View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3220_low_2 (Length: 530)

Name: NF3220_low_2
Description: NF3220
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3220_low_2
NF3220_low_2
[»] chr5 (114 HSPs)
chr5 (128-408)||(6739956-6740236)
chr5 (128-408)||(14717465-14717745)
chr5 (128-408)||(30297750-30298030)
chr5 (135-408)||(33760471-33760744)
chr5 (128-408)||(20408393-20408673)
chr5 (128-408)||(31710142-31710422)
chr5 (129-408)||(39824417-39824696)
chr5 (135-409)||(41282209-41282483)
chr5 (135-408)||(8215767-8216040)
chr5 (128-408)||(6600137-6600417)
chr5 (128-408)||(11000729-11001009)
chr5 (128-404)||(42993378-42993654)
chr5 (133-408)||(23128914-23129189)
chr5 (139-408)||(16095961-16096229)
chr5 (133-408)||(3352003-3352277)
chr5 (133-404)||(40074815-40075086)
chr5 (139-408)||(35342051-35342320)
chr5 (133-408)||(20079259-20079533)
chr5 (137-408)||(26593281-26593552)
chr5 (128-408)||(8689432-8689712)
chr5 (165-409)||(30863150-30863394)
chr5 (165-408)||(38964115-38964357)
chr5 (135-408)||(4015875-4016147)
chr5 (136-408)||(11692148-11692420)
chr5 (128-408)||(28078406-28078686)
chr5 (135-404)||(1052403-1052669)
chr5 (165-408)||(14952221-14952464)
chr5 (135-368)||(6331244-6331477)
chr5 (139-408)||(6251864-6252112)
chr5 (128-408)||(27116100-27116375)
chr5 (135-408)||(30208403-30208671)
chr5 (135-404)||(43166274-43166534)
chr5 (168-388)||(16752016-16752236)
chr5 (128-408)||(19398194-19398474)
chr5 (164-388)||(26035367-26035591)
chr5 (217-404)||(39002030-39002217)
chr5 (138-408)||(27509848-27510111)
chr5 (128-404)||(8694726-8695002)
chr5 (216-408)||(27457198-27457389)
chr5 (164-388)||(444850-445074)
chr5 (264-408)||(19659502-19659646)
chr5 (217-408)||(11935395-11935585)
chr5 (135-271)||(19661769-19661905)
chr5 (135-286)||(20517025-20517176)
chr5 (139-261)||(37923546-37923668)
chr5 (167-228)||(8689693-8689754)
chr5 (165-226)||(20079215-20079276)
chr5 (165-228)||(27457154-27457217)
chr5 (165-228)||(31710403-31710466)
chr5 (128-222)||(17002343-17002437)
chr5 (165-226)||(6252095-6252156)
chr5 (165-226)||(6600093-6600154)
chr5 (165-226)||(11000685-11000746)
chr5 (165-226)||(11935568-11935629)
chr5 (165-226)||(19659458-19659519)
chr5 (165-226)||(20408656-20408717)
chr5 (167-228)||(26593239-26593300)
chr5 (165-226)||(28078362-28078423)
chr5 (165-228)||(23128869-23128933)
chr5 (168-226)||(4015834-4015892)
chr5 (168-226)||(30297709-30297767)
chr5 (165-226)||(6739912-6739973)
chr5 (165-226)||(41282465-41282526)
chr5 (168-228)||(30863374-30863433)
chr5 (165-228)||(38964071-38964134)
chr5 (168-226)||(1052656-1052714)
chr5 (168-226)||(33760430-33760488)
chr5 (168-226)||(39824679-39824737)
chr5 (168-226)||(43166229-43166287)
chr5 (165-226)||(8216023-8216084)
chr5 (165-226)||(8694989-8695050)
chr5 (165-226)||(35342303-35342364)
chr5 (135-195)||(567722-567782)
chr5 (165-225)||(6332900-6332960)
chr5 (168-223)||(39401952-39402007)
chr5 (168-226)||(3351962-3352020)
chr5 (165-226)||(14717728-14717790)
chr5 (168-226)||(27116059-27116117)
chr5 (165-226)||(16095917-16095978)
chr5 (164-225)||(19398149-19398210)
chr5 (168-225)||(30208362-30208419)
chr5 (165-226)||(40075073-40075134)
chr5 (174-226)||(14952447-14952499)
chr5 (135-202)||(11935344-11935411)
chr5 (134-176)||(8695010-8695052)
chr5 (168-226)||(27510094-27510152)
chr5 (165-223)||(42993644-42993702)
chr5 (133-170)||(40075100-40075137)
chr5 (128-177)||(42262795-42262844)
chr5 (128-176)||(11000677-11000725)
chr5 (128-176)||(20408677-20408725)
chr5 (128-176)||(31710426-31710474)
chr5 (168-228)||(39001985-39002045)
chr5 (136-184)||(39125993-39126041)
chr5 (365-408)||(6332873-6332916)
chr5 (165-220)||(9919239-9919294)
chr5 (165-220)||(9919734-9919789)
chr5 (133-176)||(27457151-27457194)
chr5 (129-176)||(30208352-30208399)
chr5 (198-228)||(11692137-11692167)
chr5 (128-170)||(26035315-26035357)
chr5 (135-176)||(567712-567753)
chr5 (135-176)||(6252116-6252157)
chr5 (135-176)||(11935589-11935630)
chr5 (133-194)||(27457380-27457440)
chr5 (165-218)||(35155363-35155416)
chr5 (136-176)||(444851-444891)
chr5 (128-176)||(1052677-1052725)
chr5 (128-176)||(6739904-6739952)
chr5 (133-177)||(9919236-9919280)
chr5 (128-176)||(14952213-14952261)
chr5 (136-176)||(19398150-19398190)
chr5 (128-176)||(28078354-28078402)
chr5 (128-176)||(30863142-30863190)
[»] chr1 (150 HSPs)
chr1 (128-408)||(38473627-38473907)
chr1 (135-408)||(23767415-23767688)
chr1 (128-408)||(23228195-23228475)
chr1 (139-408)||(49094712-49094981)
chr1 (135-409)||(19274426-19274700)
chr1 (135-408)||(19315507-19315780)
chr1 (128-408)||(36157679-36157958)
chr1 (136-408)||(7608767-7609039)
chr1 (133-408)||(49814165-49814440)
chr1 (135-408)||(25988272-25988546)
chr1 (168-408)||(28425364-28425604)
chr1 (139-408)||(26069763-26070032)
chr1 (128-409)||(50533243-50533524)
chr1 (136-408)||(5400739-5401010)
chr1 (135-408)||(46095076-46095349)
chr1 (165-408)||(43396572-43396815)
chr1 (139-408)||(7553017-7553286)
chr1 (135-408)||(26549255-26549528)
chr1 (135-408)||(46825396-46825671)
chr1 (129-407)||(41982237-41982516)
chr1 (135-408)||(33673884-33674157)
chr1 (135-408)||(41105883-41106156)
chr1 (167-408)||(7651559-7651802)
chr1 (138-406)||(24204474-24204741)
chr1 (165-408)||(46051347-46051590)
chr1 (165-408)||(52146890-52147133)
chr1 (167-408)||(12142964-12143212)
chr1 (128-389)||(9974702-9974963)
chr1 (135-408)||(37216763-37217036)
chr1 (168-408)||(45670487-45670727)
chr1 (128-408)||(52067652-52067935)
chr1 (168-408)||(18892229-18892469)
chr1 (165-408)||(33325624-33325867)
chr1 (165-408)||(36781173-36781416)
chr1 (139-408)||(45350718-45350985)
chr1 (157-408)||(48669397-48669648)
chr1 (139-408)||(8141487-8141756)
chr1 (128-408)||(18782090-18782370)
chr1 (136-408)||(18917393-18917664)
chr1 (135-408)||(52349925-52350198)
chr1 (164-408)||(9878785-9879029)
chr1 (133-368)||(12964511-12964746)
chr1 (165-408)||(50689841-50690083)
chr1 (139-408)||(48802332-48802593)
chr1 (170-408)||(6711342-6711580)
chr1 (170-408)||(34970982-34971220)
chr1 (168-408)||(16705770-16706010)
chr1 (165-388)||(33194672-33194895)
chr1 (167-388)||(48319067-48319288)
chr1 (138-408)||(21929391-21929666)
chr1 (165-408)||(40721248-40721483)
chr1 (128-346)||(50099080-50099298)
chr1 (167-408)||(9962659-9962891)
chr1 (168-408)||(21964965-21965205)
chr1 (139-408)||(25800514-25800781)
chr1 (168-408)||(33714362-33714600)
chr1 (168-388)||(30281531-30281751)
chr1 (128-312)||(32373650-32373833)
chr1 (166-316)||(44979281-44979431)
chr1 (232-388)||(16506809-16506965)
chr1 (249-408)||(17983899-17984058)
chr1 (135-312)||(17989864-17990041)
chr1 (128-298)||(49973802-49973972)
chr1 (308-408)||(44978769-44978868)
chr1 (164-226)||(49094667-49094729)
chr1 (165-226)||(36157635-36157696)
chr1 (165-226)||(37217019-37217080)
chr1 (165-228)||(7651783-7651846)
chr1 (165-228)||(19315761-19315824)
chr1 (165-228)||(50690064-50690127)
chr1 (164-226)||(21965188-21965250)
chr1 (165-227)||(44978725-44978787)
chr1 (165-226)||(25800764-25800825)
chr1 (165-226)||(28425320-28425381)
chr1 (165-226)||(33325850-33325911)
chr1 (165-226)||(36781129-36781190)
chr1 (165-226)||(46051573-46051634)
chr1 (165-226)||(46825654-46825715)
chr1 (165-226)||(48802288-48802349)
chr1 (167-226)||(12143195-12143254)
chr1 (167-226)||(38473585-38473644)
chr1 (164-226)||(40721466-40721528)
chr1 (165-223)||(43396801-43396859)
chr1 (165-226)||(5400993-5401054)
chr1 (165-226)||(25988228-25988289)
chr1 (165-226)||(26549511-26549572)
chr1 (165-226)||(45670443-45670504)
chr1 (168-228)||(7552976-7553036)
chr1 (165-225)||(9962875-9962935)
chr1 (165-225)||(21929650-21929710)
chr1 (164-228)||(49814421-49814485)
chr1 (168-228)||(52067611-52067671)
chr1 (165-228)||(6711561-6711624)
chr1 (165-228)||(23767372-23767434)
chr1 (167-226)||(24204430-24204489)
chr1 (165-228)||(26070013-26070076)
chr1 (167-226)||(33674140-33674199)
chr1 (165-223)||(45350674-45350732)
chr1 (165-226)||(16705993-16706054)
chr1 (167-228)||(18782048-18782109)
chr1 (169-226)||(19274682-19274739)
chr1 (168-225)||(23228154-23228211)
chr1 (165-226)||(46095032-46095093)
chr1 (168-228)||(9878744-9878804)
chr1 (165-221)||(22351082-22351138)
chr1 (167-226)||(7608725-7608784)
chr1 (167-226)||(18892452-18892511)
chr1 (165-228)||(18917645-18917708)
chr1 (165-228)||(52147114-52147177)
chr1 (168-226)||(12964755-12964813)
chr1 (165-221)||(16505194-16505250)
chr1 (168-228)||(41982195-41982255)
chr1 (135-210)||(24036628-24036703)
chr1 (128-170)||(6711590-6711632)
chr1 (128-177)||(40721240-40721289)
chr1 (165-221)||(16508117-16508172)
chr1 (128-176)||(33325616-33325664)
chr1 (128-176)||(33325871-33325919)
chr1 (171-226)||(8141450-8141504)
chr1 (168-223)||(33714321-33714376)
chr1 (133-176)||(36781126-36781169)
chr1 (138-176)||(7651559-7651597)
chr1 (168-226)||(17983858-17983916)
chr1 (168-218)||(49595162-49595212)
chr1 (165-211)||(49973972-49974018)
chr1 (180-226)||(50533506-50533552)
chr1 (128-170)||(52147143-52147185)
chr1 (133-170)||(21929676-21929713)
chr1 (135-176)||(25800539-25800580)
chr1 (135-176)||(26069788-26069829)
chr1 (135-176)||(26070036-26070077)
chr1 (135-176)||(26549532-26549573)
chr1 (135-176)||(43396819-43396860)
chr1 (165-218)||(49594919-49594972)
chr1 (135-176)||(50690087-50690128)
chr1 (139-176)||(52067611-52067648)
chr1 (128-176)||(5401014-5401062)
chr1 (163-195)||(7609009-7609041)
chr1 (128-176)||(9962895-9962943)
chr1 (128-176)||(18917668-18917716)
chr1 (128-176)||(19315529-19315577)
chr1 (128-176)||(19315784-19315832)
chr1 (128-176)||(36157627-36157675)
chr1 (128-176)||(38473575-38473623)
chr1 (136-176)||(40721487-40721527)
chr1 (198-226)||(41106139-41106167)
chr1 (128-176)||(44978717-44978765)
chr1 (128-176)||(46051594-46051642)
chr1 (186-226)||(48669374-48669414)
chr1 (198-226)||(52349914-52349942)
[»] chr2 (113 HSPs)
chr2 (128-402)||(3430631-3430905)
chr2 (135-408)||(16246194-16246467)
chr2 (128-408)||(1106560-1106840)
chr2 (135-408)||(920889-921162)
chr2 (135-404)||(2455877-2456146)
chr2 (135-408)||(9276441-9276714)
chr2 (128-408)||(17484551-17484831)
chr2 (135-409)||(36444228-36444502)
chr2 (133-409)||(36210911-36211187)
chr2 (135-408)||(27328454-27328724)
chr2 (139-408)||(7378834-7379103)
chr2 (135-408)||(19180289-19180561)
chr2 (136-404)||(29737616-29737884)
chr2 (133-408)||(38750913-38751188)
chr2 (165-403)||(771981-772219)
chr2 (128-408)||(2056787-2057066)
chr2 (139-408)||(12759751-12760019)
chr2 (128-409)||(17134089-17134370)
chr2 (135-408)||(28650427-28650702)
chr2 (128-408)||(33865268-33865548)
chr2 (128-408)||(8899542-8899821)
chr2 (168-408)||(40854509-40854749)
chr2 (135-408)||(11949427-11949703)
chr2 (135-408)||(33106970-33107243)
chr2 (165-388)||(8396572-8396795)
chr2 (139-408)||(7297235-7297502)
chr2 (167-408)||(34253041-34253282)
chr2 (128-408)||(41500503-41500774)
chr2 (167-404)||(25087801-25088038)
chr2 (168-408)||(37732194-37732434)
chr2 (165-408)||(43249413-43249656)
chr2 (165-408)||(42629853-42630102)
chr2 (168-408)||(2094411-2094651)
chr2 (138-404)||(2314980-2315246)
chr2 (135-368)||(41178060-41178293)
chr2 (165-408)||(45124016-45124259)
chr2 (136-408)||(37838148-37838437)
chr2 (168-384)||(37654008-37654224)
chr2 (165-388)||(19916008-19916230)
chr2 (135-324)||(23672958-23673147)
chr2 (269-408)||(9331757-9331896)
chr2 (317-408)||(14630663-14630754)
chr2 (319-408)||(23671812-23671901)
chr2 (165-226)||(2094367-2094428)
chr2 (165-226)||(9276697-9276758)
chr2 (135-208)||(9331632-9331705)
chr2 (165-226)||(9331879-9331940)
chr2 (165-226)||(12759707-12759768)
chr2 (165-226)||(16246150-16246211)
chr2 (165-226)||(17484507-17484568)
chr2 (165-226)||(19180544-19180605)
chr2 (165-226)||(27328707-27328768)
chr2 (165-226)||(41177992-41178053)
chr2 (165-226)||(42630085-42630146)
chr2 (165-228)||(7297191-7297254)
chr2 (168-226)||(37732153-37732211)
chr2 (165-226)||(2456133-2456194)
chr2 (167-228)||(7379084-7379145)
chr2 (167-228)||(28216923-28216984)
chr2 (165-226)||(28650383-28650444)
chr2 (165-226)||(33106926-33106987)
chr2 (165-226)||(36444185-36444246)
chr2 (165-226)||(37838420-37838481)
chr2 (165-226)||(41500459-41500520)
chr2 (164-228)||(14630735-14630799)
chr2 (133-237)||(19511487-19511591)
chr2 (168-226)||(2057049-2057107)
chr2 (168-226)||(11949386-11949444)
chr2 (165-226)||(771933-771993)
chr2 (165-226)||(40854732-40854793)
chr2 (165-216)||(3358107-3358158)
chr2 (165-228)||(8899803-8899865)
chr2 (168-226)||(921145-921203)
chr2 (172-226)||(25087760-25087814)
chr2 (168-226)||(34253265-34253323)
chr2 (168-226)||(38751171-38751229)
chr2 (168-226)||(43249372-43249430)
chr2 (165-223)||(45124245-45124303)
chr2 (165-226)||(1106516-1106577)
chr2 (165-226)||(2314932-2314993)
chr2 (135-176)||(29737644-29737685)
chr2 (128-176)||(2315179-2315227)
chr2 (138-220)||(3358147-3358228)
chr2 (168-226)||(23671772-23671829)
chr2 (135-176)||(28650382-28650423)
chr2 (165-226)||(29737871-29737932)
chr2 (128-176)||(772179-772227)
chr2 (170-226)||(17134352-17134407)
chr2 (128-176)||(27328476-27328524)
chr2 (128-176)||(27328728-27328776)
chr2 (128-176)||(29737892-29737940)
chr2 (186-226)||(33865245-33865285)
chr2 (128-176)||(37654237-37654285)
chr2 (130-176)||(2094361-2094407)
chr2 (366-404)||(28216969-28217007)
chr2 (138-176)||(34253041-34253079)
chr2 (165-226)||(36211169-36211231)
chr2 (135-176)||(2456154-2456195)
chr2 (135-176)||(7297436-7297477)
chr2 (135-176)||(12759706-12759747)
chr2 (135-176)||(12759953-12759994)
chr2 (133-170)||(19915961-19915998)
chr2 (135-176)||(33106925-33106966)
chr2 (135-176)||(36444184-36444225)
chr2 (128-169)||(41500451-41500492)
chr2 (135-176)||(45124015-45124056)
chr2 (135-176)||(45124263-45124304)
chr2 (128-176)||(771925-771973)
chr2 (134-170)||(7297189-7297225)
chr2 (128-176)||(17484499-17484547)
chr2 (165-205)||(37654237-37654277)
chr2 (128-176)||(42629845-42629893)
chr2 (128-176)||(42630106-42630154)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (128-408)||(12626496-12626776)
chr6 (135-409)||(6503585-6503859)
chr6 (133-408)||(29050137-29050412)
chr6 (128-408)||(3258808-3259088)
chr6 (157-408)||(3408078-3408329)
chr6 (135-404)||(1915348-1915617)
chr6 (135-408)||(26393010-26393283)
chr6 (128-408)||(30378877-30379157)
chr6 (128-408)||(17942898-17943176)
chr6 (128-408)||(6785102-6785379)
chr6 (135-408)||(8178250-8178524)
chr6 (168-408)||(17428273-17428513)
chr6 (165-408)||(2707356-2707599)
chr6 (133-408)||(10256102-10256377)
chr6 (133-408)||(26230933-26231208)
chr6 (167-408)||(9382416-9382659)
chr6 (136-408)||(16193177-16193450)
chr6 (164-388)||(26936503-26936727)
chr6 (165-408)||(2390162-2390405)
chr6 (128-408)||(1077094-1077377)
chr6 (136-408)||(11133741-11134014)
chr6 (138-408)||(26196322-26196592)
chr6 (135-389)||(35223919-35224165)
chr6 (165-408)||(10931149-10931395)
chr6 (220-408)||(2598100-2598290)
chr6 (139-408)||(25820550-25820819)
chr6 (165-284)||(17515004-17515123)
chr6 (322-408)||(31375971-31376057)
chr6 (351-408)||(12612972-12613029)
chr6 (165-226)||(17943159-17943220)
chr6 (164-226)||(31376040-31376102)
chr6 (165-226)||(2707582-2707643)
chr6 (165-226)||(10256360-10256421)
chr6 (165-226)||(12626759-12626820)
chr6 (165-226)||(29050395-29050456)
chr6 (165-225)||(3258764-3258824)
chr6 (136-204)||(12613026-12613094)
chr6 (165-225)||(16193434-16193494)
chr6 (165-228)||(3408310-3408373)
chr6 (330-408)||(12612849-12612927)
chr6 (168-226)||(30379140-30379198)
chr6 (165-226)||(6503841-6503902)
chr6 (165-226)||(6785058-6785119)
chr6 (165-226)||(9382642-9382703)
chr6 (165-226)||(12612805-12612866)
chr6 (165-226)||(12612928-12612989)
chr6 (168-228)||(1077358-1077418)
chr6 (167-226)||(2390388-2390447)
chr6 (167-226)||(26230891-26230950)
chr6 (165-223)||(25820506-25820564)
chr6 (165-226)||(1915300-1915361)
chr6 (167-228)||(2598058-2598119)
chr6 (165-222)||(8178206-8178263)
chr6 (165-226)||(17428229-17428290)
chr6 (168-226)||(11133997-11134055)
chr6 (168-226)||(26196281-26196339)
chr6 (165-220)||(26392966-26393021)
chr6 (165-226)||(10931105-10931166)
chr6 (128-176)||(16193454-16193502)
chr6 (135-191)||(26196568-26196624)
chr6 (133-176)||(10931355-10931398)
chr6 (133-176)||(12612802-12612845)
chr6 (135-176)||(2707603-2707644)
chr6 (135-176)||(6503862-6503903)
chr6 (128-176)||(12626780-12626828)
chr6 (128-176)||(29050416-29050464)
chr6 (136-176)||(31376061-31376101)
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (128-408)||(20813442-20813722)
chr3 (135-408)||(50287433-50287706)
chr3 (128-404)||(19664401-19664677)
chr3 (138-408)||(38446347-38446616)
chr3 (135-403)||(22851863-22852131)
chr3 (128-404)||(36314977-36315253)
chr3 (138-408)||(31122532-31122802)
chr3 (128-408)||(20760072-20760352)
chr3 (128-408)||(20913755-20914035)
chr3 (128-408)||(20921873-20922153)
chr3 (128-408)||(21656378-21656658)
chr3 (128-408)||(51562022-51562302)
chr3 (128-408)||(32650821-32651101)
chr3 (165-408)||(1016941-1017184)
chr3 (133-408)||(20086315-20086590)
chr3 (133-408)||(37247821-37248096)
chr3 (129-408)||(45380261-45380540)
chr3 (128-408)||(47329176-47329455)
chr3 (147-408)||(26455461-26455722)
chr3 (168-408)||(1687551-1687791)
chr3 (128-408)||(3697006-3697286)
chr3 (128-408)||(53195874-53196154)
chr3 (128-404)||(55164120-55164396)
chr3 (133-408)||(21890036-21890310)
chr3 (167-408)||(21564395-21564636)
chr3 (128-408)||(35346472-35346745)
chr3 (139-408)||(48651119-48651388)
chr3 (128-408)||(19268381-19268667)
chr3 (135-408)||(27070740-27071013)
chr3 (167-408)||(42016772-42017013)
chr3 (157-408)||(1448736-1448984)
chr3 (139-408)||(40922166-40922435)
chr3 (166-401)||(12748289-12748524)
chr3 (168-404)||(41250786-41251022)
chr3 (165-408)||(10618481-10618724)
chr3 (165-408)||(39069624-39069866)
chr3 (167-408)||(42107100-42107341)
chr3 (165-408)||(35608132-35608374)
chr3 (145-408)||(33473240-33473503)
chr3 (165-388)||(50977761-50977984)
chr3 (165-388)||(51080893-51081116)
chr3 (164-388)||(50364908-50365132)
chr3 (168-408)||(53925980-53926220)
chr3 (136-408)||(52821050-52821334)
chr3 (135-345)||(44152567-44152777)
chr3 (165-388)||(51475267-51475492)
chr3 (167-408)||(44798166-44798407)
chr3 (165-381)||(28699582-28699798)
chr3 (253-408)||(33151681-33151836)
chr3 (216-408)||(29677424-29677616)
chr3 (217-388)||(34019409-34019580)
chr3 (165-332)||(47473127-47473294)
chr3 (250-404)||(38924003-38924157)
chr3 (135-226)||(33151819-33151910)
chr3 (167-266)||(42641295-42641394)
chr3 (164-226)||(31122785-31122847)
chr3 (294-388)||(42641199-42641293)
chr3 (165-226)||(21564619-21564680)
chr3 (165-228)||(35346428-35346491)
chr3 (165-226)||(1017167-1017228)
chr3 (165-226)||(21656641-21656702)
chr3 (165-226)||(27070696-27070757)
chr3 (165-226)||(42107056-42107117)
chr3 (164-225)||(45380216-45380277)
chr3 (165-226)||(50287689-50287750)
chr3 (165-228)||(20760028-20760091)
chr3 (165-228)||(20813398-20813461)
chr3 (165-228)||(26455703-26455766)
chr3 (168-226)||(38923958-38924016)
chr3 (168-226)||(40922125-40922183)
chr3 (165-226)||(19268650-19268711)
chr3 (165-226)||(20086271-20086332)
chr3 (165-226)||(21890293-21890354)
chr3 (165-226)||(37248079-37248140)
chr3 (168-219)||(28775436-28775487)
chr3 (165-228)||(39069847-39069910)
chr3 (165-228)||(47329132-47329195)
chr3 (165-228)||(55164072-55164135)
chr3 (168-226)||(48651371-48651429)
chr3 (165-226)||(1687774-1687835)
chr3 (168-225)||(20913714-20913771)
chr3 (168-225)||(20921832-20921889)
chr3 (165-222)||(29677603-29677660)
chr3 (168-225)||(33473199-33473256)
chr3 (167-228)||(44152794-44152855)
chr3 (165-226)||(52821006-52821067)
chr3 (165-226)||(53196137-53196197)
chr3 (168-228)||(53925939-53925999)
chr3 (167-226)||(44798390-44798449)
chr3 (164-226)||(1448691-1448753)
chr3 (164-226)||(3697269-3697331)
chr3 (168-226)||(10618440-10618498)
chr3 (168-226)||(35608091-35608149)
chr3 (134-176)||(39069870-39069912)
chr3 (165-226)||(41251009-41251070)
chr3 (167-228)||(42016994-42017055)
chr3 (165-225)||(32650777-32650837)
chr3 (165-225)||(51562286-51562346)
chr3 (165-228)||(38446597-38446660)
chr3 (135-176)||(20760027-20760068)
chr3 (133-176)||(50977758-50977801)
chr3 (164-203)||(50977990-50978029)
chr3 (133-176)||(51080890-51080933)
chr3 (164-203)||(51081122-51081161)
chr3 (128-170)||(51475215-51475257)
chr3 (163-205)||(52821294-52821336)
chr3 (165-218)||(19228937-19228990)
chr3 (165-226)||(19664664-19664724)
chr3 (135-176)||(26455478-26455519)
chr3 (135-176)||(27070695-27070736)
chr3 (135-176)||(39069623-39069664)
chr3 (133-170)||(47329129-47329166)
chr3 (128-176)||(12748280-12748328)
chr3 (128-176)||(20086263-20086311)
chr3 (128-176)||(20913703-20913751)
chr3 (128-176)||(20921821-20921869)
chr3 (128-176)||(21656662-21656710)
chr3 (128-176)||(21890314-21890362)
chr3 (136-176)||(50365091-50365131)
[»] chr7 (117 HSPs)
chr7 (128-408)||(47281125-47281407)
chr7 (135-409)||(44544276-44544550)
chr7 (128-408)||(30798369-30798649)
chr7 (138-408)||(47271851-47272121)
chr7 (137-409)||(47219014-47219286)
chr7 (135-408)||(1469494-1469767)
chr7 (135-408)||(48628672-48628945)
chr7 (128-408)||(27364340-27364620)
chr7 (133-408)||(11476557-11476832)
chr7 (133-408)||(35600123-35600398)
chr7 (128-408)||(11050262-11050542)
chr7 (165-408)||(30876156-30876399)
chr7 (165-408)||(31684135-31684378)
chr7 (130-408)||(38427564-38427841)
chr7 (128-408)||(7335920-7336199)
chr7 (128-404)||(8162717-8162993)
chr7 (128-408)||(37393999-37394278)
chr7 (165-408)||(23842202-23842445)
chr7 (138-408)||(45723492-45723762)
chr7 (135-408)||(42979339-42979612)
chr7 (145-404)||(4923093-4923352)
chr7 (136-408)||(41139409-41139685)
chr7 (165-408)||(47294292-47294535)
chr7 (135-408)||(43968260-43968533)
chr7 (128-408)||(18353004-18353284)
chr7 (168-408)||(30971942-30972182)
chr7 (135-408)||(43752777-43753050)
chr7 (165-408)||(29248239-29248482)
chr7 (165-408)||(47119888-47120133)
chr7 (165-409)||(33884222-33884460)
chr7 (128-404)||(44800415-44800691)
chr7 (165-408)||(40851180-40851414)
chr7 (135-408)||(221163-221415)
chr7 (165-404)||(47579091-47579331)
chr7 (168-388)||(37354284-37354501)
chr7 (249-408)||(41113358-41113517)
chr7 (167-388)||(3797544-3797755)
chr7 (128-361)||(40520776-40521011)
chr7 (135-328)||(39033928-39034122)
chr7 (281-408)||(2960641-2960768)
chr7 (232-388)||(27774072-27774228)
chr7 (139-311)||(43024983-43025155)
chr7 (165-294)||(42888772-42888901)
chr7 (165-293)||(45233574-45233702)
chr7 (196-317)||(29739709-29739829)
chr7 (133-226)||(2960768-2960861)
chr7 (165-270)||(44550938-44551043)
chr7 (164-226)||(47120116-47120178)
chr7 (165-226)||(2960597-2960658)
chr7 (168-226)||(38427523-38427581)
chr7 (165-226)||(11476513-11476574)
chr7 (165-226)||(31684091-31684152)
chr7 (165-226)||(37393955-37394016)
chr7 (165-226)||(41113500-41113561)
chr7 (165-226)||(43752733-43752794)
chr7 (165-226)||(47219268-47219329)
chr7 (165-226)||(47294248-47294309)
chr7 (165-226)||(48628928-48628989)
chr7 (165-225)||(30876383-30876443)
chr7 (356-408)||(42888937-42888989)
chr7 (165-228)||(35600079-35600142)
chr7 (168-226)||(23842428-23842486)
chr7 (128-206)||(31793822-31793900)
chr7 (165-226)||(1469450-1469511)
chr7 (165-226)||(11050218-11050279)
chr7 (165-226)||(42888972-42889033)
chr7 (167-228)||(45723450-45723511)
chr7 (167-226)||(8162671-8162730)
chr7 (167-226)||(41139368-41139426)
chr7 (168-226)||(43968219-43968277)
chr7 (164-226)||(47281080-47281142)
chr7 (165-226)||(221398-221459)
chr7 (165-222)||(5106168-5106225)
chr7 (165-226)||(44544532-44544593)
chr7 (165-226)||(47579044-47579104)
chr7 (167-223)||(30798327-30798383)
chr7 (136-184)||(39241836-39241884)
chr7 (217-312)||(29739619-29739713)
chr7 (167-242)||(41107269-41107344)
chr7 (167-226)||(18353267-18353328)
chr7 (135-201)||(29739568-29739634)
chr7 (165-226)||(40851397-40851458)
chr7 (198-235)||(42888900-42888937)
chr7 (128-176)||(5106185-5106233)
chr7 (353-408)||(5106127-5106181)
chr7 (165-215)||(25801523-25801573)
chr7 (186-228)||(30971919-30971961)
chr7 (168-226)||(44800370-44800428)
chr7 (168-226)||(47272104-47272162)
chr7 (165-222)||(7336186-7336243)
chr7 (165-222)||(27364296-27364353)
chr7 (135-176)||(34378564-34378605)
chr7 (165-221)||(27773033-27773089)
chr7 (159-207)||(43025162-43025210)
chr7 (280-319)||(12583313-12583352)
chr7 (133-176)||(30876153-30876196)
chr7 (129-176)||(43752726-43752773)
chr7 (134-176)||(29248237-29248279)
chr7 (165-215)||(34378565-34378615)
chr7 (168-226)||(42979299-42979356)
chr7 (134-176)||(44544304-44544346)
chr7 (167-220)||(27692011-27692064)
chr7 (167-228)||(33884440-33884501)
chr7 (135-176)||(40851179-40851220)
chr7 (135-176)||(45233662-45233703)
chr7 (135-176)||(48628949-48628990)
chr7 (128-176)||(11050210-11050258)
chr7 (128-176)||(11476505-11476553)
chr7 (128-176)||(30876403-30876451)
chr7 (128-176)||(31684083-31684131)
chr7 (128-176)||(31684338-31684386)
chr7 (128-176)||(35600071-35600119)
chr7 (128-176)||(37393947-37393995)
chr7 (128-176)||(41113521-41113569)
chr7 (136-176)||(43025168-43025208)
chr7 (128-176)||(43968463-43968511)
chr7 (128-176)||(47119880-47119928)
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (135-408)||(33807781-33808054)
chr4 (128-408)||(8882014-8882294)
chr4 (134-408)||(42273666-42273942)
chr4 (135-408)||(17847097-17847369)
chr4 (128-408)||(11795155-11795435)
chr4 (128-408)||(28812288-28812567)
chr4 (129-408)||(39995168-39995447)
chr4 (138-408)||(35929910-35930179)
chr4 (135-408)||(31590944-31591215)
chr4 (128-409)||(32118574-32118855)
chr4 (167-408)||(28264542-28264783)
chr4 (168-408)||(40988533-40988773)
chr4 (128-408)||(50542355-50542635)
chr4 (165-408)||(4544986-4545229)
chr4 (165-408)||(26017320-26017563)
chr4 (157-408)||(28159954-28160205)
chr4 (135-408)||(12196345-12196609)
chr4 (128-408)||(14564656-14564936)
chr4 (135-408)||(31208615-31208884)
chr4 (165-408)||(48707734-48707977)
chr4 (139-409)||(37381717-37381987)
chr4 (139-408)||(48149370-48149639)
chr4 (165-409)||(33174020-33174264)
chr4 (133-407)||(10588446-10588719)
chr4 (128-408)||(9339124-9339407)
chr4 (168-408)||(24458632-24458872)
chr4 (165-408)||(23135007-23135250)
chr4 (165-408)||(49118508-49118751)
chr4 (128-408)||(2055145-2055418)
chr4 (139-408)||(25734224-25734493)
chr4 (136-408)||(25730108-25730380)
chr4 (135-408)||(17993018-17993291)
chr4 (128-408)||(33693334-33693615)
chr4 (145-408)||(15984887-15985150)
chr4 (133-408)||(23552927-23553204)
chr4 (168-388)||(19168816-19169036)
chr4 (164-408)||(30467004-30467252)
chr4 (135-408)||(50276139-50276409)
chr4 (205-408)||(55517186-55517389)
chr4 (136-408)||(22298387-22298658)
chr4 (181-408)||(44490232-44490459)
chr4 (198-408)||(51371048-51371258)
chr4 (134-404)||(19496107-19496391)
chr4 (165-388)||(24623045-24623268)
chr4 (210-408)||(31973533-31973731)
chr4 (216-408)||(5227338-5227530)
chr4 (139-408)||(32317818-32318093)
chr4 (165-408)||(39699942-39700185)
chr4 (168-388)||(42549643-42549862)
chr4 (128-346)||(56555203-56555424)
chr4 (165-408)||(30141109-30141350)
chr4 (165-408)||(48551765-48551990)
chr4 (135-290)||(44490077-44490232)
chr4 (128-226)||(20534288-20534386)
chr4 (135-233)||(19496321-19496419)
chr4 (328-408)||(20534225-20534305)
chr4 (138-231)||(31617613-31617706)
chr4 (165-228)||(48551721-48551784)
chr4 (133-225)||(51371262-51371352)
chr4 (167-226)||(5227513-5227572)
chr4 (165-228)||(11795111-11795174)
chr4 (165-228)||(15985131-15985194)
chr4 (165-228)||(25730361-25730424)
chr4 (164-226)||(28812243-28812305)
chr4 (165-226)||(8881970-8882031)
chr4 (165-226)||(28264766-28264827)
chr4 (165-226)||(31591198-31591259)
chr4 (165-226)||(44490442-44490503)
chr4 (165-226)||(49118734-49118795)
chr4 (165-225)||(30466960-30467020)
chr4 (165-224)||(22298643-22298702)
chr4 (167-226)||(33807739-33807798)
chr4 (167-226)||(48149622-48149681)
chr4 (165-228)||(55517142-55517205)
chr4 (165-226)||(17847053-17847114)
chr4 (165-226)||(26017546-26017607)
chr4 (164-225)||(31973715-31973776)
chr4 (165-226)||(42273925-42273986)
chr4 (165-226)||(50276095-50276156)
chr4 (165-225)||(39995124-39995184)
chr4 (165-228)||(9339080-9339143)
chr4 (128-195)||(17847338-17847405)
chr4 (165-228)||(23553185-23553248)
chr4 (167-226)||(33452368-33452427)
chr4 (164-226)||(23134962-23135024)
chr4 (165-223)||(50542311-50542369)
chr4 (139-220)||(1425269-1425350)
chr4 (165-226)||(4544942-4545003)
chr4 (165-226)||(12196592-12196653)
chr4 (164-225)||(32118838-32118899)
chr4 (167-226)||(14564919-14564978)
chr4 (164-226)||(19496058-19496120)
chr4 (172-226)||(24458595-24458649)
chr4 (168-226)||(31208867-31208925)
chr4 (168-226)||(33173980-33174038)
chr4 (165-226)||(10588703-10588764)
chr4 (165-226)||(28159910-28159971)
chr4 (165-226)||(48707690-48707751)
chr4 (168-228)||(2055399-2055459)
chr4 (165-225)||(35930163-35930223)
chr4 (168-228)||(37381967-37382027)
chr4 (167-226)||(25734182-25734241)
chr4 (188-234)||(8433822-8433868)
chr4 (168-226)||(30141068-30141126)
chr4 (135-176)||(33174224-33174265)
chr4 (165-226)||(33693290-33693351)
chr4 (128-176)||(22298662-22298710)
chr4 (128-176)||(35929929-35929977)
chr4 (128-176)||(48551950-48551998)
chr4 (128-176)||(50542303-50542351)
chr4 (133-176)||(30466957-30467000)
chr4 (167-226)||(32318076-32318134)
chr4 (129-176)||(40988523-40988570)
chr4 (165-211)||(9800377-9800423)
chr4 (128-170)||(10588730-10588772)
chr4 (168-226)||(56555125-56555183)
chr4 (374-408)||(56555166-56555200)
chr4 (135-176)||(9339079-9339120)
chr4 (128-169)||(17847045-17847086)
chr4 (135-176)||(25730384-25730425)
chr4 (135-176)||(28160157-28160198)
chr4 (133-170)||(40988779-40988816)
chr4 (135-176)||(49118507-49118548)
chr4 (128-176)||(11795103-11795151)
chr4 (128-176)||(15985154-15985202)
chr4 (198-226)||(17993007-17993035)
chr4 (136-176)||(23134963-23135003)
chr4 (128-176)||(25734427-25734475)
chr4 (136-176)||(28812244-28812284)
chr4 (136-176)||(32118858-32118898)
chr4 (128-176)||(48551713-48551761)
chr4 (128-176)||(50276339-50276387)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (135-408)||(513175-513447)
chr8 (128-408)||(35443170-35443451)
chr8 (135-408)||(2533139-2533412)
chr8 (139-408)||(43806534-43806803)
chr8 (165-408)||(37933539-37933782)
chr8 (138-408)||(1293356-1293626)
chr8 (133-408)||(24430572-24430848)
chr8 (165-408)||(22683989-22684232)
chr8 (139-404)||(9056343-9056607)
chr8 (138-408)||(28707447-28707716)
chr8 (139-408)||(4649021-4649290)
chr8 (139-408)||(38106971-38107239)
chr8 (128-408)||(38633711-38633985)
chr8 (139-408)||(41536528-41536797)
chr8 (168-408)||(35884431-35884671)
chr8 (165-408)||(440737-440980)
chr8 (165-408)||(259875-260117)
chr8 (165-408)||(655804-656046)
chr8 (165-408)||(841539-841781)
chr8 (135-408)||(23972296-23972571)
chr8 (138-408)||(42988228-42988497)
chr8 (165-408)||(28496356-28496598)
chr8 (138-409)||(39513339-39513610)
chr8 (139-408)||(33651712-33651981)
chr8 (164-404)||(12010445-12010688)
chr8 (168-388)||(23935133-23935353)
chr8 (165-388)||(7434783-7435006)
chr8 (167-408)||(40301894-40302135)
chr8 (168-408)||(13796989-13797228)
chr8 (168-388)||(29485187-29485406)
chr8 (168-408)||(38208652-38208893)
chr8 (164-388)||(6016101-6016325)
chr8 (216-408)||(3875856-3876048)
chr8 (251-408)||(36400071-36400228)
chr8 (128-346)||(24193356-24193564)
chr8 (273-408)||(15847117-15847252)
chr8 (133-408)||(36218782-36219055)
chr8 (164-333)||(8137069-8137239)
chr8 (135-242)||(9884723-9884830)
chr8 (128-242)||(15846998-15847113)
chr8 (128-277)||(39295289-39295432)
chr8 (165-228)||(43806490-43806553)
chr8 (165-226)||(3876031-3876092)
chr8 (168-228)||(2533393-2533453)
chr8 (348-408)||(24193131-24193191)
chr8 (165-228)||(36400027-36400090)
chr8 (168-226)||(4649273-4649331)
chr8 (165-223)||(13797214-13797272)
chr8 (165-226)||(440963-441024)
chr8 (165-226)||(12010675-12010736)
chr8 (165-226)||(37933765-37933826)
chr8 (165-228)||(260098-260161)
chr8 (165-228)||(655760-655823)
chr8 (165-228)||(841495-841558)
chr8 (165-228)||(22683945-22684008)
chr8 (165-228)||(23972252-23972315)
chr8 (136-194)||(9056581-9056639)
chr8 (168-226)||(33651964-33652022)
chr8 (168-226)||(41536487-41536545)
chr8 (165-226)||(513430-513491)
chr8 (165-226)||(38107222-38107283)
chr8 (165-225)||(35443435-35443495)
chr8 (165-228)||(1293607-1293670)
chr8 (168-226)||(28496315-28496373)
chr8 (168-225)||(38633670-38633727)
chr8 (168-228)||(36218741-36218801)
chr8 (168-226)||(24430531-24430589)
chr8 (172-226)||(35884394-35884448)
chr8 (169-226)||(9056299-9056356)
chr8 (165-226)||(15847235-15847296)
chr8 (165-226)||(24193087-24193148)
chr8 (164-220)||(43469202-43469258)
chr8 (133-176)||(28496558-28496601)
chr8 (128-170)||(23935363-23935405)
chr8 (135-220)||(27428406-27428496)
chr8 (165-223)||(28707404-28707461)
chr8 (167-228)||(38208874-38208934)
chr8 (128-176)||(24193079-24193127)
chr8 (168-220)||(42988187-42988239)
chr8 (133-176)||(1293630-1293673)
chr8 (370-404)||(8137240-8137274)
chr8 (164-218)||(18874173-18874227)
chr8 (165-218)||(21356654-21356707)
chr8 (135-176)||(37933786-37933827)
chr8 (128-176)||(7434775-7434823)
chr8 (136-176)||(8137070-8137110)
chr8 (168-228)||(40301853-40301913)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (165-408)||(218782-219026)
scaffold0004 (168-226)||(219009-219067)
scaffold0004 (128-176)||(218774-218822)
[»] scaffold1986 (2 HSPs)
scaffold1986 (157-408)||(3-254)
scaffold1986 (198-226)||(237-265)
[»] scaffold0693 (2 HSPs)
scaffold0693 (128-408)||(5028-5308)
scaffold0693 (165-228)||(4984-5047)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (128-408)||(12955-13235)
scaffold0184 (168-228)||(13216-13276)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (128-408)||(59609-59889)
scaffold0078 (168-228)||(59568-59628)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (128-408)||(252439-252719)
scaffold0005 (167-226)||(252397-252456)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (133-408)||(47827-48102)
scaffold0096 (168-226)||(48085-48143)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (165-388)||(1994-2217)
[»] scaffold0727 (2 HSPs)
scaffold0727 (133-408)||(5048-5325)
scaffold0727 (165-228)||(5306-5369)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (128-409)||(11225-11499)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (167-321)||(289-443)
[»] scaffold0717 (2 HSPs)
scaffold0717 (128-226)||(1940-2038)
scaffold0717 (328-408)||(1877-1957)
[»] scaffold1562 (2 HSPs)
scaffold1562 (328-408)||(599-679)
scaffold1562 (128-226)||(662-760)
[»] scaffold1158 (2 HSPs)
scaffold1158 (328-408)||(1914-1994)
scaffold1158 (128-226)||(1833-1931)
[»] scaffold0952 (2 HSPs)
scaffold0952 (328-408)||(3372-3452)
scaffold0952 (164-226)||(3328-3389)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (165-274)||(14546-14655)
scaffold0117 (128-176)||(14538-14586)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (244-318)||(19757-19831)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (135-195)||(101215-101275)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (165-221)||(5728-5784)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 114)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6740236 - 6739956
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6740236 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcc 6740137  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740136 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 6740037  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740036 aggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6739956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 14717465 - 14717745
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14717465 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaagtgttcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtct 14717564  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717565 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 14717664  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717665 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 14717745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30298030 - 30297750
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  30298030 caaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 30297931  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30297930 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctagg 30297831  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297830 agccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 30297750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33760744 - 33760471
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33760744 gtcctttaattttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaattccttttaga 33760645  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760644 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 33760545  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760544 tttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33760471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 20408393 - 20408673
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20408393 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 20408492  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20408493 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagg 20408592  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20408593 agctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 20408673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 31710142 - 31710422
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  31710142 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagttc 31710241  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31710242 ttttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagg 31710341  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31710342 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgatt 31710422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 129 - 408
Target Start/End: Original strand, 39824417 - 39824696
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39824417 aaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtact 39824516  T
Q  229 tttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 328  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824517 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 39824616  T
Q  329 gccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824617 ggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaccaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgatt 39824696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Original strand, 41282209 - 41282483
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41282209 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 41282308  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    |||  |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41282309 ggataatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccaga 41282408  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41282409 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattt 41282483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 8215767 - 8216040
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8215767 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaatttctttaaatttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 8215866  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215867 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 8215966  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215967 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 8216040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6600417 - 6600137
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  6600417 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcc 6600318  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    | |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6600317 tcttagaggatgatggtgataattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaga 6600218  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600217 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11001009 - 11000729
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11001009 caaagtggtcatttaattttcaaaagtcctaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 11000910  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000909 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 11000810  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000809 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11000729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Original strand, 42993378 - 42993654
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  42993378 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcc 42993477  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993478 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 42993577  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42993578 agccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggaattgtttgaaac 42993654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23129189 - 23128914
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129189 tggtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaattctttaagtttcaaaagtctaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 23129090  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    |||||  |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23129089 gaggataatggtgatgattcagatgatagcagcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagcca 23128990  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23128989 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgatt 23128914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16096229 - 16095961
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16096229 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 16096130  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096129 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 16096030  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096029 gtacc-aagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 16095961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3352277 - 3352003
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3352277 tggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 3352178  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3352177 -agaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 3352079  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3352078 aatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 3352003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 133 - 404
Target Start/End: Original strand, 40074815 - 40075086
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40074815 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcgtttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 40074914  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40074915 caggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 40075014  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40075015 gatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaac 40075086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 35342051 - 35342320
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||     
T  35342051 tttaaattttaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaatcaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaaagat 35342150  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342151 gatggtgatgattcagttgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 35342250  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35342251 ataccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgatt 35342320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20079533 - 20079259
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20079533 tggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa-tcctttta 20079435  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20079434 gaggatgatggtgataattcagatgatagcaacaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtca 20079335  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20079334 gatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 20079259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 137 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26593552 - 26593281
Alignment:
Q  137 cctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagg 236  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26593552 cctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttggtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagg 26593453  T
Q  237 acgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatt 336  Q
    |  |||  |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593452 ataatggtgatggtttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatt 26593353  T
Q  337 tggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26593352 tggtaccaaagataagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 26593281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 8689432 - 8689712
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8689432 caaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtct 8689531  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689532 ttttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 8689631  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8689632 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgatt 8689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 165 - 409
Target Start/End: Original strand, 30863150 - 30863394
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  30863150 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggctgatggtgatgattcagatgatagcaa 30863249  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30863250 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagca 30863349  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30863350 attaccaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattt 30863394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 38964357 - 38964115
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  38964357 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 38964258  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38964257 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 38964159  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38964158 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 38964115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4016147 - 4015875
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016147 gtcctttaagtttcaaaagtaccaaacaagtcctttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 4016048  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4016047 ggatgatggtgatgatttagatgatagtaa-aaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccaga 4015949  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4015948 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgatt 4015875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11692420 - 11692148
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  11692420 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaag 11692321  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || ||||  | | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11692320 gatgatggtggtgattcaaatgttagcaacaaagagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagat 11692221  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11692220 ttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgatt 11692148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28078686 - 28078406
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28078686 caaagtggtcttttaagtttcaaaagccccaaacaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtct 28078587  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  28078586 ttttagaggaagatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttagg 28078487  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28078486 agccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 28078406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 135 - 404
Target Start/End: Original strand, 1052403 - 1052669
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1052403 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaagtgatcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 1052502  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052503 ggatgatggtgatgatacagatgatagcaacaaagagcatc---caccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccaga 1052599  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052600 tttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 1052669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 14952221 - 14952464
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||    
T  14952221 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgttgattcagatgatagcaa 14952320  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14952321 caaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagca 14952420  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14952421 attaccaactatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgatt 14952464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 6331244 - 6331477
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6331244 gtcctttaagtttcaaaagtcccaagcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 6331343  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6331344 ggatgatggtgatgatttagatgatagtaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcaga 6331443  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatta 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6331444 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 6331477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 6251864 - 6252112
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        
T  6251864 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga---- 6251959  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6251960 -----------------tgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttg 6252042  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6252043 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6252112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27116375 - 27116100
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27116375 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaagtcccaaccaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27116276  T
Q  227 attttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 326  Q
     |||||||||| ||||      ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27116275 cttttagaggatgatg------attaagatgatagcaacaaagaacattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttag 27116182  T
Q  327 gagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27116181 gagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttaaaatgatt 27116100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30208671 - 30208403
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||     ||||||||| |||||||    
T  30208671 gtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaatcatttaagtttcaaaagtcccaaacaattccttttagtttttgaatc-----aaacaagtctttttaga 30208577  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30208576 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaa 30208477  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30208476 tttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgatt 30208403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 135 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43166534 - 43166274
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43166534 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttaga 43166435  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||| || ||         ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43166434 ggatgatttaaat---------gatagaaacaaagagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcaga 43166344  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43166343 tttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 43166274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Original strand, 16752016 - 16752236
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16752016 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 16752115  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  16752216 accaactatgttatctacaat 16752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19398474 - 19398194
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19398474 caaaatcgtcctttaagtttcaaaaatccaaaacaagttttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcc 19398375  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19398374 ttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagtaacaaagaacattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaga 19398275  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19398274 ggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgatt 19398194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26035591 - 26035367
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||||    
T  26035591 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagca 26035492  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26035491 acaaagagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagc 26035392  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||    
T  26035391 aattaccaactatggtatctacaat 26035367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 217 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39002217 - 39002030
Alignment:
Q  217 caaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaag 316  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39002217 caaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaatagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 39002118  T
Q  317 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39002117 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 39002030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 27509848 - 27510111
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27509848 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcgaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcattttagagga 27509947  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||        |||    
T  27509948 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ccttttag------ttttt 27510040  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  27510041 ggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgcttattacaataggacttgtttgaaacgatt 27510111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Original strand, 8694726 - 8695002
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||    || ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  8694726 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtctaaaagtggtcatttaagtttcaaaagtaaaaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagctt 8694825  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||| |    
T  8694826 ttttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatg 8694925  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8694926 agccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataattatcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaac 8695002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 216 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27457389 - 27457198
Alignment:
Q  216 tcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaa 315  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27457389 tcaaacaagttcttttagaggatgatgatgatgattcaaatg-tggcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaa 27457291  T
Q  316 gtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27457290 gtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 27457198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Original strand, 444850 - 445074
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||    
T  444850 atcctttaaattttaaaagtcttaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatgttgatgatccagatgataaca 444949  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    | ||||| ||| || ||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  444950 ataaagatcatgatccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagc 445049  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  445050 aattaccaactatgctatctacaat 445074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 264 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19659646 - 19659502
Alignment:
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  19659646 acaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagc 19659547  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19659546 aattaccaactatgctatctacaataggacttatttgaaacgatt 19659502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 408
Target Start/End: Original strand, 11935395 - 11935585
Alignment:
Q  217 caaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11935395 caaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgataacaacaaagatcattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaag 11935494  T
Q  317 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935495 tgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11935585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19661905 - 19661769
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19661905 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 19661806  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagag 271  Q
    ||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19661805 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagag 19661769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 286
Target Start/End: Original strand, 20517025 - 20517176
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20517025 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaattgtttcaaataagtccttttaga 20517124  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccattt 286  Q
    ||| ||||  ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20517125 ggatgatgatgatgatttagattatagcaacaaaaagcattatccaccattt 20517176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37923668 - 37923546
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  37923668 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtgtttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 37923569  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatag 261  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||    
T  37923568 gatggtgatgatttagatgatag 37923546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8689754 - 8689693
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689754 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 8689693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 20079215 - 20079276
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20079215 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20079276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 27457154 - 27457217
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457154 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 27457217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31710466 - 31710403
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710466 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 31710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17002437 - 17002343
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaaca 222  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  17002437 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcacagacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaaca 17002343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6252156 - 6252095
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6252156 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6252095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 6600093 - 6600154
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600093 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6600154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 11000685 - 11000746
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000685 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11000746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11935629 - 11935568
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935629 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11935568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 19659458 - 19659519
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19659458 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 19659519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20408717 - 20408656
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20408717 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20408656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 26593239 - 26593300
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593239 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 26593300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 28078362 - 28078423
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078362 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28078423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 23128869 - 23128933
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaa-caagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128869 tcctttaagtttcaaaagtctcaaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23128933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 4015834 - 4015892
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4015834 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaagcaagtc 4015892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 30297709 - 30297767
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297709 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30297767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 6739912 - 6739973
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6739912 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6739973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41282526 - 41282465
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41282526 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttaaatcatttcaaacaagtc 41282465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30863433 - 30863374
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30863433 tttaagtttcaaaagtc-caaacaagtcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcat 30863374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 38964071 - 38964134
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38964071 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacgagtctttttagtttctgaatcgtttcaaacaagtcat 38964134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1052714 - 1052656
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1052714 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 1052656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 33760430 - 33760488
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760430 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctcttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33760488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39824737 - 39824679
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824737 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 39824679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 43166229 - 43166287
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43166229 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 43166287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8216084 - 8216023
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216084 tcctttaagttttaaaagtcccatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8216023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8695050 - 8694989
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8695050 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 8694989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35342364 - 35342303
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342364 tcctttaagtttcaaaagtttcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35342303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 567782 - 567722
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtc 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  567782 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtcctttaagtttcaaaagtctaaaacaagtc 567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6332960 - 6332900
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6332960 tcctttaagttttaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 6332900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 39401952 - 39402007
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39401952 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaa 39402007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 3351962 - 3352020
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3351962 tttaagtttcaaaagtctcgaacaagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 3352020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14717790 - 14717728
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaa-gtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717790 tccttcaagtttcaaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14717728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 27116059 - 27116117
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27116059 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcattttaaacaagtc 27116117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 16095917 - 16095978
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16095917 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaacccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 16095978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 19398149 - 19398210
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19398149 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 19398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 30208362 - 30208419
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30208362 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 30208419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40075134 - 40075073
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40075134 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttttgtttttgaattgtttcaaacaagtc 40075073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14952499 - 14952447
Alignment:
Q  174 tttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952499 tttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14952447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 202
Target Start/End: Original strand, 11935344 - 11935411
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttag 202  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11935344 gtcctttaatttttaaaaatttcaatcaagtactttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcattttag 11935411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8695052 - 8695010
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8695052 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 8695010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27510152 - 27510094
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510152 tttaagttttaaaagtttcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27510094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42993702 - 42993644
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  42993702 tcctttaagtttcaaaagttccaaagaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaa 42993644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40075137 - 40075100
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40075137 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttt 40075100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Original strand, 42262795 - 42262844
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42262795 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaagtgatccttttagtttc 42262844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 11000677 - 11000725
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11000677 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 11000725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20408725 - 20408677
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  20408725 caaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 20408677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31710474 - 31710426
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31710474 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 31710426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 39001985 - 39002045
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39001985 tttaagtttcaaaagttccaaataaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcat 39002045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Original strand, 39125993 - 39126041
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtc 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  39125993 tcctttaagtttcaaaagtctcaaccaagtcctttaaatttcaaaagtc 39126041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 408
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6332916
Alignment:
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 6332916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Original strand, 9919239 - 9919294
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9919239 tcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 9919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9919789 - 9919734
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9919789 tcctttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 9919734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 27457151 - 27457194
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27457151 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 27457194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Original strand, 30208352 - 30208399
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30208352 aaaatcgtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 30208399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 228
Target Start/End: Original strand, 11692137 - 11692167
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692137 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 11692167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 26035315 - 26035357
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26035315 caaagtggtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttt 26035357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 567753 - 567712
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  567753 gtcctttaagtttcaaaagtctaaaacaagtcctttaagttt 567712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6252157 - 6252116
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6252157 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 6252116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11935630 - 11935589
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11935630 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 11935589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27457440 - 27457380
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagt 194  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27457440 tggtcctttaagtttcaaaa-tcccaaagaagtccgttaagtttcaaaagtctcaaacaagt 27457380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35155416 - 35155363
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttca 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  35155416 tcctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 35155363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 444851 - 444891
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  444851 tcctttaaattttaaaagtcttaaacaaatccttttagttt 444891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1052725 - 1052677
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1052725 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 1052677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 6739904 - 6739952
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6739904 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagttt 6739952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 9919236 - 9919280
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttc 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  9919236 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttc 9919280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 14952213 - 14952261
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  14952213 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 14952261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 19398150 - 19398190
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19398150 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagttt 19398190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 28078354 - 28078402
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28078354 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 28078402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 30863142 - 30863190
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  30863142 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagttt 30863190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 150)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 38473907 - 38473627
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38473907 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtca 38473808  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473807 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 38473708  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473707 aaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 38473627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23767688 - 23767415
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23767688 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 23767589  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767588 ggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 23767489  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23767488 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 23767415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23228475 - 23228195
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23228475 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 23228376  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23228375 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttagg 23228276  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23228275 agtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgatt 23228195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 49094981 - 49094712
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  49094981 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggat 49094882  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094881 gatggtgatgattctgatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 49094782  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094781 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 49094712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Original strand, 19274426 - 19274700
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19274426 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttatgtttcaaaagtcccaaataagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtcgttttaga 19274525  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274526 ggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 19274625  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274626 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattt 19274700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 19315507 - 19315780
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19315507 gtcctttaaatttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttctaga 19315606  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19315607 ggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcaga 19315706  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19315707 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 19315780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36157958 - 36157679
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaa-caagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36157958 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtcccaaaacaaatcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 36157860  T
Q  227 attttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 326  Q
     |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157859 cttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 36157760  T
Q  327 gagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157759 gagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt-ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 36157679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7609039 - 7608767
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7609039 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaacagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagag 7608940  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7608939 gataatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagat 7608840  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7608839 ttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgatt 7608767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 49814165 - 49814440
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49814165 tggtcctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 49814264  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814265 gaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 49814364  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  49814365 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctagaatatgacttatttgaaacgatt 49814440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25988546 - 25988272
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25988546 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttag 25988447  T
Q  234 aggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 333  Q
    || | |||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25988446 agaatgatagtgatgatttagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcag 25988347  T
Q  334 atttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988346 atttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 25988272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28425604 - 28425364
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  28425604 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 28425505  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28425404 accaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgatt 28425364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 26069763 - 26070032
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26069763 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 26069862  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26069863 gatggtgatgatttagatgataacaacaaagatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttg 26069962  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26069963 ataccaaaaatgagttcaaggaaacaattaccaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 26070032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 128 - 409
Target Start/End: Original strand, 50533243 - 50533524
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50533243 caaagtggtcatttaagttacaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaaaagtca 50533342  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50533343 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 50533442  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50533443 agccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctataataggacttgtttgaaacgattt 50533524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 5400739 - 5401010
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5400739 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaagaagtccttttagag 5400838  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  5400839 gatgatggtgattattcagatgatagcaacaaatagtattatccaccatttg-catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagat 5400937  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5400938 ttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagatt 5401010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 46095349 - 46095076
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46095349 gtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtcttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 46095250  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46095249 ggatgatggtgatgacttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacaga 46095150  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46095149 tttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 46095076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 43396572 - 43396815
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  43396572 tcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagtatgatggtgatgattcagatgatagcaa 43396671  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43396672 caaagagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 43396771  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43396772 attatcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgatt 43396815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7553286 - 7553017
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  7553286 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaattttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcttttcagaggat 7553187  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553186 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 7553087  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7553086 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 7553017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 26549255 - 26549528
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26549255 gtcctttaagtttcaaaagccacaaacaagtcctttaaatttcaaaagccacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttaga 26549354  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    | | ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26549355 gaatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaga 26549454  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26549455 tttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgatt 26549528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 46825396 - 46825671
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaa--gtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||   ||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46825396 gtcctttaagtttcaaaagactcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 46825495  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825496 gaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 46825595  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825596 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 46825671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 129 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41982516 - 41982237
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982516 aaaatggtcttttaagtttcaaaagtccaaaacaaatcttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 41982417  T
Q  229 ttt-agaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41982416 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttagg 41982317  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgat 407  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41982316 agtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatcaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgat 41982237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 33673884 - 33674157
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33673884 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagttttaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 33673983  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| |||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33673984 ggatgattgtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 33674083  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33674084 tttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaattaccagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgatt 33674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 41105883 - 41106156
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |    
T  41105883 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaaatttcaaaagttccaaaaaagtccttttaatttttgaaccgtttcaaacagatcattttata 41105982  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41105983 ggatgatggtgatgatttaaataatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcaga 41106082  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106083 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 41106156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 7651559 - 7651802
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtag--attattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |  || ||| ||||||||||||    
T  7651559 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttatagaggatgatggtgtgatgatttagatgatagcaa 7651658  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7651659 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagca 7651758  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7651759 attatcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 7651802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24204741 - 24204474
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24204741 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaa-gtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagagga 24204643  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24204642 tgatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagattt 24204543  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24204542 ggtaccaaagacgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 24204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 46051347 - 46051590
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  46051347 tcctttaagtttcaaaagtcccaaataaggccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 46051446  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46051447 caaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 46051546  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46051547 attaccaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgatt 46051590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 52146890 - 52147133
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  52146890 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 52146989  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  52146990 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagca 52147089  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  52147090 attacaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgatt 52147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 12142964 - 12143212
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttc-------aaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgat 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||    
T  12142964 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgat 12143063  T
Q  260 agcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaagg 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12143064 agcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaagg 12143163  T
Q  360 aagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143164 aagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12143212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 128 - 389
Target Start/End: Original strand, 9974702 - 9974963
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9974702 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcttttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcc 9974801  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9974802 ttttagaggatgattgtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacg 9974901  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaata 389  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9974902 agccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 37216763 - 37217036
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  37216763 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtgcttttaaa 37216862  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  37216863 ggatgatggtgatgatttagatgataccaacaaagaacattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctaga 37216962  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37216963 gttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37217036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45670727 - 45670487
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  45670727 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 45670628  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45670627 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 45670529  T
Q  368 atc-aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670528 accaaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 45670487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 52067935 - 52067652
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52067935 caaagtggttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagattcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 52067836  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattat---tcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 324  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52067835 ttttagaggatgatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgtt 52067736  T
Q  325 aggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  52067735 aggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaattacaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 52067652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 18892229 - 18892469
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  18892229 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 18892328  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 18892469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 33325624 - 33325867
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||    
T  33325624 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatggtgatgatttagatgagtgcaa 33325723  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  33325724 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagca 33325823  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325824 attaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33325867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36781416 - 36781173
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  36781416 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 36781317  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36781316 caaaaagcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 36781217  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36781216 attaccaactatgatatctacaataagacttgtttgaaacgatt 36781173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45350985 - 45350718
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45350985 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttt-agagga 45350887  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350886 tgatggtgataatttagatgatagcaacaaaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 45350787  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45350786 ggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacgatt 45350718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 157 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 48669648 - 48669397
Alignment:
Q  157 caaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagat 256  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  48669648 caaacaagccctttatgtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagat 48669549  T
Q  257 gatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttca 356  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48669548 gatagcaacaaagaacattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttca 48669449  T
Q  357 aggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48669448 aggaagcaatcaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 48669397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8141756 - 8141487
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  8141756 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgat 8141657  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8141656 gatggtgatgattcgaatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttg 8141557  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141556 gtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 8141487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18782370 - 18782090
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18782370 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagccctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 18782271  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||| | | ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18782270 ttttagagaatggtggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatg 18782171  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  18782170 aaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatcaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgatt 18782090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 18917393 - 18917664
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18917393 tcctttaagtttcaaaagccccaaacaagtcctttaagtt-caaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagag 18917491  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || |||   ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18917492 gatgataatgatgattcagatgatagtaacaaagagaattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatat 18917591  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18917592 ttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattattaaatatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 18917664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 52350198 - 52349925
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52350198 gtcctttaagtttcaaaagttccaaagtcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 52350099  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    | | ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  52350098 gaatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaa 52349999  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52349998 tttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgatt 52349925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 164 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9879029 - 9878785
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||    
T  9879029 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgacagca 9878930  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9878929 acaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagc 9878830  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9878829 aattaccaactattttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 9878785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 133 - 368
Target Start/End: Original strand, 12964511 - 12964746
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  12964511 tggttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttaatttttgaattgtttcaaacaagttctttta 12964610  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964611 gaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 12964710  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatta 368  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12964711 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 12964746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 50689841 - 50690083
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  50689841 tcctttaagtttcaaaagtcccaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 50689939  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50689940 caaagagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagca 50690039  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50690040 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 50690083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 48802593 - 48802332
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  48802593 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcc--------tcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 48802502  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48802501 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttg 48802402  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48802401 ataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 48802332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 170 - 408
Target Start/End: Original strand, 6711342 - 6711580
Alignment:
Q  170 taagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaag 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  6711342 taagtttcaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaag 6711441  T
Q  270 agcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattat 369  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6711442 agcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 6711541  T
Q  370 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6711542 caactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgatt 6711580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 170 - 408
Target Start/End: Original strand, 34970982 - 34971220
Alignment:
Q  170 taagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaag 269  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34970982 taagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgacgatgattcagatgatagcaacaaag 34971081  T
Q  270 agcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattat 369  Q
    | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  34971082 aacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattac 34971181  T
Q  370 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34971182 caactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 34971220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 16705770 - 16706010
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| |||||| |||||| |||||    
T  16705770 tttaagtttcaaaagccacaaacaagtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatgacgatgattcaggtgatagaaacaa 16705869  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgatt 16706010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33194895 - 33194672
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33194895 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcatttgactttttgaatcgtttcgaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 33194796  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33194795 caaagagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 33194696  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  33194695 actaccaactatgctatctacaat 33194672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48319288 - 48319067
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  48319288 ctttaagtttcaattgtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgcttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 48319189  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48319188 aagaacattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 48319089  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaat 388  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  48319088 taccaactatgctatatacaat 48319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 21929391 - 21929666
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21929391 ctttaagtttcaaaagtctcaatcaagtcatttaagtttcaaaagttccagacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagagga 21929490  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21929491 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaagattatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagattt 21929588  T
Q  338 ggtacc-------aaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||       ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21929589 ggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 21929666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 40721248 - 40721483
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||         ||||||||||||||    
T  40721248 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttctgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgat---------tcagatgatagcaa 40721338  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  40721339 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagc 40721438  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40721439 aattatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgatt 40721483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 346
Target Start/End: Original strand, 50099080 - 50099298
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50099080 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagaccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtca 50099179  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  50099180 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaaa 50099279  T
Q  328 agccagatttggtaccaaa 346  Q
    || || |||||||||||||    
T  50099280 agtcatatttggtaccaaa 50099298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 9962659 - 9962891
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||         ||||||||||    
T  9962659 ctttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtctttttagaggatgatggtgat---------gatagcaaca 9962749  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9962750 aagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 9962849  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9962850 taccaactatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgatt 9962891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 21964965 - 21965205
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  21964965 tttaagtttcaaaagtctcaatcaaatccttttagttttcgaatcgtttcaaataagtctttttagagaatgatggtgataattcggatgatagcaacaa 21965064  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21965065 agaacattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaatt 21965164  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21965165 accaattatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgatt 21965205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 25800514 - 25800781
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttc-aaacaagtcattttagagga 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  25800514 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttttaaacaagtccttttagagga 25800613  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  25800614 tgatggtgatgattaagatgaaagcaaaaaagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agattt 25800707  T
Q  338 ggtacca----aaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25800708 ggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaattaccaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 25800781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33714600 - 33714362
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  33714600 tttaaatttcaaaagttccaaacaagtcctcttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaacaa 33714501  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  33714500 agaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaa-tgtaagt-ggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 33714403  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33714402 atcaactatgttatctacaataggatttgtttgaaacgatt 33714362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Original strand, 30281531 - 30281751
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  30281531 tttaagtttcaaaagttccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatacttttagagaatgatggtgatgattcatatgatagcaacaa 30281630  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  30281731 accaactatgctatctacaat 30281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32373833 - 32373650
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  32373833 caaagtggtcctttaagtttcaaaa-tcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcttttcaaacaagtcc 32373735  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattt 312  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32373734 ttttagaggatgatggtgatcattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44979431 - 44979281
Alignment:
Q  166 cctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaac 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  44979431 cctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttatgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaac 44979332  T
Q  266 aaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaag 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44979331 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16506965 - 16506809
Alignment:
Q  232 agaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 331  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16506965 agaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagatcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagcc 16506866  T
Q  332 agatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16506865 agatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 16506809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17984058 - 17983899
Alignment:
Q  249 attcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |    
T  17984058 attcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaaga 17983959  T
Q  349 tgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17983958 tgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgatt 17983899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17990041 - 17989864
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17990041 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaaatttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttaga 17989942  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattt 312  Q
    ||| ||||  ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17989941 ggatgatggtgatgatttaaatgatagtaacaaatagcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 298
Target Start/End: Original strand, 49973802 - 49973972
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  49973802 caaaatcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattaaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 49973901  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaa 298  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49973902 ttttaaaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaa 49973972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978769
Alignment:
Q  308 aattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgat 407  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 49094667 - 49094729
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094667 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 49094729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 36157635 - 36157696
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157635 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36157696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37217080 - 37217019
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37217080 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37217019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7651846 - 7651783
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651846 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 7651783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19315824 - 19315761
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315824 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 19315761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50690127 - 50690064
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50690127 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 50690064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21965250 - 21965188
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21965250 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21965188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 44978725 - 44978787
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44978725 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 44978787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25800825 - 25800764
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25800825 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 25800764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 28425320 - 28425381
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425320 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28425381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33325911 - 33325850
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325911 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33325850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 36781129 - 36781190
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781129 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36781190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46051634 - 46051573
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051634 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 46051573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46825715 - 46825654
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825715 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 46825654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 48802288 - 48802349
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48802288 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48802349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12143254 - 12143195
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143254 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12143195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 38473585 - 38473644
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473585 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38473644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40721528 - 40721466
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40721528 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttccaacaagtc 40721466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43396859 - 43396801
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43396859 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 43396801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5401054 - 5400993
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5401054 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcttttcaaacaagtc 5400993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 25988228 - 25988289
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988228 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 25988289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26549572 - 26549511
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26549572 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 26549511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 45670443 - 45670504
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670443 tcctttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 45670504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 7552976 - 7553036
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7552976 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 7553036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9962935 - 9962875
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962935 tcctttaagtttcaaaagtctcaaagaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 9962875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21929710 - 21929650
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21929710 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 21929650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49814485 - 49814421
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49814485 atcctataagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtcat 49814421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 52067611 - 52067671
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52067611 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 52067671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6711624 - 6711561
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6711624 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttttatttttgaatcgtttcaaacaagtcat 6711561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 23767372 - 23767434
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767372 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaa-tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23767434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 24204430 - 24204489
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24204430 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtc 24204489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26070076 - 26070013
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070076 tcctttaagtttcaaaagtctcaaagaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 26070013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33674199 - 33674140
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33674199 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtgtcaaacaagtc 33674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 45350674 - 45350732
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  45350674 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaa 45350732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16706054 - 16705993
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16706054 tcctttaagtttcaaaaatttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 16705993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 18782048 - 18782109
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18782048 ctttatgtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcat 18782109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19274739 - 19274682
Alignment:
Q  169 ttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19274739 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 19274682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 23228154 - 23228211
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228154 tttaagtttcaaaagtccctaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 23228211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 46095032 - 46095093
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46095032 tcctttaagtttcaaaaattccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 46095093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 9878744 - 9878804
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878744 tttaagtttcaaaagtcccaaataagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 9878804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 22351082 - 22351138
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22351082 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaac 22351138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 7608725 - 7608784
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608725 ctttaaatttcaaaaatcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 7608784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18892511 - 18892452
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892511 ctttaagtttcaaaagttccaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 18892452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18917708 - 18917645
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917708 tcctttaagtttcataagtctcaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaaatcat 18917645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52147177 - 52147114
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52147177 tcctttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcat 52147114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12964813 - 12964755
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12964813 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgattcaaacaagtc 12964755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 16505194 - 16505250
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaac 221  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16505194 tcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaac 16505250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 41982195 - 41982255
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41982195 tttaagtttcaaaagtctcatataagtccttttagtttttgcatcgtttcaaacaagtcat 41982255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 24036628 - 24036703
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaa 210  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  24036628 gtccattaagtttcaaaagtcccaaagtgagcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaa 24036703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6711632 - 6711590
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6711632 caaaatggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 6711590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Original strand, 40721240 - 40721289
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttc 177  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40721240 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttc 40721289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16508172 - 16508117
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||    
T  16508172 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-ttttgaattgtttcaaac 16508117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 33325616 - 33325664
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33325616 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 33325664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33325919 - 33325871
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33325919 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 33325871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 8141450 - 8141504
Alignment:
Q  171 aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141450 aagtttcaaaagttccaaacaagttt-tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8141504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 33714321 - 33714376
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  33714321 tttatgtttcaaatgtcccaaacaagtctttctagtttttgaatcgtttcaaacaa 33714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 36781126 - 36781169
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36781126 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 36781169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Original strand, 7651559 - 7651597
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7651559 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 7651597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 17983858 - 17983916
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17983858 tttaaatttcaaaagtcttaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaccaagtc 17983916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49595212 - 49595162
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttca 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  49595212 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcattttagtttttgaatcgtttca 49595162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49974018 - 49973972
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaat 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  49974018 tcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaat 49973972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50533552 - 50533506
Alignment:
Q  180 aagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50533552 aagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 50533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 52147185 - 52147143
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52147185 caaagtggtcctttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttt 52147143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21929713 - 21929676
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21929713 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 21929676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 25800539 - 25800580
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25800539 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 25800580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 26069788 - 26069829
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  26069788 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcattttagttt 26069829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26070077 - 26070036
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26070077 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaagaaatccttttagttt 26070036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26549573 - 26549532
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26549573 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 26549532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43396860 - 43396819
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43396860 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 43396819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 49594919 - 49594972
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttca 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  49594919 tcctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 49594972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50690128 - 50690087
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50690128 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 50690087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 52067611 - 52067648
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52067611 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 52067648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5401062 - 5401014
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  5401062 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagttt 5401014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7609041 - 7609009
Alignment:
Q  163 aatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7609041 aatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc 7609009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9962943 - 9962895
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  9962943 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaagaagtccttttagttt 9962895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18917716 - 18917668
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  18917716 caaagtggtcctttaagtttcataagtctcaaacaagtccttttagttt 18917668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 19315529 - 19315577
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19315529 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagttt 19315577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19315832 - 19315784
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19315832 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 19315784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 36157627 - 36157675
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  36157627 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagttt 36157675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 38473575 - 38473623
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38473575 caaagtggtactttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 38473623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40721527 - 40721487
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40721527 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 40721487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41106167 - 41106139
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106167 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41106139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 44978717 - 44978765
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  44978717 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 44978765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46051642 - 46051594
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  46051642 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 46051594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 48669374 - 48669414
Alignment:
Q  186 caaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48669374 caaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 48669414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 226
Target Start/End: Original strand, 52349914 - 52349942
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52349914 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 52349942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 113)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 128 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3430905 - 3430631
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3430905 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 3430806  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3430805 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatg 3430706  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 402  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430705 agccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16246467 - 16246194
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16246467 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 16246368  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246367 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 16246268  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246267 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 16246194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1106840 - 1106560
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106840 caaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 1106741  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106740 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 1106641  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1106640 agtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaataggacttatttgaaatgatt 1106560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 920889 - 921162
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  920889 gtcctttaagtttcaaacgtcccaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttaaga 920988  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920989 ggatgatggtgatgatttagatgatggcaataaagagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 921088  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921089 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 921162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 404
Target Start/End: Original strand, 2455877 - 2456146
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2455877 gtcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaagcaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 2455976  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  2455977 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaa 2456076  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456077 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 2456146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 9276441 - 9276714
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9276441 gtcctttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 9276540  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9276541 ggatgatggtgatgattcaaatgaaagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaa 9276640  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276641 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 9276714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17484831 - 17484551
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17484831 caaagtggtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaattct 17484732  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
     ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17484731 gtttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttagg 17484632  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484631 agtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17484551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36444502 - 36444228
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36444502 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttcagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgttacaaacaagtcattttaaa 36444403  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36444402 ggatgatggtgataatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccaga 36444303  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36444302 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctactataggacttgtttgaaacgattt 36444228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 133 - 409
Target Start/End: Original strand, 36210911 - 36211187
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36210911 tggtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcatttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 36211010  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36211011 gaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtca 36211110  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36211111 gatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaacaattt 36211187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 27328454 - 27328724
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27328454 gtcctttaaatttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttaaaacaagtccttttaga 27328553  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||   || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27328554 ggatgatg---atgattcagatgataacaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcaga 27328650  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328651 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 27328724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 7378834 - 7379103
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  7378834 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaagaagtccttttagtttttgaatcgtttcacacaagtccttttagaggat 7378933  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7378934 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 7379033  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7379034 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 7379103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 19180289 - 19180561
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19180289 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttaga 19180388  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19180389 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gagccaga 19180487  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19180488 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattactaactatactatctacaataagacttgtttgaaacgatt 19180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 136 - 404
Target Start/End: Original strand, 29737616 - 29737884
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29737616 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagag 29737715  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||    
T  29737716 gatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagat 29737815  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29737816 ttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaac 29737884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 38750913 - 38751188
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38750913 tggtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 38751012  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38751013 gaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagcca 38751112  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38751113 catttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatactatctacattaggacttgtttgaaacgatt 38751188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 165 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 772219 - 771981
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  772219 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 772120  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  772119 caaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 772020  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772019 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 771981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 2056787 - 2057066
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2056787 caaagtggtcctttaagtttcaaatgtcccaaacaaatc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 2056885  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056886 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagtgcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 2056985  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2056986 agctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 2057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12760019 - 12759751
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  12760019 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaacagtctcaaacaagtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 12759920  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  12759919 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gaggcaaatttg 12759821  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759820 gtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12759751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 409
Target Start/End: Original strand, 17134089 - 17134370
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  17134089 caaagtggtcctttaagttttaaaagttccaaacaaatcctttaagtttcaaaagttccaaacaggtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 17134188  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17134189 ttttagaggatgatggttatgattcacatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttagg 17134288  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134289 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 17134370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28650702 - 28650427
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28650702 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 28650603  T
Q  235 ggacgatgtag--attattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||| ||||  |  || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650602 ggatgatggtgtgatgatttagatgataacaacaaagagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 28650503  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650502 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28650427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33865548 - 33865268
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865548 caaagtggtcctttaagttttaaaagccccaaacaaattctttatgtttcaaaagtcccaaccaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 33865449  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33865448 ttttagaggatgatggtgaagattcaaatgatagcaacaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttagg 33865349  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33865348 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 33865268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 8899542 - 8899821
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8899542 caaaatcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 8899641  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| |||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8899642 ttttagaggatgattgtgatgatttaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttagg 8899741  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8899742 agccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttg-ttgaaacgatt 8899821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 40854509 - 40854749
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40854509 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatctttttaaagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 40854608  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40854749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11949703 - 11949427
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11949703 gtcctttaagtttcaaaagtttcaaagtggtcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttaga 11949604  T
Q  235 ---ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 331  Q
       ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11949603 tcaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtc 11949504  T
Q  332 agatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949503 agatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11949427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33107243 - 33106970
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||    ||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33107243 gtcctttaagtttcaaaagttccaaagttgtcctttaagtttcaaaagtcttaaacaaatccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcattttaga 33107144  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33107143 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccata 33107044  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33107043 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaataggactcgtttgaaacgatt 33106970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8396795 - 8396572
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  8396795 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaa 8396696  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8396695 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 8396596  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8396595 attatcaactatgctatctacaat 8396572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7297502 - 7297235
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7297502 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 7297403  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7297402 gatggtgataatttagatgataacaacaaag--cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttg 7297305  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7297304 gtaccaaagatgagttcaagaagacaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 7297235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 34253041 - 34253282
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||    
T  34253041 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcgaacaagtccttttagaggatgatggtgatcattcaaatgatagcaaca 34253140  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34253141 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaat 34253240  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253241 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 34253282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 41500774 - 41500503
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||         ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  41500774 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaa---------caaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 41500684  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41500683 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagg 41500584  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41500583 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgatt 41500503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 167 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25088038 - 25087801
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  25088038 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 25087939  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  25087938 aagaccattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaat 25087839  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25087838 tatcaactatgttatatacaataagacttgtttgaaac 25087801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37732434 - 37732194
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  37732434 tttaaatttcaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 37732335  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgatt 37732194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43249656 - 43249413
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  43249656 tccttcaaatttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaa 43249557  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  43249556 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaaca 43249457  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  43249456 attaccaactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgatt 43249413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 42629853 - 42630102
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattat------tcagatga 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||      ||||||||    
T  42629853 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatgatgatgatgatgattcagatga 42629952  T
Q  259 tagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaag 358  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42629953 taacaacaaagagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaag 42630052  T
Q  359 gaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42630053 aaagcaattatcaattatgctatctatgataggacttgtttgaaacgatt 42630102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2094651 - 2094411
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  2094651 tttaagtttgaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcctttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 2094552  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 2094411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2315246 - 2314980
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2315246 ctttaagtttcaaaagtcccaaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttcgagga 2315147  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2315146 tgatgatgatgatttacatgataacaacaaatagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagattt 2315047  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2315046 ggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 2314980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41178293 - 41178060
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41178293 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagccatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttaga 41178194  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178193 ggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 41178094  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatta 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41178093 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 41178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 45124016 - 45124259
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  45124016 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaa 45124115  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  45124116 caaggagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaaca 45124215  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45124216 attaccaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgatt 45124259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 37838148 - 37838437
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37838148 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctt-aagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtcattttagag 37838246  T
Q  236 gacgatg---------tagattat---------tcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagt 317  Q
    || ||||         ||||| ||         | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37838247 gatgatggtgatgatttagatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagaacattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt 37838346  T
Q  318 gggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37838347 gggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37838437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 168 - 384
Target Start/End: Original strand, 37654008 - 37654224
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||||||||    
T  37654008 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagcaacaa 37654107  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37654108 agaacattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 37654207  T
Q  368 atcaactatgctatcta 384  Q
    | |||||||| ||||||    
T  37654208 accaactatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19916230 - 19916008
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| |||||||  |||||||    
T  19916230 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc-ttttagagggtgatggtgatgattcagacaatagcaa 19916132  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19916131 ccaagagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaacca 19916032  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  19916031 attaccaactatgctatctacaat 19916008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 135 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23673147 - 23672958
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673147 gtcctttaagtttcaaaaattccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 23673048  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 324  Q
    ||| ||||   || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673047 ggaggatgataatgatttagatgatagcaacaaagagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 408
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331896
Alignment:
Q  269 gagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatta 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || || |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  369 tcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgatt 9331896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 408
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630754
Alignment:
Q  317 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 14630754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671812
Alignment:
Q  319 ggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgatt 23671812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 2094367 - 2094428
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2094367 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2094428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9276758 - 9276697
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276758 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9276697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 208
Target Start/End: Original strand, 9331632 - 9331705
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttg 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  9331632 gtcctttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttg 9331705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9331940 - 9331879
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9331940 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9331879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 12759707 - 12759768
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759707 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12759768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 16246150 - 16246211
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246150 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 16246211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 17484507 - 17484568
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484507 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17484568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19180605 - 19180544
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180605 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 19180544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27328768 - 27328707
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328768 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27328707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 41177992 - 41178053
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177992 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41178053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42630146 - 42630085
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630146 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42630085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 7297191 - 7297254
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7297191 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagattttgaatcgtttcaaacaagtcat 7297254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 37732153 - 37732211
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37732153 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37732211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2456194 - 2456133
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2456194 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 2456133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7379145 - 7379084
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379145 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 7379084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 28216923 - 28216984
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28216923 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcat 28216984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 28650383 - 28650444
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650383 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28650444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 33106926 - 33106987
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33106926 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacgagtc 33106987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 36444185 - 36444246
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36444185 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 36444246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37838481 - 37838420
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37838481 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 37838420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 41500459 - 41500520
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41500459 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttctagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41500520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14630799 - 14630735
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630799 atcctttaagttttaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 14630735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 19511487 - 19511591
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  19511487 tggttctttaagttttaaaagtttcaaacaaattctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttaaattgtttcaaacaaatcctttta 19511586  T
Q  233 gagga 237  Q
     ||||    
T  19511587 aagga 19511591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2057107 - 2057049
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057107 tttaagtttcaaaagtcccagacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2057049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 11949386 - 11949444
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949386 tttaagtttcaaatgtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11949444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 771933 - 771993
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  771933 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatc-tttcaaacaagtc 771993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40854793 - 40854732
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40854793 tcctttaagtttcaaaagtcccaaactagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 40854732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 3358107 - 3358158
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgttt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3358107 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgttt 3358158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8899865 - 8899803
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8899865 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttc-aacaagtcat 8899803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 921203 - 921145
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  921203 tttaagtttcaaaagtcttaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 921145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 25087760 - 25087814
Alignment:
Q  172 agtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25087760 agtttcaaaagtcccaaacaagtcatttttgtttttgaattgtttcaaacaagtc 25087814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34253323 - 34253265
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253323 tttaagtttcaaaggtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 34253265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38751229 - 38751171
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38751229 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtc 38751171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 43249372 - 43249430
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43249372 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcgaacaagtc 43249430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45124303 - 45124245
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  45124303 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 45124245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 1106516 - 1106577
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1106516 tcctttaaatttcaaaagttgcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaataagtc 1106577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 2314932 - 2314993
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2314932 tcctttaagtttcaaaggtcccaaataagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 2314993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 29737644 - 29737685
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29737644 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 29737685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2315227 - 2315179
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2315227 caaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagttt 2315179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3358228 - 3358147
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| || || ||||||    
T  3358228 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc-tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttaatttttaaaacgattcaaa 3358147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 23671772 - 23671829
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23671772 tttaagtttcaaaagtctcaa-caaatcattttagattttgaatcgtttcaaacaagtc 23671829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 28650382 - 28650423
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28650382 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 28650423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29737932 - 29737871
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29737932 tcctttaaatttcaaaaggcccaaacaaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 29737871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 772227 - 772179
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  772227 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 772179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17134407 - 17134352
Alignment:
Q  170 taagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17134407 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-ttttaaatcgtttcaaacaagtc 17134352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 27328476 - 27328524
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27328476 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 27328524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27328776 - 27328728
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27328776 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 27328728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29737940 - 29737892
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  29737940 caaagtggtcctttaaatttcaaaaggcccaaacaaatccttttagttt 29737892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 33865245 - 33865285
Alignment:
Q  186 caaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33865245 caaacaagtcattctagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33865285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37654285 - 37654237
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37654285 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 37654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 176
Target Start/End: Original strand, 2094361 - 2094407
Alignment:
Q  130 aaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2094361 aaatcgtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 2094407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28217007 - 28216969
Alignment:
Q  366 ttatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28217007 ttatcaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaac 28216969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Original strand, 34253041 - 34253079
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34253041 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 34253079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36211231 - 36211169
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaag-tcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36211231 tcctttaagtttcaaaaggtctcaaacaagtccttttaatttttaaattgtttcaaacaagtc 36211169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2456195 - 2456154
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2456195 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 2456154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7297477 - 7297436
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7297477 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 7297436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 12759706 - 12759747
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12759706 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 12759747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12759994 - 12759953
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12759994 gtcctttaagtttcaacagtctcaaacaagtcctttaagttt 12759953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Original strand, 19915961 - 19915998
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19915961 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 19915998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 33106925 - 33106966
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33106925 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 33106966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 36444184 - 36444225
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36444184 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 36444225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 41500451 - 41500492
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctt 169  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41500451 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctt 41500492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 45124015 - 45124056
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45124015 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 45124056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45124304 - 45124263
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  45124304 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagttt 45124263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 771925 - 771973
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  771925 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 771973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Original strand, 7297189 - 7297225
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7297189 ggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 7297225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 17484499 - 17484547
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  17484499 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 17484547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37654277 - 37654237
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagttt 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  37654277 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 37654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 42629845 - 42629893
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  42629845 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 42629893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42630154 - 42630106
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  42630154 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagttt 42630106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 12626496 - 12626776
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12626496 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 12626595  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626596 ttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 12626695  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626696 agccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaccaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12626776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Original strand, 6503585 - 6503859
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6503585 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 6503684  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503685 ggatgatggtgatgatttatatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 6503784  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503785 tttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattt 6503859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 29050137 - 29050412
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29050137 tggtcctttaagtttcaaaagtcccaaaaaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 29050236  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050237 aaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 29050336  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050337 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 29050412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3259088 - 3258808
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3259088 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatactttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 3258989  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3258988 ttttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagg 3258890  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatc-aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3258889 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 3258808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 157 - 408
Target Start/End: Original strand, 3408078 - 3408329
Alignment:
Q  157 caaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagat 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  3408078 caaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagat 3408177  T
Q  257 gatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408178 gatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttca 3408277  T
Q  357 aggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3408278 aggaagcaattaccaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 3408329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1915617 - 1915348
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1915617 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttccaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttata 1915518  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915517 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaga 1915418  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915417 tttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 1915348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26393283 - 26393010
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26393283 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaagtgatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 26393184  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26393183 ggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccaga 26393084  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  26393083 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaagttttttgaaacgatt 26393010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 30378877 - 30379157
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||     
T  30378877 caaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaacagtcccaaacaagtccttttaaattttgaatcgtttcaaacaagtcc 30378976  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30378977 ttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaga 30379076  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379077 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 30379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 17942898 - 17943176
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  17942898 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa--cc 17942995  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942996 ttttagatgatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 17943095  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17943096 agccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattaccaattatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 17943176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6785379 - 6785102
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6785379 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 6785280  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785279 ttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 6785180  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6785179 agccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca---accaattatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 6785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8178524 - 8178250
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||     
T  8178524 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttaggttttgaatcgtttcaaacaagtgcttttaa 8178425  T
Q  234 aggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 333  Q
    |||| || |  ||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8178424 aggatgacggtgatgatttgaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 8178325  T
Q  334 atttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8178324 atttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgatt 8178250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17428513 - 17428273
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17428513 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtatttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaagatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 17428414  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17428413 agaacattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17428314  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428313 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17428273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 2707356 - 2707599
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  2707356 tcctttaagttccaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 2707455  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2707456 caaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagca 2707555  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707556 attaccaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 2707599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 10256102 - 10256377
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  10256102 tggtcctttaagtttcaaaaatttcaaacaagctctttaagtttcaaaagccccaaacaagtctttttagttttcgaatcgttttaaacaagttctttta 10256201  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| || |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10256202 gaggatgacggtgatgattgagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacca 10256301  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256302 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 10256377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26231208 - 26230933
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26231208 tggtcctttaagtttcaagaatttcaaacaagtctttgaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcctttcaaacaagtcatttta 26231109  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26231108 gaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagcca 26231009  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26231008 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaactaccaactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgatt 26230933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 9382416 - 9382659
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagatt--attcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  || |  ||||||||||||| ||    
T  9382416 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagcccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgaattgattcagatgatagaaa 9382515  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9382516 caaagagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 9382615  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9382616 attaccaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgatt 9382659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 16193177 - 16193450
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16193177 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaattcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 16193276  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16193277 ggatgatggtgatgattcagatgataacaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaa 16193376  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16193377 tttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattttatctgcattagaacttgtttgaaacgatt 16193450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Original strand, 26936503 - 26936727
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  26936503 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatctttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagca 26936602  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26936603 acaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaac 26936702  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26936703 aattatcaactatgctatctacaat 26936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 2390162 - 2390405
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||||||||    
T  2390162 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgatttagatgatagcaa 2390261  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2390262 caaatagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 2390361  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390362 attaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 2390405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 1077094 - 1077377
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1077094 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaaatttaaaaagtcatgaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcc 1077193  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattatt---caccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 324  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1077194 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcatcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgtt 1077293  T
Q  325 aggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  1077294 aggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttatttgaaacgatt 1077377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 11133741 - 11134014
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| |||||||||||  |||    |||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11133741 tcctttaagtttcaaaagtcctaaagtggtcctgtaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttaattttttaatcgtttcaaacaagtcattttagag 11133840  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11133841 gatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 11133940  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttc-aaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11133941 ttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaattaccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgatt 11134014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26196592 - 26196322
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26196592 ctttaactttcaaaagtcccaaacacatactttaactttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagga 26196493  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26196492 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagt-gttgttaggagccagattt 26196394  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatc-aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26196393 agtaccaaagatgagttcacggaagcaattaccaaactatgttatctacaataggacttggttgaaccgatt 26196322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 135 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35224165 - 35223919
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||        ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35224165 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaaagttc--------caaacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttaga 35224074  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35224073 ggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacaatatacacaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctaga 35223974  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaata 389  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35223973 tttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10931395 - 10931149
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||    
T  10931395 tcctttaagtttcaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagataatagcaa 10931296  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgt----catgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaagga 360  Q
     ||||| |||||| |||||||| |    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10931295 taaagaacattatccaccatttctcatgcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaa 10931196  T
Q  361 agcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  10931195 aacaatta-caactatgctatccacattaggacttgtttgatacgatt 10931149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 220 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2598290 - 2598100
Alignment:
Q  220 acaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcac--catttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagt 317  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2598290 acaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaaaagcattatccacaccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagt 2598191  T
Q  318 gggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2598190 gggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 2598100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25820819 - 25820550
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||       
T  25820819 tttaatttacaaaagtcccaaacaagtcgtttaagtttcgaaagtccgaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttgaaacaactccttttagagatt 25820720  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||| |||||| | |||||| ||  ||||| ||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||    
T  25820719 gatggtgatgatttagatgatagtaacaaataacattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttg 25820620  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25820619 gtaccaaacatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacgataggaattgtttgaaacgatt 25820550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 284
Target Start/End: Original strand, 17515004 - 17515123
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  17515004 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 17515103  T
Q  265 caaagagcattattcaccat 284  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  17515104 caaagagcattatccaccat 17515123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376057
Alignment:
Q  322 gttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31376057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612972
Alignment:
Q  351 agttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12612972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17943220 - 17943159
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17943220 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17943159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31376102 - 31376040
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31376102 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31376040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2707643 - 2707582
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707643 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2707582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10256421 - 10256360
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10256421 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttcgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 10256360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12626820 - 12626759
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626820 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12626759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29050456 - 29050395
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050456 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 29050395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 3258764 - 3258824
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258764 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 3258824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12613094 - 12613026
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtt 204  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12613094 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtt 12613026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16193494 - 16193434
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193494 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 16193434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3408373 - 3408310
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408373 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 3408310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612849
Alignment:
Q  330 ccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 12612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30379198 - 30379140
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379198 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30379140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6503902 - 6503841
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6503902 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 6503841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 6785058 - 6785119
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785058 tcctttatgtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6785119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9382703 - 9382642
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382703 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9382642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 12612805 - 12612866
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12612805 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 12612866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 12612928 - 12612989
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612928 tcctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12612989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1077418 - 1077358
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1077418 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtcat 1077358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2390447 - 2390388
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390447 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2390388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 26230891 - 26230950
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26230891 ctttaagttttaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26230950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 25820506 - 25820564
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  25820506 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttaattttttaatcgtttcaaacaa 25820564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 1915300 - 1915361
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1915300 tcctttaagtttccaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatagtttcaaacaagtc 1915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 2598058 - 2598119
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598058 ctttaagttttaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 2598119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Original strand, 8178206 - 8178263
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaaca 222  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8178206 tcctttaagttttaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 8178263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 17428229 - 17428290
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428229 tcctttaaatttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17428290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11134055 - 11133997
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134055 tttaagtttcaaaagtcctaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11133997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 26196281 - 26196339
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26196281 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcggttcaaccaagtc 26196339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Original strand, 26392966 - 26393021
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26392966 tcctctaagtttcaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 26393021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 10931105 - 10931166
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10931105 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaaatacttttagtttttgaatcgtatcaaacaagtc 10931166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16193502 - 16193454
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16193502 caaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 16193454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26196624 - 26196568
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaaca 191  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  26196624 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacacatactttaactttcaaaagtcccaaaca 26196568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10931398 - 10931355
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10931398 tggtcctttaagtttcaaaagtcacaaacaaatccttttagttt 10931355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 12612802 - 12612845
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12612802 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 12612845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2707644 - 2707603
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2707644 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 2707603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6503903 - 6503862
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6503903 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 6503862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12626828 - 12626780
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  12626828 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 12626780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29050464 - 29050416
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  29050464 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 29050416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31376101 - 31376061
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31376101 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 31376061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20813722 - 20813442
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813722 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcttttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 20813623  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813622 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 20813523  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20813522 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 20813442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 50287433 - 50287706
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50287433 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 50287532  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50287533 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaataaagatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaa 50287632  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287633 tttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 50287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Original strand, 19664401 - 19664677
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664401 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 19664500  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19664501 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatg 19664600  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664601 agtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 19664677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 38446347 - 38446616
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446347 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 38446445  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446446 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 38446545  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38446546 ggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 38446616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 135 - 403
Target Start/End: Original strand, 22851863 - 22852131
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22851863 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttttaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 22851962  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22851963 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccata 22852062  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 403  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22852063 tttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttatttgaaa 22852131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36315253 - 36314977
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  36315253 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 36315154  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36315153 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaag 36315054  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315053 agccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 36314977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 31122532 - 31122802
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31122532 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagagga 31122631  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     |||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31122632 tgatagtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagattt 31122731  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31122732 ggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 31122802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20760352 - 20760072
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  20760352 caaaatcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttaaaacaaatcc 20760253  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||||||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20760252 ttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagg 20760153  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20760152 agtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 20760072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20914035 - 20913755
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20914035 caaagtggtcctttaagtttcaaaactcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtcc 20913936  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20913935 ttttaaaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaatagcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagg 20913836  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20913835 agccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 20913755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20922153 - 20921873
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20922153 caaagtggtcctttaagtttcaaaactcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtcc 20922054  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20922053 ttttaaaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaatagcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagg 20921954  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20921953 agccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 20921873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 21656378 - 21656658
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21656378 caaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtctcaaacaagtcc 21656477  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21656478 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttagg 21656577  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21656578 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 21656658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 51562022 - 51562302
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51562022 caaagtggttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtct 51562121  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562122 ttttagaggatgatgatgataattcagatgatagcaaaaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 51562221  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51562222 aggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgatt 51562302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32651101 - 32650821
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||      
T  32651101 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttt 32651002  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32651001 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 32650902  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  32650901 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataatagaacttgtttgaaatgatt 32650821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 1016941 - 1017184
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  1016941 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 1017040  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1017041 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 1017140  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017141 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 1017184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20086590 - 20086315
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20086590 tggtcctttaagtttcaaaagttccagacaagtcctttgagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 20086491  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| | ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086490 gaggatggtggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 20086391  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20086390 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgatt 20086315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 37247821 - 37248096
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37247821 tggtcatttaagtttcaaaaatttcaaagaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 37247920  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     |||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37247921 aaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtca 37248020  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248021 gatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37248096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 129 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45380540 - 45380261
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380540 aaaatggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtactttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 45380441  T
Q  229 tttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 328  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45380440 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatga 45380342  T
Q  329 gccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatc-aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45380341 gccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaattatcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 45380261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 47329455 - 47329176
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  47329455 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc-tttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 47329357  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329356 ttttaaaggatgatgatgatgattaagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 47329257  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  47329256 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgatt 47329176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 147 - 408
Target Start/End: Original strand, 26455461 - 26455722
Alignment:
Q  147 tcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtaga 246  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||    
T  26455461 tcaaaagtcccaaacaagtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggataatggtga 26455560  T
Q  247 ttattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaa 346  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26455561 tgattcagatggtagcaacaaagagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaa 26455660  T
Q  347 aatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26455661 gatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 26455722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 1687551 - 1687791
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||  |||||||||||||||    
T  1687551 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatatagatgatagcaacaa 1687650  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1687651 agatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1687750  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687751 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 1687791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 3697006 - 3697286
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3697006 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagttccaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaaatca 3697105  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697106 ttttagaggaagatgatgatgattcagatgatagcaacaaatagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 3697205  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3697206 agcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattaccaactatactatctacaataggacttgtttgaaaggatt 3697286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 53195874 - 53196154
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  53195874 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtccgaaacaaatcatttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtct 53195973  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53195974 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttagg 53196073  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  53196074 agcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataattaccaactatgttatctacaataagacttctttgaaacgatt 53196154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55164396 - 55164120
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55164396 caaaatcgtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacgagtca 55164297  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55164296 ttttaaaggatgatggtgatgatttagataatagcaacaaagagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttagg 55164197  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55164196 agccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattagcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaac 55164120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 21890036 - 21890310
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21890036 tggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacag-tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcttttta 21890134  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21890135 gaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcta 21890234  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21890235 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaatatgttatctataataggacttgtttgaaacgatt 21890310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 21564395 - 21564636
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||| |    
T  21564395 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaata 21564494  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21564495 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaat 21564594  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564595 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 21564636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35346745 - 35346472
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35346745 caaagtggtcatttaagttt-aaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtca 35346647  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  |||      ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346646 ttttaaaggatgatggtgat------gatgataacaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 35346553  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35346552 agccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 35346472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 48651119 - 48651388
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  48651119 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttcaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttaggttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 48651218  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48651219 gatggtgatgattcagatgataacaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 48651318  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48651319 gtatcaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 48651388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 19268381 - 19268667
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19268381 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 19268480  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||| ||| ||||  ||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268481 ttttagtggatgatggtgatgactcggatgataacaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 19268580  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaacta------tgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||      || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19268581 agccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttattgttatctacattaggacttgtttaaaacgatt 19268667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27071013 - 27070740
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27071013 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttttaagtttcaaaaatcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 27070914  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27070913 ggatgatggtgatgacttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcaga 27070814  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27070813 tttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 27070740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 42016772 - 42017013
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  42016772 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaaca 42016871  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    || || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42016872 aaaagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaat 42016971  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42016972 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 42017013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 157 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1448984 - 1448736
Alignment:
Q  157 caaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagat 256  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  1448984 caaacaagtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagat 1448885  T
Q  257 gatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  1448884 gatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttca 1448785  T
Q  357 aggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  1448784 aggaagcaattaccaactatggta---acaataggacttctttgaaacgatt 1448736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40922435 - 40922166
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  40922435 tttaagtttcaaaagtaccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtcattttagtttttgactcgtttcaaacaagtcattttaaaggat 40922336  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40922335 gatggtgatgattcacatgacagcaacaaagaacattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttg 40922236  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40922235 gtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgatt 40922166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 166 - 401
Target Start/End: Original strand, 12748289 - 12748524
Alignment:
Q  166 cctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaac 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||| ||| ||||||||| |||    
T  12748289 cctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgacggtgatgatttagatgatagtaac 12748388  T
Q  266 aaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaa 365  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12748389 aaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 12748488  T
Q  366 ttatcaactatgctatctacaataggacttgtttga 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748489 ttaccaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 404
Target Start/End: Original strand, 41250786 - 41251022
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||| ||| | |||||| ||||||    
T  41250786 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttcaaggatgatgatgatgatttacatgataacaacaa 41250885  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41250986 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 41251022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10618724 - 10618481
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  10618724 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtctttttagagaataatggtgatgattcagatgatagcaa 10618625  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  10618624 caaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagca 10618525  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618524 attaccaattatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgatt 10618481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 39069624 - 39069866
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||| ||||||||||||||||    
T  39069624 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagatga-gatagtgatgattcagatgatagcaa 39069722  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||    
T  39069723 caaagagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaaca 39069822  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  39069823 attatcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgatt 39069866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 42107341 - 42107100
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  42107341 ctttaagattcaaaagtctcagacaagccgttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 42107242  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  42107241 aagagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaat 42107142  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107141 taccaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgatt 42107100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35608374 - 35608132
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||| ||||||||||||    
T  35608374 tcctttaagtttcaaaattcccaaacaagtct-tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggattatgatgatgatttagatgatagcaa 35608276  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35608275 caaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaacca 35608176  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35608175 attaccaattatgctatctacaataggacttatttgaaacgatt 35608132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33473503 - 33473240
Alignment:
Q  145 tttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgta 244  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||      
T  33473503 tttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggt 33473404  T
Q  245 gattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacca 344  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  33473403 gatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtacca 33473304  T
Q  345 aaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || || |  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33473303 aagataaaatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgatt 33473240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 50977761 - 50977984
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  50977761 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 50977860  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50977861 caaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 50977960  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  50977961 actaccaactatgctatctacaat 50977984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 51080893 - 51081116
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  51080893 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 51080992  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51080993 caaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 51081092  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  51081093 actaccaactatgctatctacaat 51081116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50365132 - 50364908
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||    
T  50365132 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagattatagca 50365033  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50365032 acaaagagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagc 50364933  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||    
T  50364932 aattaccaactatgttatctacaat 50364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 53926220 - 53925980
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||    
T  53926220 tttaagtttcaaaagtctaaaacaaatctttttagtttttgaaccgtttcaaacaaatctttctagaggatgattgtgatgattcagatgatagcaacaa 53926121  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  53926020 accaactatactatctacaatatgacttatttgaaatgatt 53925980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 52821334 - 52821050
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52821334 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagag 52821235  T
Q  236 gac------------gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgt 323  Q
    ||             ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52821234 gatcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgt 52821135  T
Q  324 taggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52821134 taggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgatt 52821050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 135 - 345
Target Start/End: Original strand, 44152567 - 44152777
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152567 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 44152666  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44152667 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcaga 44152766  T
Q  335 tttggtaccaa 345  Q
    |||||||||||    
T  44152767 tttggtaccaa 44152777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 51475492 - 51475267
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattat--tcagatgatagc 262  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  51475492 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatgatcagatgatagc 51475393  T
Q  263 aacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaag 362  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51475392 aacaaagaccattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaag 51475293  T
Q  363 caattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  51475292 caattaccaactatgctatctacaat 51475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 44798166 - 44798407
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaattt-agtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaac 265  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |  ||| ||||| |||||||||||    
T  44798166 ctttaagtttcaaaagtcctaaacatgtcctttttagtttttgaatcgtttcaaacacgtccttttagaggataacggtgatgattcatatgatagcaac 44798265  T
Q  266 aaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaa 365  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44798266 aaagagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaa 44798364  T
Q  366 ttatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798365 ttaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 44798407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 381
Target Start/End: Original strand, 28699582 - 28699798
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  28699582 tcctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagccctttaagaggatgatggtgatgattaagatgatagcaa 28699681  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28699682 caaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagca 28699781  T
Q  365 attatcaactatgctat 381  Q
    |||||| |||| |||||    
T  28699782 attatctactaagctat 28699798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 253 - 408
Target Start/End: Original strand, 33151681 - 33151836
Alignment:
Q  253 agatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33151681 agatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattag 33151780  T
Q  353 ttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151781 ttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33151836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 216 - 408
Target Start/End: Original strand, 29677424 - 29677616
Alignment:
Q  216 tcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaa 315  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29677424 tcaaacaagtccttttagagaatgatggtgatgatttagattatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaa 29677523  T
Q  316 gtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29677524 atgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgatt 29677616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Original strand, 34019409 - 34019580
Alignment:
Q  217 caaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  34019409 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaag 34019508  T
Q  317 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34019509 tgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattatcaactatgctatctacaat 34019580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 332
Target Start/End: Original strand, 47473127 - 47473294
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||    
T  47473127 tcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggataacggggatgattcagatgatagcaa 47473226  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47473227 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 250 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 38924157 - 38924003
Alignment:
Q  250 ttcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaat 349  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  38924157 ttcatatgatagcaacaaagagcgttattcattatttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagat 38924058  T
Q  350 gagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38924057 aagttcaacgaagcaattaccaactattttatctacgataggacttgtttgaaac 38924003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33151910 - 33151819
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151910 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33151819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42641394 - 42641295
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  42641394 ctttaagtttcaaaagtcccaaataaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgatgatggtgataattcagatgatagcaaca 42641295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31122847 - 31122785
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122847 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31122785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42641293 - 42641199
Alignment:
Q  294 ttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  42641293 ttaataagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacttggctatatacaat 42641199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21564680 - 21564619
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564680 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21564619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 35346428 - 35346491
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346428 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 35346491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1017228 - 1017167
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017228 tcctttaagtttcaaaagtcccatacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1017167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21656702 - 21656641
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656702 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21656641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 27070696 - 27070757
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27070696 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27070757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 42107056 - 42107117
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107056 tcctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42107117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 45380216 - 45380277
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380216 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 45380277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50287750 - 50287689
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287750 tcctttaagtttcaaaagtctcatacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 50287689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 20760028 - 20760091
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760028 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 20760091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 20813398 - 20813461
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813398 tcctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 20813461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26455766 - 26455703
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455766 tcctttaagtttcaaaagtctcaaccaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 26455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 38923958 - 38924016
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38923958 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 38924016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 40922125 - 40922183
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922125 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 40922183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19268711 - 19268650
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19268711 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttattttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 19268650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 20086271 - 20086332
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086271 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20086332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21890354 - 21890293
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890354 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21890293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37248140 - 37248079
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248140 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtacttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37248079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 28775436 - 28775487
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28775436 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaa 28775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39069910 - 39069847
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39069910 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 39069847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 47329132 - 47329195
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47329132 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttccaacaagtcat 47329195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 55164072 - 55164135
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  55164072 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttaatttttgaattgtttcaaataagtcat 55164135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48651429 - 48651371
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48651429 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48651371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1687835 - 1687774
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1687835 tcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 1687774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 20913714 - 20913771
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913714 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 20913771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 20921832 - 20921889
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20921832 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 20921889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29677660 - 29677603
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaaca 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  29677660 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccgtttagtttttcaatcgtttcaaaca 29677603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 33473199 - 33473256
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473199 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 33473256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44152855 - 44152794
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152855 ctttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 44152794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 52821006 - 52821067
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52821006 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtctttttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 52821067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53196197 - 53196137
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53196197 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttag-ttttgaatcgtttcaaagaagtc 53196137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 53925939 - 53925999
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53925939 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaataagtcat 53925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44798449 - 44798390
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798449 ctttaagtttcaaaattctcatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 44798390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 1448691 - 1448753
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1448691 atcctttaagtttcaaaagtaccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtc 1448753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3697331 - 3697269
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3697331 atcctttaagttttaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcctttcaaacaagtc 3697269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 10618440 - 10618498
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618440 tttatgtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 10618498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 35608091 - 35608149
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35608091 tttaagtttcaaaaatgtcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 35608149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39069912 - 39069870
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39069912 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 39069870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41251070 - 41251009
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41251070 tcctttaagtttcaaaggtcccaaataagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 41251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42017055 - 42016994
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42017055 ctttaaatttcaaaagtttcaaacaggtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 42016994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 32650777 - 32650837
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32650777 tcctttaagtttcaaaagtttcaaacaattctttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 32650837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51562346 - 51562286
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51562346 tcctttgagtttcaaaagtctcaagcaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51562286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38446660 - 38446597
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446660 tcctttaagttttaaaagttccaaagaagtgcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 38446597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 20760027 - 20760068
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20760027 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 20760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 50977758 - 50977801
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50977758 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 50977801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 50978029 - 50977990
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50978029 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagt 50977990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 51080890 - 51080933
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51080890 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 51080933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51081161 - 51081122
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51081161 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagt 51081122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 51475215 - 51475257
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51475215 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 51475257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52821336 - 52821294
Alignment:
Q  163 aatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagttt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  52821336 aatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 52821294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 19228937 - 19228990
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttca 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||    
T  19228937 tcctttaagtttcaaaagtcccaaagtgatcattttagtttttgaatcgtttca 19228990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19664724 - 19664664
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19664724 tcctttaagtttcaaaaatttcaaataagtctttttagtttttgaat-gtttcaaacaagtc 19664664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 26455478 - 26455519
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  26455478 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagttt 26455519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 27070695 - 27070736
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27070695 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 27070736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 39069623 - 39069664
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39069623 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 39069664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Original strand, 47329129 - 47329166
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47329129 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 47329166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 12748280 - 12748328
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12748280 caaagtggacctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 12748328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 20086263 - 20086311
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  20086263 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagttt 20086311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 20913703 - 20913751
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20913703 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagttt 20913751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 20921821 - 20921869
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20921821 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagttt 20921869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21656710 - 21656662
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21656710 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 21656662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21890362 - 21890314
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  21890362 caaaatggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagttt 21890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50365131 - 50365091
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50365131 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 50365091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 117)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 47281407 - 47281125
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  47281407 caaagtggtcctttaagtttcaaaaatctcaatcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 47281308  T
Q  228 ttttagaggacg--atgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 325  Q
    |||||||||| |  |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281307 ttttagaggatgtgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 47281208  T
Q  326 ggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281207 ggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47281125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Original strand, 44544276 - 44544550
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44544276 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 44544375  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44544376 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccata 44544475  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544476 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 44544550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30798649 - 30798369
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  30798649 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaatagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 30798550  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798549 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 30798450  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30798449 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgatt 30798369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 47271851 - 47272121
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47271851 ctttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagga 47271950  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47271951 tgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattc 47272050  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272051 ggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47272121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 137 - 409
Target Start/End: Original strand, 47219014 - 47219286
Alignment:
Q  137 cctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagg 236  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47219014 cctttaagtttcaaacgtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagg 47219113  T
Q  237 acgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatt 336  Q
    | ||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47219114 atgatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatt 47219213  T
Q  337 tggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219214 tagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 47219286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1469767 - 1469494
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469767 gtcctttaagtttcaaaagtcccgaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 1469668  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    | | ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469667 gaatgatggtgatgattcatatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 1469568  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469567 tttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 1469494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 48628672 - 48628945
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48628672 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 48628771  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| |||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48628772 ggatgatagtgatgatttagatgatagaaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaa 48628871  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628872 tttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 48628945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27364620 - 27364340
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27364620 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 27364521  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364520 ttttagaggatgatgatgacgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 27364421  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27364420 agccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgatt 27364340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11476832 - 11476557
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11476832 tggtcctttaagttttaaaagtcccaaaaaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 11476733  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476732 aaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 11476633  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476632 gatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11476557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35600398 - 35600123
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35600398 tggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 35600299  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     |||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600298 aaggatgatggtaaagattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcca 35600199  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35600198 tatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 35600123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11050542 - 11050262
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11050542 caaattggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaatgtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 11050443  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11050442 ttttagaggatgctggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagg 11050343  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050342 aggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaaatatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11050262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 30876156 - 30876399
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  30876156 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 30876255  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30876256 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagca 30876355  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30876356 attaccaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgatt 30876399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 31684378 - 31684135
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  31684378 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaa 31684279  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31684278 caaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 31684179  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684178 attaccaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31684135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 38427841 - 38427564
Alignment:
Q  130 aaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatt 229  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38427841 aaatcgtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtcctt 38427742  T
Q  230 ttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 329  Q
    ||||| || ||||  | | ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427741 ttagatgatgatgatg-tgatttagattatagcaacaaagagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 38427643  T
Q  330 ccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38427642 ccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgatt 38427564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 7335920 - 7336199
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7335920 caaaatcgtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcc 7336019  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| ||||  |||  ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7336020 ttttaaaggataatgatgatgatttagatgatagcaacaaatagtattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 7336119  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7336120 agccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaatagaac-tgtttgaaacgatt 7336199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8162993 - 8162717
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||     
T  8162993 caaagtggtcttttaagtttcaaaagccccaaacaagtcttttaagtttcaaaagttgcaaacaagtccttttagtttttaaatcttttcaaacaaatcc 8162894  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8162893 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 8162794  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8162793 agccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 8162717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37394278 - 37393999
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  37394278 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt-aaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcc 37394180  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    | |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37394179 tcttagagtatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttagg 37394080  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394079 agtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37393999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 23842202 - 23842445
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  23842202 tcctttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 23842301  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23842302 caaagagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagca 23842401  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842402 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 23842445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45723762 - 45723492
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45723762 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaagaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 45723663  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45723662 tgatggtgattatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattt 45723563  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45723562 ggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattactaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 45723492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 42979612 - 42979339
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42979612 gtcctttaagtttcaaaagttccaaataagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttaga 42979513  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42979512 ggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcaga 42979413  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42979412 tttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaattaccaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgatt 42979339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 145 - 404
Target Start/End: Original strand, 4923093 - 4923352
Alignment:
Q  145 tttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgta 244  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  4923093 tttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaactagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggt 4923192  T
Q  245 gattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacca 344  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4923193 gatgattcaaatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtacca 4923292  T
Q  345 aaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4923293 aagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 41139685 - 41139409
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41139685 tcctttaagtttcaaaagccccaaacaaattctttaagtttcaaaagttccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttatag 41139586  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41139585 gatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagat 41139486  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaac----tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41139485 ttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacgatt 41139409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 47294535 - 47294292
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||  |||||||||||    
T  47294535 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattttgatgatagcaa 47294436  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47294435 taaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagca 47294336  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294335 attaccaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47294292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43968533 - 43968260
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43968533 gtcctttaagtgtcaaaagtcccaaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacgagtccttttaga 43968434  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  43968433 ggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaa 43968334  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968333 tttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 43968260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 18353004 - 18353284
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18353004 caaagtggtcatttaagtttcgaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 18353103  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18353104 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttagg 18353203  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18353204 agtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattaccaactatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgatt 18353284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30972182 - 30971942
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||    
T  30972182 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagtaacaa 30972083  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 30971942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43753050 - 43752777
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  43753050 gtcctctaaatttcaaaagtctcaaagtggtcctttaagtttcaaaagcccaaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttaaaacaaattcttttaga 43752951  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43752950 ggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcaga 43752851  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752850 tttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 43752777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 29248239 - 29248482
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  29248239 tcctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 29248338  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||    
T  29248339 caaagagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatca 29248438  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29248439 attaccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaatgatt 29248482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 47119888 - 47120133
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  47119888 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 47119987  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47119988 caaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagca 47120087  T
Q  365 attatcaac--tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47120088 attaccaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgatt 47120133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 409
Target Start/End: Original strand, 33884222 - 33884460
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  |||      |||||||||||    
T  33884222 tcctttaagtttcaaaagtaccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttggaggatgatggtgat------gatgatagcaa 33884315  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33884316 caaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 33884415  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33884416 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattt 33884460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44800691 - 44800415
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||     
T  44800691 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaactaatcc 44800592  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44800591 ttttagtggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaggaacattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 44800492  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44800491 aaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattaccaactatgttatctacaacaggacttgtttgaaac 44800415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 40851180 - 40851414
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||         ||||||||    
T  40851180 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgat---------gatagcaa 40851270  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40851271 caaagagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagca 40851370  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40851371 attaccaactattctacctacaataggacttgtttgaaacgatt 40851414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 221163 - 221415
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221163 gtcctttaactttcaaaagtcccaaacaattcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 221262  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||                     ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221263 ggatgatgttgatgatttagatgatagcaacaaag---------------------tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccaga 221341  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221342 tttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 221415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 47579331 - 47579091
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  47579331 tcctttaagtttttaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacatgtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 47579232  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc- 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  47579231 caaagagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 47579132  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47579131 aattaccaattatgctatctataataggacttgtctgaaac 47579091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 37354501 - 37354284
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||    
T  37354501 tttaagttacaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatg---atgattcagatgatagcaacaa 37354405  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    | | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37354404 acaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37354305  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  37354304 accaactatgctatctacaat 37354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 249 - 408
Target Start/End: Original strand, 41113358 - 41113517
Alignment:
Q  249 attcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41113358 attcagatgatagcaacaaagagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaata 41113457  T
Q  349 tgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41113458 tgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 41113517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3797755 - 3797544
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||      ||||||||||||||||||    
T  3797755 ctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttac----acgatg------attcagatgatagcaaca 3797666  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3797665 aagagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 3797566  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3797565 tatcaactatgctatctacaat 3797544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 361
Target Start/End: Original strand, 40520776 - 40521011
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaa--gtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||   ||  ||  ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40520776 caaagtggtcctttaagtttcgaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagcttttgaattgtttcaaacaagt 40520875  T
Q  226 cattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 325  Q
    | |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40520876 ccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgtta 40520975  T
Q  326 ggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40520976 ggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 328
Target Start/End: Original strand, 39033928 - 39034122
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39033928 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttaa 39034027  T
Q  234 aggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 328  Q
    |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034028 aggatgatggtgatcatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960641
Alignment:
Q  281 ccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgcta 380  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  381 tctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacgatt 2960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 232 - 388
Target Start/End: Original strand, 27774072 - 27774228
Alignment:
Q  232 agaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 331  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27774072 agaggatgatggtgataattcagataatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagcc 27774171  T
Q  332 agatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27774172 agatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 27774228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 311
Target Start/End: Original strand, 43024983 - 43025155
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || | || |||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43024983 tttaagtttcaaaagtttcaaataagttctctaagattcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 43025082  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaatt 311  Q
    ||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43025083 gatggttatgattcagatgatagcaacaaagagcaatatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 42888772 - 42888901
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| |||| |||||||    
T  42888772 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagattatagcaa 42888871  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgct 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42888872 caaagagcattatccaccatttgccatgct 42888901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45233702 - 45233574
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||| | ||||||| ||    
T  45233702 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatgatttaaatgatagtaa 45233603  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgc 293  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  45233602 caaatagcattatccactatttgtcatgc 45233574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Original strand, 29739709 - 29739829
Alignment:
Q  196 aatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgctt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  29739709 aatttagtttttgaatcgtttcaaacaattccttttagaggatgataatgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcct 29739808  T
Q  296 aaaaagatgactaattttaagt 317  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  29739809 -aaaagatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2960861 - 2960768
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2960861 tggtcctttaagtttcaaaagtcctaaacaattcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttcaatcgtttcaaacaagtc 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44551043 - 44550938
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44551043 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctgtttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaa 44550944  T
Q  265 caaaga 270  Q
    ||||||    
T  44550943 caaaga 44550938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47120178 - 47120116
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47120178 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47120116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 2960597 - 2960658
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960597 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2960658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 38427523 - 38427581
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427523 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38427581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 11476513 - 11476574
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476513 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11476574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 31684091 - 31684152
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684091 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31684152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 37393955 - 37394016
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37393955 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37394016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41113561 - 41113500
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41113561 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 41113500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 43752733 - 43752794
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752733 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 43752794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47219329 - 47219268
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47219329 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 47219268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 47294248 - 47294309
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294248 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47294309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48628989 - 48628928
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628989 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48628928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30876443 - 30876383
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876443 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 30876383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 408
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42888989
Alignment:
Q  356 aaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 42888989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 35600079 - 35600142
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600079 tcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 35600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23842486 - 23842428
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842486 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23842428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31793900 - 31793822
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttt 206  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  31793900 caaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttt 31793822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 1469450 - 1469511
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469450 tcctttaagtttcaaaggtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1469511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 11050218 - 11050279
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11050218 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttcagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11050279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42889033 - 42888972
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42889033 tcctttaagtttcaaaagtttcaaataagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42888972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 45723450 - 45723511
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45723450 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcat 45723511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 8162671 - 8162730
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162671 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 8162730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 41139368 - 41139426
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139368 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcc-tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41139426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 43968219 - 43968277
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968219 tttaagtttcaaaggtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 43968277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 47281080 - 47281142
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281080 atcctttaagcttcaaaagactcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47281142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 221459 - 221398
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  221459 tcctttaagtttcaaaagttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 221398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5106225 - 5106168
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaaca 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5106225 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 5106168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44544593 - 44544532
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44544593 tcctttaagtttctaaagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 44544532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 47579044 - 47579104
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47579044 tcctttaagtttcaaaagtc-caaacaagtcattttagtttttgaattgtttcagacaagtc 47579104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 30798327 - 30798383
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30798327 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttgttgaatcgtttcaaacaa 30798383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39241884 - 39241836
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtc 184  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241884 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtc 39241836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 312
Target Start/End: Original strand, 29739619 - 29739713
Alignment:
Q  217 caaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattt 312  Q
    |||||||||||||||| |||| ||    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  29739619 caaacaagtcattttaaaggatgagaatgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcct-aaaagatgactaattt 29739713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 242
Target Start/End: Original strand, 41107269 - 41107344
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatg 242  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41107269 ctttaaatttcaaaagtctcaaataagtctttatagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatg 41107344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18353328 - 18353267
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaa--agtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18353328 ctttaagtttcaaatgagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 18353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Original strand, 29739568 - 29739634
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaattta 201  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29739568 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtcatttta 29739634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40851458 - 40851397
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40851458 tcctttaagtttcaaaaatttcaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtc 40851397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42888937 - 42888900
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888937 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 42888900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5106233 - 5106185
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5106233 caaaatcgtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 5106185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106181
Alignment:
Q  353 ttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataaga-atgtttgaaacgatt 5106181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Original strand, 25801523 - 25801573
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25801523 tcctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtt 25801573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 30971919 - 30971961
Alignment:
Q  186 caaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971919 caaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 30971961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 44800370 - 44800428
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44800370 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 44800428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47272162 - 47272104
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272162 tttaagtttcaaaattctaaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47272104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7336243 - 7336186
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaaca 222  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  7336243 tcctttaagtttcaaaaattccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaaca 7336186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Original strand, 27364296 - 27364353
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaaca 222  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27364296 tcctttaagttttaaaagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 27364353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 34378564 - 34378605
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34378564 gtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaatccttttagttt 34378605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 27773033 - 27773089
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaac 221  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27773033 tcctttaaatttcaaaagttccaaactagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 27773089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Original strand, 43025162 - 43025210
Alignment:
Q  159 aacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagttttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  43025162 aacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcgttttagttttt 43025210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 319
Target Start/End: Original strand, 12583313 - 12583352
Alignment:
Q  280 accatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgg 319  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12583313 accatttttcatgcgtaaaaagatgactaattttaagtgg 12583352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 30876153 - 30876196
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30876153 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 30876196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Original strand, 43752726 - 43752773
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  43752726 aaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 43752773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Original strand, 29248237 - 29248279
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  29248237 ggtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 29248279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Original strand, 34378565 - 34378615
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtt 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  34378565 tcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtt 34378615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 42979299 - 42979356
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42979299 tttaagtttcaaaattct-aaacaagtccttttagtttgtgaatcgtttcaaacaagtc 42979356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Original strand, 44544304 - 44544346
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  44544304 ggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 44544346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27692064 - 27692011
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27692064 ctttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 27692011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33884501 - 33884440
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884501 ctttaagttttaaaagtttcaaccaagtccttttcgtttttaaatcgtttcaaacaagtcat 33884440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 40851179 - 40851220
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40851179 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 40851220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45233703 - 45233662
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45233703 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 45233662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48628990 - 48628949
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48628990 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 48628949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 11050210 - 11050258
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  11050210 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttcagttt 11050258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 11476505 - 11476553
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  11476505 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 11476553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30876451 - 30876403
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30876451 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 30876403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 31684083 - 31684131
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  31684083 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 31684131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31684386 - 31684338
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  31684386 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 31684338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 35600071 - 35600119
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  35600071 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagttt 35600119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 37393947 - 37393995
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  37393947 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 37393995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41113569 - 41113521
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  41113569 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagttt 41113521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 43025168 - 43025208
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43025168 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcgttttagttt 43025208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43968511 - 43968463
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  43968511 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 43968463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 47119880 - 47119928
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  47119880 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 47119928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33808054 - 33807781
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33808054 gtcctttaattttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 33807955  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33807954 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaa 33807855  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807854 tttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33807781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8882294 - 8882014
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  8882294 caaagtggtcctttaagcttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaatcaagtcc 8882195  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882194 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 8882095  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8882094 agccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctagaataggacttgtttgaaacgatt 8882014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 134 - 408
Target Start/End: Original strand, 42273666 - 42273942
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42273666 ggtcctttaagttttaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttag 42273765  T
Q  234 aggacgatgtag--attattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 331  Q
    |||| ||||  |  || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42273766 aggatgatggtgtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtc 42273865  T
Q  332 agatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273866 agatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 42273942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17847369 - 17847097
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17847369 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttata 17847270  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847269 ggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcct-aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 17847171  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847170 tttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17847097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11795435 - 11795155
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11795435 caaagtggtcctttaagtatcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 11795336  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795335 ttttagaggatgatggtgatgattaaaatgaaagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 11795236  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11795235 agccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgatt 11795155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28812567 - 28812288
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28812567 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtactttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 28812468  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28812467 ttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagg 28812369  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28812368 agccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28812288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 39995447 - 39995168
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39995447 aaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaatcaaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 39995348  T
Q  229 tttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 328  Q
    ||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39995347 tttagaggatgatgataatgattcagatgatagcaacaaagaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttagga 39995248  T
Q  329 gccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39995247 gccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 39995168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 35929910 - 35930179
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35929910 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcgttttagagga 35930009  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930010 tgatggtgatgattcagatgataacaacaaagagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 35930108  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35930109 ggtaccaaaaatgagttcatggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 35930179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 31590944 - 31591215
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31590944 gtcctttaagtttcaaaagttccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaa-caaattattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaga 31591042  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591043 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 31591141  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591142 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31591215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 128 - 409
Target Start/End: Original strand, 32118574 - 32118855
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||      
T  32118574 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttc 32118673  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||   || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32118674 ttttaaaggatgatgataatgattcagatgatagcaacaaagagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttagg 32118773  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32118774 agccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattt 32118855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Original strand, 28264542 - 28264783
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  28264542 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 28264641  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28264642 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 28264741  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264742 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28264783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 40988533 - 40988773
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40988533 tttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 40988632  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 50542635 - 50542355
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50542635 caaagtggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcagcagtcccaaacaagttcttttattttttgaatcgtttcaaacaagtca 50542536  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50542535 ttttaaaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttagg 50542436  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  50542435 agtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgatt 50542355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4545229 - 4544986
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4545229 tcctttaagttttaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgttccaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 4545130  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  4545129 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagca 4545030  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545029 attaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 4544986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 26017320 - 26017563
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| | ||||||||||    
T  26017320 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgatagcaa 26017419  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26017420 caaatagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 26017519  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017520 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 26017563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 157 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28160205 - 28159954
Alignment:
Q  157 caaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagat 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  28160205 caaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgattcagat 28160106  T
Q  257 gatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28160105 gatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttca 28160006  T
Q  357 aggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28160005 agaaagcaattaccaactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgatt 28159954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 12196345 - 12196609
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12196345 gtcctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaa 12196444  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||| |||||         ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196445 ggatgatttagat---------gaaggcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaga 12196535  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12196536 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 12196609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 14564656 - 14564936
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  14564656 caaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcc 14564755  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14564756 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttagg 14564855  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14564856 agccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 14564936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 31208615 - 31208884
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31208615 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtatcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 31208714  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31208715 ggatgatggtgatgatttagatgttagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgttt----agatgactaattttaagtgggtgttgggagccaga 31208810  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208811 tttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31208884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 48707977 - 48707734
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||| ||| |||||||| |||    
T  48707977 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcattttaaaggatgatggtgatgatttagatgataacaa 48707878  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48707877 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 48707778  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48707777 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagatt 48707734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 139 - 409
Target Start/End: Original strand, 37381717 - 37381987
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||     
T  37381717 tttaattttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcctttcaaaggat 37381816  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    || |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37381817 gacggtgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatg 37381916  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37381917 gtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgattt 37381987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 48149370 - 48149639
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  48149370 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggat 48149469  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48149470 gatgacgatgattcaaatgaaagcaacaaagtgcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttg 48149569  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48149570 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 48149639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33174264 - 33174020
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  33174264 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 33174165  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33174164 caaggagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagca 33174065  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33174064 attaccaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgattt 33174020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 133 - 407
Target Start/End: Original strand, 10588446 - 10588719
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10588446 tggtcctttaagtttcaaaaatcccaaacaagtt-tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtcctttta 10588544  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
     |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10588545 aaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagcca 10588644  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgat 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10588645 gatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgat 10588719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9339407 - 9339124
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  || |    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9339407 caaaatcgtcctttaagtttcaaaagttccacagtcgtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcc 9339308  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9339307 ttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcgacaaagagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 9339208  T
Q  328 agccagatttggtaccaaa---aatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9339207 agccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 9339124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24458872 - 24458632
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  24458872 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataa 24458773  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    | |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24458772 atagcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24458673  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24458672 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 24458632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23135250 - 23135007
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  23135250 tcctttaagtttaaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 23135151  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23135150 caaagaacattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 23135051  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135050 attaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 23135007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 49118508 - 49118751
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||  ||| ||| ||||||||||||    
T  49118508 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaa 49118607  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49118608 aaaatagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagca 49118707  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118708 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 49118751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 2055145 - 2055418
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||       ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2055145 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaa-------agtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 2055237  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    ||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2055238 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttagg 2055337  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2055338 agccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattatcaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 2055418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25734493 - 25734224
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25734493 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 25734394  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25734393 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaataacattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttg 25734294  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25734293 gtacgaaagatgagttcaattaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaatgatt 25734224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 25730108 - 25730380
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25730108 tcctctaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagcccttttagag 25730207  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 335  Q
    || ||||  ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  25730208 gatgatggtgatgatttagataatagcaacaaagaacattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggat 25730307  T
Q  336 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25730308 ttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 25730380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17993291 - 17993018
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17993291 gtcctttaagtttcaaaagttccaaagtcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 17993192  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    | | ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17993191 gaatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaa 17993092  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17993091 tttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgatt 17993018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33693615 - 33693334
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaa-acaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33693615 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaagcaagttctttaagtttcaaaagtcccaagaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtc 33693516  T
Q  227 attttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 326  Q
     ||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33693515 ctttcagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttag 33693416  T
Q  327 gagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33693415 gaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgatt 33693334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 145 - 408
Target Start/End: Original strand, 15984887 - 15985150
Alignment:
Q  145 tttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgta 244  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||      
T  15984887 tttcaaaagtcccaatcaagccctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttgtagaagatgatggt 15984986  T
Q  245 gattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacca 344  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15984987 gatgatttagatgattgcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtacta 15985086  T
Q  345 aaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15985087 aagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgatt 15985150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 23552927 - 23553204
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23552927 tggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcctttta 23553026  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaaga----gcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 328  Q
     |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23553027 taggatgatggtgatgattca-atgatagcaacaaagatcattcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagga 23553124  T
Q  329 gccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23553125 gccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaattatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 23553204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19169036 - 19168816
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19169036 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagatgatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 19168937  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  19168836 accaactatgctatctacaat 19168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 164 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30467252 - 30467004
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatt----ttagaggacgatgtagattattcagatgat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  30467252 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttccttttagaggatgatggtgatgattcagatgat 30467153  T
Q  260 agcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaagg 359  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30467152 agcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaagg 30467053  T
Q  360 aagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30467052 aagaaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 30467004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 50276409 - 50276139
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  50276409 gtcctttaagttttaaaagtctcaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttaaa 50276310  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  50276309 ggatgatggtgatgattcagatgatagtaacaaatagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcaga 50276213  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276212 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 50276139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 205 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 55517389 - 55517186
Alignment:
Q  205 tttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  55517389 tttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatg 55517290  T
Q  305 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55517289 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 55517190  T
Q  405 gatt 408  Q
    ||||    
T  55517189 gatt 55517186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 136 - 408
Target Start/End: Original strand, 22298387 - 22298658
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22298387 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtc-ccaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagag 22298485  T
Q  236 gacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatg-cttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    || ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22298486 gatgatgatgaaga-tcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 22298584  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| || |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22298585 tttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaattaccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgatt 22298658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 408
Target Start/End: Original strand, 44490232 - 44490459
Alignment:
Q  181 agtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattca 280  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||  ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||    
T  44490232 agtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaacaaatagtattatcca 44490331  T
Q  281 ccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgcta 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  44490332 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgata 44490431  T
Q  381 tctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490432 tctacaataggacttgtttgaaacgatt 44490459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 198 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 51371258 - 51371048
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  51371258 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtttttttagaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgccatgtctaa 51371159  T
Q  298 aaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgt 397  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51371158 aaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgt 51371059  T
Q  398 ttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||    
T  51371058 ttgaaacgatt 51371048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19496391 - 19496107
Alignment:
Q  134 ggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaa--gtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttt 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19496391 ggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttt 19496292  T
Q  232 agaggac------------gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgg 319  Q
    ||||||             ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19496291 agaggatcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg 19496192  T
Q  320 gtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19496191 gtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatggtatctacaataggacttgtttgaaac 19496107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 24623045 - 24623268
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  24623045 tcctttaagtttcaaaagtcctagacaagtcattttaatttttgaaccgtttcgaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcaggtgatagcaa 24623144  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24623145 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 24623244  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  24623245 attaccaactatgctatctacaat 24623268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Original strand, 31973533 - 31973731
Alignment:
Q  210 atcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaa 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31973533 atcgtttcaaacaagtccttttcgaagatgatggtaatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaa 31973632  T
Q  310 ttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31973633 ttttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 31973731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 216 - 408
Target Start/End: Original strand, 5227338 - 5227530
Alignment:
Q  216 tcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaa 315  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5227338 tcaaacaagtctttttggaggaagattgtgatgattcagatgatagcaacgaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 5227437  T
Q  316 gtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227438 gtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 5227530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 32317818 - 32318093
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| |||    ||||||||| ||||||  ||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  32317818 tttaagtttcaaaagtcccaaggtgatcctttaaatttcaa--gtctcaaataagtccttttactttttgaatcgtttcaaacaaatctttttagaggat 32317915  T
Q  239 gatgtagattattcagatgat--------agcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagc 330  Q
    ||||  |||||||||||||||        ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32317916 gatggtgattattcagatgataggctgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaga 32318015  T
Q  331 cagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32318016 cagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaatgatt 32318093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 39699942 - 39700185
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||   ||| ||||||||||||  ||    
T  39699942 tcctttgagtttcaaaagtttcaaataaatccttttaatttttgaatcgtttcaaataagtctttttagaggatgatagtgatgattcagatgatattaa 39700041  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39700042 caaagagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaaca 39700141  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39700142 attaccaattatgttatctataataagacttgtttgaaacgatt 39700185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42549862 - 42549643
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42549862 tttaagtttcaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttagaggatgatggagatgattcagatgatagcaacaa 42549763  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  42549762 agagcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaatt 42549664  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  42549663 accaactatgttatctacaat 42549643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 56555424 - 56555203
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56555424 caaaatcgtcatttaagtttcaaaagtcccaaagtgaccctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtca 56555325  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattat---tcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 324  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  56555324 ttttagaggatgatgatgatgatgattcagataatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtc 56555225  T
Q  325 aggagccagatttggtaccaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  56555224 aggagccagatttggtaccaaa 56555203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30141350 - 30141109
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  || | |||   ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||  | |||||||||||||    
T  30141350 tcctttaagtttcaaaaatcacaaacaagtcctttaaatttc--aatagtttcaaacaattcgttttagaggatgatggtgatgctgcagatgatagcaa 30141253  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  30141252 caaagagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagca 30141153  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30141152 attaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgatt 30141109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 48551990 - 48551765
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||          
T  48551990 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatg------------atga------ 48551909  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  48551908 caaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagca 48551809  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48551808 attaccaaccatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 48551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Original strand, 44490077 - 44490232
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44490077 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaga 44490176  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtca 290  Q
    |||  |||  ||| ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  44490177 ggataatggtgatgatttagatgatagcaaaaaatagtattatccaccatttgtca 44490232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20534386 - 20534288
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20534386 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaattcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 20534288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19496419 - 19496321
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19496419 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttag 19496321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534305
Alignment:
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgatt 20534305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31617706 - 31617613
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttt 231  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31617706 ctttaagtttcaaaagtctcatacaagtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttccaaacaagtcttttt 31617613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 48551721 - 48551784
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48551721 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 48551784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51371352 - 51371262
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51371352 tggtcatttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcct--aagtttcaaaagttccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51371262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5227572 - 5227513
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227572 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 5227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 11795111 - 11795174
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795111 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 11795174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15985194 - 15985131
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985194 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 15985131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25730424 - 25730361
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25730424 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 25730361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 28812243 - 28812305
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28812243 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28812305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 8881970 - 8882031
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8881970 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8882031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28264827 - 28264766
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264827 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28264766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31591259 - 31591198
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591259 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacgagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31591198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44490503 - 44490442
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490503 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 44490442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 49118795 - 49118734
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118795 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 49118734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 30466960 - 30467020
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466960 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 30467020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22298702 - 22298643
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaag 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22298702 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaag 22298643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 33807739 - 33807798
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807739 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33807798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48149681 - 48149622
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149681 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 55517142 - 55517205
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517142 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 55517205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 17847053 - 17847114
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17847053 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttatagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17847114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26017607 - 26017546
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26017607 tcctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttgtagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26017546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31973776 - 31973715
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973776 atcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 31973715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42273986 - 42273925
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273986 tcctttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42273925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 50276095 - 50276156
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276095 tcctgtaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 50276156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 39995124 - 39995184
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39995124 tcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 39995184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 9339080 - 9339143
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9339080 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaattccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcat 9339143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17847405 - 17847338
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtc 195  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17847405 caaagtggtcctttaggtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc 17847338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23553248 - 23553185
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553248 tcctttaagttttaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23553185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 33452368 - 33452427
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452368 ctttaagtttcaaaaattccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33452427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 23134962 - 23135024
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23134962 atcctttaagtttcaaaagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23135024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 50542311 - 50542369
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  50542311 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaa 50542369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1425350 - 1425269
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  1425350 tttaagttttaaaagttccaaacaaatcctttaagtttcaaaaatcccaaataagttcttttagtttttgaatcgtttcaaa 1425269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 4544942 - 4545003
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544942 tcctttaagtttcaaaggtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 4545003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12196653 - 12196592
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12196653 tcctttaagcttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 12196592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32118899 - 32118838
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32118899 atcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagt 32118838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14564978 - 14564919
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14564978 ctttaaatttcaaaactctcaaacaaatccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14564919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 19496058 - 19496120
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19496058 atcctttaaatttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 19496120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 24458595 - 24458649
Alignment:
Q  172 agtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458595 agtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 24458649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31208925 - 31208867
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208925 tttaagtttcaaaagtccaaaacaactccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31208867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 33173980 - 33174038
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33173980 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttttcaaatcgtttcaaacaagtc 33174038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10588764 - 10588703
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10588764 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttaatttttggatcgtttcaaacaagtc 10588703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 28159910 - 28159971
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28159910 tcctttaagtttcaaaaatctcaaacaagttcttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 28159971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 48707690 - 48707751
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48707690 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagattttgaatcttttcaaacaagtc 48707751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2055459 - 2055399
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2055459 tttaagttttaaaagttccaaacaagtcgtttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 2055399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35930223 - 35930163
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930223 tcctttaagtttcaaaggttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 35930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37382027 - 37381967
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37382027 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttttgtttttaaatcatttcaaacaagtcat 37381967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 25734182 - 25734241
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25734182 ctttaagttttaaaagtctcaaacaactctagttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 25734241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8433868 - 8433822
Alignment:
Q  188 aacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8433868 aacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 8433822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 30141068 - 30141126
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141068 tttaagtttcaaaaattctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30141126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33174265 - 33174224
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33174265 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 33174224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 33693290 - 33693351
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33693290 tcctttaaatttcaaaagttccaaataagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 33693351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22298710 - 22298662
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22298710 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 22298662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 35929929 - 35929977
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35929929 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 35929977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48551998 - 48551950
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48551998 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 48551950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 50542303 - 50542351
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50542303 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 50542351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 30466957 - 30467000
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30466957 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 30467000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32318134 - 32318076
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32318134 ctttaagtttcaaaagtaccaa-caagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 32318076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Original strand, 40988523 - 40988570
Alignment:
Q  129 aaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40988523 aaaatggtcttttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 40988570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9800423 - 9800377
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaat 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9800423 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatctttttagtttttgaat 9800377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10588772 - 10588730
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10588772 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttt 10588730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 56555125 - 56555183
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||  |  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555125 tttaagtttcaaagattccaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 56555183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 56555200 - 56555166
Alignment:
Q  374 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555200 tatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 56555166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 9339079 - 9339120
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9339079 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaattccttttagttt 9339120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 17847045 - 17847086
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctt 169  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17847045 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctt 17847086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25730425 - 25730384
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25730425 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 25730384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28160198 - 28160157
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28160198 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 28160157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40988816 - 40988779
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40988816 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 40988779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 49118507 - 49118548
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49118507 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 49118548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 11795103 - 11795151
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  11795103 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 11795151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15985202 - 15985154
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  15985202 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 15985154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 226
Target Start/End: Original strand, 17993007 - 17993035
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993007 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17993035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 23134963 - 23135003
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23134963 tcctttaagtttcaaaagtttcaaacaaatccttttagttt 23135003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25734475 - 25734427
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25734475 caaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 25734427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 28812244 - 28812284
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28812244 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 28812284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32118898 - 32118858
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32118898 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagttt 32118858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 48551713 - 48551761
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  48551713 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagttt 48551761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50276387 - 50276339
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50276387 caaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 50276339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 513175 - 513447
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  513175 gtcctttaagtttcaaaagtaccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaattattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaga 513274  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513275 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 513373  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513374 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 513447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 35443170 - 35443451
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443170 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35443269  T
Q  227 attttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 326  Q
     ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35443270 cttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttag 35443369  T
Q  327 gagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35443370 gagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 35443451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Original strand, 2533139 - 2533412
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2533139 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaagtcgtcctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 2533238  T
Q  235 ggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaga 334  Q
    ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2533239 ggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaga 2533338  T
Q  335 tttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2533339 tttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 2533412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43806803 - 43806534
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43806803 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 43806704  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  43806703 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagattta 43806604  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43806603 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 43806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 37933539 - 37933782
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  37933539 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 37933638  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37933639 caaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 37933738  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37933739 attaccaactatgctatctacgataagacttgtttgaaacgatt 37933782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 1293356 - 1293626
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1293356 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaaatcacaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaactagtccttttagagga 1293455  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1293456 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagattt 1293555  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1293556 gataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 1293626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24430848 - 24430572
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaa-tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttt 231  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24430848 tggttctttaagtttcaaaagtctcaaacaaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcctttt 24430749  T
Q  232 agaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 331  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  24430748 agaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtg 24430649  T
Q  332 agatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24430648 agatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaattatcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24430572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22684232 - 22683989
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  22684232 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 22684133  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22684132 caaagagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaaca 22684033  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22684032 attaccaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 22683989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 139 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9056607 - 9056343
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9056607 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtt-tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggat 9056509  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9056508 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttg 9056409  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9056408 gtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaac 9056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28707716 - 28707447
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28707716 ctttaagttttaaaagt-tccaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttacagga 28707618  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28707617 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagattt 28707518  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28707517 ggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgatt 28707447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 4649021 - 4649290
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4649021 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagttttcgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 4649120  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  4649121 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttg 4649220  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4649221 gtaccaaagacgagttcaaggaaacaattaccaattatgctatctacaattggacttgtttgaaacgatt 4649290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 38106971 - 38107239
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  38106971 tttaagttttaaaagtttcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtct-tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagatgat 38107069  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107070 gatggtgataatttaaatgatagcaacaaagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 38107169  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38107170 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 38107239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 38633985 - 38633711
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  38633985 caaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 38633886  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  |||      |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38633885 ttttagaggatgatggtgat------gatgatagtaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaga 38633792  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38633791 aatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgatt 38633711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 41536797 - 41536528
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  41536797 tttaagtttcaaaagtctcgaacaagttccttaggtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttgaaacaattcattttagaggat 41536698  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41536697 gatggtgatgatttagatgatagtaacaaagagtatttttcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttg 41536598  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41536597 gtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 41536528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35884671 - 35884431
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  35884671 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataa 35884572  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    | |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35884571 atagcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35884472  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35884471 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 35884431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 440737 - 440980
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  440737 tcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 440836  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    |||||| |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  440837 caaagaacattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagca 440936  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  440937 attaccaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 440980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 259875 - 260117
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  259875 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 259974  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
     ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  259975 gaaagaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 260073  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  260074 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 260117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 656046 - 655804
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  656046 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 655947  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
     ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  655946 gaaagaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 655848  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  655847 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 841781 - 841539
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  841781 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaa 841682  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
     ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  841681 gaaagaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 841583  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  841582 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 841539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 135 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23972571 - 23972296
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23972571 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaagtggtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 23972472  T
Q  235 ggacgat-gtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccattt-gtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23972471 ggatgattggtgatgattcagatgatagcaacaaagagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtca 23972372  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23972371 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 23972296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 42988497 - 42988228
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42988497 ctttaaatttcaaaagtcccaaacaagttctctaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagagga 42988398  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     ||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42988397 tgatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagattt 42988298  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42988297 ggtaccaaatataagttaaatgaagcaattatcaactatattatctacaataggactt-tttgaaacgatt 42988228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28496598 - 28496356
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  28496598 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 28496499  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28496498 caaagagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtatta-gaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 28496400  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496399 attaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28496356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39513610 - 39513339
Alignment:
Q  138 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagga 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39513610 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtccttttagagga 39513511  T
Q  238 cgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 337  Q
     || |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39513510 tgacgatgatgattcagatgatagcaacaaagagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagattt 39513411  T
Q  338 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  39513410 ggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgttatctacattaggacttatttgaaacaattt 39513339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 139 - 408
Target Start/End: Original strand, 33651712 - 33651981
Alignment:
Q  139 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggac 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  33651712 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctgaaacatgtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttagaggat 33651811  T
Q  239 gatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 338  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33651812 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttg 33651911  T
Q  339 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||  ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33651912 gtatgaaagatgagttcaaggaaacaattacaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgatt 33651981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 164 - 404
Target Start/End: Original strand, 12010445 - 12010688
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||| |||||||||||||||    
T  12010445 atccgttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttttggaagatgatggcgatgattcagatgatagca 12010544  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  12010545 acaaagagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaac 12010644  T
Q  364 aattatcaactatgctat---ctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12010645 aattaccaactatgctatctactacaataggacttgtttgaaac 12010688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Original strand, 23935133 - 23935353
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||  ||||||| ||||||    
T  23935133 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattatgatgataacaacaa 23935232  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatctacaat 23935353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 7434783 - 7435006
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  7434783 tcctttaaatttcgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgcttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 7434882  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7434883 caaagagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 7434982  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  7434983 attaccaactatgttatctacaat 7435006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40302135 - 40301894
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  40302135 ctttaagtttaaaaagttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgatgatgatgatgattcagatgatagcaaca 40302036  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  40302035 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaat 40301936  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40301935 taccaactatgctatctacaatatgacttttttgaaacgatt 40301894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 13796989 - 13797228
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  13796989 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 13797088  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13797089 agagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgatacc-aaaatgagttcaaagaagcaatt 13797187  T
Q  368 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13797188 accaactatgctatatacaataggatttgtttgaaacgatt 13797228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Original strand, 29485187 - 29485406
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  29485187 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 29485286  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 367  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  368 atcaactatgctatctacaat 388  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  29485386 accaactatgttatctacaat 29485406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 38208652 - 38208893
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaa 267  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  38208652 tttaaatttcaaaagtctcagacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaacaa 38208751  T
Q  268 agagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaag-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 366  Q
    | | |||||| ||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  38208752 aaaacattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaat 38208851  T
Q  367 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38208852 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 38208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Original strand, 6016101 - 6016325
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||    
T  6016101 atcctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagacgatagca 6016200  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagc 363  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||| || |||||    
T  6016201 acaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagc 6016300  T
Q  364 aattatcaactatgctatctacaat 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  6016301 aattaccaactatgctatctacaat 6016325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 216 - 408
Target Start/End: Original strand, 3875856 - 3876048
Alignment:
Q  216 tcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaa 315  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3875856 tcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgattgcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 3875955  T
Q  316 gtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875956 gtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 3876048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 251 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36400228 - 36400071
Alignment:
Q  251 tcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  36400228 tcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatg 36400129  T
Q  351 agttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36400128 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 36400071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 128 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24193564 - 24193356
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24193564 caaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatactttatgtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgattcgtttcaaacaagtcc 24193465  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24193464 ttttagaggatgat---------tcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagg 24193375  T
Q  328 agccagatttggtaccaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24193374 agccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 273 - 408
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847252
Alignment:
Q  273 attattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  373 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 15847252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36219055 - 36218782
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||| ||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||    
T  36219055 tggttctttaactttcaaaagtcccaaacaagtt-tttaacttttaaaagtcttaaacaagtccttttagtttttgaattatttcaaacaaattctttta 36218957  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||  | ||||  |||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||    
T  36218956 gataatgatgatgatgcttcagatgataacaacaaagaccattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtca 36218857  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  36218856 gatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatcaactatattatctacatcatgacttgtttgaaacgatt 36218782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 333
Target Start/End: Original strand, 8137069 - 8137239
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  8137069 atcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaactccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagca 8137168  T
Q  264 acaaagagca-ttattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 333  Q
    ||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8137169 acaaagaacatttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 242
Target Start/End: Original strand, 9884723 - 9884830
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9884723 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcattttaga 9884822  T
Q  235 ggacgatg 242  Q
    ||| ||||    
T  9884823 ggatgatg 9884830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 15846998 - 15847113
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt-aagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15846998 caaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacatgtc 15847097  T
Q  227 attttagaggacgatg 242  Q
     |||||||||| ||||    
T  15847098 cttttagaggatgatg 15847113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39295432 - 39295289
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  39295432 caaagtggttctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc- 39295334  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattat 277  Q
        |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39295333 ----agaggatgatggtgatgattcaga-gatagcaacaaagatcattat 39295289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 43806490 - 43806553
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806490 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 43806553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3876092 - 3876031
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876092 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 3876031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2533453 - 2533393
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533453 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 2533393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24193191 - 24193131
Alignment:
Q  348 atgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193191 atgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24193131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 36400027 - 36400090
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400027 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 36400090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4649331 - 4649273
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4649331 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 4649273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13797272 - 13797214
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13797272 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaa 13797214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 441024 - 440963
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  441024 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12010736 - 12010675
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12010736 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 12010675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37933826 - 37933765
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933826 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37933765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 260161 - 260098
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260161 tcctttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 260098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 655760 - 655823
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655760 tcctttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 655823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 841495 - 841558
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841495 tcctttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 841558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 22683945 - 22684008
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22683945 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcat 22684008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 23972252 - 23972315
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23972252 tcctttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23972315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9056639 - 9056581
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9056639 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagt 9056581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33652022 - 33651964
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33652022 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33651964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 41536487 - 41536545
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41536487 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 513491 - 513430
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  513491 tcctttaagtttcaaaagtctcaaactagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 513430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38107283 - 38107222
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107283 tcctttaagtttcaaaagtcccaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38107222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35443495 - 35443435
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35443495 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagt 35443435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1293670 - 1293607
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293670 tcctttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 1293607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 28496315 - 28496373
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496315 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28496373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 38633670 - 38633727
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633670 tttaagtttcaaaagtctcaaacaggtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 38633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 36218741 - 36218801
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36218741 tttaactttcaaaagttctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 36218801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 24430531 - 24430589
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24430531 tttaagtttcaaaaatccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 24430589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 35884394 - 35884448
Alignment:
Q  172 agtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884394 agtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35884448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 9056299 - 9056356
Alignment:
Q  169 ttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9056299 ttaagtttcaaaagtttcaaacaaatcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 9056356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15847296 - 15847235
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847296 tcctttaagtttcaaaagctccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 15847235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 24193087 - 24193148
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24193087 tcctttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtc 24193148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43469258 - 43469202
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43469258 atcctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcattttagtttttgaatcgtttcaaa 43469202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28496601 - 28496558
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28496601 tggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 28496558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23935405 - 23935363
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttt 170  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23935405 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttt 23935363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27428496 - 27428406
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtc-----aatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||     | |||||||||||||||||||||||    
T  27428496 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaataagtcttttaaatttcaaaagttccaaacaagtcctttaattttagtttttgaatcgtttcaaa 27428406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 28707404 - 28707461
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28707404 tccttaaagtttcaaaagtctcaagcaagtct-tttagtttttgaatcgtttcaaacaa 28707461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38208934 - 38208874
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208934 ctttaagtttcaaaggtcttaaacaagttt-tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 38208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 24193079 - 24193127
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24193079 caaagtggtcctttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 24193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 42988187 - 42988239
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaa 220  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  42988187 tttaagttttaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 42988239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1293673 - 1293630
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1293673 tggtcctttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 1293630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 370 - 404
Target Start/End: Original strand, 8137240 - 8137274
Alignment:
Q  370 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8137240 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 8137274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18874227 - 18874173
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttca 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  18874227 atcctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 18874173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21356707 - 21356654
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttca 218  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  21356707 tcctttaagtttaaaaagtctcaaacaagttctttcagtttttgaatcgtttca 21356654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37933827 - 37933786
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37933827 gtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 37933786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 7434775 - 7434823
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  7434775 caaattggtcctttaaatttcgaaagtcccaaacaagtccttttagttt 7434823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 8137070 - 8137110
Alignment:
Q  136 tcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8137070 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 8137110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 40301853 - 40301913
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40301853 tttaagtttcaaatgtcctaaataagtccttttagattttgaatcgtttcaaaaaagtcat 40301913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 165 - 408
Target Start/End: Original strand, 218782 - 219026
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgat-gtagattattcagatgatagca 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  218782 tcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatagta-atgattcagatgatagca 218880  T
Q  264 acaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtggg-tgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaag 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  218881 acaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaag 218980  T
Q  363 caattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218981 caattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 219026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 219067 - 219009
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  219067 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaattttcgaatcgtttcaaacaagtc 219009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 218774 - 218822
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  218774 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagttt 218822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 157 - 408
Target Start/End: Original strand, 3 - 254
Alignment:
Q  157 caaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagat 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||| ||||| ||    
T  3 caaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttgtagaggatgatggtgatgattcatat 102  T
Q  257 gatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  103 gatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttca 202  T
Q  357 aggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  203 aggaagcaattaccgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 237
Alignment:
Q  198 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  265 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 5028
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5308 caaagtggtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaaatctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 5209  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5208 ttttagaggatgatggtgataattcagatgttagcaacaaataacattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttagg 5109  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5108 agccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 4984 - 5047
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4984 tcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Original strand, 12955 - 13235
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12955 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcacaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtct 13054  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  13055 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattagg 13154  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13155 agctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaattatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 13235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 13216
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13276 tttaagttttgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 59889 - 59609
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  59889 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcacaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtct 59790  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  59789 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattagg 59690  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  59689 agctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaattatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 59609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 59568 - 59628
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59568 tttaagttttgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 59628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 252719 - 252439
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  252719 caaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcc 252620  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  252619 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttagg 252520  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  252519 agccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 252439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 252397 - 252456
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252397 ctttaaatttcaaaactctcaaacaaatccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 252456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 47827 - 48102
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  47827 tggtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgagtcatttcaaacaagttctttta 47926  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 332  Q
    ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47927 gaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacca 48026  T
Q  333 gatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  48027 gatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaactatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgatt 48102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48143 - 48085
Alignment:
Q  168 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48143 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 48085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2217 - 1994
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  2217 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 2118  T
Q  265 caaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2117 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagca 2018  T
Q  365 attatcaactatgctatctacaat 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  2017 attaccaactatgctatctacaat 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 133 - 408
Target Start/End: Original strand, 5048 - 5325
Alignment:
Q  133 tggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5048 tggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcctttta 5147  T
Q  233 gaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaaga----gcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 328  Q
     |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5148 taggatgatggtgatgattca-atgatagcaacaaagatcattcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagga 5245  T
Q  329 gccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5246 gccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaattatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 5325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5369 - 5306
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 228  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5369 tcctttaagttttaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 5306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 409
Target Start/End: Original strand, 11225 - 11499
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 227  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11225 caaagtggtcctttaggttacaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 11324  T
Q  228 ttttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 327  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||       |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa-------cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 11417  T
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 409  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  11418 agccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattaccaactatgctacctacaataggtcttatttaaaacgattt 11499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 443 - 289
Alignment:
Q  167 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaaca 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  443 ctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaattcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 344  T
Q  267 aagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggt 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  343 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2038 - 1940
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2038 caaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacatgtcctttatgtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1957
Alignment:
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgatt 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Original strand, 599 - 679
Alignment:
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgatt 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 760 - 662
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  760 caaagtggtccttttagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctgaaataaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1914
Alignment:
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgatt 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 1833 - 1931
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833 caaagtggtccttttagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctgaaataaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3372
Alignment:
Q  328 agccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgatt 3372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 3328 - 3389
Alignment:
Q  164 atcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3328 atcctttaagtttcaaaaatc-caaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 3389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Original strand, 14546 - 14655
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggacgatgtagattattcagatgatagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||   ||| |||  |||||||||||    
T  14546 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtgcttttaaaggatgatagtgatgatttggatgatagcaa 14645  T
Q  265 caaagagcat 274  Q
    ||||||||||    
T  14646 caaagagcat 14655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 14538 - 14586
Alignment:
Q  128 caaaatggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagttt 176  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  14538 caaaattgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 14586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 19757 - 19831
Alignment:
Q  244 agattattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtg 318  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19757 agatgattcatatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 101275 - 101215
Alignment:
Q  135 gtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtc 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  101275 gtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtc 101215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5784 - 5728
Alignment:
Q  165 tcctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcaatttagtttttgaatcgtttcaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  5784 tcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgatttgtttcaaac 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University