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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3177_high_2 (Length: 429)

Name: NF3177_high_2
Description: NF3177
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3177_high_2
NF3177_high_2
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (10-412)||(43076004-43076408)
chr7 (10-412)||(43086231-43086635)
chr7 (10-412)||(43089902-43090306)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 412
Target Start/End: Original strand, 43076004 - 43076408
Alignment:
Q  10 aagaatatagacaaggatatacacatgcataagtaagcataaccaataaaaagtaaccaaaagcaaataataaacgaatcatccattatattcatgaata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076004 aagaatatagacaaggatatacacatgcataagtaagcataaccaataaaaagtaaccaaaagtaaataataaacgaatcatccattatattcatgaata 43076103  T
Q  110 ttcataagtaaagaataaagcaaaacaacacatcttctatccaaattgacac--aaaattattttattaatgtattgattcacctcaaatgacagtgtta 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076104 ttcttaagtaaagaataaagcaaaacaacacatcttctatccaaattgacacaaaaaattattttattaatgtattgattcacctcaaatgacagtgtta 43076203  T
Q  208 caaacttacagtacatattacaannnnnnnctacacatctctatctcctccatcaatttttcacatatagctccaagtgaatttttattctataacaata 307  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076204 caaacttacagtacatattacaatttttttctacacatctctatctcctccatcaatttttcacatatagctccaagtgaatttttattctataacaata 43076303  T
Q  308 aattatatgtaataataacaacaacaaaatgtacaattcaaataccgtggtagaaaataagaagaatacgtgtaaaatgaaac---attactaaacagag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  43076304 aattatatgtaataataacaacaacaaaatgtacaattcaaataccgtggtagaaaat---aagaatacgtgtaaaatgaaacattattactaaacagag 43076400  T
Q  405 taatatac 412  Q
    ||||||||    
T  43076401 taatatac 43076408  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 412
Target Start/End: Original strand, 43086231 - 43086635
Alignment:
Q  10 aagaatatagacaaggatatacacatgcataagtaagcataaccaataaaaagtaaccaaaagcaaataataaacgaatcatccattatattcatgaata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086231 aagaatatagacaaggatatacacatgcataagtaagcataaccaataaaaagtaaccaaaagtaaataataaacgaatcatccattatattcatgaata 43086330  T
Q  110 ttcataagtaaagaataaagcaaaacaacacatcttctatccaaattgacac--aaaattattttattaatgtattgattcacctcaaatgacagtgtta 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086331 ttcttaagtaaagaataaagcaaaacaacacatcttctatccaaattgacacaaaaaattattttattaatgtattgattcacctcaaatgacagtgtta 43086430  T
Q  208 caaacttacagtacatattacaannnnnnnctacacatctctatctcctccatcaatttttcacatatagctccaagtgaatttttattctataacaata 307  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086431 caaacttacagtacatattacaatttttttctacacatctctatctcctccatcaatttttcacatatagctccaagtgaatttttattctataacaata 43086530  T
Q  308 aattatatgtaataataacaacaacaaaatgtacaattcaaataccgtggtagaaaataagaagaatacgtgtaaaatgaaac---attactaaacagag 404  Q
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T  43086531 aattatatgtaataataacaacaacaaaatgtacaattcaaataccgtggtagaaaat---aagaatacgtgtaaaatgaaacattattactaaacagag 43086627  T
Q  405 taatatac 412  Q
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T  43086628 taatatac 43086635  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 412
Target Start/End: Original strand, 43089902 - 43090306
Alignment:
Q  10 aagaatatagacaaggatatacacatgcataagtaagcataaccaataaaaagtaaccaaaagcaaataataaacgaatcatccattatattcatgaata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43089902 aagaatatagacaaggatatacacatgcataagtaagcataaccaataaaaagtaaccaaaagtaaataataaacgaatcatccattatattcatgaata 43090001  T
Q  110 ttcataagtaaagaataaagcaaaacaacacatcttctatccaaattgacac--aaaattattttattaatgtattgattcacctcaaatgacagtgtta 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43090002 ttcttaagtaaagaataaagcaaaacaacacatcttctatccaaattgacacaaaaaattattttattaatgtattgattcacctcaaatgacagtgtta 43090101  T
Q  208 caaacttacagtacatattacaannnnnnnctacacatctctatctcctccatcaatttttcacatatagctccaagtgaatttttattctataacaata 307  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43090102 caaacttacagtacatattacaatttttttctacacatctctatctcctccatcaatttttcacatatagctccaagtgaatttttattctataacaata 43090201  T
Q  308 aattatatgtaataataacaacaacaaaatgtacaattcaaataccgtggtagaaaataagaagaatacgtgtaaaatgaaac---attactaaacagag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  43090202 aattatatgtaataataacaacaacaaaatgtacaattcaaataccgtggtagaaaat---aagaatacgtgtaaaatgaaacattattactaaacagag 43090298  T
Q  405 taatatac 412  Q
    ||||||||    
T  43090299 taatatac 43090306  T

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