View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3150_low_2 (Length: 1093)

Name: NF3150_low_2
Description: NF3150
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3150_low_2
NF3150_low_2
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (716-1076)||(21110953-21111313)
chr7 (284-659)||(47202401-47202767)
chr7 (285-649)||(3304638-3305001)
chr7 (286-656)||(31642951-31643318)
chr7 (285-600)||(8154865-8155178)
chr7 (296-644)||(42925531-42925878)
chr7 (284-644)||(3936030-3936388)
chr7 (782-1076)||(18658141-18658435)
chr7 (316-659)||(28230379-28230718)
chr7 (284-659)||(36468416-36468786)
chr7 (365-659)||(24042148-24042439)
chr7 (284-645)||(33573922-33574277)
chr7 (284-645)||(36629125-36629483)
chr7 (790-1076)||(21129987-21130273)
chr7 (287-590)||(36408347-36408648)
chr7 (284-633)||(19225477-19225825)
chr7 (286-603)||(9151777-9152074)
chr7 (343-633)||(37518233-37518521)
chr7 (284-465)||(42864981-42865162)
chr7 (300-644)||(33151129-33151467)
chr7 (288-572)||(31985400-31985685)
chr7 (296-469)||(1518802-1518975)
chr7 (287-567)||(24690215-24690494)
chr7 (484-627)||(43737063-43737207)
chr7 (59-228)||(18657990-18658162)
chr7 (296-444)||(19818500-19818648)
chr7 (284-467)||(36946171-36946353)
chr7 (296-409)||(43737237-43737350)
chr7 (286-417)||(7115151-7115282)
chr7 (327-470)||(5278358-5278501)
chr7 (423-659)||(6467603-6467839)
chr7 (511-644)||(42877149-42877282)
chr7 (285-463)||(6467020-6467198)
chr7 (288-376)||(26555040-26555128)
chr7 (336-469)||(16983673-16983806)
chr7 (296-462)||(48776100-48776268)
chr7 (540-638)||(28346076-28346173)
chr7 (374-469)||(48775705-48775798)
chr7 (285-391)||(37398771-37398877)
chr7 (305-467)||(48705899-48706061)
chr7 (350-459)||(43185887-43185996)
chr7 (550-645)||(28349227-28349322)
chr7 (284-463)||(39581840-39582019)
chr7 (497-580)||(26555131-26555214)
chr7 (372-469)||(8214257-8214354)
chr7 (366-427)||(8214462-8214523)
chr7 (284-357)||(37518142-37518215)
chr7 (615-659)||(47203105-47203149)
chr7 (16-45)||(21123081-21123110)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (284-659)||(18583423-18583796)
chr1 (284-659)||(23442645-23443018)
chr1 (284-659)||(33611289-33611662)
chr1 (284-645)||(49786190-49786548)
chr1 (284-645)||(34162600-34162960)
chr1 (296-641)||(41584556-41584904)
chr1 (284-659)||(17000287-17000659)
chr1 (351-644)||(32817557-32817848)
chr1 (284-633)||(42545901-42546248)
chr1 (296-633)||(15069732-15070068)
chr1 (284-571)||(49677478-49677763)
chr1 (296-590)||(45046741-45047033)
chr1 (286-633)||(40650556-40650902)
chr1 (284-644)||(40907813-40908171)
chr1 (296-603)||(7011172-7011478)
chr1 (284-583)||(28866509-28866806)
chr1 (329-603)||(44573021-44573292)
chr1 (284-633)||(45567769-45568103)
chr1 (394-659)||(32542313-32542563)
chr1 (284-579)||(34006246-34006541)
chr1 (284-467)||(52744722-52744905)
chr1 (284-584)||(26723367-26723660)
chr1 (288-641)||(6223634-6223972)
chr1 (483-659)||(30829541-30829707)
chr1 (483-659)||(24471389-24471556)
chr1 (296-644)||(38885161-38885481)
chr1 (286-470)||(27794925-27795108)
chr1 (483-645)||(43319271-43319434)
chr1 (284-467)||(24472706-24472889)
chr1 (296-468)||(3561226-3561398)
chr1 (296-468)||(42928980-42929152)
chr1 (285-427)||(25563294-25563436)
chr1 (527-659)||(27794762-27794893)
chr1 (527-644)||(52744937-52745054)
chr1 (483-645)||(38950202-38950353)
chr1 (374-469)||(890609-890704)
chr1 (358-469)||(9446048-9446159)
chr1 (365-441)||(9445846-9445922)
chr1 (359-470)||(26230145-26230256)
chr1 (288-341)||(890748-890801)
chr1 (483-574)||(800877-800969)
chr1 (365-441)||(43318940-43319016)
chr1 (365-428)||(800552-800615)
chr1 (296-391)||(45880000-45880095)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (284-631)||(31519771-31520116)
chr8 (287-659)||(21004297-21004661)
chr8 (296-644)||(3094603-3094953)
chr8 (296-644)||(8885344-8885690)
chr8 (284-645)||(44106144-44106503)
chr8 (284-622)||(27927820-27928156)
chr8 (300-633)||(42280786-42281120)
chr8 (284-630)||(28916719-28917055)
chr8 (372-659)||(37248466-37248750)
chr8 (286-644)||(9073426-9073782)
chr8 (284-586)||(34853309-34853608)
chr8 (372-639)||(16310526-16310791)
chr8 (373-553)||(40994805-40994983)
chr8 (284-469)||(36165716-36165902)
chr8 (284-469)||(11698195-11698380)
chr8 (296-469)||(14163948-14164121)
chr8 (284-469)||(17119758-17119943)
chr8 (285-469)||(40392631-40392815)
chr8 (285-446)||(40328015-40328176)
chr8 (286-444)||(36980689-36980847)
chr8 (483-659)||(41530576-41530754)
chr8 (297-461)||(1076659-1076822)
chr8 (483-644)||(36404231-36404391)
chr8 (296-467)||(4259528-4259697)
chr8 (288-469)||(36317887-36318072)
chr8 (483-659)||(7971072-7971249)
chr8 (300-462)||(28423523-28423684)
chr8 (284-462)||(6395186-6395364)
chr8 (497-584)||(35676628-35676715)
chr8 (296-464)||(8621528-8621697)
chr8 (506-572)||(11698385-11698451)
chr8 (296-421)||(34645520-34645645)
chr8 (312-470)||(39093602-39093760)
chr8 (372-464)||(7982478-7982570)
chr8 (373-441)||(31234486-31234554)
chr8 (365-469)||(33472166-33472270)
chr8 (365-469)||(33472373-33472477)
chr8 (358-441)||(10833468-10833551)
chr8 (358-427)||(9845323-9845392)
chr8 (297-460)||(7981618-7981781)
chr8 (365-465)||(10840717-10840817)
chr8 (384-469)||(9845488-9845573)
chr8 (377-421)||(24627717-24627761)
chr8 (615-659)||(31519383-31519427)
chr8 (591-650)||(40994735-40994794)
chr8 (377-427)||(41530812-41530862)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (284-659)||(2358501-2358876)
chr3 (288-641)||(47301944-47302294)
chr3 (284-645)||(50716173-50716533)
chr3 (284-645)||(50796314-50796674)
chr3 (296-644)||(3902697-3903043)
chr3 (284-659)||(52777148-52777511)
chr3 (284-659)||(43472848-43473201)
chr3 (284-641)||(28872928-28873286)
chr3 (285-644)||(35141999-35142353)
chr3 (284-633)||(47739812-47740158)
chr3 (296-641)||(501032-501375)
chr3 (380-659)||(3937295-3937563)
chr3 (284-644)||(38977627-38977985)
chr3 (296-645)||(51258324-51258672)
chr3 (284-578)||(34821222-34821514)
chr3 (285-646)||(3351946-3352306)
chr3 (316-644)||(51540525-51540853)
chr3 (284-645)||(49096105-49096464)
chr3 (296-632)||(46622686-46623010)
chr3 (284-585)||(39149791-39150089)
chr3 (285-641)||(30721690-30722044)
chr3 (354-602)||(33438486-33438731)
chr3 (296-454)||(47123136-47123294)
chr3 (497-659)||(48303898-48304060)
chr3 (296-454)||(47130502-47130660)
chr3 (284-389)||(3938357-3938462)
chr3 (288-461)||(5127782-5127955)
chr3 (521-633)||(34821510-34821622)
chr3 (298-470)||(40062473-40062645)
chr3 (284-427)||(35345788-35345931)
chr3 (284-469)||(51492894-51493080)
chr3 (296-421)||(46624863-46624988)
chr3 (483-633)||(45244322-45244469)
chr3 (537-633)||(47123039-47123135)
chr3 (537-633)||(47130405-47130501)
chr3 (297-463)||(29048444-29048610)
chr3 (550-645)||(42936590-42936685)
chr3 (296-462)||(47979895-47980063)
chr3 (284-469)||(54229776-54229961)
chr3 (296-469)||(14828809-14828983)
chr3 (296-467)||(47769359-47769530)
chr3 (284-401)||(4300159-4300276)
chr3 (296-361)||(33439384-33439449)
chr3 (374-469)||(45712053-45712148)
chr3 (340-462)||(27143351-27143473)
chr3 (376-468)||(26053491-26053584)
chr3 (350-469)||(29035893-29036013)
chr3 (530-581)||(42936685-42936736)
chr3 (550-645)||(33701457-33701554)
chr3 (365-427)||(8735530-8735592)
chr3 (365-427)||(9087771-9087833)
chr3 (1022-1076)||(26713623-26713677)
chr3 (550-645)||(33700678-33700774)
chr3 (615-659)||(2358110-2358154)
chr3 (615-659)||(3938805-3938849)
chr3 (1024-1076)||(26675261-26675313)
chr3 (365-429)||(33842034-33842098)
chr3 (398-469)||(29035809-29035880)
chr3 (377-440)||(45244514-45244577)
chr3 (1022-1076)||(26736859-26736913)
chr3 (1022-1076)||(26743870-26743924)
chr3 (1022-1076)||(26750795-26750849)
chr3 (350-459)||(46555445-46555554)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (284-659)||(32441726-32442098)
chr4 (285-659)||(6228693-6229063)
chr4 (285-659)||(34972789-34973151)
chr4 (285-645)||(49396937-49397299)
chr4 (285-659)||(55052498-55052870)
chr4 (288-645)||(6003556-6003911)
chr4 (284-633)||(25491274-25491621)
chr4 (296-644)||(19835450-19835796)
chr4 (288-646)||(38536098-38536455)
chr4 (297-624)||(48318956-48319281)
chr4 (284-633)||(40703604-40703952)
chr4 (287-644)||(17933019-17933374)
chr4 (296-659)||(2505922-2506285)
chr4 (284-645)||(25752322-25752685)
chr4 (790-1076)||(39132463-39132749)
chr4 (284-560)||(41412977-41413252)
chr4 (408-659)||(23523821-23524071)
chr4 (284-585)||(46440151-46440452)
chr4 (297-644)||(7931591-7931931)
chr4 (311-659)||(3703155-3703502)
chr4 (284-579)||(8106387-8106682)
chr4 (286-465)||(53893906-53894085)
chr4 (296-545)||(31582313-31582560)
chr4 (418-644)||(29822550-29822773)
chr4 (497-645)||(25539038-25539186)
chr4 (284-399)||(54631371-54631486)
chr4 (284-442)||(52089315-52089473)
chr4 (432-633)||(54631489-54631689)
chr4 (296-460)||(27742004-27742169)
chr4 (296-445)||(41322983-41323132)
chr4 (296-469)||(7863544-7863717)
chr4 (300-445)||(25538873-25539019)
chr4 (524-633)||(53894108-53894217)
chr4 (497-619)||(38416520-38416642)
chr4 (527-659)||(50392529-50392662)
chr4 (296-462)||(14474103-14474268)
chr4 (288-377)||(29822775-29822864)
chr4 (328-469)||(27879651-27879792)
chr4 (284-421)||(47456751-47456888)
chr4 (327-469)||(37222064-37222206)
chr4 (284-344)||(38417020-38417080)
chr4 (296-363)||(49001451-49001518)
chr4 (581-659)||(41413249-41413327)
chr4 (338-468)||(42497809-42497939)
chr4 (373-467)||(49002822-49002916)
chr4 (365-469)||(25140466-25140570)
chr4 (377-469)||(25140687-25140779)
chr4 (372-459)||(47784101-47784188)
chr4 (345-429)||(47873953-47874037)
chr4 (288-391)||(55838875-55838978)
chr4 (377-427)||(25140894-25140944)
chr4 (291-343)||(4936614-4936666)
chr4 (295-391)||(55774704-55774800)
chr4 (328-391)||(1788175-1788238)
chr4 (396-462)||(38416937-38417004)
chr4 (350-409)||(39118308-39118367)
chr4 (579-645)||(42660430-42660496)
chr4 (288-401)||(20078719-20078832)
chr4 (316-417)||(46381079-46381180)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (718-966)||(4329251-4329499)
chr2 (316-645)||(36948851-36949178)
chr2 (284-644)||(32187743-32188102)
chr2 (285-627)||(39447101-39447441)
chr2 (296-644)||(33452329-33452675)
chr2 (284-641)||(15994987-15995343)
chr2 (316-633)||(44465633-44465949)
chr2 (285-590)||(41510304-41510606)
chr2 (327-644)||(45153708-45154023)
chr2 (284-574)||(41854778-41855061)
chr2 (296-645)||(25217660-25218023)
chr2 (284-574)||(42894369-42894657)
chr2 (318-644)||(17474707-17475033)
chr2 (284-659)||(5507323-5507699)
chr2 (284-584)||(41203060-41203358)
chr2 (296-574)||(36874977-36875253)
chr2 (296-641)||(34517026-34517369)
chr2 (287-463)||(19109892-19110068)
chr2 (299-468)||(16750318-16750485)
chr2 (306-469)||(8388746-8388909)
chr2 (296-462)||(35251032-35251198)
chr2 (478-580)||(4268303-4268406)
chr2 (286-409)||(30763804-30763927)
chr2 (284-461)||(42478846-42479023)
chr2 (284-417)||(38308706-38308840)
chr2 (483-645)||(9847495-9847658)
chr2 (504-659)||(25715270-25715427)
chr2 (288-462)||(45293743-45293916)
chr2 (497-574)||(33366920-33366996)
chr2 (300-470)||(26228160-26228330)
chr2 (295-421)||(37773700-37773827)
chr2 (380-573)||(38066643-38066834)
chr2 (365-427)||(17766784-17766846)
chr2 (498-572)||(38308880-38308954)
chr2 (288-361)||(13704690-13704763)
chr2 (376-430)||(9847386-9847440)
chr2 (365-427)||(34519492-34519554)
chr2 (296-337)||(27670723-27670764)
chr2 (296-361)||(38065463-38065528)
chr2 (365-427)||(9847167-9847229)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (284-659)||(4064598-4064971)
chr5 (296-644)||(6156615-6156961)
chr5 (296-644)||(15799109-15799455)
chr5 (284-645)||(33487493-33487853)
chr5 (284-643)||(20891497-20891855)
chr5 (284-659)||(12464998-12465355)
chr5 (296-641)||(38871558-38871901)
chr5 (370-659)||(26190263-26190550)
chr5 (284-644)||(38692662-38693020)
chr5 (296-632)||(39524672-39525006)
chr5 (284-641)||(15957637-15957991)
chr5 (296-633)||(28083269-28083604)
chr5 (296-584)||(32841861-32842149)
chr5 (284-572)||(31221218-31221504)
chr5 (296-644)||(37183672-37184019)
chr5 (285-645)||(24203564-24203918)
chr5 (285-633)||(40619865-40620216)
chr5 (284-603)||(38372234-38372543)
chr5 (285-557)||(29862583-29862854)
chr5 (284-644)||(31929004-31929342)
chr5 (383-645)||(25746910-25747168)
chr5 (483-659)||(26318987-26319163)
chr5 (296-659)||(27212577-27212934)
chr5 (284-469)||(7884250-7884435)
chr5 (483-659)||(37094991-37095165)
chr5 (284-449)||(14111944-14112107)
chr5 (284-584)||(26095035-26095334)
chr5 (284-469)||(12847500-12847685)
chr5 (296-469)||(13908605-13908778)
chr5 (483-655)||(34440617-34440779)
chr5 (483-645)||(36359661-36359824)
chr5 (284-469)||(23269391-23269579)
chr5 (296-466)||(27158144-27158314)
chr5 (296-392)||(26898694-26898790)
chr5 (484-574)||(14111851-14111942)
chr5 (483-658)||(38640590-38640767)
chr5 (479-582)||(8032217-8032321)
chr5 (286-469)||(40613556-40613739)
chr5 (300-469)||(41639385-41639557)
chr5 (358-463)||(21070429-21070534)
chr5 (358-470)||(8738938-8739050)
chr5 (296-462)||(6800818-6800984)
chr5 (284-350)||(26190201-26190267)
chr5 (375-469)||(27494123-27494217)
chr5 (285-391)||(33901094-33901200)
chr5 (365-469)||(16429339-16429443)
chr5 (354-470)||(26093502-26093618)
chr5 (286-469)||(26622170-26622350)
chr5 (365-467)||(8739148-8739250)
chr5 (385-469)||(1350290-1350374)
chr5 (296-467)||(41253359-41253530)
chr5 (365-427)||(28445169-28445231)
chr5 (527-640)||(34529913-34530029)
chr5 (306-387)||(7036677-7036758)
chr5 (527-633)||(43388189-43388297)
chr5 (374-441)||(34530300-34530367)
chr5 (365-427)||(8973569-8973631)
chr5 (594-659)||(1350451-1350516)
chr5 (327-464)||(11186097-11186234)
chr5 (358-430)||(16429168-16429240)
chr5 (381-441)||(28445381-28445441)
chr5 (555-633)||(28108277-28108354)
chr5 (615-649)||(38030765-38030799)
chr5 (377-427)||(38641033-38641083)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (284-645)||(23406717-23407077)
chr6 (284-644)||(2813103-2813463)
chr6 (284-645)||(5699479-5699846)
chr6 (284-630)||(17264346-17264690)
chr6 (286-645)||(4508183-4508540)
chr6 (288-659)||(5638786-5639138)
chr6 (297-644)||(14587452-14587797)
chr6 (406-641)||(32035038-32035266)
chr6 (296-659)||(3717173-3717534)
chr6 (298-603)||(1945423-1945725)
chr6 (305-641)||(24604261-24604597)
chr6 (478-645)||(33413417-33413584)
chr6 (478-644)||(7412750-7412916)
chr6 (287-584)||(9905100-9905392)
chr6 (296-519)||(2539498-2539719)
chr6 (284-431)||(21514910-21515057)
chr6 (286-469)||(29519374-29519557)
chr6 (296-469)||(13800918-13801091)
chr6 (300-469)||(7734221-7734390)
chr6 (308-409)||(32044537-32044638)
chr6 (286-446)||(34528558-34528718)
chr6 (284-467)||(29289504-29289687)
chr6 (287-462)||(6704009-6704183)
chr6 (285-469)||(14037845-14038026)
chr6 (288-459)||(236899-237069)
chr6 (297-423)||(16450355-16450481)
chr6 (284-327)||(33413365-33413408)
chr6 (296-421)||(3365808-3365933)
chr6 (285-401)||(10310311-10310427)
chr6 (376-427)||(17501003-17501054)
chr6 (498-556)||(21517572-21517630)
chr6 (286-343)||(7412971-7413028)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (288-644)||(9380-9734)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (284-633)||(141843-142188)
[»] scaffold0508 (1 HSPs)
scaffold0508 (284-659)||(3273-3648)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (284-429)||(140620-140765)
scaffold0010 (562-633)||(140541-140612)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (484-633)||(23056-23205)
scaffold0182 (365-438)||(23228-23301)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (300-463)||(59865-60028)
scaffold0006 (373-444)||(59480-59551)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (296-464)||(4471-4639)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 716 - 1076
Target Start/End: Original strand, 21110953 - 21111313
Alignment:
Q  716 attatttgcaaacgaaggaatctaatttaacatcatgcatcactcattaagagacctaggaatctatttcatttctttgaagcttctcaaccacttgact 815  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21110953 attatttgcacacgaaggaatctaattcaacatcatgcatcactcattaagagacctaggaatctatttcatttctttgaagcttctcaaccacctgact 21111052  T
Q  816 catagtaggcctaatatttttatctacctcttcacactccaaagcaactttcgccaaaatttccatcttacttgaatcacaattagttccaatattagga 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21111053 catagtaggcctaatatttttatctacctctacacactccaaagcaactttcgccaaaatttccatcttacttgaatcacaattagttccaattttagga 21111152  T
Q  916 tccaaaatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaagttatcaaccttccattgtatgcaacttctccatcaactccttctatat 1015  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21111153 tccataatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaatttatcaaccttccattgtatgccacttctccatcaactccttccatat 21111252  T
Q  1016 tcatcattgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21111253 tcatcattgttggactctttccggttatcatatccaacaaaacaaccccataactataaac 21111313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 47202767 - 47202401
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47202767 ggggaagtttaagagcaatccaatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacga-------tgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 47202675  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  47202674 attaatattgtccctaaaacggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaactatttt---acctta 47202578  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47202577 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagttttcggattacaaaatctggaaaaatc 47202478  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47202477 cgtaactccatttttcaccctataacaaaagaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 47202401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 285 - 649
Target Start/End: Original strand, 3304638 - 3305001
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3304638 gggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgagaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaatgataagagttaggaaga 3304737  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||     
T  3304738 ttaatattgtccctaaaatggttatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttaccttag 3304834  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcccta-ttttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3304835 aaaagggtgtttggggggtttttggattatgtaatccggaaatatcatgtaacacaccctatttttttgaagtttctggattacaaaatccggaaaaatc 3304934  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctc 649  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3304935 cgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccaaattatgaaatccggaaatctc 3305001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 286 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 31643318 - 31642951
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31643318 ggaagtttcagagcaatccgatcaagtagtccgaaac-ccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaagat 31643220  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||       ||||||||    
T  31643219 taatattgtccctaaaatagctatacatgttaaaaatatgtttaggatttatgctgatccagttcagattatataatccgaacta---ttttaccttaaa 31643123  T
Q  486 aaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  31643122 aaagggtgtttggggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacacaccctattttttgaagtttccaaattacaagatccagaaaaatccg 31643023  T
Q  585 taactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggca 656  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31643022 taactccatttttcaccctataacaaacgaaaacaccattccagattatgaaatccggaaacctcaagggca 31642951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 285 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 8155178 - 8154865
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8155178 gggaagtttcagaacaattcgatcaagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaataatgaccaaaaacaaaaggataagagctaggaaga 8155079  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||       |||||||    
T  8155078 ttgatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatagagtttagattatataatccgaacta---ttttaccttaa 8154982  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154981 aaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 8154882  T
Q  584 gtaactccatttttcac 600  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8154881 gtaacttcatttttcac 8154865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Original strand, 42925531 - 42925878
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaagattaatattgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42925531 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccaatttttgactaagaacaagtaacaatgatccaaaaacggaaggatgagagttaggaagattaatattgt 42925630  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgt 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||        ||||| ||||| |||||    
T  42925631 ccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcgtattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaaaggtgt 42925727  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42925728 ttagggggtttccggattatgtaatccgaaaacatcatgtaatgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatcaggaaaaacccgtaactccat 42925827  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42925828 ttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaa 42925878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 3936388 - 3936030
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3936388 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagcagtccgaaaatccgatttttgactaagaataggtaacaatgacccaaaatagaaggatgagagttaggaag 3936289  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||        |||||     
T  3936288 attaatattgtccctaaaatgattatccatgttacaaacatgtttacaatttgtgctaatacatttcggattatataattcggact---gttttaccttg 3936192  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3936191 aaaaagggtgtttagggggtttttggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacc 3936092  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| ||||  |||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3936091 cgttactcattttttcactctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaa 3936030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 782 - 1076
Target Start/End: Original strand, 18658141 - 18658435
Alignment:
Q  782 tttcatttctttgaagcttctcaaccacttgactcatagtaggcctaatatttttatctacctcttcacactccaaagcaactttcgccaaaatttccat 881  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18658141 tttcattgctttgaagcttctcaaccacctggctcatattaggcctaatatctctatcttcctctacacaatccaaagcaactttagccaaaacttccat 18658240  T
Q  882 cttacttgaatcacaattagttccaatattaggatccaaaatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaagttatcaaccttcca 981  Q
    |||| || |||||||||| || || ||   |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658241 cttatttaaatcacaattggtccccattgcaggatccataatttcttcaacccaacatgtactcctctttttctctcttacccaagttatcaaccttcca 18658340  T
Q  982 ttgtatgcaacttctccatcaactccttctatattcatcattgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18658341 ttgtatgccatttctccatcaacgtcttctatattcatcatcgttggactctttccagttatcatctccaacaatacaaccccataaccataaac 18658435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 316 - 659
Target Start/End: Original strand, 28230379 - 28230718
Alignment:
Q  316 ccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgt 415  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  28230379 ccgaaaacccgaattttgactaagaacatgcaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtccataaaatgactatccatgt 28230478  T
Q  416 tacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatg 514  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28230479 tacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtttagggggtttccggattatg 28230575  T
Q  515 taatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacagga 614  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||| | ||    
T  28230576 taatccggaaacatcaagtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgttact-cattttttaccctttaacaaaaga 28230674  T
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  28230675 aaacaccattctggattataaaatcc-gaaaactcaagggcattt 28230718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 36468416 - 36468786
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  36468416 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgattttttactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttatgaag 36468515  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||        |||||     
T  36468516 attaatattgttcctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataattcaaact---gttttaccttg 36468612  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36468613 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatc-tgaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagtttccatattacaaaatccggaaaaatc 36468711  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||| ||||  ||||||| |||  |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||||    
T  36468712 cgttactcattttttca-cctttaacaaaagaaaacatcattccgaattataaaatttggaaat-tcaagggcattt 36468786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 365 - 659
Target Start/End: Original strand, 24042148 - 24042439
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24042148 aaggatgagagttaggaagattgatattgtccctaaaatgactatcaatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatcc 24042247  T
Q  465 gaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggat 563  Q
    |||||        ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24042248 gaact---gttttaccttgaaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccttattttttgaagtttccggat 24042344  T
Q  564 tacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  24042345 tacaaaatccggaaaaacccgtaactccatttttcaccctatatcaaaggaaaacaccattccgaattatgaaattcagaaa-ctcaagggcattt 24042439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Original strand, 33573922 - 33574277
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33573922 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagttcgaaaacccaatttttgattaaaaacatgtaacaatgactcaaaacaaaaggataagagttagaaag 33574021  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||       ||||||    
T  33574022 attaatattgtccctaaaatagttatacatgttacaaatatgtttatgatttgtgctcatacagttcagattatataattcgaacta---ttttacctta 33574118  T
Q  484 aaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    |||||         |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33574119 aaaaa--------tggggttttcggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcaccctattttttaaagtttccggattacaaaatccaaaaaaatcc 33574210  T
Q  584 gtaactccatttttcaccct-----acaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
     ||||| |||||||||| ||     | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  33574211 ataacttcatttttcactctataacaaaacaaaggaaaacaccatcccggattatgaaacccggaaa 33574277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 36629483 - 36629125
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  36629483 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaccaggtaacagtgagccaaaacagaaggatgagagttaggaag 36629384  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||| ||||||||||| |   |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  36629383 attaatattctccctaaaatgac--gacatgtaacaaacatgtttaaaatttgcgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttacctta 36629289  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36629288 aaaaatggtgtttagagggtttccagattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctatttttttaagttaccagattacaaaatccggaaaaatc 36629189  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaac-acaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||| ||||  |||||||||||  ||| | || |||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  36629188 cgttactcattttttcaccctctaacaaaagaaaaacaccattccatattataaaatccggaaa 36629125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 790 - 1076
Target Start/End: Original strand, 21129987 - 21130273
Alignment:
Q  790 ctttgaagcttctcaaccacttgactcatagtaggcctaatatttttatctacctcttcacactccaaagcaactttcgccaaaatttccatcttacttg 889  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||| | ||  |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  21129987 ctttgaagcatctcaacaacctgactcatagtaggcctaatatccctatcttcttcaacacaatccaaagcaactctaaccaaaatttccatcttactta 21130086  T
Q  890 aatcacaattagttccaatattaggatccaaaatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaagttatcaaccttccattgtatgc 989  Q
    ||||| ||||| | || ||   ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21130087 aatcataattattccctattgcaggatccaagatttgttcaacccaacatgtactcctctttttctctcttacccaagttatcaaccttccattatatgt 21130186  T
Q  990 aacttctccatcaactccttctatattcatcattgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  21130187 cccttctccatcaactccttctatattcatcattgttggactctttccggttatcatctctaacacgacaaccccgtaactataaac 21130273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 287 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 36408648 - 36408347
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatt 386  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |  ||||||| |||||||    
T  36408648 gaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaaccaaatttttgactaagaacacgtaacaatgacccaaaacagaagaaagagagttaagaagatt 36408549  T
Q  387 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaa 486  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||        ||||| |||    
T  36408548 aatattgtccctaaaattactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataattcgaact---gttttaccttgaaa 36408452  T
Q  487 aagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 585  Q
     | |||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36408451 gatggtgtttatgaggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtatcgcgccttattttttgaagtttctggattacaaaatccggaaaaatccgt 36408352  T
Q  586 aactc 590  Q
     ||||    
T  36408351 tactc 36408347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Original strand, 19225477 - 19225825
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||   |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  19225477 ggggaagtttcggagcaatccgatcaaatagtccgaaaacctgatttttgactaagaatgggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 19225576  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||| ||||  ||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |        | |||     
T  19225577 atttatatcatccataaaatgaatatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgataccgttcagattatataatccgaatt---gttttatcttg 19225673  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgg-aaaaat 581  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  19225674 aaaaatggtgtttaggggatttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcaccctattttttgaagtttttggattacaaaatccggaaaaaat 19225773  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    |||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||| || |||||    
T  19225774 ccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcatttcgaattat 19225825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 286 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 9152074 - 9151777
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  9152074 ggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccaaaaacccgattttttactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagat 9151975  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||        ||||| ||    
T  9151974 taatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatctggact---gttttaccttgaa 9151878  T
Q  486 aaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9151877 aaaggatgtttagggggtttccggattatgtaat------------------gcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacctg 9151796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 343 - 633
Target Start/End: Original strand, 37518233 - 37518521
Alignment:
Q  343 aagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctga 442  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  37518233 aagtaacaatgacctaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatagtgttcctaaaatgactatctctgttacaaacatgtttagaatttatgctga 37518332  T
Q  443 tacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcc 541  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  37518333 tacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacttcatgtaacacgcc 37518429  T
Q  542 ctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||  || | | ||||||||||||  |||||||    
T  37518430 ctattttttgaagtttctggattataaaatccggaaaaatccgttacttattttttcaccctttaataaaagaaaacatcattttggattat 37518521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 284 - 465
Target Start/End: Original strand, 42864981 - 42865162
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| || | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  42864981 ggggatgtttcagagcaatccgatcaagtagtccgaaaacctgatttttgaccaagaacaggtgacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 42865080  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccg 465  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42865081 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatatttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccg 42865162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 300 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 33151467 - 33151129
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcccta 399  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151467 aatccgatcaagtagtcagaaaacccaatttttgactaagaacagataacaatgacccaaaatagaaggatgagagttaggaagattaatattgtcccta 33151368  T
Q  400 aaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaa-gggtgttt-g 497  Q
    |     |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||        ||||||||||| | |||||| |    
T  33151367 a-----ctattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcgaattatataatccgaact---gttttaccttaaaaaatgagtgtttag 33151276  T
Q  498 ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcccta-ttttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc-cattt 595  Q
    ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||  |||   |||    
T  33151275 gggatttccggattatgtaatccgaagacatcatataatgcgccctattttttttaagtttccgaattacaaaatc--taaaaatccgttcctcattttt 33151178  T
Q  596 ttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||  |||| | |||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  33151177 ttcaccctttaacaaaagaaaacatcattctagattatataatccggaa 33151129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 572
Target Start/End: Original strand, 31985400 - 31985685
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||    
T  31985400 aagttttggaacaatctgatcaagtagcccaaaaaccagatttttgactaagaacggttaacaatgacccaaaacagaatgatgagagttagaaagatta 31985499  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaa 487  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||         |||| ||||    
T  31985500 atattgtccataaaatgactattcatgttaaaaatatgtttaaaatttgtgttgatacagttcgaattatataatccgaact--gtttcccccttgaaaa 31985597  T
Q  488 agggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcccta--ttttttgaagtttccggattacaaaatc 572  Q
    | |||||||  ||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31985598 atggtgtttaaggggtgttcgaattatgtaatccgaaaaaatcatgtaacgcgccctattttttttgaggttttcggattacaaaatc 31985685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1518975 - 1518802
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1518975 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaaccctattttttactaagaacagctaacaataacccaaaatagaaggatgagagttaagaagattaatattgtc 1518876  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    | |||||||  |||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1518875 cataaaatgattatcgatgttacaaacatgtttataatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact 1518802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 567
Target Start/End: Original strand, 24690215 - 24690494
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaa-tccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  24690215 gaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaaatccgattattgactaagaacgggtaacaatgacccaaaacaaaaggatgagagttaggtagat 24690314  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||         |||| ||    
T  24690315 taatattgtccataaaatgacgatccatgttacaaacatgcttaaaatttatgctgatacagttcagattatataatcc-atct--gtttttcccttgaa 24690411  T
Q  486 aaagggtgtttg-ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattaca 567  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24690412 aaagggtgtttgaggggtgttcggattgtataatctgaaaaaatcaaatagtgagccctattttttgaagtttccggattaca 24690494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 484 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 43737207 - 43737063
Alignment:
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43737207 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 43737108  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccg 627  Q
    ||| ||||  |||||||||||  |||| | ||||||| |||||||    
T  43737107 cgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacaccattccg 43737063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Original strand, 18657990 - 18658162
Alignment:
Q  59 tcaattctaaatcaactttcacccaagtttattgatcaaatataagattatttgcaaagataaataatgaaggttaataaattctcgtatgttctctcaa 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  18657990 tcaattctacatcaactttcacctaagtttattgatcagatataagattatttgcaaagataaagaatgtaggttaatcaatcatcgtacgttctctcaa 18658089  T
Q  159 aatcaagagacggagcaatctaattc-gcatcattcatcactcaata--tttttcgttgctttgaagcttctc 228  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||    
T  18658090 aatcaagagacgaagtaatctaactcaacatcattcatcactcaaaaactctttcattgctttgaagcttctc 18658162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19818648 - 19818500
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19818648 gagcaatccgatcaagtagtccaaaaacccgattttcgaccaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 19818549  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgata 444  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19818548 cctaaaataactatccatgttacaagcatgtttaggatttgtgctgata 19818500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 284 - 467
Target Start/End: Original strand, 36946171 - 36946353
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36946171 ggggaagtttcgaagcaattcgatcaagtatcccgaaaaccagaattttgactaataacaactaacaatgacccaaaacaaaaggatgagagttaggaag 36946270  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
     |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36946271 cttaatattgt-cttaaaatgattattcatgttacaaacatattcagaatttgtgctgatacagttcgggttatataatccgaa 36946353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43737350 - 43737237
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43737350 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccggtttttaactaagaacatgtaacaatgacccaaaacataaggatcagagttaggaagattaatattgtc 43737251  T
Q  396 cctaaaatggctat 409  Q
    ||||||||| ||||    
T  43737250 cctaaaatgactat 43737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 286 - 417
Target Start/End: Original strand, 7115151 - 7115282
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||    
T  7115151 ggaagtttcagagcaatacgatcaagtagcccgaaaacacgatttttgactaagaacaactaacaatgaccaaaaatagaaggatgagagttatcaagat 7115250  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgtta 417  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  7115251 taatattgtccataaattggttatccatgtta 7115282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5278501 - 5278358
Alignment:
Q  327 atttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgt 426  Q
    |||| |||||||||||   ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5278501 atttgtgactaagaacggctaacaatgacccaaaacagaaggataagagttaggaagattaatattatccttaaaatgactatccatgttacaaacatgt 5278402  T
Q  427 ttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaacta 470  Q
    | |  |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5278401 tcaaaatttatgctaatacagttcagattatataatccgaacta 5278358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 423 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 6467839 - 6467603
Alignment:
Q  423 atgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgg 521  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  6467839 atgtttaaaatttatgctgatacagttcggattatataatccgaactgtttttc--ccttgaaaaagggtgtttagggggtgttcggattatgtaatccg 6467742  T
Q  522 gaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccgga--ttacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaaca 619  Q
     | | |||||||||| | |||||||||||||  |||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  6467741 aacaaatcatgtaacacaccctattttttgagatttctggattttacataattcggaaaaatccgtaact-catttttcaccatttaacaaaggaaaaca 6467643  T
Q  620 tcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
     ||||||| || || |||||||||||  || |||||||||    
T  6467642 ccattccgaatcataaaatccggaaacttcaagggcattt 6467603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 511 - 644
Target Start/End: Original strand, 42877149 - 42877282
Alignment:
Q  511 tatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacac 610  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||  ||||     
T  42877149 tatgtaatccggaaacattatgtaacgcgccctattttttttattttcccgattacaaaatccggaaaaacacgttactcattttttcaccctttaacaa 42877248  T
Q  611 aggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42877249 aagaaaacatcattccggattatataatccggaa 42877282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 463
Target Start/End: Original strand, 6467020 - 6467198
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||| |    
T  6467020 gggaaatttcagaacaatccgatcaagtagccggaataccaaatttttaactaagaacagctaacaatgacctaaaatagaaggaagagagttaggaaaa 6467119  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatc 463  Q
    ||||||||| || ||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6467120 ttaatattgcccttaaaataactatccatattacaaacatgtttagaacttgtgttgatatagttcggattatataatc 6467198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 26555040 - 26555128
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  26555040 aagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgtttttttactaagaacatgtaacaatgacccaaaatagaaggatgagagt 26555128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 469
Target Start/End: Original strand, 16983673 - 16983806
Alignment:
Q  336 taagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggattt 435  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |     |  ||||    
T  16983673 taagaacagctaataatgaccaaaaatagaaggatgagagttaggaagattaatattgtctgtaaactggttatccatgttacaaacagacccaaaattt 16983772  T
Q  436 gtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16983773 gtgctgatacaattcagattatataatccgaact 16983806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 48776100 - 48776268
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa--aaggataagagttaggaagattaatattg 393  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |  | | || |||||||||||||||||||||     
T  48776100 gagcaatctgattaagtagctcgaaaatcaaatttttgactaagaacaactagcaatgacctaaaatgactatgcatgagagttaggaagattaatatta 48776199  T
Q  394 tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    ||| ||||||  |||| ||||||| ||| ||||| |  ||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  48776200 tccttaaaatcactatccatgttataaacatgttcaaaatttgtgctaatataatttggattatataat 48776268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 540 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 28346173 - 28346076
Alignment:
Q  540 ccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaat 638  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  | ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28346173 ccctactttttgaagtttctggattacaaaattcggaaacatccgtaact-catttttttctctttaacaaaggaaaacatcattccagattatgaaat 28346076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 48775798 - 48775705
Alignment:
Q  374 agttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48775798 agttaggaagattaatattgtccttaaactgactattcatgttacaagcatgtttaaaatttgtgc--atacagttcggattatataatcctaact 48775705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Original strand, 37398771 - 37398877
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||| |  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||    
T  37398771 gggaagtttcggagcaatctgatcaagtagcctaaaaaccgaattttttactaagaacaactaacaatgacctaaaacagaatgatgagagttaggaaga 37398870  T
Q  385 ttaatat 391  Q
    |||||||    
T  37398871 ttaatat 37398877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 467
Target Start/End: Original strand, 48705899 - 48706061
Alignment:
Q  305 gatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatg 404  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||  || ||||||| |||| | || |||  ||||||||||||||||||| || | |||| |     
T  48705899 gatcaagtagcccgaaaattgaattttttactgagaacaataaacaatgacctaaaacataaagatccgagttaggaagattaatatggtacttaaacta 48705998  T
Q  405 gctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    | ||| | ||||| ||||| | |||| || |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  48705999 gttatccgtgttaaaaataggcttagaatctgtgctgatacagttcagattatataaaccgaa 48706061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43185996 - 43185887
Alignment:
Q  350 aatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacactt 449  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||  ||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  43185996 aatgacctaaaatataagtatgagagttaggaatgttaatattgtccaaaaaatgattatccatgttataaacatgtttaaaatttgtgctgatacagtt 43185897  T
Q  450 cggattatat 459  Q
     |||||||||    
T  43185896 tggattatat 43185887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Original strand, 28349227 - 28349322
Alignment:
Q  550 tgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| |  |||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  28349227 tgaagttttcggattacaaaattcagaaaaattcgtaactcattttttcaccatttaacaaagaaaaacaccatttccgattatgaaatccggaaa 28349322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39582019 - 39581840
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||| | ||| || ||||||| ||||    
T  39582019 ggggaattttttaagcaatatgatcaagtagcccaaaaaccggatttttgacgaagaataactaacaatgacctaaaacagaagaatgagagttatgaag 39581920  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatt--tgtgctgatacacttcggattatataatc 463  Q
    |||||||  |||  |||| ||| ||| ||||||||||| |   |||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39581919 attaata--gtctttaaattggttattcatgttacaaacaaacttataatttgtgtgctgatacagttcggattatataatc 39581840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 580
Target Start/End: Original strand, 26555131 - 26555214
Alignment:
Q  497 gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa 580  Q
    |||||| ||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||| |||||    
T  26555131 gggggtgttcggattaggtaatccaaaaaaatcatgtaacgcgccctattttttgtgatattcggattacaaaatccgaaaaaa 26555214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 469
Target Start/End: Original strand, 8214257 - 8214354
Alignment:
Q  372 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| ||| |||| || || | ||||  |||||||||||    
T  8214257 agagttaggaagattaatattgtccttagaatgactatccatgttgcaaacatgttcagaattggtgttgatgcagtttgaattacgtaatccgaact 8214354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 427
Target Start/End: Original strand, 8214462 - 8214523
Alignment:
Q  366 aggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||| |||||    
T  8214462 aggatgagagttaggaagattaatattgtccttaaaatgacaatcgatgttacaaacatgtt 8214523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 357
Target Start/End: Original strand, 37518142 - 37518215
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgaccc 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  37518142 ggggaagtttcggagcaatccgatcaaatagtccaaaaacccaatttttaactaagaacaggtaacaatgaccc 37518215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 615 - 659
Target Start/End: Original strand, 47203105 - 47203149
Alignment:
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47203105 aaacatgattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 47203149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 45
Target Start/End: Original strand, 21123081 - 21123110
Alignment:
Q  16 aacacaaagataaagagaaaagggaactta 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21123081 aacacaaagataaagagaaaagggaactta 21123110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 18583423 - 18583796
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18583423 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggcag 18583522  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||       ||||||    
T  18583523 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgccgatacagttcagattatataatccgaacta---ttttacctta 18583619  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18583620 aaaaaaggtgtttagggggtttccggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcgccctatttttttaagtttccagattacaaaatccggaaaagtc 18583719  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  18583720 cgtaacttcatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccgaaaacctcaagggcattt 18583796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 23443018 - 23442645
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23443018 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 23442919  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||       ||||||    
T  23442918 attaatattgtccctaaaatggctgtacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagtttggattatataatccgaacta---ttttacctta 23442822  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23442821 aaaaaagatgtttggggggtttccgaattatataatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccagattataaaatccggaaaaatc 23442722  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23442721 cgtaactccatttttcaccttataacaaaggaaaacatcattccggataatgaaatccggaaacctcaagggcattt 23442645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 33611289 - 33611662
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33611289 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggataagatttaggaag 33611388  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  33611389 ataaatattgtccttaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttacctta 33611485  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  33611486 aaaaagggtgtttagggggtttccagattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccaaattacaaaatccgaaaaaatc 33611585  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  33611586 cgtaactccatttttcaccctataacaaagaaaaacaccattctggattatgaaatccagaaacctcaagggcattt 33611662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 49786548 - 49786190
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49786548 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtaggccgaaaacttgatttttgactaaaaacatgtaacattgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 49786449  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||       | ||||    
T  49786448 attaatattgtccataaaatggctatacatgttacaaataagtttaggatttgtgctgatacagttaggattatataatccgaacta---ttttatctta 49786352  T
Q  484 aaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49786351 aaaaagggtgtttgggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctattttttaaagttttcggattgcaaaatccggaaaaatcc 49786252  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
     |||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  49786251 ataactccatttttcaccctataataaaggaaaacacaattccagattatgaaatccggaaa 49786190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Original strand, 34162600 - 34162960
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||| ||||||||||    
T  34162600 ggggaagtttcggagcaaaccaatcaagtagcccgaaaattcgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaaacggaaggataggagttaggaa 34162699  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||        |||||    
T  34162700 gattaatattgtccctaaaatggctatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataattcgaact----gtttacctt 34162795  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgg-aaaaa 580  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34162796 gaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatctaacacgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaaa 34162895  T
Q  581 tccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34162896 cccgcaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa 34162960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 296 - 641
Target Start/End: Original strand, 41584556 - 41584904
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41584556 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 41584655  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttc-----ggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagg 490  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||        ||||| |||||||    
T  41584656 cataaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattggattatataatccgaact---gatttaccttgaaaaagg 41584752  T
Q  491 gtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaact 589  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41584753 atgtttagggggtttccggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacatgccctagtttttgaaatttccggattacaaaatccagaaaaacccgtaact 41584852  T
Q  590 ccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
     |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41584853 tcatttttcaccctataacaaaagaaaacaccattcctgattatgaaatccg 41584904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 17000659 - 17000287
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  17000659 ggggaagtttcggagcaatccaatcaagtagcccgaaaattcgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaaacggaaggatgagagttaggaa 17000560  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||        |||||    
T  17000559 gattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagctcagattatataattcaaact---gttttacctt 17000463  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  17000462 gaaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccagaaacatcatctaacgtgccctattatttgatgtttccgaattacaaaatccggaaaaa- 17000364  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  17000363 ccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattctggattatgaaatcc-gaaaactcaagggcattt 17000287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 351 - 644
Target Start/End: Original strand, 32817557 - 32817848
Alignment:
Q  351 atgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttc 450  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  32817557 atgacccaaaacagaaggatgggagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaggatttgtgctgatacagttc 32817656  T
Q  451 ggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttt 549  Q
    |||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32817657 ggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaatctggaaacatcatgtaatgcgccctattttt 32817753  T
Q  550 tgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32817754 tgaagtttccggattacaaaatctggaaaaacccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaa 32817848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 42546248 - 42545901
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatcc-gatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |     
T  42546248 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaaacccggtttttaactaagaacagataacaatgacccaaaacagaaggatgagagttagaat 42546149  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||    
T  42546148 gattaatattatctctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttacctt 42546052  T
Q  483 aaaaaagggtg-tttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42546051 gaaaaagggtgcttagggggttttcggatcatgttatccggaaacatcatgtaacgcgtcctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 42545952  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    |||| | | |||||||||||||  |||| | || |||| |||||||||||||    
T  42545951 ccgtta-ttcatttttcaccctttaacaaaagataacaccattccggattat 42545901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 296 - 633
Target Start/End: Original strand, 15069732 - 15070068
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  15069732 gagcaatccgatcaagtagctcgaaaatccgatttttaactaagaacaagtaacaatgatccaaaacagaaggatgaaagttagtaagattaatattgtc 15069831  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
     |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        | ||| ||||| ||||||    
T  15069832 tctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcggattatataatctgaact---gttttatcttgaaaaatggtgtt 15069928  T
Q  496 t--gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  |    
T  15069929 taggggggtttccggattatataatccggaaacatcatgtaacacgtcctattttttgaagtttccggattacaaaatccgaaaatatccgttactcatt 15070028  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    | ||| ||||  |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15070029 tgttctccctttaacaaaagaaaacatcatttcggattat 15070068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 284 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 49677763 - 49677478
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  49677763 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtaggctgaaaacccgatttttaactaagaacatgtaacaatgacccaaaacataagaatgagagttaggaag 49677664  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||     
T  49677663 attaatattgtccctaaaatgactatctatgttacaaacatggttagaatttatgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttg 49677567  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaat 571  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49677566 aaaaggggtgtttagggggtttctggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccagattacaaaat 49677478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 296 - 590
Target Start/End: Original strand, 45046741 - 45047033
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45046741 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccggtttttaactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 45046840  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt-aaaaaagggtgt 494  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||       || || ||||  ||||||    
T  45046841 cctgaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatacaatccgaacta---ttttacattgaaaagggggtgt 45046937  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc 590  Q
    || |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45046938 ttagggggtttccggattatgtaattcggaaacatcatgtaatg-gccctcttttttgaagttttcggattacaaaatccggaaaaatccgttactc 45047033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 286 - 633
Target Start/End: Original strand, 40650556 - 40650902
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  40650556 ggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaactcggtttttaactaagaacaggtaacaatgacccaaacgagaaggatgagagttaggaagat 40650655  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||        ||||| ||    
T  40650656 taatattgtccctaaaatgattatccatgttacaaacatggttataatttgtgctgatacagttcagatcatataatccgaact---gttttaccttgaa 40650752  T
Q  486 aaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40650753 aaatggtgtttaaggggtttccggattatgtaatccagaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagtttccggattacaaattccgaaaaaatccg 40650852  T
Q  585 taactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    | ||||   |||||||| ||  |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  40650853 ttactcatttttttcacgctttaacaaaagaaaacaccattccggattat 40650902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Original strand, 40907813 - 40908171
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||  | || |||  |||||||||||    
T  40907813 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgattttttactaacaacaggtaacaatgacccaaagcagaaagatgggagttaggaag 40907912  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt- 482  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||        |||||     
T  40907913 attaatattgtctctaaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcaga-tatataatccgaact---gttttacctta 40908008  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  40908009 aaaaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaatccgaaaacatcatgtagcacgcccaattttttgaagtttccggattgcaaaattctaaaaaat 40908108  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||| ||||  |||||||||||  |||| | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  40908109 ccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacaccatttcggattataaaatctggaa 40908171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 296 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7011478 - 7011172
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7011478 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaaaaacaggttacaatgacctaaaacagaaggatgagagttaagaagattaatattgtc 7011379  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||| ||||| | ||||    
T  7011378 cctaaaatgactatccatgttagaaacatgtttagaatttttgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttaccttgaaaaatgatgtt 7011282  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccc-tattttttgaagtttccggattacaaaatcc-ggaaaaatccgtaactcca 592  Q
    | ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||    
T  7011281 tagggggttttcggattacatgattcggaaacatcatgtaacgcgccctttttttttgaagtttccggattacaaaatccagaaaaaatccgttact-ca 7011183  T
Q  593 tttttcaccct 603  Q
    |||||||||||    
T  7011182 tttttcaccct 7011172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 284 - 583
Target Start/End: Original strand, 28866509 - 28866806
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  28866509 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaataccgatttttgactaagaacaggtaacaatgtcccaaaacagaaggatgagagttatgaag 28866608  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||     
T  28866609 attaaaaatgtccataaaatggctatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact--gtttttcccttt 28866706  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28866707 aaaaagggtgtttagcgggtgttcagattatgtaatccggaaaaatcatgtagcgcgccctattttttatag-ttccggattacaaaatccggaaaaatc 28866805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 329 - 603
Target Start/End: Original strand, 44573021 - 44573292
Alignment:
Q  329 ttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgttt 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44573021 ttttgactaagaacaagtaacaatgatccaaaacagaaggatgagagttagaaagattaatattgtccctaaaatgactattcatgttacaaacatgttt 44573120  T
Q  429 aggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaaca 527  Q
    |  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||       ||||| ||||| || ||||  ||| ||| |||||||||||||| | |||||    
T  44573121 ataatttgtgct-atacagttcagattatataatccgaacta---ttttaccttgaaaaaaggagtttaagggatttccggattatgtaatccgaaaaca 44573216  T
Q  528 tcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccct 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||    
T  44573217 tcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgaaaaaatctgttactcattttttcaccct 44573292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Original strand, 45567769 - 45568103
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||    
T  45567769 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgattttttactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaatggatgagagttagaaag 45567868  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |                  |||||     
T  45567869 attaatattgtccctaaaatgactatccatattacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattgttt-----------------taccttt 45567951  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  45567952 aaaaagggtgtttagggggttttcggatcatgtaatccaaaaatatcatgtagcgcgccctattttttgaagtttccgaattacaaaattcggaaaaacc 45568051  T
Q  583 cgtaactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||| ||||   |||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  45568052 cgttactcatttttttcaccctttaacaaaagaaaatatcattccggattat 45568103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 394 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 32542563 - 32542313
Alignment:
Q  394 tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtg 493  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||   ||||||||    
T  32542563 tccctagaatgactatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttacctt---aaagggtg 32542470  T
Q  494 ttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactcca 592  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||    
T  32542469 tttagggggtttctggattatgtaatccgtaaacatcatgtaacgcaccctattttttgaagattccggattac----------aaaatccgtaactcca 32542380  T
Q  593 tttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  32542379 tttttcaccctacaacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacctcaatggcattt 32542313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 284 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 34006541 - 34006246
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34006541 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacctaatttttgactaagaacaggtagcaatgacacaaaatagaaggatgagagttaggaag 34006442  T
Q  384 attaatattg-tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||         ||||    
T  34006441 attaatattgttccctaaaatgactatccatgttacaaacatctttaaaatttgtgctaatacaatttggattatataatctgaact--gtttttccctt 34006344  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 579  Q
     |||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34006343 gaaaaagggtgtttatggggtgttcaaattatgtaatccggaaaaatcatgtagcccgccctattttttgaattttccggattaaaaaatccggaaaa 34006246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 284 - 467
Target Start/End: Original strand, 52744722 - 52744905
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  52744722 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccaatttttgactaagaacaagtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 52744821  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  52744822 attaatgttgttcctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagcatttgtgctgatacagttcagattatttaatccgaa 52744905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 284 - 584
Target Start/End: Original strand, 26723367 - 26723660
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  26723367 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccaaaaacccgattttttactaagaacagataacaatgactcaaaatagaatgatcagagtaaggaag 26723466  T
Q  384 attaatattg-tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||          ||||    
T  26723467 attaatattgttccctaaaatgactat-catgttacaaacatgttttaaatttgtgctgatatagttcggattatataatccgaac--cgtttttccctt 26723563  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||      ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  26723564 aaaaaagggtgtttagggggtgttcggattatg-----cggaaaaatcatgtagc-cgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccaaaaaaat 26723657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 641
Target Start/End: Original strand, 6223634 - 6223972
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | ||| || | |||||||||         
T  6223634 aagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacctaaaacagaagaatgatagttaggaat---- 6223729  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaa 487  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||||| ||          ||||||||||||||||||        ||||| ||||    
T  6223730 -tattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatatttaaaatttgtgttg----------gattatataatccgaact--gtttttaccttgaaaa 6223816  T
Q  488 agggtgtttg-ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctatttt-ttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 585  Q
    ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||    
T  6223817 aggatgtttatggggtgttcggattatgtaatccaaaaaaatcatgtaatgcgctctatttttttgaagttttcggattgaaaaattcgaaaaaatccgt 6223916  T
Q  586 aactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  6223917 aactcattttttcaccctataacaaaggaaaacacgagttcggattatgaaatccg 6223972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Original strand, 30829541 - 30829707
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          |||||    
T  30829541 aaaaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcgcccta-tttttgaagtttccggattac----------aaaat 30829629  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  30829630 ccgtaacttcatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacttcaagggcattt 30829707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Original strand, 24471389 - 24471556
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt--gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa 580  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||          ||||    
T  24471389 aaaaaagggtgtttaggggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgcccta-tttttgaagtttctggattac----------aaaa 24471477  T
Q  581 tccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24471478 tccgtaactccattttgcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacctcaaggacattt 24471556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 38885481 - 38885161
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38885481 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccaatttttaactaagaacaagtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaaaattaatattgtc 38885382  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    | |||||||              | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        ||||| ||||||||||||    
T  38885381 cttaaaatg--------------acacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaaat---gttttaccttgaaaaagggtgtt 38885299  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |           |||||||||||||| || ||||  ||    
T  38885298 taaggggtttccggattatgtaatc-tgaaacatcatgtaacacgccctctttttttaagtgt-----------aatccggaaaaatctgttactcattt 38885211  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  38885210 tttcaccctttaacaaaagaaaacaccattccggattatataatccggaa 38885161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 286 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27795108 - 27794925
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||    
T  27795108 ggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccaaaaacccgatgtttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaag-atgatagttaggaagat 27795010  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaacta 470  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27795009 taatattgtccataaaatgactatctatgttataaacatgtttaaaatttgcgctgatacagttcagattatataattcgaacta 27794925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 483 - 645
Target Start/End: Original strand, 43319271 - 43319434
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43319271 aaaaaagagtgtttagggggttttcggattatgtaatccgaaaaaatcatgtaacgcgccatatttttttagatttccggattacaaaatccggaaaaat 43319370  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  43319371 ccgtaactcattttttcaccctttaacaaaggaaaacactgttccagattataaaatccagaaa 43319434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 284 - 467
Target Start/End: Original strand, 24472706 - 24472889
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| | ||| || | ||||||||||    
T  24472706 ggggaagtttcggagcaatccaatcaagttgcccacaaattcgatttttgactaagaacagctaacaatgaccaaaaacagaagaatgatagttaggaag 24472805  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24472806 cttaatattttccttaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctaatatagttcggattatataatccgaa 24472889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 468
Target Start/End: Original strand, 3561226 - 3561398
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | || ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  3561226 gagcaatctgatcaagtaacccaaagatcggatttttgactaagaacaactaacaatgacctaaaacagaatgatgagagttagaaagattaatactgtc 3561325  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaac 468  Q
    | ||||||  ||||  |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3561326 cttaaaattactatctatgttacaaacatgttcataatttgtgctgatacagttcggattatataattcgaac 3561398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42929152 - 42928980
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||| | ||| || ||||||| ||| |||||||| |||    
T  42929152 gagcaatctgatcaagtagctcgaaaaccagatttttgactgagaacaactaacaatgatctaaaacataagaatgagagttaagaaaattaatatggtc 42929053  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaac 468  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||| ||| | | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42929052 cttaaaatggcaatacatgttataaacatgctcatgatttgtactgatacagtccggattatataatccgaac 42928980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 427
Target Start/End: Original strand, 25563294 - 25563436
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||||||| || |||| ||||     
T  25563294 gggaagtttcggagcaatccgatcaagtagctcgaatatcggatttttgactaataacaactaacaatgacctaaaacaaaaggatgagggttatgaagc 25563393  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  25563394 ttaatattgtccttaaaatgactatccatattacaaacatgtt 25563436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 527 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 27794893 - 27794762
Alignment:
Q  527 atcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattcc 626  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| || | |    
T  27794893 atcatgtaaagcgccctattttt-gagattttcggattacaaaatctgaaaaaatccataactcattttttcaccctataacaaaggaaaacaccagttc 27794795  T
Q  627 ggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  27794794 ggattatgaaatccgaaaatttcaagggcattt 27794762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 527 - 644
Target Start/End: Original strand, 52744937 - 52745054
Alignment:
Q  527 atcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattcc 626  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |||| | ||||| |||||||     
T  52744937 atcatgtagcgcgccctattttttgaagttttcagattacaaaattcggaaaaatccgttactcattttttcacactttaacaaaagaaaatatcattct 52745036  T
Q  627 ggattatgaaatccggaa 644  Q
     ||||||  |||||||||    
T  52745037 agattatataatccggaa 52745054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 483 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 38950353 - 38950202
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttgggg-gttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||    
T  38950353 aaaaaagagtgtttagggagttttcggattatgtaatctgaaaaaatcatgtaacgcgccctattttt----------ggattacaaaatctggaaaaat 38950264  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  38950263 ccgtaact-catttttca-cttttaacaaaggaaaataccattccgaattataaaatccggaaa 38950202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 890704 - 890609
Alignment:
Q  374 agttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  890704 agttatgaagattaatattgtccttaaactggttatccatgttacaaacagacttagaatttgtgctgatacatttcggataatataatccgaact 890609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 469
Target Start/End: Original strand, 9446048 - 9446159
Alignment:
Q  358 aaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattat 457  Q
    |||||| |||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||  |||||||||     
T  9446048 aaaatacaaggatgaaagctaagaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttataaacatgttcagaattggtgctggtactgttcggattac 9446147  T
Q  458 ataatccgaact 469  Q
     |||||||||||    
T  9446148 gtaatccgaact 9446159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Original strand, 9445846 - 9445922
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctg 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  9445846 aaggatgagagttaggaagattaacattctccttaaaatgactatccatgctacaaagatgtttagaattggtgctg 9445922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26230256 - 26230145
Alignment:
Q  359 aaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattata 458  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||  | | |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||    
T  26230256 aaatagaaggatgagagctatgaagattaatatgatccttaaattggctatccatgttacaagcaagattagaacttgtgttgatacagttcgggttata 26230157  T
Q  459 taatccgaacta 470  Q
    ||||||| ||||    
T  26230156 taatccgcacta 26230145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 890801 - 890748
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaa 341  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  890801 aagttttggagcaatctgatcaagtaacccgaaaaccagatttttgactaagaa 890748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 574
Target Start/End: Original strand, 800877 - 800969
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 574  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||  ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  800877 aaaaaatggtgtttagggggtgttcggattctataatccgaaaaaatcaaataaagcgccctattttttgagattttcggattacaaaatccg 800969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Original strand, 43318940 - 43319016
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctg 441  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  43318940 aaggatgaaagttaggaagattaatattgttcttaaaatgactatcaatgttacaaacatgttcagaattggtgctg 43319016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Original strand, 800552 - 800615
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgttt 428  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  800552 aaggatgagagttaggaaaattaatattgtcctaaaaatgactatccatgctacaaacatgttt 800615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Original strand, 45880000 - 45880095
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatat 391  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| || || ||| ||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  45880000 gagcaatttgatcaagtatcccaaaaactagatttttgactaaaaaaaactaacaatgacctaaaacagaaggatgaaagttaggaagattaatat 45880095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 247; Significance: 1e-136; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 284 - 631
Target Start/End: Original strand, 31519771 - 31520116
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  31519771 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaatgaccaaaaacaaaaggatacgagttaggaag 31519870  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  31519871 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaattatatttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttacctta 31519967  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31519968 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgctctattttttgaagtttctggattacaaaatccggaaaaagc 31520067  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggatt 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  31520068 cgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggatt 31520116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 287 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 21004661 - 21004297
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatt 386  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21004661 gaagtttcagagcaatctgatcaagtagccggaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttatgaagatt 21004562  T
Q  387 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaa 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||       |||||||||    
T  21004561 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtactgata-----cggattatataatccgaacta---ttttaccttaaaa 21004470  T
Q  487 aagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 585  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21004469 aatggtgtttagggagttttcggattatgtaatccggaaacat-atgtaacgcgccttattttttaaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 21004371  T
Q  586 aactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21004370 aactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatctggaaacctcaagggcattt 21004297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 3094953 - 3094603
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3094953 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaactcgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 3094854  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnn-accttaaaaaagggtgt 494  Q
    | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||         ||||| ||||| |||||    
T  3094853 cataaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatcggaactgtttgttttaccttgaaaaatggtgt 3094754  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3094753 ttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaatgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgtaactccat 3094654  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  3094653 ttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccgaattattaaatgcggaa 3094603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Original strand, 8885344 - 8885690
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8885344 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgattttttactaagaacaggtaacaataacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 8885443  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        ||||| |||| |||||||    
T  8885444 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttaccttgaaaatgggtgtt 8885540  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||    
T  8885541 tagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgttactcattt 8885640  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8885641 tttcactctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaa 8885690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44106503 - 44106144
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  44106503 ggggaagtttcagagcaatcagatcaagtagcacgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgactcaaaacagaaggatgagagttaggaag 44106404  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||     
T  44106403 attaatattgtccatggaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttaccttg 44106307  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44106306 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatctggaaaaatc 44106207  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||| ||||  |||||||||||  |||| | ||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  44106206 cgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacaccattctagattataaaatccggaaa 44106144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 284 - 622
Target Start/End: Original strand, 27927820 - 27928156
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27927820 ggggaagtttcggagcaatctgatcaagtagtccgaaaacccaatttttaactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 27927919  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||     
T  27927920 attaatattgtctctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttg 27928016  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27928017 aaaaatggtgtttagggggtttcctgattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 27928116  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatca 622  Q
    ||| ||||  |||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  27928117 cgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatca 27928156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 300 - 633
Target Start/End: Original strand, 42280786 - 42281120
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcccta 399  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280786 aatccgatcaagtagtccaaaaatccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtcccta 42280885  T
Q  400 aaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gg 498  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||| ||    
T  42280886 aaatgactatgcatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtttagg 42280982  T
Q  499 gggttttcggattatgtaatcgggaaacatc---atgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccattt 595  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||    
T  42280983 gggtttccggattatgtaatctggaaacatcatgatgtaacgcgctctattttttgaagttttcggattacgaaatccggaaaaatccgttactcatttt 42281082  T
Q  596 ttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  42281083 ttcaccctttaacaaaaaaaaacatcattccggattat 42281120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 284 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 28917055 - 28916719
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttg-actaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || ||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  28917055 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtc-gaaaacccgatttttttaccaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttagaaa 28916957  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |            |||||    
T  28916956 gattaatattgtccctaaaatgactatccatgtaacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatctg-----------tacctt 28916868  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28916867 aagaaagggtgtttagggggtttccggtttatgtaatccagaaacatcatttaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaac 28916768  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggat 630  Q
    |||| || |  |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  28916767 ccgttacccattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggat 28916719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 372 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 37248750 - 37248466
Alignment:
Q  372 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactan 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  37248750 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactatccatgtaacaaacatgtttagaatttgtgctgatacaattcggattatataattcaaact-- 37248653  T
Q  472 nnnnnnaccttaaaaaagggtgtttgggggttttc-ggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaa 570  Q
          ||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37248652 -gttttaccttgaaaaatggtgtttagggggtttctggattatgtaatccggaaacatcatctaacgcgccctatttttttaagttttcggattacaaaa 37248554  T
Q  571 tccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37248553 tccagaaaaacccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattctggattttgaaatccggaaa-ctcaagggcattt 37248466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 286 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 9073782 - 9073426
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  9073782 ggaagtttcggagcaatccaatcaagtagtccaaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacataaggatgagacttaggaagat 9073683  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||       || || ||    
T  9073682 taatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctaatacagttcgggttatataatccgaacta---tttcactttgaa 9073586  T
Q  486 aaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  9073585 aaaaggtgtttagggggtttctggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgaatcttattttttgaagtttccggattaacaaatccgaaaaagtccg 9073486  T
Q  585 taactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    | ||||  ||||| |||||  |||| | |||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  9073485 ttactcattttttaaccctttaacaaaagaaaacatcatttcgaattatataatccggaa 9073426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 284 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34853608 - 34853309
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  34853608 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtaatccgaaaactcgatttctgcctaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 34853509  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||        |||||     
T  34853508 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatttttagaatttgtgctgatacagtttggattatataatccggact---gttttaccttg 34853412  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  34853411 aaaaagggtgtttagagggtttccagatt-tgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttaaagttttcggattacaaaatccggaaaaacc 34853313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 372 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 16310791 - 16310526
Alignment:
Q  372 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactan 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||      
T  16310791 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatatagttcggattatataatttgaact-- 16310694  T
Q  472 nnnnnnaccttaaaaaagggtgtttgggggttttc-ggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaa 570  Q
          ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16310693 -gttttaccttgaaaaagggtgtttagggagtttctggattgtgtaatccggaaaaatcatctaacgcaccctattttttgaagtttccggattacaaaa 16310595  T
Q  571 tccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatc 639  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16310594 tccggaaaaacctgtaactccatttttcaccccataacaaaggaaaacaccattctggattatgaaatc 16310526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 373 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40994983 - 40994805
Alignment:
Q  373 gagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactann 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  40994983 gagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact--- 40994887  T
Q  473 nnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaa 553  Q
         ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40994886 gttttaccttgataaagggtgtttagggggttttcagattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaa 40994805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Original strand, 36165716 - 36165902
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatcc-gatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  36165716 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccaaaaaacccggtttttaactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaagaa 36165815  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36165816 gattaatattgtctctaaaataactatccatgttacaaacatgtttacaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact 36165902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Original strand, 11698195 - 11698380
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||||    
T  11698195 ggggaagtttcggagcattccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacagataacaatgaccaaaaacggaaggatgagagttaggaag 11698294  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11698295 attaatattatccctaaaatgactatccatgttaaaaacatgcttagaatttctgctgatacagttcgaattatataatccgaact 11698380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Original strand, 14163948 - 14164121
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14163948 gagcaaaccgatcaagtaccccgaaaacgcagtttttgactaagaacaggtaacaatgaccaaaaacagaaggatgagagttaggaaaattaatattgtc 14164047  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14164048 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacatttcagattatataatccgaact 14164121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Original strand, 17119758 - 17119943
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  17119758 ggggaagtttcggagaaatccaatcaagtagtccgaaaacccggtttttgactaagaacaggtaacaatgatccaaaacagaaggatgagagttaggaag 17119857  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17119858 attaatattgtccgtaaaatgacaatccatgttacaaacatatttagaatttgtgctgatacaattcagattatataatccgaact 17119943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 285 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 40392815 - 40392631
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  40392815 gggaagtttcggagaaatccgatcaagtagcttgaaaacttgatttttgactaagaacaactaacaatgacccaaatcataaagataagagttaggaaga 40392716  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  40392715 ttaatattgtccataaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagtacagattatataatccgaact 40392631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 285 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 40328176 - 40328015
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  40328176 gggaagttttggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaataacccaaaacagaaagatgagagttaggaaga 40328077  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgataca 446  Q
    |||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  40328076 ttaatattatccataaaatgacaatccatgttacaaacatgtttagtatttatgctgataca 40328015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36980847 - 36980689
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36980847 ggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaatcggatttttgactaagaatagctaacaatgacccaaaatagaaggataagagttagaaagat 36980748  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgata 444  Q
     |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  36980747 caatattgtccttaaaatgattatccatgttacaaacatgttcataatttgtgctgata 36980689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 41530754 - 41530576
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaaca-tcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa 580  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41530754 aaaaaagggtttttagggggtgttcagattatgtaatctgaaaaaaatcatgtaacgcgccctattttttgagatttccggattacaaaattcggaaaaa 41530655  T
Q  581 tccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||    
T  41530654 tccgtaactcatttttccaccctttaacaaaggaaaacatcattccggattataaaatccagaaacttcaagggcattt 41530576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 1076822 - 1076659
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  1076822 agcaatccaatcaagtagcccgaaaatcagatttttgaccaagaacaactaacaatgatgcaaaacaaaatgatgagagctatgaagattaatattgtcc 1076723  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataa 461  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1076722 ataaaatggatattcatgttacaaacatgtttaaaatttgtgct-atacaattcggattatataa 1076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 483 - 644
Target Start/End: Original strand, 36404231 - 36404391
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36404231 aaaaaagggtgtttaggagttttcggattatataatccgaaaa-atcatgtaacacgccctattttttgagattttcggattacaaaatccggaataatc 36404329  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  36404330 cgtaactcattttttcaccctttaacaaagggaaactccattccggattataaaatccggaa 36404391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 467
Target Start/End: Original strand, 4259528 - 4259697
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4259528 gagcaagccgatctagtagcccgaaaaccagagttttgactaagaacaactaacaatgatcgaaaagaa--ggatgatagttaggaagattaatattgtc 4259625  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    | ||||||| ||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4259626 cataaaatgactatcaatgttacaaacatgcttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaa 4259697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36318072 - 36317887
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||    
T  36318072 aagttttggaactatccgatcaagtagcccgaaaatcgaatttctgactaagaacagctaacaatgacccaaaattgaaagataagagttagaaagatta 36317973  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaat----atgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    ||||| |  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36317972 atattgtccttaaaatgattatccatgttacaaattaacatgttcacaatttgtgctaatacagttcagattatataatccgaact 36317887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Original strand, 7971072 - 7971249
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttg-ggggttttcggattatgtaatcgggaaa-catcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa 580  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7971072 aaaaaagggtgtttatggggtgtttggattatgtaatccagaaaacatcacgtagcgcgtcctatttt-tgaagtttccagattacaaaatccggaaaaa 7971170  T
Q  581 tccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  7971171 tccgtaactccgtttttcaccctataacgaaggaaaacgccattctagattatgaaatctggaaacctcaagggcattt 7971249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 300 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28423684 - 28423523
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcccta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28423684 aatccgatcaagtagcccgaaaaactaatttttgactaagaacaactac-aatgacgcaaaatagaaggatgagagttaggaagattaatattgtctgta 28423586  T
Q  400 aaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    |||||   || ||||||||||| |||||||| ||||||  |||| || ||| |||||||||||    
T  28423585 aaatgttcatccatgttacaaacatgtttagaatttgtagtgatgcagttcagattatataat 28423523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 284 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6395364 - 6395186
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||| | ||| || ||||||||||||    
T  6395364 ggggatgtttcagaacaatccgatcaagtagcccgaaaatcagatttttgactacgaacagctaacaatgacctaaaacagaagaatgagagttaggaag 6395265  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
     |||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||| | |||  | ||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  6395264 tttaatattgtccataaaatgaatatccatgctacaaaaaagttcggaattggtgctgatacaattaagattatataat 6395186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 497 - 584
Target Start/End: Original strand, 35676628 - 35676715
Alignment:
Q  497 gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35676628 gggggtgttcggattatgtaatccggaaaaatcatatagcgcgccctattttttgtagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 35676715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 464
Target Start/End: Original strand, 8621528 - 8621697
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa--aaggataagagttaggaagattaatattg 393  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |   ||||||||||| ||||||||||||     
T  8621528 gagcaatccgatcaagtagctcaaaaattggatttttgactaagaacaactaacaatgacctaaaatgattatccataagagttagaaagattaatatta 8621627  T
Q  394 tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||| || |  || |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8621628 tccttaaaatgattatccatgttacgaacaaattca-aatttgtgctgatacagttcgggttatataatcc 8621697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 572
Target Start/End: Original strand, 11698385 - 11698451
Alignment:
Q  506 cggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatc 572  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11698385 cggattatgtaatccggaaacatcatgtaacacgtcttattttttgaagtttccggattacaaaatc 11698451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34645645 - 34645520
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||| ||    
T  34645645 gagcaatgtgatcaagtagcccgaaaaccggatgtttgactaagaacatgtaacaatgatccaaaacagaaggatgagagttagaaaaattaaaattatc 34645546  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaa 421  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||    
T  34645545 cttaaaatgactatctatgttacaaa 34645520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39093760 - 39093602
Alignment:
Q  312 tagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatac 411  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | || ||| ||| || | ||||||||||| |||  |||| ||| |||      
T  39093760 tagcccgaaaatcatattttttactaagaacaattaacaatgacctaaaacataaagatgagactttgaaagattaatatggtcattaaactggttatgt 39093661  T
Q  412 atgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaacta 470  Q
    |||||||||| ||| |||  |||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39093660 atgttacaaacatgcttataatttatgttgatacatttcagattatataatccgaacta 39093602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7982570 - 7982478
Alignment:
Q  372 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  7982570 agagttgggaagattaatattgtccttaaaatgactatttatgttacaaacatgttcaaaatttgtgccgatacagttcagattatataatcc 7982478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 441
Target Start/End: Original strand, 31234486 - 31234554
Alignment:
Q  373 gagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  31234486 gagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaatatgttcagaattggtgctg 31234554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33472270 - 33472166
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||  | || || ||||||| |||| |    
T  33472270 aaggatgagagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgttaagaattggtgcttgtgcagtttggattatgtaattc 33472171  T
Q  465 gaact 469  Q
    |||||    
T  33472170 gaact 33472166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33472477 - 33472373
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| |||| || || ||||||| |||||     
T  33472477 aaggatgatagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaattggtgatgatgcagtttggattatgtaatct 33472378  T
Q  465 gaact 469  Q
    |||||    
T  33472377 gaact 33472373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 441
Target Start/End: Original strand, 10833468 - 10833551
Alignment:
Q  358 aaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctg 441  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  10833468 aaaacaaaaggatgaaagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaattggtgctg 10833551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9845392 - 9845323
Alignment:
Q  358 aaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  9845392 aaaatataaggacgagagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgtt 9845323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7981781 - 7981618
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| | ||| ||||| ||| ||| |||||||| | |||||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  7981781 agcaatccgatcaagtagcctgaaaattgcatttttaattaataacaactaacaataacccaaaacagaaggatgagggttaggaaacttaacattgtcc 7981682  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatata 460  Q
     ||||||   ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| || |||| ||| |||| ||||    
T  7981681 ttaaaataaatatccatgttacaaacatgttcaaaatttgtgttggtacagttcagattctata 7981618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 465
Target Start/End: Original strand, 10840717 - 10840817
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||| |   | || ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  10840717 aaggatgagagttaggaagattaatattgtccttacactggttatccatgttacaaaaaaactcagaatttgtgctaatacaattcgaaatatataatcc 10840816  T
Q  465 g 465  Q
    |    
T  10840817 g 10840817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9845573 - 9845488
Alignment:
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  9845573 attaatattgcccttaaaatgagtatccatgttacaaacatgtttagaattggtgctgacgcagtttggattatgtaatccgaact 9845488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24627761 - 24627717
Alignment:
Q  377 taggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  24627761 taggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaa 24627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 615 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 31519427 - 31519383
Alignment:
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31519427 aaacatgattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 31519383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 40994794 - 40994735
Alignment:
Q  591 catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctcc 650  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  40994794 catttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaaagctcc 40994735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41530862 - 41530812
Alignment:
Q  377 taggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  41530862 taggaagattaatattgtccttgaaatgactatccatgttacaaacatgtt 41530812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 2358501 - 2358876
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2358501 ggggaagtttcagagcaattcgatcaagtagcccaaaaacccgatttttgactaagaatatgcaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 2358600  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  2358601 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttatgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttacctta 2358697  T
Q  484 aaaaagggtgtttgg-gggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcccta-ttttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2358698 aaaaagggtgtttggagggtttccggattatgtaagccggaaacatcatgtaacacgccctatttttttgaagtttccggattacaaaatccaggaaaat 2358797  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatcc-ggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2358798 ccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccgggaaacctcaagggcattt 2358876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 288 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 47302294 - 47301944
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  47302294 aagtttcagaacaatccgatcaagtagcccgaaaactcgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttag-aatatta 47302196  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt-aaaa 486  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||| ||||    
T  47302195 atattgtcc-taaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttaccttaaaaa 47302100  T
Q  487 aagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 585  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47302099 aagggtgtttaggaggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccttatttttttaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccat 47302000  T
Q  586 aactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47301999 aactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccgaattatgaaatccg 47301944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 50716533 - 50716173
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || ||| |||||||||||    
T  50716533 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaatgacccaaaaacggaatgatgagagttaggaa 50716434  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |        |||||    
T  50716433 gattaatattgtccctaaaatgactattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaatt---gttttacctt 50716337  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  50716336 gaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatctggaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagttttcggattacaaaatccgaaaaaac 50716237  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  50716236 ccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaataccattccggattatgaaattcggaaa 50716173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Original strand, 50796314 - 50796674
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || ||| |||||||||||    
T  50796314 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaatgacccaaaaacggaatgatgagagttaggaa 50796413  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |        |||||    
T  50796414 gattaatattgtccctaaaatgactattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaatt---gttttacctt 50796510  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  50796511 gaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatctggaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagttttcggattacaaaatccgaaaaaac 50796610  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  50796611 ccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaataccattccggattatgaaattcggaaa 50796674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Original strand, 3902697 - 3903043
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3902697 gagcaatccgatcaagtaatctgaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaagcagaaggatgagagttatgaagattaatattgtc 3902796  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    | |||||||   || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||    
T  3902797 cataaaatgatcatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 3902893  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  3902894 tagggggtttccggattatgtaatccaaaaacatcatgtaacgcgctctattttttgaagttttcggattacaaaatccggaaaaaccagtaactccact 3902993  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3902994 tttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaa 3903043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 52777511 - 52777148
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52777511 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacatgtagcaatgacccaaaacaaaaggataagagttaagaag 52777412  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt- 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||        |||||     
T  52777411 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcaaattatataatccgaact---gttttaccttg 52777315  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||          |||||    
T  52777314 aaaaaagggtgtttagggggtttccttattatgtaatccggaaacatcatgtaaagtgctcta-tttttgaagtttccggattac----------aaaat 52777226  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  52777225 ccgtaactccatttttcatcctataacaaaggaaaacaccattccagattatgaaatccgaaaacctcaagggcattt 52777148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 43472848 - 43473201
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43472848 ggggaagtttcagagtaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacagataacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 43472947  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||       ||||||    
T  43472948 attaatattgtccttaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataattcgaacta---ttttacctta 43473044  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||                   |||||||    
T  43473045 aaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaatgcaccatattttttgaagtt-------------------aaaaatc 43473125  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  43473126 cgtaactccatttttcaccc-aaaacaaaggaaaacaccattccggattatgaaattcggaaacctcaaggacattt 43473201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 284 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 28873286 - 28872928
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||| || ||||||| |||    
T  28873286 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacagtgacccaaaagcggaagaatgagagttaagaa 28873187  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||    
T  28873186 gattaatattgtccctaaaatgactatctatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttacctt 28873090  T
Q  483 aaaaaa--gggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 579  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  28873089 aaaaaaaagggtgtttagggggttgttggattatgtaatccggaaacataatgtaacgcgtcctattttttgaaattttcggattataaaatccagaaaa 28872990  T
Q  580 atccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    |  ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28872989 actcgtaacttcatttttcaccctataacaaagaaaaacatcattccagattatgaaatccg 28872928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 285 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 35142353 - 35141999
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  35142353 gggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccagtttttgactaagaacagataacaatgacccaaagcagaaggatgagagttaggaaga 35142254  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||        |||||||    
T  35142253 ttaatattgtctttaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacaattcatattatataatccgaact---gttttaccttaa 35142157  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35142156 aaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctaatttttgaagtttccggattacaaaacccggaaaaatcc 35142057  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    || |||   |||||||||||  |||| | || |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  35142056 gttact---tttttcaccctttaacaaaagataacaccattccggattatataatccggaa 35141999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Original strand, 47739812 - 47740158
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| | || |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||    
T  47739812 ggggaagttttggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccaatttttaactaaaaccaggtaataatgacc-aaaacagaaggatgagagttatgaag 47739910  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |       |||||     
T  47739911 attaatattgtcccttaaatgactatctatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatcaaaacaatttt---accttg 47740007  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47740008 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatctggaaaaatc 47740107  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
     ||  |||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  47740108 tgttgctcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattat 47740158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 296 - 641
Target Start/End: Original strand, 501032 - 501375
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  501032 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacatgatttttgaataaaaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagctaggaagattaatattgtc 501131  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||        ||||| ||||| ||||||    
T  501132 cataaaatgactatccattttacaaacatgtttagaatttgtgcttatacagttcggattatataat-cgaact---gttttaccttgaaaaaaggtgtt 501227  T
Q  496 t-gggggtttt-cggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  501228 tagggggttttccggattatgcaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttttggattacaaaatccggaaaaactcataactccat 501327  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  501328 ttttcgccctataacaaaggaaaacaccattcaggaatatgaaatccg 501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 380 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 3937563 - 3937295
Alignment:
Q  380 gaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnac 479  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||    
T  3937563 gaagattaatattgtccataaaatggttatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaactatttt---ac 3937467  T
Q  480 cttaaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 579  Q
    |||||||||||||||||        ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3937466 cttaaaaaagggtgttt--------tcgaattatgtaatccagaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaattcggaaaa 3937375  T
Q  580 atccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3937374 actcgtaactccatttttcatcctataacaaaggaaaacaccattctggattataaaatccggaaacctcaagggcattt 3937295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Original strand, 38977627 - 38977985
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  38977627 ggggaagttttggagcaatccgatcaagtagctcgaaaactcggtttttaactaaggacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 38977726  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||        |||||     
T  38977727 attaatattgtccataaaatgactatccatgttacaaacatgtttataatttgtgctgatacagttcggattatataatttgaact---gttttaccttg 38977823  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38977824 aaaaaaggtgtttagggggttttcggattatgtaatcccaaaacaccatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatctagaaaaatc 38977923  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| |||   |||||||||||  |||| |  |||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  38977924 cgttacttattttttcaccctttaacaaaataaaacaccattccagattatataatccggaa 38977985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 296 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 51258672 - 51258324
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattg-t 394  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  51258672 gagcaatccgatcaagttgtccgaaaactcgatttttgactaagaacatgtaacaatgactcaaaacaaaaggatgagagttatgaagattaatattgtt 51258573  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgt 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |         |||| ||||| |||||    
T  51258572 ccctaaaatgactatccatgttataaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcggattatataattcaaatt--gtttttcccttgaaaaatggtgt 51258475  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    || |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51258474 ttagggggtgttcggattatgtaatccgaaaaaattatgtaacgcgccctattttttgaaatttatggattacaaaatccggaaaaatccgtaact-cat 51258376  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  51258375 ttttcaccctttaacaaaggaaaacacaattccggattatgaaatccagaaa 51258324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 284 - 578
Target Start/End: Original strand, 34821222 - 34821514
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| | | ||||||||    
T  34821222 ggggaagtttcagagcgatccgatcaagtagcctgaaaacccgctttttaactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgaaatttaggaag 34821321  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||       |||||     
T  34821322 attaatattgtccataaaatgactatctatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaacta---ttttaccttg 34821418  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaa 578  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34821419 aaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcgctctattttttgaagtttccggattacaaaattcggaaa 34821514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 285 - 646
Target Start/End: Original strand, 3351946 - 3352306
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||    
T  3351946 gggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcctgaaaaccctattttttactaagaaccggtaacaatgacccaaaacagaagaatgagagttaggaaga 3352045  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||        ||||| |    
T  3352046 ttaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataattcgaact---gttttaccttga 3352142  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |    
T  3352143 taaagggtgtttagggggtttccgaattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcaccctatttttttaagtttcctgattacaaaatttggaaaaattc 3352242  T
Q  584 gtaactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaat 646  Q
    || ||||   |||||||||||  |||| |  |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  3352243 gttactcatttttttcaccctttaacaaaaaaaaacatcattttggattataaaatccgaaaat 3352306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 316 - 644
Target Start/End: Original strand, 51540525 - 51540853
Alignment:
Q  316 ccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgt 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  51540525 ccgaaaacccgatttttgactaagaacgtgtaacaatgacccaaaggagaaggatgagagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactatccaagt 51540624  T
Q  416 tacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatg 514  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||        ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  51540625 tacaaacatgtttagaatttgtgctgatactattcagattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaacggtgtttaaggggtttccggattatg 51540721  T
Q  515 taatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc--catttttcaccctacaacacag 612  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||  |||| |     
T  51540722 taattcggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattccaaaatccagaaaaatccgttactcattttttttcaccctttaacaaaa 51540821  T
Q  613 gaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  51540822 gaaaacaccatttcggattataaaatctggaa 51540853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Original strand, 49096105 - 49096464
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  49096105 ggggaagttttggagcaatccgatcaagtagcccgaaaactcgatttttgacgaagaacaggtaacaatgactcaaaacagaaggatgagagttaggaag 49096204  T
Q  384 attaatattg-tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||         ||||    
T  49096205 atttatattgttccctaaaatgactatctatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcagattatataattcaaact---gtttttcctt 49096301  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  49096302 gaaaaaggctgtttagggggtgtttggattatgtaattcgaaaaaatcatgtaacatgccatattttttgagatttccggattacaaaatccggaaaaat 49096401  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||  ||||||||||||  || | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  49096402 ccgtaact-tatttttcaccctttaataaagaaaaacatcattccagattatgaaattcggaaa 49096464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 296 - 632
Target Start/End: Original strand, 46622686 - 46623010
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  46622686 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaacaatgacccaaaacagaagaatgagagtaaggaagattaatattgtc 46622785  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| |           |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        || || ||||| ||||||    
T  46622786 cctaaaatgactatcc-----------atgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttactttgaaaaatggtgtt 46622871  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccgg-attacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  |    
T  46622872 tagggggtttccagattatgtaatccggaaacatcatgtaacgtgtcctattttttgaagtttccggttttataaaatccggaaaaatccgttactcatt 46622971  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggatta 632  Q
    |||||| | |  |||| | |||||||||||||| |||||    
T  46622972 ttttcatcatttaacaaaagaaaacatcattccagatta 46623010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 284 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 39150089 - 39149791
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||     
T  39150089 ggggaagtttcggagcaattcgaccaagtagcccgaaaacccggtttttaactaagaacatgtaacagtgacccaaaacagaaggatgagagttaggaaa 39149990  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   |||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||        |||||     
T  39149989 attaatattgtctctaaaatgactaccaatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatagagttcggattatataacccgaact---gttttaccttg 39149893  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39149892 aaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacactatgtaacgcgccctattttttg-agtttctggattacaaaatccggaaaaatc 39149794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 285 - 641
Target Start/End: Original strand, 30721690 - 30722044
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  |||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30721690 gggaagtttcggagcaatccgatcaagtagctcgaaaacccaatttttgactaataacgggtatcaatgacccaaaacagaaggataagagttaggaaga 30721789  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    ||||||||||||||||||||   | |   |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||        |||| |    
T  30721790 ttaatattgtccctaaaatg---aga---gttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatctgaactatttttc--ccttga 30721881  T
Q  485 aaaagggtgttt--gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaa---cgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 579  Q
    |||| |||||||  ||| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||     
T  30721882 aaaatggtgtttaggggagtgttcggattatgtaatccgaaaaaatcatgtaatattgcgccctattttttgaagttttcggattacaaaatctaaaaac 30721981  T
Q  580 atccgtaactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    |||| ||||||   |||||||| ||| |||| ||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  30721982 atccataactcatttttttcactctataacaaaggaaaacaccagttcagattatgaaatccg 30722044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 354 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 33438731 - 33438486
Alignment:
Q  354 acccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcgga 453  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  33438731 acccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactatccatattacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcaga 33438632  T
Q  454 ttatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtg-tttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttga 552  Q
    ||||||||||||||||        ||||| ||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33438631 ttatataatccgaact---gttttaccttgaaaaatggtgttttgagggtttccacattatgtaatccgg-aacatcatgtaacgcgccctattttttga 33438536  T
Q  553 agtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccc 602  Q
    |||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  33438535 agtttttggattacaaaattcagaaaaatccgttacttattttttcaccc 33438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 296 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47123294 - 47123136
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47123294 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaattcggtttttaactaagaacaggtaacaatggcccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 47123195  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggat 454  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47123194 cctaaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggat 47123136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 497 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 48304060 - 48303898
Alignment:
Q  497 gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  48304060 gggggttttcggattatgtaatctgaaaaaatcatgtaacacaccctattttttgagatttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactcattttt 48303961  T
Q  597 tcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  48303960 tcaccctttaacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatctggaaacctcaagggcattt 48303898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 296 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47130660 - 47130502
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47130660 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaattcggtttttaactaagaacaggtaacaatggcccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 47130561  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggat 454  Q
    |||||||||  | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47130560 cctaaaatgattgtccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggat 47130502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 3938462 - 3938357
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3938462 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtaacccgaaaaccagatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 3938363  T
Q  384 attaat 389  Q
    ||||||    
T  3938362 attaat 3938357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 461
Target Start/End: Original strand, 5127782 - 5127955
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||| |||| || ||||||||    
T  5127782 aagtttcaaagcaattcaatcaagtagtccgaaaaccagatttttgaccaagaacaactaacaatgacgcaaaacaaatggatgagagctatgaagatta 5127881  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataa 461  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  5127882 atattgtccataaaatggatatccatgttacaaacatgtttaaaatttatgctgatacaattcagattatataa 5127955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 521 - 633
Target Start/End: Original strand, 34821510 - 34821622
Alignment:
Q  521 ggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacat 620  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||     
T  34821510 ggaaacatcaggtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaattccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacac 34821609  T
Q  621 cattccggattat 633  Q
    |||||||||||||    
T  34821610 cattccggattat 34821622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 298 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 40062645 - 40062473
Alignment:
Q  298 gcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccc 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||      
T  40062645 gcaatctgatcaagtagcccgaaaaccagatttttgactaagaacaactaataatgacctaaaacaaaaggaccagagttaggaagattaatatggtctt 40062546  T
Q  398 taaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaacta 470  Q
    |||| | | ||| ||||||||||| |   | |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40062545 taaactagttatccatgttacaaacaaactcaaaatttgtgctgatatagttcggattatataatccgaacta 40062473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 427
Target Start/End: Original strand, 35345788 - 35345931
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||     
T  35345788 ggggaagtttcggagcaatccgatcaattaacccgaaaacccaatttttgactaagaacaactaacaatgacgaaaaacaaaaggatgagagttagaaat 35345887  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  35345888 attaatattgtccataaaatgactatccatgttacaaacatgtt 35345931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 51493080 - 51492894
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttg-actaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||| || ||||||  ||||||||||  ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  51493080 ggggaagtttcggagcaatctgatcaagtaggccaaaaacccaatttttttactaagaacagctaacaatgaccaaaaacataaggatgagagttaggaa 51492981  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51492980 gattaatattgtccataaaataactattcatattacaaacatgattagaatttgtgctagtacagttcggattataaaatccgaact 51492894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 296 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 46624988 - 46624863
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  46624988 gagcaattcgatcaagtagtccaaaaattagatttttgactaataacaactaataatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattttc 46624889  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaa 421  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  46624888 cataaaatgactatacatgttacaaa 46624863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 483 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 45244469 - 45244322
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  45244469 aaaaaagggtgtttgg---ttttcagattatgtaatccgaaaaaatcatgtaacgcgccctattttttgagattttcgaattacaaaatccggaaaaatc 45244373  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    | ||||||  ||||||| | |  |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  45244372 cataactcattttttcatcttttaacaaaggaaaacacaattccggattat 45244322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 537 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 47123135 - 47123039
Alignment:
Q  537 gcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  47123135 gcgccctattttttgaagtttccggattacaaaattcggaaaaacccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccagattat 47123039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 537 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 47130501 - 47130405
Alignment:
Q  537 gcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  47130501 gcgccctattttttgaagtttccggattacaaaattcggaaaaacccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccagattat 47130405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29048610 - 29048444
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttg-actaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||  ||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  29048610 agcaatccgatcaagtagcctgaaaaccagatttttatactaagaacagttaacaatgacctaaaacataaggataagagttatgaagattaatattatc 29048511  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatc 463  Q
    | ||||||  || | ||||||||||| || || || ||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  29048510 cttaaaataactgt-catgttacaaacatattcagaatttgtgttgatatagttccgattatataatc 29048444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42936685 - 42936590
Alignment:
Q  550 tgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42936685 tgaagtttctggattttataatctggaaaaatccgtaactccttttttcaccctttaacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa 42936590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 47979895 - 47980063
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa--aaggataagagttaggaagattaatattg 393  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  |   || |||||||| |||||||||||||    
T  47979895 gagcaatctgatcaagtagcccggaaattgattttttgattaataacaactaacaatgacctaaaatgactatccatgagagttagaaagattaatattg 47979994  T
Q  394 tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    ||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47979995 tccttaaaatgactatctatgttataaatatgttcaaaatttgtgctgatacagttcggattatataat 47980063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Original strand, 54229776 - 54229961
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||| | || | || |||  |||| ||||||    
T  54229776 ggggaagtttcagagcaatctgatcaagtagcaagaaaaccgaatttttgactaataacaactaacaatgacctagaacataatgatgcgagtaaggaag 54229875  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||| |   | || ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  54229876 attaatatggtccttaaactggatattcatgttacaaacagactcagaatttgtgttgatacagtttgaattatataatccgaact 54229961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Original strand, 14828809 - 14828983
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttt-tgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgt 394  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | | |||| || |||| ||||||||||||| |    
T  14828809 gagcaatccaatcaagtaatccgaaaatcagattttttgactaagaacaactaacaaggacccaaaacagatggatgagggttatgaagattaatattat 14828908  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    || ||||||   ||| ||||||| ||| || ||||| ||||| | | ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  14828909 ccttaaaattattatccatgttataaacatatttagaatttgcgttaatatatttcggattatataatccaaact 14828983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 47769530 - 47769359
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||   |||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||| || ||| | |||||  |||||||||||  |     
T  47769530 gagcaatccgatcaaataacccgaatatcattttttcgactgggaacaactaacaatgacctaaaatagaatgatgatagttaaaaagattaatatgatt 47769431  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  47769430 cttaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaatttgcgctgatacaattcagattctataatccgaa 47769359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 401
Target Start/End: Original strand, 4300159 - 4300276
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||   ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| || | |||||||| | ||||||||||    
T  4300159 ggggaagttttagagcaatctaatcaataagcccaaaaactggattttttactaagaacatctaacaatgacctaatacaaaaggatgatagttaggaag 4300258  T
Q  384 attaatattgtccctaaa 401  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4300259 attaatattgtccttaaa 4300276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33439449 - 33439384
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33439449 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaatctgatttttaactaagaaaaagtaacaatgacccaaaa 33439384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 469
Target Start/End: Original strand, 45712053 - 45712148
Alignment:
Q  374 agttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||| ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45712053 agttaggaagattaatatggtctttaaaatgattatccatgttacaaacatgatcataatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact 45712148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 462
Target Start/End: Original strand, 27143351 - 27143473
Alignment:
Q  340 aacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgc 439  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |  ||||||||  |||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27143351 aacaactaacaatgatccaaaatagaaggatgatggttaggaatcttaatattatccttaaaataactatccatgttacaaacatgttcagaatttgtgc 27143450  T
Q  440 tgatacacttcggattatataat 462  Q
    |||||||  || |||||||||||    
T  27143451 tgatacagatcagattatataat 27143473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 468
Target Start/End: Original strand, 26053491 - 26053584
Alignment:
Q  376 ttaggaagattaatattgt-ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaac 468  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  26053491 ttaggaagattagtattgttccctaaaatgactatccaagttataaacatgtttagaatttgtgttgatacagtttggattatataatcagaac 26053584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 29036013 - 29035893
Alignment:
Q  350 aatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgat-acact 448  Q
    ||||||| |||| | || ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||| |    
T  29036013 aatgacctaaaacataatgatgagagttaggaagagtaatatggtccttaaaatgattatccatgttacaaacatgcttagaatttgtgttgataacagt 29035914  T
Q  449 tcggattatataatccgaact 469  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29035913 tcagattatataattcgaact 29035893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 42936736 - 42936685
Alignment:
Q  530 atgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42936736 atgtagcgcaccctattttttgaagttttcggattacaaaatccggaaaaat 42936685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Original strand, 33701457 - 33701554
Alignment:
Q  550 tgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc--catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |  |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  33701457 tgaagtttccggattacgtaatccggaaaaattcgtaactcattttttttcaccttttaacaaaggaaaacaccattctggattacgaaatccggaaa 33701554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8735592 - 8735530
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  8735592 aaggatgaaagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatcaatgttacaaacatgtt 8735530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9087833 - 9087771
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  9087833 aaggatgaaagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatcaatgttacaaacatgtt 9087771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1076
Target Start/End: Original strand, 26713623 - 26713677
Alignment:
Q  1022 ttgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  26713623 ttgttggactctttccggtaatcatctccaacaccacaactccatagctataaac 26713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33700774 - 33700678
Alignment:
Q  550 tgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccattttt--caccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||  |||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33700774 tgaagtttatggattacgtaatccgaaaaaattcgtaac-ccatttttttcaccctttaacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccagaaa 33700678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 615 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 2358154 - 2358110
Alignment:
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2358154 aaacatgattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 2358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 615 - 659
Target Start/End: Original strand, 3938805 - 3938849
Alignment:
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3938805 aaacatgattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 3938849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1024 - 1076
Target Start/End: Original strand, 26675261 - 26675313
Alignment:
Q  1024 gttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26675261 gttggactctttccggtaatcatctccaacaccacaattccataactataaac 26675313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 429
Target Start/End: Original strand, 33842034 - 33842098
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgttta 429  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  33842034 aaggatgagagttacgaacattaatattgtccttaaaatgactatccatattacaaacatgttta 33842098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 29035880 - 29035809
Alignment:
Q  398 taaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29035880 taaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaatttgtattcatacaattcgaattatataatccgaact 29035809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45244577 - 45244514
Alignment:
Q  377 taggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgct 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  45244577 taggaagattaatattgtccttaaaatgactaaccatgttacaaacatgttcagaattggtgct 45244514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1076
Target Start/End: Original strand, 26736859 - 26736913
Alignment:
Q  1022 ttgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  26736859 ttgttggactctttcctgtaatcatctccaacaccacaactccatagctataaac 26736913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1076
Target Start/End: Original strand, 26743870 - 26743924
Alignment:
Q  1022 ttgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  26743870 ttgttggactctttccggtaatcatctccaacacaacgactccatagctataaac 26743924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1076
Target Start/End: Original strand, 26750795 - 26750849
Alignment:
Q  1022 ttgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  26750795 ttgttggactctttccggtaatcatctccaacacaacgactccatagctataaac 26750849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 46555554 - 46555445
Alignment:
Q  350 aatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacactt 449  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||  |||||| ||| ||  | |  ||||||||| ||||| ||    
T  46555554 aatgacctaaaacagaaggatgagagttatgaagattaatatggtccttaaaatggttatctatgttataaacatactcaaaatttgtgcttatacaatt 46555455  T
Q  450 cggattatat 459  Q
    | ||||||||    
T  46555454 cagattatat 46555445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 32442098 - 32441726
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32442098 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaactcgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaag 32441999  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||       ||||||    
T  32441998 attaatattgtctttaaaatggttatacatgttacaaatatgtttacgatatgtgctggtacagtttggattatataatccgaacta---ttttacctta 32441902  T
Q  484 aaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32441901 aaaaaatgtgtttaggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgcgctattttttgaagtttccggattacaaaatccagaaaaatcc 32441802  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  32441801 ttaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacctcaagggtattt 32441726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 285 - 659
Target Start/End: Original strand, 6228693 - 6229063
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6228693 gggaagttttagagcaatccgatcaaatagcccgaaaacccaatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaaga 6228792  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  6228793 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttactaatatctttaggatttgagttgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttaccttaa 6228889  T
Q  485 aaaa--gggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||  |||||||| ||||||| || |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6228890 aaaaaggggtgtttaggggtttccgaatt---taatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccgggttacaaaatccggaaaaatc 6228986  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  6228987 cgtagctccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatcctgaaacctcaaggacattt 6229063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 285 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 34973151 - 34972789
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34973151 gggaagtttcagagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacagataacaatgacctaaaacaaaaggataagagttaggaaga 34973052  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  34973051 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttatgctgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttaccttaa 34972955  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||          |||||||    
T  34972954 aaaatggtgtttagggggttttcggattatgtagtccgaaaacatcatgtaacgcgccctatttttttaagtttccagattac----------aaaatcc 34972865  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34972864 gtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 34972789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 285 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 49397299 - 49396937
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49397299 gggaagtttcagagcaatccgatcaagtagctcgaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgactcaaaacaaaaggataagagttaggaaga 49397200  T
Q  385 ttaatattgtccctaaa----atggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacc 480  Q
    |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||     
T  49397199 ttaatattgtccctaaaatggatggttatacatgttacaaatatgtttaggatttttgctgatacagttcggtttatataatccgaacta---ttttaca 49397103  T
Q  481 ttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 579  Q
    |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49397102 ttaaaaaatgatgtttaagggattttcggattatgtaatccaaaaacatcttgtaacgcatcctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 49397003  T
Q  580 atccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49397002 atccgtaactccatttttcaccctataataaaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 49396937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 285 - 659
Target Start/End: Original strand, 55052498 - 55052870
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaa-taaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |  |||||| | ||||||||||    
T  55052498 gggaagtttcggagcaatccaatcaagtagcccgaaaattcgatttttgactaagaacaggtaacaatgaccaaaaaatggaaggatgatagttaggaag 55052597  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||        |||||     
T  55052598 attaacattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgataaagttcggattatataattcgaact---gttttaccttg 55052694  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  55052695 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatataatccggaaacatcatctaacacgccctattttttgaagtttccggattacataatccggaaaaacc 55052794  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  55052795 cgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa-ctcaagggcattt 55052870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 288 - 645
Target Start/End: Original strand, 6003556 - 6003911
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6003556 aagtttcagagcaatccaatcaagtagcccgaaaacctgatttttgactaagaacaagtaacaatgacccaaaacaaaaggataagagttaggaagatta 6003655  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaa 487  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  6003656 atattatccctaaaatgactatacatattaaaaatatgtttatgatttgtgccgatacagttcggattatataatccgaacta---ttttaccttaaaaa 6003752  T
Q  488 agggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccct--attttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
      ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||   |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  6003753 --ggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcactcttattttttttaagtttccggattataaaattcgaaaaaatccg 6003850  T
Q  585 taactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  6003851 taactccatttttcaccctataacaaaggaaaccaccattccggattatgaaatccagaaa 6003911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Original strand, 25491274 - 25491621
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  25491274 ggggaaattttggagcaatccgatcaagtagtccaaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 25491373  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |        |||||     
T  25491374 attaatattgtccataaaatgactattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaatt---gttttaccttg 25491470  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  25491471 aaaaaaggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctattttttgaagtttccggattacaaaatccgaaaaaact 25491570  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  25491571 cgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattat 25491621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 19835796 - 19835450
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  19835796 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgacttttgactaaaaacaggtaacaatgacgcaaaacagaaagatgagagttaggaagattaatattgtt 19835697  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||    
T  19835696 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 19835600  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||    
T  19835599 tagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcaccctatttttcaaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgttactcattt 19835500  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19835499 tttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaa 19835450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 288 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 38536455 - 38536098
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaagatt 386  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  | ||  || |||||||||||||||    
T  38536455 aagttttggaacaatccgatcaagtagcctgaaaacttgatttttgactaagaacatgtaacaatgacctaaaaacagaataatgagagttaggaagatt 38536356  T
Q  387 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaa 486  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||        ||||| |||    
T  38536355 aatattgtccataaaatgactattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgcagatacaatttagattatataatccgaact---gttttaccttgaaa 38536259  T
Q  487 aagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 585  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38536258 aaaggtgtttagggggtttccggattatgtaatctggaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagtttccgaattacaaaatccggaaaaacccgt 38536159  T
Q  586 aactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaat 646  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38536158 aacttcatttttcaccctataacaaaggaaaacaccatttcggattatgaaatccggaaat 38536098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 297 - 624
Target Start/End: Original strand, 48318956 - 48319281
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48318956 agcaatccgatcaagtagtccgaaaatccgattttttactaagaatagataacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtcc 48319055  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt-aaaaaagggtgtt 495  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||||| |||||| ||||||    
T  48319056 ctaaaatgactatcaatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgagct---gttttaccttgaaaaaaaggtgtt 48319152  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48319153 tagggggttttcggattatgtaatccagaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattac-aaatccggaaaaatccgtcactcattt 48319251  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcatt 624  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  48319252 tttcaccctttaacaaaagaaaacatcatt 48319281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 40703952 - 40703604
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  40703952 ggggaagtttcttagcaatccgatcaagtagtccaaaaacccgatttttgactaagaaaagataacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 40703853  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||     
T  40703852 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttg 40703756  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40703755 aaaaagggtgtttagggggttttcaggttatgtaatccggaaacatcatgtaatgcaccctattttttgaaatttccggattacaaaatccggaaaaatc 40703656  T
Q  583 cgtaactccat-ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||| ||||  | ||||||||||  || | | |||||||||||||| ||||||    
T  40703655 cgttactcattcttttcaccctttaaaaaaagaaaacatcattccagattat 40703604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 287 - 644
Target Start/End: Original strand, 17933019 - 17933374
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatt 386  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17933019 gaagtttcggagcaatccgatcaagtggtctgaaaatctgattttttactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagatt 17933118  T
Q  387 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaa 486  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  17933119 aataatgtccctaaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatactgttcggattatataatccgaact---gttttaccttaaaa 17933215  T
Q  487 aagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgt 585  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17933216 aagggtgtttaaggggtttccagattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttctggattacaaaatctggaaaaatccgt 17933315  T
Q  586 aactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
     | ||  |||| ||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  17933316 tattcatttttgcaccctttaacaaaagaaaacatcattccagattatataatccggaa 17933374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 296 - 659
Target Start/End: Original strand, 2505922 - 2506285
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2505922 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgattattgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagaattaggaagattaatattgtc 2506021  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||        ||||| ||||||||||||    
T  2506022 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcggattatataatccaaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 2506118  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccc-tattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc-ca 592  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||  |||||||||||| ||||       
T  2506119 tagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgcccttattttttgatgtttctgaatcacaaaatttggaaaaatccgttactcatt 2506218  T
Q  593 tttttcaccctacaacacaggaaaacatca-ttccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2506219 tttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattttctgattataaaatccggaaa-ctcaagggcattt 2506285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Original strand, 25752322 - 25752685
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||| |||| ||||||    
T  25752322 ggggaagtttcggagcaatctgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatcacccaaaaacataaagatgagagctaggaa 25752421  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||        |||||    
T  25752422 gattgatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctaatacatttcggatcatataatccgaact---gttttacctt 25752518  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25752519 gaaaaagggtgtttatggggttttcggattatgtaatctggaaacatcatgtaatgcgccctattttttgaaatttccggattacaaaatccggaaaaat 25752618  T
Q  582 ccgtaactc-catttttcaccctacaac--acaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    || | ||||   ||||||||| |  |||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25752619 ccattactcatttttttcaccttttaacaaaaaaaaaaacatcattccggattataaaatccggaaa 25752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 790 - 1076
Target Start/End: Complemental strand, 39132749 - 39132463
Alignment:
Q  790 ctttgaagcttctcaaccacttgactcatagtaggcctaatatttttatctacctcttcacactccaaagcaactttcgccaaaatttccatcttacttg 889  Q
    |||| |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  39132749 ctttcaagcatctcaaccacctggctcatattaggcctaatatctctatcttcctctacacactccaaagcaactttagccaaaatttccatcttaatta 39132650  T
Q  890 aatcacaattagttccaatattaggatccaaaatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaagttatcaaccttccattgtatgc 989  Q
    ||||||||||| |  | ||   |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39132649 aatcacaattaatcactattgaaggatccataatttcttccacccaacatgcactcctttttttctctcttacccaagttaccaaccttccattatatgc 39132550  T
Q  990 aacttctccatcaactccttctatattcatcattgttggactctttccggttatcatctccaacaatacaaccccataactataaac 1076  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39132549 cacttctccatcaactccttcaatattcatcattgttgatctttttccagttatcatctccaacaaaacaatcccataactataaac 39132463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 284 - 560
Target Start/End: Original strand, 41412977 - 41413252
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  41412977 ggggaagtttcagaacaatctgatcaagtagcccgaaaaccagatttttgattaagaacatgtaacaatgacctaaaacaaaatgataagagttaggaag 41413076  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggat--tatataatccgaactannnnnnnacct 481  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||       ||||    
T  41413077 attaatattgttcctaaaatgactatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatatataatccgaacta---ttttacct 41413173  T
Q  482 taaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccg 560  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41413174 taaaaaagagtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgc-tcctattttttgaagtttccg 41413252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 408 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 23524071 - 23523821
Alignment:
Q  408 atacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaa-gggtgtttgggggttttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||       ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  23524071 atacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagtgtggattatataatccgaattatttt---accttaaaaaaagggtgtttagggggtttc 23523975  T
Q  507 -ggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctac 605  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  23523974 tggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctattttttgaagtttccggattacaaaatccgaaaaaatccgtaactccatttttcaccctct 23523875  T
Q  606 aacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  23523874 aacaaaggaaaacatcattccgaattatgaaatcctaaaatctcaagggcattt 23523821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 284 - 585
Target Start/End: Original strand, 46440151 - 46440452
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaa--gtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttagga 381  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||| | |||| | |||||| ||||||| ||    
T  46440151 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaatccgatttttgattaagaacacaggtaacaatgatctaaaagagaaggatgagagttatga 46440250  T
Q  382 agattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacct 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||        ||||    
T  46440251 agattagtattgtccctaaaatgaatatccatgttacaaccatgtttagaatttgtgctgatatagttcggattatataatccgaact---gttttacct 46440347  T
Q  482 taaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa 580  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46440348 tgaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctatttttttaagtttccggattataaaattcggaaaaa 46440447  T
Q  581 tccgt 585  Q
     ||||    
T  46440448 cccgt 46440452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 7931931 - 7931591
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7931931 agcaatccgaccaagtagtccgaaaactcgatttttgaccaaaaacatgtaacaatgacccaaaacaga-ggatgagagttaggaagattaatattgtcc 7931833  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt 496  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||        || ||  | ||||||||||    
T  7931832 ctaaaataactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctaatatagttcagattatataatccgaact---gttttacatt-gagaagggtgttt 7931737  T
Q  497 -gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccattt 595  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  7931736 agggggtttccggattatgtaatccggaaacataatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattgcaaaatccggaaaaacccgttactcatttt 7931637  T
Q  596 ttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||  |||| | |||||   |||||||||||||  |||||||||    
T  7931636 ttcaccctttaacaaaagaaaa---cattccggattatataatccggaa 7931591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 311 - 659
Target Start/End: Original strand, 3703155 - 3703502
Alignment:
Q  311 gtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctata 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||| | ||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  3703155 gtagcccgaaaatccgatttttgactaaaagtaggtaacattgacctaaaacagaaggatgagagttatgaagattaatattcttcctaaaatgactatc 3703254  T
Q  411 catgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcgga 509  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |  ||||         |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |    
T  3703255 tatgttacaaaaatgtttagaatttgtgctgatacagtttgaattatataaccataactgtttttc--ccttgaaaaatggtgtttagggggtgttcgaa 3703352  T
Q  510 ttatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaaca 609  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  3703353 ttatgtaatccgaaaaaatcatgtaacacgtcctattttttgaagttttcggattacaaaatccgaaaaaatccgtaactcattttttcaccctataaca 3703452  T
Q  610 caggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
     |||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  3703453 aaggaaaacactagttcggattatgaaatccggaaacttcaagggcattt 3703502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 284 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 8106682 - 8106387
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | |||||| |||||||| |||    
T  8106682 ggggaagtttcggagtaatctgatcaagtagcccaaaaacctgatttttgaataagaacaggtaacaatgactcaaaacagaaggatgagagttagaaag 8106583  T
Q  384 attaatattg-tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    ||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||        |||     
T  8106582 attaacattgttctctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcggattatataatctgaactatttttc--ccta 8106485  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaa 579  Q
     ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8106484 gaaaaatggtgtttagggggtgttcggattatgtaatacggaaaaatcatgtagcgcgccctattttttgaagttttcggattacaaaatccggaaaa 8106387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 286 - 465
Target Start/End: Original strand, 53893906 - 53894085
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  53893906 ggaagtttcagagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttagaaagat 53894005  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccg 465  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53894006 taatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccg 53894085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 296 - 545
Target Start/End: Original strand, 31582313 - 31582560
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||     
T  31582313 gagcaatccgatcaattagcccgaaaactagatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaaaattaacattgtt 31582412  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||    
T  31582413 cataaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacaattcagattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 31582509  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctat 545  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  31582510 tagggggtttccggattatgtaatcagaaaacatcatgtaatgcgccctat 31582560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 418 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 29822773 - 29822550
Alignment:
Q  418 caaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtttg-ggggttttcggattatgta 516  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        ||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  29822773 caaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaatt---gttttaccttgaaagagggtgtttatggggtttccggattatgta 29822677  T
Q  517 atcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaa 616  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  29822676 atccgaaaacatcatgtaacgcgctgtattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgtaactccatttttcaccctataacaaagg-aa 29822578  T
Q  617 acatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29822577 acaccattccatattatgaaatccggaa 29822550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 497 - 645
Target Start/End: Original strand, 25539038 - 25539186
Alignment:
Q  497 gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttt 596  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25539038 gggggtttccggattatgtaatccagaaacatcatgtaacatgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgtaactccatttt 25539137  T
Q  597 tcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25539138 tcaccatataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa 25539186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 284 - 399
Target Start/End: Original strand, 54631371 - 54631486
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  54631371 ggggaagttttggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 54631470  T
Q  384 attaatattgtcccta 399  Q
    ||||||||||||||||    
T  54631471 attaatattgtcccta 54631486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 284 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 52089473 - 52089315
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| || | |||||||||     
T  52089473 ggggaagttttgaagcaatccgatcaagtagtccaaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaccagaagaatgaaagttaggaaa 52089374  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctga 442  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  52089373 attaatattgtcccaaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaagatttgtgctga 52089315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 432 - 633
Target Start/End: Original strand, 54631489 - 54631689
Alignment:
Q  432 atttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt-aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatc 529  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||        ||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54631489 atttgtgctgatacagttcagattgtataatccgaact---gttttaccttgaaaaaaatgtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatc 54631585  T
Q  530 atgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccgga 629  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||||    
T  54631586 atgtaacgcgccatactttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgttactcatttttccaccctttaacaaaagaaaacgtcattccgga 54631685  T
Q  630 ttat 633  Q
    ||||    
T  54631686 ttat 54631689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 460
Target Start/End: Original strand, 27742004 - 27742169
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattg-t 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27742004 gagcaatccgattaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaaaatgtaccaatgactcaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtt 27742103  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatata 460  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27742104 ccctaaaataactatttatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacaattcaaattatata 27742169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 445
Target Start/End: Original strand, 41322983 - 41323132
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41322983 gagcaatccgatcaagtatgccgaaaactcaatttttaactaagaacaattaacaatgaccaaaaacaaaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 41323082  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatac 445  Q
    | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  41323083 cataaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgttgatac 41323132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7863717 - 7863544
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||  ||  ||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7863717 gagcaatctgattaagtagcccgaaaaccgaattttttattaagaacagttaccaatgacctaaaacagaaggataaaagttaggaatattaatattgtc 7863618  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    | |||||||  | | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7863617 cttaaaatgattgtccatgttacaaacatgtttagaatttgtgcagatacagttcagattatataatccgaact 7863544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 445
Target Start/End: Original strand, 25538873 - 25539019
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaagattaatattgtccct 398  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25538873 aatccaatcaagtagcctgaaaaccaaatttttgactaagaagaggtaacaatgacccaaaaacggaaggatgagagttaagaaaattaatattgtccct 25538972  T
Q  399 aaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatac 445  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25538973 aaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatac 25539019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 524 - 633
Target Start/End: Original strand, 53894108 - 53894217
Alignment:
Q  524 aacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcat 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  53894108 aacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttcctgattgcaaaatccggaaaaacccgttagtcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcat 53894207  T
Q  624 tccggattat 633  Q
    ||||||||||    
T  53894208 tccggattat 53894217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 497 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 38416642 - 38416520
Alignment:
Q  497 gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttt 596  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||    
T  38416642 gggggtgttcggattatgtaatccgaaaaaatcatgtaacgtgccctatttttttatgtttccggattacaaaatttgaaaaaatccgcaactcattttt 38416543  T
Q  597 tcaccctacaacacaggaaaaca 619  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  38416542 tcaccctataacaaaggaaaaca 38416520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 527 - 659
Target Start/End: Original strand, 50392529 - 50392662
Alignment:
Q  527 atcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattc 625  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||  |||| ||||||||| | |||    
T  50392529 atcatgtaacgcgccccattttttgagatttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactcatttttttcactctttaacaaaggaaaacaccgttc 50392628  T
Q  626 cggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| | |||||||    
T  50392629 cggattactaaatccggaaacctcaaaggcattt 50392662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 14474103 - 14474268
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||     
T  14474103 gagcaatccgatcaagtagcttgaaaacaggatttttgatcaagaacaggtaacaatgacctaaaatagaaggatgagggttaggaagattaatattgt- 14474201  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
     || ||| | |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  14474202 tcttaaacgactatccatgttacaaacatgttcaaaatttgtgttgatacaattcagattatataat 14474268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29822864 - 29822775
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagtt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||    
T  29822864 aagtttttgagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccaatttttgattaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagtt 29822775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27879792 - 27879651
Alignment:
Q  328 tttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||  |||||    
T  27879792 tttttgactaggaacaactaacaatgatctaaaacaaaattatgagagttaggaatattaatatggtccttaaaatgaccattcatgttacaagcatgtt 27879693  T
Q  428 taggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
     || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  27879692 cagaatttgtgctgatacagttcagattatataatctgaact 27879651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47456888 - 47456751
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||    
T  47456888 ggggaagtttcggagcaatctgatcaagtagcccgaaaaccgaatttttgactaagaatatctaacaatgacctaaaacataaggatgagatttaggaag 47456789  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaa 421  Q
    |||||||| |||| |||| | | ||| |||||||||||    
T  47456788 attaatatggtccttaaactagttatccatgttacaaa 47456751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 37222206 - 37222064
Alignment:
Q  327 atttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga-ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatg 425  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  37222206 attttttactaagaacaactaacaatgacccaaaacagaatgatgaga-ttaagaagaattaatatggtccttaaagtggttatccatgttacaaacatg 37222108  T
Q  426 tttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  37222107 tttagaatttatgctgatacaattcaaattatataatccgaact 37222064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38417080 - 38417020
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38417080 ggggaagttttagagcactccgatcaagtagctcgaaaacccgatttttgactaagaacaa 38417020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 363
Target Start/End: Original strand, 49001451 - 49001518
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaata 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  49001451 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatcagatttttgactatgaacagttaacaatgacccaaaata 49001518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 581 - 659
Target Start/End: Original strand, 41413249 - 41413327
Alignment:
Q  581 tccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  41413249 tccgtaactccatttttcaccctataacaaagaaaaacactattccggattatgaaatccgaaaatctcaaggacattt 41413327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 468
Target Start/End: Original strand, 42497809 - 42497939
Alignment:
Q  338 agaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgt 437  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||| | | | |  ||||||    
T  42497809 agaacaactaacaatgacctaaaacaaaatgatgagagttagaaagattaatatggtccttaaactagctatataagttacaaacaagctcataatttgt 42497908  T
Q  438 gctgatacacttcggattatataatccgaac 468  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42497909 gctgatacaattcagattatataatccgaac 42497939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 467
Target Start/End: Original strand, 49002822 - 49002916
Alignment:
Q  373 gagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||    
T  49002822 gagttaggaagattaatattttccataaaatgactatttatgttacaaacatatttagaatttgtgctgatatagtttggaatatataattcgaa 49002916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 469
Target Start/End: Original strand, 25140466 - 25140570
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||| |  |||| ||||  ||||||    
T  25140466 aaggatgagagttaggaagattaatattgttcttaaaatgattatacatgttacaaacatgttcagaattggtgttgatgctattcgaattacgtaatcc 25140565  T
Q  465 gaact 469  Q
    |||||    
T  25140566 gaact 25140570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 469
Target Start/End: Original strand, 25140687 - 25140779
Alignment:
Q  377 taggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |  |||||||||  |||||||||||    
T  25140687 taggaagattaatattgtcctcaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaattggtgctgatgctgttcggattacgtaatccgaact 25140779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 47784188 - 47784101
Alignment:
Q  372 agagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaata-tgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatat 459  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47784188 agagttagga-gattaatattgtccttaaaatgactatccatattacaaacaatgtttagaatttgtgctgatatagttcggattatat 47784101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 47874037 - 47873953
Alignment:
Q  345 gtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgttta 429  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  47874037 gtaacaatgatccaaaacagaaggatgagaattaagaagattaatattgtccctaaaatgactatccatgttataaacatgttta 47873953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 55838875 - 55838978
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  55838875 aagttttagagcaatctggttaagtagcccgaaaaccaaattttcgactgggaacaactaacaatgacctaaaacataaggattagagttagggagatta 55838974  T
Q  388 atat 391  Q
    ||||    
T  55838975 atat 55838978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 427
Target Start/End: Original strand, 25140894 - 25140944
Alignment:
Q  377 taggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  25140894 taggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgtt 25140944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 343
Target Start/End: Original strand, 4936614 - 4936666
Alignment:
Q  291 ttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaaca 343  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4936614 ttttggagcaatccgatcaaatagcccaaaaatcagatttttaactaagaaca 4936666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 391
Target Start/End: Original strand, 55774704 - 55774800
Alignment:
Q  295 agagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatat 391  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55774704 agagcaatctggttaagtagcccgaaaaccaaattttcgactgggaacaactaataatgacctaaaacataaggattagagttagggagattaatat 55774800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1788238 - 1788175
Alignment:
Q  328 tttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatat 391  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  1788238 ttttttactaagaacaagtaacaatgacctaaaacagaagaatgagagttatgaagattaatat 1788175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38417004 - 38416937
Alignment:
Q  396 cctaaaatggctataca-tgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38417004 cctaaaatgactatccaatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcagattatataat 38416937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39118367 - 39118308
Alignment:
Q  350 aatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctat 409  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  39118367 aatgacctaaattagaaggataagagttagtaagattaatatggtccttaaactggctat 39118308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 645
Target Start/End: Original strand, 42660430 - 42660496
Alignment:
Q  579 aatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  42660430 aatccgtaactcattttttcaccctttaacaaaggaaaacactattctggattataaaatccggaaa 42660496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20078832 - 20078719
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||  | ||| ||||||| |||| | ||||||  ||| |||||| ||||    
T  20078832 aagtttcagagcaatttgatcaagtagcccaaaaaccagattttaaactaagaaagactaacaatgacctaaaacagaaggatgcgagctaggaatatta 20078733  T
Q  388 atattgtccctaaa 401  Q
    |||| |||| ||||    
T  20078732 atatggtccttaaa 20078719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 417
Target Start/End: Original strand, 46381079 - 46381180
Alignment:
Q  316 ccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgt 415  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||   ||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||    
T  46381079 ccgaaaaccagatttttgactaagaataactaacaatgatctaaaactgaagaatgagagttatgaagattaatatggtccttaaactggttatccatgt 46381178  T
Q  416 ta 417  Q
    ||    
T  46381179 ta 46381180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 718 - 966
Target Start/End: Original strand, 4329251 - 4329499
Alignment:
Q  718 tatttgcaaacgaaggaatctaatttaacatcatgcatcactcattaagagacctaggaatctatttcatttctttgaagcttctcaaccacttgactca 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4329251 tatttgcaaacgaaggaatctaatttaacatcatgtatcactcattaagagacctaggaatctatttcatttctttgaagcttctcaaccacctgactca 4329350  T
Q  818 tagtaggcctaatatttttatctacctcttcacactccaaagcaactttcgccaaaatttccatcttacttgaatcacaattagttccaatattaggatc 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4329351 tagtaggcctaatatttttatctacctctacacacttcaaagcaactttggccaaaatttccatcttacttgaatcacaattagttccaatattaggatc 4329450  T
Q  918 caaaatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaa 966  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4329451 cataatttcttccacccaacatctactcctctttttctctcttacccaa 4329499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 316 - 645
Target Start/End: Original strand, 36948851 - 36949178
Alignment:
Q  316 ccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgt 415  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36948851 ccgaaaacccaatttttgactaagaacaggtaacaattacccaaaacaaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatagctatacatgt 36948950  T
Q  416 tacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatg 514  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||       ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  36948951 tataaatatgtttaggatttgtgctgatacagtttggattatataatccaaactatttt---accttaacaaatggtgtttagggggtttccggattatg 36949047  T
Q  515 taatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacagga 614  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36949048 taatccgaaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttgcagattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctataacaaagga 36949147  T
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36949148 aaacaccattccggattatgaaatctggaaa 36949178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Original strand, 32187743 - 32188102
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  32187743 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgatttttgaccaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 32187842  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||     
T  32187843 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatatttaaaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttg 32187939  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  32187940 aaaaatggtgtttcgggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaactcgccctattttttgaagtttccagattacaaaatccagaaaaacc 32188039  T
Q  583 cgtaactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| ||||   |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32188040 cgttactcatttttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattatacaatccggaa 32188102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 285 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39447441 - 39447101
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39447441 gggaagtttcagagcaatccgatcaagcagtcggaagacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaatagaaggatgagagttaggaaga 39447342  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||       ||||| |    
T  39447341 ttaatattgtctttaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagtttgaattatataatccgaacta---ttttaccttga 39447245  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39447244 aaaagggtgtttatggggtttccagattatgtaatccgaaaacatcatgtaatgcgccctattttttgaagttttcggattacaaaatccggaaaaatcc 39447145  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccg 627  Q
    || ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  39447144 gttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccg 39447101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Original strand, 33452329 - 33452675
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33452329 gagcaatccgatcaagtagtccagaaacccgatttttgactaagaacagataacaaagacccaaaacaaaagaatgagagttaggaagattaatattgtc 33452428  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||    
T  33452429 cctaaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctaatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 33452525  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  33452526 tagggagtttccggattatgtgatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccgaattacaaaatccagaaaaatccgttactcattt 33452625  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    || ||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  33452626 ttccaccctttaacaaaagaaaacatcatttcggattatataatccggaa 33452675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 284 - 641
Target Start/End: Original strand, 15994987 - 15995343
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| |||||||| |||    
T  15994987 ggggaagtttcggagcaatccgatcaaatagtctgaaaatccaattttttactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaatgatgagagttagaaag 15995086  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||        | |||     
T  15995087 attaatattgtccataaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttttgctgatacagttcgaattatataatccgaact---gttttagcttg 15995183  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcccta-ttttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15995184 aaaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgcaacgcgccctatttttttgaagtttcccgattacaaaatccggaaaaac 15995283  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    |||| |||   |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15995284 ccgttactaattttttcaccctttaacaaaagaaaacaccattccggattataaaatccg 15995343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 316 - 633
Target Start/End: Original strand, 44465633 - 44465949
Alignment:
Q  316 ccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgt 415  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  44465633 ccgaaaacctgatttttgactaagaagaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactaaccatgt 44465732  T
Q  416 tacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatg 514  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44465733 tacaaacatgtttagaatttgtgctgatacatttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtttagggggtttccggagtatg 44465829  T
Q  515 taatcgggaaac-atcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacagg 613  Q
    |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| | |    
T  44465830 taatccataaactatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgttactcattttttcaccctttaacaaaag 44465929  T
Q  614 aaaacatcattccggattat 633  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  44465930 aaaacatcattctggattat 44465949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 285 - 590
Target Start/End: Original strand, 41510304 - 41510606
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  41510304 gggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccagtttttaactaagaacaagtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaaga 41510403  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||        ||||| |    
T  41510404 ttaatattgtccctaaaatgactat-catgttacaaacatgtttagaaattgtgctgatacagttcagattatataatccggact---gttttaccttga 41510499  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41510500 aaaggggtgtttagggggtttccagattatgtaatccagaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacgaaatctggaaaaatcc 41510599  T
Q  584 gtaactc 590  Q
    || ||||    
T  41510600 gttactc 41510606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 644
Target Start/End: Original strand, 45153708 - 45154023
Alignment:
Q  327 atttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgt 426  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  45153708 attttggactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaagaagattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgt 45153807  T
Q  427 ttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaa 525  Q
    |||  | ||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||        ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45153808 ttataacttgtgctgatacagttcaaattatataatctaaact---gttttaccttgaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaa 45153904  T
Q  526 catcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattc 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  45153905 catcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccagattacaaaattcagaaaaacccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattc 45154004  T
Q  626 cggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  45154005 cggattatataatccggaa 45154023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 284 - 574
Target Start/End: Original strand, 41854778 - 41855061
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  41854778 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccaaaaatccggtttttaactaagaacagataacaatgactcaaaacagaaggatgagagttaggaag 41854877  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||     ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||        |||||     
T  41854878 attaatattgtccctgaaatgactat-----ttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcaaattatataatccgaact---gttttaccttg 41854969  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 574  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41854970 aaaaagggtgtttagggggtttccggatcatgtaatccggaaacatcatgtaacacaccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 41855061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 645
Target Start/End: Original strand, 25217660 - 25218023
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaagattaatattgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25217660 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgattttttactaagaacaggtaacaatgacccaaaaacagaaggaagagagttaggaagattaaaattgt 25217759  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcgg----------------attatataatccgaactannnnnnna 478  Q
    ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |                |||||||||||||||||        |    
T  25217760 ccccaaaatgactatccatgctacaaacatgtttagaatttgtgctaatacagttccggattatattatctacaattatataatccgaact---gtttta 25217856  T
Q  479 ccttaaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaa 578  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25217857 ccttgaaaaggggtgtttaggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcaccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgaaaa 25217956  T
Q  579 aatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  25217957 aatccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattgcggattataaaatccagaaa 25218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 284 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 42894657 - 42894369
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  42894657 ggggaagtttcggagtaatccgatcaagtagtccgaaaactcgatttttgcctaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggaagagagttaggaag 42894558  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||        |||||     
T  42894557 attaatattgtccctaaaatgattatccatgttagaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggaatatataatccggact---gttttaccttg 42894461  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 574  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  42894460 aaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctatttttttaagtttccggattatataatccg 42894369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 318 - 644
Target Start/End: Original strand, 17474707 - 17475033
Alignment:
Q  318 gaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgtta 417  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| | || || | ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  17474707 gaaaacccgatttttgacgaagaacaggtaacaatgccgcataacagaattatgagagttaggaagattaatattgtctctaaaatgactatccatgtta 17474806  T
Q  418 caaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgta 516  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||        ||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  17474807 caaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcggattatataatccaaact---gttttaccttgaaaaattgtgtttagggggtttccggattatgta 17474903  T
Q  517 atcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaa 616  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |  |||| | ||||    
T  17474904 atccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttaaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgttactcattttttcaccttttaacaaaagaaa 17475003  T
Q  617 acatcatt--ccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||| |||  |||||||||  |||||||||    
T  17475004 acattattccccggattatataatccggaa 17475033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 5507699 - 5507323
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||| || ||||||  ||||    
T  5507699 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagttgcccgaaaacctgatttttgactaagaacaggtagcaatgacccaaaacagaagaatgagagttgtgaag 5507600  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    |||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||    
T  5507599 attaatattgtttataaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaactatttttt--cctta 5507502  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgg--gaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa 580  Q
    | ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |   ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  5507501 agaaaaggtgtttagggggtgttcggattatataatccgaaaaaaaatcatgtaacgcgtcttattttttgaagtttttggattacaaaattcgaaaaaa 5507402  T
Q  581 tccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    || |||||||  ||||||||| || |||| |||||||||  | | |||||||||||| ||| |||  || |||||||||    
T  5507401 tctgtaactcattttttcaccatataacaaaggaaaacactagttcggattatgaaacccgaaaacttcaagggcattt 5507323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 284 - 584
Target Start/End: Original strand, 41203060 - 41203358
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  41203060 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagttgcccgaaaatccaatttttaactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgaaagttaggaag 41203159  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||          |||     
T  41203160 attaatattgtccataaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcggtttatataatctgaactgtttttct--cttt 41203257  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgcccta-ttttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41203258 aaaaagggtgtttacggggtgttcggattatgtaatccagaaaaattatgta--gcaccctatttttttgtagtttccggattacaaaatccggaaaaat 41203355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 296 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 36875253 - 36874977
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  36875253 gagcaattcgattaagtagtctgaaaacccgatttttgcctaagaacgggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattatc 36875154  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||        ||||| ||||| ||||||    
T  36875153 cctaaaatgactatccatgttacaaacttgtttagaatttatgctaatacagtttggattatataatccggact---gttttaccttgaaaaatggtgtt 36875057  T
Q  496 -tgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 574  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36875056 cagagggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 36874977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 296 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 34517369 - 34517026
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||     
T  34517369 gagcaatccgatcaagtattccgaaaacccaatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacaaaaggatgaaagttatgatgattaatattgtt 34517270  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    | ||||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||         |||| ||||| ||||||    
T  34517269 cataaaatgactatccatgttaccgacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccaaact--gtttttcccttgaaaaatggtgtt 34517172  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    |  ||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  34517171 taaggggtatttggattatgtaatc-cgaaaaatcatgtaacgcgccctattttttgagatttttcgattacaaaatccgaaaaaattcgtaactcattt 34517073  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  34517072 tttcaccgtataacaaaggaaaacaccagttcggaatatgaaatccg 34517026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 287 - 463
Target Start/End: Original strand, 19109892 - 19110068
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatt 386  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19109892 gaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccaaaaactggatttttgactaagaacagctaacaatgacccaaaataaaaggatgagagttaggaagatt 19109991  T
Q  387 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatc 463  Q
    |||||| ||| ||||||| | || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  19109992 aatattatccttaaaatgacgatccatgttacaaagatatttaaaatttgtgctgatatagtttggattatataatc 19110068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 299 - 468
Target Start/End: Original strand, 16750318 - 16750485
Alignment:
Q  299 caatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccct 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16750318 caatccgatcaagtagtccgaaaatccgattttttactaagaacagataacaatgacccaaaacagaaggatgagagtta-gaagattaatattgttcct 16750416  T
Q  399 aaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaac 468  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||  |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16750417 aaaatgactatccatattacaaacat-attagaatttatgctgatacagttcgaattatataatccgaac 16750485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 306 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8388909 - 8388746
Alignment:
Q  306 atcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatgg 405  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8388909 atcaagtagctcgaaaacccgattttagactaagaacagccaacaatgacccaaaactgaaggatgagagttaggaagattaatattgtccataagatgg 8388810  T
Q  406 ctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8388809 caatccatgttacaaacatctttagaatttgtgctgatacatttcggactatataatctgaact 8388746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35251198 - 35251032
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  35251198 gagcaatctgatcaagtagcccgaaaaccggattttcgactaagaacaactaacaatgacctaaaatagaaggataggagttaagaagattaatatggtc 35251099  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    | |||| ||||||| ||| ||||||| |   | || ||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  35251098 cttaaactggctatccatattacaaacaaactcagaatttgtgctaatacagtttggattatataat 35251032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 478 - 580
Target Start/End: Original strand, 4268303 - 4268406
Alignment:
Q  478 accttaaaaaagggtgtttg-ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgga 576  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  4268303 accttgaaaaagggtgtttatggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttttggattacaaaatccgaa 4268402  T
Q  577 aaaa 580  Q
    ||||    
T  4268403 aaaa 4268406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 286 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30763927 - 30763804
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| | || ||| ||||||||||||||    
T  30763927 ggaagtttcggagcaatccgatcaagttgcccaaaaatcagatttttgactaagaacagctaacaatgaccaaaaacagaaagatgagagttaggaagat 30763828  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctat 409  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||    
T  30763827 taatattgtccataaaatgactat 30763804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 284 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 42479023 - 42478846
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| |||||   ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  42479023 ggggaagtttcagagcaatctgatcaagtagcccgaaaactgaatttttgactgagaacggctaacaatgacctaaaacataaggatgagagttaggaag 42478924  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataa 461  Q
    |||||||| |||| |||| ||| |||  || |||||||||   | |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42478923 attaatatggtccttaaactggttatctatattacaaataaactcaaaatttgtgctgatacatttcagattatataa 42478846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 417
Target Start/End: Original strand, 38308706 - 38308840
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagt--tagga 381  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||| | |||  || ||    
T  38308706 ggggaagtttcagagcaatctgatcaagtagcccgaaatcccgatttttgactaagaacaggtaacaa-gacccaaaacagaaggatgatagttataaga 38308804  T
Q  382 agattaatattgtccctaaaatggctatacatgtta 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||    
T  38308805 agattaatattgtccataaaatgacaatccatgtta 38308840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 483 - 645
Target Start/End: Original strand, 9847495 - 9847658
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttggg-ggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9847495 aaaaaaaggtgtttggatggtgttcggattatgtaatacgaaaaaatcatgtaacgcgcccaattttttgagattttcggattacaaaatctggaaaaat 9847594  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    | |||||||  |||||||| ||  |||| || ||||   |||||| |||||| |||||||||||    
T  9847595 cagtaactcattttttcactctttaacaaagaaaaatgccattccagattataaaatccggaaa 9847658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25715427 - 25715270
Alignment:
Q  504 ttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaa--tccgtaactccatttttcacc 601  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||| |||| |||||  |  |||||||  |||||||||    
T  25715427 ttcggattatgtaatccgaaaaaatcaggtaacgcgccctatcttttgagatttttggattacaaagtccgaaaaaaaatttgtaactcattttttcacc 25715328  T
Q  602 ctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  25715327 ctttaacaaaggaaaacaccattccggattataaaatccggaaacttcaagggcattt 25715270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 45293916 - 45293743
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| | || ||| ||||||||||||||||    
T  45293916 aagtttcagagcaatatgatcaagtagcccgaaaaccggatttttgactaagaacaactagcaatgacctaaaacagaaagatgagagttaggaagatta 45293817  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    ||||   || ||||  || ||| ||||||| || || | | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  45293816 atatgacccttaaaccggttatccatgttataatta-gatcagaatttgtgctgatacagttcagattatataat 45293743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 497 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 33366996 - 33366920
Alignment:
Q  497 gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 574  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33366996 gggggttttcggattatgtaatccggaaatatcatgtaacgcgtctta-tttttgaagttttcggattacaaaatccg 33366920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26228330 - 26228160
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcccta 399  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  26228330 aatctgatcaagtagctcgaaaactagatttttgactaagaacaactaacaattacctaaaacaaaaggatgagagttagcaagattaatatggtcatta 26228231  T
Q  400 aaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaacta 470  Q
    || | | ||| ||||| ||||| |  || |  || | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26228230 aactagttatccatgtcacaaacagattcataatgtatgctgatacagttcgaattatataacccgaacta 26228160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 421
Target Start/End: Original strand, 37773700 - 37773827
Alignment:
Q  295 agagcaatccgatcaagtagcccgaaaatcc--gatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatatt 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||||| | |||| | |||||| |||||||| |||||||| ||     
T  37773700 agagcaatctgatcaagtagccc-aaaatactggacttttgactaagaacaactaacaatgaactaaaacagaaggatgagagttagaaagattaacata 37773798  T
Q  393 gtccctaaaatggctatacatgttacaaa 421  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  37773799 gtccttaaactggctatccatgttacaaa 37773827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 573
Target Start/End: Original strand, 38066643 - 38066834
Alignment:
Q  380 gaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnac 479  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| | ||||  ||||| |||||||||  |||||         |    
T  38066643 gaagattaatattgtccttaaaatgactatccattttacaaacatatttagaatttgtgttaatactgttcggtttatataatatgaact--gtttttcc 38066740  T
Q  480 cttaaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatcc 573  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| || || |||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38066741 cttgaaaaggggtgtttatgggtgtttgggttatgtaatccgaaaaaatcatataacacaccctattttttgaagttttcggattataaaatcc 38066834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Original strand, 17766784 - 17766846
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  17766784 aaggatgagagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatcaatgttacaaacatgtt 17766846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 572
Target Start/End: Original strand, 38308880 - 38308954
Alignment:
Q  498 ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatc 572  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38308880 ggggtgttcggattatataatccggaaaaatcaaatagcgcgccctattttttgaagttttcggattacataatc 38308954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 361
Target Start/End: Original strand, 13704690 - 13704763
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaa 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||    
T  13704690 aagtttcagagcaatctgatcaagtagcccgaaaatcggatttttgactgaaaacaactaacaataacctaaaa 13704763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 430
Target Start/End: Original strand, 9847386 - 9847440
Alignment:
Q  376 ttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttag 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  9847386 ttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatcgacgttacaaatatgtttag 9847440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Original strand, 34519492 - 34519554
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  34519492 aaggatgaaagttaggaagattaatattgtccttaaaatgattatccatgttacaaacatgtt 34519554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27670764 - 27670723
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgacta 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27670764 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaacccgatttttgacta 27670723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 38065463 - 38065528
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  38065463 gagcaatccgatcaaatagcctgaaaatctaattttttactaagaacaggtaacaataacccaaaa 38065528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Original strand, 9847167 - 9847229
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  9847167 aaggatgaaagttatgaagattaatattgtccttaaaatgactatcaatgttacaaacatgtt 9847229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 4064598 - 4064971
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaa-taaaaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  4064598 ggggaagtttcggagcaatccaatcaagtagcccgaaaattcgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaaatagaaggatgatagttaggaa 4064697  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||        |||||    
T  4064698 gattaacattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgataaagttcggattatataattcgaact---gttttacctt 4064794  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4064795 gaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatctaacacgccctattttttaaagtttccggattacataatccggaaaaac 4064894  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4064895 ccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa-ctcaagggcattt 4064971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6156961 - 6156615
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6156961 gagcaatccgatcaagtagcccaaaaacccggtttttaactaagaacatgtaacaatgaccaaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 6156862  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||         ||||| ||| ||||||||    
T  6156861 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttatgctgatacaattcgtattatataatccgaac---ggttttaccttgaaagagggtgtt 6156765  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6156764 tagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgtaactccatt 6156665  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6156664 tttcaccatataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaa 6156615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 15799455 - 15799109
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  15799455 gagcaatccggtcaagtagcccggaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgcgaattaggaagaataatattgtc 15799356  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |        || || ||||||||||||    
T  15799355 cataaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatctgaaat---gttttacgttgaaaaagggtgtt 15799259  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15799258 tagggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaacccgtaactccatt 15799159  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15799158 tttcaccctataacaaaggaaaataccattccggattatgaaatccggaa 15799109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33487853 - 33487493
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  33487853 ggggaagtttcggagcaaatcgatcaagtagcccgaaaactcgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaaactgaaggatgagagttaggaa 33487754  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||    
T  33487753 gattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatttttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttacctt 33487657  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  33487656 gaaaaggggtgtttagggagtttccggattatgtaacccgaaaacatcatataacgcgccctattttttgaagttttcggattacaaaattcggaaaaac 33487557  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33487556 ccgtaactccatttttcaccctgtaacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa 33487493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 284 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 20891855 - 20891497
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  20891855 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcctgaaaacccgatttttgactaagaataggtaacaataacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 20891756  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||     
T  20891755 attaatattatccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttaccttg 20891659  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891658 aaaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaattcggaaacatcatgtaacatgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 20891559  T
Q  583 cgtaactc-catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccgga 643  Q
    ||| ||||   ||||||||| |  || | | ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  20891558 cgttactcatttttttcaccatttaataaaagaaaacaccatttcggattataaaatccgga 20891497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 12464998 - 12465355
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12464998 ggggtagtttcagagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaatgatccaaaacaaaaggataagagttatgaag 12465097  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| || ||||||       |||| |    
T  12465098 attaatattgtccctaaaataactatacatattacaaatatgtttaggatttgtgc---------tcggattatatactcagaacta---ttttacctaa 12465185  T
Q  484 aaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465186 aaaaatggtgtttaggggtttccggatt---taatccggaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 12465282  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  12465283 gtaactccatttttcaccctataa---aggcaaacaccattctggatcatgaaatccgaaaaactcaaaggcattt 12465355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 296 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 38871901 - 38871558
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38871901 gagcaatccgattaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattattattgtc 38871802  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||| | ||||    
T  38871801 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaaagatgtt 38871705  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  38871704 tagagggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgccccctattttatgaagttttcggattacaaaatccggaaaaatccgttactcattt 38871605  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    ||| ||  |  |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38871604 tttaactttttaacaaaagaaaacaccattccggattataaaatccg 38871558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 370 - 659
Target Start/End: Original strand, 26190263 - 26190550
Alignment:
Q  370 taagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26190263 taagagttaggaatattaaaattatccttaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact 26190362  T
Q  470 annnnnnnaccttaaaaaagggtgtttgggggttttcgga-ttatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaa 568  Q
    |       ||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190363 atttt---accttaaaaaagggtgtttagggggtttctgaattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcaccctattttttgaagtttccggattacaa 26190459  T
Q  569 aatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| |||||    
T  26190460 aatccggaaaaatccgtaactccatttttcacccgataagaaaggaaaacaccattccagattatgaagtctggaaacctcaaggacattt 26190550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Original strand, 38692662 - 38693020
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| | || ||| ||||||| |||     
T  38692662 ggggaagtttcggagcaatccgaccaagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaatgggtaacaatgacccaaaacagaaagatgagagttatgaat 38692761  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||     
T  38692762 attaatattgtccttaaaatgattatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttg 38692858  T
Q  484 aaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgg-aaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  38692859 aaaaagggtgtttaggggtttccggattatgtaatccggaaacatcacgtaacgcgccctatttttttaagtttccggattacaaaattcggaaaaaacc 38692958  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38692959 cgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaa 38693020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 296 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 39525006 - 39524672
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  39525006 gagcaatctgatcaagtagttcgaaaacccaattttggactaagaacaagtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtt 39524907  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||    
T  39524906 cctaaaatgactatacatattacaaatatgtttagaatttgtgatgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 39524810  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||    
T  39524809 tagggggtttccgaattatgtaatccgaaaacatcatgtaacacgccctatttttttaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccattgctcattt 39524710  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggatta 632  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||    
T  39524709 tttcaccctttaacaaaagaaaacatcatttcggatta 39524672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 284 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 15957991 - 15957637
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  15957991 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaacctgatttttgactaagaacaggtaataatgacccaaaacaaaagaaccagagttaggaag 15957892  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||        |||||     
T  15957891 attaatattgtccctaaaattactatctatgttacaaacatgtttagaatttgtactgatacagttcagattatataatccaaact---gttttaccttg 15957795  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15957794 aaaatgggtgtttagggggtttccggattatttaatccggaaacatcatgtaatacgccctatttttcgaagtttccgaattacaaaatccggaaaaatc 15957695  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    | | ||| |||||||||||||  |||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  15957694 cattact-catttttcaccctttaacaaaagaaaacaccatttcggattataaaatccg 15957637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 296 - 633
Target Start/End: Original strand, 28083269 - 28083604
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  28083269 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaactcgattttttcctaagaacaggtaacaatgaccaaaaacagaaggatgaaagttagaaagattaatattgtc 28083368  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        || || ||||||||||||    
T  28083369 cctaaaatgactatccatgttacaaatatgtttataatttgtgctgatacagttcggattatataatccggact---gttttacgttgaaaaagggtgtt 28083465  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||    
T  28083466 tagagggtttccggattatgtaatccggaaatatcatgtaatgcgccctattttttgaattttccggattacaaaatccggaaaaacccgttactcattt 28083565  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    | |||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  28083566 tctcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattat 28083604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 296 - 584
Target Start/End: Original strand, 32841861 - 32842149
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattg-t 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  32841861 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactacgaacatgtaacaatgactcaaaatagaaggatgagagttaggaagattaatattgtt 32841960  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgt 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||         |||| |||||||||||    
T  32841961 ccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacaattcgaattatataatccgaact--gtttttcccttgaaaaagggtgt 32842058  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||  |||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32842059 ttatggggtgttcggattatgtaatcttgaaaaattatctagcgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 32842149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 284 - 572
Target Start/End: Original strand, 31221218 - 31221504
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  31221218 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccagtttttaactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaagatgagagttaggaag 31221317  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||        |||||     
T  31221318 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttataatttgtgctgatacagtttggattatataatccgaact---gttttaccttg 31221414  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatc 572  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31221415 aaaaagggtgtttagagggtttccggattatgtaatccagaaacatcatgtaacgcgccatattttttgaagttttcggattacagaatc 31221504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 296 - 644
Target Start/End: Original strand, 37183672 - 37184019
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37183672 gagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaatgacccaaaacaaaaagatgagagttaggaagattaatattgtc 37183771  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt-aaaaaagggtgt 494  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||         |||| ||||||||||||    
T  37183772 cataaaatgactatccatgttacaaacatatttagaatttgtgttgatacagttcagattatataatccagact---gttttgccttgaaaaaagggtgt 37183868  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    || | |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| || ||||  |    
T  37183869 ttagagggtttccggattatgtaatctgaaaatatcatgtaacgtgccctattttttgaagtttcaagattacaaaatctagaaaaatctgttactcatt 37183968  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||||||||   |||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  37183969 ttttcacccgttaacaaaagaaaacattattccggattatataatccggaa 37184019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 285 - 645
Target Start/End: Original strand, 24203564 - 24203918
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||| | ||||||||||| |    
T  24203564 gggaagtttcggagcaatccgatcaaatagcccgaaaactcaatttttaactaagaacaggtaacaatgatccaaaacagaaggttgagagttaggaaca 24203663  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaa 484  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||        ||| |||    
T  24203664 ttaatattgtccttaaaatgattatcccagttacaaacatgtttagaatttatgctgatacagttcggattatataacccgaact---gttttaccctaa 24203760  T
Q  485 aaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatcc 583  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||     
T  24203761 aaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagt----cgattacaaaatccgaaaaaatct 24203856  T
Q  584 gtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    || | ||  |||| ||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24203857 gttaatcatttttccaccctttaacaaaagaaaacaccattccggattataaaatccggaaa 24203918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 285 - 633
Target Start/End: Original strand, 40619865 - 40620216
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaa----gaacaagtaagaatgacccaaaataaaagg-ataagagttag 379  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  40619865 gggaagtttcggaacaatccgaccaagtagtccggaaacccgatttttgactaattaagaacaggtaacaatgacccaaaacagaagggatgagagttag 40619964  T
Q  380 gaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnac 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||       ||    
T  40619965 gaagattaatattgtccctaaaatgattgtccatgttacaagcatgtttagaatttgtactgatacaattcggattatataatctgaaatatttt---ac 40620061  T
Q  480 cttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaa 578  Q
    ||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40620062 cttgaaaaatgatgtttagggggtttccggattatgtaatccgaaaacatcatataacgtgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaa 40620161  T
Q  579 aatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    |||| || ||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  40620162 aatctgttactcattttttcacccttcaacaaaagaaaacatcattatggattat 40620216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 284 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 38372543 - 38372234
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||         ||  || ||||||||||||    
T  38372543 ggggaagtttcggagcgatccgatcaagtagcccgaaaacccaatttttaactaagaacatgtaacaatgacg--------aattatgagagttaggaag 38372452  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||        |||||     
T  38372451 attaatattgtccctaaaatgactatccatgtaacaaacatgtttagaatttgtgctaatacagttcggattatataatctgaact---gttttaccttg 38372355  T
Q  484 aaaaagggtgtttg-ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38372354 aaaaagggtatttaaggggtttccgaattatgtaatccggaaacatcatgtaacccgccctatttttttaagtttccggattacaaaatccagaaaaatc 38372255  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccct 603  Q
    ||| ||||  |||||||||||    
T  38372254 cgttactcattttttcaccct 38372234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 285 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 29862854 - 29862583
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    |||||| | ||||||||||    
T  29862854 gggaagtttcggagcaatcacatcaagtagcccgaaaacttgatttttgactaagaacaggtaataatgacccaaaaacggaaggatgaaagttaggaag 29862755  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||        |||||     
T  29862754 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataattcgaact---gttttaccttg 29862658  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagttt 557  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29862657 aaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcacctaacgcgccctattttttgaagttt 29862583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Original strand, 31929004 - 31929342
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  31929004 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacctggtttttaactaagaacaggtaacaatgactcaaaacagaaggatgagagttaggaag 31929103  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||     
T  31929104 attaatattgt-cctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttaccttg 31929199  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||                  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31929200 aaaaggggtgtttagggggtttccggattatgtaat------------------gcgccctattttttgaaatttctggattacaaaatccggaaaaatc 31929281  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| ||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31929282 cgttact-catttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccggattatataatccggaa 31929342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 25747168 - 25746910
Alignment:
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||    
T  25747168 gattaatgttgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttacctt 25747072  T
Q  483 aaaaaagggtgtttgggggttttc-ggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25747071 aaaaaatggtgtttaggggatttccggattatgtaatccgaaaacatcatgtaacgcgccctattttt-gaagtttccggattagaaaatccggaaaaat 25746973  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||| ||||  ||||||||  |  |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25746972 ccgttactcattttttcactttt-aacaaaagaaaacatcattccgaattataaaatccggaaa 25746910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 26319163 - 26318987
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26319163 aaaaaagggtgtttagggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcaccctattttg-gaagtttccggataacaaaatccggaaaaat 26319065  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26319064 ccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccgaattatgaaatccggaaaccgcaagggcattt 26318987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 296 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 27212934 - 27212577
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27212934 gagcaatccaatcaaatagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgactcaaaccagaaggatgagagttaggaagattaatattgtt 27212835  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    |     ||| ||||  |||||||||| |||||||  |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||         |||| ||||||||||||    
T  27212834 c-----atgactatctatgttacaaacatgtttataatttgtactgatatagttcgaattatataatccgaactgtttttc--ccttcaaaaagggtgtt 27212742  T
Q  496 tgggg-gttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatt 594  Q
      ||| || ||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||    
T  27212741 cagggtgtgttctggttatgtaatccgaaaaaatcatgtaacgcaccctattttttgagattttcggattacaaaatccgaaaaaacccgtaactcattt 27212642  T
Q  595 tttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  27212641 tttcaccctataacaaaggaaaacatcagttcggattatgaaatccgaaaatttcaaaggcattt 27212577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7884435 - 7884250
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7884435 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgattcttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaag 7884336  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  7884335 attaatattgtccctaaaatgacaatacatattacaaacatatttagaatttgtgttgatacagttcagattatataattcgaact 7884250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Original strand, 37094991 - 37095165
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37094991 aaaaaagggtgtttaagggttttcggatttggtaatccggaaacatcatgtaacgcgccttatttttt-aagttttcggattacaaaatccggaaaaatc 37095089  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||    
T  37095090 cgtaactccatttttcaccctataacaaagg-aaacaccattccggattatgaaattcgaaaacctcaagggcattt 37095165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 284 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14112107 - 14111944
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  14112107 ggggaagtttcggagcaatcctatcaagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaataacccaaaataa--ggatgaaagttaggaag 14112010  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacactt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  14112009 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatatttaaaatttgtgctgatacactt 14111944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 284 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26095334 - 26095035
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||   || |||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  26095334 ggggaagtttcggagcaatctgaacaagtagcccaaaaacccgattttttactgaaaacagccaacaatgacacaaaatagaagaatgagagttaagaag 26095235  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||        | ||     
T  26095234 attaatattgtccataatatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttatgttgatacaattcagattatataatccgaactatttttc--ctttg 26095137  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26095136 aaaaagagtgtttatggggtgttcggattatgtaatccgaaaaaaatatgtaacgcgctctattttttgtggtttttggattacaaaatcagaaaaaatc 26095037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12847685 - 12847500
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| | ||  |  |||||| |||||    
T  12847685 ggggaagtttcagagtaatatgatcaagtagcccgaaaactcgatttttgactaagaacagctaacaatgatccaaaacagaaatacgagagttgggaag 12847586  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  12847585 attaatattgtccataaaatgattatctatgttacaaacatgttcagaatttgtgctgatacagttcggattatttaaaccgaact 12847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13908778 - 13908605
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  13908778 gagcaatccgatcaagtagtctgaaaacctgatttttgacaaagaacagctaacaatgactcaaaagagaaggatgaaggttaagaagattaatattgtc 13908679  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    | ||||||| |||| | ||||||||| |||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13908678 cataaaatgactatccgtgttacaaacatgtttaaaatttatgttgatacaattcggattatataatccgaact 13908605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 483 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 34440779 - 34440617
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||          |||||    
T  34440779 aaaaaagggtgtttagggggttttcggattatgcaatccgaaaacatcatgtaacgcgtccta-tttttgaagttttcggattac----------aaaat 34440691  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggc 655  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  34440690 ccgtaactccattttttaccctataacaaaggaaaacatcatttcagattatgaaattcggaaacctcaagggc 34440617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 483 - 645
Target Start/End: Original strand, 36359661 - 36359824
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |    
T  36359661 aaaaaaaggtgtttagggggttttcagattatgtaatccgaaaaaatcatgttacgcgtcctattttttgagatttctggattacaaaatccgaaaaatt 36359760  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaaca-tcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  36359761 ccgtaact-catttttcaccctttaacaaaagaaaacacccattccagattatgaaatccggaaa 36359824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 284 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23269579 - 23269391
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  23269579 ggggaagtttcgaagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgaataagaacatctaactataacccagaatagaagaatgagagttaggaag 23269480  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttg---tgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||| ||||| || | |||   || ||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  23269479 attaatattgtccttaaaatgattgttcatgttacaaacatgttcagaagttgtgatgatgataaagttcggattatataatctgaact 23269391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27158314 - 27158144
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||   |||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  27158314 gagcaatctgatcaagtagcctgaaaaccgaattttttattaataacaactaataatgacccaaaagtgaaggatgaggattaggaagcttaatattgtc 27158215  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccga 466  Q
    | ||||||| |||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27158214 cttaaaatgactatccatgtttcaaacatgttcataatttgtgctgatacagttcagattatataatccga 27158144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Original strand, 26898694 - 26898790
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26898694 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaactcgatttttgactaagaacatataacaatgactcaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatatt 26898790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 484 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 14111942 - 14111851
Alignment:
Q  484 aaaaagggtgtttggggg-ttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg 574  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14111942 aaaaagggtgtttaggggattttcagattatgtaatccaaaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttctggattacaaaatccg 14111851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 483 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 38640767 - 38640590
Alignment:
Q  483 aaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||  ||    
T  38640767 aaaaaagggtgtttaggggtgttcggattatgtaatccgaataaatcatttaacgcgccctattttttgagatttccagattataaaatccgaaaatctc 38640668  T
Q  583 cgtaactc--catttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcatt 658  Q
     ||| |||    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  38640667 tgtagctcattttttttcaccctttaacaaaggaaaacaccattccagattataaaatccggaaacttcaagggcatt 38640590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 479 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 8032321 - 8032217
Alignment:
Q  479 ccttaaaaaagggtgtttggg-ggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaa 577  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  8032321 ccttgaaaaagggtgtttaggaggtgttcggattatgtaatccggaaaaatcatgtaatgtgccctattttttgaaatttccagattacaaaatccgaaa 8032222  T
Q  578 aaatc 582  Q
    |||||    
T  8032221 aaatc 8032217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 469
Target Start/End: Original strand, 40613556 - 40613739
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||   ||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || | | |||||| | ||||||||||||    
T  40613556 ggaagtttcggagcaatctgatcaagtagctcaaaaactggatttttaactaagaacagttagcaatgacctaatacataaggatgaaagttaggaagat 40613655  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40613656 taataatgtccttaaaataattatccatgttacaaacatgttcataatttttgctcatacagttcggattatataatccgaact 40613739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 469
Target Start/End: Original strand, 41639385 - 41639557
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttg---actaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||     
T  41639385 aatctgatcaagtagcctgaaaatcagatttttttttactaagaacaactaacaatgacctaaaacaaaaagatgagagttagggaaattaatattgtca 41639484  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
     |||| ||| |||  |||||||||| |   | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41639485 ttaaactggttatctatgttacaaacagactcagaatttgtgctgatacagttcggattatataatccaaact 41639557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21070534 - 21070429
Alignment:
Q  358 aaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattat 457  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||| || || |||||||    
T  21070534 aaaataaatggatgagggttatgaagattaatattgtccttaaaatgactatctatgttacaaatatgttcagaatttgtactgattcagtttggattat 21070435  T
Q  458 ataatc 463  Q
    ||||||    
T  21070434 ataatc 21070429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 470
Target Start/End: Original strand, 8738938 - 8739050
Alignment:
Q  358 aaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattat 457  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| |||| || || |||||||    
T  8738938 aaaatacagggatgagagttaggaagattaatattgttcttaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaattggtgttgatgcagtttggattat 8739037  T
Q  458 ataatccgaacta 470  Q
     ||||||||||||    
T  8739038 gtaatccgaacta 8739050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 6800818 - 6800984
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||  ||||||    
T  6800818 gagcaatatgatcaagtagttcgaaaaccggatttttgactaagaacatctaacaatgacctaaaacagaaggatgagaatgaggaagattagcattgtc 6800917  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    | ||||||| || | |||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  6800918 cttaaaatgactgtccatgttgcaaacatgttcataatttatgctgatacagttcaaattatataat 6800984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 284 - 350
Target Start/End: Original strand, 26190201 - 26190267
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaaga 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26190201 ggggaagtttcagagcaatccgatctagtagtccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaaga 26190267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 469
Target Start/End: Original strand, 27494123 - 27494217
Alignment:
Q  375 gttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | || || |||| |  |||||||||||    
T  27494123 gttaggaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaatatgtttagaattggtgctggtgcagtttggatcacgtaatccgaact 27494217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33901200 - 33901094
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| ||| | |||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  33901200 gggaagtttcggagcaatctgatcaaatagtctgaaaatcaaatttttgactaaaaacaactaacaatgacctaaaagagaaggatatgagttaggaaga 33901101  T
Q  385 ttaatat 391  Q
    |||||||    
T  33901100 ttaatat 33901094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16429443 - 16429339
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  | || ||||||  ||||||    
T  16429443 aaggataagagtttggaagattaatattgtccttaaaacgactattcatgttacaaacatgttcagaattggtgctgatgtagtttggattaggtaatcc 16429344  T
Q  465 gaact 469  Q
    |||||    
T  16429343 gaact 16429339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26093618 - 26093502
Alignment:
Q  354 acccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcgga 453  Q
    |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||||| | || |||    
T  26093618 acccaaaacagaaggatgagagttaagaagattaattttgtccataaaatgactatccatgttagaaacatgttcataatttatgctgatatagttagga 26093519  T
Q  454 ttatataatccgaacta 470  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26093518 ttatataatctgaacta 26093502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 26622350 - 26622170
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||||| |||||| | |||||||||| |    
T  26622350 ggaagtttcggagcaatctgatcaagtagtccgaaaaccggatttttgacta--aacaactaacaataacctaaaatagaaggatgaaagttaggaagtt 26622253  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||| |||| |||  ||| ||   |||||||||| |  ||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26622252 taatatggtccttaatctggtta-ctatgttacaaacaaattcgaaatttgtgctgatacagttcgaattatataatccgaact 26622170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 467
Target Start/End: Original strand, 8739148 - 8739250
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||| |||||| | || || ||||||  ||||||    
T  8739148 aaggatgagagttaggaagattaatattgtccttaaaatgactacccatgttacaaacatgttcagaattggtgctggtgcagtttggattacgtaatcc 8739247  T
Q  465 gaa 467  Q
    |||    
T  8739248 gaa 8739250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 469
Target Start/End: Original strand, 1350290 - 1350374
Alignment:
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | || | |||||||||||||||||    
T  1350290 ttaatattatccataaaatggttatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgttgatatagtttgaattatataatccgaact 1350374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 41253530 - 41253359
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |  ||||||| | || |||||| ||| ||||||| |||| |  ||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  41253530 gagcaatctgatcaagtggcccggaatttggattttttattaggaacaactaacaatgacctaaaacaggaggatgatagttaggaagattaatatggta 41253431  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    | |||| | | ||| ||||||||||| | ||| |  ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  41253430 cttaaattcgttattcatgttacaaacaagttcataattggtgctggtacagttcgaattatataatccgaa 41253359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Original strand, 28445169 - 28445231
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||    
T  28445169 aaggatgagagttaggaagattaatattgtccttaaaacgaccatacatgttacaaacatgtt 28445231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 34530029 - 34529913
Alignment:
Q  527 atcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg---gaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcat 623  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    ||||||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||  | |     
T  34530029 atcatgtaacacgccctattttttgaggtttttggattacaaaatccgaaaaaaaaatccgcaactcattttttcatcctataacaaaggaaaaactaag 34529930  T
Q  624 tccggattatgaaatcc 640  Q
    | |||||||||||||||    
T  34529929 ttcggattatgaaatcc 34529913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7036758 - 7036677
Alignment:
Q  306 atcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7036758 atcaaatagcccgaaaatcagatttttaactgtgaacaaccaacaatgacctaatatagaaggataagagttaggaagatta 7036677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 527 - 633
Target Start/End: Original strand, 43388189 - 43388297
Alignment:
Q  527 atcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc--catttttcaccctacaacacaggaaaacatcatt 624  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  43388189 atcatgtaatgcgccctatttttttagatttccggattacaaaatccaaaagaatccgtaactcattttttttcacactttaacaaaggaaaacaccatt 43388288  T
Q  625 ccggattat 633  Q
     ||||||||    
T  43388289 tcggattat 43388297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34530367 - 34530300
Alignment:
Q  374 agttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  34530367 agttaggaagattaatattgtccttaaaatgactaaccatgttacaaacatgttcagaattagtgctg 34530300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Original strand, 8973569 - 8973631
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  8973569 aaggatgagagttaggaaggttaatattgtccttaaaatgattatccatgttacaaacatgtt 8973631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Original strand, 1350451 - 1350516
Alignment:
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  1350451 ttttcaccctataacaaaggaaaacaccagttcggattatgaaatccgaaaatttcaagggcattt 1350516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 464
Target Start/End: Original strand, 11186097 - 11186234
Alignment:
Q  327 atttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgt 426  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| | |||||| ||||| | ||| |||||||| |||  ||||  || ||| |||||||||||||       
T  11186097 attttttactaagaacatctaacaattacctaaaacagaaggatgagagtcaagaaaattaatatggtcattaaatcggttatccatgttacaaatagac 11186196  T
Q  427 ttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
    | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11186197 tcagaatttatgctgatacagttcggattatataatcc 11186234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16429240 - 16429168
Alignment:
Q  358 aaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttag 430  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  16429240 aaaatacaaggatgagagttatgaagattagtattatcattaaaatgactatccatgttacaaacatgtttag 16429168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 28445381 - 28445441
Alignment:
Q  381 aagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctg 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  28445381 aagattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaattcgtgctg 28445441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 28108354 - 28108277
Alignment:
Q  555 tttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| ||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  28108354 tttccggattacaaaatctggaaaaacccgttactcattttctca-cctttaacaaaagaaaacatcattccggattat 28108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 38030799 - 38030765
Alignment:
Q  615 aaacatcattccggattatgaaatccggaaatctc 649  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38030799 aaacaccattccggattatgaaatccggaaatctc 38030765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38641083 - 38641033
Alignment:
Q  377 taggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  38641083 taggaagattaatattgtccttaaaatgactatctatgttacaaacatgtt 38641033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23407077 - 23406717
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  23407077 ggggaagtttcggagcaatcaaatcaagtagcccgaaaacttgatttttgactaagaacaagtaataatgacccaaaaacggaaggatgagagttaggaa 23406978  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||        |||||    
T  23406977 gattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataattcgaact---gttttacctt 23406881  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaat 581  Q
     ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  23406880 gaaaaatggtgtttagggggtttccggattatgtaatccagaaacatcaactaacgcgccctattttttgaagtttccggattacgaaattcggaaaaac 23406781  T
Q  582 ccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23406780 tcgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattacgaaatccggaaa 23406717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 284 - 644
Target Start/End: Original strand, 2813103 - 2813463
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  2813103 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaaacggaaggatgagagttaggaa 2813202  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||         |||||    
T  2813203 gattaatattatccataaaatgactattcatgttaaaaatatgtttagaatttgtggtgatacagttcggattatata-tccgaac---cgttttacctt 2813298  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaa--atccggaaaa 579  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2813299 gaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacacaccttattttttgaagtttccggattacaaaatatccggaaaa 2813398  T
Q  580 atccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2813399 atctgtaactccatttttcaccctataataaaggaaaacaccattccgaattatgaaatccggaa 2813463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 284 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5699846 - 5699479
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaa 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  5699846 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaatcccgatttttgactaagaataggtaacaatgacccaaaaacagaaggatgagagttatgaa 5699747  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact----annnnnnna 478  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |    |       |    
T  5699746 gattaatattgtccttaaaatgactatccatgttacaaacatatttagaatttgtgttaatacagttcggattatataatctgaaatctgaactgtatta 5699647  T
Q  479 ccttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaa 577  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5699646 ccttgaaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttcaagtttccggattacaaaattcgaaa 5699547  T
Q  578 aaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5699546 aaacccgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa 5699479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 284 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 17264690 - 17264346
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  17264690 ggggaagtttcggagcaatcccatcaagtagcccaaaaactcaatttttaactaagaacaggtaacaatgacgcaaaacagaaggatgagagttaggaag 17264591  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    || |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||       |||||     
T  17264590 ataaatattgtccctaaaatgactaaccatgttgcaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaactatttt---accttg 17264494  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17264493 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccagattacaaaatccggaaaaatc 17264394  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggat 630  Q
    ||| ||||  |||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||    
T  17264393 cgttactcattttttcaccctgtaacaaaagaaaacatcattcaggat 17264346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 286 - 645
Target Start/End: Original strand, 4508183 - 4508540
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  4508183 ggaagtttcggagcaatccaatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaaggatgaaagttaggaagat 4508282  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        ||||| ||    
T  4508283 taatattgtccctaaaatgactatccatattacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaact---gttttaccttgaa 4508379  T
Q  486 aaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
    ||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4508380 aaaagttgtttaggggatttccggattatataatccggaaacatcatgtaacacgccctaatttttgaaatttctggattataaaatccggaaaaatccg 4508479  T
Q  585 taactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    | ||||  |||||||||||  |||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  4508480 ttactcattttttcaccctctaacaaaagaaaacaccattctggattataaaatccggaaa 4508540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 288 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 5639138 - 5638786
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5639138 aagtttcagagcaatctgaccaagtagcccggaaacccgatttttgattaagaacaggtaacaatgactcaaaacaaaaggataagagttaagaagatta 5639039  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaa 487  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||    
T  5639038 atattgtccctagaatggctatatatgttacagacatgtttatgatatgtgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaa 5638942  T
Q  488 agggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgta 586  Q
    ||||||||| |||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||    
T  5638941 agggtgtttagggatttttcaaattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttt-----------------aaaatccggaaaaatccgta 5638859  T
Q  587 actccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5638858 actctatttttcaccctataacagaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaacctcaagggcattt 5638786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 297 - 644
Target Start/End: Original strand, 14587452 - 14587797
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14587452 agcaatccaatcaagtagcccaaaaatccatttttttactaagaacatgtaacaatgacccaaaacataaggattagagttaggaagattaatattgtcc 14587551  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt 496  Q
     ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||        ||||| ||||| |||||||    
T  14587552 gtaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgccgatacagttatgattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaatggtgttt 14587648  T
Q  497 -gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccattt 595  Q
     ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  14587649 agggggtttatggattatgtaatcaggaaacatcatgtaacgcgccctattttttaaagttttcggattacaaaatccggaaaaatcccttactcatttt 14587748  T
Q  596 ttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||||||||  |||| | ||||| |  ||||| ||||||  |||||||||    
T  14587749 ttcaccctttaacaaaagaaaatacaattccagattatataatccggaa 14587797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 406 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 32035266 - 32035038
Alignment:
Q  406 ctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggttt 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32035266 ctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgataca-----gattatataatccgaactatttt---accttaaaaaagggtgtttagggggttt 32035175  T
Q  505 tcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcacccta 604  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  32035174 ccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcatcata 32035075  T
Q  605 caacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
     |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32035074 taacaaaagaaaacatcattccagattatgaaatccg 32035038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 296 - 659
Target Start/End: Original strand, 3717173 - 3717534
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataa-aaggataagagttaggaagattaatattgt 394  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  3717173 gagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacatgtaacaatgacccaaaaacagaaggatgagagttagaaaaattaatattgt 3717272  T
Q  395 ccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgt 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||  ||||    
T  3717273 ccctaaaatgactatccatgttacagacatgtttagaatttgtgatgatacagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaattgtgt 3717369  T
Q  495 tt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccat 593  Q
    || || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||  |    
T  3717370 ttaggaggtttccagattatataatccggaaacatcatgtaacgcgccctaatttttgaagtttccggattacaaaattcggaaaagcccattactcatt 3717469  T
Q  594 ttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3717470 ttttcaccctttaacaaaagaaaacaccattcaagattataaaatccggaaa-ctcaagggcattt 3717534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 298 - 603
Target Start/End: Original strand, 1945423 - 1945725
Alignment:
Q  298 gcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccc 397  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1945423 gcaatccgatcaaataacccgaaaatccgatttttgaataaaaacaggtaacaatgtcccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattatccc 1945522  T
Q  398 taaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtttg 497  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |          ||| ||||| || ||||     
T  1945523 taaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgccgatacagttcggattatataatctgaattgttttca---cttgaaaaatggggttta 1945619  T
Q  498 ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactccattttt 597  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1945620 ggggtgttcagattatataatccggaaaatttatgtaacgcaccctagtttttgaagttttcggattacaaaatccggaaaaatccgtaactcatttttt 1945719  T
Q  598 caccct 603  Q
    ||||||    
T  1945720 caccct 1945725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 305 - 641
Target Start/End: Original strand, 24604261 - 24604597
Alignment:
Q  305 gatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604261 gatcaagtagcccaaaaacccgatttttgactaagaacaggtaacaatgactcaaaacagaaggatgaaagttaggaagattaatattgtctctaaaatg 24604360  T
Q  405 gctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgttt-gggggtt 503  Q
     ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||         |||| ||||| |||||||  |||||     
T  24604361 actatctttgttacaaatatgtttagaatttgtgctgatagagttcagattatataatatgaact--gtttttcccttgaaaaatggtgtttaaggggtg 24604458  T
Q  504 ttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgtaactc-catttttcaccc 602  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  24604459 ttcggattatgtaatccgaagaaatcatgtaagacgccctattttttgaagtttttggattacaaaattcggaaaaatccttaactcatttttttcaccc 24604558  T
Q  603 tacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccg 641  Q
    ||  ||| ||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  24604559 tatgacaaaggaaaacaccagttcggaatatgaaatccg 24604597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 33413417 - 33413584
Alignment:
Q  478 accttaaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccgga 576  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  33413417 accttgaaaaaggttgtttagggggtttccagattatgtaatctggaaacatcatgtaacgcgccctatttt-tgaagtttccggattacaaaattcaga 33413515  T
Q  577 aaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaa 645  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33413516 aaaattcgtaactccatttttcaccctataacaaaggaaaacaccattccggattatgaaatccggaaa 33413584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 478 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 7412916 - 7412750
Alignment:
Q  478 accttaaaaaagggtgtttgggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaa 577  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412916 accttgaaaaagggtgtttaggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacacgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaa 7412817  T
Q  578 aaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    ||| |||| ||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7412816 aaacccgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccagattatataatccggaa 7412750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 9905392 - 9905100
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatt 386  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  9905392 gaagtttcggagcaatccgatcaagtagcccgaaaacccgatttttgactaagaattggtaacaatgactcaaaacagaaggataagagtaaggaaaatt 9905293  T
Q  387 aatattg-tccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaa 485  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||      || ||||||||||| |||||        |||| ||    
T  9905292 aatattgttccctaaaatgattatccatgttacaaacatgtttaaaatttgtgctgata-----tgggttatataatccaaactatttttc--ccttgaa 9905200  T
Q  486 aaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccg 584  Q
      | || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9905199 tgatggcgtttagggggtgttcggattatgtaatccggaaaaatcacgtagcgcgccctattttttgaaatttccgaattacaaaatccggaaaaatccg 9905100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 296 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 2539719 - 2539498
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||| ||| | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2539719 gagcaatccgatcaagtagtccgaaaactcggtttttaactacgaataggtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttaggaagattaatattgtc 2539620  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaaagggtgtt 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||    
T  2539619 cctaaaatgactatccatgttacaaacatgttcagaatttgtgcggatagagttcggattatataatccgaact---gttttaccttgaaaaagggtgtt 2539523  T
Q  496 t-gggggttttcggattatgtaatc 519  Q
    | |||||||| | ||||||||||||    
T  2539522 tagggggtttccagattatgtaatc 2539498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 284 - 431
Target Start/End: Original strand, 21514910 - 21515057
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  21514910 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtccgaaaatccgatttttgactaagaacaggtaacaatgacccaaaggagaaggatgagagttaggaag 21515009  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttagg 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  21515010 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatatttagg 21515057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 286 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 29519557 - 29519374
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  29519557 ggaagtttcggagcaatttgatcaagtagctcgaaaacccgatttttgaccaagaacacgtaacaatgacccaaaatagaaggatgatagttaggaagat 29519458  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29519457 taatattttccataaaatgacaattcatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcatattatataatccgaact 29519374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Original strand, 13800918 - 13801091
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  13800918 gagcaatccgatcaagtagttcaaaaatccgatttttgactaagaacaactaacaatgacccaaaacataatgatgagagttaggaagattaatattgtt 13801017  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    | |||||||   ||  |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  13801018 cataaaatgataatctatgttacaaacatgtttagaatttatgctaatacagttccgattatgtaatccgaact 13801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 300 - 469
Target Start/End: Original strand, 7734221 - 7734390
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcccta 399  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7734221 aatctgatcaagtagcccgaaaacctgatttttgatcaagaacagataacaatgatccaaaacaaaaggatgatagttaggaagattaatattgtccata 7734320  T
Q  400 aaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||| | || | ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  7734321 aaatgacaattcgtgttacaaacatgtttagaatttgtattgatacagttcgaattatataatctgaact 7734390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 308 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32044638 - 32044537
Alignment:
Q  308 caagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggct 407  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32044638 caagtagcccgaaaacctgatttttgactaagaacaggtaacaatgatccaaaacaaaaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatgact 32044539  T
Q  408 at 409  Q
    ||    
T  32044538 at 32044537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34528718 - 34528558
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagat 385  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  34528718 ggaagttttggagcaatccgatcaagtagaccgaaaaccagatttttgactaagaacagctaataatgacccaaaacagaagaatgagagttagaaagat 34528619  T
Q  386 taatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgataca 446  Q
    ||||||| ||| | |||||  ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  34528618 taatattatccttgaaatgaatatccatgttacaaacatgttcataatttgtgctgataca 34528558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 467
Target Start/End: Original strand, 29289504 - 29289687
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| | ||||||  ||||||||||     
T  29289504 ggggaagtttcggagcaatttgatcaagtagcacgaaaacctgatttttgactaagaacatctaacaatgacctaaaacagaaggatgcgagttaggaaa 29289603  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaa 467  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||  |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29289604 attaatattgtccataaaattaatatctatgttacaaagatgttcataatttgtgctgatacagttcagattatataatccgaa 29289687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 462
Target Start/End: Original strand, 6704009 - 6704183
Alignment:
Q  287 gaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatt 386  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||| |  ||||  ||| ||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||    
T  6704009 gaagtttcagagcaatctgatcaaatagtccgaaaaccggatttttgac-attaacagctaacaatgacctaaaatcgaatgatgagagttaggaagatt 6704107  T
Q  387 aatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataat 462  Q
    |||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||  ||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  6704108 aatattgtccttaaactagttatccatgttacaaatagatttggaatttgtgctaacacagttcggattatataat 6704183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 469
Target Start/End: Original strand, 14037845 - 14038026
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||    |||| |||||    
T  14037845 gggatgttttggagcaatctgatcaagtagcacgaaaactagatttttgactaagaacaactaacaatgacctaaaacagaaggat---ggttaagaaga 14037941  T
Q  385 ttaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaact 469  Q
    ||||||| |||  ||||  || ||| ||||||||||| |   | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14037942 ttaatatggtctttaaacaggttatccatgttacaaagagactcagaatttgtgctgatacagttcgggttatataatccgaact 14038026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 237069 - 236899
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||| ||  | |||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  237069 aagtttcagagcaatccgatcaaataacctgaatattgg-ttttcgactgaaaacaactaacaatgacctaaaatagaacgatgagagttaggaagatta 236971  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatat 459  Q
    |||| |||| |||||||  | | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  236970 atatggtccttaaaatgattttccatgttacaaacatgttcataatttgtgctgatatagttcgaattatat 236899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16450481 - 16450355
Alignment:
Q  297 agcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcc 396  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| | || ||| ||| ||||||||||||||||  |||    
T  16450481 agcaatctgatcaagtagcccaaaaaccaaatttttgactaagaacagctaacaatgacctaaaacataatgatgagatttaggaagattaatatgttcc 16450382  T
Q  397 ctaaaatggctatacatgttacaaata 423  Q
     |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16450381 ttaaactggttatccatgttacaaata 16450355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 327
Target Start/End: Original strand, 33413365 - 33413408
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccga 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33413365 ggggaagtttcagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccga 33413408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3365933 - 3365808
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||| | ||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  3365933 gagcaatatgatcaagtaacctgaaaaccggatttttgagtgtgaacaattaacaatgacctaaaacagaaggatgaaagttaggaagattaatatgttc 3365834  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaa 421  Q
    | |||| | | ||| |||||||||||    
T  3365833 cttaaacttgttatccatgttacaaa 3365808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 401
Target Start/End: Original strand, 10310311 - 10310427
Alignment:
Q  285 gggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaaga 384  Q
    |||||||||  || ||||| || |||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||| | | ||| ||| |||||| ||| || | |||||||||||    
T  10310311 gggaagtttcggaacaatctgaccaagtagcctaaaaattggatttttgactgagaacaacttacaataacctaaaatagaagaatgatagttaggaaga 10310410  T
Q  385 ttaatattgtccctaaa 401  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  10310411 ttaatatggtccttaaa 10310427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17501054 - 17501003
Alignment:
Q  376 ttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtt 427  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  17501054 ttaggaagattaataatgtccttaaaatgactattcatgttacaaacatgtt 17501003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 556
Target Start/End: Original strand, 21517572 - 21517630
Alignment:
Q  498 ggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtt 556  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  21517572 ggggtttccgaattatgtaatccggaaacattatgtagcacgccctattttttggagtt 21517630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7413028 - 7412971
Alignment:
Q  286 ggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaaca 343  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  7413028 ggaagtttcggagcaatccgatcaactagtccgaaaacctgatttttggctaagaaca 7412971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 644
Target Start/End: Original strand, 9380 - 9734
Alignment:
Q  288 aagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagatta 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| | |||||  || ||||    
T  9380 aagtttcagagcaatccgatcaagtaatccgaaaatccgatttttaactaagaacatgtaacaatgacccaaaacagaatgatgaaagttataaatatta 9479  T
Q  388 atattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnaccttaaaaa 487  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||        || || ||||    
T  9480 atattgtccataaaatgactatccatgttacaaacatgtatagaatttatgctgatacagttcggattatataatccgaact---gttttactttgaaaa 9576  T
Q  488 agggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatccgta 586  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9577 agggtgttcagggggttttcggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgtcctattttttgaagtttccggattacaaaattcggaaaaacccgta 9676  T
Q  587 actccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaa 644  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9677 actctatttttcaccctataacaaaggaaaacacaattccgaattatgaaatccggaa 9734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 284 - 633
Target Start/End: Original strand, 141843 - 142188
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||  | ||||||  |||||||||||    
T  141843 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacatgcaacaatgacccaaac-agaaggatgggagttaggaag 141941  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctta 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |       |||||     
T  141942 attaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttagaatttgtgctgatacagttcggattatataatctcaacaa---ttttaccttg 142038  T
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  142039 aaaaagggtgtttagggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatctggaaaaatc 142138  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
     || ||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  142139 tgttac-acatttttcaccctttaacaaaagaaaacatcattccgaattat 142188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0508 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0508
Description:

Target: scaffold0508; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 284 - 659
Target Start/End: Original strand, 3273 - 3648
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttg-actaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaa 382  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  3273 ggggaagtttcagagcaatctgatcaagtagcccgaaaacctgatttttttactaagaacaagtaacaatgacccaaaacagaaggatgagagttacgaa 3372  T
Q  383 gattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatccgaactannnnnnnacctt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||    
T  3373 gattaatattgtccctaaaatgattatcgatgttacaaacatgtttagaatttgcgccgatacagttcagattatataatccgaact---gttttacctt 3469  T
Q  483 aaaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccg--gaaaa 579  Q
     |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||    
T  3470 gaaaaagggtgtttatggggtttccggattatgtaatccggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttctagattacaaaattcgaaaaaaa 3569  T
Q  580 atccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattatgaaatccggaaatctccagggcattt 659  Q
    || ||| ||||  |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||    
T  3570 attcgttactcattttttcaccctttaacaaaagaaaacaccattccggattataagattcggaaa-ctcaagggcattt 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 94; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 284 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 140765 - 140620
Alignment:
Q  284 ggggaagttttagagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaag 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  140765 ggggaagtttcggagcaatccgatcaagtagtctgaaaacccgatttttgactaagaacaagtaacaatgacctaaaacaaaaggatgagagttaggaag 140666  T
Q  384 attaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgttta 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  140665 attaatattgtccctaaaatgactatcaatgttacaaacatgttta 140620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 140612 - 140541
Alignment:
Q  562 attacaaaatccggaaaaatccgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  140612 attacaaaatccggaaaaatcctttactcattttttcaccttttaacaaaagaaaacatcattccggattat 140541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 23205 - 23056
Alignment:
Q  484 aaaaagggtgttt-gggggttttcggattatgtaatcgggaaacatcatgtaacgcgccctattttttgaagtttccggattacaaaatccggaaaaatc 582  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23205 aaaaaaggtgtttagggggtttccggattatataatccggaaacatcatgtaatgcaccctattttttgaagtttccggattataaaattcggaaaaatc 23106  T
Q  583 cgtaactccatttttcaccctacaacacaggaaaacatcattccggattat 633  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||    
T  23105 cgttact-catttttcacccttcaacaaaagaaaacataattacggattat 23056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23301 - 23228
Alignment:
Q  365 aaggataagagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtg 438  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  23301 aaggatgagagttaggaagattaatattgtccctaaaatgactatccatgttacaaacatgtttcgaatttgtg 23228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 463
Target Start/End: Original strand, 59865 - 60028
Alignment:
Q  300 aatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtcccta 399  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||| |      | |||||||||||||||||||||||  ||    
T  59865 aatctgatcaagtaacccgaaaatcaaatttttgactaagaacggctaacaatgacctaaaatgactatccatgagttaggaagattaatattgtcttta 59964  T
Q  400 aaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatc 463  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||||| |  |||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  59965 aaatgactatctatgttacaaacatgttcaaaatttgtgctggtacagttcatattatataatc 60028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 59551 - 59480
Alignment:
Q  373 gagttaggaagattaatattgtccctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgata 444  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  59551 gagttagaaagattaatattgtccttaaaatgactatccatgtcacaaacatgtttaaaatttgtactgata 59480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4639 - 4471
Alignment:
Q  296 gagcaatccgatcaagtagcccgaaaatccgatttttgactaagaacaagtaagaatgacccaaaataaaaggataagagttaggaagattaatattgtc 395  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |  ||||| ||||| |||||| ||| |||||||  ||| | || ||| |  |||| |||||||||||| |||    
T  4639 gagcaatccgatcaaatagctcaaaaaccgtattttggactaggaacaactaacaatgacctcaaacataatgatgatggttaagaagattaatatggtc 4540  T
Q  396 cctaaaatggctatacatgttacaaatatgtttaggatttgtgctgatacacttcggattatataatcc 464  Q
      ||||||| ||||  || ||||||| | ||| |  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  4539 tttaaaatgactatctattttacaaacaggttcaaaatttgtgccgatacagttcagattatataatcc 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University