View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3229_low_192 (Length: 213)

Name: NF3229_low_192
Description: NF3229
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3229_low_192
NF3229_low_192
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-197)||(2875-3071)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-197)||(13671613-13671809)
chr6 (1-197)||(27670324-27670520)
chr6 (1-197)||(4186915-4187111)
chr6 (1-197)||(21262370-21262566)
chr6 (1-197)||(9864556-9864752)
chr6 (1-197)||(31548125-31548321)
chr6 (1-197)||(7062312-7062508)
chr6 (1-197)||(4738119-4738315)
chr6 (1-197)||(7069498-7069694)
chr6 (1-189)||(29907089-29907277)
chr6 (1-189)||(30117103-30117291)
chr6 (1-197)||(34649030-34649226)
chr6 (1-197)||(34655481-34655677)
chr6 (1-197)||(4020031-4020227)
chr6 (1-197)||(4026457-4026653)
chr6 (1-197)||(1428219-1428415)
chr6 (1-197)||(32328289-32328485)
chr6 (1-197)||(34711353-34711549)
chr6 (2-194)||(1167278-1167471)
chr6 (1-91)||(11058052-11058142)
chr6 (1-197)||(10081357-10081554)
chr6 (61-197)||(9846811-9846947)
chr6 (75-187)||(18765994-18766106)
chr6 (127-197)||(11016444-11016514)
chr6 (61-187)||(22870530-22870656)
chr6 (130-196)||(14354724-14354790)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (1-197)||(26621700-26621896)
chr1 (1-197)||(44241587-44241783)
chr1 (1-197)||(4599759-4599955)
chr1 (1-197)||(9869335-9869531)
chr1 (1-197)||(32797953-32798149)
chr1 (1-197)||(44916568-44916764)
chr1 (1-197)||(1115778-1115974)
chr1 (1-197)||(35085239-35085432)
chr1 (1-197)||(23762132-23762328)
chr1 (1-197)||(1174836-1175032)
chr1 (1-197)||(11913058-11913254)
chr1 (1-197)||(29001961-29002157)
chr1 (1-197)||(39053134-39053330)
chr1 (1-197)||(39059506-39059702)
chr1 (1-197)||(41305315-41305506)
chr1 (1-197)||(43686859-43687055)
chr1 (1-197)||(41297747-41297943)
chr1 (1-197)||(45016011-45016207)
chr1 (1-197)||(6238885-6239081)
chr1 (24-196)||(31072571-31072743)
chr1 (1-197)||(42092126-42092322)
chr1 (1-137)||(41299044-41299180)
chr1 (31-197)||(23251612-23251778)
chr1 (127-197)||(28996371-28996441)
chr1 (17-198)||(47646916-47647098)
chr1 (1-197)||(5357543-5357739)
chr1 (1-197)||(38672572-38672769)
chr1 (61-197)||(13249008-13249142)
chr1 (124-197)||(21815173-21815245)
chr1 (68-197)||(31473556-31473685)
chr1 (61-197)||(45619940-45620076)
chr1 (127-197)||(28413468-28413539)
chr1 (61-194)||(13830568-13830701)
chr1 (127-197)||(2824615-2824686)
chr1 (127-197)||(39806413-39806484)
chr1 (75-185)||(47294326-47294435)
chr1 (124-189)||(9316316-9316380)
chr1 (61-97)||(6244575-6244611)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-197)||(39433137-39433333)
chr7 (1-197)||(33850439-33850635)
chr7 (1-197)||(45433816-45434012)
chr7 (1-197)||(1948429-1948625)
chr7 (1-197)||(3923889-3924085)
chr7 (1-197)||(23612619-23612815)
chr7 (1-196)||(14287945-14288140)
chr7 (1-196)||(14299130-14299325)
chr7 (1-196)||(36875775-36875970)
chr7 (1-197)||(6020660-6020856)
chr7 (1-197)||(8185188-8185384)
chr7 (1-197)||(8192748-8192944)
chr7 (1-197)||(48346892-48347088)
chr7 (1-197)||(48353276-48353472)
chr7 (1-197)||(9642712-9642908)
chr7 (1-197)||(15914868-15915064)
chr7 (1-197)||(26602142-26602338)
chr7 (1-197)||(15949389-15949585)
chr7 (1-197)||(19090038-19090234)
chr7 (1-197)||(21642748-21642944)
chr7 (1-197)||(1379177-1379373)
chr7 (1-197)||(2446876-2447072)
chr7 (1-197)||(5049708-5049904)
chr7 (1-197)||(6795668-6795864)
chr7 (1-197)||(8142241-8142438)
chr7 (1-64)||(13774059-13774122)
chr7 (138-197)||(22854002-22854061)
chr7 (1-49)||(37026278-37026326)
chr7 (1-50)||(5056250-5056299)
chr7 (2-197)||(7412713-7412907)
chr7 (87-197)||(43364566-43364675)
chr7 (1-197)||(21900983-21901180)
chr7 (127-197)||(10830920-10830991)
chr7 (127-197)||(11024712-11024783)
chr7 (66-187)||(9702036-9702157)
chr7 (124-197)||(27951202-27951275)
chr7 (124-197)||(27954439-27954512)
chr7 (124-197)||(20403848-20403923)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (1-197)||(4973793-4973989)
chr5 (1-197)||(12505561-12505757)
chr5 (1-197)||(40958413-40958609)
chr5 (1-197)||(2958089-2958285)
chr5 (1-197)||(2966558-2966754)
chr5 (1-197)||(2439030-2439227)
chr5 (1-197)||(5876448-5876644)
chr5 (1-197)||(22360194-22360390)
chr5 (1-197)||(25894445-25894641)
chr5 (1-197)||(42151049-42151245)
chr5 (1-197)||(22314060-22314256)
chr5 (1-197)||(29414465-29414661)
chr5 (1-197)||(29980689-29980885)
chr5 (1-197)||(30041040-30041236)
chr5 (1-197)||(34357084-34357280)
chr5 (1-197)||(34358875-34359071)
chr5 (61-197)||(30579986-30580122)
chr5 (1-197)||(12918746-12918942)
chr5 (1-197)||(3413086-3413282)
chr5 (66-197)||(9843644-9843776)
chr5 (61-197)||(19853324-19853459)
chr5 (66-197)||(42747381-42747511)
chr5 (127-197)||(2155915-2155986)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-197)||(16405576-16405772)
chr4 (1-197)||(36754587-36754783)
chr4 (1-197)||(30211332-30211528)
chr4 (1-197)||(16838155-16838351)
chr4 (1-197)||(55462568-55462764)
chr4 (1-197)||(17457085-17457281)
chr4 (1-197)||(27590535-27590731)
chr4 (1-197)||(37368111-37368307)
chr4 (1-197)||(13594338-13594534)
chr4 (1-197)||(5660345-5660541)
chr4 (1-197)||(8104112-8104307)
chr4 (1-197)||(41373217-41373413)
chr4 (1-94)||(30238490-30238583)
chr4 (107-197)||(37356145-37356235)
chr4 (1-65)||(7780637-7780701)
chr4 (127-197)||(30238585-30238655)
chr4 (61-197)||(49359111-49359247)
chr4 (127-197)||(52182963-52183033)
chr4 (66-197)||(2948140-2948272)
chr4 (66-187)||(13568275-13568396)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (1-197)||(43931807-43932003)
chr3 (1-197)||(10941100-10941296)
chr3 (1-197)||(6036496-6036692)
chr3 (1-197)||(32746600-32746796)
chr3 (1-197)||(24179304-24179500)
chr3 (1-197)||(43995308-43995503)
chr3 (1-197)||(4311282-4311478)
chr3 (1-197)||(23068694-23068890)
chr3 (1-197)||(27501763-27501959)
chr3 (9-197)||(9570343-9570532)
chr3 (9-197)||(9576845-9577034)
chr3 (1-197)||(20650921-20651117)
chr3 (1-160)||(25893466-25893625)
chr3 (66-197)||(47441096-47441227)
chr3 (1-120)||(13015216-13015335)
chr3 (1-197)||(2785935-2786132)
chr3 (1-197)||(9330934-9331130)
chr3 (1-197)||(20952550-20952746)
chr3 (61-197)||(17735634-17735770)
chr3 (61-197)||(19036903-19037039)
chr3 (61-197)||(24705101-24705237)
chr3 (61-197)||(25692267-25692407)
chr3 (17-197)||(27900777-27900955)
chr3 (127-197)||(461225-461295)
chr3 (124-187)||(25805276-25805341)
chr3 (163-197)||(41354109-41354143)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-197)||(21331790-21331986)
chr2 (1-197)||(42931168-42931364)
chr2 (1-197)||(15852780-15852976)
chr2 (1-197)||(36781980-36782176)
chr2 (1-197)||(45012213-45012409)
chr2 (36-197)||(21341722-21341883)
chr2 (1-197)||(2021244-2021440)
chr2 (1-197)||(16817126-16817322)
chr2 (1-197)||(16856283-16856479)
chr2 (1-197)||(2157842-2158038)
chr2 (1-197)||(2164258-2164454)
chr2 (1-197)||(12951026-12951222)
chr2 (1-197)||(34834608-34834804)
chr2 (1-197)||(34841052-34841248)
chr2 (1-197)||(43268089-43268285)
chr2 (1-197)||(21067753-21067950)
chr2 (1-197)||(13901752-13901949)
chr2 (69-197)||(29485193-29485321)
chr2 (61-197)||(11909746-11909882)
chr2 (1-197)||(13163049-13163245)
chr2 (61-197)||(36842078-36842214)
chr2 (61-197)||(37439329-37439465)
chr2 (2-197)||(17788887-17789082)
chr2 (127-197)||(24852822-24852892)
chr2 (61-197)||(28144781-28144917)
chr2 (66-197)||(41455901-41456033)
chr2 (165-197)||(34745087-34745119)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (2-197)||(15012619-15012814)
chr8 (1-197)||(26250387-26250583)
chr8 (1-197)||(45068212-45068408)
chr8 (1-197)||(11357989-11358185)
chr8 (1-197)||(16710464-16710660)
chr8 (1-197)||(1238444-1238640)
chr8 (1-197)||(36425526-36425722)
chr8 (1-197)||(6464372-6464568)
chr8 (1-197)||(7311579-7311775)
chr8 (1-197)||(36021595-36021791)
chr8 (1-197)||(36076197-36076393)
chr8 (1-197)||(8013116-8013312)
chr8 (1-197)||(36005278-36005474)
chr8 (2-83)||(31017617-31017698)
chr8 (1-91)||(41242018-41242108)
chr8 (1-64)||(12768974-12769037)
chr8 (127-197)||(24220068-24220138)
chr8 (66-197)||(7933721-7933853)
chr8 (127-197)||(14394054-14394124)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (1-197)||(2356-2552)
scaffold0510 (1-197)||(8677-8873)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-197)||(15401-15597)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-197)||(49920-50116)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (1-197)||(3060-3256)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-197)||(4801-4997)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-165)||(12163-12327)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (124-197)||(17564-17636)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (124-187)||(1512-1575)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (129-197)||(4554-4622)


Alignment Details
Target: scaffold0343 (Bit Score: 189; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2875 - 3071
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2875 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcattaaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 2974  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2975 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 3071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-103; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13671809 - 13671613
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671809 atcaactgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 13671710  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671709 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 13671613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 27670324 - 27670520
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27670324 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatcaattgaatgataa 27670423  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27670424 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacccatgttttgatagatgattattctaaacttagattc 27670520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 4186915 - 4187111
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4186915 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 4187014  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4187015 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 4187111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21262566 - 21262370
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21262566 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaacttttgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatggatgatttctcaatctatagaatgataa 21262467  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
     | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21262466 aagagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 21262370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9864752 - 9864556
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9864752 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctgttgaatgataa 9864653  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9864652 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgagatatgattattctaaacctagattc 9864556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 31548125 - 31548321
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31548125 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataa 31548224  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548225 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 31548321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7062508 - 7062312
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7062508 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 7062409  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7062408 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 7062312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4738315 - 4738119
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4738315 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttcttgatctattgaatgataa 4738216  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4738215 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 4738119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7069694 - 7069498
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069694 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaacagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 7069595  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7069594 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 7069498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 29907089 - 29907277
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29907089 atcaattgtattatttaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaataaatgatttctcaatctattgaatgataa 29907188  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaac 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907189 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaac 29907277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30117291 - 30117103
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30117291 atcaattgtattatttaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaataaatgatttctcaatctattgaatgataa 30117192  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaac 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30117191 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaac 30117103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 34649030 - 34649226
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34649030 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 34649129  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34649130 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 34649226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 34655481 - 34655677
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34655481 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 34655580  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34655581 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 34655677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4020227 - 4020031
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4020227 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 4020128  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4020127 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggtttttctaaacctagattc 4020031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4026653 - 4026457
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4026653 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 4026554  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4026553 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggtttttctaaacctagattc 4026457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1428415 - 1428219
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1428415 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 1428316  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1428315 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 1428219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32328485 - 32328289
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32328485 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 32328386  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32328385 gaaaggtttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 32328289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34711549 - 34711353
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34711549 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcaatgatttctcaatccattgaatgataa 34711450  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34711449 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaatctatgctttgatagatggttattctaaacctagattc 34711353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1167471 - 1167278
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa-tgataa 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  1167471 tcaattgtatcgttttatcgttgatgtctcaaactattaaacgatccaagagtcgatcttatgatttaatcgacgatttctcaatctattaaaatgataa 1167372  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctaga 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1167371 gaaagctttaagtttggatacaaagagtgattatcaaaacatcaattccatatctagaatttatgttttgatagactattattctaaacctaga 1167278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11058142 - 11058052
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctatt 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11058142 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 11058052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10081554 - 10081357
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||      
T  10081554 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaaaaatccaattgtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatatattcaacgatcc 10081455  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatg-attattctaaacctagattc 197  Q
     |||| |||| || | |||||     |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10081454 aaaagctttacgtatcgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaattattctaaacctagattc 10081357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 9846811 - 9846947
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||  |||||     |||||||||||||||||||| | ||||  ||||     
T  9846811 tatcgtttaatccacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttctgatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgttaagaat 9846910  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  9846911 cattgttttgatagataaatattttaaacctagattc 9846947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 18765994 - 18766106
Alignment:
Q  75 tgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatag 174  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||   |||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  18765994 tgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatag 18766093  T
Q  175 atgattattctaa 187  Q
    | |||||||||||    
T  18766094 aagattattctaa 18766106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 11016444 - 11016514
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11016444 gtgattatcaaaacatcaaccctatgtctaaaatcattgttttgatagatgaaaattctaaacctagattc 11016514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 22870530 - 22870656
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||  |  ||||  || |||||  || |||||||||||||||  ||| | ||||||||||     
T  22870530 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatatgatggcattaaccttcgatacttaaggtgattatcaaaacactaatcctatgtctagaat 22870629  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaa 187  Q
       ||||||||||||||||||||||||    
T  22870630 tcttgttttgatagatgattattctaa 22870656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 196
Target Start/End: Original strand, 14354724 - 14354790
Alignment:
Q  130 attatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagatt 196  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||   | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  14354724 attatcaaaacctaaattccatgtctagaattaaagttttgctagattattattctaaccctagatt 14354790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 26621700 - 26621896
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26621700 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 26621799  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26621800 gaaaactttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 26621896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44241587 - 44241783
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241587 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtgtcaaactattgaatgattcaagagtcagtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 44241686  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241687 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaatttcatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 44241783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 4599759 - 4599955
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4599759 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcaatgatttctcaatctattgaatcataa 4599858  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4599859 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattaccaaaacatcaattccatgtctataacctatgttttgatagatgattattctaaaccttgattc 4599955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 9869335 - 9869531
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9869335 atcaattgtatcattcaatcatcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaattgatgatttctcaatctattaaatgataa 9869434  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869435 gaaagctttaggtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 9869531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 32797953 - 32798149
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32797953 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctatcgaatgataa 32798052  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32798053 gaaaactttaagtttggatacaaaatgtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 32798149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44916568 - 44916764
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44916568 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaacgataa 44916667  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44916668 gaaaactttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatatctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 44916764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1115974 - 1115778
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115974 atcaattgtatcattctatcgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 1115875  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115874 taaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 1115778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 35085239 - 35085432
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35085239 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcagt---atcatttaatcgatgatttctcaacctattgaatgataa 35085335  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35085336 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaagcctagattc 35085432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23762328 - 23762132
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762328 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 23762229  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23762228 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaaaatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 23762132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1174836 - 1175032
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174836 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgctcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 1174935  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1174936 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaatcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 1175032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11913254 - 11913058
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  11913254 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtttcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaattgaagatttctcagtctattgaatgataa 11913155  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11913154 gaaagctttaagttttgatacaaaaggtgattatcaaaacataaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctaaattc 11913058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 29001961 - 29002157
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29001961 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaataataa 29002060  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29002061 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 29002157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39053330 - 39053134
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39053330 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 39053231  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39053230 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 39053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39059702 - 39059506
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39059702 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 39059603  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39059602 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 39059506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41305506 - 41305315
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305506 atcaattgtatcattcgaacgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtc-----atctaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 41305412  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305411 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 41305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43686859 - 43687055
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686859 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 43686958  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43686959 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 43687055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 41297747 - 41297943
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297747 atcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 41297846  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41297847 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 41297943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 45016011 - 45016207
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45016011 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 45016110  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45016111 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 45016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6238885 - 6239081
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6238885 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 6238984  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6238985 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 6239081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Original strand, 31072571 - 31072743
Alignment:
Q  24 gatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31072571 gatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcataaaatcaatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaa 31072670  T
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagatt 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31072671 aaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttcatagatgattattctaaaccttgatt 31072743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 42092126 - 42092322
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42092126 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 42092225  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42092226 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgacagatggttattctaaacctagattc 42092322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41299180 - 41299044
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41299180 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcaatgatttctcaatctattgaatgataa 41299081  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41299080 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaa 41299044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 23251612 - 23251778
Alignment:
Q  31 caaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtga 130  Q
    ||||||||| ||  || ||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||     ||||    
T  23251612 caaactattaaacaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaatgatccgaaagctttaagttccgatactttgtgtga 23251711  T
Q  131 ttatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23251712 ttatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattctaaacctagattc 23251778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 28996371 - 28996441
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28996371 gtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 28996441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 47646916 - 47647098
Alignment:
Q  17 aatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttg 116  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| | || ||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||  |||||  | ||| ||     
T  47646916 aatcgttgatttctcaatctattaaacgatccaatattcagtcgtatcgtttaatcgacgatttttcagtctattaaacgatctgaaagcatgaagctta 47647015  T
Q  117 gatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacct-atgttttgatagatgattattctaaacctagattct 198  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47647016 gatactcaaagtgattatcaaaacatcaatcccatgtctagaatttcatgttttgatagatgattattctaaacctagattct 47647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5357739 - 5357543
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  |||||| |||||  | |||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||      
T  5357739 atcaattgtattgttcaattgttgatttcccaaactattaaacaattcaatagtcgaccgtatcgtttaatcgacaatttctcaatctattcaacgatcc 5357640  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||   ||||     |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5357639 gaaagctttaagttccaatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattctaaacctggattc 5357543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38672769 - 38672572
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  |||| || |||| |||||| || |||||||||||||||| || |||      
T  38672769 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 38672670  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatg-attattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38672669 gaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagatgaattattctaaacctagattc 38672572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 13249008 - 13249142
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||   | ||  ||||| || |||||  || |||||||||||||||| ||| |  |||||||||     
T  13249008 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctaatagcattaagcttcgatacttaaggtgattatcaaaacattaatcc--tgtctagaat 13249105  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13249106 tcttgttttgatagatgattattctaaccctagattc 13249142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Original strand, 21815173 - 21815245
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21815173 aaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatagaagattattct-aacctagattc 21815245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 31473556 - 31473685
Alignment:
Q  68 taatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgtt 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||  || |   ||||| || |||||  || |||||||||||||||  ||| | ||||||||||    ||||    
T  31473556 taatcgacgatttctcaatctattaaacgatccgatatcattaagctttgatacttaaggtgattatcaaaacactaatcctatgtctagaattcttgtt 31473655  T
Q  168 ttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31473656 ttgatagatgattattctaaccctagattc 31473685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45620076 - 45619940
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||  |||||     ||||||||||||||||  || | ||||||||||     
T  45620076 tatcgtttaatcaacgatttctcaatctattaaacgatccgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacattgatcctatgtctagaat 45619977  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  45619976 cattgttttgatagatgaatattttaaacctatattc 45619940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28413539 - 28413468
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28413539 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattc 28413468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13830701 - 13830568
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtt-tggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaa 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||  ||||||| | |||  | ||||||||||||||||| | ||| | || |||||||    
T  13830701 tatcatttaatcgatgatgtctcaatctattaaatgatacgatagccttaagttcttgat-tacaaagtgattatcaaaacttaaatccaatctctagaa 13830603  T
Q  160 cctatgttttgatagatgattattctaaacctaga 194  Q
     | |   |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13830602 tcaaaactttgatagattattattctaaccctaga 13830568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2824686 - 2824615
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2824686 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattatcctaaacctagattc 2824615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 39806413 - 39806484
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39806413 gtgattatcaaaacatcgatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattc 39806484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Original strand, 47294326 - 47294435
Alignment:
Q  75 tgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatag 174  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||  |||   ||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| |  |||||||    
T  47294326 tgatttcccaaactatacaatgatacgaaagctttaagtttcaatattcaaagtgattatcaaacc-taagttccatgtctagaacctaagcattgatag 47294424  T
Q  175 atgattattct 185  Q
    | |||||||||    
T  47294425 aagattattct 47294435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Original strand, 9316316 - 9316380
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaac 189  Q
    ||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  9316316 aaagtgattatcaaacc-taagttccatgtctagaaccaatgcattgatagaagattattctaaac 9316380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6244611 - 6244575
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatga 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6244611 tatcttttaatcgatgatttctcaatctattaaatga 6244575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 39433137 - 39433333
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433137 atcaattgtatctgtcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttttcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 39433236  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433237 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 39433333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33850635 - 33850439
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33850635 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 33850536  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33850535 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattataaacctagattc 33850439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 45433816 - 45434012
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45433816 atcaattgtaccattcaatagtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcaatgatttctcaatttattgaatgataa 45433915  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45433916 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 45434012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1948625 - 1948429
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1948625 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 1948526  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1948525 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 1948429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3924085 - 3923889
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3924085 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 3923986  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3923985 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 3923889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 23612619 - 23612815
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23612619 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtatcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 23612718  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23612719 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 23612815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14287945 - 14288140
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287945 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 14288044  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagatt 196  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14288045 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagatt 14288140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14299130 - 14299325
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299130 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 14299229  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagatt 196  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14299230 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagatt 14299325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 36875775 - 36875970
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36875775 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttattgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 36875874  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagatt 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36875875 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctatgttttgatagatggttattctaaacctagatt 36875970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6020856 - 6020660
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6020856 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctataaaatgataa 6020757  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020756 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 6020660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8185384 - 8185188
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8185384 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 8185285  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8185284 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 8185188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8192944 - 8192748
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8192944 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 8192845  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192844 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 8192748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48347088 - 48346892
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48347088 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 48346989  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48346988 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 48346892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48353472 - 48353276
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48353472 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 48353373  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48353372 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 48353276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9642908 - 9642712
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9642908 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcattcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 9642809  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    | ||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9642808 ggaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 9642712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15914868 - 15915064
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914868 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 15914967  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
     |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15914968 caaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 15915064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 26602142 - 26602338
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602142 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 26602241  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26602242 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattttaaacctagattc 26602338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15949389 - 15949585
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949389 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 15949488  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15949489 gaaagctttaggtttggatacacaaggtggttatccaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 15949585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 19090038 - 19090234
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19090038 atcaattgtatcactcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 19090137  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19090138 gaaaactttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 19090234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 21642748 - 21642944
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21642748 atcaattatatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtacaatcgatgatttctaaatctattgaatgataa 21642847  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21642848 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgtttcgatagatggttattctaaacctagattc 21642944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1379177 - 1379373
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1379177 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 1379276  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1379277 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 1379373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2446876 - 2447072
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2446876 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 2446975  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2446976 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 2447072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5049904 - 5049708
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5049904 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 5049805  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5049804 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 5049708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6795668 - 6795864
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6795668 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 6795767  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6795768 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 6795864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8142438 - 8142241
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa-tgata 99  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  8142438 atcaattgtatcattcaatggttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaattgatgatttctcaatctatttaaatgata 8142339  T
Q  100 agaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8142338 agaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacgtcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctaaattc 8142241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13774122 - 13774059
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774122 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 13774059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22854061 - 22854002
Alignment:
Q  138 aacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22854061 aacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 22854002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 37026278 - 37026326
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattca 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026278 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattca 37026326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 5056299 - 5056250
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaa 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5056299 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaa 5056250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7412907 - 7412713
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataag 101  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||  || ||| | ||| || |||  |||||| || ||||||||| |||| | || |||  |    
T  7412907 tcaatcgtatcttttaatcgttgatttctcaaactattaaacaatccaatattcgatcgtattgtttaattgacgatttctcagtctactaaacgatccg 7412808  T
Q  102 aaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||  | ||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412807 aaagcatgaagcttagatactcaaagtgattatcaaaacataaatcccatgtctaaattcc-tgttttgatagatgattattctaaacctagattc 7412713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 43364566 - 43364675
Alignment:
Q  87 ctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattcta 186  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||   |||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||     
T  43364566 ctattgaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatagaagattattct- 43364664  T
Q  187 aacctagattc 197  Q
    |||||||||||    
T  43364665 aacctagattc 43364675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21901180 - 21900983
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||      
T  21901180 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgaatcgtttaatcgatgatttctcaatctattcaacgatcc 21901081  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21901080 gaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctaaaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattc 21900983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10830991 - 10830920
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10830991 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattc 10830920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11024783 - 11024712
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11024783 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattc 11024712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Original strand, 9702036 - 9702157
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||   |||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  | |    
T  9702036 tttaatcgtcgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctaaaacaaaag 9702135  T
Q  166 ttttgatagatgattattctaa 187  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  9702136 ctttgatagaagattattctaa 9702157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Original strand, 27951202 - 27951275
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||   | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  27951202 aaagtgattctcagaacctaaattccatgtctagaattaaagttttgttagattattattctaaccctagattc 27951275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Original strand, 27954439 - 27954512
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||   | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  27954439 aaagtgattatcagaacctaaattccatgtctacaattaaagttttgctagattattattctaaccctagattc 27954512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20403923 - 20403848
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacct--atgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  | || |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20403923 aaagtgattatcaaaatctaaattccatgtctagaactttgacgtattgatatatgattattctaaccttagattc 20403848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 4973793 - 4973989
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973793 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 4973892  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973893 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattattaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 4973989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12505757 - 12505561
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505757 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaaatattgaatggtccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 12505658  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505657 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 12505561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40958609 - 40958413
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958609 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaaccattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 40958510  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40958509 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 40958413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2958089 - 2958285
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2958089 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 2958188  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2958189 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 2958285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2966558 - 2966754
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2966558 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 2966657  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2966658 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 2966754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2439030 - 2439227
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2439030 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagccggtcttatcatttaatcgatgatttttcaatctattgaatgataa 2439129  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaa-gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2439130 gaaagctttaagtttggataaaaaaaggtgattatcaagacatcaattccatgtctagaacttatgttatgatagatgattattttaaaactagattc 2439227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 5876448 - 5876644
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876448 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 5876547  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5876548 gaaaactttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctataacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 5876644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22360194 - 22360390
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360194 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 22360293  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22360294 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctacacctagattc 22360390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25894641 - 25894445
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25894641 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 25894542  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25894541 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 25894445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 42151049 - 42151245
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42151049 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatggtaa 42151148  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42151149 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 42151245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22314060 - 22314256
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22314060 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgataatttctcaatctattgaatgataa 22314159  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314160 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctaaaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 22314256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29414661 - 29414465
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414661 atcaattgtatcattcaattatcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 29414562  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29414561 gaaagctttagggttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 29414465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 29980689 - 29980885
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29980689 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 29980788  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29980789 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 29980885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30041236 - 30041040
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30041236 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 30041137  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30041136 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 30041040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34357280 - 34357084
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34357280 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34357181  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34357180 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 34357084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34359071 - 34358875
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34359071 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34358972  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34358971 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 34358875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30580122 - 30579986
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  30580122 tatcgtttaatcgatgatttctcaatctattaaatgatatgaaagctttaagtttcgatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaat 30580023  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  30580022 cattgttttgatagataaatattctaaacccagattc 30579986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12918942 - 12918746
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| || ||||||||| ||  || |||  |||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||      
T  12918942 atcaattgtgttgttcaatcgttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattgaatgatcc 12918843  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||| | |||||     |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12918842 gaaagctttaagtcttgatactttgtgtgactatcaaaacattgattccatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattctaaacatagattc 12918746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3413282 - 3413086
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||| ||  || ||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||      
T  3413282 atcaattgtattgttcaatcgttgatttcccaaactattaaacaatccaatagccgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattaaacgatcc 3413183  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||   |||||     ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3413182 gaaagctttaagtcctgatactttgtgtgattaccaaaacattgattccatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattttaaacatagattc 3413086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 9843644 - 9843776
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||    
T  9843644 tttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattg 9843743  T
Q  166 ttttgatagatga-ttattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9843744 ttttgatagataatttattctaaacctagattc 9843776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19853459 - 19853324
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||  |||||| |  |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  19853459 tatcgtttaatcgatgatttctcaatcaattaaacgatccgaaaactttaagatatgatactttgcgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagatc 19853360  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
     | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19853359 at-tgtttagatagatgaatattctaaagctagattc 19853324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 42747381 - 42747511
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |   |||||||| |||||  |||  |||||||||||||  ||  | ||||||||||   | |    
T  42747381 tttaatcgacgatttctcaatctattaaatgatccgataacattaagtttcgatacttaaaa-gattatcaaaacacaaaccctatgtctagaattcaag 42747479  T
Q  166 ttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42747480 ttttgatagatgattattctaaccctagattc 42747511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2155986 - 2155915
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2155986 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattatcctaaacctagattc 2155915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 16405576 - 16405772
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405576 atcaattgtatcattcaattgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16405675  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405676 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaatcatcaattccatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 16405772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36754783 - 36754587
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36754783 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcattcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 36754684  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36754683 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 36754587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30211528 - 30211332
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30211528 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcggtgatttctcaatctattgaatgataa 30211429  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30211428 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatccatttcatatctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 30211332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16838351 - 16838155
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838351 atcaattgtatcatccaatcgtcgatgtctcagactattaaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16838252  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838251 gaaagctttaagtttggataaaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 16838155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55462764 - 55462568
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55462764 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 55462665  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462664 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 55462568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 17457085 - 17457281
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17457085 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 17457184  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457185 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 17457281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 27590535 - 27590731
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27590535 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 27590634  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27590635 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 27590731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37368307 - 37368111
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37368307 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 37368208  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37368207 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 37368111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 13594338 - 13594534
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13594338 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 13594437  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13594438 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 13594534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5660541 - 5660345
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5660541 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcagtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattaaatgctaa 5660442  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660441 gaaagcgttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaattcatgttgtgatagatgattattttaaacctagattc 5660345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8104112 - 8104307
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8104112 atcaattgtatc-ttcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataa 8104210  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104211 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 8104307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 41373217 - 41373413
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41373217 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 41373316  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41373317 gaaagctttaggcttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 41373413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 30238490 - 30238583
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30238490 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgttgatttctcaatctattgaa 30238583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37356235 - 37356145
Alignment:
Q  107 tttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37356235 tttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 37356145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 7780637 - 7780701
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatca 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7780637 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcagtcttatca 7780701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 30238585 - 30238655
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30238585 gtgattatcaaaacattcattccatgtctagaatctctgttttgatagatggttattctaaacctagattc 30238655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49359247 - 49359111
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||   ||||  | ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||      
T  49359247 tatcgtttaatcgacgatttctcagtctattaaacgatctaaaagcgtgaagcttatatacacaaagtgattatcaaaacataaatcctatgtctagatt 49359148  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49359147 tcctgttttgatagatgattattctaaacctagattc 49359111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 52183033 - 52182963
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  52183033 gtgattatcaaaacatcaattttatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattttaaacctagattc 52182963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 2948140 - 2948272
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||    
T  2948140 tttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattg 2948239  T
Q  166 ttttgatagatga-ttattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2948240 ttttgatagataatttattctaaacctagattc 2948272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Original strand, 13568275 - 13568396
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||   |||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  | |    
T  13568275 tttaatcgtcgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctaaaacaaaag 13568374  T
Q  166 ttttgatagatgattattctaa 187  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  13568375 ctttgatagaagattattctaa 13568396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43931807 - 43932003
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43931807 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttgccaatctattgaatgataa 43931906  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43931907 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 43932003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10941296 - 10941100
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10941296 atcaattgtatcattcaatcgtcaatgtctcaaactattgaatatttcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 10941197  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10941196 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatatctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 10941100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6036496 - 6036692
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036496 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 6036595  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6036596 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 6036692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 32746600 - 32746796
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746600 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 32746699  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32746700 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 32746796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24179304 - 24179500
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24179304 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 24179403  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179404 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 24179500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43995308 - 43995503
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43995308 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 43995407  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43995408 gaaagctttaagtttggatacaaaaggt-attatcaaaacatcaatttcatgtccagaacttatgttttgatagatgattattctaaacatagattc 43995503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4311478 - 4311282
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311478 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 4311379  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4311378 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 4311282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 23068694 - 23068890
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068694 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 23068793  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23068794 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 23068890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27501959 - 27501763
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27501959 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 27501860  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501859 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 27501763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9570532 - 9570343
Alignment:
Q  9 tatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9570532 tatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcgt 9570433  T
Q  109 taagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacct-atgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570432 taaatttggatacaaaagatgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctcttgttttgatagatgattattctaaacctagattc 9570343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9577034 - 9576845
Alignment:
Q  9 tatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9577034 tatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcgt 9576935  T
Q  109 taagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacct-atgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9576934 taaatttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctcttgttttgatagatgattattctaaaccaagattc 9576845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20651117 - 20650921
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20651117 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggttttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 20651018  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20651017 gaaggcgttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacattaattccatgtctagaattcatgttgtgatagaggattattctaaacctagattc 20650921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 25893466 - 25893625
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893466 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 25893565  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25893566 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaac 25893625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 47441096 - 47441227
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47441096 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaatttcatgtctagaacttatg 47441195  T
Q  166 ttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47441196 ttttgatagaggattattctaaacctagattc 47441227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 13015216 - 13015335
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015216 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 13015315  T
Q  101 gaaagttttaagtttggata 120  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  13015316 gaaagctttaggtttagata 13015335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2785935 - 2786132
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| | || ||| ||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||| || |||      
T  2785935 atcaattgtatcgtttaatcgttgatttctcaaactactaaacgatccaatattcggtcgtatcgtttaatcgacgatttctccatcgattaaacgatcc 2786034  T
Q  101 gaaagttttaag-tttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||  | ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2786035 gaaagcatgaagctttgaatacaaaaggtgattatcagaacatcaatcctatgtccagaattcatgttttgatagatgatgattctaaacctagattc 2786132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9331130 - 9330934
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||| |   || ||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||      
T  9331130 atcaattgtattgttcaatcgttgatttcccaaactattaagcaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattaaacgatct 9331031  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||   |||||     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9331030 gaaagctttaagtcccgatactttgtgtgattatcaaaacattgattccatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattctaaacatagattc 9330934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20952746 - 20952550
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||| ||  || ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||      
T  20952746 atcaattgtattgttcagtcgttgatttcccaaactattaaacaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttcttaatctattcaacgatcc 20952647  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||  |||||     |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20952646 gaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgataggtcaatattctaaacctagattc 20952550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 17735634 - 17735770
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  || || |||||||   |||||     |||||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  17735634 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgatagctttaagtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaacgctatgtctagaat 17735733  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17735734 cattgttttgatagatgaatattctaaacctagattc 17735770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 19036903 - 19037039
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  || || |||||||   |||||     |||||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  19036903 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgatagctttaagtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaacgctatgtctagaat 19037002  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19037003 cattgttttgatagatgaatattctaaacctagattc 19037039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 24705101 - 24705237
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||  |||||     |||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  24705101 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacatcaaccttatgtctagaat 24705200  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24705201 cattgttttgatagatgaatattctaaacttagattc 24705237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 25692267 - 25692407
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaa- 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||  ||||| |||||||| ||||||     |||||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  25692267 tatcgtttaatcgatgatttctcaatcttttaaaagatctgaaagctttaagttcggatactttgtgtgattatcaaaacatcaaccctatgtctagaat 25692366  T
Q  160 ---cctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
        |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25692367 catgcattgttttgatagatgaatattctaaacctagattc 25692407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 27900777 - 27900955
Alignment:
Q  17 aatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttg 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||| ||| ||||| | |||| |||  || | ||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||      
T  27900777 aatcgtcgatttcccaaactattaaacgatccaatagtcgattttattattgcatagttgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttcc 27900876  T
Q  117 gatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
     |||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  27900877 aatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaatgctttga-agaagattattct-aacctagattc 27900955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 461295 - 461225
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  461295 gtgattatcaaaacacaaatcctatgtctagaatctttattttgatagatgattattctaaccctagattc 461225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25805341 - 25805276
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacct--atgttttgatagatgattattctaa 187  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||||    
T  25805341 aaagtgataatcaaaacctaaattccatgtctagaactttgacgtattgatagatgattattctaa 25805276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41354143 - 41354109
Alignment:
Q  163 atgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41354143 atgttttgatagatggttattctaaacctagattc 41354109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21331986 - 21331790
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21331986 atcaattgtgtcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 21331887  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21331886 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcagaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 21331790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42931364 - 42931168
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42931364 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 42931265  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42931264 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 42931168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15852780 - 15852976
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15852780 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataa 15852879  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15852880 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 15852976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36782176 - 36781980
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36782176 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 36782077  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36782076 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 36781980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 45012213 - 45012409
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  45012213 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 45012312  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45012313 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 45012409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21341883 - 21341722
Alignment:
Q  36 tattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21341883 tattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatc 21341784  T
Q  136 aaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341783 agaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 21341722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2021440 - 2021244
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021440 atcaattgtatcattcaattgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 2021341  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2021340 gaaagttttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgatttcatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacttagattc 2021244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16817322 - 16817126
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817322 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16817223  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16817222 gaaagctttaggtttggatgcacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaccaatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 16817126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16856479 - 16856283
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856479 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16856380  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16856379 gaaagctttaggtttggatgcacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaccaatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 16856283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2157842 - 2158038
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2157842 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 2157941  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2157942 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 2158038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2164258 - 2164454
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2164258 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 2164357  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2164358 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 2164454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 12951026 - 12951222
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12951026 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 12951125  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12951126 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgacagatggttattctaaacctagattc 12951222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34834804 - 34834608
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34834804 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34834705  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34834704 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 34834608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34841248 - 34841052
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34841248 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34841149  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34841148 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 34841052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43268089 - 43268285
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43268089 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttttcaatctattaaatgataa 43268188  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43268189 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 43268285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21067950 - 21067753
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgat-a 99  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21067950 atcaattgtatcattcaattgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagacgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 21067851  T
Q  100 agaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    | |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21067850 aaaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatcgatggttattctaaacctagattc 21067753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13901949 - 13901752
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa-tgata 99  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  13901949 atcaattgtatcattcaatggttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaattgatgatttctcaatctatttaaatgata 13901850  T
Q  100 agaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13901849 agaaagctttaggtttggatacctaaggtgattatcaaaacgtcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 13901752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 29485193 - 29485321
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29485193 aatcgatgatttctcgatctattgaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttt 29485292  T
Q  169 tgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29485293 tgatagatggttattctaaacctagattc 29485321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11909882 - 11909746
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||   ||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  11909882 tatcgtttaatcgacgatttctcagtctattaaacgattcaaaagcatgaagtttagatacaagaagtgattatcaaaacatcaattctatgtctaaaat 11909783  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909782 tcatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 11909746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 13163049 - 13163245
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||| || ||| ||| | ||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||      
T  13163049 atcaattgtatcgtttaatcgttgatttcccaaactattaaacgatccaacattcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcactctattaaacgatct 13163148  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||   | ||| || |||||  || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13163149 gaaaccatgaagcttagatactcaaggtgattatcaaaacgtaaatcccatgtctagaattcctgttttgataaatgattattctagacctagattc 13163245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 36842078 - 36842214
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| | || |||  |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  36842078 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatctgaaagctctacgttccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaat 36842177  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36842178 cattgttttgatagatgaatattctaaacctagattc 36842214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37439465 - 37439329
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||  ||||| |||||| |  |||||   | |||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  37439465 tatcatttaatcaacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagatccgatactttatgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaat 37439366  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37439365 cattgttttgatagataaatattctaaaactagattc 37439329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17789082 - 17788887
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataag 101  Q
    ||||||||||  || ||| || ||| |||||||||||| |   || ||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||  |    
T  17789082 tcaattgtattgtttaattgttgatttctcaaactattaagcaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctatcaaacgatccg 17788983  T
Q  102 aaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||| ||||||||  || |      |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17788982 aaagctttaagttctgacaatttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcatttttttgatagataaatattctaaacctagattc 17788887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24852892 - 24852822
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24852892 gtgattatctaaacaccaatcctatgtctagaatccttgttttgatagatgattattctaaccctagattc 24852822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28144917 - 28144781
Alignment:
Q  61 tatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaac 160  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||  |||||     ||||||| ||||||| ||||   ||||||||||     
T  28144917 tatcgtttaattgacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattaccaaaacaccaatcttatgtctagaat 28144818  T
Q  161 ctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28144817 cattgttttgatagatgaatattctaaacttagattc 28144781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 41455901 - 41456033
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||    
T  41455901 tttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattg 41456000  T
Q  166 ttttgatagat-gattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  41456001 ttttgatagataaactattctaaacctagattc 41456033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34745119 - 34745087
Alignment:
Q  165 gttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34745119 gttttgatagatgattattataaacctagattc 34745087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 5e-95; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 15012619 - 15012814
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15012619 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaattgatgatttcttaatctattgaatgataag 15012718  T
Q  102 aaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15012719 aaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtttagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 15012814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26250583 - 26250387
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26250583 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttttcaatctattgaatgataa 26250484  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26250483 gaaagcttttagtttggatacaaaaggtgattattaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 26250387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45068408 - 45068212
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45068408 atcaattgtaccattcaatagtcgatgtttcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 45068309  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45068308 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattcaatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 45068212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11358185 - 11357989
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11358185 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 11358086  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358085 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 11357989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16710660 - 16710464
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710660 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16710561  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16710560 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 16710464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1238444 - 1238640
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238444 atcaattgtatcattcaatagtcgatgtcacaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatagatgatttctcaatctattgaatgataa 1238543  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1238544 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 1238640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36425722 - 36425526
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  36425722 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttcttgatctattgaatgctaa 36425623  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36425622 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 36425526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6464568 - 6464372
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6464568 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 6464469  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6464468 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 6464372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 7311579 - 7311775
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7311579 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 7311678  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7311679 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 7311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36021791 - 36021595
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36021791 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 36021692  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36021691 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 36021595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 36076197 - 36076393
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36076197 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 36076296  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36076297 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 36076393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8013312 - 8013116
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8013312 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 8013213  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8013212 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgacagatggttattctaaacctagattc 8013116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36005474 - 36005278
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36005474 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 36005375  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36005374 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaaccaagattc 36005278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 31017617 - 31017698
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctc 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31017617 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctc 31017698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41242108 - 41242018
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctatt 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41242108 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 41242018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 12768974 - 12769037
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768974 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 12769037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24220138 - 24220068
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24220138 gtgattatcaaaacattgatttcatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattctaaacatagattc 24220068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7933853 - 7933721
Alignment:
Q  66 tttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||    
T  7933853 tttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattg 7933754  T
Q  166 ttttgatagatga-ttattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7933753 ttttgatagataatttattctaaacctagattc 7933721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 14394054 - 14394124
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14394054 gtgattatcaaaaccttaatcctatgtcaagaatcattgttttgatagatgaatattctacacctagattc 14394124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2552 - 2356
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2552 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcaatgatttctcaatctattgaatgataa 2453  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2452 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtttagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 2356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8873 - 8677
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873 atcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 8774  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8773 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 8677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15597
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15401 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcacactattgaatgattcaagaatcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 15500  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15501 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattcaatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 15597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 49920 - 50116
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49920 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 50019  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50020 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 50116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3256 - 3060
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3256 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttaccgttcaatcgatgatttctcaatctattgattgataa 3157  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156 gaaagctttaagtttggatacacaagatgattatcaaaacatgaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 3060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4801
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4997 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 4898  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4897 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattc 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12163 - 12327
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12163 atcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 12262  T
Q  101 gaaagttttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 165  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12263 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 12327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17636 - 17564
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17636 aaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatagaagattattct-aacctagattc 17564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 1512
Alignment:
Q  124 aaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaa 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||    
T  1575 aaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatagaagattattctaa 1512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4622
Alignment:
Q  129 gattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattc 197  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||  |   ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4554 gattatcgaaacctaaattccatgtctagaacaaaaactttgatagaagattattctaatcctagattc 4622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University