View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3282-Insertion-1 (Length: 1140)
Name: NF3282-Insertion-1
Description: NF3282
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3282-Insertion-1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 885; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 885; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 1126
Target Start/End: Complemental strand, 1608313 - 1607180
Alignment:
| Q |
6 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
105 |
Q |
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| T |
1608313 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
1608214 |
T |
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| Q |
106 |
atgcaaaaagaagcacaagaaaattctcaacaacaacaaaactcattggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
205 |
Q |
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| T |
1608213 |
atgcaaaaagaagcacaagaaaattctcaacaacaacaaaactcatttgtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
1608114 |
T |
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| Q |
206 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
305 |
Q |
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| T |
1608113 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
1608014 |
T |
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| Q |
306 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattgtgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
405 |
Q |
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| T |
1608013 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattatgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
1607914 |
T |
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| Q |
406 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaatgattttatatttttctatttaaaatttaagtattgtactgctaaaaggttattcaataacttta |
505 |
Q |
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| T |
1607913 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaatgattttatatttttctatttaaaatttaagtattgtgctgctaaaaagttattcaataacttta |
1607814 |
T |
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| Q |
506 |
ttcatgaagaattaaatgtaagataaattattgaatgtttattttgtgacatacatagagtaatataaatatgatagggttgaaaatgggaagataaaaa |
605 |
Q |
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| T |
1607813 |
tttaggaagaattaaatgaaagataaattatggaatgtttattttgtgacatacatagagtaatataaatatgatagggttgaaaatgggaagataaaaa |
1607714 |
T |
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| Q |
606 |
tgaattttaaaataagaagacacaaagagcaattataatgtgtagatgttcaagtatcttcaatattttaggtatataatgttttaattttttcctnnnn |
705 |
Q |
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| T |
1607713 |
tgaattttaaaataacaagacacaaagagcaattataatttgtagatgttcaagtatcttcaatattttaggtatataatgttttaattttttcttaaaa |
1607614 |
T |
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| Q |
706 |
nnnntgttaaaattttgtaatctccagatttacatttgattcatatgataatattgatgtcataacactatcgcttatgtac-ttttatatga--atata |
802 |
Q |
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| T |
1607613 |
aaaatgttaaaattttgtaatctccagatttaaatttgattcatatgataatattgatgtcataacactatcgcttatgtactttttatatgaatatata |
1607514 |
T |
|
| Q |
803 |
tatagtcatattaatcaaaatatctggattcgtcacttgcagaaacagaagaagggtcatttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgca |
902 |
Q |
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| T |
1607513 |
tatagtcatactaatcaaaatttctggattcgtcacttgcagaaacagaagaagggtcatttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgca |
1607414 |
T |
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| Q |
903 |
gtctaagtctccagtaaagtacaatcttgtggt-gcaaaagatggttctggtcagtac-agactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaa |
1000 |
Q |
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| T |
1607413 |
gtcaaagggtccagtaaagtacaatcttgtggtggcaaaagatggttctggacagtacaagactgtgcaggctgctttaaatgctgctgctaagagaaaa |
1607314 |
T |
|
| Q |
1001 |
tataagaca--gtttgtgatacatg-taagaaagtgttttatagaagagaaca-tgag--tgctgtccataatgacaata-tatgctg--tggtgat-gt |
1090 |
Q |
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| T |
1607313 |
tataagacaaggtttgtgatacatgttaagaaaggtgtttatag-agagaacattgaggttgctgttcataatgacaatattatgctggttggtgatggg |
1607215 |
T |
|
| Q |
1091 |
atgccaaaata-cataataacaaggttctagaagtgt |
1126 |
Q |
| |
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| T |
1607214 |
atg-caaaataccataataacaa-gttctagaagtgt |
1607180 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 793; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 1126
Target Start/End: Complemental strand, 1625320 - 1624201
Alignment:
| Q |
6 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
1625320 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
1625221 |
T |
|
| Q |
106 |
atgcaaaaagaagcacaagaaaattctcaacaacaacaaaactcattggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
205 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
1625220 |
atgcaaaaagaagcacaagacaattctcaacaacaacaaaactcatcggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctagttgaaaacacaattt |
1625121 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
305 |
Q |
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| T |
1625120 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgcaagcaaaaattgttcaccgaatgatgtacaaacatggctcacaacttctctcacaaatattga |
1625021 |
T |
|
| Q |
306 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattgtgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
405 |
Q |
| |
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| T |
1625020 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcaatttcattatgcaaaccaatgtcattgagatgataaggaacatcttagccatcaat |
1624921 |
T |
|
| Q |
406 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaatgattttatatttttctatttaaaatttaagtattgtactgctaaaaggttattcaataacttta |
505 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
1624920 |
atgcattttctgaaacataacaaaggtattaacaatgattttatttttttctatttaaaa-ttaagtattgtactgctaaaaaattattcaataacttta |
1624822 |
T |
|
| Q |
506 |
ttcatgaagaattaaatgtaagataaattattgaatgtttattttgtgacatacatagagtaatataaatatgatagggttgaaaatgggaagataaaaa |
605 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1624821 |
tttaggaagaattaaatgaaagataaattattgaatgtttattttgtgacatacatagagtaatataaatatgatagggttaaaaatgggtatataaaaa |
1624722 |
T |
|
| Q |
606 |
tgaattttaaaataagaagacacaaagagcaattataatgtgtagatgttcaagtatcttcaatattttaggtatataatgttttaattttttcctnnnn |
705 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1624721 |
tgaattttaaaataagaagacac--agagcaattataatttgtagatgttcaagtatcttcaatattttaggtatataatgttttaattttttcttaaaa |
1624624 |
T |
|
| Q |
706 |
nnnntgttaaaattttgtaatctccagatttacatttgattcatatgataatattgatgtcataacactatcgcttatgtacttttatatgaatatatat |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1624623 |
aaaatgttaaaattttgtaatctccagatttaaatttaattcatatgataatattgatgtcataacactatggcttatgtacttt--------tatatat |
1624532 |
T |
|
| Q |
806 |
agtcatattaatcaaaatatctggattcgtcacttgcagaaacagaagaagggtcatttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtc |
905 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1624531 |
agtcatactaatcaaaatttctggatccgtcacttgcagaaacagaagaagggtcatttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtc |
1624432 |
T |
|
| Q |
906 |
taagtctccagtaaagtacaatcttgtggt-gcaaaagatggttctggtcagtac-agactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatat |
1003 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1624431 |
aaagggtccagtaaagtacaatcttgtggtggcaaaagatggttctggtcagtacaagactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatat |
1624332 |
T |
|
| Q |
1004 |
aagaca--gtttgtgatacatg-taagaaagtgttttatagaagagaaca-tgag--tgctgtccataatgacaata-tatgctg--tggtgat-gtatg |
1093 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |
|
|
| T |
1624331 |
aagacaaggtttgtgatacatgttaagaaaggtgtttatag-agagaacattgaggttgctgttcataatgacaatattatgctggttggtgatgggatg |
1624233 |
T |
|
| Q |
1094 |
ccaaaata-cataataacaaggttctagaagtgt |
1126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1624232 |
-caaaataccataataacaa-gttctagaagtgt |
1624201 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 460 - 1126
Target Start/End: Complemental strand, 1630852 - 1630176
Alignment:
| Q |
460 |
ttaaaatttaagtattgtactgctaaaaggttattcaataactttattcatgaagaattaaatgtaagataaattattgaatgtttattttgtgacatac |
559 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1630852 |
ttaaaatttaagtattgtactgctaaaaggttattcaataactttattcaggaagaattaaatgaaagataaattattgagtgtttattttgtgacatac |
1630753 |
T |
|
| Q |
560 |
atagagtaatataaatatgatagggttgaaaatgggaagataaaaatgaattttaaaataagaagacacaaagagcaattataatgtgtagatgttcaag |
659 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1630752 |
atagagtaatataaatatgatagggttgaaaatgggaagataaaaatgaattttaaaataagaagacacaaagagcaattataatgtgtagatgttcaag |
1630653 |
T |
|
| Q |
660 |
tatcttcaatattttaggtatataatgttttaattttttcctnnnnnnnntgttaaaattttgtaatctccagatttacatttgattcatatgataatat |
759 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1630652 |
tatattcaatattttaggtatataatgttttaattttttcctaaaaaaaatgttaaaattttgtaatctccagatttacatttgattcatataataatat |
1630553 |
T |
|
| Q |
760 |
tgatgtcataacactatcgcttatgtacttttatatgaatatatatagtcatattaatcaaaatatctggattcgtcacttgcagaaacagaagaagggt |
859 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1630552 |
tgaagtcatagcactatcgcttatgtacttttatatgaatatatatagtcatactaatcaaaaattttggattcgtcacttgcagaaacagaagaagggt |
1630453 |
T |
|
| Q |
860 |
catttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtctaagtctccagtaaagtacaatcttgtggt-gcaaaagatggttctggtcagta |
958 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1630452 |
cattttcaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtctaagtctccagtaaagtacaatcttgtggtggcaaaagatggttctggacagta |
1630353 |
T |
|
| Q |
959 |
c-agactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatataagaca--gtttgtgatacatg-taagaaagtgttttatagaagagaaca-tga |
1053 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
1630352 |
caagactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatataagacaaggtttgtgatacatgttaagaaaggtgtttatag-agagaacattga |
1630254 |
T |
|
| Q |
1054 |
g--tgctgtccataatgacaata-tatgctg--tggtgat-gtatgccaaaata-cataataacaaggttctagaagtgt |
1126 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1630253 |
ggttgctgttcataatgacaatattatgctggttggtgatgggatg-caaaataccataataacaa-gttctagaagtgt |
1630176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1631803 - 1631340
Alignment:
| Q |
6 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1631803 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
1631704 |
T |
|
| Q |
106 |
atgcaaaaagaagcacaagaaaattctcaacaacaacaaaactcattggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1631703 |
atgcaaaaagaagcacaagcaaattctcaacaacaacaaaactcattggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
1631604 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1631603 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
1631504 |
T |
|
| Q |
306 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattgtgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1631503 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattatgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
1631404 |
T |
|
| Q |
406 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaatgattttatatttttctatttaaaattta |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1631403 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaatgattttatatttttctatttaaaattta |
1631340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 10818742 - 10819219
Alignment:
| Q |
6 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10818742 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagaattgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaccaagctcttacc |
10818841 |
T |
|
| Q |
106 |
atgcaaaaagaagcacaagaaaattctcaacaacaacaaaactcattggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
10818842 |
atgcaaaaagaagcacatgaaaattctcaac---aacaaaactcatcggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatatgaaaatacaattt |
10818938 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10818939 |
ttcatctcaaccgcacacttgaaggcttaaacaatgcaagtaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctcacaacttctctcacaaatattga |
10819038 |
T |
|
| Q |
306 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattgtgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10819039 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcaatttcattatgcaagccaatgtcactgagatgataaggaacatcttagccatcaat |
10819138 |
T |
|
| Q |
406 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaatgattttatatttttctatttaaaatttaagtattgtactgctaaaa |
487 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10819139 |
atgcatttcctgaatcataaaacaggtactaacaatgattttatttttttctatttaaaa-gtaagtattgtagtgctaaaa |
10819219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 750 - 1024
Target Start/End: Original strand, 10819711 - 10819995
Alignment:
| Q |
750 |
atgataatattgatgtcataacactatcgcttatgtactttt-atatgaatatatatagtcatattaatcaaaatatctggattcgtcacttgcagaaac |
848 |
Q |
| |
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| T |
10819711 |
atgataatattgatgtcataacactatcgcttatgtactttttatataaatatatatagtcatactaatctaaatttctggatccgtca-ttgcagaaac |
10819809 |
T |
|
| Q |
849 |
agaa------gaagggtcatttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtctaagtctccagtaaagtacaatcttgtggt-gcaaaa |
941 |
Q |
| |
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| T |
10819810 |
agaaatagaagaagggtcacttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtctaagtctccaatgaagttcaatcttgtggtggcaaaa |
10819909 |
T |
|
| Q |
942 |
gatggttctggtcagtac-agactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatataagaca--gtttgtgatacatgt |
1024 |
Q |
| |
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|
| T |
10819910 |
gatggttctggacagtacaagactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatacaagacaaggtatgtgatacatgt |
10819995 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 585 - 699
Target Start/End: Original strand, 10819521 - 10819635
Alignment:
| Q |
585 |
ttgaaaatgggaagataaaaatgaattttaaaataagaagacacaaagagcaattataatgtgtagatgttcaagtatcttcaatattttaggtatataa |
684 |
Q |
| |
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| T |
10819521 |
ttgaaaacgggaagctaaaaaagaattttaaaatatgaagacacaaagaacaattataatttgtagatgatgaagtttcttcaattttttaggtatataa |
10819620 |
T |
|
| Q |
685 |
tgttttaattttttc |
699 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |
|
|
| T |
10819621 |
agttttaattttttc |
10819635 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 598 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 1603086 - 1602996
Alignment:
| Q |
598 |
gataaaaatgaattttaaaataagaagacacaaagagcaattataatgtgtagatgttcaagtatcttcaatattttaggtatataatgttttaa |
692 |
Q |
| |
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|
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| T |
1603086 |
gataaaaaataattttaaaatatgaagacaca----gcaattataatttgtatatgatgaagtatcttcaattttttaggtatataatgttttaa |
1602996 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18786261 - 18785826
Alignment:
| Q |
6 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcatttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttcaattagccttaaaacaagctcttacc |
105 |
Q |
| |
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| T |
18786261 |
caaacactacacaacacaaatgaacaatcacttcaaaatcaaacatagagttgaattcagggaaatgcttgttaaattagccttaaaccaagctcttacc |
18786162 |
T |
|
| Q |
106 |
atgcaaaaagaagcacaagaaaattctcaacaacaacaaaactcattggtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatttgaaaacacaattt |
205 |
Q |
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| T |
18786161 |
atgcaaaaagaagcacaagataattctcaacaacaacaaaactcatccgtgcataaaacggttcatgctgattgtttcaagctatttgaaaacacaattt |
18786062 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcatctcaaccgtacacttgaaggcttaaacaatgctagcaaaaattgttcaccaaatgatgcacaaacatggctaacaacttctctcacaaatattga |
305 |
Q |
| |
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| T |
18786061 |
ttcatctcaaccatacacttgaaggcttaaacaatgcaagcaaaaattgttcaccgaatgatgtacaaacatggctcacaacttctctcacaaatattga |
18785962 |
T |
|
| Q |
306 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcgatttcattgtgcaaaccaatgtcactgaaatgataaggaacatcttagccatcaat |
405 |
Q |
| |
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| T |
18785961 |
aacatgtaaaagtggagctttagaactcaatgctcaagatttcaatttcattatgcaaaccaatgtcattgagatgataaggaacatcttagccatcaat |
18785862 |
T |
|
| Q |
406 |
atgcatttcctgaaacatagcaaaggtactaacaat |
441 |
Q |
| |
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| T |
18785861 |
atgcatttcctaaaacataacaaaggtaataacaat |
18785826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 835 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 18785528 - 18785335
Alignment:
| Q |
835 |
tcacttgcagaaacagaagaagggtcatttccaaattggttttctgtgcatgaaaggaagcttttgcagtctaagtctccagtaaagtacaatcttgtgg |
934 |
Q |
| |
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|
| T |
18785528 |
tcacttgcagaaacagaagaagggtcatttccaaattggttttctatgcatgaaaggaagcttttgcagtctaagtctccagtaaagtacaatattgtgg |
18785429 |
T |
|
| Q |
935 |
t-gcaaaagatggttctggtcagtac-agactgtgcaagctgctttaaatgctgctgctaagagaaaatataagaca--gtttgtgatacatgt |
1024 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
18785428 |
tggcaaaagatggttctggacagtacaagactgtgcaagctgctctaaatgctgctgctaagagaaaatataagacaaggtttgtgatacatgt |
18785335 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10144758 - 10144721
Alignment:
| Q |
154 |
gtgcataaaacggttcatggtgattgtttgaagctatt |
191 |
Q |
| |
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| T |
10144758 |
gtgcatgaaacggttcatcgtgattgtttgaagctatt |
10144721 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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