39-109)||(25108709-25108778)
chr2 (84-125)||(17306533-17306574)
chr2 (39-103)||(22413403-22413466)
chr2 (81-140)||(24697759-24697819)
chr2 (85-125)||(25587690-25587730)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (20-211)||(9218-9410)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (20-211)||(9674-9866)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (20-169)||(76695-76844)
scaffold0001 (82-223)||(446396-446536)
scaffold0001 (39-109)||(160476-160545)
scaffold0001 (84-154)||(497337-497410)
[»] scaffold0170 (2 HSPs)
scaffold0170 (80-223)||(2574-2718)
scaffold0170 (81-154)||(2865-2940)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (80-267)||(10718-10901)
[»] scaffold0737 (3 HSPs)
scaffold0737 (39-201)||(6554-6716)
scaffold0737 (121-267)||(5519-5667)
scaffold0737 (39-103)||(2064-2127)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (20-225)||(95275-95481)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (20-169)||(10185-10334)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (20-149)||(78289-78418)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (80-254)||(20699-20874)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (80-265)||(11219-11407)
scaffold0439 (80-123)||(3508-3551)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (20-169)||(78030-78179)
scaffold0047 (82-140)||(22189-22247)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (50-169)||(2795-2914)
scaffold0507 (39-91)||(2942-2994)
scaffold0507 (39-109)||(8320-8389)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (80-223)||(556-700)
scaffold1539 (81-154)||(847-922)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (80-239)||(4630-4789)
scaffold0379 (80-236)||(14679-14835)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (20-169)||(14134-14283)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (37-138)||(2886-2987)
scaffold0371 (80-242)||(16656-16819)
scaffold0371 (72-123)||(11251-11303)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (84-226)||(791-934)
scaffold0083 (84-226)||(6095-6238)
scaffold0083 (82-226)||(11562-11707)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (30-169)||(59512-59651)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (84-210)||(60313-60439)
scaffold0075 (39-102)||(53816-53878)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (80-252)||(3319-3492)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (80-254)||(127242-127418)
scaffold0010 (81-125)||(556-600)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (20-146)||(849-975)
scaffold0109 (184-265)||(782-866)
scaffold0109 (184-265)||(6085-6169)
[»] scaffold0077 (5 HSPs)
scaffold0077 (20-146)||(33404-33530)
scaffold0077 (80-227)||(14125-14272)
scaffold0077 (184-265)||(33513-33597)
scaffold0077 (86-177)||(2962-3053)
scaffold0077 (81-140)||(55835-55894)
[»] scaffold1633 (2 HSPs)
scaffold1633 (20-146)||(262-388)
scaffold1633 (184-251)||(371-438)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (20-146)||(10849-10975)
scaffold0546 (184-265)||(7138-7222)
scaffold0546 (184-265)||(10958-11042)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (84-242)||(2771-2930)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (80-254)||(24215-24390)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (86-254)||(284-453)
scaffold0409 (86-254)||(8539-8708)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (84-220)||(10497-10635)
scaffold0107 (82-125)||(36090-36133)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (39-201)||(1379-1541)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (82-251)||(17463-17633)
scaffold0220 (80-225)||(12996-13140)
scaffold0220 (82-225)||(15816-15958)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (80-225)||(53492-53637)
scaffold0065 (80-223)||(54920-55064)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (82-242)||(950-1109)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (20-123)||(605-709)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (80-223)||(11046-11189)
scaffold0040 (80-223)||(22146-22289)
scaffold0040 (80-125)||(102061-102106)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (80-242)||(136454-136617)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (80-245)||(20855-21021)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (37-225)||(5423-5611)
scaffold0108 (80-123)||(7876-7919)
scaffold0108 (81-125)||(3166-3210)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-123)||(41193-41297)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (80-188)||(75934-76042)
scaffold0054 (80-123)||(65943-65986)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (80-223)||(11666-11809)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (54-195)||(19327-19469)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (84-205)||(63051-63173)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (80-225)||(397545-397690)
scaffold0002 (39-105)||(397429-397494)
scaffold0002 (181-242)||(127632-127694)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (84-223)||(39169-39309)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (80-245)||(109223-109382)
scaffold0004 (84-140)||(332230-332286)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (80-169)||(5943-6032)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (82-220)||(1448-1584)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (80-225)||(19502-19645)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (80-223)||(7510-7653)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (119-267)||(263-411)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (82-179)||(113562-113654)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (80-188)||(13011-13118)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (84-254)||(66076-66238)
scaffold0056 (72-123)||(15678-15729)
[»] scaffold0111 (5 HSPs)
scaffold0111 (78-140)||(7338-7400)
scaffold0111 (78-140)||(14457-14519)
scaffold0111 (201-267)||(13340-13408)
scaffold0111 (201-267)||(19607-19675)
scaffold0111 (80-125)||(19766-19811)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (80-220)||(15365-15502)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (80-137)||(19094-19151)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (85-152)||(1460-1528)
scaffold0241 (80-143)||(4622-4686)
scaffold0241 (39-105)||(1339-1404)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (56-167)||(46980-47095)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (81-193)||(125676-125787)
scaffold0011 (81-179)||(38265-38364)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (38-123)||(15938-16023)
scaffold0123 (81-140)||(25016-25076)
[»] scaffold1662 (2 HSPs)
scaffold1662 (201-267)||(227-295)
scaffold1662 (80-125)||(386-431)
[»] scaffold1223 (1 HSPs)
scaffold1223 (80-163)||(100-183)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (85-163)||(7406-7485)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (80-154)||(7460-7534)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (56-169)||(44086-44204)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (80-125)||(10879-10924)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (201-265)||(1658-1724)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (85-125)||(18335-18375)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (81-125)||(8070-8114)
scaffold0074 (82-125)||(616-659)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (56-226)||(106266-106442)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (39-123)||(3749-3834)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (82-125)||(17413-17456)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (39-123)||(7439-7525)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (82-188)||(117089-117193)
scaffold0034 (39-103)||(32325-32388)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (82-124)||(13713-13755)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (201-239)||(23574-23612)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (81-123)||(221376-221418)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (202-239)||(233-270)
[»] scaffold0505 (2 HSPs)
scaffold0505 (80-125)||(3729-3774)
scaffold0505 (80-123)||(1718-1761)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (81-154)||(7565-7638)
scaffold0278 (131-220)||(7669-7758)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (114-223)||(24973-25080)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (42-146)||(64931-65036)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (81-122)||(142490-142531)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (81-154)||(10072-10147)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (90-201)||(10759-10870)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (85-125)||(25771-25811)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (81-124)||(1609-1652)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (130-225)||(8164-8258)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (39-123)||(378-464)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (80-123)||(18132-18175)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (39-123)||(1848-1934)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (72-123)||(56093-56144)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (81-124)||(17086-17129)
scaffold0046 (81-124)||(26198-26241)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (80-123)||(25655-25698)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (82-140)||(911-969)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (66-169)||(107-214)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (56-169)||(2746-2864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (108-142)||(7631-7665)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (66-169)||(23686-23793)
scaffold0230 (66-131)||(20793-20863)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (82-140)||(14272-14330)
scaffold0005 (104-152)||(166607-166655)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (81-138)||(2567-2624)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (38-103)||(16329-16393)
[»] scaffold1256 (1 HSPs)
scaffold1256 (67-123)||(345-400)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (131-225)||(10345-10438)
scaffold0462 (72-123)||(420-472)
scaffold0462 (72-123)||(5926-5978)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (149-201)||(884-936)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (39-103)||(27978-28041)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (81-125)||(206692-206736)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (81-125)||(106192-106236)
scaffold0006 (82-125)||(96915-96958)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (83-122)||(18752-18791)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (80-123)||(34336-34379)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (81-124)||(57726-57769)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (80-123)||(61797-61840)
[»] scaffold1695 (1 HSPs)
scaffold1695 (80-146)||(430-496)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (39-125)||(7903-7989)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (82-124)||(19816-19858)
scaffold0106 (81-109)||(19906-19934)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (82-124)||(4864-4906)
[»] scaffold0645 (1 HSPs)
scaffold0645 (80-125)||(137-182)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (81-141)||(13834-13895)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (84-125)||(1807-1847)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (90-123)||(17332-17365)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (84-125)||(49083-49124)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (82-123)||(3981-4022)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (39-103)||(825-888)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (39-103)||(877-940)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (39-103)||(44394-44457)
scaffold0022 (39-103)||(78115-78178)


Alignment Details
Target: scaffold0207 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15501 - 15314
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15501 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcgacaacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaa 15402  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15401 caacttacgacttgacaaatttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacatcaacatacaacaactt 15314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18875961 - 18875731
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875961 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 18875862  T
Q  139 gacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat 238  Q
     ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875861 aacaacatcaacaatttatatcactccaatatcttggaacaacaacttataacttgacaattttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat 18875762  T
Q  239 aacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
     ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  18875761 -acagcagagacaacaacatacaacaacttca 18875731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 43277821 - 43277631
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43277821 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatattttggaac 43277722  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagac---aacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  43277721 aacaacttacaacttgacaactttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacagtaacatacaacaacttca 43277631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46387151 - 46387021
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46387151 agggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 46387052  T
Q  139 gacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
     |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  46387051 aacaacttagacatctcatatgactccaata 46387021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37785361 - 37785171
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37785361 acagagcatcaaaccctcaactttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaactcatgtgactccaatatcttggaac 37785262  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||   ||||||||||||||||||    
T  37785261 aacaacttacaacttgacaatcttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagtagagacagcaacatacaacaacttca 37785171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8852273 - 8852081
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852273 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaaaataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 8852174  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  8852173 ctcaatgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 8852081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 11066412 - 11066604
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11066412 catcaagccctcaacttacaaggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctcaacttaaaagagtatgcatgga 11066511  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  11066512 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 11066604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36686308 - 36686127
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36686308 catcaaaccctcaacttacaaggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 36686209  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  36686208 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 36686127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 4070777 - 4070952
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  4070777 acagggcatcaaaccctcaacatatatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatacgattccaatatcttggaaca 4070876  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4070877 acaacttacaactttgcaactttgaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacaacaaagacaaca 4070952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 11053682 - 11053857
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11053682 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtattcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaaaaacttatatgactcaaatatcttggaaca 11053781  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  11053782 acaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcatagacaaca 11053857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 59478 - 59308
Alignment:
Q  42 gcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagac 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  59478 gcatcaatcccacaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagcatgcatggactcaacgtcttacaacttaaac 59379  T
Q  142 aacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  59378 aacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Original strand, 3286978 - 3287162
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3286978 acagagcatcaagccatcaacttcaaatgagtatacattgactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaatttatatgactccaatatcttggaac 3287077  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  3287078 aacaacttacaacctgacaactttgactaacatatgaaacttaatgatttaataatcaat-acaacag---caacatacaacaacttca 3287162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13150644 - 13150524
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150644 catcaagccctcaacttacatggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 13150545  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13150544 ctcaacgtcttacaacttaga 13150524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Original strand, 20619229 - 20619349
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20619229 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatgga 20619328  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20619329 ctcaacgtcttacaacttaga 20619349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32434697 - 32434505
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32434697 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattaaagaacatcaagacctaaacttaaatgagtatgcatgga 32434598  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  32434597 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 32434505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 234
Target Start/End: Original strand, 15281313 - 15281468
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15281313 acagggcattaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacgacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaaca 15281412  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataat 234  Q
     |||||||| ||||  |||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15281413 acaacttacaactttgcaacttagaccgacacttgcaacttaatgatattaataat 15281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17130740 - 17130569
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17130740 ggcatcaaaccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttccaacttagacaacttcaacaacttatatgactctaatatcttggaacatca 17130641  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17130640 acttacaactt-acaacttagaccaacgcttgcaatttaaggatattaataatcaataacagtagagacaaca 17130569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Original strand, 48811845 - 48812075
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  48811845 catcaagccctcaacttacaggacatcaagccctcaacatgatatttataaatatacattacagggcatcaaactctcaacttaaatgagtatgcaatgg 48811944  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||||    
T  48811945 actcaacatcttacgactta-acaacttagatatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaac 48812043  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||||    |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  48812044 ttaa----ttaatattcaacaacaacagaggcaaca 48812075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30821295 - 30821133
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  30821295 agggcatcaagccctcaacataatatgtaaaaatatacattacatgacatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacgactt 30821196  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  30821195 a-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 30821133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 33001010 - 33001157
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  33001010 acagggcattaagccctcaactttatatgagtatgcatggactcagcaacttacaatttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttgaaac 33001109  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  33001110 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttacaacttaatgat 33001157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36705672 - 36705526
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  36705672 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacgactcccacaacttatatgactccaatatcttggaat 36705573  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | ||||| || |||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  36705572 aacaactcacaactttacaacttagaccaatacttgcaacttaatga 36705526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 38480031 - 38480212
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  38480031 catcaagccctcaacttacagggcatcaagcccccaacataatatgtataaatatatattacatggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatag 38480130  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    |||| || |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  38480131 actctacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 38480212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12128210 - 12128080
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || |    
T  12128210 agggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaac 12128111  T
Q  182 aacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    | ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  12128110 atcttacaacttaaacaacttcgaccaacat 12128080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17071290 - 17071146
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  17071290 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatgtactcaacaacgtacaacttaaacaactcca-caacttatatgactccaatatcttgaaat 17071192  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatg 224  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17071191 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatg 17071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10660257 - 10660117
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |      
T  10660257 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaac-tccacaacttatatgactccaatatcttgaa-- 10660161  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
       ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  10660160 ---aacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 10660117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 12371282 - 12371371
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  12371282 acagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaatgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 12371371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18075574 - 18075454
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||||||||| ||||  ||| | || |    
T  18075574 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaaacaacttagatatcttatatgactcaaataatttgaatcaac 18075475  T
Q  182 aacttacgacttgacaacttt 202  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  18075474 atcttacaacttgacaacttt 18075454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14183674 - 14183611
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaa 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14183674 acagggcatcaagccctcaagttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaaacaa 14183611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14220049 - 14219925
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| | |||  |||    
T  14220049 acagagcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatacgatttcaacaacttaaaac 14219950  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttg 203  Q
    | |||||||| ||||  ||||||||    
T  14219949 aacaacttacaacttagcaactttg 14219925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15096727 - 15096572
Alignment:
Q  40 gggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||  || | ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||    
T  15096727 gggcatcaagcccttaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcaataaccaacaactt 15096628  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||  |||| |||||||| ||||    
T  15096627 agacaacttcaacaacttatacgacttcaacaacttaaaacaacaacttacaactt 15096572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8136131 - 8136014
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaact 136  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |  ||||||    
T  8136131 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatagactcagcaaccaacaact 8136032  T
Q  137 tagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  8136031 tagacaacttcaataact 8136014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13133539 - 13133465
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13133539 acagggcatcaagccctcagcttaaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaact 13133465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 32301019 - 32301129
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||      
T  32301019 cagggcatcaagccctcaacttaaataaatatgcatagactcaacaacttacaacctggacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacga 32301116  T
Q  181 caacttacgactt 193  Q
    |||||||| ||||    
T  32301117 caacttacaactt 32301129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 131029 - 130985
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131029 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 130985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20253649 - 20253545
Alignment:
Q  43 catcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||| ||    
T  20253649 catcaaaccctcaacttaatatgtataattatacatttcagagcatcaagctctcaacttttaatgagtattcatggactcaacaaccaacaacttaaac 20253550  T
Q  142 aactt 146  Q
    |||||    
T  20253549 aactt 20253545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 38519281 - 38519325
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38519281 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 38519325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 20585534 - 20585602
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  20585534 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 20585602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19558309 - 19558243
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  19558309 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 19558243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 19282134 - 19282179
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19282134 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 19282179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48213928 - 48213815
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||  |||||||  |||||| ||| |||| ||| | ||| |||||    
T  48213928 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaactttaacaacttagacaacttatacgacttcaacaacttagaaca 48213829  T
Q  180 ccaacttacgactt 193  Q
     |||||||| ||||    
T  48213828 acaacttacaactt 48213815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 19282270 - 19282338
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  19282270 ttgacaaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 19282338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 44373990 - 44374033
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44373990 agggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 44374033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 44382855 - 44382898
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44382855 agggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 44382898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 46386961 - 46386893
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  46386961 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataattaat-acagcagagacagcaacatacaacaacttca 46386893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 48809532 - 48809489
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48809532 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcgtggactca 48809489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6170522 - 6170404
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  6170522 acatattatgtataaatatacattatagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 6170424  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  6170423 catctcttatgactccaata 6170404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13699756 - 13699710
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13699756 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaac 13699710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 146
Target Start/End: Original strand, 47094138 - 47094200
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  47094138 ggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 47094200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12466134 - 12466068
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  12466134 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttattaatcaat-acagcagagacagcaacatacaacaactt 12466068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12466270 - 12466225
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12466270 acagggcatcaaaccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 12466225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15576966 - 15576925
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15576966 agggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 15576925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 20585398 - 20585443
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20585398 acagggcatcaagccatcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 20585443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 42461861 - 42461902
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42461861 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatacatggactcaac 42461902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11769126 - 11769039
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||    
T  11769126 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaata 11769039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 16996131 - 16996171
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16996131 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggact 16996171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22001283 - 22001196
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22001283 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagagcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggactca 22001196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14153936 - 14153885
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14153936 tatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgattatgcatggactca 14153885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Original strand, 15139225 - 15139332
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-tta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| |  |  |||||||||| ||| |||    
T  15139225 acaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacaacttagaacaacaacttacaacttaacgactttgacaataacttgcaacttaacgatatta 15139324  T
Q  230 ataatcaa 237  Q
    ||||||||    
T  15139325 ataatcaa 15139332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 17232330 - 17232422
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagaca 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17232330 acatattatgtataaatatacattacatagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttagaca 17232422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24270862 - 24270776
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24270862 agggcatcaagccctcaactttatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactca 24270776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 25941350 - 25941436
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25941350 agggcatcaagccctcaactttatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactca 25941436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37727957 - 37727865
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagaca 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37727957 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagctctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttagaca 37727865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 63
Target Start/End: Original strand, 38479966 - 38480009
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataata 63  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38479966 catcaaaccctcaacttacagggcatcaaaccctcaacataata 38480009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Original strand, 43747414 - 43747492
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgca 115  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43747414 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgca 43747492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 44374124 - 44374192
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  44374124 ttgaccaacatatgcaacttaattatttaataatcaat-acagcaaagacaacaacatacaacaacttca 44374192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 44382989 - 44383057
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  44382989 ttgaccaacatatgcaacttaattatttaataatcaat-acagcaaagacaacaacatacaacaacttca 44383057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45848043 - 45847951
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagaca 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  45848043 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcagcatcttaacaacttagaca 45847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 709489 - 709370
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaa 230  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||||||||    ||||    
T  709489 acaacttggtcaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacaacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaa----ttaa 709394  T
Q  231 taatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    || |||| |||||||||| |||||    
T  709393 tattcaacaacaacagaggcaaca 709370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9390116 - 9389998
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||  |    
T  9390116 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaatatcttaacagctta-acaacttaga 9390018  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  9390017 catctcttatgactccaata 9389998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 16077417 - 16077483
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  16077417 acagggcatcaaacccttaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 16077483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14161880 - 14161835
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14161880 acagggcatcaagccctcaatgtaaatgattatgcatggactcaac 14161835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2282579 - 2282516
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2282579 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 2282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4691849 - 4691765
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4691849 agggcatcaagcccccaactttatatgaatgattatacattccagagcatcaagccctcaactttaataattatgcatggactca 4691765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9177878 - 9177834
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9177878 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 9177834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9744136 - 9744092
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9744136 acagggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggactca 9744092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11772480 - 11772397
Alignment:
Q  104 aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttac 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||  |||||||| || |||||    
T  11772480 aatgagtatgcatggactcaacatcttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaataatttggaacaacatcttac 11772397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 16091668 - 16091712
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16091668 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 16091712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17017667 - 17017623
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17017667 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 17017623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1868287 - 1868217
Alignment:
Q  38 tagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1868287 tagggcattaagccctcaacatattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 1868217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9033556 - 9033517
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9033556 gcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 9033517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13746021 - 13745970
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  13746021 tatacattccagagcatcaagccctcaactttaataattatgcatggactca 13745970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 15139104 - 15139190
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  |  | ||||||||  ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15139104 agggcatcaagccctcaacttaatatgaaggattatacattcaacaaggcatcaaaccctcgactttaatgagtatgcatggactca 15139190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 18203722 - 18203781
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18203722 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcgtggactcaacaacttacatcttaga 18203781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15120285 - 15120235
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggact 121  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15120285 tataaattccagagcatcaagccctcaacttaatatgagtatgcatggact 15120235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Original strand, 16056120 - 16056180
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaac 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16056120 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaac 16056180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 223
Target Start/End: Original strand, 16462169 - 16462246
Alignment:
Q  146 tcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16462169 tcaacaacttatatgactccaatactttggaacaacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 16462246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11525776 - 11525732
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11525776 cagggcatcaagggcccaacttgaatgagtatgcatggactcaac 11525732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12256150 - 12256087
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  12256150 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttctagggcatcaagccctcaactta 12256087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Original strand, 14044541 - 14044608
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14044541 ggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 14044608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 14044655 - 14044715
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14044655 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 14044715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Original strand, 14354571 - 14354638
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14354571 ggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 14354638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 14354685 - 14354745
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14354685 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 14354745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15008828 - 15008765
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15008828 agggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 15008765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16220047 - 16219984
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16220047 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattagtatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 16219984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 22072785 - 22072848
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22072785 agggaatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 22072848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36509810 - 36509638
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36509810 acagtgcatcaagccctcaacttcaaatgaatatgcatggactcaacgacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 36509711  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36509710 aacaacttacaacttgacaactttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaca 36509638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25250892 - 25250737
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25250892 acagggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaaca 25250793  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataat 234  Q
     |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25250792 acaacttacaactttacaacttagaccaacatttgcaacttaatgatattaataat 25250737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25314677 - 25314522
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25314677 acagggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaaca 25314578  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataat 234  Q
     |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25314577 acaacttacaactttacaacttagaccaacatttgcaacttaatgatattaataat 25314522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20470124 - 20469951
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  20470124 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacctacaacttagacaacttcaacaacttatacgactccagtattttggaacaac 20470025  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20470024 aacttacaactttgcaactttgaccaacatttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcaaagacaaca 20469951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 31454860 - 31455052
Alignment:
Q  8 aggagcacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatg 107  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31454860 aggatcacaggacatcaagccctcatcttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatg 31454959  T
Q  108 agtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  31454960 agtatgcatgaactcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 31455052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21555438 - 21555257
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21555438 catcaagccgtcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatatataaatatacattacagggtatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 21555339  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  21555338 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 21555257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 31455478 - 31455633
Alignment:
Q  13 cacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 112  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31455478 cacaggacatcaagccctcatcttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 31455577  T
Q  113 gcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31455578 gcatgaactcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaata 31455633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12122560 - 12122398
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12122560 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacaactt 12122461  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  12122460 a-acaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 12122398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 19920659 - 19920782
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920659 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaaaataatatgtataaatatacattacatgacatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 19920758  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  19920759 ctcaacgtcttacaacttaaacaa 19920782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21558103 - 21557922
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21558103 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 21558004  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  21558003 actcaacatctaacgactta-acaagttggacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 21557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21406665 - 21406495
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       
T  21406665 ggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaactcatgtgactccgatatcttggaaca--- 21406569  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  21406568 ------------acaactttgaccaacatatgcaactaaatgatttaataatcaataacagcagagacagcaacatacaacaactt 21406495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 17875008 - 17875157
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17875008 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 17875107  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  17875108 actcagcatcttacgactta-acaacttagacatcttatatgactccaata 17875157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Original strand, 16227393 - 16227534
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc---aacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16227393 ggcatcaaacccccaacttaaatgagtatgcatggactccacaacgtgt-acaatttggacaacatcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaa 16227491  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16227492 caacttaaaacttgacaactttgactaacatatgcaacttaat 16227534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 10953023 - 10953168
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaa-tgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10953023 acagggcagcaaaccctcaacttaaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacatcttagacaactcca-caacttatatgactccaatatcttggaat 10953121  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  10953122 atcaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 10953168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 169
Target Start/End: Original strand, 25743632 - 25743719
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  25743632 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacttcttacaacttaaacaacgtgaacatctcatatgactccaata 25743719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21309078 - 21309011
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaat 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21309078 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacatttcagggcatcaaaccctcaacttaaat 21309011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Original strand, 15796329 - 15796389
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15796329 acagggcatcaagccctaaacataaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaga 15796389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20198797 - 20198711
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20198797 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaaggactca 20198711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5889579 - 5889461
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  5889579 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 5889481  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  5889480 catctcttatgactccaata 5889461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25578242 - 25578146
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  25578242 agggcatcaagcccccaacgtgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaatattttggaaca 25578146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 26749001 - 26749086
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacat-aatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26749001 agggcatcaagccctcaactttaatataaatgattatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgattatgcatggactca 26749086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8504743 - 8504700
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8504743 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 8504700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8834189 - 8834106
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  8834189 tatacattccagaacatcaaaccctcaacttaatatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaact 8834106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14026910 - 14026867
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14026910 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 14026867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 20565466 - 20565533
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20565466 acagagcatcaaaccctcaactttaaatgagtatgcatggactcatcaacttacaacttagacaactt 20565533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 25742880 - 25742923
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25742880 acagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactca 25742923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 26761474 - 26761525
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26761474 tatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 26761525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21741961 - 21741843
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||  |    
T  21741961 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaattta-acaacttaga 21741863  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  21741862 catctcttatgactccaata 21741843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25575869 - 25575764
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||| |    
T  25575869 agggcatcaagcccccaatttgaatgagtatgcatggactcaacaacttaaatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaatattttggaacaac 25575771  T
Q  182 aacttac 188  Q
    | |||||    
T  25575770 atcttac 25575764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 29914343 - 29914409
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||    
T  29914343 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggacttagcaaccaacaacttagacaactt 29914409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33895949 - 33895855
Alignment:
Q  111 atgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaa 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||  || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33895949 atgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatca-caact--taagactccaatactttggaacaacaacttacgactttacaacttagaccaa 33895855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Original strand, 22143838 - 22143902
Alignment:
Q  38 tagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22143838 tagggcatcaaaccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 22143902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 19920812 - 19920880
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  19920812 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataaacaat-acagcagagacagcaacacacaacaacttca 19920880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21731671 - 21731612
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21731671 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 21731612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21809791 - 21809732
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21809791 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 21809732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25574676 - 25574571
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||| |    
T  25574676 agggcatcaagcccccaatttgaatgagtatgcatggattcaacaacttaaatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaatattttggaacaac 25574578  T
Q  182 aacttac 188  Q
    | |||||    
T  25574577 atcttac 25574571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 29447839 - 29447929
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  29447839 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaaagacaacttacaactttacaacttagaccaacacctgcaacttaat 29447929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20027270 - 20027207
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20027270 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 20027207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21619018 - 21618958
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  21619018 catcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 21618958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22107717 - 22107632
Alignment:
Q  133 aacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22107717 aacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaactttacaacttagaccaacacctgcaactt 22107632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23200490 - 23200414
Alignment:
Q  149 acaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  23200490 acaacttatatgactccaatatcttggattaacatcttacaactttacaacttagaccaactcttgcaacttaatga 23200414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Original strand, 17010849 - 17010937
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  17010849 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacggcaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaactt 17010937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21330555 - 21330512
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21330555 cagggcattaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 21330512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16605432 - 16605390
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16605432 acagggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactc 16605390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Original strand, 23469713 - 23469751
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 120  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23469713 agggcatcaagcccccaacttatatgagtatgcatggac 23469751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26733046 - 26733000
Alignment:
Q  79 tacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26733046 tacaggggatcaagcccgcaacatgaatgagtatgcatggactcaac 26733000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Original strand, 15796214 - 15796273
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15796214 agggcatcaagccctcaacataagag-tataaatatac-tcacagggcatcaagccctcaac 15796273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21401950 - 21401897
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21401950 tatacattccagagcgtcaagccctcaactttaatgattatgcatgggctcaac 21401897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23202740 - 23202699
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc 122  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23202740 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactc 23202699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6551506 - 6551462
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  6551506 agggcatcaagccctcaactttagataagtatgcatggactcaac 6551462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8952915 - 8952875
Alignment:
Q  215 caacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8952915 caacttaatgatattaataatcaacaacaacagagacaaca 8952875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26740857 - 26740813
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26740857 cagggcatcaagcccccaacatgaatgattatgcatggactcaac 26740813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17319177 - 17318928
Alignment:
Q  21 atcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17319177 atcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatatataaatatacattacattgcatcaagccctcaacttaaatgagtatacatggac 17319078  T
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaact 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  17319077 tcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgctact 17318978  T
Q  220 taatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  17318977 taatgatataataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 17318928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 18708437 - 18708636
Alignment:
Q  13 cacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 112  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18708437 cacagagcatcaagacctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatgtacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 18708536  T
Q  113 gcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  18708537 gcatggactcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 18708636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23017198 - 23017094
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23017198 catcaaaccctcaacttacagggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 23017099  T
Q  120 ctcaa 124  Q
    |||||    
T  23017098 ctcaa 23017094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20734504 - 20734323
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20734504 catcaaaccctcaacttacagggcattaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 20734405  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  20734404 actcaacatcttatgactta-acaacttagatatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 20734323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19444354 - 19444250
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19444354 catcaagccctcaacttacagggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 19444255  T
Q  119 actca 123  Q
    |||||    
T  19444254 actca 19444250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16133744 - 16133649
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgca 115  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16133744 catcaagccctcaacttacagggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgca 16133649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 16245243 - 16245402
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |  |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  16245243 acaggccatcaaaccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatggacaacttatatgaatccaatactttggaaca 16245342  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
     || ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16245343 acatcttacaacttaacaacatggactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 16245402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31735915 - 31735752
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31735915 acagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttataacttagacaactt---------atatgactccaatatcttggaaca 31735825  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
     |||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  31735824 acaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcagagaca 31735752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19656347 - 19656210
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||       
T  19656347 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaatga 19656250  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  19656249 caacttacaactttacaactttgaccaacacttgcaactt 19656210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 20136577 - 20136685
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||    
T  20136577 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttagacaacatcgacatcttatatgactccaacattttggaaca 20136676  T
Q  180 ccaacttac 188  Q
     || |||||    
T  20136677 acatcttac 20136685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22196292 - 22196184
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||    
T  22196292 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttagacaacatcgacatcttatatgactccaacattttggaaca 22196193  T
Q  180 ccaacttac 188  Q
     || |||||    
T  22196192 acatcttac 22196184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19829948 - 19829807
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||     
T  19829948 gcatcaagccctcaacttcaaataagtatgcatagactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacaacat 19829849  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  19829848 cttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 19829807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27323672 - 27323577
Alignment:
Q  74 tacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  27323672 tacattacagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgacgccaata 27323577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23528315 - 23528226
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||    
T  23528315 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgaactcaacatcttacaacttagacatcatgaacatcttatatgactccaata 23528226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20411783 - 20411639
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20411783 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaatttggacaacatcaacaacttatatgacttcaatactttggaac 20411684  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    | || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  20411683 aacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 20411639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23083282 - 23083140
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  23083282 acagggcattaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacg 23083184  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  23083183 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 23083140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Original strand, 15895839 - 15895935
Alignment:
Q  83 gggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15895839 gggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttggacaacatcgacaacttatatgactccaatactttggaaca 15895935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18260216 - 18260102
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtctt--acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18260216 acagggcatcaagccctcaacttaa-tgagtatgcatggactcaacaacgtgtacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaa 18260118  T
Q  178 caccaacttacgactt 193  Q
    || |||||||| ||||    
T  18260117 caacaacttacaactt 18260102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22212506 - 22212363
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||| |||||| || |||| ||||||| |  |||||||| | |    
T  22212506 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcgtggactcaacaacttacaacatgcacaacatcaacatcttatataactccaaaactttggaacaacga 22212407  T
Q  184 cttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  22212406 cttacaacttagacaacttagaccaacacttgcaactttatgat 22212363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 186
Target Start/End: Original strand, 17105602 - 17105707
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| | ||||||||| |||  |||||||  |||| |||     
T  17105602 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacgacgtagacaacgtaaacaactcaaatggttccaataatttgggacaa 17105701  T
Q  181 caactt 186  Q
    ||||||    
T  17105702 caactt 17105707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Original strand, 31733825 - 31733954
Alignment:
Q  140 acaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttga-caactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat 238  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733825 acaacttaaacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttaacaactt-gaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat 31733923  T
Q  239 aacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
     ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  31733924 -acagcagagacaacaacatacaacaacttca 31733954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 23538580 - 23538664
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||    
T  23538580 gcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttagacaacgtagacaactcaaatggttccaata 23538664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Original strand, 17743109 - 17743213
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||      
T  17743109 cagggcatcaagccctcaacttaaatgggtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacga 17743206  T
Q  181 caactta 187  Q
    |||||||    
T  17743207 caactta 17743213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Original strand, 18203987 - 18204058
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaaca 151  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  18203987 acagggcatcaaaccctcaacataaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttagaaaacctcaaca 18204058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22376897 - 22376811
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22376897 acagggcatcaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaagttatatgactccaa 22376811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23492302 - 23492219
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgact 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23492302 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatgaactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatatgact 23492219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23497900 - 23497817
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgact 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23497900 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatgaactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatatgact 23497817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Original strand, 31733740 - 31733807
Alignment:
Q  102 taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31733740 taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 31733807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23151286 - 23151182
Alignment:
Q  108 agtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgacc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  23151286 agtatgcatggactcaacgtcttacaacataaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacgacttaaacaacttagacc 23151187  T
Q  207 aacat 211  Q
    |||||    
T  23151186 aacat 23151182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27573311 - 27573248
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||    
T  27573311 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttggacaac 27573248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15705779 - 15705641
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaac-ttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| || |||| |  || ||||||||||  |||||||     
T  15705779 caggtcatcaagcccccaacttaaatgattatgcatggactcaacaacttacaactttggacaacatcgacaatt--taagactccaatactttggaacg 15705682  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
     |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  15705681 acaacttacaactttacaacttagaccaacacctgcaactt 15705641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18177884 - 18177813
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaaca 151  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18177884 acagggcatcaaaccctcaacataaatgagtatgcatgcactcaacatcttacaacgtagaaaacctcaaca 18177813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27126351 - 27126283
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  27126351 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acatcagagacagcaacatacaacaacttca 27126283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25957041 - 25956923
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  25957041 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 25956943  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  25956942 catctcttatgactccaata 25956923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17229868 - 17229823
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17229868 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatggatggactcaac 17229823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24551213 - 24551136
Alignment:
Q  148 aacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  24551213 aacaacttatatgactccaatatcttggaataacaacttacaactttacaacttaaaccaacacttgcaacttaatga 24551136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20078382 - 20078307
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtctt--acaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  20078382 caggacatcaagctctcaacttaaatgagtatgcatagactcaacaacttggacaacttagacaacatcaacaact 20078307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 23500700 - 23500764
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  23500700 agggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 23500764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 7825824 - 7825892
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  7825824 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttagtaatcaat-acagcagagacagcaacatacaacaacttca 7825892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15891577 - 15891509
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||   |||||||||||||||||||    
T  15891577 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-atagcagagacaacaacatacaacaacttca 15891509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27126487 - 27126446
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27126487 acagggcatcaagccctcaactcaaatgagtatgcatggact 27126446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27326815 - 27326767
Alignment:
Q  32 aacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatta 80  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27326815 aacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacatta 27326767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27387555 - 27387507
Alignment:
Q  32 aacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatta 80  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27387555 aacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacatta 27387507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 33442956 - 33443000
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33442956 cagggcatcaagcccccaacataaatgagtatgcatggactcaac 33443000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 125
Target Start/End: Original strand, 7825694 - 7825733
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7825694 catcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 7825733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 16493057 - 16493116
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16493057 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 16493116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21680891 - 21680805
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  21680891 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacatccaacagggcatcaagccctcaaatttaatgagtatgcaaggactca 21680805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 25920659 - 25920745
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25920659 agggcatcaagcccccaactttatatgaatgaatatacattcaacagggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactca 25920745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 18913780 - 18913871
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  18913780 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaacttaat 18913871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 18937038 - 18937129
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  18937038 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaacttaat 18937129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 121
Target Start/End: Original strand, 22556241 - 22556282
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22556241 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggact 22556282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Original strand, 23076640 - 23076697
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  23076640 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatctta 23076697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Original strand, 31733692 - 31733744
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaat 72  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31733692 catcaatccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaat 31733744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15174383 - 15174295
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15174383 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaactt 15174295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18458161 - 18458110
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18458161 tatacattctagagcatcaagccctcaactataatgagtatgcatggactca 18458110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 19362335 - 19362378
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19362335 cagggcataaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 19362378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 28947500 - 28947543
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28947500 acagggcatcaaacccccaactttaatgagtatgcatggactca 28947543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6083799 - 6083714
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagt-atgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||  || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  6083799 ggcatcaagcccgcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagccctcaactttaatgattaatgcatggactca 6083714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 18453091 - 18453166
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact---caacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||   ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  18453091 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactccacaacgt-gtacaacttggacaacatcaacaact 18453166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Original strand, 20223853 - 20223910
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  20223853 cagggcatcaagccccaaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatctta 20223910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Original strand, 22117837 - 22117894
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22117837 cagggcatcaagccccaaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatctta 22117894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Original strand, 35008058 - 35008115
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  35008058 caggccatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatctta 35008115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 265
Target Start/End: Original strand, 19734349 - 19734538
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19734349 acagagcatcaagccctcaacttccaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 19734448  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaa---catacaacaactt 265  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19734449 aacaacttacaacttgacaactttgaccatcatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaacaacatacaacaactt 19734538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19435773 - 19435583
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19435773 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatatcttggaac 19435674  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  19435673 aacaacttacaacttgacaaatttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 19435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 19609268 - 19609460
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19609268 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagtcctcaacttaaatgagtatgcatgga 19609367  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  19609368 ctcaacgtcttacagcttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 19609460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15042236 - 15042086
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15042236 catcaatccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 15042137  T
Q  120 ctcaacgtcttacaactt-agacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15042136 ctcaacgtcttacaacttaaaacaacttagacatctcatatgactccaata 15042086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 15112188 - 15112338
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15112188 catcaatccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 15112287  T
Q  120 ctcaacgtcttacaactt-agacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15112288 ctcaacgtcttacaacttaaaacaacttagacatctcatatgactccaata 15112338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35812545 - 35812396
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35812545 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacatgatatgtataaatatatattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 35812446  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  35812445 gtcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 35812396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 50160061 - 50160220
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| || |||||| |||||||  ||||||||    
T  50160061 acagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaaacaacatcgacagcttatatgaatccaatactttggaaca 50160160  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50160161 acttcttacaacttaacaactttgactaacatatgcaatttaatgatttaataatcaata 50160220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 20614 - 20783
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||    
T  20614 ggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatacctccaatatcttggaataacaa 20713  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaat--aatcaataacaacagagaca 251  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||| | ||  ||||||||||| ||||||||    
T  20714 cttacaactttacaacttagaccaacacttgcaattaaatgatattattaaatcaataacagcagagaca 20783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32467334 - 32467149
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatata-tataaatatacattacagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaact 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  32467334 agggcatcaagccctcaacata-tagagtataattatac-tcacagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaact 32467237  T
Q  137 tagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  32467236 tagacaactccat-aacttatatgactccaatatcttggaataacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 32467149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 21061582 - 21061752
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaac 184  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  21061582 catcaagccttcaactttaaaagagtatgcatggacttagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgaatccaatattttgaaacaacaac 21061681  T
Q  185 ttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21061682 ttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaacttaacgatattaataatcaataacagtagagacaaca 21061752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10357490 - 10357399
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  10357490 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 10357399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Original strand, 3485074 - 3485158
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaa---catacaacaactt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3485074 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaacaacatacaacaactt 3485158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 33185896 - 33186037
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33185896 catcaagccctcaacttacagagcatcaagccttcaatataatatgtataaatatacattacaggacatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 33185995  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatga 161  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  33185996 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatga 33186037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 3484975 - 3485091
Alignment:
Q  30 tcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtc 128  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3484975 tcaacatacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatc 3485074  T
Q  129 ttacaacttagacaactt 146  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  3485075 ttacgactt-gacaactt 3485091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 15364971 - 15365140
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15364971 acagggcatcaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaaca 15365069  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||||||||    |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  15365070 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaa----ttaatattcaacaacaacagaggcaaca 15365140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 251
Target Start/End: Original strand, 15612054 - 15612199
Alignment:
Q  108 agtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgacca 207  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| | |||||    
T  15612054 agtatgcatgggctcaacaacttacaacttagacaacttcaacatcttatatgactccaatatcttggagcatcaacttacaactttacaacctagacca 15612153  T
Q  208 acatatgcaacttaatgat-ttaat-aatcaataacaacagagaca 251  Q
    |||  ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15612154 acacttgcaattaaatgatattaataaatcaataacaccagagaca 15612199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13036764 - 13036620
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  13036764 acagggcatcaagccctcaacttcaaacgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaaattatatgactccaatactttggaac 13036665  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    | || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  13036664 aacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 13036620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9871570 - 9871424
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  9871570 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaccatcaacaacttatatgactccaatactttggaaa 9871471  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | || ||||| ||||   ||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  9871470 aacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgtaacttaatga 9871424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10357391 - 10357242
Alignment:
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttga-caactttgaccaacatatgcaact 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  10357391 tcaacatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaact 10357292  T
Q  220 taatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  10357291 taatgatttaataatcaat-acagcaaagacaacaacatacaacaacttca 10357242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 19738149 - 19738288
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  19738149 acagggcatcaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcgacaacttatatgactccaatactttggaaca 19738247  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||||||    
T  19738248 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaactt 19738288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 27995813 - 27995955
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  27995813 acagggcatcaagccctcaaatcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaata 27995911  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  27995912 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 27995955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 51992573 - 51992717
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||     
T  51992573 acagggcatcaatccctcaacttcaaatgagtatgcagggactcaacaacgtacaacttagacaac-tccacaacttatatga-tccaatatcttggaat 51992670  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | || ||||| || | ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  51992671 aacagcttacaaccttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 51992717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 16042922 - 16043011
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  16042922 acagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacatcttataccttagacaacatgaacatcttatatgactccaata 16043011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 9637868 - 9637992
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||| ||||    
T  9637868 acagagcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcaacaactgacaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacaacttagaac 9637967  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttg 203  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||    
T  9637968 aataacttacaacttagcaactttg 9637992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 53631590 - 53631454
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||   |    
T  53631590 agggcatgaagccatcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaaattacaacttggacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaatgac 53631493  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  53631492 aacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaactt 53631454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 115
Target Start/End: Original strand, 46642570 - 46642655
Alignment:
Q  34 cttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgca 115  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  46642570 cttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacttaaatgagtatgca 46642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 40229495 - 40229562
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  40229495 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaactt 40229562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10357593 - 10357533
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357593 agggcatcaaaccctcaacattatatgtataa-tatacattacagggcatcaagccctcaac 10357533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 42874977 - 42875045
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42874977 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-ataacagagacagcaacatacaacaacttca 42875045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19567036 - 19566919
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaact 136  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |  ||||||    
T  19567036 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacatccaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaaggactcagcaaccaacaact 19566937  T
Q  137 tagacaacttcaacaact 154  Q
    |  |||||||||||||||    
T  19566936 ttaacaacttcaacaact 19566919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 40906820 - 40906894
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||| |||||    
T  40906820 acagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatgaactcaacaacttacaacatggacaacatcatcaact 40906894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 46740138 - 46740212
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  46740138 acagggcatcaagcccccaactttaaagagtatgcatggactcagcagccaacaacttagacaacttcaacaact 46740212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 11424996 - 11425041
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11424996 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 11425041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 11425132 - 11425184
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11425132 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 11425184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16027084 - 16027039
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16027084 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 16027039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 16997569 - 16997614
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16997569 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 16997614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33244135 - 33244061
Alignment:
Q  195 acaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||||| |||||||    
T  33244135 acaactttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacatcaacatacaataacttca 33244061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 37018778 - 37018844
Alignment:
Q  203 gaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  37018778 gaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 37018844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 12622441 - 12622484
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12622441 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 12622484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 16997705 - 16997773
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  16997705 ttgaccaacatgtgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 16997773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32307204 - 32307098
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||| ||| ||||     
T  32307204 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaatattttgaaacaa 32307106  T
Q  181 caacttac 188  Q
    || |||||    
T  32307105 catcttac 32307098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 267
Target Start/End: Original strand, 14548809 - 14548872
Alignment:
Q  206 caacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14548809 caacaaatgcaacttaatgatttaataatcaat-acaacagagacagcaacatacaacaacttca 14548872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 239
Target Start/End: Original strand, 25090831 - 25090869
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25090831 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 25090869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33244187 - 33244129
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33244187 acagggcatcaagccctcaactttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaactt 33244129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Original strand, 15099050 - 15099211
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||  |    
T  15099050 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacattttaacaactta-acaacttaga 15099148  T
Q  150 caactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    || ||| |||||||| ||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  15099149 cagctcttatgactctaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 15099211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 25090695 - 25090740
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25090695 acagggcatcaagccctcaaagtaaatgagtatgcatggactcaac 25090740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Original strand, 25512571 - 25512624
Alignment:
Q  70 aatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25512571 aatatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgattatgcatggactca 25512624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 42874841 - 42874886
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42874841 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatccatggactcaac 42874886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 55582286 - 55582331
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55582286 acagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaac 55582331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13592316 - 13592273
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13592316 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 13592273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 13844304 - 13844384
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctta 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13844304 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 13844384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14853085 - 14853026
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14853085 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 14853026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 15791593 - 15791636
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15791593 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 15791636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 15791682 - 15791725
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15791682 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 15791725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 26444879 - 26444921
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26444879 acagggcatcaagccctcaactt-aatgagtatgcatggactca 26444921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26922766 - 26922680
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||  ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26922766 agggcatcaaaccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacatgacatcaaaccctcaactttaatgagtatgcaaggactca 26922680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Original strand, 361956 - 362074
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||  |    
T  361956 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaatatcttaacaactta-acagcttaga 362054  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  362055 catctcttatgactccaata 362074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Original strand, 14825379 - 14825437
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14825379 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 14825437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17048419 - 17048332
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  17048419 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaactttacaacttagaccaacacctgcaactt 17048332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Original strand, 19857283 - 19857401
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||  |    
T  19857283 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggcctcaacatcttaactactta-acaacttaga 19857381  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  19857382 catctcttatgactccaata 19857401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Original strand, 17958367 - 17958420
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17958367 tatacattccagagcatcaagctctcaactttaatgattatgcatggactcaac 17958420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2425607 - 2425563
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2425607 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaatgactcaa 2425563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12288540 - 12288477
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12288540 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 12288477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 152
Target Start/End: Original strand, 14650637 - 14650685
Alignment:
Q  104 aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  14650637 aatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaa 14650685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14928067 - 14928004
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14928067 agggcatcaaaccctcaacgtaataagtattgatatacttt-cagggcatcaagccctcaactta 14928004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 46640747 - 46640684
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46640747 agggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttacagggcatcaagccctcaactta 46640684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 14180 - 14118
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactt 102  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14180 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactt 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 46225601 - 46225559
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46225601 acagggcatcaaaccctcaactt-aatgagtatgcatggactca 46225559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 44024532 - 44024454
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatg 117  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||  || | |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44024532 agggcatcaaacccccaactttaaatgaatgattatacattccagagcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatg 44024454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 115
Target Start/End: Original strand, 14507624 - 14507657
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14507624 agggcatcaagccctcaactttaatgagtatgca 14507657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 17333189 - 17333230
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17333189 ggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 17333230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13592210 - 13592133
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaaca 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  13592210 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaactctacaacttagaccaaca 13592133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 35659731 - 35659775
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35659731 acagggcatcaagcccccaactttagatgagtatgcatggactca 35659775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 125
Target Start/End: Original strand, 37018653 - 37018685
Alignment:
Q  93 ccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37018653 ccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 37018685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 52243525 - 52243462
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  52243525 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagcactcaactta 52243462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Original strand, 5214862 - 5215095
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5214862 catcaagccctcaacttacaggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 5214961  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgac-ttgacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5214962 ctcaacgacttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttaacaac-ttgaccaacatatgcaac 5215060  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5215061 ttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 5215095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41173427 - 41173177
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41173427 catcaagccctcaacttagagggcatcaagccctcaacataatgtgtataaatatacattacatggcatctagccctcaacgtaaatgagtatgcatgga 41173328  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41173327 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaac 41173228  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  41173227 ttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 41173177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5206711 - 5206476
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206711 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 5206612  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt--gacaactttgaccaacatatgcaa 217  Q
    || |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| | ||   ||||||| |||||| ||||||||    
T  5206611 cttaacgtcttacaacttaaaaaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaaatttaaacaacttagaccaatatatgcaa 5206512  T
Q  218 cttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5206511 cttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 5206476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 14507848 - 14508097
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507848 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 14507947  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgac-ttgacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||  |||   || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  14507948 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttaaatatcttatatgactccaataatttgattcaacatcttacaactttaacaac-ttgaccaacatatgcaac 14508046  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaataacaacagagac---aacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  14508047 ttaatgatttaataatcaat-acaaaaaagacaaaaacatacaacaacttca 14508097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45531616 - 45531427
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45531616 agggcatcaagccctcaacttccaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaaaatcttggaacaa 45531517  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagac---aacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  45531516 ctacttacgacttgacaactttgacctacatatgcaacttaatgattaaataatcaataacagcagagacaataacatacaacaacttca 45531427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Original strand, 16728339 - 16728529
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16728339 acagggcatcaaaccctcaactttgaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaactcatgtgactccaatatcttggaac 16728438  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  16728439 aacaacttacaacttgacaaccttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acaacagagacaacaacatacaacaacttca 16728529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15932562 - 15932343
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15932562 catcaagccctcaacttacagggcataaagccctcaatataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcattga 15932463  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| | ||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15932462 ctcaacgtgttacaacttaaacaacttaaacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaatttaaacaac-ttgaccaacatatacaac 15932364  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaata 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15932363 ttaatgatttaataatcaata 15932343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14153466 - 14153276
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14153466 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacttcaacaactcatgtgactccaatatcttgaaac 14153367  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagac---aacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14153366 aacaacttacaacttgacaactttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatgaat-acatcagagacagtaacatacaacaacttca 14153276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17520013 - 17519864
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17520013 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 17519914  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17519913 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 17519864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17534875 - 17534726
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534875 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 17534776  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17534775 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 17534726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 40811755 - 40811904
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811755 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 40811854  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  40811855 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 40811904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 40806940 - 40807132
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40806940 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 40807039  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  40807040 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 40807132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50349099 - 50348939
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50349099 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgaatatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatatcttggaac 50349000  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50348999 aacaacttaaaacttgacaactttgactaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 50348939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 251
Target Start/End: Original strand, 13516366 - 13516565
Alignment:
Q  48 aaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13516366 aaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaataagtatgcaatggactcaacatcttacgactta-acaactt 13516464  T
Q  147 caacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacag 246  Q
      ||| |||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13516465 ggacatctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaacttgacaactttgaccaacat----aacttaatgatttaataaccaataacagcag 13516560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42353598 - 42353459
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  42353598 gcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatgtactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaataacaa 42353499  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42353498 cttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 42353459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22307672 - 22307499
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307672 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 22307573  T
Q  139 gacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
     |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  22307572 aacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 22307499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30175622 - 30175430
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30175622 catcaaaccctcaacttatagggtatcaagccctcaacataatatggataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtaagcatgga 30175523  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  30175522 ctcaaaatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 30175430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Original strand, 17538070 - 17538200
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17538070 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggagtcaacgtcttacaactta 17538169  T
Q  139 gacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
     |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17538170 aacaacttagacatctcatatgactccaata 17538200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 20417130 - 20417305
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttag-acaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20417130 acagggca-caagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaactttggacaacttcaacaacccatatgactccaatatcttggaac 20417228  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    | |||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20417229 aacaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcagagacaaca 20417305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15448055 - 15447906
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15448055 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 15447956  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15447955 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaata 15447906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31225012 - 31224831
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31225012 catcaagccctcaacttactgggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 31224913  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  31224912 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 31224831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 16044424 - 16044590
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16044424 acagggcatcaagccctcaacttaaatgggtacgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatgtgattccaatatcttggaaca 16044523  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaaca 245  Q
     |||||||| ||||  ||||||| |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  16044524 acaacttacaactttgcaacttttaccaacacttgcaacataaggatattaataatcattaacaaca 16044590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 16059283 - 16059449
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16059283 acagggcatcaagccctcaacttaaatgggtacacatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgattccaatatcttggaaca 16059382  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaaca 245  Q
     |||||||| ||||  ||||||| |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  16059383 acaacttacaactttgcaacttttaccaacacttgcaacataaggatattaataatcattaacaaca 16059449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 17044041 - 17044143
Alignment:
Q  21 atcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044041 atcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 17044140  T
Q  121 tca 123  Q
    |||    
T  17044141 tca 17044143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 267
Target Start/End: Original strand, 10562772 - 10562949
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaac 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  10562772 catcaagccctcaacttcaaatgagtatgcaaggactcaacaacatacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatatcttggaaca----- 10562866  T
Q  185 ttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  10562867 --acaacttgacaactttgactaacatatgaaacttaatgatttaatcatcaat-acagcagagataacaacatacaacaacttca 10562949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 242
Target Start/End: Original strand, 16049898 - 16050063
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaa 177  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16049898 ttacaaggcatgaagccctcaacttaaatgggtacgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgattccaatatcttggaa 16049997  T
Q  178 caccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataaca 242  Q
    || |||||||| ||||  ||||||| |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  16049998 caacaacttacaactttgcaacttttaccaacacttgcaacataaggatattaataatcattaaca 16050063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19569320 - 19569151
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaac-ttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||     
T  19569320 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaactttggacaactt----aacttatatgactccaatatcttggaaa 19569225  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    | |||||||| ||||  | |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  19569224 aacaacttacaactttgcgacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcagagaca 19569151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 37427614 - 37427757
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  37427614 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacagcttagacaacatcgacatcttatatgactccaatattttggaaca 37427713  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||  |||| ||||||| |||| |||| | |||||||||    
T  37427714 acatcttaacacttcacaacttagaccgacattttcaacttaat 37427757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12512821 - 12512676
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaa-tgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12512821 acagggcatcaatccctcaacttaaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacatcttagacaact-ctacaacttatatgactccaatatcttggaat 12512723  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  12512722 atcaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 12512676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14642552 - 14642408
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     
T  14642552 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaaaaacgtacaacttagacaacttca-caacttatatga-tccaatatcttggaat 14642455  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  14642454 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 14642408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 31415203 - 31415379
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||    
T  31415203 catcaagccctcaacttataggacattaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctc-----aaatgagtatgcaatgg 31415297  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  31415298 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 31415379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Original strand, 17693131 - 17693290
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||      
T  17693131 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtgtgcatggactcaacaacttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatt 17693230  T
Q  179 accaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaa 237  Q
    | || ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17693231 aacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgctacttaataatttaataatcaa 17693290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13031821 - 13031727
Alignment:
Q  32 aacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaac 125  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13031821 aacttacagggcatcaagccctcaacataacatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaac 13031727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13026723 - 13026638
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaac 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13026723 ggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaac 13026638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17548623 - 17548519
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17548623 catcaagccctcaacttacagggcgtcaagccctcaacataatatgtataaatatagattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 17548524  T
Q  119 actca 123  Q
    |||||    
T  17548523 actca 17548519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11886670 - 11886502
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  11886670 ggcatcaagccctcaacatatatgagtatgcatggacttagcaacttagaacttagacaacatcaacaacttataggatgccaatatcttggaacaacaa 11886571  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    ||||| ||||  |||||| ||||||||  | ||| | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  11886570 cttacaactttgcaacttagaccaacacctccaattaaatgatattaatgatcaataacagcagagaca 11886502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 37037868 - 37038012
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||     
T  37037868 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgattatgcatggactcaaaaacgtacaacttagacaaattca-caacttatatga-tccaatatcttggaat 37037965  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  37037966 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 37038012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 225
Target Start/End: Original strand, 6158453 - 6158591
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaac 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  6158453 catcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaaaaacgtacaacttagataacttca-caacttatatga-tccaatatcttggaataacaac 6158550  T
Q  185 ttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  6158551 ttacaactttacaacttagaccaacactttcaacttaatga 6158591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 46751959 - 46752049
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  46751959 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaata 46752049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Original strand, 6155694 - 6155807
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||| |||||    
T  6155694 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacaacttagaaca 6155793  T
Q  180 ccaacttacgactt 193  Q
     |||||||| ||||    
T  6155794 acaacttacaactt 6155807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Original strand, 12269265 - 12269371
Alignment:
Q  42 gcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaac 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  12269265 gcatcaagccctcaacataatatgtataaatgtacattacagagcatcaagccctcacccaacttaaataagtatgcaatggactcaacatcttaacaac 12269364  T
Q  136 ttagaca 142  Q
    |||||||    
T  12269365 ttagaca 12269371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Original strand, 15565533 - 15565634
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||     
T  15565533 cagggcatcaagcccttaacttaaatg--tatgcatggactcgacaacatacaacttggacaacatcaacaacttatacgactccaatactttggaacaa 15565630  T
Q  181 caac 184  Q
    ||||    
T  15565631 caac 15565634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19884397 - 19884332
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaact 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  19884397 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acaacagagacatcaacatacaacaact 19884332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 9577534 - 9577609
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac-gtct-tacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9577534 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaacaatgtgtacaacttagacaacatcaacaact 9577609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35065454 - 35065386
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  35065454 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 35065386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 11192007 - 11192081
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11192007 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcagaaaccaacaacttagacaacttcaataact 11192081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 323966 - 324076
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||      
T  323966 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttgcaacttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacga 324063  T
Q  181 caacttacgactt 193  Q
    |||||||| ||||    
T  324064 caacttacaactt 324076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1465818 - 1465669
Alignment:
Q  68 taaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaacaactcatatga 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||||    
T  1465818 taaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttagacatctcttatga 1465720  T
Q  162 ctccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  1465719 ctccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 1465669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2842326 - 2842274
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2842326 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 2842274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 44269707 - 44269759
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44269707 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 44269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18700707 - 18700651
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  18700707 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatgaactcaacaacttacaactt 18700651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2842460 - 2842417
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2842460 agggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 2842417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20630509 - 20630417
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaact----taaatgagtatgc-atggactcaacgtctta-caacttagaca 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20630509 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacctaatgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaccaacttagaca 20630417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 35353777 - 35353845
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  35353777 ttgaccaacatatacaacttaatgatttaataataaat-acaacagagacaacaacatacaacaacttca 35353845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 239
Target Start/End: Original strand, 11258645 - 11258683
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11258645 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 11258683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 122
Target Start/End: Original strand, 14519411 - 14519453
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14519411 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactc 14519453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17259232 - 17259170
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  17259232 ggcatcaagccctcaatttaaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 17259170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43890016 - 43889905
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaac-ttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| || |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||     
T  43890016 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgtatggtctcaacaacttacaactttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacg 43889919  T
Q  180 ccaacttacgactt 193  Q
     |||||||| ||||    
T  43889918 acaacttacaactt 43889905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19884533 - 19884488
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19884533 acagggcattaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 19884488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Original strand, 24545691 - 24545768
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgact 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24545691 catcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaactttaacaacttcaacaacttatacgact 24545768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35065590 - 35065545
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35065590 acagggcatcaggccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 35065545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42327316 - 42327236
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactc 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  42327316 ggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatgaactcaacaacgtacaacttaaacaac-tccacaacttatatgactc 42327236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17661204 - 17661141
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17661204 agggcatcaaaccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 17661141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42325143 - 42325079
Alignment:
Q  161 actccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  42325143 actccaatatcttggaataacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 42325079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 316029 - 316088
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  316029 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 316088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 15206844 - 15206887
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15206844 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 15206887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 17207190 - 17207236
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17207190 acagggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggactcaac 17207236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 31415131 - 31415181
Alignment:
Q  13 cacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataata 63  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31415131 cacaggacatcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataata 31415181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 324067 - 324157
Alignment:
Q  128 cttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  324067 cttacaacttagacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaactttacaacttagaccaacacctgcaactt 324157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 11258481 - 11258526
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11258481 acagagcatcaagccttcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 11258526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 12469733 - 12469823
Alignment:
Q  128 cttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  || ||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  12469733 cttacaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatacttttgaacgacaacttacaactttacaacttagaccaacacctgcaactt 12469823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17519745 - 17519679
Alignment:
Q  204 accaacatatgcaacttaatgatttaat-aatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  17519745 accaacatatgcaacttaatgatttaataaatcaat-acagcagagacagcaacatacaacaacttca 17519679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17534607 - 17534541
Alignment:
Q  204 accaacatatgcaacttaatgatttaat-aatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  17534607 accaacatatgcaacttaatgatttaataaatcaat-acagcagagacagcaacatacaacaacttca 17534541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 44269575 - 44269616
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44269575 ggcataaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 44269616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6805895 - 6805803
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  6805895 acaacttggtcaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacaacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 6805803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 13919238 - 13919282
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13919238 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 13919282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14251048 - 14250973
Alignment:
Q  149 acaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  14251048 acaacttatatga-tccaatatcttggaataacaacttacaaccttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 14250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 42386211 - 42386274
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42386211 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 42386274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 15245926 - 15245969
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15245926 cagggcatcaagcccccaactttaataagtatgcatggactcaa 15245969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 15265047 - 15265090
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15265047 cagggtatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatgaactcaa 15265090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23318926 - 23318883
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23318926 caggacatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 23318883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35961816 - 35961728
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  35961816 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaactt 35961728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 50756367 - 50756324
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50756367 acagagcatcaagccctcaactttaatgattatgcatggactca 50756324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 53646903 - 53646864
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53646903 gcatcaagccctcaacttaatatgagtatgcatggactca 53646864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1645002 - 1644933
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1645002 agggcatcaatccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagcccccaacttaattgag 1644933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Original strand, 13179294 - 13179356
Alignment:
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataaca 242  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13179294 caacttacaacttagcaactttgaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaaca 13179356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 11562513 - 11562558
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  11562513 acagggcatcaagccctacactttaatgagtatgcacggactcaac 11562558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 35353613 - 35353658
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35353613 acagggcatcaagtcatcaacgtaaatgagtatgcatggaatcaac 35353658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43889914 - 43889824
Alignment:
Q  128 cttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  43889914 cttacaacttagataacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaattttacaacttagaccaacacctgcaactt 43889824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45804406 - 45804361
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45804406 acagggcattaagcccccaactttaatgattatgcatggactcaac 45804361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9512098 - 9512016
Alignment:
Q  42 gcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||| |||||||| | ||||  || | ||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9512098 gcatcaagccctcaacttgatatgaatgattatacattcaacagggcatgaa-ccctcaactttaatgagtatgcatggactca 9512016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9520073 - 9519991
Alignment:
Q  42 gcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||| |||||||| | ||||  || | ||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9520073 gcatcaagccctcaacttgatatgaatgattatacattcaacagggcatgaa-ccctcaactttaatgagtatgcatggactca 9519991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 43925867 - 43925927
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  43925867 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 43925927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 54331418 - 54331374
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaa-cttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  54331418 acagggcatcaagccctcaagtttagatgagtatgcatggactca 54331374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20084670 - 20084455
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||     ||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  20084670 agggcatcaagccctcaacataaagagcataaatacac-tcacagagcatcaagccctcaactttaaatgaatatgcatggactcagcaacttacaactt 20084572  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20084571 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaacaacttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaataatttaataatcaa 20084472  T
Q  238 taacaacagagacaaca 254  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20084471 taacagcagagacaaca 20084455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Original strand, 24713166 - 24713414
Alignment:
Q  21 atcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24713166 atcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcagggac 24713265  T
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaact 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||| |||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  24713266 tcaacgtcttacaacttaaacagcttagacatctcatatgacttcaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaac-ttgaccaacatatgcaact 24713364  T
Q  220 taatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  24713365 taatgatttaataatcaat-acaacagagacagcaacatacaacaacttca 24713414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22259365 - 22259175
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22259365 acagggcatcaagctttcaactttgaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaactcatgtgactccaatatcttggaac 22259266  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  22259265 aacaacttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 22259175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 23947210 - 23947423
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23947210 agggcatcaagccctcaacatataaagtataaatatac-tcacagggcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaactt 23947308  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatca 236  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23947309 agacaacttcatcaacttatatgactccaatatcttggaacaacaacttacgactttgcaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataatca 23947408  T
Q  237 ataacaacagagaca 251  Q
    |||||| ||||||||    
T  23947409 ataacagcagagaca 23947423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39937118 - 39936926
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39937118 catcaagccctcaacttacaaggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattagagggcatcaagccctcaacttaaataagtatgcatgga 39937019  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  39937018 ctcaacatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacgacttaaacaacttagaccaacat 39936926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Original strand, 19127973 - 19128080
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19127973 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 19128072  T
Q  139 gacaactt 146  Q
     |||||||    
T  19128073 aacaactt 19128080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21580265 - 21580084
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21580265 catcaagccctcaacttacagagcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 21580166  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  21580165 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 21580084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Original strand, 22244453 - 22244626
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22244453 acagggcatcaaaccctcaactttaaatgagtaagcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgactccaagatcttggaac 22244552  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    | |||||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22244553 aacaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaatttaatgatattaataatcaataacagcagagaca 22244626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Original strand, 23888776 - 23888948
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  23888776 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttggacaaattcaacaacctatatgaatccaatatcttggaaca 23888875  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
     |||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  23888876 acaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacaatagagaca 23888948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17907970 - 17907795
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17907970 acagggcatcaagctctcaactttaatgagcatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcagaaacttatatgactccaatatcttggaaca 17907871  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  17907870 acaacttacaactttgcaacttagactaacatttgcaacttaatgatatcaataatcaacaacagcagagacaaca 17907795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22584734 - 22584563
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt-agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  22584734 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaactttagacaacttcaacaacctatatgactccaatatcttggaacaa 22584635  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    |||||||| | ||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22584634 caacttacaaatttgcaacttagactaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcagagaca 22584563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 18760367 - 18760500
Alignment:
Q  13 cacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 112  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18760367 cacagagcataaaaccctcaacttacagggcatcaagcccccaacataacatgtataaatatacattacaggacatcaagccctcaacttaaatgagtat 18760466  T
Q  113 gcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18760467 gtatggactcaacgtcttacaacttaaacaactt 18760500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Original strand, 17217638 - 17217811
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17217638 acagggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcatcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaaca 17217737  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataa-tcaataacaacagagaca 251  Q
     ||||||   ||||  |||||| |||| | |  |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  17217738 acaactttgaactttgcaacttagaccgatacttgcaacttaatgatattaataattcaacaacagcagagaca 17217811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 19699116 - 19699292
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |    
T  19699116 acagggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacgacttatatacctccaatatcttggaata 19699215  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaat--aatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||   |||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19699216 acaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaatcaaatgatattattaaatcaataacagcagagacaaca 19699292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19929822 - 19929708
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  19929822 acagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacgtcgacaacttatatgattccaatattttggaaca 19929723  T
Q  180 ccaacttacgacttg 194  Q
     |||||||| |||||    
T  19929722 acaacttacaacttg 19929708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39695531 - 39695386
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39695531 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttaaacaactcca-caacttatatgactccaatatcttggaat 39695433  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  39695432 aacaacttacaacttcacaacttagaccaacacttgcaacttgatga 39695386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42266595 - 42266451
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||     
T  42266595 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaacttc-acaacttatatga-tctaatatcttggaat 42266498  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | ||||||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  42266497 aacaacttacagctttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 42266451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 220
Target Start/End: Original strand, 5760467 - 5760604
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||       
T  5760467 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaatga 5760564  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  5760565 caacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaactt 5760604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41681133 - 41680998
Alignment:
Q  66 tataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  41681133 tataaatatacattacagggcatcaagccctcgacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacgactta-acaacttagatatctcatatgactc 41681035  T
Q  165 caatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    |||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  41681034 caataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 41680998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13665466 - 13665303
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  13665466 acagggcatcaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggataacatcaacaacttatatgactccaatgctttggaaca 13665368  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag 248  Q
     || ||||  ||||   ||||| ||||| ||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||    
T  13665367 acatcttaaaactttgtaacttagaccaccatttgcaacttaa----ttaatattcaataacaacagag 13665303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13724741 - 13724578
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  13724741 acagggcatcaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggataacatcaacaacttatatgactccaatgctttggaaca 13724643  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag 248  Q
     || ||||  ||||   ||||| ||||| ||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||    
T  13724642 acatcttaaaactttgtaacttagaccaccatttgcaacttaa----ttaatattcaataacaacagag 13724578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 178
Target Start/End: Original strand, 23669474 - 23669573
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  23669474 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacagcttacaacttggacaacttcaccaacttatatgactccaatactttggaac 23669573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25849441 - 25849328
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  25849441 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttggacaac-tccacaacttatatgactccaatattttggaat 25849343  T
Q  179 accaacttacgactt 193  Q
    | |||||||| ||||    
T  25849342 aacaacttacaactt 25849328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18302970 - 18302802
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  18302970 cagggcatcgagccctcaacataa-tgagtatgcatggactcagcaacctacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacaa 18302872  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||| |    |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18302871 catcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttga----ttaatattcaacaacaacagagacaaca 18302802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29763867 - 29763744
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttgga 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||    
T  29763867 ttacagggcatcaagccctcgacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacgactta-acaacttaaacatctcatatgacttcaataatttgga 29763769  T
Q  177 acaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
     || || ||||| |||| |||||||    
T  29763768 tcaacatcttacaacttaacaactt 29763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 18833351 - 18833474
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||  | |||||  |||    
T  18833351 ggcatcaagcccttaacttaaatgagtatgcatagactcaacaacttacaacttggacaacatcgacaact--taagactccaatacttcggaacgacaa 18833448  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaac 209  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  18833449 cttacaactttacaacttagaccaac 18833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6102755 - 6102612
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||    || |||||||||||||||||  ||||| |    
T  6102755 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacgactta-agaact----catctcatatgactccaataatttggatc 6102661  T
Q  179 accaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    | || ||||| ||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  6102660 aacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 6102612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22318969 - 22318883
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22318969 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 22318883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31723800 - 31723692
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |  || |||||    
T  31723800 acaggacatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacaatttagaaca 31723701  T
Q  180 ccaacttac 188  Q
     ||||||||    
T  31723700 acaacttac 31723692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2419081 - 2419018
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatg-gactcaacgtcttacaacttagacaac 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  2419081 agggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatgagactcaacatcttacaacttaaacaac 2419018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20502313 - 20502206
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || ||||||||||||||  ||||||||     
T  20502313 cagggcatcaagcccccaacatggatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttagaaaacatcgacatcttatatgactccaataatttggaacaa 20502214  T
Q  181 caacttac 188  Q
    || |||||    
T  20502213 catcttac 20502206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 45471469 - 45471426
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45471469 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 45471426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17086362 - 17086257
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||| |    
T  17086362 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaatattttggaacaac 17086264  T
Q  182 aacttac 188  Q
    | |||||    
T  17086263 atcttac 17086257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39695616 - 39695550
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  39695616 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttaaacaact 39695550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22253376 - 22253332
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22253376 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaac 22253332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38550411 - 38550235
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  38550411 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaataagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 38550313  T
Q  150 caactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    || ||| |||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  |||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  38550312 catctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgat 38550235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42818781 - 42818713
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata-acaacaga-gacaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||    
T  42818781 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaatacactagagacaacaacatacaacaacttca 42818713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20179529 - 20179486
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20179529 agggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 20179486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22381942 - 22381899
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22381942 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatggatggactcaac 22381899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 23418395 - 23418454
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  23418395 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaactta 23418454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17979541 - 17979457
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17979541 ggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacatccaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaaggactca 17979457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 42818908 - 42818863
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42818908 acagggcatcaatccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 42818863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 41681724 - 41681680
Alignment:
Q  30 tcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatat 74  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41681724 tcaacttacagggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatat 41681680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Original strand, 9225 - 9292
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||  |||||||    
T  9225 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaatgactcaacatccaacaacttaatcaacttc 9292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20025293 - 20025250
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20025293 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactca 20025250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20179395 - 20179327
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  20179395 ttgaccaacatatgcaacttaattatttaataatcaat-acagcaaagacaacaacatacaacaacttca 20179327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 21513354 - 21513397
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21513354 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaaggactca 21513397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 22207271 - 22207346
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  22207271 tatacattccagagcatcaaaccctcaacttaatatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 22207346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 22473595 - 22473638
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22473595 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactca 22473638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 22995751 - 22995794
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22995751 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 22995794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 28397458 - 28397501
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28397458 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 28397501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36728325 - 36728242
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgact 163  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36728325 acagggcatgaatccctcaactttaatgagtatgcatcgactcagcaaccaacaacttggacaacttcaacaacttatacgact 36728242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 37515435 - 37515478
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37515435 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 37515478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13428462 - 13428344
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatg-catggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  13428462 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacgtaaatgagtatgtaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 13428364  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  13428363 catctcttatgactccaata 13428344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36733618 - 36733581
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36733618 catcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 36733581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 38988406 - 38988447
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38988406 ggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 38988447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 39019503 - 39019544
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39019503 ggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 39019544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Original strand, 39833687 - 39833804
Alignment:
Q  57 cataatatatataaatatacattacagggcatcaagcc----ctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaac 150  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||  ||    
T  39833687 catattatgtataaatatacattacagagcatcaagccatcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactca-acaacttagac 39833785  T
Q  151 aactcatatgactccaata 169  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  39833786 atctcttatgactccaata 39833804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6574038 - 6573986
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6574038 tatacattccagagcatcaaaccctcaacttaatatgagtatgcatggactca 6573986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Original strand, 23418447 - 23418523
Alignment:
Q  149 acaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| | ||||| ||  |||||||||||||    
T  23418447 acaacttatatgactccaacatcttggaataacaacttacaactttacaacgtagaccaccacttgcaacttaatga 23418523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22963623 - 22963517
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || || | |||||||||| ||||||||     
T  22963623 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtattcttggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatttaactccaatattttggaacaa 22963525  T
Q  181 caacttac 188  Q
    || |||||    
T  22963524 catcttac 22963517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25849557 - 25849492
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatata-tataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25849557 agggcatcaaaccctcaacata-tagagtataattatac-tcacagggcatcaagccctcaacttaaa 25849492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27472708 - 27472616
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagaca 142  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  27472708 acatattatgtataaatatatattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatagactcaacatcttaacaacttagaca 27472616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36406018 - 36405975
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36406018 acagggcatcaagcccccaactttaattagtatgcatggactca 36405975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40493222 - 40493179
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40493222 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 40493179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1323495 - 1323453
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctca 98  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1323495 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctca 1323453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5083365 - 5083324
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5083365 cagggcatcaagcccctaacttaaatgaatatgcatggactc 5083324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Original strand, 19698999 - 19699063
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19698999 agggcatcaagccctcaacatataaagtataattatac-tcacagggcatcaagccctcaacttaa 19699063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18815969 - 18815925
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  18815969 acagggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatgaactca 18815925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18819889 - 18819845
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18819889 acagggcatcaaaccctcaactttagatgagtatgcatggactca 18819845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19155094 - 19155042
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19155094 catcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatctta 19155042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 20498354 - 20498417
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  20498354 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaaaccctcaactta 20498417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22419623 - 22419567
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22419623 agggcatcaagcccccaacatgaatgtgtatgcatggactcaacaacttacatctta 22419567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 24352930 - 24352990
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  24352930 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 24352990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 57744 - 57994
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  57744 catcaagccctcaacttacaaggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagcccttaacttaaatgagtatgcatgga 57843  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  57844 ctcaatgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccagtaatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaac 57943  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||    
T  57944 ttaatgatttaataatcaat-acagtagagacaacaacatacaacaacttca 57994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 69)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20634689 - 20634441
Alignment:
Q  13 cacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 112  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634689 cacaggacatcaagccctcaacttacagggcatcaaaccctcaacataatttgtataaatatacattatagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 20634590  T
Q  113 gcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacata 212  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || |||        ||||||| ||||||||||    
T  20634589 gcatgtactcaacatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatctt--------acaacttagaccaacata 20634498  T
Q  213 tgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  20634497 tgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacagcaacatacaacaacttca 20634441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7053045 - 7052860
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttc-aacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7053045 gcatcaagccctcaacttcaaatgaatatgcatggaatcaacaacttacaacttagacaacttccaacaactcatatgactccaatatcttggaacaaca 7052946  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  7052945 acttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacagcacagacagcaacatacaacaactt 7052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 20587686 - 20587924
Alignment:
Q  32 aacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtctta 131  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587686 aacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattatatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtctta 20587785  T
Q  132 caacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaa 230  Q
    ||||||| |||||||  |||  | |||||||||| |||  ||||| || || |||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20587786 caacttaaacaacttagacatttaatatgactcctataatttggatcaacatcttacagcttaaacaacttagaccaacatatgtaacttaatgatttaa 20587885  T
Q  231 taatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||| | | ||||||   ||||||||||||||||||    
T  20587886 taatcaat-atagcagagacagcaacatacaacaacttca 20587924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 20592224 - 20592462
Alignment:
Q  32 aacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtctta 131  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592224 aacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattatatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtctta 20592323  T
Q  132 caacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaa 230  Q
    ||||||| |||||||  |||  | |||||||||| |||  ||||| || || |||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20592324 caacttaaacaacttagacatttaatatgactcctataatttggatcaacatcttacagcttaaacaacttagaccaacatatgtaacttaatgatttaa 20592423  T
Q  231 taatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||| | | ||||||   ||||||||||||||||||    
T  20592424 taatcaat-atagcagagacagcaacatacaacaacttca 20592462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38888107 - 38887932
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaac 184  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38888107 catcaaaccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaataacaac 38888008  T
Q  185 ttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||    
T  38888007 tt--------acaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacagcagaaacagcaacatacaacaactt 38887932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 48300807 - 48300999
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48300807 catcaaaccctcaacttaccgggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccctaaacttaaatgagtatgcatgga 48300906  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  48300907 ctcaaaatcttacaacttaaaaaacttaaacaactcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 48300999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Original strand, 35088461 - 35088586
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088461 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 35088560  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaact 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35088561 ctcaacgtcttacaacttaaacaact 35088586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Original strand, 51476027 - 51476191
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaac-ttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51476027 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaactttggacaacttcaacaacctatatgactccaatatcttggaac 51476126  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataaca 242  Q
    | |||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51476127 aacaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcagcttaatgatattaataatcaacaaca 51476191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 250
Target Start/End: Original strand, 45754513 - 45754678
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaact 185  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45754513 catcaagccctcaacttttatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgattccaatatcttggaacaacaact 45754612  T
Q  186 tacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagac 250  Q
    ||| ||||  |||||| ||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45754613 tacaactttgcaacttagaccaacacttgcaattaaatgatattaataatcaataacagcagagac 45754678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51274636 - 51274465
Alignment:
Q  30 tcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtc 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  51274636 tcaacttacaaggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattgcagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatagactcaacatc 51274537  T
Q  129 ttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    |||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  51274536 ttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 51274465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38057653 - 38057509
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     
T  38057653 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaacttca-caacttatatga-tccaatatcttggaat 38057556  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38057555 aacaacttacaactttacaacttagaccaacatttgcaacttaatga 38057509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 234
Target Start/End: Original strand, 13301841 - 13301994
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  13301841 agggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgactccaacatcttggaacaac 13301940  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataat 234  Q
    ||||||| ||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  13301941 aacttacaacttagcgactttgaccaatacttgcaacttaatgatattaataat 13301994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 42696771 - 42696947
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagac-aacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42696771 acagggcatcaagccctcaacatatatgagtatgcatggactcatcaacttacaacttagacaaacttcaacaacttatatgattccaatatcttggaac 42696870  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaat-aatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    | |||||| | |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  42696871 aacaactt-caactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaatgactcaacaacagcagagacaaca 42696947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14238617 - 14238484
Alignment:
Q  13 cacagaacatcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 112  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14238617 cacagagcatcaagccctcaacttacagggcatcaagctctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtat 14238518  T
Q  113 gc-atggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14238517 gcaatggactcaacatcttacgactt-gacaactt 14238484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 24726379 - 24726520
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  24726379 ggcatcaagccctcaactttaaacgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaactcca-caacttatatgactccaatatcttggaataaca 24726477  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  24726478 acttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 24726520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8276993 - 8276850
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8276993 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcgtggactcaacaacgtacaacttaaacaact-ctacaacttatatgactccaatatcttggaat 8276895  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8276894 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaat 8276850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13528866 - 13528762
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13528866 catcaagccctcaacttacagggcgtcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 13528767  T
Q  119 actca 123  Q
    |||||    
T  13528766 actca 13528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14238501 - 14238417
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  14238501 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacagcaacatacaacaactt 14238417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41227744 - 41227653
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  41227744 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtgttgcaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 41227653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 23967625 - 23967735
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||      
T  23967625 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacga 23967722  T
Q  181 caacttacgactt 193  Q
    |||||||| ||||    
T  23967723 caacttacaactt 23967735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 48520243 - 48520353
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||      
T  48520243 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagcatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacgg 48520340  T
Q  181 caacttacgactt 193  Q
    |||||||| ||||    
T  48520341 caacttacaactt 48520353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Original strand, 22349647 - 22349753
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||     
T  22349647 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaa-ttttacaacttatatga-tccaatatcttggaat 22349744  T
Q  179 accaactta 187  Q
    | |||||||    
T  22349745 aacaactta 22349753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11809485 - 11809358
Alignment:
Q  128 cttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat- 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  11809485 cttacaacttagacaacttacacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttcgtaacttagaccaacacttgcaacttaatgata 11809386  T
Q  227 ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11809385 ttaataatcaacaacagcagagacaaca 11809358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 16381096 - 16381152
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16381096 ggcatcaagccctcaacataaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaga 16381152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 18120566 - 18120652
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18120566 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaaggactca 18120652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 19675929 - 19675997
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  19675929 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 19675997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 243
Target Start/End: Original strand, 23073050 - 23073165
Alignment:
Q  129 ttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-t 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||  ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||||| |    
T  23073050 ttacaacttagacaacttaaacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttagaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaatgatat 23073149  T
Q  228 taataatcaataacaa 243  Q
    |||||||||| |||||    
T  23073150 taataatcaacaacaa 23073165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41306007 - 41305889
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  41306007 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 41305909  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  41305908 catctcttatgactccaata 41305889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4596855 - 4596810
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4596855 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 4596810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 20241871 - 20241916
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20241871 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 20241916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21046923 - 21046855
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata-acaacaga-gacaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||    
T  21046923 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaatacagaagagacaacaacatacaacaacttca 21046855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 22124194 - 22124238
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22124194 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaac 22124238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 42912228 - 42912296
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   ||||||||||||||||||    
T  42912228 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcaaagacagcaacatacaacaacttca 42912296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 1642490 - 1642635
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||      
T  1642490 acagggaatcaagctctcaacttcaaatgagtatccatggactccacaatgtacaacttagacaacacca-caacttatatgactccaatatcttggatt 1642588  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |  | ||||  |||| ||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  1642589 aatatcttagaactttacaacttagaccaactcttgcaacttaatga 1642635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16059188 - 16059150
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16059188 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 16059150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 20316365 - 20316439
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||| || ||||||    
T  20316365 cagggcatcaagccctcaacttaaaatgagtatccatggattcaacaacttacaacttggacaacatcgacaact 20316439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28194869 - 28194751
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtct-tacaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||  |    
T  28194869 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatctaaacaactta-acaacttaga 28194771  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  28194770 catctcttatgactccaata 28194751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 44891633 - 44891707
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | |||||  |||||||||||||||    
T  44891633 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaaaaactttaacaacttcaacaact 44891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 42912092 - 42912137
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42912092 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtacgcatggactcaac 42912137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 51323326 - 51323406
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51323326 ggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagagcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatgga 51323406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4596714 - 4596667
Alignment:
Q  206 caacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4596714 caacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 4596667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52954535 - 52954432
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||| ||     
T  52954535 ggcatcaagcctccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaatattttggaacaacat 52954437  T
Q  184 cttac 188  Q
    |||||    
T  52954436 cttac 52954432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17904062 - 17903995
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||    
T  17904062 acagggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaactt 17903995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 20316470 - 20316549
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaaca 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  20316470 acaacttagacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacgataacttacaactttacaatttagaccaaca 20316549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21240228 - 21240189
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21240228 catcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 21240189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24720806 - 24720763
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24720806 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactca 24720763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28477764 - 28477678
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28477764 ggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacatccaacagggcatcaatccctcaactttaatgagtatgcaaggactcaac 28477678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 43542819 - 43542911
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagaca 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43542819 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagctctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttagaca 43542911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16059320 - 16059279
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16059320 ggcatcatgccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 16059279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 19675793 - 19675838
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19675793 acagggaatcaaaccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 19675838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 131
Target Start/End: Original strand, 20636617 - 20636686
Alignment:
Q  67 ataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctta 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20636617 ataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 20636686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35982099 - 35982010
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttag 139  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  35982099 acatattatgtataaataaacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttag 35982010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7321986 - 7321900
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||  || | ||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7321986 agggcatcaagcccccaacttaatatgaatgattatacattcaacagagcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatcgactca 7321900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14793435 - 14793392
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14793435 acaggtcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactca 14793392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29764566 - 29764478
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  29764566 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaactt 29764478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7321865 - 7321803
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  7321865 acaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacaacttagaacaacaacttacaactt 7321803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 115
Target Start/End: Original strand, 14800438 - 14800472
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgca 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14800438 cagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgca 14800472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 115
Target Start/End: Original strand, 14809312 - 14809346
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgca 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14809312 cagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgca 14809346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 21753839 - 21753908
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21753839 agggcatcaacccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagcccccaacttaattgag 21753908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46382975 - 46382857
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||| ||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||| |||||||  |    
T  46382975 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatagactcaatatcttaacaactta-acaacttaga 46382877  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  46382876 catctcttatgactccaata 46382857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 50614446 - 50614377
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50614446 agggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 50614377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 50622274 - 50622205
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50622274 agggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 50622205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 48520344 - 48520434
Alignment:
Q  128 cttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||| | |||| |||| || ||||||||  ||||||||    
T  48520344 cttacaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttgcaactttacaatttagaccaacacctgcaactt 48520434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 12709631 - 12709683
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaac-ttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  12709631 tatacattccagagcatcaagccctctactttaaatgattatgcatggactca 12709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 41050363 - 41050296
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41050363 ggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 41050296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 45495995 - 45496078
Alignment:
Q  42 gcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||| |||||||| | ||||  || | ||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45495995 gcatcaagccctcaactttatatgaatgattatacattcaacagagcatcaaaccctcaactttaatgattatgcatggactca 45496078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50614329 - 50614285
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  50614329 agggcatcaagccctcaacaatgaatgagtatgcatggactcaac 50614285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50622157 - 50622113
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  50622157 agggcatcaagccctcaacaatgaatgagtatgcatggactcaac 50622113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Original strand, 51475951 - 51476014
Alignment:
Q  41 ggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaa 105  Q
    |||||||| ||||||||||||    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51475951 ggcatcaagccctcaacataaagagtataattatac-tcacagggcatcaagccctcaacttaaa 51476014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47564 - 47374
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  47564 acagggcatcaatccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaactcacatgactccaatatcttgaaac 47465  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||    
T  47464 aacaacttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagtagagacaacaacatacaacaacttca 47374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 265
Target Start/End: Original strand, 28329 - 28519
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28329 acagggcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcaacaacttactatttggacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaac 28428  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
      |||||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||    
T  28429 gacaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgcaactaaatgatgttaataatcaataacagcagagatagcaacataaaacaactt 28519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1263
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttc-aacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1078 gcatcaagccctcaacttcaaatgaatatgcatggaatcaacaacttacaacttagacaacttccaacaactcatatgactccaatatcttggaacaaca 1177  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  1178 acttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacagcacagacagcaacatacaacaactt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Original strand, 145750 - 145966
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  145750 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacaattt 145849  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatca 236  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145850 a-acaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaacttaatgatttaataatca 145948  T
Q  237 ataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||  |||||||    
T  145949 ataacaacaatgacaaca 145966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10897779 - 10897613
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaac 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  10897779 catcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatagactcaacaacttacaacttagacaacctcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca---ac 10897683  T
Q  185 ttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10897682 ttacaacttgacaactttgaccaatatatgcaacttaatgatttaataatcaataacagcagagacaaca 10897613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24781948 - 24781756
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24781948 catcaagccctcaacttatagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacataaatgagtatgcatgga 24781849  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  24781848 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 24781756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5032432 - 5032240
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5032432 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 5032333  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  5032332 ctcaacgtcttacaacttaaataacttaaacacctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 5032240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 6576176 - 6576364
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576176 agggcatcaagcccccaacataatatttataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 6576275  T
Q  139 gacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
     |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  6576276 aacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 6576364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 22689625 - 22689816
Alignment:
Q  21 atcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 120  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22689625 atcaagccctcaacatacagggcatcaaactctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 22689724  T
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  22689725 tcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 22689816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 22694221 - 22694412
Alignment:
Q  21 atcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 120  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694221 atcaagccctcaacatacagggcatcaaactctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggac 22694320  T
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  22694321 tcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 22694412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 24883406 - 24883555
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24883406 catcaagccctcaacttacaaggcatcaagccctcaacataatatgtaaaaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaattagtatgcatgga 24883505  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  24883506 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 24883555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 9974869 - 9975018
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9974869 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattccagggcatcaagccctcaacttaaatgggtatgcatgga 9974968  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  9974969 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatcttatatgacttcaata 9975018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Original strand, 24435997 - 24436119
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24435997 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaagccttcaacttaaatgagtatgcatgga 24436096  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagaca 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  24436097 ctcaacatcttacaacttagaca 24436119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19202247 - 19202127
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19202247 catcaagccctcaacttacaaggcatcaagccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatgaa 19202148  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  19202147 ctcaatgtcttacaacttaga 19202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 19357996 - 19358142
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactta-aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19357996 acagggcatcaaaccctcaactttgaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaactcatgtgactccaatatcttagaac 19358095  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataa 233  Q
    | ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358096 aacaactt--------acaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataa 19358142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 265
Target Start/End: Original strand, 14693275 - 14693451
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14693275 acagggcatcaagccctcgacttcaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaactt---caactcatatgactccaatatcttgaaac 14693371  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaca--acatacaacaactt 265  Q
    | |||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  14693372 aacaacttacaac---------ttgaccaacatatgcaacttaatgattaaataatcaataacggcagagacatcacatacaacaactt 14693451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 27851630 - 27851805
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  27851630 acagggcatcaagccctcagcttaaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgattccaacatcttggaaca 27851729  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||    
T  27851730 acaacttacaacttagcgactttgaccaatacttgcaacttaatgatattaataattaacaacagcaaagacaaca 27851805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 44071543 - 44071718
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  44071543 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcatcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacatcttggaaca 44071642  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  | ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  44071643 acaacttacaacttagcgactttgaccataacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcaaagacaaca 44071718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 25045054 - 25045199
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25045054 acagggcatcaagccctcaacatcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaacacca-caacttatatgactccaatatcttggaat 25045152  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  25045153 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 25045199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Original strand, 26896264 - 26896360
Alignment:
Q  30 tcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaac 125  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26896264 tcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaatccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaac 26896360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7672555 - 7672436
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  7672555 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacgtaatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttccatgagtatgcaatgg 7672456  T
Q  119 actcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||| || |||||| |||||    
T  7672455 actcgacatcttacgactta 7672436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6478358 - 6478254
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6478358 catcaaaccctcaacttacagggcgtcaagccctcaacataatatgcataaatatacattacagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 6478259  T
Q  119 actca 123  Q
    |||||    
T  6478258 actca 6478254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Original strand, 5985141 - 5985306
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  5985141 acagggaatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggacttagcaacttacaacttagacaactt---------atatgactccaatatcttggaac 5985231  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataa-tcaataacaacagagaca 251  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  5985232 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaataattcaacaacaacagagaca 5985306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 356978 - 357051
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  356978 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtat 357051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 21367797 - 21367996
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatat--atataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatg 117  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  21367797 catcaagccctcaacttacagagcatcaagcccttaacttaatatatatataaatatacattccagggcatcaagccctcgtctttaatgagtatgtatg 21367896  T
Q  118 gactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| ||  ||| ||||||| | ||||     
T  21367897 gactcaacatcttacaacttag---------acaactcatatgactccaataatttggaacaacatcttacaactttacttcttagaccaacgtttgcat 21367987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18389299 - 18389155
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||||||     
T  18389299 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacagcttagacaacttca-caagttataaga-tccaatatcttggaat 18389202  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  18389201 aacaacttacaactttacaacttagagcaacacttgcaacttaatga 18389155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24865869 - 24865786
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24865869 catcaagccctcaacctacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 24865786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 25140948 - 25141071
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||    
T  25140948 acagcgcatcaagccctcaactttaatgagtatggatggactcaacaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatatgacttcaacaacttagaaca 25141047  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttg 203  Q
     |||||||| ||||| | ||||||    
T  25141048 acaacttacaacttgccgactttg 25141071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 265
Target Start/End: Original strand, 9975026 - 9975172
Alignment:
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |  | ||||||||||||||| |||||    
T  9975026 tcaacatcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttaacaatttgaccaacatatgtaactt 9975125  T
Q  221 aatgatttaataatcaataacaacagagacaa---catacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||    
T  9975126 aatgatttaataatcaata-cagcagagacaacaacatacaacaactt 9975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24815679 - 24815536
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | |||| |||||| |||||||  |||||||     
T  24815679 acagggtatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcgaaaacttatatgattccaatactttggaact 24815580  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  24815579 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 24815536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 27860345 - 27860511
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |   ||||      ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  27860345 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcttggactcatcaac---caac------aacttcaacaacttatacgattccaacatcttggaaca 27860435  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  27860436 acaacttacaacttagcgactttgaccaatacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcaaagacaaca 27860511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Original strand, 22500841 - 22500932
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22500841 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatagactcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaata 22500932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Original strand, 22508775 - 22508866
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22508775 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatagactcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaata 22508866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24835080 - 24834937
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |||  | |||||| |||||||  |||||||     
T  24835080 acagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaatatcgacattttatatgattccaatactttggaact 24834981  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  24834980 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 24834937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20913120 - 20913051
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatc 89  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20913120 catcaatccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatc 20913051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 20915115 - 20915252
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaac 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  || ||||| || |    
T  20915115 catcaagccctcaacttaaatgagcatgcaatggattcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaatactttagaacaacatc 20915213  T
Q  185 ttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    |||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  20915214 ttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 20915252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 178
Target Start/End: Original strand, 34136849 - 34136946
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtc--ttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||    
T  34136849 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacgtgtacaacttggacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaac 34136946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28653376 - 28653308
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  28653376 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 28653308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Original strand, 24515364 - 24515431
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  24515364 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttc 24515431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24865768 - 24865647
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || |||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||| |    
T  24865768 acagggcatcaagccctcaacttacatgagtatgcaacggactcgacatcttacgactta-acaacttagacatctcatataactccaataatttggatc 24865670  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactt 201  Q
    | || ||||| |||| |||||||    
T  24865669 aacatcttacaacttaacaactt 24865647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 3538816 - 3538861
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3538816 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 3538861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18391309 - 18391268
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18391309 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 18391268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 36839352 - 36839404
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36839352 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaaca 36839404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23969752 - 23969684
Alignment:
Q  32 aacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaac 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969752 aacttacagagcatcaagccctacacataatttgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaac 23969684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Original strand, 17306665 - 17306733
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  17306665 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataattaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 17306733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21316806 - 21316759
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21316806 ttacagagcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 21316759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Original strand, 26392292 - 26392389
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || ||| || |||| |||||||||  ||||||||    
T  26392292 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga-aacatcgacatcttatataactccaataatttggaaca 26392389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21336708 - 21336663
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21336708 ttacagagcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 21336663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 36839216 - 36839261
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36839216 acagggcatcaagctctcaacataaatgagtatgcatggactcaac 36839261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23969502 - 23969459
Alignment:
Q  195 acaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969502 acaacttt-accaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 23969459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 21115649 - 21115708
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21115649 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 21115708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23969641 - 23969606
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969641 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatg 23969606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43947577 - 43947534
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43947577 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 43947534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22252700 - 22252625
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact---caacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  22252700 cagggtatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactccacaacgt-gtacaacttggacaacatcaacaact 22252625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27485356 - 27485295
Alignment:
Q  190 acttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataat-caataacaacagagaca 251  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27485356 actttacaacttagaccaacatatgtaacttaatgatttaataattcaata-caacagagaca 27485295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Original strand, 22685900 - 22685953
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  22685900 tatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgattctgcatggactcaac 22685953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28653511 - 28653467
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28653511 acagggcatcaagcc-tcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 28653467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18787232 - 18787169
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18787232 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 18787169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 25085506 - 25085558
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25085506 tatacattccagagcatcaagccatcaacttaatatgagtatgcatggactca 25085558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1384778 - 1384735
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  1384778 acagggcatcaagcccttaagtttaatgagtatgcatggactca 1384735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18547158 - 18547115
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18547158 cagggtatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 18547115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 21237664 - 21237723
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  21237664 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatgaactcaacaacttacatcttaga 21237723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 22258963 - 22259087
Alignment:
Q  31 caacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtc 128  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||  || | |||||||   |||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  22258963 caacgtatagagcataaaaccctcaacttaatatggatgattatacatccaacatcgcatcaatctctcaactttaatgagtatgcatggactcagcttc 22259062  T
Q  129 ttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22259063 -gacaacttagaccacttcgacaact 22259087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 25108709 - 25108778
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25108709 agggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 25108778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 17306533 - 17306574
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17306533 ggcatcaagccttcagcgtaaatgagtatgcatggactcaac 17306574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22413466 - 22413403
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22413466 agggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 22413403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24697819 - 24697759
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  24697819 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 24697759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25587730 - 25587690
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25587730 gcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactcaac 25587690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9410 - 9218
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9410 catcaagccctcaacttataggtcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 9311  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  9310 ctcaacgtcttacaacttaaataacttaaacacctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 9218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9866 - 9674
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9866 catcaaaccctcaacttacagggtatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattataggccatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 9767  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  9766 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 9674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 76695 - 76844
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  76695 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgca 76794  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  76795 ctcaacgtcttacaacttaaacaactttgacatctcatatgactccaata 76844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 446396 - 446536
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  446396 agggcatcaagccctcaactcaa-tgagtatgcatggaattaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacaac 446494  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    |  |||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  446495 attttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 446536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 160476 - 160545
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  160476 agggcatcaaaccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagcccccaacttaattgag 160545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Original strand, 497337 - 497410
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa-cgtct--tacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  497337 ggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaatcaacttgtacaacttagacaacatcaacaact 497410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 2574 - 2718
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2574 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgaatatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 2673  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2674 aacaacttacaacttgacaactttgaccagcatatgcaacttaat 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 2865 - 2940
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact---caacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  2865 cagggtatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactccacaacgt-gtacaacttggacaacatcaacaact 2940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10901 - 10718
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  10901 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaagttagacaacttcaacaacacatatgactctaatatcttggaat 10802  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    | ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  10801 aacaactt--------acaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacagcagagacaacaacatacaacaacttca 10718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6716 - 6554
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6716 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatatattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgaactcaacgtcttacaactta 6617  T
Q  139 gacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
     |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  6616 aacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 6554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5667 - 5519
Alignment:
Q  121 tcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttga-caactttgaccaacatatgcaact 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  5667 tcaacatcttacaacttaaacaacttagagatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaactt-gaccaacatatgcaact 5569  T
Q  220 taatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  5568 taatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 5519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2127 - 2064
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2127 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 2064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 95275 - 95481
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  95275 catcaagccctcaacttacagagcatcaagccctcaacgtaatatgtatgaatatacattctagagcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatgga 95374  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagac-aacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |    
T  95375 ctcaacaacttacaacttagacaaacttgaacaacttatatgactccaataacttggaacaacatcttacgactttgcaacttagaccaacatttgcatc 95474  T
Q  219 ttaatga 225  Q
    |||||||    
T  95475 ttaatga 95481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10334 - 10185
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10334 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccttcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagctcttaacttaaatgagtatgcatgga 10235  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  10234 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttagacatctcatatgactccaata 10185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 78418 - 78289
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78418 catcaagccctcaacttacaggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 78319  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  78318 ctcaacgtcttacaacttaaacaacttcaa 78289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 20699 - 20874
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  20699 acagagcatcaaatcctcaacttcaaatgagtatgcacggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaatttatatgactccaatactttggaac 20798  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20799 aacatcttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacagcagaaacaaca 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 265
Target Start/End: Original strand, 11219 - 11407
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||| | || ||| || ||||||||||||||  ||||| ||    
T  11219 acagggcatcaagccctcaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacatggacatcatcgacatcttatatgactccaatactttggatca 11318  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacaa---catacaacaactt 265  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||   |||||||||||||    
T  11319 acaacttacaacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaacaatcaataacagcacagacaacaacatacaacaactt 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3551
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  3508 acagggcatcaagccctcaaatttaatgactatgcatggactca 3551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 78030 - 78179
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatgga 119  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  78030 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatagattacagggcattaagccctcaacttaaatgaggatgcatgga 78129  T
Q  120 ctcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  78130 ctcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaata 78179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Original strand, 22189 - 22247
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22189 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 22247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2914 - 2795
Alignment:
Q  50 ccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  2914 ccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaaacaacttaga 2815  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || |||||||||||||||||    
T  2814 catctcatatgactccaata 2795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2942
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaa 91  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2994 agggcattaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaa 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8320
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||| | |||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8389 agggcatcaagctctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaacttaattgag 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 556 - 700
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  556 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaagttacaacttggacaacatcaacaacttatatgacaccaatatcttggaac 655  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  656 aacaacttacaacttgacaactttgactaacatacgcaacttaat 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 847 - 922
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggact---caacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  847 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactccacaacgt-gtacaacttggacaacatcaacaact 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4789 - 4630
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  4789 acagggcatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatccacaacttatatgaatccaatactttggaaca 4690  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
     || ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4689 acatcttacaacttaacaactttgactaacataagcaacttaatgatttattaatcaata 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14835 - 14679
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  14835 acagggcatcaagcactcaacttgaatgagtatgcatggtctcaacaacttacaacttagacaacatcgacaatttatatgaatccaatactttggaaca 14736  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatca 236  Q
     || ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14735 acatcttacaacttaacaactttgactaacataagcaacttaatgatttattaatca 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 14134 - 14283
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14134 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 14233  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  14234 actcaacatcttacgactta-acaacttagacatctcatatgactccaata 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 2886 - 2987
Alignment:
Q  37 atagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaact 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2886 atagggcatcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcaggaagccctcaacttaaattagtatgcatggactcaacgtcttacaact 2985  T
Q  137 ta 138  Q
    ||    
T  2986 ta 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Original strand, 16656 - 16819
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| | |||||||||    
T  16656 acagggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttataccacttcaacaacttggaaca 16755  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataaca 242  Q
     |||||||| ||||  | | ||||||||  |  |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  16756 acaacttacaacttagcgaatttgaccataacttgcaacttaatgatattaacaatcaacaaca 16819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11303 - 11251
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11303 tatacagtccagagcatcaagccctcaacttaatatgagtatgcatggactca 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 934 - 791
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  934 ggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggacttagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaaca 835  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  834 acttacaactttacaacttagaccaacacttgcaaattaatgat 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6238 - 6095
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238 ggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggacttagcaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaaca 6139  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  6138 acttacaactttacaacttagaccaacacttgcaaattaatgat 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11707 - 11562
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  11707 agggcatcaagccctcaactttagatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaaattatatgactccaatatcttgaaacaa 11608  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  11607 caacttacaactttataacttagaccaacacttgcaacttaatgat 11562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 59651 - 59512
Alignment:
Q  30 tcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtct 129  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  59651 tcaacttacagggcatcaagtcctcaacatgatatgtataaatatatattacagggcatcaagtcctcaaattaaatgagtatgcatggactcaacatct 59552  T
Q  130 tacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  59551 tacaacttaaacaacttagacatctcatatgacttcaata 59512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 60313 - 60439
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||    
T  60313 ggcatcaagccctcaacttatatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacttcaacaacttatatacctccaatatcttggaataacaa 60412  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaaca 210  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  60413 cttacaactttacaacttagaccaaca 60439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 53878 - 53816
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactt 102  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53878 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactt 53816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 3319 - 3492
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3319 acagggcatcaagccctcaacatatatgagtatgcatagactcagcaacttacaacttagacaacttcagcaacttatatgattccaatatcttggaaca 3418  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaa 252  Q
     ||| |||| ||||  |||||| ||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3419 acaagttacaactttgcaacttagaccaacacttgcatttaaatgatattaataatcaataacagcagagacaa 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 127418 - 127242
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  127418 acagggaatcaagccatctacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttgaacaacttatatgactccaatatcttgcaaaa 127319  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataa-tcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||| ||||  |||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  127318 tcaacttacaactttgcaacttagaccaacacttgtaacttaatgatattaataattcaacaacagcagagacaaca 127242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 556 - 600
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  556 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 849
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  975 catcaaaccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 876  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  875 actcaacatcttacgactt-gacaactt 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 866 - 782
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  866 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaaagcaacatacaacaactt 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6169 - 6085
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6169 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacagcaacatacaacaactt 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 33404 - 33530
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33404 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaatccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 33503  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33504 actcaacatcttacgactt-gacaactt 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 14125 - 14272
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||  |||||||    
T  14125 acagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaactcca-caacttatgtgattccaatactttggaac 14223  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatt 227  Q
    | || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14224 aacatcttataacttgacaactttgactaacatatgcaacttaatgatt 14272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Original strand, 33513 - 33597
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33513 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacatcaacatacaacaactt 33597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Original strand, 2962 - 3053
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaa 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2962 catcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaac-tccacaacttatatgactccaatatcttggaa 3053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 55894 - 55835
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  55894 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 55835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 262 - 388
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  262 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataattatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 361  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  362 acttaacatcttacgactt-gacaactt 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Original strand, 371 - 438
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaca 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 10849 - 10975
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10849 catcaagccctcaacttacagggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 10948  T
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10949 actcaacatcttacgactt-gacaactt 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Original strand, 7138 - 7222
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  7138 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagacagcaacatacaacaactt 7222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Original strand, 10958 - 11042
Alignment:
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10958 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagaaagcaacatacaacaactt 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2930 - 2771
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  2930 ggcatcaagccctcaactttaatgagtatacatggactcaacaaccaacgacttagacaactccaacaacttatacgactccaatatcttggaacgacaa 2831  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatg-atttaataatcaataaca 242  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2830 cttacaactttgcaactttgaccaaaacttgcaacttaatgaatttaataatcaacaaca 2771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 24215 - 24390
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||     
T  24215 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacatcaacaacttatatgactccaatactttagaact 24314  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
     |||||||  ||||   ||||| ||||||||  | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||    
T  24315 acaacttaaaactttgtaacttagaccaacacttccaacttaatgataatgataatcaacaacaacagaggcaaca 24390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 284 - 453
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaact 185  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  284 catcaaaccctcaacatatatgagtatgcatgggctcatcaaattacaacttaaacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaacaact 383  T
Q  186 tacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||| ||||  |||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  384 tacaactttgcaacttagaccgacacttgcaacttagtgatattaataatcagtaacagtagagacaaca 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 8539 - 8708
Alignment:
Q  86 catcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaact 185  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8539 catcaaaccctcaacatatatgagtatgcatgggctcatcaaattacaacttaaacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaacaact 8638  T
Q  186 tacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||| ||||  |||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  8639 tacaactttgcaacttagaccgacacttgcaacttagtgatattaataatcagtaacagtagagacaaca 8708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10635 - 10497
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa---cgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| | | ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  10635 ggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactccatagcgtgt-ataacttggacaacatcaacaacatatatgactccaatatcttggaacaa 10537  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10536 caacttacaacttgacaactttgactaacatatgcaactt 10497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 36090 - 36133
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36090 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 36133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Original strand, 1379 - 1541
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  1379 agggcatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcaacttacatgagtatgcaatagactcgacatcttacgactt 1478  T
Q  138 agacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    | |||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  1479 a-acaacttagacatctcatataactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt 1541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 17463 - 17633
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |    
T  17463 agggcatcaagccctcaacatataggagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacatcaacaacttatacgatgccaatatcttggaacaac 17562  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagaca 251  Q
    ||||||| ||||  |||||  ||||||||  ||||| | |||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  17563 aacttacaacttcgcaactcagaccaacacttgcaattaaatgatattaatcatcaataacagtagagaca 17633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13140
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||     
T  12996 acagggcatcaagctctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaacttc-acaacttatatga-tccaatatcttggaat 13093  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | ||| ||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  13094 aacaatttacagctttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 13140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 15816 - 15958
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | || |||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |     
T  15816 agggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatgaactcaacaacgtagaacttaaacaacttca-caacttatacga-tccaatatcttggaataa 15913  T
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||||||| |||| |||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  15914 caacttacaactttacaaattagactaacacttgcaacttaatga 15958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53637 - 53492
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  53637 acagggcatcaaaccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacgtacaacttagacaactcca-caacttatatgactcgaatatcttggaat 53539  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |  ||||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  53538 aaaaacttacaactttacaactttaaccaacacttgcaacttaatga 53492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 54920 - 55064
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  54920 acagagcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggataacatcaacaacttatatgactccaatactttggaac 55019  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
    | || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  55020 aacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 55064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 950 - 1109
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  950 agggcatcaaaacctcaacttgaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacatcaacaacttatatgactccaatactttggaacaac 1049  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataaca 242  Q
    ||| ||| ||||  ||| || ||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1050 aac-tacaactttgcaaattagaccagcacttgcaacttgatgatttgataatcaataaca 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 709 - 605
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  709 catcaagccctcaacttacagggcatctagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 610  T
Q  119 actca 123  Q
    |||||    
T  609 actca 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 11046 - 11189
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11046 acagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggaccaaacatcctacaacttggacaacatcgacatcttatatgactccaatattttggaaca 11145  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| |||| ||||||| || | |||| |||||||||||    
T  11146 acatcttacaacttcacaacttagatcgacatttgcaacttaat 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 22146 - 22289
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22146 acagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggcctaaatatcttacaacttggacaacatcgacatcttatatgactccaatattttggaaca 22245  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| |||| ||||||| || | |||| |||||||||||    
T  22246 acatcttacaacttcacaacttagatcgacatttgcaacttaat 22289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 102106 - 102061
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  102106 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 102061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 136617 - 136454
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  136617 acagggcatcacaccctcaactttaatgactatgcatggactcaacgaccaacaacttagacaacttcaacagcttatacgactccaacatcttggaaca 136518  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataaca 242  Q
     |||||||| ||||  | |||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  136517 acaacttacaacttagcgactttgacaataacttgcaacttaatgatattaataatcaacaaca 136454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21021 - 20855
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||    
T  21021 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgacttcaacattttggaaca 20922  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaaca 245  Q
     |||||||| ||||    ||||| ||||  |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20921 acaacttacaacttagagacttttaccataacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacaaca 20855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Original strand, 5423 - 5611
Alignment:
Q  37 atagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaac 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||     ||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5423 atagggcatcaagccctcaacataaagagcataaatacac-tcatagggcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaac 5521  T
Q  136 ttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| || ||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  5522 ttggacaacatcaacaacttatatgactcaaatactttggaacaacatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaatttaatga 5611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7919 - 7876
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7919 acagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 7876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 3166 - 3210
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3166 cagggcatcaagccgtcaacttaaatgagtatgcttggactcaac 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41297 - 41193
Alignment:
Q  20 catcaaaccttcaacttatagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atgg 118  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41297 catcaaaccctcaacttacagggcattcagcccttaacataatatgtataaatatacattatagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcaatgg 41198  T
Q  119 actca 123  Q
    |||||    
T  41197 actca 41193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 76042 - 75934
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||    
T  76042 acagggcatcaagccctcaacttaaatcagtatgcatggactcaacatcttataacttagacaacatcgacatcttatatgactccaacattttggaaca 75943  T
Q  180 ccaacttac 188  Q
     || |||||    
T  75942 acatcttac 75934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 65986 - 65943
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  65986 acagagcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 65943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11666
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  11809 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgtatggactcagcaacttacaacttggacaacatcgacaacttatatgattccaatactttggaaca 11710  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  11709 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19469 - 19327
Alignment:
Q  54 caacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaaca 151  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||    
T  19469 caacataatatgtataactatacattatagggcaacaaaccctcaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttagaca 19371  T
Q  152 actcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttga 195  Q
     |||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||    
T  19370 tctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacgacttga 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 63173 - 63051
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||  |||||||| |||    
T  63173 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttagacaacgtcaacaacatctacgactccaatactttggaacaacaa 63074  T
Q  184 cttacgactt-gacaactttgac 205  Q
    | ||  |||| ||||||||||||    
T  63073 catataacttagacaactttgac 63051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 397545 - 397690
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  397545 acagggcatcaaaccctcaacttcaaatgagtatgcatggactcaaatacgtacaacttggacaaatcca-caacttatatgactccaatatcttggaat 397643  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  397644 aacaacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacataatga 397690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Original strand, 397429 - 397494
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatata-tataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  397429 agggcatcaaaccctcaacata-tagagtataattatac-tcacagggcatcaagccctcaacttaaa 397494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 127694 - 127632
Alignment:
Q  181 caacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataaca 242  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  127694 caacttacaacttagcaactttgaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaaca 127632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Original strand, 39169 - 39309
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||    
T  39169 ggcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaacttatatgactccaatactttagaacaaca 39268  T
Q  183 acttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     ||||| ||||   ||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  39269 tcttacaactttgtaacttagacaaacacttgcaacttaat 39309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 109223 - 109382
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaac-ttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  |||||||| || || |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  109223 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactccgcaaccaacaacttaaacgacattcaacaacttatacaactccaatatcttgggac 109322  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaaca 245  Q
    | ||||||        ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  109323 aacaactt--------acaactttgaccaacacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacaaca 109382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 332230 - 332286
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  332230 ggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 332286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 5943 - 6032
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||| || ||| ||||||||||    
T  5943 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggaatcaacatcttacaacttaaacaacatgaacatcttatacgactccaata 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1584 - 1448
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||   |    
T  1584 agggcatgaagccatcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaaattacaacttggacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaatgac 1487  T
Q  182 aacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  1486 aacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaactt 1448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19645 - 19502
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  | ||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||     
T  19645 acagagcatcaagccctcaacttcaaatgagtatgcatggactagacaacatacaacttaaacaactcca-caact--tatgactccaatatcttggaat 19549  T
Q  179 accaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |  ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  19548 aataacttacaactttacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 19502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7653 - 7510
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | |||| |||||| |||||||  |||||||     
T  7653 acagggtatcaagccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcgaaaacttatatgattccaatactttggaact 7554  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaat 223  Q
     || ||||| ||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  7553 acatcttacaactttgtaacttagaccaacacttgcaacttaat 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 263 - 411
Alignment:
Q  119 actcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaac 218  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  263 actcaacatcttacgactta-acaacttagatatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaacaactt-gaccaacatatgcaac 360  T
Q  219 ttaatgatttaataatcaataacaacagagacaaca---tacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||   |||||||||||||    
T  361 ttaatgatttaataatcaat-acagtagagacaacaacgtacaacaacttca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 113654 - 113562
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  113654 agggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacctacaact-----aacttcaacaacttatacgactccaatatcttggaaca 113562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13118 - 13011
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  13118 acagggcatcaagctctcaactcaa-tgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacgtcaacaacttatacgactccaatactttggaaca 13020  T
Q  180 ccaacttac 188  Q
     || |||||    
T  13019 acatcttac 13011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Original strand, 66076 - 66238
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||         ||| |||||| | ||||||||| | |||    
T  66076 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaactt---------atacgactccgacatcttggaataacaa 66166  T
Q  184 cttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat-ttaataatcaataacaacagagacaaca 254  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  66167 cttacaactttgcgactttgaccaatacttgcaacttaatgatattaataatcaacaacagcaaagacaaca 66238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15729
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15678 tatacattccagagcatcaagccctctactttaatgattatgcatggactca 15729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 5)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 7338 - 7400
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7338 ttacagggcatcaaaccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaga 7400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 14457 - 14519
Alignment:
Q  78 ttacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14457 ttacagggcatcaaaccctcaacttgaatgagtatgcatggactcaacatcttacaacttaga 14519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13408 - 13340
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagac---aacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  13408 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaataacatacaacaacttca 13340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19675 - 19607
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagagac---aacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  19675 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaagaacatacaacaacttca 19607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19811 - 19766
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19811 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 19766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 15365 - 15502
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  || || |||||||  |||||||     
T  15365 acagggcatgaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaact--taagaatccaatactttggaacg 15462  T
Q  180 ccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
     |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  15463 acaacttacaactt-acaacttagaccaacacctgcaactt 15502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19151 - 19094
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19151 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaactt 19094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 1460 - 1528
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaa 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  1460 gcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcagcaacttacaacttagacaacttcaacaa 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Original strand, 4622 - 4686
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaa 143  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  4622 acagagcatcaagccctcaacttgaaatgagtatgcatggactcgggaacttacaacttagacaa 4686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1404
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1339 agggcatcaagccctcaacataaagagtataattatac-tcacagggcatcaagccctcaacttaaa 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47095 - 46980
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaac 150  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||    
T  47095 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacattttacaactta-acaacttagac 46997  T
Q  151 aactcatatgactccaa 167  Q
    | |||||||||||||||    
T  46996 atctcatatgactccaa 46980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 125676 - 125787
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaac-ttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaaca 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||     
T  125676 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaacaacttacaactttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaacg 125773  T
Q  180 ccaacttacgactt 193  Q
     |||||||| ||||    
T  125774 acaacttacaactt 125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38364 - 38265
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa-cgtct--tacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaa 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||    
T  38364 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaatcaacttgtacaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaa 38267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Original strand, 15938 - 16023
Alignment:
Q  38 tagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15938 tagggcatcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgattatgcatggactca 16023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 25016 - 25076
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25016 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 295 - 227
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagag---acaacatacaacaacttca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  295 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acagcagagacaacaacatacaacaacttca 227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 431 - 386
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  431 acagggcaccaagccctcaacgtaaatgagtatgaatggactcaac 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 183 - 100
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgact 163  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  183 acagtgcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcagcaaccaacaacttagacaacttcaacaacttatacgact 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 163
Target Start/End: Original strand, 7406 - 7485
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaactt-aaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgact 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  7406 gcatcaagccctcaactttaaatgagtatgcatggactcagaaacttacaacttagacaacttcaataacttatacgact 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 7460 - 7534
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||    
T  7460 acagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaaattacaacttggacaacatcaacaact 7534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44204 - 44086
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  44204 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 44106  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  44105 catctcttatgactccaata 44086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 10879 - 10924
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10879 acagggcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 10924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Original strand, 1658 - 1724
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaataacaacagaga---caacatacaacaactt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  1658 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaat-acaacagagatagcaaaatacaacaactt 1724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18375 - 18335
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375 gcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 18335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 8070 - 8114
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8070 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatagactcaac 8114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 616 - 659
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  616 agggcatcaagccttcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 106266 - 106442
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctc----aacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  106266 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaactctcacctaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttaga 106364  T
Q  150 caactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatgat 226  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||  |||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  106365 catctcttatgactccaataacttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgat 106442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 3749 - 3834
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3749 agggcatcaaaccctcaacttaatatgaatgt-tatacattcaatagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 3834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 17413 - 17456
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17413 agggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaac 17456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7525 - 7439
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7525 agggcatcaagccctcaacttaatatgaatgatgatacattcaacagggcatcaagccctcaactttaatgagtatgcaaggactca 7439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Original strand, 117089 - 117193
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacacc 181  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||  |||||||  |    
T  117089 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacatacaacttggacaacatcgacaact--taagactccaatactttggaactac 117186  T
Q  182 aacttac 188  Q
    |||||||    
T  117187 aacttac 117193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 32325 - 32388
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32325 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 32388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13755 - 13713
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13755 agggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactcaa 13713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 239
Target Start/End: Original strand, 23574 - 23612
Alignment:
Q  201 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574 ttgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 23612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 221418 - 221376
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  221418 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagcatgcatggactca 221376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 233
Alignment:
Q  202 tgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270 tgaccaacatatgcaacttaatgatttaataatcaata 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 3729 - 3774
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3729 acagggcatcaaaccctcaactttaatgagtatgcatggactcaac 3774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 1718 - 1761
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1718 acagggcatcaagtcctcaactttaatgagtatgcatggactca 1761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 7565 - 7638
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| || ||||||    
T  7565 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaactcacaacttggacaacatcgacaact 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Original strand, 7669 - 7758
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaactt 220  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| |||| || || |||||  ||||||||    
T  7669 acaacttagacaacaccaacaacttatatgactccaatactttggaacgacaacttataactttacaatttagagcaacacctgcaactt 7758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25080 - 24973
Alignment:
Q  114 catggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatat 213  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||  | |||| ||||||||  |    
T  25080 catgaactcaacaacttacaacttagacaacttc-acaacttatatga-tccaatatcttggaataataacttacaactttgctacttagaccaacactt 24983  T
Q  214 gcaacttaat 223  Q
    ||||||||||    
T  24982 gcaacttaat 24973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 65036 - 64931
Alignment:
Q  42 gcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||||| | | ||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||||| |    
T  65036 gcatcaaaccctcaactttaaatgaatgattatacattccagagcatcaagccctcaacttaatatgagtatgcattgactcaacaaccaacaacttaaa 64937  T
Q  141 caactt 146  Q
    ||||||    
T  64936 caactt 64931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Original strand, 142490 - 142531
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  142490 cagggcatcaagcccccaacttaaatgagtatgcatggactc 142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 10072 - 10147
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtc--ttacaacttagacaacttcaacaact 154  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||||||||||||||||||||||    
T  10072 cagggcatcaaacccccaacttaaatgagtatgtatggactcaacaacgtgtgcaacttagacaacttcaacaact 10147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 201
Target Start/End: Original strand, 10759 - 10870
Alignment:
Q  90 aagccctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttac 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||| || || |||||    
T  10759 aagccctcaacctaaatgagtatgcaatggactcaacatcttacgactta-ataacttatacacctcatataactccaataatttggatcaacatcttac 10857  T
Q  189 gacttgacaactt 201  Q
     |||| |||||||    
T  10858 aacttaacaactt 10870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25811 - 25771
Alignment:
Q  85 gcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25811 gcatcaagccctcaacgtaaatgagtatgcatggactcaac 25771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 1609 - 1652
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1609 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Original strand, 8164 - 8258
Alignment:
Q  130 tacaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||| |   ||||||||||||    
T  8164 tacaacttaaacaactcca-caacttatatgactctaatatcttggaataacaacttacaactttacaacttagaccaaaaatagcaacttaatga 8258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 464 - 378
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  || | ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  464 agggcatcaagctctcaacttaatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactca 378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 18132 - 18175
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18132 acagggcatcaagccctcaagtttaatgagtatgcatggactca 18175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 1848 - 1934
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacatt--acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1848 agggcatcaagccctcaactttatatgaatgattatacattcaacagggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactca 1934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 56093 - 56144
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  56093 tatacattccagagcatcaagccctcaactttaatgattatgcatggactca 56144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17129 - 17086
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17129 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 17086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26241 - 26198
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26241 cagggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 26198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 25655 - 25698
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25655 acagggcatgaagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 25698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 969 - 911
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  969 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 107 - 214
Alignment:
Q  66 tataaatatacattacagggcatcaagcc---ctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaacaactcatatg 160  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||    
T  107 tataaatatacattacagagcgtcaagcctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttagacatctcttatg 205  T
Q  161 actccaata 169  Q
    |||||||||    
T  206 actccaata 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Original strand, 2746 - 2864
Alignment:
Q  56 acataatatatataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||  |    
T  2746 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatgcactcaacatcttaaaaactta-acaacttaga 2844  T
Q  150 caactcatatgactccaata 169  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  2845 catctcttatgactccaata 2864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7665 - 7631
Alignment:
Q  108 agtatgcatggactcaacgtcttacaacttagaca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7665 agtatgcatggactcaacgtcttacaacttagaca 7631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23793 - 23686
Alignment:
Q  66 tataaatatacattacagggcatcaagcc---ctcaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaacttagacaacttcaacaactcatatg 160  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||    
T  23793 tataaatatacattacagagcgtcaagcctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acaacttagacatctcttatg 23695  T
Q  161 actccaata 169  Q
    |||||||||    
T  23694 actccaata 23686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20863 - 20793
Alignment:
Q  66 tataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctta 131  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20863 tataaatatacattatagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 20793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14330 - 14272
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttaga 140  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14330 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatcttaga 14272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 166655 - 166607
Alignment:
Q  104 aatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaacttcaacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  166655 aatgagtatgcatggactcaacaacttacaacttggacaacatcaacaa 166607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2624 - 2567
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaactta 138  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  2624 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaacaacttacatctta 2567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16393 - 16329
Alignment:
Q  38 tagggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16393 tagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 16329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 345
Alignment:
Q  67 ataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  400 ataaatatac-tcacagggcaccaagccctcaattttaatgagtatgcatggactca 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 10345 - 10438
Alignment:
Q  131 acaacttagacaacttcaacaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgactt-gacaactttgaccaacatatgcaacttaatga 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  10345 acaacttagacaacatcaacaact--taagactccaatactttggaacgacaacttacaacttagacaacttaaaccaacatctgcaacttgatga 10438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 420 - 472
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  420 tatacattccagtgcatcaagcccacaacttaatataagtatgcatggactca 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 5926 - 5978
Alignment:
Q  72 tatacattacagggcatcaagccctcaacttaa-atgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5926 tatacattccagtgcatcaagcccacaacttaatataagtatgcatggactca 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 884
Alignment:
Q  149 acaactcatatgactccaatatcttggaacaccaacttacgacttgacaactt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  936 acaacttatatgactccaatatcttggaataacaacttacaactttacaactt 884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28041 - 27978
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28041 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 27978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 206736 - 206692
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  206736 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 206692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 106192 - 106236
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  106192 cagggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 106236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 96915 - 96958
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  96915 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaac 96958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18791 - 18752
Alignment:
Q  83 gggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactc 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18791 gggcatcaagccctcaacttcaatgactatgcatggactc 18752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 34336 - 34379
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34336 acagggcatcaagccttcaactttaatgactatgcatggactca 34379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 57726 - 57769
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  57726 cagggcattaagcccccaactttaatgagtatgcatggactcaa 57769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 61797 - 61840
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  61797 acagggcatcaagcccccaactttagtgagtatgcatggactca 61840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 430 - 496
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagacaactt 146  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  430 acagggcatcaaacccctaactttaatgagtatgcatggactcaacaaccaacaacttaaacaactt 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 7903 - 7989
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||  || | |||||||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7903 agggcatcaaacccccaactttaaatgaatgattatacattccagagcataaagtcctcaactttaatgattatgcatggactcaac 7989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19858 - 19816
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19858 agggcatcaagcccccaactttaatgagtatgcattgactcaa 19816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19934 - 19906
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaacttaaatgag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19934 cagggcatcaagccctcaacttaaatgag 19906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4906 - 4864
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaa 124  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  4906 agggcatcaagcccccaacatgaatgagtatgcatggactcaa 4864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 182 - 137
Alignment:
Q  80 acagggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  182 acagggcatcaagccctacactttaatgagtatgcacggactcaac 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13895 - 13834
Alignment:
Q  81 cagggcatcaagccctcaact-taaatgagtatgcatggactcaacgtcttacaacttagac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  13895 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacatctttcatcttagac 13834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 1807 - 1847
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1807 ggcatcaatccctcaacttaa-tgagtatgcatggactcaac 1847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 123
Target Start/End: Original strand, 17332 - 17365
Alignment:
Q  90 aagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17332 aagccctcaactttaatgagtatgcatggactca 17365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 49083 - 49124
Alignment:
Q  84 ggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactcaac 125  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49083 ggcatcaagcccccaactttaatgattatgcatggactcaac 49124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4022 - 3981
Alignment:
Q  82 agggcatcaagccctcaacttaaatgagtatgcatggactca 123  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4022 agggcatcaagccctcatctttaatgggtatgcatggactca 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 825 - 888
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| | |||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  825 agggcatcaagctctcaacgtaataagtattaatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 877 - 940
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  877 agggcatcaagccctcaacgtaataagtattgatatac-ttccagggcatcaagccctcaactta 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 44394 - 44457
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| | |||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44394 agggcatcaagctctcaacgtattaagtattaatatac-ttacagggcatcaagccctcaactta 44457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 78115 - 78178
Alignment:
Q  39 agggcatcaaaccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctcaactta 103  Q
    |||||||||| | |||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  78115 agggcatcaagctctcaacgtattaagtattaatatac-ttacagggcatcaagccctcaactta 78178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University