View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3267_low_48 (Length: 228)

Name: NF3267_low_48
Description: NF3267
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3267_low_48
NF3267_low_48
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (8-228)||(66290-66509)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (8-228)||(53577-53796)
scaffold0031 (17-154)||(36041-36171)
scaffold0031 (107-173)||(36352-36419)
scaffold0031 (17-70)||(65838-65891)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (8-228)||(11312660-11312879)
chr7 (1-228)||(12318132-12318358)
chr7 (1-228)||(15605147-15605374)
chr7 (1-224)||(13635348-13635570)
chr7 (1-224)||(16583261-16583482)
chr7 (1-228)||(15580696-15580922)
chr7 (17-228)||(70640-70850)
chr7 (17-228)||(74749-74959)
chr7 (1-228)||(9593350-9593576)
chr7 (17-228)||(33128-33338)
chr7 (17-228)||(12714885-12715096)
chr7 (17-228)||(12718689-12718900)
chr7 (17-228)||(16114262-16114473)
chr7 (17-228)||(16117415-16117626)
chr7 (17-228)||(16907075-16907286)
chr7 (17-228)||(18283387-18283598)
chr7 (17-183)||(39722287-39722452)
chr7 (17-228)||(18279424-18279635)
chr7 (17-228)||(26292416-26292627)
chr7 (1-228)||(18933-19159)
chr7 (17-228)||(12704533-12704744)
chr7 (17-228)||(12723600-12723811)
chr7 (9-224)||(11987225-11987439)
chr7 (81-228)||(9644391-9644539)
chr7 (15-224)||(14429905-14430120)
chr7 (1-228)||(8917432-8917657)
chr7 (15-224)||(12321620-12321836)
chr7 (1-228)||(13149160-13149385)
chr7 (1-228)||(13461766-13461992)
chr7 (1-173)||(13918710-13918879)
chr7 (1-173)||(25927433-25927602)
chr7 (1-173)||(1859016-1859185)
chr7 (16-224)||(3271846-3272061)
chr7 (4-148)||(16457312-16457455)
chr7 (1-224)||(6801217-6801439)
chr7 (15-156)||(9751703-9751849)
chr7 (1-224)||(16724510-16724730)
chr7 (1-224)||(17701524-17701744)
chr7 (15-228)||(2760153-2760373)
chr7 (11-131)||(7519331-7519447)
chr7 (15-156)||(2832389-2832536)
chr7 (1-152)||(2530342-2530491)
chr7 (1-228)||(15728330-15728555)
chr7 (15-228)||(9446033-9446253)
chr7 (1-228)||(14216920-14217145)
chr7 (138-206)||(2530040-2530108)
chr7 (15-156)||(39267847-39267994)
chr7 (1-67)||(16275497-16275563)
chr7 (1-131)||(18425443-18425566)
chr7 (16-224)||(20569474-20569690)
chr7 (1-66)||(35151611-35151676)
chr7 (152-228)||(16438909-16438985)
chr7 (1-224)||(18556978-18557199)
chr7 (8-47)||(14152048-14152087)
chr7 (185-228)||(48593331-48593374)
chr7 (167-228)||(42205284-42205345)
chr7 (17-154)||(45169961-45170091)
chr7 (16-131)||(42204017-42204139)
chr7 (107-177)||(45170268-45170339)
chr7 (3-52)||(24054474-24054523)
chr7 (16-52)||(15211484-15211520)
chr7 (3-69)||(19649530-19649596)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (8-228)||(17804209-17804428)
chr6 (8-228)||(25767043-25767262)
chr6 (1-213)||(22429920-22430131)
chr6 (17-228)||(14472292-14472501)
chr6 (17-228)||(18955638-18955848)
chr6 (17-228)||(22862967-22863177)
chr6 (17-228)||(19870611-19870822)
chr6 (1-228)||(12706694-12706920)
chr6 (17-210)||(1644726-1644918)
chr6 (17-228)||(11566883-11567094)
chr6 (17-228)||(23395089-23395300)
chr6 (17-228)||(23989941-23990152)
chr6 (17-210)||(8243882-8244074)
chr6 (1-228)||(16741211-16741437)
chr6 (17-210)||(18917159-18917351)
chr6 (17-228)||(12618719-12618929)
chr6 (15-224)||(18907133-18907349)
chr6 (1-228)||(5616689-5616915)
chr6 (1-224)||(19662775-19662996)
chr6 (1-173)||(23414651-23414820)
chr6 (1-173)||(27556409-27556578)
chr6 (1-228)||(2685194-2685419)
chr6 (16-224)||(19790657-19790873)
chr6 (1-228)||(9482168-9482393)
chr6 (144-224)||(27415821-27415901)
chr6 (1-228)||(22592679-22592903)
chr6 (15-228)||(20907856-20908076)
chr6 (1-228)||(12496314-12496539)
chr6 (8-131)||(27325581-27325712)
chr6 (15-158)||(16523330-16523478)
chr6 (1-228)||(1587606-1587831)
chr6 (1-228)||(20803428-20803654)
chr6 (88-210)||(21834782-21834903)
chr6 (16-228)||(18180517-18180734)
chr6 (1-173)||(27416124-27416287)
chr6 (1-67)||(1644293-1644359)
chr6 (1-67)||(31478265-31478331)
chr6 (1-154)||(16624137-16624283)
chr6 (16-131)||(21766718-21766839)
chr6 (119-221)||(15894310-15894413)
chr6 (81-173)||(31478076-31478168)
chr6 (3-71)||(19848034-19848102)
chr6 (18-228)||(23657295-23657513)
chr6 (1-67)||(21702293-21702359)
chr6 (119-224)||(21739900-21740006)
chr6 (15-69)||(27553612-27553666)
chr6 (17-154)||(31477765-31477895)
chr6 (15-71)||(15041589-15041645)
chr6 (3-71)||(23992441-23992509)
chr6 (15-224)||(27567488-27567704)
chr6 (88-173)||(1644462-1644548)
chr6 (15-69)||(15894479-15894533)
chr6 (15-224)||(22408183-22408398)
chr6 (175-224)||(16523281-16523330)
chr6 (17-154)||(16760316-16760446)
chr6 (3-52)||(22432259-22432308)
chr6 (3-52)||(22438809-22438858)
chr6 (17-154)||(22949129-22949259)
chr6 (17-154)||(22953085-22953215)
chr6 (17-154)||(23871573-23871703)
chr6 (17-154)||(23875529-23875659)
chr6 (107-173)||(16760068-16760135)
chr6 (3-70)||(19873130-19873197)
chr6 (107-173)||(22948881-22948948)
chr6 (107-173)||(22952837-22952904)
chr6 (107-173)||(23871325-23871392)
chr6 (107-173)||(23875281-23875348)
chr6 (1-67)||(25135706-25135772)
chr6 (3-52)||(19862988-19863037)
chr6 (88-141)||(22074174-22074227)
chr6 (16-69)||(25603425-25603478)
chr6 (16-69)||(25611763-25611816)
chr6 (91-221)||(25642064-25642196)
chr6 (16-52)||(16929647-16929683)
chr6 (16-52)||(16965367-16965403)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (1-224)||(15482668-15482890)
chr3 (8-228)||(20461375-20461594)
chr3 (8-228)||(7793224-7793444)
chr3 (8-224)||(327043-327259)
chr3 (8-228)||(2897698-2897917)
chr3 (1-228)||(31097429-31097656)
chr3 (17-228)||(30065970-30066180)
chr3 (17-228)||(11854757-11854967)
chr3 (17-228)||(11070092-11070302)
chr3 (17-228)||(11165404-11165614)
chr3 (17-228)||(55022891-55023101)
chr3 (17-228)||(15617398-15617609)
chr3 (17-228)||(14499349-14499559)
chr3 (17-228)||(7109722-7109933)
chr3 (17-228)||(7113657-7113868)
chr3 (1-228)||(15849960-15850183)
chr3 (17-228)||(22336743-22336954)
chr3 (17-228)||(27409518-27409729)
chr3 (17-228)||(28949748-28949959)
chr3 (17-228)||(22321688-22321899)
chr3 (81-228)||(11300386-11300533)
chr3 (1-228)||(16797929-16798154)
chr3 (1-228)||(16808756-16808981)
chr3 (15-224)||(18383795-18384010)
chr3 (16-228)||(3402830-3403050)
chr3 (16-224)||(19725790-19726004)
chr3 (15-224)||(322614-322829)
chr3 (1-228)||(17241978-17242203)
chr3 (16-228)||(3389810-3390030)
chr3 (16-224)||(12496280-12496495)
chr3 (1-173)||(5223070-5223239)
chr3 (16-224)||(11298407-11298621)
chr3 (1-173)||(15464871-15465040)
chr3 (15-224)||(11862815-11863031)
chr3 (16-224)||(11595017-11595233)
chr3 (1-173)||(12339472-12339641)
chr3 (15-224)||(1982689-1982905)
chr3 (15-156)||(14665423-14665570)
chr3 (15-156)||(14668579-14668726)
chr3 (20-228)||(38814409-38814615)
chr3 (1-117)||(8489459-8489571)
chr3 (17-184)||(12037871-12038044)
chr3 (15-215)||(11851603-11851810)
chr3 (1-173)||(11300696-11300866)
chr3 (1-228)||(3833680-3833905)
chr3 (16-224)||(42325964-42326180)
chr3 (17-228)||(11557259-11557477)
chr3 (1-154)||(16750543-16750689)
chr3 (5-127)||(11854427-11854545)
chr3 (1-67)||(4589228-4589294)
chr3 (15-69)||(12172818-12172872)
chr3 (1-67)||(19775353-19775419)
chr3 (119-184)||(12172938-12173004)
chr3 (1-67)||(16696791-16696857)
chr3 (120-224)||(15060427-15060532)
chr3 (164-228)||(26190883-26190947)
chr3 (88-173)||(4589039-4589125)
chr3 (15-69)||(23053128-23053182)
chr3 (3-69)||(46822279-46822345)
chr3 (17-154)||(4111204-4111334)
chr3 (16-69)||(12511084-12511137)
chr3 (124-224)||(15051655-15051756)
chr3 (17-154)||(15964993-15965123)
chr3 (17-154)||(15968917-15969047)
chr3 (17-154)||(15972841-15972971)
chr3 (120-224)||(16909885-16909990)
chr3 (81-173)||(19775516-19775608)
chr3 (17-154)||(19775789-19775919)
chr3 (17-154)||(4107352-4107482)
chr3 (119-183)||(23052996-23053061)
chr3 (17-154)||(37439591-37439721)
chr3 (16-52)||(14878574-14878610)
chr3 (3-71)||(23408438-23408506)
chr3 (20-67)||(15941938-15941985)
chr3 (107-173)||(15964745-15964812)
chr3 (107-173)||(15968669-15968736)
chr3 (107-173)||(15972593-15972660)
chr3 (16-71)||(30029867-30029922)
chr3 (3-69)||(15878092-15878158)
chr3 (16-69)||(15051531-15051584)
chr3 (16-69)||(15060307-15060360)
chr3 (16-69)||(16369423-16369476)
chr3 (120-224)||(16369543-16369648)
chr3 (16-69)||(16909765-16909818)
chr3 (16-52)||(17525216-17525252)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (8-228)||(24735415-24735634)
chr2 (17-228)||(10101520-10101730)
chr2 (81-228)||(19688631-19688778)
chr2 (17-210)||(24649378-24649570)
chr2 (17-228)||(12901386-12901597)
chr2 (17-228)||(27379307-27379518)
chr2 (17-228)||(27383353-27383564)
chr2 (17-228)||(27601817-27602028)
chr2 (17-228)||(24628353-24628564)
chr2 (17-228)||(41530884-41531089)
chr2 (1-224)||(22461068-22461289)
chr2 (16-224)||(25963595-25963809)
chr2 (107-228)||(15477713-15477835)
chr2 (15-226)||(22811787-22812006)
chr2 (1-173)||(31344883-31345052)
chr2 (16-224)||(25961413-25961628)
chr2 (20-228)||(19928377-19928583)
chr2 (1-224)||(23187081-23187302)
chr2 (1-224)||(23598344-23598565)
chr2 (16-221)||(40428486-40428699)
chr2 (15-228)||(21327441-21327662)
chr2 (15-224)||(24174822-24175038)
chr2 (16-228)||(24716405-24716622)
chr2 (20-228)||(18855336-18855541)
chr2 (15-228)||(21318510-21318731)
chr2 (15-224)||(24655217-24655433)
chr2 (15-224)||(37524697-37524905)
chr2 (1-127)||(41666955-41667078)
chr2 (119-216)||(24673711-24673809)
chr2 (1-228)||(27263278-27263504)
chr2 (5-228)||(60826-61046)
chr2 (15-133)||(21916069-21916193)
chr2 (15-224)||(24869902-24870118)
chr2 (135-224)||(21918194-21918284)
chr2 (16-69)||(22799167-22799220)
chr2 (17-154)||(30344946-30345076)
chr2 (3-71)||(25616199-25616267)
chr2 (17-154)||(1283410-1283540)
chr2 (115-221)||(22758596-22758704)
chr2 (91-221)||(22740841-22740973)
chr2 (16-69)||(23019747-23019800)
chr2 (14-63)||(24673590-24673639)
chr2 (1-42)||(26125214-26125255)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-228)||(12909-13135)
scaffold0044 (1-228)||(19193-19419)
scaffold0044 (1-66)||(62266-62331)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (1-228)||(36819183-36819410)
chr1 (1-228)||(16080319-16080545)
chr1 (3-213)||(24782990-24783199)
chr1 (17-228)||(1010744-1010954)
chr1 (17-228)||(20228683-20228894)
chr1 (17-228)||(16375332-16375543)
chr1 (17-228)||(21407376-21407587)
chr1 (1-228)||(19211872-19212098)
chr1 (17-228)||(52639562-52639773)
chr1 (17-224)||(23819178-23819383)
chr1 (15-224)||(18181999-18182215)
chr1 (15-224)||(22449144-22449360)
chr1 (1-228)||(20138088-20138314)
chr1 (1-224)||(12646876-12647097)
chr1 (1-173)||(33797288-33797457)
chr1 (16-228)||(18393838-18394059)
chr1 (89-224)||(33797626-33797760)
chr1 (16-228)||(45310241-45310462)
chr1 (88-228)||(8761507-8761648)
chr1 (21-228)||(18882393-18882598)
chr1 (15-224)||(3472804-3473017)
chr1 (16-224)||(45489621-45489837)
chr1 (1-228)||(46975473-46975698)
chr1 (113-224)||(21022767-21022879)
chr1 (15-228)||(3704939-3705159)
chr1 (16-228)||(17678462-17678679)
chr1 (8-53)||(21313140-21313185)
chr1 (119-224)||(22831256-22831361)
chr1 (1-154)||(41388196-41388342)
chr1 (119-224)||(6151990-6152096)
chr1 (1-154)||(39244096-39244242)
chr1 (1-154)||(39247651-39247797)
chr1 (115-221)||(42865092-42865200)
chr1 (1-64)||(20229267-20229330)
chr1 (88-173)||(20229075-20229161)
chr1 (17-154)||(1925084-1925214)
chr1 (17-154)||(20924098-20924228)
chr1 (16-71)||(21788081-21788136)
chr1 (17-68)||(33050067-33050118)
chr1 (3-71)||(22468735-22468803)
chr1 (3-69)||(20135201-20135267)
chr1 (15-63)||(21022653-21022701)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (8-228)||(36133837-36134056)
chr4 (17-228)||(17810293-17810503)
chr4 (17-228)||(14757297-14757507)
chr4 (17-228)||(9556551-9556762)
chr4 (1-228)||(1951636-1951862)
chr4 (17-228)||(27534047-27534257)
chr4 (17-228)||(4561208-4561419)
chr4 (1-156)||(22634369-22634523)
chr4 (17-228)||(5756812-5757023)
chr4 (11-228)||(18222253-18222468)
chr4 (17-228)||(33742399-33742609)
chr4 (1-228)||(17152362-17152587)
chr4 (1-228)||(18228728-18228954)
chr4 (15-224)||(16487956-16488172)
chr4 (1-224)||(3412804-3413023)
chr4 (1-228)||(18236897-18237123)
chr4 (1-228)||(26243540-26243765)
chr4 (16-224)||(16356831-16357045)
chr4 (1-173)||(43256343-43256512)
chr4 (1-228)||(16243275-16243500)
chr4 (1-228)||(23139277-23139501)
chr4 (16-224)||(16348543-16348757)
chr4 (1-228)||(19757476-19757701)
chr4 (1-228)||(19782105-19782330)
chr4 (144-224)||(43256040-43256120)
chr4 (1-228)||(2014784-2015009)
chr4 (3-156)||(20157407-20157566)
chr4 (15-224)||(5338859-5339076)
chr4 (15-228)||(15353181-15353402)
chr4 (16-224)||(11250439-11250655)
chr4 (15-156)||(13812966-13813113)
chr4 (81-224)||(25555600-25555744)
chr4 (21-224)||(9530460-9530660)
chr4 (119-221)||(12570156-12570259)
chr4 (1-68)||(28569477-28569544)
chr4 (1-67)||(14708668-14708734)
chr4 (1-67)||(15224800-15224866)
chr4 (133-224)||(18602624-18602715)
chr4 (115-223)||(44675762-44675872)
chr4 (4-66)||(18602766-18602828)
chr4 (1-67)||(42997484-42997550)
chr4 (17-154)||(10712874-10713004)
chr4 (17-154)||(10926644-10926774)
chr4 (152-224)||(18609218-18609290)
chr4 (4-64)||(18609340-18609400)
chr4 (115-216)||(23843608-23843711)
chr4 (16-63)||(25555503-25555550)
chr4 (15-69)||(12570036-12570090)
chr4 (17-154)||(14954122-14954252)
chr4 (88-224)||(16351727-16351864)
chr4 (17-154)||(25689891-25690021)
chr4 (20-136)||(45938173-45938284)
chr4 (107-173)||(14954433-14954500)
chr4 (16-71)||(15093798-15093853)
chr4 (107-173)||(25689643-25689710)
chr4 (81-154)||(15224963-15225035)
chr4 (94-154)||(12487802-12487862)
chr4 (127-184)||(15125071-15125130)
chr4 (16-52)||(23843501-23843537)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-228)||(2548-2773)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-228)||(18507-18733)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-228)||(173297-173521)
scaffold0001 (15-228)||(422406-422626)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-224)||(23535468-23535688)
chr5 (17-221)||(15236662-15236865)
chr5 (8-158)||(17410452-17410601)
chr5 (17-228)||(20295868-20296079)
chr5 (17-228)||(19472594-19472805)
chr5 (1-228)||(18774208-18774435)
chr5 (1-228)||(42805425-42805651)
chr5 (15-224)||(21366544-21366759)
chr5 (1-228)||(18784051-18784278)
chr5 (1-228)||(20232556-20232781)
chr5 (1-228)||(26742621-26742847)
chr5 (1-173)||(20911101-20911270)
chr5 (1-228)||(26666006-26666231)
chr5 (1-228)||(26937603-26937828)
chr5 (1-213)||(24532938-24533148)
chr5 (1-173)||(18355963-18356132)
chr5 (1-228)||(33409234-33409459)
chr5 (144-224)||(18356474-18356554)
chr5 (144-223)||(20910680-20910759)
chr5 (16-224)||(12028443-12028659)
chr5 (16-209)||(22757148-22757349)
chr5 (16-228)||(23451371-23451588)
chr5 (20-228)||(16674177-16674383)
chr5 (20-228)||(17718314-17718520)
chr5 (16-224)||(123184-123399)
chr5 (21-156)||(24767493-24767634)
chr5 (16-224)||(20805575-20805788)
chr5 (16-228)||(23458615-23458832)
chr5 (16-228)||(23462876-23463093)
chr5 (1-228)||(21340642-21340867)
chr5 (16-228)||(17919026-17919245)
chr5 (1-127)||(21885166-21885289)
chr5 (15-224)||(24221899-24222115)
chr5 (1-228)||(25229281-25229506)
chr5 (1-228)||(25293437-25293662)
chr5 (16-221)||(20766997-20767207)
chr5 (17-81)||(40723608-40723672)
chr5 (16-152)||(1858929-1859070)
chr5 (1-67)||(10752949-10753015)
chr5 (15-224)||(26680604-26680818)
chr5 (15-224)||(26952211-26952425)
chr5 (1-66)||(4036225-4036290)
chr5 (1-228)||(26172470-26172696)
chr5 (81-173)||(10753112-10753204)
chr5 (17-154)||(10753385-10753515)
chr5 (115-221)||(14079278-14079386)
chr5 (3-71)||(17517240-17517308)
chr5 (15-63)||(31342169-31342217)
chr5 (81-152)||(31342220-31342291)
chr5 (196-228)||(17410646-17410678)
chr5 (107-173)||(11220521-11220588)
chr5 (107-173)||(11228930-11228997)
chr5 (107-173)||(11230919-11230986)
chr5 (107-172)||(11226940-11227006)
chr5 (16-69)||(23201383-23201436)
chr5 (16-69)||(23512121-23512174)
chr5 (16-69)||(23572107-23572160)
chr5 (16-52)||(21873277-21873313)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-224)||(228252-228473)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (21-225)||(13365-13568)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-228)||(19892-20117)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (17-228)||(3750-3960)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (17-228)||(65402-65613)
scaffold0029 (17-210)||(61505-61697)
scaffold0029 (17-228)||(80736-80943)
scaffold0029 (1-67)||(80300-80366)
scaffold0029 (81-152)||(80463-80533)
scaffold0029 (15-69)||(12785-12839)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-224)||(9544-9766)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (1-227)||(16231351-16231576)
chr8 (17-210)||(43251834-43252026)
chr8 (17-228)||(19278157-19278368)
chr8 (17-228)||(21972459-21972670)
chr8 (17-228)||(21976544-21976755)
chr8 (11-228)||(22044900-22045115)
chr8 (49-228)||(22111904-22112083)
chr8 (1-228)||(23834177-23834404)
chr8 (1-228)||(30308629-30308853)
chr8 (88-228)||(22028647-22028788)
chr8 (81-224)||(18619561-18619705)
chr8 (15-224)||(20465917-20466133)
chr8 (15-224)||(30643169-30643386)
chr8 (16-224)||(16410133-16410347)
chr8 (16-222)||(20856305-20856518)
chr8 (16-224)||(17926585-17926799)
chr8 (15-216)||(15602903-15603111)
chr8 (1-228)||(23846890-23847115)
chr8 (1-173)||(14398039-14398208)
chr8 (15-216)||(15611355-15611563)
chr8 (1-154)||(21387079-21387228)
chr8 (1-147)||(21383659-21383801)
chr8 (20-228)||(15538473-15538679)
chr8 (120-224)||(377414-377519)
chr8 (119-221)||(24755856-24755959)
chr8 (20-228)||(15531914-15532119)
chr8 (120-224)||(19259460-19259565)
chr8 (15-228)||(22010553-22010769)
chr8 (1-187)||(32605216-32605400)
chr8 (1-68)||(17055412-17055479)
chr8 (1-67)||(32598684-32598750)
chr8 (16-152)||(39094875-39095018)
chr8 (3-71)||(18678141-18678209)
chr8 (16-228)||(16861201-16861418)
chr8 (20-228)||(17828458-17828663)
chr8 (16-71)||(32121759-32121814)
chr8 (17-154)||(18862600-18862730)
chr8 (115-221)||(19983223-19983331)
chr8 (17-154)||(21827969-21828099)
chr8 (3-69)||(23648567-23648633)
chr8 (16-131)||(23776807-23776929)
chr8 (15-69)||(24755736-24755790)
chr8 (115-221)||(19899225-19899333)
chr8 (17-69)||(377295-377347)
chr8 (17-149)||(21410971-21411096)
chr8 (17-149)||(21805463-21805588)
chr8 (107-173)||(18862911-18862978)
chr8 (107-173)||(21828280-21828347)
chr8 (119-221)||(16184862-16184966)
chr8 (16-69)||(17353984-17354037)
chr8 (16-69)||(19259632-19259685)
chr8 (16-69)||(21162099-21162152)
chr8 (16-69)||(21168772-21168825)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (17-228)||(12443-12653)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (17-210)||(4994-5186)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (17-228)||(58593-58804)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-228)||(3405-3631)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (17-228)||(35817-36027)
scaffold0109 (1-228)||(6950-7175)
scaffold0109 (1-67)||(11336-11402)
scaffold0109 (1-67)||(38853-38919)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (98-228)||(10459-10589)
scaffold0004 (3-70)||(69804-69871)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-228)||(18235-18461)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (15-228)||(4452-4672)
scaffold0676 (17-154)||(471-602)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-228)||(24843-25070)
scaffold0012 (17-154)||(189332-189462)
scaffold0012 (107-173)||(189643-189710)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (15-224)||(181-398)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (15-224)||(415-631)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (15-227)||(5608-5826)
scaffold0476 (15-227)||(6803-7021)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (1-228)||(6132-6357)
scaffold0546 (1-67)||(1905-1971)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (81-228)||(12-160)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (15-224)||(1516-1731)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (15-224)||(42649-42860)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (11-224)||(23232-23443)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (15-228)||(1364-1584)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (15-184)||(6227-6403)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (16-224)||(46605-46820)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (17-228)||(15111-15328)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (15-224)||(18534-18750)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-228)||(9909-10134)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (15-158)||(17056-17206)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (16-224)||(1962-2178)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-173)||(20395-20564)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (16-216)||(9536-9741)
scaffold0104 (16-216)||(1853-2059)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (16-224)||(44104-44318)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-173)||(30890-31059)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-228)||(18360-18585)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (16-226)||(35387-35605)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (144-224)||(71460-71540)
scaffold0003 (1-152)||(71074-71215)
scaffold0003 (15-224)||(413929-414145)
scaffold0003 (20-228)||(139736-139941)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-228)||(5875-6100)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (16-224)||(8583-8799)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (1-173)||(6686-6855)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (97-183)||(928-1014)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (88-224)||(19170-19307)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (88-224)||(21447-21584)
scaffold0037 (1-67)||(80810-80876)
scaffold0037 (88-152)||(80642-80706)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (16-228)||(4099-4320)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (16-216)||(920-1126)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (20-228)||(63878-64084)
scaffold0042 (119-221)||(34791-34894)
scaffold0042 (20-221)||(75762-75961)
scaffold0042 (15-69)||(34960-35014)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-173)||(207768-207949)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (16-224)||(6294-6508)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (21-156)||(9990-10131)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (15-156)||(2927-3074)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (16-221)||(19613-19826)
scaffold0017 (16-221)||(15091-15304)
scaffold0017 (16-52)||(193034-193070)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-228)||(9426-9651)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (15-146)||(73725-73861)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (89-221)||(15300-15430)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (15-224)||(7493-7709)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (15-227)||(311-520)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (1-228)||(77045-77271)
scaffold0043 (16-52)||(18259-18295)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (16-228)||(30619-30836)
scaffold0008 (1-127)||(1882-2005)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (20-228)||(36331-36536)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (120-224)||(6956-7061)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (81-221)||(192198-192339)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (1-224)||(374-580)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (15-227)||(2311-2531)
scaffold0439 (15-227)||(10171-10391)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-67)||(9340-9406)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (115-221)||(3872-3980)
scaffold0149 (115-221)||(8303-8411)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (119-210)||(13969-14061)
scaffold0056 (15-69)||(14127-14181)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (1-67)||(15343-15409)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (119-184)||(2974-3040)
scaffold0158 (119-184)||(6640-6706)
scaffold0158 (15-68)||(2854-2907)
scaffold0158 (15-68)||(6520-6573)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (1-67)||(8505-8571)
scaffold0111 (1-67)||(15649-15715)
scaffold0111 (115-184)||(32565-32636)
scaffold0111 (17-49)||(32459-32491)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (16-200)||(7173-7364)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (2-68)||(16696-16762)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (16-131)||(38451-38573)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (17-154)||(11456-11586)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (17-154)||(14042-14172)
scaffold0141 (107-173)||(14353-14420)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (16-73)||(4841-4898)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (18-224)||(1817-2029)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (16-131)||(2191-2313)
scaffold0410 (81-152)||(11473-11544)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (16-69)||(6118-6171)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (115-221)||(15550-15658)
scaffold0297 (16-52)||(15737-15773)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (88-133)||(33649-33694)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (16-69)||(16389-16442)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (16-69)||(21844-21897)
scaffold0210 (16-69)||(29736-29789)
scaffold0210 (168-224)||(21684-21740)
scaffold0210 (168-224)||(29576-29632)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (16-69)||(14687-14740)
scaffold0081 (16-69)||(23702-23755)
scaffold0081 (16-69)||(39126-39179)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (168-221)||(174952-175005)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (94-154)||(488-548)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (94-154)||(32615-32675)


Alignment Details
Target: scaffold0036 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 66509 - 66290
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  66509 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 66411  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66410 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 66311  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  66310 gtctcattagtacctaaagtt 66290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 53577 - 53796
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  53577 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 53675  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53676 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 53775  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53776 gtctcattagtacctaaagtt 53796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36171 - 36041
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  36171 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 36079  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  36078 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 36041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36419 - 36352
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  36419 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 36352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 65891 - 65838
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag 70  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  65891 actcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacag 65838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 11312660 - 11312879
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  11312660 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 11312758  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312759 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 11312858  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11312859 gtctcattagtacctaaagtt 11312879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12318132 - 12318358
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12318132 tcatcatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttc 12318230  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318231 ttaatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 12318330  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318331 taaataggtctcattagtacctaaagtt 12318358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15605374 - 15605147
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605374 tcatcatcatattcagactcatgcattttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 15605275  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605274 ttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 15605175  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605174 taaataggtctcattagtacctaaagtt 15605147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13635570 - 13635348
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13635570 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaatttc 13635472  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13635471 ttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctctgttaatatct 13635372  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  13635371 taaataggcctcattagtacctaa 13635348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16583261 - 16583482
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16583261 tcatcaacttattcagactcatgcaacgtagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaatttc 16583359  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16583360 tcgatcattcaacaataattcaagtaatgcaatcaatca-taaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 16583458  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  16583459 tatataggtctcattagtacctaa 16583482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15580696 - 15580922
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15580696 tcatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacgatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttt 15580794  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  15580795 tttatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttttcagttaacatcc 15580894  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15580895 taaataggtctcactataacctaaagtt 15580922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 70850 - 70640
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  70850 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaattattcaataat 70752  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  70751 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 70652  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
     |||||||||||    
T  70651 ctacctaaagtt 70640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 74959 - 74749
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  74959 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaattattcaataat 74861  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  74860 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 74761  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
     |||||||||||    
T  74760 ctacctaaagtt 74749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9593350 - 9593576
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  9593350 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattt 9593446  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9593447 cttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataatttactttatattcacttaaaatttcataaaagcttcacagttctcagttaatat 9593546  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9593547 ctttattaggtctcattagtacctaaagtt 9593576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 33128 - 33338
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  33128 actcatgcaactgagttaaataacaataacagcataatcggaacatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 33226  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33227 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 33326  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
     |||||||||||    
T  33327 ctacctaaagtt 33338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 12714885 - 12715096
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12714885 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 12714983  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  12714984 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 12715083  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  12715084 tgtacctaaagtt 12715096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 12718689 - 12718900
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12718689 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 12718787  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  12718788 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 12718887  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  12718888 tgtacctaaagtt 12718900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 16114262 - 16114473
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16114262 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 16114360  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  16114361 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 16114460  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  16114461 tgtacctaaagtt 16114473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 16117415 - 16117626
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16117415 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 16117513  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  16117514 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 16117613  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  16117614 tgtacctaaagtt 16117626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16907286 - 16907075
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16907286 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 16907188  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  16907187 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 16907088  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  16907087 tgtacctaaagtt 16907075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 18283387 - 18283598
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18283387 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 18283485  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  18283486 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 18283585  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  18283586 tgtacctaaagtt 18283598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 39722287 - 39722452
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39722287 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaact-cattttcaacaacttcctgatcattcaataat 39722385  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39722386 aattcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 39722452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 18279424 - 18279635
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18279424 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacaacttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 18279522  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  18279523 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 18279622  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  18279623 tgtacctaaagtt 18279635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 26292416 - 26292627
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  26292416 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttccttatcattcaataat 26292514  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  || || | | |||||| |||||||| || ||    
T  26292515 aattcaattaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaagtcacaatcattatctttaataggtcacacta 26292614  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  26292615 tgtacctaaagtt 26292627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19159 - 18933
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  19159 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattc 19063  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19062 cttgatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 18963  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18962 ctttaataggtctcattagcacctaaagtt 18933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12704744 - 12704533
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12704744 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcagcagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 12704646  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  12704645 aattcaagtaatgcattcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 12704546  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  12704545 tgtacctaaagtt 12704533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 12723600 - 12723811
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12723600 actcatgtaacttagttaaataacaatatcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattt-attttcaacaacttcctgatcattcaataat 12723698  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  12723699 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 12723798  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  12723799 tgtacctaaagtt 12723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 11987225 - 11987439
Alignment:
Q  9 ttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||    
T  11987225 ttattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaa-tcattttcaacagtttcttgatcat 11987321  T
Q  109 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc-ttaaata 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |  || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11987322 tcaataataaatcaagtaaatgcaatcaatccataattcacttattattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatatcttttaata 11987421  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11987422 ggtctcactagtacctaa 11987439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 9644391 - 9644539
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  9644391 aattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataatttactttatattcacttaaaatttcataaaagctt 9644490  T
Q  180 cacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9644491 cacagttctcagttaatatctttattaggtctcattagtacctaaagtt 9644539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 14429905 - 14430120
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |  ||||    ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  14429905 agactcatgcaacttagttaaataacaatagccgcataatcagatcacaacaacagtatacttcatcatatcaattcattt-catcaacatcttgatcat 14430003  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14430004 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacagatctcagttaacatcttaaatag 14430103  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  14430104 gtcacattactacctaa 14430120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8917432 - 8917657
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||   | |||||| ||||| ||||  |||||| |||    
T  8917432 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcaacataatcaaatcacatcag--gtttaataacaaat-cattcacaacaatttc 8917528  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  8917529 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcttaaaagcttcagagttctcggtcaatatc 8917628  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8917629 tttaataggtctcattagcacccaaagtt 8917657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12321836 - 12321620
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  12321836 agactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 12321738  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| |  ||||||| |||||| |||    
T  12321737 ttccataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagtttcacagattgcagttaacatcttatata 12321638  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  12321637 ggtcacattactacctaa 12321620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13149160 - 13149385
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  13149160 tcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaatttc 13149256  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  13149257 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 13149356  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  13149357 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 13149385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13461766 - 13461992
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||||| ||||  |||||| |||    
T  13461766 tcatcaacttattcatactcatgcaaattagtttaattacaattgcagcataatcaaatcacatcag--gtttaataacaaat-cattcacaacaatttc 13461862  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||| || ||    
T  13461863 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaaacaatcaatccataatttcacttcataatcaattaacaattcataaaagcttcagagttctcagtcaacat 13461962  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13461963 ctttaataggtctcattagcacctaaagtt 13461992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13918879 - 13918710
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  13918879 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 13918784  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  13918783 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttcataa 13918710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25927602 - 25927433
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  25927602 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--aacttaata-aaaattca-tttcaacaacatc 25927507  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  25927506 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 25927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1859185 - 1859016
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  1859185 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacaaca--agcttaataac-aattc-ttttcaacaacatc 1859090  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  1859089 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttcataa 1859016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 3271846 - 3272061
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||        ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  3271846 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcattt-ctacaacatcttgatta 3271944  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||  | ||| |||| |||||| |||    
T  3271945 ttcaataata-ttcaagtaatgcaattaatcagtaaatcacatcataatcagcttaatagttcataacagcttcacatatttcatttaacatcttatata 3272043  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||| || |||||||    
T  3272044 ggtctcactactacctaa 3272061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16457455 - 16457312
Alignment:
Q  4 tcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttctt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  16457455 tcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattttcaacaatttctt 16457359  T
Q  103 gattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcac 148  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  16457358 gatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcac 16457312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6801217 - 6801439
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  6801217 tcatcaacttatttcagacccatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcatgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 6801312  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    |||||| | | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||| | |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6801313 cttgatcaattaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataatttcacttcataatcacttaatatatcataatggcttcacagttctcagtcaata 6801412  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  6801413 tctccaataggtctcactagcacctaa 6801439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9751849 - 9751703
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||       | ||||||| |||||| || ||||||| ||||||| |    
T  9751849 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagtataattcataatatc-aattca-ttccaacaacatcttgatca 9751752  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  9751751 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 9751703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16724730 - 16724510
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||   | | |||| ||| | |||| |||| |  |||    
T  16724730 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatgaaatcacatcag--gttaaataacaagt-cattctcaatag-ttc 16724635  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaat-caatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |  ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16724634 ttgatcattcaacaataattcaaataaatataattcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaa-cttcacagttctcagtcaatat 16724536  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16724535 ctttaataggtctcattagtacctaa 16724510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17701744 - 17701524
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||   | | |||| ||| | |||| |||| |  |||    
T  17701744 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatgaaatcacatcag--gttaaataacaagt-cattctcaatag-ttc 17701649  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaat-caatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |  ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  17701648 ttgatcattcaacaataattcaaataaatataattcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaa-cttcacagttctcagtcaatat 17701550  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17701549 ctttaataggtctcattagtacctaa 17701524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 2760153 - 2760373
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||         | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||     
T  2760153 agactcatgcaacttagttaaataacgaaagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataatatcaa-ttcattttcaacaacatcatgatc 2760251  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| || | || ||| |||||| | |||||||| |||||||||    
T  2760252 attcaataatatctcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttta-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaat 2760350  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||| | || |||||||||||    
T  2760351 atgtcttactactacctaaagtt 2760373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7519447 - 7519331
Alignment:
Q  11 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattc 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  7519447 attcagactcatccaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatcttgatcattc 7519352  T
Q  111 aataataattcaagtaatgca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7519351 aataatatttcaagtaatgca 7519331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2832536 - 2832389
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agct---taatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     | ||   ||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  2832536 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcccatcaacaatataactttataatatc-aattca-tttcaacaacatcttgatc 2832439  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  2832438 attcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 2832389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2530491 - 2530342
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatca-catcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  2530491 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcataatca--agcttaataac-aattcattttcagcaattt 2530395  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    |||||| |||| |||||  ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2530394 cttgatcattccataattttttgagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 2530342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15728330 - 15728555
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  15728330 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 15728426  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| |  |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15728427 ttgatcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcctaatcatttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatat 15728525  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15728526 cattattaggtctcattagcacctaaagtt 15728555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9446253 - 9446033
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||       ||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  9446253 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcattt-caacaacatctagttta 9446155  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | | ||| ||||||||||    
T  9446154 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccggctaacatcttaaata 9446055  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
     || |||||| |||||||||||    
T  9446054 tgtttcattactacctaaagtt 9446033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14216920 - 14217145
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  14216920 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagttcaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 14217016  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  14217017 ttgatcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataactcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttcttagtcaatat 14217115  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  14217116 cattattaggtctcattagcacctacagtt 14217145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2530108 - 2530040
Alignment:
Q  138 caataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2530108 caatatatcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttcccagttaacatcttaaata 2530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39267994 - 39267847
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||         | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  39267994 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccacaacattaaaacttcataatatc-aattca-tttcaacaacatcttgatc 39267897  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  39267896 attcaatactatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 39267847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 16275497 - 16275563
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16275497 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 16275563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18425443 - 18425566
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||||||||    |||| ||    
T  18425443 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataac-aattcattt----caacatc 18425535  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgca 131  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18425536 ttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 18425566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20569690 - 20569474
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  20569690 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcatatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 20569591  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||  | |||| ||| |||||||||||    
T  20569590 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacatgtatcagctaacatcttaaatag 20569491  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  20569490 gtttcattactacctaa 20569474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 35151611 - 35151676
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 66  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35151611 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 35151676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16438985 - 16438909
Alignment:
Q  152 ataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16438985 ataatcacttaacatttcatataagcttcacagttctcagtccatatctttaataggtctcactagcacctaaagtt 16438909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18556978 - 18557199
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  18556978 tcatcaacttatacatagtcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggttcaatagcaaa-tcattctcaatagtttc 18557074  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgc-aatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| ||| | ||||||   |||| |||  |  |||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  18557075 ttgatcatttaacaataattcaagtaaatacaaatcaaatcataattcatttcttaatcacttaacaactcataa-ggcttcacagttctcagataatat 18557173  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  18557174 ctttaataggtctcactagcacctaa 18557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 14152087 - 14152048
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagca 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14152087 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagca 14152048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48593374 - 48593331
Alignment:
Q  185 ttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48593374 ttctcagttaatatcttaaataggtctcagtagtacctaaagtt 48593331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 42205284 - 42205345
Alignment:
Q  167 ttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42205284 ttcataacagcttcacaggtctcagttaacatctcaaataggtcacattactacctaaagtt 42205345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 45170091 - 45169961
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  45170091 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 45169999  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  45169998 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 45169961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 42204017 - 42204139
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  42204017 gactcatgcaacttagttaaacaacaacagcagcataatcagatcacagcagcattataatttcatgacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 42204116  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgca 131  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  42204117 tcaagaataaatcaagtaatgca 42204139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45170339 - 45170268
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagc 177  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  45170339 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataatagc 45170268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 24054474 - 24054523
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24054474 atcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 24054523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211520
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcata 15211520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19649596 - 19649530
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19649596 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaaca 19649530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 17804209 - 17804428
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  17804209 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 17804307  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804308 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 17804407  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17804408 gtctcattagtacctaaagtt 17804428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25767262 - 25767043
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  25767262 cttattcagactcatgcaacttagttaagtaacaatagcagcataatcagatcacaccaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 25767164  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767163 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaattacattataatcacttagcatttcataatagtttcacagttctcagttaatatcttaaatag 25767064  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25767063 gtctcattagtacctaaagtt 25767043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22430131 - 22429920
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22430131 tcatcatcatattcagactcatgcaacttagttaattaactatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaatttc 22430033  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  22430032 ttgatcatttaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataataacttcacagttctcagctaacatct 22429933  T
Q  201 taaataggtctca 213  Q
    |||||||||||||    
T  22429932 taaataggtctca 22429920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 14472292 - 14472501
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14472292 actcatgcaacttagttaat-aacaatagcagcataattagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 14472389  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14472390 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 14472489  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  14472490 gtacctaaagtt 14472501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18955848 - 18955638
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18955848 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcggatcatatcaacaacttaatatcaa-ttcattttcaataacttcttaatcattcaataat 18955750  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18955749 aattcaagtaatgcaatcaatcaatcaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatcttatataggtctcatta 18955650  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  18955649 gtacctaaagtt 18955638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 22862967 - 22863177
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  22862967 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaactttctaatcattcaataat 22863065  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22863066 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatacagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 22863165  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  22863166 gtacctaaagtt 22863177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 19870611 - 19870822
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19870611 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 19870709  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||| || ||    
T  19870710 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatcttaaataggtcacacta 19870809  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  19870810 tgtacctaaagtt 19870822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12706694 - 12706920
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  12706694 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcagcaattt 12706790  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12706791 cttgatcattcaaaaataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcattttatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 12706890  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12706891 ctttaataggtctcattagtacctaaagtt 12706920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 1644726 - 1644918
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1644726 actcatgcaacttagtttaataacaatggcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 1644824  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  1644825 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 1644918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 11566883 - 11567094
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11566883 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 11566981  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  11566982 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 11567081  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  11567082 tgtacctaaagtt 11567094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 23395089 - 23395300
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23395089 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 23395187  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  23395188 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 23395287  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  23395288 tgtacctaaagtt 23395300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 23989941 - 23990152
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23989941 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattaccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 23990039  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  23990040 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 23990139  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  23990140 tgtacctaaagtt 23990152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 8243882 - 8244074
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8243882 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 8243980  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  8243981 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagctccacaattcacaatcattatctttaataggtc 8244074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16741211 - 16741437
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| | ||||||| ||    
T  16741211 tcatcaacttaattcagacacatgcaacttagtttaataacaattgtagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcactgtcaacaattt 16741307  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  16741308 cttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcataaaagcttcacaattctcagtcaatat 16741407  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16741408 ctttaataggtctcactagtacctaaagtt 16741437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18917351 - 18917159
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18917351 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataattatatcatatcaacagcccaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 18917253  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  18917252 aattcaagcaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 18917159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12618929 - 12618719
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  12618929 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttgataccaa-ttcattt-caacaactccctgatcattcaataat 12618832  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  12618831 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacataataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 12618732  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  12618731 tgtacctaaagtt 12618719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 18907133 - 18907349
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18907133 agactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 18907231  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat-cacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||  |  ||||||| ||||||||||    
T  18907232 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatgaacttaacagttcataacagcttcacatattgcagttaacatcttaaata 18907331  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  18907332 ggtcacattactacctaa 18907349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5616915 - 5616689
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  5616915 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaataacaaa-tcattctcagcaacttc 5616819  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcat-aatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||||  ||||    
T  5616818 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaaatcttcaaagttctcagtccatat 5616719  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| | ||||||| ||| | ||||||||||    
T  5616718 ctttagtaggtcttatttgcacctaaagtt 5616689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19662775 - 19662996
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  19662775 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 19662870  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  19662871 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 19662970  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  19662971 ctccaataggtctcactagcacctaa 19662996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 23414651 - 23414820
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  23414651 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 23414746  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  23414747 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 23414820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 27556409 - 27556578
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  27556409 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 27556504  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  27556505 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 27556578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2685419 - 2685194
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  2685419 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 2685324  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | || | |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2685323 cttgatcaatcgacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 2685224  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  2685223 ctctaataggtctcactagcacctagagtt 2685194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19790873 - 19790657
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  19790873 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacatcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 19790774  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19790773 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 19790674  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  19790673 gtttcattactacctaa 19790657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9482393 - 9482168
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  9482393 tcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataagcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaatttc 9482297  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||  |||| | ||||    
T  9482296 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatctataattcatttcataatctcttaacaattcataaaaacttcacagtttacagtcattatc 9482197  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||    
T  9482196 tttaatagttcacattagtacctaaagtt 9482168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27415901 - 27415821
Alignment:
Q  144 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27415901 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagtacctaa 27415821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22592903 - 22592679
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  22592903 tcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgtagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttc 22592807  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||    
T  22592806 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaa-cttcacagttcacagttattatc 22592708  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22592707 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 22592679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20908076 - 20907856
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||||||| |    
T  20908076 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttgatca 20907978  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag-ttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  20907977 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacaattcttaacaacttcccagattct-agttaacatcttaaat 20907879  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  20907878 aggtttcattactacctaaagtt 20907856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12496314 - 12496539
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-atatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||   |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  12496314 tcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcagatcaca---acaggttctataacaaat-cattctcaacaattt 12496409  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  12496410 cttgatcattcaacaatatttcaagtaaaggcaatcaatccatatttcagttcataatctcttaacagttcctaaaagcttcacagttcacagtcattat 12496509  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  12496510 ctttaataggtctcataactacctaaagtt 12496539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27325712 - 27325581
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttc-aacaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        | ||||||| ||||||||||| ||||||     
T  27325712 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcatatcacatcaacagtataacttcataatatc-aattcattttcaaacaaca 27325614  T
Q  99 tcttgattattcaataataattcaagtaatgca 131  Q
     |||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  27325613 acttgatcattccataatatttcaagtaatgca 27325581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16523478 - 16523330
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    || |  ||||    |||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  16523478 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaactttatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcat 16523380  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 158  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16523379 tcaataatatttcaggtaatgcaattaatcattaaatcacattataatca 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1587831 - 1587606
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  1587831 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 1587735  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| |  |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1587734 ttgatcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcctaatcatttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatat 1587636  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1587635 cattattaggtctcattagcacctaaagtt 1587606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20803654 - 20803428
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||||| |||| |||| |  |||    
T  20803654 tcatcaacttattcatattcatgcagcttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcag--gttaaataacaaat-cattctcaatagtttc 20803558  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaat--caatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||    ||  ||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20803557 ttgatcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataaaagcttcacagttctaagtcaatat 20803458  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20803457 cattattaggtctcattagcacctaaagtt 20803428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21834903 - 21834782
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||| |    
T  21834903 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatacatttaatcattaaatcacattataatcaacttagcagtt--aaacagcttcacagat 21834806  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  21834805 ttcagttaacatcttaaataggtc 21834782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 18180517 - 18180734
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca----gcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||     ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||| || |||    
T  18180517 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttaatcatt 18180615  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | ||||| || || | || ||| | |||| | |||||||| |||||||||| |    
T  18180616 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttaacagttga-aacagccttacagatttcagttaacatcttaaatatg 18180714  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| | || |||||||||||    
T  18180715 tcttactactacctaaagtt 18180734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27416287 - 27416124
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||       ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  27416287 tcatcaacatattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca-atca-------agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 27416198  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  27416197 ttgatcattcattaatatttagagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 27416124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 1644293 - 1644359
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1644293 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 1644359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 31478331 - 31478265
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31478331 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 31478265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 16624137 - 16624283
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  | ||||||| | |||||||||    |||| ||    
T  16624137 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--aacttaataac-aattcattt----caacatc 16624229  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16624230 ttgatcattcaataatacttcaagtaatgcatttaatcattaattcacaatata 16624283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766839
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcat 21766816  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgca 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21766817 tcaataatatttcaagtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15894413 - 15894310
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |   |||||| ||| || ||||||| |||||     
T  15894413 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagattgtagttaacatcctatataggtcacattac 15894314  T
Q  218 tacc 221  Q
    ||||    
T  15894313 tacc 15894310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31478168 - 31478076
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31478168 aattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 31478076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19848102 - 19848034
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  19848102 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 19848034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23657513 - 23657295
Alignment:
Q  18 ctcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaa-cttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       |||||||||||||||| | |   | |||||    
T  23657513 ctcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacagcagcattataatttcatcagaacaattcattttcaacaatcattaaggttatt 23657414  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
    ||| ||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||   |||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||| | |||| |    
T  23657413 caagaataaatcaagtaatgcatttaatctttaaatcacattacaacagcttaacatatcataacagcctcacagatctcagttaacatctcacatagat 23657314  T
Q  210 ctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |  |||| |||||||||||    
T  23657313 catattactacctaaagtt 23657295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 21702293 - 21702359
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  21702293 tcatcaacttattcataatcatgcaacttaattaaataacaattgcagcaaaatcaaatcacatcaa 21702359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21740006 - 21739900
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |  || |||| ||| || ||||||| |||||     
T  21740006 ttcaagtaatgcaattaatcattaagtcacattataaccagcttaacatttcataacagcttcacagattgcaattaacatcctatataggtcacattac 21739907  T
Q  218 tacctaa 224  Q
    |||||||    
T  21739906 tacctaa 21739900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27553666 - 27553612
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27553666 agactcatgcaacttagttaaagaacaacagcagcataatcagatcacaacaaca 27553612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31477895 - 31477765
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  31477895 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 31477803  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  31477802 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 31477765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15041645 - 15041589
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  15041645 agactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagc 15041589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 23992441 - 23992509
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23992441 atcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 23992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27567704 - 27567488
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  27567704 agactcatacaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaaaaacatcgtaatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagttta 27567606  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||  |||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| | || | | | ||||||||||    
T  27567605 ttcaagcataaatcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagatttcggctgacatcttaaata 27567506  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||| || |||||||    
T  27567505 ggtttcagtactacctaa 27567488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 173
Target Start/End: Original strand, 1644462 - 1644548
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  1644462 tttcaacaacatcttgatcattcaaaaatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 1644548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15894533 - 15894479
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15894533 agactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 15894479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22408398 - 22408183
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agcttaatatcaa--attcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||     | ||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||| ||| |    
T  22408398 agactcgtgcaacttggttaaataacaaaagcagtataatcagatcacaacaactttataacttcataacaacaattcattt-caacaacatctagatca 22408300  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||  |||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  22408299 ttcaagaatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagtctcacagatttcaattaacatcttaaata 22408201  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
     |||| | || |||||||    
T  22408200 agtcttactactacctaa 22408183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16523330 - 16523281
Alignment:
Q  175 agcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16523330 agcttcacagatctcagttaacatcttaaataggtcacattactacctaa 16523281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 16760316 - 16760446
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  16760316 actcgtgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 16760408  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16760409 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 16760446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 22432259 - 22432308
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22432259 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 22432308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 22438809 - 22438858
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22438809 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 22438858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 22949129 - 22949259
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||   ||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  22949129 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattta--tttcaaca---tcttgatcattcaataat 22949221  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  22949222 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 22949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 22953085 - 22953215
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||   ||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  22953085 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattta--tttcaaca---tcttgatcattcaataat 22953177  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  22953178 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 22953215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 23871573 - 23871703
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||   ||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  23871573 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattta--tttcaaca---tcttgatcattcaataat 23871665  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  23871666 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 23871703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 23875529 - 23875659
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||   ||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  23875529 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattta--tttcaaca---tcttgatcattcaataat 23875621  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  23875622 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 23875659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 16760068 - 16760135
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  16760068 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 16760135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 70
Target Start/End: Original strand, 19873130 - 19873197
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag 70  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  19873130 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacag 19873197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 22948881 - 22948948
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22948881 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 22948948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 22952837 - 22952904
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22952837 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 22952904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 23871325 - 23871392
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  23871325 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 23871392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 23875281 - 23875348
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  23875281 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 23875348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25135772 - 25135706
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  25135772 tcatcaacttattcataatcatgcaactcaattaaataacatttgcagcattatcaaatcacatcaa 25135706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 19862988 - 19863037
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19862988 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 19863037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22074227 - 22074174
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaat 141  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22074227 tttcagcaacattttgattattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaat 22074174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25603478 - 25603425
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  25603478 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaaca 25603425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25611816 - 25611763
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  25611816 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaaca 25611763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25642196 - 25642064
Alignment:
Q  91 caacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttct 188  Q
    ||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||   ||| ||| |||||| | ||||| || |      
T  25642196 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaacatctcataacaacttcaaagattg 25642097  T
Q  189 cagttaatatcttaaataggtctcattagtacc 221  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  25642096 cagttaacttcttatataggtctcattactacc 25642064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16929683 - 16929647
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16929683 gactcatgcaacttggttaattaacagtagcagcata 16929647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16965403 - 16965367
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16965403 gactcatgcaacttggttaattaacagtagcagcata 16965367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15482668 - 15482890
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15482668 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaatttc 15482766  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482767 ttgagcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 15482866  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15482867 taaataggtctcattagtacctaa 15482890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20461594 - 20461375
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20461594 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 20461496  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461495 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 20461396  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20461395 gtctcattagtacctaaagtt 20461375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7793444 - 7793224
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataat-cagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  7793444 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataattcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatc 7793346  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793345 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaacaaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 7793246  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7793245 ggtctcattagtacctaaagtt 7793224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 327259 - 327043
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa-tcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  327259 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataactaagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaatttcttgatc 327161  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327160 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 327061  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  327060 ggtctcattagtacctaa 327043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2897917 - 2897698
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |    
T  2897917 cttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattt-attttcatcaacttcttgatca 2897819  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  2897818 ttcaataataattccagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttaacagttaacatcttaaatag 2897719  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||| || |||||||||||    
T  2897718 gcctcactattacctaaagtt 2897698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31097656 - 31097429
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  31097656 tcatcaacttattcagactcatgcaacatagttaattaacaattgcagcataatcagatcacatcaatagcttaataac-aattcattttcaacaatttc 31097558  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatt-tcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31097557 ttgatcattcaacaataattcaagtagtggaatcaatcaatatatcacaacataatcacttagcattctcataaaagcttcacagttctcagttaatatc 31097458  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31097457 ttaaataggtctcagtagtacctaaagtt 31097429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 30065970 - 30066180
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  30065970 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 30066068  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30066069 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 30066168  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  30066169 gtacctaaagtt 30066180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 11854757 - 11854967
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11854757 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacaacttaacatcaa-ttcattttcaataacttcttgatcattcaataat 11854855  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11854856 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatcttagataggtctcatta 11854955  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  11854956 gtacctaaagtt 11854967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 11070092 - 11070302
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  11070092 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaagaat 11070190  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11070191 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcgatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 11070290  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  11070291 gtacctaaagtt 11070302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11165614 - 11165404
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  11165614 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 11165516  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11165515 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttggcatttcaatatagtttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 11165416  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  11165415 gtacctaaagtt 11165404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 55022891 - 55023101
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  55022891 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagtataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 55022989  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  55022990 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 55023089  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||    
T  55023090 gtatctaaagtt 55023101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 15617398 - 15617609
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  15617398 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaagttcctgatcattcaataat 15617496  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  15617497 aattcaagtaatgtaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 15617596  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  15617597 tgtacctaaagtt 15617609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 14499349 - 14499559
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  14499349 actcatgcaacttagttaaataacaataaccgcataatcagatcttatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 14499447  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14499448 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacaattagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 14499547  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
     |||||||||||    
T  14499548 ctacctaaagtt 14499559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 7109722 - 7109933
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7109722 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 7109820  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  7109821 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 7109920  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  7109921 tgtacctaaagtt 7109933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 7113657 - 7113868
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7113657 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 7113755  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  7113756 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 7113855  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  7113856 tgtacctaaagtt 7113868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15850183 - 15849960
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||| |||||||||| ||| |||    
T  15850183 tcatcaacttattcagtctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcagatcatatcaa--gtttaataacaa-ttcattttca-caatttc 15850088  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||    
T  15850087 ttgatcattcaacaataattcaagttatgcaatcaatccatatatcacaatataatcatttagcatttcataaaagcttcaccgatctcattaaatatct 15849988  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15849987 taaataggtctcattagtacctaaagtt 15849960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 22336743 - 22336954
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22336743 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 22336841  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  22336842 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 22336941  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  22336942 tgtacctaaagtt 22336954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27409729 - 27409518
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27409729 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 27409631  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  27409630 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 27409531  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  27409530 tgtacctaaagtt 27409518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 28949748 - 28949959
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28949748 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 28949846  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  28949847 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 28949946  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  28949947 tgtacctaaagtt 28949959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 22321688 - 22321899
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22321688 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaatagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 22321786  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  22321787 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 22321886  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  22321887 tgtacctaaagtt 22321899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11300533 - 11300386
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttc 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  11300533 aattcattttcaataacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttt 11300434  T
Q  181 acagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11300433 acaattaacagttaacatcttagataggtctcattagtacctaaagtt 11300386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16798154 - 16797929
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  16798154 tcatcaacttattcatactcatgcaacatagtttaataacaagtgcaacataatcaaatcacatcaaa--cttaataacaaat-cattttcaacaatttc 16798058  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  16798057 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcgtaaaagcttcacaattctcagtcaatatc 16797958  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||    
T  16797957 tttaataggttccattagtacctatagtt 16797929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16808981 - 16808756
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  16808981 tcatcaacttattcatactcatgcaatatagtttaataacaagtgcaacataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-catttgcaacaatttc 16808885  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  16808884 ttgaccattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcgtaaaagcttcacaattctcagtcaatatc 16808785  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||    
T  16808784 tttaataggttccattagtacctatagtt 16808756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18384010 - 18383795
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |  ||||    ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  18384010 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattcattt-catcaacatcttgatcat 18383912  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  18383911 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattaaaatcagcttaacagttcataacagcttcactgatctcagttaacatcttaaatag 18383812  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  18383811 gtcacattactacctaa 18383795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3403050 - 3402830
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  3403050 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcatgacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 3402951  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3402950 tcaagaataaatcaaggaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataatagcttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 3402851  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  3402850 gtcacattactacctaaagtt 3402830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19726004 - 19725790
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt-------aatatcaaattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  19726004 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgactcataatatcaa-ttcattt-caacaacatcttgatcat 19725907  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  || ||||||| | |||||| | ||||||||| |    
T  19725906 tcaataatatttcaagtaatgtaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagtttcacagatttcagttgacatcttaaatgg 19725807  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  19725806 gtcacattactacctaa 19725790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 322614 - 322829
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |   || |  ||||    ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  322614 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcggcataatcagatcacaacaatattatacttcatcatatcaattcattt-catcaacatcttgatcat 322712  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  322713 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacacttcataacagcttcacagatcttagttaacatcttaaatag 322812  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  322813 gtcacattactacctaa 322829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17241978 - 17242203
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  17241978 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 17242073  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17242074 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 17242173  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17242174 ctctaataggtctcactagcacctaaagtt 17242203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3390030 - 3389810
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | || |    
T  3390030 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcatgacaacaattcattttcaacaacatcaaggtttt 3389931  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3389930 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 3389831  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  3389830 gtcacattactacctaaagtt 3389810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 12496280 - 12496495
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||        ||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  12496280 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcattt-ctacaacatcttgatca 12496378  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  12496379 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaata 12496477  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  12496478 ggtcacattactacctaa 12496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 5223070 - 5223239
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  5223070 tcatcaacttattcatactcatacaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 5223165  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  5223166 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 5223239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11298621 - 11298407
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  11298621 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatcat 11298523  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  11298522 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacaaatttcagttaatatcttaaatag 11298424  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  11298423 gtcacattactacctaa 11298407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 15464871 - 15465040
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  15464871 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 15464966  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  15464967 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttcataa 15465040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 11862815 - 11863031
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcac------atca--acagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      || |  ||  | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |     
T  11862815 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcaccaaaatattataacttcataatatcaa-ttcattt-caacaacatcttggtc 11862912  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||  |||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  11862913 attcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataatcagcttaacagttcatagcagcttcacagatttcaaataacatcttaaat 11863012  T
Q  206 aggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  11863013 aggtcacattaatacctaa 11863031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11595233 - 11595017
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  11595233 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 11595134  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11595133 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 11595034  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  11595033 gtttcattactacctaa 11595017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 12339472 - 12339641
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||  || |||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  12339472 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattctcatca--agtttaataac-aattca-tttcaacaacatc 12339567  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  12339568 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 12339641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1982905 - 1982689
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----cttaatatcaa--attcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||      ||| ||| |||  |||||||||||||||| | | | | |    
T  1982905 agactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacactataacttcataacaacaattcattttcaacaacatataggtca 1982806  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||  |  ||||||| ||||||| |||    
T  1982805 ttcaaaaatagttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaataacttaacagttcataacaacttcacatattgcagttaacatcttaattag 1982706  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  1982705 gtcacattactacctaa 1982689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 14665423 - 14665570
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ctt---aatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||   |||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14665423 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataatcagatcacatcaacagtataactttaaaatatc-aattca-tttcaacaacatcttgatc 14665520  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  14665521 attcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 14665570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 14668579 - 14668726
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ct---taatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||   ||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14668579 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatc-aattca-tttcaacaacatcttgatc 14668676  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||    
T  14668677 attcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcatattataat 14668726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 38814409 - 38814615
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  38814409 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 38814505  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||| | |||||| || |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  38814506 tcaagtaaaggcaatcattccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcgcattagt 38814605  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  38814606 acctaaagtt 38814615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8489571 - 8489459
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  8489571 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 8489476  T
Q  101 ttgattattcaataata 117  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8489475 ttgatcattcaataata 8489459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12038044 - 12037871
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  12038044 actcatgcaacttagttaaataacaa-agcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattcattt-caacaacatcttgatcatt 12037947  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  12037946 caataatatctcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcaaaatggtttcacag 12037871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 11851603 - 11851810
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||         | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |     
T  11851603 agactcatgcaacttagttaaataacgatagtagcataattagatcacaacaacattataacttcataatatcaa-ttcattt-caacaacatcttgttc 11851700  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||  |||||||||  | |||| ||| |||||||||    
T  11851701 attcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataatcagcttaacagttcatagcagcttcacaaatttcagataacatcttaaat 11851800  T
Q  206 aggtctcatt 215  Q
    ||||| ||||    
T  11851801 aggtcacatt 11851810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11300866 - 11300696
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||||| |||||||||| |    
T  11300866 tcatcaacttatttcagactcatgcaacttagttaaataacaattgtagcataatcaaatcacat-aac-gtttaataac-aattca-tttcaacaacat 11300771  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| || | |||||||| |||||||    
T  11300770 cttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcaaattacaaacaacttagcagttcataa 11300696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3833680 - 3833905
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| | |||| ||||||| | |    
T  3833680 tcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaagt-cattctcaacaattgc 3833776  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |  |||    
T  3833777 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcatcatc 3833876  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3833877 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 3833905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 42325964 - 42326180
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  42325964 gactcatgcaacttagttaaaaaacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 42326063  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | | ||| || ||| ||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  42326064 tcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaagttaacagttcttaacaacttcacaagtctcagttaacatcttaaatag 42326163  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  42326164 gtttcattactacctaa 42326180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11557477 - 11557259
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       ||||||||| || |||| |||   |||||    
T  11557477 actcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcattt-catcaacatctaatttatt 11557379  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  ||| ||| | ||||||||||    
T  11557378 caagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccagctaacaccttaaatagg 11557279  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  11557278 tttcattactacctaaagtt 11557259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16750689 - 16750543
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||||||||    |||| ||    
T  16750689 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataac-aattcattt----caacatc 16750597  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16750596 ttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 16750543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 11854427 - 11854545
Alignment:
Q  5 caacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| |||| |    
T  11854427 caacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcggcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatcttaa 11854522  T
Q  105 ttattcaataataattcaagtaa 127  Q
    |  |||||||||| ||| |||||    
T  11854523 tctttcaataatatttcgagtaa 11854545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4589294 - 4589228
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4589294 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 4589228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 12172818 - 12172872
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12172818 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaaca 12172872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 19775353 - 19775419
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19775353 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 19775419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 12172938 - 12173004
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  12172938 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcacag 12173004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 16696791 - 16696857
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  16696791 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataaacaaatcacatcaa 16696857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 15060427 - 15060532
Alignment:
Q  120 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||| || || |    
T  15060427 tcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaccatcttatataggtcacaatact 15060526  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  15060527 acctaa 15060532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26190947 - 26190883
Alignment:
Q  164 catttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26190947 catttcaaaataggttcacaattttcagttaacatcttaaataggtctcattactacctaaagtt 26190883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4589125 - 4589039
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4589125 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 4589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23053182 - 23053128
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23053182 agactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 23053128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 46822279 - 46822345
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  46822279 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaaca 46822345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4111334 - 4111204
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  4111334 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 4111242  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4111241 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 4111204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 12511084 - 12511137
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  12511084 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaaca 12511137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Original strand, 15051655 - 15051756
Alignment:
Q  124 gtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacct 222  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||| || || |||||    
T  15051655 gtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacaaattgcagttaacatcttatataggtcacaatactacct 15051754  T
Q  223 aa 224  Q
    ||    
T  15051755 aa 15051756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 15964993 - 15965123
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  15964993 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 15965085  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15965086 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15965123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 15968917 - 15969047
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  15968917 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 15969009  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15969010 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15969047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 15972841 - 15972971
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  15972841 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 15972933  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15972934 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15972971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 16909885 - 16909990
Alignment:
Q  120 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| ||||| |    
T  16909885 tcaagtaataaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacaattcataaaagcttcacagattgcagttaacatcttgtataggtcacattact 16909984  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  16909985 acctaa 16909990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Original strand, 19775516 - 19775608
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  19775516 aattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 19775608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 19775789 - 19775919
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  19775789 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 19775881  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  19775882 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 19775919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4107482 - 4107352
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  4107482 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 4107390  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4107389 atttcaactaatgcatttaatcattaattcacagtata 4107352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23053061 - 23052996
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcaca 183  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  23053061 ttcaagtaatgcaattaataattaaatcacattataaacaacttaaaatttcataatagcttcaca 23052996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37439721 - 37439591
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  37439721 actcatgcaacttagtttaacaacaattgtagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 37439629  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  37439628 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 37439591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 14878610 - 14878574
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14878610 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 14878574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 23408438 - 23408506
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  23408438 atcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaacatagacagattacaacaacagc 23408506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15941985 - 15941938
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  15941985 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa 15941938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 15964745 - 15964812
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15964745 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 15964812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 15968669 - 15968736
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15968669 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 15968736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 15972593 - 15972660
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15972593 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 15972660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 30029867 - 30029922
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  30029867 gactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagc 30029922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15878158 - 15878092
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  15878158 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 15878092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 15051531 - 15051584
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  15051531 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagttcacaacaaca 15051584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 15060307 - 15060360
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  15060307 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagttcacaacaaca 15060360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 16369423 - 16369476
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  16369423 gactcatgcaacttggttaagtaacaatagcagcataggcagttcacaacaaca 16369476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 16369543 - 16369648
Alignment:
Q  120 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  |   |||||| |||||| |||| || ||||| |    
T  16369543 tcaagtaatgaaattaatgattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcacatattggagttaacatcttatatagatcacattact 16369642  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  16369643 acctaa 16369648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 16909765 - 16909818
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  16909765 gactcatgcaacttggttaaataacaatagtagcataagcagttcacaacaaca 16909818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17525252 - 17525216
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17525252 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcata 17525216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 24735415 - 24735634
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  24735415 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 24735513  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735514 ttcaataataattcaagtaatgcgatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 24735613  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24735614 gtctcattagtacctaaagtt 24735634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10101730 - 10101520
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10101730 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 10101632  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10101631 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 10101532  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  10101531 gtacctaaagtt 10101520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19688778 - 19688631
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttc 180  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688778 aattcatcttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttc 19688679  T
Q  181 acagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688678 acagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 19688631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 24649378 - 24649570
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  24649378 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 24649476  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  24649477 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 24649570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12901597 - 12901386
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  12901597 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcggatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 12901499  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  12901498 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 12901399  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  12901398 tgtacctaaagtt 12901386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27379518 - 27379307
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27379518 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 27379420  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  27379419 aattaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 27379320  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  27379319 tgtacctaaagtt 27379307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27383564 - 27383353
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27383564 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 27383466  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  27383465 aattaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 27383366  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  27383365 tgtacctaaagtt 27383353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 27601817 - 27602028
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27601817 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 27601915  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  27601916 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 27602015  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  27602016 tgtacctaaagtt 27602028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24628564 - 24628353
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24628564 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatattaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 24628466  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  24628465 aattcaagcaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 24628366  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  24628365 tgtacctaaagtt 24628353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41531089 - 41530884
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  41531089 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 41530997  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  41530996 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 41530897  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  41530896 tgtacctaaagtt 41530884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22461289 - 22461068
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  22461289 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 22461194  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22461193 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 22461094  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  22461093 ctccaataggtctcactagcacctaa 22461068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25963809 - 25963595
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  25963809 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatcat 25963711  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  25963710 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcaattaacatcttaaatag 25963612  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  25963611 gtcacattactacctaa 25963595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Original strand, 15477713 - 15477835
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||    
T  15477713 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaata 15477812  T
Q  207 ggtctcatta-gtacctaaagtt 228  Q
    |||| || || ||||||||||||    
T  15477813 ggtcacactatgtacctaaagtt 15477835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22812006 - 22811787
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  22812006 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcaaatcacaacaacattataacttcatcatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 22811908  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaa-tcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||  |||||||||| | ||| |||| |||||||||    
T  22811907 ttcaataatacttcaggtaatgcaatttaatcattaaatcacattataatcaacttaatagttcatagcagcttcacagatttcacttaacatcttaaat 22811808  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaag 226  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  22811807 aggtcacattactacctaaag 22811787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 31344883 - 31345052
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  31344883 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataataattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 31344978  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31344979 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcatgaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 31345052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25961628 - 25961413
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----cttaatatcaa--attcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||      ||| ||| |||  |||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  25961628 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataacaacaattcattttcaacaacatctagatcat 25961529  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  ||||| || ||||||| |  ||||||  |  ||| ||| ||||||||||||    
T  25961528 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaacaacttaacagttcataacaaattcacatattgcagctaacatcttaaatagg 25961429  T
Q  209 tctcattagtacctaa 224  Q
    | |||||| |||||||    
T  25961428 tttcattactacctaa 25961413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19928583 - 19928377
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  19928583 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 19928487  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||| ||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| | || || ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  19928486 tcaaataaagacaatcaatccatatttcatttcataatctcctaacaattcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 19928387  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  19928386 acctaaagtt 19928377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23187081 - 23187302
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||   | ||||    ||| ||||| |||| |  |||    
T  23187081 tcatcaacttattcatactcatggaacttggtttaataacaattgcagcataatcaaatcatatca---ggttaaataaaaaatcattctcaatagtttc 23187177  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||| | || |||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| | ||||    
T  23187178 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaattaatccacaattcacttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttcacagtcattatc 23187277  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  23187278 tttaataggtctcattagtacctaa 23187302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23598344 - 23598565
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||   | ||||    ||| ||||| |||| |  |||    
T  23598344 tcatcaacttattcatactcatggaacttggtttaataacaattgcagcataatcaaatcatatca---ggttaaataaaaaatcattctcaatagtttc 23598440  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||| | || |||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| | ||||    
T  23598441 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaattaatccacaattcacttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttcacagtcattatc 23598540  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  23598541 tttaataggtctcattagtacctaa 23598565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 40428486 - 40428699
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |   |||  |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  40428486 gactcatgcaacttagttcaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaatattataacttcataataacaattcattttcaacaacatcaaggttat 40428585  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    | || ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40428586 ttaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaatag 40428685  T
Q  208 gtctcattagtacc 221  Q
    ||| ||||| ||||    
T  40428686 gtcacattactacc 40428699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21327662 - 21327441
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------aattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||  |||        ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  21327662 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacagcagcagcataacttcataattatcaattcattt-ctacaacatcttgatt 21327564  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||  | ||||||| ||||||||||   ||| |||| || ||||||    
T  21327563 attcaacaatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataaacagcttaatagttcataacagcttcacagaattcacttaacattttaaat 21327464  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||||| || ||| |||||||    
T  21327463 atgtctcactactacttaaagtt 21327441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 24174822 - 24175038
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  24174822 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagttta 24174920  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | | ||| ||||||||||    
T  24174921 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccggctaacatcttaaata 24175020  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  24175021 ggtttcattactacctaa 24175038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24716622 - 24716405
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag----cttaatatcaa--attcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||     ||| ||| |||  |||||||| ||||||| || | || |||    
T  24716622 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattcattt-caacaacatcataatcatt 24716524  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    ||||||||  || ||||||||| | ||||  |||||||||||| || || ||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24716523 caataatatgtctagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacaggtttcagttaacatcttaaatagg 24716425  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  24716424 tctcactactacctaaagtt 24716405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18855541 - 18855336
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| | | || ||||||    
T  18855541 catgcaacttagttaaacaacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataat 18855446  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||| | |||||| |  |||  |||  | ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||     
T  18855445 tcaagtaaaggcaatcacttcatatttcatttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctctaataggtctcactagc 18855346  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  18855345 acctaaagtt 18855336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21318731 - 21318510
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------aattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||  |||        ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  21318731 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataattatcaattcattt-ctacaacatcttgatt 21318633  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||  | ||||||  |||||||||    ||| |||| |||||||||    
T  21318632 attcaacaatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataaacagcttaatagttcatagcagcttcacataattcacttaacatcttaaat 21318533  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||||| || ||| |||||||    
T  21318532 atgtctcactactacttaaagtt 21318510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24655433 - 24655217
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||       ||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  24655433 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcattt-caacaacatctagttta 24655335  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | | ||| ||||||||||    
T  24655334 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccggctaacatcttaaata 24655235  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  24655234 ggtttcattactacctaa 24655217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 37524697 - 37524905
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     | ||| ||| ||  |||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  37524697 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacatcaacattgtaacttcataacaacaattca-tttcaataacatcttgatca 37524795  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| | || || ||||||  ||||||||||   ||| |||| ||||| ||||    
T  37524796 ttcaataatatttcaagtaatgcaat-------taaatcacattataatcagcctaacagttcatagcagcttcacagacttcaattaacatctt-aata 37524887  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  37524888 ggtcacattactacctaa 37524905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 41666955 - 41667078
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  41666955 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 41667051  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa 127  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||    
T  41667052 ttgatcattcaacaacaattcaagtaa 41667078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 24673711 - 24673809
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||||| |||||    
T  24673711 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacagtataatcagcttaacatttcataatagcttcacagatcgcaattaacatcctatataggtcacatta 24673809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27263278 - 27263504
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  27263278 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 27263374  T
Q  101 ttgattattcaataat-aattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || | | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27263375 ttgatcattcaacaataaattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcataatcatttaacaatccgtaa-agcttcacagttctcagtcaata 27263473  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27263474 tcattattaggtctcattagcacctaaagtt 27263504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 60826 - 61046
Alignment:
Q  5 caacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttga 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||||||    
T  60826 caacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatca-atcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagtttcttga 60921  T
Q  105 ttattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatctta 202  Q
    | |||||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |     
T  60922 tcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcataatcatttgacaattcataa-agcttcacagttctcggtcaatatcatt 61020  T
Q  203 aataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  61021 attaggtctcattagcacctaaagtt 61046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21916193 - 21916069
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||| |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  21916193 agactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaacataatcagatcacaacaaaagcataaattcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 21916095  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaat 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  21916094 ttcaataatatttcaagtaatgcaat 21916069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 24869902 - 24870118
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||  |||       |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  24869902 agactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaaaatcataaattcataacaacaattca-tttcaacaacatctagttta 24870000  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | | ||||  |||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | | |||||| |  | | ||| ||||||||||    
T  24870001 ttcaagaataattcgagtaatgtatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttcttaacaacctcacagattccggctaacatcttaaata 24870100  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  24870101 ggtttcattactacctaa 24870118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21918284 - 21918194
Alignment:
Q  135 aatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21918284 aatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacagatttcagttaacatcttaaataggtcacattactacctaa 21918194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22799220 - 22799167
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  22799220 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 22799167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30345076 - 30344946
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  30345076 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 30344984  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  30344983 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 30344946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 25616199 - 25616267
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25616199 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 25616267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 1283410 - 1283540
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  1283410 actcatgcaacttagattaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 1283502  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  1283503 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 1283540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22758704 - 22758596
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||   ||| ||| |||||| ||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||    
T  22758704 ataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaacatctcataacagcttcatagattgcagttaatttcttatataggtctc 22758605  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  22758604 attactacc 22758596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22740973 - 22740841
Alignment:
Q  91 caacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttct 188  Q
    ||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||   ||| ||| |||||| | ||||| || |      
T  22740973 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaacatctcataacaacttcaaagattg 22740874  T
Q  189 cagttaatatcttaaataggtctcattagtacc 221  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22740873 cagttaacttcttatataggtctcattactacc 22740841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23019800 - 23019747
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  23019800 gactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 23019747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 24673590 - 24673639
Alignment:
Q  14 cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 63  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  24673590 cagactcatgcaacatggttaaataacaatagcagcacaagcagatcaca 24673639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 26125214 - 26125255
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaa 42  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26125214 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaa 26125255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12909 - 13135
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  12909 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaataggagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaatttc 13007  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13008 ttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctccacagttctcagttaatatct 13107  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13108 taaataggtctcattagtacctaaagtt 13135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19193 - 19419
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  19193 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaataggagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaatttc 19291  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19292 ttgatcattcaataataattaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctccacagttctcagttaatatct 19391  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19392 taaatatatctcattagtaccgaaagtt 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 62266 - 62331
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 66  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  62266 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 62331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36819410 - 36819183
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819410 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaccagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 36819311  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36819310 ttgatcattcaataataattcaagaaatgcaatcaataaataaatcacaatataatcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcatttaatatct 36819211  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819210 taaataggtctcattagtacctaaagtt 36819183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16080545 - 16080319
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16080545 tcatcatcatattcagactcatgcaacttagttaattaaaaatagcagcataatcagatcacatcaataacttattatcaa-ttcattttcaacaacttc 16080447  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16080446 ttgatcatccaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataaaagcttcacagttctcagttaatctct 16080347  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080346 taaataggtctcattagtacctaaagtt 16080319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24783199 - 24782990
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttctt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24783199 atcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatgaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttctt 24783101  T
Q  103 gattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatctta 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  24783100 gatcattcaataataattcaagtaatgcaattaattaataaatcacattataatcacttagcatttcataacagcttcacaattttcagttaacatctta 24783001  T
Q  203 aataggtctca 213  Q
    | |||||||||    
T  24783000 agtaggtctca 24782990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 1010744 - 1010954
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  1010744 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 1010842  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1010843 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 1010942  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  1010943 gtacctaaagtt 1010954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20228894 - 20228683
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20228894 actcatgcaacttagtttaataacaatggcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 20228796  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  20228795 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 20228696  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  20228695 tgtacctaaagtt 20228683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16375543 - 16375332
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16375543 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 16375445  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  16375444 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 16375345  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  16375344 tgtacctaaagtt 16375332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 21407376 - 21407587
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21407376 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 21407474  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  21407475 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 21407574  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  21407575 tgtacctaaagtt 21407587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19211872 - 19212098
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  19211872 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaa-ttcattctcaacaattt 19211968  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19211969 cttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 19212068  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19212069 cttttataggtctcattagtacctaaagtt 19212098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 52639562 - 52639773
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52639562 actcatgtaacttagttaaataacaataacagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 52639660  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  52639661 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 52639760  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  52639761 tgtacctaaagtt 52639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23819383 - 23819178
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23819383 actcatgcaacttcgtttaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcagcaatttcttgatcattcaataat 23819287  T
Q  117 aattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatt 215  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23819286 aattcaagtaaagacaatcaatccataaatcactttatattcacttaacatctcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtctcatt 23819187  T
Q  216 agtacctaa 224  Q
    || ||||||    
T  23819186 agcacctaa 23819178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18182215 - 18181999
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||       |||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  18182215 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatttattt-caacaacatcttgatca 18182117  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| | |    
T  18182116 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattgaatcacattataaacaacttagcatctcataacagcttcacagtttgcagttaacttcttataca 18182017  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  18182016 agtcacattactacctaa 18181999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22449360 - 22449144
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-aat-tca----ttttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||    ||||||||||| ||||||| ||    
T  22449360 agactcatgcaacttagttaaataatagtagcagcataatcagatcacaacaagagcataatttcataatatcaatacttttcaacaacatcttgatcat 22449261  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| |||     
T  22449260 tcaataatatttcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatatat 22449161  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  22449160 gtcacattactacctaa 22449144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20138088 - 20138314
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| ||    
T  20138088 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaattt 20138184  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaag-taatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||  |||||| |||||||||||  || |||| ||||| |||  |||  | | |||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  20138185 cttgaacattcaacaataattcaagcaaaggcaaccaatccatatttcatttcaaaatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagttattat 20138284  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20138285 ctttaataggtctcattagtacctaaagtt 20138314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12646876 - 12647097
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  12646876 tcatcaacttatttcagattcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 12646971  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12646972 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 12647071  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  12647072 ctccaataggtctcactagcacctaa 12647097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 33797288 - 33797457
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  33797288 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 33797383  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  33797384 ttgatcattcaataatatttcgattaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 33797457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18394059 - 18393838
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   ||||        | ||| || |||||||||||||||  | |||    
T  18394059 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataattccataacaacaattttattttcaacaacttcaaggtta 18393960  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18393959 ttcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 18393860  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  18393859 ggtcacattactacctaaagtt 18393838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 33797626 - 33797760
Alignment:
Q  89 ttcaacaacttcttgattattcaataataattc--aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33797626 ttcaacaacatcttgaatattcaa--ataattcttaagtaatgca-taaaacattatatcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagtt 33797722  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797723 ctcagttaacatcttaaataggtctcattagtacctaa 33797760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45310462 - 45310241
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||   ||||        | ||| ||||||||||||||||||  | |||    
T  45310462 gactcatgcaacttagttaaataacgacagcagcataatcagatcacaacagcattataattccataacaacaatttcattttcaacaacttcaaggtta 45310363  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45310362 ttcaagaataaatcaagcaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 45310263  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  45310262 ggccacattactacctaaagtt 45310241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8761648 - 8761507
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  8761648 tttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataattagcttaatagttcataacagcttcacagat 8761549  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
     ||| |||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  8761548 ttcatttaacatcttatataggtttcactactacctaaagtt 8761507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 18882393 - 18882598
Alignment:
Q  21 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataatt 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  18882393 atgcaacttagttaaataacattttcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattatcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 18882489  T
Q  121 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagta 219  Q
    ||||| || ||||| | || |||  ||   | |||||| |||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  18882490 caagtaaaggcaattattccatatttcttttcataatctcttaacaattcataaaggcttcacaattctcagttaatatctctaataggtctcactagca 18882589  T
Q  220 cctaaagtt 228  Q
    |||||||||    
T  18882590 cctaaagtt 18882598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3473017 - 3472804
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcac------atcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      || |||  | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||    
T  3473017 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaagagtattaacttcataatatcaaa-tca-cttcaacaacatcttgatcat 3472920  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag-ttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||| |||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| ||||    
T  3472919 tcaacaatatttcaagtaattcatttaatcattaaatcacatttcaaacaacttagcatttcataacagcttcacagattccca-ttaacatctt-aata 3472822  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  3472821 ggtcacattactacctaa 3472804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45489837 - 45489621
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  45489837 gactcatgcaacttagttaaataatagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 45489738  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || || |||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45489737 tcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 45489638  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  45489637 gtttcattactacctaa 45489621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 46975473 - 46975698
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  46975473 tcatcagcttattcatagacgtgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttc 46975569  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| ||  |||||| | ||||| ||||| |||| | ||||    
T  46975570 ttgatcattcaacaataattcaagtaaagacaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacaggtcataaaaacttcatagttcacagtcattatc 46975669  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  46975670 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 46975698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Original strand, 21022767 - 21022879
Alignment:
Q  113 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtct 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||     
T  21022767 taatatttcaagtaatgcaattaatcattaattcacattataatcagcttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtca 21022866  T
Q  212 cattagtacctaa 224  Q
    ||||| |||||||    
T  21022867 cattactacctaa 21022879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3705159 - 3704939
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||       |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  3705159 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcaaaatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagttta 3705061  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||  | ||| ||| | |||||||| |  | | ||| ||||||||||    
T  3705060 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaatagttcttaacaacttcacagattccggctaacatcttaaata 3704961  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||    
T  3704960 ggtttcattactacctaaagtt 3704939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17678679 - 17678462
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca----gcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||     ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||| || |||    
T  17678679 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttaatcatt 17678581  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || | ||||| || |||| || ||| | |||| | |||||||| |||||||||| |    
T  17678580 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaataacattacaaacaacttaacagttca-aacagccttacagatttcagttaacatcttaaatatg 17678482  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| | || |||||||||||    
T  17678481 tcttactactacctaaagtt 17678462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Original strand, 21313140 - 21313185
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21313140 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa 21313185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22831361 - 22831256
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |  || |||| ||| || ||||||| ||||| |    
T  22831361 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagctaacatttcataacagcttcacagattgcaattaacatcctatataggtcacattact 22831262  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  22831261 acctaa 22831256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41388342 - 41388196
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||  |||||||||  ||||||||||    |||| ||    
T  41388342 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcgtatca--agcttaata-aaaattcattt----caacatc 41388250  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  41388249 ttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 41388196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 6151990 - 6152096
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |  || |||| ||| || ||||||| |||||     
T  6151990 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataaacagcttaacatttcataacagcttcacagattgcaattaacatcctatataggtcacattac 6152089  T
Q  218 tacctaa 224  Q
    |||||||    
T  6152090 tacctaa 6152096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39244242 - 39244096
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  | |||||||   |||||||||    |||| ||    
T  39244242 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--aacttaata-agaattcattt----caacatc 39244150  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  39244149 ttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 39244096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39247797 - 39247651
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  | |||||||   |||||||||    |||| ||    
T  39247797 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--aacttaata-agaattcattt----caacatc 39247705  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  39247704 ttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 39247651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42865200 - 42865092
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| |    
T  42865200 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacctttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcac 42865101  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  42865100 attactacc 42865092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20229330 - 20229267
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacat 64  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  20229330 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattccagcataatcaaatcacat 20229267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20229161 - 20229075
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  20229161 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 20229075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1925214 - 1925084
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  1925214 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 1925122  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  1925121 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 1925084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20924228 - 20924098
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  20924228 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 20924136  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  20924135 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 20924098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21788136 - 21788081
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  21788136 gactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagc 21788081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 33050118 - 33050067
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33050118 actcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaac 33050067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22468803 - 22468735
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  22468803 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagc 22468735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 20135201 - 20135267
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  20135201 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaaca 20135267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 21022653 - 21022701
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 63  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  21022653 agactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaggcagatcaca 21022701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36134056 - 36133837
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |    
T  36134056 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcca-ttcatcttcaacaacttcctgatca 36133958  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36133957 ttcaataataactcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttcccagttaatatcttaaatag 36133858  T
Q  208 gtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  36133857 gtctcattaatacctaaagtt 36133837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 17810293 - 17810503
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17810293 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 17810391  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17810392 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttaacatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 17810491  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  17810492 gtacctaaagtt 17810503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14757507 - 14757297
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  14757507 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacaacttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 14757409  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14757408 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 14757309  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  14757308 gtacctaaagtt 14757297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 9556551 - 9556762
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  9556551 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaatact 9556649  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  9556650 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 9556749  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  9556750 tgtacctaaagtt 9556762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1951862 - 1951636
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  1951862 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattt 1951766  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1951765 cttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataatttactttatattcacttaaaatttcataaaagcttcacagttctcagttaatat 1951666  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1951665 ctttattaggtctcattagtacctaaagtt 1951636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 27534047 - 27534257
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27534047 actcatgcaacttagtttaataacaataacagcataatcggatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaataacttcttaatcattcaataat 27534145  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  27534146 gattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataacaacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatctcagataggtctcatta 27534245  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  27534246 gtacctaaagtt 27534257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4561419 - 4561208
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  4561419 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattt-attttcaacaacttcctaatcattcaataat 4561321  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  4561320 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 4561221  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  4561220 tgtacctaaagtt 4561208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22634523 - 22634369
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22634523 tcatcaacttattcagacgcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatc-aattcattttcaacaatttc 22634425  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  22634424 ttgatcattcaataataattcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 22634369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5757023 - 5756812
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5757023 actcatgtaacttagttaaataacaataacagcataatcagattatatcaacaacttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 5756925  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  5756924 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 5756825  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  5756824 tgtacctaaagtt 5756812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18222468 - 18222253
Alignment:
Q  11 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  18222468 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattccttgatcattc 18222372  T
Q  111 aataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  18222371 aataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctttaataggt 18222272  T
Q  210 ctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18222271 ctcattagcacctaaagtt 18222253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 33742399 - 33742609
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  33742399 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttgataccaa-ttcattt-caacaactccctgatcattcaataat 33742496  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  33742497 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacataataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 33742596  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  33742597 tgtacctaaagtt 33742609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17152587 - 17152362
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||| |     
T  17152587 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattt-caacaattc 17152492  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  17152491 cttgatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaatcttcacagttctcagtcaatat 17152392  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17152391 ctttaataggtctcattaacacctaaagtt 17152362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18228954 - 18228728
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||| ||||||| |||||| |     
T  18228954 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataaaaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttcataacaa-ttcatttccaacaattc 18228858  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| | |||    
T  18228857 cttgatcattcaataataattcaagtaaagacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcgtaaaagcttcacagttctcagtcattat 18228758  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18228757 ctttaataggtctcattagcacctaaagtt 18228728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16488172 - 16487956
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||  |||       ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  16488172 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaattc-ttttcaacaacatcttgatca 16488074  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16488073 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagtagcttcacagatctcaattaacatcttaaata 16487974  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    || | ||||| |||||||    
T  16487973 ggacacattactacctaa 16487956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3412804 - 3413023
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| || |||    
T  3412804 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaataatttc 3412900  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  |||  || |||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3412901 ttgatcattcaacaataattcaataaatataattcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctca-tcaatatc 3412998  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  3412999 tttaataggtctcattagtacctaa 3413023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18236897 - 18237123
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  18236897 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaatttc 18236993  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcat-aatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||||  ||||    
T  18236994 ttaatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaaatcttcaaagttctcagtccatat 18237093  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| | ||||||| ||| | ||||||||||    
T  18237094 ctttagtaggtcttatttgcacctaaagtt 18237123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26243765 - 26243540
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  26243765 tcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaatttc 26243669  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||  |||  | |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26243668 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcattccatatttcatttcataatctcttaacaattcataaaggcttcacagttctcagtcaatatc 26243569  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26243568 tctaataggtctcactagcacctaaagtt 26243540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16357045 - 16356831
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  16357045 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcatttcca-caacatcttgatcat 16356947  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta-taatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||  |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16356946 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaaaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaatag 16356848  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  16356847 gtcacattactacctaa 16356831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43256512 - 43256343
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  43256512 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgtagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 43256417  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  43256416 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 43256343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16243500 - 16243275
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  16243500 tcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaatttc 16243404  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | | |||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  16243403 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcacaatctcttaacaattcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 16243304  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16243303 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 16243275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23139277 - 23139501
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  23139277 tcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-ttc 23139372  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| | | || |||||||||||||  | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  23139373 ttgatcaattaacaataattcaagtatgggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatc 23139472  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23139473 tctaataggtctcactagcacctaaagtt 23139501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16348757 - 16348543
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  16348757 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcatttcca-caacatcttgataat 16348659  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| || | || |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16348658 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttta-aaaagcttcacagatttcagttaacatcttaaatag 16348560  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  16348559 gtcacattactacctaa 16348543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19757701 - 19757476
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  19757701 tcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttc 19757605  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  19757604 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 19757505  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  19757504 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 19757476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19782105 - 19782330
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  19782105 tcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttc 19782201  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  19782202 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 19782301  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  19782302 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 19782330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43256120 - 43256040
Alignment:
Q  144 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256120 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttcccagttaacatcttaaataggtctcattagtacctaa 43256040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2014784 - 2015009
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||| |||||  |||||| |||    
T  2014784 tcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattcgcaacaatttc 2014880  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||  |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  2014881 ttgatcattccacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatttcttaacaattcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 2014980  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||    
T  2014981 tttaataggtcaccttagtacctaaagtt 2015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20157566 - 20157407
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agct---taatatcaaattcattttcaac 94  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||   ||||||| |||||| |||||||    
T  20157566 atcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacggtataactttataatatc-aattca-tttcaac 20157469  T
Q  95 aacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  20157468 aacatctagatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 20157407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5339076 - 5338859
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------aattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||  |||        ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  5339076 agactcatgcatcatagttaaataacaataacagcacaagcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcattt-caacaaaatcttgatt 5338978  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||| |||||| ||| | ||| |||| |||||| ||    
T  5338977 attcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataatcagcttaatggttcataacagcttctcagatttcatttaacatcttatat 5338878  T
Q  206 aggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5338877 aggtctcactactacctaa 5338859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15353402 - 15353181
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttg-att 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||       ||||||||| ||||||| ||  | |||    
T  15353402 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacagcaacatcataatttcataacaacaattcattt-caacaacatcaaggatt 15353304  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||  |  ||||||| |||||| ||    
T  15353303 attcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacaaattccagttaacatcttagat 15353204  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  15353203 aggtttcattactacctaaagtt 15353181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11250655 - 11250439
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  11250655 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 11250556  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11250555 tcaagaataattcatgtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcataggtctcagttaacatcttaaatag 11250456  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  11250455 gtttcattactacctaa 11250439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13813113 - 13812966
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||         | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||     
T  13813113 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccacaacattaaaacttcataatatcaa-ttcattt-caacaacatcttgatc 13813016  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  13813015 attcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 13812966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 25555600 - 25555744
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagctt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||    
T  25555600 aattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaactt 25555699  T
Q  180 cacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  25555700 cacaggtctcagttaacatcttaaataagtttcattactacctaa 25555744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 9530460 - 9530660
Alignment:
Q  21 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataatt 120  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| | | || |||||||    
T  9530460 atgcaacttagttaaatgacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataataaat-cattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataatt 9530555  T
Q  121 caagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagta 219  Q
    | ||||| | |||||| || |||  |||  |  |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  9530556 cgagtaaaggcaatcactccatatttcatttcctaatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttctcggtcattatctttaataggtctcattagta 9530655  T
Q  220 cctaa 224  Q
    |||||    
T  9530656 cctaa 9530660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 12570156 - 12570259
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||| |||||     
T  12570156 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcctatataggtcacattac 12570255  T
Q  218 tacc 221  Q
    ||||    
T  12570256 tacc 12570259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 28569544 - 28569477
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 68  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28569544 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaac 28569477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14708734 - 14708668
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14708734 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 14708668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 15224800 - 15224866
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15224800 tcatcaacttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 15224866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18602715 - 18602624
Alignment:
Q  133 tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata-tcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18602715 tcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatattctttaataggtcttattagtacctaa 18602624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 223
Target Start/End: Original strand, 44675762 - 44675872
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcac--ttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |    
T  44675762 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 44675861  T
Q  213 attagtaccta 223  Q
    |||| ||||||    
T  44675862 attactaccta 44675872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18602828 - 18602766
Alignment:
Q  4 tcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 66  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18602828 tcaacttattcatactcatgaaacttagtttagtaacaattgcagcataatcaaatcacatca 18602766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42997550 - 42997484
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  42997550 tcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa 42997484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 10712874 - 10713004
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  10712874 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 10712966  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10712967 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10713004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 10926644 - 10926774
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  10926644 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 10926736  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10926737 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10926774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18609290 - 18609218
Alignment:
Q  152 ataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata-tcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18609290 ataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatattctttaataggtcttattagtacctaa 18609218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18609400 - 18609340
Alignment:
Q  4 tcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacat 64  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18609400 tcaacttattcatactcatgaaacttagtttagtaacaattgcagcataatcaaatcacat 18609340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 23843608 - 23843711
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| |    
T  23843608 ataactcaagtaatacaattaatcattaaaacacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcac 23843707  T
Q  213 atta 216  Q
    ||||    
T  23843708 atta 23843711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 25555503 - 25555550
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25555503 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 25555550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 12570036 - 12570090
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12570036 agactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 12570090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14954252 - 14954122
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||   ||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  14954252 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattta--tttcaaca---tcttgatcattcaataat 14954160  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  14954159 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacaatata 14954122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16351864 - 16351727
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||  |    
T  16351864 tttcaacaacatctagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaaaaacttcacaaat 16351765  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
      | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16351764 tccggctaacatcttaaataggtttcattactacctaa 16351727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 25689891 - 25690021
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||   ||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  25689891 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattta--tttcaaca---tcttgatcattcaataat 25689983  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  25689984 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 25690021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 45938173 - 45938284
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| | | || |||||     
T  45938173 catgcatcttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaa-tcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataa- 45938267  T
Q  120 tcaagtaatgcaatcaa 136  Q
    |||||||| ||||||||    
T  45938268 tcaagtaaggcaatcaa 45938284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14954500 - 14954433
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  14954500 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 14954433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 15093798 - 15093853
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  15093798 gactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagc 15093853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 25689643 - 25689710
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  25689643 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 25689710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 15224963 - 15225035
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||    
T  15224963 aattcatttt-aacaacatcttggtcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcatattata 15225035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Original strand, 12487802 - 12487862
Alignment:
Q  94 caacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  12487802 caacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 12487862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15125130 - 15125071
Alignment:
Q  127 atgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15125130 atgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacag 15125071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 23843501 - 23843537
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23843501 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcata 23843537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2548
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  2773 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaattgcagcataatcagatcacatcaacagcttaataacaa-ttcattt-caacaatttc 2676  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2675 ttgatcattcaataacaattcaagtaatccaatcaatcaatatatcacaatataatcacttagcagttcataaaagcttcacaattctcagttaatatct 2576  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2575 taaataggtctcattagtacctaaagtt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18733 - 18507
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||    
T  18733 tcatcaacttattcagactcatgcaacttaggtaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaataacaa-ttcattttcaataatttc 18635  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  18634 ttgatcattcaaaaataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataaaagcttcacagttctcattcaatatct 18535  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||    
T  18534 ttaataggtctcagcagtacctaaagtt 18507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 173297 - 173521
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  173297 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaatttc 173393  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  173394 tttatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaatatatcacaatataatcacttagcatttcataatagcttcaaagttctcagttaatatct 173493  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  173494 ttaataggtctctttagtacctaaagtt 173521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 422626 - 422406
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  422626 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataattagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagatca 422528  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag-ttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||| || | |||||  | ||| ||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  422527 ttcaagaataattcaagtaatgcatttagtcgttaaatcacattacaaacaacttaatagttcttaacaacttcacagattct-agttaacatcttaaat 422429  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  422428 aggtttcattactacctaaagtt 422406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23535688 - 23535468
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  23535688 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatc-aattca-tttcaacaatttc 23535591  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  23535590 ttgatcattcaataataattaaagtaatgcaatctatcaataaatcac-gtataatcacttagcatttcatagaagcttcacagttctcatttaatatct 23535492  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  23535491 taaacaggtctcattagtacctaa 23535468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15236865 - 15236662
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  15236865 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaagaat 15236767  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15236766 aattcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 15236667  T
Q  217 gtacc 221  Q
    |||||    
T  15236666 gtacc 15236662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Original strand, 17410452 - 17410601
Alignment:
Q  8 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  17410452 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacttaatatc-aattcatcttcgacaacttcttgatca 17410550  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410551 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 17410601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 20295868 - 20296079
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20295868 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 20295966  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  20295967 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 20296066  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  20296067 tgtacctaaagtt 20296079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19472805 - 19472594
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19472805 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 19472707  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  19472706 aatttaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 19472607  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  19472606 tgtacctaaagtt 19472594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18774208 - 18774435
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  18774208 tcatcaacttaattcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattttcaacaattt 18774304  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||| | ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18774305 cttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataatttcacttcataatcactgaacaattcataaaagcttcacagttctcaggtaata 18774404  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18774405 tctttaataggtctcattagcacctaaagtt 18774435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42805425 - 42805651
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  42805425 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttggttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattc 42805521  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42805522 cttgatcatttaataataattcaagtaaataaaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 42805621  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  42805622 ctttaataggtctcaatggcacctaaagtt 42805651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21366759 - 21366544
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |  ||||    ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  21366759 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattcattt-catcaacatcttgatcat 21366661  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21366660 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacagatctcagttaacatcttaaatag 21366561  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  21366560 gtcacattactacctaa 21366544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18784051 - 18784278
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  18784051 tcatcaacttaattcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattttcaacaattt 18784147  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||| | ||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  18784148 ctttatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataatttcacttcataatcactgaacaattcataaaagcctcacagttctcagtcaata 18784247  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18784248 tctttaattggtctcattagcacctaaagtt 18784278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20232556 - 20232781
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  20232556 tcatcaacttatttcagacttatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattctcaacaa-tt 20232651  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
     ||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20232652 attgatcaatcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 20232751  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20232752 cttaaataggtcttattagtacctaaagtt 20232781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26742847 - 26742621
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   |||||||| ||| | |||| ||||||| |     
T  26742847 tcatcaacttagttcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcag--gcttaataacaact-cattctcaacaattc 26742751  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| |||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26742750 cttgatcattcaataataattcgagtaaatacaatcaaaccataattcactttataatcacttaatatatcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 26742651  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  26742650 ctttaataggtctcaatggcacctaaagtt 26742621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20911270 - 20911101
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  20911270 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 20911175  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  20911174 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 20911101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26666231 - 26666006
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  26666231 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 26666136  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26666135 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 26666036  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26666035 ctctaataggtctcactagcacctagagtt 26666006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26937828 - 26937603
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  26937828 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 26937733  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26937732 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 26937633  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26937632 ctctaataggtctcactagcacctagagtt 26937603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24533148 - 24532938
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  24533148 tcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcaacataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaa-tt 24533053  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24533052 cttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttagtatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatat 24532953  T
Q  199 cttaaataggtctca 213  Q
    ||  |||||||||||    
T  24532952 ctctaataggtctca 24532938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 18355963 - 18356132
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  || |||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  18355963 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--agtttaataac-aattca-tttcaacaacatc 18356058  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18356059 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 18356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33409234 - 33409459
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  33409234 tcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttc 33409330  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  33409331 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 33409430  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  33409431 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 33409459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 18356474 - 18356554
Alignment:
Q  144 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18356474 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagtatctaa 18356554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20910759 - 20910680
Alignment:
Q  144 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtaccta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20910759 atcacattataatcacttagcatttcacaatagcttcacagtcctcagataacatcttaaataggtctcattagtaccta 20910680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12028659 - 12028443
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  12028659 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 12028560  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || || |||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12028559 tcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 12028460  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  12028459 gtttcattactacctaa 12028443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22757148 - 22757349
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  22757148 gactcatgtaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 22757247  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22757248 tcaataataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 22757347  T
Q  208 gt 209  Q
    ||    
T  22757348 gt 22757349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 23451371 - 23451588
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag----cttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||     ||| ||| ||  ||||| ||||||||||| || | || |||    
T  23451371 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacatcaattc-ttttcaacaacatcataatcatt 23451469  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| || || ||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23451470 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcactttacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatagg 23451568  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  23451569 tctcactactacctaaagtt 23451588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 16674177 - 16674383
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  16674177 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 16674273  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||| | ||||||||| |||  |||  | ||| || |||| || ||||||| | ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  16674274 tcaagtaaaggcaatcaatctatatttcatttcatagtctcttaacagttcataaaaactttacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 16674373  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  16674374 acctaaagtt 16674383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17718520 - 17718314
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||   | | |||| || || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17718520 catgcaacttagttaaataacatttgccgcataatcaaatcacatcat--gttcaataacagat-cattctcaacaatttcttgatcattcaataataat 17718424  T
Q  120 tcaagtaatgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||| | || |||||  |||  |||  | |||||| || | || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17718423 tcaagtaaaggaaatcaattcatatttcatttcataatctctaaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcaatatctttaataggtctcattagt 17718324  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  17718323 acctaaagtt 17718314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 123399 - 123184
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||    ||||    
T  123399 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcatcacaacaattcattttcaacaacatcaaagttat 123300  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||   |||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| | |||||    
T  123299 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatctttaaatcacattacaacagcttaacaattcataacagcctcacagatctcagttaacatctcacatagg 123200  T
Q  209 tctcattagtacctaa 224  Q
    ||  |||| |||||||    
T  123199 tcatattactacctaa 123184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24767634 - 24767493
Alignment:
Q  21 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ct---taatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||   ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  24767634 atgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatc-aattca-tttcaacaacatcttgatcattcaa 24767537  T
Q  113 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  24767536 taatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 24767493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 20805575 - 20805788
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-aat-tcattt---tcaacaacttcttgattattc 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||   |||| ||| ||| ||| ||   |||||||| ||| ||| ||||    
T  20805575 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaagaacaaaataatttcataatatcaattcattcaacaacatctagatcattc 20805674  T
Q  111 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta-taatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  20805675 aataacatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattaccaataacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaataggt 20805773  T
Q  210 ctcattagtacctaa 224  Q
    | ||||| |||||||    
T  20805774 cacattactacctaa 20805788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 23458615 - 23458832
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag----cttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||     ||| ||| ||  ||||| ||||||||| | || | || |||    
T  23458615 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagaagcataatcagatcacaacaacactatacttcataacagcaattc-ttttcaacagcatcataatcatt 23458713  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || || ||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23458714 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatagg 23458812  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  23458813 tctcactactacctaaagtt 23458832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 23462876 - 23463093
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag----cttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||     ||| ||| ||  ||||| ||||||||| | || | || |||    
T  23462876 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagaagcataatcagatcacaacaacactatacttcataacagcaattc-ttttcaacagcatcataatcatt 23462974  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || || ||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23462975 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatagg 23463073  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  23463074 tctcactactacctaaagtt 23463093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21340867 - 21340642
Alignment:
Q  1 tcatcaacttatt-cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||| ||    
T  21340867 tcatcaacttatttcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaa-tcattctaaacaa-tt 21340772  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| | | || |||||||| ||| || ||||||| || |||  |||  | |||||| |||| || |||| ||  |||||||||||| |||| | |||    
T  21340771 cttgatcaattaacaataattcgagtaaaggcaatcactccatatttcatttcataatcccttaacaattcaaaaaggcttcacagttcccagtcattat 21340672  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21340671 ctctaataggtctcactagcacctaaagtt 21340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17919245 - 17919026
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  17919245 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattgtaatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 17919146  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||  ||||| || ||||||| ||  ||||||  |||| | || || |||||||||    
T  17919145 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatctttaaatcacattacaacaacttaacaattcataacagtctcacagacctcactcaacatattaaatagg 17919046  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | || ||| |||||||||||    
T  17919045 tttccttactacctaaagtt 17919026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21885289 - 21885166
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  21885289 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 21885193  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa 127  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||    
T  21885192 ttgatcattcaacaacaattcaagtaa 21885166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 24221899 - 24222115
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  24221899 agactcatgcaacctagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagttta 24221997  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | | |||  |||||||||    
T  24221998 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccggctaacgtcttaaata 24222097  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  24222098 ggtttcattactacctaa 24222115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25229506 - 25229281
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  ||     
T  25229506 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagttta 25229410  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  25229409 ttgatcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-aacttctcagttctcagtcaatat 25229311  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25229310 cattattaggtctcattagcacctaaagtt 25229281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25293662 - 25293437
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  ||     
T  25293662 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagttta 25293566  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  25293565 ttgatcattcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-aacttctcagttctcagtcaatat 25293467  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25293466 cattattaggtctcattagcacctaaagtt 25293437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 20766997 - 20767207
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-aat-tcatt---ttcaacaacttcttgattattc 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||| | |||  ||| ||| ||| |   ||||||||| ||| ||| ||||    
T  20766997 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcaaatcacaacaacaacataagttcataatatcaattcattcaacaacatctagatcattc 20767096  T
Q  111 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta-taatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||  |||||| | |||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  20767097 aataacatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattaccaacaacttagtagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaataggt 20767195  T
Q  210 ctcattagtacc 221  Q
    | ||||| ||||    
T  20767196 cacattactacc 20767207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40723672 - 40723608
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa 81  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  40723672 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcggatcatatcaacaacttaatatcaa 40723608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1859070 - 1858929
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca----gcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||     ||| ||| ||  |||||| |||||||||| || | || |||    
T  1859070 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattca-tttcaacaacatcataatcatt 1858972  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  1858971 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 1858929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 10752949 - 10753015
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10752949 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataattaaatcacatcaa 10753015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 26680604 - 26680818
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttc-ttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || | |||| |||       |||||| |||||| ||| ||   | ||    
T  26680604 agactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacatcatcataatttcatagtaacaattca-tttcaataacatcaaggttt 26680702  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||| || | ||||||   ||| ||| | |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26680703 attcaagaataattcaagtaatgcatttgatcgttaaatcacattacaaacaacttag---ttcttaacaacttcacaagtctcagttaacatcttaaat 26680799  T
Q  206 aggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  26680800 aggtttcattactacctaa 26680818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 26952211 - 26952425
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttc-ttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || | |||| |||       |||||| |||||| ||| ||   | ||    
T  26952211 agactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacatcatcataatttcatagtaacaattca-tttcaataacatcaaggttt 26952309  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||| || | ||||||   ||| ||| | |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26952310 attcaagaataattcaagtaatgcatttgatcgttaaatcacattacaaacaacttag---ttcttaacaacttcacaagtctcagttaacatcttaaat 26952406  T
Q  206 aggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  26952407 aggtttcattactacctaa 26952425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 4036225 - 4036290
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 66  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4036225 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 4036290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26172470 - 26172696
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| || || |||| |  |||    
T  26172470 tcatcaacttaatcataatcattcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaa-tcgttctcaatagtttc 26172566  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| |||| | ||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||  | | | |||    
T  26172567 ttgatcattcaacaacaattcaagtaagtgtaattcaatccataattcacttcataatcatttgacaattcataa-agcttcacagttcataatcattat 26172665  T
Q  199 cttaaataggtctcatta-gtacctaaagtt 228  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  26172666 ctttaataggtcacactatgtacctaaagtt 26172696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Original strand, 10753112 - 10753204
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  10753112 aattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 10753204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 10753385 - 10753515
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  10753385 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 10753477  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10753478 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10753515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 14079278 - 14079386
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcac--ttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |    
T  14079278 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataagagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 14079377  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  14079378 attactacc 14079386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 17517308 - 17517240
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  17517308 atcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 17517240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 31342169 - 31342217
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  31342169 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 31342217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 152
Target Start/End: Original strand, 31342220 - 31342291
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31342220 aattcattttcaacaacatcaagtttattcaaggataattcaagtaatgcaattaatcgttaaatcacatta 31342291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 17410646 - 17410678
Alignment:
Q  196 tatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410646 tatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 17410678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 11220521 - 11220588
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11220521 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 11220588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 11228930 - 11228997
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11228930 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 11228997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 11230919 - 11230986
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11230919 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 11230986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Original strand, 11226940 - 11227006
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcata 172  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11226940 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcata 11227006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 23201383 - 23201436
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  23201383 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 23201436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 23512121 - 23512174
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23512121 gactcatgcactttagttaaataacaatagcagcataggcagatcgcatcaaca 23512174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 23572107 - 23572160
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  23572107 gactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaaca 23572160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873313
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 21873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 228473 - 228252
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  228473 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcagatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaactatttc 228377  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  228376 ttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatcaataaatcactatataatcacttagcatttcataaaaacttcacagttctcagttaatatc 228277  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  228276 ttaagtaggtctcattagtacctaa 228252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13568 - 13365
Alignment:
Q  21 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataatt 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13568 atgcaactcagttaattaacaataacagaataatcagatcacatcaacaacttaatatcaa-tcgatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 13470  T
Q  121 caagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtac 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13469 aaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctacacagttatcagttaatatcttaaataggtctcattagtac 13370  T
Q  221 ctaaa 225  Q
    |||||    
T  13369 ctaaa 13365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20117 - 19892
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  20117 tcatcaacttattcagattcatgcaacttagtttaataacaattgcaacataatcagatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaatttc 20021  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20020 ttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacgtttcataaaagcttcacagttctcaattaatatc 19921  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19920 tttaataggtctcattagtacctaaagtt 19892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3960 - 3750
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3960 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 3862  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  3861 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatctcagataggtctcatta 3762  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  3761 gtacctaaagtt 3750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 65613 - 65402
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65613 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcttgatcattcaataat 65515  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  65514 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 65415  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  65414 tgtacctaaagtt 65402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 61697 - 61505
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  61697 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 61599  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  61598 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 61505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 80736 - 80943
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  80736 actcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt-caacatcttcctgatcattcaataat 80831  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  80832 aattcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataaacacttagcatttcaatacagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 80931  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  80932 gtacctaaagtt 80943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 80300 - 80366
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  80300 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 80366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 152
Target Start/End: Original strand, 80463 - 80533
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  80463 aattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 80533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 12785 - 12839
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  12785 agactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaaca 12839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9766 - 9544
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttc-aacaactt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||   ||||| ||    
T  9766 tcatcaacttatttagactcatgcaacatagttaattaacaattgcagcgtaatcagatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcatttaataacaattt 9670  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9669 cttgatcattcaataataattcaagtaaatgcgatcaatcaataaatcacattataatcacttaaaatttcataaaagcttcacagttctcagttaatat 9570  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9569 cttaaataggtctcattagtacctaa 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16231576 - 16231351
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  16231576 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaaatt 16231480  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16231479 cttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 16231380  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagt 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16231379 ctttaataggtctcattagtacctaaagt 16231351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 43251834 - 43252026
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  43251834 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctaatcattcaataat 43251932  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  43251933 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 43252026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19278368 - 19278157
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19278368 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 19278270  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  19278269 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 19278170  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  19278169 tgtacctaaagtt 19278157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21972670 - 21972459
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21972670 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 21972572  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  21972571 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 21972472  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  21972471 tgtacctaaagtt 21972459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21976755 - 21976544
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21976755 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 21976657  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  21976656 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 21976557  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  21976556 tgtacctaaagtt 21976544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 22044900 - 22045115
Alignment:
Q  11 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22044900 attcagactcatgcaacttagtttgataacaattgcagcacaatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaatttcttgatcattc 22044996  T
Q  111 aataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22044997 cataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatctcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggt 22045096  T
Q  210 ctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  22045097 ctcattagtatctaaagtt 22045115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 22111904 - 22112083
Alignment:
Q  49 cataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcac 148  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111904 cataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcac 22112002  T
Q  149 attataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta-gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22112003 attataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacactatgtacctaaagtt 22112083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23834177 - 23834404
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  23834177 tcatcaacttaattcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcatcatagtcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaattt 23834273  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||||| ||| | ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  23834274 cttggtcattcaacaataattcaagtaaatacaatcagtccataaattcacttcataatcacttaacaattcataaaagattcacagttctcagtcaata 23834373  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23834374 tctttaataggtctcattagtacctaaagtt 23834404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30308853 - 30308629
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| |||||     |||||| ||||| ||||  |||||| |||    
T  30308853 tcatcaacttattcatactcatgcaaattagtttaataacaattgcaacataatcaaatcccatcagat--ttaataacaaat-cattcacaacaatttc 30308757  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30308756 ttgatcattcaacaataattcaagtaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcttaaaagcttcagagttctcagtcaatatct 30308657  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30308656 ttaataggtctcattagcacctaaagtt 30308629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 22028647 - 22028788
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22028647 tttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagcttcacagtt 22028746  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22028747 cttagtcaatatcttcaataggtctcattagtacttaaagtt 22028788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 18619561 - 18619705
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctt 179  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  18619561 aattcattttcagcaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaagacaatcaatccataaatcactttatattcacttaacatctcataaaagctt 18619660  T
Q  180 cacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18619661 cacagttctcagtcaatatctttaataggtctcattagcacctaa 18619705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20466133 - 20465917
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  20466133 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 20466035  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||| |||    
T  20466034 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttagcatttcataacagcttcacagattgcagttaacctcttatata 20465935  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  20465934 ggtcacattactacctaa 20465917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30643386 - 30643169
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  30643386 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 30643288  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagc-ttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  30643287 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcatattataatcaacttaacagttcgtaacagctttcacagattgcagttaacatcttaaat 30643188  T
Q  206 aggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  30643187 aggtcacattactacctaa 30643169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16410347 - 16410133
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  16410347 gactcatgcaacttagtgaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataataccaattcattt-caacaacatcttgatcat 16410249  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16410248 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacatatttcagttaatatcttaaatag 16410150  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  16410149 gtcacattactacctaa 16410133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20856518 - 20856305
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----cttaatatcaa--attcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |      ||| ||| |||  |||||||||||||||| ||| | ||||    
T  20856518 gactcatgcaacttagttaaataacaa-agcagcataatcagatcacaacaatattataacttcataacaacaattcattttcaacaacatctaggttat 20856420  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  20856419 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttagcaattcataacaggttcacagatctcagctaacatctttaatag 20856320  T
Q  208 gtctcattagtacct 222  Q
    ||| ||||| |||||    
T  20856319 gtcacattactacct 20856305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17926799 - 17926585
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  17926799 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcaaaacaacagcataatttcacaatatcaattcattt-caacaacatcttgatcat 17926701  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  17926700 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcaattaacatcttaaatag 17926602  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  17926601 gtcacattactacctaa 17926585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15603111 - 15602903
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||        ||||| |||||||||| ||||||| |    
T  15603111 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacatcaacagcaaaatttcataatatcgattca-tttcaacaacatcttgatca 15603013  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata-atcacttagca-tttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |  |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15603012 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacagacaacttagcagtttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaat 15602914  T
Q  206 aggtctcatta 216  Q
    ||||| |||||    
T  15602913 aggtcacatta 15602903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23847115 - 23846890
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt-aatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||   |||| || |||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  23847115 tcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcaca---acagatttaataacaaat-cattctcaacaattt 23847020  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | |||    
T  23847019 cttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattat 23846920  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23846919 ctttaataggtcacattagtacctaaagtt 23846890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14398208 - 14398039
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  | ||||||||| | |||||| ||||||||||  |    
T  14398208 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcgcat--aaagcttaataac-aattca-tttcaacaacaac 14398113  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  14398112 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 14398039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15611563 - 15611355
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  15611563 agactcatgcaacttggttaaataacaaaaccagcataatcagatcacatcaacagcaaaatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 15611465  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata-atcacttagca-tttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |  |||||| | ||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15611464 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacagacaacttagtagtttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaat 15611366  T
Q  206 aggtctcatta 216  Q
    ||||| |||||    
T  15611365 aggtcacatta 15611355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 21387079 - 21387228
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  21387079 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 21387174  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    ||||| |||| ||| || ||| |  |||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  21387175 ttgatcattcgatactatttcgaacaatgcatttaatcattaaatcacagtata 21387228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 21383659 - 21383801
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  21383659 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 21383754  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatca 147  Q
    || || |||||||| || ||| || |||||| | ||||| |||||||    
T  21383755 ttaatcattcaatactatttcgagcaatgcatttaatcattaaatca 21383801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 15538473 - 15538679
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||     
T  15538473 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaa-ttcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataac 15538569  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||| | ||||||||| |||  |||  | || ||| |||| || ||||||| | |||||| |||| |||| | |||||  |||||||||||||||     
T  15538570 tcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcattatcccttaacagttcataaaatcttcactgttcacagtcattatctctaataggtctcattagc 15538669  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  15538670 acctaaagtt 15538679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 377414 - 377519
Alignment:
Q  120 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  377414 tcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattatgatcagcttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcacattact 377513  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  377514 acctaa 377519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 24755856 - 24755959
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||| |||||     
T  24755856 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcctatataggtcacattac 24755955  T
Q  218 tacc 221  Q
    ||||    
T  24755956 tacc 24755959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 15531914 - 15532119
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  15531914 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaa-ttcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 15532010  T
Q  120 tcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||| || |||||||||| |||  |||  | || ||| |||| || || |||| | ||||| ||||| |||| | |||||  |||||||||||||||     
T  15532011 tcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcattatcccttaacagtt-ataaaatcttcatagttcacagtcattatctctaataggtctcattagc 15532109  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  15532110 acctaaagtt 15532119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19259565 - 19259460
Alignment:
Q  120 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| ||||| |    
T  19259565 tcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaacatcttgtataggtcacattact 19259466  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  19259465 acctaa 19259460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22010769 - 22010553
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||     | ||| ||| ||  |||||||||    |||| ||| ||| |    
T  22010769 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaactttataacttcataacaacaattcattt----caacatctagatca 22010674  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || | | |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  22010673 ttcaagaatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacaacctcacagatttcagttaacatcttaaata 22010575  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
     |||| | || |||||||||||    
T  22010574 tgtcttactactacctaaagtt 22010553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 32605216 - 32605400
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||  || | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  32605216 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcacaatcaaatcacatca--agttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 32605312  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttc 187  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  32605313 ttgatcattcaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttc 32605400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17055479 - 17055412
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 68  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  17055479 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaataacatcaac 17055412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 32598684 - 32598750
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  32598684 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcacaatcaaatcacatcaa 32598750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 39095018 - 39094875
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||   |||  |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  39095018 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacaattcattttcaacaacatcaaggttat 39094919  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  39094918 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaattacatta 39094875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18678209 - 18678141
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18678209 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 18678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16861418 - 16861201
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca----gcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||      || ||| ||  |||||| |||||||||| |||| || |||    
T  16861418 gactcatgcaactcggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatatttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttaatcatt 16861320  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||| || | ||||| || |||| || ||| | |||| | |||| |||  ||||||||| |    
T  16861319 caataatatttcaagtaatgtatttaatcattaaatcacattacaaacaacttaacagttca-aacagccttacagatttcagctaacctcttaaatatg 16861221  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  16861220 tctcactactacctaaagtt 16861201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17828663 - 17828458
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| | | || |||||     
T  17828663 catgcaacttagttaattaacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaa-tcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataa- 17828569  T
Q  120 tcaagtaatg-caatc-aatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||  |||  | || ||| |||| ||  |||||| | ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  17828568 tcaagtaaagacaatcaaatccatatttcatttcattatcccttaacaaatcataaaatcttcacagttcacagtcattatctctaataggtctcgttag 17828469  T
Q  218 tacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||    
T  17828468 cacctaaagtt 17828458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 32121759 - 32121814
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 71  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  32121759 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 32121814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18862730 - 18862600
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  18862730 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 18862638  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  18862637 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 18862600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 19983223 - 19983331
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcac--ttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |    
T  19983223 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 19983322  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  19983323 attactacc 19983331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21828099 - 21827969
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  21828099 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 21828007  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  21828006 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 21827969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 23648567 - 23648633
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  23648567 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaaca 23648633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23776929 - 23776807
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||        ||||||||||| |||| |||||||||| |||| || |    
T  23776929 gactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaatttca-tttcaacaacatcttaatca 23776831  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgca 131  Q
    ||||||||||  | ||||||||||    
T  23776830 ttcaataatatcttaagtaatgca 23776807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 24755736 - 24755790
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24755736 agactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 24755790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 19899225 - 19899333
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcac--ttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |    
T  19899225 ataactcaagtaatgaaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 19899324  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  19899325 attactacc 19899333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 377295 - 377347
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  377295 actcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatcacaacaaca 377347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 21410971 - 21411096
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  21410971 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataac-aattcattt----caacatcttgatcattcaataat 21411063  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 149  Q
    | ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  21411064 atttcaaataatgcatttaatcattaattcaca 21411096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 21805463 - 21805588
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  21805463 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataac-aattcattt----caacatcttgatcattcaataat 21805555  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 149  Q
    | ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  21805556 atttcaaataatgcatttaatcattaattcaca 21805588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18862978 - 18862911
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  18862978 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 18862911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21828347 - 21828280
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  21828347 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 21828280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 16184862 - 16184966
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  16184862 ttcaagcaatgcaattaaacattaaatcacattataatcaacattaacatctcatatcagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcacatta 16184961  T
Q  217 gtacc 221  Q
     ||||    
T  16184962 ctacc 16184966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17354037 - 17353984
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17354037 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 17353984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19259685 - 19259632
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  19259685 gactcatgcaacttggttaaataacaatagtagcataagcagttcacaacaaca 19259632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21162152 - 21162099
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  21162152 gactcatgcaacttagttaaataataataacagcataggcagatcacaacaaca 21162099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21168825 - 21168772
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  21168825 gactcatgcaacttagttaaataataataacagcataggcagatcacaacaaca 21168772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 12443 - 12653
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||| ||||||    
T  12443 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcccaatcatttaataat 12541  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12542 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 12641  T
Q  217 gtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||    
T  12642 gtacctaaagtt 12653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 4994
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5186 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagctcatatcaacaacttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 5088  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||    
T  5087 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 4994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 58804 - 58593
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  58804 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 58706  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  58705 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 58606  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  58605 tgtacctaaagtt 58593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3631 - 3405
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3631 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagtataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattt 3535  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3534 cttgatcattcaataacaattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactctatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatat 3435  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3434 ctttaatgggtctcattagtacctaaagtt 3405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36027 - 35817
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36027 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataattagatcatatcaacagcttaatatcaatt--aatttcaacaacttcctgatcattcaataat 35930  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | | |||||| |||||||| || ||    
T  35929 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtcacacta 35830  T
Q  217 -gtacctaaagtt 228  Q
     ||||||||||||    
T  35829 tgtacctaaagtt 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6950 - 7175
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||  || |||||||    
T  6950 tcatcaacttattcatgctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaataacaaa-tcattcacagcaacttc 7046  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  7047 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacataacaattcataaaagcttcagagttctcagtcaatatc 7146  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7147 tttaataggtcacattagcacctaaagtt 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 11402 - 11336
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  11402 tcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcattatcaaatcacatcaa 11336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 38919 - 38853
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||||    
T  38919 tcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcattatcaaatgacatcaa 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10589 - 10459
Alignment:
Q  98 ttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10589 ttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagtatttcataatagcttcacagttctcagttaata 10490  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10489 tcttaaataggtctcattagtacttaaagtt 10459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 70
Target Start/End: Original strand, 69804 - 69871
Alignment:
Q  3 atcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag 70  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  69804 atcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacag 69871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18461 - 18235
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  18461 tcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaa-ttcattttcaacaattc 18365  T
Q  100 cttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  18364 cttgatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttattttcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcattat 18265  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18264 ctttaataggtctcattagcacctaaagtt 18235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 4452 - 4672
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  4452 agactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataatcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatca 4550  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||    
T  4551 ttcgataatatttcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataatcaacttagcatttcataatagtttcacagtttacagttaacttcttatata 4650  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  4651 ggtctcactactacctaaagtt 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 471 - 602
Alignment:
Q  17 actcatgcaactt-agttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataa 115  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| |||||||||    
T  471 actcatgcaactttagttaaataacaatagcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataa 563  T
Q  116 taattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    || ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  564 tatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25070 - 24843
Alignment:
Q  1 tcatcaactta-ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaactt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||  ||||||||| || |     
T  25070 tcatcaacttaattcagactcatgcaactcagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aacacattttcaataattc 24974  T
Q  100 c-ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaata 197  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24973 ctttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcctaaaagcttcacagttctcagtcaata 24874  T
Q  198 tcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24873 tctttaataggtctcattagtacctaaagtt 24843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 189462 - 189332
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  189462 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 189370  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  189369 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 189332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 189710 - 189643
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  189710 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 189643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 181 - 398
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||       ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  181 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacataacttcataatatcaattcattttcaacaacatcttgatca 280  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||    
T  281 ttcaataatatttcaagtaatgcaattagtcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcacagatttccgttaacatcttaatta 380  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  381 ggtcacattactacctaa 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 415 - 631
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||       ||||| |||||||| || ||||||| |    
T  415 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataatatcaattc-ttttcaacgacatcttgatca 513  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  514 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagtagcttcacagatctcaattaacatcttaaata 613  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  614 ggtcgcattactacctaa 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 5608 - 5826
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||       ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  5608 agactcatgcaacttagttaaataacagtagcagcataatcagatcacaacaacagcatagttcataatatcaa-ttcattttcaacaacatcttgatca 5706  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  5707 ttcaataatatctcaagtaatgcaattattcatttaatcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcaaagatctcagttaacatctt-aata 5805  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagt 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  5806 ggtcacattactacctaaagt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 6803 - 7021
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||       ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  6803 agactcatgcaacttagttaaataacagtagcagcataatcagatcacaacaacagcatagttcataatatcaa-ttcattttcaacaacatcttgatca 6901  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  6902 ttcaataatatctcaagtaatgcaattattcatttaatcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcaaagatctcagttaacatctt-aata 7000  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagt 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  7001 ggtcacattactacctaaagt 7021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6357 - 6132
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||  || |||||||    
T  6357 tcatcaacttattcatgctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaataacaaa-tcattcacagcaacttc 6261  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  6260 ttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacataacaattcataaaagcttcagagttctcagtcaatatc 6161  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  6160 tttaataggtcacattagcacctaaagtt 6132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 1905 - 1971
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  1905 tcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcattatcaaatcacatcaa 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 12 - 160
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctt 179  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  12 aattcattctcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagctt 111  T
Q  180 cacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  112 cacagttctcagtcaatatttttaataagtctcattagtacctaaagtt 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 1516 - 1731
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    || |  ||||    ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  1516 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaactttatacttcatcatatcaattcattt-catcaacatcttgatcat 1614  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1615 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacagatctcagttaacatcttaaatag 1714  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  1715 gtcacattactacctaa 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 42649 - 42860
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||       | ||||||||| |||||||    |||| ||||||| ||    
T  42649 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattaacttcataatatcaa-ttcattt----caacatcttgatcat 42743  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42744 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattagaatcagcttaacagttcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaatag 42843  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  42844 gtcacattactacctaa 42860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 23232 - 23443
Alignment:
Q  11 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattc 110  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||    
T  23232 attcagactcatgaaacatagtttaataataattgcagcttaatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattctcaacaatttcttggtcattc 23328  T
Q  111 aataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  23329 aacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaagcttcatagttctcagtcaatatcttgaataggt 23428  T
Q  210 ctcattagtacctaa 224  Q
    |||||||||| ||||    
T  23429 ctcattagtaactaa 23443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1584 - 1364
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----cttaatatcaa--attcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||      ||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  1584 agactcatgcaacttagttaaataaccaaagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataacaacaattcattt-caacaacatcttgatca 1486  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1485 ttcaataatatttcaagtaatgcaattattcgttaagtcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 1386  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||||| || ||||||||    
T  1385 ggtcacattactaactaaagtt 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6403 - 6227
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||       ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6403 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaattcattt-caacaacttcttgatca 6305  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6304 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaataattaaatcacaatataaacaacttaacatttcataatagcttcacag 6227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46820 - 46605
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||  |||       ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  46820 gactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaattcatttcca-caacatcttgatcat 46722  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||| ||||    
T  46721 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttagcatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttatatag 46622  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  46621 gtcacattactacctaa 46605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15328
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  15111 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcacaaca-cagcataacttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatcatt 15208  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||| | |||    
T  15209 caataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaactttttataacagcttcacagattgcagttaacatcttataaagg 15308  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  15309 tctcactactacctaaagtt 15328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18750 - 18534
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||        | ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||     
T  18750 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaa-ttcgttt-caacaacatcttgatc 18653  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||| ||    
T  18652 attcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacataccatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttatat 18553  T
Q  206 aggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18552 aggtctcattactacctaa 18534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9909 - 10134
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  9909 tcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaatttc 10005  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||    
T  10006 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatc 10105  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  10106 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 10134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17206 - 17056
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||       ||||||||| ||||||| ||||||  |    
T  17206 agactcatggaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcataacttcataatatcaattcatttccaacaacatcttgaaca 17107  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17106 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatca 17056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2178 - 1962
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-aat-----tcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| |||     ||  |||||||||| ||||||| |||    
T  2178 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatccatttcaacaacatcttgatcatt 2079  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcattt-cataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| | | ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2078 caatgaaatttcaagtaatgcatttaatcattaaattacattacaaacaacttagcattttcataacagcttcacatatttcagttaatatcttaaatag 1979  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  1978 gtcacattactacctaa 1962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20564 - 20395
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||| ||||| |||| ||    
T  20564 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataac-aattca-tttcatcaacatc 20469  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  20468 ttgattattcaataatatttcgtgtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 20395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9741
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa-------tatcaaattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||       |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  9536 gactcatgcaacttagttaaataacaataacaacataatcagatcacatcaacagcataactcataatatcaa-ttcattt-caacaacatcttgatcat 9633  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || || ||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  9634 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagtttcacagatttcggttaacatcttaaatag 9732  T
Q  208 gtctcatta 216  Q
    ||| |||||    
T  9733 gtcacatta 9741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 1853 - 2059
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  1853 gactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatcat 1951  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || || ||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  1952 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagtttcacagatttcggttaacatcttaaatag 2050  T
Q  208 gtctcatta 216  Q
    ||| |||||    
T  2051 gtcacatta 2059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 44104 - 44318
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  44104 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcatttcca-caacatcttgataat 44202  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| || | || |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44203 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttta-aaaagcttcacagatttcagttaacatcttaaatag 44301  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  44302 gtcacattactacctaa 44318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 30890 - 31059
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  30890 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattacagcataatcaaatctcatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 30985  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  30986 ttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 31059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18360 - 18585
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||   | |||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  18360 tcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataaacaaatcacatca--ggtttaataacaaa-tcattctcaacaatttc 18456  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| || |||| |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||    
T  18457 ttgatcattcaacaataattcaagtaaaggcaatcagtccataattcatttaataatctcttaacaattcataaaaacttcatagttcacagtcattatc 18556  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18557 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35387
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  35605 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 35506  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  35505 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaataattcataacagcttcacaggtctcagttaacatctcaaatag 35406  T
Q  208 gtctcattagtacctaaag 226  Q
    ||| ||||| ||| |||||    
T  35405 gtcacattactacataaag 35387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 71460 - 71540
Alignment:
Q  144 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71460 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagtacctaa 71540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 71074 - 71215
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||       ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  71074 tcatcaacatattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca-atca-------agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 71163  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||| | |||||  |||||||||||    
T  71164 ttgatcattcaataatatttaaaataatgcatttaatcataaaatcacatta 71215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 414145 - 413929
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||       |||||  |||||||||| ||| ||| |    
T  414145 agacgcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattc-gtttcaacaacatctagatca 414047  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  ||||||| |||||| |||    
T  414046 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccagttaacatcttatata 413947  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
     || || ||| |||||||    
T  413946 tgtttctttactacctaa 413929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 139736 - 139941
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||| | | |  ||||||    
T  139736 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaacaacaaa-tcattctcaacaa-ttcttgatcaataatcaataat 139831  T
Q  120 tcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    || ||| || ||||||| || |||  |||  | |||||| |||| || |||||||   |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||     
T  139832 tcgagtaaaggcaatcactccatatttcatttcataatctcttaacaattcataaagccttcacagttctcagtcattatctctaataggtctcactagc 139931  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  139932 acctaaagtt 139941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6100 - 5875
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  6100 tcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 6004  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  6003 ttgatcattcaacaataattcaagtaagtatatttcaatccataattcacttaataatcatttaacaattcataa-agcttcacaattctcagtcaatat 5905  T
Q  199 cttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  5904 cattattaggtctcattagtacctaaagtt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8799
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  8583 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 8682  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8683 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 8782  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    || |||||| |||||||    
T  8783 gtttcattactacctaa 8799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 6686 - 6855
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  6686 tcatgaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatctcatca--agcttaataac-aattca-tttcaacaacatc 6781  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||| |||| |||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  6782 ttgatcattctataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 6855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1014 - 928
Alignment:
Q  97 cttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 183  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  1014 cttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19307 - 19170
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  19307 tttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataatcagcttaatagttcataacagcttcacagat 19208  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
     ||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  19207 ttcatttaacatcttatataggtctcactactacctaa 19170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21584 - 21447
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||  |    
T  21584 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatacaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacaaat 21485  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21484 ttcagttaacatcttaaataggtcacattactacctaa 21447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 80876 - 80810
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  80876 tcatcaacttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataattaaatcacatcaa 80810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 80706 - 80642
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  80706 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagcaatgcatttaatcattaaatcacatta 80642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4320 - 4099
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||   ||||        | ||| ||||||||||||||||||  | |||    
T  4320 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacagcattataattcgataacaacaatttcattttcaacaacttcaaggtta 4221  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  4220 ttcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagattcacatatctcagttaacatcttaaata 4121  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  4120 ggtcacattactacctaaagtt 4099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 920 - 1126
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  920 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatcat 1018  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||||||  ||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  1019 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcaggtca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatag 1117  T
Q  208 gtctcatta 216  Q
    ||| |||||    
T  1118 gtcacatta 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 63878 - 64084
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  63878 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaa-ttcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 63974  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | |||||||||||  ||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  63975 tcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcatagtcattatctttaataggtcacattagt 64074  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  64075 acctaaagtt 64084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34894 - 34791
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  34894 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacaattcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcacattac 34795  T
Q  218 tacc 221  Q
    ||||    
T  34794 tacc 34791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 75762 - 75961
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  75762 catgcaacttagttaaataacattttcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaa-ttcattctcaacaatttcttgaccattcaacaataat 75858  T
Q  120 tcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||| || |||||| ||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||| |||||||    
T  75859 tcaagtaaaggcaatctatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaatatgtcacattagt 75958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 35014 - 34960
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35014 agactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 34960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 207949 - 207768
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaaattcattttc- 91  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||        | ||||||| |||||||||||     
T  207949 tcatcaacttattcatattcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcatatcatatcaacagtataacttcataatatc-aattcattttca 207851  T
Q  92 aacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  207850 aacaacaacttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 207768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6508 - 6294
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| |||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  6508 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggaagatcacaacaatagcataatttcataatatcaattcattt-caacaacatcttgatcat 6410  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | | |||||| |||| || |||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  6409 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaagttagcagttca-aacagcttcacatatttcagttaacatcttaaatag 6311  T
Q  208 gtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  6310 gtcacattactacctaa 6294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10131 - 9990
Alignment:
Q  21 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ct---taatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||   ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  10131 atgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatc-aattca-tttcaacaacatcttgatcattcaa 10034  T
Q  113 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  10033 taatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 9990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 2927 - 3074
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agct---taatatcaaattcattttcaacaacttcttgatt 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||   |||||||||  | | |||||||||| |||||||     
T  2927 agacttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaatataactttataatatcaa--ttaatttcaacaacatcttgatc 3024  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  3025 attcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 3074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19826 - 19613
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaa-------ttcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||   |||  ||| |       ||||||||||||||| ||  | ||||    
T  19826 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacacttcattttcaacaacatcaaggttat 19727  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  19726 tcaagaataaacccagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaactgcttagcaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaagtag 19627  T
Q  208 gtctcattagtacc 221  Q
    ||| ||||| ||||    
T  19626 gtcacattactacc 19613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15304 - 15091
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaa-------ttcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||||   |||  ||| |       ||||||||||||||| ||  | ||||    
T  15304 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcatcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacacttcattttcaacaacatcaaggttat 15205  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 207  Q
    |||| |||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  15204 tcaagaataaacccagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaactgcttagcaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaagtag 15105  T
Q  208 gtctcattagtacc 221  Q
    ||| ||||| ||||    
T  15104 gtcacattactacc 15091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 193034
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcata 193034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9426 - 9651
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | |||| | ||   | |||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  9426 tcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagtataattaaatcataacag--gtttaataacaaat-cattctcaacaatttc 9522  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||  |||  | |||||| |||| || ||||| | | ||||||||||| |||| | ||||    
T  9523 ttgatcattcaataataattcaagtaaaggcaatcaattcatatttcatttcataatctcttaacagttcatgaaaacttcacagttcacagtcattatc 9622  T
Q  200 ttaaataggtctcattagtacctaaagtt 228  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  9623 tttaataggtcacattagtacctaaagtt 9651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 73861 - 73725
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--atca----aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |  ||||    |||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  73861 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcat 73763  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  73762 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatc 73725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15430 - 15300
Alignment:
Q  89 ttcaacaacttcttgattattcaataataattc--aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagtt 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15430 ttcaacaacatcttgaatattcaa--ataattcttaagtaatgca-taaaacattatatcacattataatcacttatcatttcacaatagcttcacagtt 15334  T
Q  187 ctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacc 221  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||    
T  15333 ctcagttaacat-tttaatatgtctcattagtacc 15300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 7493 - 7709
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  7493 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacagcaacatcataatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagatca 7591  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | ||  |||||| ||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |  ||||||| |||||| |||    
T  7592 ttcaagaataattcaagtaatgcatttattcgttaaatcgcattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacagattccagttaacatcttatata 7691  T
Q  207 ggtctcattagtacctaa 224  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  7692 ggtttcattactacctaa 7709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 311 - 520
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||     | ||| ||| ||  ||||   |||||||||| ||||||| |    
T  311 agactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacaatataacttcataacaacaatttcatttcaacaacatcttgatca 410  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 206  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||           | |||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  411 ttcaataatatttaaagtaatgcaattattca-----------tgtaatcagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 499  T
Q  207 ggtctcattagtacctaaagt 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  500 ggtcacattactacctaaagt 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 77271 - 77045
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  77271 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 77175  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatat 198  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||  | | | |||    
T  77174 ttgatcattcaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttcataatcattat 77076  T
Q  199 cttaaataggtctcatta-gtacctaaagtt 228  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  77075 ctttaataggtcacactatgtacctaaagtt 77045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 18259 - 18295
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18259 gactcatgcaacatagttaattaacaatagcagcata 18295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30836 - 30619
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca----gcttaatatca--aattcattttcaacaacttcttgattatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||     ||| ||| ||  |||||| ||||||| || |||| || |||    
T  30836 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcggatcacaacaacattatacttcataacaacaattca-tttcaactacatctttatcatt 30738  T
Q  110 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||| | |||| || | ||| |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  30737 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagaagttca-aacaactttacagatttcagttaacatcttaaatagg 30639  T
Q  209 tctcattagtacctaaagtt 228  Q
    |||||  | |||||||||||    
T  30638 tctcacaactacctaaagtt 30619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 1882 - 2005
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  1882 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaatcacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaa-tcattctcaatagtttc 1978  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaa 127  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||    
T  1979 ttgatcattcaacaacaattcaagtaa 2005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 36331 - 36536
Alignment:
Q  20 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataataat 119  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||| | | || || |||    
T  36331 catgcaacttaattaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaat-cattcttaacaa-ttcttgatcaattaacaacaat 36426  T
Q  120 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |   |||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||     
T  36427 ttgggtaatggcaatcaatccatatttcacttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctctaataggtctcactagc 36526  T
Q  219 acctaaagtt 228  Q
    ||||||||||    
T  36527 acctaaagtt 36536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7061 - 6956
Alignment:
Q  120 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 218  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  7061 tcaagtaatgcaattaatcattaaatctcattataatcagcttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcacattact 6962  T
Q  219 acctaa 224  Q
    ||||||    
T  6961 acctaa 6956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 192339 - 192198
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagctt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||  | ||||||| | |||    
T  192339 aattcattttcaacaacatcaaggtaattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaaaaattcataacaactt 192240  T
Q  180 cacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacc 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  192239 cacagatctcagttaacatcttaaataggtcacattactacc 192198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 374 - 580
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttc 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | || | ||||| |||| |||| || |||    
T  374 tcatcaacttattcataatcatgcaacttaattaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcag--gttaaacaacaaat-cattctcaataatttc 470  T
Q  101 ttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    || || |||||| ||||||||||             || |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  471 ttaatcattcaacaataattcaa-------------tccataattcacttcataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatatct 556  T
Q  201 taaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  557 ttaataggtttcattagtacctaa 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2531 - 2311
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttg-att 106  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| || ||||||| ||  | |||    
T  2531 agactcatgcaatttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcaatt-caacaacatcaaggatt 2433  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||| | ||    
T  2432 attcaagaataaatcaagtaatgtatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagattccagttaacatctaagat 2333  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagt 227  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  2332 aggtttcattactacctaaagt 2311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10391 - 10171
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttg-att 106  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||       |||||| || ||||||| ||  | |||    
T  10391 agactcatgcaatttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcaatt-caacaacatcaaggatt 10293  T
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaat 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||| | ||    
T  10292 attcaagaataaatcaagtaatgtatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagattccagttaacatctaagat 10193  T
Q  206 aggtctcattagtacctaaagt 227  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  10192 aggtttcattactacctaaagt 10171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 9340 - 9406
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9340 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 9406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 3872 - 3980
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| ||||||| |    
T  3872 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcaattaatatcttatataggtcac 3971  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  3972 attactacc 3980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 8303 - 8411
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| ||||||| |    
T  8303 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcaattaatatcttatataggtcac 8402  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  8403 attactacc 8411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13969
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtc 210  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| || |||||||    
T  14061 ttcaagtaattcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagatttcagttaacatcctatataggtc 13969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14181 - 14127
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14181 agactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 14127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 15343 - 15409
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15343 tcatcaacttattcataattatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 15409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 2974 - 3040
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2974 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcacag 3040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 6640 - 6706
Alignment:
Q  119 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  6640 ttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcacag 6706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Original strand, 2854 - 2907
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 68  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2854 agactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatcacaacaac 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Original strand, 6520 - 6573
Alignment:
Q  15 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 68  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6520 agactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatcacaacaac 6573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 8505 - 8571
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  8505 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatcaa 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 15649 - 15715
Alignment:
Q  1 tcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 67  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15649 tcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatcaa 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Original strand, 32565 - 32636
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacag 184  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32565 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacag 32636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Original strand, 32459 - 32491
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagc 49  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32459 actcatgcaacatagttaattaacaatagcagc 32491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7173
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||    ||||    
T  7364 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacattataatttcatcacaacaattcattttcaacaacatcaaagttat 7265  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatct 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||    ||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  7264 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatctttaaatcacattacaacagtttaacttttcataacagcctcacagatctcagttaacatct 7173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16762 - 16696
Alignment:
Q  2 catcaacttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 68  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  16762 catcaacttattcataatcatgcgacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcatatcaac 16696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38573 - 38451
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatta 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||         ||||||||||| |||| |||||||||| |||| || |    
T  38573 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaatttca-tttcaacaacatcttaatca 38475  T
Q  108 ttcaataataattcaagtaatgca 131  Q
    ||||||||||  | ||||||||||    
T  38474 ttcaataatatcttaagtaatgca 38451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11586 - 11456
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  11586 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 11494  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  11493 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 11456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14172 - 14042
Alignment:
Q  17 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgattattcaataat 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  14172 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaa-ttcattt----caacatcttgatcattcaataat 14080  T
Q  117 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  14079 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 14042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14420 - 14353
Alignment:
Q  107 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  14420 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 14353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4898 - 4841
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt 73  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4898 gactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagctt 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 1817 - 2029
Alignment:
Q  18 ctcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattattc 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||   |||  |||       ||||||||| ||| ||| || | || ||||    
T  1817 ctcatgcaacttagttaaataacaaaggcagcataatcagaccacaacaacattataagttcataaccacaattcattt-caataacatcgttatcattc 1915  T
Q  111 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||  | ||| |||| |||||| ||||||    
T  1916 aataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacatatttcatttaacatcttatataggt 2014  T
Q  210 ctcattagtacctaa 224  Q
    |||| || |||||||    
T  2015 ctcactactacctaa 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 2191 - 2313
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca-------aattcattttcaacaacttcttgattat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| || ||   |||| |||       ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  2191 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcaaatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 2290  T
Q  109 tcaataataattcaagtaatgca 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  2291 tcaagaataattcaagtaatgca 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 152
Target Start/End: Original strand, 11473 - 11544
Alignment:
Q  81 aattcattttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 152  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  11473 aattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 11544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 6118 - 6171
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6118 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 6171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15658 - 15550
Alignment:
Q  115 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcac--ttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctc 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||    
T  15658 ataattcaagtaatgcaattaatcattatctcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttatataggtctc 15559  T
Q  213 attagtacc 221  Q
    |||| ||||    
T  15558 attactacc 15550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15773 - 15737
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 52  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15773 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 15737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 33649 - 33694
Alignment:
Q  88 tttcaacaacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaat 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33649 tttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaatgcaat 33694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16389
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcatatcacaacaaca 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21897 - 21844
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21897 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 21844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29789 - 29736
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  29789 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 29736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21740 - 21684
Alignment:
Q  168 tcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21740 tcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtctcattactacctaa 21684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29632 - 29576
Alignment:
Q  168 tcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacctaa 224  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29632 tcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtctcattactacctaa 29576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 14687 - 14740
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  14687 gactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 23702 - 23755
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  23702 gactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 23755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 39126 - 39179
Alignment:
Q  16 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 69  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  39126 gactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 39179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 174952 - 175005
Alignment:
Q  168 tcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagtacc 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  174952 tcataatagcttcacagatttcagttaacttcttatataggtctcattactacc 175005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Original strand, 488 - 548
Alignment:
Q  94 caacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  488 caacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32675 - 32615
Alignment:
Q  94 caacttcttgattattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 154  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  32675 caacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 32615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University