View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3162_low_17 (Length: 447)

Name: NF3162_low_17
Description: NF3162
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3162_low_17
NF3162_low_17
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (10-447)||(477968-478405)
chr8 (16-420)||(8451062-8451466)
chr8 (28-444)||(7127079-7127495)
chr8 (44-440)||(23853804-23854200)
chr8 (66-444)||(13414917-13415295)
chr8 (22-444)||(40588645-40589052)
chr8 (152-444)||(185507-185797)
chr8 (287-442)||(33642681-33642836)
chr8 (272-443)||(11870364-11870535)
chr8 (110-431)||(37712017-37712332)
chr8 (286-444)||(598152-598310)
chr8 (224-442)||(3606656-3606874)
chr8 (187-444)||(9496797-9497050)
chr8 (354-442)||(36194538-36194626)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (19-444)||(16731780-16732205)
chr7 (19-444)||(17709914-17710339)
chr7 (19-439)||(9328522-9328941)
chr7 (19-444)||(22289088-22289513)
chr7 (66-444)||(16098384-16098762)
chr7 (14-444)||(29200870-29201294)
chr7 (19-444)||(30493525-30493949)
chr7 (15-420)||(1581458-1581864)
chr7 (23-441)||(17877259-17877667)
chr7 (287-444)||(3601767-3601924)
chr7 (70-435)||(30824418-30824763)
chr7 (220-444)||(3275082-3275307)
chr7 (354-444)||(24251621-24251711)
chr7 (354-443)||(33224476-33224565)
chr7 (354-444)||(44481269-44481359)
chr7 (349-426)||(47580052-47580129)
chr7 (382-444)||(24139221-24139283)
chr7 (280-359)||(24139139-24139218)
chr7 (370-440)||(35030573-35030643)
chr7 (115-200)||(34578437-34578522)
chr7 (372-444)||(35013759-35013831)
chr7 (269-340)||(44480897-44480968)
chr7 (194-239)||(3601683-3601728)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (16-443)||(28106983-28107410)
chr6 (33-444)||(15605909-15606320)
chr6 (19-444)||(14680006-14680434)
chr6 (105-443)||(15053091-15053429)
chr6 (42-419)||(29367996-29368365)
chr6 (165-426)||(19690812-19691073)
chr6 (152-443)||(11731585-11731873)
chr6 (151-365)||(30801985-30802199)
chr6 (286-444)||(34104380-34104538)
chr6 (280-444)||(27443039-27443205)
chr6 (336-422)||(3100409-3100496)
chr6 (320-436)||(21944551-21944667)
chr6 (19-123)||(11731885-11731989)
chr6 (16-88)||(19364217-19364288)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (19-443)||(32576964-32577386)
chr4 (44-444)||(37245767-37246167)
chr4 (10-444)||(49951151-49951585)
chr4 (19-444)||(51734887-51735311)
chr4 (19-444)||(29655581-29656005)
chr4 (14-442)||(2064695-2065123)
chr4 (19-444)||(51259444-51259870)
chr4 (11-444)||(18442062-18442493)
chr4 (11-411)||(55734848-55735248)
chr4 (19-444)||(56065476-56065905)
chr4 (21-426)||(28537720-28538123)
chr4 (19-444)||(21321374-21321802)
chr4 (19-439)||(49119320-49119727)
chr4 (43-420)||(41835250-41835627)
chr4 (44-439)||(28426068-28426450)
chr4 (19-360)||(43840305-43840647)
chr4 (199-444)||(26422517-26422762)
chr4 (196-426)||(47226263-47226493)
chr4 (189-442)||(24989851-24990093)
chr4 (288-439)||(44936002-44936153)
chr4 (359-442)||(23095401-23095484)
chr4 (342-426)||(8754396-8754480)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (66-441)||(12660210-12660585)
chr5 (19-444)||(15988664-15989089)
chr5 (19-442)||(8387933-8388356)
chr5 (16-443)||(20204799-20205226)
chr5 (44-426)||(26597390-26597772)
chr5 (44-444)||(4267971-4268371)
chr5 (52-444)||(25730688-25731080)
chr5 (16-444)||(22767188-22767600)
chr5 (19-441)||(41940655-41941077)
chr5 (44-442)||(27292306-27292704)
chr5 (10-442)||(27532823-27533256)
chr5 (105-392)||(34652221-34652507)
chr5 (79-444)||(11375437-11375793)
chr5 (80-275)||(37448033-37448228)
chr5 (290-441)||(23074950-23075101)
chr5 (19-229)||(30222929-30223139)
chr5 (269-444)||(30222755-30222928)
chr5 (218-441)||(32632561-32632784)
chr5 (372-426)||(26076480-26076534)
chr5 (337-404)||(31908351-31908418)
chr5 (342-420)||(30573616-30573694)
chr5 (48-113)||(16074612-16074677)
chr5 (116-315)||(42989241-42989440)
chr5 (342-435)||(14823661-14823754)
chr5 (17-57)||(37447988-37448028)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (19-442)||(25682498-25682921)
chr1 (34-444)||(4395021-4395430)
chr1 (44-444)||(44527125-44527525)
chr1 (19-443)||(48949640-48950064)
chr1 (10-444)||(5609177-5609611)
chr1 (16-420)||(36733538-36733944)
chr1 (19-444)||(51113162-51113587)
chr1 (50-444)||(16816712-16817108)
chr1 (184-420)||(44602764-44603000)
chr1 (44-444)||(52109326-52109725)
chr1 (92-426)||(48166157-48166481)
chr1 (19-441)||(24538357-24538756)
chr1 (277-443)||(21031254-21031420)
chr1 (264-444)||(2885315-2885498)
chr1 (366-444)||(17371642-17371720)
chr1 (327-439)||(38679016-38679128)
chr1 (345-444)||(14485183-14485282)
chr1 (360-441)||(4898538-4898619)
chr1 (378-439)||(23163357-23163418)
chr1 (22-64)||(17507308-17507350)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (19-444)||(34695819-34696242)
chr2 (19-444)||(34718231-34718654)
chr2 (19-444)||(88406-88831)
chr2 (22-441)||(12130556-12130975)
chr2 (19-444)||(44017233-44017658)
chr2 (250-439)||(9710033-9710222)
chr2 (174-415)||(1417925-1418166)
chr2 (60-442)||(26198575-26198952)
chr2 (44-260)||(18345586-18345801)
chr2 (222-444)||(13109784-13110006)
chr2 (218-444)||(14827126-14827351)
chr2 (337-444)||(18344209-18344316)
chr2 (287-441)||(11291982-11292134)
chr2 (153-242)||(9709910-9709999)
chr2 (324-444)||(35158758-35158880)
chr2 (236-444)||(22845600-22845795)
chr2 (342-441)||(25552315-25552414)
chr2 (344-399)||(36445479-36445534)
chr2 (349-437)||(10244492-10244580)
chr2 (354-419)||(43293835-43293900)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (19-444)||(42340192-42340616)
chr3 (44-443)||(53496904-53497303)
chr3 (19-444)||(55199358-55199783)
chr3 (44-444)||(2615365-2615755)
chr3 (8-444)||(46007137-46007571)
chr3 (264-444)||(34497287-34497467)
chr3 (259-443)||(31341641-31341829)
chr3 (264-440)||(27608822-27608998)
chr3 (216-444)||(647085-647306)
chr3 (85-262)||(647308-647485)
chr3 (182-420)||(11020119-11020357)
chr3 (220-444)||(2121129-2121353)
chr3 (264-401)||(24176862-24176999)
chr3 (280-441)||(27747603-27747764)
chr3 (120-224)||(27941129-27941233)
chr3 (295-441)||(19117638-19117784)
chr3 (348-444)||(26046864-26046960)
chr3 (66-308)||(48227307-48227550)
chr3 (337-444)||(55213490-55213597)
chr3 (354-442)||(1702806-1702894)
chr3 (370-444)||(48227566-48227640)
chr3 (372-420)||(49525133-49525181)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (28-444)||(42-462)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (188-441)||(182-434)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (280-444)||(44156-44322)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (344-443)||(20330-20429)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 478405 - 477968
Alignment:
Q  10 cacagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataacc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  478405 cacaggcaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccaagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcaacgttccatgaccacaacc 478306  T
Q  110 atctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  478305 atctaacatcttttgtgtgttgtgttagagatttccatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcaacgggcaaatatgacagttttggaggggga 478206  T
Q  210 ggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcg 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  478205 ggcagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccgggttatcttcgaatctgactctactactctagtgcaagctctatcg 478106  T
Q  310 tctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagac 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  478105 tctccgggttatggtgattcggtattttatgatattgtttctaatattatttatcagttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagac 478006  T
Q  410 aagcgaacatgattgctaataccttagctagggcgtcc 447  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  478005 aagcgaacatggttgctcataccttagctagggcgtcc 477968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 8451466 - 8451062
Alignment:
Q  16 caaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaa 115  Q
    ||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |    
T  8451466 caaaatagagtgcaaggtcatagttcaatttgggagaaaccgtgcgagacgtggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatttta 8451367  T
Q  116 catcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagt 215  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8451366 catcttttggatgttgtgttagagactcttgtggacaatttattcgggctcaaacaaaaaggaagcgggcaaatatgacagtgttggagggggaggcagt 8451267  T
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  8451266 agctttactcgattccattcacttcgctgatgtgaacggatgggaccgggttgtcttcgagtctgactcatctactttagtgcaagctttatcgtctcca 8451167  T
Q  316 ggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    ||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8451166 ggtcatggtgattcggaattttatgttattgtgtctagtattatntatcagttatctttacattcaaacttcgaggtgaagtttgttangagacaagcga 8451067  T
Q  416 acatg 420  Q
    |||||    
T  8451066 acatg 8451062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 444
Target Start/End: Original strand, 7127079 - 7127495
Alignment:
Q  28 caaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgt 127  Q
    |||||||||| || | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||| | ||| |    
T  7127079 caaggtaacaacttagtttgggagaagccgagcgagacatggttgaagtggaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccgtcttacatcctctgcat 7127178  T
Q  128 gttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcga 227  Q
    ||||||||||||| | ||  ||  ||||||| || || ||||  |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7127179 gttgtgttagagactctcgggggaaatttattcgtgcacaaatgaaatggaaacgggcaaatatgaaagttttggagggggaggtagtagccttactcga 7127278  T
Q  228 tgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgat 327  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7127279 tgctattcactttgctgatgtgaacagatgggaccgggttgccttcgagtctgactatgctactttagtgcaagctctttcgtctccgggccatggtgat 7127378  T
Q  328 tctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgcta 427  Q
    |  ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7127379 ttagtattctatgttattgtttcaagtattatttatcagttatctttacattccaactttgatgtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctc 7127478  T
Q  428 ataccttagctagggcg 444  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7127479 atactttagctagggcg 7127495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 440
Target Start/End: Original strand, 23853804 - 23854200
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  23853804 tttgggagaaaccgaacgagacgtggttgaagtgcgatgtggacgccgcgttccatgaccgtaactatattacatcttttgcgtgttatgttagagactc 23853903  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
     | ||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  23853904 ccgtgggcaatttattcgggttcaaacgaaatgacagcggaaaaatatgacagttttggagggtgaggcagtagccttacttgaggccattcactttgtt 23854003  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||  || ||||| |||   ||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||| ||    
T  23854004 gatgctaacagatgagactgagttgtcttcgagtccgactcatcaactctagtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgcta 23854103  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctag 440  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  23854104 ttgtttctagtattagttatccgttatctttacattccaacttcaaggtgaactttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctag 23854200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 66 - 444
Target Start/End: Original strand, 13414917 - 13415295
Alignment:
Q  66 gtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggct 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| | ||||||| | ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||  || |||||||| ||||||    
T  13414917 gtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgtgtgtttttttagagactttcgcgggcaatttattcgggct 13415016  T
Q  166 caaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccagg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||  |||  || |||||||| |  |    
T  13415017 caaacgaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttccttttgcggatgcaaacagatgggatcgag 13415116  T
Q  266 ttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatca 365  Q
    || |||| || || || ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  13415117 ttgtctttgagtccgattcttctactctagtgcaaggtatatcgtccccgggccatggtgattctgaattttatgctattgtttttagtattatttatca 13415216  T
Q  366 tttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  13415217 attatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgctaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 13415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40589052 - 40588645
Alignment:
Q  22 agagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatctt 121  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||    
T  40589052 agagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagtgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatataacaactt 40588953  T
Q  122 ttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagcctt 221  Q
    |||| ||| |             || |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  40588952 ttgcttgtag-------------cagg--caatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatataacagttttggagggggaggcagtagccgt 40588868  T
Q  222 actcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttat 321  Q
    |||||| ||| |||  |||||  |||  || ||||| |||| |||| |||| || ||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||  ||    
T  40588867 actcgaggcccttcgttttgcggatgcaaacagatgagaccgggttgtctttgagtctgattcatctactctagtgtaaactctatcgtccccgggccat 40588768  T
Q  322 ggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatga 421  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40588767 gatgattctgaattctatgctattgtttatagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatga 40588668  T
Q  422 ttgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||  |||| ||||||||||||    
T  40588667 ttgcacatactttagctagggcg 40588645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 185797 - 185507
Alignment:
Q  152 aatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaa 251  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  185797 aatttatctgggctcaaacgaaatggaaacgggcaaatatgacagttttggagggg-aggaagtagccttactcgatactattcactttgttgatgtgaa 185699  T
Q  252 tagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttct 351  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  185698 tagatggaaccgggttgtctacgagtctgactctgctactttagtgcaagctctttcgtctccggaccatggtgattcagaattctatgctattgtttct 185599  T
Q  352 aatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||  ||||||||||||    
T  185598 agtattatttatcagttatctttacatt-cacattcgaggtgtagtttgttaggagacaagcgaacatagttggtcatagtttagctagggcg 185507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33642836 - 33642681
Alignment:
Q  287 ctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaactt 386  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33642836 ctactctaatgcaagctctgtcgtctccgggccatggtgattcagaattcaatgatattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaactt 33642737  T
Q  387 caaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  33642736 caaggcgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgttcatactttagctaggg 33642681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 11870364 - 11870535
Alignment:
Q  272 tcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatc 371  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | |  |||||||||| |  || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11870364 tcgagtctgactcagctactcttgtgcaagctctattgtctcggagccatggtgattcggatttctatgctattgtttctagtattatttatcagttatc 11870463  T
Q  372 tttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  11870464 tttacattctaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctagggc 11870535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 431
Target Start/End: Original strand, 37712017 - 37712332
Alignment:
Q  110 atctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggga 209  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | |    ||| ||||||||  | ||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  37712017 atcttacattttttgcgtgttgtgttagaaactcgtgtgggcaatttatttgagctaaaacgaaatgacagcgggaaaatatgacagttttgaagggg-a 37712115  T
Q  210 ggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcg 309  Q
    || |||||| |||    ||||||||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  37712116 ggtagtagcttta----atgccattcactttgttgatgtgaacagatgagatcaggttatcttctagtttgaccctgctactctagtgtaagctctattg 37712211  T
Q  310 tctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagac 409  Q
    ||| |||   |||||||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  37712212 tcttcggac-atggtgattcagaatactatgctattgtttctagtattatttatgagttatctttacattctaacttcgatgtgaagtctgttaagagac 37712310  T
Q  410 aagcgaacatgattgctaatac 431  Q
    | || |||||| ||||| ||||    
T  37712311 atgcaaacatggttgctcatac 37712332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 598310 - 598152
Alignment:
Q  286 gctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaact 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    || |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  598310 gctactctagtgcaagctctatcgtcttcaggtcatggtgattcgaagttctatgctattgtttctagtattatttattagttatctttacatttcaact 598211  T
Q  386 tcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  598210 tcgtggtgaaatttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctaaggcg 598152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3606874 - 3606656
Alignment:
Q  224 tcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatgg 323  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||| |||||| |||| ||| | ||| | || |||||  | ||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  3606874 tcgatgccattcaatttcttgatgtgaacagatggaaccaagttgttttcaagtccgactcaacaactttagtacaaactctatcgtctcagggtcatgg 3606775  T
Q  324 tgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgatt 423  Q
    ||| |  | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3606774 tgacttggaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattctaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaatatggtt 3606675  T
Q  424 gctaataccttagctaggg 442  Q
    | | |||| ||||||||||    
T  3606674 gttcatactttagctaggg 3606656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 444
Target Start/End: Original strand, 9496797 - 9497050
Alignment:
Q  187 aatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||  ||| |||| || ||  | || |    
T  9496797 aatatgacagttttggagggtgaggcagtagccttacttgatgacattcactttgttgatgtgaact-atgggaccgtgttgtctttgagtccaattcag 9496895  T
Q  287 ctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaactt 386  Q
    | |   |||||||| ||||||||||| || || ||||||| |  | ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||  | || ||||||| |||||||    
T  9496896 cca---tagtgcaatctctatcgtcttcgagtcatggtgacttggaattctatgttattgttgctaacattatttatctgtgatatttacatcccaactt 9496992  T
Q  387 caaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  9496993 cagagtgaagtttattaggagacaagcgaacatagttgcttatactttagctagggcg 9497050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36194626 - 36194538
Alignment:
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  36194626 tattatttatcgattatctttatatttcaatttcgagatgaagtttgttaggagacaagaaaacatggttgctcatagtttagctaggg 36194538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 16731780 - 16732205
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||||    
T  16731780 aatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaaccatattacat 16731879  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16731880 cttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagc 16731979  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||  ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16731980 cttactcgaggccattcactctgctgatgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctctatcatctccgggc 16732079  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732080 catggtgattcagaattctctgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 16732179  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  16732180 tggttgctcatactttagctagggcg 16732205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 17709914 - 17710339
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||||    
T  17709914 aatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaaccatattacat 17710013  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17710014 cttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagc 17710113  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||  ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17710114 cttactcgaggccattcactctgctgatgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctctatcatctccgggc 17710213  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17710214 catggtgattcagaattctctgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 17710313  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  17710314 tggttgctcatactttagctagggcg 17710339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 9328941 - 9328522
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9328941 aatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacat 9328842  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |  || |||||||| || |||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9328841 catttgcgtgttgtgttagagattcccg-ggacaatttattcgagctcaaacgaaatggcaacgggaaaatatgactgttttggagggggaggcagtagc 9328743  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  9328742 cttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttggagtctgactctgatactctagtgcaagctctatcgtcagcggga 9328643  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     ||||| |||| | ||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9328642 catggtaattcagaattctatgcgtttgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgatgtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 9328543  T
Q  419 tgattgctaataccttagcta 439  Q
    || ||||| |||| |||||||    
T  9328542 tggttgctcatactttagcta 9328522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 22289088 - 22289513
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||| | ||||    
T  22289088 aatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaagccgcgtgagacgtggtttaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacat 22289187  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||| || ||| |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22289188 ctttcgcgtgttgtgttagagattcccgtgggcaattcattcggactcagacgaaatggcaacgagcaaatatgacagttttggagggggaggtggttgc 22289287  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||| | |||||||| || | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22289288 cttactcgatgccattcactttgccgttgggaacaaatgggaccgggctgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggc 22289387  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22289388 catggtgattcagaattttatgctattgtttctagtattatttttcagttatctttacattccaacttcgaggtgatgtttgttaggagacaagcgaaca 22289487  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||    
T  22289488 tggttgctcatagcttagctagggcg 22289513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 66 - 444
Target Start/End: Original strand, 16098384 - 16098762
Alignment:
Q  66 gtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggct 165  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||    
T  16098384 gtggttgaagtgcaatgtggacgcatcgttccatgaccgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagactcccataggcaatttattcgggct 16098483  T
Q  166 caaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccagg 265  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||| |||||| |||  || | |||||||| ||    
T  16098484 caaacgaaatggaaacgaacaaatatgacaattttggagggagaggtagtagccttactagaggcccttcaatttgctgatgctaacaaatgggaccggg 16098583  T
Q  266 ttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatca 365  Q
    || ||||||| || |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16098584 ttgtcttcgagtccgactcatctactctagtacaagctccatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgatattgtttctagtattagttatca 16098683  T
Q  366 tttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  16098684 gttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttatgagacaagcgaacatggttgctcatattttagctagggcg 16098762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29201294 - 29200870
Alignment:
Q  14 gacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatct 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||        |||| |    
T  29201294 gacaaaatacagtgcaaggtaatagctcagtttgggagaaaccgcacgagacgtggttgaagtgcaatgttgatgccgctttccat--------ccatat 29201203  T
Q  114 aacatcttttgcgtgttgtgttagagatt--ttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggagg 211  Q
     | ||||||||| |||||| ||||||| |  |   ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29201202 tatatcttttgcatgttgtattagagactcatgtgtggccagtttattcgggctcaaacgaaatgacagcggacaaatatgacagttttggagggggagg 29201103  T
Q  212 aagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtc 311  Q
     || |   ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29201102 tagcatgtttacttgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggaaacgggttgtcttcgagtctgactcagctactctagtgcaagctctatcgtc 29201003  T
Q  312 tccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaa 411  Q
    || |||  |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29201002 tctgggccatggtgattcagaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaa 29200903  T
Q  412 gcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
     |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  29200902 acgaacatggttgctcatactttagctagggcg 29200870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30493949 - 30493525
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||| ||| |||| ||||| | || ||||| ||||| ||| ||| | |||||| ||||| ||| ||||||  || |||||||||  |||||| || ||||    
T  30493949 aataaagtgcaagataacaacacagtttggaagaaatcgaacgaaacgtggttaaagtgcaatatggatgtcgcattccatgactgtaaccaacttacat 30493850  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30493849 attttgcgtgttgtgttagaaattctcatgggcaatttactcaggctcaaacgaaatggcagcagacaagtatgacagttttggagggg-aggcagtagc 30493751  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30493750 cttacttgatgtcgttcacttagctgatatgaacagatgagaccaggttgtcttcgagtccgactcaattactctagtgcaagctctatcgtcttcgggc 30493651  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30493650 catggtgattcagaattttatgctattgtttatagtattatttatcagttatctttacatttcaacttcatagtgaagtttgttaggagacaaccaaaca 30493551  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||| | |||| ||||||||||||    
T  30493550 tggttgttcatactttagctagggcg 30493525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 1581458 - 1581864
Alignment:
Q  15 acaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatcta 114  Q
    ||||| || ||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  1581458 acaaagtatagtgcaacgtaacaactcagtttgggagaaactgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccataaccatatt 1581557  T
Q  115 acatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggg-aggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |     ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||| | | |    
T  1581558 acatcttttgcgtgttgtgctagagactccagcggatagtttatccgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatattatagtttttgaggggggatgca 1581657  T
Q  214 gtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctc 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || | |||| | || || ||  ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  1581658 gtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacagatgagatcgggttctattggagtccaactcatctacactaatgcaaactctatcgtctc 1581757  T
Q  314 cgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagc 413  Q
    |||   ||||||||||   ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1581758 cggaccatggtgattcgaaattctatgccattgtttataatattatttatcagttatctttacatttcaacttcgatgtgaagtttgttaggagacaagc 1581857  T
Q  414 gaacatg 420  Q
    |||||||    
T  1581858 gaacatg 1581864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Original strand, 17877259 - 17877667
Alignment:
Q  23 gagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttt 122  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||   ||||||| | |||| | |    
T  17877259 gagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaaatgcaatgtggatgtcgcgttccatgattgtaaccatattacatttgt 17877358  T
Q  123 tgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagcctta 222  Q
    ||||||| | |||| ||| |  |||||  | || || || |||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17877359 tgcgtgtggcgttatagactcccatgggaagttcattcgtgctcaaacgaaatcgcagcggggaaatatgacagtattggagggggaggaagtagcctta 17877458  T
Q  223 ctcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatg 322  Q
    ||| | ||| |||||||| | |||| ||| |||||| | | |||| ||||||| ||||||||          |||||||||||||||| |  |||| |||    
T  17877459 ctcaaggcccttcactttacaaatgcgaacagatggaatcgggttgtcttcgagtctgactc----------gtgcaagctctatcgtttatgggtcatg 17877548  T
Q  323 gtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgat 422  Q
    |||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  17877549 gtgattcgtaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacatttcaatttcgaggtgaagtttgttatgagacaagcgaccatggt 17877648  T
Q  423 tgctaataccttagctagg 441  Q
    |||| |||| |||| ||||    
T  17877649 tgctcatactttaggtagg 17877667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 444
Target Start/End: Original strand, 3601767 - 3601924
Alignment:
Q  287 ctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaactt 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3601767 ctactctagtgcaagctttatcgtctctggaccatggtgattcagaattttatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattctaaatt 3601866  T
Q  387 caaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  3601867 cgaggtgaagtttgttaggagacaatcgaacatggttgctcatagtttagctagggcg 3601924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30824763 - 30824418
Alignment:
Q  70 ttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaa 169  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||  ||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  |  |   ||||||| |||||| |||    
T  30824763 ttgaagtgcaatgtggatgctacatttcatgactgtagtcatattacatcttttgcatgttgtgttagagactgccgcgaataatttattcgggctaaaa 30824664  T
Q  170 caaaatgg-cagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggtta 268  Q
     ||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||     
T  30824663 aaaaaaagacagcggataaatatgacagttttgaaggg--aggcagtagccttactcgaggcccttcacttttctaatgcgaacagatgggatcaggttg 30824566  T
Q  269 tcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcattt 368  Q
    |||||||                   ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  30824565 tcttcga-------------------gtgcatgctctatcgtctctgggtcatggtgattcagaattctatgttattgtttctagtcttatttatcagtt 30824485  T
Q  369 atctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaatacctta 435  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30824484 atctttacattccaactttgaagtgaagtttgttaggagataagcgaacatggttgctcatacctta 30824418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 444
Target Start/End: Original strand, 3275082 - 3275307
Alignment:
Q  220 ttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggtt 319  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  || ||| | || ||||  |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||      
T  3275082 ttactcaatgctattcactttgctgttgggaacatataggactgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcatctctaggcc 3275181  T
Q  320 atggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacat 419  Q
    | | ||||||   |||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3275182 acgatgattcataattttatgctattgtttttagtattatttttcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaagagacaagcgaacat 3275281  T
Q  420 gattgctaatacctt-agctagggcg 444  Q
    | ||| | ||| ||| ||||||||||    
T  3275282 ggttgatcatagcttaagctagggcg 3275307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Original strand, 24251621 - 24251711
Alignment:
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  24251621 tattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 24251711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 354 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33224565 - 33224476
Alignment:
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  33224565 tattatttttcagttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctcataacttatctagggc 33224476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Original strand, 44481269 - 44481359
Alignment:
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  44481269 tattatttaccagttatctttacatttcaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 44481359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 426
Target Start/End: Original strand, 47580052 - 47580129
Alignment:
Q  349 tctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47580052 tctagtattatttatcagttatctttatattccaacttcgaggtgaagtttggtaggagacaagcgaacatggttgct 47580129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Original strand, 24139221 - 24139283
Alignment:
Q  382 aacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  24139221 aacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 24139283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 359
Target Start/End: Original strand, 24139139 - 24139218
Alignment:
Q  280 gactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattat 359  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24139139 gactcagctactctagtgcaagctctgtcgtctccgggtcatgttgatttgaaattttatgctattgtttctagtattat 24139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35030643 - 35030573
Alignment:
Q  370 tctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctag 440  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35030643 tctttacattccaactttgaggtgaagtttgcgaagagacaagcgaacataattgctcatactttagctag 35030573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34578522 - 34578437
Alignment:
Q  115 acatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagtttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  34578522 acatcttttgcgtgttgtgttcgaaattcccgtgggcaatttattcgggctcagacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtttt 34578437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 444
Target Start/End: Original strand, 35013759 - 35013831
Alignment:
Q  372 tttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||  ||| ||||||||||||    
T  35013759 tttacattccaatttcaagttgaagtttattaggagacaagcaaatatggtcgctcgtactttagctagggcg 35013831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Original strand, 44480897 - 44480968
Alignment:
Q  269 tcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatg 340  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  44480897 tcttcgagtccgactccgctactctactgcaaacgttatcgtctccgggtcatggtgattcggaattttatg 44480968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 3601683 - 3601728
Alignment:
Q  194 cagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactt 239  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  3601683 cagttttggagggggaggtggtagccttactcgaggcccttcactt 3601728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 443
Target Start/End: Original strand, 28106983 - 28107410
Alignment:
Q  16 caaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | ||| ||  |||||||||| | ||||||||| |    
T  28106983 caaaatagagtgcaaggtaacatctcagtttgggagaaaccaaacgagacgtggttgaagtgcaacgaggaagccacgttccatgatcgtaaccatctta 28107082  T
Q  116 catcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagt 215  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |  | ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28107083 catctttcgtgtgttgtgttagagactcccgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatggcagcggacagatatgacagttttggagggggaggcagt 28107182  T
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28107183 agccttacttgatgccattcactttgcaaatatgaatagatgggatcacgttgtcttcgagtctaactccgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 28107282  T
Q  316 ggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    ||  |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |    
T  28107283 ggccatggtgattcagaattctatgttattgtttctagtattatttattagttatctttacattccaacttcgagctgtagtttgttaggagacaaccaa 28107382  T
Q  416 acatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  28107383 acatggttgctcatactttagctagggc 28107410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15606320 - 15605909
Alignment:
Q  33 taacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgt 132  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||| || || || || | ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15606320 taacaactcagtttgggagaaaccgcacgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcatttcacgatcgtaaccatattacatctttttcgtgttgt 15606221  T
Q  133 gttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgcca 232  Q
    |||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15606220 gttagagactcccatgggcaacttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggaaaacatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgcca 15606121  T
Q  233 ttcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgt 332  Q
    ||||||||| | ||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |     
T  15606120 ttcactttgttgatgggaacaaatgggaccgggttgtcttcaagtccgactcagctactctagtgcaagctctatcgtctctaggtcatggtgattcaga 15606021  T
Q  333 attttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaatacc 432  Q
    |   |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |     
T  15606020 acactatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaattttgttagcagacaagcgaacatggttgctcatgct 15605921  T
Q  433 ttagctagggcg 444  Q
    ||||||||||||    
T  15605920 ttagctagggcg 15605909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 14680006 - 14680434
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||  | ||||    
T  14680006 aatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggataccgcgttccatgaccgcaaccacattacat 14680105  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggt---caatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |  ||    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14680106 cttttgcatgttgtgttagagactcccgcggcgggcaatttattatggctcaaatgaaatggcagcgggaaaatatgacagtattggagggggaggcagt 14680205  T
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||  || |||||| |||  ||| |||| || || |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14680206 agccttactcgaggcccttcactctgctgatgcaaacagatggaaccgagttgtctttgattccgactcgtctactctattgcaagctctatcatctccg 14680305  T
Q  316 ggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    ||   |||||||||   ||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14680306 ggcagtggtgattcaaaattctctgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacatgcga 14680405  T
Q  416 acatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14680406 acatggttgctcatactttaactagggcg 14680434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15053429 - 15053091
Alignment:
Q  105 taaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggag 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  15053429 taaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagacttcagtggacaatttattcgggctcaaacaagatgacagcgggtaaatatgatagtgttggag 15053330  T
Q  205 ggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctc 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| | ||| ||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |    
T  15053329 ggggaggcagtagccttactcgatgccattcgccttgctgacgtgaaaaaatgagacaaggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaaacgc 15053230  T
Q  305 tatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttag 404  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||| | ||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15053229 tatcgtcttcgggccatggtgattcggaattctatgctgttgcttataatattatttatcaattatatttacattccaatttcgaggtgaagtttgttag 15053130  T
Q  405 gagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
     |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15053129 aagacaagcaaacatgattgctcatactttagctagggc 15053091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29368365 - 29367996
Alignment:
Q  42 aatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagat 141  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||| |||     ||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  29368365 aatttgggagaaatcgaacgaaatgtggttgaagtgaaatgtggacgctgcagttcatgaccgtaa-----taa-atcttttgcgtgttgtgtttgagac 29368272  T
Q  142 tttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttg 241  Q
    | || ||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||||    
T  29368271 tctcgtggacaatttattcg--ctcaaaagaaatggcagcggataaatatgacagttttggagggggaggcaatatccttactcgaggcccttcactttg 29368174  T
Q  242 ctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatga 341  Q
    || |||  |||||||||||||    | | ||||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||| ||||     
T  29368173 ctgatgctaatagatgggacctaactgttttcgagtccgactcatctactatagtgcaagctctatcgtctccgggtcatagtgattcgtaattctatgc 29368074  T
Q  342 tattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacat 419  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29368073 tattgcttctagtattagttatcagttatctttaccttccaacttcaaggtaaagtttgttaggaaacaagcgaacat 29367996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19691073 - 19690812
Alignment:
Q  165 tcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccag 264  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||      
T  19691073 tcaaacgaaatgacaacggacaaatatgaccgttttggaaggggaggcaatagccttattcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatgtgaccga 19690974  T
Q  265 gttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatc 364  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||  | ||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19690973 gttgtcttcgagtctgactcagctactttagtgcaagctctatcgtctctgagtcatggtgatttggaattctatgtcattgtttctagtattatttatc 19690874  T
Q  365 atttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    | |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19690873 agttatctttacatttaaactttgaggtgaagtttgttaggaaacaagcgaacatgattgct 19690812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11731873 - 11731585
Alignment:
Q  152 aatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||  |  ||||||||||| ||| |||    
T  11731873 aatttatccgggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggg-aggcagcagcct--ctcgagactcttcactttgctgatgagaa 11731777  T
Q  252 tagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttct 351  Q
     | || ||| |||||| ||||||| || ||||||   | | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| |  || |||| || |||||||    
T  11731776 catataggaacaggttgtcttcgagtccgactctttcaatatagtgcaagctctattgtctccgggccatggtggttcggagttctatgctactgtttct 11731677  T
Q  352 aatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  11731676 agtaatatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggaggcaagcgaacatggttgctcatactttagctagggc 11731585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30802199 - 30801985
Alignment:
Q  151 caatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtga 250  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  30802199 caatttattcgggcttaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggtgggggaggcagtagccttactagatgccatttactttgcagatgtga 30802100  T
Q  251 atagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttc 350  Q
    | | ||||||| ||||| ||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |  | ||| |||| |||||||||    
T  30802099 aaaaatgggactaggttgtcttcgagtccgattcagctactttagtgcaagctctatcgtttccgagccatggtgacttggaattctatgttattgtttc 30802000  T
Q  351 taatattatttatca 365  Q
    || ||||||||||||    
T  30801999 tagtattatttatca 30801985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34104538 - 34104380
Alignment:
Q  286 gctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaact 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  34104538 gctactctagtgcaagcgctatcgtctccggaccatggtgattcagaattttatgctattgtttttagtattatttttcagttatctttacattcgaact 34104439  T
Q  386 tcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  34104438 tcgaggtgaagtttgttaggagacaagcaaacatggttgctcatagcttagctatggcg 34104380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 444
Target Start/End: Original strand, 27443039 - 27443205
Alignment:
Q  280 gactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacatt 379  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  27443039 gactcagctactctagtgca-gcgctatcgtctctaggccatggtgattcagaattttatgctattgtttctagtattatatttcagttatctttacatt 27443137  T
Q  380 cca---acttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||   ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  27443138 ccaccaactttgaggtgaagtttgttaggagagaagcgaacatggttgctcatagcttagctagggcg 27443205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 422
Target Start/End: Original strand, 3100409 - 3100496
Alignment:
Q  336 ttatgatattgtttctaatattatttatcatttatcttt-acattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgat 422  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3100409 ttattatattgtttatagtattatttatcagttatcttttacattccaactttgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgat 3100496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21944667 - 21944551
Alignment:
Q  320 atggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacat 419  Q
    ||||| |||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||    
T  21944667 atggtaattcagaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatttttatattccaacttcgatgtgaagtttgttaaaagacaagcgatcat 21944568  T
Q  420 gattgctaataccttag 436  Q
      ||||| |||| ||||    
T  21944567 tgttgctcatactttag 21944551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11731989 - 11731885
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||  || |||||||||  |||| || | ||||    
T  11731989 aatatagtgcaaggtaacaactcagcttgggagaaactgagcgagacgtggtggaagtgcaatgtagatgacgcattccatgactgtaacaatattacat 11731890  T
Q  119 ctttt 123  Q
    |||||    
T  11731889 ctttt 11731885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19364288 - 19364217
Alignment:
Q  16 caaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatg 88  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  19364288 caaaatcgagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgagcgaga-gtggttaaagtgcattgtggatg 19364217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32577386 - 32576964
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32577386 aatatagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgag-gagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccttaaccatcttacat 32577288  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  32577287 cttttgcgtgttgtgttagagattcccgggg-caatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgactgttttggagggggaggtactagc 32577189  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| |||| || | |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  32577188 cttactcgctgctatttactttgctgatgtaaacatatgggactgggttgtcttcgagtctgactctgctactctagtgcaagctcaatcgtcagcggga 32577089  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| ||||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577088 catggtgattcagaattctatgcgattgtttatagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 32576989  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    || ||||| |||| |||||||||||    
T  32576988 tggttgctcatactttagctagggc 32576964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37246167 - 37245767
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |     
T  37246167 tttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaatcgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagactc 37246068  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
     |  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37246067 ccgagggaaatttattcgggcacaaacgaaatggaaacgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgctattcactttgct 37245968  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| | ||| |||| ||    
T  37245967 tatgtgaacagatgggaccgggttgtcttcgagtctgactctgctactttagtgcaagctctttcgtctctgggccatggtgattcagaattctatgcta 37245868  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  37245867 ttgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaatcgaacatggttgctcatactttagctagggc 37245768  T
Q  444 g 444  Q
    |    
T  37245767 g 37245767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 444
Target Start/End: Original strand, 49951151 - 49951585
Alignment:
Q  10 cacagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataacc 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  49951151 cacaggcataatagagtgcaaggtaacaactcagttttggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcattccatgaccgcaacc 49951250  T
Q  110 atctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggga 209  Q
    || | ||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  49951251 atattacatcttttgcatgctgtgttagagattctcgcggccaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagtattggaggggga 49951350  T
Q  210 ggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcg 309  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||  ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  49951351 ggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctttatca 49951450  T
Q  310 tctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagac 409  Q
    ||| ||||   ||||||||| | ||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49951451 tcttcgggccgtggtgattcagaattctctgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagac 49951550  T
Q  410 aagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  49951551 aagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 49951585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51735311 - 51734887
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||    
T  51735311 aatagggtgcaatgtaacatctcagtttgggcgaaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgattgtaaccatcttacat 51735212  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | | | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51735211 cttttgtgtgttgtgttagagacttccgttgacaatttattcgggcttaaacgaaatgacagcgtgcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagc 51735112  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  51735111 cttactcgatgccattcactttgctgatgtgaatagataggacga-gttgtcttcgagtcaggctcctctactctagtgcaagctctatcgtctctggac 51735013  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51735012 catggtgattcataattctatgatattgtttctagtattatttatctgttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggtgacaagtgaaca 51734913  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  51734912 tggttgctcatactttagctagggcg 51734887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29656005 - 29655581
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  29656005 aatagaatgcaaggtaatatctcagtttggaagaaaccgagtgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgatcgtaaccctcttacat 29655906  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||  |||||||||||||  |  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29655905 cttttgt-tgttgtgttagaggctcccgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgactgttttggagggagaggcagtagc 29655807  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  29655806 cttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggaaccgtgttgtcttcgagtctgactacgctactctagtgcaagctctatcatcttcgggc 29655707  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29655706 catggtgattcagaattctatgttattgtttctagtattatttatcagctatctttacatttccacttcgagatgaagtttgttaggagacaagcgaaca 29655607  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  29655606 tggttgctcatactttagctagggcg 29655581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Original strand, 2064695 - 2065123
Alignment:
Q  14 gacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatct 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |    
T  2064695 gacaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgagcgagtcgtggttgaagtgcaatgtggacgccacgttccatgaccgtaaccatat 2064794  T
Q  114 aacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaa 213  Q
     ||||| | |||||||||||||||||| |  |  ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  2064795 tacatcctctgcgtgttgtgttagagactcccgcggataatttattcgggctcaaacaaaatgacagcgggcaaatatgacagtattgaagggggaggca 2064894  T
Q  214 gtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctc 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||   | |||| |||| || || |||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  2064895 gtagccttactcgacgcccttcactttgctgatgagaacagatggagtcgggttgtctttgagtcggactcatctactctagcccaagctctatcgtctc 2064994  T
Q  314 cgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagc 413  Q
    | ||| ||||||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2064995 caggtcatggtgattcgaaattatatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacatttcaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaaac 2065094  T
Q  414 gaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  2065095 gaacatggttgctcatactttagctaggg 2065123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51259870 - 51259444
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||| | ||||    
T  51259870 aatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaaccgcgtgagacgtggttgaactgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacat 51259771  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggg-aggaagtag 217  Q
    |||| |  |||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  51259770 ctttcgtatgttgtgttagagactctcgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgacagttttggaggggggaggcagttg 51259671  T
Q  218 ccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccggg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || ||  || | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51259670 ccttactcgatgtcattcactttgctgttgggatcagttcggaccaggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtcttcggg 51259571  T
Q  318 ttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaac 417  Q
      |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259570 ccatggtgattcagaattttatgttattgtttctagtattatttttcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaac 51259471  T
Q  418 atgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  51259470 atggttgctcatagcttagctagggcg 51259444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18442493 - 18442062
Alignment:
Q  11 acagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataacca 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||  |||||    
T  18442493 acagacaaaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgcggatgtcgcgttccatgaccgcaacca 18442394  T
Q  111 tctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggag 210  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18442393 tattacaacttttgcgtgttgtgttagagactcccatgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggaagcgggaaaatatgacagtattggagggggag 18442294  T
Q  211 gaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgt 310  Q
    | ||||||||||||||| ||| | |||||||||  || ||| |||||| ||| |||||| ||||| |  |||||  |||  |||||||||||| ||||||    
T  18442293 gcagtagccttactcgaggccctacactttgctgttgcgaacagatggaaccgggttattttcgagtgcgactcatcta--ctagtgcaagctatatcgt 18442196  T
Q  311 ctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagaca 410  Q
    ||  ||   |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18442195 ctttggcccatggtgattcagaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttatattccaacttcaaggtgaagtttgttatgagaca 18442096  T
Q  411 agcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    | |||| ||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  18442095 aacgaaaatggttgctcatattttagctagggcg 18442062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 55734848 - 55735248
Alignment:
Q  11 acagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataacca 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |  |||||    
T  55734848 acagacaaaatagagtgcaaggtaacaactcggtttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgctccatgatctcaacca 55734947  T
Q  111 tctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggag 210  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| | ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  55734948 tattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcccatgagcaatttgttcgggctcaaacgaaatggaagcgagcaaatatgacagtattggagggggag 55735047  T
Q  211 gaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgt 310  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |  || ||| | |||| ||| |||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  55735048 gcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgttgcgaacacatggaaccgggttattttcgagtccgattcatctactctagtgcaagctctatcgt 55735147  T
Q  311 ctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagaca 410  Q
    || |||   |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55735148 cttcggaccatggtgattcagaattctatgctattgtttctagtattattgatcagttatcttaacatttcaacttcgaggtgaagtttgttaggagaca 55735247  T
Q  411 a 411  Q
    |    
T  55735248 a 55735248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 56065476 - 56065905
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||| | | ||| | ||||    
T  56065476 aatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaactgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatgaccgtcaacatattacat 56065575  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |  | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  56065576 ctttcgcgtgttgttttagagactcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagttttggagggggaggcagttgc 56065675  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |      
T  56065676 cttactcgatgccattcactttgctgttgggaatatatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcatctccagac 56065775  T
Q  319 tatggtg----attctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcg 414  Q
     ||||||    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  56065776 catggtgattaattcggaattttatgctattgtttctaatattatttttcagttatctttacattccaacttcgagatgaagtttgttaggagacaagcg 56065875  T
Q  415 aacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  56065876 aacatggttgctcatagcttagctagggcg 56065905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28538123 - 28537720
Alignment:
Q  21 tagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatct 120  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||| |    
T  28538123 tagagtgcaaggtaacaattcagtttgggagaaaccgaacgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgatcgtaaccatattacatat 28538024  T
Q  121 tttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagcct 220  Q
    |||||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  28538023 tttgcgtgttgtgttagagactcccacgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggaaaatatgatagttt--gagggggaggcagtagcct 28537926  T
Q  221 tactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggtta 320  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| | ||| | || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |    
T  28537925 tactcgaggcccttcactttgttgatgcgaacagatgggaccgggttgtgttcaagtccgactcatctactttagtgcaagctctatcgtctctgggcca 28537826  T
Q  321 tggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 420  Q
    |||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28537825 tggtgattcaaaattctatgctattgtttctagtattattaatcagttatcattacattccaacttcgaggtgaagtttggtagaagacaagcgaacatg 28537726  T
Q  421 attgct 426  Q
     |||||    
T  28537725 gttgct 28537720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 21321374 - 21321802
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| ||||| |||| | || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||     
T  21321374 aatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaatcgagcgaaacgtggttgaagtgcaatgtggatgttgcgttccatgaccgtaaccatattacaa 21321473  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||  ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  21321474 cttttgcatgttgtattagagactctcgcgggaaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagttttggagggggagacaatagc 21321573  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaa--gctctatcgtctccgg 316  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||  || |||||||||| |||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  21321574 cttactcgaggcccttcacttttctgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaattgctctattgtctcagg 21321673  T
Q  317 gttatggtgattctgtattttatgatattgt-ttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    || |||||||||| | ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21321674 gtcatggtgattcagaattctatgttattgtgttccaatattatttatcagttagctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaagagacaagcga 21321773  T
Q  416 acatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
     |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  21321774 tcatggttgctcatactttagctagggcg 21321802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 49119727 - 49119320
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    ||||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49119727 aatagagtgtaaggtaacaacccagtttgggataaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacat 49119628  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||               | ||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49119627 cttttgtgtgttgtgttagagattcc-------------ttcgggctcaaacgaaatggcaacaggcaaatatgactgttttggagggggaggcagtagc 49119541  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  49119540 cttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttcaagtctgactctgatactctagtgccagctctatcgtcagcggga 49119441  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     ||||| |||  | ||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49119440 catggtaatttagaattatatgcgattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggagaagtttgttaggagacaagcgaaca 49119341  T
Q  419 tgattgctaataccttagcta 439  Q
    || ||||| |||| |||||||    
T  49119340 tggttgctcatactttagcta 49119320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41835627 - 41835250
Alignment:
Q  43 atttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagatt 142  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  41835627 atttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccacgttccttgaacgtaaccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagact 41835528  T
Q  143 ttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgc 242  Q
     ||   | |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || |||| |||||    
T  41835527 ctcgcagacaatttattcgggctcaaacaaaatgacagctggcaaatatgacagttttggagggggatgcagtagccttactcgagacccttcattttgc 41835428  T
Q  243 taatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgat 342  Q
      |||  || |||||||||| |||| ||||||| |  || ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| | ||  |||| |    
T  41835427 ggatgcaaacagatgggaccgggttgtcttcgagttcgattcatctactctagtgcaaacgctatcgtctccgggccatggtgattcggaatcctatgct 41835328  T
Q  343 attgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 420  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835327 attgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaatttcgagatgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 41835250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 28426068 - 28426450
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  28426068 tttgggataaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagattc 28426167  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
                  | ||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28426168 c-------------ttcgggctcaaacgaaatggcaacaggcaaatatgactgttttggagggggaggcagtagccttactcgctgctattcactttgct 28426254  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||| || |||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||  ||||| |||  | ||| ||||  |    
T  28426255 gatgtaaacagatgggaccgggttgtcttcaagtctgactctgatactctagtgccagctctatcgtcagcgggacatggtaatttagaattatatgcga 28426354  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagcta 439  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  28426355 ttgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggagaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagcta 28426450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43840647 - 43840305
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| ||||  |||| || | ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||  || |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  43840647 aatagagtgcaagacaacaacttagtttgggagagaccgcacgagacgtggttgaagttcaacgtggatgccgcgttctatgagcataaccatcttacat 43840548  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggag-gaagtag 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  | ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |     
T  43840547 cttttgcgttttgtgttagagactcccgtggacaatttattcggggtcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagtgttggagggggagacaacaac 43840448  T
Q  218 ccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccggg 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| | || ||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  43840447 ctttactcgatgccattcactttgctgatgtgaacaaatgagaccggtttgtcttcgagttcgactcagctactctaatgcaagctctatcgtcttcgga 43840348  T
Q  318 ttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatt 360  Q
      |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  43840347 ccatggtgattcggaattctatgctattgtttctagtattatt 43840305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26422762 - 26422517
Alignment:
Q  199 ttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgc 298  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26422762 ttggagagggaggcagtagccttactcgatgctatttactttgctgatgtaaacagatgggatcgggttgtcttcgagtctgactctgatactctagtgc 26422663  T
Q  299 aagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtt 398  Q
    |||||||||||||  ||||  || ||||||| | ||| ||||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26422662 aagctctatcgtcagcgggacatagtgattcagaattctatgcgattgtttttagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtt 26422563  T
Q  399 tgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||||| |||| ||| ||| ||||    
T  26422562 tgttaggagacagacaaacatggttgctcatactttaactacggcg 26422517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47226493 - 47226263
Alignment:
Q  196 gttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctag 295  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| ||||| || |  ||| | ||||| || |||||  ||||| |||    
T  47226493 gttttggagggggaggtaatagtcttactcgaggcttttcactttgctgatgcgaacagatgagatcgagttgtgttcgagtccgactcatctactttag 47226394  T
Q  296 tgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaa 395  Q
     |||||||||||||||| | ||  |||||||||| |  || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47226393 agcaagctctatcgtcttcaggccatggtgattcagatttatatgctattgtttctagtattatttatcaattatctttacattccaacttcaaagtgaa 47226294  T
Q  396 gtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    |  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47226293 gaatgttaggcgacaagcaaacatgattgct 47226263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24990093 - 24989851
Alignment:
Q  189 tatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgct 288  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||           ||| |||| || |||||||| |||    
T  24990093 tatgacagttttggaagtggagacagtagccttactcgatgtcattcactttactaatgggattat----------gttgtctttgagtctgactcagct 24990004  T
Q  289 actctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttca 388  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||   ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24990003 actctagtgcaagctctaccgtctctgggccacggtgattcaaaattctatgttat-gtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcg 24989905  T
Q  389 aggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||| ||| ||||||    
T  24989904 aggtgaagtttgttaagagacaaacgaacacggttgcttatactttatctaggg 24989851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 44936153 - 44936002
Alignment:
Q  288 tactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttc 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||  | |||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44936153 tactctagtgcaaactctatcgttttcgggccacggtgatttagaattctatgttattgtttctattattatttatcagttatctttacattccaacttc 44936054  T
Q  388 aaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagcta 439  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  44936053 gaggtgaagtttgttagcagacaagcgaacatggttgctcatagtttagcta 44936002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 442
Target Start/End: Original strand, 23095401 - 23095484
Alignment:
Q  359 tttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  23095401 tttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattactcatattttagctaggg 23095484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8754480 - 8754396
Alignment:
Q  342 tattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8754480 tattgtttttagtattatttatcaattatctttacattccaacttcgagatgaagtttgttatgagacaagcgaacatggttgct 8754396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 66 - 441
Target Start/End: Original strand, 12660210 - 12660585
Alignment:
Q  66 gtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggct 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  12660210 gtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactttcatggacaatttattcgggct 12660309  T
Q  166 caaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccagg 265  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |    
T  12660310 caaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagtgttagagcgggaggcagtagtcttactcgatgtcattcactttgctaatgtgaacaaatgagaccgtg 12660409  T
Q  266 ttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatca 365  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12660410 ttatcgtcgagtctgactcagctactctagtgcaagctctatcgtcttcgggccacggtgattcagaattctatgatattgtttctagtattatttttca 12660509  T
Q  366 tttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
     |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  12660510 gttatgtttacattctaacttcgagctgaagtttgttaggagacaagcgaacatgactgctcatactttagctagg 12660585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15989089 - 15988664
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||  |||||| | |||     
T  15989089 aatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgttgttgaagtgaaatatggatgtcgcgttccatgaccgcaaccatattacaa 15988990  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||  |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15988989 cttttgcgtgttatgtcagagactttcgcgagcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtaac 15988890  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  15988889 cttactcgaggccctttactttgctgatgcgaacatatgggaccgggttgtcttcaagtccgtctcagctactctagtgcaatctctatcgtcttcaggc 15988790  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15988789 catggtgattcggaattctatgttattgtttctagtattatttatcagttatctttacattacaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcagaca 15988690  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||    
T  15988689 tggttgctcatactttagctaaggcg 15988664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 8387933 - 8388356
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| | |  || | ||||    
T  8387933 aatagagtgcaagctaacaactcagtctgggagaaaccgcgtgagacgtggttgaagtacaatgtggatgccgcgtttcatgaccgttaaaatattacat 8388032  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8388033 ctttcgcgtgttgtgttagagactctcgtgggcaattcattcaggctcaaacgaaatggcaacgaacaaatatgacagttttggagggggaggcagttgc 8388132  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8388133 cttactcgatgccattcactttgcggttgggaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccaggc 8388232  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8388233 catggtgattcagaattttatgctattgtttccagtattatttttcagttttctttacattccaacttcgaggggaagtttgttaggagacaagcgaaca 8388332  T
Q  419 tgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    || ||||| ||| |||||||||||    
T  8388333 tggttgctcatagcttagctaggg 8388356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 443
Target Start/End: Original strand, 20204799 - 20205226
Alignment:
Q  16 caaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaa 115  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  20204799 caaaatagagtgtaaggtaataactcagtttgggagaaaccaaatgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccataaccatatta 20204898  T
Q  116 catcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagt 215  Q
    |||||||| | | ||||| |||||| |  |  ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20204899 catcttttacattttgtgctagagactcccgcgggaaatttatccaggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagtattggagggggaggcagt 20204998  T
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  || ||| |||||| |||  ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20204999 agccttactcgaggccattcactttgttgttgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcctctccg 20205098  T
Q  316 ggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    ||| ||||||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20205099 ggtcatggtgattcaaaattctatgctattgtttctagtattatatatcagttatctttacattccaacttctaggtgaagtttgttaggagacaagcga 20205198  T
Q  416 acatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  20205199 acatggttgctcatactttagctagggc 20205226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26597772 - 26597390
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||| || |  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |     
T  26597772 tttgggagaaatcgtgtaagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgatcatcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactc 26597673  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
     | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26597672 ccgtggacaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgacaattttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgca 26597573  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
      || ||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||    
T  26597572 gttgggaatagatgagaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgtta 26597473  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26597472 ttgtttctagtattatttttcaattatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgct 26597390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 4267971 - 4268371
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  4267971 tttgggagaaaccgaacgagtcatggttaaagtgcaacgtggacgccgcgtttcttgattgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactc 4268070  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
    || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  4268071 tcgtgggcaatttattcaggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactagaggcccttcactttgct 4268170  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||  || || ||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| |||| ||    
T  4268171 gatgctaacaggtgggaccgggttttcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcggaattctatgcta 4268270  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  4268271 ttgtttctagtattaattctcagttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaggagacaagcgaacatggttgctcatactttatctagggc 4268370  T
Q  444 g 444  Q
    |    
T  4268371 g 4268371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 25730688 - 25731080
Alignment:
Q  52 aaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtc 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||  |||  |||||||||||||||  |  |  ||      
T  25730688 aaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggattccgcgttccatgaccgtaaccatattacaattttcacgtgttgtgttagagtctcacgcggga 25730787  T
Q  152 aatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaa 251  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||    
T  25730788 aatttattcgagctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaa 25730887  T
Q  252 tagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttct 351  Q
     |||||||||   ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||    
T  25730888 cagatgggactgagttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcagggtcatggtgattaagaattctatgttattgtttct 25730987  T
Q  352 aatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  25730988 agtattatttatcagttatatttacattccaacttccaggtgaagtttgttaggagataagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 25731080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22767600 - 22767188
Alignment:
Q  16 caaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |    
T  22767600 caaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgacagtaatcatctta 22767501  T
Q  116 catcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22767500 catcttttgcgtgttgtgttagagattcccgggggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgactgttttggagggggaggcagt 22767401  T
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22767400 agccttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttcgagtttgactctgatactctagtgcaagctctatcgtcagcg 22767301  T
Q  316 ggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    ||  ||||| |||| | ||| ||||  ||||                ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22767300 ggacatggtaattcagaattctatgcgattg----------------tcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaaacga 22767217  T
Q  416 acatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  22767216 acatggttgctcatactttagctaaggcg 22767188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41941077 - 41940655
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  41941077 aatagagtgcaaggtatcaacccaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaactatcttacat 41940978  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcg-gacaaatatgacagttttggagggggaggaagtag 217  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |  | |||  ||||||| || |||||||| ||||| ||    || |||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  41940977 cttttgtgtgtagtgttaaagactcccgtgggaaatttattcgagctcaaacgaaatgacatatagaaaaatatgacagttttggagggggagacaatag 41940878  T
Q  218 ccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccggg 317  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |  ||| ||| |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  41940877 ccttactcaatgtcattcactttgctcatgtgaacaactgg-accgggttgtcttcgagtccgactcaactactctagtgcaaactctatcgtctctgga 41940779  T
Q  318 ttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaac 417  Q
      || ||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41940778 ccattgtgattcagaattctatgctattgtttctagtattatttaccggttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagagaac 41940679  T
Q  418 atgattgctaataccttagctagg 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  41940678 atgattgctaatactttagctagg 41940655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 442
Target Start/End: Original strand, 27292306 - 27292704
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||   ||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| |     
T  27292306 tttgggagaaaccgaacgagtcatggttgaagtgcaatgtggatgtcacgttccatgatagtaaccatattacatattttgcatgttgtgttagagactc 27292405  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27292406 tcgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatattattgttttgaagggggaggcaatagccttactagatgcccttcactttgct 27292505  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||  || |||||||||| |||| ||||||| |  |||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  | |||||||| ||    
T  27292506 gatgataacagatgggaccgggttgtcttcgagttcgactcatctgctctagtgcaaactctatcgtctccaggccatggtgatttggaattttatgcta 27292605  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  27292606 ttgtttctagtattaattatcagttatctttacattccaacttcaaagtgaagtttatcaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctaggg 27292704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27533256 - 27532823
Alignment:
Q  10 cacagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataacc 109  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |  | | ||||||||||| || |||||| | |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  27533256 cacagacagaatatagtgcaaggtaatagtttagtttgggagaaatcgcgcgagacgcgactgaagtgtaatgtggatgtcgcgttccatgatcgtaacc 27533157  T
Q  110 atctaacatctttt-gcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggg 208  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  27533156 agtttacatctttttgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggtagcaggaaaatataacagttttggaggggg 27533057  T
Q  209 aggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatc 308  Q
    ||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||| |||| || |||||||  || ||||    
T  27533056 aggcaatagctttattcgatgtcattcactttgctgatgtgaatagatgggaccgggttgttttcgagtccgactttgcttctttagtgcagactttatc 27532957  T
Q  309 gtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggaga 408  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| | || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27532956 gtctccgggtcatggtgattcagaattctttgctattgtttcaagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggaga 27532857  T
Q  409 caagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    |||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  27532856 caagcgaacatggttacttatactttagctaggg 27532823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34652507 - 34652221
Alignment:
Q  105 taaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggag 204  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |     
T  34652507 taaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttatccggtctcaaacaaaa-ggcagcgagcaaatatgacagtgttgtaa 34652409  T
Q  205 ggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctc 304  Q
    ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||||||  | |||||  ||||||||||||||||||    
T  34652408 ggggagataataaccttactcgatgccattcactttgccgatgtgaacagatgggatcgggttgtcttcgagcccgactcgactactctagtgcaagctc 34652309  T
Q  305 tatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggt 392  Q
    || |||||| |||  |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34652308 taccgtctctgggccatggtgattcagaattatatgttattgtttctagtattatttatcaattatctttacattccaacttcgaggt 34652221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11375793 - 11375437
Alignment:
Q  79 aatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggc 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | ||   |   |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  11375793 aatgtggatgctgcgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcaggtgatttattcggactcaaacgaaatggc 11375694  T
Q  179 agcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatc 278  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||  |||| |||||||| |||| |||| || ||    
T  11375693 agcgagtaaatatgacagttttggagggggagacagtagccttactcgaggcccttcattttgcggatgcaaatatatgggaccgggttgtctttgagtc 11375594  T
Q  279 tgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacat 378  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||          |||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  11375593 tgattcatctattctagtgcaagctctatcgtctccggtccatggtgattcggaattcta---------ctctcgtattatttatgagttatctttacat 11375503  T
Q  379 tccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  11375502 tccaactccgaggtgaagtttgttaagagacaagcgaacatagttgctcatactttagctagggcg 11375437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 275
Target Start/End: Original strand, 37448033 - 37448228
Alignment:
Q  80 atgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggca 179  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||| | || ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  37448033 atgtggatgtcgtgttccatgaccataaccatcttacatcgtttatatgttgtgttagagactctcgtggacaatgtattcggactcaaacaaaatggca 37448132  T
Q  180 gcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcga 275  Q
    |||  |||| |||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  37448133 gcgtgcaaacatgacagtgttgaaaggggaggcggtagccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggaaccgggttgtcttcga 37448228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 290 - 441
Target Start/End: Original strand, 23074950 - 23075101
Alignment:
Q  290 ctctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaa 389  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||   ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  23074950 ctctagtgcaagctttatcgtcttcggtccatggtgattcataattctatgttattgtttatagtattatttatcagttatgtttacattccaactttaa 23075049  T
Q  390 ggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  23075050 ggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatagtttagctagg 23075101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30223139 - 30222929
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  |||| |  ||||||||||||  ||||||| | ||||    
T  30223139 aatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaacatggacgtcgcgttccatgactgtaaccatattacat 30223040  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||   | ||| |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  30223039 cttttgcgtgttgtgttagagacttccatgggcaatttattcgggctcaaacgaatttgcagcaagcgaatttgacagttttggagagggagacagtagc 30222940  T
Q  219 cttactcgatg 229  Q
     ||||| ||||    
T  30222939 tttacttgatg 30222929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30222928 - 30222755
Alignment:
Q  269 tcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcattt 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||| |||||||| ||  ||  ||||||| ||    
T  30222928 tcttcgaatctgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtcttcgggtcacggtgattcggaattctatgctattgtttatagaat--tttatcaatt 30222831  T
Q  369 atctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| |||  |||||||    
T  30222830 atctttacattctaactttgatgtgaagtttgttaagagacatgcaaacatgattgctcatactttaattagggcg 30222755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 441
Target Start/End: Original strand, 32632561 - 32632784
Alignment:
Q  218 ccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccggg 317  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| || ||  ||||||||   ||| |||| |||| || ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  32632561 ccttactcgaggcctttcattttactgatacgaatagattaaaccgggttgtctttgagtctgactcatctactttagtgtaagctttatcgtctccgag 32632660  T
Q  318 ttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaac 417  Q
      || ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  32632661 ccatagtgattcagaattctatgacattgtttctaatattatttatttgttatctttacattctaacttcgaggtgacgtttattatgagacaagcgaac 32632760  T
Q  418 atgattgctaataccttagctagg 441  Q
    ||  ||||  |||| |||||||||    
T  32632761 atagttgcccatactttagctagg 32632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Original strand, 26076480 - 26076534
Alignment:
Q  372 tttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26076480 tttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcaaacatggttgct 26076534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31908418 - 31908351
Alignment:
Q  337 tatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttag 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  31908418 tatgctattgtttataatattatttatcagttatcttcacatttcaactttgagatgaagtttgttag 31908351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30573694 - 30573616
Alignment:
Q  342 tattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 420  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||  || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30573694 tattgtttttagtattatttatcagttatctttatattttaattttgaggtgaaatttgttagaagacaagcgaacatg 30573616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Original strand, 16074612 - 16074677
Alignment:
Q  48 ggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatct 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16074612 ggagaaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatct 16074677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42989440 - 42989241
Alignment:
Q  116 catcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagt 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || | ||   ||||||| | ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| ||     
T  42989440 catcttttgcgtgttggtttagagacttccgtgactaatttattccggctcaagcgaaatagcagcagacaaatatgacaactttgaaggggtaggcagg 42989341  T
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    |   |||||||||| |||||||| || | ||||||| |||||  | |  ||||||||||  || | |||  |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  42989340 aatattactcgatgtcattcactatgatgatgtgaacagatgcaatcgagttatcttcgtgtccgtctcaactactctaatgcaaactttatcgtctccg 42989241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14823754 - 14823661
Alignment:
Q  342 tattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaatacctta 435  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| || || |||||  ||| ||| ||||| ||||||||    
T  14823754 tattgtttctcatattatttatgagttagttttacattccatctttaagatgaagtttattcggcgacaaatgaatatggttgctcatacctta 14823661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 37447988 - 37448028
Alignment:
Q  17 aaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccg 57  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37447988 aaaatagagtgcaaggtaacagctcagtttgggagaaaccg 37448028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 25682498 - 25682921
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  25682498 aatagagtgcaaggcaagaactcaatttgggagaaaccgtgtgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaacgtaaccatcttacat 25682597  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25682598 cttttgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttatctgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagc 25682697  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25682698 cttactcgatgtcattcactttgctaatgtgaacagatgggaccgggctgtcttcgagtttgactcagctactctagtacaagctctatcgtctccgggc 25682797  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |  ||||||  | ||| |||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25682798 cacagtgatttagaattctatactattgtttctagtattatttttcagttatctttacattctaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgagca 25682897  T
Q  419 tgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    || ||||| |||| ||||||||||    
T  25682898 tggttgctcatactttagctaggg 25682921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 444
Target Start/End: Original strand, 4395021 - 4395430
Alignment:
Q  34 aacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtg 133  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| || ||||    
T  4395021 aacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgtggctgaagtgcaatgtggaagccgcgttccatgaccgtaaccatatcacaacttttgcatgctgtg 4395120  T
Q  134 ttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccat 233  Q
    ||||||| | || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||| |    
T  4395121 ttagagactctcgtgggcaatttatccgggctcaatcgaaatggcagcgggcaaatatgagagttttgaagggg-aggcactagccttactcgaggccct 4395219  T
Q  234 tcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgta 333  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |    
T  4395220 tcactttgctgatgcgaatagatgggaccaggttatcttcgagtccaactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcaaggtcatggtgattcagaa 4395319  T
Q  334 ttttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaatacct 433  Q
    || |||  |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  4395320 ttctatcctattgtttatagtattatttatcagttatctttacatttcaactttgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactt 4395419  T
Q  434 tagctagggcg 444  Q
    |||||||||||    
T  4395420 tagctagggcg 4395430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 44527125 - 44527525
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  44527125 tttgggagaaaccgaccgagtcatggttaaagtgcaatgtggacgccgcgttccatgactgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactc 44527224  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
    |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  44527225 ttgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactagaggcccttcactttgct 44527324  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||  || |||||||||| |||| ||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| |||| ||    
T  44527325 gatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactcttgtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcggaattctatgcta 44527424  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||    
T  44527425 ttgtttctagtattaattattagttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaggagacaagcgaacatggctgctcatactttaactagggc 44527524  T
Q  444 g 444  Q
    |    
T  44527525 g 44527525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 48950064 - 48949640
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||| | ||||    
T  48950064 aatagagtgcaagctaacaactcagattgggagaaaccgcgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacat 48949965  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  | | | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  48949964 ctttcgcgtgttgtgttagagactcccgttggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgaaagttttggagggggaggcagttgc 48949865  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  || ||| |||||||||| |||| ||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  48949864 cttactcgatgcgattcactttgttgttgggaacagatgggaccgggttgtcttcgagttcaactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggc 48949765  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48949764 catggtgattcggaattttatgctattgtttctagtattatttttcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 48949665  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    || || || ||| ||||||||||||    
T  48949664 tggttactcatagcttagctagggc 48949640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 444
Target Start/End: Original strand, 5609177 - 5609611
Alignment:
Q  10 cacagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataacc 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  5609177 cacaggcataatagagtgcaaggcaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgttccatgactgtaacc 5609276  T
Q  110 atctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggggga 209  Q
    || | ||| |||| ||||| |||| |||||| |  || |  |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5609277 atattacaactttcgcgtgctgtgctagagactcacacgagcaatttattcgggctcaaactctatgacagcggacaaatatgatagttttgaaggggga 5609376  T
Q  210 ggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcg 309  Q
    || ||||||||||||||| | | ||||||||| |  || ||| ||||| || | |||| ||||||| |  |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5609377 ggcagtagccttactcgaggtccttcactttgatgttgcgaacagatgagatcgggttgtcttcgagttcgactcatctactctagtgcaaactctatcg 5609476  T
Q  310 tctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagac 409  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5609477 tctcagggtcatggtgattcagaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagac 5609576  T
Q  410 aagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  5609577 aagcgaacatggttgctcatacattagctagggcg 5609611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 420
Target Start/End: Original strand, 36733538 - 36733944
Alignment:
Q  16 caaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaat--gtggatgcagcgttccatgaccataaccatct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| | || | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  36733538 caaaatagaatgcaaggtaataactgagtttcggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatatgtggatgccgcgtttcatgactataaccatct 36733637  T
Q  114 aacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaa 213  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36733638 tacaccttttgtgtgttgtgttagagactctcgtggacaatttattcgggctcaaacaaaatgacaacgggtaaatatggcagttttggagggggaggca 36733737  T
Q  214 gtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctc 313  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  36733738 gtagtcttactcaatgttattcactttgctgatgtgaacaaatgggaccgggttgtcttcgagtctgactctataactctagtgcaagctatatcgtctc 36733837  T
Q  314 cgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagc 413  Q
    ||||  ||| ||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36733838 cgggccatgatgattcataattctatgttattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttacgagacaagc 36733937  T
Q  414 gaacatg 420  Q
    |||||||    
T  36733938 gaacatg 36733944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 51113162 - 51113587
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| || | |||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | | ||| | ||||    
T  51113162 aatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaatcgtgtgagacgtggttaaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaccgtcaacatattacat 51113261  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  | ||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  51113262 ctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaattcattcggactcaaacgaaatggcaacgagcaaatataaccgttttggagggggaggcagttgc 51113361  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  || ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  51113362 cttactcgatgtcattcactttgttgttgggaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctctgggc 51113461  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51113462 catggtgattcggagttttatgctattgtttctagtattatttttcagttatcttaacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagagaagcgaaca 51113561  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||    
T  51113562 tggttgctcatagcttagctagggcg 51113587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16817108 - 16816712
Alignment:
Q  50 agaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatgg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |  ||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| | ||  |     
T  16817108 agaaaccgagtgagatgtggttgaagtgcaatgcggacgccgcgttccatgtctgtaaccatattacatcttttgtgtattgttttagagactctcgcgt 16817009  T
Q  150 tcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtg 249  Q
     |||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||      
T  16817008 gcaatttattcgagctcaatcaaaatggcagtgggcaaatatgacaattttggagggg-aggcagtagccttactcgaggcccttcattttgctgatgca 16816910  T
Q  250 aatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatg---gtgattctgtattttatgatattg 346  Q
    || |||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||||| |||| |||| |||||||| |  |||   ||||||| | ||| || | |||||    
T  16816909 aacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcgtctactctagttcaagttctaccgtctccgagccatggacgtgattcggaattctacgctattg 16816810  T
Q  347 tttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  16816809 tttctagtattatttatcagttatctttacattccaactttaaggtgaagtttgttaggagagaagagaacatggttgctcatactttagttagggcg 16816712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 420
Target Start/End: Original strand, 44602764 - 44603000
Alignment:
Q  184 acaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgact 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||  |||||| ||| |||    
T  44602764 acaaatatgacaattttggagggggagacattagtcttactcgatgtcattcactttactgatgtgaacagatgagaccgggttgccttcgagtctaact 44602863  T
Q  284 ctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaa 383  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44602864 ccgctactctagtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcaaaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacattccaa 44602963  T
Q  384 cttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 420  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44602964 cttcgaggtgaagtttgttaggggacaagcgaacatg 44603000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 52109326 - 52109725
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |     
T  52109326 tttgggagaaaccgacaaagacgtggttgaagtgtaatgtggacgttgtgttccatgaccgtaatcatcttatatcttttgcatgttgtgttagagactc 52109425  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
       ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  52109426 ctgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgatcattttggagggggatgcagtagccttactcgaggtccttcactttgct 52109525  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||  || ||||||||   |||| |||| || | ||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||| | ||| |||| ||    
T  52109526 gatgctaacagatggga-tgggttgtctttgagtgtgattcatctactctagtacaagctctattgtctccggaccatggtgattcggaattctatgtta 52109624  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  ||| | |||| |||| ||||||    
T  52109625 ttgtttctagtattagttatcagttatctttacattctaacttcaaggtaaagtttgttatgagacaaacaaacatagttgttcatactttagatagggc 52109724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 426
Target Start/End: Original strand, 48166157 - 48166481
Alignment:
Q  92 cgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatat 191  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  48166157 cgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtggtcaatttattcgggctcaaatgaaatggcagcgagcaaatat 48166256  T
Q  192 gacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctact 291  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  48166257 gacagttttggagtgggagacaatagccttactcgatgtcattcactttgcttatgtgaatatatgggatcgggttgtcttcgagtctgattcagctact 48166356  T
Q  292 ctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaagg 391  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||   |||||||| | | ||| |||| ||||           ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||     
T  48166357 ctattgcaagctctatagtcttgggacgatggtgatacagaattctatgctatt----------atatttatctgttatctttacatttcaacttcaaga 48166446  T
Q  392 tgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48166447 tgaagtttgttaggaaacaaacgaacatgattgct 48166481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 441
Target Start/End: Original strand, 24538357 - 24538756
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||| ||| || ||||||||||| |||||| || ||| ||||||  | | ||    
T  24538357 aatagagtgcaaggtaacatctcagtttgagagaaaccaagtgagacctggtcgaaatgcaatgtggatgccgcgttctataaccgtaaccaagttagat 24538456  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  | |||  ||||||| ||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||||||                
T  24538457 cttttgtgtgttgtgttagagactcccgtggataatttattcgggctcaaacgaattggcagcaggcaaatacgacagttttggaggg------------ 24538544  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||          |||||||||  ||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  24538545 -ttactcgatgccattcactttgct----------gatgggaccgagttcttttcgagtctgactcttctactctagtgcaagatctatctgcttcgggt 24538633  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     || ||||||| | ||| || | |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24538634 catagtgattcagaattctacgctattatttctagtattatttatctgttatctttacattctaactttgaggtgaagttcgttaggaaacaagcgaaca 24538733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 277 - 443
Target Start/End: Original strand, 21031254 - 21031420
Alignment:
Q  277 tctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttac 376  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21031254 tctgactcagctattctagtgcaagctctatcgtctccggactatggtgattcggaattttatgttatagtttctagtattatttatcaattatctttac 21031353  T
Q  377 attccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  21031354 atcctaacttcgaggtgaagttttttaggagacaagcgaacatgattgctcatagtttagccagggc 21031420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 264 - 444
Target Start/End: Original strand, 2885315 - 2885498
Alignment:
Q  264 ggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttat 363  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2885315 ggttgtcttcgagtcagactcagctactctagtgcaagctctatcgtcttcgggctatggtgattcggagttatatgctattgtttctagtattatttat 2885414  T
Q  364 c----atttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |    | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  2885415 cagttaattatctttacatttcaacttcgtggtgaagtttgttaggatacaagcgaacatg-ttgctcatactttagctagggcg 2885498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 366 - 444
Target Start/End: Original strand, 17371642 - 17371720
Alignment:
Q  366 tttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  17371642 tttagctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaggagacaagcgaatatggtcgctcataccttagctagggcg 17371720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38679128 - 38679016
Alignment:
Q  327 ttctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgct 426  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||| |||||| ||    
T  38679128 ttctgaattttttgttattgtttctaatattatttataaggtagctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaggcgaaaaatgaatatgattact 38679029  T
Q  427 aataccttagcta 439  Q
     ||||||||||||    
T  38679028 cataccttagcta 38679016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 444
Target Start/End: Original strand, 14485183 - 14485282
Alignment:
Q  345 tgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  14485183 tgtttttagtattgtttatcagttatttttacattccaactttaaggtgaagttcattaggagacaaacgaacatagttgctcatactttagctagggcg 14485282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4898619 - 4898538
Alignment:
Q  360 ttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  4898619 ttatcagttgtctttacatttcaacttcgatgtaaagtttgttaggagacaaacgaatatgattgctcatactttagttagg 4898538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 439
Target Start/End: Original strand, 23163357 - 23163418
Alignment:
Q  378 ttccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagcta 439  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  23163357 ttccaacttcgagataaagtttgttagaagacaagcgaacatggttgctcatactttagcta 23163418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Original strand, 17507308 - 17507350
Alignment:
Q  22 agagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgaga 64  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17507308 agagtgcaaggtaatatctcagtttgggagaaaccgagcgaga 17507350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34696242 - 34695819
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||  || ||||||||  | |||||||||||||| ||| | ||||    
T  34696242 aatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccataagcatattacat 34696143  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34696142 cttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaatcga--tggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagc 34696045  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34696044 cttactcaaggccattcactttgctgatgtcaatagatgggaacgggttgtcttcgagtccgactccgctactctagtgcaagcgttatcgtctccgggt 34695945  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34695944 catggtgattcagaattttatgctattgtttctagtataatttaccagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 34695845  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  34695844 tggttgctcatactttagctagggcg 34695819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34718654 - 34718231
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||  || ||||||||  | |||||||||||||| ||| | ||||    
T  34718654 aatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccataagcatattacat 34718555  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34718554 cttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaatcga--tggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagc 34718457  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34718456 cttactcaaggccattcactttgctgatgtcaatagatgggaacgggttgtcttcgagtccgactccgctactctagtgcaagcgttatcgtctccgggt 34718357  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34718356 catggtgattcagaattttatgctattgtttctagtataatttaccagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 34718257  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  34718256 tggttgctcatactttagctagggcg 34718231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 88406 - 88831
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||     
T  88406 aatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccgtaaccatattacaa 88505  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  || |||||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  88506 cttttgcatgttgtgttagagactctcgcgggcaatttattcgggctcaaatgaaatggcaatgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagc 88605  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | |||  || |||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  88606 cttactcgaggcccttcactttgttgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcaagat 88705  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  88706 catggtgattcagaattctatgctattgtttccagtattatttatcagttagctttacattccaacttcaacgtgaagtttatttggagacaagcgaaca 88805  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  88806 tggttgctcatactttagctagggcg 88831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12130975 - 12130556
Alignment:
Q  22 agagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatctt 121  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |   |||||    
T  12130975 agagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatctt 12130876  T
Q  122 ttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagcctt 221  Q
    ||| ||||||||||||||| |  |  || ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12130875 ttgggtgttgtgttagagactcccgcgggcaaattattcgggctcaaacgaaatgacagcgagcaaatatgatagtgttggagggggaggcagtagcctt 12130776  T
Q  222 actcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttat 321  Q
    ||| || ||  ||||||||||| |||  ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||    
T  12130775 acttgaggctcttcactttgctgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacat 12130676  T
Q  322 ggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatga 421  Q
    |||||||| | ||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12130675 ggtgattcagaattctatgctattatttctagtattatttatcagttatatttacattccaacttcgaggtgaagtttgttatgagacaagcgaacatgg 12130576  T
Q  422 ttgctaataccttagctagg 441  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  12130575 ttgctcatactttagctagg 12130556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44017658 - 44017233
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||| ||| |||||||||| || | ||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| | || | ||||||  ||| ||| ||||||| ||||    
T  44017658 aataaagtgcaaggtaacagctaagttttgaagaagccgagcgagacatggttgaagtgcaatgcgaattccgcgttctgtgatcatgaccatcttacat 44017559  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  | ||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||  |  | |    
T  44017558 ctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaaataaaatgacaccgtgcaaatatgacagttttggagggggagacaacaac 44017459  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||       
T  44017458 cttactcgatgccattcacgttgctaatgtgaacatatgagaccaagttgtcttcgagtctgactccgttactttagtgcaagctctatcgtctccgaaa 44017359  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     ||||| |||  | ||| ||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||    
T  44017358 catggtcattaagaattatatgccattgtttcttgtattatttatcagttatcttttcattctaacttcgatatgaagtgtgttaggagacaagtaaaca 44017259  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  44017258 tagttgctcatactttaactagggcg 44017233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 439
Target Start/End: Original strand, 9710033 - 9710222
Alignment:
Q  250 aatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgttt 349  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||   ||| ||||  |||||||    
T  9710033 aatagatgggaccgggttgtcttcgagtctgactttgatactctagtgcaagctctatcgtcagcgggacatggtaattcataattctatgcaattgttt 9710132  T
Q  350 ctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagcta 439  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  9710133 ctagtattatttatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagcta 9710222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1418166 - 1417925
Alignment:
Q  174 atggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttc 273  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || |||| |||  ||||||||||||||| |  |||   |||||| |||  || |||||||||  |||| |||||    
T  1418166 atggtagcgggcaaatatgacggttatgaagggagagacagtagccttactcgaggtaatttgatttgctgatgcaaacagatgggactgggttgtcttc 1418067  T
Q  274 gaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctt 373  Q
    || ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1418066 gagtctgactcatctactctagttcaagctctattgtctctggactatggtgattcagaattctatgctattgtttctagtattatttatcaattatctt 1417967  T
Q  374 tacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1417966 tacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcga 1417925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 442
Target Start/End: Original strand, 26198575 - 26198952
Alignment:
Q  60 cgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatg------accataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaa 153  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||       ||||||| ||| |  ||||||||| ||| ||||||||||| |    ||| |||    
T  26198575 cgagacgtggttgaagtgtattgtggatgtcgcgttccattttcattaccataatcatattgcatcttttgtgtgctgtgttagagactcatgtgggcaa 26198674  T
Q  154 tttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaata 253  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||      
T  26198675 tttattcgagctcaaataaaatggtagcgaacaaatatgacagttttggagggggatgcagtagcctt-cttgatgccatttactttgctaatgtgaac- 26198772  T
Q  254 gatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaa 353  Q
           || || |  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |    ||| |||| |||||||||||     
T  26198773 -------ccggggt--cttcgagtccgactcagctactctagtgcaagctctatcgtctctaggtcatggtgaattgaaattctatgctattgtttctag 26198863  T
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || || |||| ||||||||||    
T  26198864 tattatttaccagttatctttacatttcaactttgaggtgaagtttgttaggtaacaagtgaacatggtttctcatactttagctaggg 26198952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18345801 - 18345586
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18345801 tttggaagaaaccgaacgagacatggttgaagtgcaatgtggacgcaacgttccatgagcgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagactt 18345702  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
     | |||  |||||||  |  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18345701 ccgtgggtaatttatttgaactcaaacgaaatggtaacggacaaatatgacagtttt-gagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgct 18345603  T
Q  244 aatgtgaatagatggga 260  Q
     |||  || ||||||||    
T  18345602 gatgctaacagatggga 18345586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13110006 - 13109784
Alignment:
Q  222 actcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttat 321  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  13110006 actcgaggcccttcacttagctgatgcgatcagatgggacatggttgtcttcgagtccgactcttctactctagtggaagctctatcgtcttcgggccat 13109907  T
Q  322 ggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatga 421  Q
    |||||||  | ||| || | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  13109906 ggtgatttggaattataagctattgtttccagtattatttatcagttatctttacattccaacgttgaggtgaagtttgtcaggagacaaacgaacatag 13109807  T
Q  422 ttgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||| | |||| ||||||||||||    
T  13109806 ttgttcatactttagctagggcg 13109784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 444
Target Start/End: Original strand, 14827126 - 14827351
Alignment:
Q  218 ccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccggg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||| || |  ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  14827126 ccttactcgatgtcattcactttactgatatgaatagatgagatcgagttgtctttgaatctgacttagctactctagtgcaagctctatcgtgtttggg 14827225  T
Q  318 ttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaac 417  Q
    | ||||||||||   ||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||| |||||    
T  14827226 tcatggtgattcgaaattctatgctattatttataatattatgtattagttatctttacattccaacttcgaggtaaagttagttaaga-acaaacgaac 14827324  T
Q  418 atgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14827325 atggttgctcatactttatctagggcg 14827351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18344316 - 18344209
Alignment:
Q  337 tatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttag 436  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  18344316 tatgatattgtttctagtattaattatcagttatctttacattccaacttcaaggtgaaatttgttaggagataagcgaacatggttgctcatactttag 18344217  T
Q  437 ctagggcg 444  Q
    ||||||||    
T  18344216 ctagggcg 18344209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11292134 - 11291982
Alignment:
Q  287 ctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaactt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||   |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  11292134 ctactctagtgcaagctctatcgttttcggcc-atgatgattcaaaattttatgttattgtttatagtattatttatcagttatctatacattc-aactt 11292037  T
Q  387 caaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  11292036 caaggtgaagtttgttaggagacgagcgaacatgtttgctcatactttagctagg 11291982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Original strand, 9709910 - 9709999
Alignment:
Q  153 atttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgc 242  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9709910 atttattcaggctcaaacgaaatggcaacgaacaaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgc 9709999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 35158880 - 35158758
Alignment:
Q  324 tgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaagg--tgaagtttgttaggagacaagcgaacatga 421  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||      
T  35158880 tgattcagaattctatgctattgtttctattattatttatcaattatttttacattccaacttcaaggcatgaagtttgttatgagacaagcgaacatag 35158781  T
Q  422 ttgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||| |||  || |||||||||    
T  35158780 ttgctcatagtttcgctagggcg 35158758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 444
Target Start/End: Original strand, 22845600 - 22845795
Alignment:
Q  236 actttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtatt 335  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||    
T  22845600 actttgctgatgcgaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccaactaatctactctagtgcaagctctatcgtctccagatcatggtgattcagaatt 22845699  T
Q  336 ttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaatacctta 435  Q
     || | ||||||||||| |||||| |          ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||    
T  22845700 ctaggctattgtttctagtattatct----------tttgctttccaacttcaatgtgaagtttgttagga-acaagcgaacat--ttgctcatacttta 22845786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 441
Target Start/End: Original strand, 25552315 - 25552414
Alignment:
Q  342 tattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  25552315 tattatttctaatattatttatcagttatttttacatttcaattttaagatgaaatttgttaagagacaagtgaacatggttgctcatactttagttagg 25552414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36445534 - 36445479
Alignment:
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagttt 399  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36445534 ttgtttctcatattatttttcaattctctttacattccaacttcgaggtgaagttt 36445479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10244580 - 10244492
Alignment:
Q  349 tctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagc 437  Q
    |||| |||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  10244580 tctagtattatttctgagttagctttagattccaacttcgaggtgaagtttattaagcggcaagtgaacatgattgctcatactttagc 10244492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 419
Target Start/End: Original strand, 43293835 - 43293900
Alignment:
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacat 419  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  43293835 tattattgctcaattatctttacatttcaacctcgaggtgaagcttattaggcgacaagcgaacat 43293900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 42340616 - 42340192
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| |   |||||||| ||||    
T  42340616 aatagagtctaaggcaacaactcagtttgagagaaaccgtgcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgttg-gttctatgtcggcaaccatcttacat 42340518  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  42340517 cttttgcgtgttgtgttagagactctcgtggacaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggcagatatgacagtgttggagggggaggcaatagc 42340418  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  42340417 cctactcgatgtcattcactttgcagatgtgaacagatgggaccgagttgtcttcgagtcagactcagctactttagtgcaagctctgtcgtctccgggc 42340318  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42340317 catggtgattcagaattctatgctattgtttctaatattatttatcagctatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 42340218  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| | || |||| |||||||    
T  42340217 tggttgctcacactttagatagggcg 42340192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 44 - 443
Target Start/End: Original strand, 53496904 - 53497303
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  53496904 tttgggagaaaccgaccgagtcatggttaaagtgcaatgtggacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactc 53497003  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
    |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  53497004 ttgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatgacagcggacaaatgtgacagtttttgagggggaggcagtagccttactagaggcccttcactttgct 53497103  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
     |||  || |||||||||| |||| ||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||| ||    
T  53497104 gatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactcttgtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcggaattctatgcta 53497203  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  53497204 ttgtttctagtattaattatcagttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaggagacaagcgaacatggctgctcatactttagctagggc 53497303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 55199358 - 55199783
Alignment:
Q  19 aatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacat 118  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||| | |  || | ||||    
T  55199358 aataaagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaaccgcgtgagatgtggttgacgtgcaatgtggatgccacgtttcatgaccgtcaatatattacat 55199457  T
Q  119 cttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  55199458 ctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacagctgataaatatgacagttttggagggggaggcagttgc 55199557  T
Q  219 cttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||  || |||||||||| |||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  55199558 cttactcgatgccattcactttgttgttggaaacagatgggaccgggttgtcttcaagtccgactcagctactctggtgcaagcgctatcgtctacgggt 55199657  T
Q  319 tatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 418  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55199658 catggtgattcggaattttatgctattgtttctagtattatttttcagtcatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaaca 55199757  T
Q  419 tgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||| ||| |||||||| ||||    
T  55199758 tggttgctcatagcttagctacggcg 55199783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 2615365 - 2615755
Alignment:
Q  44 tttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattt 143  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||  ||    
T  2615365 tttgggagaaatcgtgcaagacgtggttgaaatgcaatgtggataccgcgtttcatgatcataaccatattacattttttgtgcgttgtgttagaggctt 2615464  T
Q  144 tcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgct 243  Q
    |  ||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2615465 ttgtgggcaattcattcgggctcaaacgaattggcagcgggcaaatatgatagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgtcgttcactttgct 2615564  T
Q  244 aatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgata 343  Q
              |||||||  | ||| ||||  |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||  | |  |||||||||| | ||| |||||||    
T  2615565 ----------gatgggaaaatgttgtctttcaatccgactcaactactctagtgcgagctctatcgtctttgtgccatggtgattcagaattctatgata 2615654  T
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  2615655 ttgtttttagtattatttatcagttatttttacattccaacctcgagatgaagtttgttaggagacaaacgaacatggttgctcatactttaactagggc 2615754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 444
Target Start/End: Original strand, 46007137 - 46007571
Alignment:
Q  8 agcacagacaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataa 107  Q
    |||||||  |||||| ||| || | ||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |   |||    
T  46007137 agcacaggtaaaataaagtgcaggataacaactcagtttgggaaaaacaaagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccattattgtaa 46007236  T
Q  108 ccatctaacatcttttgcgtgttgtgtt-agagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggg 206  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| ||||| | || |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||    
T  46007237 ccatcttatatcttttgcgtgttttgtttagagactctcgtggaaaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatacgacaattttttaggg 46007336  T
Q  207 ggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctcta 306  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||   || |||| |||||||    || | ||||||| || || ||  |||||||||||||| || ||    
T  46007337 ggagacagtagccttacttgatgccattcactttgtcgatatgaacagatggg---cgggtgtcttcgagtccgattcaactactctagtgcaaactata 46007433  T
Q  307 tcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttagga 406  Q
    |||||||||||  |||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| || || | ||| ||||||||||| |    
T  46007434 tcgtctccgggccatggcgattcggaattttatgctattgtttctagcattatttatcagttatttttacattctaattttagggtaaagtttgttagaa 46007533  T
Q  407 gacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  46007534 gacaaatgaacatgattgctcatactttaactagggcg 46007571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 264 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34497467 - 34497287
Alignment:
Q  264 ggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttat 363  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  34497467 ggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgttcctagtattattttt 34497368  T
Q  364 catttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  34497367 cagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatagcttagctagggcg 34497287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31341829 - 31341641
Alignment:
Q  259 gaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatc----gtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaat 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  31341829 gaccgggttatcttcgaatctgactccactactctagtgcaagctctatcctacgtctccgggtcatggtgattcagaattttatactattgtttctaat 31341730  T
Q  355 attatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  31341729 attatttatcagttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttattaggagacaaactgacatggttgctcataccttagttagggc 31341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 264 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27608998 - 27608822
Alignment:
Q  264 ggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttat 363  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  27608998 ggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgtttctagtattattttt 27608899  T
Q  364 catttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctag 440  Q
    || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27608898 cagttatctttacattccaacttcgagctgaagtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatagcttagctag 27608822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 647306 - 647085
Alignment:
Q  216 agccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccg 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  647306 agccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatgtgaccgagttatcttcgagtctgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctccg 647207  T
Q  316 ggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcga 415  Q
    ||  |||||||||| | ||| |||| | |||||| ||        ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  647206 ggccatggtgattcggaattctatgttgttgtttata-------gtatcagttatctttacattccaacttcgaggtgaaatttgttaggagacaaacga 647114  T
Q  416 acatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  647113 acatggttgctcatactttagttagggcg 647085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 647485 - 647308
Alignment:
Q  85 gatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcgga 184  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||   | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  647485 gatgccgcgttccatgagcgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttctctaggcaatttttccgggctcaaacgaaatggcagcggg 647386  T
Q  185 caaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggacc 262  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  647385 ctaatatgacagttatggagggggaggcagcagccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatgggacc 647308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 11020357 - 11020119
Alignment:
Q  182 ggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctga 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| | |||| ||  |||| ||||||| |||||    
T  11020357 ggacaaatatgacacttttggagggggagacatcagctttactcgatgctatttactttgctgatgggaacaaatggaactgggttgtcttcgagtctga 11020258  T
Q  282 ctctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattcc 381  Q
    ||   |||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11020257 cttaactactccagtgtaaggtctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctgtgctattgtttctagtattatttatcaattatctttacatttc 11020158  T
Q  382 aacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 420  Q
    ||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11020157 aacctcgatgtgaagtttgtttggagacaagcgaacatg 11020119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 444
Target Start/End: Original strand, 2121129 - 2121353
Alignment:
Q  220 ttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||| | || || || ||||   |||||||| |||||||||||| |||||  ||      
T  2121129 ttactcgatgtcattcactttgctgatatgaatagatgggatcgtgttgtttttgagtccgacttaactactctaatgcaagctctattgtctctaggcc 2121228  T
Q  320 atggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacat 419  Q
    ||| | ||||   ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2121229 atgattattcataattttgtgctattgtttctagtattatttatcagttatctttacatctcaacttcgaggtaaagtttgttaggagacaagcgaacat 2121328  T
Q  420 gattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    | ||||| |||| |||| |||||||    
T  2121329 ggttgctcatactttagttagggcg 2121353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Original strand, 24176862 - 24176999
Alignment:
Q  264 ggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttat 363  Q
    |||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| || | |||||| |||| ||||||||||    
T  24176862 ggttgtcttcgagtctgacacaactactctagtgcaagctctatcgtctctgggtcatggtgattcggaattctaagctattgtatctagtattatttat 24176961  T
Q  364 catttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgt 401  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24176962 aagttatctttacattccaacttcgaggtgaagtttgt 24176999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27747764 - 27747603
Alignment:
Q  280 gactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacatt 379  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||   ||| |||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  27747764 gactccgcttctttagtgcaggctttatcgtctccgggccatggtgattcaaaattctatgctattgtttttagtattatttttcagttatctttacatt 27747665  T
Q  380 ccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||    
T  27747664 ccaacttcgaggtgaagtttgttaagagacaagcgaacatagttgctcatactttatctagg 27747603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27941233 - 27941129
Alignment:
Q  120 ttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagcc 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27941233 ttttgcgtgttgtattagagattctcgaggacaatttattcggactcaaacaaaatggcagcggacaaatatgatagttttggagggggaggcagtagcc 27941134  T
Q  220 ttact 224  Q
    |||||    
T  27941133 ttact 27941129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19117784 - 19117638
Alignment:
Q  295 gtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtga 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||  ||||||    
T  19117784 gtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgtttttagtattatttttcagttatttttgcattccaaatttgaggtga 19117685  T
Q  395 agtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  19117684 agtttgttaggagacagtcgaacatagttgctcatagcttagctagg 19117638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 444
Target Start/End: Original strand, 26046864 - 26046960
Alignment:
Q  348 ttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  26046864 ttctagtattatttatcagttatctttacattctaactttgaggtgacgtttgttaggagacaagcgaacatggttgctcatactttagctagggcg 26046960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 308
Target Start/End: Original strand, 48227307 - 48227550
Alignment:
Q  66 gtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgtgttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggct 165  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || || ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| ||||||    
T  48227307 gtggttgaagtacaatgtggatgccgcatttcattaccgtaaccatgttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgcgggcaatttattcgggct 48227406  T
Q  166 caaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcga-tgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccag 264  Q
     |||| |||  |||| ||  ||| ||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||   ||  |||||||||| |||||||| |||   |||      
T  48227407 taaacgaaacagcagtgggaaaacatgactgtattggagtgggatgcagtagccttactcgagaccccatcactttgctgatgtgaatggataaaaccga 48227506  T
Q  265 gttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatc 308  Q
    ||| |||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48227507 gttgtctttgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatc 48227550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 444
Target Start/End: Original strand, 55213490 - 55213597
Alignment:
Q  337 tatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttag 436  Q
    |||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||     
T  55213490 tatgctattgtttttggtattatatatcagttatctttacgttccaacttcgaggtgaaatttgttaggagaaaagcgaacatggttgcttatactttaa 55213589  T
Q  437 ctagggcg 444  Q
    ||||||||    
T  55213590 ctagggcg 55213597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1702894 - 1702806
Alignment:
Q  354 tattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctaggg 442  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||    
T  1702894 tattatttactagttatctttacattcgaacttcaaggtgaagtttgttagaagacaagcgaatatgattactcatactttaactaggg 1702806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 444
Target Start/End: Original strand, 48227566 - 48227640
Alignment:
Q  370 tctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| || || |||| ||||||||||||    
T  48227566 tctttacattccaacttcgaggtgaaatttgttaggagacaagcaaatatggttcctcatactttagctagggcg 48227640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 49525181 - 49525133
Alignment:
Q  372 tttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatg 420  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  49525181 tttacattccaattttgaggtaaagtttgttaggcgacaagcgaacatg 49525133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 444
Target Start/End: Original strand, 42 - 462
Alignment:
Q  28 caaggtaacatctcaatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcagcgttccatgaccataaccatctaacatcttttgcgt 127  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||| | | ||| ||  |||||| ||||    
T  42 caagctaacaactcagtttgggagaaactgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatgaccgtcaacatatacnatctttcgcgt 141  T
Q  128 gttgtgttagagattttcatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcga 227  Q
    ||||| ||||||| |  | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  142 gttgttttagagactcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtttgggagggggaggcagttgccttactcga 241  T
Q  228 tgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtg-- 325  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |   ||||||      
T  242 tgccattcactttgctgttgggaatatatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcatctccagaccatggtgat 341  T
Q  326 --attctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgatt 423  Q
      |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  342 taattcggaattttatgctattgtttctaatattatttttcagttatctttacattccaacttcgagatgaagtttgttaggagacaagcgaacatggtt 441  T
Q  424 gctaataccttagctagggcg 444  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  442 gctcatagcttagctagggcg 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 434 - 182
Alignment:
Q  188 atatgacagttttggagggggaggaagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccaggttatcttcgaatctgactctgc 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | || ||| || | |||||| |||  || | |||||| |   |||| ||||| || |||||  |    
T  434 atatgacagttttggagggg-aggtagtagccttgttggaggccctttattttgctgatgcaaacaaatgggatccaattattttcgagtccgactcatc 336  T
Q  288 tactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttc 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  335 tactctagtgcaagctctatcatctccaggtcatggtaattcagaattctatgctattgtttctagtattatttatcagttatccttacattccaacttc 236  T
Q  388 aaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagg 441  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||    
T  235 gatgtgaagtttgttaggagacaagcgaacacggttgctcatactttaactagg 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44322 - 44156
Alignment:
Q  280 gactctgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggttatggtgattctgtattttatgatattgtttctaatattatttatcatttatctttacatt 379  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  44322 gactcagctactctagtgca-gcgctatcgtctctaggccatggtgattcagaattttatgctattgtttctagtattatatttcagttatctttacatt 44224  T
Q  380 cca---acttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggcg 444  Q
    |||   ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  44223 ccaccaactttgaggtgaagtttgttaggagagaagcgaacatggttgctcatagcttagctagggcg 44156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 20330 - 20429
Alignment:
Q  344 ttgtttctaatattatttatcatttatctttacattccaacttcaaggtgaagtttgttaggagacaagcgaacatgattgctaataccttagctagggc 443  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  20330 ttgtttctagtattatttatcagttatctttacatgtcaactttgaggtgaagtttgttaggagacaagcgaatatgattactcatactttagctagggc 20429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University