View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3226_1D_low_5 (Length: 435)

Name: NF3226_1D_low_5
Description: NF3226_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3226_1D_low_5
NF3226_1D_low_5
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (24-324)||(38119909-38120210)
chr1 (60-320)||(45828585-45828845)
chr1 (27-320)||(11196872-11197162)
chr1 (86-320)||(47660882-47661116)
chr1 (61-316)||(22527009-22527269)
chr1 (69-315)||(51336919-51337165)
chr1 (69-314)||(47505356-47505607)
chr1 (89-303)||(23273217-23273431)
chr1 (84-316)||(13636805-13637043)
chr1 (84-316)||(19159034-19159272)
chr1 (84-320)||(52804877-52805119)
chr1 (90-316)||(26878723-26878955)
chr1 (84-320)||(19522092-19522325)
chr1 (90-316)||(3729154-3729386)
chr1 (90-320)||(21143939-21144175)
chr1 (77-315)||(35256210-35256448)
chr1 (84-320)||(50617697-50617940)
chr1 (84-316)||(31780472-31780704)
chr1 (87-316)||(94916-95139)
chr1 (323-435)||(38127848-38127960)
chr1 (324-435)||(37284927-37285038)
chr1 (330-435)||(45052888-45052993)
chr1 (323-435)||(27400623-27400735)
chr1 (330-435)||(9006390-9006495)
chr1 (323-435)||(12127252-12127364)
chr1 (331-435)||(20306149-20306253)
chr1 (339-435)||(26707395-26707491)
chr1 (323-435)||(37304167-37304279)
chr1 (323-435)||(49140342-49140454)
chr1 (330-435)||(2064410-2064515)
chr1 (323-435)||(1762873-1762985)
chr1 (323-435)||(12481258-12481370)
chr1 (323-435)||(16024036-16024148)
chr1 (340-435)||(44322816-44322911)
chr1 (337-435)||(37585892-37585990)
chr1 (323-435)||(6798006-6798118)
chr1 (331-435)||(25995931-25996035)
chr1 (323-435)||(35612281-35612393)
chr1 (323-435)||(37576320-37576432)
chr1 (329-433)||(49643872-49643976)
chr1 (329-435)||(31703759-31703865)
chr1 (323-435)||(3089481-3089593)
chr1 (344-435)||(4697081-4697172)
chr1 (332-435)||(8762598-8762701)
chr1 (330-425)||(23476550-23476645)
chr1 (338-435)||(27547868-27547965)
chr1 (323-421)||(4330050-4330148)
chr1 (224-315)||(49854968-49855059)
chr1 (323-432)||(39486404-39486504)
chr1 (240-320)||(16269758-16269838)
chr1 (89-168)||(8548257-8548336)
chr1 (323-384)||(45843367-45843428)
chr1 (84-143)||(470574-470633)
chr1 (81-156)||(49854822-49854897)
chr1 (75-152)||(16269590-16269667)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (24-320)||(37343260-37343556)
chr7 (24-320)||(41734738-41735034)
chr7 (69-320)||(47521767-47522024)
chr7 (69-320)||(16488383-16488634)
chr7 (83-320)||(16680469-16680706)
chr7 (83-320)||(17654705-17654942)
chr7 (84-320)||(5538356-5538598)
chr7 (90-316)||(48406372-48406604)
chr7 (84-316)||(15071088-15071326)
chr7 (90-316)||(9368213-9368445)
chr7 (90-316)||(41883554-41883786)
chr7 (84-316)||(17837967-17838205)
chr7 (90-316)||(17460073-17460305)
chr7 (90-316)||(17592909-17593141)
chr7 (90-316)||(35607202-35607434)
chr7 (90-319)||(34741732-34741958)
chr7 (69-320)||(27450481-27450734)
chr7 (90-316)||(10521844-10522076)
chr7 (133-316)||(42504788-42504977)
chr7 (69-315)||(36980573-36980807)
chr7 (323-435)||(7579071-7579183)
chr7 (90-262)||(19801568-19801740)
chr7 (323-435)||(31638142-31638254)
chr7 (337-435)||(44332718-44332816)
chr7 (331-435)||(48626262-48626366)
chr7 (329-435)||(17359326-17359432)
chr7 (330-435)||(21391389-21391494)
chr7 (323-432)||(28297958-28298067)
chr7 (330-435)||(33716734-33716839)
chr7 (337-433)||(43247568-43247664)
chr7 (324-435)||(41453204-41453315)
chr7 (89-320)||(13323044-13323280)
chr7 (323-426)||(41191893-41191996)
chr7 (330-435)||(10526457-10526561)
chr7 (323-435)||(8937048-8937160)
chr7 (123-320)||(11630143-11630328)
chr7 (323-435)||(41751789-41751901)
chr7 (324-435)||(19681694-19681805)
chr7 (337-435)||(34037110-34037208)
chr7 (330-435)||(6356911-6357016)
chr7 (331-435)||(36423516-36423620)
chr7 (331-435)||(6356432-6356536)
chr7 (330-434)||(28286317-28286421)
chr7 (348-435)||(35146897-35146984)
chr7 (330-435)||(8542645-8542750)
chr7 (224-315)||(47670154-47670245)
chr7 (330-435)||(40673206-40673309)
chr7 (75-156)||(9491787-9491868)
chr7 (387-435)||(17363437-17363485)
chr7 (69-156)||(47669996-47670083)
chr7 (330-435)||(1114200-1114296)
chr7 (382-425)||(17750144-17750187)
chr7 (240-320)||(22726680-22726760)
chr7 (272-315)||(9491893-9491936)
chr7 (323-364)||(27738935-27738976)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (24-320)||(38971051-38971347)
chr5 (24-319)||(42538804-42539092)
chr5 (60-320)||(5199770-5200036)
chr5 (84-317)||(42937467-42937700)
chr5 (84-316)||(8577344-8577582)
chr5 (90-320)||(38407662-38407898)
chr5 (84-316)||(8468-8706)
chr5 (60-256)||(511409-511606)
chr5 (90-316)||(28238544-28238776)
chr5 (84-316)||(19037968-19038206)
chr5 (92-316)||(30708061-30708291)
chr5 (60-320)||(40622792-40623052)
chr5 (84-316)||(28879612-28879850)
chr5 (24-320)||(15939655-15939947)
chr5 (92-270)||(7761603-7761787)
chr5 (323-435)||(35569979-35570091)
chr5 (329-435)||(36440399-36440505)
chr5 (330-435)||(32288276-32288381)
chr5 (330-435)||(34264547-34264652)
chr5 (323-435)||(2183082-2183194)
chr5 (323-432)||(24040287-24040398)
chr5 (324-435)||(27186013-27186124)
chr5 (323-435)||(9989462-9989574)
chr5 (349-435)||(16860619-16860705)
chr5 (331-435)||(38958923-38959027)
chr5 (337-425)||(25567197-25567285)
chr5 (349-435)||(16860502-16860588)
chr5 (330-435)||(37424461-37424569)
chr5 (337-435)||(29199151-29199249)
chr5 (224-305)||(8699377-8699458)
chr5 (323-435)||(11316097-11316205)
chr5 (24-87)||(36503422-36503485)
chr5 (86-121)||(8699237-8699272)
chr5 (272-320)||(511609-511657)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (60-320)||(34819397-34819657)
chr8 (60-320)||(40075487-40075747)
chr8 (60-320)||(35554598-35554858)
chr8 (24-320)||(5301070-5301354)
chr8 (80-317)||(20859026-20859263)
chr8 (69-320)||(30761068-30761319)
chr8 (90-316)||(1055540-1055772)
chr8 (90-316)||(23019098-23019330)
chr8 (90-316)||(26662461-26662693)
chr8 (84-316)||(15033570-15033808)
chr8 (94-316)||(486548-486776)
chr8 (90-316)||(42482317-42482549)
chr8 (90-316)||(22307-22539)
chr8 (69-320)||(39831541-39831798)
chr8 (92-315)||(52097-52320)
chr8 (29-320)||(45132749-45133037)
chr8 (175-316)||(41242986-41243127)
chr8 (330-432)||(45077405-45077507)
chr8 (330-435)||(38588733-38588838)
chr8 (330-434)||(7949558-7949662)
chr8 (323-435)||(27473270-27473382)
chr8 (185-316)||(43214398-43214529)
chr8 (332-435)||(15871820-15871923)
chr8 (86-253)||(12716091-12716257)
chr8 (323-432)||(45276798-45276907)
chr8 (323-435)||(33295883-33295995)
chr8 (323-435)||(44594800-44594912)
chr8 (323-435)||(1432270-1432382)
chr8 (323-435)||(7535032-7535144)
chr8 (323-435)||(27669555-27669667)
chr8 (337-435)||(11707949-11708047)
chr8 (330-435)||(5152733-5152838)
chr8 (323-435)||(15048538-15048650)
chr8 (340-431)||(1870089-1870182)
chr8 (330-435)||(5435099-5435204)
chr8 (345-425)||(40048216-40048296)
chr8 (337-424)||(1646717-1646804)
chr8 (331-430)||(1651776-1651875)
chr8 (331-430)||(1740152-1740251)
chr8 (341-435)||(37569513-37569608)
chr8 (351-435)||(24659395-24659479)
chr8 (84-316)||(34367429-34367653)
chr8 (354-435)||(34470714-34470795)
chr8 (224-317)||(5679874-5679967)
chr8 (239-316)||(39604301-39604378)
chr8 (84-181)||(41239359-41239456)
chr8 (337-410)||(11173858-11173931)
chr8 (24-156)||(21176090-21176219)
chr8 (330-435)||(18298439-18298533)
chr8 (263-320)||(21176303-21176360)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (24-320)||(51686124-51686414)
chr4 (75-320)||(50196340-50196585)
chr4 (75-320)||(50020500-50020745)
chr4 (60-320)||(8110161-8110421)
chr4 (60-320)||(46439030-46439283)
chr4 (60-320)||(10729781-10730041)
chr4 (60-320)||(10943550-10943810)
chr4 (84-316)||(21018397-21018635)
chr4 (84-314)||(30723546-30723782)
chr4 (90-316)||(6178615-6178847)
chr4 (84-316)||(41795844-41796082)
chr4 (84-316)||(49168525-49168763)
chr4 (81-315)||(14317624-14317858)
chr4 (90-316)||(1305945-1306177)
chr4 (84-316)||(40355223-40355460)
chr4 (90-316)||(49093436-49093668)
chr4 (90-316)||(31424754-31424986)
chr4 (80-315)||(71952-72187)
chr4 (84-320)||(50278164-50278385)
chr4 (323-435)||(44991477-44991589)
chr4 (80-310)||(21535045-21535275)
chr4 (323-435)||(50768960-50769072)
chr4 (117-318)||(11081483-11081684)
chr4 (24-287)||(41930810-41931070)
chr4 (323-435)||(19088540-19088652)
chr4 (323-435)||(33091652-33091764)
chr4 (323-435)||(53751101-53751213)
chr4 (330-432)||(1433473-1433575)
chr4 (330-435)||(19508612-19508717)
chr4 (323-435)||(30683727-30683839)
chr4 (323-435)||(38339631-38339743)
chr4 (331-435)||(43734485-43734589)
chr4 (323-435)||(46849868-46849980)
chr4 (323-435)||(50508656-50508768)
chr4 (323-433)||(53995135-53995245)
chr4 (323-432)||(14985470-14985579)
chr4 (323-435)||(8592108-8592220)
chr4 (323-435)||(42855538-42855650)
chr4 (323-435)||(44957528-44957640)
chr4 (330-435)||(15477844-15477949)
chr4 (330-435)||(21763380-21763485)
chr4 (84-316)||(37016409-37016640)
chr4 (323-435)||(41752015-41752127)
chr4 (331-435)||(43566577-43566681)
chr4 (330-432)||(39448690-39448792)
chr4 (330-435)||(623878-623983)
chr4 (331-432)||(37206629-37206730)
chr4 (330-435)||(52557286-52557391)
chr4 (323-435)||(6712102-6712214)
chr4 (323-435)||(16037993-16038105)
chr4 (330-430)||(53259342-53259442)
chr4 (348-435)||(6505735-6505822)
chr4 (330-425)||(12817952-12818047)
chr4 (324-435)||(23755999-23756110)
chr4 (330-435)||(24898335-24898440)
chr4 (330-435)||(25182011-25182116)
chr4 (344-435)||(23755617-23755708)
chr4 (324-435)||(41878058-41878169)
chr4 (330-425)||(36122642-36122737)
chr4 (24-216)||(50904435-50904627)
chr4 (239-314)||(44676950-44677025)
chr4 (99-320)||(55278613-55278831)
chr4 (225-315)||(13624485-13624575)
chr4 (90-223)||(44674656-44674795)
chr4 (247-320)||(50904366-50904437)
chr4 (98-320)||(40886456-40886677)
chr4 (83-145)||(12892091-12892153)
chr4 (264-320)||(30706914-30706970)
chr4 (75-145)||(13624332-13624402)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (69-320)||(20353551-20353802)
chr3 (24-267)||(11380783-11381026)
chr3 (24-320)||(42759665-42759949)
chr3 (60-320)||(6928135-6928395)
chr3 (75-320)||(44232721-44232966)
chr3 (90-316)||(34048439-34048671)
chr3 (90-316)||(42900967-42901199)
chr3 (84-316)||(2648377-2648615)
chr3 (81-315)||(48891532-48891766)
chr3 (90-316)||(50477584-50477816)
chr3 (90-316)||(54389139-54389371)
chr3 (84-316)||(16646509-16646747)
chr3 (84-316)||(46401719-46401957)
chr3 (90-316)||(46698122-46698354)
chr3 (113-316)||(599881-600081)
chr3 (112-320)||(17562171-17562386)
chr3 (84-316)||(2271857-2272095)
chr3 (75-320)||(41615271-41615510)
chr3 (91-318)||(49266177-49266410)
chr3 (84-316)||(47070987-47071226)
chr3 (323-435)||(10506147-10506259)
chr3 (323-435)||(42591923-42592035)
chr3 (323-435)||(54108101-54108213)
chr3 (324-435)||(51509318-51509429)
chr3 (325-435)||(54752304-54752414)
chr3 (84-316)||(4005215-4005450)
chr3 (84-316)||(9473293-9473528)
chr3 (90-320)||(50213974-50214210)
chr3 (330-425)||(39241504-39241599)
chr3 (337-435)||(11256256-11256354)
chr3 (69-244)||(16861562-16861743)
chr3 (323-432)||(22201755-22201864)
chr3 (90-316)||(49141337-49141557)
chr3 (330-432)||(21969775-21969877)
chr3 (330-432)||(21992211-21992313)
chr3 (330-432)||(22151991-22152093)
chr3 (330-435)||(8474045-8474150)
chr3 (330-435)||(26318381-26318486)
chr3 (330-435)||(32633264-32633369)
chr3 (330-435)||(39951503-39951608)
chr3 (323-435)||(16931745-16931857)
chr3 (323-435)||(53716433-53716544)
chr3 (337-435)||(39664383-39664481)
chr3 (84-316)||(52388414-52388637)
chr3 (323-435)||(5900622-5900734)
chr3 (323-435)||(18464595-18464707)
chr3 (323-435)||(29818316-29818428)
chr3 (323-435)||(47669398-47669510)
chr3 (337-435)||(47303218-47303315)
chr3 (330-435)||(12203750-12203855)
chr3 (331-432)||(24428714-24428815)
chr3 (330-435)||(44893886-44893991)
chr3 (60-193)||(48565957-48566090)
chr3 (324-432)||(21568886-21568993)
chr3 (337-435)||(4773395-4773493)
chr3 (330-432)||(15986381-15986482)
chr3 (349-431)||(46152778-46152860)
chr3 (342-435)||(41835125-41835218)
chr3 (337-425)||(27801642-27801730)
chr3 (323-435)||(1994368-1994479)
chr3 (323-435)||(4757693-4757804)
chr3 (323-423)||(19883378-19883478)
chr3 (224-315)||(30253041-30253132)
chr3 (84-316)||(36130499-36130722)
chr3 (251-320)||(48565879-48565948)
chr3 (69-144)||(42804750-42804825)
chr3 (224-315)||(42804908-42804999)
chr3 (86-156)||(30252898-30252968)
chr3 (323-384)||(28986392-28986453)
chr3 (38-154)||(18751920-18752036)
chr3 (93-145)||(26334789-26334841)
chr3 (399-435)||(28986359-28986395)
chr3 (25-87)||(12373946-12374008)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (56-257)||(24885416-24885617)
chr6 (59-320)||(26172927-26173187)
chr6 (84-316)||(22304244-22304482)
chr6 (90-316)||(6204163-6204395)
chr6 (90-316)||(11691130-11691362)
chr6 (90-316)||(30826429-30826661)
chr6 (24-250)||(2405802-2406027)
chr6 (84-316)||(27638762-27639000)
chr6 (24-320)||(2407246-2407524)
chr6 (90-320)||(3384438-3384667)
chr6 (84-320)||(31771077-31771308)
chr6 (69-304)||(18001601-18001836)
chr6 (323-435)||(7270768-7270880)
chr6 (323-435)||(32993214-32993326)
chr6 (323-435)||(34994579-34994691)
chr6 (323-432)||(5938015-5938124)
chr6 (330-435)||(9046232-9046337)
chr6 (323-435)||(24744467-24744579)
chr6 (323-435)||(34890783-34890895)
chr6 (325-435)||(5639372-5639482)
chr6 (338-435)||(3423369-3423466)
chr6 (324-432)||(5310966-5311074)
chr6 (323-435)||(18053095-18053207)
chr6 (323-435)||(26600496-26600608)
chr6 (324-435)||(7270093-7270204)
chr6 (323-435)||(21856754-21856866)
chr6 (81-266)||(3502038-3502237)
chr6 (323-425)||(21540186-21540288)
chr6 (337-435)||(26957115-26957213)
chr6 (323-435)||(6236120-6236232)
chr6 (323-435)||(25176856-25176968)
chr6 (323-435)||(35167689-35167803)
chr6 (330-432)||(31247262-31247364)
chr6 (331-435)||(6137577-6137681)
chr6 (324-435)||(32753317-32753424)
chr6 (330-423)||(2517148-2517241)
chr6 (330-435)||(31237892-31237997)
chr6 (224-315)||(32642906-32642997)
chr6 (224-315)||(32641812-32641903)
chr6 (89-156)||(32641674-32641741)
chr6 (69-156)||(32643068-32643155)
chr6 (323-369)||(6532331-6532377)
chr6 (69-156)||(24085617-24085704)
chr6 (238-291)||(24085789-24085842)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (90-316)||(30493772-30494004)
chr2 (63-316)||(28471542-28471803)
chr2 (86-320)||(36653303-36653543)
chr2 (90-316)||(5354985-5355217)
chr2 (90-316)||(15834270-15834502)
chr2 (90-316)||(43981535-43981767)
chr2 (90-316)||(43536515-43536747)
chr2 (63-316)||(29398389-29398648)
chr2 (80-316)||(39950508-39950744)
chr2 (330-435)||(26181899-26182004)
chr2 (56-198)||(6637866-6638011)
chr2 (24-156)||(7416959-7417091)
chr2 (323-435)||(16305164-16305276)
chr2 (323-435)||(29472381-29472493)
chr2 (337-435)||(2148085-2148183)
chr2 (93-316)||(10825732-10825961)
chr2 (323-425)||(24138715-24138817)
chr2 (324-425)||(38332844-38332945)
chr2 (323-435)||(8174084-8174196)
chr2 (323-435)||(15744596-15744708)
chr2 (84-316)||(17423480-17423706)
chr2 (330-435)||(13193134-13193239)
chr2 (323-435)||(15405955-15406067)
chr2 (337-435)||(19815903-19816001)
chr2 (330-435)||(34735542-34735647)
chr2 (330-435)||(41474228-41474333)
chr2 (331-435)||(24372166-24372270)
chr2 (323-425)||(7469305-7469407)
chr2 (323-424)||(12860577-12860678)
chr2 (323-435)||(19847518-19847629)
chr2 (330-435)||(36713734-36713836)
chr2 (330-432)||(10991997-10992099)
chr2 (323-435)||(7496179-7496290)
chr2 (323-424)||(17052197-17052294)
chr2 (235-316)||(45431519-45431600)
chr2 (24-156)||(25514808-25514931)
chr2 (69-156)||(40538702-40538789)
chr2 (224-315)||(7416797-7416888)
chr2 (90-151)||(3938350-3938411)
chr2 (259-315)||(40538540-40538596)
chr2 (323-362)||(33470195-33470234)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (323-435)||(50675-50787)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (329-435)||(8573-8679)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (323-435)||(18412-18524)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (330-435)||(15594-15699)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (323-435)||(45895-46007)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (337-435)||(349226-349324)
scaffold0003 (337-425)||(113519-113607)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (330-435)||(82057-82162)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (330-432)||(14337-14439)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (330-435)||(19854-19959)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (323-435)||(24301-24413)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (323-435)||(72901-73012)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (330-435)||(20897-21001)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (331-435)||(21658-21762)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (330-425)||(6144-6236)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (238-320)||(12360-12442)
scaffold0155 (80-145)||(12538-12603)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (240-317)||(22256-22333)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 38119909 - 38120210
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaa-cataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgccta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38119909 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaaacataaaatattactactcctgatcctactgatgctgccggtgcctcctcctcggcctttggcctagcctc 38120008  T
Q  123 ctggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38120009 ctggtcaagatcggcacgatctggtccctaacatgggtcatcgtctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcttgacctatctgcgcatcagtgt 38120108  T
Q  223 aggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggcat 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38120109 aggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccactcccactgctctacaatgatctgctcttcatttgctggcat 38120208  T
Q  323 cg 324  Q
    ||    
T  38120209 cg 38120210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45828845 - 45828585
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45828845 tactgctactcctggtcctgctgatgctgctggtgccttctccttggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 45828746  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45828745 tcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcaccttgacctatctgcgcatcagcgtaggcaacatcggcactaaccatgtcataggtgtcagg 45828646  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45828645 cgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 45828585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11197162 - 11196872
Alignment:
Q  27 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  11197162 accaagtcatgaaaatatatcctaaacattaaatactact---cctggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcttcggcctctggcctcgcctcctag 11197066  T
Q  127 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||    
T  11197065 tcaagatcggcgcgatctgctcctcaacatggatcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctgacctaactgcacattagcgtaggc 11196966  T
Q  227 aacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11196965 aacagcggcactaactatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgccttgtaccgctcccacggctctgcaatgatctgatcttcatttgctggc 11196872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47661116 - 47660882
Alignment:
Q  86 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg 185  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47661116 ctgctggtgcctcctcatcgacccatggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccgctgttgaggg 47661017  T
Q  186 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactccc 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  47661016 ctcatgacctcctcctgacctatatgcgcatcagcataggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttcttgcctcgtaccgctccc 47660917  T
Q  286 actgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47660916 attgctctgcaatgatcttctcttcatttgctggc 47660882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22527269 - 22527009
Alignment:
Q  61 actactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggt 160  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  22527269 actactactactggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccttaagatggct 22527170  T
Q  161 catcgcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtg 254  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22527169 catggcctcaaacgactgctgaggggtcatgctcatgacctccttctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtg 22527070  T
Q  255 tcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22527069 tcaggcgagcttctcgcctcataccgttcccactgctctgcaa-gatctgctcttcatttgc 22527009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51337165 - 51336919
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  51337165 tcctgttcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcagcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcct 51337066  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51337065 gaaaccattgatgagggctcatgacctcctcctggccaatctatgcatcagcgtaggcaacagcgccgctaaccatgtcataggtatcatgcgagcttct 51336966  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51336965 cgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttg 51336919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47505607 - 47505356
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||| || |||| |||| |||| ||||    
T  47505607 tcctggtcctgctgatgctgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagataggcgtgatctgctctctaatatggctcatggcct 47505508  T
Q  169 gaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 262  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47505507 gaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcga 47505408  T
Q  263 gcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcattt 314  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  47505407 gcttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctgctcttcattt 47505356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 303
Target Start/End: Original strand, 23273217 - 23273431
Alignment:
Q  89 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctc 188  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23273217 ctggtgccacctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagattgacgcgatctgctccataacatgggtcatggcctgaaaccactgttgagggctc 23273316  T
Q  189 atgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccact 288  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  23273317 atgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggctacaacggcactaaccatgtcataggtgtctggcgagcttctcgcctcataccgctcccact 23273416  T
Q  289 gctctgcaatgatct 303  Q
    ||| |||||||||||    
T  23273417 gctgtgcaatgatct 23273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 13636805 - 13637043
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  13636805 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 13636904  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13636905 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 13637004  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13637005 ccgctcccactggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 13637043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19159272 - 19159034
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19159272 tgctgatggtgcctcctcctgggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 19159173  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19159172 gggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcaccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 19159073  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19159072 ccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 19159034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52805119 - 52804877
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| | |||| || | |||||||||||||  ||||    
T  52805119 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaattggcgcggtctgctccctcatatggctcgtggcctgaaaccactactgag 52805020  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  52805019 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 52804920  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52804919 ccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 52804877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26878955 - 26878723
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  26878955 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 26878856  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  26878855 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 26878756  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878755 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 26878723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Original strand, 19522092 - 19522325
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19522092 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgactcatggcctgaaaccactgttgag 19522191  T
Q  184 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
    |||||||| ||||||   | || ||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  19522192 ggctcatgtcctcct---ggcccatctgtgcatcagcataggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctc 19522288  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19522289 tcactgctgtgcaatgatctgctctttatttgctggc 19522325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 3729154 - 3729386
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  3729154 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaattggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 3729253  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  3729254 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 3729353  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729354 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 3729386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21144175 - 21143939
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||        
T  21144175 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactactgaggggtcg 21144076  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||    
T  21144075 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcaagcttctcgcctcataccgctc 21143976  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143975 ccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 21143939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 315
Target Start/End: Original strand, 35256210 - 35256448
Alignment:
Q  77 ctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccac 176  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||| | |||| || ||||||||     
T  35256210 ctactgctgctgttggtgtctcctcctcggcctctggcctcgcctccttgccaatatcggcgcgatctgctctctaacatagctcatggcttgaaaccat 35256309  T
Q  177 tgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgt 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||    
T  35256310 tgttgagggctcatgacctcctcctggccaatatgtgcatcaatgtaggcaacagcgctgctaaccatgtcataggtatcatgcgagcttctcgccttgt 35256409  T
Q  277 accactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35256410 accactcccactgctctgcaatgatatgctcctcatttg 35256448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Original strand, 50617697 - 50617940
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  50617697 tgctgatgatgcatcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaaaatcggtgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccacagctgag 50617796  T
Q  184 gg-------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgt 276  Q
    ||       ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  50617797 ggggtcatgctcatgacctcctcctgacctaactgcgcagcagcgtaggcaacagcgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcat 50617896  T
Q  277 accactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50617897 accgctcccactgttgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 50617940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 31780472 - 31780704
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| |||||||||  |||    
T  31780472 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctaggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgttccctcatatggctcatggcctaaaaccactgccgag 31780571  T
Q  184 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
    || |||||  ||||| ||| |||| |||| |||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  31780572 gggtcatgctctcctcctggcctaactgcacatcagcgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctc 31780671  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31780672 ccactgctctacaatgatctgctcttcatttgc 31780704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 316
Target Start/End: Original strand, 94916 - 95139
Alignment:
Q  87 tgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg-- 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||      
T  94916 tgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttgagggg 95015  T
Q  185 ----gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacca 280  Q
        |||||||||||||| ||  |||| ||||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  95016 tcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcat------------cagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccg 95103  T
Q  281 ctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  95104 ctcccactactctgcaatgatctgctcttcatttgc 95139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 38127848 - 38127960
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38127848 cgttatggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaaggtattatgattaaatagtgaatgatatt 38127947  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    |||||||||||||    
T  38127948 attagtaactgtt 38127960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37285038 - 37284927
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285038 gttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 37284939  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||||||||    
T  37284938 ttggtaactgtt 37284927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45052993 - 45052888
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45052993 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 45052894  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  45052893 actgtt 45052888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27400735 - 27400623
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400735 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatatt 27400636  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  27400635 attggtaactgtt 27400623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9006495 - 9006390
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9006495 gtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggta 9006396  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  9006395 actgtt 9006390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12127364 - 12127252
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12127364 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatatt 12127265  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  12127264 attggtaactgtt 12127252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 20306149 - 20306253
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20306149 tttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 20306248  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  20306249 ctgtt 20306253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 339 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707395
Alignment:
Q  339 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 26707395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 37304167 - 37304279
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37304167 cgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 37304266  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  37304267 attggtaactgtt 37304279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49140454 - 49140342
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140454 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 49140355  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  49140354 attggtaactgtt 49140342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2064515 - 2064410
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  2064515 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactactattattggta 2064416  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  2064415 actgtt 2064410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1762985 - 1762873
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  1762985 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtgttctgattaaatagtgactgatatt 1762886  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  1762885 attggtaactgtt 1762873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12481370 - 12481258
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12481370 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 12481271  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  12481270 attggtaactgtt 12481258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 16024036 - 16024148
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16024036 cgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttgaggtattatgattaaatagtgactaatatt 16024135  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  16024136 attggtaactgtt 16024148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 340 - 435
Target Start/End: Original strand, 44322816 - 44322911
Alignment:
Q  340 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44322816 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgtt 44322911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37585990 - 37585892
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585990 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 37585892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6798118 - 6798006
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6798118 cgttagggtttgtgttatgagggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 6798019  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  6798018 attggtaattgtt 6798006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 25995931 - 25996035
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25995931 tttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtaatatgattaaatagtggctgatattattggtaa 25996030  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  25996031 ctgtt 25996035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35612393 - 35612281
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35612393 cgttagggtctgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 35612294  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  35612293 attggtaaatgtt 35612281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 37576320 - 37576432
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37576320 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttataagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgaccgatatt 37576419  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  37576420 attggtaactgtt 37576432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 329 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 49643976 - 49643872
Alignment:
Q  329 ggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagt 428  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  49643976 ggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgagtgatattattggt 49643877  T
Q  429 aactg 433  Q
    |||||    
T  49643876 aactg 49643872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 329 - 435
Target Start/End: Original strand, 31703759 - 31703865
Alignment:
Q  329 ggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagt 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31703759 ggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggt 31703858  T
Q  429 aactgtt 435  Q
    |||||||    
T  31703859 aactgtt 31703865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 3089481 - 3089593
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3089481 cgttagggtttgtgttatgtggatcctataactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 3089580  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    |||  ||||||||    
T  3089581 attgataactgtt 3089593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 344 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4697172 - 4697081
Alignment:
Q  344 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4697172 ggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 4697081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8762701 - 8762598
Alignment:
Q  332 ttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaac 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  8762701 ttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgaataaatagtaactgatattattggtaaa 8762602  T
Q  432 tgtt 435  Q
    ||||    
T  8762601 tgtt 8762598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23476645 - 23476550
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23476645 gtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattatt 23476550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 338 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27547965 - 27547868
Alignment:
Q  338 tatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27547965 tatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtactatgctttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatactattggtaactgtt 27547868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4330148 - 4330050
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatat 421  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4330148 cgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcattttaatcatattccttgttaaggtattatggttaaatagtggctgatat 4330050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Original strand, 49854968 - 49855059
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49854968 ggcaacatcgccactaaccatgtcataggtatcaggggagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatatgctcctcatttg 49855059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39486504 - 39486404
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39486504 cgttagggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgc---------gtattatgattaaatagtgattgatatt 39486414  T
Q  423 attagtaact 432  Q
    ||||||||||    
T  39486413 attagtaact 39486404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Original strand, 16269758 - 16269838
Alignment:
Q  240 accatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16269758 accatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcttaccgctcccactactgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 16269838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8548336 - 8548257
Alignment:
Q  89 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  8548336 ctggtgcctcctcctcggcctttgggctctcctcctggtcaaaatcgacgcgatctgctccctcatatgggtcatggcct 8548257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45843428 - 45843367
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatg 384  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45843428 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctagctttttttattagtatcattttggtcctatg 45843367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 470633 - 470574
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatc 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  470633 tgctgatgctgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatc 470574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Original strand, 49854822 - 49854897
Alignment:
Q  81 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  49854822 tgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtaatgatcggcacgatctgctgcctaacat 49854897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 152
Target Start/End: Original strand, 16269590 - 16269667
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatcccta 152  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16269590 tcctattgatgctgttgttgccgcctgctcgacctctggcctcgcgtcctggtcaagatcggcacgatctgctcccta 16269667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37343556 - 37343260
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |    
T  37343556 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcatggtcttgctgatgctactggtgcctcctcatcggcttctggcctcgcctcc 37343457  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37343456 tagtcaagatcggcgcgatctgcttcctaacatgggtcatggtctgaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcagcgta 37343357  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343356 ggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgccttgtaccgctctcactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 37343260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41735034 - 41734738
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |    
T  41735034 tacaccaagtcatgaaactatatcctaaacataaaatactactactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctccttgacctatgaactcgcctcc 41734935  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  41734934 tggtcaagatcggcgcgatctgttccctaacatgggtcatggcctgaaaccactgctgaaggctcatgacctcctcctgacctatatgcgcatcagcgta 41734835  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41734834 ggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcagacgagcttctcacctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 41734738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 47521767 - 47522024
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  47521767 tcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagacaggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcct 47521866  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatg------acctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 262  Q
     |||||||||||||||| |||||      ||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47521867 aaaaccactgttgaggggtcatgctcgtgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcga 47521966  T
Q  263 gcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47521967 gcttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 47522024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16488634 - 16488383
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||| |||  |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  16488634 tcctggtcctgctgatgctgttgttgccgccttgtcggcccttggcctcgcctcctagtcaagatcagcgtgatcggctccctaacatggctcatggcct 16488535  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16488534 gaaaccactgttgagggctcatgacctcctcttgacccatctgtgcatcagcgtaggcaacaacgacactaaccatgtcatagctatcaggcgagcttct 16488435  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16488434 cgcatcgtaccgctcccactgctgtgcaatgatctactcttcatttgctggc 16488383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16680706 - 16680469
Alignment:
Q  83 atgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16680706 atgctgctggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctgatcaagatcggcgcgatctactccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttga 16680607  T
Q  183 gggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccact 282  Q
    |||||||||||||||| ||| |  || || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  16680606 gggctcatgacctcctcctggctcatttgtgcatcagcgtagacaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcagacgagcttctcgcctcataccgct 16680507  T
Q  283 cccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16680506 tccactgttgtgcaatgatcttctcttcatttgctggc 16680469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17654942 - 17654705
Alignment:
Q  83 atgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17654942 atgctgctggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctgatcaagatcggcgcgatctactccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttga 17654843  T
Q  183 gggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccact 282  Q
    |||||||||||||||| ||| |  || || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  17654842 gggctcatgacctcctcctggctcatttgtgcatcagcgtagacaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcagacgagcttctcgcctcataccgct 17654743  T
Q  283 cccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17654742 tccactgttgtgcaatgatcttctcttcatttgctggc 17654705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Original strand, 5538356 - 5538598
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  5538356 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 5538455  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5538456 gggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacaccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 5538555  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5538556 ccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 5538598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48406604 - 48406372
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||        
T  48406604 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 48406505  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  48406504 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 48406405  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406404 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 48406372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 15071088 - 15071326
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15071088 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcttatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 15071187  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15071188 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagctccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 15071287  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071288 ccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 15071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 9368213 - 9368445
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  9368213 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 9368312  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  9368313 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 9368412  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368413 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 9368445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41883786 - 41883554
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  41883786 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 41883687  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  41883686 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 41883587  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883586 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 41883554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17838205 - 17837967
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  17838205 tgctgatggtgccccctcctcggcctttgggctcgccttctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 17838106  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17838105 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaagtgcgcatcagcgtagacaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 17838006  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17838005 ccgctcccactgctctgcaatgatctgttcttcatttgc 17837967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 17460073 - 17460305
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||        
T  17460073 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtaaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 17460172  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  17460173 tgctcatgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 17460272  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460273 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 17460305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17593141 - 17592909
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||        
T  17593141 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtaaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 17593042  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  17593041 tgctcatgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 17592942  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592941 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 17592909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 35607202 - 35607434
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  35607202 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 35607301  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  35607302 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 35607401  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607402 tcactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 35607434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34741958 - 34741732
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctca 189  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34741958 tggtgcctccttctcggcccctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgagggctca 34741859  T
Q  190 tgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactg 289  Q
    |||||||||   | || ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34741858 tgacctcct---ggcccatctgtgcatcaacgtaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcagacgagcttctcgcctcataccactcccactg 34741762  T
Q  290 ctctgcaatgatctgctcttcatttgctgg 319  Q
     | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34741761 ttgtgcaacgatatgctcttcatttgctgg 34741732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 27450481 - 27450734
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||    
T  27450481 tcctggtcctgctgatgctgttggtgcctcctc---ggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatgactcatggcct 27450577  T
Q  169 gaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 262  Q
    |||||||||| ||||||      ||||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450578 gaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgctcataagcttaggcaacaacg-cactaaccatgtcataggtgtcaggcga 27450676  T
Q  263 gcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27450677 gcttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctactcttcatttgctggc 27450734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10522076 - 10521844
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||  ||||||        
T  10522076 tggtgcctcctcctcggcctatgggcttgcctcctggtcaaaattggcgcgatctggtccctcatatggctcatggcctcaaaccacttctgaggggtca 10521977  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  10521976 tgctcatgacctcctcctggcctaaccgcgcatcagcgtaggcaacaacgctactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcacctcataccgctc 10521877  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10521876 ccactgctctgcaatgatatgctcttcatttgc 10521844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 133 - 316
Target Start/End: Original strand, 42504788 - 42504977
Alignment:
Q  133 tcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 226  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  42504788 tcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagcgtaggc 42504887  T
Q  227 aacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42504888 aacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 42504977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36980807 - 36980573
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||    
T  36980807 tcctggtcctgctgatgctgttcgtgcctcctcctcggcctctggtctcgcctcctggccaatatcggcgcgatcttctctctaacatggctcatggcct 36980708  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||             |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36980707 aaaaccattgttgagggctcatgacctcctcctggcccatctgtgcat------------tagcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttct 36980620  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36980619 cgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttg 36980573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7579183 - 7579071
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7579183 cgttatggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatatt 7579084  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  7579083 attggtaactgtt 7579071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19801740 - 19801568
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctca 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  19801740 tggtgcctcctcctcggcctctggccttgccccctggtcaagatcgacgcaatctgctccctaagatggttcatgacctgaaaccactactgagggctca 19801641  T
Q  190 tgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 262  Q
    ||||||||| |||  | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19801640 tgacctcctcctggaccatctgtgcatcagcgtaggcaacagtgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 19801568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31638254 - 31638142
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638254 cgttatggtttgtgtcatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 31638155  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  31638154 attggtaactgtt 31638142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44332816 - 44332718
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44332816 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 44332718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48626366 - 48626262
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48626366 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 48626267  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  48626266 ctgtt 48626262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 329 - 435
Target Start/End: Original strand, 17359326 - 17359432
Alignment:
Q  329 ggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagt 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17359326 ggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggt 17359425  T
Q  429 aactgtt 435  Q
    |||||||    
T  17359426 aactgtt 17359432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21391494 - 21391389
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21391494 gtttgtgttatgtggatcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 21391395  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  21391394 actgtt 21391389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Original strand, 28297958 - 28298067
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28297958 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 28298057  T
Q  423 attagtaact 432  Q
    |||| |||||    
T  28298058 attaataact 28298067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 33716734 - 33716839
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33716734 gtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggta 33716833  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  33716834 actgtt 33716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 337 - 433
Target Start/End: Original strand, 43247568 - 43247664
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43247568 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattactggtaactg 43247664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41453315 - 41453204
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41453315 gttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatta 41453216  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||||||||    
T  41453215 ttggtaactgtt 41453204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13323280 - 13323044
Alignment:
Q  89 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg--- 185  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||       
T  13323280 ctggtgcctcctcctcggtctctatcctcgcctcctggtcataattggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactactgaggggtc 13323181  T
Q  186 ---ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccact 282  Q
       ||||||||||||| |||  | | ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||    
T  13323180 atgctcatgacctcctcctggtcaa-ctgcgcatcagcgtaggtaacagcgccaaaaaccatgtcataggtgtcaagtgagcttctcgcctcataccgct 13323082  T
Q  283 cccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323081 cccactgttgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 13323044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 323 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41191996 - 41191893
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191996 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttcttattaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 41191897  T
Q  423 atta 426  Q
    ||||    
T  41191896 atta 41191893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 10526457 - 10526561
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10526457 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccaatgcc-tgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggta 10526555  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  10526556 actgtt 10526561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8937160 - 8937048
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8937160 cgttatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattaatatcatgttggtcatattccttgttaaggtattgtgattaaatagtgattgatatt 8937061  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  8937060 attggtaactgtt 8937048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 11630143 - 11630328
Alignment:
Q  123 ctggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgt 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||          
T  11630143 ctggtgaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcctgacctgaaaccactgctgagggctcatgacctccttctggcctaactgtgcat------ 11630236  T
Q  223 aggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||   | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11630237 ------cagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttttcgcctcataccgctctcaccattgtgcaatgatctgatcttcatttgctggc 11630328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 41751789 - 41751901
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41751789 cgttagggtttgtgttatgtggatcttctaactttatttattagtattattttggtcctatgtcttgttaagttattatgattaaatagtgactgatatt 41751888  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  41751889 attggtaactgtt 41751901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19681805 - 19681694
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19681805 gttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaatgcattatgattaaatattgactgatatta 19681706  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||||||||    
T  19681705 ttggtaactgtt 19681694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34037208 - 34037110
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34037208 ttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcatattttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgtt 34037110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 6356911 - 6357016
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  6356911 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaacagtgattgatattattgata 6357010  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  6357011 actgtt 6357016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 36423516 - 36423620
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||    
T  36423516 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatcaaatagtgactgatactatcggtaa 36423615  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  36423616 ctgtt 36423620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 6356432 - 6356536
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6356432 tttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 6356531  T
Q  431 ctgtt 435  Q
     ||||    
T  6356532 ttgtt 6356536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28286421 - 28286317
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  28286421 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggaactattccttcttaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggca 28286322  T
Q  430 actgt 434  Q
    |||||    
T  28286321 actgt 28286317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 348 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35146984 - 35146897
Alignment:
Q  348 ctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35146984 ctctaactttatttatcaatatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 35146897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 8542645 - 8542750
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  8542645 gtttgtgttgtgtgggtcttctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgacggatattactggta 8542744  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  8542745 actgtt 8542750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Original strand, 47670154 - 47670245
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47670154 ggcaacatcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttg 47670245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40673309 - 40673206
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40673309 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaatagtgactgatattattggta 40673212  T
Q  430 actgtt 435  Q
    | ||||    
T  40673211 agtgtt 40673206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 156
Target Start/End: Original strand, 9491787 - 9491868
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9491787 tcctgctggtgctggtggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctcctggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 9491868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 435
Target Start/End: Original strand, 17363437 - 17363485
Alignment:
Q  387 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17363437 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 17363485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 47669996 - 47670083
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||| | ||||||||    
T  47669996 tcctggtcctgctgatgctactggtgcctcctcctcggcctctggcatcgcctcctggtaattatcggcgcgatctggtgcctaacat 47670083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 1114200 - 1114296
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||         |||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  1114200 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattgtggtcctattcc---------tattatgattaaatagtgacgggtattattggta 1114290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17750187 - 17750144
Alignment:
Q  382 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17750187 atgccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattatt 17750144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Original strand, 22726680 - 22726760
Alignment:
Q  240 accatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || |||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  22726680 accatgtcataggtatcaggcgagcctctcgcctcgtactgcttccactgttgtgcaatgatcggctcctcattagctggc 22726760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 315
Target Start/End: Original strand, 9491893 - 9491936
Alignment:
Q  272 ctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9491893 ctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttg 9491936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27738976 - 27738935
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttatt 364  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27738976 cgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 27738935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38971347 - 38971051
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38971347 tacaccaagacatgaaaatatatcctaaacataaaatattactactcctggtcctgctgatgctgctcgtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctct 38971248  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38971247 tggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccactgttgagggctcatggcctcctcctgacctatctgcgcatcagcgta 38971148  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38971147 ggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcagacgagcttctcgcttcatatcgctcccactgctctgcaatgatttgctcttcatttgctggc 38971051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42539092 - 42538804
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| |    
T  42539092 tacaccaagtcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactactcttagtcctgttgatgctgctggtgcctcctcctcgacct-------cgcctcc 42539000  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  42538999 tggtcaaaatcggcgcgatctgctccttaacatgggtcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctgacctatttgcgcatcagcgta 42538900  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctgg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42538899 ggcaacagcgacactaaccatgtcatttgtgtcaggagagcttctcgcctcgtaccgcttccactgctctacaatgatctgctcttcatttgctgg 42538804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5200036 - 5199770
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  5200036 tactactggtcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcttcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaagatggc 5199937  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatg------acctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 253  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||      ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5199936 tcatgacctgaaaccactgctgagggctcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtagacaacggcgccactaaccatgtcataggt 5199837  T
Q  254 gtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199836 gtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctatgcaatgatctgctcttcatttgctggc 5199770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 317
Target Start/End: Original strand, 42937467 - 42937700
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  42937467 tgctgatggtgcctcctcctcagcctctggcctcgcctccttgctaatatcggcgcaatctgctccctaacatggctcatggcctgataccactgttgag 42937566  T
Q  184 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42937567 ggctcatgccctcctcctggcctatctgtgcattagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctc 42937666  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgct 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42937667 ccactgctctgcaatgatatgctcctcatttgct 42937700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 8577344 - 8577582
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8577344 tgctgatggtgcctcctcctcggcctttgggctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatttgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 8577443  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8577444 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 8577543  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8577544 ccgctcccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgc 8577582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 320
Target Start/End: Original strand, 38407662 - 38407898
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||        
T  38407662 tggtgcctcctcctcggcctatggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgaggggtca 38407761  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      |||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  38407762 tgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctc 38407861  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  38407862 ccactgctgtgcaatgacctgctcttcatttgctggc 38407898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 8468 - 8706
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8468 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 8567  T
Q  184 ggctcatg------acctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    || |||||      ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8568 gggtcatgctcataacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcacaggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 8667  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  8668 ccgctcccactgctattgaatgatctgctcttcatttgc 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Original strand, 511409 - 511606
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  511409 tactgctactcctggttctgctgatgctgctggtgccacctcctcggcctttggcctcgcctcctggtcaagatcggtgcgatctactccctaacatgag 511508  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactg-ttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtc 256  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  511509 tcatggcctgaaaccactgcttgaaggctcatgacctcctcctggcctatctgcgcattagtgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtc 511606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 28238544 - 28238776
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctc- 188  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     
T  28238544 tggtgcctcctccccggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgagggctca 28238643  T
Q  189 -----atgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
         |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  28238644 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 28238743  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28238744 ccactgctctgtaatgatctgctcttcatttgc 28238776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 19037968 - 19038206
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19037968 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcacgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 19038067  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19038068 gggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 19038167  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038168 ccgctgccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 19038206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 92 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30708291 - 30708061
Alignment:
Q  92 gtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg------ 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||          
T  30708291 gtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatg 30708192  T
Q  186 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactccc 285  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  30708191 ctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctccc 30708092  T
Q  286 actgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  30708091 actggtctgcaatgatctgctctttatttgc 30708061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 40622792 - 40623052
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||||     
T  40622792 tactgctagtcctggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggccttgcctcctggccaatatcgccgcgatctgctctctaacatggc 40622891  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  ||||||||| |    |||||||||||||| || ||| |    
T  40622892 tcatggcctgaaaccattgttgagggctcatgacctccgtctgacccatctgcacatctgcataggcaacaacactgctaaccatgtcatatgtatcaag 40622991  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  40622992 cgagcttctcgcctcgtaccgctctcactgctcttcaatgatatgttcctcatttgctggc 40623052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28879850 - 28879612
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  28879850 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggatcatggcctcaaaccactgctgag 28879751  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||| ||    
T  28879750 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggtaacaacgccactaaccatgtcgtaggtgtcagacgagtttctcacctcata 28879651  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28879650 ccgctcccactggtctgcaatgatctgctattcatttgc 28879612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15939947 - 15939655
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  15939947 tacaccaagtcctaaaaatatatcctaaacataagatactactactcctggtgttgctgatgttgctggtgccgcctcctcggcctctggcctcgcctcc 15939848  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  ||| || | ||||||||| |||||   |||||| | || | |||||   ||    
T  15939847 tgaccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggcgcatggcctcagtccattgctcagggctcatcacctc---ctgacccaactactcatcaacata 15939751  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||  || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15939750 ggcaacaacgcctctaaccatgtcataggtatcatgcgagcttctcgcctcgtaccgct-tcattgctctttaatgatctgctcctcatttgctggc 15939655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7761787 - 7761603
Alignment:
Q  92 gtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg------ 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | | |||| |||| |||||||||||||| ||||||          
T  7761787 gtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggtgcgatctgctccttcatatggctcatggcctgaaaccactgctgaggggtcatg 7761688  T
Q  186 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcg 270  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761687 ctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcg 7761603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35570091 - 35569979
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35570091 cgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagttattatgattaaatagtgactgatatt 35569992  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  35569991 attggtaactgtt 35569979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 36440505 - 36440399
Alignment:
Q  329 ggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagt 428  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36440505 ggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggt 36440406  T
Q  429 aactgtt 435  Q
    |||||||    
T  36440405 aactgtt 36440399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32288381 - 32288276
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32288381 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgattgatattattggta 32288282  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  32288281 actgtt 32288276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34264652 - 34264547
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34264652 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggta 34264553  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  34264552 actgtt 34264547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 2183082 - 2183194
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2183082 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatcttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatatt 2183181  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  2183182 attggtaactgtt 2183194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24040398 - 24040287
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcat--tttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgata 420  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24040398 cgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcatattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgata 24040299  T
Q  421 ttattagtaact 432  Q
    ||||| ||||||    
T  24040298 ttattggtaact 24040287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Original strand, 27186013 - 27186124
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27186013 gttagggtttgttttatgtgggtcctctaattttattaattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgaatggtatta 27186112  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||| ||||    
T  27186113 ttggtaattgtt 27186124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 9989462 - 9989574
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9989462 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttattaaggtattatgattaaacagtgactaatatt 9989561  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  9989562 attggtaattgtt 9989574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16860705 - 16860619
Alignment:
Q  349 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16860705 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactgatattattggtaactgtt 16860619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38959027 - 38958923
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38959027 tttgtgttatgtgagtcctctaactttatttataagtatcattttggtcttatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 38958928  T
Q  431 ctgtt 435  Q
     ||||    
T  38958927 ttgtt 38958923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25567285 - 25567197
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25567285 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttagtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattatt 25567197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16860588 - 16860502
Alignment:
Q  349 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16860588 tctaactttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 16860502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37424569 - 37424461
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctc---taactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatta 426  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37424569 gtttgtgttatgtgggtcctcctctaactttatttattaatatcattttggtcctattttttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattg 37424470  T
Q  427 gtaactgtt 435  Q
    |||||||||    
T  37424469 gtaactgtt 37424461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29199249 - 29199151
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  29199249 ttatgtggatcttctaacattatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatgttattgataactgtt 29199151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 305
Target Start/End: Original strand, 8699377 - 8699458
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgc 305  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  8699377 ggcaacagcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctatgcagtgatctgc 8699458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 11316097 - 11316205
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    |   |||||||||||||| ||||| |||||    
T  11316097 cgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtctt----aacaattatgattaaatattgacttatatt 11316192  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  11316193 attggtaactgtt 11316205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Original strand, 36503422 - 36503485
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgct 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  36503422 tacaccaagttatgaaaatatatcttaaacataaaatactactactcttgatcctgctggtgct 36503485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Original strand, 8699237 - 8699272
Alignment:
Q  86 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcct 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8699237 ctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcct 8699272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Original strand, 511609 - 511657
Alignment:
Q  272 ctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  511609 ctcgtaccgctcccaccgctctgcaatgatctacgattcatttgctggc 511657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 34819397 - 34819657
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34819397 tactgctactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 34819496  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34819497 ttatggcctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcctgacctatctgcgtatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcagg 34819596  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34819597 cgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 34819657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 40075487 - 40075747
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40075487 tactgctactcctggtcctgctgatgttgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 40075586  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  40075587 tcatggcctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcctggcctatctgcgcattagcgtaggcaacagtagcactaaccatgtcataggtgttagg 40075686  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40075687 cgagcttctcgcctcgtaccgctctcactgctctgcaatgatctgcccttcatttgctggc 40075747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35554858 - 35554598
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35554858 tactgctactcctggtcctgctgatggtgctggtgcctcctcctcggcctctgtcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctaacatggg 35554759  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35554758 tcatggcctgaaaccattgctgagggctcatgaactcctcctgacctatttgcgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcagg 35554659  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35554658 cgagcttcttgcctcgtaccgctctcactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 35554598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Original strand, 5301070 - 5301354
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5301070 tacaccaagtcctaaaaatatatcctaaacataaaatactactggtcttggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcc 5301169  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||       
T  5301170 tagtcaagatcggcgcgatctactccctaacatggatcatggcctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagt--- 5301266  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5301267 ---------ggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatatgctcttcatttgctggc 5301354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20859263 - 20859026
Alignment:
Q  80 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||     
T  20859263 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaagatcggcgcgatttgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgc 20859164  T
Q  180 tgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacc 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  20859163 tgagggctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagtgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcagtcgagcttctcgcctcatacc 20859064  T
Q  280 actcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgct 317  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20859063 gctcccactgctgtgcaatgatctactcttcatttgct 20859026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 30761068 - 30761319
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  30761068 tcctggtcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcct 30761167  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30761168 gaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctggcacatctgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttct 30761267  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |  ||| |||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  30761268 cacctcataccgcttccactgctgtgtaatgatctgctttttatttgctggc 30761319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1055772 - 1055540
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  1055772 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 1055673  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  1055672 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 1055573  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055572 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 1055540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 23019098 - 23019330
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  23019098 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 23019197  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  23019198 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 23019297  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019298 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 23019330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26662693 - 26662461
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  26662693 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 26662594  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  26662593 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 26662494  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662493 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 26662461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 15033570 - 15033808
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  15033570 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactactgag 15033669  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15033670 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 15033769  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15033770 ctgctcccactgatctgcaatgatctgctcttcatttgc 15033808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 316
Target Start/End: Original strand, 486548 - 486776
Alignment:
Q  94 gcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg------ct 187  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| || |||      ||    
T  486548 gcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgtggggtcatgct 486647  T
Q  188 catgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccac 287  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||    
T  486648 catgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctgccac 486747  T
Q  288 tgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  486748 tgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 486776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 42482317 - 42482549
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||        
T  42482317 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 42482416  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||     
T  42482417 tgctcatgacctcctcctggcataactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttatcgcctcataccgctg 42482516  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42482517 ccactgctctgcaatgatctactcttcatttgc 42482549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 22307 - 22539
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  22307 tggtgcctcctcctcggcctttgggctctcctccaggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 22406  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  22407 tgctcatgacctcctccccgcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcctctcgcctcataccgctg 22506  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22507 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 22539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 39831541 - 39831798
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| | || ||||    
T  39831541 tcctggtcctgctgatgctgctgttgcatcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctcccaaagatggcttatggcct 39831640  T
Q  169 gaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 262  Q
    | |||||||| ||||||      |||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||    
T  39831641 ggaaccactgctgaggggtcatgctcatggcctcctcctggcctaactgctcatcagcataggcaacaacgccactaaccatgtcataggagtccagcga 39831740  T
Q  263 gcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39831741 gcttctcgcctcataccgctcccactcctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 39831798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52320 - 52097
Alignment:
Q  92 gtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatg 191  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  52320 gtgccccctcctcggcatgtggcctcgcctcctggccaatatcggcgtgatctgctctttaacatggctcatggcctgaaaccattgctgagggctcatg 52221  T
Q  192 acctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgct 291  Q
    ||||||| | | || ||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52220 acctcctccaggcccatctgtgcatcagagtaggcaacaacgccgctaaccatgtcatagatatcaggtgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgct 52121  T
Q  292 ctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  52120 ctgcaatgatctgcttctcatttg 52097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45133037 - 45132749
Alignment:
Q  29 caagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtc 128  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  45133037 caagtcctaaaaatatatcctaaacataaaatactactactcatggtcttgttgatgctgctggtgccgcctcctcggcctctggcctctcctcctggcc 45132938  T
Q  129 aagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaa 228  Q
    || ||||||| |||||| || || ||||||  ||| |||| |  ||| || | |||||||||   | ||| |||||| | |||| ||||||  |||||||    
T  45132937 aatatcggcgtgatctgctctcttacatggcgcatggcctcagtccattgctcagggctcat---cacctgctgacccaactgctcatcagcataggcaa 45132841  T
Q  229 cagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     | || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45132840 taacgccgctaaccatgtcataggcatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgcttccactgctctgcaatgatctactcctcatttgctggc 45132749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 316
Target Start/End: Original strand, 41242986 - 41243127
Alignment:
Q  175 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctc 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41242986 actgttgagggcttatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagggtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctc 41243085  T
Q  275 gtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41243086 gtaccgctcccactgctctgcagtgatttgctcttcatttgc 41243127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45077507 - 45077405
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45077507 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 45077408  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  45077407 act 45077405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 38588733 - 38588838
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38588733 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 38588832  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  38588833 actgtt 38588838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Original strand, 7949558 - 7949662
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7949558 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgata 7949657  T
Q  430 actgt 434  Q
    |||||    
T  7949658 actgt 7949662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27473382 - 27473270
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473382 cgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 27473283  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  27473282 attggtaactgtt 27473270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 185 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43214529 - 43214398
Alignment:
Q  185 gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcc 284  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  43214529 gctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcataccgctcc 43214430  T
Q  285 cactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43214429 cactggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 43214398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15871923 - 15871820
Alignment:
Q  332 ttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaac 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15871923 ttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaac 15871824  T
Q  432 tgtt 435  Q
    ||||    
T  15871823 tgtt 15871820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 253
Target Start/End: Original strand, 12716091 - 12716257
Alignment:
Q  86 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg 185  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||      
T  12716091 ctgctgttgccgcctcctcggcctctggcctcgcctccta-tcaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcttgaaaccattgttgagaa 12716189  T
Q  186 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 253  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12716190 ctcatgacctcctcctgacccatctgcgcatcagcataggcaatagcggcactaaccatgtcataggt 12716257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45276907 - 45276798
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45276907 cgttagggattgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 45276808  T
Q  423 attagtaact 432  Q
    ||| ||||||    
T  45276807 attggtaact 45276798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33295995 - 33295883
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295995 cgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 33295896  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    |||  ||||||||    
T  33295895 attgataactgtt 33295883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44594912 - 44594800
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44594912 cgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtattattttggttctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 44594813  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  44594812 attggtaactgtt 44594800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 1432270 - 1432382
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1432270 cgttagggtttgtgttatttgggtcctctaactttatttattaatatcattttgatcatatgccttgttaatgtattatgtttaaatagtgactgatatt 1432369  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  1432370 attggtaactgtt 1432382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7535144 - 7535032
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7535144 cgttatagtttgtgttatgtgagtcctctagctttatttattagtatcattttggtcttattcctcgttaacgtattatgattaaataatgactgatatt 7535045  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  7535044 atttgtaactgtt 7535032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 27669555 - 27669667
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27669555 cgttagggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaaatagtgactgatgtt 27669654  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  27669655 attggtaactgtt 27669667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11708047 - 11707949
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11708047 ttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgtt 11707949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5152838 - 5152733
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  5152838 gtttgtgttatatgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcatatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggta 5152739  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  5152738 actgtt 5152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 15048538 - 15048650
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15048538 cgttagggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaataatgattgatatt 15048637  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  15048638 attggtaactgtt 15048650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 340 - 431
Target Start/End: Original strand, 1870089 - 1870182
Alignment:
Q  340 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtat--tatgattaaatagtgactgatattattagtaac 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870089 tgtgggtcccctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaatgtattatatgattaaatagtgactgatattattagtaac 1870182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5435204 - 5435099
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||    
T  5435204 gtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctagttaaggtattataattaaataatgacaaatattattggta 5435105  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  5435104 actgtt 5435099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 425
Target Start/End: Original strand, 40048216 - 40048296
Alignment:
Q  345 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048216 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 40048296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 337 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1646804 - 1646717
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattat 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646804 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattat 1646717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 331 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1651875 - 1651776
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1651875 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 1651776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 331 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1740251 - 1740152
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1740251 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 1740152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 341 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37569608 - 37569513
Alignment:
Q  341 gtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgatt-aaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37569608 gtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaaatagtgactgatatgattggtaactgtt 37569513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 351 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24659479 - 24659395
Alignment:
Q  351 taactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24659479 taactttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactgatattattactaactgtt 24659395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 34367429 - 34367653
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  34367429 tgctgatgctgcctcctcctcggcccctggcctcgcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 34367528  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| |||||              ||| |  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  34367529 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcg--------------acaacaccataaaccatgtcataggtttcaggcgagcttctcgcctcata 34367614  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34367615 ccgctctcactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 34367653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 354 - 435
Target Start/End: Original strand, 34470714 - 34470795
Alignment:
Q  354 ctttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34470714 ctttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgtt 34470795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5679967 - 5679874
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgct 317  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5679967 ggcaacagcgccagtgaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccaatgctgtgcaatgatctcctcttcatttgct 5679874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39604378 - 39604301
Alignment:
Q  239 aaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39604378 aaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcacactgctctgcaatgatctactcttcatttgc 39604301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 181
Target Start/End: Original strand, 41239359 - 41239456
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttg 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  41239359 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgttg 41239456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11173931 - 11173858
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaata 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11173931 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttgggttctatgctttgttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Original strand, 21176090 - 21176219
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||     ||||| |||||| || || ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |    
T  21176090 tacaccaagtcctaaaaatctatcctaaacagaaaatactactacgt---atcctgctgatgttgttgttgcctccaccttggcctctagcctcgcctcc 21176186  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21176187 tggtcatgaacggcgcgatctgctccctaacat 21176219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18298533 - 18298439
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |           |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18298533 gtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttaatcat-----------aggtattatgattaaatagtgacaaatattattagta 18298445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 320
Target Start/End: Original strand, 21176303 - 21176360
Alignment:
Q  263 gcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21176303 gcttctcgcctcgtaccgctctcactgatgtgcaatgatcggctcttcatttgctggc 21176360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 51686414 - 51686124
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||      |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  51686414 tacaccaagtcctaaaaatctatcataaacataaaatactactggtcctg------ctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctca 51686321  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  51686320 tggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctaaaaccactgttgagggcttatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgta 51686221  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51686220 ggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctgctcttcatttgttggc 51686124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 50196585 - 50196340
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 174  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  50196585 tcctgctgatgttgttgatgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaagatcggtgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaacc 50196486  T
Q  175 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctc 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50196485 actgttaagggctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctc 50196386  T
Q  275 gtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50196385 ataccgctcccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 50196340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 320
Target Start/End: Original strand, 50020500 - 50020745
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 174  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  50020500 tcctgctgatgcttctggtgcctcctcctcagcctttggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatttgctccataagatggctcatggcctgaaacc 50020599  T
Q  175 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctc 274  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50020600 actactgagggcccatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagtgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcaagcttctcgcctc 50020699  T
Q  275 gtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50020700 ataccgctcccactgttatgcaatgatctgctcttcatttgctggc 50020745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8110421 - 8110161
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  8110421 tactactggtcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcccctcctggccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggc 8110322  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  8110321 tcatggcctgaaaccactactgagagctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagcataggcaacagcggcacgaaatatgtcataggtgtcagg 8110222  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8110221 cgagcttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 8110161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46439283 - 46439030
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||       ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46439283 tactgctactcctggtcctgctgatactgctggtgcctcctcctcggtct-------cgcctcctggtcaagatcgacgcgatctgctccctaacatggg 46439191  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46439190 tcatggcctgaaaccactgttcagggctcatgacctcctcctgatctatatgcgcatcaacgcaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcagg 46439091  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  46439090 cgagcttctcgcctcgtaccgcttccactgctctacaatgatctgctattcgtttgctggc 46439030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 10729781 - 10730041
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || || |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |     
T  10729781 tactactactcctgatcctactgtagttgttgttgccgcctcctcggcctctggcctcacctcttggccaatatcggcgtgatctggtccctaacatagc 10729880  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  10729881 tcatggcctgaaaccattgttgagggctcatgacctccgcctggcccatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcagg 10729980  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10729981 cgagcttctcgccttgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttgctggc 10730041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 10943550 - 10943810
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || || |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |     
T  10943550 tactactactcctgatcctactgtagttgttgttgccgcctcctcggcctctggcctcacctcttggccaatatcggcgtgatctggtccctaacatagc 10943649  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  10943650 tcatggcctgaaaccattgttgagggctcatgacctccgcctggcccatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcagg 10943749  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10943750 cgagcttctcgccttgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttgctggc 10943810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 21018397 - 21018635
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  21018397 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 21018496  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21018497 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccattaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 21018596  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21018597 ccgctcccactactctgcaatgatctgctcttcatttgc 21018635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 314
Target Start/End: Original strand, 30723546 - 30723782
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  30723546 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 30723645  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30723646 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 30723745  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcattt 314  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30723746 ccgctcccactggtctgcaatgatctgctcttcattt 30723782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 6178615 - 6178847
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  6178615 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 6178714  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  6178715 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 6178814  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178815 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 6178847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 41795844 - 41796082
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41795844 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 41795943  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41795944 gggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 41796043  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796044 ccgctgccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 41796082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49168763 - 49168525
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  49168763 tgctgatggtgcctcctcctcggcctatgggctctcctcctggtcaaaatcgacgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 49168664  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  49168663 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgccataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 49168564  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168563 ccgctgccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 49168525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14317858 - 14317624
Alignment:
Q  81 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  14317858 tgatgctgctggtgcctcctcctcgtcctctggcctcgcctcctggccaacatcggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcttgaaaccattgtt 14317759  T
Q  181 gagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacca 280  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||     
T  14317758 gagggctcatgacctccgcctggcccatctgcgcgtcagcgtaggcaacagcaccgctaacaatgtcataggtatcacgcgagcttctcgcctcgtaccg 14317659  T
Q  281 ctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14317658 ctcacactgctctgcaataatctgctcctcatttg 14317624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 1305945 - 1306177
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  1305945 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 1306044  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  1306045 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcttaccgctg 1306144  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306145 ccactgctctgcaatgatcttctcttcatttgc 1306177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 40355223 - 40355460
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  40355223 tgctgatggtgcctcctcctcggcctatgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctcc-tcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 40355321  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  40355322 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 40355421  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40355422 ccgctcccactggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 40355460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49093668 - 49093436
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  49093668 tggtgcctcctcctcagcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 49093569  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  49093568 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 49093469  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093468 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 49093436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31424986 - 31424754
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  31424986 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 31424887  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||     
T  31424886 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcacaggtgtcagacgagcttctcgcctcataccgctg 31424787  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424786 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 31424754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 72187 - 71952
Alignment:
Q  80 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||| |||| ||| |||||| ||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  72187 ctgatgctgctagtgcctcctcctcagcctctagccttgccttctggccaatatcggcacgatctactctctaacatggctcatggcctgaaaccattgc 72088  T
Q  180 tgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacc 279  Q
    |||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  72087 tgagggctcatgacctactcctgggccatctgtgcatcagcataggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtacc 71988  T
Q  280 actcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  71987 gctcccactactctgcaatgatctgctcctcatttg 71952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 50278385 - 50278164
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  50278385 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccccgcctcctggtcaaaatcggctcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgtagag 50278286  T
Q  184 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
    |||||||||||||||   | || ||||| |||||||            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  50278285 ggctcatgacctcct---ggcccatctgtgcatcag------------cggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctc 50278201  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50278200 ccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 50278164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44991589 - 44991477
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991589 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 44991490  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  44991489 attggtaactgtt 44991477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Original strand, 21535045 - 21535275
Alignment:
Q  80 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactg-gtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactg 178  Q
    |||||| || || |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  21535045 ctgatgttgttgttgccgcctcctcggcctctggccttgcct-ctgtgtcaatatcgacgcgatctgctccctaacatggctcatggcctgaaatcattg 21535143  T
Q  179 ttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtac 278  Q
     ||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  21535144 ctgagggctcatgacctcctcctaacccatttgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcatac 21535243  T
Q  279 cactcccactgctctgcaatgatctgctcttc 310  Q
    | ||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21535244 cgctctcactgttgtgcaatgatctactcttc 21535275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 50768960 - 50769072
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50768960 cgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 50769059  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  50769060 attggtaactgtt 50769072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 318
Target Start/End: Original strand, 11081483 - 11081684
Alignment:
Q  117 cgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcat 216  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||| |||| ||||   ||||||| || |||||||    
T  11081483 cgcctcctggtcaatatcggcgtgatcttctccctaacatgggtcatggcctgaaaccattactcaggggtcataacctttgtctgacccatatgcgcat 11081582  T
Q  217 cagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11081583 caacgtaggcaacatcgccactaaccatgtcacaggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgcccccactgctctgcaatgatctgcccttcatttgc 11081682  T
Q  317 tg 318  Q
    ||    
T  11081683 tg 11081684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 287
Target Start/End: Original strand, 41930810 - 41931070
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |    
T  41930810 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactattactcctggtcctgctgatgctgctggtgccgcctccttgacctctggcctcgcctcc 41930909  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  ||| || | | ||||||| |||||   || ||| | |||| |||||   ||    
T  41930910 tggccaatatcagcgcgatctgctccctaacatggcgcatggcctcagtccattgctcatggctcatcacctc---ctaacccaactgctcatcaacata 41931006  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccac 287  Q
     |||||| || | |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41931007 agcaacaacgccgctaaccatgtcacaagtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccac 41931070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19088652 - 19088540
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088652 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 19088553  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  19088552 attggtaactgtt 19088540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33091764 - 33091652
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091764 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 33091665  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  33091664 attggtaactgtt 33091652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 53751213 - 53751101
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53751213 cgttatgatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtataattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatatt 53751114  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  53751113 attggtaactgtt 53751101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1433575 - 1433473
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1433575 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttatggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 1433476  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  1433475 act 1433473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19508717 - 19508612
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19508717 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattagta 19508618  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  19508617 actgtt 19508612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30683839 - 30683727
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30683839 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatatt 30683740  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| | |||||||    
T  30683739 attggcaactgtt 30683727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 38339631 - 38339743
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38339631 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacacatatt 38339730  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  38339731 attggtaactgtt 38339743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43734589 - 43734485
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43734589 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattatttgtaa 43734490  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  43734489 ctgtt 43734485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46849980 - 46849868
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46849980 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatatt 46849881  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  46849880 attggtaactgtt 46849868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 50508768 - 50508656
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50508768 cgttatggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 50508669  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  50508668 attggtaactgtt 50508656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53995245 - 53995135
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53995245 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 53995146  T
Q  423 attagtaactg 433  Q
    ||| |||||||    
T  53995145 attggtaactg 53995135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Original strand, 14985470 - 14985579
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985470 cgttagggttcgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 14985569  T
Q  423 attagtaact 432  Q
    ||| ||||||    
T  14985570 attggtaact 14985579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 8592108 - 8592220
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8592108 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 8592207  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  8592208 attggtaactgtt 8592220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42855650 - 42855538
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42855650 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcctcgttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 42855551  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  42855550 attggtaactgtt 42855538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 44957528 - 44957640
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957528 cgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgataatgtattatgattaaatagtgactgatatt 44957627  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  44957628 attggtaactgtt 44957640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15477949 - 15477844
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15477949 gtttgtgttacgtgggtcctctaactttgtttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactcatattattggta 15477850  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  15477849 actgtt 15477844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21763485 - 21763380
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21763485 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttttatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 21763386  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  21763385 actgtt 21763380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 37016409 - 37016640
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | || | |||| |||||||||||||| ||||    
T  37016409 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgccttctagtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatattgctcatggcctgaaaccactgctgag 37016508  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| |        || |||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37016509 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaacg-------agcgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 37016601  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016602 ccgctttcactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 37016640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41752127 - 41752015
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41752127 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 41752028  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  41752027 attggtaactgtt 41752015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43566681 - 43566577
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43566681 tttgtgttatgtgggtcctcaaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaa 43566582  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  43566581 ctgtt 43566577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39448792 - 39448690
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  39448792 gtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggta 39448693  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  39448692 act 39448690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 623983 - 623878
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  623983 gtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgacagatattattggta 623884  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  623883 actgtt 623878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 331 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37206730 - 37206629
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37206730 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtggctgatattattggtaa 37206631  T
Q  431 ct 432  Q
    ||    
T  37206630 ct 37206629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 52557391 - 52557286
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  52557391 gtttgtattatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtaactgatattattggta 52557292  T
Q  430 actgtt 435  Q
    | ||||    
T  52557291 attgtt 52557286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 6712102 - 6712214
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6712102 cgttagggtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctgtgccttattaagatattatgattaaatagtgactgatatt 6712201  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  6712202 attggtaaatgtt 6712214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16038105 - 16037993
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16038105 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaagtagtgacggatatt 16038006  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  16038005 attggtaattgtt 16037993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 53259442 - 53259342
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||    
T  53259442 gtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaacaatgagtgatattattggta 53259343  T
Q  430 a 430  Q
    |    
T  53259342 a 53259342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 348 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6505822 - 6505735
Alignment:
Q  348 ctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6505822 ctctaattttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 6505735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Original strand, 12817952 - 12818047
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12817952 gtttgtgttatgtgggtcctgtaactttatttatcagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattatt 12818047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23756110 - 23755999
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756110 gttagggtttgcgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 23756011  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    ||  ||||||||    
T  23756010 ttgataactgtt 23755999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 24898335 - 24898440
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24898335 gtttgtgttatgtgcgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcacatgtcttgttaatgtattatgattaaatagtgactaatattattggta 24898434  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  24898435 actgtt 24898440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25182116 - 25182011
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25182116 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggta 25182017  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  25182016 actgtt 25182011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 344 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23755708 - 23755617
Alignment:
Q  344 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23755708 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtt 23755617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41878169 - 41878058
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41878169 gttagggtttatgttatgtgggtcctccaactttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaatattgactgatatta 41878070  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||||||||    
T  41878069 ttggtaactgtt 41878058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36122737 - 36122642
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36122737 gtttgtgttatataggtcctctaactatatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgactaaatagtgattgatattatt 36122642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50904627 - 50904435
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |    
T  50904627 tacatcaagtcctaaaaatttatcctaaaaataaaatactactagtcctggtctcggtcctgctgatggtgcctcctcctcggtctttggcgttgcctcc 50904528  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcat 216  Q
    |||  || ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  50904527 tggctaatatcggcgcgatatgctccctaacatggctcatggcctgataccactgctgagggcccatgacctcctcctggcccatctgtgcat 50904435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 314
Target Start/End: Original strand, 44676950 - 44677025
Alignment:
Q  239 aaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcattt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44676950 aaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcattt 44677025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 320
Target Start/End: Original strand, 55278613 - 55278831
Alignment:
Q  99 ctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcct 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| | ||| || ||||||| ||||  ||| |||| |||||| || | |||| |||| |||||||    
T  55278613 ctcctcggcctccggcctcgcctcttggtcaatatcggtgtgatatgctccctaatatggtgcatggcctcaaaccattgctcagggttcatcacctcct 55278712  T
Q  199 tctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaat 298  Q
       |||| |||||| ||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  55278713 ---gacccatctgctcatcagcataggcaacaacaccactaaccatgtcataagtatcaggcgagcctctcgcctcgtactactcccactgttgtgcaat 55278809  T
Q  299 gatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||    
T  55278810 gatttgctcctcattagctggc 55278831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 13624485 - 13624575
Alignment:
Q  225 gcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13624485 gcaacaacgccactaaccatatcataggtatcatgcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttg 13624575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 223
Target Start/End: Original strand, 44674656 - 44674795
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||   ||||         
T  44674656 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactaccgaggggtca 44674755  T
Q  185 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  44674756 tgctcatgacctcctcctggcctaactgagcatcagtgta 44674795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 50904437 - 50904366
Alignment:
Q  247 cataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  50904437 cataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatga--tgctcctcatttgctggc 50904366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 320
Target Start/End: Original strand, 40886456 - 40886677
Alignment:
Q  98 cctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcc 197  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||   ||| ||   | |||| || | | ||||||| ||||      
T  40886456 cctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaatatcggtgcaatctgctccctaacatgtcgcatggctgcagaccattgctcaaggctcatcacct-- 40886553  T
Q  198 ttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccac--tcccactgctctgc 295  Q
     |||||||||  ||| ||||||  ||||||||| || || ||| ||| ||||| || ||| | |||| ||||| |||||||| |  |||||||| | |||    
T  40886554 -tctgacctaattgctcatcagcataggcaacaacgccattaatcatctcataagtatcaagagagcctctcgcctcgtaccgcgctcccactggtgtgc 40886652  T
Q  296 aatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  40886653 aatgatctgctcctcatttgctggc 40886677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12892153 - 12892091
Alignment:
Q  83 atgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12892153 atgctgctgttgccgcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaatatcggcacgatctg 12892091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30706970 - 30706914
Alignment:
Q  264 cttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30706970 cttctcgcctcgtaccgctcacactactctgcaatgatatgctcttcatttgttggc 30706914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Original strand, 13624332 - 13624402
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 145  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||    
T  13624332 tcctgctggtgctgttggtgcctcctcctcggcatctggcctcgcctcctggtaatgatcgacgcaatctg 13624402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20353802 - 20353551
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||    
T  20353802 tcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgtctcctggtcatgatcggcgcgatctgctccccaagatgggtcatggcct 20353703  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353702 gaaaccactgatgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaagcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 20353603  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20353602 cgtctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgttggc 20353551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 11380783 - 11381026
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11380783 tacaccaagtcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactactcctggtcctgttgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcttcc 11380882  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  11380883 tagtcaagatcgccgcgatctgctccctaacatgggtcatgacctgaaaccactgctgaggactcatgacctcctcctgtcctatctgcgcatcagcgta 11380982  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttc 267  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11380983 ggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgttaggcgagcttc 11381026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42759949 - 42759665
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  42759949 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcatggtcctgctaatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctct 42759850  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||           
T  42759849 tggtcaagatcggcgcgatgtgctcccttacatgggtcatggcctgaaaccactgctgagggttcatgacctcctcctgacctatctgcgcat------- 42759757  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
         ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42759756 -----cagcggcactaaccatgtcatgggtgtcagacgagcttctcgcctcatgccgctcccactactgtgcaatgatctgttcttcatttgctggc 42759665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6928395 - 6928135
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  6928395 tactgctactcctggtcctgctgatggtgctggtgcatcctccttggcatctggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacacgag 6928296  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcagg 259  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6928295 tcatggcctgaaaccactgctgagggatcatgacatcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggcaactacgacactaaccatgccataggtgtcagg 6928196  T
Q  260 cgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6928195 cgaacttctcacctcgtaccgctcccaccgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 6928135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44232966 - 44232721
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  44232966 tcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcgacctatgggctcgcctcctggtcaagatcggcgcgttctgctccctaagatggcttatggcctgaaacc 44232867  T
Q  175 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44232866 actgttgagggctcatgacctcctcctggcctaattgcacatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcacctc 44232767  T
Q  275 gtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44232766 ataccgctcccactgatgtgcaatgatctgcttttcatttgctggc 44232721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34048671 - 34048439
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  34048671 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 34048572  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  34048571 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 34048472  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048471 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 34048439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 42900967 - 42901199
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  42900967 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 42901066  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  42901067 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 42901166  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901167 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 42901199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 2648377 - 2648615
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| | ||    
T  2648377 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctaag 2648476  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2648477 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 2648576  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2648577 ccgctcccattggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 2648615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48891766 - 48891532
Alignment:
Q  81 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgtt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  48891766 tgatgctgctggtgcctcctcctcagcctctggccttgccttctgaccaatatcgacgcgatctgctctctaacatggctcatggcctgaaaccattgct 48891667  T
Q  181 gagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacca 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  48891666 gagggctcatgacctccttctggctcatctgtgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccg 48891567  T
Q  281 ctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  48891566 ctcccactgctcagcaatgatcttctcctcatttg 48891532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 50477584 - 50477816
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  50477584 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 50477683  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  50477684 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 50477783  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50477784 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 50477816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54389371 - 54389139
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  54389371 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 54389272  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  54389271 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 54389172  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389171 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 54389139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16646747 - 16646509
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16646747 tgctgatggtgcctcctcctcgacctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgttgag 16646648  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16646647 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagtgtaggaaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 16646548  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646547 ccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 16646509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46401957 - 46401719
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||  || ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46401957 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggttctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 46401858  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  46401857 ggatcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 46401758  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401757 ccgctgccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 46401719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 46698122 - 46698354
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  46698122 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 46698221  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  46698222 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtatgcaatagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 46698321  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698322 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 46698354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 113 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 600081 - 599881
Alignment:
Q  113 gcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgc 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |   |  | | |||     
T  600081 gcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgggggctcatgacctctt---gggccaactgt 599985  T
Q  213 gcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599984 gcatcagtgtaggcaacagcggcactaaccatgtcgtaggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcat 599885  T
Q  313 ttgc 316  Q
    ||||    
T  599884 ttgc 599881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 112 - 320
Target Start/End: Original strand, 17562171 - 17562386
Alignment:
Q  112 ggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg-------ctcatgacctccttctgac 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||       ||||||||||||| ||| |    
T  17562171 ggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccattgctgagggggtcatgctcatgacctcctcctggc 17562270  T
Q  205 ctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctg 304  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17562271 ctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaagcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctttgcaatgatctg 17562370  T
Q  305 ctcttcatttgctggc 320  Q
    || |||||||||||||    
T  17562371 cttttcatttgctggc 17562386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 2271857 - 2272095
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| | ||| | |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  2271857 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctagtcaaaattggcgtgatctgcttcctcatatggctcatggcctcaaaccactgctgag 2271956  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  2271957 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaatcatgtcataggtgttaggcgagcttctcgcctcata 2272056  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2272057 ccgctcccactggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 2272095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41615510 - 41615271
Alignment:
Q  75 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 174  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  41615510 tcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaagatcggcgcaatctgctccctaagatggctcatggcctgaaacc 41615411  T
Q  175 actgttgagggct------catgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
    |||||||||||||      ||||||||||| ||| |||| ||||||||            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41615410 actgttgagggctcatgcacatgacctcctcctggcctaactgcgcat------------cagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 41615323  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    || ||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41615322 cgcctcataccgcttccactgttgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 41615271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Original strand, 49266177 - 49266410
Alignment:
Q  91 ggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg----- 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| | ||||         
T  49266177 ggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagacaggcgcaatctgctccctaagatggctgatggcctgaaaccactgctaaggggtcat 49266276  T
Q  186 -ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcc 284  Q
     |||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||    
T  49266277 gctcatgacctcctcatggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacatcgccactaaccatgtcataagtgtcagacgagcttctcgcctaataccgctcc 49266376  T
Q  285 cactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctg 318  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49266377 cactgctatgcaatgatttgctcttcatttgctg 49266410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 47070987 - 47071226
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaa-ccactgttga 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  47070987 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcatcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaaccactgctga 47071086  T
Q  183 ggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgt 276  Q
    |||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||||| |  ||  || |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  47071087 ggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgcaggcaacaacaccataaaacatgtcatagatgtcaggcgagtttctcgcctcat 47071186  T
Q  277 accactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071187 accgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 47071226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10506259 - 10506147
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506259 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 10506160  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  10506159 attggtaattgtt 10506147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 42591923 - 42592035
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42591923 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 42592022  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  42592023 attggtaactgtt 42592035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54108213 - 54108101
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108213 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 54108114  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  54108113 attggtaactgtt 54108101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51509429 - 51509318
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509429 gttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 51509330  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||||||||    
T  51509329 ttggtaactgtt 51509318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 325 - 435
Target Start/End: Original strand, 54752304 - 54752414
Alignment:
Q  325 ttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattat 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54752304 ttatggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattat 54752403  T
Q  425 tagtaactgtt 435  Q
    | |||||||||    
T  54752404 tggtaactgtt 54752414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 4005215 - 4005450
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4005215 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccttgcctcttggtcaagatcggcacgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaaccactgctgag 4005314  T
Q  184 ggctcatg---acctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacca 280  Q
    || |||||   |   |||  ||  | | ||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  4005315 gggtcatgctcatgacctcatgggccaactgtgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcgtaggcgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccg 4005414  T
Q  281 ctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4005415 ctcccaccggtctacaatgatctgctcttcatttgc 4005450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9473528 - 9473293
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||    
T  9473528 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctagtcaagatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaactactgctaag 9473429  T
Q  184 ggctcatgacct---ccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacca 280  Q
    || |||||  |    | | ||  || | ||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  9473428 gggtcatgctcatgacatcctagcccaactgtgcatcagcgtaggcaacagcaccgctaaccatatcgtaggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccg 9473329  T
Q  281 ctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473328 ctctcactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 9473293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 320
Target Start/End: Original strand, 50213974 - 50214210
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || | |||| |||| |||||||||||| | ||| ||        
T  50213974 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaaaatcggcgcgatctgctctcttatatggctcatggcctgaaaccacagctgatgggtaa 50214073  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      || ||||||| || ||| |||| ||||||||||  |||||||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||    
T  50214074 tgcttatgaccttctcctggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacaacgccacaatccatgtcataggtgttaggcgggcttctcgcctcataccgctc 50214173  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50214174 ccactgctgtgcaatgatctgcttttcatttgctggc 50214210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Original strand, 39241504 - 39241599
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241504 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 39241599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 11256256 - 11256354
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11256256 ttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 11256354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 244
Target Start/End: Original strand, 16861562 - 16861743
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| |||| |||| ||||    
T  16861562 tcctggtcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctgttcaagatcagcgcaatctgctctctaagatggctcatggcct 16861661  T
Q  169 gaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccat 244  Q
    |||||||||| |||||      |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16861662 gaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgtgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccat 16861743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Original strand, 22201755 - 22201864
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22201755 cgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatatt 22201854  T
Q  423 attagtaact 432  Q
    ||| ||||||    
T  22201855 attggtaact 22201864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 49141337 - 49141557
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  49141337 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 49141436  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||     
T  49141437 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcag------------cgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttcccgcctcataccgctg 49141524  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141525 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 49141557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 21969775 - 21969877
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21969775 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggta 21969874  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  21969875 act 21969877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 21992211 - 21992313
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21992211 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggta 21992310  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  21992311 act 21992313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 22151991 - 22152093
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22151991 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 22152090  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  22152091 act 22152093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8474150 - 8474045
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8474150 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgata 8474051  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  8474050 actgtt 8474045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26318486 - 26318381
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26318486 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggta 26318387  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  26318386 actgtt 26318381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32633369 - 32633264
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32633369 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggta 32633270  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  32633269 actgtt 32633264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 39951503 - 39951608
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39951503 gtttgtgttatgtgggtcctttaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgata 39951602  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  39951603 actgtt 39951608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 16931745 - 16931857
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16931745 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattaagattaaatagttactgatatt 16931844  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| ||| |||||    
T  16931845 attggtagctgtt 16931857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 53716433 - 53716544
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716433 cgttagggtttgtgttacgtggg-cctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 53716531  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  53716532 attggtaactgtt 53716544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39664481 - 39664383
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  39664481 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaaatgtt 39664383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 52388414 - 52388637
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  52388414 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagattggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaaccactgctaag 52388513  T
Q  184 ggctcatgacctccttc-tgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccact 282  Q
    || |||||      ||| ||||||    || || | ||    ||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  52388514 gggtcatg------ttcatgacctcctggcccaactgt----gcatcaacgccgctaaccatgtcgtaggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccgct 52388603  T
Q  283 cccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  52388604 cccacttgtctgcaatgatctgctcttcatttgc 52388637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5900734 - 5900622
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5900734 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 5900635  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
     || |||| ||||    
T  5900634 tttggtaattgtt 5900622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 18464595 - 18464707
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18464595 cgttagggtttgtgttatgtaggtcctatagctttatttattagtatcattttggtcatatgcattgttaaggtattatggttaaatagtgactgatatt 18464694  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  18464695 attggtaactgtt 18464707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 29818316 - 29818428
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818316 cgttagggtttgtgttatatggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgttttattaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 29818415  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  29818416 attggtaactgtt 29818428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 47669398 - 47669510
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  47669398 cgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagatattatgattaaatagtgatagatatt 47669497  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    |||  ||||||||    
T  47669498 attgataactgtt 47669510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 47303315 - 47303218
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47303315 ttatgtgggtcctctaactttatttatta-tatcattttgatcatatgccttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 47303218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12203855 - 12203750
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12203855 gtttgtgttatgtgggacctctaactttatttattagtatcattttggtaatatgttttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggta 12203756  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  12203755 actgtt 12203750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 331 - 432
Target Start/End: Original strand, 24428714 - 24428815
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24428714 tttgtgttatgtggatcctctaacttaatttattagtatcattttgctcctatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 24428813  T
Q  431 ct 432  Q
    ||    
T  24428814 ct 24428815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 44893886 - 44893991
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  44893886 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagatattatgatcaaatagtgactgatatcattggta 44893985  T
Q  430 actgtt 435  Q
    | ||||    
T  44893986 attgtt 44893991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48566090 - 48565957
Alignment:
Q  60 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 159  Q
    |||| ||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48566090 tactgctactcctggtcttgttgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctaccctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 48565991  T
Q  160 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgac 193  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48565990 tcatggcctgcaaccactgctgagggctcatgac 48565957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 21568886 - 21568993
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21568886 gttagggtttgtgttatgtgg-tcctctaaccttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactaatatta 21568984  T
Q  424 ttagtaact 432  Q
    || ||||||    
T  21568985 ttggtaact 21568993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 4773395 - 4773493
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4773395 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtt 4773493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 15986381 - 15986482
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15986381 gtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcctat-tcgtgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggta 15986479  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  15986480 act 15986482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 349 - 431
Target Start/End: Original strand, 46152778 - 46152860
Alignment:
Q  349 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaac 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46152778 tctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaac 46152860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41835218 - 41835125
Alignment:
Q  342 tgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41835218 tgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaatgtattttgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 41835125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 337 - 425
Target Start/End: Original strand, 27801642 - 27801730
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801642 ttatgtggatcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattatt 27801730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1994479 - 1994368
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  1994479 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgagcgatatt 1994381  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    |||  ||||||||    
T  1994380 attgataactgtt 1994368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4757804 - 4757693
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  4757804 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgataa-gaattatgatcaaatagtgaccgatatt 4757706  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  4757705 attggtaactgtt 4757693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 423
Target Start/End: Original strand, 19883378 - 19883478
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19883378 cgttagggtttgtgttatgtgagtaccttaactttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 19883477  T
Q  423 a 423  Q
    |    
T  19883478 a 19883478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Original strand, 30253041 - 30253132
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30253041 ggcaacagcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctagcctcgtaccgctcccactgctctacaatgatatgctcttcatttg 30253132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36130722 - 36130499
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  36130722 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccttgcatcttggtcaagatcggcgcgatctgctccctcatatgcgtcatggactgaaaccactgctgag 36130623  T
Q  184 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
    || |||||     ||  ||||||    || || | ||    ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  36130622 gggtcatg-----ctcatgacctcctggcccaactgt----gcatcagcgccgctaaccatgtcgtaggtgtcagacgagcttctcgcctcttaccgctc 36130532  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36130531 caactggtctgcaatgatatgctcttcatttgc 36130499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 48565948 - 48565879
Alignment:
Q  251 ggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48565948 ggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtactgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 48565879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Original strand, 42804750 - 42804825
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatct 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  42804750 tcctggtcctactgatgctgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtaatgattggcgcgatct 42804825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Original strand, 42804908 - 42804999
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||| |||| || ||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42804908 ggcaatagcgccagtaaccatatcataggtatcatgcgagcttcttgcctcgtaccgctcccactgctctacaatgatctgctcctcatttg 42804999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Original strand, 30252898 - 30252968
Alignment:
Q  86 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  30252898 ctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctccaggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 30252968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28986453 - 28986392
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatg 384  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28986453 cgttagggtttgtgttatatgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatg 28986392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18752036 - 18751920
Alignment:
Q  38 aaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggc 137  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||| |||||||    
T  18752036 aaaatctatcctaaatagaaaatattactactcttggtcttgctgatgttggtgttgcctcctcctcggcctctggccccgtttcctggtcatgatcggc 18751937  T
Q  138 gcgatctgatccctaac 154  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18751936 gcgatctgcttcctaac 18751920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 145
Target Start/End: Original strand, 26334789 - 26334841
Alignment:
Q  93 tgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 145  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  26334789 tgccgcctcctcggcctctggcctcgtctcctggtcaatatcggcgcgatctg 26334841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28986395 - 28986359
Alignment:
Q  399 tatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28986395 tatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 28986359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12374008 - 12373946
Alignment:
Q  25 acaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgct 87  Q
    |||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12374008 acaccaagtcctaaaaatctgtccgaaacataaaatactcctactgctgatcctactcatgct 12373946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 257
Target Start/End: Original strand, 24885416 - 24885617
Alignment:
Q  56 aaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaaca 155  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24885416 aaaatattactactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctccttctcggcctctggcctcgcctcctgctcaagatcggtgcgatccgctccctaaca 24885515  T
Q  156 tgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgt 255  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885516 tgggtcatggcctgaaacaactgctgagggctcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcatcgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgt 24885615  T
Q  256 ca 257  Q
    ||    
T  24885616 ca 24885617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26173187 - 26172927
Alignment:
Q  59 atactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgg 158  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  26173187 atactactggtcctggtcctattgatgctgctggtgccttctcctcggcctctagcctcgcctcatgatcaagatcggcgcgatctgctcc-taagatgg 26173089  T
Q  159 gtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcag 258  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26173088 ctcatggcctaaaaccactgctgagggctcatgaccttctcctggccaatctgtgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcag 26172989  T
Q  259 gcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    | |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26172988 gtgagcttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgctctttatttgctggc 26172927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22304482 - 22304244
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22304482 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 22304383  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22304382 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 22304283  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304282 ccgctcccactggtctgcaatgatctgctcttcatttgc 22304244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6204395 - 6204163
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  6204395 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 6204296  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  6204295 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 6204196  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204195 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 6204163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11691362 - 11691130
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  11691362 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 11691263  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  11691262 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 11691163  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691162 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 11691130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 30826429 - 30826661
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  30826429 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 30826528  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  30826529 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 30826628  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826629 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 30826661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 250
Target Start/End: Original strand, 2405802 - 2406027
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  2405802 tacaccaaatcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactggtcctggtcctgctgatgttgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcc 2405901  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||     
T  2405902 tggtcaagatcggcgcgatctgctccgtaacatgggtcatggcctgaaaccactactgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcaacgtt 2406001  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcata 250  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2406002 gg-aacagcggcactaaccatgtcata 2406027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27639000 - 27638762
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  27639000 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 27638901  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  27638900 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactgaccatgtcataggtgtcaggcgaacttctcgcctcata 27638801  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638800 ccgctgccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 27638762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2407524 - 2407246
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  2407524 tacaccaagtcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactggtcctg------ctgatgctgctagtgcctcctcctcggactctggcctcgcctcc 2407431  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 223  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||           
T  2407430 tggtcaagatcgacgcgatctgctctctaacatgggtcatggtctgaaaccaccggtgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcat------- 2407338  T
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
         || || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2407337 -----caacggcattaaccatgtcataggtgtgcggcgagcttctcgcttcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 2407246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3384667 - 3384438
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctca 189  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  3384667 tggtacctcatcctaggcctctggcctcgcctctaagtcaagatcggggcgatttgctccctaacatggctcatggcctgaaaccactactgagggctca 3384568  T
Q  190 tgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactg 289  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||     
T  3384567 tgacctcctcctgacctatttgtgcatcagcg-aggcaacaacaacactaaccatgtcataggtgtcaggccagcttctcgcctcgtatcgctcccacta 3384469  T
Q  290 ctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3384468 ctctgaaatgatttgctcttcatttgctggc 3384438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31771308 - 31771077
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  31771308 tgctgatgttgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctaatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 31771209  T
Q  184 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
    || |||||     || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||  |||    
T  31771208 gggtcatg-----ctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggtgtcaagcgagtttctcacctcatactgctc 31771114  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31771113 ccactgctgtgcaatgatctgctcttcatttgctggc 31771077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 304
Target Start/End: Original strand, 18001601 - 18001836
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 168  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  18001601 tcctggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctaacctcgcctcctggccaatattggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcct 18001700  T
Q  169 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttct 268  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18001701 gaaaccattgatgagggctcatgacctcttcctggcccatctgtgcatcagcgtaggcaacatcgccgttaaccatgtcataggtatcaagcgagcttct 18001800  T
Q  269 cgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctg 304  Q
    || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18001801 cgccttgtaccgctcccactgctctacaatgatctg 18001836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 7270768 - 7270880
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270768 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 7270867  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  7270868 attggtaactgtt 7270880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32993326 - 32993214
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32993326 cgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtgttatgattaaataatgactgatatt 32993227  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  32993226 attggtaactgtt 32993214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34994691 - 34994579
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34994691 cgttagggtttgtgttatgcgggtcctctaacttgatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 34994592  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  34994591 attggtaactgtt 34994579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5938124 - 5938015
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5938124 cgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 5938025  T
Q  423 attagtaact 432  Q
    ||| ||||||    
T  5938024 attggtaact 5938015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 9046232 - 9046337
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9046232 gtttgtgttatgtgggtcctctaaatttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaagctattatgattaaatagtgactgatattattggta 9046331  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  9046332 actgtt 9046337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 24744467 - 24744579
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744467 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 24744566  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  24744567 attggtaactgtt 24744579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 34890783 - 34890895
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34890783 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaataatgactgatatt 34890882  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  34890883 attggtaactgtt 34890895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 325 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5639482 - 5639372
Alignment:
Q  325 ttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattat 424  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5639482 ttatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattat 5639383  T
Q  425 tagtaactgtt 435  Q
    | |||| ||||    
T  5639382 tggtaattgtt 5639372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 338 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3423466 - 3423369
Alignment:
Q  338 tatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3423466 tatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgaccgatattattggtaactgtt 3423369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 5310966 - 5311074
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5310966 gttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 5311065  T
Q  424 ttagtaact 432  Q
    || ||||||    
T  5311066 ttggtaact 5311074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 18053095 - 18053207
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053095 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 18053194  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  18053195 attggtaattgtt 18053207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 26600496 - 26600608
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26600496 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttattaaggtattatgattaaatagtgaccgatatt 26600595  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  26600596 attggtaactgtt 26600608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Original strand, 7270093 - 7270204
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7270093 gttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattg 7270192  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    ||  ||||||||    
T  7270193 ttgataactgtt 7270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21856866 - 21856754
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21856866 cgttatggtttttgttatatgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaacagtgacggatatt 21856767  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    |||  ||||||||    
T  21856766 attgataactgtt 21856754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3502237 - 3502038
Alignment:
Q  81 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccac---- 176  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||        
T  3502237 tgatgttgttggtgcttcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgtgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccacgaaa 3502138  T
Q  177 ----tgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagctt 266  Q
        || ||||||      ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3502137 ccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagtgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtggcaggcgagctt 3502038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21540288 - 21540186
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21540288 cgttagggtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgattgatatt 21540189  T
Q  423 att 425  Q
    |||    
T  21540188 att 21540186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 26957115 - 26957213
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26957115 ttatgggggtcctctagctttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgtt 26957213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6236232 - 6236120
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6236232 cgttagggtttgtgttatgtgaatcctctaacttcatttattagtatcatcttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatatt 6236133  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  6236132 attggtaactgtt 6236120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25176968 - 25176856
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  25176968 cgttagggtttgtgttatgtggggcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacaaatatt 25176869  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  25176868 attggtaactgtt 25176856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35167803 - 35167689
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtat--tatgattaaatagtgactgata 420  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35167803 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcctaatccttgttaaggtattatatgattaaatagtgactgata 35167704  T
Q  421 ttattagtaactgtt 435  Q
    ||| | |||||||||    
T  35167703 ttaatggtaactgtt 35167689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 31247262 - 31247364
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  31247262 gtttgttttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattggta 31247361  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  31247362 act 31247364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6137681 - 6137577
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6137681 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgagtgatattatttgtaa 6137582  T
Q  431 ctgtt 435  Q
     ||||    
T  6137581 ttgtt 6137577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Original strand, 32753317 - 32753424
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753317 gttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactgtatttattagtataa----ggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 32753412  T
Q  424 ttagtaactgtt 435  Q
    || |||| ||||    
T  32753413 ttggtaagtgtt 32753424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 423
Target Start/End: Original strand, 2517148 - 2517241
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517148 gtttgtgttatgtgggtcctccaactttatttataagaatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 2517241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 31237892 - 31237997
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||    
T  31237892 gtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttgatcatgttccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattgtta 31237991  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  31237992 actgtt 31237997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32642997 - 32642906
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32642997 ggcaacaacgccactaaccatgtcataggtatcaggggagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttg 32642906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Original strand, 32641812 - 32641903
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32641812 ggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatccgctcctcatttg 32641903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Original strand, 32641674 - 32641741
Alignment:
Q  89 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32641674 ctggtgcctcctcctcggtctctggcctcgcctcctggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 32641741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32643155 - 32643068
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32643155 tcctggtcctgctggtgctgctggtgcctcctcctcagcctctagcctcgcctcatggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 32643068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 369
Target Start/End: Original strand, 6532331 - 6532377
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 369  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6532331 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 6532377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 24085617 - 24085704
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24085617 tcctggtcctgctgatgttgctggtggctcctcctcggcctctggcctcgcctccaagtaatgatcggcgcaatctgctgcctaacat 24085704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 291
Target Start/End: Original strand, 24085789 - 24085842
Alignment:
Q  238 taaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgct 291  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24085789 taaccatatcataggtatcaggcaagcttctcgccttgtaccgctcccactgct 24085842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 30493772 - 30494004
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  30493772 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 30493871  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  30493872 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 30493971  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30493972 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 30494004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28471803 - 28471542
Alignment:
Q  63 tactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac--tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggt 160  Q
    ||||||| ||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  28471803 tactactactggtcctaatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctccctttgtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggt 28471704  T
Q  161 catcgcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtg 254  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28471703 catggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtg 28471604  T
Q  255 tcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471603 tcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 28471542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 320
Target Start/End: Original strand, 36653303 - 36653543
Alignment:
Q  86 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  36653303 ctgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcagcgagatctgctcccaaagatggctcatggcctgaaaccactgctgaggg 36653402  T
Q  186 ctcatgacc------tccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtacc 279  Q
     |||||| |      ||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36653403 gtcatgatcatgttctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcctacc 36653502  T
Q  280 actcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36653503 gctcccactgttgtgcaatgatctgctcttcaattgctggc 36653543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5355217 - 5354985
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  5355217 tggtgcctcatcctcggcctctaggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctcccttatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 5355118  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  5355117 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 5355018  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5355017 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 5354985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15834502 - 15834270
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| || |||| |||| |||| ||||||        
T  15834502 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggttatggcctcaaacgactgctgaggggtca 15834403  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||     
T  15834402 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagtttctcgcctcataccgctg 15834303  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834302 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 15834270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43981767 - 43981535
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  43981767 tggtgtctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 43981668  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  43981667 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 43981568  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43981567 ccactgctctgcaatgatctgttcttcatttgc 43981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Original strand, 43536515 - 43536747
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 185  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  43536515 tggtgcctcctcctcagcctctggactctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 43536614  T
Q  186 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactc 283  Q
      |||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  43536615 tgctcatgacctcctcatggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctg 43536714  T
Q  284 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536715 ccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 43536747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 316
Target Start/End: Original strand, 29398389 - 29398648
Alignment:
Q  63 tactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtca 162  Q
    ||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||  ||| || ||||| | |||| |||    
T  29398389 tactactactgatcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaaaatcggcatgatatgctccctcatatggctca 29398488  T
Q  163 tcgcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtc 256  Q
    | |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  29398489 tggcctgaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccgtaaaccatgtcataggtgtc 29398588  T
Q  257 aggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29398589 aggcgagcttctcgcctcataccgctcccaccgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 29398648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39950744 - 39950508
Alignment:
Q  80 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||| |||||     
T  39950744 ctgatcctgctggtgcctcctcctcggcctctgggttcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaatcactgc 39950645  T
Q  180 tgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtct 273  Q
    |||||      |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39950644 tgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcagacgagcttctcgcct 39950545  T
Q  274 cgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950544 c------atcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 39950508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26182004 - 26181899
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26182004 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 26181905  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  26181904 actgtt 26181899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 6637866 - 6638011
Alignment:
Q  56 aaaatactactact---cctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatcccta 152  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6637866 aaaatactactactggtcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggtctcccctcctggtcaatatcggcgcgatctgctcccta 6637965  T
Q  153 acatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcct 198  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6637966 acatggctcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcct 6638011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7417091 - 7416959
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7417091 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctggtcctactgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcc 7416992  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    || | | |||||||||||| || | ||||||||    
T  7416991 tgataatgatcggcgcgatttgctgcctaacat 7416959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 16305164 - 16305276
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16305164 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgattgatatt 16305263  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  16305264 attggtaactgtt 16305276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 29472381 - 29472493
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472381 cgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 29472480  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  29472481 attggtaattgtt 29472493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2148183 - 2148085
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2148183 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 2148085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 316
Target Start/End: Original strand, 10825732 - 10825961
Alignment:
Q  93 tgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatga 192  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||     
T  10825732 tgcctcctcctcggcctctggtctcgcctcctggtcaaaatcaacgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgaggggtcatgc 10825831  T
Q  193 cc------tccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactccca 286  Q
    ||      ||||  || |||| ||||||||||  |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||    
T  10825832 ccatgaactcctcttggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggtgagcttctcgcctcataccgcttcca 10825931  T
Q  287 ctgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10825932 ctgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 10825961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24138817 - 24138715
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24138817 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 24138718  T
Q  423 att 425  Q
    |||    
T  24138717 att 24138715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 38332844 - 38332945
Alignment:
Q  324 gttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta 423  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332844 gttagggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatta 38332943  T
Q  424 tt 425  Q
    ||    
T  38332944 tt 38332945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8174196 - 8174084
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8174196 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 8174097  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||| ||||    
T  8174096 attggtaattgtt 8174084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 15744596 - 15744708
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15744596 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 15744695  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  15744696 attggtaactgtt 15744708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17423706 - 17423480
Alignment:
Q  84 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 183  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  17423706 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 17423607  T
Q  184 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgta 277  Q
    ||      |||||||||||||  || |||| |||||||||||            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17423606 gggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcag------------cgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 17423519  T
Q  278 ccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423518 ccgctgccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 17423480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 13193134 - 13193239
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  13193134 gtttgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactcatattattggta 13193233  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  13193234 actgtt 13193239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15406067 - 15405955
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15406067 cgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatatt 15405968  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  15405967 attggtaactgtt 15405955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19816001 - 19815903
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19816001 ttatgtgggtcctctgactttatttattagtatcattttgctcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 19815903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34735647 - 34735542
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34735647 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgactgatataattgata 34735548  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  34735547 actgtt 34735542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 41474228 - 41474333
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  41474228 gtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattataattaaatagtgactgatagtattggta 41474327  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  41474328 actgtt 41474333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24372270 - 24372166
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24372270 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcctttttaaagtattatgattaaattgtgactgatattattggtaa 24372171  T
Q  431 ctgtt 435  Q
    |||||    
T  24372170 ctgtt 24372166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 7469305 - 7469407
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7469305 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagttagtgatatt 7469404  T
Q  423 att 425  Q
    |||    
T  7469405 att 7469407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12860678 - 12860577
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12860678 cgttacggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacgggtatt 12860579  T
Q  423 at 424  Q
    ||    
T  12860578 at 12860577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19847629 - 19847518
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19847629 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccgatatt 19847531  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  19847530 attggtaactgtt 19847518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 36713734 - 36713836
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  36713734 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattag--tcattttggttctatgccttgttaaggtattatgatt-aatagtgactgatattattggta 36713830  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  36713831 actgtt 36713836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 10991997 - 10992099
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  10991997 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctatgtcttgctaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggta 10992096  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  10992097 act 10992099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7496290 - 7496179
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7496290 cgttagggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-gaattatgagtaaatagtgaccgatatt 7496192  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  7496191 attggtaactgtt 7496179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Original strand, 17052197 - 17052294
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17052197 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta----acgttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 17052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45431600 - 45431519
Alignment:
Q  235 cactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45431600 cactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctaccaatgatctgcaatgatctgctcttcatttgc 45431519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Original strand, 25514808 - 25514931
Alignment:
Q  24 tacaccaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac 123  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||         |||||||||||| ||||||||||| |    
T  25514808 tacatcaagtcctaaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctggtcctgctgatgctg---------cctcctcggcctctggcctcgcctcc 25514898  T
Q  124 tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  25514899 tggccaatatcggcgcgatctgctccataacat 25514931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40538789 - 40538702
Alignment:
Q  69 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 156  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||    
T  40538789 tcctggtcctgcttatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctactggtaatgatcggtgcgatctgctgcctaacat 40538702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7416888 - 7416797
Alignment:
Q  224 ggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||||| || || |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  7416888 ggcaacatcgccagtaactatatcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactactctgcaatgatttgctcctcatttg 7416797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 151
Target Start/End: Original strand, 3938350 - 3938411
Alignment:
Q  90 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccct 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3938350 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccct 3938411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40538596 - 40538540
Alignment:
Q  259 gcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttg 315  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40538596 gcgagtttctcgcctcgtatcgctcccactgctctgcattgatctgctcctcatttg 40538540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33470234 - 33470195
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttattta 362  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33470234 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 33470195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 50787 - 50675
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50787 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 50688  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  50687 attggtaactgtt 50675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 329 - 435
Target Start/End: Original strand, 8573 - 8679
Alignment:
Q  329 ggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagt 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8573 ggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggt 8672  T
Q  429 aactgtt 435  Q
    |||||||    
T  8673 aactgtt 8679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 18412 - 18524
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18412 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 18511  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  18512 attggtaactgtt 18524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 15594 - 15699
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15594 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttttgtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggta 15693  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  15694 actgtt 15699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 45895 - 46007
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45895 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttacttattagtttcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 45994  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  45995 attggtaactgtt 46007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 349226 - 349324
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  349226 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgtt 349324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 425
Target Start/End: Original strand, 113519 - 113607
Alignment:
Q  337 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113519 ttatgtggctcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 113607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 82162 - 82057
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  82162 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggta 82063  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  82062 actgtt 82057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14439 - 14337
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  14439 gtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggta 14340  T
Q  430 act 432  Q
    |||    
T  14339 act 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 19854 - 19959
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  19854 gtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggttttatgattaaatagtgacggatattattgata 19953  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  19954 actgtt 19959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 24301 - 24413
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24301 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctgttccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatatt 24400  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  24401 attggtaactgtt 24413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 72901 - 73012
Alignment:
Q  323 cgttatggtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 422  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  72901 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccaatatt 72999  T
Q  423 attagtaactgtt 435  Q
    ||| |||||||||    
T  73000 attggtaactgtt 73012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 20897 - 21001
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagta 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20897 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccgatattattggta 20995  T
Q  430 actgtt 435  Q
    ||||||    
T  20996 actgtt 21001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 21658 - 21762
Alignment:
Q  331 tttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaa 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21658 tttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattattggtaa 21757  T
Q  431 ctgtt 435  Q
     ||||    
T  21758 ttgtt 21762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Original strand, 6144 - 6236
Alignment:
Q  330 gtttgtcttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 425  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144 gtttgtgttatgtggatcctctaactttatttatta---tcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12442 - 12360
Alignment:
Q  238 taaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgctggc 320  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12442 taaccctgtcataggtatcaggccagcttctcacctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgctcctcatttggtggc 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12603 - 12538
Alignment:
Q  80 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  12603 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctgccctcgcctcttggtaatgatcggcgcgatctg 12538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Original strand, 22256 - 22333
Alignment:
Q  240 accatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgtctcgtaccactcccactgctctgcaatgatctgctcttcatttgct 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  22256 accatgtcataggtatcaggcgagtctctcgcctcgtagtgctcccactgctgtgcaatgatatgctcctcatttgct 22333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University