View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3177_high_1 (Length: 670)
Name: NF3177_high_1
Description: NF3177
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3177_high_1 |
 |  |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 627; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 627; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 662
Target Start/End: Original strand, 15645986 - 15646636
Alignment:
| Q |
12 |
tcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgta |
111 |
Q |
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|
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| T |
15645986 |
tcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgta |
15646085 |
T |
 |
| Q |
112 |
atatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaa |
211 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15646086 |
atatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaa |
15646185 |
T |
 |
| Q |
212 |
tattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaa |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
15646186 |
tattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaa |
15646285 |
T |
 |
| Q |
312 |
accacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatt |
411 |
Q |
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| T |
15646286 |
accacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaattttaaaaaaataaaagttaatgtaaggatt |
15646385 |
T |
 |
| Q |
412 |
taccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctc |
511 |
Q |
| |
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| T |
15646386 |
taccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctc |
15646485 |
T |
 |
| Q |
512 |
tttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatatttctgc |
611 |
Q |
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| T |
15646486 |
tttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctattaacatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatatttctgc |
15646585 |
T |
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| Q |
612 |
aaatgagaagttctggaaatatcctttgttatctatggtggactgatgatg |
662 |
Q |
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|
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| T |
15646586 |
aaatgagaagttgtggaaatatcctttgttatctatggtggactgatgatg |
15646636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 634
Target Start/End: Original strand, 15655138 - 15655760
Alignment:
| Q |
12 |
tcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgta |
111 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15655138 |
tcattatcatcttcatatgttactatgatacccttaatatgccctatttgatgtacgagattgaagatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgta |
15655237 |
T |
 |
| Q |
112 |
atatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaa |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15655238 |
atatagtttgatttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaa |
15655337 |
T |
 |
| Q |
212 |
tattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaa |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15655338 |
tattagttgagaaggttcattaatgattttatttagctcctcctttgatgagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaattggaaa |
15655437 |
T |
 |
| Q |
312 |
accacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatt |
411 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15655438 |
accacgtgatttttcatgcctgcaatacgagatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatt |
15655537 |
T |
 |
| Q |
412 |
taccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctc |
511 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15655538 |
taccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctc |
15655637 |
T |
 |
| Q |
512 |
tttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatatttctgc |
611 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15655638 |
tttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctattagcatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatatcgatcaatatttttgc |
15655737 |
T |
 |
| Q |
612 |
aaatgagaagttctggaaatatc |
634 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15655738 |
aaatgagaaaatctggaaatatc |
15655760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 654
Target Start/End: Original strand, 15625591 - 15626230
Alignment:
| Q |
15 |
tcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaata |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15625591 |
tcatcatcttcaaatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtataacattgtagatagcaacataccgatgcaatacagctatgtgtaata |
15625690 |
T |
 |
| Q |
115 |
tagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatat |
214 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15625691 |
tagttcgatttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactaataagctccgataagaatccaaaatttccaacttctgcagcatcaaatat |
15625790 |
T |
 |
| Q |
215 |
tagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaacc |
314 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
15625791 |
tacctgagaaggttcatttatgattttatttaactccacctttgatgagtagtgtttttcaagaatggtggtccaaagaaatttaactaattggaaaaca |
15625890 |
T |
 |
| Q |
315 |
acgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttac |
414 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15625891 |
atgtgacttttcatgcctgaaatacgaattatggttaattaagttaatgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttac |
15625990 |
T |
 |
| Q |
415 |
caggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctcttt |
514 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15625991 |
cgggattggtcattatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccagaatttaaaggcaatccattttgagccaagatatgcaaagctgtctcttc |
15626090 |
T |
 |
| Q |
515 |
attcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatatttctgcaaa |
614 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15626091 |
attcacatcacgtgcaaaagctagtgcatttctatctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatatttttgcaaa |
15626190 |
T |
 |
| Q |
615 |
tgagaagttctggaaatatcctttgttatctatggtggac |
654 |
Q |
| |
|
| ||||||| || |||||| | |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
15626191 |
taagaagttatgtaaatattccatgttgtccatggtggac |
15626230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 582
Target Start/End: Original strand, 15534817 - 15535367
Alignment:
| Q |
25 |
catatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
15534817 |
catatgtcgctatgatatcctttatgtgccctatttgatgtacgacattgaagatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatcgttcgatt |
15534916 |
T |
 |
| Q |
125 |
tttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaa |
224 |
Q |
| |
|
|| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15534917 |
ttcgccatccacctcccatatcaagcttggatag-cactaataagctccgataaaaaccaaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaa |
15535015 |
T |
 |
| Q |
225 |
ggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15535016 |
ggttcatttatgatttcatttaactcct---ttgatgagtagtgtctgtctagaatcgtggtccaaagaaatttaacgaattgaaaaaccatatgatttt |
15535112 |
T |
 |
| Q |
325 |
tcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggt |
424 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15535113 |
tcaggcctgcaatacaaaatttggtta-ttaagttaatgaaaccaatgtaaaaaaattaataaaatataaa-gttaatgtaagg-tttaccaggattggt |
15535209 |
T |
 |
| Q |
425 |
catgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatca |
524 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15535210 |
catgatgtgattatgatcatgttctggataatgacaagaagaatccaatggcatttgatcttgagccaagagatgcaaagctgtttctttattcacatcg |
15535309 |
T |
 |
| Q |
525 |
cgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattg |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | ||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15535310 |
cgtgcaaaagatagttctttcttgtctcttgccattttgaaggccaagtctgcaattg |
15535367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 582
Target Start/End: Original strand, 15518000 - 15518549
Alignment:
| Q |
23 |
ttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcgg |
122 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15518000 |
ttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtatgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatagttcga |
15518099 |
T |
 |
| Q |
123 |
tttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgag |
222 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15518100 |
ttttcgcaatccacctcccatatcaagcttggatgggcactaataagctccgataagaacccaaaatttccaatttcagcagcatcaaatattagttgag |
15518199 |
T |
 |
| Q |
223 |
aaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatt |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15518200 |
aaggtttatttatgatttcatttaactccttctttgatgagtagtatctttctagaatcgtggtccagagaaatttaaccaattggaaaaccatatgatt |
15518299 |
T |
 |
| Q |
323 |
tttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattg |
422 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15518300 |
tttcaggcctgcgatacaaaatttggttac-taagttaatgaaaccaatgtaaataaatt-----aat---aaagttaatgtaagg-tttaccaggattg |
15518389 |
T |
 |
| Q |
423 |
gtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacat |
522 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | || |||| ||| |
|
|
| T |
15518390 |
gtgatgatgtgattatgatcatgttctggacaatgacaagaagaatccaatggcatttgatttttagccaagagatgtaaagctgttttttcattctcat |
15518489 |
T |
 |
| Q |
523 |
cacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattg |
582 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15518490 |
cacgtgcaaaagctagttctttcttgtctcttaccattttgaaggccaagtctgcaattg |
15518549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Original strand, 15494208 - 15494539
Alignment:
| Q |
18 |
tcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatag |
117 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15494208 |
tcatcttcaaatgtcactatgacatcctttatatgccctatttgatgtacgagattgaatatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatag |
15494307 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattag |
217 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15494308 |
ttcgatttttgctatccatctcccatatcaagcttggatgggcactaataagctccgataagaacccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattag |
15494407 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15494408 |
ttgagaaggtttatttatgatttcgtttaactcatcctttgatgtgtagtgtctgtctagaatcgttgtccaaagaaatttaaccaattggaaaaccacg |
15494507 |
T |
 |
| Q |
318 |
tgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggt |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15494508 |
tgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggt |
15494539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 430
Target Start/End: Original strand, 15605657 - 15606057
Alignment:
| Q |
15 |
tcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaata |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15605657 |
tcatcattttcatatgtcaatatgaaaccctttatatgccccatttgatgtatgaaattgaagatactataatgccgattcaagacagctatgtgtaata |
15605756 |
T |
 |
| Q |
115 |
tagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatat |
214 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
15605757 |
tagttcgatttttgcaatccacatcccatatcaagctaggataaacactgataagctctgataagaatccataatttccaacttctgcagcatcaaaaat |
15605856 |
T |
 |
| Q |
215 |
tagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaacc |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | |||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15605857 |
cagttgagaaggttgatttatgattttatgtaactcctc--tggagg-gtagtgttggtccaaaatcgttgtccaaagaaatttaaccaattggaaaacc |
15605953 |
T |
 |
| Q |
315 |
acgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttac |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| | || ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15605954 |
acgtgatttttcatgcctgcaatacaaaatttggtgatttaatt------------tggaaaagaattaataaaatataaaatataatgcaaggatttac |
15606041 |
T |
 |
| Q |
415 |
caggattggtcatgat |
430 |
Q |
| |
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| T |
15606042 |
caggattggtcatgat |
15606057 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 408 - 635
Target Start/End: Original strand, 15494724 - 15494951
Alignment:
| Q |
408 |
gatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctg |
507 |
Q |
| |
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| T |
15494724 |
gatttaccaggattagtcatgatgggatgatgatcatgttccagacaatgacaacaagaatccaatggcatttgattttgagccaagagatgcaaagctg |
15494823 |
T |
 |
| Q |
508 |
tctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatattt |
607 |
Q |
| |
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| T |
15494824 |
tctcttcattcacatcacgtgcaaaagcaagtgcatttctgcctcttgccattttcaaggccaagtctgcaattgggaaaaaatattatgatcaatattt |
15494923 |
T |
 |
| Q |
608 |
ctgcaaatgagaagttctggaaatatcc |
635 |
Q |
| |
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| T |
15494924 |
ttgcaattgcaaagttcttgaaatatcc |
15494951 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 476 - 630
Target Start/End: Original strand, 15607844 - 15607999
Alignment:
| Q |
476 |
cattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtct |
575 |
Q |
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| T |
15607844 |
cattagatttcgagccaagagatgcaaagctgtctcttcatttacatcacgtacaaaagctagttcattcctatctcttgccaattttaatgcaaagtct |
15607943 |
T |
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| Q |
576 |
gcaattgg-agaaaattatattgatcaatatttctgcaaatgagaagttctggaaa |
630 |
Q |
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| T |
15607944 |
gcaattggaagaaaaatattatgatcaatatttttgtaattgcgaagttgtggaaa |
15607999 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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