View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3184_low_80 (Length: 217)

Name: NF3184_low_80
Description: NF3184
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3184_low_80
NF3184_low_80
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (42-217)||(35492903-35493078)
chr3 (44-217)||(45529784-45529957)
chr3 (44-217)||(8456180-8456353)
chr3 (42-217)||(21362935-21363110)
chr3 (42-217)||(49258292-49258467)
chr3 (43-196)||(30807203-30807357)
chr3 (43-217)||(46576341-46576515)
chr3 (44-213)||(40133483-40133652)
chr3 (44-217)||(48977382-48977555)
chr3 (44-204)||(25289757-25289917)
chr3 (43-217)||(45272446-45272620)
chr3 (44-204)||(34492618-34492778)
chr3 (46-217)||(53424207-53424377)
chr3 (44-217)||(15566530-15566701)
chr3 (49-217)||(25379760-25379928)
chr3 (63-203)||(26108305-26108445)
chr3 (63-217)||(53233940-53234094)
chr3 (44-217)||(18176917-18177090)
chr3 (44-217)||(30257618-30257791)
chr3 (44-213)||(31537872-31538041)
chr3 (49-217)||(52821666-52821833)
chr3 (42-177)||(40940817-40940952)
chr3 (63-217)||(26174126-26174280)
chr3 (67-217)||(10190772-10190922)
chr3 (43-204)||(29915313-29915473)
chr3 (43-204)||(29964466-29964626)
chr3 (67-217)||(10083849-10083999)
chr3 (45-217)||(52455679-52455851)
chr3 (74-217)||(39041882-39042025)
chr3 (44-217)||(7470246-7470418)
chr3 (64-177)||(53288782-53288895)
chr3 (90-217)||(8097309-8097436)
chr3 (44-217)||(51532783-51532956)
chr3 (44-204)||(7485573-7485728)
chr3 (42-213)||(32151417-32151587)
chr3 (95-204)||(2511340-2511449)
chr3 (47-204)||(25344100-25344257)
chr3 (49-174)||(11390601-11390726)
chr3 (71-204)||(33398511-33398644)
chr3 (42-217)||(4462625-4462799)
chr3 (86-203)||(1692870-1692986)
chr3 (44-161)||(55287797-55287914)
chr3 (64-193)||(49167070-49167202)
chr3 (66-177)||(14343358-14343469)
chr3 (44-154)||(50582986-50583095)
chr3 (74-217)||(8958065-8958209)
chr3 (44-174)||(19857047-19857175)
chr3 (113-177)||(1242036-1242101)
chr3 (144-217)||(24165745-24165817)
chr3 (98-217)||(24407309-24407428)
chr3 (44-171)||(38732960-38733087)
chr3 (104-183)||(48972775-48972854)
chr3 (44-217)||(4252426-4252599)
chr3 (63-136)||(9853629-9853702)
chr3 (44-136)||(9842915-9843006)
chr3 (103-217)||(17579165-17579280)
chr3 (43-217)||(26158811-26158978)
chr3 (101-217)||(34844429-34844544)
chr3 (44-152)||(25017510-25017617)
chr3 (48-118)||(36660768-36660838)
chr3 (45-159)||(50162038-50162151)
chr3 (106-174)||(1178228-1178296)
chr3 (108-196)||(8455952-8456040)
chr3 (146-217)||(54475777-54475848)
chr3 (42-137)||(55371395-55371490)
chr3 (48-176)||(6041742-6041871)
chr3 (48-153)||(27887426-27887531)
chr3 (75-144)||(40777045-40777114)
chr3 (101-145)||(8170731-8170775)
chr3 (45-174)||(16140292-16140422)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (44-217)||(40542940-40543113)
chr7 (44-217)||(7175892-7176065)
chr7 (44-217)||(7275275-7275448)
chr7 (48-217)||(22119890-22120059)
chr7 (42-217)||(21835147-21835322)
chr7 (44-217)||(2751269-2751442)
chr7 (44-217)||(21217863-21218036)
chr7 (45-204)||(2103054-2103213)
chr7 (43-217)||(10091185-10091359)
chr7 (44-217)||(17212051-17212224)
chr7 (41-213)||(17196984-17197156)
chr7 (62-217)||(22703502-22703657)
chr7 (43-177)||(18044104-18044238)
chr7 (43-204)||(27009356-27009518)
chr7 (88-217)||(654735-654863)
chr7 (44-213)||(11997847-11998016)
chr7 (45-174)||(7799905-7800034)
chr7 (45-217)||(19421230-19421402)
chr7 (44-217)||(2344297-2344470)
chr7 (48-175)||(13332495-13332622)
chr7 (42-217)||(27312148-27312323)
chr7 (86-213)||(29861711-29861837)
chr7 (43-213)||(39145686-39145856)
chr7 (64-213)||(23012542-23012691)
chr7 (64-193)||(27704020-27704148)
chr7 (47-217)||(28089817-28089990)
chr7 (44-217)||(42913543-42913716)
chr7 (85-217)||(16374033-16374165)
chr7 (86-213)||(28950911-28951038)
chr7 (47-177)||(9718057-9718187)
chr7 (49-174)||(42814867-42814992)
chr7 (74-177)||(31273942-31274045)
chr7 (40-177)||(14199736-14199867)
chr7 (44-174)||(32849589-32849719)
chr7 (44-177)||(43785369-43785502)
chr7 (117-217)||(23092167-23092267)
chr7 (101-204)||(41907556-41907659)
chr7 (44-217)||(31197589-31197761)
chr7 (45-160)||(21574190-21574305)
chr7 (63-143)||(22299866-22299946)
chr7 (45-196)||(23330790-23330941)
chr7 (44-204)||(22638290-22638446)
chr7 (74-217)||(22643372-22643515)
chr7 (44-217)||(31712932-31713098)
chr7 (47-177)||(9683827-9683957)
chr7 (44-125)||(25333417-25333498)
chr7 (133-217)||(3851844-3851928)
chr7 (86-177)||(36772373-36772463)
chr7 (44-118)||(23854394-23854468)
chr7 (44-204)||(28646967-28647127)
chr7 (44-123)||(21370595-21370674)
chr7 (42-170)||(22696316-22696443)
chr7 (125-192)||(21373789-21373856)
chr7 (47-160)||(8435783-8435895)
chr7 (114-177)||(6491675-6491738)
chr7 (47-158)||(12211625-12211735)
chr7 (44-143)||(40332097-40332196)
chr7 (49-155)||(37056217-37056322)
chr7 (48-112)||(28003838-28003902)
chr7 (44-127)||(22264622-22264705)
chr7 (89-147)||(35173132-35173190)
chr7 (101-159)||(36173090-36173147)
chr7 (120-196)||(33137876-33137951)
chr7 (108-188)||(35476403-35476483)
chr7 (101-141)||(21558187-21558227)
chr7 (101-145)||(30579394-30579438)
chr7 (51-163)||(47380903-47381014)
chr7 (101-145)||(48983706-48983750)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (40-213)||(24674383-24674556)
chr1 (44-217)||(4621267-4621440)
chr1 (43-217)||(24122016-24122190)
chr1 (28-217)||(27454894-27455085)
chr1 (42-213)||(8077639-8077810)
chr1 (44-217)||(46607804-46607977)
chr1 (42-217)||(7766757-7766932)
chr1 (44-217)||(30677170-30677343)
chr1 (44-213)||(15059436-15059605)
chr1 (44-217)||(7197277-7197449)
chr1 (42-174)||(7946836-7946968)
chr1 (42-213)||(18646845-18647016)
chr1 (69-196)||(9500406-9500533)
chr1 (63-217)||(17935782-17935936)
chr1 (43-217)||(21726722-21726896)
chr1 (42-196)||(23734108-23734263)
chr1 (42-196)||(23741300-23741455)
chr1 (63-217)||(7578422-7578576)
chr1 (44-204)||(23232304-23232468)
chr1 (50-217)||(32930749-32930916)
chr1 (44-217)||(168195-168368)
chr1 (44-217)||(1378892-1379064)
chr1 (44-217)||(32729539-32729711)
chr1 (68-217)||(45859073-45859222)
chr1 (49-154)||(46113495-46113600)
chr1 (44-217)||(34778336-34778506)
chr1 (44-195)||(29057390-29057540)
chr1 (42-204)||(18533767-18533929)
chr1 (67-177)||(33905580-33905690)
chr1 (72-204)||(36155931-36156063)
chr1 (62-217)||(8779766-8779921)
chr1 (65-167)||(37351541-37351643)
chr1 (48-217)||(2272342-2272511)
chr1 (98-204)||(8254795-8254901)
chr1 (44-140)||(20487297-20487393)
chr1 (43-217)||(2537697-2537860)
chr1 (49-183)||(40145950-40146079)
chr1 (45-160)||(1486415-1486527)
chr1 (64-160)||(19034474-19034569)
chr1 (41-160)||(1138570-1138688)
chr1 (42-177)||(40802138-40802272)
chr1 (45-154)||(24216973-24217081)
chr1 (44-157)||(25237080-25237192)
chr1 (44-136)||(14258538-14258630)
chr1 (104-217)||(16899557-16899670)
chr1 (123-177)||(45331692-45331746)
chr1 (67-160)||(16539625-16539717)
chr1 (145-217)||(12876966-12877038)
chr1 (151-217)||(48699859-48699926)
chr1 (68-217)||(37047010-37047159)
chr1 (101-159)||(39964563-39964621)
chr1 (43-171)||(809215-809343)
chr1 (46-122)||(1818730-1818806)
chr1 (154-217)||(22909975-22910038)
chr1 (74-174)||(19480558-19480659)
chr1 (103-192)||(26820240-26820329)
chr1 (43-139)||(25496596-25496692)
chr1 (114-158)||(49101730-49101773)
chr1 (48-138)||(1378743-1378833)
chr1 (104-204)||(9926189-9926289)
chr1 (104-160)||(1095091-1095146)
chr1 (101-145)||(6122853-6122897)
chr1 (44-96)||(6776139-6776190)
chr1 (48-203)||(17447272-17447426)
chr1 (101-145)||(51814553-51814597)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (42-217)||(34147338-34147513)
chr6 (42-217)||(34159954-34160129)
chr6 (44-217)||(15360128-15360301)
chr6 (50-217)||(11448871-11449038)
chr6 (42-217)||(3222666-3222839)
chr6 (44-217)||(654176-654349)
chr6 (44-217)||(9238969-9239142)
chr6 (46-204)||(21982363-21982521)
chr6 (47-217)||(1344934-1345102)
chr6 (44-177)||(12591631-12591764)
chr6 (90-217)||(12390465-12390592)
chr6 (43-217)||(11007158-11007332)
chr6 (43-217)||(28672060-28672234)
chr6 (44-213)||(5360105-5360274)
chr6 (43-217)||(21148541-21148714)
chr6 (63-213)||(17081088-17081238)
chr6 (52-177)||(9690708-9690833)
chr6 (42-217)||(9843930-9844105)
chr6 (43-204)||(9208245-9208406)
chr6 (64-177)||(11840915-11841028)
chr6 (44-156)||(13753234-13753346)
chr6 (43-160)||(14212885-14213002)
chr6 (43-131)||(22576060-22576148)
chr6 (43-217)||(33499467-33499642)
chr6 (66-213)||(17149490-17149637)
chr6 (67-177)||(28968112-28968222)
chr6 (44-157)||(33718548-33718661)
chr6 (44-196)||(31039014-31039165)
chr6 (101-215)||(10377766-10377881)
chr6 (65-145)||(17706409-17706489)
chr6 (46-151)||(8479308-8479412)
chr6 (44-122)||(3625863-3625941)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (43-217)||(4718642-4718816)
chr8 (44-217)||(34237685-34237858)
chr8 (44-217)||(39349254-39349427)
chr8 (42-217)||(28193470-28193645)
chr8 (44-217)||(2618184-2618357)
chr8 (44-217)||(3734653-3734826)
chr8 (47-196)||(15259457-15259606)
chr8 (43-213)||(20305905-20306075)
chr8 (43-213)||(21092538-21092708)
chr8 (63-217)||(21603247-21603401)
chr8 (45-213)||(19471608-19471777)
chr8 (45-213)||(19542532-19542701)
chr8 (45-213)||(19589995-19590164)
chr8 (44-196)||(18532105-18532257)
chr8 (47-174)||(27746408-27746535)
chr8 (43-213)||(42643152-42643322)
chr8 (67-217)||(4698753-4698903)
chr8 (44-217)||(32879277-32879450)
chr8 (67-217)||(14632975-14633125)
chr8 (69-217)||(8765556-8765704)
chr8 (45-177)||(42328004-42328135)
chr8 (69-204)||(20469940-20470075)
chr8 (49-183)||(264463-264597)
chr8 (49-183)||(651324-651458)
chr8 (49-183)||(837059-837193)
chr8 (44-204)||(28088284-28088444)
chr8 (101-204)||(6953050-6953153)
chr8 (44-177)||(24018380-24018513)
chr8 (44-217)||(2166695-2166867)
chr8 (44-213)||(7557985-7558146)
chr8 (65-196)||(34610738-34610869)
chr8 (63-196)||(21667567-21667700)
chr8 (46-195)||(28964033-28964182)
chr8 (104-217)||(25248407-25248518)
chr8 (101-204)||(24999289-24999392)
chr8 (99-217)||(10292108-10292225)
chr8 (45-204)||(18128512-18128671)
chr8 (62-192)||(9047333-9047463)
chr8 (44-174)||(26168922-26169051)
chr8 (47-174)||(36848822-36848949)
chr8 (63-170)||(34639284-34639390)
chr8 (47-163)||(8042655-8042764)
chr8 (47-160)||(3794792-3794904)
chr8 (65-190)||(22200617-22200742)
chr8 (92-177)||(1219395-1219480)
chr8 (63-195)||(28908838-28908972)
chr8 (47-142)||(34694681-34694776)
chr8 (47-157)||(8387535-8387644)
chr8 (159-217)||(2639441-2639499)
chr8 (52-160)||(41070767-41070874)
chr8 (43-154)||(3403596-3403706)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (42-217)||(11926531-11926707)
chr5 (42-217)||(27498761-27498936)
chr5 (43-217)||(15641135-15641309)
chr5 (43-217)||(32059470-32059644)
chr5 (47-217)||(8484691-8484861)
chr5 (44-196)||(25586926-25587079)
chr5 (44-217)||(38684202-38684374)
chr5 (44-217)||(7085656-7085829)
chr5 (44-217)||(30485822-30485995)
chr5 (69-217)||(18207226-18207374)
chr5 (47-217)||(4603774-4603944)
chr5 (67-217)||(19456241-19456389)
chr5 (48-217)||(15971152-15971321)
chr5 (44-177)||(34310136-34310269)
chr5 (42-217)||(33709533-33709705)
chr5 (43-213)||(13038489-13038658)
chr5 (44-217)||(23270552-23270725)
chr5 (44-176)||(37495044-37495173)
chr5 (44-204)||(31287989-31288149)
chr5 (47-217)||(27487584-27487755)
chr5 (43-213)||(13108484-13108653)
chr5 (42-161)||(1827616-1827735)
chr5 (46-217)||(19145442-19145612)
chr5 (45-192)||(36954813-36954960)
chr5 (47-158)||(38631050-38631161)
chr5 (52-217)||(10869595-10869760)
chr5 (54-177)||(6014350-6014473)
chr5 (44-175)||(15931053-15931183)
chr5 (43-213)||(11464942-11465111)
chr5 (44-204)||(5049131-5049290)
chr5 (42-217)||(42193477-42193650)
chr5 (67-174)||(12398521-12398628)
chr5 (44-217)||(22392695-22392855)
chr5 (44-217)||(34049816-34049978)
chr5 (47-170)||(25750686-25750811)
chr5 (63-217)||(26009294-26009448)
chr5 (44-217)||(12317185-12317353)
chr5 (43-203)||(21236406-21236566)
chr5 (119-217)||(35425082-35425180)
chr5 (67-158)||(7151346-7151437)
chr5 (44-205)||(36895419-36895580)
chr5 (133-217)||(9659341-9659425)
chr5 (42-177)||(28614555-28614688)
chr5 (63-204)||(10399786-10399927)
chr5 (67-183)||(17015482-17015593)
chr5 (101-217)||(31206293-31206410)
chr5 (44-217)||(15485321-15485495)
chr5 (131-217)||(13659275-13659361)
chr5 (44-101)||(3715055-3715112)
chr5 (42-159)||(22253233-22253350)
chr5 (102-217)||(24158196-24158311)
chr5 (44-140)||(37397707-37397803)
chr5 (44-127)||(5067295-5067378)
chr5 (103-144)||(21589349-21589390)
chr5 (47-170)||(930562-930685)
chr5 (153-217)||(41351134-41351197)
chr5 (104-156)||(41568959-41569011)
chr5 (49-215)||(2499210-2499376)
chr5 (42-117)||(16616111-16616186)
chr5 (67-172)||(3639788-3639894)
chr5 (42-96)||(21042676-21042730)
chr5 (101-217)||(16247031-16247147)
chr5 (100-145)||(16773865-16773910)
chr5 (45-142)||(40330628-40330725)
chr5 (104-175)||(10813922-10813994)
chr5 (43-174)||(33025473-33025605)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (44-217)||(5112-5285)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (44-217)||(27528825-27528998)
chr4 (44-217)||(40058882-40059055)
chr4 (44-217)||(52983613-52983786)
chr4 (44-217)||(34844788-34844961)
chr4 (44-215)||(32986191-32986362)
chr4 (44-217)||(54127372-54127545)
chr4 (44-196)||(33992620-33992772)
chr4 (43-217)||(33696309-33696483)
chr4 (44-217)||(46714386-46714560)
chr4 (42-217)||(20566341-20566517)
chr4 (44-174)||(25852208-25852338)
chr4 (44-217)||(5609232-5609405)
chr4 (42-217)||(19660562-19660737)
chr4 (44-196)||(35674792-35674944)
chr4 (68-203)||(20078028-20078163)
chr4 (42-217)||(36131540-36131715)
chr4 (42-217)||(18875547-18875721)
chr4 (48-213)||(45787738-45787902)
chr4 (64-217)||(49287872-49288024)
chr4 (44-196)||(1985830-1985982)
chr4 (44-164)||(22625153-22625273)
chr4 (49-216)||(32942369-32942536)
chr4 (45-193)||(13873349-13873497)
chr4 (103-215)||(32990488-32990600)
chr4 (54-213)||(35229172-35229331)
chr4 (42-213)||(44343505-44343677)
chr4 (63-177)||(2351026-2351140)
chr4 (74-196)||(12500109-12500231)
chr4 (47-177)||(13584324-13584454)
chr4 (99-217)||(34723848-34723966)
chr4 (48-213)||(51535611-51535784)
chr4 (67-217)||(7391995-7392143)
chr4 (48-158)||(43719154-43719264)
chr4 (101-217)||(9517671-9517787)
chr4 (48-195)||(34835527-34835675)
chr4 (47-161)||(20527119-20527236)
chr4 (93-196)||(21387536-21387639)
chr4 (47-177)||(13550205-13550335)
chr4 (50-204)||(55961797-55961939)
chr4 (88-217)||(27574356-27574485)
chr4 (67-174)||(30879238-30879345)
chr4 (44-177)||(13771552-13771686)
chr4 (50-204)||(25969545-25969700)
chr4 (123-196)||(29875826-29875899)
chr4 (43-160)||(41621684-41621800)
chr4 (128-203)||(53787101-53787177)
chr4 (133-204)||(22488071-22488142)
chr4 (106-193)||(4911978-4912069)
chr4 (44-102)||(34722164-34722222)
chr4 (101-154)||(22630280-22630332)
chr4 (102-205)||(10125872-10125974)
chr4 (63-170)||(12710192-12710299)
chr4 (48-123)||(42245744-42245819)
chr4 (114-204)||(12824464-12824554)
chr4 (108-170)||(39288917-39288978)
chr4 (101-140)||(38740901-38740940)
chr4 (41-140)||(40307533-40307631)
chr4 (101-174)||(37455628-37455700)
chr4 (101-131)||(38869827-38869857)
chr4 (100-145)||(28635754-28635799)
chr4 (101-177)||(28791166-28791242)
chr4 (101-145)||(7949427-7949471)
chr4 (101-145)||(9693471-9693515)
chr4 (66-142)||(13017745-13017821)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (44-217)||(33827603-33827776)
chr2 (44-217)||(44946083-44946256)
chr2 (40-217)||(11941240-11941417)
chr2 (48-203)||(17324764-17324918)
chr2 (43-217)||(30466860-30467034)
chr2 (44-217)||(15037953-15038126)
chr2 (43-217)||(24195997-24196169)
chr2 (42-177)||(41313984-41314119)
chr2 (48-217)||(44976183-44976353)
chr2 (63-195)||(10582043-10582174)
chr2 (63-191)||(27290601-27290729)
chr2 (86-217)||(35171836-35171967)
chr2 (47-205)||(4567479-4567637)
chr2 (67-217)||(36242342-36242492)
chr2 (44-204)||(36390611-36390769)
chr2 (67-196)||(45271401-45271530)
chr2 (46-217)||(19054021-19054193)
chr2 (66-217)||(34516444-34516589)
chr2 (67-177)||(1191530-1191640)
chr2 (49-203)||(8258896-8259050)
chr2 (67-173)||(43374399-43374505)
chr2 (67-204)||(5394034-5394171)
chr2 (45-217)||(8192382-8192553)
chr2 (49-217)||(41329842-41330009)
chr2 (44-217)||(25293160-25293326)
chr2 (44-217)||(27269374-27269553)
chr2 (96-217)||(2140516-2140634)
chr2 (44-153)||(32845085-32845194)
chr2 (48-162)||(918782-918898)
chr2 (67-177)||(13266507-13266617)
chr2 (44-149)||(18976524-18976628)
chr2 (63-196)||(23787059-23787192)
chr2 (101-217)||(3943791-3943907)
chr2 (64-196)||(19849847-19849979)
chr2 (45-183)||(14946774-14946913)
chr2 (63-182)||(40997415-40997534)
chr2 (88-178)||(5608103-5608193)
chr2 (123-217)||(28668946-28669040)
chr2 (43-128)||(4852551-4852636)
chr2 (42-121)||(32526211-32526290)
chr2 (44-123)||(10324891-10324968)
chr2 (44-158)||(28194223-28194337)
chr2 (104-217)||(19174817-19174929)
chr2 (69-217)||(29361573-29361715)
chr2 (43-148)||(6714380-6714485)
chr2 (128-196)||(714176-714244)
chr2 (54-165)||(19605927-19606038)
chr2 (52-174)||(4618758-4618880)
chr2 (52-174)||(13747578-13747702)
chr2 (108-217)||(35943741-35943851)
chr2 (66-196)||(1845705-1845838)
chr2 (138-177)||(19517030-19517069)
chr2 (67-154)||(19525490-19525576)
chr2 (150-217)||(44610139-44610206)
chr2 (143-177)||(4769259-4769293)
chr2 (45-160)||(3405240-3405354)
chr2 (63-217)||(18708490-18708644)
chr2 (101-145)||(19244168-19244212)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (44-204)||(40319-40479)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (44-204)||(97409-97569)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (48-213)||(1090-1255)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (48-213)||(9333-9498)
scaffold0366 (48-174)||(12073-12199)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (44-217)||(7339-7512)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (43-217)||(41674-41848)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (69-217)||(161828-161976)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (44-199)||(14985-15140)
scaffold0328 (109-217)||(13077-13182)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (48-174)||(10766-10892)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (45-217)||(52901-53073)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (89-217)||(39131-39259)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (74-196)||(20246-20368)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (44-217)||(66756-66921)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (63-204)||(1-142)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (43-142)||(8512-8611)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (104-217)||(32342-32455)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (44-140)||(8286-8382)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-153)||(27770-27879)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (138-217)||(2456-2535)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (49-183)||(29206-29340)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (43-117)||(12884-12958)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (44-140)||(26650-26746)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (104-153)||(123146-123194)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 35492903 - 35493078
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35492903 ttaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 35493002  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  35493003 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 35493078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45529957 - 45529784
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  45529957 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggct 45529858  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  45529857 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 45529784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8456353 - 8456180
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8456353 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 8456254  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  8456253 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggatt 8456180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 21362935 - 21363110
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  21362935 ttaacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtagg 21363034  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  21363035 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggatt 21363110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49258467 - 49258292
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49258467 ttaacccatttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtggg 49258368  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  49258367 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 49258292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30807357 - 30807203
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30807357 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 30807258  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  30807257 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgg 30807203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 46576341 - 46576515
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  46576341 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggc 46576440  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||  ||||| |||||    
T  46576441 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggatt 46576515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40133652 - 40133483
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40133652 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggct 40133553  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  40133552 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 40133483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 48977382 - 48977555
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  48977382 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggtt 48977481  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  48977482 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 48977555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25289917 - 25289757
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25289917 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggct 25289818  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  25289817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 25289757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45272620 - 45272446
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45272620 taacccatttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 45272521  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  45272520 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 45272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34492778 - 34492618
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  34492778 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggct 34492679  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  34492678 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 34492618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53424377 - 53424207
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  53424377 cccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 53424278  T
Q  146 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  53424277 gtccatacagagtttgctatggctttaaacgggccccc-gcaagtgagcggtgggattggtcccctcggatt 53424207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15566701 - 15566530
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15566701 aacccatttggg-ttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggct 15566603  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  15566602 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcagatt 15566530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 25379760 - 25379928
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  25379760 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtc 25379859  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  25379860 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggatt 25379928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 203
Target Start/End: Original strand, 26108305 - 26108445
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26108305 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 26108404  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||||    
T  26108405 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53234094 - 53233940
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53234094 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 53233995  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  53233994 tctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 53233940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18177090 - 18176917
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18177090 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggact 18176991  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  18176990 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggatt 18176917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 30257618 - 30257791
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  30257618 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggact 30257717  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  30257718 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggatt 30257791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31538041 - 31537872
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31538041 aacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggct 31537942  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||||    
T  31537941 aagtctatacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcg 31537872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52821833 - 52821666
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52821833 atttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtc 52821734  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  52821733 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccc-gtaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 52821666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Original strand, 40940817 - 40940952
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40940817 ttaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgga 40940916  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40940917 ctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacgg 40940952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 26174126 - 26174280
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26174126 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgc 26174225  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||  |  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  26174226 tctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 26174280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190772
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatt 10190772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29915473 - 29915313
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  29915473 taacccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggc 29915374  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  29915373 taagtacatacagagcttgccctggctttaaacgggccccc-gcaagtgggcggtgggattg 29915313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29964626 - 29964466
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  29964626 taacccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggc 29964527  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  29964526 taagtacatacagagcttgccctggctttaaacgggccccc-gcaagtgggcggtgggattg 29964466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083849
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggatt 10083849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52455851 - 52455679
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  52455851 acccatttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggcta 52455752  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||   || |||||||  |||||||||||    
T  52455751 agtctacacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggatt 52455679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39042025 - 39041882
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 173  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39042025 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggctttaa 39041926  T
Q  174 acggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||  |||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||    
T  39041925 acggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggatt 39041882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7470418 - 7470246
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  7470418 aacccatttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggct 7470319  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||    
T  7470318 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg-ggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagatt 7470246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53288895 - 53288782
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53288895 agtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaaagcttgct 53288796  T
Q  164 ctggctttaaacgg 177  Q
     |||||||||||||    
T  53288795 ttggctttaaacgg 53288782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097309
Alignment:
Q  90 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaag 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  190 tgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggatt 8097309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 51532783 - 51532956
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  51532783 aacccatttggggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggct 51532882  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||    
T  51532883 aagtccatacagagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagatt 51532956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7485728 - 7485573
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7485728 aacccatttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggct 7485629  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||| |||    |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  7485628 aagttcat----agcttgatctggctttaaacag-gcccctgcaagtggccggtgggattg 7485573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 32151417 - 32151587
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  32151417 ttaacccatttggg-ttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtggg 32151515  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||  |||||||    
T  32151516 ctaagctcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcg 32151587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2511449 - 2511340
Alignment:
Q  95 ctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggc 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  || | ||||||||||    
T  2511449 ctccataggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggc 2511350  T
Q  195 ggggggattg 204  Q
    || |||||||    
T  2511349 ggtgggattg 2511340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25344257 - 25344100
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||  |||| |||||    
T  25344257 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaag 25344158  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||    
T  25344157 tccatacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattg 25344100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 11390601 - 11390726
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  11390601 atttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtc 11390700  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  11390701 catacagagcttgctctgtctttaaa 11390726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33398644 - 33398511
Alignment:
Q  71 ggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctt 170  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33398644 ggtttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctt 33398545  T
Q  171 taaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  33398544 taaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 33398511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 4462625 - 4462799
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||    
T  4462625 ttaactcatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatggg 4462724  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  || ||||||||    
T  4462725 ctaagttcatacagagcttactctagctttaaacggggcccc-gcaagtggacggtgggattgatccactcggatt 4462799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Original strand, 1692870 - 1692986
Alignment:
Q  86 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |    
T  1692870 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacaggccccc-g 1692968  T
Q  186 caagtgggcggggggatt 203  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  1692969 caagtgggcggtgggatt 1692986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Original strand, 55287797 - 55287914
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  55287797 aacccatttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggct 55287896  T
Q  144 aagtccatacagagcttg 161  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  55287897 aggtccatacaaagcttg 55287914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167202
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc---tt 160  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtggactaagtccatacatagcgtttt 49167169  T
Q  161 gctctggctttaaacggaccccctgcaagtggg 193  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  49167170 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtggg 49167202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14343469 - 14343358
Alignment:
Q  66 tggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 165  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14343469 tggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacagaacttgctct 14343370  T
Q  166 ggctttaaacgg 177  Q
    | ||||||||||    
T  14343369 gcctttaaacgg 14343358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Original strand, 50582986 - 50583095
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |    
T  50582986 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-t 50583084  T
Q  144 aagtccataca 154  Q
    |||||||||||    
T  50583085 aagtccataca 50583095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8958209 - 8958065
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt-a 172  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  8958209 ttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagctttaa 8958110  T
Q  173 aacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || ||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  8958109 aatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgatt 8958065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 19857047 - 19857175
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  19857047 aacccatttggg-ttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggct 19857144  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||| ||   ||||||||||||  |||||||    
T  19857145 aagttcagttagagcttgctctaactttaaa 19857175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242101
Alignment:
Q  113 cgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacgg 1242101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24165817 - 24165745
Alignment:
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24165817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatt 24165745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407428
Alignment:
Q  98 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggg 197  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  ||   ||||||||||||     
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  198 gggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggatt 24407428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Original strand, 38732960 - 38733087
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||| |||||   || ||||||  |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  38732960 aacccatttgaggttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggct 38733059  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggcttt 171  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  38733060 gagttcatacagaggttgctctgacttt 38733087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972775
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatcccc 48972775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4252599 - 4252426
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||  |     
T  4252599 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagtgatc- 4252501  T
Q  144 aagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||||| |||||  ||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  4252500 aagtccatacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggatt 4252426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Original strand, 9853629 - 9853702
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcg 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  9853629 tagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 9842915 - 9843006
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcg 136  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9842915 aacccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579165
Alignment:
Q  103 gtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcgggggga 201  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  202 ttgtacccctcggatt 217  Q
    |||  |||||| ||||    
T  17579180 ttggtcccctcagatt 17579165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 26158811 - 26158978
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||| |||||||||||| | ||   ||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||     
T  26158811 taactcatttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg- 26158909  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||      ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  26158910 taagtccataca------gctctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 26158978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 34844429 - 34844544
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||  || ||    
T  34844429 aggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggact-agtacatacagagctttgctatggctttaaatgggccccc-gcaagtggatggtgg 34844526  T
Q  200 gattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  34844527 gattggacccctcggatt 34844544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 25017510 - 25017617
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| |  ||  ||||| |||| || ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  25017510 aacccatttggggttggcccagatgttggcttgg-atcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtgggct 25017608  T
Q  144 aagtccata 152  Q
    |||||||||    
T  25017609 aagtccata 25017617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 118
Target Start/End: Original strand, 36660768 - 36660838
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  36660768 catttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 50162038 - 50162151
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||  |||||| || | || || |    
T  50162038 acccatttgggtttgactaagtggttgacttgggatcttgaagtgcgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctattgccaattttgatgtgc-a 50162136  T
Q  145 agtccatacagagct 159  Q
    |||||||||||||||    
T  50162137 agtccatacagagct 50162151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 174
Target Start/End: Original strand, 1178228 - 1178296
Alignment:
Q  106 tcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaa 174  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1178228 tcaggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaa 1178296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8456040 - 8455952
Alignment:
Q  108 aggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaa-cggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||| |||| || |||| || | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8456040 aggttcgattctctctagtaccaattttgatgggc-aagtccatacataacttgctctggctttaaatgggaccccctgcaagtgggcgg 8455952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Original strand, 54475777 - 54475848
Alignment:
Q  146 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  54475777 gtccatacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggatt 54475848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 55371490 - 55371395
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcgg 137  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||| ||| ||| |||| |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55371490 ttaacctatttgaggttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcgg 55371395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6041871 - 6041742
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | || ||||||  |||  || ||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||| || || ||||||| ||||||||  |||||    
T  6041871 catttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtggattaagt 6041772  T
Q  148 ccatacagagct-tgctctggctttaaacg 176  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  6041771 ccatacagagttatgctctgactttaaacg 6041742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 153
Target Start/End: Original strand, 27887426 - 27887531
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||   | |||| ||||||||||||  ||  || ||| || ||||||||||||    
T  27887426 catttggggttgatctagtggttggcttgagatattggagtgtgcttctctcaatgtcttaggttcgattcctccttatgtcaattttggtgggctaagt 27887525  T
Q  148 ccatac 153  Q
    ||||||    
T  27887526 ccatac 27887531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Original strand, 40777045 - 40777114
Alignment:
Q  75 tgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||   |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  40777045 tgggacattggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattctctctagtgccaatttcggtgggcta 40777114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Original strand, 8170731 - 8170775
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  8170731 aggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttgggtgggctaa 8170775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Original strand, 16140292 - 16140422
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||| || |||||||||   | |||||| ||||||||  |||| ||| ||| || ||||||| |    
T  16140292 acccatttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcctctcaaagtctcatgttcgattttctctagtgtcaattttggtgggc-a 16140390  T
Q  145 agtccatacagagc--ttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||| | |||  | ||||||||||||||    
T  16140391 agtccatataaagctatagctctggctttaaa 16140422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40543113 - 40542940
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40543113 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 40543014  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  40543013 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 40542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7176065 - 7175892
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7176065 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 7175966  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7175965 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 7175892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 7275275 - 7275448
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7275275 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 7275374  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7275375 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 7275448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 22119890 - 22120059
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22119890 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 22119989  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22119990 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 22120059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 21835147 - 21835322
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21835147 ttaatccatttagggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 21835246  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21835247 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 21835322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 2751269 - 2751442
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2751269 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 2751368  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  2751369 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggatt 2751442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21218036 - 21217863
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21218036 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggct 21217937  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21217936 aagtccatacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 21217863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Original strand, 2103054 - 2103213
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2103054 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggcta 2103153  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  2103154 agtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 2103213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 10091185 - 10091359
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10091185 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggc 10091284  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  10091285 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 10091359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 17212051 - 17212224
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17212051 aacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggct 17212150  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| | || |||||||  |||||||||||    
T  17212151 aagtccatacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggatt 17212224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17197156 - 17196984
Alignment:
Q  41 gttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17197156 gttaacccatttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtga 17197057  T
Q  141 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  17197056 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 17196984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Original strand, 22703502 - 22703657
Alignment:
Q  62 ttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttg 161  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22703502 ttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttg 22703601  T
Q  162 ctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22703602 ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 22703657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 18044104 - 18044238
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18044104 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggc 18044203  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18044204 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 18044238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Original strand, 27009356 - 27009518
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27009356 taacccatttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 27009455  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgc-aagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  27009456 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattg 27009518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654735
Alignment:
Q  88 tttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgca 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccc-gca 654765  T
Q  188 agtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  654764 agtgggcggtgggattggtcccctcggatt 654735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Original strand, 11997847 - 11998016
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11997847 aacccatttgtggttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggct 11997946  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  11997947 aagtccatacatagcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 11998016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7800034 - 7799905
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  7800034 acccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggtta 7799935  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7799934 agtccatagagagcttgctatggctttaaa 7799905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 19421230 - 19421402
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||    
T  19421230 acccatttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggcta 19421329  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||  ||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  19421330 agtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggatt 19421402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 2344297 - 2344470
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  2344297 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggct 2344396  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  2344397 aagtccatacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggatt 2344470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13332622 - 13332495
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13332622 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 13332523  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaac 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13332522 ccatacagagcttactctggctttaaac 13332495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 27312148 - 27312323
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |    
T  27312148 ttaacctatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtg 27312247  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  27312248 ccaagtccatacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagatt 27312323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Original strand, 29861711 - 29861837
Alignment:
Q  86 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctg 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  29861711 agtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccg 29861809  T
Q  186 caagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  29861810 caagtgggcggtgggattgatcccctcg 29861837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39145856 - 39145686
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39145856 taacccatttgaggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggc 39145757  T
Q  143 taagtccat-acagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  39145756 taagtcaataacagagcttgctctggctttaaacgg-gcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcg 39145686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23012691 - 23012542
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23012691 agtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 23012592  T
Q  164 ctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  23012591 ctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcg 23012542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 27704020 - 27704148
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27704020 agtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagtccatagagagcttgct 27704119  T
Q  164 ctggctttaaacggaccccctgcaagtggg 193  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27704120 ttggctttaaatggaccccc-gcaagtggg 27704148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 28089817 - 28089990
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28089817 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 28089916  T
Q  147 tccataca----gagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  | |||||  |||||||||||    
T  28089917 tccatacaaagtgagcttgctctggctttaaatgggccccc-gcaagtgggcgatgagattggtcccctcggatt 28089990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42913716 - 42913543
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||| |    
T  42913716 aacccattttcggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggat 42913617  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  42913616 aagtccatacggaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatt 42913543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Original strand, 16374033 - 16374165
Alignment:
Q  85 aagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccct 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||     
T  16374033 aagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggaccccc 16374132  T
Q  185 gcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| ||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  16374133 gcaaatggacggtgggattggtcccctcggatt 16374165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Original strand, 28950911 - 28951038
Alignment:
Q  86 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctg 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |    
T  28950911 agtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacgggtccctcg 28951010  T
Q  186 caagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  28951011 caagtcggcggtgggattggtcccctcg 28951038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9718187 - 9718057
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  9718187 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 9718088  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9718087 tccatagagagcttgctctggctttaaacgg 9718057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 42814867 - 42814992
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42814867 atttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 42814966  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  42814967 catacaaagcttgctctgactttaaa 42814992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 31273942 - 31274045
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 173  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31273942 ttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 31274041  T
Q  174 acgg 177  Q
    ||||    
T  31274042 acgg 31274045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14199867 - 14199736
Alignment:
Q  40 agttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtg 139  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  14199867 agttaacccatttggggttg------tggttgatttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtg 14199774  T
Q  140 ggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14199773 ggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaaacgg 14199736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 32849589 - 32849719
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||| || ||||||||    
T  32849589 aacccatttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggct 32849688  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32849689 aagtccacactgagcttgctctggctttaaa 32849719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43785502 - 43785369
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||| ||    
T  43785502 aacccatttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggact 43785403  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43785402 aagtccatacagagcttactctggttttaaacgg 43785369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Original strand, 23092167 - 23092267
Alignment:
Q  117 tccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggat 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  23092167 tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggat 23092266  T
Q  217 t 217  Q
    |    
T  23092267 t 23092267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907556
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| || |||    
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  41907559 attg 41907556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 31197589 - 31197761
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||  | | ||| ||| ||||||||  |    
T  31197589 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattat-gtgtcaatttcggtggatt 31197687  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||    
T  31197688 aagtccatacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagatt 31197761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21574305 - 21574190
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatt-ccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  21574305 acccatttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtgggc- 21574207  T
Q  144 aagtccatacagagctt 160  Q
    |||||||||||||||||    
T  21574206 aagtccatacagagctt 21574190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 143
Target Start/End: Original strand, 22299866 - 22299946
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22299866 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 22299946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23330941 - 23330790
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |    
T  23330941 acccatttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtgggc-a 23330843  T
Q  145 agtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||    
T  23330842 agtccatacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcgg 23330790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 22638290 - 22638446
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||| ||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  22638290 aacccatttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 22638389  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||    | |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  22638390 aag----ttcagagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattg 22638446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643372
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 173  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||||| | |||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  174 acggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| |||  |||||||| ||| | ||||   |||||||||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggatt 22643372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31713098 - 31712932
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||         | |    
T  31713098 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaa-------tagat 31713006  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||  |||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  31713005 aagtccatacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 31712932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Original strand, 9683827 - 9683957
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  ||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9683827 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 9683926  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9683927 tccataccgagcttactctggctttaaacgg 9683957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 25333417 - 25333498
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgg 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25333417 aacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctgg 25333498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 3851844 - 3851928
Alignment:
Q  133 ttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  3851844 ttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 3851928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36772463 - 36772373
Alignment:
Q  86 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36772463 agtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 23854394 - 23854468
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854394 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 28646967 - 28647127
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||  ||||||| ||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28646967 aacctatttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc- 28647065  T
Q  144 aagtccatacagag-cttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||  ||||  ||||||||||| |||||||    
T  28647066 aagtcaatacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattg 28647127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 21370595 - 21370674
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctct 123  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21370595 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccctct 21370674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 22696316 - 22696443
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22696316 ttaactcattaggggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg 22696415  T
Q  142 ctaagtccatacagagc-ttgctctggctt 170  Q
       | |||||||||||| ||||||||||||    
T  22696416 --gactccatacagagctttgctctggctt 22696443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 192
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373856
Alignment:
Q  125 gtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgg 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgg 21373856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8435895 - 8435783
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    |||||||||||||   |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8435895 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggc-aag 8435797  T
Q  147 tccatacagagctt 160  Q
    |||||||| |||||    
T  8435796 tccatacaaagctt 8435783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491738
Alignment:
Q  114 gattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgctttggctttaaacgg 6491738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12211735 - 12211625
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||   || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | |||    
T  12211735 ccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aag 12211637  T
Q  147 tccatacagagc 158  Q
    ||||||||||||    
T  12211636 tccatacagagc 12211625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 40332097 - 40332196
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||| |||  || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40332097 aacccatttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatgggct 40332196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 155
Target Start/End: Original strand, 37056217 - 37056322
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||   |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||    
T  37056217 atttggggttgatttagtggttggtttgtgatcttggagtgtgctcctctcaaggtttgagattcgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aagtc 37056315  T
Q  149 catacag 155  Q
    |||||||    
T  37056316 catacag 37056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 112
Target Start/End: Original strand, 28003838 - 28003902
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggtt 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  28003838 catttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22264705 - 22264622
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 127  Q
    |||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22264705 aacccatttggggttggccgaagggttggtttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtg 22264622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35173190 - 35173132
Alignment:
Q  89 ttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  35173190 ttgctcctccaaaggtctcaggtttgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 35173132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Original strand, 36173090 - 36173147
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagct 159  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  36173090 aggtttcaggttcgattccctcttgtgccaattttggtgggc-aagtccatacagagct 36173147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33137951 - 33137876
Alignment:
Q  120 ctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  33137951 ctctggtgtcaattttagtgggctaagtccatacagagctcgctctagctttaaatgg-ggccctgcaagtgggcgg 33137876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 35476403 - 35476483
Alignment:
Q  108 aggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaa 188  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  35476403 aggttcgattctctttggtgccaattttggtggg-taagttcatacagagctttgctctggcttagaacgggacccctgcaa 35476483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Original strand, 21558187 - 21558227
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  21558187 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttaggtggg 21558227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Original strand, 30579394 - 30579438
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  30579394 aggtctcaggttcgattttctctggtgccaatttaggtgggctaa 30579438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 163
Target Start/End: Original strand, 47380903 - 47381014
Alignment:
Q  51 ttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtcca 150  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||   || | | ||||||||||| | || ||||||| ||||||| || |||||||    
T  47380903 ttggggttggcctagtggttggcttgagattttgtagtttgctcttctcaagattttaggttcgattctcacttgtgccaatttcggtgtgc-aagtcca 47381001  T
Q  151 tacagagcttgct 163  Q
    |||| ||||||||    
T  47381002 tacatagcttgct 47381014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48983750 - 48983706
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  48983750 aggtctcaggttcgattccctctagtgtcaatttgggtgggctaa 48983706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 213
Target Start/End: Original strand, 24674383 - 24674556
Alignment:
Q  40 agttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtg 139  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24674383 agttaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtg 24674482  T
Q  140 ggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  24674483 ggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 24674556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4621440 - 4621267
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4621440 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 4621341  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4621340 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 4621267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 24122016 - 24122190
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24122016 taactcatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 24122115  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  24122116 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 24122190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27455085 - 27454894
Alignment:
Q  28 aactggaggtttagttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27455085 aactggaggtttagttaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatg 27454986  T
Q  128 ccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg--accccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27454985 ccaatttcggtgagctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggatt 27454894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 8077639 - 8077810
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8077639 ttaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 8077738  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  8077739 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 8077810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 46607804 - 46607977
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46607804 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 46607903  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  46607904 aagtccatacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 46607977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7766932 - 7766757
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7766932 ttaacccattcggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 7766833  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7766832 ctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 7766757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 30677170 - 30677343
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30677170 aacccatttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggct 30677269  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  30677270 aagtccatacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagatt 30677343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15059605 - 15059436
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15059605 aacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 15059506  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| | |||||  |||||||    
T  15059505 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcg 15059436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7197449 - 7197277
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  7197449 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-t 7197351  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  7197350 aagtcaatacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggatt 7197277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Original strand, 7946836 - 7946968
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7946836 ttaacccatttggggtcgacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 7946935  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7946936 ctaagtctatacagagcttgctctcgctttaaa 7946968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 18646845 - 18647016
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18646845 ttaacctatttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 18646944  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||  |||||||    
T  18646945 ctaagtctatacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcg 18647016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9500533 - 9500406
Alignment:
Q  69 ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 168  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9500533 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 9500434  T
Q  169 tttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9500433 tttaaacggagcccccacaagtgggcgg 9500406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 17935782 - 17935936
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17935782 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgc 17935881  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||  || ||||||||    
T  17935882 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggatt 17935936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 21726722 - 21726896
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  21726722 taacccatttgaggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggt 21726821  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||| |||  |||||| ||||    
T  21726822 taagtccatatagagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagatt 21726896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 196
Target Start/End: Original strand, 23734108 - 23734263
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23734108 ttaacccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg 23734207  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  23734208 ctaagtccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcgg 23734263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 196
Target Start/End: Original strand, 23741300 - 23741455
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23741300 ttaacccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg 23741399  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  23741400 ctaagtccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcgg 23741455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 7578422 - 7578576
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7578422 tagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 7578521  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| ||||||||||  |||  ||||||||| || |||||||   ||||||||||    
T  7578522 tctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggatt 7578576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23232468 - 23232304
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23232468 aacccatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggct 23232369  T
Q  144 aagtccatacagagctt----gctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||    
T  23232368 aagtccatacagagcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattg 23232304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 32930749 - 32930916
Alignment:
Q  50 tttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtcc 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  32930749 tttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtcc 32930848  T
Q  150 atacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  || |||||||  |||||| ||||    
T  32930849 atgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagatt 32930916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 168195 - 168368
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  168195 aacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 168294  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  | || || ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  168295 aagttcatacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggatt 168368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 1378892 - 1379064
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  1378892 aacccatttaaggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggct 1378991  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||  |||||| ||||    
T  1378992 aagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccc-gcaagtggacggtgagattggtcccctcagatt 1379064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 32729539 - 32729711
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  32729539 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggc- 32729637  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  32729638 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggatt 32729711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45859222 - 45859073
Alignment:
Q  68 gttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 167  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  45859222 gttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttg 45859123  T
Q  168 ctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||| |  |||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||    
T  45859122 ctttaaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggatt 45859073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 46113600 - 46113495
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46113600 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtc 46113501  T
Q  149 cataca 154  Q
    ||||||    
T  46113500 cataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 34778336 - 34778506
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| |    
T  34778336 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt 34778435  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
       ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  ||||| |||||    
T  34778436 ---tccatacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggatt 34778506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29057540 - 29057390
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||      
T  29057540 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgat-ggta 29057442  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcg 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||    
T  29057441 aagtctatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcg 29057390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18533929 - 18533767
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||| |||| |||     
T  18533929 ttaacccatttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatgga 18533830  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  18533829 ctaagtccatatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattg 18533767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905580
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  167 gctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||    
T  33905590 gctttaaacgg 33905580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36156063 - 36155931
Alignment:
Q  72 gtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 171  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||    
T  36156063 gtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagtttt 36155964  T
Q  172 aaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||| |  |||| ||| |||||||| |||||||    
T  36155963 aaacagggcccccgcaggtgggcggtgggattg 36155931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8779921 - 8779766
Alignment:
Q  62 ttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttg 161  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  8779921 ttagtggttgatttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagctta 8779822  T
Q  162 ctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| |||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  8779821 ctctagctttaaacggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggatt 8779766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351541
Alignment:
Q  65 gtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 164  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  165 tgg 167  Q
    |||    
T  37351543 tgg 37351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 2272342 - 2272511
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2272342 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagt 2272441  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
     |||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||  ||||||  ||| |||||||    
T  2272442 tcatacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggatt 2272511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254795
Alignment:
Q  98 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggg 197  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  198 gggattg 204  Q
    |||||||    
T  8254801 gggattg 8254795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20487393 - 20487297
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20487393 aacccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 2537697 - 2537860
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||      ||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  2537697 taacccatttggggttggcctagtggttggattgggatctt------tgctcctctcaaggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggc 2537790  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || |||||     |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  2537791 tatgtcca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggatt 2537860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40146079 - 40145950
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||     |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  40146079 atttggagttgacctagtggttgatttgtgatcttgaagtttgctccttcag-----tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtc 40145985  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  40145984 catacagagcttgctctgactttaaatgggccccc 40145950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 1486415 - 1486527
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||  ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||    
T  1486415 acccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg-ta 1486511  T
Q  145 agtccatacagagctt 160  Q
    ||||||||||||||||    
T  1486512 agtccatacagagctt 1486527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034474
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt 160  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagctt 19034474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 160
Target Start/End: Original strand, 1138570 - 1138688
Alignment:
Q  41 gttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||   |||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  1138570 gttaacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtgg 1138669  T
Q  141 gctaagtccatacagagctt 160  Q
     | |||||||||||||||||    
T  1138670 ac-aagtccatacagagctt 1138688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40802272 - 40802138
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||| ||| ||||| |  ||||||||| || | || |    
T  40802272 ttaacccatttggggttggctttgtggttggcttgagatattggagtttgctcatctcaaggtctcatgtttgattctccatggtgccaattttgatgag 40802173  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40802172 c-aagtccatacagagcttgctctgactttaaacgg 40802138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 154
Target Start/End: Original strand, 24216973 - 24217081
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  24216973 acccatttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtggg-ta 24217071  T
Q  145 agtccataca 154  Q
    | ||||||||    
T  24217072 aatccataca 24217081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25237192 - 25237080
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||| | |||| | || ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  25237192 aacccatttagagttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc- 25237094  T
Q  144 aagtccatacagag 157  Q
    ||||||||||||||    
T  25237093 aagtccatacagag 25237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14258630 - 14258538
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcg 136  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14258630 aacccatttgggcttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 16899557 - 16899670
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||| | |||    
T  16899557 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-cagtccatacaaagctttgctctggtttagaacggggcccctgcaagtggacggtgagat 16899655  T
Q  203 tgtacccctcggatt 217  Q
    ||  |||||||||||    
T  16899656 tggtcccctcggatt 16899670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45331746 - 45331692
Alignment:
Q  123 tggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45331746 tggtggcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacgg 45331692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 160
Target Start/End: Original strand, 16539625 - 16539717
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt 160  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  16539625 ggttggtttgggatcttggagtgagctccttgcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacagagctt 16539717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12877038 - 12876966
Alignment:
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  12877038 agtccatacagagcttgctctagctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatt 12876966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 217
Target Start/End: Original strand, 48699859 - 48699926
Alignment:
Q  151 tacagagcttgctctgg-ctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  48699859 tacagagcttgctctgggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggatt 48699926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 37047010 - 37047159
Alignment:
Q  68 gttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctg 166  Q
    ||||| ||||||  ||| ||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  37047010 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccccctggtacaaattttggtgggct-agtccatacagagctttgctcta 37047108  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||| ||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  37047109 gctttaaatggggcccccacaagtggacggtgggattggacccctaggatt 37047159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Original strand, 39964563 - 39964621
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagct 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  39964563 aggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcacacagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 171
Target Start/End: Original strand, 809215 - 809343
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||| | |||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||| || || ||| ||| ||||||||||    
T  809215 taacccatctagggttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtgggc 809314  T
Q  143 taagtccatacagag-cttgctctggcttt 171  Q
     ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  809315 -aagtccatacaaagccttgatctggcttt 809343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 1818730 - 1818806
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc 122  Q
    |||||||||||||| | | || ||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1818730 cccatttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctc 1818806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 22909975 - 22910038
Alignment:
Q  154 agagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  22909975 agagcttgctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggatt 22910038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Original strand, 19480558 - 19480659
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggcttta 172  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||   |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19480558 ttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcacattcgattccccgcggtgccaattttagtgggctaagtccatatagagctatgctctggcttta 19480657  T
Q  173 aa 174  Q
    ||    
T  19480658 aa 19480659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 26820240 - 26820329
Alignment:
Q  103 gtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgg 192  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||| ||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  26820240 gtctcagattcgattccctatgatgtcaatttttatgggttaagtccatacagaacttgctctgcctttaaatgggacccctgcaagtgg 26820329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25496692 - 25496596
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtg 139  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25496692 taacctatttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtg 25496596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 49101773 - 49101730
Alignment:
Q  114 gattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc 158  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49101773 gattccccctggtgccaa-ttcggtgggctaagtccatacagagc 49101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 1378743 - 1378833
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggt 138  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  1378743 catttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9926289 - 9926189
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggat 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||| || |||||||| || || ||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  9926289 tctcagattcgattccttctggtgtcaattttggtgggcaaa-tccatacaaagttttgctctggcttagaacggagcccccgcaactgggcggtgggat 9926191  T
Q  203 tg 204  Q
    ||    
T  9926190 tg 9926189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1095146 - 1095091
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt 160  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1095146 tctcaagttcgatttcttctggtgccaatttcggtgggc-aagtacatacagagctt 1095091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Original strand, 6122853 - 6122897
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  6122853 aggtctcaggttcgattccctctagtgtcaatttgggtgggctaa 6122897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Original strand, 6776139 - 6776190
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcct 96  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6776139 aacccatttggg-ttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcct 6776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Original strand, 17447272 - 17447426
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| |  | |||||| |||| ||| ||| ||| |||| |||   ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||  |||| | || |    
T  17447272 catttggggttggcccaatggttgatttgagatcttggagtgtgcttctctgaaggtctctggtttgattctctctggtgccaattttagtggac-aatt 17447370  T
Q  148 ccatacagag-cttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  17447371 ccatacaaagccttgctctggatttaaatggaccccc-gcaagtgggaggtgggatt 17447426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Original strand, 51814553 - 51814597
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  51814553 aggtctcaggttcgattctctccggtgccaatttgggtgggctaa 51814597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 34147338 - 34147513
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34147338 ttaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 34147437  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34147438 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 34147513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 34159954 - 34160129
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34159954 ttaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 34160053  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34160054 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 34160129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15360301 - 15360128
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15360301 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 15360202  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  15360201 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggatt 15360128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449038
Alignment:
Q  50 tttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtcc 149  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  150 atacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 11449038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3222839 - 3222666
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3222839 ttaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 3222741  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  3222740 ctaagtccatacagagcttgctctgtctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 3222666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 654349 - 654176
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  654349 aacccatttgggtttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 654250  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  654249 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 654176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 9238969 - 9239142
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9238969 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggtt 9239068  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  9239069 aagtccatatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 9239142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21982521 - 21982363
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  21982521 cccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaa 21982422  T
Q  146 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  21982421 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 21982363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 1344934 - 1345102
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1344934 ccatttggggttgacctagtggttggt--gggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 1345031  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||| |||||    
T  1345032 tccatacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggatt 1345102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 12591631 - 12591764
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12591631 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggct 12591730  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591731 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 12591764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390592
Alignment:
Q  90 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  190 tgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggatt 12390592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 11007158 - 11007332
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  11007158 taacccatttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggc 11007257  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11007258 taagtccatacaaagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggatt 11007332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 28672060 - 28672234
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  28672060 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggc 28672159  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28672160 taagtccatacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 28672234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5360274 - 5360105
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  5360274 aacccatttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggct 5360175  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5360174 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcg 5360105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21148714 - 21148541
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  21148714 taacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggc 21148615  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21148614 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 21148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17081238 - 17081088
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17081238 tagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 17081139  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  17081138 tctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 17081088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9690833 - 9690708
Alignment:
Q  52 tggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccat 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9690833 tggggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccat 9690734  T
Q  152 acagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9690733 acagagcttgctctggctttaaacgg 9690708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 9843930 - 9844105
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||    
T  9843930 ttaatccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtggg 9844029  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  9844030 ttaagtccatacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggatt 9844105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Original strand, 9208245 - 9208406
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9208245 taacccatttggggttgttctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtgggc 9208344  T
Q  143 taagtccatacagag-cttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  9208345 -aagtccatacagagccttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 9208406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Original strand, 11840915 - 11841028
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11840915 agtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaagcttgct 11841014  T
Q  164 ctggctttaaacgg 177  Q
     ||| |||||||||    
T  11841015 ttggttttaaacgg 11841028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 156
Target Start/End: Original strand, 13753234 - 13753346
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13753234 aacccatttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggct 13753333  T
Q  144 aagtccatacaga 156  Q
    || ||||||||||    
T  13753334 aaatccatacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Original strand, 14212885 - 14213002
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  14212885 taactcatttgggattgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggc 14212984  T
Q  143 taagtccatacagagctt 160  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14212985 taagtccatatagagctt 14213002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 131
Target Start/End: Original strand, 22576060 - 22576148
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22576060 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaa 22576148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 33499467 - 33499642
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttc-gattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33499467 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtggg 33499566  T
Q  142 ctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || |||||||||| | | ||||| |||||||||| || ||| |  ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  33499567 ct-agtccatacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 33499642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17149637 - 17149490
Alignment:
Q  66 tggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagag-cttgctc 164  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||     
T  17149637 tggttggtttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttggc-aagtccatacagagccttgctt 17149539  T
Q  165 tggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||  ||| |||||||  |||||||    
T  17149538 tggctttaaatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcg 17149490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968112
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacagaacttactctg 28968123  T
Q  167 gctttaaacgg 177  Q
     ||||||||||    
T  28968122 cctttaaacgg 28968112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33718661 - 33718548
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||  ||    
T  33718661 aacccatttagggttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaact 33718562  T
Q  144 aagtccatacagag 157  Q
    |||| |||||||||    
T  33718561 aagtacatacagag 33718548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 31039014 - 31039165
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| || | || ||| |||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||  ||| |||| ||||||    
T  31039014 aacccatttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggct 31039113  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||  |||||||||||    
T  31039114 aagtccatacagagtttgctatggctatgaatggaccccc-acaagtgggcgg 31039165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Original strand, 10377766 - 10377881
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcgggg 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| || |||||  ||||||||||| |    
T  10377766 aggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtg 10377864  T
Q  199 ggattgtacccctcgga 215  Q
    | ||||  |||||||||    
T  10377865 gcattggtcccctcgga 10377881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17706489 - 17706409
Alignment:
Q  65 gtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  17706489 gtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaa 17706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 8479308 - 8479412
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||   || | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  8479308 cccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggc-aa 8479406  T
Q  146 gtccat 151  Q
    ||||||    
T  8479407 gtccat 8479412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3625941 - 3625863
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc 122  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || || ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  3625941 aacccatttggggttggtttagtggttaatttggaattttaaagtttggtcctccaaagatctcaggtttgattccctc 3625863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 4718642 - 4718816
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4718642 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 4718741  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4718742 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 4718816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34237858 - 34237685
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34237858 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 34237759  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  34237758 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggatt 34237685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 39349254 - 39349427
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39349254 aacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 39349353  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  39349354 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 39349427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 28193470 - 28193645
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28193470 ttaacctatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 28193569  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28193570 ttaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 28193645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 2618184 - 2618357
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2618184 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggct 2618283  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  2618284 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 2618357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3734826 - 3734653
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3734826 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 3734727  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||||||  |||||||||||    
T  3734726 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggatt 3734653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15259606 - 15259457
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15259606 ccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 15259507  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  15259506 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgg 15259457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Original strand, 20305905 - 20306075
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20305905 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggc 20306004  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  20306005 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 20306075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Original strand, 21092538 - 21092708
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  21092538 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggc 21092637  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  21092638 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 21092708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 21603247 - 21603401
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21603247 tagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacagagcttgc 21603346  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21603347 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 21603401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Original strand, 19471608 - 19471777
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  19471608 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19471707  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||    
T  19471708 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcg 19471777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Original strand, 19542532 - 19542701
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  19542532 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19542631  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||    
T  19542632 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcg 19542701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19590164 - 19589995
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  19590164 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19590065  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||    
T  19590064 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcg 19589995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 18532105 - 18532257
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  18532105 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggct 18532204  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18532205 aagtccatacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcgg 18532257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27746535 - 27746408
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27746535 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 27746436  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27746435 tccatacagagcttgctctggctttaaa 27746408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42643322 - 42643152
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42643322 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggc 42643223  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  42643222 taagtccatacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 42643152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4698903 - 4698753
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4698903 ggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatgaagaacttgctctg 4698804  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  4698803 gctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggatt 4698753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 32879277 - 32879450
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32879277 aacccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 32879376  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  32879377 aagttcatacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 32879450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633125
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| |||||| |  |  ||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggatt 14633125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8765704 - 8765556
Alignment:
Q  69 ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 168  Q
    |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8765704 ttggcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 8765605  T
Q  169 tttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||  | || |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8765604 tttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 8765556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 42328004 - 42328135
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42328004 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggcta 42328102  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42328103 agtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 42328135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 204
Target Start/End: Original strand, 20469940 - 20470075
Alignment:
Q  69 ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 168  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20469940 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 20470039  T
Q  169 tttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  20470040 tttaaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattg 20470075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 264597 - 264463
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264597 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 264498  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  264497 tatacatagcttgctctggctttaaacgggccccc 264463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Original strand, 651324 - 651458
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  651324 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 651423  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  651424 tatacatagcttgctctggctttaaacgggccccc 651458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Original strand, 837059 - 837193
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  837059 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 837158  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  837159 tatacatagcttgctctggctttaaacgggccccc 837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 28088284 - 28088444
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  28088284 aacccatctggggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggtt 28088383  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || | |||||||||||| |||||||    
T  28088384 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattg 28088444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953050
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| |||    
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  6953053 attg 6953050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 24018380 - 24018513
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| ||| |||||||    
T  24018380 aacctatttggggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggct 24018479  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24018480 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 24018513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 2166695 - 2166867
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtg--gttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||    
T  2166695 aacccatttggggttggcccagtgcagttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtagg 2166792  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaa-cggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  2166793 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaataagacccc--gcaagtgggcggtgggattggtcccctcagatt 2166867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7558146 - 7557985
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  7558146 aacccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggct 7558047  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||       ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  7558046 aagtcc-------gcttgttctggctttaaacggaccccc-gcaagtggacggtgggattggtcccctcg 7557985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610738
Alignment:
Q  65 gtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 164  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  165 tggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcgg 34610738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 196
Target Start/End: Original strand, 21667567 - 21667700
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| |||| || ||| || ||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21667567 tagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 21667666  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||| ||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  21667667 tctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcgg 21667700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 28964033 - 28964182
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28964033 cccatttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaa 28964132  T
Q  146 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcg 195  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  28964133 gtccatacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcg 28964182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248518
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt-catacagagtttgctctggctttaaacgggccctc-gcaagtgggcggtgggatt 25248504  T
Q  204 gtacccctcggatt 217  Q
    |  |||||||||||    
T  25248505 ggtcccctcggatt 25248518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 24999289 - 24999392
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  24999289 aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggg 24999388  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  24999389 attg 24999392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292225
Alignment:
Q  99 agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  199 ggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||  ||| |||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggatt 10292225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Original strand, 18128512 - 18128671
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||  ||||||| ||||||| |||||||    |||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  18128512 acccatttgggattggctcattggttgacttgggatcttgaagtgtgctcctttcaaggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcga 18128611  T
Q  145 agtccatacagagctt-gctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  18128612 a-tccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 18128671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9047463 - 9047333
Alignment:
Q  62 ttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttg 161  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||     
T  9047463 ttagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggttttaagtttgattccctctaatgccaattttggtggactaagtccatacaaagctta 9047364  T
Q  162 ctctggctttaaacggaccccctgcaagtgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  9047363 ctctgactttaaacggaacccccgcatgtgg 9047333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26169051 - 26168922
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||     
T  26169051 aacccatttagggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtgggc- 26168953  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26168952 aagttcatacagagcttgttctggctttaaa 26168922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36848949 - 36848822
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||   |||| | || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36848949 ccatttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaag 36848850  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  36848849 tccatacggagtttgctcgggctttaaa 36848822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34639390 - 34639284
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttg 161  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  34639390 tagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcgat-ccctctggtgccaatttcggtggg-taagtccatacagagctttg 34639293  T
Q  162 ctctggctt 170  Q
    |||||||||    
T  34639292 ctctggctt 34639284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Original strand, 8042655 - 8042764
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||       ||||||||| || ||||||||| |    
T  8042655 ccatttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatg 8042747  T
Q  147 tccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8042748 tccatacagagtttgct 8042764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 3794792 - 3794904
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  3794792 ccatttgtggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcggcgggc-aag 3794890  T
Q  147 tccatacagagctt 160  Q
    | |||||| |||||    
T  3794891 ttcatacaaagctt 3794904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22200742 - 22200617
Alignment:
Q  65 gtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgct 163  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||  |||| |||||||||| |||||    
T  22200742 gtggttggtttgggatcttggagtttacttctctcaaagtctcaggttcgattccctctagtgccaatttc-gagggaaaagttcatacagagctttgct 22200644  T
Q  164 ctggctttaaacggaccccctgcaagt 190  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||    
T  22200643 ctggcttagaacggagcccctgcaagt 22200617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 177
Target Start/End: Original strand, 1219395 - 1219480
Alignment:
Q  92 ctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1219395 ctcctccaaagatttcaggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacgg 1219480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Original strand, 28908838 - 28908972
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtct--caggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-t 159  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||   |||| |  ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||| |    
T  28908838 tagtggttggtttggaattttggagtttgctcctctcaaggtgtttcaggttcaattccctctggtgtcaattacagtgggc-aagtccatacagagctt 28908936  T
Q  160 tgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcg 195  Q
    || |||||||||||||||  | || |||||||||||    
T  28908937 tgttctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcg 28908972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34694776 - 34694681
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||||   |||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34694776 ccatttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc 34694681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8387644 - 8387535
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctc-cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||| ||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||    
T  8387644 ccatttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc-aa 8387547  T
Q  146 gtccatacagag 157  Q
    ||||||||||||    
T  8387546 gtccatacagag 8387535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2639499 - 2639441
Alignment:
Q  159 ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  2639499 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 2639441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Original strand, 41070767 - 41070874
Alignment:
Q  52 tggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccat 151  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||| ||| ||| |||| |||   |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||    
T  41070767 tggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggc-aagttcat 41070865  T
Q  152 acagagctt 160  Q
    ||| |||||    
T  41070866 acatagctt 41070874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3403706 - 3403596
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||| ||||| | | | ||||||  || ||| ||| ||||||||| ||   |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3403706 taacccatttgaggttggccttggggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc 3403607  T
Q  143 taagtccataca 154  Q
     |||||||||||    
T  3403606 -aagtccataca 3403596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11926707 - 11926531
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11926707 ttaacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtggg 11926608  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  11926607 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatt 11926531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27498936 - 27498761
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27498936 ttaacccatttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 27498837  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27498836 ctaagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 27498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15641309 - 15641135
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15641309 taacccatttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggc 15641210  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  15641209 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 15641135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32059644 - 32059470
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32059644 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggc 32059545  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  32059544 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 32059470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8484861 - 8484691
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8484861 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 8484762  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8484761 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 8484691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 25586926 - 25587079
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25586926 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggct 25587025  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  25587026 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcgg 25587079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 38684202 - 38684374
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684202 aacccacttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 38684301  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  38684302 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccc-gcaagtgagcggtgggattggtcccctcggatt 38684374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7085829 - 7085656
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7085829 aacccatttggggctggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggct 7085730  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7085729 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 7085656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 30485822 - 30485995
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  30485822 aacccatttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggct 30485921  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30485922 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 30485995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 18207226 - 18207374
Alignment:
Q  69 ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 168  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18207226 ttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggc 18207325  T
Q  169 tttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||   |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  18207326 tttaaacgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 18207374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 4603774 - 4603944
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  4603774 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaag 4603873  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  4603874 tccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatt 4603944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456241
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat-ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19456290 gctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 19456241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15971321 - 15971152
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  15971321 catttagggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 15971222  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  15971221 ccatacatagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggatt 15971152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 34310136 - 34310269
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34310136 aacccatttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggct 34310235  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310236 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 34310269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33709705 - 33709533
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33709705 ttaacccatttggg-ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 33709607  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  33709606 ctaagtccatacagag--agctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 33709533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13038658 - 13038489
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  13038658 taacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggc 13038559  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||| ||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13038558 taagttcatacagagcaag-tatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcg 13038489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23270725 - 23270552
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  23270725 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggct 23270626  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  23270625 aagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggatt 23270552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Original strand, 37495044 - 37495173
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37495044 aacccatttgggg---acctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggct 37495140  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37495141 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacg 37495173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31288149 - 31287989
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  31288149 aacccattttgggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggtt 31288050  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  31288049 aagtccatacaaagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 31287989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27487755 - 27487584
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  27487755 ccatttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaag 27487656  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27487655 tccatacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 27487584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13108653 - 13108484
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  13108653 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggc 13108554  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13108553 taagttcatacagagcaag-tctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcg 13108484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1827735 - 1827616
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  1827735 ttaacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtggg 1827636  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttg 161  Q
     |||||||||||||||||||    
T  1827635 ttaagtccatacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19145612 - 19145442
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19145612 cccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aa 19145514  T
Q  146 gtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19145513 gtccatacagagctttgctctggctttaaatggtccccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 19145442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 36954813 - 36954960
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||    
T  36954813 acccatttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgcta 36954912  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgg 192  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  36954913 agtccatacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtgg 36954960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38631161 - 38631050
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38631161 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaag 38631062  T
Q  147 tccatacagagc 158  Q
    ||||||||||||    
T  38631061 tccatacagagc 38631050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10869760 - 10869595
Alignment:
Q  52 tggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccat 151  Q
    |||||||| | | |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  10869760 tggggttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccac 10869661  T
Q  152 acagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  10869660 actgagcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 10869595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6014473 - 6014350
Alignment:
Q  54 gggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatac 153  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6014473 gggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatac 6014374  T
Q  154 agagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6014373 agagcttgctctggctttaaacgg 6014350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Original strand, 15931053 - 15931183
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| ||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15931053 aacccatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggt-ggct 15931151  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaac 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15931152 aagtccatacagagcctgctctggctttaaac 15931183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11465111 - 11464942
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||  || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  11465111 taacccatttcgggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc 11465012  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11465011 taagttcatacagagcttactctggctttaaacggggcccc-gcaagtgggtggtgggattggtcccctcg 11464942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 5049131 - 5049290
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||  || | ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  5049131 aacccatttggggttgacttaatgattgatttggaatcttgaagtttgcttttctaaaggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtct 5049230  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  5049231 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggccccc-gcaaatggacggtgggattg 5049290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 42193477 - 42193650
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||   |||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  42193477 ttaacccatttattgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtggg 42193576  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  42193577 ctaagtctatacagagtttgctttggctttaaatggacccc--gcaagtgggcggtggggttggtcctctcggatt 42193650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398521
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  167 gctttaaa 174  Q
    ||||||||    
T  12398528 gctttaaa 12398521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 22392695 - 22392855
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  22392695 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtgggct 22392791  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||  |||||| ||||    
T  22392792 aagt----------cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagatt 22392855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 34049816 - 34049978
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |           |||||||    
T  34049816 aacccatttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctag-----------gtgggct 34049904  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||  ||||||  |||||||||||    
T  34049905 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggatt 34049978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25750811 - 25750686
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat--tccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  25750811 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggtta 25750712  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctt 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750711 agtccatatagagcttgctctggctt 25750686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26009448 - 26009294
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||| |||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  26009448 tagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagtccatgcagagcttac 26009349  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  | ||||||   |||||||||||    
T  26009348 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggatt 26009294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12317353 - 12317185
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||||| |    
T  12317353 aacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggtt 12317254  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||    |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  12317253 aagtc----cagagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattg-atccctcggatt 12317185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21236566 - 21236406
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| | || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| ||| |||  |||||    
T  21236566 taacccatttagggttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggc 21236467  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  21236466 taagtccatacagagttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggatt 21236406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Original strand, 35425082 - 35425180
Alignment:
Q  119 cctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  35425082 cctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggatt 35425180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 158
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc 158  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 205
Target Start/End: Original strand, 36895419 - 36895580
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  36895419 aacccatttgagattgacgtagtgattagcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtggtc- 36895517  T
Q  144 aagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgt 205  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| | || | |||||||||||||||||||||    
T  36895518 aagtccatacaaagctttgctctggcttagaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgt 36895580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9659425 - 9659341
Alignment:
Q  133 ttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| |||||||    
T  9659425 ttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggatt 9659341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28614688 - 28614555
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||| ||  |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |    
T  28614688 ttaacccatttggggttgg-tgagtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaa-ttcggtgag 28614591  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
     |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  28614590 ataagtccatacaaagcttgttctgactttaaacgg 28614555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 204
Target Start/End: Original strand, 10399786 - 10399927
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||  || |||| ||| |||||||| || || || | ||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  10399786 tagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgatgggctaagtccatacggagcatgc 10399885  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||| ||||||||||  |||| | |||||| ||| |||||||    
T  10399886 tctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattg 10399927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015482
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||     |||||| ||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccata-----cttgctttg 17015499  T
Q  167 gctttaaacggaccccc 183  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17015498 gctttaaacggatcccc 17015482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 31206293 - 31206410
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggg 199  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||  ||||||| ||| ||    
T  31206293 aggtctcaggttttattccccctggtgccaatttcattggcctaagtccatacagagctatgctcttgctttaaatgggacccccacaagtggacggtgg 31206392  T
Q  200 gattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| || |||||||||    
T  31206393 gattggactcctcggatt 31206410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15485495 - 15485321
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtgg-ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||  ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||     
T  15485495 aacccatttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccc-ctgacaccaatttcggtgggt 15485397  T
Q  143 taagtccatacagagct-tgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||||| ||   ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  15485396 taagtccatacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggatt 15485321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13659361 - 13659275
Alignment:
Q  131 acttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  13659361 acttcgatgggttaagtccatagagaacttgctttgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 13659275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3715112 - 3715055
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccaga 101  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3715112 aaccaatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22253350 - 22253233
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||   || |||||||||||| |  |||| ||||||| |||| ||||    
T  22253350 ttaatccatttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatggg 22253251  T
Q  142 ctaagtccatacagagct 159  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  22253250 ctaagtccatacaaagct 22253233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24158311 - 24158196
Alignment:
Q  102 ggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||  |||||  || |||||||||||||| | |    
T  24158311 ggtctcaggttcgattccttctggtgtcaatttcgatggg-taagtccatacatagctttactctggcttagaacggggcctctgcaagtgggcggtgag 24158213  T
Q  201 attgtacccctcggatt 217  Q
    ||||  |||||| ||||    
T  24158212 attggtcccctcagatt 24158196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 140
Target Start/End: Original strand, 37397707 - 37397803
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||| || |||||    
T  37397707 aacctatttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Original strand, 5067295 - 5067378
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 127  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  5067295 aacccatttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtg 5067378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 144
Target Start/End: Original strand, 21589349 - 21589390
Alignment:
Q  103 gtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21589349 gtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtgggcta 21589390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 930685 - 930562
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc-tggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||   | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||    
T  930685 ccatttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggtggac-aa 930587  T
Q  146 gtccatacagagcttgctctggctt 170  Q
     | |||||| ||||||||| |||||    
T  930586 attcatacatagcttgctccggctt 930562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41351197 - 41351134
Alignment:
Q  153 cagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  41351197 cagagcttgctctggctttaaacggggctcc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 41351134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41569011 - 41568959
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacaga 156  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41569011 tctcaggttcgatttcctcttgtgtcaatttcggtggactaagtccatacaga 41568959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2499376 - 2499210
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||||    | |||||||||||||||| | ||| || ||| |||| ||||| |||||    
T  2499376 atttggggttggcttagtggctgacttgggatcttggaatttgctcctttcaaagtctcaggttcgattctccctgttgtcaatttcgatgggc-aagtc 2499278  T
Q  149 catacagag-cttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcgga 215  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||| | |||||  |||||||||    
T  2499277 catatagagccttactctggctttaaatgggacccttgaaagtggacggtgagattggtcccctcgga 2499210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 16616111 - 16616186
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatt 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  16616111 ttaacccatttgagattggcttagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaagatctcagattcgatt 16616186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 172
Target Start/End: Original strand, 3639788 - 3639894
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctct 165  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||   |||||| ||||||||||  || |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3639788 ggttggcttgagattttggagtttgctcttctccaggtcttaggttcgattatctttggtggtaatttcggtggactaagtccatacggagctatgctct 3639887  T
Q  166 ggcttta 172  Q
    |||||||    
T  3639888 ggcttta 3639894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 21042730 - 21042676
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcct 96  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21042730 ttaactcatttggggttggtttagtgattggtttgggatcttggagtttgctcct 21042676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16247147 - 16247031
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggg 199  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||| || | |||  ||||||| ||| ||    
T  16247147 aggtctcaggttcaatcccccccggtgccaatcttggtgggcta-gtccatacagaactttgctttgggtttaaatgggctccccacaagtggacggtgg 16247049  T
Q  200 gattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  16247048 gattggacccctcggatt 16247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Original strand, 16773865 - 16773910
Alignment:
Q  100 gaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  16773865 gaggtctcaggttcgattctctctgatgccaatttaggtgggctaa 16773910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Original strand, 40330628 - 40330725
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||   |||||||| |||| |||| || |||||| || |||| |||||    
T  40330628 acccatttgaggttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttgggc 40330725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10813994 - 10813922
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaac 175  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10813994 tctcaagtttgatcccctctggtgtcaatttttttgggctaagtccatacggagctttgctctggctttaaac 10813922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Original strand, 33025473 - 33025605
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||   || |||||  || |||||||  || |||| | |||| |||      
T  33025473 taacccatttggggttggcctcgcggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaactttgattccccttgatgccgatttcgatggat 33025572  T
Q  143 taagtccatacagagct-tgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33025573 taagtccatacaaagctatgctctggctttaaa 33025605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5285 - 5112
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5285 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 5186  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  5185 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggatt 5112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27528998 - 27528825
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27528998 aacccatctggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 27528899  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  27528898 aagtccatacagagcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggatt 27528825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40059055 - 40058882
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40059055 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 40058956  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  40058955 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 40058882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 52983613 - 52983786
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  52983613 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggct 52983712  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  52983713 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 52983786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34844961 - 34844788
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34844961 aacccatttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 34844862  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34844861 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 34844788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 215
Target Start/End: Original strand, 32986191 - 32986362
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32986191 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggct 32986290  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcgga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  32986291 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgga 32986362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54127545 - 54127372
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  54127545 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggct 54127446  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  54127445 aagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 54127372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 33992620 - 33992772
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33992620 aacccatttagggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 33992719  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33992720 aagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgg 33992772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33696483 - 33696309
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33696483 taacccatttagggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggc 33696384  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | |||||  || ||||||||    
T  33696383 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggatt 33696309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 46714386 - 46714560
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatt-ccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  46714386 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggc 46714485  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  46714486 taagtccatacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 46714560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 20566341 - 20566517
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtc-tcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20566341 ttaatccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20566440  T
Q  141 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||| ||||    
T  20566441 gcaaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagatt 20566517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 25852208 - 25852338
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25852208 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 25852307  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25852308 aagtccatacagagcttgctctggctttaaa 25852338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5609405 - 5609232
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5609405 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 5609306  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  5609305 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggatt 5609232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19660737 - 19660562
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  19660737 ttaacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtggg 19660638  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19660637 ataagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 19660562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35674944 - 35674792
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35674944 aacccatttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggct 35674845  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35674844 aagtccatacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcgg 35674792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20078163 - 20078028
Alignment:
Q  68 gttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 167  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20078163 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 20078064  T
Q  168 ctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||    
T  20078063 ctttaaacggggcccccgtaagtgggcggtgggatt 20078028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36131715 - 36131540
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  36131715 ttaacccatttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggc 36131616  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  36131615 ctaagtccatacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 36131540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18875721 - 18875547
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| | || || || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  18875721 ttaacccatttgtggttgacatagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtggg 18875622  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  | |||||||  |||||||||||    
T  18875621 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccc-acaagtgggtagtgggattgatcccctcggatt 18875547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45787902 - 45787738
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  45787902 catttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagt 45787804  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  45787803 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcg 45787738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288024
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  164 ctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
     ||||||||||||| | ||| |||||||||||  | |||||  |||||||||||    
T  49287972 atggctttaaacgggctccc-gcaagtgggcgctgagattggtcccctcggatt 49288024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 1985830 - 1985982
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  1985830 aacccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggct 1985929  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  1985930 aagtccatacagagtaaactctggctttaaacggagcccccacaagtgggcgg 1985982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22625273 - 22625153
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22625273 aacccatttgaggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggct 22625174  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctc 164  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22625173 aagtccatacagagcttgctc 22625153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 32942369 - 32942536
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32942369 atttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtc 32942468  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  32942469 catacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggat 32942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13873497 - 13873349
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13873497 acccatttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggcta 13873398  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtggg 193  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |  |||| |||||||||    
T  13873397 agttcatacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtggg 13873349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990600
Alignment:
Q  103 gtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggat 202  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  203 tgtacccctcgga 215  Q
    ||  |||||||||    
T  32990588 tggtcccctcgga 32990600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 35229172 - 35229331
Alignment:
Q  54 gggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatac 153  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  35229172 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatac 35229270  T
Q  154 agagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||  |||||| |||| |||||||  |||||||    
T  35229271 atagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcg 35229331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 44343505 - 44343677
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggtt-ggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  44343505 ttaacctatttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgg 44343604  T
Q  141 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  44343605 gctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 44343677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Original strand, 2351026 - 2351140
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||     
T  2351026 tagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacatagcttgt 2351125  T
Q  163 tctggctttaaacgg 177  Q
    || ||||||||||||    
T  2351126 tccggctttaaacgg 2351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500109
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 173  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  174 acggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||  |||| ||||||||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcgg 12500109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13584454 - 13584324
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  13584454 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 13584355  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13584354 tccatagagagcttgctctggctttaaacgg 13584324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723966
Alignment:
Q  99 agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  199 ggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||  || ||||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggatt 34723966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 51535611 - 51535784
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc----t 143  Q
    ||||| |||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    |    
T  51535611 catttagggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaatt 51535710  T
Q  144 aagtccatacagagctt---gctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  51535711 aagtccatacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 51535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391995
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  167 gctttaaa-cggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||  ||||||||    ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7392044 gctttaaatgggaccccc--atagtgggcggtgggattgttcccctcggatt 7391995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43719264 - 43719154
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||    
T  43719264 catttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagt 43719165  T
Q  148 ccatacagagc 158  Q
    |||||||||||    
T  43719164 ccatacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517671
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| || | |    
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  201 attgtacccctcggatt 217  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggatt 9517671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 34835527 - 34835675
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34835527 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 34835626  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaa-cggaccccctgcaagtgggcg 195  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  34835627 ccatacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggcg 34835675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20527236 - 20527119
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtgg---ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||| |||| ||||||||   |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20527236 ccatttggagttggcttagtggacgttggtttgagattttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggct 20527137  T
Q  144 aagtccatacagagcttg 161  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  20527136 aagtccatatagagcttg 20527119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21387639 - 21387536
Alignment:
Q  93 tcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgg 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  21387639 tcctccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgg 21387540  T
Q  193 gcgg 196  Q
    ||||    
T  21387539 gcgg 21387536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Original strand, 13550205 - 13550335
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  ||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13550205 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 13550304  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13550305 tccataccgagcttactctggctttaaacgg 13550335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55961939 - 55961797
Alignment:
Q  50 tttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtcc 149  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55961939 tttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-----------cctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 55961851  T
Q  150 atacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||    
T  55961850 atacagagcttgctctgactttaaacggggcccc-acaagtgggcggtgggattg 55961797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574485
Alignment:
Q  88 tttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgca 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  188 agtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||| | | |||  |||||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggatt 27574485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30879345 - 30879238
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  30879345 ggttggtttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctg 30879246  T
Q  167 gctttaaa 174  Q
    ||||||||    
T  30879245 gctttaaa 30879238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13771686 - 13771552
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  |||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  13771686 aacccatttggggttggtctgatggttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtgggct 13771587  T
Q  144 aagtccatacagagct-tgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  13771586 aagtccatacgaagctatgctctggctttaaacgg 13771552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25969700 - 25969545
Alignment:
Q  50 tttggggttgacttagtggttggtttggg-atattgaagtttgctcctccagaggtctcag--gttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||| || ||| ||||||||||||   ||||| |||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  25969700 tttggggttggcctactggttgatttggggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aag 25969602  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||    
T  25969601 tccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccc-gtaagtgagcggtgggattg 25969545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29875899 - 29875826
Alignment:
Q  123 tggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  29875899 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctgactttaaatggaacccccgcaagttggcgg 29875826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41621800 - 41621684
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  41621800 taacccatttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtgggc 41621701  T
Q  143 taagtccatacagagctt 160  Q
     || ||||||||||||||    
T  41621700 -aaatccatacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53787177 - 53787101
Alignment:
Q  128 ccaacttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  53787177 ccaatttcggtgggctaagtccatgcggagctatgctctggctttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggatt 53787101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22488142 - 22488071
Alignment:
Q  133 ttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||    
T  22488142 ttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattg 22488071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Original strand, 4911978 - 4912069
Alignment:
Q  106 tcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacaga----gcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4911978 tcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatatagagcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtggg 4912069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Original strand, 34722164 - 34722222
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagag 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34722164 aacctatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630280
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccataca 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccataca 22630280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 10125872 - 10125974
Alignment:
Q  102 ggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | |||    
T  10125872 ggtcttaggtttgattccccctggtgccaatttcagtgggc-aaggccatacagagctttgctctagctttaaacggggccc-tgcaagtgggcagtggg 10125969  T
Q  201 attgt 205  Q
    |||||    
T  10125970 attgt 10125974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 170
Target Start/End: Original strand, 12710192 - 12710299
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||||||| | |||||||||||| || |||    
T  12710192 tagtggttggtttgggatcttggagtatgcttctcttaaggtctcaggttcgattccctttaatgtcaatttcggtggac-aagtccatacagtgctttg 12710290  T
Q  162 ctctggctt 170  Q
    |||||||||    
T  12710291 ctctggctt 12710299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Original strand, 42245744 - 42245819
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctct 123  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  42245744 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattccctct 42245819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 12824464 - 12824554
Alignment:
Q  114 gattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    |||||||||| ||| ||| || | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  12824464 gattccctcttgtgtcaattttgatgggctaagttcatatagagtttgctctagctttaaatggagctcctgcaagtggacggtgggattg 12824554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 39288917 - 39288978
Alignment:
Q  108 aggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctt 170  Q
    |||||| |||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39288917 aggttcaattcccactgatgtcaatttcggtgggc-aagtccatacagagcttgctctggctt 39288978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Original strand, 38740901 - 38740940
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38740901 aggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg 38740940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Original strand, 40307533 - 40307631
Alignment:
Q  41 gttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||  || |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  40307533 gttaacccatttggaattgacctagtgtttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtctcatatttgatt-cctttggtgccaatttcggtgg 40307631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 37455628 - 37455700
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagag-cttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  37455628 aggtctcaggttcgattccc-ctggtgccaatttcaatgggctaa-tccatatagagatttgctctggctttaaa 37455700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 131
Target Start/End: Original strand, 38869827 - 38869857
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38869827 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaa 38869857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Original strand, 28635754 - 28635799
Alignment:
Q  100 gaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  28635754 gaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttgggtgggctaa 28635799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 28791166 - 28791242
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  28791166 aggtcttaggttccattacctctggtgtcaatttcggtggg-taagtctatacaaaactttgctctggctttaaacgg 28791242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7949471 - 7949427
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  7949471 aggtctcaggttcgattctctctggtgtcaatttaggtgggctaa 7949427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9693515 - 9693471
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  9693515 aggtctcaggttcgattccctctagtgtcaatttgggtgggctaa 9693471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 142
Target Start/End: Original strand, 13017745 - 13017821
Alignment:
Q  66 tggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||| |||| || ||||||| || |||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||    
T  13017745 tggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtctcaggttccattccctctgttgccaattttggtgggc 13017821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33827776 - 33827603
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33827776 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggct 33827677  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  33827676 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggatt 33827603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44946256 - 44946083
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44946256 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 44946157  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  44946156 aagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 44946083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11941417 - 11941240
Alignment:
Q  40 agttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtg 139  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  11941417 agttaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtg 11941318  T
Q  140 ggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11941317 ggttaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 11941240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Original strand, 17324764 - 17324918
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324764 catttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 17324863  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||    
T  17324864 ccatacagagcttgctctggctttaaatgggccccc-acaagtgggcggtgggatt 17324918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30467034 - 30466860
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  30467034 taacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggc 30466935  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| | |||||||  ||| |||||||    
T  30466934 taagtccatacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggatt 30466860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 15037953 - 15038126
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15037953 aacccatttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 15038052  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  15038053 aagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagatt 15038126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 24195997 - 24196169
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24195997 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggc 24196096  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  24196097 taagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggcccc--gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 24196169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Original strand, 41313984 - 41314119
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtggg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41313984 ttaacccatttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtggg 41314083  T
Q  142 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41314084 ctaagtctatacagagcttgctctgactttaaacgg 41314119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44976353 - 44976183
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44976353 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagt 44976254  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  44976253 ccatacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggatt 44976183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582043
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcg 195  Q
    ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  10582074 tctagctttaaacgggccctc-gcaagtgggcg 10582043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 27290601 - 27290729
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290601 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 27290700  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtg 191  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27290701 tctggctttaaacgggccccccgcaagtg 27290729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 217
Target Start/End: Original strand, 35171836 - 35171967
Alignment:
Q  86 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  35171836 agtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccg 35171935  T
Q  186 caagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  35171936 caagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 35171967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4567637 - 4567479
Alignment:
Q  47 ccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaag 146  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  4567637 ccatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaa 4567538  T
Q  147 tccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4567537 tccatacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgt 4567479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242342
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 36242342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36390769 - 36390611
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  36390769 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatctg--agtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggact 36390672  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  36390671 aagtccatacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattg 36390611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 196
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271530
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcgg 45271530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 19054021 - 19054193
Alignment:
Q  46 cccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  19054021 cccatttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaa 19054120  T
Q  146 gtccatacagagcttgctctggctttaaacgg-accccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  19054121 gtccatacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggatt 19054193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516444
Alignment:
Q  66 tggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 165  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  166 ggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34516494 cgctttaaacgg-gcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 34516444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191640
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  167 gctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||    
T  1191630 gctttaaacgg 1191640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 8258896 - 8259050
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  8258896 atttggggttgacataatggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtc 8258995  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||  |||| |||||| ||||| ||||||    
T  8258996 catacagatcttgttctggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggatt 8259050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374399
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  167 gctttaa 173  Q
    |||||||    
T  43374405 gctttaa 43374399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 204
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394171
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  167 gctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
     ||||||| ||  || | |||||||||||| |||||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattg 5394171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8192553 - 8192382
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  8192553 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtgggc-a 8192455  T
Q  145 agtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8192454 agtccatatagagctttgctctggcttagaacgg-cccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggatt 8192382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 41329842 - 41330009
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  41329842 atttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtc 41329941  T
Q  149 catacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| | |||||  |||||| ||||    
T  41329942 cata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagatt 41330009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 25293160 - 25293326
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25293160 aacccatttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 25293259  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||| ||||        ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  25293260 aagttcata--------gctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggatt 25293326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27269553 - 27269374
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgcc------aacttcgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||| |      || |||||    
T  27269553 aacccatttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcgg 27269454  T
Q  138 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27269453 tgggctaagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatt 27269374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2140634 - 2140516
Alignment:
Q  96 tccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaa-cggaccccctgcaagtgggc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  2140634 tccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggc 2140539  T
Q  195 ggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    || |||||||  |||||||||||    
T  2140538 ggtgggattggtcccctcggatt 2140516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Original strand, 32845085 - 32845194
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32845085 aacccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 32845184  T
Q  144 aagtccatac 153  Q
    ||||||||||    
T  32845185 aagtccatac 32845194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 918898 - 918782
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcg---attccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  918898 catttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgctcctct-gaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggcta 918800  T
Q  145 agtccatacagagcttgc 162  Q
    ||||||||||||||||||    
T  918799 agtccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266617
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  167 gctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||    
T  13266607 gctttaaacgg 13266617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18976628 - 18976524
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  18976628 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctct-gagccaatttcggtggact 18976530  T
Q  144 aagtcc 149  Q
    ||||||    
T  18976529 aagtcc 18976524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23787192 - 23787059
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    ||||||||||||||  || ||| | |||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23787192 tagtggttggtttgaaattttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagtttgc 23787093  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||| ||||||| ||  || | ||||||||||||    
T  23787092 tctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcgg 23787059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 3943791 - 3943907
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgggggg 200  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| || |||    
T  3943791 aggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggg 3943890  T
Q  201 attgtacccctcggatt 217  Q
    ||||  ||||| |||||    
T  3943891 attggtccccttggatt 3943907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19849979
Alignment:
Q  64 agtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 163  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||| ||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  164 ctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcgg 19849979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 14946774 - 14946913
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||   |||| | ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  14946774 acccatttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggcta 14946873  T
Q  145 agtccatacagagct-tgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14946874 agtccatacggagctatgctctagctttaaacggaccccc 14946913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40997534 - 40997415
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  40997534 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataagtcaatacagagcttgc 40997435  T
Q  163 tctggctttaaacggacccc 182  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  40997434 tctgactttaaacgggcccc 40997415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5608193 - 5608103
Alignment:
Q  88 tttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgga 178  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5608193 tttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatatagagcttgctctgactttaaacgga 5608103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669040
Alignment:
Q  123 tggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 28669040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Original strand, 4852551 - 4852636
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgc 128  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4852551 taactcatttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgc 4852636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32526290 - 32526211
Alignment:
Q  42 ttaacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccct 121  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  32526290 ttaacccatttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccct 32526211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 10324891 - 10324968
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctct 123  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  10324891 aacccatttggggttggcatagtggttggtttgggatattgaagtttg-tcgtcca-atgtctcaggttcgattccctct 10324968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28194337 - 28194223
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggtt-ggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28194337 aacccatttggggttggcgtagtgatttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 28194238  T
Q  143 taagtccatacagagc 158  Q
     |||||||||||||||    
T  28194237 -aagtccatacagagc 28194223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174929
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| | || ||||||| |||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacggagcccc-gtaaatgggcggtgggat 19174914  T
Q  203 tgtacccctcggatt 217  Q
    ||  |||||||||||    
T  19174915 tgatcccctcggatt 19174929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 29361573 - 29361715
Alignment:
Q  69 ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 168  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||    ||||||||||  ||||    
T  29361573 ttggattgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcagg-tcgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtc----cagagcttgccgtggc 29361667  T
Q  169 tttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||  | |||||||||    
T  29361668 tttaaacggagcccc-gcaagtgggcagtgggattgatctcctcggatt 29361715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6714485 - 6714380
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    || ||||||||||    
T  6714485 taacccatttgggattggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtgggc 6714386  T
Q  143 taagtc 148  Q
    ||||||    
T  6714385 taagtc 6714380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 714244 - 714176
Alignment:
Q  128 ccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  714244 ccaatttcggtgggctaagtccatagagagtttgctctgactttaaacggagcccccgcaaatgggcgg 714176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19606038 - 19605927
Alignment:
Q  54 gggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatac 153  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  19606038 gggttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtgggc-aagtccatac 19605940  T
Q  154 agag-cttgctct 165  Q
    |||| ||||||||    
T  19605939 agagtcttgctct 19605927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4618880 - 4618758
Alignment:
Q  52 tggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccat 151  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  4618880 tggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcggcgggc-aagtccat 4618782  T
Q  152 acagagc-ttgctctggctttaaa 174  Q
    ||| | | ||||||||||||||||    
T  4618781 acaaaactttgctctggctttaaa 4618758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13747702 - 13747578
Alignment:
Q  52 tggggttgacttagtggt--tggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtcc 149  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||  ||| ||| |||||||||  |||||||||||| || |||| | |||||| | ||||||||||| |||||    
T  13747702 tggggttggcttagtggtgttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtgggct-agtcc 13747604  T
Q  150 atacagagc-ttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||||    
T  13747603 atacagtgctttgctctggctttaaa 13747578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 35943741 - 35943851
Alignment:
Q  108 aggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgta 206  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  35943741 aggttcaatttcctcccgtgccaattttggtaggctaagtccatacagtgctatgatttggctttaaattgagcccctgcaagtggacggtgggattgga 35943840  T
Q  207 cccctcggatt 217  Q
    |||||||||||    
T  35943841 cccctcggatt 35943851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1845838 - 1845705
Alignment:
Q  66 tggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc---taagtccatacagagcttgc 162  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |  | |||| ||||||||  |||| || ||| |||| | |||   |||||||||||| | |||||    
T  1845838 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaaaatttcagattcgattcattctgatgtcaatttcgataggctaataagtccatacaaaacttgc 1845739  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1845738 tttggctttaaacgaagcccctgcaagtgggcgg 1845705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 19517030 - 19517069
Alignment:
Q  138 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19517030 tgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacgg 19517069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19525576 - 19525490
Alignment:
Q  67 ggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccataca 154  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || | |||   || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  19525576 ggttggcttgggatcttgaagtgtgtttctctcaagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccataca 19525490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 217
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610206
Alignment:
Q  150 atacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggatt 44610206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 177
Target Start/End: Original strand, 4769259 - 4769293
Alignment:
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769259 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 4769293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3405354 - 3405240
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||  ||||||| ||| | | ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |    
T  3405354 acccattttgagttgacctagtggttgacttgggatcttggaatgtgctcatctcaaggtcacaggttcgattccctctggtgccaattttaatgggc-a 3405256  T
Q  145 agtccatacagagctt 160  Q
    |||||||||| |||||    
T  3405255 agtccatacaaagctt 3405240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 18708490 - 18708644
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagc-ttg 161  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||| || |||||   ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||| | || |||||||||| |||    
T  18708490 tagtggttgaattgggatcttggagtgtgttcctctcaaggtctcaggttcgactccctctgataccaatttcagtgggc-atgttcatacagagctttg 18708588  T
Q  162 ctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||| ||| ||||||  |||| |||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||    
T  18708589 ctctgacttaaaacgggacccccgcaaatggacggtgggattgatcccctcagatt 18708644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Original strand, 19244168 - 19244212
Alignment:
Q  101 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  19244168 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttgagtgggctaa 19244212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 40319 - 40479
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40319 aacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 40418  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  40419 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattg 40479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 97569 - 97409
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97569 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 97470  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  97469 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattg 97409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1090
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1255 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 1156  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  1155 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcg 1090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9498 - 9333
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9498 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 9399  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  9398 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12199 - 12073
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12199 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 12100  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12099 ccatacagagcttgctctggctttaaa 12073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7512 - 7339
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7512 aacctatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggct 7413  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7412 aagtccatacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 7339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41848 - 41674
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||    
T  41848 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgc 41749  T
Q  143 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||  |||||||||||    
T  41748 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggatt 41674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 161828 - 161976
Alignment:
Q  69 ttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 168  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161828 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 161927  T
Q  169 tttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||| || ||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  161928 ttttaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 161976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 14985 - 15140
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |    
T  14985 aacccatttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggtt 15084  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggg 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  15085 aagtccatccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcggggg 15140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13077
Alignment:
Q  109 ggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  ||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgct---actttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcc 13086  T
Q  209 cctcggatt 217  Q
    |||| ||||    
T  13085 cctcagatt 13077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10892 - 10766
Alignment:
Q  48 catttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10892 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 10793  T
Q  148 ccatacagagcttgctctggctttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10792 ccatacagagcttgctctggctttaaa 10766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53073 - 52901
Alignment:
Q  45 acccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggcta 144  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  53073 acccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaa 52974  T
Q  145 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  52973 aatccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggatt 52901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39259
Alignment:
Q  89 ttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaa 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  189 gtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggatt 39259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 196
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20368
Alignment:
Q  74 ttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 173  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  174 acggaccccctgcaagtgggcgg 196  Q
    ||||  |||| ||||||||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcgg 20368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 66756 - 66921
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  66756 aacccatttgggattggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggct 66855  T
Q  144 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    |||||        |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  66856 aagtc--------gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 66921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 142 - 1
Alignment:
Q  63 tagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 162  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  142 tagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgc 43  T
Q  163 tctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattg 204  Q
    ||| |||||||||||  ||||  || |||||||| |||||||    
T  42 tctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8611 - 8512
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggc 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  8611 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32455
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggatt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||| || ||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  204 gtacccctcggatt 217  Q
    |  |||||||||||    
T  32442 ggtcccctcggatt 32455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8382 - 8286
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8382 aacccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27879
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggct 143  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||    
T  27770 aacccatttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggct 27869  T
Q  144 aagtccatac 153  Q
    ||||||||||    
T  27870 aagtccatac 27879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2456
Alignment:
Q  138 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggaccccctgcaagtgggcggggggattgtacccctcggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  2535 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 2456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29340 - 29206
Alignment:
Q  49 atttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtc 148  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| |||| || ||||||| || |||||   |||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||| || ||||||    
T  29340 atttgggattggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcgg-taagtc 29242  T
Q  149 catacagagc-ttgctctggctttaaacggaccccc 183  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  29241 catacagagctttgctctggcttaaaatggaccccc 29206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12958 - 12884
Alignment:
Q  43 taacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatt 117  Q
    ||||| ||||||| ||| | |||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12958 taacctatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26746 - 26650
Alignment:
Q  44 aacccatttggggttgacttagtggttggtttgggatattgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgg 140  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||| || |||| ||| ||||||||  || |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  26746 aacccatttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 123194 - 123146
Alignment:
Q  104 tctcaggttcgattccctctggtgccaacttcggtgggctaagtccatac 153  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  123194 tctcatgttcgattccctctgttgccaatttcggtgggc-aagtccatac 123146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University