View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3116_low_30 (Length: 296)

Name: NF3116_low_30
Description: NF3116
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3116_low_30
NF3116_low_30
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-278)||(1108186-1108463)
chr2 (1-187)||(31517236-31517423)
chr2 (1-190)||(33906068-33906258)
chr2 (3-187)||(3873267-3873452)
chr2 (1-190)||(26323207-26323397)
chr2 (1-188)||(18806905-18807093)
chr2 (1-174)||(1482924-1483096)
chr2 (1-188)||(42937715-42937904)
chr2 (1-188)||(4232163-4232351)
chr2 (1-188)||(39635448-39635636)
chr2 (1-190)||(19901159-19901348)
chr2 (4-188)||(6174852-6175037)
chr2 (1-184)||(4016039-4016223)
chr2 (2-170)||(5733414-5733582)
chr2 (1-184)||(28329860-28330042)
chr2 (1-188)||(2178790-2178978)
chr2 (39-185)||(30420226-30420373)
chr2 (1-174)||(16066315-16066488)
chr2 (1-190)||(30270700-30270890)
chr2 (1-171)||(19383956-19384126)
chr2 (1-184)||(850997-851181)
chr2 (1-188)||(16588797-16588985)
chr2 (1-171)||(429830-430000)
chr2 (1-174)||(44947570-44947736)
chr2 (53-188)||(42446642-42446778)
chr2 (43-149)||(22101210-22101316)
chr2 (45-183)||(3585291-3585430)
chr2 (52-162)||(12517256-12517366)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-190)||(9008078-9008268)
chr5 (1-188)||(1579035-1579223)
chr5 (1-188)||(1605592-1605780)
chr5 (1-188)||(27679190-27679378)
chr5 (1-190)||(27420855-27421045)
chr5 (1-190)||(16069350-16069540)
chr5 (1-190)||(24105692-24105882)
chr5 (1-190)||(33491217-33491407)
chr5 (1-174)||(16737468-16737641)
chr5 (1-190)||(19358523-19358713)
chr5 (1-190)||(35782665-35782855)
chr5 (1-174)||(3386507-3386680)
chr5 (1-189)||(4120935-4121124)
chr5 (1-190)||(20992167-20992357)
chr5 (9-188)||(8374367-8374547)
chr5 (1-188)||(33991139-33991327)
chr5 (1-187)||(5202972-5203159)
chr5 (1-171)||(1165622-1165792)
chr5 (1-189)||(31883142-31883331)
chr5 (1-188)||(38598471-38598659)
chr5 (1-190)||(3921578-3921768)
chr5 (1-170)||(31410494-31410663)
chr5 (1-151)||(26602963-26603113)
chr5 (1-143)||(27025001-27025143)
chr5 (53-190)||(20992354-20992496)
chr5 (47-171)||(33284642-33284766)
chr5 (54-188)||(25634581-25634714)
chr5 (52-159)||(31638174-31638281)
chr5 (69-122)||(41818552-41818605)
chr5 (1-37)||(35420445-35420481)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (1-185)||(38856089-38856274)
chr3 (1-190)||(42307912-42308102)
chr3 (1-188)||(37698150-37698338)
chr3 (1-187)||(25999382-25999569)
chr3 (1-190)||(15520149-15520339)
chr3 (1-190)||(8042598-8042788)
chr3 (1-188)||(22174997-22175185)
chr3 (1-188)||(29445481-29445669)
chr3 (1-188)||(50528922-50529110)
chr3 (1-188)||(54534335-54534521)
chr3 (1-190)||(20842355-20842545)
chr3 (1-171)||(21581053-21581223)
chr3 (2-187)||(25494293-25494479)
chr3 (1-190)||(32244111-32244301)
chr3 (1-188)||(46452169-46452357)
chr3 (5-188)||(15520629-15520813)
chr3 (1-188)||(54870181-54870369)
chr3 (1-190)||(12117665-12117855)
chr3 (5-186)||(20699144-20699326)
chr3 (1-188)||(35226440-35226628)
chr3 (1-188)||(38933939-38934126)
chr3 (1-190)||(32359250-32359440)
chr3 (1-174)||(44609340-44609513)
chr3 (1-188)||(24835706-24835894)
chr3 (1-171)||(42104978-42105148)
chr3 (4-187)||(26122808-26122992)
chr3 (11-171)||(2895196-2895356)
chr3 (3-188)||(34700334-34700520)
chr3 (2-161)||(44688782-44688940)
chr3 (30-186)||(35643212-35643369)
chr3 (48-171)||(50529827-50529950)
chr3 (1-188)||(53028218-53028398)
chr3 (1-174)||(48925010-48925181)
chr3 (1-149)||(16354379-16354527)
chr3 (54-190)||(49128040-49128177)
chr3 (1-159)||(12915930-12916087)
chr3 (1-68)||(24366143-24366210)
chr3 (5-61)||(13696914-13696970)
chr3 (132-190)||(24366083-24366142)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-187)||(14422702-14422889)
chr8 (1-189)||(18594534-18594723)
chr8 (1-188)||(39206584-39206772)
chr8 (1-187)||(29938060-29938247)
chr8 (1-188)||(10836776-10836964)
chr8 (1-184)||(13110406-13110590)
chr8 (1-188)||(22260651-22260839)
chr8 (1-187)||(35118052-35118239)
chr8 (1-182)||(2042545-2042727)
chr8 (1-188)||(24113187-24113375)
chr8 (1-190)||(4035843-4036033)
chr8 (1-186)||(34842386-34842572)
chr8 (1-192)||(6144294-6144486)
chr8 (1-188)||(39218775-39218963)
chr8 (1-183)||(144397-144580)
chr8 (1-183)||(41575516-41575699)
chr8 (3-190)||(34998919-34999107)
chr8 (1-174)||(34679478-34679651)
chr8 (1-187)||(33278399-33278586)
chr8 (1-174)||(7774777-7774950)
chr8 (1-174)||(44804965-44805138)
chr8 (1-187)||(38167176-38167363)
chr8 (1-185)||(7791412-7791597)
chr8 (31-190)||(40117903-40118063)
chr8 (31-188)||(33287076-33287234)
chr8 (1-189)||(36491154-36491343)
chr8 (1-188)||(7811993-7812181)
chr8 (48-190)||(26783801-26783944)
chr8 (3-184)||(8021721-8021895)
chr8 (9-174)||(28639291-28639460)
chr8 (1-187)||(5320563-5320750)
chr8 (2-182)||(42571598-42571776)
chr8 (4-174)||(66203-66374)
chr8 (2-108)||(9807339-9807445)
chr8 (43-190)||(2322075-2322223)
chr8 (59-174)||(5005179-5005294)
chr8 (43-171)||(39220272-39220400)
chr8 (100-184)||(9806875-9806960)
chr8 (52-171)||(18683726-18683844)
chr8 (52-171)||(18729288-18729406)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (1-190)||(16052090-16052280)
chr1 (1-190)||(26663252-26663442)
chr1 (1-188)||(1168499-1168687)
chr1 (1-188)||(39260367-39260555)
chr1 (1-190)||(20089465-20089655)
chr1 (1-188)||(1940768-1940956)
chr1 (1-188)||(25897370-25897558)
chr1 (1-188)||(52753168-52753356)
chr1 (1-174)||(29078527-29078700)
chr1 (1-188)||(26580291-26580479)
chr1 (7-188)||(29288145-29288327)
chr1 (1-190)||(38829063-38829253)
chr1 (1-184)||(2473722-2473906)
chr1 (1-192)||(32671571-32671763)
chr1 (1-188)||(33510480-33510668)
chr1 (1-187)||(52696788-52696975)
chr1 (1-188)||(1170465-1170653)
chr1 (1-184)||(8079730-8079914)
chr1 (1-188)||(41928516-41928704)
chr1 (1-187)||(42370816-42371003)
chr1 (1-187)||(970545-970734)
chr1 (4-189)||(43905649-43905835)
chr1 (1-185)||(5215384-5215569)
chr1 (1-190)||(46409429-46409621)
chr1 (1-184)||(19715182-19715366)
chr1 (1-184)||(46760966-46761150)
chr1 (1-187)||(12682817-12683004)
chr1 (1-187)||(15203109-15203296)
chr1 (1-187)||(40092488-40092675)
chr1 (1-190)||(49146166-49146356)
chr1 (1-188)||(2347652-2347841)
chr1 (1-188)||(17591687-17591872)
chr1 (1-192)||(13996744-13996936)
chr1 (1-183)||(8120870-8121053)
chr1 (1-174)||(23498471-23498644)
chr1 (1-190)||(7145201-7145391)
chr1 (1-187)||(51359238-51359424)
chr1 (1-151)||(40149497-40149647)
chr1 (1-169)||(17587526-17587694)
chr1 (19-186)||(29695673-29695842)
chr1 (1-188)||(15554173-15554353)
chr1 (1-190)||(6765453-6765643)
chr1 (1-171)||(15717799-15717968)
chr1 (56-188)||(52086263-52086396)
chr1 (43-172)||(23322903-23323032)
chr1 (68-171)||(38171846-38171949)
chr1 (51-188)||(5217855-5217992)
chr1 (114-190)||(5675099-5675176)
chr1 (1-53)||(38171951-38172003)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-185)||(7164184-7164369)
chr7 (1-189)||(30181035-30181224)
chr7 (2-190)||(42204149-42204339)
chr7 (1-188)||(24792343-24792531)
chr7 (1-192)||(43067984-43068176)
chr7 (1-190)||(42965007-42965197)
chr7 (1-189)||(12101189-12101378)
chr7 (2-186)||(20346487-20346672)
chr7 (1-187)||(22649705-22649892)
chr7 (1-187)||(33359101-33359288)
chr7 (1-190)||(3511318-3511508)
chr7 (1-190)||(4347268-4347458)
chr7 (1-183)||(4477332-4477515)
chr7 (1-190)||(933280-933470)
chr7 (1-190)||(5280855-5281045)
chr7 (1-190)||(6394746-6394936)
chr7 (1-190)||(15655907-15656097)
chr7 (1-190)||(36890841-36891030)
chr7 (1-187)||(25748485-25748672)
chr7 (1-171)||(1803041-1803211)
chr7 (1-188)||(32041539-32041727)
chr7 (1-188)||(33846540-33846723)
chr7 (1-171)||(38866559-38866729)
chr7 (1-183)||(42673467-42673646)
chr7 (1-174)||(43156725-43156898)
chr7 (1-187)||(12097601-12097788)
chr7 (1-186)||(8630665-8630851)
chr7 (1-184)||(9452591-9452775)
chr7 (1-151)||(16894518-16894668)
chr7 (1-185)||(17753600-17753785)
chr7 (1-184)||(46891350-46891535)
chr7 (1-151)||(48865665-48865818)
chr7 (41-190)||(19828265-19828415)
chr7 (1-185)||(46134315-46134500)
chr7 (1-190)||(43021591-43021777)
chr7 (43-200)||(37005864-37006022)
chr7 (91-190)||(37704975-37705075)
chr7 (51-190)||(43405015-43405155)
chr7 (43-187)||(36849590-36849735)
chr7 (97-170)||(27691433-27691506)
chr7 (43-190)||(15655465-15655613)
chr7 (51-187)||(30075292-30075426)
chr7 (52-119)||(20163886-20163953)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-185)||(1756773-1756958)
chr4 (1-187)||(23776468-23776655)
chr4 (1-190)||(50353795-50353985)
chr4 (1-189)||(54189540-54189729)
chr4 (1-188)||(50055110-50055298)
chr4 (1-187)||(19913639-19913826)
chr4 (1-190)||(45424543-45424733)
chr4 (1-188)||(53717473-53717661)
chr4 (4-190)||(20877041-20877228)
chr4 (1-187)||(38055154-38055341)
chr4 (1-171)||(28032721-28032891)
chr4 (1-170)||(37968766-37968935)
chr4 (1-188)||(27488657-27488845)
chr4 (1-184)||(35490782-35490966)
chr4 (1-186)||(11639587-11639773)
chr4 (1-190)||(14987786-14987976)
chr4 (1-189)||(44784926-44785115)
chr4 (1-188)||(2481417-2481605)
chr4 (1-188)||(6611369-6611557)
chr4 (1-188)||(15241037-15241225)
chr4 (1-188)||(48909842-48910030)
chr4 (1-190)||(8932187-8932377)
chr4 (1-190)||(23704218-23704408)
chr4 (1-186)||(40428729-40428915)
chr4 (1-185)||(54412627-54412812)
chr4 (1-183)||(19164982-19165164)
chr4 (1-183)||(16700782-16700965)
chr4 (1-190)||(30423574-30423763)
chr4 (1-174)||(8591101-8591274)
chr4 (1-170)||(31969696-31969865)
chr4 (1-184)||(1617084-1617268)
chr4 (1-187)||(6688636-6688817)
chr4 (1-188)||(37464717-37464905)
chr4 (1-188)||(43289969-43290157)
chr4 (1-186)||(47632032-47632219)
chr4 (2-183)||(53875658-53875840)
chr4 (1-188)||(15669179-15669367)
chr4 (1-184)||(52139203-52139387)
chr4 (1-171)||(27583641-27583811)
chr4 (1-190)||(53353049-53353247)
chr4 (1-188)||(27536113-27536297)
chr4 (1-171)||(33703855-33704025)
chr4 (3-183)||(30171581-30171762)
chr4 (2-188)||(44379197-44379384)
chr4 (14-171)||(28360444-28360602)
chr4 (1-185)||(44375844-44376029)
chr4 (1-171)||(38071332-38071499)
chr4 (41-188)||(50053439-50053587)
chr4 (1-171)||(40680047-40680217)
chr4 (1-188)||(55344834-55345022)
chr4 (1-163)||(16703843-16704005)
chr4 (1-108)||(23269055-23269162)
chr4 (100-190)||(23265865-23265956)
chr4 (43-190)||(44548192-44548341)
chr4 (43-119)||(51780769-51780845)
chr4 (1-67)||(53408137-53408204)
chr4 (43-148)||(17493370-17493475)
chr4 (131-188)||(9595974-9596031)
chr4 (1-43)||(23261895-23261937)
chr4 (1-46)||(48748197-48748242)
chr4 (41-98)||(55344724-55344781)
chr4 (47-83)||(9595946-9595982)
chr4 (1-33)||(9595911-9595943)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-188)||(36701-36889)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (1-188)||(6086620-6086808)
chr6 (1-196)||(30691841-30692037)
chr6 (1-187)||(26946897-26947084)
chr6 (1-188)||(2837543-2837731)
chr6 (1-190)||(3347544-3347734)
chr6 (1-187)||(26704360-26704547)
chr6 (1-185)||(3955787-3955972)
chr6 (1-188)||(21893453-21893641)
chr6 (1-187)||(9459562-9459749)
chr6 (1-184)||(17261094-17261278)
chr6 (1-190)||(18613534-18613724)
chr6 (1-188)||(11167238-11167426)
chr6 (1-188)||(16307029-16307217)
chr6 (1-183)||(34887313-34887496)
chr6 (1-187)||(20726790-20726973)
chr6 (1-188)||(35198282-35198469)
chr6 (1-174)||(1153606-1153779)
chr6 (31-188)||(52834-52992)
chr6 (1-184)||(28199529-28199714)
chr6 (1-171)||(30698950-30699120)
chr6 (1-117)||(33464399-33464515)
chr6 (1-94)||(53001-53094)
chr6 (109-189)||(33463698-33463779)
chr6 (52-150)||(12835084-12835183)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-187)||(22972-23159)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-186)||(3708-3894)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-184)||(145266-145450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-188)||(27-215)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-190)||(10232-10422)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-185)||(316-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-184)||(27-212)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1108463 - 1108186
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  1108463 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 1108364  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggccttactgctaaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108363 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggccttactgctaaact 1108264  T
Q  201 tattgattaattggactctaagttggctttgttaattgtttttggttgattacacttgaagtgttagatcagataact 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108263 tattgattaattggactctaagttggctttgttaattgtttttggttgattacacttgaagtgttagatcagataact 1108186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31517236 - 31517423
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31517236 acataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 31517335  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31517336 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 33906068 - 33906258
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33906068 acataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 33906167  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  33906168 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcctta 33906258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 3873267 - 3873452
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3873267 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatt 3873366  T
Q  103 tatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3873367 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 26323207 - 26323397
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26323207 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26323306  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26323307 tttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcctta 26323397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 18806905 - 18807093
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18806905 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 18807004  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18807005 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 1482924 - 1483096
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1482924 acataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatt 1483023  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1483024 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 1483096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42937904 - 42937715
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42937904 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 42937805  T
Q  100 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42937804 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 4232163 - 4232351
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4232163 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 4232262  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4232263 tttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39635636 - 39635448
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39635636 acataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctata 39635537  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-catccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39635536 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 19901159 - 19901348
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19901159 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 19901258  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901259 ttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 19901348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 6174852 - 6175037
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6174852 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatattttt 6174951  T
Q  104 atttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6174952 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4016223 - 4016039
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  4016223 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatt 4016124  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4016123 tttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5733582 - 5733414
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  5733582 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgttt 5733483  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733482 ttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 5733414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 28329860 - 28330042
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28329860 acataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 28329957  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28329958 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2178790 - 2178978
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2178790 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2178889  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aagccatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || | |||||||||||||||    
T  2178890 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 185
Target Start/End: Original strand, 30420226 - 30420373
Alignment:
Q  39 gctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30420226 gctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 30420325  T
Q  139 ggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30420326 ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16066315 - 16066488
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16066315 acataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16066414  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066415 tttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagcca 16066488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30270700 - 30270890
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30270700 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 30270799  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30270800 ttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctta 30270890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 19383956 - 19384126
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  19383956 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatt 19384055  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19384056 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 851181 - 850997
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |     
T  851181 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgataagctcta 851082  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-catccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  851081 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16588797 - 16588985
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16588797 acattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 16588896  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16588897 tttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 430000 - 429830
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  430000 acataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataagctatt 429901  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  429900 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataag 429830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44947570 - 44947736
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44947570 acataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 44947662  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  44947663 tttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagcca 44947736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Original strand, 42446642 - 42446778
Alignment:
Q  53 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||      
T  42446642 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagtt 42446741  T
Q  153 cacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    | ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  42446742 cgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcct 42446778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 149
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  143 tagataa 149  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3585430 - 3585291
Alignment:
Q  45 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||| || | |||||  |||     
T  3585430 aattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggtttatgttagtg 3585331  T
Q  145 gataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    |||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  3585330 gataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517366
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  || |||||||| ||||  |||||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  152 ccacataagct 162  Q
     ||||||||||    
T  12517356 tcacataagct 12517366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 9008078 - 9008268
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9008078 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 9008177  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9008178 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 9008268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1579223 - 1579035
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1579223 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 1579124  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1579123 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1605592 - 1605780
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1605592 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 1605691  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1605692 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27679190 - 27679378
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27679190 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27679289  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27679290 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27421045 - 27420855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27421045 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 27420946  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27420945 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 27420855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16069540 - 16069350
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16069540 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16069441  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16069440 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacctta 16069350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 24105692 - 24105882
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24105692 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 24105791  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24105792 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctta 24105882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 33491217 - 33491407
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33491217 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatt 33491316  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33491317 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 33491407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16737468 - 16737641
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16737468 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16737567  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16737568 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagcca 16737641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19358713 - 19358523
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19358713 acataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 19358614  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-gccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19358613 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctta 19358523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 35782665 - 35782855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35782665 acataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35782764  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-gccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35782765 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctta 35782855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 3386507 - 3386680
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3386507 acataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3386606  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386607 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagcca 3386680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4121124 - 4120935
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  4121124 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatt 4121025  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca-tccaaacggggcctt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4121024 tttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggcctt 4120935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 20992167 - 20992357
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20992167 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatt 20992266  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20992267 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctta 20992357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 8374367 - 8374547
Alignment:
Q  9 tcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttattta 108  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8374367 tcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 8374466  T
Q  109 tttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-gccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  8374467 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33991327 - 33991139
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33991327 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 33991228  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  33991227 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcct 33991139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5203159 - 5202972
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5203159 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 5203060  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5203059 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 1165622 - 1165792
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1165622 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatt 1165721  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1165722 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataag 1165792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31883331 - 31883142
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31883331 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 31883232  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  31883231 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctt 31883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 38598471 - 38598659
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38598471 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 38598570  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  38598571 tttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3921768 - 3921578
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3921768 acataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3921669  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aagccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  3921668 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgggacctta 3921578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31410663 - 31410494
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31410663 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgataagctatt 31410564  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  31410563 tttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataa 31410494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 26602963 - 26603113
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26602963 acataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 26603062  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26603063 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27025143 - 27025001
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025143 acataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27025044  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagt 143  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  27025043 tttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992496
Alignment:
Q  53 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  153 c----acataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctta 20992496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 171
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284766
Alignment:
Q  47 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtaga 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  147 taagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataag 33284766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25634714 - 25634581
Alignment:
Q  54 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagccc 153  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||||||||||   ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||  ||||||||| | |    
T  25634714 ttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttta--ttatttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataaactc 25634617  T
Q  154 acataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  25634616 tcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcct 25634581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638174
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||| |||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  152 ccacataa 159  Q
     |||||||    
T  31638181 tcacataa 31638174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 122
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  69 ataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacc 122  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 35420445 - 35420481
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggta 37  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35420445 acataaattcataagctctttgttaagccggagggta 35420481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38856274 - 38856089
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38856274 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 38856175  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38856174 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 42307912 - 42308102
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42307912 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 42308011  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42308012 tttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 42308102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 37698150 - 37698338
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37698150 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 37698249  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37698250 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25999569 - 25999382
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25999569 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25999470  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25999469 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 15520149 - 15520339
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  15520149 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatt 15520248  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15520249 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 15520339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8042788 - 8042598
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8042788 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8042689  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8042688 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcctta 8042598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22174997 - 22175185
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22174997 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 22175096  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22175097 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29445669 - 29445481
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29445669 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 29445570  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29445569 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50529110 - 50528922
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  50529110 acataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 50529011  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50529010 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 54534335 - 54534521
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  54534335 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatt 54534432  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54534433 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 20842355 - 20842545
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  20842355 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataagttgtt 20842454  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20842455 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 20842545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21581223 - 21581053
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21581223 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatt 21581124  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581123 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 21581053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 25494293 - 25494479
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25494293 cataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 25494392  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25494393 ttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32244301 - 32244111
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32244301 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 32244202  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32244201 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 32244111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 46452169 - 46452357
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  46452169 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 46452268  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  46452269 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15520813 - 15520629
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattttta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  15520813 aaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttg 15520714  T
Q  105 tttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15520713 tttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 54870181 - 54870369
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54870181 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatt 54870280  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54870281 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 12117665 - 12117855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  12117665 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatt 12117764  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12117765 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctta 12117855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20699326 - 20699144
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattttta 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  20699326 aaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttg 20699227  T
Q  105 tttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20699226 tttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35226628 - 35226440
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  35226628 acataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgat 35226529  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  35226528 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcct 35226440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38934126 - 38933939
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38934126 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 38934027  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38934026 tttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32359440 - 32359250
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32359440 acataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 32359341  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32359340 tttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 32359250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44609340 - 44609513
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  44609340 acataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 44609439  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44609440 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagcca 44609513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24835706 - 24835894
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24835706 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 24835805  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aagccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  24835806 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 42104978 - 42105148
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42104978 acataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 42105077  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105078 tttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 42105148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26122992 - 26122808
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattttt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26122992 taaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 26122893  T
Q  104 atttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26122892 atttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2895356 - 2895196
Alignment:
Q  11 ataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatt 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  2895356 ataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatt 2895257  T
Q  111 tacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2895256 tacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataag 2895196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34700520 - 34700334
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34700520 ataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 34700421  T
Q  103 tatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  34700420 tatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44688940 - 44688782
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44688940 cataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgataagctattt 44688842  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagc 161  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44688841 ttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643212
Alignment:
Q  30 ggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 129  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  130 aagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggc 186  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 171
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529950
Alignment:
Q  48 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  148 aagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataag 50529950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 53028398 - 53028218
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  53028398 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatt 53028299  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||        |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  53028298 tttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcct 53028218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 48925010 - 48925181
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48925010 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatt 48925109  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||    
T  48925110 tttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagcca 48925181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16354527 - 16354379
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16354527 acataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataagttatt 16354428  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  16354427 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128040
Alignment:
Q  54 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagccc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  154 acataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctta 49128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12916087 - 12915930
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  12916087 acataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaactatt 12915988  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataa 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  12915987 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 24366210 - 24366143
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366210 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13696970 - 13696914
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13696970 aaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366083
Alignment:
Q  132 gcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcctta 24366083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14422889 - 14422702
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14422889 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 14422790  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14422789 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18594723 - 18594534
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18594723 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 18594624  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18594623 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 18594534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39206772 - 39206584
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39206772 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 39206673  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39206672 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29938247 - 29938060
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29938247 acataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 29938148  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29938147 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 10836776 - 10836964
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10836776 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatt 10836875  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10836876 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13110590 - 13110406
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13110590 acataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgataagctatt 13110491  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13110490 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22260651 - 22260839
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22260651 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatt 22260750  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22260751 tttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 35118052 - 35118239
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35118052 acataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35118151  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35118152 tttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 2042545 - 2042727
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2042545 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2042644  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2042645 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24113187 - 24113375
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  24113187 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtt 24113286  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24113287 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4036033 - 4035843
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4036033 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 4035934  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  4035933 tttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcctta 4035843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 34842386 - 34842572
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34842386 acataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 34842485  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34842486 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 6144294 - 6144486
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6144294 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 6144393  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggccttact 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6144394 tttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttact 6144486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39218963 - 39218775
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||    
T  39218963 acataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatt 39218864  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39218863 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 144580 - 144397
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  144580 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 144481  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacgg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  144480 tttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41575699 - 41575516
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41575699 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatt 41575600  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41575599 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 34998919 - 34999107
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34998919 ataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttt 34999018  T
Q  103 tatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  34999019 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacgggacctta 34999107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 34679478 - 34679651
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34679478 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatt 34679577  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34679578 tttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagcca 34679651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33278586 - 33278399
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33278586 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33278487  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33278486 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7774950 - 7774777
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7774950 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7774851  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7774850 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagcca 7774777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44804965 - 44805138
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44804965 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 44805064  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44805065 tttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagcca 44805138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 38167176 - 38167363
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  38167176 acataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagt 38167275  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  38167276 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7791597 - 7791412
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7791597 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7791498  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7791497 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118063
Alignment:
Q  31 gagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 130  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  131 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 40118063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Original strand, 33287076 - 33287234
Alignment:
Q  31 gagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287076 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 33287175  T
Q  131 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33287176 agcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 33287234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36491343 - 36491154
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  36491343 acataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtt 36491244  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36491243 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcctt 36491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7812181 - 7811993
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7812181 acataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7812082  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7812081 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 190
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783944
Alignment:
Q  48 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  148 aagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctta 26783944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8021895 - 8021721
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8021895 ataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 8021804  T
Q  103 tatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8021803 tatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28639460 - 28639291
Alignment:
Q  9 tcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttattta 108  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28639460 tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 28639361  T
Q  109 tttacccaaacacctttaaaaaagct----tatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28639360 tttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagcca 28639291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5320750 - 5320563
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||    
T  5320750 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgataaattatt 5320651  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5320650 tttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42571776 - 42571598
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42571776 cataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42571679  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacg 182  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42571678 ttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 66203 - 66374
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcgga-gggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  66203 taaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactattataagttatttt 66302  T
Q  103 tatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  66303 tatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagcca 66374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9807445 - 9807339
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9807445 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataagctattt 9807346  T
Q  102 ttattta 108  Q
    |||||||    
T  9807345 ttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 2322075 - 2322223
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2322075 aaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgttag 2322174  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||  ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2322175 tagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctta 2322223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005179
Alignment:
Q  59 aaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacata 158  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  159 agctcaaaataagcca 174  Q
    |||| || ||||||||    
T  5005194 agcttaagataagcca 5005179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39220400 - 39220272
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||||  |    
T  39220400 aaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacatatggatg 39220301  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39220300 tagataagttcatataagctcaaaataag 39220272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  100 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 18683844 - 18683726
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  18683844 gcttatgaaaatatggtataagcggcttataaaattggtataaactatttttatt-atttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataagc 18683746  T
Q  152 ccacataagctcaaaataag 171  Q
     |  ||||||| ||||||||    
T  18683745 tccaataagcttaaaataag 18683726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 18729406 - 18729288
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  18729406 gcttatgaaaatatggtataagcggcttataaaattggtataaactatttttatt-atttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataagc 18729308  T
Q  152 ccacataagctcaaaataag 171  Q
     |  ||||||| ||||||||    
T  18729307 tccaataagcttaaaataag 18729288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16052280 - 16052090
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16052280 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16052181  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16052180 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcctta 16052090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26663442 - 26663252
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26663442 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 26663343  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26663342 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggtctta 26663252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1168687 - 1168499
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1168687 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 1168588  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1168587 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 39260367 - 39260555
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39260367 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 39260466  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39260467 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20089655 - 20089465
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20089655 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 20089556  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20089555 tttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 20089465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1940768 - 1940956
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  1940768 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatt 1940867  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1940868 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25897558 - 25897370
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25897558 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25897459  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25897458 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 52753168 - 52753356
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  52753168 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 52753267  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52753268 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29078700 - 29078527
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29078700 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 29078601  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078600 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 29078527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 26580291 - 26580479
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26580291 acataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26580390  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26580391 tttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29288327 - 29288145
Alignment:
Q  7 attcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29288327 attcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatt 29288228  T
Q  107 tatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29288227 tatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38829253 - 38829063
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38829253 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatt 38829154  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  38829153 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaacagagcctta 38829063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2473906 - 2473722
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2473906 acataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataataagctatt 2473807  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2473806 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32671763 - 32671571
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32671763 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 32671664  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggccttact 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32671663 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttact 32671571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33510668 - 33510480
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33510668 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33510569  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33510568 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52696975 - 52696788
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  52696975 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 52696876  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52696875 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1170465 - 1170653
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1170465 acataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 1170564  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170565 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 8079730 - 8079914
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8079730 acataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 8079829  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8079830 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 41928516 - 41928704
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41928516 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 41928615  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41928616 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 42370816 - 42371003
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  42370816 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttttt 42370915  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42370916 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 970545 - 970734
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactac--gataagcta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  970545 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatcta 970644  T
Q  99 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  970645 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43905835 - 43905649
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattttt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43905835 taaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 43905736  T
Q  104 atttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43905735 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 43905649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5215569 - 5215384
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5215569 acataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 5215470  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5215469 tttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46409621 - 46409429
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaa--gtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagcta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46409621 acataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 46409522  T
Q  99 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  46409521 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctta 46409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 19715182 - 19715366
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19715182 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatt 19715281  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19715282 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 46761150 - 46760966
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  46761150 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 46761051  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  46761050 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12683004 - 12682817
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12683004 acataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 12682905  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  12682904 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15203296 - 15203109
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203296 acataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 15203197  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||    
T  15203196 tttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40092675 - 40092488
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40092675 acataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatt 40092576  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  40092575 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49146356 - 49146166
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49146356 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 49146257  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  49146256 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcctta 49146166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2347841 - 2347652
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactacgataagctat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2347841 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 2347742  T
Q  100 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-catccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  2347741 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17591872 - 17591687
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17591872 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 17591773  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  17591772 tttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 13996744 - 13996936
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  13996744 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatt 13996843  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggccttact 192  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13996844 tttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggccttact 13996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8121053 - 8120870
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  8121053 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 8120954  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8120953 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23498644 - 23498471
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  23498644 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatgaactatt 23498545  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23498544 tttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagcca 23498471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7145391 - 7145201
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7145391 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 7145292  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctc-aaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  7145291 tttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacgggacctta 7145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 51359238 - 51359424
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  51359238 acataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgataagctatt 51359337  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51359338 tttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40149647 - 40149497
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||    
T  40149647 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgataaattatt 40149548  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149547 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 17587526 - 17587694
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  17587526 acataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgataagctgtt 17587625  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587626 tttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  19 cttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  119 cacctttaa-aaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15554173 - 15554353
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||         ||||||    
T  15554173 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaaat--------gctatt 15554264  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15554265 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6765643 - 6765453
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  6765643 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatt 6765544  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6765543 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtctta 6765453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15717968 - 15717799
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15717968 acataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatt 15717870  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15717869 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataag 15717799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086263
Alignment:
Q  56 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccac 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  156 ataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcct 52086263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 172
Target Start/End: Original strand, 23322903 - 23323032
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23322903 aaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagtttatgggag 23323002  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataagc 172  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23323003 tagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38171949 - 38171846
Alignment:
Q  68 cataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||    
T  38171949 cataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaa 38171850  T
Q  168 taag 171  Q
    ||||    
T  38171849 taag 38171846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Original strand, 5217855 - 5217992
Alignment:
Q  51 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 150  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  5217855 ggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagcttatgttagtagataag 5217953  T
Q  151 cccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    | | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  5217954 ctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcct 5217992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675099
Alignment:
Q  114 ccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctta 5675099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38172003 - 38171951
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggc 53  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  38172003 acataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc 38171951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7164369 - 7164184
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7164369 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 7164270  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7164269 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30181035 - 30181224
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30181035 acataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30181134  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30181135 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 30181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42204339 - 42204149
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42204339 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42204240  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42204239 ttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 42204149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24792343 - 24792531
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24792343 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 24792442  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24792443 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 43067984 - 43068176
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43067984 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatt 43068083  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggccttact 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43068084 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttact 43068176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 42965007 - 42965197
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42965007 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 42965106  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42965107 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcctta 42965197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 12101189 - 12101378
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12101189 acataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 12101288  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12101289 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcctt 12101378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20346672 - 20346487
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20346672 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctattt 20346573  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20346572 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22649705 - 22649892
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22649705 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatt 22649804  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22649805 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33359101 - 33359288
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33359101 acataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 33359200  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33359201 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3511508 - 3511318
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3511508 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3511409  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3511408 tttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacgggacctta 3511318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4347458 - 4347268
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4347458 acataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatt 4347359  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  4347358 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcctta 4347268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 4477332 - 4477515
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4477332 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatt 4477431  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4477432 tttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 933470 - 933280
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  933470 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 933371  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  933370 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcctta 933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5281045 - 5280855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5281045 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 5280946  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5280945 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 5280855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6394936 - 6394746
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6394936 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 6394837  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6394836 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcctta 6394746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15656097 - 15655907
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15656097 acataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 15655998  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15655997 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 15655907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36890841 - 36891030
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36890841 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 36890940  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  36890941 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcctta 36891030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25748672 - 25748485
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25748672 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25748573  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  25748572 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1803211 - 1803041
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1803211 acataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataagctatt 1803112  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803111 tttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 1803041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32041727 - 32041539
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32041727 acataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 32041628  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32041627 tttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 33846540 - 33846723
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |      || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33846540 acataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatt 33846634  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33846635 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38866729 - 38866559
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38866729 acataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatt 38866630  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38866629 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataag 38866559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42673646 - 42673467
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42673646 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 42673547  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacgg 183  Q
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  42673546 ----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43156898 - 43156725
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43156898 acataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataagctatt 43156799  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156798 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagcca 43156725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12097601 - 12097788
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12097601 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatt 12097700  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  12097701 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8630851 - 8630665
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8630851 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8630752  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-catccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  8630751 tttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9452775 - 9452591
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9452775 acataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatt 9452676  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9452675 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 16894518 - 16894668
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16894518 acataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 16894617  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 151  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894618 tttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 16894668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17753785 - 17753600
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17753785 acataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatt 17753686  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-catccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17753685 tttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 46891350 - 46891535
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  46891350 acataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatt 46891449  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaa-gcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46891450 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865665
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48865818 acataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 48865719  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaa---gcttatgggagtagataagc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  48865718 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828265
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  141 agtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctta 19828265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 46134315 - 46134500
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||    
T  46134315 acataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatt 46134414  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  46134415 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 43021591 - 43021777
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  43021591 acataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataataagttatt 43021686  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43021687 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcctta 43021777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Original strand, 37005864 - 37006022
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  37005864 aaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaacttatagaag 37005963  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggccttactgctaaact 200  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37005964 tagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagccttaatgcaaaact 37006022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704975
Alignment:
Q  91 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcctt 37704976  T
Q  190 a 190  Q
    |    
T  37704975 a 37704975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43405155 - 43405015
Alignment:
Q  51 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 150  Q
    ||||||||||||||| | | || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  43405155 ggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataag 43405056  T
Q  151 cccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  43405055 ccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcctta 43405015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691506
Alignment:
Q  97 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataa 27691506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 15655465 - 15655613
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |  | ||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  ||||||  ||    
T  15655465 aaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagacttatgttag 15655564  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||| |||| |||||||| | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  15655565 tagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctta 15655613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 187
Target Start/End: Original strand, 30075292 - 30075426
Alignment:
Q  51 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||   | | |||  |||||||  |||||||||     
T  30075292 ggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-ta-tataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggcttatgttagtagataaa 30075388  T
Q  151 cccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  30075389 ctcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaac 119  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1756773 - 1756958
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1756773 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatt 1756872  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1756873 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 23776468 - 23776655
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23776468 acataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23776567  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23776568 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50353985 - 50353795
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50353985 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatt 50353886  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50353885 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 50353795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54189729 - 54189540
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54189729 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 54189630  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54189629 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 54189540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 50055110 - 50055298
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50055110 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatt 50055209  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50055210 ttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 19913639 - 19913826
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19913639 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 19913738  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19913739 ttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 45424543 - 45424733
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45424543 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 45424642  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45424643 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctta 45424733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 53717473 - 53717661
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53717473 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 53717572  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53717573 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20877228 - 20877041
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattttt 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20877228 taaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 20877129  T
Q  104 atttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20877128 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 20877041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38055341 - 38055154
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  38055341 acataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatt 38055242  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38055241 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 28032721 - 28032891
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28032721 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgataagctatt 28032820  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032821 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 28032891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 37968766 - 37968935
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37968766 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 37968865  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968866 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 37968935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27488657 - 27488845
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27488657 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27488756  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  27488757 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 35490782 - 35490966
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35490782 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 35490881  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35490882 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11639587 - 11639773
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11639587 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 11639686  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  11639687 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14987976 - 14987786
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14987976 acataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 14987877  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14987876 tttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 14987786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 44784926 - 44785115
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44784926 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 44785025  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44785026 tttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 44785115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2481417 - 2481605
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2481417 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2481516  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2481517 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 6611369 - 6611557
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6611369 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatt 6611468  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6611469 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15241037 - 15241225
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15241037 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 15241136  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15241137 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48910030 - 48909842
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48910030 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 48909931  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48909930 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 8932187 - 8932377
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8932187 acataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatt 8932286  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8932287 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 8932377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 23704218 - 23704408
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23704218 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 23704317  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23704318 tttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctta 23704408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 40428729 - 40428915
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40428729 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatt 40428828  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40428829 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54412812 - 54412627
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54412812 acataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 54412713  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54412712 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 19164982 - 19165164
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19164982 acataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 19165079  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19165080 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16700965 - 16700782
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16700965 acataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 16700866  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16700865 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30423574 - 30423763
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30423574 acataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30423672  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30423673 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacgggacctta 30423763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 8591101 - 8591274
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8591101 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 8591200  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8591201 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagcca 8591274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31969865 - 31969696
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31969865 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 31969766  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31969765 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1617268 - 1617084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1617268 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttatt 1617169  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1617168 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 6688636 - 6688817
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||    
T  6688636 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgataagctatt 6688729  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6688730 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37464905 - 37464717
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  37464905 acataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 37464806  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37464805 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 43289969 - 43290157
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43289969 acataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 43290068  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43290069 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43290157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47632219 - 47632032
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47632219 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatt 47632120  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47632119 tttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53875840 - 53875658
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53875840 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgataagctattt 53875741  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  53875740 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15669367 - 15669179
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15669367 acataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 15669268  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15669267 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52139387 - 52139203
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52139387 acataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 52139288  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52139287 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 27583641 - 27583811
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  27583641 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatt 27583740  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27583741 tttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataag 27583811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 53353247 - 53353049
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagc 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53353247 acataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 53353148  T
Q  97 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccaca----taagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53353147 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 53353049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27536113 - 27536297
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27536113 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatt 27536212  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27536213 tttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33704025 - 33703855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  33704025 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtt 33703926  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703925 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataag 33703855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30171762 - 30171581
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30171762 ataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 30171663  T
Q  103 tatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 183  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171662 catttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 44379197 - 44379384
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  44379197 cataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactattt 44379296  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  44379297 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcct 44379384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360444
Alignment:
Q  14 agctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttattta 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  113 cccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataag 28360444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44376029 - 44375844
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  44376029 acataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataaactatt 44375930  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44375929 tttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 38071332 - 38071499
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38071332 acataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 38071428  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071429 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataag 38071499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50053587 - 50053439
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50053587 tgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatggg 50053488  T
Q  141 agtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50053487 agtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 40680047 - 40680217
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40680047 acataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 40680146  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40680147 tttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataag 40680217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 55344834 - 55345022
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| || || |||||||||||    
T  55344834 acataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataagctatt 55344933  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  55344934 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggggcct 55345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16704005 - 16703843
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16704005 acataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 16703906  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctc 163  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  16703905 tttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23269055 - 23269162
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23269055 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23269154  T
Q  101 tttattta 108  Q
    ||||||||    
T  23269155 tttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265956
Alignment:
Q  100 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 23265956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 44548192 - 44548341
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| |  |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  44548192 aaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgttag 44548291  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataag--ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||    
T  44548292 tagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcctta 44548341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 51780769 - 51780845
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaac 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780769 aaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 53408204 - 53408137
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcgga-gggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408204 acataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17493475 - 17493370
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 142  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  17493475 aaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgcttataggag 17493376  T
Q  143 tagata 148  Q
    ||||||    
T  17493375 tagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Original strand, 9595974 - 9596031
Alignment:
Q  131 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9595974 agcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggcct 9596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 23261895 - 23261937
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctga 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23261895 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 48748242 - 48748197
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748242 acataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagcta 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Original strand, 9595946 - 9595982
Alignment:
Q  47 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 83  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595946 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 9595911 - 9595943
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggag 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9595911 acataaattcataagctccttgttaagccggag 9595943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36889 - 36701
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36889 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 36790  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36789 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 6086620 - 6086808
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6086620 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 6086719  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6086720 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30692037 - 30691841
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30692037 acataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30691938  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggccttactgcta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  30691937 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggccctaatgcta 30691841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26946897 - 26947084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26946897 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26946996  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26946997 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2837731 - 2837543
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2837731 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatt 2837632  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2837631 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3347544 - 3347734
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3347544 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 3347643  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3347644 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 3347734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26704360 - 26704547
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26704360 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26704459  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26704460 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 3955787 - 3955972
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3955787 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 3955886  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3955887 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21893641 - 21893453
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21893641 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 21893542  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aagccatccaaacggggcct 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  21893541 tttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9459749 - 9459562
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459749 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 9459650  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9459649 tttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 17261094 - 17261278
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17261094 acataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataagctatt 17261193  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17261194 tttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18613724 - 18613534
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  18613724 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtt 18613625  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18613624 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctta 18613534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11167426 - 11167238
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11167426 acataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 11167327  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11167326 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16307029 - 16307217
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16307029 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 16307128  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16307129 tttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 34887313 - 34887496
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34887313 acataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 34887412  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacgg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34887413 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20726973 - 20726790
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20726973 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatt 20726874  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20726873 ttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198282
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacaccttta-aaaagcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1153779 - 1153606
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1153779 acataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatt 1153680  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1153679 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagcca 1153606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52992 - 52834
Alignment:
Q  31 gagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52992 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 52893  T
Q  131 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52892 tgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 28199529 - 28199714
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28199529 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatt 28199627  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta---gataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28199628 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 30698950 - 30699120
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  30698950 acataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgataagctatt 30699049  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | || |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  30699050 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataag 30699120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33464515 - 33464399
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33464515 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33464416  T
Q  101 tttatttatttacccaa 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33464415 tttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 53094 - 53001
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  53094 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463698
Alignment:
Q  109 tttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 33463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12835183 - 12835084
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacac-ctttaaaaaagcttatgggagtagataag 150  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| || || ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  12835183 gcttattaaaatattgcttaagcagcttatgaaattagtataagttcttttgattaatgtatccaaacactttttacaaaagcttatgttagtagataag 12835084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22972 - 23159
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22972 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23071  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23072 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3894 - 3708
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3894 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3795  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  3794 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 145266 - 145450
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  145266 acataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 145365  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  145366 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27 - 215
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 126  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||||||||    
T  127 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcct 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10422 - 10232
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10422 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatt 10323  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10322 tttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctta 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 316 - 501
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  316 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 415  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  416 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 27 - 212
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatt 125  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta---gataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  126 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University