View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3151B-Insertion-5 (Length: 720)
Name: NF3151B-Insertion-5
Description: NF3151B
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3151B-Insertion-5 |
 | |
|
| [»] chr2 (2 HSPs) |
| |
|
| [»] chr6 (4 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 626; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 720
Target Start/End: Original strand, 38251648 - 38252362
Alignment:
| Q |
7 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcngcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
106 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38251648 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcagcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
38251747 |
T |
|
| Q |
107 |
aaacttgatccgagatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccnnnnnnn-caccagattcagtaaaagctcaaactcc |
205 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38251748 |
aaacttgatccgagatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccaaaaaaaacaccagattcagtaaaagctcaaactcc |
38251847 |
T |
|
| Q |
206 |
tatgggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38251848 |
tatgggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
38251947 |
T |
|
| Q |
306 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
405 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38251948 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
38252047 |
T |
|
| Q |
406 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
505 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38252048 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
38252147 |
T |
|
| Q |
506 |
tataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcacg |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38252148 |
tataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaccatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcaca |
38252247 |
T |
|
| Q |
606 |
atcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctccaaaaaaccgcgcctgaacag |
705 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38252248 |
atcctaagacagcacactaacaggatccaaaataacattactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctccaaaaaaccgcgcctgaacag |
38252347 |
T |
|
| Q |
706 |
caaaagacaacatgc |
720 |
Q |
| |
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||||| || |||||| |
|
|
| T |
38252348 |
caaaaaactacatgc |
38252362 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 43157894 - 43157180
Alignment:
| Q |
7 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcngcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157894 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcagcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
43157795 |
T |
|
| Q |
107 |
aaacttgatccgagatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccnnnnnnn-caccagattcagtaaaagctcaaactcc |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157794 |
aaacttgatctgagatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccaaaaaaaacaccagattcagtaaaagctcaaactcc |
43157695 |
T |
|
| Q |
206 |
tatgggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157694 |
tatgggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
43157595 |
T |
|
| Q |
306 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157594 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
43157495 |
T |
|
| Q |
406 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
505 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157494 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
43157395 |
T |
|
| Q |
506 |
tataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcacg |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157394 |
tataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcaca |
43157295 |
T |
|
| Q |
606 |
atcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctccaaaaaaccgcgcctgaacag |
705 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43157294 |
atcctaagacagcacactaacaggatccaaaataacattactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctccaaaaaaccgcgcctgaacag |
43157195 |
T |
|
| Q |
706 |
caaaagacaacatgc |
720 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| |
|
|
| T |
43157194 |
caaaaaactacatgc |
43157180 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 547; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 11475318 - 11474691
Alignment:
| Q |
7 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcngcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11475318 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcagcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
11475219 |
T |
|
| Q |
107 |
aaacttgatccgagatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccnnnnnnn-caccagattcagtaaaagctcaaactcc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11475218 |
aaacttgatccgatatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccaaaaaaaacaccagattcagtaaaagctcaaactcc |
11475119 |
T |
|
| Q |
206 |
tatgggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
305 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11475118 |
tataggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
11475019 |
T |
|
| Q |
306 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11475018 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
11474919 |
T |
|
| Q |
406 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
505 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11474918 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
11474819 |
T |
|
| Q |
506 |
tataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcacg |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11474818 |
tataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcaca |
11474719 |
T |
|
| Q |
606 |
atcttaagacagcacactaacaagatcc |
633 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11474718 |
atcctaagacagcacactaacaggatcc |
11474691 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 11503358 - 11502731
Alignment:
| Q |
7 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcngcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11503358 |
aatcagaacctaggggtggaagaaatgccacaacgtagctgcagcaccacaacagtccacaggcggaaaaccagctttgaactacgtagagaattacctc |
11503259 |
T |
|
| Q |
107 |
aaacttgatccgagatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccnnnnnnn-caccagattcagtaaaagctcaaactcc |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11503258 |
aaacttgatctgatatatacagaaaattaccttgaaccagcattgaagtatgcatagaacacccaaaaaaaacaccagattcagtaaaagctcaaactcc |
11503159 |
T |
|
| Q |
206 |
tatgggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
305 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11503158 |
tattggcagacagtcaagttcaacaggctacaatccagtagagttaacacacaatccaaaaacaaaagaatcaagatttgttacacactctaaaattatg |
11503059 |
T |
|
| Q |
306 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11503058 |
ctagcaaaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagatttgttacacactctaaaattatgctagcataaatagaaacgaacaaa |
11502959 |
T |
|
| Q |
406 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
505 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11502958 |
tgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcagaagctgctataaaagtgctgc |
11502859 |
T |
|
| Q |
506 |
tataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcacg |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11502858 |
tataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaacatggggaactaaagttgctgctataacaacttagcagaggtgtggctgcaca |
11502759 |
T |
|
| Q |
606 |
atcttaagacagcacactaacaagatcc |
633 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11502758 |
atcctaagacagcacactaacaggatcc |
11502731 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 385 - 720
Target Start/End: Original strand, 28245191 - 28245526
Alignment:
| Q |
385 |
gcataaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
484 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28245191 |
gcataaatagaaacaaacaaatgacagaggctgctataacacaattaggctaacaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
28245290 |
T |
|
| Q |
485 |
aagctgctataaaagtgctgctataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaact |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28245291 |
aagctgctataaaactactgctataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaccatggggaactaaagttgctgctataacaact |
28245390 |
T |
|
| Q |
585 |
tagcagaggtgtggctgcacgatcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28245391 |
tagcagaggtgtggctgcacaatcctaagacagcacactaacaggatccaaaataacattactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
28245490 |
T |
|
| Q |
685 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaagacaacatgc |
720 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28245491 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaaaacaacatgc |
28245526 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 634 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 11474590 - 11474504
Alignment:
| Q |
634 |
aaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctccaaaaaaccgcgcctgaacagcaaaagacaacatgc |
720 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
11474590 |
aaaataacattactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctccaaaaaaccgcgcctgaacagcaaaaaactacatgc |
11474504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Original strand, 28245195 - 28245237
Alignment:
| Q |
312 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaatta |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28245195 |
aaatagaaacaaacaaatgacagaggctgctataacacaatta |
28245237 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 385 - 720
Target Start/End: Original strand, 10123418 - 10123753
Alignment:
| Q |
385 |
gcataaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
484 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10123418 |
gcataaatagaaacgaacaaatgatagaggctgctataacacaattaggctaacaaaatattgtatattgcattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
10123517 |
T |
|
| Q |
485 |
aagctgctataaaagtgctgctataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaact |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10123518 |
aagctgctataaaactactgctataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccgcaaaaaatacccaccatggggaactaaagttgctgctataacaact |
10123617 |
T |
|
| Q |
585 |
tagcagaggtgtggctgcacgatcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10123618 |
tagcagaggtgtggctgcacaatcctaagacagcacactaacaggatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
10123717 |
T |
|
| Q |
685 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaagacaacatgc |
720 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10123718 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaaaacaacatgc |
10123753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 385 - 720
Target Start/End: Original strand, 19306846 - 19307181
Alignment:
| Q |
385 |
gcataaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
484 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19306846 |
gcataaatagaaacgaacaaatgatagaggctgctataacacaattaggctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
19306945 |
T |
|
| Q |
485 |
aagctgctataaaagtgctgctataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaact |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19306946 |
aagctgctataacactactgctataattcagcaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaccatggggaactaaagctgctgctataacaact |
19307045 |
T |
|
| Q |
585 |
tagcagaggtgtggctgcacgatcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19307046 |
tagcagaggtgtggctgcacaatcctaagacagcacactaacaggatccaaaataacactactaagtgattttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
19307145 |
T |
|
| Q |
685 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaagacaacatgc |
720 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19307146 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaaaacaacatgc |
19307181 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Original strand, 10123422 - 10123464
Alignment:
| Q |
312 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaatta |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10123422 |
aaatagaaacgaacaaatgatagaggctgctataacacaatta |
10123464 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Original strand, 19306850 - 19306892
Alignment:
| Q |
312 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaatta |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19306850 |
aaatagaaacgaacaaatgatagaggctgctataacacaatta |
19306892 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 385 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 25382994 - 25382664
Alignment:
| Q |
385 |
gcataaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
484 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25382994 |
gcataaatagaatcgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaggctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcag |
25382895 |
T |
|
| Q |
485 |
aagctgctataaaagtgctgctataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaact |
584 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25382894 |
aggctgctataacactactgctataattcagcaggaaaaaa-tgggacaaaccccaaaaaatacccaccatggggaactaaagctgctgctataacaact |
25382796 |
T |
|
| Q |
585 |
tagcagaggtgtggctgcacgatcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25382795 |
tagcagaggtgtggctgcacaatcctaagacagcacactaacaggagccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctc |
25382696 |
T |
|
| Q |
685 |
caaaaaaccgcgcctgaacagcaaaagacaac |
716 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25382695 |
taaaaaaccgcgcctgaacagcaaaaaacaac |
25382664 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25382990 - 25382948
Alignment:
| Q |
312 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaatta |
354 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25382990 |
aaatagaatcgaacaaatgacagaggctgctataacacaatta |
25382948 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 386 - 715
Target Start/End: Original strand, 22490433 - 22490761
Alignment:
| Q |
386 |
cataaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcaga |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22490433 |
cataaatacaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaggctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcaga |
22490532 |
T |
|
| Q |
486 |
agctgctataaaagtgctgctataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataacaactt |
585 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22490533 |
agctgctataacactactgctataattcagcaggaaaaaa-tgggacaaaccccaaaaaatacccaccatggggaaccaaagctgctgctataacaactt |
22490631 |
T |
|
| Q |
586 |
agcagaggtgtggctgcacgatcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcccatgctcc |
685 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22490632 |
agtagaggtgtggctgcacaatcctaagacatcacactaacagcagccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacacagttcctatgctcc |
22490731 |
T |
|
| Q |
686 |
aaaaaaccgcgcctgaacagcaaaagacaa |
715 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22490732 |
aaaaaaccgcgcctgaacagcaaaaaacaa |
22490761 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Original strand, 22490436 - 22490478
Alignment:
| Q |
312 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaatta |
354 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22490436 |
aaatacaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaatta |
22490478 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 48795572 - 48795375
Alignment:
| Q |
386 |
cataaatagaaacgaacaaatgacagaggctgctataacacaattaagctagcaaaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcaga |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48795572 |
cataaatagaaacgaacaaatgacagaggttgttataacacaattaggctagcacaatattgtatattccattcaaaatacaaagtcaatgtatggcaga |
48795473 |
T |
|
| Q |
486 |
agctgctat---aaaagtgctgctataattcagcaggnnnnnnntgggacaaaccccaaaaaataccgaacatggggaactaaagttgctgctataac |
580 |
Q |
| |
|
|||||||| || | | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
48795472 |
ggctgctataacaacactactgctataattcagtaggaaaaaaatgggacaaaccccaaaaaatacccaccatggggaactaaatctgatgctataac |
48795375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 573 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 48794634 - 48794515
Alignment:
| Q |
573 |
gctataacaacttagcagaggtgtggctgcacgatcttaagacagcacactaacaagatccaaaataacactactaagtggttttaacagcaaaaacaca |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48794634 |
gctataacaacttagcagaggcgtggctgcacaatcctaagacagcacattaacagaagccaaaataacactactaagtggttttaatagcaaaaacaca |
48794535 |
T |
|
| Q |
673 |
gttcccatgctccaaaaaac |
692 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48794534 |
gttcccatgctccaaaaaac |
48794515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48795569 - 48795527
Alignment:
| Q |
312 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggctactataacacaatta |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
48795569 |
aaatagaaacgaacaaatgacagaggttgttataacacaatta |
48795527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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