View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3279-Insertion-2 (Length: 1006)

Name: NF3279-Insertion-2
Description: NF3279
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3279-Insertion-2
NF3279-Insertion-2
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (545-1006)||(21652190-21652643)
chr7 (453-1005)||(21788351-21788924)
chr7 (576-1005)||(21714305-21714746)
chr7 (576-1005)||(21772083-21772524)
chr7 (628-943)||(21785592-21785917)
chr7 (646-1005)||(21681772-21682143)
chr7 (642-1005)||(21992304-21992679)
chr7 (642-1005)||(21726018-21726393)
chr7 (456-1005)||(21764184-21764718)
chr7 (453-1005)||(15713745-15714321)
chr7 (649-939)||(21623383-21623683)
chr7 (631-1005)||(21807802-21808191)
chr7 (648-1003)||(21646867-21647238)
chr7 (456-1005)||(21704765-21705305)
chr7 (642-1005)||(21628247-21628625)
chr7 (452-592)||(21652716-21652856)
chr7 (453-904)||(21792237-21792667)
chr7 (643-898)||(21689645-21689909)
chr7 (640-1005)||(21664220-21664606)
chr7 (453-904)||(21745758-21746197)
chr7 (453-592)||(21629518-21629657)
chr7 (457-576)||(21647431-21647550)
chr7 (545-604)||(21628666-21628725)
chr7 (453-695)||(21656895-21657131)
chr7 (453-572)||(21807621-21807734)
chr7 (545-592)||(21628738-21628785)
chr7 (545-592)||(21628798-21628845)
chr7 (545-592)||(21628858-21628905)
chr7 (545-592)||(21628918-21628965)
chr7 (545-592)||(21628978-21629025)
chr7 (545-592)||(21629038-21629085)
chr7 (545-592)||(21629098-21629145)
chr7 (545-592)||(21629158-21629205)
chr7 (545-592)||(21629218-21629265)
chr7 (545-592)||(21629278-21629325)
chr7 (545-592)||(21629338-21629385)
chr7 (545-592)||(21629458-21629505)
chr7 (545-592)||(21652656-21652703)
chr7 (455-576)||(21786089-21786204)
chr7 (371-453)||(39266831-39266913)
chr7 (486-543)||(21690039-21690096)
chr7 (545-592)||(21629398-21629445)
chr7 (484-539)||(21664707-21664762)
chr7 (453-513)||(21709039-21709099)
chr7 (966-1005)||(21623315-21623354)
chr7 (966-1005)||(21689535-21689574)
chr7 (455-542)||(21726427-21726514)
chr7 (342-449)||(48846848-48846955)
[»] scaffold0182 (3 HSPs)
scaffold0182 (642-912)||(25590-25870)
scaffold0182 (529-574)||(25941-25986)
scaffold0182 (966-1005)||(25432-25471)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (233-449)||(9460587-9460808)
chr3 (233-437)||(29134422-29134630)
chr3 (380-449)||(43808767-43808836)
chr3 (369-449)||(19468804-19468884)
chr3 (391-449)||(50461046-50461104)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (317-437)||(51387009-51387128)
chr1 (380-455)||(22370294-22370369)
chr1 (388-455)||(38505951-38506018)
chr1 (792-866)||(18192049-18192123)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (261-448)||(18332409-18332595)
chr6 (342-440)||(21544814-21544912)
chr6 (380-456)||(34704048-34704124)
chr6 (380-454)||(12296193-12296264)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (384-449)||(13629553-13629618)
chr4 (398-456)||(47866606-47866664)
chr4 (393-454)||(19514443-19514504)
chr4 (393-454)||(37148424-37148485)
chr4 (380-437)||(16032725-16032782)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (380-454)||(41579249-41579323)
chr2 (371-449)||(28000674-28000752)
chr2 (342-411)||(39356711-39356780)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (393-454)||(24118434-24118495)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 545 - 1006
Target Start/End: Complemental strand, 21652643 - 21652190
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatg 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21652643 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactgtgacccatctggtttgtcccaataacaacggctgaggaatttcctcatg 21652544  T
Q  645 ctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatcagttgat 744  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21652543 ct-----------cactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatcagttgat 21652455  T
Q  745 caaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttc 844  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21652454 caaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaacgttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttc 21652355  T
Q  845 ttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaatctttttg 943  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21652354 ttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaaatgaccctttagttcgttaattttatcggcaatctttttg 21652255  T
Q  944 cgtcgatcctctagaat-aagccg-tgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtactc 1006  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21652254 tgtcgatcctctagaataaagccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagcttatactc 21652190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 453 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21788924 - 21788351
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattg 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||      |||    
T  21788924 tattgtaccttggaattagatgtagtgaggatgattttacgctgaagatcaagaagatgagtgggtgtctctaactgggactcatttgtta------ttg 21788831  T
Q  553 atacactatgttctccttctcctt------------------ccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaa 634  Q
    |||||||||||||||||||||| |                  |||||||||| |||| || |||| |||||||| || |||||| |  || |  ||||||    
T  21788830 atacactatgttctccttctccctttccttttggaaccatgtccttctccttatctggctgtgactcatctggtgtggcccaatgatgacagtcgaggaa 21788731  T
Q  635 tttcctgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatc 734  Q
      || | |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21788730 agtcatcatgctttttatcaattcactatcgttatc---tttccacaatagcttgagtactacgtaaggaagttgattctccaacagaagcacatccatc 21788634  T
Q  735 atca---------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaaca 825  Q
    ||||         |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  21788633 atcacaagaaccagttgatcaactttaatattcatgtgcccaggttcatcaagcttggctttctctaagatatacaacaaagaacatccatccacgaaca 21788534  T
Q  826 acatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcg-ctaaatgaccctttagttcgttaat 924  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||    
T  21788533 acatccacgacagcttttcttcgaggcttccaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgccaaaatgacccttcagttcatcaat 21788434  T
Q  925 tttatcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaataag--ccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
     ||||| | |||||||||| |  |||||||| ||||  |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788433 gttatctgcaatctttttgtgcagatcctctggaatgtgtccagtgttttcgatgtattttgctgcccacataagcttgtact 21788351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 576 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21714746 - 21714305
Alignment:
Q  576 tccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctt 675  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |  || |  |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||  || ||||    
T  21714746 tccttcttcttctctgactgtgactcatctggtgtggcccaatgatgacaggcgaggaaattcatcatgctttttatcaatccactctggtcttcatctt 21714647  T
Q  676 tccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---------gttgatcaaccttaatattcatgtgccc 766  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21714646 tccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcattacaagaacaagttgatcaaccttgatattcatttgccc 21714547  T
Q  767 tgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttca 866  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21714546 tggttcatcaagcttggctctctccaagatatgaagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgatagcttttcttcaaggctaccaaagccttca 21714447  T
Q  867 agagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcg-ctaaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaataagcc 965  Q
    ||||||   |  ||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||| || |||||||| ||||  | |    
T  21714446 agagaccaactggttgaagctaaaacatcgttgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtc 21714347  T
Q  966 --gtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21714346 tggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtact 21714305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 576 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21772524 - 21772083
Alignment:
Q  576 tccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctt 675  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||| || |||||| |  || |  |||||| ||| | ||||||| ||||||  |||||||||  || ||||    
T  21772524 tccttcttcttccctgactgtgactcatctggtgtggcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaagccactctcgtcttcatctt 21772425  T
Q  676 tccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---------gttgatcaaccttaatattcatgtgccc 766  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||     
T  21772424 tccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgcca 21772325  T
Q  767 tgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttca 866  Q
    || ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  21772324 tggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgca 21772225  T
Q  867 agagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcg-ctaaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaat-aagc 964  Q
    ||||||   |  ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||| || |||||||| ||||  | |    
T  21772224 agagaccatctggttgaagttaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatc 21772125  T
Q  965 cg-tgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21772124 cgttattttctatgtattttgctgcccacataagtttgtact 21772083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 628 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 21785917 - 21785592
Alignment:
Q  628 tgaggaatttcctgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcac 727  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21785917 tgaggaaattcttcatgctttttatcaattcactctcgtcgctatctttccacaatagtttgaggacttcataaggaagttgattctccaacaaaagcac 21785818  T
Q  728 atccatcatca---------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatcc 818  Q
    |||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21785817 atccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatttgccctggtacatgaagcttggctttctccaagatatgtagcaaagaacatccatcc 21785718  T
Q  819 acgaacaacatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagtt 917  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21785717 acaaacaacatccacgacagcttttcttcaaggctaccaaagtcttcaagagactggccggttaaagttaaaacatcatcgctaaaatgacccttcagtt 21785618  T
Q  918 cgttaattttatcggaaatctttttg 943  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  21785617 cattaatgttatcggcaatctttttg 21785592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 646 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21682143 - 21681772
Alignment:
Q  646 tttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca------- 738  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           
T  21682143 tttttatcaattcactctcattgctatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaac 21682044  T
Q  739 --gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgac 836  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  21682043 cagttgatcaaccttaacattcatgtgccctggttcataaagcatggttttctccaagatatgtagcaaagaacatccatccacgaacaacatccatgat 21681944  T
Q  837 aacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaa 935  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||| ||||| | ||    
T  21681943 aacttttcttcaaggctatgatagccttcaagagactcgccggttaaagttaaaacatcgtcgctaaaatggcccttcaattcatcaatgttatcagcaa 21681844  T
Q  936 tctttttgcgtcgatcctctagaat--aagccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    | ||||||  | |||||| | ||||     | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681843 tttttttgtatagatccttttgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtact 21681772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 642 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21992679 - 21992304
Alignment:
Q  642 atgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca--- 738  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||       
T  21992679 atgctttttatcaattcactctcattgttatctttccacaatagcttgagtactacgtaaggaagttgattctccaacagaagcacatccatcatcacaa 21992580  T
Q  739 ------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacataca 832  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21992579 gaaccagttgatcaactttaatattcatgtgcccaggttcatcaagcttggctttctctaagatatacaacaaagaacatccatccacgaacaacatcca 21992480  T
Q  833 cgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcg 931  Q
     |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  21992479 tgacagcttttcttcgaggcttccaaagccttcaagagactttccagctaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcg 21992380  T
Q  932 gaaatctttttgcgtcgatcctctagaataagccgtg--ttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
      |||||||||| || ||||   | || |||| | ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21992379 ataatctttttgtgtagatcgcatggattaagtcctgcattttcgatgtattttgctgcccacgtaagcttgtact 21992304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 642 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21726393 - 21726018
Alignment:
Q  642 atgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca--- 738  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  21726393 atgctttctatcaatccactctcgtcttcatctgtccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaa 21726294  T
Q  739 ------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacataca 832  Q
          ||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21726293 gaaccagttgatcaaccctaatattcatgtgccatggtttattaagatccgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatcca 21726194  T
Q  833 cgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcg-ctaaatgaccctttagttcgttaattttatcg 931  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   |  ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||     
T  21726193 cgacagcttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcgtcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatca 21726094  T
Q  932 gaaatctttttgcgtcgatcctctagaataag--ccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    | |||||||||| || |||||||| ||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21726093 gcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtccggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtact 21726018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 456 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21764718 - 21764184
Alignment:
Q  456 tgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattgata 555  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||    
T  21764718 tgtaccttggacttggatgtagtgaggatgactttatgctgaagatctagaagatgagtgggtgtctctgactgtgactcatttgttatt---attgata 21764622  T
Q  556 cactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttttatcaa 655  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||| || ||||| ||| || |  | |   | || | ||  || | |||| |||||||||    
T  21764621 cactatgttctccttctccttccatgttgttatctgactgtgactcacctggtatgttccgaagata---gttgggaaaactcatcatgcattttatcaa 21764525  T
Q  656 ttcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---------gttgatca 746  Q
    |||||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||| ||    
T  21764524 ttcactctcgttatt---tttccacaatagcttgagtacttcgtaaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgacca 21764428  T
Q  747 accttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttctt 846  Q
    |||||||| ||||||||||||                  |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21764427 accttaatcttcatgtgccct------------------ttctccaagagataaagcaaagagcatccatccacgaacaacatccacgacaacttttctt 21764346  T
Q  847 caaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaatctttttgcg 945  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  || ||||| | |||||||| | |    
T  21764345 caaggctatgaaagccttcaagagactttccagttaaagttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcgatgttatcagcaatcttttggtg 21764246  T
Q  946 tcgatcctctagaataa--gccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    | | |||||| || |||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21764245 tagttcctctggattaagtgcggtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtact 21764184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 453 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 15714321 - 15713745
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattg 552  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || ||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15714321 tattataccttggaattagatgtaatgaggatatatttacgctgtagatcaagaagatgagtgggtgtctctgactgtgactcatttcgtaatggtattg 15714222  T
Q  553 atacactatgttctccttctccttc------------------cttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaa 634  Q
    ||||||||| || |||||||||||                   ||||||||||| ||||| |||| |||||||  | ||| ||| || |  |||||||||    
T  15714221 atacactatattgtccttctccttttctgtttggaaccccgttcttctccttctttgactctgactcatctggcgtatccaaatgacgatggctgaggaa 15714122  T
Q  635 tttcctgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatc 734  Q
    |||||  |||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15714121 tttccacatgcatattatcaactcactctcgttgttatctttccacaatagcttgagtacttcataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatt 15714022  T
Q  735 at---------cagttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaaca 825  Q
    ||         ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | | |||   ||   || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15714021 atcacaagatccagttgatcaagcttaatatttatgggccctgcgtgaacaa---tg---ttatccaagatatgcagcaaagagcatccatccacgaaca 15713928  T
Q  826 acatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaat 924  Q
    |||| || |||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| | |||    
T  15713927 acatccatgacagcttttcttctaggctaccaaatccttgaagtgactttccggttaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacacttcagttcatcaat 15713828  T
Q  925 tttatcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaat--aagccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
     ||||| | |||||||||| |  | |||||||||||     | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15713827 gttatcagcaatctttttgtgcagttcctctagaatgcttccagtgtttttgatgtattttgccgcccacataagcttgtact 15713745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 649 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 21623683 - 21623383
Alignment:
Q  649 ttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---------g 739  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||         |    
T  21623683 ttatcaattcattctcgttgttatctttccacaatagcttgagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaaccacatcaatcatcacaagattccg 21623584  T
Q  740 ttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaac 839  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21623583 ttgatcaagcttaatattcatctgccctggttcatgaagcttggctgtatccatgatatgcagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagc 21623484  T
Q  840 ttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaatct 938  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||    
T  21623483 ttttctttaatgctaccaaagccttcaagagactttccggttaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacccttcagttcatcaatattatcagcaatct 21623384  T
Q  939 t 939  Q
    |    
T  21623383 t 21623383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 631 - 1005
Target Start/End: Original strand, 21807802 - 21808191
Alignment:
Q  631 ggaatttcctgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatc 730  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21807802 ggaaattcctcatgatttttatcaattcaccctcattgttatcttcccacaatagcttaagtactttataaggcagttgattctccaacaaaagcacatc 21807901  T
Q  731 catcatcag---------ttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagct---tggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatcc 818  Q
    | | |||||         |||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||| |    || || ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  21807902 cgttatcagaagaaccagttgatcaagcttaatatccacatgccctggctcatcaaaccacatgactgtctccaagatataaagcaaagagcatccatcc 21808001  T
Q  819 acgaacaacatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcg-ctaaatgaccctttagtt 917  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  21808002 acgaacaacatccatgacagcttttcttcaaggctaccaaagccttcaagagactggccggttaaagttaaaacatcgtcgccaaaatgacccttcagtt 21808101  T
Q  918 cgttaattttatcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaat-aagccg-tgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    | |  || ||||| | |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  21808102 catcgatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctagaataaagccgctgttttctatgtatttcgcagaccacataagcttgtact 21808191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 648 - 1003
Target Start/End: Complemental strand, 21647238 - 21646867
Alignment:
Q  648 tttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca--------- 738  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||| | || || |||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||             
T  21647238 tttatcaattcattctcattgttatctttcaataatagtttgagtactatgtaagggagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaacca 21647139  T
Q  739 gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatcc----atccacgaacaacatacacg 834  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| || ||||    
T  21647138 gtttatcaaccttaatattcatctgccctggttcatgaagcttggctttctctaagatatgcagcaaagaacatccatatatccacgaacaatatccacg 21647039  T
Q  835 acaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcgga 933  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||       
T  21647038 acaacttttcttcaaggctacggaagcctttaagagacttgccggtcaaagttaaaacgtcgtcgctaaaatgacccttcagttcatcaatgttatctac 21646939  T
Q  934 aatctttttgcgtcgatcctctagaat--aagccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgta 1003  Q
    |||||||||| || ||||||    |||     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646938 aatctttttgtgtagatccttcttaattcttcccgtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgta 21646867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 456 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21705305 - 21704765
Alignment:
Q  456 tgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattgata 555  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||      ||||||    
T  21705305 tgtaccttggaattagatgtggtgaggatgattttacgttgaagatcaagaagatgtgtgggtgtttctgactgtgactcatttggta------ttgata 21705212  T
Q  556 cactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttttatcaa 655  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| || ||||||  |           |||||  || | || | ||  |||| ||||||||||| ||    
T  21705211 cactatgttctccatttccctccttctctttctctgcctctgaccctacaa---------aataaatacagttgtgaaaactcctcatgctttttattaa 21705121  T
Q  656 ttcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---------gttgatca 746  Q
    | ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | |||         ||||||||    
T  21705120 tccactctcatcttcatctttccacaaaagcttgagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaagcacatcctccctcacaagagccagttgatca 21705021  T
Q  747 accttaatattcatgtgccct-gcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttct 845  Q
    ||||||||||||||  ||  | | | ||| | |       || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||     
T  21705020 accttaatattcatcggcagtaggtacataatg-------ttatccaagatatggagcaaagaacatccatccatgaacaatatccacgacagcttttca 21704928  T
Q  846 tcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaattttatcggaaatctttttgc 944  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||     
T  21704927 tcaaggcactcaaagccttgaagagagtttccggttagagttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgt 21704828  T
Q  945 gtcgatcctctagaataag--ccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    || | |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704827 gtagttcctctggaataagtccggtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 21704765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 642 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21628625 - 21628247
Alignment:
Q  642 atgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca--- 738  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  21628625 atgcattttatcaattcattctcattgttatctttccacaatagcttgagtacttcataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaa 21628526  T
Q  739 ------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttgg---ctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacat 829  Q
          ||||||||| |||||||| |||  ||| ||  |||| || |   |   |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21628525 gaaccagttgatcaagcttaatatccataggccttgggtcattaaacaacgtaactttctccaagatataaagcaaagagcatccatccacgaacaacat 21628426  T
Q  830 acacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctttagttcgttaatttta 928  Q
     ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| |||    
T  21628425 ccacgacagcttttcttcaaggcatccaaagccttgaagagagtttcccgttaaatttaaaacatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgtta 21628326  T
Q  929 tcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaataag--ccgtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    || | |||||||||| || | |||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21628325 tcagcaatctttttgtgtagttcctctggaataagtccaatgttttctatgtattttgatgcccacacaagcttgtact 21628247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21652856 - 21652716
Alignment:
Q  452 atattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtatt 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21652856 atattgtaccttggaattagatgtagttaggatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggttaaggtatc 21652757  T
Q  552 gatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21652756 gatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21652716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 453 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 21792667 - 21792237
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattg 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| |  | ||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||| ||| |      |||    
T  21792667 tattgtaccttggaattagatgcagtgaggatcattttacgatgcagatcaagaagatgattgggtggctctaacagtgactcatctggca------ttg 21792574  T
Q  553 atacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttttat 652  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||   ||||| ||||   | ||| |  |  | ||| ||| ||| | ||||||| |||    
T  21792573 atacactatgttgtccttctcctttcttctccttctctaaccgtggatcatctcgttt---caaatgaagatagttgaagaaattcgtcatgctttctat 21792477  T
Q  653 caattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatcagttgatcaacctta 752  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||             |    
T  21792476 taatgcactctggttgtcgtctttccacaatagcttgagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcac------------a 21792389  T
Q  753 atattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttcttcaaggc 852  Q
    ||| |||||||| ||  ||||  | ||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||    
T  21792388 atagtcatgtgctcttgttcaaaatgcttccatttctccaagatatgcaacaaagaacatccatccacgaacaatatccatgacagcttttcttcgaggc 21792289  T
Q  853 tatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaa 904  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21792288 taccaaagccgtcaagagacttgcgggttaaagttaaaacatcatcgctaaa 21792237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 643 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 21689909 - 21689645
Alignment:
Q  643 tgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---- 738  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||        
T  21689909 tgctttttatcaattcactcttgttgttatctttccacaatagctcgagtacttcataaggaagttgattctctaacaaaagcacatccaccatcacaat 21689810  T
Q  739 -----gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacac 833  Q
         |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  21689809 agctagttgatcaaccttaatatccataggccctggttcaacaagcctgtctttctccaagatataaagcaaagagcatccatccaccaacaacatccac 21689710  T
Q  834 gacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtc 898  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||    
T  21689709 gatagcttttcttcaagactatcaaagccttcgagagaatttccggtcaatgttaaaacatcgtc 21689645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 640 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21664606 - 21664220
Alignment:
Q  640 tgatgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca- 738  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  21664606 tgatgctttctatcaatccactcttgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggtagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcac 21664507  T
Q  739 --------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttgg-----ctttc-tccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaac 824  Q
            |||||||||||||||||| |||  || |||  ||||| | |   |     | | | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  21664506 aagaaccagttgatcaaccttaatatccataggctctgggtcatccatccacgtacaacatccatccaagatataaagcaaagagcatccatccacgaac 21664407  T
Q  825 aacatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaa---acatcgtcg-ctaaatgaccctttagttcgt 920  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| | ||||||||||| ||||| |    
T  21664406 aatatccacgacagcttttcttcaaggcttccaaagccttcaagagacttgccggttaaagttaaaattacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcat 21664307  T
Q  921 taattttatcggaaatctttttgcgtcgatcctctagaataagcc--gtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
      || |||||  ||||||||||| || |||||  | || | || |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21664306 cgatgttatcaaaaatctttttgtgtagatcccgtggattgagtcttgtattttcaatgtattttgctgcccacataagcttgtact 21664220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 453 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 21746197 - 21745758
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggt---gtctttgactgtgactcatttggtaatggta 549  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||| ||          
T  21746197 tattgtaccttggacttggatgtagtgaggttgagtttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtattgtctctgaatgtgactcatttgtta------ 21746104  T
Q  550 ttgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttt 649  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |            |||   ||    | ||| |||||||||  |||  ||    
T  21746103 ttgatacattatgttctcctcctccttcctcctccatctctgaccttgacgc------------ccagccactcgagatgatgaatttcctcgtgcactt 21746016  T
Q  650 tatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatcag---------t 740  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||          |    
T  21746015 tatcaattcactctcgttgttatcttttcacaatagctagagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaagtacatcgatcatcacaagaataact 21745916  T
Q  741 tgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaact 840  Q
     |||||| ||||||||||||||  | ||  | | |||   ||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||    
T  21745915 agatcaagcttaatattcatgtctcgtgggtgaacaa---tg---ttatccaagatatggagcaaagaacatccatctacgaataacatccacgacagct 21745822  T
Q  841 tttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaa 904  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21745821 tttcttcaaggcattcaaagccttgaagagaatttccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaa 21745758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 453 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629657 - 21629518
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattg 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |  ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21629657 tattgtaccttggaattagatgtagtgaggatgactttgcgttgaagatcaagaagatgagttggtttctctaactgtgactcatttggtactggtattg 21629558  T
Q  553 atacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21629557 atgcactatgttctccttctccttcctcctcgatctctga 21629518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 457 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 21647550 - 21647431
Alignment:
Q  457 gtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattgatac 556  Q
    |||||||||||||||||| | | || |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  21647550 gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatgagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgatac 21647451  T
Q  557 actatgttctccttctcctt 576  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21647450 actgtgttctccttctcctt 21647431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 545 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 21628725 - 21628666
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatc 604  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21628725 tggtattaatacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactgtgactcatc 21628666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 21657131 - 21656895
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggt---gtctttgactgtgactcatttggtaatggta 549  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |  |||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||| || ||          
T  21657131 tattgtaccttggaataagatgtagtgaggatgagtttccgttgaagatcaagaagatgagtgggtattgtctctgattgtgactcatctgcta------ 21657038  T
Q  550 ttgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctgactttgacccatctggtttgtcccaataacaaccgctgaggaatttcctgatgctttt 649  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||      |    |  | || | ||  |||| ||||||||    
T  21657037 ttgatgcactatgttctccatctcctttcttctccttcgctgactgtgacacatctggtatgatg---tgtagatggttgcgaaaactcctcatgctttt 21656941  T
Q  650 tatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtact 695  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21656940 tatcaattcactcttgttgtcatctttccacaatagcttgagtact 21656895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 572
Target Start/End: Original strand, 21807621 - 21807734
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattg 552  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||      || |||||    
T  21807621 tattttaccttggaattagatgtagggagcatgagtttacgctgaacatcaagaagatgagttggtgtctctgactgccactcatt------tgttattg 21807714  T
Q  553 atacactatgttctccttct 572  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21807715 atacactatgttcttcttct 21807734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21628785 - 21628738
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21628785 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21628738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21628845 - 21628798
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21628845 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21628798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21628905 - 21628858
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21628905 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21628858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21628965 - 21628918
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21628965 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21628918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629025 - 21628978
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629025 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21628978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629085 - 21629038
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629085 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629145 - 21629098
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629145 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629205 - 21629158
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629205 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629265 - 21629218
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629265 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629325 - 21629278
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629325 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629385 - 21629338
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629385 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629505 - 21629458
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629505 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21652703 - 21652656
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21652703 tggtattgatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21652656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 21786204 - 21786089
Alignment:
Q  455 ttgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggtaatggtattgat 554  Q
    |||||||||||   |||||||| | || ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||      | ||||||||    
T  21786204 ttgtaccttggttgtagatgtaatgaggatgatattacgctgaagatcaagaagatgaaagggtgtctctaactgtgactcatt------tcgtattgat 21786111  T
Q  555 acactatgttctccttctcctt 576  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  21786110 aaactatgttctccttctcctt 21786089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 453
Target Start/End: Original strand, 39266831 - 39266913
Alignment:
Q  371 cattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagat 453  Q
    |||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39266831 cattagcaattaatgaaggattattagagggaaaaattaggttaaatgatagcaagacctaataagcatttagaataagagat 39266913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21690096 - 21690039
Alignment:
Q  486 attttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggta 543  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21690096 attttgtgctgaagatcaagaagatgagtgggtgtcttcgaatgtgattcatttggta 21690039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 545 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21629445 - 21629398
Alignment:
Q  545 tggtattgatacactatgttctccttctccttccttctccttctctga 592  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21629445 tggtattaatacactatgttctccttctccttcctcctccatctctga 21629398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21664762 - 21664707
Alignment:
Q  484 tgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcattt 539  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21664762 tgattttacgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctccagctgtgactcattt 21664707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21709099 - 21709039
Alignment:
Q  453 tattgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgag 513  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  21709099 tattgtaccttggaattagaagtagtgaggaggatattatgctgaagatcaaaaagatgag 21709039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 966 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21623354 - 21623315
Alignment:
Q  966 gtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21623354 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtact 21623315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 966 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 21689574 - 21689535
Alignment:
Q  966 gtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21689574 gtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtact 21689535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 21726514 - 21726427
Alignment:
Q  455 ttgtaccttggaattagatgtagttagcatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggt 542  Q
    |||||||||||   |||||||| | || ||||| ||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21726514 ttgtaccttggttgtagatgtaatgaggatgatattacgccgacgatcaagaagatgaaagggtgtctttgactgggactcatctggt 21726427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 48846848 - 48846955
Alignment:
Q  342 ataggagggaaatattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagctttt 441  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||||| | || | | ||||||||||||||| | ||   | ||| |||||||||||| |||    
T  48846848 ataggagggaaatattggagggttgtttccattagcatttaatgacatattagtggagggaaaaattaggttaaactatagcaagacctaataagcattt 48846947  T
Q  442 agaataag 449  Q
    ||||||||    
T  48846948 agaataag 48846955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 642 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 25870 - 25590
Alignment:
Q  642 atgctttttatcaattcactctcgttgtcgtctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca--- 738  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||       
T  25870 atgctttgtatcaattcactctcattctcgtttttccacaatagcttgagtacttcataaggaagttgattttccaacaaaaccacatccaccatcacaa 25771  T
Q  739 ------gttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaagcttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacataca 832  Q
          |||||||||||||||||||||| | |||||  | || | |  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  25770 gaaaaagttgatcaaccttaatattcattttccctgggttattacgtctggcattctccaagatatgtagcaaagaacatccatccacgaacaacatcaa 25671  T
Q  833 cgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgct-aaatgaccctt 912  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25670 cgacagcttttcttcaagggtaccaaagccttcaagagactttttagttaaagttaaaacatcctcgctaaaatgaccctt 25590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 25986 - 25941
Alignment:
Q  529 gtgactcatttggtaatggtattgatacactatgttctccttctcc 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25986 gtgactcatttggtaatggtattgatacactatattctccttctcc 25941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 966 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 25471 - 25432
Alignment:
Q  966 gtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtact 1005  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25471 gtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtact 25432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9460808 - 9460587
Alignment:
Q  233 gtaacacgttaatatg-ccttggtaaacagcataaatcatgctgagtgggagattatttgggcttgcatgggatacacgaaag-tca-------atttga 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||       ||||||    
T  9460808 gtaacacgttaatatggccttggtaaaccgcataaatca----gagtaggagattatttgggattgcataggatacaccaaaggtcagtttgaaatttga 9460713  T
Q  324 aattcaaattgaacttgcataggagggaaatattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataa-ttagagggaaaaattagggttaatggttg 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460712 aattcaaattgaactttcataggagggaaatattttaggattgtatgc-ttagcatttaatgatagataaattagagggaaaaattagggttaatggttg 9460614  T
Q  423 catgacctaataagcttttagaataag 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9460613 catgacctaataagcatttagaataag 9460587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29134630 - 29134422
Alignment:
Q  233 gtaacacgttaatat-gccttggtaaacagcataaatcatgctgagtgggagattatttgggcttgcatgggatacacgaaag-tca-------atttga 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||       ||||||    
T  29134630 gtaacacgttaatattgccttggtaaaccgcataaatca----gagtaggagattatttgggcttgcataggatacaccaaaggtcagtttgaaatttga 29134535  T
Q  324 aattcaaattgaacttgcataggagggaaatattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgc 423  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29134534 aattcaaattgtacgttcatacgagggaaatattttaggattgtatgc-ttagcatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgc 29134436  T
Q  424 atgacctaataagc 437  Q
    |||| |||||||||    
T  29134435 atgatctaataagc 29134422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 43808767 - 43808836
Alignment:
Q  380 ttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataag 449  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43808767 ttaatgacagcttattagagggaaaaattagggttaatgatagcatgacctaataagcatttagagtaag 43808836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19468884 - 19468804
Alignment:
Q  369 tgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataag 449  Q
    |||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19468884 tgcattagcaattaatgacagattagtagagggaaaaattaggtttagtgcttgcaagacctaataagcatttagagtaag 19468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50461104 - 50461046
Alignment:
Q  391 taattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataag 449  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  50461104 taattagagggaaaaattaggttaaatggttgctagacctaataagcatttagagtaag 50461046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 317 - 437
Target Start/End: Original strand, 51387009 - 51387128
Alignment:
Q  317 aatttgaaattcaaattgaacttgcataggagggaaatattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaa 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51387009 aatttgaaatttaaattgaactttcataggagggaaatattttaggattgtatgc-ttagcatttaatgttagataattagagggaaaaattagggttaa 51387107  T
Q  417 tggttgcatgacctaataagc 437  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51387108 tggttgcatgacctaataagc 51387128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22370369 - 22370294
Alignment:
Q  380 ttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagatat 455  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  22370369 ttaatgacagcttattagagggaaaaattagggttaatgatagtatgacctaataagcatttagagtaagggatat 22370294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 38506018 - 38505951
Alignment:
Q  388 agataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagatat 455  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38506018 agattattagagggaaaatttaggttaagtggtagcatgacctaataagcatttagaataagggatat 38505951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 792 - 866
Target Start/End: Original strand, 18192049 - 18192123
Alignment:
Q  792 aagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatacacgacaacttttcttcaaggctatcaaagccttca 866  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18192049 aagatacgcaacaaagaacatccatccacaaacaacatccatgatagcttttcttccaagttatcaaagccttca 18192123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 448
Target Start/End: Original strand, 18332409 - 18332595
Alignment:
Q  261 gcataaatcatgctgagtgggagattatttgggcttgcatgggatacacgaaa-gtcaatttgaaatt-------caaattgaacttgcataggagggaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||       ||||||||||||||||||||| |||    
T  18332409 gcataaatcatgctgagtggatgattatttgggcttgcatgggatacaccaaaagtcaattttaaattttaaattcaaattgaacttgcataggagcgaa 18332508  T
Q  353 atattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataa 448  Q
     | ||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  18332509 tttttttag---------cattagcatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgatttaataagcatttagaataa 18332595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 21544814 - 21544912
Alignment:
Q  342 ataggagggaaatattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttt 440  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  21544814 ataggagggaaattttttagggttgtatggattagcatttaatgacagattattagagggaaaaattaggtttagaggttgcaagacctaataaacttt 21544912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34704124 - 34704048
Alignment:
Q  380 ttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagatatt 456  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34704124 ttaatgctagataattagagggaaaaattaggtttagtagtagcaagacctaataagcatttagaataagggatatt 34704048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12296264 - 12296193
Alignment:
Q  380 ttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagata 454  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||   || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12296264 ttaatgatggatgattagagggaaaaattaggttta---gtagcaagacctaataagcttttaaaataagggata 12296193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 384 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13629618 - 13629553
Alignment:
Q  384 tgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataag 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13629618 tgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctgataagcatttagaataag 13629553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 456
Target Start/End: Original strand, 47866606 - 47866664
Alignment:
Q  398 agggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagatatt 456  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47866606 agggaaaaattaggtttagtgcttgcaagacctaataagcatttagaataagagatatt 47866664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19514504 - 19514443
Alignment:
Q  393 attagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagata 454  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19514504 attagagggaaaaattaggttaaaaggttgcaagaccttataagcttttagaataagtgata 19514443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 454
Target Start/End: Original strand, 37148424 - 37148485
Alignment:
Q  393 attagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagata 454  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  37148424 attagaggaaaaaattagggttaatgatagcatgacctaataagcatttggagtaagggata 37148485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16032782 - 16032725
Alignment:
Q  380 ttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagc 437  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  16032782 ttaatgctagataatttgcgggaaatattaggtttagtggtagcatgacctaataagc 16032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41579323 - 41579249
Alignment:
Q  380 ttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagata 454  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41579323 ttaatgacaggttattagagggaaaaattagggttaatgatagcatgacctaataagcatttagagtaagggata 41579249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28000752 - 28000674
Alignment:
Q  371 cattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataag 449  Q
    |||||| | ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28000752 cattagcaattaatgaaaggttatttgagggaaaaattagggttaatgatagcatgacctaacaagcatttagaataag 28000674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39356780 - 39356711
Alignment:
Q  342 ataggagggaaatattttagagttgtatgcattagtatttaatgatagataattagagggaaaaattagg 411  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39356780 ataggagggaaatatattagggttatgtggattagcaattaatgacagattattagagggaaaaattagg 39356711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24118495 - 24118434
Alignment:
Q  393 attagagggaaaaattagggttaatggttgcatgacctaataagcttttagaataagagata 454  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  24118495 attagagggaaaaattaggttaaaaggttgcaagaccttataagctttcagagtaagtgata 24118434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University