View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3276_low_15 (Length: 319)

Name: NF3276_low_15
Description: NF3276
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3276_low_15
NF3276_low_15
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (1-300)||(26830367-26830666)
chr6 (7-301)||(3808950-3809245)
chr6 (1-300)||(21593292-21593589)
chr6 (1-300)||(17762613-17762914)
chr6 (6-300)||(2973182-2973477)
chr6 (25-300)||(5043278-5043552)
chr6 (73-300)||(603323-603550)
chr6 (11-300)||(22425070-22425358)
chr6 (90-286)||(17757797-17757995)
chr6 (43-239)||(26800438-26800634)
chr6 (7-263)||(25072817-25073072)
chr6 (213-294)||(5741040-5741120)
chr6 (6-47)||(26661580-26661621)
chr6 (6-47)||(26767551-26767592)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-300)||(26363891-26364190)
chr4 (7-300)||(6655588-6655881)
chr4 (7-300)||(54882652-54882945)
chr4 (1-300)||(8665032-8665332)
chr4 (7-300)||(50674089-50674382)
chr4 (7-297)||(55085611-55085902)
chr4 (7-269)||(40630616-40630878)
chr4 (7-300)||(50262941-50263234)
chr4 (24-300)||(12073042-12073317)
chr4 (1-300)||(41964042-41964340)
chr4 (1-300)||(27417204-27417493)
chr4 (9-300)||(46703135-46703424)
chr4 (25-300)||(379028-379303)
chr4 (27-300)||(35662094-35662365)
chr4 (7-300)||(2209340-2209638)
chr4 (4-261)||(46569828-46570085)
chr4 (14-300)||(33989501-33989786)
chr4 (102-300)||(8647865-8648063)
chr4 (9-300)||(22882997-22883287)
chr4 (9-300)||(22934661-22934951)
chr4 (1-160)||(8653225-8653385)
chr4 (1-184)||(10071510-10071693)
chr4 (7-300)||(35370581-35370874)
chr4 (7-300)||(3785722-3786014)
chr4 (58-300)||(33089582-33089812)
chr4 (12-300)||(26699689-26699979)
chr4 (7-300)||(35369684-35369971)
chr4 (32-218)||(38811404-38811590)
chr4 (116-300)||(12119281-12119462)
chr4 (86-300)||(34112323-34112536)
chr4 (67-169)||(10071963-10072065)
chr4 (28-130)||(32091222-32091326)
chr4 (7-202)||(25723557-25723752)
chr4 (22-159)||(47514885-47515023)
chr4 (119-300)||(41961152-41961335)
chr4 (33-286)||(22629147-22629399)
chr4 (113-174)||(6719324-6719384)
chr4 (220-296)||(32091324-32091399)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (1-300)||(40146887-40147186)
chr5 (1-290)||(213094-213384)
chr5 (7-300)||(38746637-38746930)
chr5 (10-300)||(27015168-27015457)
chr5 (25-300)||(5057698-5057972)
chr5 (5-300)||(28277943-28278241)
chr5 (1-300)||(27637857-27638156)
chr5 (1-213)||(16642208-16642419)
chr5 (1-300)||(316385-316687)
chr5 (9-300)||(14689654-14689942)
chr5 (13-263)||(35615809-35616059)
chr5 (25-300)||(4160284-4160557)
chr5 (80-285)||(33906288-33906491)
chr5 (13-216)||(30802579-30802782)
chr5 (7-208)||(30792872-30793072)
chr5 (12-218)||(10055031-10055238)
chr5 (214-300)||(16641184-16641269)
chr5 (119-300)||(21205896-21206076)
chr5 (9-96)||(33906578-33906665)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (1-300)||(1631975-1632274)
chr2 (1-300)||(45726556-45726854)
chr2 (1-300)||(35447127-35447426)
chr2 (24-300)||(42288353-42288628)
chr2 (5-298)||(17450221-17450513)
chr2 (1-233)||(7450926-7451158)
chr2 (24-280)||(33647817-33648075)
chr2 (12-296)||(24397701-24397977)
chr2 (7-295)||(42261859-42262146)
chr2 (7-256)||(30218321-30218570)
chr2 (119-177)||(24197643-24197700)
chr2 (158-263)||(16676027-16676133)
chr2 (219-294)||(43730992-43731066)
chr2 (22-55)||(44750240-44750273)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (7-300)||(6960-7253)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-300)||(11348324-11348623)
chr1 (7-300)||(29135880-29136172)
chr1 (1-300)||(42298218-42298517)
chr1 (7-300)||(37033316-37033605)
chr1 (1-300)||(34603202-34603500)
chr1 (7-300)||(193244-193536)
chr1 (7-300)||(13547332-13547625)
chr1 (7-300)||(13549243-13549536)
chr1 (1-300)||(34602583-34602881)
chr1 (7-300)||(37879154-37879447)
chr1 (1-300)||(19754117-19754419)
chr1 (5-300)||(47255583-47255872)
chr1 (26-300)||(37167948-37168222)
chr1 (6-300)||(7482475-7482768)
chr1 (28-300)||(28242041-28242313)
chr1 (28-300)||(47114825-47115096)
chr1 (1-300)||(19752312-19752610)
chr1 (7-300)||(41135452-41135744)
chr1 (150-300)||(31925949-31926099)
chr1 (12-300)||(6808083-6808371)
chr1 (27-263)||(9109681-9109918)
chr1 (1-148)||(31928203-31928343)
chr1 (70-294)||(16216745-16216966)
chr1 (28-300)||(22078995-22079245)
chr1 (134-301)||(12318724-12318889)
chr1 (157-234)||(4535783-4535861)
chr1 (114-159)||(3331283-3331328)
chr1 (114-207)||(38747052-38747144)
chr1 (212-269)||(25651922-25651979)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (2-300)||(6431598-6431896)
chr7 (1-300)||(4512633-4512931)
chr7 (7-300)||(29608373-29608661)
chr7 (7-300)||(6360155-6360448)
chr7 (1-300)||(34310959-34311259)
chr7 (27-300)||(2389934-2390207)
chr7 (7-300)||(2361214-2361507)
chr7 (9-300)||(48599577-48599858)
chr7 (1-300)||(4508949-4509239)
chr7 (1-300)||(4510791-4511081)
chr7 (5-300)||(22269604-22269898)
chr7 (1-297)||(3258621-3258916)
chr7 (12-300)||(22328642-22328931)
chr7 (1-190)||(32358189-32358378)
chr7 (158-294)||(8359567-8359703)
chr7 (31-292)||(5116290-5116551)
chr7 (7-115)||(30814397-30814505)
chr7 (114-294)||(22552683-22552866)
chr7 (116-291)||(43363667-43363839)
chr7 (219-300)||(1360398-1360478)
chr7 (192-295)||(23794074-23794176)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (7-300)||(49199713-49200007)
chr3 (7-300)||(43402033-43402326)
chr3 (7-300)||(43403976-43404269)
chr3 (24-300)||(34490862-34491138)
chr3 (7-300)||(40912969-40913264)
chr3 (14-300)||(6095842-6096128)
chr3 (7-300)||(4569583-4569876)
chr3 (1-300)||(30235750-30236050)
chr3 (1-300)||(55302208-55302507)
chr3 (1-300)||(54593330-54593629)
chr3 (7-300)||(36018482-36018776)
chr3 (1-300)||(47303877-47304176)
chr3 (24-300)||(41819767-41820040)
chr3 (25-300)||(46860120-46860397)
chr3 (5-247)||(28074247-28074488)
chr3 (12-300)||(5434121-5434410)
chr3 (13-300)||(34795507-34795793)
chr3 (33-300)||(1683146-1683412)
chr3 (14-235)||(26323821-26324042)
chr3 (7-202)||(39127191-39127386)
chr3 (7-83)||(31340501-31340577)
chr3 (7-269)||(35138980-35139250)
chr3 (219-300)||(20937501-20937581)
chr3 (116-171)||(31340448-31340503)
chr3 (233-300)||(26323319-26323385)
chr3 (219-277)||(50432840-50432898)
chr3 (7-40)||(20937375-20937408)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (7-300)||(11190-11483)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (7-300)||(42435234-42435527)
chr8 (1-300)||(11383612-11383911)
chr8 (3-300)||(44353423-44353717)
chr8 (7-300)||(40221376-40221670)
chr8 (7-300)||(4283178-4283449)
chr8 (88-300)||(40328492-40328704)
chr8 (1-231)||(22976160-22976389)
chr8 (27-240)||(2999823-3000037)
chr8 (7-300)||(40585356-40585649)
chr8 (14-144)||(20686456-20686586)
chr8 (220-300)||(18655246-18655326)
chr8 (40-259)||(3846103-3846321)
chr8 (119-263)||(9633817-9633959)
chr8 (37-196)||(3817679-3817840)
chr8 (219-300)||(33655548-33655628)
chr8 (1-69)||(10239714-10239782)
chr8 (61-238)||(40535538-40535713)
chr8 (86-159)||(10020151-10020224)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (9-296)||(80530-80817)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (3-300)||(18244-18540)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (7-295)||(490694-490981)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (1-279)||(1671-1948)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26830666 - 26830367
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830666 actccatgatccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 26830567  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830566 aaggtttaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaaaggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 26830467  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830466 cagatgagcgcagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 26830367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3809245 - 3808950
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  3809245 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 3809146  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt-ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3809145 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacat 3809046  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttg 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3809045 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctttttg 3808950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 21593292 - 21593589
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  21593292 actccataacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggttagaacttttagggttttagatactaaatgttgagggtctttgggt 21593391  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21593392 gaggttcaaagatttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaa 21593491  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21593492 cacatgagtggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttt 21593589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 17762613 - 17762914
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  17762613 actccatggcccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgaggatctttgggt 17762712  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag--aagattcatggggttggga 198  Q
     | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  17762713 gaagttcaaggcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttggga 17762812  T
Q  199 aacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 298  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762813 aacacatgagtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 17762912  T
Q  299 tt 300  Q
    ||    
T  17762913 tt 17762914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2973477 - 2973182
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| || |||    
T  2973477 atgacccatttgttaagagaccttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttgtagatactaaaggttgaaggtctttgggtgagg 2973378  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  2973377 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgcttttttgggaagattcatggggttgggaaacaca 2973278  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973277 tgaatgcagagtcatttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 2973182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 5043278 - 5043552
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  5043278 agcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgaga 5043377  T
Q  125 atcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5043378 atcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtg 5043476  T
Q  225 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5043477 agcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttctcttt 5043552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 603550 - 603323
Alignment:
Q  73 agataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcct 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  603550 agatagtaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgcct 603451  T
Q  173 tttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  603450 tttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 603351  T
Q  273 aatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  603350 aatcaaaggctaatggttggttctcttt 603323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22425358 - 22425070
Alignment:
Q  11 ccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||| |    
T  22425358 ccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttt-agggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgtggttcaga 22425260  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt--ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  22425259 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggataagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatggg 22425160  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     | ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22425159 tgaagagtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttt 22425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 286
Target Start/End: Original strand, 17757797 - 17757995
Alignment:
Q  90 ggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga--agattca 187  Q
    |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |   |||||||    
T  17757797 ggtctttgggtgagattcaaagcttgaagatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggttagattca 17757896  T
Q  188 tggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaag 286  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  17757897 tggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcatcagtgaaatcaaaggctaag 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 26800438 - 26800634
Alignment:
Q  43 gaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaa 141  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26800438 gaaaccaaaggagaaaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcatggataaccaaaa 26800537  T
Q  142 gaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgag 239  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  26800538 gagggggctcttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggtgag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 25072817 - 25073072
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  25072817 tgactcatttgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaagaagtgaacttttagggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 25072916  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcct-tttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||  |||||||| ||||| ||||||| |    
T  25072917 tcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaacccaaag-gggggctctt-ggaaaagggattgtgcctcttgggaagagattcatagggtttggaaacaca 25073014  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
    | |  |||||||| ||| || | ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  25073015 tcaaaggagagtc-tttatgtgaaacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagat 25073072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5741040
Alignment:
Q  213 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggtt 5741040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Original strand, 26661580 - 26661621
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 47  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661580 atgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26661621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Original strand, 26767551 - 26767592
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 47  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767551 atgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26767592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 26363891 - 26364190
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  26363891 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaagggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggcctttgggt 26363990  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363991 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaa 26364090  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26364091 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttt 26364190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 6655588 - 6655881
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  6655588 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6655687  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6655688 caaaactttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 6655787  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6655788 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctcttt 6655881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 54882652 - 54882945
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  54882652 tgactcatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 54882751  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54882752 caaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 54882851  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || | |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882852 agtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 54882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 8665032 - 8665332
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8665032 actccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 8665131  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8665132 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 8665231  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  8665232 acacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttctt 8665331  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  8665332 t 8665332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50674382 - 50674089
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | |||||||||| || |||||    
T  50674382 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttaaatactaaatgttaagggtctttgggtgaggtt 50674283  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50674282 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatg 50674183  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674182 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 50674089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 55085902 - 55085611
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  55085902 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 55085803  T
Q  107 caaaactt-caagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  55085802 aaaagctttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 55085703  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55085702 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctc 55085611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 40630616 - 40630878
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  40630616 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 40630715  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  40630716 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 40630815  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttag 269  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40630816 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50263234 - 50262941
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || |||||    
T  50263234 tgacccatttgttgaaaaagtttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagacactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 50263135  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  50263134 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 50263035  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50263034 agtggagagtcttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttt 50262941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 12073042 - 12073317
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  12073042 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgta 12073141  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttggg-aaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttg 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||    
T  12073142 aatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttg 12073239  T
Q  223 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12073240 tgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttt 12073317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 41964042 - 41964340
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  41964042 actctatgacccatttggtgagaaagtttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggg 41964141  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41964142 tgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--cttttgggaaagattcatggggttgggaa 41964239  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964240 acacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 41964339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27417493 - 27417204
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  27417493 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 27417394  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27417393 gaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaggggctcttgggaaaggggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaa 27417294  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||| ||          ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27417293 cacatgagtggagagtcttt----------ttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttt 27417204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Original strand, 46703135 - 46703424
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttca 108  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  46703135 acccatttgctgaggaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 46703234  T
Q  109 aaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    || |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||     
T  46703235 aagcttcaagatgtgaatcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaa 46703333  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46703334 tggagagtcttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttt 46703424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 379028 - 379303
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  379028 agcttggtgaatctcgtggaaaccaaaggagagaacttttaggatttgtagatactaaaggttgagggactttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 379127  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  379128 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 379227  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379228 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 379303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Original strand, 35662094 - 35662365
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaat 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  35662094 cttggtgaatctcatggacaccaaatgagagaacttttaggattttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaatatgtgaat 35662193  T
Q  127 cttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgag 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||    
T  35662194 cttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgag 35662293  T
Q  227 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35662294 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttt 35662365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 2209340 - 2209638
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||    
T  2209340 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaagcaaatgagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggtt 2209439  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2209440 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 2209539  T
Q  207 agcggagagtca-----tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||||     | || |       |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2209540 agtggagagtcaaaggctatgggttggttctcagcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 2209638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46570085 - 46569828
Alignment:
Q  4 ccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||  || ||    
T  46570085 ccatgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttagggttttagatactaaatgttgaaggtctttaggtgag 46569986  T
Q  104 gttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacag 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  46569985 gttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaa 46569886  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 261  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46569885 atgagtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaag 46569828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 33989501 - 33989786
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaac 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |    
T  33989501 tttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaagcagataacttttagggtatttagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagc 33989600  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcgga 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  33989601 ttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggagaagg-ttggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtgga 33989699  T
Q  213 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  33989700 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttt 33989786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Original strand, 8647865 - 8648063
Alignment:
Q  102 aggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8647865 aggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaac 8647964  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  8647965 acaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctcttt 8648063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22883287 - 22882997
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||||| ||||||    
T  22883287 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22883188  T
Q  108 aaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| || | ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||     
T  22883187 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttggg-agagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22883089  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |   ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22883088 aaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttt 22882997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22934951 - 22934661
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||||| ||||||    
T  22934951 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22934852  T
Q  108 aaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| || | ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||     
T  22934851 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttggg-agagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22934753  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |   ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22934752 aaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttt 22934661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 8653225 - 8653385
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8653225 actccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 8653324  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaa 160  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8653325 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 8653385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 10071510 - 10071693
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  10071510 actccatgacccattttgttgggtaatcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 10071609  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagat 184  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  10071610 tgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttgatg-tttttggagaagat 10071693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35370874 - 35370581
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||    
T  35370874 tgacccatctattgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggagaggt 35370775  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaacc-aaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacag 203  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||  ||| |     
T  35370774 tcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttggg-agagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggttgataaaaac 35370676  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35370675 atcaaaggagagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaatagaaga-tctttgggaaatcaaaggctaatggttggttctcttt 35370581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 3785722 - 3786014
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |   | |||| |||||| |||| ||||||  |  || |    
T  3785722 tgacccatttgttgagtaagtttggtggatctcatggaaatcaaaggatggaacttttaggatacatggatactaaaggttgagagtctttaggcgagat 3785821  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||| | | ||||      
T  3785822 tcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-ggaaaagggttggtgccttttgaggagagaattatggggtcgaggaacact 3785920  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3785921 tcaaaggagagtc-tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttctcttt 3786014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 300
Target Start/End: Original strand, 33089582 - 33089812
Alignment:
Q  58 aacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttggga 157  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  33089582 aacttttaggtatttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagtttgaagatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctcttggg- 33089680  T
Q  158 aaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 256  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||           || ||||||||    
T  33089681 agagggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgg-----------gagaccaaaag 33089769  T
Q  257 agaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33089770 agaagatccttag-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttt 33089812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26699979 - 26699689
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggg-ttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||| | ||||||  | |||||||||    
T  26699979 catttgttgagcaagctttgtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttgtagggcatttagatactaaaggttgaagatctttggttgaggttcaaa 26699880  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaag-aggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt-ggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| | | |||||    
T  26699879 acttcaagatgtgaatcttagagagccaaatgaagggggatcttggaaaaagggttggtgccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgag 26699780  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     ||||| ||||| |||| |||||  | ||||||||   |||| |||||||| || ||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26699779 tggagattcattagtgaacaactcagatgagtcttagaaaactaaaagagatga-tctttatgtaatcaaaggttaaaggttggttctcttt 26699689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35369971 - 35369684
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  35369971 tgacccatctgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaattaaaggagggaactttta----tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 35369876  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaacc-aaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||  |||||| |    
T  35369875 caaagatttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttggg-agagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggtttagaaacaca 35369777  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | |   || |||| ||||| ||||||||||||||||||   || | ||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35369776 tcaaaagatagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggatagcaaaatagaaga-tctttg-ggaatcaaaggctaagggttggttctcttt 35369684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38811590 - 38811404
Alignment:
Q  32 tgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38811590 tgaatctcatggaaactaaaggagggaacttttagggtacttagatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttg 38811491  T
Q  131 gaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtca 218  Q
    || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||    
T  38811490 gagaacccaaagagggg-ctcttggg-aaagggttggtgtcttttgcggagagattcatgaggttaggaaacacataagtggagagtca 38811404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 12119281 - 12119462
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagag 215  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||| || || || ||     
T  12119281 aagatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttgggaaa-gggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaa 12119379  T
Q  216 tcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  12119380 tcatttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta-agaaatcgaa-gttaagggttggttctcttt 12119462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 300
Target Start/End: Original strand, 34112323 - 34112536
Alignment:
Q  86 tgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agat 184  Q
    |||||||||||| || || |||||||  || |  ||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  34112323 tgagggtctttgtgtgagattcaaaatgtccaattgtgaatcttggataacctaaagacgaggctcttag-aaaagggttggtgccttttggggagaggt 34112421  T
Q  185 tcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggcta 284  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34112422 tcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaactgaagatccttag-gaaatcaaaggcta 34112520  T
Q  285 agggttggttctcttt 300  Q
    | | ||||||||||||    
T  34112521 aagtttggttctcttt 34112536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Original strand, 10071963 - 10072065
Alignment:
Q  67 ggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttg 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10071963 ggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaagggttg 10072062  T
Q  167 gtg 169  Q
    |||    
T  10072063 gtg 10072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 32091222 - 32091326
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt--tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32091222 ttggtgaatttcatggaaactaaaagagggaatttttaaggtattttggatactaaatgttgagggtctttgagtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 32091321  T
Q  126 tcttg 130  Q
    |||||    
T  32091322 tcttg 32091326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25723752 - 25723557
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttg-agtaagg 104  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||  ||| |||| | ||||  |||||| ||  |||    
T  25723752 tgacctatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaatgagtgaactcttagggtacttcaatactaaatgttgag--tctttggagggagg 25723655  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaaca 202  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| || ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  25723654 ttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctctt-ggataatggttaatgccttttggagagagcttcgtggggttgggaaaca 25723557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47515023 - 47514885
Alignment:
Q  22 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagat 120  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | | |||||| ||| |||||| | || | ||||||| |||||||||    
T  47515023 gtaagcttgtggaatctcatggaaaccaaatgagtgaacttttagggtacttaaacactaaaggttgaaggtcttcgggtgaagttcaaagcttcaagat 47514924  T
Q  121 gtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
     ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  47514923 atgaatcttggtgaaccaaaagagtggactcttgggaaa 47514885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Original strand, 41961152 - 41961335
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtc 217  Q
    |||||||||||| | |||| ||| ||||| |||| |||| || ||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||    
T  41961152 atgtgaatcttgtagaaccgaaaaagggggctctagggagaa-ggtcggtgctttttggggagagattcat-gggttgggaaacacattaaaggagagtc 41961249  T
Q  218 atttgtgagc-----aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     | |||||||     ||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41961250 -tatgtgagcaacgtaacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttt 41961335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22629399 - 22629147
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgg 131  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||   |||||| | |||||| | || |||| || || || || |||| |||||||||||||||||||    
T  22629399 gaatctcatagaaaccaaatgagtgaacttttaggaaatttagaaactaaaggttcagtgtctctgggtgagatttaaaagttcaagatgtgaatcttgg 22629300  T
Q  132 aaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaag--attcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaa 229  Q
    | |||||||| ||| |  | || | |||| |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| || | |||||||    
T  22629299 agaaccaaaataggagaatatt-gaaaaatggttagtgccttttgg-gaagatatttatggggttgagaaacacatgagaggagagt-atctctgagcaa 22629203  T
Q  230 cttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaag 286  Q
     ||| |||| ||||| || ||||| | | ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  22629202 tttgagtgaatcttgggagaccaacataaaagatccttag-aaaatcaaaggctaag 22629147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Original strand, 6719324 - 6719384
Alignment:
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6719324 ttcaagatgtgaatcttggaaaactaaaagagtggattcttggg-aaagggttgatgccttt 6719384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Original strand, 32091324 - 32091399
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 296  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| || |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  32091324 ttgtgaacaacttgggtaagttttgggagaccagaggagaagatccttag-gaaatcaaaggcaaagtgttggttct 32091399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 40146887 - 40147186
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  40146887 actccatgacccatttgttggttaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 40146986  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40146987 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 40147086  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147087 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 40147186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 213094 - 213384
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  213094 actccatgacccattttttgggtaagcttgatgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 213193  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaa-aaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213194 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 213293  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggtt 290  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  213294 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 213384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 38746637 - 38746930
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  38746637 tgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 38746736  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38746737 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtg 38746836  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746837 agtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 38746930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 27015168 - 27015457
Alignment:
Q  10 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaa 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||    
T  27015168 cccatttgt-gggtatgcttggcgaatctaatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaa 27015266  T
Q  110 aacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  27015267 agcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagt 27015366  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015367 ggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 27015457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 5057698 - 5057972
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  5057698 agctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtga 5057797  T
Q  125 atcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5057798 atctttgagaaccaaaagagggg-cttttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtg 5057896  T
Q  225 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5057897 agcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 5057972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 28277943 - 28278241
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttggg--taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaa 102  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |    
T  28277943 catgacccatttgttgaaaataagcttggtgaatctcaaggaaactaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggatga 28278042  T
Q  103 ggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt-ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaac 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28278043 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaac 28278142  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28278143 acatgagtggagagactattgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctcttt 28278241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27638156 - 27637857
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  27638156 actctatgacccatttgttaaaaaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagaatctttgggt 27638057  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27638056 gaggttcaaag-ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgcattttgg-gaagattcatggggttaggaaa 27637959  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaa--gagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 298  Q
    || ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  27637958 cacatgagtgaagagtcttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagagaagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctct 27637859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16642419 - 16642208
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |    
T  16642419 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagcacttttagggtatttagatactaaaggttgatggtctttggg 16642320  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttggga 198  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  16642319 tgaggttcaaagcttcaagaagtgaatcttgaagaaccaaaagaggg--ctcttggg-aaagggttggtgccttttggggacagattcatggggttagga 16642223  T
Q  199 aacagatgagcggag 213  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16642222 aacacatgagtggag 16642208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 316385 - 316687
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggt------gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtc 93  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  316385 actccttgacccatttgttgagtaagcttggtaatggtgaatctcatggaaactaaaggagagaacttttattgtacttagatactaaaggttgagggtc 316484  T
Q  94 tttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatgggg 192  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  316485 tttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagggggggctcttggg-agagggttggtgccttttggggagagattcataagg 316583  T
Q  193 ttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 292  Q
    |||||||||| || |   ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  316584 ttgggaaacacatcaaaagagagtc-tttgtgagcaactt-ggtgaatcttgggagaccaaaagagaa-aatcctag-gaaatcaaaggctaagggttgg 316679  T
Q  293 ttctcttt 300  Q
    ||||||||    
T  316680 ttctcttt 316687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14689942 - 14689654
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggg-ttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttc 107  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| | |||| | ||||||||||||| | ||||    
T  14689942 acccatttgttgagtaggcttggtgaatctcatggaaactaaaggagaaaacttttagggcatttagatagtgaaggttaagggtctttgagtgatgttc 14689843  T
Q  108 aaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatga 207  Q
    |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| || |    
T  14689842 aaagtttcaagatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttcttgtg-aaagggttggtgccttttggag-agattcgtgagaatgggaaacacataa 14689745  T
Q  208 gcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
      ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14689744 aaggagagt-atttgtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttag-aaaatcaaaggctaggggttggttctcttt 14689654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 35615809 - 35616059
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  35615809 atttgttgcgtaagcttggtgaatctccttgaaaccaaatgaaaaaacttttagagtatttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaag 35615908  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| || |  |    
T  35615909 cttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttggg-aaaggggtgatgccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaag 35616007  T
Q  211 gagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
     |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35616008 aagagtc-tttgtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaagat 35616059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 4160284 - 4160557
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| || | |||||||  || |||| |||    
T  4160284 agctcggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacatttagggtatttagatactaaagtttgagggt-tttgggtgatgttcaaagtttaaagaagtg 4160382  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttg 222  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  4160383 aatcctggagaactaaaagagggggctcttgggaga-gggtaagtgtcttttggggagagattcatagggttgggaa-cacgtaagtggagagtcatttg 4160480  T
Q  223 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4160481 tgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggttctcttt 4160557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33906491 - 33906288
Alignment:
Q  80 aaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag 179  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  33906491 aaaggttgagggtctttgagtgaggttcgaagcctcaaaatgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctcttgggaga-gggttggtgccttttgggg 33906393  T
Q  180 a-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaa 278  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |  |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33906392 agagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac-ttagtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaa 33906295  T
Q  279 aggctaa 285  Q
    |||||||    
T  33906294 aggctaa 33906288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 30802579 - 30802782
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaa 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || |||||||||     
T  30802579 atttgttgagtacgcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggtatttagatattctaggttgagggtctttaggtgaggttcaaag 30802678  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    ||||| |||||  ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  30802679 cttcatgatgt-tatcttagagaaccaaaagaggaggctcttggg-aaagggtttgtgccttttggggagagattcatggggttagaaaacacatgagtg 30802776  T
Q  211 gagagt 216  Q
    ||||||    
T  30802777 gagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 30792872 - 30793072
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  || | ||    
T  30792872 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagtaaacttttagggtaattagatactaaaggttgagggtctttaggtgatgt 30792971  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | | | || ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |    
T  30792972 tcaaagcttcaagatgt-tatcttggagaaccaaaatatgtggct-ttgggaaaa-ggttggtgccttttggggagatattcatggggttgggaaacaca 30793068  T
Q  205 tgag 208  Q
    ||||    
T  30793069 tgag 30793072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10055238 - 10055031
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||| ||  || |||| |||||  ||| ||| |||| || || ||||||    
T  10055238 catttgttgagtaagtttggtgaatctcatagaaatcaaatgatggaacatttagagtacttggatactaaagattgaaggtttttgggtgagattcaaa 10055139  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  10055138 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagagggctcttggg-aaaggtttggtgccttatggggagagattcacggggttgggaaacacatgagt 10055040  T
Q  210 ggagagtca 218  Q
     ||||||||    
T  10055039 agagagtca 10055031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16641269 - 16641184
Alignment:
Q  214 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16641269 agtcaattgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatactta-aaaaatcaaaggctaaaggttggttctcttt 16641184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205896
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt--ggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagt 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| |||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctttggaaa-gggttggtgtctttttcggagagg-ttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagt 21205979  T
Q  217 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||| || || |||||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21205978 catttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaacctta-tgaaatcaaagactaaggattggttctcttt 21205896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 33906665 - 33906578
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtcttt 96  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33906665 acccatttgttgaacaagcttggtgaatctcat-gaaaccaaagaagagaacttttagggtatttagatattaaaggttgaggttcttt 33906578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1632274 - 1631975
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1632274 actccatgacctatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagt 1632175  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1632174 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggggaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaa 1632075  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632074 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 1631975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 45726556 - 45726854
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||    
T  45726556 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 45726655  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45726656 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaa 45726754  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726755 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 45726854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35447426 - 35447127
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||    
T  35447426 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtatttgtgt 35447327  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttg-gaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35447326 gaggttcaaagcttcaagatgtgagtcttgagagaaccaaaagagggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaa 35447228  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447227 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 35447128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42288628 - 42288353
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42288628 aagctaggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 42288529  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  42288528 aatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 42288430  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288429 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 42288353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 17450221 - 17450513
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  17450221 catgacccatttgttgggcaaacttagagaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgagg 17450320  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||| |    
T  17450321 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacaca 17450419  T
Q  205 tgagcgga-gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 298  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17450420 tgagcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctct 17450513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 7450926 - 7451158
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| |    
T  7450926 actccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttg-gcgtctttggg 7451024  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7451025 tgaggttcaaagcttcaggatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaagggttgatgacttttggagaagatttatggggttggaaa 7451124  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttg 233  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7451125 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 280
Target Start/End: Original strand, 33647817 - 33648075
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgt 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  33647817 aagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagagaacttttagagtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgt 33647916  T
Q  123 gaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcattt 221  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  33647917 gaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcattt 33648016  T
Q  222 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaag 280  Q
    || ||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33648017 gttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatccttagggaaatcaaag 33648075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 24397701 - 24397977
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  24397701 catttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaa--------cttttagggtatttagatactaaaggttgacggtctttgtgtgaggttcaaa 24397792  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||| ||| ||||| |||||     
T  24397793 gcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagt 24397892  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 296  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  24397893 ggagagtcatttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-aaagtcaaa-gctaagggttggttct 24397977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42262146 - 42261859
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  42262146 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 42262047  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |    
T  42262046 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttgg-agagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacaca 42261948  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 295  Q
    | |  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  42261947 tcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc 42261859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30218570 - 30218321
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||| || ||||    
T  30218570 tgacctattcgttgggtaatcttggtgaatattatggaactcaaaggagggaacttttagggtatttagatactatatgttgagggtctttgggtgaggt 30218471  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||  |||| | || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  30218470 tcaaaacatcaaaatgtgaatcttggacaaccaaaaatgagggcttatggg-agagagttagtgccttttggggagagattcatggggttgggaaacaca 30218372  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 256  Q
      |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30218371 ccaaaggagaatc-tttgtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaag 30218321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 177
Target Start/End: Original strand, 24197643 - 24197700
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttgg 177  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24197643 atgtgaatcttggggaaccaaaagaggggactcttggg-agagggttggtgccttttgg 24197700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Original strand, 16676027 - 16676133
Alignment:
Q  158 aaagggttggtgcctttt--ggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||| || | |||  |||| || |||||||    
T  16676027 aaagggttggtgccttttaaggagaa-attcatttggttgggaaacatatgagagaagagttatttctgagcaagttagttgaaacttgggagaccaaaa 16676125  T
Q  256 gagaagat 263  Q
    ||||||||    
T  16676126 gagaagat 16676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 294
Target Start/End: Original strand, 43730992 - 43731066
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 294  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  43730992 tttgtgagcaatttgggtgaatcttgggaaaccaaaatagaatatccgtag-gaaatcaaagtctaaaggttggtt 43731066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 44750240 - 44750273
Alignment:
Q  22 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggag 55  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44750240 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggag 44750273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7253
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  6960 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 7059  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7060 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 7159  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7160 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 7253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 11348324 - 11348623
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  11348324 actccatgacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaagggttgagggtctttgggt 11348423  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11348424 gaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaggtctggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaa 11348523  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348524 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 11348623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 29135880 - 29136172
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29135880 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggtt 29135979  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||    
T  29135980 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-ggaaaaacatg 29136078  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29136079 agtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttt 29136172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42298517 - 42298218
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  42298517 actccctgatccatttgttgggtaagcttggtgaatcccataacaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 42298418  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298417 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 42298318  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42298317 cacatgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttt 42298218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37033605 - 37033316
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||| || |||||    
T  37033605 tgacccttttgttgagtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttac----taaaggttgagggtctttgggtgaggtt 37033510  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37033509 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaacacatg 37033410  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37033409 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 37033316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 34603202 - 34603500
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  34603202 actctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggt 34603301  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34603302 gatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 34603401  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603402 cacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 34603500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 193244 - 193536
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||    
T  193244 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttcggtgaggtt 193343  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  193344 caaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaaaggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatg 193442  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193443 tgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 193536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13547625 - 13547332
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  13547625 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13547526  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  13547525 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13547426  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547425 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 13547332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13549536 - 13549243
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  13549536 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13549437  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  13549436 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13549337  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549336 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 13549243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34602881 - 34602583
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  34602881 actctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggt 34602782  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34602781 gatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 34602682  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602681 cacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 34602583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37879447 - 37879154
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || |||||    
T  37879447 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggaaggaactgttagggttttagatactaaatgttgaggatctttgggtgaggtt 37879348  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37879347 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatg 37879248  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37879247 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttt 37879154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 19754117 - 19754419
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  19754117 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttctagatactaaaggttaagggtctttgggt 19754216  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19754217 gaggttcaaagcaccatgatttgaatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 19754316  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattctt---agtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 297  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19754317 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctc 19754416  T
Q  298 ttt 300  Q
    |||    
T  19754417 ttt 19754419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47255872 - 47255583
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||    
T  47255872 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 47255773  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  47255772 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaaa----tggtgccttttggggaagattcat-gggttgggaaacaca 47255678  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47255677 tgattggagagtcttttgtgagcaactt-agtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttt 47255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 37167948 - 37168222
Alignment:
Q  26 gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  37167948 gcttggggaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttacagttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 37168047  T
Q  126 tcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37168048 tcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 37168147  T
Q  226 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37168148 gcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttt 37168222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7482768 - 7482475
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||    
T  7482768 atgacccatttagtgaataagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaacggttgagggtctttgggtgaggt 7482669  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt-ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7482668 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacaca 7482569  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7482568 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttt 7482475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 28242041 - 28242313
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaat 126  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  28242041 ttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaat 28242140  T
Q  127 cttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgag 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28242141 cttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgag 28242239  T
Q  227 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28242240 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 28242313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 47114825 - 47115096
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47114825 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggctttagatattaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagctgtgaatc 47114924  T
Q  128 ttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagc 227  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  47114925 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaacagggttggtaccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagc 47115023  T
Q  228 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115024 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 47115096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 19752312 - 19752610
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  19752312 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaatgagggaatttttagggttttagatactaaaggttgaaggtctttgggt 19752411  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||| || | |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  19752412 gaggttctaagcgtcataatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaagg-ttggtgccttttggggaagattcattgagttgggaaa 19752510  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19752511 cacatgagtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttctcttt 19752610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 41135452 - 41135744
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  41135452 tgacccatttgttgaataagcttggttaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttaatgtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 41135551  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    | ||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |    
T  41135552 tcaaaccttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagaggaagattttggg-agagggttggtgccttttagggagagattcatggggttgggaaacaca 41135650  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41135651 tcaaaggagagtc-tttgtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagagaagatcatttg-gaaattaaaggctaaggattggttctcttt 41135744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31926099 - 31925949
Alignment:
Q  150 tcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaa 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31926099 tcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaa 31926000  T
Q  250 ccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31925999 ccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttt 31925949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 6808083 - 6808371
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttag-ggttttagataataaaggctga-gggtctttgagtaaggttcaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||  || ||||||||    
T  6808083 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagattttttagatactaaaggttgaggggtctttaggtgaggttcaa 6808182  T
Q  110 aacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt-ggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||  | ||  || ||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  6808183 aacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagattgggctcttgg--agagattttgtgtcttttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgaa 6808280  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  6808281 tgaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaagacggaaggttggttctcttt 6808371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9109918 - 9109681
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || | ||||||| |||| | || ||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9109918 cttggtgaatgtcatggaaatcaaatgatgaaacttttggggtatataaatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 9109819  T
Q  126 tcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| | ||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| ||| || |   ||||||| ||||||    
T  9109818 tcttggagaaccaaaaaaggggactcatggg-agagggttgatgtcttttggggagagattcatgaggttgggagacacatcaaatgagagtcttttgtg 9109720  T
Q  225 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  9109719 agcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagat 9109681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31928343 - 31928203
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttg-ttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||| |||| |||||||      
T  31928343 actccatgacccatttgattgggtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggaactt--------ttagatactaaaggttgagagtctttgga 31928252  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt 148  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31928251 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagaaaaccaaaagatgggt 31928203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16216966 - 16216745
Alignment:
Q  70 tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtg 169  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||| || |  ||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16216966 tttagaaactaaaggttaagggtctttgggtgatattcaaaggttcaagatgtatatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-cgaaaagggttggtg 16216868  T
Q  170 ccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattctta 268  Q
    | ||||||| | | |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||   |||||||||||| ||||    
T  16216867 cattttggatagaaattcat-gtgttggcaaacacatgagaggagagtca-ttgtgagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatcctta 16216770  T
Q  269 gtgaaatcaaaggctaagggttggtt 294  Q
    | |||||||||||||| | |||||||    
T  16216769 g-gaaatcaaaggctacgagttggtt 16216745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 22078995 - 22079245
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||       |||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22078995 ttggtgaatcttatggaaactaaatgatggaacttttagggtatta-------aagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 22079087  T
Q  128 ttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagc 227  Q
    ||  | |||||||||||||| |  |||||  | ||||||||| | ||||| ||           ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||    
T  22079088 ttaaagaaccaaaagagggggcaattgggtga-gggttggtgtcgtttgggga-----------gttgggaaacacatcaagggagagtc-tttgtgagc 22079174  T
Q  228 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22079175 aacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaaggatt-gttctcttt 22079245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12318889 - 12318724
Alignment:
Q  134 aaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttgg--agaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaact 231  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||| || |  |||||||  ||| |||||||||    
T  12318889 aaccaaatgagagggctcttgggaga-gggttggtgccttttggggagaag-ttcataggattgagaaacacatcaaaggagagtt-tttatgagcaact 12318793  T
Q  232 tgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttg 301  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318792 tgggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatcttttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctctttg 12318724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4535861 - 4535783
Alignment:
Q  157 aaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgg 234  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  4535861 aaaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttgg 4535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Original strand, 3331283 - 3331328
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3331283 tcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 3331328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38747144 - 38747052
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatga 207  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  38747144 tcaagatatgaatcttagacaaccaaaacggggg-ctcttga-aaaagggttggtgccttttggagagaggttcatagggttggaaaacacatga 38747052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 25651922 - 25651979
Alignment:
Q  212 agagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttag 269  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  25651922 agagttatatgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaagcaaaagtgaagatccttag 25651979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 6431598 - 6431896
Alignment:
Q  2 ctccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagta 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||     
T  6431598 ctccatgacccatttattgggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtg 6431697  T
Q  102 aggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6431698 aggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaac 6431797  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6431798 acatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttt 6431896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4512931 - 4512633
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  4512931 actccatgacccatttaatgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagattctaaaggttgagggtctttgggt 4512832  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4512831 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaa 4512733  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4512732 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttt 4512633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 29608373 - 29608661
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  29608373 tgacccatatgttgataaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 29608472  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||    
T  29608473 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttg-----gattcatggggttgggaaacacatg 29608567  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608568 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 29608661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6360448 - 6360155
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  6360448 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6360349  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
     |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  6360348 aaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaaggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatg 6360249  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360248 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 6360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34311259 - 34310959
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  34311259 actccatgaccaattttttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaaggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttggg 34311160  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  34311159 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaaggttcatggggatggaaa 34311060  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34311059 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctctt 34310960  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  34310959 t 34310959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Original strand, 2389934 - 2390207
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  2389934 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 2390033  T
Q  127 cttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgag 226  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  2390034 cttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgag 2390133  T
Q  227 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390134 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 2390207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2361507 - 2361214
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| || || ||    
T  2361507 tgacccatttgttgggcaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggattttagatactaaagattgagggtctttgggtgagatt 2361408  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  2361407 caatccttcaagatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatg 2361308  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361307 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 2361214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48599858 - 48599577
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  48599858 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 48599759  T
Q  109 aaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    || ||||||||||||||          |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  48599758 aagcttcaagatgtgaa----------ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgag 48599669  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599668 tagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 48599577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4509239 - 4508949
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  4509239 actctatgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggt 4509140  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4509139 gaggttcaaagcttcaagatgtgag--------aaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 4509049  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4509048 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttt 4508949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4511081 - 4510791
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  4511081 actctatgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggt 4510982  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4510981 gaggttcaaagcttcaagatgtgag--------aaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 4510891  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4510890 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttt 4510791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 22269604 - 22269898
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaag 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| || ||    
T  22269604 catgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacatttagggtatgtagatactaaagtttgagggtctttgggtgag 22269703  T
Q  104 gttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacag 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  22269704 gttcaaagctacaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaa-gagttggtgccttttggggaagattcatggggaggggaaacac 22269801  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22269802 atgagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttctcttt 22269898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 3258621 - 3258916
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||| |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  3258621 actctatgacccatttggtgaaaaaacttggtgaatctcatggaaaccagaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggg 3258720  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3258721 tgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaa 3258820  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 297  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  3258821 acatatgagtggagagtcttttattagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-cctaagggttggttctc 3258916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22328931 - 22328642
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    ||||| |||    
T  22328931 catttgttaagtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtatttagatactaaaggttgaggatctttggtggaggttaaaa 22328832  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||     
T  22328831 gcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagt 22328732  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22328731 agagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctcttt 22328642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32358378 - 32358189
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  32358378 actccatgacccatttgttgaaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 32358279  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatgg 190  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32358278 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8359703 - 8359567
Alignment:
Q  158 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8359703 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaaga 8359604  T
Q  258 gaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 294  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8359603 gaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggtt 8359567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 5116290 - 5116551
Alignment:
Q  31 gtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatctt 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5116290 gtgaatctcatggataccaaaggaggggacttttagggtatttaaatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaaacttcaagatgtgaatctt 5116389  T
Q  130 ggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagca 228  Q
     || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||  | |   ||| |||||||||||  |    
T  5116390 tgagaaccaaaagagggggctcttggg-agagggtcggtgccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatgagggtcatttgtgataa 5116488  T
Q  229 acttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 292  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  5116489 acttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcctcag-gaaatcaaaggttaagagttgg 5116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Original strand, 30814397 - 30814505
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||||    
T  30814397 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatacttaaggttgagggtctttgggtgaggtt 30814496  T
Q  107 caaaacttc 115  Q
    |||| ||||    
T  30814497 caaagcttc 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22552866 - 22552683
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-agaagattcatggggttgg--------gaaacaga 204  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||        |||||| |    
T  22552866 tcaaaatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgg--aaacggttggtgccttttgggaaaagattcatggctttggaaagatgggaaacaca 22552769  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 294  Q
    |||| || |  || ||||||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22552768 tgagaggtg--tc-tttgtgaactacatgggtgaatcttgggagaccaaaagagaagattcatag-gaaatcaaaggataagggttggtt 22552683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43363839 - 43363667
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggaga 214  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |  | ||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||| |||||  ||||    
T  43363839 aagatgtgtatcttggagaactaaaagagggagctcttgggacattg-ttggttccttttgggaagagattcaaggg-ttgagaaacacatgagatgaga 43363742  T
Q  215 gtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttg 291  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  43363741 gtcctt-gtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatctttag-gaaattaaatgctaagggttg 43363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1360478 - 1360398
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1360478 tttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatatt-tttgggaaatcaaaggatatggattggttctcttt 1360398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23794176 - 23794074
Alignment:
Q  192 gttgggaaacagatgagcgga-gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggtt 290  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  23794176 gttgagaaacacatgagcggatgagtc-tttgtgagcaatttgggtgaatcgtaagagaccaaaagaggagatccttaga-aaatcaaaggctaatggtt 23794079  T
Q  291 ggttc 295  Q
    |||||    
T  23794078 ggttc 23794074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 49200007 - 49199713
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  49200007 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 49199908  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  49199907 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 49199808  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttggg-tgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49199807 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttt 49199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43402326 - 43402033
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  43402326 tgactcatttgttgggtgagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 43402227  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43402226 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 43402127  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43402126 agtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 43402033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43404269 - 43403976
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||    
T  43404269 tgacccatttgttgggtgagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttgggtgaggtt 43404170  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  43404169 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 43404070  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43404069 agtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 43403976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 34490862 - 34491138
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  34490862 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 34490961  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34490962 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgt 34491061  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491062 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 34491138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 40912969 - 40913264
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaa-gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||    
T  40912969 tgacccatttgttgggtaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggggacttttagggttttagatactaaaggtttagggtctttgggtgaggt 40913068  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcc-ttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40913069 tcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttttggagaagattcatggggttgggaaacaca 40913168  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40913169 tgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagagaagatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctcttt 40913264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6096128 - 6095842
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaact 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  6096128 tttgttgggaaagcttggtgaatctcatggaaatcagaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 6096029  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6096028 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 6095929  T
Q  214 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6095928 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctcttt 6095842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 4569583 - 4569876
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  4569583 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4569682  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4569683 caaagcttcaagatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatg 4569782  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569783 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 4569876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 30235750 - 30236050
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  30235750 actccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 30235849  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  30235850 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaa 30235949  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  30235950 acacaagagtggagagtcatttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctctt 30236049  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  30236050 t 30236050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 55302507 - 55302208
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |    
T  55302507 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatttcattgaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttggat 55302408  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||    
T  55302407 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaa 55302308  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55302307 cacatgagtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttt 55302208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 54593330 - 54593629
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  54593330 actccatgacccatttgttcgaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttggg 54593429  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  54593430 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtaccttttggggaagattcatggggatggaaa 54593529  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54593530 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctctt 54593628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 36018482 - 36018776
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||||  | ||||    
T  36018482 tgacccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaactttcagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggatgaggt 36018581  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  36018582 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaaacacat 36018681  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36018682 gaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctcttt 36018776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 47303877 - 47304176
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||| |    
T  47303877 actccacgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagagaacttttatggttttagatactaaatgttgaaggtctttggg 47303976  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47303977 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 47304076  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47304077 acacatgagtggagagt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctctt 47304175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41820040 - 41819767
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  41820040 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttaggtttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 41819941  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41819940 aatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgt 41819842  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41819841 gagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaaga-tctttatgaaatcaaa-gctaagggttggttctcttt 41819767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 46860120 - 46860397
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  46860120 agcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 46860219  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46860220 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 46860319  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggcta--agggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  46860320 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctcttt 46860397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 28074247 - 28074488
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||    
T  28074247 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 28074346  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  28074347 ttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaatagttggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacaca 28074445  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtga 247  Q
    |||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28074446 tgagtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgtga 28074488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5434410 - 5434121
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| | | ||||||||||||  ||||| |||    
T  5434410 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaggatatttagataccaaaagttaagggtctttgagggaggtttaaa 5434311  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  5434310 gcttcaagatgtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtgttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagt 5434211  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  5434210 ggagagtcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaagactaaagattgattctcttt 5434121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 34795507 - 34795793
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||| || | |||||||     
T  34795507 atttgttgggtaagtttggtgaatcctatgaaaaccaaaggagagatcttttagggtatttagatactaaaggttgatggtcgttgggtgatgttcaaag 34795606  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| | ||| ||  |||||||||  || |||||||||||||||||| ||| || |  |    
T  34795607 cttcaagatctgaatcttggagaaccagaagagggggttctaggg-agaggtttcatgccttttgaggagagattcatggggttgggatacacatcaaag 34795705  T
Q  211 gagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34795706 gagagt-ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggatggttctcttt 34795793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 300
Target Start/End: Original strand, 1683146 - 1683412
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgga 132  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||   ||||| | |||||| |||||||||||| || || ||||||  ||  | ||||||||||||||    
T  1683146 gaatctcatggaaatcaaatgagagaaatttatggaacttagaaactaaaggttgagggtctttgggtgagattcaaatgtttcaaatgtgaatcttgga 1683245  T
Q  133 aaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaact 231  Q
     |||||||||||  |  | || ||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  1683246 gaaccaaaagagaaggtttttcggaaa-gggttggtgcattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaact 1683344  T
Q  232 tgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1683345 ttggtgagtcttgtgagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggttggttatcttt 1683412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26324042 - 26323821
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaac 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||| |||||||| ||| || | ||||||| |    
T  26324042 tttgttgagtaagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttaagatatttagatactaaaggttgagggtcattgggtgaagttcaaagc 26323943  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt--ggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    |||||||||| ||||||| | || |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||| |||||| || |  |    
T  26323942 ttcaagatgtaaatcttgaagaatcaaaagagagggctattggg-aaagggttggtgcattttcagcag-agattcatggggttgagaaacacatcaaag 26323845  T
Q  211 gagagtcatttgtgagcaacttggg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26323844 gagagtc-tttgtgagcaacttggg 26323821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 39127191 - 39127386
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||| ||||| || ||||    
T  39127191 tgactcatttgttgagtaagcttagtgaatctcatggaaatcaacggagagaacttttagggtatttacatactaaaggtttggggcctttg-gtgaggt 39127289  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaaca 202  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||    
T  39127290 tcaaagcttcaagatatgaatcttagagaactaaaataggggactctt-ggaagagagttggtgcctttttgggagagattcatgaggttgggaaaca 39127386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31340577 - 31340501
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaag 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31340577 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaag 31340501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35139250 - 35138980
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||   | ||||    
T  35139250 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggtactttttgggtatttagatactaaacgttgagggtctttagatgaggt 35139151  T
Q  106 tcaaaactt-------caagatgtgaatcttggaaaaccaaaag--aggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttg 195  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| || ||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||    
T  35139150 tcaaaactttaagatgtaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaatgggt-tcttcgg-aaagggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttg 35139053  T
Q  196 ggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttag 269  Q
    | ||||| || |   ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  35139052 gaaaacaaatcaaatgagagtc-tttatgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaatagaagatccttag 35138980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Original strand, 20937501 - 20937581
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20937501 tttgtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaaagagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctcttt 20937581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31340503 - 31340448
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcc 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31340503 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgcc 31340448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26323385 - 26323319
Alignment:
Q  233 gggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26323385 gggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttt 26323319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50432898 - 50432840
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatca 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  50432898 tttgtgagcaacttggttgaatcttgagagaccaaaaaaggagatccttagtgaaatca 50432840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 20937375 - 20937408
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctca 40  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20937375 tgacccattagttgggtaagcttggtgaatctca 20937408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 11190 - 11483
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  11190 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 11289  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11290 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 11389  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11390 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctcttt 11483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42435527 - 42435234
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  42435527 tgacccatttgttcggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 42435428  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42435427 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 42435328  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435327 aatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 42435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 11383612 - 11383911
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  11383612 actccatgtcccatttgttaggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 11383711  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11383712 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaa 11383811  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     | || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383812 tacataagtggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 11383911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 300
Target Start/End: Original strand, 44353423 - 44353717
Alignment:
Q  3 tccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaa 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |    
T  44353423 tccatgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtga 44353522  T
Q  103 ggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaaca 202  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44353523 ggtttaaaacttcaaga---gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaagagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaaca 44353619  T
Q  203 gatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353620 catgagtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 44353717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 40221376 - 40221670
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggg-aacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||  | ||||    
T  40221376 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccataggaggggaacttttagggtttttgatactaaaggtggaaggtctttggatgaggt 40221475  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
    | | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40221476 ttagaacttcaagatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaaggggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 40221575  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40221576 gagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttt 40221670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 4283178 - 4283449
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  4283178 tgacccatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4283277  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||                      |||||||||||||||||||||| |||    
T  4283278 caaagcttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagagggggcttttgggaa----------------------agattcatggggttgggaaacacatg 4283355  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283356 agtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 4283449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 300
Target Start/End: Original strand, 40328492 - 40328704
Alignment:
Q  88 agggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattca 187  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40328492 agggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgccttttagggaagattca 40328591  T
Q  188 tggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagg 287  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |     
T  40328592 tggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtgaaatcaaaggctatga 40328691  T
Q  288 gttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||    
T  40328692 gttggttctcttt 40328704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22976160 - 22976389
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  22976160 actccataacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcttcgaaaccaaaggagtgaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 22976259  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  22976260 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-gaaaa 22976358  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaact 231  Q
    || ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  22976359 cacatgagtgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3000037 - 2999823
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  3000037 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagagaacttttagggaatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaa 2999938  T
Q  126 tcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag-aagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||    
T  2999937 tcttggagaaccaaaagagggggttcttggg-atatggttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtg 2999839  T
Q  225 agcaacttgggtgagt 240  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2999838 agcaacttgggcgagt 2999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 40585356 - 40585649
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||  | ||||    
T  40585356 tgacccatttgttgcgtgagcttgattaatctcatgaaaaccaaaggaaataacttttagagtatttagatactaaaggttaagagtctttggttgaggt 40585455  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||  | | ||||||| || ||||||| || |||||||||||||| | ||||| |    
T  40585456 tcaaagcttcaagatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatgtcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacaca 40585555  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40585556 tcaaaggagagtc-tttgtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttctcttt 40585649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20686586 - 20686456
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaac 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||||| |||||| || | ||||||| |    
T  20686586 tttgttgggtaagctcggtgaatctcattgaaaccaaaggagggaactttcagggtacttagatactaaatgttgaggatctttg-gtgaagttcaaagc 20686488  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20686487 ttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagag 20686456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655326
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactcttt 18655326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3846321 - 3846103
Alignment:
Q  40 atggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaacca 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||  || || | |||||| |||||||  |||||| || ||||||  ||||  |||||||||||| | |||||    
T  3846321 atggaaaccaaaggagaaaactttcagggtactttgaaactaaaggttgagggttcttgagtgagattcaaaggttcataatgtgaatcttgaagaacca 3846222  T
Q  139 aaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtg 237  Q
    ||||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| ||||||     
T  3846221 aaagaagag-ctcttgg-aaaagagttggtgtcttttggggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc-tttgtgagcaaattgggta 3846125  T
Q  238 agtcttgtgaaaccaaaagaga 259  Q
    | ||||  || |||||||||||    
T  3846124 aatctttggataccaaaagaga 3846103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9633959 - 9633817
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtca 218  Q
    |||||||||||| | || ||||||| ||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||||| || ||  ||||||||    
T  9633959 atgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttg--aaaaaggttggtaccttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtca 9633862  T
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  9633861 tttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaacgagaagat 9633817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3817840 - 3817679
Alignment:
Q  37 ctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaa 135  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||  || |||||| || ||||| | ||    
T  3817840 ctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtacttagaaactaaaggttgagggtttctgagtaaa-ttcaaaggttgaagatgggattcttgaagaa 3817742  T
Q  136 ccaaaagagg--ggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag-aagattcatggggttgg 196  Q
    ||||||||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3817741 ccaaaagaattagggctcttgg-aaaagggttggtgccttttggagaaagattcatggggttgg 3817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33655628 - 33655548
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || | ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33655628 tttgtgagcaatttgggtgaatcttaggagaacaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggttaagggttggttctcttt 33655548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 10239714 - 10239782
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt 69  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  10239714 actccttgacccttttgttgagtaagcttgacgaatctcatggaaatcaatagagggaacttttagggt 10239782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 238
Target Start/End: Original strand, 40535538 - 40535713
Alignment:
Q  61 ttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||| ||  ||||||||  |||||| |||| |||||  | ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  40535538 ttttagggtatttagatactaaagattgatggtctttgggt--ggttcaaagtttcaagttgtggatcttttagaaccaaaagagggggttcttgag-aa 40535634  T
Q  160 agggttggtgccttttggagaaga-ttcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtga 238  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40535635 agggttgatgccttttggataaaagttcatgtgattggaaaacacatgagagaagagtca-ttgtgagcaacttaggtga 40535713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 10020151 - 10020224
Alignment:
Q  86 tgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
    |||||||||||  || || ||||||   |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  10020151 tgagggtctttaggtgagattcaaatgatcaatatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 10020224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 80817 - 80530
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttca 108  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  80817 acccatttgttggaaaatcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactagaggttgagggtctttgggtgaggttca 80718  T
Q  109 aaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  80717 aagcttcaagatttgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgag 80618  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 296  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80617 cggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 80530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18540 - 18244
Alignment:
Q  3 tccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaa 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || |    
T  18540 tccatgacacatttgttgggtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttatagg-ttttagatactaaaggttgcgggtctttgggtga 18442  T
Q  103 ggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag-aagattcatggggttgggaaac 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||    
T  18441 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggttga-aaac 18343  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18342 acatgagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggttctcttt 18244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 490981 - 490694
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  490981 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 490882  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |    
T  490881 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttgg-agagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacaca 490783  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 295  Q
    | |  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  490782 tcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc 490694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1948 - 1671
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |    
T  1948 actccttgacctatttgttaagtaaacttggtgaattttatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatttagatactaaaggttgaaggtctttggg 1849  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttggga 198  Q
    | || | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||||||  || |||||||||  |||| ||    
T  1848 tgagctccaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactcttggg-cgaggcttggtgtcttttgtggagagattcatgtagttgaga 1750  T
Q  199 aacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaa 279  Q
    |||| || |   |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1749 aacacatcatatgagagtca-ttgtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University