View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3173_high_131 (Length: 220)

Name: NF3173_high_131
Description: NF3173
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3173_high_131
NF3173_high_131
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (1-203)||(16413273-16413474)
chr8 (1-207)||(14409401-14409606)
chr8 (1-207)||(1484402-1484607)
chr8 (1-207)||(5853249-5853454)
chr8 (1-207)||(20403227-20403432)
chr8 (1-207)||(22001753-22001958)
chr8 (1-207)||(15203188-15203393)
chr8 (1-207)||(20046152-20046357)
chr8 (1-207)||(4483281-4483485)
chr8 (1-207)||(4542330-4542535)
chr8 (28-207)||(41598188-41598366)
chr8 (8-207)||(19896265-19896466)
chr8 (1-207)||(14823774-14823978)
chr8 (1-203)||(45290651-45290853)
chr8 (14-207)||(25484245-25484430)
chr8 (28-209)||(26223917-26224097)
chr8 (14-213)||(19936975-19937174)
chr8 (1-194)||(15070571-15070765)
chr8 (44-210)||(16092297-16092463)
chr8 (29-210)||(18818348-18818530)
chr8 (29-191)||(19801367-19801527)
chr8 (44-213)||(6759255-6759421)
chr8 (56-210)||(7372778-7372932)
chr8 (44-209)||(28648999-28649164)
chr8 (44-210)||(20536208-20536374)
chr8 (43-210)||(23406379-23406548)
chr8 (61-210)||(21923900-21924049)
chr8 (59-210)||(21918969-21919121)
chr8 (44-210)||(22626736-22626901)
chr8 (44-210)||(22875065-22875230)
chr8 (44-210)||(18879191-18879352)
chr8 (28-192)||(13508023-13508188)
chr8 (64-207)||(26219717-26219858)
chr8 (59-210)||(31971257-31971407)
chr8 (28-192)||(13597555-13597720)
chr8 (64-207)||(26225268-26225409)
chr8 (38-210)||(17612059-17612231)
chr8 (28-191)||(20498581-20498745)
chr8 (48-210)||(38855212-38855372)
chr8 (110-210)||(45131019-45131117)
chr8 (95-210)||(6520368-6520483)
chr8 (1-93)||(24486001-24486093)
chr8 (88-206)||(21285601-21285719)
chr8 (44-209)||(23648554-23648719)
chr8 (1-83)||(32810054-32810136)
chr8 (28-191)||(37116366-37116531)
chr8 (81-208)||(18678094-18678221)
chr8 (95-210)||(5866280-5866395)
chr8 (107-210)||(17140916-17141019)
chr8 (95-210)||(21490995-21491110)
chr8 (81-208)||(32121734-32121861)
chr8 (110-210)||(16199666-16199765)
chr8 (95-210)||(21389458-21389571)
chr8 (95-210)||(21395988-21396101)
chr8 (95-210)||(21778784-21778897)
chr8 (95-210)||(21790481-21790594)
chr8 (95-195)||(983410-983512)
chr8 (28-191)||(17266931-17267096)
chr8 (44-191)||(17439461-17439609)
chr8 (139-210)||(23760893-23760962)
chr8 (95-210)||(21249384-21249500)
chr8 (95-210)||(21255222-21255338)
chr8 (89-206)||(26355699-26355815)
chr8 (88-196)||(21673718-21673826)
chr8 (28-191)||(24353039-24353203)
chr8 (133-191)||(19154930-19154989)
chr8 (121-206)||(17353975-17354060)
chr8 (142-191)||(20502154-20502203)
chr8 (140-189)||(22525579-22525628)
chr8 (1-43)||(35026853-35026895)
chr8 (81-206)||(23776827-23776952)
chr8 (142-206)||(17926758-17926822)
chr8 (147-183)||(20533467-20533503)
chr8 (142-206)||(24755714-24755778)
chr8 (143-191)||(28397569-28397617)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (1-209)||(30676667-30676874)
chr6 (1-209)||(34963371-34963578)
chr6 (1-207)||(12742317-12742522)
chr6 (1-207)||(19005046-19005251)
chr6 (1-207)||(22782227-22782432)
chr6 (1-207)||(24422547-24422752)
chr6 (1-207)||(33861794-33861999)
chr6 (1-207)||(33864278-33864483)
chr6 (4-207)||(25656629-25656831)
chr6 (1-207)||(8055029-8055234)
chr6 (1-207)||(18334549-18334754)
chr6 (1-207)||(19858876-19859081)
chr6 (1-207)||(2291137-2291342)
chr6 (1-207)||(26924597-26924802)
chr6 (2-207)||(25688502-25688706)
chr6 (1-207)||(1540868-1541073)
chr6 (1-207)||(1595549-1595754)
chr6 (14-207)||(25754809-25755001)
chr6 (14-207)||(20556864-20557054)
chr6 (27-207)||(3852000-3852179)
chr6 (28-191)||(18456735-18456897)
chr6 (32-204)||(16448514-16448686)
chr6 (47-210)||(29060540-29060703)
chr6 (57-191)||(18461895-18462028)
chr6 (61-210)||(17287768-17287917)
chr6 (44-210)||(20360915-20361081)
chr6 (44-210)||(25629310-25629476)
chr6 (44-209)||(18409782-18409947)
chr6 (44-210)||(16496244-16496410)
chr6 (44-210)||(20593773-20593939)
chr6 (44-210)||(20076700-20076862)
chr6 (44-195)||(25644335-25644487)
chr6 (44-210)||(19303496-19303661)
chr6 (29-210)||(22780166-22780348)
chr6 (28-208)||(19847933-19848114)
chr6 (59-210)||(20638253-20638404)
chr6 (29-210)||(20109140-20109322)
chr6 (28-210)||(8227449-8227632)
chr6 (134-210)||(27333262-27333339)
chr6 (134-210)||(27394002-27394079)
chr6 (44-191)||(18821801-18821946)
chr6 (149-210)||(25714417-25714478)
chr6 (44-210)||(35245586-35245749)
chr6 (48-210)||(23019408-23019567)
chr6 (95-210)||(28496477-28496592)
chr6 (95-210)||(29808888-29809003)
chr6 (97-208)||(23992429-23992540)
chr6 (48-195)||(9098473-9098620)
chr6 (88-206)||(19652199-19652316)
chr6 (59-210)||(16920602-16920751)
chr6 (95-210)||(1561303-1561418)
chr6 (95-195)||(19668386-19668488)
chr6 (61-183)||(15041522-15041644)
chr6 (133-189)||(33443068-33443124)
chr6 (163-210)||(22080799-22080846)
chr6 (121-206)||(19873120-19873205)
chr6 (121-206)||(22432249-22432334)
chr6 (121-206)||(22438799-22438884)
chr6 (143-210)||(22831503-22831571)
chr6 (111-210)||(25603406-25603506)
chr6 (111-210)||(25611744-25611844)
chr6 (1-44)||(12942363-12942406)
chr6 (139-196)||(4185870-4185928)
chr6 (108-191)||(11185524-11185605)
chr6 (28-191)||(23076749-23076914)
chr6 (121-206)||(19862978-19863063)
chr6 (142-206)||(21766695-21766759)
chr6 (95-161)||(27415947-27416011)
chr6 (110-206)||(18907111-18907207)
chr6 (169-213)||(19008799-19008843)
chr6 (140-191)||(35008167-35008219)
chr6 (139-196)||(4186381-4186439)
chr6 (1-43)||(15875469-15875511)
chr6 (1-43)||(28289292-28289334)
chr6 (142-187)||(16493169-16493214)
chr6 (142-191)||(18453201-18453250)
chr6 (121-206)||(25642219-25642304)
chr6 (142-206)||(15894491-15894555)
chr6 (147-183)||(19790837-19790873)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (1-209)||(32214878-32215085)
chr2 (1-207)||(22105412-22105618)
chr2 (1-207)||(18808943-18809148)
chr2 (1-207)||(23709489-23709694)
chr2 (1-207)||(23711970-23712175)
chr2 (1-207)||(39682313-39682518)
chr2 (1-207)||(571397-571602)
chr2 (1-207)||(6725995-6726200)
chr2 (1-207)||(23130862-23131067)
chr2 (1-207)||(23133329-23133534)
chr2 (1-207)||(26505379-26505584)
chr2 (1-207)||(26507857-26508062)
chr2 (1-207)||(34402479-34402684)
chr2 (1-204)||(21155017-21155219)
chr2 (1-207)||(23135590-23135795)
chr2 (1-207)||(24367774-24367979)
chr2 (1-207)||(32039455-32039660)
chr2 (1-207)||(24898152-24898358)
chr2 (1-207)||(24900635-24900841)
chr2 (1-207)||(24903112-24903318)
chr2 (1-207)||(24905589-24905795)
chr2 (1-207)||(24908064-24908270)
chr2 (1-207)||(28577099-28577304)
chr2 (1-207)||(45029811-45030016)
chr2 (27-205)||(43137301-43137478)
chr2 (28-207)||(24529512-24529691)
chr2 (1-207)||(38967374-38967579)
chr2 (44-210)||(23060513-23060679)
chr2 (44-210)||(23076442-23076608)
chr2 (44-210)||(22337115-22337281)
chr2 (44-210)||(22731189-22731355)
chr2 (29-210)||(19671830-19672010)
chr2 (44-210)||(22738135-22738300)
chr2 (44-210)||(23285865-23286027)
chr2 (44-207)||(298769-298933)
chr2 (14-121)||(24642826-24642933)
chr2 (44-210)||(23660023-23660188)
chr2 (44-210)||(23654341-23654507)
chr2 (110-210)||(38136-38235)
chr2 (29-210)||(23708558-23708738)
chr2 (61-210)||(23103369-23103516)
chr2 (44-191)||(7688-7835)
chr2 (59-210)||(20309108-20309257)
chr2 (88-205)||(28405981-28406099)
chr2 (133-210)||(8946657-8946734)
chr2 (128-204)||(24643034-24643109)
chr2 (48-206)||(7679589-7679745)
chr2 (147-210)||(23040247-23040310)
chr2 (81-203)||(25616192-25616314)
chr2 (28-191)||(23207296-23207460)
chr2 (48-206)||(25175854-25176010)
chr2 (57-191)||(32451896-32452031)
chr2 (14-83)||(22173799-22173868)
chr2 (28-191)||(20520131-20520295)
chr2 (28-191)||(23791292-23791457)
chr2 (134-209)||(22134251-22134326)
chr2 (112-210)||(23071972-23072070)
chr2 (92-195)||(18786904-18787009)
chr2 (28-191)||(22413074-22413240)
chr2 (38-114)||(22459511-22459587)
chr2 (140-189)||(23287384-23287433)
chr2 (141-189)||(26392403-26392451)
chr2 (1-44)||(20261381-20261424)
chr2 (28-67)||(29601478-29601517)
chr2 (32-191)||(24697548-24697709)
chr2 (81-206)||(22799118-22799243)
chr2 (88-191)||(23004767-23004872)
chr2 (121-189)||(23038048-23038116)
chr2 (1-43)||(10684722-10684764)
chr2 (28-191)||(25108906-25109071)
chr2 (81-206)||(23019698-23019823)
chr2 (142-206)||(40622263-40622327)
chr2 (142-191)||(9241945-9241994)
chr2 (121-206)||(22740996-22741081)
chr2 (147-183)||(24655396-24655432)
chr2 (147-183)||(24869903-24869939)
chr2 (147-183)||(25961592-25961628)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (1-207)||(3515007-3515212)
chr4 (1-209)||(19618129-19618336)
chr4 (1-207)||(18215231-18215436)
chr4 (1-207)||(15118309-15118514)
chr4 (1-207)||(52312510-52312715)
chr4 (1-207)||(12264-12469)
chr4 (1-213)||(19242693-19242905)
chr4 (1-209)||(14970664-14970871)
chr4 (1-207)||(44615288-44615493)
chr4 (1-207)||(44773044-44773249)
chr4 (1-207)||(1837466-1837671)
chr4 (1-207)||(18239376-18239581)
chr4 (1-207)||(50222296-50222501)
chr4 (1-203)||(15355281-15355483)
chr4 (14-207)||(51463838-51464030)
chr4 (14-207)||(23803235-23803427)
chr4 (38-207)||(44928873-44929042)
chr4 (14-207)||(12610950-12611135)
chr4 (28-207)||(44102214-44102392)
chr4 (1-207)||(7641149-7641344)
chr4 (28-210)||(15367690-15367872)
chr4 (28-210)||(15402703-15402885)
chr4 (28-191)||(21815569-21815731)
chr4 (28-210)||(15371202-15371384)
chr4 (28-210)||(15373483-15373665)
chr4 (29-210)||(7798774-7798956)
chr4 (28-210)||(15370018-15370199)
chr4 (44-210)||(7088877-7089043)
chr4 (30-210)||(16223532-16223712)
chr4 (32-204)||(20149832-20150004)
chr4 (44-207)||(16377478-16377639)
chr4 (44-210)||(12902757-12902923)
chr4 (64-207)||(54798729-54798872)
chr4 (44-210)||(7893703-7893869)
chr4 (97-210)||(52873375-52873488)
chr4 (44-208)||(22636437-22636601)
chr4 (33-208)||(22353835-22354010)
chr4 (44-210)||(16270191-16270356)
chr4 (44-205)||(14038653-14038814)
chr4 (88-207)||(14280316-14280434)
chr4 (44-210)||(44052829-44052995)
chr4 (44-210)||(6899891-6900056)
chr4 (46-210)||(16239927-16240090)
chr4 (28-191)||(13789-13953)
chr4 (28-195)||(52243132-52243302)
chr4 (44-203)||(23374314-23374473)
chr4 (124-210)||(3096293-3096379)
chr4 (29-195)||(43198492-43198661)
chr4 (64-207)||(8574844-8574985)
chr4 (100-210)||(39706299-39706409)
chr4 (84-206)||(12774011-12774132)
chr4 (95-195)||(12288214-12288316)
chr4 (139-210)||(15551817-15551889)
chr4 (95-210)||(17046487-17046600)
chr4 (57-191)||(6190481-6190616)
chr4 (110-210)||(14053323-14053422)
chr4 (46-135)||(15464888-15464977)
chr4 (28-191)||(46640394-46640558)
chr4 (28-191)||(53082090-53082254)
chr4 (134-206)||(8846360-8846433)
chr4 (1-44)||(15534343-15534386)
chr4 (1-43)||(14048740-14048782)
chr4 (1-43)||(36038033-36038075)
chr4 (38-161)||(43256109-43256230)
chr4 (1-43)||(49547731-49547773)
chr4 (140-189)||(17333298-17333347)
chr4 (142-206)||(16348716-16348780)
chr4 (142-206)||(16357004-16357068)
chr4 (1-43)||(15497028-15497070)
chr4 (1-43)||(19857607-19857649)
chr4 (147-209)||(20157517-20157579)
chr4 (1-42)||(52873135-52873176)
chr4 (147-183)||(11250619-11250655)
chr4 (142-206)||(12570014-12570078)
chr4 (110-206)||(15093775-15093871)
chr4 (142-206)||(15121853-15121917)
chr4 (147-183)||(15353365-15353401)
chr4 (110-206)||(16488098-16488194)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-208)||(10772-10978)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (1-208)||(21840766-21840972)
chr1 (1-207)||(23593691-23593897)
chr1 (1-207)||(13988866-13989071)
chr1 (1-207)||(21923248-21923453)
chr1 (1-207)||(21475044-21475249)
chr1 (1-207)||(29776688-29776893)
chr1 (1-207)||(29298137-29298341)
chr1 (1-209)||(16361915-16362123)
chr1 (1-207)||(31612313-31612518)
chr1 (14-210)||(45574812-45575008)
chr1 (1-207)||(22123024-22123230)
chr1 (28-210)||(13212845-13213027)
chr1 (1-207)||(16275320-16275526)
chr1 (28-207)||(433012-433189)
chr1 (1-213)||(15859965-15860177)
chr1 (28-207)||(21346961-21347140)
chr1 (28-213)||(21342090-21342275)
chr1 (28-207)||(21707167-21707345)
chr1 (28-207)||(21711709-21711887)
chr1 (32-204)||(40389157-40389329)
chr1 (44-209)||(50210168-50210333)
chr1 (44-207)||(34509783-34509946)
chr1 (44-210)||(27250684-27250850)
chr1 (44-210)||(22532269-22532435)
chr1 (28-191)||(21896194-21896358)
chr1 (44-209)||(22468651-22468816)
chr1 (30-191)||(21861510-21861672)
chr1 (44-210)||(21026680-21026846)
chr1 (108-210)||(20847173-20847275)
chr1 (28-191)||(35261019-35261180)
chr1 (38-195)||(16758664-16758822)
chr1 (46-209)||(20135188-20135351)
chr1 (29-210)||(33681010-33681188)
chr1 (142-209)||(20454606-20454673)
chr1 (28-210)||(14295494-14295672)
chr1 (84-196)||(21754059-21754170)
chr1 (28-191)||(41049974-41050138)
chr1 (48-210)||(22237630-22237788)
chr1 (88-206)||(22921868-22921986)
chr1 (29-194)||(20918620-20918782)
chr1 (121-206)||(21714546-21714631)
chr1 (28-191)||(50614054-50614219)
chr1 (28-191)||(50621882-50622047)
chr1 (95-206)||(20248283-20248394)
chr1 (95-210)||(38801396-38801508)
chr1 (28-191)||(16368225-16368388)
chr1 (31-191)||(50686630-50686792)
chr1 (134-195)||(52928014-52928076)
chr1 (44-133)||(22354527-22354616)
chr1 (28-161)||(22130849-22130978)
chr1 (147-209)||(24783150-24783212)
chr1 (81-206)||(21788034-21788159)
chr1 (121-206)||(42865245-42865330)
chr1 (38-122)||(12271642-12271725)
chr1 (38-161)||(33797570-33797691)
chr1 (140-191)||(21533923-21533974)
chr1 (1-43)||(43543214-43543256)
chr1 (110-206)||(18182141-18182237)
chr1 (142-194)||(20958124-20958176)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-207)||(4694-4899)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-203)||(17397-17598)
scaffold0023 (1-207)||(94411-94616)
scaffold0023 (47-207)||(44454-44614)
scaffold0023 (48-206)||(100378-100534)
scaffold0023 (139-210)||(119875-119947)
scaffold0023 (48-206)||(40135-40291)
scaffold0023 (134-206)||(101503-101576)
scaffold0023 (81-206)||(38471-38596)
[»] chr3 (99 HSPs)
chr3 (1-208)||(13544024-13544230)
chr3 (1-207)||(9707564-9707769)
chr3 (1-203)||(12567564-12567765)
chr3 (1-207)||(17463178-17463383)
chr3 (1-207)||(45606864-45607069)
chr3 (1-207)||(7781304-7781509)
chr3 (1-207)||(8899094-8899299)
chr3 (1-207)||(34159326-34159531)
chr3 (1-207)||(55476491-55476696)
chr3 (1-207)||(6469091-6469296)
chr3 (1-207)||(10247680-10247885)
chr3 (1-207)||(16454238-16454443)
chr3 (1-207)||(28848568-28848773)
chr3 (1-207)||(38961848-38962053)
chr3 (1-205)||(16282768-16282971)
chr3 (1-207)||(13151747-13151953)
chr3 (1-207)||(13154212-13154418)
chr3 (3-207)||(17446614-17446816)
chr3 (1-205)||(41123892-41124092)
chr3 (28-207)||(17672626-17672804)
chr3 (14-207)||(50242822-50243014)
chr3 (28-207)||(29172566-29172745)
chr3 (14-210)||(43550448-43550644)
chr3 (1-207)||(8499518-8499725)
chr3 (28-191)||(53070637-53070799)
chr3 (28-207)||(12119708-12119887)
chr3 (1-207)||(15412429-15412636)
chr3 (44-210)||(14972854-14973020)
chr3 (1-207)||(27165250-27165457)
chr3 (44-210)||(17487856-17488022)
chr3 (44-210)||(17499338-17499504)
chr3 (29-210)||(26686887-26687069)
chr3 (27-192)||(42386428-42386594)
chr3 (75-207)||(15977515-15977646)
chr3 (44-210)||(13442274-13442440)
chr3 (44-210)||(18438534-18438700)
chr3 (44-210)||(23083316-23083482)
chr3 (44-210)||(25476340-25476506)
chr3 (29-210)||(43840932-43841114)
chr3 (1-207)||(53301461-53301669)
chr3 (59-210)||(12399209-12399360)
chr3 (59-210)||(20698405-20698556)
chr3 (44-207)||(24153164-24153326)
chr3 (44-207)||(40213676-40213838)
chr3 (95-207)||(55500942-55501053)
chr3 (64-207)||(36166598-36166739)
chr3 (44-210)||(11424718-11424880)
chr3 (44-196)||(14576788-14576939)
chr3 (28-210)||(24340661-24340844)
chr3 (64-207)||(21618449-21618590)
chr3 (29-191)||(52523666-52523831)
chr3 (63-196)||(14572603-14572735)
chr3 (28-192)||(23274705-23274870)
chr3 (103-207)||(10556985-10557088)
chr3 (107-207)||(44494809-44494908)
chr3 (28-210)||(37642203-37642386)
chr3 (108-207)||(17737236-17737337)
chr3 (48-210)||(15470927-15471085)
chr3 (95-210)||(13210333-13210448)
chr3 (95-210)||(14234487-14234602)
chr3 (29-206)||(16097332-16097509)
chr3 (29-206)||(16103784-16103960)
chr3 (84-196)||(32307691-32307802)
chr3 (81-208)||(46822267-46822394)
chr3 (38-210)||(22147474-22147646)
chr3 (28-191)||(37251106-37251270)
chr3 (29-128)||(2051138-2051238)
chr3 (95-206)||(12174265-12174376)
chr3 (28-90)||(17248225-17248287)
chr3 (146-207)||(28194693-28194755)
chr3 (95-208)||(12511059-12511172)
chr3 (46-191)||(43925977-43926123)
chr3 (154-207)||(45577947-45578000)
chr3 (104-206)||(49668091-49668193)
chr3 (81-209)||(30029841-30029968)
chr3 (104-206)||(9512924-9513026)
chr3 (104-206)||(9520899-9521001)
chr3 (28-191)||(22110290-22110454)
chr3 (142-206)||(856140-856204)
chr3 (142-206)||(23077530-23077594)
chr3 (134-196)||(1644718-1644780)
chr3 (95-191)||(12377940-12378038)
chr3 (147-209)||(14665398-14665460)
chr3 (1-43)||(54520985-54521027)
chr3 (140-189)||(13919350-13919399)
chr3 (121-206)||(15878083-15878168)
chr3 (1-41)||(29544799-29544839)
chr3 (147-209)||(14668554-14668616)
chr3 (142-206)||(11298580-11298644)
chr3 (142-206)||(14878569-14878633)
chr3 (1-36)||(12305315-12305350)
chr3 (142-191)||(606378-606428)
chr3 (143-189)||(9577646-9577691)
chr3 (141-206)||(15060284-15060349)
chr3 (142-191)||(15246037-15246086)
chr3 (121-206)||(17525190-17525275)
chr3 (147-183)||(3389994-3390030)
chr3 (141-205)||(15051509-15051573)
chr3 (158-206)||(26196500-26196548)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-207)||(20747-20952)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-207)||(37821-38026)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (1-207)||(456321-456526)
chr7 (1-207)||(15376670-15376875)
chr7 (1-207)||(16232520-16232725)
chr7 (1-207)||(20385080-20385285)
chr7 (1-207)||(21189552-21189757)
chr7 (1-207)||(32125491-32125696)
chr7 (1-207)||(41522917-41523122)
chr7 (1-207)||(41525379-41525584)
chr7 (1-206)||(11393244-11393448)
chr7 (1-207)||(11972496-11972701)
chr7 (1-207)||(14949079-14949284)
chr7 (1-207)||(18640272-18640477)
chr7 (1-207)||(24702238-24702443)
chr7 (1-207)||(27216860-27217065)
chr7 (1-207)||(16213684-16213889)
chr7 (1-207)||(16410059-16410264)
chr7 (1-210)||(18430709-18430917)
chr7 (14-210)||(13647325-13647521)
chr7 (1-207)||(24704688-24704890)
chr7 (28-207)||(44116509-44116687)
chr7 (27-207)||(3386333-3386512)
chr7 (57-203)||(24275175-24275320)
chr7 (1-207)||(13869346-13869553)
chr7 (28-207)||(17061899-17062077)
chr7 (29-207)||(20110556-20110723)
chr7 (1-207)||(26355940-26356156)
chr7 (1-207)||(26358392-26358608)
chr7 (28-203)||(38898360-38898535)
chr7 (44-207)||(3564319-3564482)
chr7 (28-191)||(12756655-12756817)
chr7 (87-207)||(48273392-48273512)
chr7 (44-210)||(12698831-12698998)
chr7 (44-207)||(18456368-18456530)
chr7 (44-210)||(38227481-38227646)
chr7 (44-210)||(9509189-9509355)
chr7 (28-210)||(2280057-2280238)
chr7 (80-207)||(13831373-13831499)
chr7 (38-210)||(26211995-26212168)
chr7 (95-210)||(10589039-10589154)
chr7 (87-210)||(67745-67868)
chr7 (88-210)||(22072913-22073036)
chr7 (14-113)||(15081919-15082019)
chr7 (28-210)||(19486682-19486865)
chr7 (44-195)||(15143993-15144143)
chr7 (110-210)||(16386268-16386369)
chr7 (28-210)||(16495402-16495580)
chr7 (95-210)||(34200786-34200901)
chr7 (95-210)||(47831807-47831922)
chr7 (112-210)||(28505321-28505419)
chr7 (59-208)||(40443393-40443541)
chr7 (29-188)||(12255730-12255892)
chr7 (28-195)||(1867933-1868101)
chr7 (48-206)||(18005650-18005806)
chr7 (100-206)||(811142-811248)
chr7 (28-192)||(10063761-10063921)
chr7 (104-206)||(14932749-14932851)
chr7 (104-206)||(15356184-15356286)
chr7 (104-206)||(15360298-15360400)
chr7 (97-206)||(44014182-44014291)
chr7 (48-195)||(16056343-16056488)
chr7 (48-210)||(16219677-16219835)
chr7 (121-204)||(18154873-18154956)
chr7 (28-191)||(20220128-20220290)
chr7 (95-210)||(27847838-27847951)
chr7 (95-210)||(11996033-11996148)
chr7 (28-187)||(15008437-15008597)
chr7 (95-210)||(15754893-15755008)
chr7 (1-61)||(13841157-13841217)
chr7 (38-122)||(15113031-15113114)
chr7 (104-195)||(12901338-12901431)
chr7 (111-210)||(15211456-15211557)
chr7 (38-122)||(15116568-15116651)
chr7 (1-44)||(11303409-11303452)
chr7 (1-43)||(16108646-16108688)
chr7 (1-55)||(18627717-18627771)
chr7 (142-206)||(12187019-12187083)
chr7 (140-195)||(14044761-14044817)
chr7 (140-195)||(14354791-14354847)
chr7 (142-206)||(17138113-17138177)
chr7 (147-209)||(2832499-2832561)
chr7 (1-43)||(23664910-23664952)
chr7 (1-43)||(29796771-29796813)
chr7 (1-43)||(29800590-29800632)
chr7 (121-206)||(19649521-19649606)
chr7 (95-161)||(2530144-2530208)
chr7 (140-191)||(18203831-18203882)
chr7 (1-43)||(14270019-14270061)
chr7 (147-183)||(9446216-9446252)
chr7 (147-183)||(20569654-20569690)
chr7 (133-184)||(48991206-48991258)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (1-207)||(264725-264930)
chr5 (1-207)||(39363384-39363589)
chr5 (1-207)||(10732897-10733102)
chr5 (1-207)||(20909012-20909217)
chr5 (1-207)||(29345980-29346185)
chr5 (1-207)||(42245322-42245527)
chr5 (1-207)||(29348453-29348658)
chr5 (1-207)||(29350926-29351131)
chr5 (1-207)||(39245136-39245341)
chr5 (1-207)||(29329934-29330136)
chr5 (1-207)||(32027393-32027598)
chr5 (1-207)||(20917909-20918110)
chr5 (28-207)||(36154767-36154942)
chr5 (29-207)||(11581184-11581361)
chr5 (28-207)||(20901992-20902172)
chr5 (28-207)||(2154597-2154776)
chr5 (32-204)||(18319021-18319193)
chr5 (28-207)||(10775660-10775838)
chr5 (28-207)||(31061068-31061247)
chr5 (1-207)||(38619434-38619641)
chr5 (5-206)||(23064512-23064714)
chr5 (32-204)||(24067110-24067282)
chr5 (44-210)||(9077952-9078118)
chr5 (44-210)||(25421532-25421698)
chr5 (44-210)||(23390451-23390617)
chr5 (44-207)||(24529223-24529386)
chr5 (44-210)||(21729019-21729185)
chr5 (44-210)||(21808344-21808510)
chr5 (44-210)||(24493569-24493734)
chr5 (102-210)||(21997547-21997655)
chr5 (44-210)||(8286797-8286964)
chr5 (44-210)||(1096467-1096633)
chr5 (44-210)||(25431395-25431560)
chr5 (64-207)||(22412187-22412329)
chr5 (44-210)||(13025311-13025476)
chr5 (44-210)||(13095495-13095660)
chr5 (44-210)||(22075018-22075185)
chr5 (44-191)||(22144068-22144215)
chr5 (29-206)||(21565546-21565723)
chr5 (110-210)||(21292992-21293090)
chr5 (134-210)||(21329541-21329618)
chr5 (28-210)||(40725853-40726036)
chr5 (100-210)||(21502167-21502277)
chr5 (61-191)||(37723922-37724050)
chr5 (95-191)||(20026945-20027043)
chr5 (134-210)||(19660879-19660956)
chr5 (95-206)||(22959538-22959649)
chr5 (48-210)||(26011995-26012154)
chr5 (81-208)||(17517193-17517320)
chr5 (111-200)||(18418590-18418678)
chr5 (31-191)||(22178161-22178323)
chr5 (112-210)||(36314577-36314675)
chr5 (121-206)||(26704075-26704160)
chr5 (121-206)||(26973808-26973893)
chr5 (64-144)||(20766095-20766174)
chr5 (153-207)||(20806850-20806904)
chr5 (95-210)||(19668898-19669013)
chr5 (110-206)||(21873254-21873350)
chr5 (141-194)||(26732884-26732937)
chr5 (38-161)||(18356364-18356485)
chr5 (141-191)||(26740697-26740747)
chr5 (142-206)||(22032323-22032387)
chr5 (88-161)||(29448052-29448126)
chr5 (95-161)||(20910805-20910869)
chr5 (1-43)||(9776521-9776563)
chr5 (142-191)||(23469822-23469871)
chr5 (142-206)||(18770054-18770118)
chr5 (142-206)||(20805552-20805616)
chr5 (143-206)||(20766974-20767037)
chr5 (136-206)||(23501402-23501472)
chr5 (121-206)||(14079149-14079234)
chr5 (142-191)||(21328268-21328317)
chr5 (142-187)||(21731514-21731559)
chr5 (142-187)||(21809634-21809679)
chr5 (121-206)||(23201360-23201445)
chr5 (142-206)||(23512098-23512162)
chr5 (142-206)||(23572084-23572148)
chr5 (147-183)||(26680605-26680641)
chr5 (147-183)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-209)||(12206-12413)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-207)||(13947-14152)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (3-209)||(11286-11491)
scaffold0029 (142-206)||(12763-12827)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (5-203)||(501088-501285)
scaffold0001 (28-207)||(85563-85742)
scaffold0001 (29-206)||(160688-160864)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (3-208)||(9241-9445)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-207)||(13392-13597)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-207)||(136680-136885)
scaffold0028 (1-207)||(139149-139354)
scaffold0028 (1-207)||(144087-144292)
scaffold0028 (1-207)||(134211-134416)
scaffold0028 (1-207)||(141618-141823)
scaffold0028 (84-206)||(132662-132784)
scaffold0028 (105-192)||(62216-62303)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (28-207)||(158434-158612)
scaffold0003 (44-207)||(339905-340065)
scaffold0003 (95-161)||(71350-71414)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (14-207)||(82072-82264)
scaffold0037 (29-195)||(22610-22776)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-207)||(40400-40605)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (14-207)||(106-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (28-207)||(16784-16962)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (28-212)||(9744-9928)
scaffold0145 (44-210)||(32942-33107)
scaffold0145 (44-210)||(38761-38926)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (28-204)||(4300-4475)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (14-207)||(12064-12250)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (28-207)||(29931-30110)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (14-204)||(1250-1440)
scaffold0101 (121-206)||(8995-9080)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (28-191)||(79268-79430)
scaffold0056 (44-209)||(17170-17337)
scaffold0056 (142-206)||(14139-14203)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (28-207)||(4214-4392)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (28-207)||(2112-2291)
scaffold0247 (28-210)||(17965-18148)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (28-191)||(20364-20524)
scaffold0031 (44-210)||(128751-128916)
scaffold0031 (121-206)||(65830-65915)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (28-207)||(161073-161252)
scaffold0007 (28-127)||(164574-164674)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (44-210)||(3106-3271)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-207)||(38613-38820)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (38-210)||(51913-52085)
scaffold0011 (59-210)||(167948-168099)
scaffold0011 (142-191)||(38204-38253)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (44-210)||(13211-13377)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (44-207)||(22886-23048)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (44-203)||(26020-26179)
scaffold0122 (64-207)||(44682-44825)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (44-209)||(3141-3306)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (44-208)||(39479-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (44-208)||(75170-75333)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (44-210)||(1851-2017)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (59-210)||(1018-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (44-210)||(4849-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (44-210)||(3470-3636)
scaffold0292 (44-210)||(343-508)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (44-210)||(16555-16721)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (45-210)||(16113-16278)
scaffold0120 (44-210)||(32913-33077)
scaffold0120 (44-210)||(45928-46092)
scaffold0120 (149-210)||(17389-17450)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (29-210)||(8472-8650)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (44-210)||(4508-4673)
scaffold0228 (44-210)||(12090-12255)
scaffold0228 (44-210)||(22042-22207)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (44-210)||(25896-26061)
scaffold0026 (44-210)||(39858-40023)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (95-210)||(28414-28529)
scaffold0046 (95-210)||(11292-11407)
scaffold0046 (95-210)||(1997-2112)
scaffold0046 (157-210)||(4552-4605)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (61-210)||(8479-8628)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (44-210)||(6076-6245)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (29-195)||(8481-8650)
scaffold0621 (48-210)||(6535-6695)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (44-192)||(24257-24406)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (59-210)||(1952-2103)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (64-207)||(116430-116571)
scaffold0022 (28-191)||(128908-129072)
scaffold0022 (28-187)||(78345-78504)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (44-210)||(39913-40078)
scaffold0080 (89-191)||(19883-19987)
scaffold0080 (142-183)||(18708-18749)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (28-195)||(27687-27855)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (28-191)||(53487-53651)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (28-210)||(11464-11647)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (28-210)||(38194-38377)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (119-210)||(4712-4803)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (28-191)||(13147-13312)
scaffold0357 (28-195)||(16038-16206)
scaffold0357 (140-191)||(2680-2732)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (44-210)||(10381-10544)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (59-210)||(32067-32216)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (44-147)||(3485-3588)
scaffold0327 (147-206)||(289-348)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (61-209)||(174767-174913)
scaffold0021 (141-210)||(121766-121835)
scaffold0021 (95-191)||(136373-136471)
scaffold0021 (95-191)||(145081-145179)
scaffold0021 (44-120)||(124675-124751)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (29-158)||(13144-13274)
scaffold0175 (95-210)||(34123-34238)
scaffold0175 (154-210)||(273-329)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (44-210)||(15420-15584)
scaffold0114 (142-206)||(7295-7359)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-191)||(12587-12750)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (110-210)||(13497-13596)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (110-210)||(11464-11564)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (95-207)||(15664-15776)
scaffold0261 (121-206)||(1339-1424)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (49-122)||(13092-13165)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (29-195)||(10481-10647)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (100-210)||(6134-6244)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (28-210)||(1012-1190)
scaffold0184 (147-183)||(4284-4320)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (48-196)||(129919-130066)
scaffold0010 (28-191)||(60653-60818)
scaffold0010 (143-191)||(666-714)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (48-206)||(19268-19424)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (29-206)||(45732-45909)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (44-210)||(20910-21077)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (100-210)||(15788-15898)
scaffold0020 (143-206)||(178898-178961)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-189)||(7997-8161)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (95-210)||(16282-16395)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (28-153)||(225465-225589)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (134-210)||(6611-6688)
scaffold0333 (134-210)||(13991-14068)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (28-191)||(6221-6386)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (88-210)||(32538-32657)
scaffold0034 (44-191)||(51839-51985)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (48-206)||(133-290)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (88-206)||(2805-2923)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (28-195)||(25121-25288)
scaffold0123 (28-128)||(620-719)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (88-206)||(14696-14814)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-83)||(6070-6152)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (48-196)||(5657-5803)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (95-210)||(1289-1402)
scaffold0106 (142-207)||(15291-15356)
scaffold0106 (95-210)||(7266-7379)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (59-189)||(4545-4675)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (108-191)||(1051-1134)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (139-210)||(1083-1155)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (28-191)||(97024-97189)
scaffold0006 (28-191)||(106302-106467)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (144-210)||(4888-4954)
scaffold0395 (44-151)||(918-1021)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (95-210)||(51582-51695)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (134-206)||(1086-1159)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (121-206)||(23843-23928)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (44-129)||(27911-27996)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (36-100)||(12039-12103)
scaffold0503 (149-191)||(11982-12024)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (44-187)||(38339-38483)
scaffold0139 (121-206)||(19980-20065)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (110-210)||(46995-47093)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (59-210)||(1021-1170)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (104-206)||(29558-29660)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (95-210)||(12942-13054)
scaffold0138 (27-117)||(18175-18265)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (32-195)||(8016-8180)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (104-210)||(23898-24001)
scaffold0100 (1-43)||(36023-36065)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (95-210)||(12766-12881)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (139-206)||(2694-2762)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (88-195)||(10542-10649)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (95-207)||(5136-5246)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (134-206)||(28813-28887)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (84-206)||(32102-32224)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (95-196)||(6826-6927)
scaffold0556 (48-135)||(8090-8176)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (28-191)||(267679-267843)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (59-151)||(6669-6761)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (143-206)||(36454-36517)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (111-210)||(192997-193098)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (121-206)||(69794-69879)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (57-191)||(569-702)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (28-191)||(1736-1900)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (104-183)||(29117-29196)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-43)||(3186-3228)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (81-206)||(4796-4921)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (140-189)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (142-206)||(1881-1945)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (142-206)||(10575-10639)
scaffold0297 (146-206)||(15736-15796)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (142-206)||(21856-21920)
scaffold0210 (142-206)||(29748-29812)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (38-161)||(15365-15486)
scaffold0107 (142-191)||(36199-36248)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (95-195)||(103635-103737)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (104-191)||(2694-2783)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-43)||(1591-1633)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (28-158)||(57-188)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (142-206)||(6095-6159)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (142-206)||(26828-26892)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (142-206)||(44081-44145)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (147-206)||(159-218)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (145-183)||(4999-5037)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (110-183)||(16369-16442)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (88-153)||(2217-2281)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (142-191)||(7450-7499)
scaffold0111 (142-191)||(14569-14618)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (121-206)||(18236-18321)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (147-183)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (143-191)||(3276-3324)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (142-206)||(1830-1894)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (142-206)||(14664-14728)
scaffold0081 (142-206)||(23679-23743)
scaffold0081 (142-206)||(39103-39167)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (143-191)||(30350-30398)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16413273 - 16413474
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413273 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 16413372  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413373 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 16413471  T
Q  201 atg 203  Q
    |||    
T  16413472 atg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14409401 - 14409606
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409401 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 14409500  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409501 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 14409599  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  14409600 atgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1484607 - 1484402
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484607 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 1484508  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484507 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 1484409  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  1484408 atgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 5853249 - 5853454
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853249 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 5853348  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853349 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 5853447  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  5853448 atgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20403432 - 20403227
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403432 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 20403333  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403332 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 20403234  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  20403233 atgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22001958 - 22001753
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001958 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 22001859  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001858 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22001760  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  22001759 atgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15203188 - 15203393
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203188 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 15203287  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15203288 gacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaag 15203386  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  15203387 atgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 20046152 - 20046357
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20046152 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgtt 20046251  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046252 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 20046350  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  20046351 atgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4483485 - 4483281
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483485 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 4483386  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483385 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 4483288  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  4483287 atgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 4542330 - 4542535
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4542330 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgtt 4542429  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542430 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-cttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 4542528  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  4542529 atgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41598366 - 41598188
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598366 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41598267  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598266 gctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19896466 - 19896265
Alignment:
Q  8 ttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 107  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896466 ttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 19896367  T
Q  108 atttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896366 atttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 19896268  T
Q  205 tga 207  Q
    |||    
T  19896267 tga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14823978 - 14823774
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823978 tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 14823879  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14823878 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaag 14823781  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  14823780 atgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 45290651 - 45290853
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-t 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45290651 tatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgat 45290750  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290751 tggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 45290849  T
Q  200 gatg 203  Q
    ||||    
T  45290850 gatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484430
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac--------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26224097 - 26223917
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224097 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26223998  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26223997 gctatttttgtatattg-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 19936975 - 19937174
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 112  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19936975 gatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttg 19937074  T
Q  113 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19937075 atcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcc 19937173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15070765 - 15070571
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15070765 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttga 15070666  T
Q  99 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092463
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818530
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  29 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759255
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372778
Alignment:
Q  56 atatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 155  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  156 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649164
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536208
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406379
Alignment:
Q  43 ttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 140  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924049
Alignment:
Q  61 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 160  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  161 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919121
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 157  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  158 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626736
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875065
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22875132  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879352
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 13508023 - 13508188
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  13508023 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 13508122  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    || || || || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508123 tgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971257
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 13597555 - 13597720
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  13597555 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 13597654  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    || || ||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597655 tgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20498745 - 20498581
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  20498745 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 20498646  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498645 tgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855372
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520368
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||    
T  6520384 gattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24486001 - 24486093
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486001 tatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23648719 - 23648554
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  23648719 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttat-tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatc 23648621  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648620 tgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 32810136 - 32810054
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810136 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37116531 - 37116366
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  37116531 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 37116433  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116432 tgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678221
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140916
Alignment:
Q  107 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  206 gatgt 210  Q
    |||||    
T  17140920 gatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490995
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121734
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32121761 gtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389571
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396101
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778897
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790594
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 983410 - 983512
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  193 tga 195  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 17266931 - 17267096
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17266931 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 17267029  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  | | |||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267030 tgaaccg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439609
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 141  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 17439558  T
Q  142 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439559 ctgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21249500 - 21249384
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249500 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21249402  T
Q  193 tgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | |||||||||||||    
T  21249401 tgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21255338 - 21255222
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255338 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21255240  T
Q  193 tgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | |||||||||||||    
T  21255239 tgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355815
Alignment:
Q  89 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T
Q  188 taagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  26355797 taagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673718
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  187 ctaagttgat 196  Q
    ||||||||||    
T  21673727 ctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24353203 - 24353039
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||| |||||| |||  || |  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||    
T  24353203 tttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatca 24353106  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353105 tgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 19154930 - 19154989
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154930 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 35026853 - 35026895
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026853 tatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 23776827 - 23776952
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || | |||||||||  | ||||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  23776827 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatga 23776926  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||  | |||| ||| ||||||||||    
T  23776927 gtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 17926758 - 17926822
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  17926758 ctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 17926822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24755778 - 24755714
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  24755778 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 24755714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 30676667 - 30676874
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676667 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 30676766  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676767 gacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 30676865  T
Q  201 atgatgatg 209  Q
    ||| |||||    
T  30676866 atgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34963578 - 34963371
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963578 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 34963479  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963478 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 34963380  T
Q  201 atgatgatg 209  Q
    ||| |||||    
T  34963379 atgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12742522 - 12742317
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742522 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 12742423  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742422 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 12742324  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  12742323 atgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19005251 - 19005046
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005251 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 19005152  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005151 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 19005053  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  19005052 atgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22782432 - 22782227
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782432 tatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgtt 22782333  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782332 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22782234  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  22782233 atgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24422752 - 24422547
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422752 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24422653  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422652 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 24422554  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  24422553 atgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33861999 - 33861794
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861999 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 33861900  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861899 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 33861801  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  33861800 atgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33864483 - 33864278
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864483 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 33864384  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864383 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 33864285  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  33864284 atgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25656831 - 25656629
Alignment:
Q  4 gatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25656831 gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaac 25656732  T
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T
Q  204 atga 207  Q
    ||||    
T  25656632 atga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8055234 - 8055029
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055234 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 8055135  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055134 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 8055036  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  8055035 atgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18334549 - 18334754
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334549 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 18334648  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334649 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 18334747  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  18334748 atgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 19858876 - 19859081
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858876 tatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 19858975  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858976 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 19859074  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  19859075 atgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 2291137 - 2291342
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291137 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 2291236  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291237 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 2291335  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  2291336 atgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 26924597 - 26924802
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924597 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 26924696  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924697 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 26924795  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  26924796 atgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25688706 - 25688502
Alignment:
Q  2 atgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688706 atgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 25688607  T
Q  102 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25688606 acttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaaga 25688508  T
Q  202 tgatga 207  Q
    | ||||    
T  25688507 taatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 1540868 - 1541073
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540868 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 1540967  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1540968 gacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaag 1541066  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  1541067 atgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1595754 - 1595549
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595754 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 1595655  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1595654 gaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaag 1595556  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  1595555 atgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754809
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557054
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga--aattgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Original strand, 3852000 - 3852179
Alignment:
Q  27 ttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3852000 ttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtca 3852099  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852100 tgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18456897 - 18456735
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456897 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18456798  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456797 gctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448686
Alignment:
Q  32 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  131 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060540
Alignment:
Q  47 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcc 146  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  57 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg 18461930  T
Q  157 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287917
Alignment:
Q  61 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 160  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  161 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361081
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629476
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409947
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496244
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593773
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076700
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttact 20076767  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  144 gcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303661
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 19303594  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780348
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Original strand, 19847933 - 19848114
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||      
T  19847933 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgt 19848032  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848033 tgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638404
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 125  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  126 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 8227449 - 8227632
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  8227449 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 8227548  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227549 tgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245586
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  144 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019408
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  148 atgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
      | |||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
      | |||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992429
Alignment:
Q  97 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  197 taagatgatgat 208  Q
    ||||||| ||||    
T  23992440 taagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcc 146  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||||    
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  147 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652199
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 16920602 - 16920751
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| | | |||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||    
T  16920602 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtt 16920698  T
Q  159 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  16920699 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561303
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  192 ttga 195  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Original strand, 15041522 - 15041644
Alignment:
Q  61 tgcattacttga-attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 159  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||    
T  15041522 tgcattacttgagattttat-tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattg 15041620  T
Q  160 ttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15041621 ttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  163 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603506
Alignment:
Q  111 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgatg 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  210 t 210  Q
    |    
T  25603506 t 25603506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611844
Alignment:
Q  111 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgatg 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  210 t 210  Q
    |    
T  25611844 t 25611844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12942406 - 12942363
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12942406 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185928
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11185605 - 11185524
Alignment:
Q  108 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185605 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23076914 - 23076749
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||  |||||||| |  || ||||||||||||| ||     
T  23076914 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatct 23076816  T
Q  127 tgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
     | | | |||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076815 ggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766695
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Original strand, 27415947 - 27416011
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415947 gttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg--tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18907207 - 18907111
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907207 ttgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  169 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4186439 - 4186381
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4186439 atactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 15875511 - 15875469
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15875511 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 28289292 - 28289334
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28289292 tatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 25642219 - 25642304
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  25642219 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 15894491 - 15894555
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  15894491 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 15894555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 32214878 - 32215085
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214878 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 32214977  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214978 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 32215076  T
Q  201 atgatgatg 209  Q
    ||| |||||    
T  32215077 atgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22105618 - 22105412
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22105618 tatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgtt 22105519  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105518 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22105419  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  22105418 atgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18809148 - 18808943
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809148 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 18809049  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809048 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 18808950  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  18808949 atgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 23709489 - 23709694
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709489 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 23709588  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709589 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 23709687  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  23709688 atgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 23711970 - 23712175
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711970 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 23712069  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712070 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 23712168  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  23712169 atgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39682518 - 39682313
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682518 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 39682419  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682418 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 39682320  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  39682319 atgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 571602 - 571397
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  571602 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgtt 571503  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571502 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 571404  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  571403 atgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6726200 - 6725995
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726200 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 6726101  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726100 gacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 6726002  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  6726001 atgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23131067 - 23130862
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131067 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 23130968  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130967 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 23130869  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  23130868 atgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23133534 - 23133329
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133534 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 23133435  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133434 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 23133336  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  23133335 atgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26505584 - 26505379
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505584 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 26505485  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505484 gacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 26505386  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  26505385 atgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26508062 - 26507857
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508062 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 26507963  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507962 gacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 26507864  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  26507863 atgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 34402479 - 34402684
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402479 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 34402578  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402579 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 34402677  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  34402678 atgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21155017 - 21155219
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155017 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 21155116  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155117 gacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 21155215  T
Q  201 atga 204  Q
    ||||    
T  21155216 atga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23135795 - 23135590
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135795 tatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 23135696  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135695 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 23135597  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  23135596 atgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24367979 - 24367774
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367979 tatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24367880  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24367879 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaa 24367781  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  24367780 atgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 32039455 - 32039660
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039455 tatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 32039554  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32039555 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaag 32039653  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  32039654 atgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24898152 - 24898358
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898152 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24898251  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898252 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24898350  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  24898351 gatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24900635 - 24900841
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900635 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24900734  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900735 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24900833  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  24900834 gatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24903112 - 24903318
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903112 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24903211  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903212 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24903310  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  24903311 gatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24905589 - 24905795
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905589 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24905688  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905689 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24905787  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  24905788 gatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24908064 - 24908270
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908064 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24908163  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908164 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24908262  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  24908263 gatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28577304 - 28577099
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577304 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 28577205  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577204 ggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 28577106  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  28577105 atgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 45029811 - 45030016
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029811 tatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 45029910  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029911 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 45030009  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  45030010 atgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43137478 - 43137301
Alignment:
Q  27 ttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137478 ttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 43137379  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 205  Q
    || |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137378 tgttgtttttgtata-ttactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 24529512 - 24529691
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24529512 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtca 24529611  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529612 tgctgtttttgtatactg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38967579 - 38967374
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-t 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38967579 tatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgat 38967481  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967480 tgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38967382  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  38967381 gatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060513
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076442
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337115
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731355
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671830
Alignment:
Q  29 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738300
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738235 gcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285865
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298933
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  144 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 24642826 - 24642933
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 24642925  T
Q  114 tattatta 121  Q
    ||||||||    
T  24642926 tattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660023
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654507
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708738
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103516
Alignment:
Q  61 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 160  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  161 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  144 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309108
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  159 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  187 ctaagttgattaagatgat 205  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7679745 - 7679589
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  ||  || |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  7679745 atataattatatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 7679649  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679648 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616192
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23207460 - 23207296
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23207460 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatca 23207363  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207362 tgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175854
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Original strand, 32451896 - 32452031
Alignment:
Q  57 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 155  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  32451896 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 32451994  T
Q  156 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451995 gtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 83  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 20520131 - 20520295
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  20520131 tttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatca 20520228  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  ||| |||| | |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520229 tgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23791457 - 23791292
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23791457 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatca 23791359  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  ||| |||| | |||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791358 tgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  112 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Original strand, 18786904 - 18787009
Alignment:
Q  92 gacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 188  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||  |||  |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786904 gacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactg-gtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 18787002  T
Q  189 aagttga 195  Q
    |||||||    
T  18787003 aagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 22413074 - 22413240
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatat--tattatgt 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||  | |||| |    
T  22413074 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatat 22413171  T
Q  125 catg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413172 catgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 114  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20261424 - 20261381
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20261424 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29601517 - 29601478
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601517 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697709
Alignment:
Q  32 atgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 130  Q
    ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||      
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaa 24697646  T
Q  131 gtttttg-tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
     | |||| | ||||||||| |||| || |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697647 ctgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 22799118 - 22799243
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || | |||||||||| | |||||| |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22799118 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22799217  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||  | |||| ||| ||||||||||    
T  22799218 gtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004767
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 185  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   | |||| | |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 23004773  T
Q  186 tctaag 191  Q
    | ||||    
T  23004772 tttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 10684722 - 10684764
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10684722 tatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25109071 - 25108906
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||  ||||||| ||   ||||||||| |||| |||    
T  25109071 tttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatca 25108973  T
Q  127 tgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||   | |||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108972 tgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 23019698 - 23019823
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || | |||||||||| | |||||| |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||    
T  23019698 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatga 23019797  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||  | |||| ||||||||||||||    
T  23019798 gtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 40622263 - 40622327
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  40622263 ctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 22740996 - 22741081
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22740996 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3515212 - 3515007
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515212 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 3515113  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515112 gacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 3515014  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  3515013 atgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19618129 - 19618336
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19618129 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgtt 19618228  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618229 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 19618327  T
Q  201 atgatgatg 209  Q
    ||| |||||    
T  19618328 atgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18215231 - 18215436
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215231 tatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 18215330  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215331 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 18215429  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  18215430 atgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15118309 - 15118514
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118309 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 15118408  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118409 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 15118507  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  15118508 atgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52312715 - 52312510
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312715 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 52312616  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312615 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 52312517  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  52312516 atgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12264 - 12469
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264 tatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 12363  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12364 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 12462  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  12463 atgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19242905 - 19242693
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242905 tatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 19242806  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242805 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 19242707  T
Q  200 gatgatgatgtcca 213  Q
    |||||||| |||||    
T  19242706 gatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14970664 - 14970871
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970664 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 14970763  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14970764 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaa 14970862  T
Q  201 atgatgatg 209  Q
    ||| |||||    
T  14970863 atgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44615493 - 44615288
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615493 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 44615394  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615393 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 44615295  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  44615294 atgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 44773044 - 44773249
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44773044 tatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgtt 44773143  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773144 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 44773242  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  44773243 atgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 1837466 - 1837671
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837466 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 1837565  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837566 gacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 1837664  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  1837665 atgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18239376 - 18239581
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239376 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 18239475  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239476 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 18239574  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  18239575 atgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 50222296 - 50222501
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222296 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 50222395  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222396 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 50222494  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  50222495 atgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 15355281 - 15355483
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-t 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15355281 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgat 15355380  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355381 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 15355479  T
Q  200 gatg 203  Q
    ||||    
T  15355480 gatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464030
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803427
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 207
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929042
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610950
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt--------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44102392 - 44102214
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44102392 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 44102293  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102292 gctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 7641149 - 7641344
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7641149 tatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgtt 7641248  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641249 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg-----------tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 7641337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15367872 - 15367690
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367872 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15367773  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15367772 tgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15402885 - 15402703
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402885 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15402786  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15402785 tgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 21815569 - 21815731
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21815569 tttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcat 21815668  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815669 gctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15371384 - 15371202
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371384 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 15371285  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15371284 tgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15373665 - 15373483
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373665 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 15373566  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15373565 tgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798774
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15370199 - 15370018
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15370101  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15370100 tgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088877
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223532
Alignment:
Q  30 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149832
Alignment:
Q  32 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  131 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377639
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatact 16377575  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902757
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798872
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893703
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 210
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873488
Alignment:
Q  97 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  197 taagatgatgatgt 210  Q
     |||||||||||||    
T  52873475 gaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353835
Alignment:
Q  33 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |  |  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270356
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 16270289  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038653
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 205  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280316
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14280336  T
Q  188 taagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14280335 taagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052829
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899891
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240090
Alignment:
Q  46 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 145  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc 16240025  T
Q  146 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 13789 - 13953
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  13789 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 13888  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13889 tgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 52243132 - 52243302
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  52243132 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatca 52243231  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    ||  |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243232 tgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 203
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374473
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  124 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  128 g-ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |  |  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706409
Alignment:
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  199 agatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||    
T  39706398 agatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  84 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  183 cggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  192 ttga 195  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17046600 - 17046487
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17046600 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 17046504  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  17046503 gttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6190616 - 6190481
Alignment:
Q  57 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 155  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  6190616 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 6190518  T
Q  156 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190517 gtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 135
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  46 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 135  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 46640394 - 46640558
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| |||    
T  46640394 tttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatca 46640491  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640492 tgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 53082090 - 53082254
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  53082090 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatca 53082187  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082188 tgaactgtttta-tgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15534386 - 15534343
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15534386 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 14048782 - 14048740
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14048782 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 36038075 - 36038033
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36038075 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Original strand, 43256109 - 43256230
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |    ||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  || |    
T  43256109 ttataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgg 43256206  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  43256207 tatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 49547731 - 49547773
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49547731 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 16348716 - 16348780
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  16348716 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16348780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 16357004 - 16357068
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  16357004 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 15497028 - 15497070
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15497028 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19857649 - 19857607
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19857649 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 20157517 - 20157579
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20157517 tatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 52873135 - 52873176
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttata 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  52873135 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12570078 - 12570014
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  12570078 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12570014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15093871 - 15093775
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  15093871 ttgatattatgaagtcatgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 15121853 - 15121917
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15121853 ctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Original strand, 16488098 - 16488194
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  16488098 ttgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16488194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10772
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10978 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 10879  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10878 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 10780  T
Q  201 atgatgat 208  Q
    ||| ||||    
T  10779 atgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21840972 - 21840766
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840972 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 21840873  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840872 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 21840774  T
Q  201 atgatgat 208  Q
    ||| ||||    
T  21840773 atgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 23593691 - 23593897
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593691 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 23593790  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593791 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 23593889  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  23593890 gatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13989071 - 13988866
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989071 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 13988972  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988971 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 13988873  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  13988872 atgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21923248 - 21923453
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923248 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 21923347  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923348 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 21923446  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  21923447 atgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21475044 - 21475249
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475044 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 21475143  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21475144 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaag 21475242  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  21475243 atgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29776893 - 29776688
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776893 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 29776794  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776793 gacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 29776695  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  29776694 atgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29298341 - 29298137
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298341 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 29298242  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298241 gacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 29298144  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  29298143 atgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16362123 - 16361915
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16362123 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgt 16362024  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362023 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 16361925  T
Q  200 gatgatgatg 209  Q
    |||| |||||    
T  16361924 gatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31612518 - 31612313
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31612518 tatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgtt 31612419  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612418 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 31612320  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  31612319 atgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45575008
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 22123024 - 22123230
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22123024 tatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgtt 22123123  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22123124 gacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaa 22123222  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  22123223 gatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 13212845 - 13213027
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212845 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 13212944  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || |||||||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212945 tgttgtttttgtatactg-ttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16275320 - 16275526
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-t 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16275320 tatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgat 16275419  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16275420 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaa 16275518  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  16275519 gatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 433189 - 433012
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  433189 tttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 433090  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433089 tgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15859965 - 15860177
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-t 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  15859965 tatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgat 15860064  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15860065 tgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 15860163  T
Q  200 gatgatgatgtcca 213  Q
    |||||||| |||||    
T  15860164 gatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21347140 - 21346961
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347140 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 21347041  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    || ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347040 tgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21342275 - 21342090
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342275 tttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 21342176  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 213  Q
    || |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342175 tgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21707345 - 21707167
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21707345 tttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcat 21707246  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707245 gctttttttgtatact-attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21711887 - 21711709
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21711887 tttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcat 21711788  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711787 gctttttttgtatact-attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389157
Alignment:
Q  32 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  131 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210333
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509783
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250850
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532269
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 21896194 - 21896358
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  21896194 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 21896293  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896294 tgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468816
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  30 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 128  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026680
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  108 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  208 tgt 210  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 35261019 - 35261180
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  35261019 tttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatca 35261115  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261116 tgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 135  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  136 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135188
Alignment:
Q  46 tgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 144  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  145 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681010
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 14295494 - 14295672
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  14295494 tttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcat 14295589  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  14295590 gatg-gtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754059
Alignment:
Q  84 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 182  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  183 cggtctaagttgat 196  Q
    ||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 41049974 - 41050138
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  41049974 tttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 41050071  T
Q  127 tgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050072 tgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237630
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921986
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    | || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918686 gatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 50614054 - 50614219
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||   || |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  50614054 tttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaaga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 50614152  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614153 tgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 50621882 - 50622047
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||   || |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  50621882 tttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaaga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 50621980  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621981 tgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  194 gattaagatgatg 206  Q
    ||| | |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 38801396 - 38801508
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38801396 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgtt---gcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagat 38801491  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  38801492 gttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 16368225 - 16368388
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||   ||    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||    
T  16368225 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg--ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatca 16368321  T
Q  127 tgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||   | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368322 tgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686630
Alignment:
Q  31 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 129  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||     
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatga 50686694  T
Q  130 tgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
      | |||| |  |||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686693 actattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 133
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 133  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 22130849 - 22130978
Alignment:
Q  28 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  22130849 tttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 22130944  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    || ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22130945 tgatg-gtttggatactgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 21788034 - 21788159
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || | |||||||||  | ||||||||||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  21788034 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatga 21788133  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21788134 gtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 122  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33797691 - 33797570
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |    ||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  33797691 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttg 33797594  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  33797593 tatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 43543256 - 43543214
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43543256 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Original strand, 18182141 - 18182237
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18182141 ttgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20958176 - 20958124
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20958176 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttg 20958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4899 - 4694
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4899 tatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 4800  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4799 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattagg 4701  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  4700 atgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17598
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17397 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 17496  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17497 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 17595  T
Q  201 atg 203  Q
    |||    
T  17596 atg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 94616 - 94411
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94616 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 94517  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94516 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 94418  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  94417 atgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  47 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  146 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100378
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40291
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  ||||||||    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  148 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 38471 - 38596
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || | |||||||||  | |||||| |||| ||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38471 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 38570  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||  | |||| ||||||||||||||    
T  38571 gtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 99)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13544230 - 13544024
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544230 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 13544131  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544130 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 13544032  T
Q  201 atgatgat 208  Q
    ||| ||||    
T  13544031 atgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 9707564 - 9707769
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707564 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 9707663  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707664 gacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 9707762  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  9707763 atgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12567765 - 12567564
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567765 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 12567666  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567665 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 12567567  T
Q  201 atg 203  Q
    |||    
T  12567566 atg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17463383 - 17463178
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463383 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 17463284  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463283 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 17463185  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  17463184 atgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 45606864 - 45607069
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606864 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 45606963  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606964 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 45607062  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  45607063 atgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 7781304 - 7781509
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781304 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 7781403  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781404 gatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 7781502  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  7781503 atgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8899299 - 8899094
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899299 tatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 8899200  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8899199 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaag 8899101  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  8899100 atgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34159531 - 34159326
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159531 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 34159432  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159431 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 34159333  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  34159332 atgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55476696 - 55476491
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476696 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 55476597  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476596 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 55476498  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  55476497 atgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 6469091 - 6469296
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6469091 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgtt 6469190  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469191 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 6469289  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  6469290 atgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10247680 - 10247885
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247680 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 10247779  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10247780 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaag 10247878  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  10247879 atgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16454238 - 16454443
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454238 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 16454337  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16454338 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 16454436  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  16454437 atgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 28848568 - 28848773
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848568 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 28848667  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848668 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 28848766  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  28848767 atgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 38961848 - 38962053
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961848 tatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 38961947  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38961948 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaa 38962046  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  38962047 atgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16282768 - 16282971
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282768 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 16282867  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282868 gacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 16282966  T
Q  201 atgat 205  Q
    |||||    
T  16282967 atgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 13151747 - 13151953
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151747 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 13151846  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151847 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 13151945  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  13151946 gatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 13154212 - 13154418
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154212 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 13154311  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154312 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 13154410  T
Q  200 gatgatga 207  Q
    ||||||||    
T  13154411 gatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446816
Alignment:
Q  3 tgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  103 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagat 17446811  T
Q  203 gatga 207  Q
    |||||    
T  17446812 gatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41124092 - 41123892
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124092 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 41123993  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123992 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 41123897  T
Q  201 atgat 205  Q
    |||||    
T  41123896 atgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17672804 - 17672626
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672804 tttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 17672705  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672704 gctgtttttgtatactg-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242822
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 29172566 - 29172745
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172566 tttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29172665  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172666 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550644
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8499725 - 8499518
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||     
T  8499725 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattga 8499626  T
Q  99 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  199 agatgatga 207  Q
    |||||||||    
T  8499526 agatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 53070637 - 53070799
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53070637 tttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 53070736  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070737 gttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 12119708 - 12119887
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119708 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 12119807  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119808 tgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15412636 - 15412429
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15412636 tatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttga 15412537  T
Q  99 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15412438  T
Q  199 agatgatga 207  Q
    |||||||||    
T  15412437 agatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972854
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27165457 - 27165250
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  |||     
T  27165457 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattga 27165358  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165357 tgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 27165259  T
Q  199 agatgatga 207  Q
    |||||||||    
T  27165258 agatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487856
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499338
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686887
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42386594 - 42386428
Alignment:
Q  27 ttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 125  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42386594 ttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtc 42386495  T
Q  126 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386494 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977515
Alignment:
Q  75 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagct 15977548  T
Q  175 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977547 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442274
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18438700 - 18438534
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438700 tgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 18438601  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18438600 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083482
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476506
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840932
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 53301461 - 53301669
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||     
T  53301461 tatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattga 53301560  T
Q  100 -tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 197  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53301561 atgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatt 53301659  T
Q  198 aagatgatga 207  Q
    ||||||||||    
T  53301660 aagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399209
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698556
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153326
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 24153262  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213838
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 g-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500942
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 55500955  T
Q  195 attaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||    
T  55500954 attaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424880
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 24340661 - 24340844
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  24340661 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 24340760  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || || || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  24340761 tgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618449
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  128 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  63 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 162  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  163 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23274870 - 23274705
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  23274870 tttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 23274771  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274770 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556985
Alignment:
Q  103 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 10556990  T
Q  203 gatga 207  Q
    |||||    
T  10556989 gatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  107 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 37642203 - 37642386
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  37642203 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 37642302  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  37642303 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  108 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17737239  T
Q  205 tga 207  Q
    |||    
T  17737238 tga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470927
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  148 atgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234487
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||    
T  14234503 gattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097332
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    | || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103784
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307691
Alignment:
Q  84 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  183 cggtctaagttgat 196  Q
    ||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822267
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147646
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 22147572  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     |||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  22147573 cataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 37251106 - 37251270
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  37251106 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 37251203  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251204 tgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 128
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174376
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  194 gattaagatgatg 206  Q
    ||| | |||||||    
T  12174364 gatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 17248225 - 17248287
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248225 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  146 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511059
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  195 attaagatgatgat 208  Q
    ||||||||| ||||    
T  12511072 attaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  46 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtact 43926026  T
Q  144 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  154 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668193
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 49668189  T
Q  203 gatg 206  Q
    ||||    
T  49668190 gatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029841
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512924
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9512928  T
Q  203 gatg 206  Q
    ||||    
T  9512927 gatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520899
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9520903  T
Q  203 gatg 206  Q
    ||||    
T  9520902 gatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 22110290 - 22110454
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| |||    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  22110290 tttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgatg--ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatca 22110387  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110388 tgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 196
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644780
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgat 1644780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12378038 - 12377940
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||   | |||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378038 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 54521027 - 54520985
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54521027 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 29544799 - 29544839
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttat 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29544799 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668554
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298644
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 11298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878633
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 12305350 - 12305315
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgtt 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12305350 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15060349 - 15060284
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  15060349 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatg 15060284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 17525190 - 17525275
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  17525190 atgtcatactgttgttgcactctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 17525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15051573 - 15051509
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||| |||||||||    
T  15051573 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgat 15051509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 206
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  158 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20952 - 20747
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20952 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 20853  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20852 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 20754  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  20753 atgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38026 - 37821
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38026 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 37927  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37926 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 37828  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  37827 atgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 456526 - 456321
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456526 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 456427  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456426 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 456328  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  456327 atgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15376670 - 15376875
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376670 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 15376769  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376770 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 15376868  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  15376869 atgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16232725 - 16232520
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232725 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 16232626  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232625 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 16232527  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  16232526 atgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 20385080 - 20385285
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385080 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 20385179  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385180 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 20385278  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  20385279 atgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21189552 - 21189757
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189552 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 21189651  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189652 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 21189750  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  21189751 atgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32125696 - 32125491
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125696 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 32125597  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125596 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 32125498  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  32125497 atgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41523122 - 41522917
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523122 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 41523023  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523022 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 41522924  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  41522923 atgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41525584 - 41525379
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525584 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 41525485  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525484 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 41525386  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  41525385 atgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 11393244 - 11393448
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393244 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 11393343  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393344 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 11393442  T
Q  201 atgatg 206  Q
    ||||||    
T  11393443 atgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11972701 - 11972496
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972701 tatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 11972602  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972601 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 11972503  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  11972502 atgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14949079 - 14949284
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949079 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 14949178  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949179 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 14949277  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  14949278 atgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18640477 - 18640272
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640477 tatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 18640378  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640377 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 18640279  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  18640278 atgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24702443 - 24702238
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702443 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24702344  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702343 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 24702245  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  24702244 atgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27217065 - 27216860
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217065 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 27216966  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27216965 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaag 27216867  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  27216866 atgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16213889 - 16213684
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213889 tatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgtt 16213790  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213789 gacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 16213691  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  16213690 atgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16410264 - 16410059
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410264 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 16410165  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410164 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 16410066  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  16410065 atgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18430917 - 18430709
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18430917 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgtt 18430818  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430817 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 18430719  T
Q  201 atgatgatgt 210  Q
    ||||||||||    
T  18430718 atgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647325
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24704890 - 24704688
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704890 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 24704791  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704790 gacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 24704695  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  24704694 atgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44116687 - 44116509
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116687 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44116588  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116587 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3386512 - 3386333
Alignment:
Q  27 ttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3386512 ttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtca 3386413  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386412 tgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  57 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 24275222  T
Q  157 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13869553 - 13869346
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||     
T  13869553 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttga 13869454  T
Q  99 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13869355  T
Q  199 agatgatga 207  Q
    |||||||||    
T  13869354 agatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 17061899 - 17062077
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061899 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcat 17061998  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061999 gct-attttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110556
Alignment:
Q  29 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 26355940 - 26356156
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355940 tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 26356039  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  26356040 gacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaa 26356139  T
Q  191 gttgattaagatgatga 207  Q
     ||||||||||||||||    
T  26356140 attgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 26358392 - 26358608
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358392 tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 26358491  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  26358492 gacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaa 26358591  T
Q  191 gttgattaagatgatga 207  Q
     ||||||||||||||||    
T  26358592 attgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Original strand, 38898360 - 38898535
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898360 tttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 38898459  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898460 tgctgtttttatatactg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564482
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 12756655 - 12756817
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12756655 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 12756754  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    | |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756755 gttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  87 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698831
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 142  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456530
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 18456466  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227481
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38227548  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509189
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 2280057 - 2280238
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2280057 tttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatca 2280156  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280157 tgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  80 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactacc-gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  180 agtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26211995
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589039
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  195 attaagatgatgatgt 210  Q
       |||||||||||||    
T  10589054 tcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67745
Alignment:
Q  87 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 185  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  186 tctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Original strand, 15081919 - 15082019
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 112  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15081919 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttg 15082018  T
Q  113 a 113  Q
    |    
T  15082019 a 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 19486682 - 19486865
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  19486682 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 19486781  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  19486782 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144143
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144093 gag-atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386369
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  209 gt 210  Q
    ||    
T  16386368 gt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16495580 - 16495402
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  16495580 tttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcat 16495485  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16495484 gatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47831922 - 47831807
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831922 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 47831824  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||    
T  47831823 gattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  112 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443393
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  159 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  128 g-ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 188  Q
    |  |   |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 1867933 - 1868101
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| |||    
T  1867933 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatca 1868030  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    ||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868031 tgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005650
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |    
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811248
Alignment:
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T
Q  199 agatgatg 206  Q
     |||||||    
T  811241 tgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 10063761 - 10063921
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| |||    
T  10063761 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatca 10063855  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    || || || || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10063856 tgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932851
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T
Q  204 atg 206  Q
    |||    
T  14932849 atg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356286
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T
Q  204 atg 206  Q
    |||    
T  15356284 atg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360400
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T
Q  204 atg 206  Q
    |||    
T  15360398 atg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  97 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  196 ttaagatgatg 206  Q
    | | |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219835
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 20220128 - 20220290
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  20220128 tttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatca 20220223  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  | |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220224 tgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 27847838 - 27847951
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996148
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagtt 11996131  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  11996132 gttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 15008437 - 15008597
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  15008437 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatca 15008534  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    ||  ||| |||| |||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008535 tgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755008
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13841217 - 13841157
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841217 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 122  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211456
Alignment:
Q  111 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgat 208  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 15211458  T
Q  209 gt 210  Q
    ||    
T  15211457 gt 15211456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 122  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11303452 - 11303409
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11303452 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 16108646 - 16108688
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108646 tatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 18627771 - 18627717
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataatt 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627771 tatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12187019
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187083 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 17138113 - 17138177
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138113 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 23664910 - 23664952
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23664910 tatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 29796813 - 29796771
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29796813 tatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 29800632 - 29800590
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29800632 tatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||  |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Original strand, 2530144 - 2530208
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530144 gttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 14270019 - 14270061
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  14270019 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 48991258 - 48991206
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 184  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  48991258 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 264725 - 264930
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264725 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 264824  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264825 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 264923  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  264924 atgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39363589 - 39363384
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363589 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 39363490  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363489 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 39363391  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  39363390 atgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10732897 - 10733102
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732897 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 10732996  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732997 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 10733095  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  10733096 atgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20909217 - 20909012
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909217 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 20909118  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909117 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 20909019  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  20909018 atgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29346185 - 29345980
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346185 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 29346086  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29346085 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaag 29345987  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  29345986 atgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 42245322 - 42245527
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245322 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 42245421  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42245422 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 42245520  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  42245521 atgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29348658 - 29348453
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348658 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 29348559  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29348558 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaag 29348460  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  29348459 atgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29351131 - 29350926
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351131 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 29351032  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29351031 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaag 29350933  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  29350932 atgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39245341 - 39245136
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39245341 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttatt 39245242  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245241 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 39245143  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  39245142 atgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29330136 - 29329934
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330136 tatgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 29330040  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330039 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 29329941  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  29329940 atgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32027598 - 32027393
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027598 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 32027499  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32027498 gacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaag 32027400  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  32027399 atgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 20917909 - 20918110
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20917909 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgtt 20918008  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918009 gact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 20918103  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  20918104 atgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 36154767 - 36154942
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154767 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 36154866  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154867 gctgtttttgtatactgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581361
Alignment:
Q  29 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
     |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 20901992 - 20902172
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20901992 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtca 20902091  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20902092 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 2154597 - 2154776
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154597 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtca 2154696  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154697 tgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319193
Alignment:
Q  32 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  131 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 10775660 - 10775838
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775660 tttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 10775758  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775759 tgctggttttatatactg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31061247 - 31061068
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061247 tttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 31061148  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061147 tgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38619641 - 38619434
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  38619641 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttga 38619542  T
Q  99 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38619443  T
Q  199 agatgatga 207  Q
    |||||||||    
T  38619442 agatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23064714 - 23064512
Alignment:
Q  5 atgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttga 102  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23064714 atgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattga 23064615  T
Q  103 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064614 cttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23064516  T
Q  203 gatg 206  Q
    ||||    
T  23064515 gatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067110
Alignment:
Q  32 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  131 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077952
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421532
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390617
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529223
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729185
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808510
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493569
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 24493636  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  102 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  202 tgatgatgt 210  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286964
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-tgtatac 142  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096467
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431395
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412187
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025311
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095495
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075018
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  144 gcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565546
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    | || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293090
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40726036 - 40725853
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  40726036 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 40725937  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  40725936 tgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502277
Alignment:
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  199 agatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||    
T  21502266 agatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723922
Alignment:
Q  61 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tg 159  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  160 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959649
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  194 gattaagatgatg 206  Q
    ||| | |||||||    
T  22959637 gatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012154
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517320
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  111 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  31 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 127  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  112 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766174
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 144  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 207
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  153 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668898
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| | || ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    ||| | |||||||||||    
T  19668914 gatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873254
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356364
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||  |    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt--g 18356388  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  18356387 tatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22032387 - 22032323
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032387 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29448126 - 29448052
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448126 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Original strand, 20910805 - 20910869
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910805 gttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 9776563 - 9776521
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9776563 tatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 18770054 - 18770118
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  18770054 ctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805552
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20805552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766974
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20766974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 23501402 - 23501472
Alignment:
Q  136 tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501402 tgtattctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14079234 - 14079149
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| | | | |||| ||||||||||||||    
T  14079234 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgattaagatgatg 14079149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201360
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23512162 - 23512098
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  23512162 ctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23512098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23572148 - 23572084
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23572148 ctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 12206 - 12413
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12206 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgtt 12305  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12306 gacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaag 12404  T
Q  201 atgatgatg 209  Q
    ||| |||||    
T  12405 atgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14152 - 13947
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14152 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 14053  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14052 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 13954  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  13953 atgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11491 - 11286
Alignment:
Q  3 tgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11491 tgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 11392  T
Q  103 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11391 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagat 11293  T
Q  203 gatgatg 209  Q
    | |||||    
T  11292 gttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12827 - 12763
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  12827 ctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 501285 - 501088
Alignment:
Q  5 atgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgact 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501285 atgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgact 501186  T
Q  105 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501185 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 85563 - 85742
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85563 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 85662  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  85663 tgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160688
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9445 - 9241
Alignment:
Q  3 tgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9445 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 9346  T
Q  103 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 9247  T
Q  203 gatgat 208  Q
    | ||||    
T  9246 gttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13597 - 13392
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13597 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 13498  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13497 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 13399  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  13398 atgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 136885 - 136680
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136885 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 136786  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136785 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 136687  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  136686 atgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 139354 - 139149
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139354 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 139255  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139254 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 139156  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  139155 atgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 144292 - 144087
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144292 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 144193  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144192 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 144094  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  144093 atgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 134416 - 134211
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134416 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 134317  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134316 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaag 134218  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  134217 atgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 141823 - 141618
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141823 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 141724  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  141723 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaag 141625  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  141624 atgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132662
Alignment:
Q  84 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 182  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  183 cggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62216
Alignment:
Q  105 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62303 tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 158434 - 158612
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158434 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 158533  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158534 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340065
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 71414 - 71350
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  71414 gttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82072
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    | || ||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40605 - 40400
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40605 tatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtt 40506  T
Q  101 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40505 gacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaag 40407  T
Q  201 atgatga 207  Q
    |||||||    
T  40406 atgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 106
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16962 - 16784
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16962 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16863  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16862 gttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9928 - 9744
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9928 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtca 9829  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 212  Q
    | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9828 ttctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32942
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33009  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38761
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38828  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4475 - 4300
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4475 tttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcat 4376  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4375 gttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12064
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 113  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  114 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactg-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30110 - 29931
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30110 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcat 30011  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30010 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1440
Alignment:
Q  14 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 112  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  113 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9080
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  8995 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 79268 - 79430
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79268 tttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcat 79367  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79368 gctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17337
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt--tgtata 141  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 14139 - 14203
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  14139 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4392 - 4214
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392 tttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 4294  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4293 tgctggttttgtatactg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2291
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-gttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtca 2211  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    || |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2212 tgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18148
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  17965 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 18064  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || || || ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  18065 tgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 20364 - 20524
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364 tttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20462  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    | || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20463 gttg-ttttgtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128751
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-tttttt 128818  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  128817 ttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65915
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||| |||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatg 65915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 161073 - 161252
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161073 tttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 161172  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |  ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  161173 ttatgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 164574 - 164674
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  164574 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 164673  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  164674 t 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3271
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 3204  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 38613 - 38820
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||  |||     
T  38613 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattga 38712  T
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38713 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgatta 38811  T
Q  199 agatgatga 207  Q
    |||||||||    
T  38812 agatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51913
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168099
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13211
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22886
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 g-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 203
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3306
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39479
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 39544  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75333
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 75268  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1851
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1169
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4849
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3470
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 343
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16721
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16113
Alignment:
Q  45 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 144  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  145 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33077
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45928
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 210
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8650
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4508
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12090
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22042
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25896
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatact 25963  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39858
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatact 39925  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28414
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 194  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  195 attaagatgatgatgt 210  Q
    || |||||||||||||    
T  28429 atgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  157 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8479
Alignment:
Q  61 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 160  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  161 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6245
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  144 gccta---tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
     ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 125  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  126 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6535
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 142  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1952
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  64 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 163  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  164 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 128908 - 129072
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  128908 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 129006  T
Q  127 tg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |  |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129007 tgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 78504 - 78345
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||   ||    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||    
T  78504 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg--ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatca 78408  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78407 tgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39913
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  89 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  186 tctaag 191  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 183
Target Start/End: Original strand, 18708 - 18749
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18708 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 27687 - 27855
Alignment:
Q  28 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  27687 tttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatca 27786  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27787 tgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 53487 - 53651
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  53487 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 53586  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53587 tgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11647 - 11464
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  11647 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 11548  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  11547 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 38194 - 38377
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  38194 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 38293  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  38294 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  119 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13312 - 13147
Alignment:
Q  28 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 125  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  13312 tttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 13213  T
Q  126 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16206
Alignment:
Q  28 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  16038 tttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatca 16137  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16138 tgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10544
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatact 10476  T
Q  144 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32067
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3588
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  144 gcct 147  Q
    ||||    
T  3585 gcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 289
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  348 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174767
Alignment:
Q  61 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-g 159  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  160 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 136373 - 136471
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136373 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 145081 - 145179
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145081 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 120  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  29 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34123
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  34139 gttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  154 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15584
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7295
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7359 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12750 - 12587
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  12750 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 12652  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12651 tgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13497
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  210 t 210  Q
    |    
T  11564 t 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  194 gattaagatgatga 207  Q
    ||||||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  49 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6244
Alignment:
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  199 agatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||    
T  6233 agatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 1012 - 1190
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  1012 tttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcat 1107  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1108 gatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  148 atgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 60653 - 60818
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||    
T  60653 tttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatca 60751  T
Q  127 t--gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60752 tgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19268
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45909
Alignment:
Q  29 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    | || ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20910
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  144 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15898
Alignment:
Q  100 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15886  T
Q  199 agatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||    
T  15887 agatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Original strand, 7997 - 8161
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  7997 tttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatca 8096  T
Q  127 t--gctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    |  ||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8097 tgagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16282
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  16298 gttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 225589 - 225465
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  225589 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatca 225491  T
Q  127 tgctgtttttgtatactgcctatgttg 153  Q
     |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  225490 cgctg-ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 6221 - 6386
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||    
T  6221 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatca 6319  T
Q  127 t--gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6320 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32538
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  143 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 133
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25288 - 25121
Alignment:
Q  28 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||| ||||    
T  25288 tttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcat 25191  T
Q  128 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    |  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25190 gagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 719 - 620
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  719 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatca 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14814
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  187 ctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6152 - 6070
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6152 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  148 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1402 - 1289
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1402 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1306  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  1305 gttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7266
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7379 gttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 7283  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | |||||||||||||    
T  7282 gttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  159 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  108 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 97189 - 97024
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  97189 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 97091  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  ||| |||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97090 tgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 106467 - 106302
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  106467 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 106369  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  ||| |||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106368 tgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 151
Target Start/End: Original strand, 918 - 1021
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctg---ttgtatact 1013  T
Q  144 gcctatgt 151  Q
    ||||||||    
T  1014 gcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51695 - 51582
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51695 gttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51599  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    | | || ||||||||||    
T  51598 gttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 12039
Alignment:
Q  36 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12103 tgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  44 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 141  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||||||  ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tata 38386  T
Q  142 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 187  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46995
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1170
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  159 g-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 210  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29558
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T
Q  204 atg 206  Q
    |||    
T  29560 atg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12942
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    |   |||||||||||||    
T  12955 g---aagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Original strand, 18175 - 18265
Alignment:
Q  27 ttttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18175 ttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 8016 - 8180
Alignment:
Q  32 atgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-- 128  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||      
T  8016 atgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaa 8113  T
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 195  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8114 ctggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24001
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 202  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagat 23993  T
Q  203 gatgatgt 210  Q
    ||||||||    
T  23994 gatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 36023 - 36065
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  36023 tatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12881 - 12766
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12881 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagtt 12783  T
Q  194 gattaagatgatgatgt 210  Q
    ||| |  ||||||||||    
T  12782 gatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 206
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 186  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  187 ctaagttga 195  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 5136 - 5246
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5136 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5232  T
Q  194 gattaagatgatga 207  Q
    | | ||||||||||    
T  5233 gttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32102
Alignment:
Q  84 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 182  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  183 cggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6826
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 193  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  194 gat 196  Q
    |||    
T  6828 gat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  48 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 135  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 267843 - 267679
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  267843 tttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatca 267746  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||  |||||||  |||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267745 tgaactgtttta-tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6669
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 151  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193098
Alignment:
Q  111 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgat 208  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 193096  T
Q  209 gt 210  Q
    ||    
T  193097 gt 193098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 569
Alignment:
Q  57 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgc 154  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||    ||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  |||||||  ||| |||||||||||||    
T  702 tatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgc 607  T
Q  155 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  606 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1900
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  1736 tttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 1833  T
Q  127 tgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||   | |||| |||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1834 tgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29196 - 29117
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29196 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 3228 - 3186
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3228 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 4796 - 4921
Alignment:
Q  81 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 180  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || | |||||||||| | |||| |||||| ||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  4796 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatga 4895  T
Q  181 gtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||  | |||| ||||||||||||||    
T  4896 gtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1881
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1945 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15796
Alignment:
Q  146 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 21856 - 21920
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21856 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29812
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29748 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Original strand, 15365 - 15486
Alignment:
Q  38 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |    ||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15365 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttg 15462  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  15463 tatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 103635 - 103737
Alignment:
Q  95 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| |||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103635 gttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttt-tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T
Q  192 ttga 195  Q
    ||||    
T  103734 ttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  104 ttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 1633 - 1591
Alignment:
Q  1 tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 43  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1633 tatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 57
Alignment:
Q  28 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 126  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| |||    
T  188 tttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatca 90  T
Q  127 tg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    ||  ||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  89 tgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtt 57  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26892 - 26828
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  26892 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44145 - 44081
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  44145 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 159
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  218 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  145 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Original strand, 16369 - 16442
Alignment:
Q  110 ttgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| | |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16369 ttgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 153
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2281
Alignment:
Q  88 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 153  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18321 - 18236
Alignment:
Q  121 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18321 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1894 - 1830
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  1894 ctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 191  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University