View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3274_low_8 (Length: 268)

Name: NF3274_low_8
Description: NF3274
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3274_low_8
NF3274_low_8
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (4-265)||(22907214-22907476)
chr8 (4-169)||(5238184-5238350)
chr8 (4-169)||(24661248-24661414)
chr8 (4-169)||(43685643-43685809)
chr8 (2-266)||(16193714-16193980)
chr8 (1-254)||(24928788-24929043)
chr8 (16-265)||(43373480-43373731)
chr8 (4-265)||(16404975-16405235)
chr8 (4-254)||(17345581-17345832)
chr8 (16-261)||(6774258-6774505)
chr8 (16-261)||(24548986-24549233)
chr8 (38-136)||(21844594-21844692)
chr8 (38-136)||(21851987-21852085)
chr8 (16-136)||(30120854-30120974)
chr8 (16-136)||(16674392-16674512)
chr8 (154-248)||(23837214-23837308)
chr8 (20-61)||(23226076-23226117)
chr8 (79-265)||(222754-222943)
chr8 (79-265)||(736377-736566)
chr8 (79-265)||(860272-860461)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (4-265)||(26680201-26680463)
chr4 (5-265)||(15675090-15675352)
chr4 (4-169)||(10488659-10488825)
chr4 (4-169)||(16327926-16328092)
chr4 (31-265)||(31115629-31115865)
chr4 (4-265)||(54118244-54118507)
chr4 (4-265)||(13246430-13246693)
chr4 (2-136)||(122020-122154)
chr4 (5-201)||(10104251-10104449)
chr4 (4-136)||(13048221-13048353)
chr4 (38-265)||(10644219-10644449)
chr4 (5-66)||(33240901-33240962)
chr4 (167-265)||(111395-111493)
chr4 (16-265)||(47357654-47357906)
chr4 (20-201)||(40885570-40885753)
chr4 (154-248)||(41166083-41166177)
chr4 (220-265)||(10104449-10104494)
chr4 (154-241)||(15044851-15044938)
chr4 (154-266)||(52265645-52265758)
chr4 (154-218)||(13809647-13809711)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (4-265)||(37066-37328)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (4-265)||(7293017-7293279)
chr7 (4-169)||(11516324-11516490)
chr7 (4-169)||(15441564-15441730)
chr7 (4-169)||(30262129-30262295)
chr7 (4-265)||(47481031-47481294)
chr7 (4-260)||(11580739-11580997)
chr7 (4-265)||(13037014-13037277)
chr7 (4-265)||(36052667-36052927)
chr7 (11-265)||(18253842-18254098)
chr7 (2-263)||(16211768-16212031)
chr7 (2-265)||(3059966-3060231)
chr7 (5-265)||(13321014-13321278)
chr7 (4-136)||(25292338-25292470)
chr7 (39-265)||(16478985-16479213)
chr7 (38-136)||(13572808-13572906)
chr7 (16-136)||(10989541-10989661)
chr7 (38-128)||(13911046-13911136)
chr7 (38-135)||(2437590-2437687)
chr7 (11-132)||(295973-296094)
chr7 (4-46)||(14113989-14114031)
chr7 (4-46)||(14423639-14423681)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (1-265)||(16744112-16744377)
chr3 (4-265)||(17912483-17912744)
chr3 (4-265)||(15859024-15859287)
chr3 (4-169)||(2449238-2449404)
chr3 (2-266)||(51158016-51158282)
chr3 (1-254)||(13838905-13839160)
chr3 (1-265)||(14842558-14842824)
chr3 (11-265)||(15936634-15936890)
chr3 (2-265)||(2049810-2050075)
chr3 (2-265)||(12030145-12030410)
chr3 (11-262)||(15938476-15938729)
chr3 (4-136)||(13975722-13975853)
chr3 (4-136)||(45860937-45861068)
chr3 (4-136)||(13954890-13955021)
chr3 (16-261)||(15614838-15615085)
chr3 (38-265)||(16821139-16821369)
chr3 (156-265)||(47984650-47984759)
chr3 (156-265)||(48003224-48003333)
chr3 (16-136)||(55316351-55316471)
chr3 (4-66)||(19231982-19232044)
chr3 (156-265)||(47993937-47994046)
chr3 (156-265)||(48012510-48012619)
chr3 (16-136)||(41270207-41270327)
chr3 (20-61)||(14080715-14080756)
chr3 (148-265)||(12264932-12265049)
chr3 (2-50)||(19260821-19260869)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (4-169)||(20623066-20623232)
chr5 (4-169)||(21233528-21233694)
chr5 (4-166)||(37052844-37053007)
chr5 (5-265)||(18531068-18531330)
chr5 (4-169)||(16536294-16536460)
chr5 (5-265)||(22053834-22054096)
chr5 (2-265)||(23506965-23507230)
chr5 (6-169)||(25900408-25900571)
chr5 (4-265)||(27182547-27182810)
chr5 (4-254)||(34939289-34939540)
chr5 (16-136)||(29188284-29188404)
chr5 (38-134)||(27009975-27010071)
chr5 (38-265)||(4200007-4200237)
chr5 (16-265)||(22366481-22366733)
chr5 (16-265)||(25426628-25426880)
chr5 (38-265)||(18778014-18778244)
chr5 (38-136)||(43443417-43443515)
chr5 (16-265)||(12374-12626)
chr5 (16-136)||(19500031-19500151)
chr5 (16-265)||(21073595-21073847)
chr5 (154-265)||(23493917-23494029)
chr5 (154-218)||(7728466-7728530)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (4-169)||(19689401-19689567)
chr2 (4-169)||(23820168-23820334)
chr2 (4-265)||(36982441-36982704)
chr2 (4-169)||(14906440-14906606)
chr2 (4-265)||(19794704-19794967)
chr2 (4-169)||(20015108-20015274)
chr2 (5-265)||(24341390-24341652)
chr2 (5-265)||(43642958-43643220)
chr2 (4-265)||(25265390-25265653)
chr2 (2-260)||(462743-463003)
chr2 (4-265)||(8891242-8891505)
chr2 (1-265)||(20627310-20627576)
chr2 (4-136)||(17396653-17396784)
chr2 (54-265)||(7507894-7508107)
chr2 (16-265)||(19886661-19886913)
chr2 (188-248)||(9636761-9636821)
chr2 (188-232)||(24884718-24884762)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (4-265)||(19206-19469)
scaffold0195 (4-265)||(21290-21553)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (4-169)||(26892-27058)
scaffold0141 (11-169)||(22637-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (4-169)||(1582-1748)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (4-169)||(51452589-51452755)
chr1 (1-265)||(41394222-41394488)
chr1 (2-265)||(20931345-20931610)
chr1 (4-265)||(20445679-20445942)
chr1 (4-265)||(20531444-20531707)
chr1 (4-265)||(20893626-20893889)
chr1 (6-265)||(20913037-20913291)
chr1 (4-265)||(37844450-37844714)
chr1 (38-261)||(2116258-2116484)
chr1 (54-265)||(22227809-22228022)
chr1 (54-265)||(22232506-22232719)
chr1 (38-136)||(45051554-45051652)
chr1 (38-136)||(18601140-18601238)
chr1 (16-136)||(5072388-5072508)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (5-265)||(8849-9111)
scaffold0025 (11-265)||(148721-148977)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (2-265)||(1124-1389)
scaffold0266 (1-263)||(3579-3843)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (4-265)||(36913-37176)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-265)||(953-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (2-265)||(48598-48863)
scaffold0023 (38-136)||(36225-36323)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-265)||(48187-48443)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-265)||(12115-12379)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (4-265)||(13506-13769)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (1-261)||(14626115-14626377)
chr6 (4-254)||(23153458-23153710)
chr6 (4-265)||(35009439-35009702)
chr6 (4-254)||(1657748-1657999)
chr6 (4-254)||(15862484-15862734)
chr6 (16-261)||(1650105-1650352)
chr6 (44-265)||(25175563-25175787)
chr6 (162-265)||(27740838-27740941)
chr6 (4-87)||(27751605-27751688)
chr6 (16-265)||(27653983-27654235)
chr6 (155-248)||(18381821-18381914)
chr6 (4-201)||(29665937-29666137)
chr6 (178-265)||(22361926-22362014)
chr6 (154-218)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (4-265)||(123164-123427)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-254)||(171916-172171)
scaffold0001 (1-254)||(177619-177874)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-265)||(6061-6326)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (11-265)||(107747-108003)
scaffold0026 (73-136)||(64585-64648)
scaffold0026 (19-61)||(89863-89905)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (4-265)||(41648-41911)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (2-261)||(41733-41994)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (4-265)||(5061-5324)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (2-265)||(128167-128431)
scaffold0008 (38-128)||(31697-31787)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (4-254)||(247442-247694)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-265)||(26422-26678)
scaffold0162 (4-265)||(8180-8440)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (4-265)||(534-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (11-136)||(5660-5785)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (2-265)||(8878-9143)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (4-265)||(34460-34724)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-259)||(272031-272291)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-136)||(51180-51314)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (38-261)||(9371-9596)
scaffold0215 (38-261)||(16269-16494)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (4-136)||(89454-89586)
scaffold0028 (4-55)||(107784-107835)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (15-261)||(2966-3215)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (54-265)||(5254-5466)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (38-136)||(13347-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (38-136)||(167-265)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (167-265)||(9382-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (54-265)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (39-265)||(42997-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (38-136)||(14083-14181)
scaffold0139 (38-133)||(21138-21233)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (16-136)||(1304-1424)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (54-265)||(54416-54630)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (4-87)||(3370-3453)
scaffold0361 (211-263)||(3210-3262)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (176-265)||(48514-48603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (154-241)||(197390-197477)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (188-265)||(104793-104871)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (187-248)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (20-61)||(1546-1587)
scaffold0456 (20-61)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (20-61)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (11-129)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (20-61)||(70307-70348)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (177-241)||(2548-2612)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 16193714 - 16193980
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||     
T  16193714 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttc 16193813  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  16193814 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 16193913  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgt 266  Q
     | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16193914 ggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24928788 - 24929043
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  24928788 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24928887  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| |||     
T  24928888 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggtta 24928987  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
    | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  24928988 tggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 43373480 - 43373731
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  43373480 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 43373579  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 213  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||    
T  43373580 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgat 43373679  T
Q  214 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43373680 gttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 16404975 - 16405235
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  16404975 atggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 16405074  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16405075 ataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattg 16405171  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16405172 ttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 213  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  214 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 213  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  214 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844692
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852085
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120854
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 248  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  79 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 175  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  176 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  79 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 175  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  176 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  79 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 175  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  176 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 15675090 - 15675352
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||     
T  15675090 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 15675189  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  15675190 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgt 15675289  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15675290 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  31 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  131 ttgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 228  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  229 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 54118244 - 54118507
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  54118244 atggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 54118343  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  54118344 ataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatag 54118443  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  54118444 ttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13246693 - 13246430
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13246693 atggataattgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13246594  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  13246593 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 13246494  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13246493 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 122154 - 122020
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  122154 ttatggataattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 122055  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  122054 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 10104251 - 10104449
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||     
T  10104251 tggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 10104350  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104351 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048353
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644219
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  137 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 234  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 10644250  T
Q  235 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10644249 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 33240962 - 33240901
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 66  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240962 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  167 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 118  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  119 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 248
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 248  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  220 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 241  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 266
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 252  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  253 tggattgatgatgt 266  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 218  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 200  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  201 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | |  |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 11580739 - 11580997
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  11580739 atggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 11580838  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  11580839 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 11580938  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattga 260  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  11580939 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 13037014 - 13037277
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||    
T  13037014 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaa 13037113  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |      
T  13037114 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatga 13037213  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13037214 atattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36052927 - 36052667
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  36052927 atggataattgttgctaaatttatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaa 36052828  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  36052827 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtgg 36052731  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36052730 ttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16212031 - 16211768
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| ||||||     
T  16212031 ttatggacaattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttc 16211932  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| |    
T  16211931 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttat 16211832  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 263  Q
     | || |||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  16211831 ggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3060231 - 3059966
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| | ||| ||||||     
T  3060231 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttc 3060132  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  3060131 aaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 3060033  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  3060032 tgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--a 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  103 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479213
Alignment:
Q  39 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  138 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 236  Q
    ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |    
T  16479085 aattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgct 16479184  T
Q  237 tgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16479185 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572808
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989541
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911136
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437590
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 295973 - 296094
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||||||||||| ||| || || |  | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||    
T  295973 attgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgta 296072  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaatt 132  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  296073 aaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 46  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 46  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 16744112 - 16744377
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  16744112 attatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttt 16744211  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744212 taaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 16744311  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16744312 tgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 15859024 - 15859287
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  15859024 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 15859123  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  15859124 atatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 15859223  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15859224 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 51158016 - 51158282
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||     
T  51158016 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 51158115  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  51158116 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 51158215  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgt 266  Q
     | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  51158216 ggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13839160 - 13838905
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  13839160 attatgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  13839060 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 13838961  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
    | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13838960 tggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 14842558 - 14842824
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  14842558 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgtt 14842657  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  14842658 caaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 14842757  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14842758 tggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2050075 - 2049810
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  2050075 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 2049976  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| | |||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  2049975 aaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctat 2049876  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2049875 ggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 12030145 - 12030410
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  12030145 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 12030244  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | |    
T  12030245 aaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctat 12030344  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     | || |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12030345 ggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatg 262  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955021
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgc 13955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614838
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 213  Q
    || ||||| |||| || ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 15614886  T
Q  214 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15614885 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821139
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  137 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 234  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  235 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  156 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 255  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  256 attgatgatg 265  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  156 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 255  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  256 attgatgatg 265  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316351
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19232044 - 19231982
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 66  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232044 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  156 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 255  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  256 attgatgatg 265  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  156 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 255  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  256 attgatgatg 265  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270207
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265049
Alignment:
Q  148 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 247  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  248 attcatggattgatgatg 265  Q
    | | ||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 19260821 - 19260869
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgttt 50  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  19260821 ttatggataattgttgctaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 166  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 18531068 - 18531330
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||     
T  18531068 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 18531167  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  18531168 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 18531266  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18531267 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 22053834 - 22054096
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| ||     
T  22053834 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 22053933  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  22053934 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 22054033  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22054034 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23507230 - 23506965
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||     
T  23507230 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 23507131  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  23507130 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 23507031  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     | || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23507030 ggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  6 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  106 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 27182547 - 27182810
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||    
T  27182547 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaa 27182646  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  27182647 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 27182746  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27182747 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009975
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200237
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  137 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 234  Q
    |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  235 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778244
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  137 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 234  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  235 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443515
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500031
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 252  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  253 tggattgatgatg 265  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 218  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 36982441 - 36982704
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||    
T  36982441 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaa 36982540  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  36982541 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 36982640  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36982641 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 19794704 - 19794967
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  19794704 atggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 19794803  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||     
T  19794804 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttattt 19794903  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
      | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794904 ccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 24341390 - 24341652
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| ||     
T  24341390 tggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaat 24341489  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  24341490 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgt 24341589  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    || |||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24341590 tgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 43642958 - 43643220
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||    
T  43642958 tggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 43643057  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    || | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||     
T  43643058 taggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgc 43643157  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43643158 tgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 463003 - 462743
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  463003 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 462904  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  462903 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 462805  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattga 260  Q
    | | || |||| ||||| ||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  462804 tggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8891505 - 8891242
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||    
T  8891505 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaa 8891406  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  8891405 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 8891306  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  8891305 ctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 20627310 - 20627576
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||     
T  20627310 attatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtc 20627409  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| ||     
T  20627410 caaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgatttta 20627509  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | | || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  20627510 tggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 151  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  152 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 249  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  250 tcatggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  188 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 248  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  188 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19469 - 19206
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  19469 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 19370  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  19369 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 19270  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19269 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 169  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41394488 - 41394222
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||    
T  41394488 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgtt 41394389  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  |||||||||||     
T  41394388 caaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgtta 41394289  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394288 ttgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20931610 - 20931345
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  20931610 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 20931511  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  20931510 atatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 20931411  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     | || |||| |||||||| |||||||||| ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20931410 ggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20445942 - 20445679
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  20445942 atggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 20445843  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | |    
T  20445842 gtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatgg 20445743  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20445742 ctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20531707 - 20531444
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  20531707 atggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 20531608  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | |    
T  20531607 gtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatgg 20531508  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20531507 ctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 20893626 - 20893889
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||    
T  20893626 atggataattgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaa 20893725  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |      
T  20893726 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatga 20893825  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20893826 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20913291 - 20913037
Alignment:
Q  6 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||    
T  20913291 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatat 20913192  T
Q  106 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgat 203  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | |    
T  20913191 atgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggtt 20913099  T
Q  204 gctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | |||| ||| |||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20913098 gttaattgatcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 37844450 - 37844714
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  37844450 atggataattgttgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 37844549  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagtta-tgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 200  Q
     || | | |||||| ||  || ||||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  37844550 gtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 37844649  T
Q  201 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  37844650 gttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116258
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 2116385  T
Q  137 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 234  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2116384 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 2116285  T
Q  235 tttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2116284 cttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 151  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  152 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 251  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  252 atggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 151  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  152 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 251  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  252 atggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601238
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072508
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9111 - 8849
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||     
T  9111 tggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 9012  T
Q  105 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 202  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||     
T  9011 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgc 8912  T
Q  203 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |  |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8911 tattaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 148977 - 148721
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  148977 attgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 148878  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||    
T  148877 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaa 148778  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  148777 ttgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1389 - 1124
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||     
T  1389 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 1290  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  1289 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 1190  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     | || |||| ||| |||| |||||||||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  1189 ggttgttaattgatattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 3579 - 3843
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  3579 attatagataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3678  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  3679 caaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 3778  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 263  Q
    | |||| |||| ||||||||  |||| |||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3779 tggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 36913 - 37176
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||    
T  36913 atggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaa 37012  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | |    
T  37013 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatgg 37112  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37113 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 953 - 1218
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  953 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1052  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| |||||||     
T  1053 caaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgtta 1151  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1152 tggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48863 - 48598
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||     
T  48863 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 48764  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  48763 aaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 48664  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     | |  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48663 ggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36225
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12379 - 12115
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||    
T  12379 attatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtt 12280  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  12279 taaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgtta 12182  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |  ||| |||| |||||| |  || |||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12181 tgaatgttaattgatgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 14626115 - 14626377
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  14626115 attatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 14626214  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgtt 197  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  14626215 caaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgtt 14626313  T
Q  198 gttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
     | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  14626314 atggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23153710 - 23153458
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  23153710 atggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 23153611  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | |    
T  23153610 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatgg 23153511  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23153510 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650352
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 213  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  214 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175563
Alignment:
Q  44 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  143 atgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttggg 240  Q
     |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  241 tatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  162 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  262 gatg 265  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 87  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 212  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  213 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 248
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  155 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 248  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt-- 101  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  200 tg 201  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 265
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  178 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 265  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 218  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 123164 - 123427
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  123164 atggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 123263  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  123264 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 123363  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  123364 ttgttaattgatgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 172171 - 171916
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  172171 attatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 172072  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  172071 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgtta 171972  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
    | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  171971 tggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 177874 - 177619
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  177874 attatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 177775  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  177774 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgtta 177675  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
    | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  177674 tggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 6061 - 6326
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  6061 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||     
T  6161 caaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtta 6259  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | |||| ||||   |||| |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6260 tggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64648
Alignment:
Q  73 tgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  19 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 200  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  201 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41994 - 41733
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| |     
T  41994 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctc 41895  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | |    
T  41894 aaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctat 41795  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
     | || |||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41794 ggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 5061 - 5324
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||    
T  5061 atggataattgttgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaa 5160  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  5161 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 5260  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  5261 ctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 128167 - 128431
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  128167 ttatggataattgttgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 128266  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    |||| |||| |  ||  ||||| |||||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  128267 aaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttat 128365  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |||| |||| ||||||||  ||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  128366 ggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31787
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 31787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 247442 - 247694
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||    
T  247442 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaa 247541  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |      
T  247542 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatga 247641  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 254  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  247642 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 26422 - 26678
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| |||||||||    
T  26422 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgta 26521  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 208  Q
     |||||| ||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||    
T  26522 aaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 26621  T
Q  209 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  26622 ttgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8440
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 201  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  202 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  111 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9143 - 8878
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  9143 ttatggaaaattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 9044  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 199  Q
    || |||||| |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  9043 aattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 8944  T
Q  200 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
     |||| |||| ||||||||  ||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8943 ggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgtt 200  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  201 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    | || || | |||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 272291 - 272031
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 100  Q
    ||||||||| | | |||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| ||||||    
T  272291 attatggataaatattgctaaatacgtactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgtt 272192  T
Q  101 taaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttg 198  Q
     ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||     
T  272191 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgtta 272092  T
Q  199 ttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattg 259  Q
    | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  272091 tagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 51180 - 51314
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||||     
T  51180 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 51279  T
Q  102 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51280 aaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9596
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  137 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 235  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  236 ttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16494
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  137 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 235  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  236 ttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 89454 - 89586
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  89454 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 89553  T
Q  104 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||| | | |||| | ||||| ||||||||||||    
T  89554 ataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 107784 - 107835
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatg 55  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107784 atggataatttttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  15 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 114  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  115 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 211  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  212 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 261  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-ttt 150  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  151 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 250  Q
    |    ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  251 catggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 167
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  167 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgt-agaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-ttt 150  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||| | |||| |||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  151 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 250  Q
    |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  251 catggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42997
Alignment:
Q  39 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 137  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  138 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 235  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  236 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21233
Alignment:
Q  38 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  16 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 115  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  116 gagaagttatgaaaattgtgc 136  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54416
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 150  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  151 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 249  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  250 tcatggattgatgatg 265  Q
    | ||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3370
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 87  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3210
Alignment:
Q  211 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 263  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  176 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197477
Alignment:
Q  154 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 241  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 197477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  188 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  187 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  11 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatg 108  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  109 tagaaatgagaagttatgaaa 129  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  20 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  177 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 241  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University