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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3151B-Insertion-19 (Length: 211)

Name: NF3151B-Insertion-19
Description: NF3151B
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3151B-Insertion-19
NF3151B-Insertion-19
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (7-117)||(22218-22328)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (7-117)||(39800221-39800331)
chr5 (7-112)||(42878727-42878832)
chr5 (53-98)||(40057130-40057175)
chr5 (8-116)||(3926439-3926547)
chr5 (7-47)||(40057165-40057205)
chr5 (7-47)||(39206909-39206949)
chr5 (7-47)||(35188400-35188440)
chr5 (53-116)||(33742521-33742584)
chr5 (7-70)||(39886957-39887020)
chr5 (7-44)||(2209869-2209906)
chr5 (7-92)||(23429510-23429589)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (7-117)||(25293826-25293936)
chr1 (14-116)||(15378980-15379082)
chr1 (7-92)||(31585014-31585099)
chr1 (7-109)||(2191566-2191668)
chr1 (7-116)||(11894504-11894613)
chr1 (7-57)||(29677386-29677436)
chr1 (7-100)||(38264103-38264196)
chr1 (7-116)||(47141031-47141140)
chr1 (7-116)||(48378860-48378969)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (7-117)||(9047-9157)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (7-117)||(12149228-12149338)
chr3 (7-92)||(21288359-21288444)
chr3 (7-114)||(25874480-25874587)
chr3 (7-73)||(36585012-36585078)
chr3 (7-116)||(13826296-13826405)
chr3 (7-92)||(5295482-5295567)
chr3 (7-116)||(27926410-27926519)
chr3 (7-116)||(3778754-3778862)
chr3 (7-116)||(48251264-48251373)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (53-117)||(27337257-27337321)
chr7 (7-116)||(23809451-23809560)
chr7 (7-116)||(5973233-5973342)
chr7 (7-116)||(1052836-1052948)
chr7 (7-100)||(7767255-7767348)
chr7 (15-116)||(2943835-2943936)
chr7 (7-92)||(38440187-38440272)
chr7 (7-116)||(11038962-11039071)
chr7 (7-116)||(33189563-33189672)
chr7 (7-116)||(36299048-36299156)
chr7 (7-47)||(27337311-27337351)
chr7 (7-113)||(47925083-47925188)
chr7 (10-113)||(22518955-22519058)
chr7 (7-116)||(30541263-30541371)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (57-117)||(40568747-40568807)
chr4 (7-109)||(8819067-8819169)
chr4 (21-109)||(51357450-51357538)
chr4 (7-109)||(36464577-36464679)
chr4 (7-112)||(40714597-40714702)
chr4 (7-116)||(42555582-42555691)
chr4 (7-116)||(43624591-43624697)
chr4 (7-92)||(29117275-29117360)
chr4 (7-116)||(17120059-17120168)
chr4 (7-85)||(22279279-22279357)
chr4 (7-100)||(19841991-19842084)
chr4 (7-116)||(33340844-33340953)
chr4 (7-115)||(38951868-38951976)
chr4 (7-39)||(40568713-40568745)
chr4 (7-78)||(41041721-41041792)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (53-117)||(42622475-42622539)
chr2 (8-116)||(13807790-13807898)
chr2 (7-115)||(45151015-45151123)
chr2 (7-73)||(5110496-5110562)
chr2 (7-92)||(31575717-31575802)
chr2 (7-91)||(5938947-5939031)
chr2 (7-73)||(13626089-13626155)
chr2 (7-116)||(5704842-5704951)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (7-112)||(7986979-7987084)
chr8 (7-116)||(8227017-8227126)
chr8 (7-116)||(28211691-28211800)
chr8 (7-116)||(9762703-9762812)
chr8 (7-116)||(11481662-11481771)
chr8 (7-100)||(7968238-7968331)
chr8 (7-78)||(36582708-36582779)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (7-92)||(7622571-7622656)
chr6 (7-116)||(641806-641914)
chr6 (7-116)||(8576983-8577092)
chr6 (7-85)||(35167063-35167140)
chr6 (7-116)||(28582409-28582518)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (7-92)||(6722-6807)


Alignment Details
Target: scaffold0115 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22328 - 22218
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacctgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 22229  T
Q  107 caacttcctat 117  Q
    |||||||||||    
T  22228 caacttcctat 22218  T

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Target: chr5 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 39800221 - 39800331
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39800221 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatctgcacccgcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 39800320  T
Q  107 caacttcctat 117  Q
    |||||||||||    
T  39800321 caacttcctat 39800331  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 42878727 - 42878832
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| || ||    
T  42878727 aattaatggatatgaatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaataccatt 42878826  T
Q  107 caactt 112  Q
    ||||||    
T  42878827 caactt 42878832  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 40057175 - 40057130
Alignment:
Q  53 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatcctta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40057175 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatcctta 40057130  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3926547 - 3926439
Alignment:
Q  8 attaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttc 107  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||  |||| |||||| |||||| ||| |||  | |||    
T  3926547 attaatggatgtggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctataaaatcgagtaaattacataaataacctcaatatcattc 3926448  T
Q  108 aacttccta 116  Q
    |||||||||    
T  3926447 aacttccta 3926439  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 40057205 - 40057165
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccc 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40057205 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccc 40057165  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 39206909 - 39206949
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccc 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39206909 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacaccc 39206949  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 35188400 - 35188440
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccc 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35188400 aattaatggatacggatgcggatttagtggtatccacaccc 35188440  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 116
Target Start/End: Original strand, 33742521 - 33742584
Alignment:
Q  53 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttccta 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  33742521 tatccacacccgctattaaacagagtaaattacataaataaccttaatatcattcaacttccta 33742584  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 39887020 - 39886957
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctatta 70  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  39887020 aattaatggatacagatgcagatttcatggtatctacacccgcgggtatccgtacccgctatta 39886957  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 2209906 - 2209869
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgca 44  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2209906 aattaatggatacggatgcagatttaatggtacccgca 2209869  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23429589 - 23429510
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  || || |    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23429589 aattaatggatacagatgcggatttaatggtattcacacc--cgcattt----acccgctattaaactgagtaaattacataaata 23429510  T

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Target: chr1 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 25293826 - 25293936
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293826 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacctgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 25293925  T
Q  107 caacttcctat 117  Q
    |||||||||||    
T  25293926 caacttcctat 25293936  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15379082 - 15378980
Alignment:
Q  14 ggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttc 113  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15379082 ggatacggatgcagatttaatagtatccacacccgcagatatccatacccgctattaaattgagtaaattacataaataaccttaatacctttcaacttc 15378983  T
Q  114 cta 116  Q
    |||    
T  15378982 cta 15378980  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 31585014 - 31585099
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  31585014 aattaatggatacggatgcggatttaatgatatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgattaaattacataaata 31585099  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 2191566 - 2191668
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| | |||    
T  2191566 aattaatggatacagatgcagatttaatggtatccgcacccgcagatatccatacctgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaatactttt 2191665  T
Q  107 caa 109  Q
    |||    
T  2191666 caa 2191668  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11894613 - 11894504
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||  | ||    
T  11894613 aattaatggatatggatgcggatttaacggtatccacacccgtggatatccataccgactattaaaccgagtaaattacataaataaccttaatatcatt 11894514  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  11894513 caacttccta 11894504  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 29677386 - 29677436
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatcc 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29677386 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatcc 29677436  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 38264103 - 38264196
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaat 100  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||  | | |||||| |||||| |||||||    
T  38264103 aattaatggatatggatgtgaatttaatggtatccgcacccgcagatatctatacccgctattaaaccaattaaattacataaataaccttaat 38264196  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 47141140 - 47141031
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| | || |  ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| |||||  ||||||  |||||| || ||    
T  47141140 aattaatggataggaatacatatttaatggtatcagcacccgcggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattaaataaataatcttaataccatt 47141041  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  47141040 caacttccta 47141031  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 48378860 - 48378969
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||||  |||| |||||||||||||| | |||| | |||| ||| |||  | ||    
T  48378860 aattaatggatacatatgcggatttaatgatattcacgcccgcggacatccataccctctattaaactgagtaagttacatcaataacctcaatatcatt 48378959  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  48378960 caacttccta 48378969  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9157
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9047 aattaatggatacggatgctgatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacccgttattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 9146  T
Q  107 caacttcctat 117  Q
    |||||||||||    
T  9147 caacttcctat 9157  T

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Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12149338 - 12149228
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12149338 aattaatggatacggatgctgatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacccgttattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 12149239  T
Q  107 caacttcctat 117  Q
    |||||||||||    
T  12149238 caacttcctat 12149228  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21288444 - 21288359
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  21288444 aattaatggatagggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccaagtaaattacataaata 21288359  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 25874480 - 25874587
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |  ||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  25874480 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgttattaaaccgaatatattacataaataacctcaatatcatt 25874579  T
Q  107 caacttcc 114  Q
    ||||||||    
T  25874580 caacttcc 25874587  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 36585078 - 36585012
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaac 73  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  36585078 aattaatggatacggatgcagattaaatggtatccgcacccgcggatatccatacccgctattaaac 36585012  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13826405 - 13826296
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||| |||  | ||    
T  13826405 aattaatggatatggatacagatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacattaataacctcaatatcatt 13826306  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  13826305 caacttccta 13826296  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5295567 - 5295482
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5295567 aattaatggatacagatgcagatttaatggtatctacacctgcggatatccatatccgctattaaactgagtaaattacataaata 5295482  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 27926410 - 27926519
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||   |  ||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| ||| || ||    
T  27926410 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacatgcggatatctatatgcgctattaaaccgaataaattatgtaaataacctcaataccatt 27926509  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  27926510 caacttccta 27926519  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 3778754 - 3778862
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |  | || ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||  | ||    
T  3778754 aattaatggatacagatgcggatttaacggtatccatacccgcggatattcata-ccactattaaacagagtaaattacataaataaccttaatatcatt 3778852  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  3778853 caacttccta 3778862  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 48251264 - 48251373
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||  | |||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||| || ||    
T  48251264 aattaatggatgcagatacggatttaatggtatccctacccgcgtatatccatatccgctattaaaccgagtaaattagataaataaccttaataccatt 48251363  T
Q  107 caacttccta 116  Q
     |||||||||    
T  48251364 aaacttccta 48251373  T

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Target: chr7 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27337321 - 27337257
Alignment:
Q  53 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttcctat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337321 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttcctat 27337257  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 23809451 - 23809560
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  23809451 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacttgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 23809550  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  23809551 caacttccta 23809560  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5973342 - 5973233
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  5973342 aattaatggatacagatgcggatttaatggtattcacacccgcggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 5973243  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  5973242 caacttccta 5973233  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 1052836 - 1052948
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcac--cct-cggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcc 103  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||| || || | |||||| |||||| ||||||| ||    
T  1052836 aattaatggataaggatgtggatttaatggtatccgcacctcctgcggatatccatacccgctattataccgaataaattacataaataaccttaatacc 1052935  T
Q  104 tttcaacttccta 116  Q
    |||||| ||||||    
T  1052936 tttcaaattccta 1052948  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7767348 - 7767255
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaat 100  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  7767348 aattaatggacacggattcagatttaatggtatccacacctgcggatatccatacccactattaaactgagtaaattacataaataaccttaat 7767255  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Original strand, 2943835 - 2943936
Alignment:
Q  15 gatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttcc 114  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||| | |||||||||||    
T  2943835 gatacgaatgcagatttaatggtatccacatccgcggatatccatatccgctattaaaccgagtaaattacataaataacattaatacatttcaacttcc 2943934  T
Q  115 ta 116  Q
    ||    
T  2943935 ta 2943936  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 38440187 - 38440272
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  38440187 aattaatggatacggatgcggatttgatggtatccacacctgcagatatccatacccactattaaaccgagtaaattacataaata 38440272  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 11038962 - 11039071
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||| |||| |||| | ||||||  |||||| || ||    
T  11038962 aattaatgaatatggatacggatttaatggtatccacacccgcagatatccataccggctattaaaccgagtaaatttcataaataagcttaataccatt 11039061  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    | ||||||||    
T  11039062 ccacttccta 11039071  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33189672 - 33189563
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||  |  | ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  33189672 aattaatggatacagatgcgaattcaatggtatccacacccgcggataaacatatccgttattacacagagtaaattacataaatatccttaataccatt 33189573  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    |||| |||||    
T  33189572 caacatccta 33189563  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 36299156 - 36299048
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||  | | |||||| |||||| ||||||| | |||    
T  36299156 aattaatggatacaaatgttgatttaatggtatccgcacccacggatattcatacccgctattaaac-caataaattacataaataaccttaatacattt 36299058  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||| ||||||    
T  36299057 caaattccta 36299048  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27337351 - 27337311
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccc 47  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337351 aattaatagatacggatgcggatttaatggtatccgcaccc 27337311  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 47925188 - 47925083
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |  ||||||   |||||||||||||| | | || ||| |||||| |||||||  ||||    
T  47925188 aattaatggatacgaaagtggatttaatggtatccgcacccacaaatatccatgcccgctattaaacttact-aaatacataaataaccttaatatcttt 47925090  T
Q  107 caacttc 113  Q
    |||||||    
T  47925089 caacttc 47925083  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 22518955 - 22519058
Alignment:
Q  10 taatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 109  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  | |||||||  || || ||||||| ||| | |||||| ||||||  ||||||  |||||||    
T  22518955 taatggatacggatgtgggtttaatggtatccgcatcagcagatatccatacacgttattaaattgaataaattacataaataaacttaatatctttcaa 22519054  T
Q  110 cttc 113  Q
    ||||    
T  22519055 cttc 22519058  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 30541263 - 30541371
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||  | ||| |||||||| |||| |  ||| |||||| || ||||  ||||    
T  30541263 aattaatggatatggatgccgatttaatggtatttgcacccgcagatatccatatccgttattaaaccgagtaagatacataaataacc-taataacttt 30541361  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  30541362 caacttccta 30541371  T

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Target: chr4 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 117
Target Start/End: Original strand, 40568747 - 40568807
Alignment:
Q  57 cgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttcctat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40568747 cgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttcctat 40568807  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 8819067 - 8819169
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | | |||||| |||||| | ||||| |||||    
T  8819067 aattaatggatatggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccatacccgctattaaactaaataaattacataaataacattaataccttt 8819166  T
Q  107 caa 109  Q
    |||    
T  8819167 caa 8819169  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 51357538 - 51357450
Alignment:
Q  21 gatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  51357538 gatgcggatttaatggtatccacacccacggatatccatacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 51357450  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 36464577 - 36464679
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  || |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  36464577 aattaatagatacggatgcggatttaatgatatccgcacccgcaaatatccttactcgctattaaactgaataaattacataaataaccttaataccttt 36464676  T
Q  107 caa 109  Q
    |||    
T  36464677 caa 36464679  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 40714597 - 40714702
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||| |||||    
T  40714597 aattagtggatacagatgcagatttaatggcatccgcacccgcggatatccatactcgctattaaaccgagtaaattacataaataactttaataccttt 40714696  T
Q  107 caactt 112  Q
    ||||||    
T  40714697 caactt 40714702  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 42555691 - 42555582
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||  || |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  42555691 aattaatgaatatgaatgtggatttaatgatatccgcacccacgaatatccatactcgctattaaaccaagtaaattacataaatatccttaataccttt 42555592  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  42555591 caacttccta 42555582  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43624697 - 43624591
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||  | ||    
T  43624697 aattaatggatacggatgcggat---atggtatccacactcgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaatatcatt 43624601  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  43624600 caacttccta 43624591  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29117360 - 29117275
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  29117360 aattaatggatacggatgcggatttaacggtatccgcatccgcggatatccatttccgctattaaactgaataaattacataaata 29117275  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 17120059 - 17120168
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||  ||||||  ||||    
T  17120059 aattaatggatacgaatgcggacttaatggcatccgcacgcgcggatatccatacccgatattaaaccgagtaaattacataagtaatcttaatatcttt 17120158  T
Q  107 caacttccta 116  Q
     |||||||||    
T  17120159 gaacttccta 17120168  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22279357 - 22279279
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattac 85  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||    
T  22279357 aattaatggatacagatgcagatttaatagtatccacacccgcggatatccaaatccgctattaaaccgagtaaattac 22279279  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19842084 - 19841991
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||   ||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  19842084 aattaatggataaagatgcggatttaatggtttccacacccgcgaatatcaatacctgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaat 19841991  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33340953 - 33340844
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| | |||||||  | || ||||||||  |||| || ||  |||||| | ||||| |||||    
T  33340953 aattaatggatacggatgcagatttaatggtatatgtacccgcagatatccatatccactattaaatagagtaaaatatataaataacattaataccttt 33340854  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  33340853 caacttccta 33340844  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 38951976 - 38951868
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |   |||||  | |||||||||||| |||  |||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  38951976 aattaatggatacagatgcggatttaatggtattcacacccgcatttatccatatccgctattaaaccgaggaaattacataaataacctcaatatcatt 38951877  T
Q  107 caacttcct 115  Q
    |||||||||    
T  38951876 caacttcct 38951868  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 40568713 - 40568745
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40568713 aattaatggatacggatgcggatttaatggtat 40568745  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 41041792 - 41041721
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagt 78  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  41041792 aattaatagatacagatgcgaatttaatgatatccacacccgcggacatccatacccgctattaaaccgagt 41041721  T

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Target: chr2 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Original strand, 42622475 - 42622539
Alignment:
Q  53 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaacttcctat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42622475 tatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttttaacttcctat 42622539  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13807898 - 13807790
Alignment:
Q  8 attaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttc 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||| |||  | |||    
T  13807898 attaatggatacggatgtggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccaagtaaattatataaataacctcaatatcattc 13807799  T
Q  108 aacttccta 116  Q
    |||||||||    
T  13807798 aacttccta 13807790  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Original strand, 45151015 - 45151123
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  45151015 aattaatggatacagatgcggatttaatggtatccacacccacagatatccatatccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 45151114  T
Q  107 caacttcct 115  Q
    |||||||||    
T  45151115 caacttcct 45151123  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 5110562 - 5110496
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaac 73  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  5110562 aattaatggatacgaatgcggatttaatggtatccacacccgcagatatccatacccgctattaaac 5110496  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 31575717 - 31575802
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  31575717 aattaatggatacggatgcggatttaattgtatccacaccagcggatatccatatccgctattaaaccaagtaaattacataaata 31575802  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5939031 - 5938947
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaat 91  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  5939031 aattaatggatacaaatgcggatttaatggtatctacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtatattacataaat 5938947  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 13626089 - 13626155
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaac 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||  |||| |||||||||    
T  13626089 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatctacacccgcgaatatccataccctctattaaac 13626155  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5704951 - 5704842
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||| |  | | |||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  5704951 aattaatggatacggatgtggatttaatggtatccacacccgcaaatattcatatctgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 5704852  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  5704851 caacttccta 5704842  T

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Target: chr8 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 7986979 - 7987084
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| || ||    
T  7986979 aattaatggatacggatgcggatttaatggtattcacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaataccatt 7987078  T
Q  107 caactt 112  Q
    ||||||    
T  7987079 caactt 7987084  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 8227017 - 8227126
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||  | ||    
T  8227017 aattaatagatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatattcatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 8227116  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  8227117 caacttccta 8227126  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 28211691 - 28211800
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||  |  |||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28211691 aattaatggatacgaatgcggatttaatagtatccacacccgcagatatccatattcgctattaaaccaagtaaattacataaataaccttaataccttt 28211790  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  28211791 caacttccta 28211800  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 9762703 - 9762812
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||  || | |||||| |||||| |||||||  | ||    
T  9762703 aattaatggatatggatgcggatttgatggtatccacatcctcggatatccatactcgctattaaatcgaataaattacataaataaccttaatatcatt 9762802  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  9762803 caacttccta 9762812  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11481771 - 11481662
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || || || ||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||  | ||    
T  11481771 aattaatggatatggatgtggatttaacggtatccacatccgcgaatatccatacccgctattaaaccgagtaaattatgtaaataacctcaatatcatt 11481672  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  11481671 caacttccta 11481662  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 7968238 - 7968331
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||  |  ||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||    
T  7968238 aattaatggatacgcatgcggatttaatggtattcacacccgcgtatatccatattcgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaat 7968331  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 36582708 - 36582779
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  36582708 aattaatggatacggatgcggatttaatagtatacacacccgcgaatatccatacccgttattaaaccgagt 36582779  T

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Target: chr6 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7622656 - 7622571
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  7622656 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattaagtaaata 7622571  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 641806 - 641914
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||  ||||    
T  641806 aattaatggatacatatgaggatttaatggtaaccgcatccgcggatatccatatccgctattaaactgagtaaattacataaataacc-taataacttt 641904  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  641905 caacttccta 641914  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8577092 - 8576983
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| |||  | ||    
T  8577092 aattaatggatacagatgcagatttaatggtatccacacccgtggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattatataaataacctcaatatcatt 8576993  T
Q  107 caacttccta 116  Q
    ||||||||||    
T  8576992 caacttccta 8576983  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Original strand, 35167063 - 35167140
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattac 85  Q
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T  35167063 aattaattgatacggatgtggatttaatggtatctgca-ccgcggatatccatacccgctactaaactgagtaaattac 35167140  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28582518 - 28582409
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgccttt 106  Q
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T  28582518 aattagtggatacaaatacggatttaatagtatccacaccctcagatatccatactcgctattaaacaaaataaattacataaataattttgataccttt 28582419  T
Q  107 caacttccta 116  Q
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T  28582418 caacttccta 28582409  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 6722 - 6807
Alignment:
Q  7 aattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcaccctcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 92  Q
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T  6722 aattaatggatacagatgcggatttaatggtatccacacccgtggatattcatacccgctattaaaccgagtaaattacataaata 6807  T

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