View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3294_low_5 (Length: 238)

Name: NF3294_low_5
Description: NF3294
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3294_low_5
NF3294_low_5
[»] chr7 (151 HSPs)
chr7 (2-215)||(2325593-2325806)
chr7 (1-214)||(37100116-37100329)
chr7 (1-215)||(12199298-12199512)
chr7 (6-215)||(35963981-35964190)
chr7 (1-215)||(21507102-21507318)
chr7 (1-214)||(16330640-16330854)
chr7 (1-215)||(48801000-48801217)
chr7 (6-215)||(33612024-33612235)
chr7 (6-214)||(9004745-9004955)
chr7 (7-215)||(41722825-41723034)
chr7 (1-215)||(826376-826591)
chr7 (1-215)||(828387-828602)
chr7 (1-215)||(12548062-12548277)
chr7 (1-215)||(15916047-15916262)
chr7 (1-215)||(15924356-15924571)
chr7 (6-215)||(4466411-4466621)
chr7 (6-215)||(8713116-8713326)
chr7 (6-215)||(8718620-8718830)
chr7 (6-215)||(9009730-9009940)
chr7 (6-215)||(9577982-9578192)
chr7 (6-215)||(14229705-14229915)
chr7 (6-215)||(19014396-19014606)
chr7 (6-215)||(4030137-4030346)
chr7 (8-215)||(5840800-5841008)
chr7 (6-215)||(648541-648752)
chr7 (1-215)||(821363-821578)
chr7 (1-215)||(9258383-9258595)
chr7 (1-215)||(9311658-9311870)
chr7 (6-215)||(14448-14658)
chr7 (6-215)||(544888-545098)
chr7 (6-215)||(4158429-4158639)
chr7 (6-215)||(15061381-15061591)
chr7 (6-215)||(15066470-15066680)
chr7 (6-215)||(18389787-18389997)
chr7 (6-215)||(23203918-23204128)
chr7 (6-215)||(23510045-23510255)
chr7 (6-215)||(23515827-23516037)
chr7 (6-215)||(10204845-10205056)
chr7 (6-214)||(4313340-4313550)
chr7 (1-215)||(5397849-5398066)
chr7 (6-215)||(17946843-17947053)
chr7 (1-215)||(23293449-23293666)
chr7 (1-215)||(30257474-30257691)
chr7 (6-215)||(48340357-48340569)
chr7 (6-215)||(538014-538224)
chr7 (1-215)||(3201435-3201652)
chr7 (1-215)||(3210475-3210692)
chr7 (38-215)||(8521908-8522085)
chr7 (6-215)||(13434996-13435207)
chr7 (6-215)||(13731914-13732125)
chr7 (1-215)||(20109140-20109356)
chr7 (1-215)||(16487496-16487710)
chr7 (7-215)||(4307977-4308187)
chr7 (1-215)||(13652105-13652322)
chr7 (1-215)||(18072206-18072423)
chr7 (1-215)||(35953800-35954017)
chr7 (1-215)||(14551791-14552006)
chr7 (1-215)||(19364521-19364736)
chr7 (1-215)||(13658628-13658845)
chr7 (1-215)||(15205819-15206036)
chr7 (6-215)||(15173643-15173855)
chr7 (1-215)||(14545551-14545766)
chr7 (1-224)||(16154717-16154943)
chr7 (1-215)||(16119087-16119304)
chr7 (1-215)||(18274125-18274342)
chr7 (1-215)||(18288340-18288557)
chr7 (1-215)||(45407552-45407769)
chr7 (38-224)||(9192665-9192853)
chr7 (1-215)||(16464875-16465092)
chr7 (1-215)||(23077018-23077235)
chr7 (1-215)||(13674616-13674833)
chr7 (1-215)||(14582027-14582244)
chr7 (1-215)||(14752879-14753096)
chr7 (1-215)||(15176395-15176612)
chr7 (1-215)||(16076572-16076789)
chr7 (1-215)||(16471401-16471618)
chr7 (1-215)||(18588995-18589212)
chr7 (1-215)||(18592589-18592806)
chr7 (1-215)||(18599220-18599437)
chr7 (1-215)||(18618878-18619095)
chr7 (1-215)||(27292059-27292276)
chr7 (1-215)||(39387911-39388128)
chr7 (6-213)||(3376265-3376472)
chr7 (15-215)||(319766-319968)
chr7 (1-215)||(13667938-13668155)
chr7 (1-215)||(16532805-16533022)
chr7 (1-215)||(16632640-16632857)
chr7 (1-213)||(39271283-39271495)
chr7 (1-215)||(34390748-34390963)
chr7 (1-215)||(24057797-24058014)
chr7 (83-215)||(16097260-16097392)
chr7 (1-215)||(12575920-12576137)
chr7 (6-215)||(48355315-48355527)
chr7 (1-215)||(12562065-12562280)
chr7 (78-215)||(9725873-9726010)
chr7 (1-215)||(22578752-22578967)
chr7 (108-215)||(25180921-25181028)
chr7 (2-215)||(20624729-20624942)
chr7 (6-215)||(782520-782732)
chr7 (2-215)||(4294723-4294937)
chr7 (6-215)||(15706996-15707206)
chr7 (83-219)||(12661747-12661883)
chr7 (2-215)||(20627048-20627262)
chr7 (2-215)||(20630939-20631153)
chr7 (2-215)||(20635547-20635761)
chr7 (2-215)||(20637419-20637633)
chr7 (2-215)||(38387902-38388116)
chr7 (9-210)||(48713581-48713782)
chr7 (108-215)||(11953993-11954100)
chr7 (6-215)||(12567765-12567977)
chr7 (6-215)||(14941486-14941695)
chr7 (6-215)||(15369079-15369288)
chr7 (97-215)||(16525736-16525854)
chr7 (1-112)||(1614098-1614210)
chr7 (6-213)||(8780197-8780405)
chr7 (6-76)||(9585408-9585478)
chr7 (4-213)||(9193766-9193976)
chr7 (4-213)||(9562064-9562273)
chr7 (4-213)||(21005274-21005484)
chr7 (4-112)||(16897112-16897222)
chr7 (6-213)||(8787036-8787244)
chr7 (1-123)||(368234-368357)
chr7 (1-79)||(4790775-4790855)
chr7 (4-138)||(6257348-6257484)
chr7 (1-102)||(16497878-16497982)
chr7 (1-72)||(4090826-4090897)
chr7 (1-72)||(39388860-39388931)
chr7 (158-212)||(23292494-23292548)
chr7 (6-125)||(33609855-33609975)
chr7 (1-150)||(4256427-4256578)
chr7 (1-95)||(6712311-6712405)
chr7 (6-87)||(9264240-9264323)
chr7 (4-74)||(4460651-4460721)
chr7 (1-95)||(17911711-17911806)
chr7 (1-72)||(19515251-19515322)
chr7 (1-95)||(38877532-38877626)
chr7 (4-109)||(1462676-1462782)
chr7 (165-215)||(10838703-10838753)
chr7 (1-74)||(11483744-11483817)
chr7 (4-95)||(17206262-17206353)
chr7 (1-112)||(46274230-46274335)
chr7 (1-74)||(4316873-4316945)
chr7 (1-121)||(11997180-11997301)
chr7 (1-125)||(30063799-30063922)
chr7 (1-95)||(4465652-4465748)
chr7 (4-95)||(4983015-4983106)
chr7 (166-213)||(4090992-4091039)
chr7 (1-95)||(15523155-15523249)
chr7 (186-215)||(3197166-3197195)
chr7 (1-74)||(25034208-25034279)
chr7 (1-112)||(679344-679455)
[»] chr3 (153 HSPs)
chr3 (1-215)||(17388603-17388818)
chr3 (1-215)||(43841813-43842028)
chr3 (1-219)||(5687807-5688025)
chr3 (1-215)||(14071464-14071678)
chr3 (1-215)||(17480596-17480811)
chr3 (1-215)||(14866811-14867026)
chr3 (1-215)||(15429980-15430195)
chr3 (6-215)||(34053360-34053571)
chr3 (1-215)||(4830177-4830392)
chr3 (1-215)||(22164469-22164684)
chr3 (1-215)||(22169773-22169988)
chr3 (6-215)||(2781375-2781585)
chr3 (6-215)||(3338496-3338706)
chr3 (6-215)||(4768763-4768973)
chr3 (6-215)||(6710173-6710383)
chr3 (6-215)||(6809794-6810004)
chr3 (6-215)||(6815616-6815826)
chr3 (6-215)||(13093713-13093923)
chr3 (6-215)||(15854336-15854546)
chr3 (6-215)||(41473052-41473262)
chr3 (6-215)||(2722066-2722275)
chr3 (1-221)||(3279962-3280182)
chr3 (6-215)||(14494573-14494785)
chr3 (1-215)||(19566744-19566959)
chr3 (1-215)||(2006078-2006292)
chr3 (6-215)||(4365976-4366186)
chr3 (6-215)||(4383505-4383715)
chr3 (6-215)||(15424917-15425127)
chr3 (6-215)||(16385204-16385414)
chr3 (6-215)||(24696986-24697196)
chr3 (6-210)||(53354556-53354761)
chr3 (1-215)||(21264828-21265044)
chr3 (6-215)||(25765583-25765794)
chr3 (6-215)||(9360230-9360440)
chr3 (6-215)||(13087650-13087860)
chr3 (6-214)||(12246933-12247142)
chr3 (1-215)||(13194695-13194912)
chr3 (1-215)||(15944656-15944873)
chr3 (1-215)||(6829412-6829627)
chr3 (6-215)||(9365747-9365957)
chr3 (6-215)||(13098440-13098650)
chr3 (7-221)||(16034208-16034421)
chr3 (6-215)||(20556189-20556398)
chr3 (1-215)||(12775791-12776008)
chr3 (1-215)||(15947327-15947544)
chr3 (6-215)||(47974956-47975167)
chr3 (6-215)||(5226244-5226455)
chr3 (6-215)||(25055149-25055359)
chr3 (1-215)||(5211942-5212159)
chr3 (1-215)||(7785722-7785939)
chr3 (1-215)||(11948125-11948342)
chr3 (1-215)||(13204287-13204504)
chr3 (1-215)||(50908663-50908880)
chr3 (1-215)||(53160287-53160504)
chr3 (6-215)||(14976057-14976269)
chr3 (6-215)||(14660558-14660752)
chr3 (1-215)||(10559589-10559806)
chr3 (1-215)||(13665231-13665448)
chr3 (1-215)||(15951898-15952115)
chr3 (1-215)||(20154161-20154378)
chr3 (1-215)||(20155774-20155991)
chr3 (1-214)||(13325941-13326157)
chr3 (20-215)||(43496344-43496540)
chr3 (1-215)||(8991539-8991756)
chr3 (1-215)||(30026610-30026827)
chr3 (1-215)||(42281065-42281282)
chr3 (9-215)||(3249872-3250080)
chr3 (1-215)||(16377526-16377742)
chr3 (76-215)||(1991022-1991161)
chr3 (6-215)||(11399011-11399221)
chr3 (1-215)||(10546205-10546422)
chr3 (1-215)||(11940348-11940565)
chr3 (1-215)||(13135471-13135688)
chr3 (1-215)||(13142079-13142296)
chr3 (1-215)||(15573166-15573383)
chr3 (1-215)||(17732992-17733209)
chr3 (1-215)||(14347829-14348043)
chr3 (1-215)||(7601115-7601332)
chr3 (1-215)||(10159426-10159643)
chr3 (1-215)||(10166087-10166304)
chr3 (1-215)||(10601718-10601935)
chr3 (1-215)||(11880240-11880457)
chr3 (1-215)||(13193301-13193518)
chr3 (1-215)||(14815750-14815967)
chr3 (1-215)||(15564030-15564247)
chr3 (6-186)||(16334194-16334375)
chr3 (1-215)||(16372807-16373024)
chr3 (1-215)||(18128711-18128928)
chr3 (1-215)||(18214088-18214305)
chr3 (1-215)||(10249036-10249252)
chr3 (1-214)||(15634813-15635029)
chr3 (1-215)||(10147756-10147973)
chr3 (1-215)||(12186319-12186536)
chr3 (1-215)||(12192733-12192950)
chr3 (1-215)||(12199374-12199591)
chr3 (1-215)||(13186670-13186887)
chr3 (1-215)||(13504139-13504356)
chr3 (1-215)||(15556179-15556396)
chr3 (1-215)||(16705741-16705958)
chr3 (1-215)||(37935294-37935511)
chr3 (1-215)||(37943139-37943356)
chr3 (48-215)||(17766537-17766705)
chr3 (48-215)||(19067857-19068025)
chr3 (21-215)||(13605187-13605380)
chr3 (1-215)||(10141150-10141367)
chr3 (1-215)||(10608030-10608247)
chr3 (1-215)||(32403620-32403837)
chr3 (1-215)||(1803-2023)
chr3 (58-215)||(3212640-3212798)
chr3 (1-215)||(37978055-37978272)
chr3 (1-182)||(13000673-13000857)
chr3 (10-215)||(3244825-3245032)
chr3 (2-215)||(14444996-14445210)
chr3 (1-215)||(14457043-14457258)
chr3 (52-215)||(55514936-55515100)
chr3 (6-215)||(19655848-19656060)
chr3 (1-169)||(4651430-4651601)
chr3 (1-215)||(14137501-14137695)
chr3 (4-133)||(36076324-36076454)
chr3 (6-215)||(20155096-20155300)
chr3 (2-215)||(13068915-13069129)
chr3 (6-215)||(20150642-20150847)
chr3 (1-215)||(15639184-15639384)
chr3 (1-215)||(15645760-15645960)
chr3 (145-215)||(14953554-14953624)
chr3 (150-215)||(15234057-15234122)
chr3 (1-101)||(27407342-27407443)
chr3 (1-96)||(11827277-11827373)
chr3 (1-202)||(20224992-20225194)
chr3 (1-73)||(13418513-13418585)
chr3 (4-150)||(17023382-17023529)
chr3 (7-125)||(22038976-22039095)
chr3 (4-74)||(17041849-17041919)
chr3 (133-215)||(36079323-36079405)
chr3 (166-215)||(4654768-4654817)
chr3 (6-125)||(42244387-42244506)
chr3 (1-72)||(1993577-1993648)
chr3 (1-72)||(1998736-1998807)
chr3 (1-72)||(10850611-10850682)
chr3 (1-125)||(8685683-8685807)
chr3 (4-150)||(13069902-13070049)
chr3 (44-209)||(17209753-17209919)
chr3 (4-74)||(17050862-17050932)
chr3 (1-74)||(8532019-8532092)
chr3 (1-52)||(5666663-5666714)
chr3 (181-215)||(16336176-16336210)
chr3 (1-125)||(11577587-11577710)
chr3 (1-125)||(41545605-41545728)
chr3 (2-125)||(27992547-27992670)
chr3 (1-123)||(17577036-17577158)
chr3 (1-138)||(7908649-7908787)
chr3 (154-184)||(13204261-13204291)
chr3 (1-74)||(11869728-11869800)
[»] chr8 (107 HSPs)
chr8 (1-215)||(24034791-24035005)
chr8 (4-215)||(18264141-18264353)
chr8 (7-215)||(14878045-14878253)
chr8 (1-215)||(22818363-22818577)
chr8 (1-214)||(17126961-17127174)
chr8 (1-215)||(45466817-45467034)
chr8 (1-215)||(18230395-18230611)
chr8 (1-215)||(20263538-20263754)
chr8 (1-215)||(21050167-21050383)
chr8 (1-215)||(19997509-19997724)
chr8 (1-215)||(25751456-25751671)
chr8 (6-215)||(20043883-20044093)
chr8 (6-215)||(21103385-21103595)
chr8 (6-215)||(22370678-22370888)
chr8 (6-215)||(35996214-35996424)
chr8 (1-215)||(23879942-23880158)
chr8 (6-215)||(1685785-1685995)
chr8 (6-215)||(20038228-20038438)
chr8 (6-215)||(21105427-21105637)
chr8 (6-215)||(29325431-29325641)
chr8 (1-215)||(22831266-22831482)
chr8 (1-215)||(21939233-21939448)
chr8 (1-215)||(33632550-33632767)
chr8 (1-215)||(38349663-38349880)
chr8 (6-215)||(14351394-14351611)
chr8 (1-215)||(22285101-22285315)
chr8 (6-215)||(11351272-11351482)
chr8 (1-168)||(6570376-6570543)
chr8 (1-215)||(20002865-20003080)
chr8 (1-215)||(21945168-21945383)
chr8 (1-215)||(26826617-26826834)
chr8 (1-215)||(18399398-18399615)
chr8 (1-215)||(21821475-21821692)
chr8 (1-215)||(21831757-21831974)
chr8 (1-215)||(21842781-21842998)
chr8 (1-215)||(23912202-23912419)
chr8 (1-215)||(27537572-27537789)
chr8 (1-215)||(42418267-42418482)
chr8 (6-215)||(9317967-9318177)
chr8 (6-215)||(15759690-15759900)
chr8 (1-215)||(21098031-21098248)
chr8 (1-215)||(21858592-21858809)
chr8 (1-215)||(23904347-23904564)
chr8 (1-215)||(25228753-25228970)
chr8 (2-175)||(39730493-39730668)
chr8 (1-215)||(19768266-19768483)
chr8 (1-215)||(20836216-20836433)
chr8 (1-215)||(22098914-22099131)
chr8 (1-214)||(20713196-20713412)
chr8 (1-214)||(21956037-21956253)
chr8 (6-221)||(25397062-25397278)
chr8 (6-215)||(17613310-17613521)
chr8 (6-215)||(17621492-17621703)
chr8 (1-215)||(19360018-19360235)
chr8 (1-215)||(40952001-40952218)
chr8 (1-215)||(8328750-8328967)
chr8 (1-183)||(23779554-23779739)
chr8 (1-214)||(21950235-21950451)
chr8 (4-153)||(18273216-18273366)
chr8 (1-215)||(8308579-8308796)
chr8 (1-215)||(8322084-8322301)
chr8 (1-215)||(18821580-18821797)
chr8 (1-215)||(21382852-21383069)
chr8 (1-215)||(22032814-22033031)
chr8 (1-215)||(22039416-22039633)
chr8 (1-215)||(22093343-22093560)
chr8 (1-215)||(22103132-22103349)
chr8 (10-215)||(18162127-18162336)
chr8 (1-215)||(8315227-8315444)
chr8 (1-215)||(16418184-16418401)
chr8 (1-215)||(43836044-43836242)
chr8 (6-215)||(23503265-23503474)
chr8 (1-215)||(14821312-14821527)
chr8 (1-215)||(37652935-37653150)
chr8 (6-215)||(17515552-17515765)
chr8 (83-215)||(21037797-21037929)
chr8 (2-215)||(17503937-17504151)
chr8 (6-148)||(26013103-26013246)
chr8 (6-140)||(11346308-11346443)
chr8 (116-215)||(22364280-22364379)
chr8 (4-213)||(6279878-6280087)
chr8 (1-190)||(1302069-1302261)
chr8 (1-112)||(23455708-23455820)
chr8 (1-213)||(21139793-21140006)
chr8 (1-111)||(1693249-1693362)
chr8 (6-213)||(1990239-1990447)
chr8 (1-125)||(21319549-21319674)
chr8 (157-215)||(21328462-21328520)
chr8 (6-125)||(14161973-14162092)
chr8 (1-74)||(22854132-22854206)
chr8 (1-92)||(24039258-24039352)
chr8 (4-213)||(23193689-23193900)
chr8 (1-72)||(29003758-29003829)
chr8 (1-66)||(5579193-5579258)
chr8 (4-150)||(19792041-19792187)
chr8 (1-125)||(24342185-24342310)
chr8 (1-75)||(22029862-22029938)
chr8 (1-73)||(18008262-18008334)
chr8 (1-95)||(15636203-15636296)
chr8 (4-172)||(23221300-23221471)
chr8 (1-150)||(26854193-26854346)
chr8 (6-125)||(24967385-24967505)
chr8 (1-95)||(15634430-15634523)
chr8 (1-74)||(31469553-31469625)
chr8 (38-125)||(22904759-22904846)
chr8 (186-215)||(27063439-27063468)
chr8 (186-215)||(27092551-27092580)
[»] chr1 (74 HSPs)
chr1 (5-214)||(49379395-49379605)
chr1 (6-215)||(8648996-8649207)
chr1 (1-215)||(13250861-13251076)
chr1 (1-214)||(17986683-17986896)
chr1 (1-215)||(8653877-8654093)
chr1 (1-215)||(36850106-36850320)
chr1 (1-215)||(2386353-2386568)
chr1 (6-215)||(17716878-17717087)
chr1 (1-215)||(27911079-27911294)
chr1 (6-215)||(3985386-3985596)
chr1 (6-215)||(3990665-3990875)
chr1 (6-215)||(16485407-16485617)
chr1 (6-215)||(38045465-38045675)
chr1 (1-215)||(4028430-4028645)
chr1 (6-215)||(28206107-28206319)
chr1 (1-215)||(46143291-46143506)
chr1 (6-215)||(27041814-27042024)
chr1 (6-215)||(27047568-27047778)
chr1 (6-215)||(39286380-39286591)
chr1 (1-215)||(41461851-41462065)
chr1 (1-215)||(18885151-18885366)
chr1 (6-215)||(26134280-26134491)
chr1 (6-215)||(44538364-44538575)
chr1 (1-214)||(8953242-8953457)
chr1 (1-215)||(19874885-19875100)
chr1 (1-215)||(19879843-19880057)
chr1 (8-215)||(41802405-41802613)
chr1 (1-215)||(25727075-25727289)
chr1 (1-215)||(25735483-25735697)
chr1 (6-215)||(16431677-16431887)
chr1 (6-215)||(48256429-48256638)
chr1 (38-215)||(12060247-12060424)
chr1 (1-215)||(20231629-20231846)
chr1 (1-192)||(22659828-22660021)
chr1 (1-168)||(16365097-16365265)
chr1 (1-215)||(19771950-19772166)
chr1 (1-215)||(19599669-19599886)
chr1 (1-215)||(20393704-20393921)
chr1 (6-215)||(28208015-28208223)
chr1 (1-215)||(17093838-17094055)
chr1 (1-215)||(20399726-20399943)
chr1 (1-215)||(22841824-22842041)
chr1 (1-214)||(20238195-20238411)
chr1 (1-215)||(2395040-2395257)
chr1 (1-215)||(17101674-17101891)
chr1 (1-215)||(21797901-21798118)
chr1 (1-215)||(21804609-21804826)
chr1 (1-215)||(23501548-23501765)
chr1 (38-215)||(19364793-19364971)
chr1 (1-215)||(19788031-19788246)
chr1 (1-215)||(41309251-41309461)
chr1 (1-215)||(18816482-18816697)
chr1 (78-214)||(41224623-41224759)
chr1 (4-210)||(20412381-20412587)
chr1 (8-215)||(21783967-21784177)
chr1 (9-215)||(21792093-21792302)
chr1 (46-215)||(22635467-22635637)
chr1 (86-168)||(52235711-52235793)
chr1 (1-213)||(28763624-28763838)
chr1 (10-112)||(52755199-52755302)
chr1 (6-125)||(13799276-13799395)
chr1 (1-150)||(16148260-16148411)
chr1 (1-125)||(22411234-22411359)
chr1 (1-125)||(52169117-52169242)
chr1 (1-125)||(16384793-16384916)
chr1 (1-93)||(24680270-24680361)
chr1 (1-112)||(26194362-26194473)
chr1 (1-125)||(15346686-15346810)
chr1 (1-74)||(25404968-25405041)
chr1 (4-64)||(16354209-16354269)
chr1 (1-72)||(12059671-12059742)
chr1 (1-95)||(21924787-21924881)
chr1 (7-73)||(30818957-30819022)
chr1 (1-125)||(15421225-15421349)
[»] scaffold0916 (1 HSPs)
scaffold0916 (6-215)||(3646-3855)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (1-215)||(150607-150823)
scaffold0009 (1-215)||(153620-153837)
scaffold0009 (1-214)||(245559-245779)
[»] chr6 (127 HSPs)
chr6 (1-215)||(20993516-20993732)
chr6 (1-215)||(8603625-8603840)
chr6 (1-215)||(5671824-5672040)
chr6 (7-215)||(18854755-18854966)
chr6 (1-215)||(22737963-22738177)
chr6 (6-215)||(4188271-4188481)
chr6 (6-215)||(15700312-15700522)
chr6 (6-215)||(19075094-19075304)
chr6 (6-215)||(22060762-22060972)
chr6 (6-215)||(22071843-22072053)
chr6 (1-215)||(26474076-26474290)
chr6 (1-214)||(25786114-25786327)
chr6 (1-215)||(15158262-15158478)
chr6 (11-215)||(18844580-18844787)
chr6 (1-215)||(19560652-19560868)
chr6 (1-215)||(12474291-12474506)
chr6 (6-215)||(27565595-27565805)
chr6 (6-215)||(23603041-23603253)
chr6 (1-215)||(29360442-29360652)
chr6 (6-215)||(18184151-18184363)
chr6 (1-215)||(22005890-22006105)
chr6 (3-224)||(19614933-19615155)
chr6 (1-215)||(14077091-14077308)
chr6 (1-215)||(15153804-15154020)
chr6 (6-215)||(17283799-17284009)
chr6 (1-215)||(18006440-18006657)
chr6 (1-215)||(18732468-18732683)
chr6 (1-215)||(25775163-25775378)
chr6 (1-215)||(12657072-12657283)
chr6 (1-215)||(12442634-12442852)
chr6 (1-215)||(30671030-30671245)
chr6 (1-215)||(11607491-11607708)
chr6 (1-215)||(16738854-16739071)
chr6 (2-215)||(35271287-35271503)
chr6 (1-215)||(17934529-17934746)
chr6 (1-215)||(19828855-19829072)
chr6 (1-215)||(6479318-6479535)
chr6 (1-215)||(6490739-6490956)
chr6 (1-215)||(17119624-17119840)
chr6 (1-215)||(18107294-18107511)
chr6 (1-215)||(20022033-20022250)
chr6 (1-215)||(20164291-20164508)
chr6 (1-215)||(22164786-22165003)
chr6 (1-215)||(22244573-22244790)
chr6 (1-215)||(22766359-22766576)
chr6 (1-215)||(22773042-22773259)
chr6 (1-215)||(22786938-22787155)
chr6 (1-215)||(27322821-27323038)
chr6 (6-215)||(24218850-24219064)
chr6 (1-215)||(20015868-20016085)
chr6 (1-215)||(20170988-20171205)
chr6 (1-215)||(25615394-25615611)
chr6 (4-215)||(6795069-6795280)
chr6 (1-215)||(18233583-18233782)
chr6 (69-215)||(18195325-18195472)
chr6 (6-215)||(25949452-25949661)
chr6 (1-215)||(24854484-24854701)
chr6 (1-215)||(24861143-24861360)
chr6 (6-215)||(209884-210096)
chr6 (1-215)||(1626275-1626491)
chr6 (6-215)||(17743633-17743826)
chr6 (1-214)||(29596435-29596655)
chr6 (6-215)||(25968693-25968902)
chr6 (6-210)||(25964046-25964250)
chr6 (1-215)||(5152376-5152591)
chr6 (1-215)||(19966397-19966612)
chr6 (88-215)||(24511780-24511907)
chr6 (1-210)||(16470100-16470309)
chr6 (89-215)||(32544764-32544890)
chr6 (1-215)||(25402205-25402422)
chr6 (85-211)||(19569927-19570053)
chr6 (2-215)||(21559860-21560074)
chr6 (113-215)||(23540718-23540820)
chr6 (1-221)||(18448900-18449121)
chr6 (6-215)||(21573628-21573838)
chr6 (2-215)||(23297164-23297378)
chr6 (125-215)||(25656209-25656299)
chr6 (59-215)||(5949439-5949597)
chr6 (1-112)||(22601202-22601314)
chr6 (1-121)||(23616209-23616332)
chr6 (4-112)||(5399357-5399466)
chr6 (1-125)||(20218311-20218436)
chr6 (1-125)||(22112336-22112461)
chr6 (1-125)||(25923222-25923347)
chr6 (1-116)||(29563418-29563540)
chr6 (20-101)||(30245346-30245427)
chr6 (159-215)||(22344244-22344300)
chr6 (4-112)||(14992124-14992233)
chr6 (1-73)||(19563730-19563803)
chr6 (4-214)||(26138790-26139001)
chr6 (4-112)||(29093671-29093782)
chr6 (4-213)||(25507718-25507928)
chr6 (1-125)||(25339073-25339198)
chr6 (4-79)||(32543367-32543442)
chr6 (1-74)||(17793865-17793938)
chr6 (1-100)||(18396360-18396460)
chr6 (1-150)||(18627552-18627706)
chr6 (167-215)||(19563653-19563701)
chr6 (1-72)||(20105519-20105590)
chr6 (1-150)||(25031028-25031179)
chr6 (4-213)||(26018087-26018297)
chr6 (1-150)||(28733949-28734100)
chr6 (1-205)||(19612494-19612698)
chr6 (1-125)||(19993722-19993847)
chr6 (1-74)||(23517231-23517304)
chr6 (4-213)||(26157460-26157670)
chr6 (1-150)||(26821980-26822131)
chr6 (1-125)||(4741109-4741235)
chr6 (1-74)||(13217236-13217309)
chr6 (1-125)||(20221315-20221437)
chr6 (1-125)||(22115299-22115421)
chr6 (1-125)||(23523783-23523908)
chr6 (4-150)||(12660253-12660399)
chr6 (1-95)||(13168501-13168595)
chr6 (1-95)||(17522219-17522312)
chr6 (1-72)||(24545504-24545575)
chr6 (4-125)||(31965350-31965470)
chr6 (1-125)||(3923762-3923887)
chr6 (1-62)||(9414510-9414570)
chr6 (1-125)||(20464503-20464626)
chr6 (1-72)||(29254109-29254180)
chr6 (1-95)||(29682734-29682828)
chr6 (185-215)||(12992841-12992871)
chr6 (1-74)||(24392782-24392854)
chr6 (179-215)||(4741288-4741324)
chr6 (1-73)||(18973785-18973856)
chr6 (129-213)||(20435498-20435581)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (1-221)||(17484154-17484376)
chr4 (6-215)||(14653235-14653445)
chr4 (1-215)||(3371742-3371957)
chr4 (6-215)||(16952023-16952234)
chr4 (1-215)||(39043238-39043453)
chr4 (6-215)||(3392072-3392282)
chr4 (6-215)||(10631496-10631706)
chr4 (6-215)||(3355381-3355593)
chr4 (1-215)||(3419180-3419395)
chr4 (1-215)||(9945064-9945279)
chr4 (6-215)||(5717516-5717726)
chr4 (4-214)||(13622419-13622629)
chr4 (6-215)||(18078808-18079018)
chr4 (6-215)||(18080704-18080914)
chr4 (6-215)||(26811252-26811462)
chr4 (1-215)||(25146367-25146584)
chr4 (1-215)||(7197347-7197562)
chr4 (6-215)||(6518500-6518710)
chr4 (6-215)||(36654105-36654315)
chr4 (1-215)||(16217579-16217796)
chr4 (1-215)||(16392796-16393012)
chr4 (6-215)||(18287113-18287325)
chr4 (1-215)||(16683484-16683699)
chr4 (6-215)||(14690584-14690794)
chr4 (1-215)||(18242319-18242536)
chr4 (1-215)||(18984135-18984352)
chr4 (6-215)||(7897270-7897482)
chr4 (6-215)||(12845034-12845246)
chr4 (1-215)||(15123988-15124205)
chr4 (1-215)||(56579802-56580019)
chr4 (6-215)||(11888733-11888942)
chr4 (1-215)||(7431-7648)
chr4 (1-215)||(10559024-10559241)
chr4 (1-215)||(10732878-10733095)
chr4 (1-215)||(10946647-10946864)
chr4 (1-215)||(15248440-15248657)
chr4 (1-215)||(55798459-55798675)
chr4 (3-215)||(15305360-15305575)
chr4 (1-215)||(8091651-8091864)
chr4 (1-215)||(10637735-10637952)
chr4 (1-215)||(10651126-10651343)
chr4 (1-215)||(18563564-18563781)
chr4 (1-215)||(21420697-21420914)
chr4 (2-215)||(15255068-15255284)
chr4 (1-215)||(42708978-42709194)
chr4 (22-215)||(41400627-41400822)
chr4 (1-215)||(3045-3262)
chr4 (1-215)||(10684764-10684981)
chr4 (1-215)||(10898404-10898621)
chr4 (1-215)||(11495851-11496068)
chr4 (1-215)||(13823674-13823891)
chr4 (1-215)||(15265990-15266207)
chr4 (1-215)||(40844851-40845068)
chr4 (1-215)||(15259368-15259585)
chr4 (1-215)||(15302128-15302345)
chr4 (1-215)||(22105062-22105279)
chr4 (1-215)||(26293354-26293571)
chr4 (1-215)||(11504733-11504950)
chr4 (6-215)||(24124980-24125190)
chr4 (1-215)||(16227165-16227380)
chr4 (56-215)||(40560345-40560506)
chr4 (1-215)||(48641810-48642014)
chr4 (6-215)||(21275383-21275593)
chr4 (1-221)||(15866260-15866481)
chr4 (104-215)||(11048537-11048648)
chr4 (1-159)||(7870974-7871135)
chr4 (4-213)||(43701324-43701534)
chr4 (1-214)||(17996259-17996474)
chr4 (4-213)||(20058917-20059127)
chr4 (4-214)||(31594015-31594225)
chr4 (1-112)||(9857333-9857445)
chr4 (6-112)||(10731269-10731376)
chr4 (6-112)||(10945038-10945145)
chr4 (6-112)||(11902475-11902582)
chr4 (1-100)||(16953772-16953872)
chr4 (111-215)||(15410068-15410172)
chr4 (1-213)||(39487-39699)
chr4 (20-213)||(3771941-3772134)
chr4 (1-125)||(12808020-12808145)
chr4 (1-95)||(12347498-12347592)
chr4 (3-125)||(23793449-23793570)
chr4 (1-95)||(13883336-13883430)
chr4 (1-125)||(5675593-5675716)
chr4 (1-61)||(40563741-40563802)
chr4 (6-67)||(21102124-21102187)
chr4 (38-112)||(11922293-11922368)
chr4 (4-150)||(38652286-38652432)
[»] chr2 (100 HSPs)
chr2 (6-215)||(20282176-20282386)
chr2 (1-215)||(21468197-21468412)
chr2 (1-215)||(25370084-25370302)
chr2 (6-215)||(5499531-5499742)
chr2 (1-215)||(28496443-28496658)
chr2 (6-215)||(25358266-25358476)
chr2 (1-215)||(27745190-27745404)
chr2 (6-215)||(42767116-42767328)
chr2 (1-215)||(23798164-23798379)
chr2 (8-215)||(24507436-24507643)
chr2 (1-215)||(25803546-25803761)
chr2 (6-215)||(10896-11106)
chr2 (1-215)||(23014238-23014454)
chr2 (1-215)||(23018352-23018568)
chr2 (1-215)||(36684421-36684637)
chr2 (1-215)||(40916559-40916775)
chr2 (7-215)||(18994210-18994420)
chr2 (6-215)||(20172566-20172775)
chr2 (6-215)||(35080724-35080934)
chr2 (1-215)||(39870328-39870545)
chr2 (1-215)||(29563316-29563532)
chr2 (1-214)||(20708013-20708227)
chr2 (1-215)||(18446499-18446716)
chr2 (1-215)||(21201018-21201235)
chr2 (1-215)||(23644709-23644926)
chr2 (1-215)||(111610-111827)
chr2 (1-215)||(27615539-27615756)
chr2 (1-215)||(27632235-27632452)
chr2 (1-215)||(118282-118499)
chr2 (6-214)||(19929508-19929730)
chr2 (1-215)||(23158643-23158860)
chr2 (1-215)||(23163213-23163430)
chr2 (1-215)||(23569900-23570117)
chr2 (1-215)||(23574470-23574687)
chr2 (1-215)||(27768075-27768292)
chr2 (20-215)||(32441115-32441309)
chr2 (6-215)||(23340696-23340905)
chr2 (1-214)||(32140095-32140309)
chr2 (1-215)||(17583339-17583556)
chr2 (1-215)||(17591145-17591362)
chr2 (1-215)||(19278538-19278755)
chr2 (1-215)||(22043898-22044115)
chr2 (1-215)||(22288318-22288535)
chr2 (1-215)||(22665822-22666039)
chr2 (1-215)||(16769749-16769966)
chr2 (1-215)||(16776411-16776628)
chr2 (1-215)||(24794525-24794742)
chr2 (1-215)||(24801234-24801451)
chr2 (1-215)||(24877627-24877844)
chr2 (1-215)||(27628331-27628548)
chr2 (1-215)||(27621686-27621903)
chr2 (1-215)||(33181802-33182017)
chr2 (2-215)||(25144006-25144220)
chr2 (6-215)||(23139764-23139958)
chr2 (6-215)||(23551554-23551748)
chr2 (83-215)||(25198600-25198732)
chr2 (83-215)||(45706421-45706553)
chr2 (20-215)||(11391253-11391444)
chr2 (20-215)||(11407914-11408105)
chr2 (1-215)||(11317941-11318156)
chr2 (50-215)||(23633909-23634075)
chr2 (83-214)||(23634131-23634262)
chr2 (1-215)||(24172119-24172334)
chr2 (6-190)||(24824753-24824940)
chr2 (6-215)||(16133947-16134157)
chr2 (6-202)||(25481506-25481703)
chr2 (6-202)||(25489112-25489309)
chr2 (6-215)||(24820343-24820555)
chr2 (124-215)||(25038686-25038777)
chr2 (85-215)||(17637315-17637445)
chr2 (4-213)||(539324-539534)
chr2 (1-214)||(20635786-20636001)
chr2 (1-112)||(29577197-29577309)
chr2 (1-218)||(23698553-23698771)
chr2 (6-109)||(23704409-23704513)
chr2 (1-69)||(25043007-25043075)
chr2 (106-210)||(23613897-23614000)
chr2 (1-112)||(24609919-24610031)
chr2 (9-125)||(21344321-21344437)
chr2 (1-112)||(21261-21373)
chr2 (1-79)||(24177562-24177640)
chr2 (167-214)||(23084635-23084682)
chr2 (20-213)||(25858338-25858532)
chr2 (1-72)||(30949148-30949219)
chr2 (6-150)||(19124141-19124286)
chr2 (40-119)||(15584001-15584081)
chr2 (4-72)||(22328620-22328688)
chr2 (20-213)||(24366054-24366248)
chr2 (1-95)||(24371307-24371401)
chr2 (1-125)||(41653450-41653575)
chr2 (1-95)||(20852253-20852347)
chr2 (4-125)||(19012850-19012971)
chr2 (3-112)||(23256868-23256976)
chr2 (1-59)||(23613996-23614054)
chr2 (1-74)||(22578215-22578286)
chr2 (1-95)||(13004613-13004707)
chr2 (1-123)||(31590354-31590475)
chr2 (1-49)||(23648802-23648851)
chr2 (1-74)||(24321923-24321995)
chr2 (1-74)||(36129989-36130061)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (6-215)||(2964-3174)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (6-215)||(23383-23593)
scaffold0031 (6-215)||(77960-78170)
scaffold0031 (39-215)||(18371-18548)
scaffold0031 (39-215)||(100569-100750)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (1-215)||(32043-32258)
scaffold0071 (6-215)||(37111-37321)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (6-215)||(8602-8812)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (1-215)||(34794-35009)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-215)||(117896-118111)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (6-215)||(34102-34313)
[»] chr5 (111 HSPs)
chr5 (1-215)||(21734366-21734581)
chr5 (1-215)||(23435449-23435664)
chr5 (1-215)||(23446816-23447031)
chr5 (1-215)||(41765536-41765751)
chr5 (6-215)||(7760864-7761074)
chr5 (6-215)||(15732070-15732280)
chr5 (6-215)||(15736289-15736499)
chr5 (6-215)||(18067360-18067570)
chr5 (6-215)||(18073655-18073865)
chr5 (6-215)||(20595079-20595289)
chr5 (6-215)||(20789972-20790182)
chr5 (6-215)||(20795753-20795963)
chr5 (6-215)||(21812009-21812219)
chr5 (6-215)||(23618225-23618435)
chr5 (6-215)||(23684979-23685189)
chr5 (6-215)||(23849622-23849832)
chr5 (6-215)||(34780438-34780648)
chr5 (1-215)||(14482506-14482721)
chr5 (1-215)||(42789584-42789799)
chr5 (6-215)||(20601365-20601575)
chr5 (6-215)||(20607656-20607866)
chr5 (6-215)||(20613993-20614203)
chr5 (6-215)||(23972959-23973169)
chr5 (1-215)||(18483449-18483666)
chr5 (6-215)||(24935600-24935810)
chr5 (6-215)||(24941292-24941502)
chr5 (1-215)||(20245681-20245897)
chr5 (1-215)||(26848395-26848610)
chr5 (1-215)||(30729966-30730181)
chr5 (6-215)||(28834657-28834867)
chr5 (1-215)||(6406389-6406606)
chr5 (6-215)||(20832219-20832431)
chr5 (8-215)||(23771055-23771263)
chr5 (6-215)||(24220499-24220711)
chr5 (17-215)||(18613037-18613236)
chr5 (1-215)||(3388149-3388366)
chr5 (1-215)||(12322460-12322673)
chr5 (6-214)||(20915705-20915915)
chr5 (1-215)||(25891104-25891321)
chr5 (1-214)||(20571198-20571414)
chr5 (2-215)||(22143133-22143349)
chr5 (6-215)||(23343297-23343509)
chr5 (6-215)||(31057463-31057675)
chr5 (1-221)||(13910135-13910358)
chr5 (1-215)||(20449579-20449796)
chr5 (1-215)||(22323356-22323573)
chr5 (1-215)||(23267815-23268032)
chr5 (1-215)||(23599894-23600111)
chr5 (1-215)||(33701617-33701834)
chr5 (6-215)||(24214876-24215088)
chr5 (8-215)||(20444097-20444307)
chr5 (1-215)||(22856283-22856500)
chr5 (1-215)||(25006067-25006284)
chr5 (1-215)||(25577401-25577617)
chr5 (1-215)||(5077955-5078172)
chr5 (1-215)||(20802248-20802465)
chr5 (1-215)||(30758922-30759139)
chr5 (1-215)||(30769027-30769244)
chr5 (1-215)||(26842939-26843154)
chr5 (1-215)||(16103993-16104210)
chr5 (1-215)||(18772104-18772321)
chr5 (1-215)||(21729956-21730173)
chr5 (1-215)||(29052772-29052988)
chr5 (1-214)||(20616449-20616665)
chr5 (1-214)||(22316750-22316966)
chr5 (1-214)||(21389796-21390009)
chr5 (1-215)||(9728649-9728866)
chr5 (1-215)||(18610940-18611157)
chr5 (1-215)||(24952432-24952649)
chr5 (1-215)||(24969097-24969314)
chr5 (1-215)||(25115062-25115279)
chr5 (1-215)||(25174154-25174371)
chr5 (1-215)||(25202020-25202237)
chr5 (1-215)||(25266175-25266392)
chr5 (6-182)||(21273778-21273954)
chr5 (1-224)||(21382403-21382627)
chr5 (6-215)||(20169222-20169431)
chr5 (9-215)||(23626594-23626805)
chr5 (1-215)||(26780674-26780891)
chr5 (2-215)||(35307395-35307609)
chr5 (1-215)||(25741810-25742025)
chr5 (6-215)||(20967869-20968079)
chr5 (38-215)||(21833089-21833267)
chr5 (1-215)||(25122043-25122248)
chr5 (1-215)||(25181134-25181339)
chr5 (30-215)||(23743341-23743527)
chr5 (1-135)||(23756880-23757014)
chr5 (1-135)||(23822336-23822470)
chr5 (1-168)||(28621767-28621937)
chr5 (1-129)||(21400807-21400938)
chr5 (1-191)||(23582761-23582956)
chr5 (4-112)||(22948699-22948808)
chr5 (4-112)||(22942489-22942598)
chr5 (1-125)||(31757954-31758079)
chr5 (1-112)||(20724698-20724810)
chr5 (155-215)||(22000233-22000293)
chr5 (6-150)||(12410655-12410801)
chr5 (1-125)||(2953372-2953497)
chr5 (1-125)||(22170910-22171035)
chr5 (38-109)||(17408585-17408657)
chr5 (7-79)||(15059739-15059811)
chr5 (6-125)||(24165383-24165503)
chr5 (1-72)||(34223012-34223083)
chr5 (1-125)||(16677202-16677327)
chr5 (1-125)||(20738479-20738604)
chr5 (1-95)||(24166389-24166483)
chr5 (1-68)||(31414744-31414811)
chr5 (1-125)||(23114384-23114508)
chr5 (8-150)||(20103739-20103884)
chr5 (165-213)||(34222882-34222930)
chr5 (1-112)||(23029418-23029528)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (6-215)||(8866-9076)
scaffold0230 (6-215)||(16392-16602)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (6-215)||(17398-17608)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (6-215)||(14328-14538)
scaffold0035 (6-215)||(49776-49986)
scaffold0035 (1-62)||(30985-31045)
scaffold0035 (1-62)||(31756-31816)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (6-215)||(33131-33341)
scaffold0022 (1-215)||(110680-110896)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (6-215)||(369260-369470)
scaffold0004 (1-100)||(24174-24276)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (8-215)||(38200-38408)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (1-215)||(1080-1295)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (3-215)||(13353-13567)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-221)||(13922-14144)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (1-215)||(6231-6448)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-215)||(162603-162820)
scaffold0011 (6-215)||(163668-163881)
scaffold0011 (1-205)||(172865-173070)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (6-215)||(18684-18895)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-215)||(13176-13391)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (1-212)||(5510-5724)
[»] scaffold0489 (1 HSPs)
scaffold0489 (6-215)||(800-1010)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (1-215)||(5851-6068)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (6-215)||(424771-424983)
scaffold0001 (1-215)||(159194-159409)
scaffold0001 (1-150)||(520875-521026)
scaffold0001 (1-125)||(82444-82567)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-215)||(19559-19774)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-221)||(56428-56651)
scaffold0042 (1-131)||(71998-72131)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (4-214)||(48912-49124)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (6-215)||(13848-14060)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-215)||(117878-118093)
scaffold0029 (1-215)||(124122-124337)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-215)||(2165-2382)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-215)||(299911-300128)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (1-214)||(13914-14130)
[»] scaffold1323 (1 HSPs)
scaffold1323 (22-215)||(448-643)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (1-215)||(3345-3560)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-215)||(12290-12505)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (1-214)||(12087-12301)
[»] scaffold0506 (2 HSPs)
scaffold0506 (1-215)||(7583-7800)
scaffold0506 (1-102)||(1659-1763)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (1-215)||(15230-15447)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-215)||(704-921)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-215)||(186367-186584)
scaffold0012 (6-72)||(50012-50079)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (6-209)||(1907-2111)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (40-215)||(42867-43043)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-214)||(24602-24818)
scaffold0078 (1-215)||(30672-30889)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (1-215)||(10525-10743)
scaffold0346 (1-215)||(2168-2385)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (1-215)||(2097-2313)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (6-215)||(21443-21655)
scaffold0142 (6-96)||(26709-26802)
[»] scaffold0760 (1 HSPs)
scaffold0760 (1-214)||(5972-6188)
[»] scaffold0624 (1 HSPs)
scaffold0624 (1-214)||(4804-5002)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (6-215)||(8575-8784)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (1-215)||(1807-2024)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-215)||(2793-3010)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-215)||(5400-5617)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-215)||(14362-14577)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (1-215)||(1777-1994)
scaffold0404 (1-215)||(4069-4286)
[»] scaffold1092 (1 HSPs)
scaffold1092 (1-215)||(1430-1644)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (1-215)||(2807-3021)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (6-215)||(9568-9778)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (6-215)||(6542-6752)
scaffold0447 (6-215)||(11156-11366)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-215)||(418-636)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (6-215)||(9151-9361)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (89-214)||(70376-70501)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (7-170)||(9638-9802)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (2-215)||(21415-21629)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (3-215)||(121682-121901)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (1-143)||(60665-60809)
scaffold0072 (106-139)||(60613-60646)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (48-215)||(1971-2143)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (1-210)||(1243-1451)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-215)||(5563-5778)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (6-215)||(27503-27715)
scaffold0138 (6-215)||(39499-39711)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (1-179)||(1517-1696)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (1-215)||(122-337)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-215)||(83990-84205)
scaffold0037 (6-215)||(48528-48740)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (83-215)||(104942-105074)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (2-215)||(19491-19705)
scaffold0150 (2-215)||(26320-26534)
scaffold0150 (1-150)||(25343-25495)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (2-215)||(23277-23491)
[»] scaffold0091 (3 HSPs)
scaffold0091 (1-167)||(17175-17344)
scaffold0091 (180-215)||(21385-21420)
scaffold0091 (180-215)||(25582-25617)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (6-215)||(18509-18721)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (2-215)||(18980-19195)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (23-215)||(4926-5120)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-215)||(169103-169314)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (1-113)||(17730-17844)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-214)||(1538-1753)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-102)||(2-104)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (6-168)||(37742-37907)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (6-215)||(44058-44251)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (1-121)||(3449-3572)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (136-214)||(22526-22604)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (6-168)||(61978-62142)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-106)||(19802-19909)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (88-215)||(74174-74301)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-102)||(33802-33906)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (4-213)||(22173-22383)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (6-201)||(6759-6968)
scaffold0099 (1-183)||(47834-48029)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (109-171)||(8915-8977)
scaffold0371 (10-75)||(8977-9043)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (4-213)||(6455-6665)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-125)||(49820-49945)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-110)||(38664-38773)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (6-213)||(8971-9178)
[»] scaffold0855 (1 HSPs)
scaffold0855 (1-95)||(3596-3690)
[»] scaffold0847 (1 HSPs)
scaffold0847 (1-95)||(3761-3855)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (1-95)||(1777-1871)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (6-69)||(21308-21371)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (172-214)||(45016-45058)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (2-67)||(4654-4719)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (1-67)||(3972-4040)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-64)||(21448-21511)
[»] scaffold1559 (1 HSPs)
scaffold1559 (1-74)||(1529-1601)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (25-74)||(21748-21797)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-74)||(14218-14291)
[»] scaffold0557 (1 HSPs)
scaffold0557 (186-215)||(1288-1317)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (1-49)||(5215-5264)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (1-49)||(33773-33822)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 151)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2325806 - 2325593
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325806 catgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaacgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 2325707  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2325706 tttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaata 2325607  T
Q  202 tcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  2325606 tcaattcataaaac 2325593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37100329 - 37100116
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37100329 acatgagtgagtatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 37100230  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37100229 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaggtggagggtttgataatcgttaatccatcatctcaaat 37100130  T
Q  201 atcaattcataaaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  37100129 atcaattcataaaa 37100116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12199298 - 12199512
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12199298 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtataatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 12199397  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12199398 atttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaactattattaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 12199497  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  12199498 atcaattcataaaac 12199512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35964190 - 35963981
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35964190 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgagataatcctaatcaaaccaagctttaactctaatcttatgtaaccctaatctc 35964091  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35964090 taatctgaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcacaaatatcaa 35963991  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  35963990 ttcataaaac 35963981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21507102 - 21507318
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  21507102 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaggttattaaccctaatcttatgtaaccc 21507201  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21507202 taatctctaatctaaattcaccgttttaacataaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 21507301  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  21507302 atatcaattcataaaac 21507318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16330854 - 16330640
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16330854 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 16330755  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16330754 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 16330655  T
Q  200 tatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  16330654 tatcaattcataaaa 16330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48801217 - 48801000
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaa-tcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48801217 acatgagtgagtggacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaaatcttatgtaacc 48801118  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48801117 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattggtaatccatcatctca 48801018  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48801017 aatatcaattcataaaac 48801000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33612235 - 33612024
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  33612235 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 33612136  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33612135 tctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 33612036  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  33612035 aattcataaaac 33612024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 9004745 - 9004955
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaa-tcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9004745 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaaatcttatgtaaccctaatc 9004844  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9004845 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcagacagtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaattatc 9004944  T
Q  204 aattcataaaa 214  Q
    |||||||||||    
T  9004945 aattcataaaa 9004955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 41722825 - 41723034
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41722825 gtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgcataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagttattaaccataatcttatgtaaccctgatctc 41722924  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41722925 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaa 41723024  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  41723025 ttcataaaac 41723034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 826376 - 826591
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  826376 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccct 826475  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826476 aatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 826575  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  826576 tatcaattcataaaac 826591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 828387 - 828602
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  828387 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccct 828486  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828487 aatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 828586  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  828587 tatcaattcataaaac 828602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12548277 - 12548062
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12548277 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 12548178  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548177 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 12548078  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  12548077 tatcaattcataaaac 12548062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15916262 - 15916047
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15916262 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 15916163  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916162 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 15916063  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  15916062 tatcaattcataaaac 15916047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15924571 - 15924356
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15924571 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 15924472  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15924471 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 15924372  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  15924371 tatcaattcataaaac 15924356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4466621 - 4466411
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  4466621 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 4466522  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4466521 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 4466422  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4466421 attcataaaac 4466411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 8713116 - 8713326
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  8713116 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 8713215  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8713216 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 8713315  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  8713316 attcataaaac 8713326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 8718620 - 8718830
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  8718620 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 8718719  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8718720 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 8718819  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  8718820 attcataaaac 8718830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 9009730 - 9009940
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  9009730 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 9009829  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9009830 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 9009929  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9009930 attcataaaac 9009940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 9577982 - 9578192
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  9577982 agtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 9578081  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9578082 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 9578181  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9578182 attcataaaac 9578192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14229915 - 14229705
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  14229915 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 14229816  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14229815 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 14229716  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  14229715 attcataaaac 14229705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19014606 - 19014396
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  19014606 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 19014507  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19014506 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 19014407  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  19014406 attcataaaac 19014396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 4030137 - 4030346
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4030137 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgacataatcctaatcaaaccaagcttgaaccctaatcttatgtaaccctaatttc 4030236  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4030237 taatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttcatccatcatctcaaatatcaa 4030336  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  4030337 ttcataaaac 4030346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 5840800 - 5841008
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  5840800 tgagtagatttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccctaatctct 5840899  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5840900 aatccaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 5840999  T
Q  207 tcataaaac 215  Q
    |||||||||    
T  5841000 tcataaaac 5841008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 648752 - 648541
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||     
T  648752 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaattttatgtaaccctaatt 648653  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  648652 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcatactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 648553  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  648552 aattcataaaac 648541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 821363 - 821578
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  821363 acattagtgaatagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccct 821462  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821463 aatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 821562  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  821563 tatcaattcataaaac 821578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9258595 - 9258383
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9258595 acatgagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttaggtaacccta 9258496  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  9258495 atctataagctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactatggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatc--ctcaaat 9258398  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  9258397 atcaattcataaaac 9258383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 9311658 - 9311870
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9311658 acatgagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttaggtaacccta 9311757  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  9311758 atctataagctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactatggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatc--ctcaaat 9311855  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  9311856 atcaattcataaaac 9311870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14658 - 14448
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  14658 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 14559  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 14459  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  14458 attcataaaac 14448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 545098 - 544888
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  545098 agtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 544999  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  544998 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 544899  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  544898 attcataaaac 544888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4158639 - 4158429
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  4158639 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 4158540  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4158539 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 4158440  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4158439 attcataaaac 4158429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15061381 - 15061591
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15061381 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15061480  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061481 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15061580  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15061581 attcataaaac 15061591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15066470 - 15066680
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15066470 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15066569  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066570 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15066669  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15066670 attcataaaac 15066680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 18389787 - 18389997
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  18389787 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattt 18389886  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18389887 cttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccatcatctcaaatatca 18389986  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  18389987 attcataaaac 18389997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23203918 - 23204128
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23203918 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23204017  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204018 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23204117  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23204118 attcataaaac 23204128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23510045 - 23510255
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23510045 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23510144  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23510145 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23510244  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23510245 attcataaaac 23510255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23515827 - 23516037
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23515827 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatactaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23515926  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515927 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23516026  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23516027 attcataaaac 23516037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 10204845 - 10205056
Alignment:
Q  6 agtgagtagact--tctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  10204845 agtgagtagactcttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctagtt 10204944  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10204945 tctaatctaaattcaccgatttaacatgaattaaccattatcaaactataaaaacgaaagtggaaggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 10205044  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  10205045 aattcataaaac 10205056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 4313340 - 4313550
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  4313340 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagcttttaaccctaatcttatgtaaccctaatt 4313439  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4313440 tctaatctaaattcattgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 4313539  T
Q  204 aattcataaaa 214  Q
    |||||||||||    
T  4313540 aattcataaaa 4313550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5397849 - 5398066
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  5397849 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatgagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaacc 5397948  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5397949 ctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctca 5398048  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5398049 aatatcaattcataaaac 5398066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 17946843 - 17947053
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  17946843 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaaccctaattt 17946942  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17946943 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 17947042  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  17947043 attcataaaac 17947053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23293666 - 23293449
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23293666 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaaccttaatcttatgtaacc 23293567  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23293566 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggatatgaaagtggagggtttgatgattgttaatccatcatctca 23293467  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23293466 aatatcaattcataaaac 23293449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 30257474 - 30257691
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30257474 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaaaccaagctttaagccttaatcttatgtaacc 30257573  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30257574 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 30257673  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30257674 aatatcaattcataaaac 30257691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48340569 - 48340357
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  48340569 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgtaaccctcat 48340470  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48340469 ctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 48340370  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  48340369 caattcataaaac 48340357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 538224 - 538014
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  538224 agtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 538125  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  538124 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaaaatca 538025  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  538024 attcataaaac 538014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3201652 - 3201435
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  3201652 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 3201553  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3201552 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 3201453  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3201452 aatatcaattcataaaac 3201435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3210692 - 3210475
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  3210692 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctattaaccctcaatcttatgtaaca 3210593  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  3210592 ctaatctctaatctaaattaaccgttttaacatgaattaaccattatcaaatcgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatcaatcatcgca 3210493  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3210492 aatatcaattcataaaac 3210475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8522085 - 8521908
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522085 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaattttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaa 8521986  T
Q  138 ccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521985 ccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 8521908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 13434996 - 13435207
Alignment:
Q  6 agtgagtagact--tctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13434996 agtgagtagactcttctcttgtcttgagattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaccctaatcttatgtaaccctagtt 13435095  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13435096 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccactatcaaactatagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatcaatcatctcaaatatc 13435195  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  13435196 aattcataaaac 13435207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 13731914 - 13732125
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctc-ttgtcttcggattt-tgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13731914 agtgagtagacttctccttttctt-ggatttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccataatcttatgtaaccctaat 13732012  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13732013 ctctaatctaaattcatcgttttaaaatgaattaaccatgatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 13732112  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  13732113 caattcataaaac 13732125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109356
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||      
T  20109140 acatgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtcttaataaaataatcctaatcaacccaagctattgaccctagtcttatgtaacta 20109239  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20109240 taatctctaatctaaattcgttgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 20109339  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  20109340 atatcaattcataaaac 20109356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16487496 - 16487710
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  16487496 acatgagtgagtagaattctcttgtcttgggattgtgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttcaaccctaatcttacataaccct 16487595  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16487596 agtttctaatctaaatttaccgtttttacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccat-atctcaaa 16487694  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  16487695 tatcaattcataaaac 16487710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 4307977 - 4308187
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||  |||| |||  ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  4307977 gtgagtagactcttcttttctggggattattggataagtataaatgacataatcctaatcaaaccaaacttttaaccctaatcttatgtaaccctaattt 4308076  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308077 ctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 4308176  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4308177 attcataaaac 4308187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13652105 - 13652322
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13652105 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13652204  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13652205 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 13652304  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13652305 aatatcaattcataaaac 13652322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18072423 - 18072206
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18072423 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18072324  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| | | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18072323 ctaatttattatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 18072224  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18072223 aatatcaattcataaaac 18072206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 35953800 - 35954017
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  35953800 acattagtgagtatacttcttcttctcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 35953899  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35953900 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 35953999  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35954000 aatatcaattcataaaac 35954017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14551791 - 14552006
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  14551791 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatctcatgtaaccct 14551890  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  14551891 aatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 14551990  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  14551991 tatcaattcataaaac 14552006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19364521 - 19364736
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19364521 acattagtaagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 19364620  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19364621 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggtgggtttgataattatttatccatcgtctcaaa 19364720  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  19364721 tatcaattcataaaac 19364736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13658628 - 13658845
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13658628 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13658727  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13658728 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataattgtttatccattatctca 13658827  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13658828 aatatcaattcataaaac 13658845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15206036 - 15205819
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15206036 acatgagtgagtagacttctatttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15205937  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15205936 ctaatttcttatctaaattcactgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccatcatctca 15205837  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||||    
T  15205836 aatatcaagtcataaaac 15205819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15173855 - 15173643
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15173855 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatggcataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaaa 15173756  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15173755 ttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 15173656  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  15173655 caattcataaaac 15173643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14545551 - 14545766
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  14545551 acattagtgagtagacttctcttgtcttgtgattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatctcatgtaaccct 14545650  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  14545651 aatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 14545750  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  14545751 tatcaattcataaaac 14545766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16154943 - 16154717
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16154943 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16154844  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  16154843 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccatcattcca 16154744  T
Q  198 aatatcaattcataaaactaaaattga 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16154743 aatatcaattcataaaacgaaagttga 16154717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16119304 - 16119087
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16119304 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16119205  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  16119204 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccatcattcca 16119105  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16119104 aatatcaattcataaaac 16119087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18274125 - 18274342
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18274125 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18274224  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18274225 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 18274324  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18274325 aatatcaattcataaaac 18274342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18288340 - 18288557
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18288340 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18288439  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18288440 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 18288539  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18288540 aatatcaattcataaaac 18288557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45407769 - 45407552
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  45407769 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 45407670  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45407669 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 45407570  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45407569 aatatcaattcataaaac 45407552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 9192665 - 9192853
Alignment:
Q  38 ggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9192665 ggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttacgtaaccctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaatt 9192764  T
Q  136 aaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaactaaaattga 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9192765 gaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataactgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagttga 9192853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16465092 - 16464875
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16465092 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggactgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16464993  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16464992 ctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 16464893  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16464892 aatatcaattcataaaac 16464875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23077235 - 23077018
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23077235 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 23077136  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23077135 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattattcca 23077036  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23077035 aatatcaattcataaaac 23077018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13674616 - 13674833
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13674616 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 13674715  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  13674716 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 13674815  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13674816 aatatcaattcataaaac 13674833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14582027 - 14582244
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  14582027 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 14582126  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  14582127 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 14582226  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14582227 aataacaattcataaaac 14582244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14752879 - 14753096
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  14752879 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 14752978  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  14752979 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 14753078  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14753079 aatatcaattcataaaac 14753096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15176395 - 15176612
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15176395 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 15176494  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  15176495 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 15176594  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15176595 aatatcaattcataaaac 15176612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16076789 - 16076572
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  16076789 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaattaagccaaactctaagccttaatcttatgtaacc 16076690  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16076689 ctaatttcttatctaaattcaccgccttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 16076590  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  16076589 aatattaattcataaaac 16076572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16471618 - 16471401
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctct-tgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16471618 acatgagtgagtagacttctccatgtcttgggactgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16471519  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16471518 ctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 16471419  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16471418 aatatcaattcataaaac 16471401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18589212 - 18588995
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||    
T  18589212 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaacc 18589113  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  18589112 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattatttca 18589013  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18589012 aatatcaattcataaaac 18588995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18592806 - 18592589
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||    
T  18592806 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaacc 18592707  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  18592706 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattatttca 18592607  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18592606 aatatcaattcataaaac 18592589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18599437 - 18599220
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||    
T  18599437 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaacc 18599338  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  18599337 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattatttca 18599238  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18599237 aatatcaattcataaaac 18599220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18618878 - 18619095
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||    
T  18618878 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaacc 18618977  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  18618978 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 18619077  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18619078 aatatcaattcataaaac 18619095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27292059 - 27292276
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27292059 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 27292158  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27292159 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggcttgataattgtttatccattattcca 27292258  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27292259 aatatcaattcataaaac 27292276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 39387911 - 39388128
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  39387911 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 39388010  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  39388011 ctaatttcttatctgaagtcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 39388110  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39388111 aatatcaattcataaaac 39388128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3376472 - 3376265
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  3376472 agtgagtaaactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctatttt 3376373  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3376372 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatca 3376274  T
Q  205 attcataaa 213  Q
    |||||||||    
T  3376273 attcataaa 3376265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 319766 - 319968
Alignment:
Q  15 acttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatcta 112  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  319766 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctg 319865  T
Q  113 aattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 212  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  319866 aattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataa 319965  T
Q  213 aac 215  Q
    |||    
T  319966 aac 319968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13667938 - 13668155
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||    
T  13667938 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagtcttaatcttatgtaacc 13668037  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  13668038 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 13668137  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13668138 aatatcaattcataaaac 13668155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16532805 - 16533022
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16532805 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16532904  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16532905 ctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatgattcca 16533004  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16533005 aatatcaattcataaaac 16533022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16632857 - 16632640
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16632857 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16632758  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16632757 ctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatgattcca 16632658  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16632657 aatatcaattcataaaac 16632640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 39271283 - 39271495
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  39271283 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattggtggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaactctaatcttatgtaaccct 39271382  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  39271383 aatttcttatctaaattcaccgtttcaacatgaattaacaattatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaa 39271481  T
Q  200 tatcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||||    
T  39271482 tatcaattcataaa 39271495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 34390748 - 34390963
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  34390748 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 34390847  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  34390848 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 34390947  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  34390948 tgttaattcataaaac 34390963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24057797 - 24058014
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  24057797 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaaaccttaatctaatgtaacc 24057896  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||    
T  24057897 ctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaagcgaaagtggagggtttgataatcgttagtccattatccca 24057996  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24057997 aatatcaattcataaaac 24058014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16097392 - 16097260
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097392 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgcggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 16097293  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097292 taatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 16097260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12575920 - 12576137
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  12575920 acatgactgagtagacttctccttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 12576019  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  ||    
T  12576020 ctaatttcttatctaaattcactgttttaacatggaacaaccattatcaaactgtagaaacgaaagttgtgggattgataattgtttatccattattcca 12576119  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12576120 aatatcaattcataaaac 12576137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48355527 - 48355315
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  48355527 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctatt 48355428  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  48355427 ttctcttctaaattcactgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatat 48355328  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  48355327 taattcataaaac 48355315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12562065 - 12562280
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  12562065 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagcaaagccttaaaccataatattatgtaaccct 12562164  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  12562165 agtttctcttctaaatttaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 12562264  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  12562265 tgttaattcataaaac 12562280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 215
Target Start/End: Original strand, 9725873 - 9726010
Alignment:
Q  78 aaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgata 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9725873 aaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgata 9725972  T
Q  178 attgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9725973 attgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 9726010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22578752 - 22578967
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22578752 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataattctaatcaagccaagtcttaaaccttaatattatgtaaccct 22578851  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||    
T  22578852 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcattaatccatcattccaaa 22578951  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  22578952 tgttaattcataaaac 22578967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25181028 - 25180921
Alignment:
Q  108 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25181028 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatt 25180929  T
Q  208 cataaaac 215  Q
    ||||||||    
T  25180928 cataaaac 25180921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 20624729 - 20624942
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || | |||| |||||||||||||     
T  20624729 catgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaaccttaaatcttaatattatgtaaccctag 20624828  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||     
T  20624829 tttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccgtcattccaaatg 20624928  T
Q  202 tcaattcataaaac 215  Q
    | ||||||||||||    
T  20624929 ttaattcataaaac 20624942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 782732 - 782520
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  782732 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagt 782633  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  782632 ttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttggtaatcgttaatccattattccaaatgt 782533  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  782532 taattcataaaac 782520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 4294723 - 4294937
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||| | | |||| ||||||||    
T  4294723 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctaatcaagttaagccttaaaccttagtattatataacccta 4294822  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  4294823 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 4294922  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  4294923 gttaattcataaaac 4294937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15707206 - 15706996
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  15707206 agtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcttaatcaagccaagtcttaaaccctaattttatgtaaccctagttt 15707107  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| | |    
T  15707106 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaagtgaagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgtta 15707007  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15707006 attcataaaac 15706996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 12661747 - 12661883
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661747 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttcacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 12661846  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaactaaa 219  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  12661847 ttatccattatttcaaatatcaattcataaaattaaa 12661883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 20627048 - 20627262
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20627048 catgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 20627147  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | | |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  20627148 gtttattttctaaattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 20627247  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  20627248 gttaattcataaaac 20627262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 20630939 - 20631153
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20630939 catgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 20631038  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | | |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  20631039 gtttattttctaaattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 20631138  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  20631139 gttaattcataaaac 20631153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 20635547 - 20635761
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20635547 catgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 20635646  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | | |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  20635647 gtttattttctaaattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 20635746  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  20635747 gttaattcataaaac 20635761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 20637419 - 20637633
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20637419 catgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 20637518  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | | |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  20637519 gtttattttctaaattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 20637618  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  20637619 gttaattcataaaac 20637633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38388116 - 38387902
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  38388116 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccata 38388017  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||    
T  38388016 gtttctcttctaaattcacagttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaat 38387917  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  38387916 gttaattcataaaac 38387902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 48713581 - 48713782
Alignment:
Q  9 gagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctcta 107  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48713581 gagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaatttcta 48713680  T
Q  108 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||    || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48713681 atctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccacactcatgaagcgaaaatggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaatt 48713779  T
Q  208 cat 210  Q
    |||    
T  48713780 cat 48713782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11954100 - 11953993
Alignment:
Q  108 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11954100 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 11954001  T
Q  208 cataaaac 215  Q
    ||||||||    
T  11954000 cataaaac 11953993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 12567765 - 12567977
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||| |    
T  12567765 agtgggtagacttatcttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttcaaccttaatattatgtaaccctagt 12567864  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  12567865 ttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgagaatcgttaatccattattccaaatgt 12567964  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  12567965 taattcataaaac 12567977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14941695 - 14941486
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |    
T  14941695 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatctaaatcaagccaagccttaaaccctaactttatgtaaccctagttt 14941596  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||| |    
T  14941595 ctcttctaa-ttcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgctaatccattatcccaaatatta 14941497  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    || ||||||||    
T  14941496 atacataaaac 14941486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15369288 - 15369079
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |    
T  15369288 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatcaaaatcaagccaagccttaaaccctaactttatgtaaccctagttt 15369189  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||| |    
T  15369188 ctcttctaa-ttcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgctaatccattatcccaaatatta 15369090  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    || ||||||||    
T  15369089 atacataaaac 15369079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 215
Target Start/End: Original strand, 16525736 - 16525854
Alignment:
Q  97 cctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 196  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16525736 cctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatgtatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcattcc 16525835  T
Q  197 aaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16525836 aaatatcaattcataaaac 16525854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 1614098 - 1614210
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  1614098 acatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaacctt 1614197  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  1614198 actttctaatcta 1614210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8780405 - 8780197
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||| | |    
T  8780405 agtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctacttt 8780306  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgt-tttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||| |||||| | ||||  |||||||||| |||| ||||||  | || |||| | |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8780305 ctaatctaatttcaccatatttataatgaattaacaattaccaaactaag-aagcgaacgcggagggtttagtaattgttaattcatcatctcaaatatc 8780207  T
Q  204 aattcataaa 213  Q
    ||||||||||    
T  8780206 aattcataaa 8780197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 9585408 - 9585478
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9585408 agtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 9585478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9193976 - 9193766
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||| ||||| |||| |||   || |    
T  9193976 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaactctaattttatataaatatact 9193877  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| |||| || |||||  |||||||||| |||| ||||||  | || |||| | |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  9193876 ttctaatctaatttcatcgtttttataatgaattaacaattaccaaactaag-aagcgaacgcggagggtttagtaattgttaattcatcatctcaaata 9193778  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  9193777 tcaattcataaa 9193766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 9562064 - 9562273
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||  ||  ||| |    
T  9562064 tgagtgagtagactcttcttgtcttgtgattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttat-aaaatctact 9562162  T
Q  103 ctctaatctaaattcacc-gttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||| |||| ||||||  | || |||| | |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  9562163 ttctaatctaatttcaccatttttataatgaattaacaattaccaaactaag-aagcgaacgcggagggtttagtaattgttaattcatcatctcaaata 9562261  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  9562262 tcaattcataaa 9562273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21005484 - 21005274
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||  ||| |    
T  21005484 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccatgaaccctaattttatataaatctact 21005385  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||| | || ||||||   ||| ||| |  |||||||| | |  ||||| || ||||||| ||||||    
T  21005384 ttctaatctaatttccccgtttttataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgacaacggagggttag-tgtttgttaattcatcatcacaaata 21005286  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  21005285 tcaattcataaa 21005274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16897222 - 16897112
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatc-aaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16897222 tgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaa 16897123  T
Q  102 tctctaatcta 112  Q
    | | |||||||    
T  16897122 tttttaatcta 16897112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8787244 - 8787036
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||| | |    
T  8787244 agtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctacttt 8787145  T
Q  105 ctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||||  | || |||| ||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||     
T  8787144 ctaatctaatttctccgtttttataatgaattaacaattaccaaactaag-aagcgaatgtggacggtttagtaattgttaattcatcatctcaaatata 8787046  T
Q  204 aattcataaa 213  Q
    |||| |||||    
T  8787045 aatttataaa 8787036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 368234 - 368357
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  368234 acatgagtgagtagacttcttatgtcttggaattgttgaataagtataatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccctaattttatgtaaccct 368333  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtt 123  Q
    | | |||  |||||||||||||||    
T  368334 agtttctcttctaaattcaccgtt 368357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 4790855 - 4790775
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa 79  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790855 acatgagtgagtagacttctttttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa 4790775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6257484 - 6257348
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||| |    
T  6257484 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgaaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctact 6257385  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaac 138  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  6257384 ttctaatctaatttcaccgtttttaaaatgaattaac 6257348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 16497878 - 16497982
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16497878 acatgagtgagtagatttctccttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16497977  T
Q  98 ctaat 102  Q
    |||||    
T  16497978 ctaat 16497982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 4090826 - 4090897
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4090826 acatgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 4090897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 39388860 - 39388931
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39388860 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 39388931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23292548 - 23292494
Alignment:
Q  158 cgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292548 cgaaagtggagggtttgatgattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataa 23292494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Original strand, 33609855 - 33609975
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||| | |    
T  33609855 agtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctacttt 33609954  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  33609955 ctaatcaaatttcaccgtttt 33609975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4256578 - 4256427
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  |     
T  4256578 acatgagtgagtagactcttcttgttttgggattgttggatgagtctaataacctaatcctaatcaaaccaagcctcaaaccctaattttatgtaaatcc 4256479  T
Q  100 aatctctaatctaaattcacc-gttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    | | |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  4256478 actttctaatctaatttcaccatttttataatgaattaacaagtatcaaact 4256427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6712405 - 6712311
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  6712405 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 6712311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 9264323 - 9264240
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatc 87  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9264323 agtgagtagacttctccttatcttaggattgttggataagtctaatgacataatccacatcaaaccaagctattaaccctaatc 9264240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4460721 - 4460651
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4460721 tgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttgcatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 4460651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 17911711 - 17911806
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt-taaccctaatcttatgtaa 95  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  17911711 acatgtgtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcttcgaaccctaattttatgtaa 17911806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19515322 - 19515251
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19515322 acatgagttagtagactcttcttctcttgggattcttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 19515251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 38877532 - 38877626
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  38877532 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagactcgaaccctaatcttatgtaa 38877626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Original strand, 1462676 - 1462782
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||| |  |||||||||  |||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  1462676 tgagtgagtagaatcttcttgtctttagattgttgaataattttaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatgtcaacctaat 1462775  T
Q  103 ctctaat 109  Q
     ||||||    
T  1462776 ttctaat 1462782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10838753 - 10838703
Alignment:
Q  165 ggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10838753 ggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaac 10838703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11483817 - 11483744
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||||||||||||||||  |||| | || ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11483817 acatgagtgagtagactcttcttattttaggattgttggataagtataatgacataatcttaatcaaaccaagc 11483744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17206353 - 17206262
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  17206353 tgagtgagtagacttct-ttatcttgggattgttggatgagtctaatgacataatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 17206262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 46274230 - 46274335
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaa-ccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||        |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  46274230 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaat--------cctaatcaaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccc 46274321  T
Q  99 taatctctaatcta 112  Q
    |||| |||||||||    
T  46274322 taatttctaatcta 46274335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4316945 - 4316873
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4316945 acatgagtgagtagactttgtttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagc 4316873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11997301 - 11997180
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||| | ||||||| | |||| |||  ||    
T  11997301 acatgagtgagtagactcttcttgtgttgggattgttggataagtctaataatttattcctaatcaaaccaaagcataaaccctagttttatataaatct 11997202  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg 121  Q
    | | |||||||||| |||||||    
T  11997201 actttctaatctaatttcaccg 11997180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30063922 - 30063799
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | | || ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  ||    
T  30063922 acatgagtgagttgacttct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatccctatcaagccaagcctcgaaccctaatcttatgtaaatct 30063824  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| | |||||||||||    
T  30063823 attttctaatct-atttcaccgtttt 30063799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4465748 - 4465652
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  4465748 acatgagtgagtagactcttctttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 4465652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4983106 - 4983015
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  4983106 tgagtgagtagacttat-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 4983015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 213
Target Start/End: Original strand, 4090992 - 4091039
Alignment:
Q  166 gagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 213  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4090992 gagggtttagtaattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaa 4091039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 15523155 - 15523249
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  15523155 acatgagtaagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgcgtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctagaaccgtaatcttatgtaa 15523249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3197195 - 3197166
Alignment:
Q  186 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3197195 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 3197166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25034279 - 25034208
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25034279 acatgagtgagtaggcttct-ttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagc 25034208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 679455 - 679344
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | ||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||  ||    
T  679455 acatgagtgagtagacaact-ttgtcttggaattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaaacctagaaccctaatcttatgtaaatct 679357  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  679356 attttctaatcta 679344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 153)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17388603 - 17388818
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17388603 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccct 17388702  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17388703 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 17388802  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  17388803 tatcaattcataaaac 17388818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43842028 - 43841813
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43842028 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 43841929  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43841928 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 43841829  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  43841828 tatcaattcataaaac 43841813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 5687807 - 5688025
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5687807 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataattctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaagcccaatcttatgtaacccta 5687906  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5687907 atttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 5688006  T
Q  201 atcaattcataaaactaaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  5688007 atcaattcataaatctaaa 5688025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14071678 - 14071464
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14071678 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaacccta 14071579  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14071578 atttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 14071479  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    || ||||||| ||||    
T  14071478 attaattcatgaaac 14071464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17480596 - 17480811
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17480596 acatgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaatcttatgtaaccct 17480695  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  17480696 aatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttaaaaattgttaatcaatcatctcaaa 17480795  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  17480796 tatcaattcataaaac 17480811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14867026 - 14866811
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14867026 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 14866927  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14866926 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 14866827  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  14866826 tatcaattcataaaac 14866811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15429980 - 15430195
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15429980 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 15430079  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15430080 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 15430179  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  15430180 tatcaattcataaaac 15430195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34053571 - 34053360
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaa-tcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34053571 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctattaaccctaaatcttatgtaaccctaatc 34053472  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34053471 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcagactgtggaaacgaaagtggagggtttgatacttgttaatccatcatctcaaatatc 34053372  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  34053371 aattcataaaac 34053360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4830177 - 4830392
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4830177 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 4830276  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830277 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 4830376  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  4830377 tatcaattcataaaac 4830392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22164684 - 22164469
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22164684 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 22164585  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164584 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 22164485  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  22164484 tatcaattcataaaac 22164469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22169988 - 22169773
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22169988 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 22169889  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169888 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 22169789  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  22169788 tatcaattcataaaac 22169773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 2781375 - 2781585
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  2781375 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 2781474  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2781475 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 2781574  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  2781575 attcataaaac 2781585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3338706 - 3338496
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  3338706 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 3338607  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3338606 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 3338507  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  3338506 attcataaaac 3338496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4768973 - 4768763
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  4768973 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 4768874  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4768873 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 4768774  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4768773 attcataaaac 4768763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 6710173 - 6710383
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  6710173 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 6710272  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6710273 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 6710372  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  6710373 attcataaaac 6710383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 6809794 - 6810004
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  6809794 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 6809893  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6809894 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 6809993  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  6809994 attcataaaac 6810004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 6815616 - 6815826
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  6815616 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 6815715  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6815716 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 6815815  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  6815816 attcataaaac 6815826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13093923 - 13093713
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  13093923 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 13093824  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13093823 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 13093724  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  13093723 attcataaaac 13093713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15854336 - 15854546
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15854336 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15854435  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854436 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15854535  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15854536 attcataaaac 15854546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 41473052 - 41473262
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  41473052 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 41473151  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41473152 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 41473251  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  41473252 attcataaaac 41473262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 2722066 - 2722275
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  2722066 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctattgacataatcctaatcaaaccaagcttgaaccctaatcttatgcaaccttaatttc 2722165  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2722166 taatctaaattcactgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggggggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaa 2722265  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  2722266 ttcataaaac 2722275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3279962 - 3280182
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3279962 acatgagtgcgtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 3280061  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3280062 gtttctaatctaaactcaccattttaacatgaattaaccattatcaaaatgtataagcgaaagtggaaggtttgataattgttaattcatcatctcaaat 3280161  T
Q  201 atcaattcataaaactaaaat 221  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  3280162 atcaattcataaaacgaaaat 3280182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14494785 - 14494573
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14494785 agtgactagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 14494686  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14494685 ctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 14494586  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  14494585 caattcataaaac 14494573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19566959 - 19566744
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19566959 acatgagtgggtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaattacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccct 19566860  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19566859 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtagagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 19566760  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    || |||||||||||||    
T  19566759 taacaattcataaaac 19566744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 2006078 - 2006292
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2006078 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccctaatctcatgtaacccta 2006177  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2006178 gtttctaatataaattcaccgtcttaacataaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatttcaaat 2006277  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  2006278 atcaattcataaaac 2006292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 4365976 - 4366186
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  4365976 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatcttatgtaaccctaattc 4366075  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4366076 gttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 4366175  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4366176 attcataaaac 4366186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 4383505 - 4383715
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  4383505 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatcttatgtaaccctaattc 4383604  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4383605 gttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 4383704  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4383705 attcataaaac 4383715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15425127 - 15424917
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15425127 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15425028  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425027 cttatctaaattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15424928  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15424927 attcataaaac 15424917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16385414 - 16385204
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  16385414 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 16385315  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385314 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 16385215  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  16385214 attcataaaac 16385204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 24696986 - 24697196
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  24696986 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattt 24697085  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24697086 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 24697185  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  24697186 attcataaaac 24697196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 53354761 - 53354556
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  53354761 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattt 53354662  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53354661 cttatctaaaatcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 53354562  T
Q  205 attcat 210  Q
    ||||||    
T  53354561 attcat 53354556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21265044 - 21264828
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21265044 acatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagcctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc 21264945  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21264944 taatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattattaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 21264845  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  21264844 atatcaattcataaaac 21264828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25765794 - 25765583
Alignment:
Q  6 agtgagtagact--tctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  25765794 agtgagtagactcttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccgtagtt 25765695  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25765694 tcgaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 25765595  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  25765594 aattcataaaac 25765583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9360440 - 9360230
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||      
T  9360440 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgtaaccctaattc 9360341  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360340 cttatctaaattcaccgccttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 9360241  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9360240 attcataaaac 9360230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 13087650 - 13087860
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  13087650 agtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 13087749  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13087750 cttatccaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 13087849  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  13087850 attcataaaac 13087860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 12246933 - 12247142
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  12246933 agtgagtagacttctctggtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 12247032  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12247033 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccataatctcaaatatca 12247132  T
Q  205 attcataaaa 214  Q
    ||||||||||    
T  12247133 attcataaaa 12247142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13194912 - 13194695
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13194912 acatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcgaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13194813  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13194812 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 13194713  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13194712 aatatcaattcataaaac 13194695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15944656 - 15944873
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15944656 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15944755  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15944756 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatccca 15944855  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15944856 aatatcaattcataaaac 15944873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6829627 - 6829412
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  6829627 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacacaatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccct 6829528  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6829527 aatttcttatctaaattcactgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatagtttatccatcatctcaaa 6829428  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  6829427 tatcaattcataaaac 6829412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9365957 - 9365747
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  9365957 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgtataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 9365858  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9365857 cttatctaaattcaccgccttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatta 9365758  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9365757 attcataaaac 9365747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 13098440 - 13098650
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||      
T  13098440 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaacctaattc 13098539  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13098540 cttatccaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 13098639  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  13098640 attcataaaac 13098650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 16034208 - 16034421
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16034208 gtgagtggacttctcctgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacaaaattttaaccctaatcttatgtaaccctaatttct 16034307  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16034308 aatc-aaattcaccgttttaacaagaattaacaattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtgaatccatcatctcaaatatcaat 16034406  T
Q  207 tcataaaactaaaat 221  Q
    ||||||||| |||||    
T  16034407 tcataaaacgaaaat 16034421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 20556189 - 20556398
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||      
T  20556189 agtgagtagact-ctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcctatgtaaccctaattc 20556287  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556288 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20556387  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20556388 attcataaaac 20556398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12776008 - 12775791
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  12776008 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 12775909  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12775908 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 12775809  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12775808 aatatcaattcataaaac 12775791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15947327 - 15947544
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15947327 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15947426  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15947427 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatccca 15947526  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15947527 aatatcaattcataaaac 15947544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 47974956 - 47975167
Alignment:
Q  6 agtgagtagact--tctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  47974956 agtgagtagactcttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctttaaccataatcttatgtaaccctagtt 47975055  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  47975056 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccataatgtcaaatatc 47975155  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  47975156 aattcataaaac 47975167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5226455 - 5226244
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||     
T  5226455 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccttaatt 5226356  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5226355 ccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggcaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 5226256  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  5226255 aattcataaaac 5226244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 25055149 - 25055359
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25055149 agtgagtagactcttcttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccctagttt 25055248  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25055249 ctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtataagcgaaagtggagggtttgataattgttaatcaatcatctcaaatatca 25055348  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  25055349 attcataaaac 25055359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5212159 - 5211942
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5212159 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 5212060  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| || | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212059 ctaatttcttatatgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 5211960  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5211959 aatatcaattcataaaac 5211942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7785939 - 7785722
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  7785939 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 7785840  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7785839 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccattatctca 7785740  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7785739 aatatcaattcataaaac 7785722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 11948125 - 11948342
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11948125 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 11948224  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11948225 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 11948324  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11948325 aatatcaattcataaaac 11948342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13204504 - 13204287
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13204504 acatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13204405  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
     |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13204404 ttaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctta 13204305  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13204304 aatatcaattcataaaac 13204287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50908880 - 50908663
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  50908880 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaact 50908781  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50908780 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 50908681  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50908680 aatatcaattcataaaac 50908663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53160504 - 53160287
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  53160504 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 53160405  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53160404 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 53160305  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53160304 aatatcaattcataaaac 53160287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14976269 - 14976057
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  14976269 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatattatgtaaccctaat 14976170  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14976169 ctctaatctaaattcatcgctttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttaataattgttaatccatcatctcaaatat 14976070  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  14976069 taattcataaaac 14976057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14660752 - 14660558
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               |||||||||||||    
T  14660752 agtgagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctat---------------taaccctaatctc 14660668  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14660667 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaa 14660568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10559806 - 10559589
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10559806 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 10559707  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10559706 ctaattgcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 10559607  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10559606 aatatcaattcataaaac 10559589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13665231 - 13665448
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13665231 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13665330  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13665331 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataaatgtttatccatcatctca 13665430  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13665431 aatatcaattcataaaac 13665448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15952115 - 15951898
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15952115 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15952016  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15952015 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtctgataattgtttatccatcatctca 15951916  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15951915 aatatcaattcataaaac 15951898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20154161 - 20154378
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20154161 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtcggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaacc 20154260  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20154261 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacggaagtggagggtttgataattgtttatccatcattcca 20154360  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20154361 aatatcaattcataaaac 20154378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20155991 - 20155774
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20155991 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgagatttttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaacc 20155892  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20155891 ctaatttctaatctaaattcaccgctttaaaatggatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctca 20155792  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20155791 aatatcaattcataaaac 20155774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13325941 - 13326157
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttta-accctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  13325941 acatgagtgagtagatttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaagcaagttttataccttaatcctatgtaacc 13326040  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13326041 ataatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctca 13326140  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  13326141 aatatcaattcataaaa 13326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 43496344 - 43496540
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattca 118  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43496344 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 43496443  T
Q  119 ccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||  ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43496444 ccactttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 43496540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8991539 - 8991756
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |    
T  8991539 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaatc 8991638  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8991639 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 8991738  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8991739 aatatcaattcataaaac 8991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30026827 - 30026610
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30026827 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 30026728  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  30026727 ctaatctcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 30026628  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||| |||||||||||    
T  30026627 aatatctattcataaaac 30026610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 42281065 - 42281282
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  42281065 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagttctaagccttaatcttatgtaacc 42281164  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42281165 ctaatttcttgtctaaattcaccgctctaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 42281264  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42281265 aatatcaattcataaaac 42281282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3250080 - 3249872
Alignment:
Q  9 gagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3250080 gagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaattgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttct 3249981  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3249980 aatctaaattcaccgctttaacgtggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccaccatctcaaatatcaat 3249881  T
Q  207 tcataaaac 215  Q
    |||||||||    
T  3249880 tcataaaac 3249872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16377742 - 16377526
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  16377742 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 16377643  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16377642 taatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 16377543  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  16377542 atatcaattcataaaac 16377526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Original strand, 1991022 - 1991161
Alignment:
Q  76 ttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1991022 ttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 1991121  T
Q  176 taattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991122 taattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 1991161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 11399011 - 11399221
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  11399011 agtgagtagactcttcttgtgttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccctagttt 11399110  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  11399111 ctaatctaaatttaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatagaagcgaaagtggagggcttgataatagttaattcatcatctcaaatatca 11399210  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  11399211 attcataaaac 11399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10546422 - 10546205
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  10546422 acatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaagctaagctctaagcgttaatcttatgtaacc 10546323  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10546322 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatagtttatccatcatctca 10546223  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10546222 aatatcaattcataaaac 10546205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 11940348 - 11940565
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |    
T  11940348 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaac 11940447  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11940448 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgttgaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 11940547  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11940548 aatatcaattcataaaac 11940565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13135688 - 13135471
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  13135688 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaacc 13135589  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  13135588 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 13135489  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13135488 aatatcaattcataaaac 13135471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13142296 - 13142079
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  13142296 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaacc 13142197  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  13142196 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 13142097  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13142096 aatatcaattcataaaac 13142079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15573383 - 15573166
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15573383 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15573284  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15573283 ctaacttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 15573184  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15573183 aatatcaattcataaaac 15573166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17733209 - 17732992
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  17733209 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataattctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 17733110  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  17733109 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 17733010  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17733009 aatatcaattcataaaac 17732992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14348043 - 14347829
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14348043 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagtcttaaaccctaattttatgtaaccct 14347944  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||    
T  14347943 agtttctaatctaaattcaccgttttaaaataaattaacaattatcaaactgtagaatcgaaagtggagggttag-taattggtaattcatcatctcaaa 14347845  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  14347844 tatcaattcataaaac 14347829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 7601115 - 7601332
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  7601115 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 7601214  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  7601215 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 7601314  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7601315 aatatcaattcataaaac 7601332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10159643 - 10159426
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10159643 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 10159544  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  10159543 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 10159444  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10159443 aatatcaattcataaaac 10159426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10166304 - 10166087
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10166304 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 10166205  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  10166204 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 10166105  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10166104 aatatcaattcataaaac 10166087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10601935 - 10601718
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  10601935 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 10601836  T
Q  99 -taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
     |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10601835 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 10601736  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10601735 aatatcaattcataaaac 10601718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11880457 - 11880240
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  11880457 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 11880358  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  11880357 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 11880258  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11880257 aatatcaattcataaaac 11880240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13193518 - 13193301
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13193518 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 13193419  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  13193418 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 13193319  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13193318 aatatcaattcataaaac 13193301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14815750 - 14815967
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  14815750 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 14815849  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  14815850 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 14815949  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14815950 aatatcaattcataaaac 14815967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15564247 - 15564030
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15564247 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 15564148  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  15564147 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 15564048  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15564047 aatatcaattcataaaac 15564030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 16334194 - 16334375
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  16334194 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataaccctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 16334293  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 186  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334294 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 16334375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16373024 - 16372807
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16373024 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaaaccttaatcttatgtaacc 16372925  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  16372924 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 16372825  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16372824 aatatcaattcataaaac 16372807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18128928 - 18128711
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  18128928 acatgagtgagtagatttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatataacc 18128829  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| | | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18128828 ctaatttattatctaaatttaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggggttgacaattgtttatccatcatctca 18128729  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18128728 aatatcaattcataaaac 18128711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18214305 - 18214088
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  18214305 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 18214206  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  18214205 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 18214106  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18214105 aatatcaattcataaaac 18214088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10249036 - 10249252
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  10249036 acattagtgagtagacttatcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacca 10249135  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  10249136 taatttcttatctaaattcaccgctttaacatggaccaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 10249235  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  10249236 atatcaattcataaaac 10249252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15635029 - 15634813
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  15635029 acatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcattaatcttatgtaacc 15634930  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15634929 ctaacttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgcagggtttgataattgtttatccattattcca 15634830  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  15634829 aatatcaattcataaaa 15634813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10147756 - 10147973
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10147756 acatgagtgagtagacttcttcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 10147855  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  10147856 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 10147955  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10147956 aatatcaattcataaaac 10147973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12186536 - 12186319
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||    
T  12186536 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgaaacc 12186437  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  12186436 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 12186337  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12186336 aatatcaattcataaaac 12186319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12192950 - 12192733
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||    
T  12192950 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgaaacc 12192851  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  12192850 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 12192751  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12192750 aatatcaattcataaaac 12192733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12199591 - 12199374
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  12199591 acatgagtgagtagagttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 12199492  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  12199491 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 12199392  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12199391 aatatcaattcataaaac 12199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13186887 - 13186670
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13186887 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 13186788  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  13186787 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttcgtccattattcca 13186688  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13186687 aatatcaattcataaaac 13186670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13504356 - 13504139
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13504356 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcagaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13504257  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  13504256 ctaatttcttatccgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttggtaattgtttatccattattcca 13504157  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13504156 aatatcaattcataaaac 13504139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15556396 - 15556179
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  15556396 acataagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 15556297  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  15556296 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 15556197  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15556196 aatatcaattcataaaac 15556179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16705741 - 16705958
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16705741 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 16705840  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  16705841 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 16705940  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16705941 aatatcaattcataaaac 16705958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 37935294 - 37935511
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  37935294 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 37935393  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  37935394 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 37935493  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37935494 aatatcaattcataaaac 37935511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 37943139 - 37943356
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  37943139 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 37943238  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  37943239 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 37943338  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37943339 aatatcaattcataaaac 37943356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 17766537 - 17766705
Alignment:
Q  48 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17766537 aatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacgctaatctctaatctaaattcatcactttaatatggattaaccattatca 17766636  T
Q  147 aactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17766637 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 17766705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 19067857 - 19068025
Alignment:
Q  48 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  19067857 aatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacgctaatctctaatctaaattcatcactttaatatggattaaccattatca 19067956  T
Q  147 aactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19067957 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 19068025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 13605187 - 13605380
Alignment:
Q  21 cttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcacc 120  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13605187 cttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacctaattttatgtaaccctaatttctaatcgaaattcacc 13605286  T
Q  121 gttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13605287 gttttaacatgaattaacaattatcaaacagtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 13605380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10141150 - 10141367
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10141150 acatgagtgagtagacttcttcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 10141249  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  10141250 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 10141349  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10141350 aatatcaattcataaaac 10141367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10608247 - 10608030
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  10608247 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaataaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 10608148  T
Q  99 -taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
     |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10608147 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 10608048  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10608047 aatatcaattcataaaac 10608030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32403837 - 32403620
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  32403837 acatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 32403738  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  32403737 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtcgagggtttgataattgtttatccattattcca 32403638  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  32403637 aatatcaattcgtaaaac 32403620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2023 - 1803
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  2023 acatgagtgagtagacttctctttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 1924  T
Q  98 ctaatctctaatctaaatt---caccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 194  Q
    ||||| ||| |||||||||   ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1923 ctaatttcttatctaaattattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatc 1824  T
Q  195 tcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  1823 tcaaatatcaattcgtaaaac 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 215
Target Start/End: Original strand, 3212640 - 3212798
Alignment:
Q  58 tcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaa 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3212640 tcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttttgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaa 3212739  T
Q  157 acgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212740 gcgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 3212798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37978272 - 37978055
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  37978272 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaaaccttaatctcatgtaacc 37978173  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  37978172 ctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaagcgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatccca 37978073  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||||    
T  37978072 aatatcaaatcataaaac 37978055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13000857 - 13000673
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13000857 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13000758  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13000757 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 13000673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3245032 - 3244825
Alignment:
Q  10 agtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctcta 107  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3245032 agtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtgtaattgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttcta 3244933  T
Q  108 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 207  Q
    || ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  3244932 atataaattcaccgctttaacgtggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaaaggtttgataattgttaattcaccatctcaaatatcaatt 3244833  T
Q  208 cataaaac 215  Q
    ||||||||    
T  3244832 cataaaac 3244825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14445210 - 14444996
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14445210 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 14445111  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||    
T  14445110 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaat 14445011  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  14445010 gttaattcataaaac 14444996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14457258 - 14457043
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||| |    
T  14457258 acatgagtgagtaaacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacctt 14457159  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  14457158 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 14457059  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  14457058 tgttaattcataaaac 14457043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Original strand, 55514936 - 55515100
Alignment:
Q  52 acataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  55514936 acataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttacgtatacctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgtatcaaccattatcaaact 55515035  T
Q  151 gtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55515036 gtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcatctcaactatcaattcataaaac 55515100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19656060 - 19655848
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19656060 agtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagt 19655961  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  19655960 ttctcttctaaattcaccattttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgt 19655861  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  19655860 taattcataaaac 19655848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 4651430 - 4651601
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  4651430 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 4651529  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagg 169  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4651530 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatctaactgtggaaacgaaagtggagg 4651601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14137695 - 14137501
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  14137695 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgtataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaactctaat-ttatgtaaccct 14137597  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14137596 agtttctaatttaaattcaccattttaacatgaatt--------------------aacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 14137517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Original strand, 36076324 - 36076454
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |    
T  36076324 tgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtagccctagt 36076423  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaa 133  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36076424 ttctaatctaaattcaccgttttaacatgaa 36076454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 20155096 - 20155300
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||      ||| |||| ||||||||||||| | |    
T  20155096 agtgagtagacttctcttgtcttgggatcgttggataagtctaaatgacataatcctattcaaaccaa------accttaatattatgtaaccctagttt 20155189  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| | |    
T  20155190 ctcttctaaattcaccgttttaagatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgtta 20155289  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20155290 attcataaaac 20155300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 13068915 - 13069129
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  13068915 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacatagtcctaatcaagtcaacccttaaaccttaatattatgtaacccta 13069014  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||     
T  13069015 gtttctcttctaaattccccgttttaacatggattaaatattatcaaagtgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaaa 13069114  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  13069115 gttaattcataaaac 13069129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 20150642 - 20150847
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| |     
T  20150642 agtgagtagacttctcttatcttgggatcgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaaccctagtt 20150741  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||      | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |     
T  20150742 tctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgt------ggaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgtt 20150835  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  20150836 aattcataaaac 20150847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15639184 - 15639384
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  15639184 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 15639283  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| ||||                 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  15639284 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaa-----------------caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 15639366  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15639367 aatatcaattcataaaac 15639384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15645760 - 15645960
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  15645760 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 15645859  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| ||||                 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  15645860 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaa-----------------caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 15645942  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15645943 aatatcaattcataaaac 15645960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Original strand, 14953554 - 14953624
Alignment:
Q  145 caaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14953554 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcattaaac 14953624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15234122 - 15234057
Alignment:
Q  150 tgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234122 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 15234057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 27407342 - 27407443
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27407342 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccct 27407441  T
Q  100 aa 101  Q
    ||    
T  27407442 aa 27407443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11827373 - 11827277
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaac 96  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11827373 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaac 11827277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20225194 - 20224992
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||    
T  20225194 acatgaatgagtagactcttcttgtcttgggattgttggacaagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattctatgtaaatct 20225095  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaaca-tgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    | | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||   ||  ||||||||||||||| | || ||||| || ||||||| |||    
T  20225094 attttctaatctaaattcaccgtttttatagtgaattaacaagtatcaaactcataatgcgaaagtggagggttag-tacttgttaattcatcatcacaa 20224996  T
Q  199 atat 202  Q
    ||||    
T  20224995 atat 20224992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 13418513 - 13418585
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13418513 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 13418585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 17023382 - 17023529
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||| |    
T  17023382 tgagtgtgtagatttct-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctatt 17023480  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
     |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  17023481 ttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 17023529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 22038976 - 22039095
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||| | ||    
T  22038976 gtgagtggactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctattttc 22039075  T
Q  106 taatctaaattcaccgtttt 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22039076 taatctaatttcaccgtttt 22039095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 17041849 - 17041919
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041849 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 17041919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 36079323 - 36079405
Alignment:
Q  133 attaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079323 attaatcattatcaaactggagaagcgaaagtggatggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 36079405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Original strand, 4654768 - 4654817
Alignment:
Q  166 gagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4654768 gagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 4654817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 42244506 - 42244387
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||   |||| |    
T  42244506 agtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatttaattt 42244408  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  42244407 ctaatctaatttcaccgtttt 42244387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 1993577 - 1993648
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1993577 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1993648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 1998736 - 1998807
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1998736 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1998807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10850682 - 10850611
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10850682 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacataatcctaatcaaaccaa 10850611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 8685807 - 8685683
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  8685807 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 8685708  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| | |||||||||||    
T  8685707 attttctaatct-atttcaccgtttt 8685683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 13069902 - 13070049
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||  ||||||||| ||||||||  ||| |    
T  13069902 tgagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaacaacactcgaaccctaattttatgtaaatctatt 13070000  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
     |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  13070001 ttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 13070049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 17209753 - 17209919
Alignment:
Q  44 gtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccat 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |     
T  17209753 gtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaaa 17209852  T
Q  142 tatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattca 209  Q
    || ||||||   ||| |||| | |||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17209853 taccaaactcataaagcgaatgcggagggttag-tatttgttaattcatcatctcaaatatcaattca 17209919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 17050862 - 17050932
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||  | |||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17050862 tgagtgagtagactctttttgttttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 17050932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 8532019 - 8532092
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8532019 acatgagtgaaaagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatccaaatcaaaccaagc 8532092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 5666663 - 5666714
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatga 52  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5666663 acatgagtgactagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 5666714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 215
Target Start/End: Original strand, 16336176 - 16336210
Alignment:
Q  181 gtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16336176 gtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 16336210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11577710 - 11577587
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  11577710 acatgtgtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaacgacctaatccctatcaaaccaagcctcaaaccctaattttatgtaaatct 11577612  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  11577611 attttctaatct-aattcaccgtttt 11577587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41545728 - 41545605
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || | ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||   |    
T  41545728 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttcagattgttgaatgaatctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaattt 41545630  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  41545629 attgtctaatct-aattcaccgtttt 41545605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27992670 - 27992547
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || ||||| | |||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  |||    
T  27992670 catgagtgagtagatttct-ttgtattgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaaatcta 27992572  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
     | |||||||||| |||| ||||||    
T  27992571 ttttctaatctaatttcatcgtttt 27992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17577158 - 17577036
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||| | ||| ||||||||  ||    
T  17577158 acatgagtgagtaaatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctaaaactcaaattttatgtaaatct 17577060  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtt 123  Q
    | | |||||||||| |||||||||    
T  17577059 attttctaatctaatttcaccgtt 17577036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 7908649 - 7908787
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||  | |||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||  ||    
T  7908649 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgcgataattggatgagtctaatggcctattcctaatcaaaccaagcctcaaaccctaattttatataaatct 7908748  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaac 138  Q
    | | |||||||||  |||||| ||||   ||||||||||    
T  7908749 actttctaatctagtttcacctttttttaatgaattaac 7908787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13204291 - 13204261
Alignment:
Q  154 aaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204291 aaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 13204261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11869800 - 11869728
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11869800 acatgcgtgagtatacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 11869728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 107)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24034791 - 24035005
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034791 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgccataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 24034890  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24034891 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 24034990  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||| ||||||||    
T  24034991 atcaatgcataaaac 24035005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18264353 - 18264141
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18264353 tgagtgagcagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaat 18264254  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18264253 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttcgataattgttaatccatcatctcaaatat 18264154  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  18264153 caattcataaaac 18264141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14878253 - 14878045
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14878253 gtgagtggacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccataatttct 14878154  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14878153 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttaataattgttaatccatcatctcaaatatcaat 14878054  T
Q  207 tcataaaac 215  Q
    |||||||||    
T  14878053 tcataaaac 14878045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22818363 - 22818577
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22818363 acatgagtgtgtagacttctcttgtcttgggattgttggataaatctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 22818462  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22818463 atttctaatctaaattcattgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttaataattgttaatccatcatctcaaat 22818562  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  22818563 atcaattcataaaac 22818577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17126961 - 17127174
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17126961 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccataatcttatgtaaccctg 17127060  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17127061 gtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgttgaagcgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 17127160  T
Q  201 atcaattcataaaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  17127161 atcaattcataaaa 17127174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 45466817 - 45467034
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45466817 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 45466916  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45466917 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaacagtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctca 45467016  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45467017 aatatcaattcataaaac 45467034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18230611 - 18230395
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  18230611 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaataaaaccaagttattgaccctaatcttatgtaaccc 18230512  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18230511 taatctctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 18230412  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||| ||||    
T  18230411 atatcaattcatgaaac 18230395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20263538 - 20263754
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20263538 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 20263637  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20263638 taatctctaatctaaatttaccgttttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 20263737  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  20263738 atatcaattcataaaac 20263754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21050167 - 21050383
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21050167 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 21050266  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21050267 taatctctaatctaaatttaccgttttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 21050366  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  21050367 atatcaattcataaaac 21050383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19997509 - 19997724
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19997509 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 19997608  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  19997609 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatacttgttcgtccatcatctcaaa 19997708  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  19997709 tatcaattcataaaac 19997724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25751671 - 25751456
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25751671 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 25751572  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25751571 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 25751472  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  25751471 tatcaattcataaaac 25751456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20044093 - 20043883
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20044093 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20043994  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043993 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20043894  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20043893 attcataaaac 20043883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21103595 - 21103385
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  21103595 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 21103496  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21103495 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 21103396  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21103395 attcataaaac 21103385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 22370678 - 22370888
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  22370678 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 22370777  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370778 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 22370877  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  22370878 attcataaaac 22370888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 35996214 - 35996424
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  35996214 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 35996313  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35996314 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 35996413  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  35996414 attcataaaac 35996424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23879942 - 23880158
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23879942 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacattatcctaattaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 23880041  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23880042 taatctctaatctaaattcattgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaa 23880141  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  23880142 atatcaattcataaaac 23880158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 1685785 - 1685995
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  1685785 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 1685884  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685885 cttatctaaattcaccgctttaacatggataaacaattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 1685984  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  1685985 attcataaaac 1685995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20038438 - 20038228
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20038438 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20038339  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20038338 cttatctaaattcatcgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20038239  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20038238 attcataaaac 20038228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21105637 - 21105427
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  21105637 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 21105538  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21105537 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 21105438  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21105437 attcataaaac 21105427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 29325431 - 29325641
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  29325431 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattt 29325530  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325531 cttatctgacttcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 29325630  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  29325631 attcataaaac 29325641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22831266 - 22831482
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22831266 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 22831365  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22831366 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaaccgtggaaacgaatatggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 22831465  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||||||    
T  22831466 ttatcaattcataaaac 22831482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21939448 - 21939233
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21939448 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaaccttaatcttatgtaaccct 21939349  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939348 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcatctcaaa 21939249  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  21939248 tatcaattcataaaac 21939233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33632550 - 33632767
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  33632550 acatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatataacc 33632649  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33632650 ctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctca 33632749  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33632750 aatatcaattcataaaac 33632767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38349880 - 38349663
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  38349880 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaattttaaaccttaatcttatgtaacc 38349781  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38349780 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctca 38349681  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||| |||||||    
T  38349680 aatatcaatttataaaac 38349663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14351611 - 14351394
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14351611 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatct 14351512  T
Q  105 ctaatctaaa-------ttcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||||||||       ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14351511 ctaatctaaaatctaaattcactgatttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctca 14351412  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14351411 aatatcaattcataaaac 14351394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22285101 - 22285315
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22285101 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccct 22285200  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  22285201 aatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatct-taa 22285299  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  22285300 tatcaattcataaaac 22285315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11351482 - 11351272
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  11351482 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 11351383  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351382 cttatcaaaattcactgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 11351283  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  11351282 attcataaaac 11351272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6570543 - 6570376
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570543 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 6570444  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggag 168  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6570443 gtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 6570376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20002865 - 20003080
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20002865 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 20002964  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || ||||||||||| || ||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002965 aattccttatctaaattcatcgctttaacatagatcaaccattatcgaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 20003064  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  20003065 tatcaattcataaaac 20003080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21945383 - 21945168
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21945383 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacataatcctaatcaaactaggctttcaaccttaatcttatgtaaccct 21945284  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21945283 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 21945184  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||    
T  21945183 tatcaattgataaaac 21945168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26826617 - 26826834
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  26826617 acattagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaacc 26826716  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  26826717 ctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaattggagggtttgatgattgttaattcatcatctca 26826816  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26826817 aatatcaattcataaaac 26826834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18399398 - 18399615
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||     
T  18399398 acatgagtgagtagacttctctttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccttaatcttatgtaact 18399497  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18399498 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctca 18399597  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18399598 aataccaattcataaaac 18399615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21821475 - 21821692
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21821475 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 21821574  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  21821575 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 21821674  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21821675 aatatcaattcataaaac 21821692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21831757 - 21831974
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  21831757 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttacgtaacc 21831856  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  21831857 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 21831956  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21831957 aatatcaattcataaaac 21831974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21842998 - 21842781
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21842998 acattagtgagtagacttctacttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 21842899  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842898 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 21842799  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21842798 aatatcaattcataaaac 21842781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23912202 - 23912419
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23912202 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaacc 23912301  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23912302 ctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttgtccatcattcca 23912401  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23912402 aatatcaattcataaaac 23912419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27537572 - 27537789
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27537572 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 27537671  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27537672 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 27537771  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27537772 aatatcaattcataaaac 27537789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42418482 - 42418267
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42418482 acataagtgagtagactcttcttgtcttggggttgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaattttatgtaaccct 42418383  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  42418382 aatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 42418283  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||| ||||    
T  42418282 tatcaattcatcaaac 42418267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 9317967 - 9318177
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  9317967 agtgagtagactcttcttatattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttaacccctaatcttatgtaaccctagttt 9318066  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  9318067 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaataaca 9318166  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9318167 attcataaaac 9318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15759690 - 15759900
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  15759690 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggctaagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 15759789  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15759790 ctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattatcgaactgtagaagcgaaaatggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 15759889  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15759890 attcataaaac 15759900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21098248 - 21098031
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  21098248 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttgtgtaacc 21098149  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  21098148 ctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttgtccatcattcca 21098049  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21098048 aatatcaattcataaaac 21098031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21858809 - 21858592
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21858809 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 21858710  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21858709 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataactgtttatccatcatctca 21858610  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21858609 aatatcaattcctaaaac 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23904347 - 23904564
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  23904347 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttgtgtaacc 23904446  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23904447 ctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttgtccatcattcca 23904546  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23904547 aatatcaattcataaaac 23904564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25228753 - 25228970
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25228753 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 25228852  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  25228853 ctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 25228952  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25228953 aatatcaattcataaaac 25228970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39730668 - 39730493
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39730668 catgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccct 39730569  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39730568 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttga 39730493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19768266 - 19768483
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  19768266 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaaagacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 19768365  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19768366 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgatagtagagggtttgataattatttatccatcatctca 19768465  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19768466 aatatcaattcataaaac 19768483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20836216 - 20836433
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20836216 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 20836315  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20836316 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 20836415  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20836416 aatatcaattcataaaac 20836433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22099131 - 22098914
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22099131 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacatgatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22099032  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22099031 ctaatttcttatctaaattcaccgttttatcatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 22098932  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22098931 aatatcaattcataaaac 22098914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20713196 - 20713412
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20713196 acatgagtgagtatacttatctttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 20713295  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20713296 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccatcatctca 20713395  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  20713396 aatatcaattcataaaa 20713412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21956037 - 21956253
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21956037 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 21956136  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  21956137 ctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 21956236  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  21956237 aatatcaattcataaaa 21956253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 25397062 - 25397278
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  25397062 agtgagtatactcttcttgtcttgagatttttggatatgtctaatgacataatcctaatcaaacgaagttttaaaccctaattttatctaaccctaattt 25397161  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25397162 ctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcaaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 25397261  T
Q  205 attcataaaactaaaat 221  Q
    ||||||||||| |||||    
T  25397262 attcataaaacgaaaat 25397278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 17613310 - 17613521
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  17613310 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtttaaatgacataatcctaattgaaccaaactctaagccttaatcttatgtaaccctaatt 17613409  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17613410 tcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 17613509  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  17613510 aattcataaaac 17613521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 17621492 - 17621703
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| | | |||||||||||||||||||     
T  17621492 agtgagtagacttatcttgtcttgggattgctggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaatctaagctttaatcttatgtaaccctaatt 17621591  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17621592 tcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 17621691  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  17621692 aattcataaaac 17621703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19360018 - 19360235
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||    
T  19360018 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagttctaagccttaattttatgcaacc 19360117  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19360118 ctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 19360217  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19360218 aatatcaattcataaaac 19360235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40952218 - 40952001
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  40952218 acatgagtgagtagacttctccttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 40952119  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  40952118 ctaatttcttatctaaattcgtcgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 40952019  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40952018 aatatcaattcataaaac 40952001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8328967 - 8328750
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  8328967 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 8328868  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  8328867 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 8328768  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8328767 aatatcaattcataaaac 8328750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 23779554 - 23779739
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23779554 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaacc 23779653  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23779654 ctaatctctaatctaaattcaccgccttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtt 23779739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21950235 - 21950451
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21950235 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 21950334  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    | ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  21950335 caaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattattcca 21950434  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  21950435 aatatcaattcataaaa 21950451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18273366 - 18273216
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18273366 tgagtgagcagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaat 18273267  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273266 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtg 18273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8308579 - 8308796
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  8308579 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 8308678  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  8308679 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 8308778  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8308779 aatatcaattcataaaac 8308796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8322301 - 8322084
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  8322301 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 8322202  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  8322201 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 8322102  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8322101 aatatcaattcataaaac 8322084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18821797 - 18821580
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  18821797 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtttgataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaacc 18821698  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18821697 ctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 18821598  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18821597 aatatcaattcataaaac 18821580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21382852 - 21383069
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  21382852 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 21382951  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  21382952 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 21383051  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21383052 aatatcaattcataaaac 21383069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22033031 - 22032814
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  22033031 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctcagccttaatcttatgtaacc 22032932  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22032931 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggttttgataattgtttatccattattcca 22032832  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22032831 aatatcaattcataaaac 22032814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22039633 - 22039416
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22039633 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatgctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22039534  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22039533 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 22039434  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22039433 aatatcaattcataaaac 22039416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22093343 - 22093560
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22093343 acatgagtgagtagaattctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacatagtcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22093442  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22093443 ctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 22093542  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22093543 aatatcaattcataaaac 22093560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22103132 - 22103349
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  22103132 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaact 22103231  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||    
T  22103232 ctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatcattgtttatccattattcca 22103331  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22103332 aatatcaattcataaaac 22103349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Original strand, 18162127 - 18162336
Alignment:
Q  10 agtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatctcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18162127 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcta 18162226  T
Q  108 atctaaattcaccgtttt--aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    ||||||||| ||  | ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  18162227 atctaaatttacgatattcctatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcttctcaaatctcaa 18162326  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
     |||||||||    
T  18162327 ctcataaaac 18162336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8315227 - 8315444
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  8315227 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 8315326  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  ||    
T  8315327 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatgattgttcgtccattattcca 8315426  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8315427 aatatcaattcataaaac 8315444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16418401 - 16418184
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| ||||||||||    
T  16418401 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaatctctaagccttaattttatgtaacc 16418302  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16418301 ctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggaggatttgataattgtttatccatgatctca 16418202  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16418201 aatatcaattcataaaac 16418184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43836242 - 43836044
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |                
T  43836242 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaactccaattt------------ 43836155  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43836154 ----ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 43836059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23503265 - 23503474
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| |    
T  23503265 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccttaattttatttaaccctaattt 23503364  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  23503365 ctaatctaaattcattgttttaacatgaattaa-cattatcaaactgtagaagcgaaaatggaaggtttgataattgttaattcatcatctcagatatca 23503463  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    | |||||||||    
T  23503464 aatcataaaac 23503474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14821312 - 14821527
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14821312 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 14821411  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||  ||||    
T  14821412 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgacaatcgttaatccattattccaaa 14821511  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  14821512 tgttaattcataaaac 14821527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 37652935 - 37653150
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  37652935 acatgagtgagtagacttcttatgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagcattaaaccttaatattatgtaaccct 37653034  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||  ||||    
T  37653035 aatttctcttttaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaaaccattattccaaa 37653134  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  37653135 tgttaattcataaaac 37653150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17515765 - 17515552
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||     
T  17515765 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaacctaaccttaaaccttaatcttatgtagccctag 17515666  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||     
T  17515665 tttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtgaaaacaaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatg 17515566  T
Q  202 tcaattcataaaac 215  Q
    | ||||||||||||    
T  17515565 ttaattcataaaac 17515552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 21037797 - 21037929
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21037797 taatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 21037896  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  21037897 ttatccattattccaaatataaattcataaaac 21037929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17504151 - 17503937
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  17504151 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggacaagtctaattgcataatcttaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 17504052  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||    
T  17504051 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaat 17503952  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  17503951 gttaattcataaaac 17503937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Original strand, 26013103 - 26013246
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26013103 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatgaagtcttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 26013202  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  26013203 ctaatctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccaaa 26013246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11346443 - 11346308
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||      
T  11346443 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 11346344  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacca 140  Q
    || |||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  11346343 cttatctaaattcactgctttaacatggatcaacca 11346308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 215
Target Start/End: Original strand, 22364280 - 22364379
Alignment:
Q  116 tcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22364280 tcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 22364379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 6279878 - 6280087
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||   ||     
T  6279878 tgagtgagtagactcttct-gccttgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatataaatttac 6279976  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  6279977 tttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattaccaaactatagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaata 6280075  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    |||||| |||||    
T  6280076 tcaatttataaa 6280087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1302261 - 1302069
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1302261 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 1302162  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaaca--tgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccat 190  Q
    | | |||  ||||||||||| |||| ||||  || |||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1302161 agtttctcttctaaattcactgtttcaacatttggattaaatatcatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccat 1302069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 23455708 - 23455820
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23455708 acatgagtgagtagactcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctagtcaaaccgagctttaaaccctaattttatgtaaccct 23455807  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    ||| |||||||||    
T  23455808 aatttctaatcta 23455820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 21139793 - 21140006
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaac-caagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  21139793 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgagatttttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaactaaaccataaaccctaattttatataaatct 21139892  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||   ||| |||| | |||||||| | |||||||| || |||||||| ||    
T  21139893 actttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaattaccaaactcataaagcgaatgcggagggttag-taattgttaattcatcatctaaa 21139991  T
Q  199 atatcaattcataaa 213  Q
    ||||||||| |||||    
T  21139992 atatcaatttataaa 21140006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 1693249 - 1693362
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  1693249 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 1693348  T
Q  98 ctaatctctaatct 111  Q
    ||||| ||| ||||    
T  1693349 ctaatttcttatct 1693362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1990447 - 1990239
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | |||| |||| |||| |||   || | |    
T  1990447 agtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccttaattttatataaatatacttt 1990348  T
Q  105 ctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||  | || ||||   |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1990347 ctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaattaccaaactaag-aagcgaacacggagggtttagtaattgttaattcatcatctcaaatatc 1990249  T
Q  204 aattcataaa 213  Q
    ||||||||||    
T  1990248 aattcataaa 1990239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 21319549 - 21319674
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  21319549 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattcttggacaagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 21319648  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||| |||||||||||||||||    
T  21319649 attttctactctaaattcaccgtttt 21319674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21328520 - 21328462
Alignment:
Q  157 acgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328520 acgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 21328462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14162092 - 14161973
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  14162092 agtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcatcgaaccctaattttatgtaaatctaattt 14161994  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  14161993 ctaatctaatttcaccgtttt 14161973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 22854132 - 22854206
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22854132 acatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagc 22854206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24039352 - 24039258
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatg 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  24039352 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatg 24039258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23193900 - 23193689
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||| | || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| || |||| |||| |||| |||  |||     
T  23193900 tgagtgagtagactcttcttgtctcgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccttaatcaaatcaagccttgaaccttaattttatataaatctac 23193801  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgtt-ttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||    || ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||    
T  23193800 tttctaatctaatttcaccgttgttataatgaattaacaaatatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-tatttgttaattcatcatctcaaat 23193702  T
Q  201 atcaattcataaa 213  Q
     ||||||||||||    
T  23193701 gtcaattcataaa 23193689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 29003758 - 29003829
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003758 acatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 29003829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 5579193 - 5579258
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatca 66  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5579193 acatgagtgagtagacttctcatgtcttaggattgttggataaatctaatgacataatcctaatca 5579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19792187 - 19792041
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||  ||| |    
T  19792187 tgagtgagtagacttct--tgtcttgggattgttggatgaatctaatgacctaatcctaatcaaactaagcattgaaccctaattttatgtaaaactact 19792090  T
Q  103 ctctaatctaaattcacc-gttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
     |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  19792089 ttctaatctaatttcaccatttttataatgaattaacaagtatcaaact 19792041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 24342185 - 24342310
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  24342185 acataagtgagtagactcttcttgtcttggaattgttggataagtttaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 24342284  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||| ||| |||||||||||    
T  24342285 attttctaatttaatttcaccgtttt 24342310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22029938 - 22029862
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct 75  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22029938 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct 22029862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 18008262 - 18008334
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 73  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18008262 acatgagtgagtagactcttcttgttttgggattgttgtataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 18008334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 15636203 - 15636296
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  15636203 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattattggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 15636296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23221471 - 23221300
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||   || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| | |  ||||    
T  23221471 tgagtgaatagactcttcttgtcttgggattgctgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagccttgaaccctagttttatatgaatctaa 23221372  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtt 172  Q
    | |||||||||| ||||||| | |||  |||||||||| | |||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  23221371 tttctaatctaatttcaccgatgttataatgaattaacaaatatcaaactcataaagcgaaagtggagggtt 23221300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 26854193 - 26854346
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgt--cttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  |||      
T  26854193 acatgagtgagtagactcttcttgtgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagactcgaaccctaattttagataaat 26854292  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    ||| | |||||||||| |||| || |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  26854293 ctactttctaatctaatttcatcgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 26854346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Original strand, 24967385 - 24967505
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||| ||||| | |||| |||  ||| | |    
T  24967385 agtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacgcaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagttttatataaatctacttt 24967484  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  24967485 ctaatctaatttcaccgtttt 24967505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 15634430 - 15634523
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  15634430 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattatttgatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 15634523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31469625 - 31469553
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31469625 acatgggtgactagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagc 31469553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 125
Target Start/End: Original strand, 22904759 - 22904846
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||    
T  22904759 ggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagccttgaaccctaatcttatgtaaatctattttctaatat-aattcaccgtttt 22904846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Original strand, 27063439 - 27063468
Alignment:
Q  186 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063439 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 27063468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Original strand, 27092551 - 27092580
Alignment:
Q  186 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27092551 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 27092580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 74)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49379605 - 49379395
Alignment:
Q  5 gagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49379605 gagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaccctaatcttatgtaatcctaatc 49379506  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49379505 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 49379406  T
Q  204 aattcataaaa 214  Q
    |||||||||||    
T  49379405 aattcataaaa 49379395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 8648996 - 8649207
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648996 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaatc 8649095  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8649096 tctaatataaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 8649195  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  8649196 aattcataaaac 8649207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13250861 - 13251076
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  13250861 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccgt 13250960  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250961 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 13251060  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  13251061 tatcaattcataaaac 13251076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17986683 - 17986896
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17986683 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagttttaaccctaatcttatgtaacccta 17986782  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17986783 atttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 17986882  T
Q  201 atcaattcataaaa 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  17986883 atcaaatcataaaa 17986896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8653877 - 8654093
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8653877 acatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 8653976  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8653977 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcttaa 8654076  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  8654077 atatcaattcataaaac 8654093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36850320 - 36850106
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36850320 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaacccta 36850221  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36850220 gtttctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattattaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 36850121  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  36850120 atcaattcataaaac 36850106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 2386353 - 2386568
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  2386353 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccct 2386452  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2386453 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 2386552  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  2386553 tatcaattcataaaac 2386568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 17716878 - 17717087
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17716878 agtgagtatgcttctcttgtcttgggatggttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctagtttc 17716977  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17716978 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatccatcatctaaaatatcaa 17717077  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  17717078 ttcataaaac 17717087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27911294 - 27911079
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27911294 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 27911195  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911194 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 27911095  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  27911094 tatcaattcataaaac 27911079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 3985386 - 3985596
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  3985386 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 3985485  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3985486 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 3985585  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  3985586 attcataaaac 3985596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 3990665 - 3990875
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  3990665 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 3990764  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3990765 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 3990864  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  3990865 attcataaaac 3990875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 16485407 - 16485617
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  16485407 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 16485506  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16485507 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 16485606  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  16485607 attcataaaac 16485617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 38045465 - 38045675
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  38045465 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 38045564  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38045565 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 38045664  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  38045665 attcataaaac 38045675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4028430 - 4028645
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4028430 acatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtcttaatgacataatcctaatcaaactaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 4028529  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4028530 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatc-aactgtgtaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 4028628  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  4028629 atatcaattcataaaac 4028645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28206319 - 28206107
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28206319 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 28206220  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28206219 ctctaatctaaattcaccactttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 28206120  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  28206119 caattcataaaac 28206107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46143506 - 46143291
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttta-accctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46143506 acatgagtgagtatacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttacaccctaatcttatgtaaccct 46143407  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46143406 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactttagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 46143307  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  46143306 tatcaattcataaaac 46143291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 27041814 - 27042024
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  27041814 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 27041913  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041914 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 27042013  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  27042014 attcataaaac 27042024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 27047568 - 27047778
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  27047568 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 27047667  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047668 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 27047767  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  27047768 attcataaaac 27047778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39286591 - 39286380
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaa-tcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||     
T  39286591 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactattaaccctaaatcttatgtaaccctaatt 39286492  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39286491 tctaatctaaattcaccgttttaaaatgaattaaccattattaaactgtgaaaacgaaagcgaagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatc 39286392  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  39286391 aattcataaaac 39286380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 41461851 - 41462065
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  41461851 acatgagtgagtatacttctcttgtcttgggtttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaacccga 41461950  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41461951 atttctaatctaaattcactattttaacttgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagttgaaggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 41462050  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  41462051 atcaattcataaaac 41462065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18885366 - 18885151
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  18885366 acatgagtgagtagacttct--tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaaccttaatcctatgtaacc 18885269  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18885268 ctaatctataatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatccatcatctca 18885169  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18885168 aatatcaattcataaaac 18885151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26134491 - 26134280
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  26134491 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagttttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 26134392  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26134391 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaactgtggaaacgaaagtggggggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 26134292  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  26134291 aattcataaaac 26134280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 44538364 - 44538575
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  44538364 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatacgagtaaatgacataattctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 44538463  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44538464 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 44538563  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  44538564 aattcataaaac 44538575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8953457 - 8953242
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  8953457 acatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcataatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaactc 8953358  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8953357 taatctctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaaagaaaatggaaggtttgataattgttaatccatcatctcaa 8953258  T
Q  199 atatcaattcataaaa 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  8953257 atatcaattcataaaa 8953242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19875100 - 19874885
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19875100 acatgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagacttaaaccctaatcttatgtaaccct 19875001  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  19875000 agtttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaacctgtaaaagtgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatatcaaa 19874901  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  19874900 tatcaattcataaaac 19874885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19880057 - 19879843
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  19880057 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcc-aatcaaaccaagccttaaaccctaatcttacgtaaccct 19879959  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19879958 agtttctaatctaaattcaccgttgtaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaa 19879859  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  19879858 tatcaattcataaaac 19879843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 41802405 - 41802613
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || | |||    
T  41802405 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacactaatcttatgtaaccttagtttct 41802504  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41802505 aatctaaattcattgttttaacatgaattaaccattatcaaagtgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaat 41802604  T
Q  207 tcataaaac 215  Q
    |||||||||    
T  41802605 tcataaaac 41802613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25727075 - 25727289
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25727075 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccctaattttatgtaaccct 25727174  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  25727175 aatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggaggg-ttaataattgttaattcatcatctcaaa 25727273  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||| ||||||    
T  25727274 tatcaattcgtaaaac 25727289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25735483 - 25735697
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25735483 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccctaattttatgtaaccct 25735582  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  25735583 aatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggaggg-ttaataattgttaattcatcatctcaaa 25735681  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||| ||||||    
T  25735682 tatcaattcgtaaaac 25735697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 16431677 - 16431887
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16431677 agtgagtagactcttcttgtcttggaatcgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 16431776  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16431777 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaaatggagggtttaataattgttaatccatcatctcaaatatca 16431876  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  16431877 attcataaaac 16431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 48256429 - 48256638
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||    
T  48256429 agtgagtagattcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctaattttatgtaacattaatttc 48256528  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48256529 taatataaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatctatcatctcaaatatcaa 48256628  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  48256629 ttcataaaac 48256638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12060424 - 12060247
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060424 ggataagtctaatgacataatcttaatccaaccaagctttaactctaatattatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaa 12060325  T
Q  138 ccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060324 ccgttatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 12060247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20231629 - 20231846
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20231629 acatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 20231728  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20231729 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 20231828  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20231829 aatatcaattcataaaac 20231846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22660021 - 22659828
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22660021 acataagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 22659922  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22659921 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatcaatca 22659828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16365265 - 16365097
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16365265 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttagataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccct 16365166  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggag 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16365165 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacgattatcaaaccgtggaaacgaaagtggag 16365097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19772166 - 19771950
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19772166 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcgtataagtctaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccctaatcttatataaccct 19772067  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacc-attatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19772066 aatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaattaaccaattatcaacctgtagaagcgaaagtggagggtatgataattgttaatccatcatctcaa 19771967  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||| |||||||    
T  19771966 atatcaattaataaaac 19771950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19599886 - 19599669
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  19599886 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcaaagctctaagccttaatcttatgtaacc 19599787  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  19599786 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 19599687  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19599686 aatatcaattcataaaac 19599669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20393704 - 20393921
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20393704 acatgagtgcgtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgagataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 20393803  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20393804 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 20393903  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20393904 aatatcaattcataaaac 20393921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 28208015 - 28208223
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  28208015 agtgagtagactcttcttgtcttcggattcttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccctagttt 28208114  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  28208115 ctaatctaaattcactgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaata-ca 28208212  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  28208213 attcataaaac 28208223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17094055 - 17093838
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  17094055 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccgtaatcttatgtaacc 17093956  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  17093955 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 17093856  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17093855 aatatcaattcataaaac 17093838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20399726 - 20399943
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20399726 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 20399825  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  20399826 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 20399925  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20399926 aatatcaattcataaaac 20399943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22841824 - 22842041
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22841824 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22841923  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22841924 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22842023  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22842024 aatatcaattcataaaac 22842041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20238195 - 20238411
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  20238195 acatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaaaccaagctctatgccttaatcttatgtaacc 20238294  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20238295 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 20238394  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  20238395 aatatcaattcataaaa 20238411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2395257 - 2395040
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  2395257 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggacaagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 2395158  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  2395157 ctaatttcttatctggattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 2395058  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2395057 aatatcaattcataaaac 2395040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17101891 - 17101674
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  17101891 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccgtaatcttatgtaacc 17101792  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  17101791 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgacagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 17101692  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17101691 aatatcaattcataaaac 17101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21798118 - 21797901
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  21798118 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 21798019  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  21798018 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 21797919  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21797918 aatatcaattcataaaac 21797901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21804826 - 21804609
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  21804826 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 21804727  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  21804726 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 21804627  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21804626 aatatcaattcataaaac 21804609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23501765 - 23501548
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  23501765 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaact 23501666  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23501665 ctaatttcttatctgaattcactgtcttaacatggatcaaccattatcaagctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 23501566  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23501565 aatatcaattcataaaac 23501548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 19364793 - 19364971
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364793 ggataagtctattgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttgtgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 19364892  T
Q  137 accattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||| |  ||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364893 accattatcaaactttttaattgaaattggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 19364971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19788246 - 19788031
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  19788246 acatgactgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatatgtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaattttatataaccct 19788147  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19788146 aatttgtaatctaaattcactgtttcaacatgaattaaccattatcaaactatagaagcgaaagtatagggtttgataattgctaatccataatctcaaa 19788047  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||    
T  19788046 tatcaatttataaaac 19788031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41309461 - 41309251
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||     
T  41309461 acatgagtgagtagatttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct------ctaatcttatgtaacct 41309368  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  41309367 taatttcttatctgaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatttttccaa 41309268  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  41309267 atatcaattcataaaac 41309251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18816482 - 18816697
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  18816482 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagacttaaaccttaatattatgtaaccct 18816581  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  18816582 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaa 18816681  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  18816682 tgttaattcataaaac 18816697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 41224623 - 41224759
Alignment:
Q  78 aaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgata 177  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  41224623 aaccttaatcttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaaagaaaatggaaggtttgata 41224722  T
Q  178 attgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41224723 attgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 41224759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 20412381 - 20412587
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  20412381 tgagtaagtagactcttcttgtcttgagattgcgggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaccctaattttatgtaaccctaatt 20412480  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||    || ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  20412481 tctaatctaaattcaccgttttcataatgaattaacaaataccaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatat 20412579  T
Q  203 caattcat 210  Q
    ||||||||    
T  20412580 caattcat 20412587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21784177 - 21783967
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| | | ||| ||||||||||||| | |    
T  21784177 tgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaactttaatattatgtaaccctagttt 21784078  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||| | |    
T  21784077 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataatcgttaatccattattccaaatgtta 21783978  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21783977 attcataaaac 21783967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21792302 - 21792093
Alignment:
Q  9 gagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| | ||    
T  21792302 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttc 21792203  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |  |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||| | ||    
T  21792202 tcttctaaattcaacgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagagtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaa 21792103  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  21792102 ttcataaaac 21792093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22635637 - 22635467
Alignment:
Q  46 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattat 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  22635637 ctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaactctaattttatgtaaccctaatttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattat 22635538  T
Q  145 caaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22635537 caaactatggaaacgaaagtggagggtttgatggtcgttaatccattatcccaaatattaattcataaaac 22635467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52235793 - 52235711
Alignment:
Q  86 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggag 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  52235793 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaagttgtggaaacgaaagtggag 52235711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28763838 - 28763624
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||       
T  28763838 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtagggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatataaata 28763739  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaaca-tgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    || | |||||||||| ||||| ||| | | | ||||||||| | |||||||||   ||| ||||||||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||    
T  28763738 tactttctaatctaatttcactgttatcataatgaattaacaaatatcaaactcataaagcgaaagtggagggcta-atatttgttaattcatcatctca 28763640  T
Q  198 aatatcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||||||    
T  28763639 aatatcaattcataaa 28763624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52755302 - 52755199
Alignment:
Q  10 agtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctctaa 108  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  52755302 agtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaacccctaactttatgtaaccctaatttctaa 52755203  T
Q  109 tcta 112  Q
    ||||    
T  52755202 tcta 52755199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13799395 - 13799276
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  13799395 agtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcatcgaaccctaattttatgtaaatctaattt 13799297  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  13799296 ctaatctaatttcaccgtttt 13799276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16148411 - 16148260
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  16148411 acatgagtgagtaaactcttcttgtctttgaattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 16148312  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  16148311 actttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 16148260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 22411234 - 22411359
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||| | |||| ||| |||    
T  22411234 acatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagttttatataaacct 22411333  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||    
T  22411334 actttctaatctaatttcaacgtttt 22411359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 52169117 - 52169242
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| | |||| |||  ||    
T  52169117 acatgattgagtaaactcttcttgtcttgggattgttgcataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagttttatataaatct 52169216  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  52169217 actttctaatctaatttcaccgtttt 52169242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16384916 - 16384793
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  16384916 acatgagtgagcagacttct-ttctcttgggattgttggatgagtctaatgacataatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 16384818  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| | |||||||||||    
T  16384817 attttctaatct-atttcaccgtttt 16384793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24680270 - 24680361
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgt 93  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  24680270 acatgagtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataat-cttatcaaaccaagcctataaccctaattttatgt 24680361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 26194362 - 26194473
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||| || ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  26194362 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaaacctcgaaccctaattttatgtaaatct 26194460  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  26194461 attttctaatcta 26194473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15346810 - 15346686
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| |  ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | || | ||||| ||||||||||||    
T  15346810 acatgagtaagtagacttct-ttatcttgggattgttagatgagtctaatgacctaatcttattcaaagcaagcctaaaactctaattttatgtaaccct 15346712  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||    
T  15346711 attttctaatctaatctcaccgtttt 15346686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25405041 - 25404968
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||| |||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25405041 acatgagtgagtaaactctttttgtcttgggattgatgtataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 25404968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 16354209 - 16354269
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaat 64  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16354209 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcttaat 16354269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12059742 - 12059671
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  12059742 acattagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctgatcataatcaaaccaa 12059671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 21924787 - 21924881
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21924787 acatgagtgagtagtctttt-ttgtcttgggattgttagatgagtctaatgacttaatcctattcaaaccaagcctaaaaccctaattttatgtaa 21924881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 30819022 - 30818957
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 73  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  30819022 gtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 30818957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 15421225 - 15421349
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  || |||| |||| |  |||||||||||||| |||  ||    
T  15421225 acatgtgtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatgaaactaagcctagaaccctaatcttatttaaatct 15421323  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||    
T  15421324 attttctaatctaatttcatcgtttt 15421349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 3646 - 3855
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3646 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatttc 3745  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3746 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctctaatatcaa 3845  T
Q  206 ttcataaaac 215  Q
    ||||||||||    
T  3846 ttcataaaac 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 150823 - 150607
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  150823 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 150724  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  150723 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 150624  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  150623 atatcaattcataaaac 150607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 153837 - 153620
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  153837 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 153738  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  153737 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 153638  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  153637 aatatcaattcataaaac 153620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 245779 - 245559
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaac 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  245779 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatggcataatcctaatcaaaacaagcttttaaaccttaatcttatgtaac 245680  T
Q  97 cctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttga---taattgtttatccatcat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  245679 cctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataataattgttaatccatcat 245580  T
Q  194 ctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  245579 ctcaaatatcaattcataaaa 245559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 127)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20993732 - 20993516
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaa-tcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  20993732 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactattaaccctaaatcttatgtaaccc 20993633  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20993632 taatctctaatctaaattcacctttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 20993533  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  20993532 atatcaattcataaaac 20993516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8603625 - 8603840
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  8603625 acatgagtgagtagacttctcttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccct 8603724  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603725 attttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgttgaagcgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 8603824  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  8603825 tatcaattcataaaac 8603840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5672040 - 5671824
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |    
T  5672040 acatgagtgagtagacttctcttgtattaggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagatattgaccctaatcttatgtaactc 5671941  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5671940 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 5671841  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  5671840 atatcaattcataaaac 5671824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 18854755 - 18854966
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18854755 gtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatc 18854854  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18854855 tctaatctaaattcaccgttttaacataaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 18854954  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  18854955 aattcataaaac 18854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22737963 - 22738177
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  22737963 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaataacataatcctaatcaaaccaagcttgaaaccctaattttatgtaaccct 22738062  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738063 aatttctaatctaaattcaccgttttaacaggaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg-ttgataattgttaatccatcatctcaaa 22738161  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  22738162 tatcaattcataaaac 22738177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 4188271 - 4188481
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  4188271 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 4188370  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4188371 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 4188470  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  4188471 attcataaaac 4188481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15700312 - 15700522
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15700312 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15700411  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15700412 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15700511  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15700512 attcataaaac 15700522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19075304 - 19075094
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  19075304 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 19075205  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19075204 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 19075105  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  19075104 attcataaaac 19075094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22060972 - 22060762
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  22060972 agtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 22060873  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22060872 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 22060773  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  22060772 attcataaaac 22060762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22072053 - 22071843
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  22072053 agtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 22071954  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22071953 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 22071854  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  22071853 attcataaaac 22071843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26474076 - 26474290
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26474076 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaacaaagcttaaaccctaatcttatgtaacccta 26474175  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26474176 atttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatagaagcgaaaatggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 26474275  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  26474276 atcaattcgtaaaac 26474290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25786327 - 25786114
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25786327 acatgagtatgtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccttattcttatgtaacccta 25786228  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25786227 gtttctaatctaaattcacctttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 25786128  T
Q  201 atcaattcataaaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  25786127 atcaattcataaaa 25786114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15158262 - 15158478
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15158262 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggaaaagtcttaatgacataatcgtaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccc 15158361  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15158362 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgttaatccatcatctcaa 15158461  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  15158462 atatcaattcataaaac 15158478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 18844580 - 18844787
Alignment:
Q  11 gtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctcta 107  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18844580 gtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctcta 18844679  T
Q  108 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18844680 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatt 18844779  T
Q  208 cataaaac 215  Q
    ||||||||    
T  18844780 cataaaac 18844787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19560868 - 19560652
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||    
T  19560868 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttattgaccgtaatcttatgtaaccc 19560769  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19560768 taatctctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactctggaaacgaaaattgagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 19560669  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  19560668 atatcaattcataaaac 19560652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12474506 - 12474291
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12474506 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataattctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaaccct 12474407  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474406 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 12474307  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  12474306 tatcaattcataaaac 12474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27565805 - 27565595
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  27565805 agtgactagacttctcttgtcttgggattgttggataattctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 27565706  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27565705 cttatctaaattcaccgctttaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 27565606  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  27565605 attcataaaac 27565595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23603253 - 23603041
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  23603253 agtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 23603154  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23603153 ttctaatctaaatttaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatat 23603054  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  23603053 caattcataaaac 23603041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29360442 - 29360652
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29360442 acatgagtgagtagacttctcttgtcttggggttgttggataagtctaatgtcataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 29360541  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29360542 ttttctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacga----ggaaggtttgataattgttaattcatcatctcaaat 29360637  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  29360638 atcaattcataaaac 29360652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18184363 - 18184151
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  18184363 agtgagtagacttcttcttgtcttgcgattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccataatcttatgtaaccttaat 18184264  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18184263 ctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 18184164  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  18184163 caattcataaaac 18184151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22005890 - 22006105
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22005890 acatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 22005989  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22005990 aattccttatctaaaatcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataagtgtttatccatcatctcaaa 22006089  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  22006090 tatgaattcataaaac 22006105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19615155 - 19614933
Alignment:
Q  3 atgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||     
T  19615155 atgagtgcgtagacttctcttgtcttcggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccttaatcttatgtaaccctag 19615056  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  19615055 tttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaacggtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctaaaaca 19614956  T
Q  202 tcaattcataaaactaaaattga 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  19614955 tcaattcataaaacgaaagttga 19614933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14077308 - 14077091
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  14077308 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagcttaaaaccttaatcttatgtaacc 14077209  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14077208 ctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggttttgataattgttaatccatcatctca 14077109  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14077108 aatatcaattcataaaac 14077091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15153804 - 15154020
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15153804 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggaaaagtcttaatgacataatcgtaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccc 15153903  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15153904 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaatgaaattggatgttttgataattgttaatccatcatctcaa 15154003  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  15154004 atatcaattcataaaac 15154020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17284009 - 17283799
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaac-cctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  17284009 agtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgccataatcctaatcaaaccaagctttaaatcctaattttatgtaaccctaattt 17283910  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17283909 ctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattataaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 17283810  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  17283809 attcataaaac 17283799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18006440 - 18006657
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18006440 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18006539  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18006540 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 18006639  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  18006640 aatatcaattcatgaaac 18006657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18732468 - 18732683
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |    
T  18732468 acatgagtgagtag-cttctcttgtctttggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaatcaagatattgaccctaatcttatgtaactc 18732566  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18732567 taatctctaatctaaattcaccgttttataatgaatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 18732666  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  18732667 atatcaattcataaaac 18732683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25775163 - 25775378
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaac-cctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| |||||||    
T  25775163 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttagataagtctaattacataatcctaatcaaagcaacccttaaatcctaatcttatttaaccct 25775262  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25775263 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgatttaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 25775362  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
     |||||||||||||||    
T  25775363 aatcaattcataaaac 25775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12657283 - 12657072
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12657283 acattagtgagtagacttctcttgtcttaggtttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatcttatgtaaccct 12657184  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    ||||||||||  ||||||||||||||    
T  12657183 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaacagtggaaacgaaagtggagg----gataattgttcgtccatcatctcaaa 12657088  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  12657087 tatcaattcataaaac 12657072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12442634 - 12442852
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaac 96  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||||||    
T  12442634 acatcagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaatcaaactcttaaaccttaatcttatgtaac 12442733  T
Q  97 cctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12442734 cctaatttctaatctaaattcaccgctttgacatgaattaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctc 12442833  T
Q  197 aaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12442834 aaatatcaattcataaaac 12442852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30671245 - 30671030
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||    
T  30671245 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaattacataatccaaatcaaaccaagatttaaaccttaattttatgtaatcct 30671146  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30671145 aatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtgaagagtttgataattgttaatccatcatctcaaa 30671046  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  30671045 tatcaattcataaaac 30671030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 11607491 - 11607708
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11607491 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 11607590  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11607591 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 11607690  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11607691 aatatcaattcataaaac 11607708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16738854 - 16739071
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16738854 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 16738953  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16738954 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 16739053  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16739054 aatatcaattcataaaac 16739071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 35271287 - 35271503
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  35271287 catgagttagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctcaatcttatgtaaccc 35271386  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35271387 taatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtcgagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 35271486  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  35271487 atatcaattcataaaac 35271503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17934529 - 17934746
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  17934529 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 17934628  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  17934629 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 17934728  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17934729 aatatcaattcataaaac 17934746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19829072 - 19828855
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  19829072 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 19828973  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||  |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  19828972 ctaatttcgtatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 19828873  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19828872 aatatcaattcataaaac 19828855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 6479318 - 6479535
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  6479318 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 6479417  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  6479418 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 6479517  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6479518 aatatcaattcataaaac 6479535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 6490739 - 6490956
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  6490739 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 6490838  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  6490839 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 6490938  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6490939 aatatcaattcataaaac 6490956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17119624 - 17119840
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  17119624 acatgagtgagaagacttcttcgtgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaatcttaatcttatgtaacc 17119723  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17119724 ttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgcattaaccat-atcaaacagtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctca 17119822  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17119823 aatatcaattcataaaac 17119840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18107294 - 18107511
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18107294 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaagccaagctataagccttaatcttatgtaacc 18107393  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18107394 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 18107493  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18107494 aatatcaattcataaaac 18107511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20022250 - 20022033
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20022250 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 20022151  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  20022150 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 20022051  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20022050 aatatcaattcataaaac 20022033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20164291 - 20164508
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20164291 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 20164390  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  20164391 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 20164490  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20164491 aatatcaattcataaaac 20164508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22165003 - 22164786
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22165003 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22164904  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22164903 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22164804  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22164803 aatatcaattcataaaac 22164786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22244573 - 22244790
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22244573 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22244672  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22244673 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22244772  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22244773 aatatcaattcataaaac 22244790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22766576 - 22766359
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22766576 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22766477  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  22766476 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtgggaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccattattcca 22766377  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22766376 aatatcaattcataaaac 22766359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22773259 - 22773042
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22773259 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22773160  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22773159 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22773060  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22773059 aatatcaattcataaaac 22773042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22787155 - 22786938
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22787155 acatgagtgagtagatttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22787056  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22787055 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaaggatttgataattttttatccattatctca 22786956  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22786955 aatatcaattcataaaac 22786938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27323038 - 27322821
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctct-tgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27323038 acatgagtgagtagacttctccatgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 27322939  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  27322938 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatctatcattcca 27322839  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27322838 aatatcaattcataaaac 27322821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 24218850 - 24219064
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24218850 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 24218949  T
Q  103 ctctaatctaaat--tcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     ||| || || ||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24218950 ttcttatatatatattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 24219049  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  24219050 atcaattcataaaac 24219064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20016085 - 20015868
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20016085 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccctaagccttaatcttatgtaacc 20015986  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  20015985 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 20015886  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20015885 aatatcaattcataaaac 20015868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20170988 - 20171205
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20170988 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 20171087  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  20171088 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 20171187  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20171188 aatatcaattcataaaac 20171205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25615394 - 25615611
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttg-tcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||     
T  25615394 acatgagtgagtagacttctctttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccatgctctaagccttaatcttatgtaact 25615493  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| || | ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615494 ctaatttcttatatgaattcaccgctttaagatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 25615593  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25615594 aatatcaattcataaaac 25615611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 6795069 - 6795280
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6795069 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaat 6795168  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||    
T  6795169 ttctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatatcaaatat 6795267  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||| ||||||    
T  6795268 caattcgtaaaac 6795280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18233782 - 18233583
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |               ||||||||    
T  18233782 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctat---------------taacccta 18233698  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18233697 atctctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatccaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 18233598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18195472 - 18195325
Alignment:
Q  69 ccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtgga 167  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18195472 ccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 18195373  T
Q  168 gggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18195372 gggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 18195325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 25949452 - 25949661
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  25949452 agtgagtagattcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaagcaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 25949551  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  25949552 ctactctaaattcaccgttttaacatcaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatca 25949650  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  25949651 attcataaaac 25949661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24854701 - 24854484
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24854701 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24854602  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24854601 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24854502  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24854501 aatatcaattcataaaac 24854484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24861360 - 24861143
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24861360 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24861261  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24861260 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24861161  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24861160 aatatcaattcataaaac 24861143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 210096 - 209884
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  210096 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgatataatcctaatcaaatgaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 209997  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209996 ttcttatctaagttcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtgaggggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 209897  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  209896 caattcataaaac 209884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1626275 - 1626491
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgt-cttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1626275 acatgagtgagtagacttctttttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaattttatgtaaccc 1626374  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||    
T  1626375 tagtttctattctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaagcgaaagcggagggtttgataatcgttaatccattatcccaa 1626474  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  1626475 atatcaattcataaaac 1626491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 17743633 - 17743826
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                |    
T  17743633 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaattt----------------c 17743716  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17743717 taatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgtaagtagagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaa 17743816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 29596435 - 29596655
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatct---tatgt 93  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||    
T  29596435 acatgagtgagtagacttatctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagctattaaaccttaatctaattatgt 29596534  T
Q  94 aaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  29596535 aaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggaggatttgataattgtccgtccatcat 29596634  T
Q  194 ctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  29596635 ctcaaatatcaatttataaaa 29596655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 25968693 - 25968902
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||| |    
T  25968693 agtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccataattttatgtaaccataattt 25968792  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |    
T  25968793 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatta 25968891  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||| ||||    
T  25968892 attcatgaaac 25968902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Original strand, 25964046 - 25964250
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||| |    
T  25964046 agtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccataattttatgtaaccataattt 25964145  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |    
T  25964146 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatta 25964244  T
Q  205 attcat 210  Q
    ||||||    
T  25964245 attcat 25964250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5152591 - 5152376
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  5152591 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacatgattctaatcaagccaaggcttaaaccttaatattatgtaaccct 5152492  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  5152491 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaa 5152392  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  5152391 tgttaattcataaaac 5152376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19966612 - 19966397
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  19966612 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagcaaagccttaaaccataatattatgtaaccct 19966513  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||    
T  19966512 agtttctcttctaaatttaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatttcaaa 19966413  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  19966412 tgttaattcataaaac 19966397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Original strand, 24511780 - 24511907
Alignment:
Q  88 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24511780 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatt 24511879  T
Q  188 catcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24511880 catcatctcaaatatcaattcataaaac 24511907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16470100 - 16470309
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  16470100 acatgagtgagtagaatcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaaaccaagccttaaaccttaattttgtgtaaccct 16470199  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  16470200 aatttctaatctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaa 16470298  T
Q  200 tatcaattcat 210  Q
    |||||||||||    
T  16470299 tatcaattcat 16470309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Original strand, 32544764 - 32544890
Alignment:
Q  89 tatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32544764 tatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatcc 32544863  T
Q  189 atcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32544864 atcacctcaaatatcaattcataaaac 32544890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25402422 - 25402205
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||    
T  25402422 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaacc 25402323  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | |||  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||    
T  25402322 ctagtttctcttctaaatttaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattcca 25402223  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  25402222 aatgttaattcataaaac 25402205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19570053 - 19569927
Alignment:
Q  85 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 184  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  19570053 atcttatgtaatcctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgtta 19569954  T
Q  185 atccatcatctcaaatatcaattcata 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19569953 atccatcatcttaaatatcaattcata 19569927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21560074 - 21559860
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||| | | |||| ||||||||    
T  21560074 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctgatcaagtcaagccttaaaccttagtattatataacccta 21559975  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||    
T  21559974 gtttctcttctaaattcatcgttttaacatggattaaatattattaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccatcattccaaat 21559875  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  21559874 gttaattcataaaac 21559860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23540820 - 23540718
Alignment:
Q  113 aattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 212  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23540820 aattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 23540721  T
Q  213 aac 215  Q
    |||    
T  23540720 aac 23540718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 18448900 - 18449121
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18448900 acattagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaatccttaaaccttaatattatgtaaccct 18448999  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  | ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  18449000 agtttctcttataaattctccgttataacatggattaaatattatcaaactgtggaaatgaaattggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 18449099  T
Q  200 tatcaattcataaaactaaaat 221  Q
    | | |||||||||||| |||||    
T  18449100 tgttaattcataaaacgaaaat 18449121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21573838 - 21573628
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||| ||| | | || | |||||||| | |    
T  21573838 agtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctgaccaagtcaagccttaaaccttagtattgtataaccctagttt 21573739  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| | |    
T  21573738 ctcttctaaattcatcgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgtta 21573639  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21573638 attcataaaac 21573628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23297378 - 23297164
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||| | | || | ||| ||||    
T  23297378 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaagtcaagccttaaaccttagtattgtataaaccta 23297279  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  23297278 gtttctcttataaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggattgataatcgttaatccatcattccaaat 23297179  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  23297178 gttaattcataaaac 23297164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25656299 - 25656209
Alignment:
Q  125 taacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656299 taacatgagttaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 25656209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5949597 - 5949439
Alignment:
Q  59 cctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccatta--tcaaactgtgaa 155  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    ||  | |||  |    
T  5949597 cctaatcaaatcaagccttaaaccctaatattatataaccctagtttctaatctaaattcaccgtttgaacatgaattaaccctagcttctta-tgtaga 5949499  T
Q  156 aacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5949498 agcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 5949439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22601314 - 22601202
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22601314 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaaactttaaaccctaattttatgtaaccct 22601215  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  22601214 actttctaatcta 22601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23616332 - 23616209
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctct-tgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  23616332 acatgagtgagtagacttctctctatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaacc 23616233  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccg 121  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23616232 ctaatttcttatctaaattcaccg 23616209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 5399357 - 5399466
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |    
T  5399357 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaacctatt 5399456  T
Q  103 ctctaatcta 112  Q
     |||||||||    
T  5399457 ttctaatcta 5399466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20218436 - 20218311
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  20218436 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaattttatataaatct 20218337  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  20218336 actttctaatctaatttcaccgtttt 20218311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22112461 - 22112336
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  22112461 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaattttatataaatct 22112362  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  22112361 actttctaatctaatttcaccgtttt 22112336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25923347 - 25923222
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||  ||    
T  25923347 acatgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacatattcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatataaatct 25923248  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  25923247 actttctaatctaatttcaccgtttt 25923222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 29563418 - 29563540
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatct---tatgt 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||    
T  29563418 acatgagtgagtagacttctctttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaaccttaatctaattatgt 29563517  T
Q  94 aaccctaatctctaatctaaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29563518 aaccctaatctctaatctaaatt 29563540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 30245346 - 30245427
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30245346 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcatagtcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaaccctaa 30245427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 22344244 - 22344300
Alignment:
Q  159 gaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22344244 gaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 22344300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14992233 - 14992124
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  14992233 tgagtgagtagacacttcttgtcttgggaatgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaattttatataaacctaat 14992134  T
Q  103 ctctaatcta 112  Q
     |||||||||    
T  14992133 ttctaatcta 14992124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19563803 - 19563730
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaag 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19563803 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaag 19563730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 26138790 - 26139001
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||  | | |    
T  26138790 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatccact 26138889  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||   ||| |||| | |||||| | | || ||||| || ||||||| ||||||    
T  26138890 ttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttgttaattcatcatcacaaata 26138988  T
Q  202 tcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  26138989 tcaattcataaaa 26139001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 29093671 - 29093782
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatc-aaaccaagc--tttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  29093671 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaattacgtaatcctaatcaaaaccaagcctttaaaccctaattttatgtaacccta 29093770  T
Q  101 atctctaatcta 112  Q
    || |||||||||    
T  29093771 atttctaatcta 29093782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 25507718 - 25507928
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttta-accctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  || |||||||| |||| |||  | | |    
T  25507718 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccatacaccctaattttatataaatccact 25507817  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||   ||| |||| | |||||||| | || ||||| || ||||||| ||||||    
T  25507818 ttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggttag-tatttgttaattcatcatcacaaata 25507916  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  25507917 tcaattcataaa 25507928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25339198 - 25339073
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||  ||    
T  25339198 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagtcttgaaccctaattttatataaatct 25339099  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | ||||||| || |||||| ||||    
T  25339098 actttctaatcgaatttcaccatttt 25339073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 32543367 - 32543442
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa 79  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32543367 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattggtggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaa 32543442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17793938 - 17793865
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17793938 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccctatcaaaccaagc 17793865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18396460 - 18396360
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |||    
T  18396460 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggacaagtctaatgatttaatcctaatcaaaccaagccttgatccctaattttatgtaaacct 18396361  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  18396360 a 18396360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 18627552 - 18627706
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcc---taatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaac 96  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||     
T  18627552 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaataatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatataaa 18627651  T
Q  97 cctaatctctaatctaaattcaccgttt-taacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
     ||| | |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||    
T  18627652 tctactttctaatctaatttcaccgtttatataatgaattaacaagtatcaaact 18627706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19563701 - 19563653
Alignment:
Q  167 agggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19563701 agggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 19563653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20105590 - 20105519
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20105590 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 20105519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25031179 - 25031028
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||| |||| |||| |||  ||    
T  25031179 acatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcataatcaaatcaagcctcgaaccttaattttatataaatct 25031080  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    ||| |||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  25031079 aatttctaatctaatttcactgtttttataatgaattaacaaatatcaaact 25031028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 26018087 - 26018297
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||  | | |    
T  26018087 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgatgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatccact 26018186  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||   ||| |||| | |||||| | | || ||||| || ||||||| ||||||    
T  26018187 ttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttgttaattcatcatcacaaata 26018285  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  26018286 tcaattcataaa 26018297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28734100 - 28733949
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||  |||| |||| ||||||||  ||    
T  28734100 acatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaatcaagcctcgaaccttaattttatgtaaatct 28734001  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  28734000 actttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 28733949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19612698 - 19612494
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt-taaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||  ||    
T  19612698 acataagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaacgacctaatcctagtcaagccaagcttcgaaccctaattttatataa-tct 19612600  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||| | |||||||||   ||| ||| ||||||||||| | || ||||| || ||||||| |||    
T  19612599 actttctaatctaatttcaccgtttttataaagaattaacaagtatcaaactcataaagcgacagtggagggttag-tacttgttaattcatcatcacaa 19612501  T
Q  199 atatcaa 205  Q
    |||||||    
T  19612500 atatcaa 19612494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 19993722 - 19993847
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||| |||  ||    
T  19993722 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgaactaatcctaatcaaaccaaacctcgaaccctaattttatataaatct 19993821  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | | |||||||| |||||||||||    
T  19993822 actttttaatctaatttcaccgtttt 19993847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23517304 - 23517231
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23517304 acatgagtgagtagattcttcttgtcttgggattattggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 23517231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 26157460 - 26157670
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||  | | |    
T  26157460 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgatgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatccact 26157559  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||   ||| |||| | |||||| | | || || || || ||||||| ||||||    
T  26157560 ttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttattaattcatcatcacaaata 26157658  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  26157659 tcaattcataaa 26157670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 26821980 - 26822131
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| ||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  26821980 acataagtgagtagactcttcttatcttgggattgttgtatgagtctaatgacctaatcctaatcaaatcaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 26822079  T
Q  100 aatctctaatctaaattcacc-gttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    | | |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  26822080 attttctaatctaatttcaccatttttataatgaattaacaagtatcaaact 26822131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 4741109 - 4741235
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  |    
T  4741109 acattagtgagtagactcttctttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatc 4741208  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    || | |||||||||| ||||| |||||    
T  4741209 tactttctaatctaatttcactgtttt 4741235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13217309 - 13217236
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |  ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13217309 acatgagtgagtagactcttcttgtttcgggattgttggataagtcgaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 13217236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 20221315 - 20221437
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||   |    
T  20221315 acatgagtgaataaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctcgaaccctaatcttatgtaaatgt 20221412  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  20221413 attttctaatct-aattcaccgtttt 20221437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 22115299 - 22115421
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||   |    
T  22115299 acatgagtgaataaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctcgaaccctaatcttatgtaaatgt 22115396  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  22115397 attttctaatct-aattcaccgtttt 22115421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23523908 - 23523783
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||| ||| ||||||  |||||| || ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||  ||    
T  23523908 acatgaatgactagactcttcttgttttgggattgttggatgagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatataaatct 23523809  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||    
T  23523808 actttctaatctaatttcactgtttt 23523783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12660399 - 12660253
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |  ||||| ||| ||| ||||  |||||    
T  12660399 tgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgatctaatccctatcaaaccaagcctcgaacccaaatttta-gtaaatctaat 12660302  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
     |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  12660301 ttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 12660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 13168501 - 13168595
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  13168501 acattagtgagtagacttct-ttatcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 13168595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17522312 - 17522219
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  17522312 acatgagtaagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 17522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24545575 - 24545504
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||  |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24545575 acatgagtgagtagactcttcttgtattgagattgttggataagtctaataacgtaatcctaatcaaaccaa 24545504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31965470 - 31965350
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||| |    
T  31965470 tgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatctctatcaaaccaagtctcgaaccctgatcttatgtaaatctatt 31965372  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
     |||||||| | |||||||||||    
T  31965371 ttctaatct-atttcaccgtttt 31965350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 3923762 - 3923887
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |||| |  ||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||  ||    
T  3923762 acatgagtgagtagactcttcttgtcttagaattgttggatgagtctaatggcctaattcctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatataaatct 3923861  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||    
T  3923862 attttctaatctaaattcaccatttt 3923887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 9414510 - 9414570
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatccta 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  9414510 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccta 9414570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 20464503 - 20464626
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||    
T  20464503 acatgagtgagtagacatct-ttctcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcgttaaaccctaattttatgtaaatct 20464601  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||| | |||||||||||||    
T  20464602 attttctaat-ttaattcaccgtttt 20464626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 29254109 - 29254180
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||  |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29254109 acatgggtgagtagactcttcatgtcttgagattgttggataaatctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 29254180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 29682734 - 29682828
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |  |||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  29682734 acatgagtgagtagacctct-ttgtcatgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcatcgaaccctaatcttatgtaa 29682828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12992871 - 12992841
Alignment:
Q  185 atccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12992871 atccatcatctcaaatatcaattcataaaac 12992841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24392854 - 24392782
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  24392854 acatgagtgagtagacttctttt-tcataggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 24392782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Original strand, 4741288 - 4741324
Alignment:
Q  179 ttgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4741288 ttgttaatccatcatcttaaatatcaattcataaaac 4741324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 18973785 - 18973856
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 73  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  18973785 acatgagtgagtagacttct-ttttcttaggattgttggatgagtttaatgacctaatccctatcaaaccaag 18973856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Original strand, 20435498 - 20435581
Alignment:
Q  129 atgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 213  Q
    |||||||||| | ||||||||| |  || |||| | |||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20435498 atgaattaacaaatatcaaactcttgaagcgaaggaggagggttag-tatttgttaatccatcatcacaaatatcaattcataaa 20435581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17484376 - 17484154
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17484376 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 17484277  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17484276 taatctctattctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttgatccatcatcccaa 17484177  T
Q  199 atatcaattcataaaactaaaat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  17484176 atatcaattcataaaacgaaaat 17484154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14653445 - 14653235
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14653445 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatct 14653346  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14653345 ctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 14653246  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  14653245 attcataaaac 14653235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 3371742 - 3371957
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3371742 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 3371841  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3371842 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 3371941  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  3371942 tatcaattcataaaac 3371957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 16952023 - 16952234
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  16952023 agtgagtagacttctcttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 16952122  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16952123 tcttatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 16952222  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  16952223 aattcataaaac 16952234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39043453 - 39043238
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  39043453 acatgagtgagtagacttctcttgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttacgtaaccct 39043354  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39043353 agtttataatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggattgataattgttaatccatcatctcaaa 39043254  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  39043253 tatcaattcataaaac 39043238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 3392072 - 3392282
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3392072 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatct 3392171  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3392172 ctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 3392271  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  3392272 attcataaaac 3392282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 10631496 - 10631706
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  10631496 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaaccctaattt 10631595  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10631596 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 10631695  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  10631696 attcataaaac 10631706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 3355381 - 3355593
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3355381 agtgagtagacttcttcttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 3355480  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3355481 ctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 3355580  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  3355581 caattcataaaac 3355593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 3419180 - 3419395
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3419180 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 3419279  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3419280 aatttcttatctaaattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatcccaaa 3419379  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  3419380 tatcaattcataaaac 3419395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 9945064 - 9945279
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9945064 acatgagtgagtagacttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaaccct 9945163  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9945164 aatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaattaatcattatcaaaccgtggaaatgaaagtggaggatttgataattgttaatccatcatctcaaa 9945263  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  9945264 tatcaattcataaaac 9945279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 5717516 - 5717726
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  5717516 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 5717615  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717616 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 5717715  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  5717716 attcataaaac 5717726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 13622419 - 13622629
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  13622419 tgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagccttaaccttaatcttatgtaaccctaatt 13622518  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13622519 tctaatctaaattcaacgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgaaggtttgataattgttaaatcatcatctcaaatatc 13622618  T
Q  204 aattcataaaa 214  Q
    |||||||||||    
T  13622619 aattcataaaa 13622629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 18078808 - 18079018
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||      
T  18078808 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatctaaccctaattc 18078907  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078908 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 18079007  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  18079008 attcataaaac 18079018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18080914 - 18080704
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  18080914 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatcttatgtaaccctaattc 18080815  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18080814 gttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 18080715  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  18080714 attcataaaac 18080704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 26811252 - 26811462
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  26811252 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 26811351  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26811352 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 26811451  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  26811452 attcataaaac 26811462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25146367 - 25146584
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25146367 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 25146466  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25146467 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattattaatccatcatctca 25146566  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  25146567 aatatcaattcttaaaac 25146584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 7197347 - 7197562
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7197347 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacttaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccct 7197446  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7197447 aatttctaatctaaattcaccgtttgaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 7197546  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  7197547 tatcaattcataaaac 7197562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 6518500 - 6518710
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| |    
T  6518500 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctcatataaccctaattt 6518599  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6518600 cttatctaaattcacccctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 6518699  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  6518700 attcataaaac 6518710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36654315 - 36654105
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  36654315 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccatgctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 36654216  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36654215 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 36654116  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  36654115 attcataaaac 36654105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16217796 - 16217579
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16217796 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaaccttaatcttatgtaacc 16217697  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  16217696 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgttcgtccatcatctca 16217597  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16217596 aatatcaattcataaaac 16217579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16392796 - 16393012
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  16392796 acatgagtgagtagacttcttttctcttgggattgttggataagttttaatgacataatcctaatcaaatcaagttattaaccctagtcttatgtaaccc 16392895  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16392896 taatctctaatctaatttcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 16392995  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  16392996 atatcaattcataaaac 16393012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 18287113 - 18287325
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  18287113 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccataat 18287212  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18287213 ctctaatttaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatctaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 18287312  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  18287313 caattcataaaac 18287325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16683484 - 16683699
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16683484 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 16683583  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  16683584 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 16683683  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  16683684 tatcaattcataaaac 16683699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14690794 - 14690584
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  14690794 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttttgtaaccctgatct 14690695  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  14690694 ctaatctaaattcaccgctttaacatggactaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataactgttcgtccatcatcttaaatatca 14690595  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  14690594 attcataaaac 14690584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18242319 - 18242536
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18242319 acatgagtgagtagacttctctttgccttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 18242418  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  18242419 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttttataattgttcgtccatcatctaa 18242518  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18242519 aatatcaattcataaaac 18242536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18984135 - 18984352
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18984135 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18984234  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18984235 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 18984334  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18984335 aatatcaattcataaaac 18984352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7897482 - 7897270
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7897482 agtgagtagacttcttcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 7897383  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7897382 ttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 7897283  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  7897282 caattcataaaac 7897270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 12845034 - 12845246
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12845034 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 12845133  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12845134 ttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 12845233  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  12845234 caattcataaaac 12845246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15124205 - 15123988
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15124205 acatgagtgagtagacttttccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15124106  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15124105 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgtaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 15124006  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15124005 aatatcaattcataaaac 15123988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 56580019 - 56579802
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  56580019 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 56579920  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56579919 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 56579820  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  56579819 aatatcaattcataaaac 56579802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11888942 - 11888733
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  11888942 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagcctttaaccctgttcttatgtaatcctaattt 11888843  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11888842 ctaatctaa-ttcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgacaatggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 11888744  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  11888743 attcataaaac 11888733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7648 - 7431
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  7648 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaatccaagctctaagccttaatcttatgcaacc 7549  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7548 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 7449  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7448 aatatcaattcataaaac 7431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10559024 - 10559241
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10559024 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctataagccttaatcttatgtaacc 10559123  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10559124 ctaatttcttatctaaattcactgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 10559223  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10559224 aatgtcaattcataaaac 10559241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10732878 - 10733095
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10732878 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 10732977  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10732978 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcattcca 10733077  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10733078 aatatcaattcataaaac 10733095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10946647 - 10946864
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10946647 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 10946746  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10946747 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcattcca 10946846  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10946847 aatatcaattcataaaac 10946864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15248440 - 15248657
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15248440 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15248539  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15248540 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 15248639  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15248640 aatatcaattcataaaac 15248657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 55798459 - 55798675
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  55798459 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 55798558  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  55798559 taatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 55798658  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  55798659 atatcaattcataaaac 55798675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 15305360 - 15305575
Alignment:
Q  3 atgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15305360 atgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccct 15305459  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15305460 aatttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 15305559  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  15305560 tatcaattcataaaac 15305575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8091864 - 8091651
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8091864 acatgagtgagtatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagcttaaacc-taatcttatataacccta 8091766  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||| |    |||||||||||    
T  8091765 gtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagaggatggtttgataattgttaagttttcatctcaaat 8091666  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  8091665 atcaattcataaaac 8091651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10637735 - 10637952
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10637735 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 10637834  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  10637835 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccgttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattactcca 10637934  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10637935 aatatcaattcataaaac 10637952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10651126 - 10651343
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10651126 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 10651225  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  10651226 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccgttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattactcca 10651325  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10651326 aatatcaattcataaaac 10651343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18563564 - 18563781
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18563564 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18563663  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18563664 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 18563763  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18563764 aatatcaattcataaaac 18563781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21420697 - 21420914
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21420697 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 21420796  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  21420797 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 21420896  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    | ||||||||||||||||    
T  21420897 attatcaattcataaaac 21420914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 15255068 - 15255284
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15255068 catgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 15255167  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  15255168 taatttcttatctgaattcaccatcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 15255267  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  15255268 atatcaattcataaaac 15255284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42709194 - 42708978
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  42709194 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaggcaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 42709095  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  42709094 taatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 42708995  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  42708994 atatcaattcataaaac 42708978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 41400627 - 41400822
Alignment:
Q  22 ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 119  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41400627 ttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagctaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcac 41400726  T
Q  120 cgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41400727 cgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaaatggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 41400822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3045
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  3262 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 3163  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  3162 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 3063  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3062 aatatcaattcataaaac 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10684764 - 10684981
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10684764 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 10684863  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  10684864 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 10684963  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10684964 aatatcaattcataaaac 10684981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10898404 - 10898621
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10898404 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 10898503  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  10898504 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 10898603  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10898604 aatatcaattcataaaac 10898621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11496068 - 11495851
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  11496068 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 11495969  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  11495968 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 11495869  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11495868 aatatcaattcataaaac 11495851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13823674 - 13823891
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13823674 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 13823773  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  13823774 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 13823873  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13823874 aatatcaattcataaaac 13823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15266207 - 15265990
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15266207 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaattacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15266108  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15266107 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattattcca 15266008  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15266007 aatatcaattcataaaac 15265990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40845068 - 40844851
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  40845068 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 40844969  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  40844968 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 40844869  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40844868 aatatcaattcataaaac 40844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15259585 - 15259368
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15259585 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaattacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15259486  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15259485 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgcggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 15259386  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  15259385 aatataaattcataaaac 15259368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15302128 - 15302345
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  15302128 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatataacc 15302227  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15302228 ctaatttcttatctgaattcaccgttctaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccattattcca 15302327  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15302328 aatatcaattcataaaac 15302345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22105062 - 22105279
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22105062 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22105161  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22105162 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22105261  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22105262 aatatcaattcataaaac 22105279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26293354 - 26293571
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  26293354 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 26293453  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  26293454 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 26293553  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26293554 aatatcaattcataaaac 26293571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11504950 - 11504733
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11504950 acatgagtgagtagacatctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 11504851  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11504850 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatcgatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 11504751  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11504750 aatatcaattcataaaac 11504733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24125190 - 24124980
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  24125190 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaagccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctagttt 24125091  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |    
T  24125090 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgaagaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatta 24124991  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  24124990 attcataaaac 24124980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16227165 - 16227380
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  16227165 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgagataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaattttatgtaaccct 16227264  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  16227265 agtttctcttctaaattcactgttttaacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaa 16227364  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16227365 tattaattcataaaac 16227380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40560506 - 40560345
Alignment:
Q  56 aatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40560506 aatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatataaccctaatttttaatctaaattcaccgctttaacatgaagtaaccattatcaaactgtg 40560407  T
Q  154 aaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40560406 gaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 40560345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 48641810 - 48642014
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  48641810 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatatttaaaccttaatcttatgtaaccc 48641909  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |            | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48641910 taatttctaatctaaattcaccgttttaacataaattaaccattatcaaatt------------ggggagggtttgataattgtaaatccatcatctcaa 48641997  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  48641998 atatcaattcataaaac 48642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 21275383 - 21275593
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||| || | |    
T  21275383 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgtttgttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaattttatgtaaccttagttt 21275482  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| | |    
T  21275483 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgtta 21275582  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21275583 attcataaaac 21275593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15866260 - 15866481
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||| || | |||| ||||||||||||    
T  15866260 acatgagtgagtagacttattatgtcttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagttaagccttaaagcttaatattatgtaaccct 15866359  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||    
T  15866360 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaattggagggtttgataatcgtttatccattattccaaa 15866459  T
Q  200 tatcaattcataaaactaaaat 221  Q
    | | |||||||||||| |||||    
T  15866460 tgttaattcataaaacgaaaat 15866481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 11048537 - 11048648
Alignment:
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11048537 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 11048636  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    |||| |||||||    
T  11048637 aattgataaaac 11048648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 7870974 - 7871135
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  7870974 acatgagtgagtagacttcttcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 7871073  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacg 159  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7871074 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacg 7871135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43701534 - 43701324
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |||| |||  |||     
T  43701534 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgagccctaattttatataaatctac 43701435  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||    
T  43701434 tttctaatctaaattcaccgttttaacatgtattaacaattaccaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatttatcatctcaaata 43701336  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    | ||||||||||    
T  43701335 ttaattcataaa 43701324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17996259 - 17996474
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa--ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||  || |||| ||||||||||     
T  17996259 acataagtgagtagacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaatattatgtaacct 17996358  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  |||    
T  17996359 tagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatatcatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaa 17996458  T
Q  199 atatcaattcataaaa 214  Q
    || | |||||||||||    
T  17996459 atgttaattcataaaa 17996474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20059127 - 20058917
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||| ||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||  |||     
T  20059127 tgagtgggtagactcttctagtcttgggattgttgggtaaatctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgaacccaaattttatataaatctac 20059028  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  20059027 tttctaatctaaattcatcgttttcacatgaattaacaattaccaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaata 20058929  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  20058928 tcaattcataaa 20058917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 31594015 - 31594225
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    |||||||||||| |  |||||||||  |||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||  | |     
T  31594015 tgagtgagtagattcttcttgtcttgagattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaatcaagccttgaaccccaattttatataaatc-at 31594113  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  31594114 tttctaatataaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccaaactgtaaaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaata 31594212  T
Q  202 tcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  31594213 tcaattcataaaa 31594225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 9857333 - 9857445
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9857333 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaattttacgtaaccct 9857432  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    ||| |||||||||    
T  9857433 aatttctaatcta 9857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 10731269 - 10731376
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10731269 agtgagtagacccttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 10731368  T
Q  105 ctaatcta 112  Q
    ||||||||    
T  10731369 ctaatcta 10731376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 10945038 - 10945145
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10945038 agtgagtagacccttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 10945137  T
Q  105 ctaatcta 112  Q
    ||||||||    
T  10945138 ctaatcta 10945145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11902582 - 11902475
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11902582 agtgagtagactcttcttgccttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 11902483  T
Q  105 ctaatcta 112  Q
    ||||||||    
T  11902482 ctaatcta 11902475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16953872 - 16953772
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  16953872 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggatagttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaaccctaattttatgtaatcct 16953773  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  16953772 a 16953772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Original strand, 15410068 - 15410172
Alignment:
Q  111 taaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 210  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  || |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15410068 taaattcagcgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaatgaaagtgaagggtttgataatctttaatccattatcccaaatattaattcat 15410167  T
Q  211 aaaac 215  Q
    |||||    
T  15410168 aaaac 15410172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39699 - 39487
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaac-caagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||  || | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  39699 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataggtctaatgacgtaatcctaatcaaacgaaaccataaaccctaattttatataaatct 39600  T
Q  100 aatctctaatctaaattcacc-gttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    | | |||||||||| |||||| || |||  |||||||||| ||||  || ||  | || | || | |||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  39599 actttctaatctaatttcaccagtcttataatgaattaacaattacgaagctaag-aagcaaacgcggagggttag-taattgttaattcatcatctcaa 39502  T
Q  199 atatcaattcataaa 213  Q
    |||||||||||||||    
T  39501 atatcaattcataaa 39487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3772134 - 3771941
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 119  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||| || |||| |||  ||| | |||||||||| |||||    
T  3772134 tcttgtcttggaattgttggataagtcttatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccttattttatataaatctattttctaatctaatttcac 3772035  T
Q  120 cg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 213  Q
    || |||||  |||||||||| | |||||||||   ||| |||| | |||||||| | || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3772034 cgtttttataatgaattaacaaatatcaaactcataaagcgaacgcggagggttag-tatttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaa 3771941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12808145 - 12808020
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||| | |||| |||  ||    
T  12808145 acatgagtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagttttatataaatct 12808046  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  12808045 actttctaatctaatttcaccgtttt 12808020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 12347498 - 12347592
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  12347498 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 12347592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23793570 - 23793449
Alignment:
Q  3 atgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||  |||     
T  23793570 atgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaatccaagcctcgaaccctaatcttatgtaaatctat 23793472  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  23793471 tttctaatct-aattcaccgtttt 23793449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13883430 - 13883336
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  13883430 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 13883336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 5675593 - 5675716
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  5675593 acatgtgtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 5675692  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||    
T  5675693 attttctaatct--attcaccgtttt 5675716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40563802 - 40563741
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcct 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  40563802 acatcagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcct 40563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21102187 - 21102124
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaa 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21102187 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 21102124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11922368 - 11922293
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatcta 112  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||    
T  11922368 ggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctattttctaatcta 11922293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 38652286 - 38652432
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||  |||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  | |||||| |||||||| | || |     
T  38652286 tgagtgattagactcttcttgtcttgtgattgttggatgagtctgatgacctaatcataatcaaactaagcctcgaacctaattttatgtaaac-tattt 38652384  T
Q  104 tctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  38652385 tctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 38652432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 100)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 20282176 - 20282386
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20282176 agtgagtagacttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaatct 20282275  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20282276 ctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 20282375  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20282376 attcataaaac 20282386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21468412 - 21468197
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21468412 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 21468313  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21468312 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 21468213  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  21468212 tatcaattcataaaac 21468197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25370302 - 25370084
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370302 acatgagtgaatatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 25370203  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaa----ttaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25370202 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaattaaccattatcagactctggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctc 25370103  T
Q  197 aaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25370102 aaatatcaattcataaaac 25370084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5499742 - 5499531
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  5499742 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccttaatc 5499643  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5499642 tctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcatctcaaatatc 5499543  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  5499542 aattcataaaac 5499531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28496658 - 28496443
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  28496658 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatataaccct 28496559  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28496558 aatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 28496459  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  28496458 tatcaattcataaaac 28496443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 25358266 - 25358476
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  25358266 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 25358365  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25358366 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 25358465  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  25358466 attcataaaac 25358476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27745190 - 27745404
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27745190 acatgagtgagtaaacttctcttgtttttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaacccta 27745289  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27745290 ttttctaatctaaattcaccgttttaacaagaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaat 27745389  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  27745390 atcaattcataaaac 27745404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42767328 - 42767116
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42767328 agtgagtagacttcttcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccctaat 42767229  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42767228 ctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatat 42767129  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  42767128 caattcataaaac 42767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23798379 - 23798164
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23798379 acatgagtgagtagacttcttttgtctggagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccct 23798280  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23798279 agtttctaatctaaattcacagttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 23798180  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  23798179 tatcaattcataaaac 23798164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 24507436 - 24507643
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctcta 107  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24507436 tgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctagtttcta 24507535  T
Q  108 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24507536 atccaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagagtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatt 24507635  T
Q  208 cataaaac 215  Q
    ||||||||    
T  24507636 cataaaac 24507643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25803761 - 25803546
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  25803761 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagcttttaaccccaatcttatgtaatcct 25803662  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25803661 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 25803562  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  25803561 tatcaattcataaaac 25803546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11106 - 10896
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  11106 agtgagtagacttctcttgtcttgcgattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 11007  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 10907  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  10906 attcataaaac 10896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23014454 - 23014238
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23014454 acatgtgtgagtagacttctcttgtcttgggattgttcgataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccc 23014355  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23014354 taatctctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 23014255  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||  ||||||||||||    
T  23014254 atagtaattcataaaac 23014238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23018568 - 23018352
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23018568 acatgtgtgagtagacttctcttgtcttgggattgttcgataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccc 23018469  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23018468 taatctctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 23018369  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||  ||||||||||||    
T  23018368 atagtaattcataaaac 23018352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 36684421 - 36684637
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36684421 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaacccta 36684520  T
Q  101 atctctaatctaaattc-accgttttaacatg-aattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36684521 gtttctaatctaaattcaaccgttttaacatgaaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaa 36684620  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||| |||||||    
T  36684621 atatcaatttataaaac 36684637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40916775 - 40916559
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40916775 acatgagtgagtagactttttttgtctcgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc 40916676  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40916675 taatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 40916576  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  40916575 atatcaattcataaaac 40916559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18994420 - 18994210
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  18994420 gtgagtagagttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaacactaatct 18994321  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18994320 ctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaactattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 18994221  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  18994220 attcataaaac 18994210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20172775 - 20172566
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20172775 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20172676  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20172675 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat-tca 20172577  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20172576 attcataaaac 20172566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 35080724 - 35080934
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  35080724 agtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattt 35080823  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  35080824 cttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatca 35080923  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  35080924 attcataaaac 35080934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39870545 - 39870328
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  39870545 acatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagcctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttctaagccttaatcttatgtaacc 39870446  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39870445 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatgaataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataattgtttatccatcatctca 39870346  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39870345 aatatcaattcataaaac 39870328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29563316 - 29563532
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29563316 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacacaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccc 29563415  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    || | | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29563416 tagtttttaatctaaatttaccattgtaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 29563515  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  29563516 atatcaattcataaaac 29563532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20708227 - 20708013
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20708227 acatgagtgagtagacacttcttgtcttgggattattggataagtctaatggcaaaatccaaatcaaaccaagctttaaaccctaatcttatgtaatcct 20708128  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20708127 agtttctaatctaaattcacttttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaa 20708028  T
Q  200 tatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  20708027 tatcaattcataaaa 20708013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18446716 - 18446499
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18446716 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 18446617  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18446616 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 18446517  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18446516 aatatcaattcataaaac 18446499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21201018 - 21201235
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  21201018 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttagtcttatgtaacc 21201117  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21201118 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 21201217  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21201218 aatatcaattcataaaac 21201235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23644709 - 23644926
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23644709 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 23644808  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23644809 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 23644908  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23644909 aatatcaattcataaaac 23644926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 111610 - 111827
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  111610 acatgagtgagtagacttctccttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttacgtaacc 111709  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  111710 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 111809  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  111810 aatatcaattcataaaac 111827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27615539 - 27615756
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27615539 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 27615638  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27615639 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 27615738  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27615739 aatatcaattcataaaac 27615756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27632235 - 27632452
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27632235 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 27632334  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27632335 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 27632434  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27632435 aatatcaattcataaaac 27632452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 118282 - 118499
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  118282 acatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttacgtaacc 118381  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  118382 ctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcaa 118481  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  118482 aatatcaattcataaaac 118499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 19929508 - 19929730
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  19929508 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaata 19929607  T
Q  104 t------------ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatc 191  Q
    |            |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19929608 tgtaaccttaatcctaatctaaattcaccattttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatc 19929707  T
Q  192 atctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19929708 atctcaaatatcaattcataaaa 19929730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23158860 - 23158643
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23158860 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccacgctctaagccttaatcttatgtaacc 23158761  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23158760 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 23158661  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23158660 aatatcaattcataaaac 23158643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23163430 - 23163213
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23163430 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 23163331  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23163330 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 23163231  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23163230 aatatcaattcataaaac 23163213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23570117 - 23569900
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23570117 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccacgctctaagccttaatcttatgtaacc 23570018  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23570017 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 23569918  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23569917 aatatcaattcataaaac 23569900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23574687 - 23574470
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23574687 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 23574588  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  23574587 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 23574488  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23574487 aatatcaattcataaaac 23574470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27768292 - 27768075
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27768292 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaccaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 27768193  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27768192 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 27768093  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27768092 aatatcaattcataaaac 27768075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32441309 - 32441115
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 119  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  32441309 tcttgtcttaggattgtcggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaacc-taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcat 32441211  T
Q  120 cgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32441210 tgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcttcatctcaaatatcaattcataaaac 32441115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23340696 - 23340905
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  23340696 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 23340795  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  23340796 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaattgtataatcgaaagtggagggttag-taattattaattcatcatctcaaatatca 23340894  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23340895 attcataaaac 23340905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32140095 - 32140309
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||    
T  32140095 acatgagtgaatagacttcttttgtcatgggattgttggagaagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttcaatccgaatcttatgtaaccct 32140194  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32140195 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactatagaagcgaaaatggagggtttgataattgttaatccatcatctaaaa 32140294  T
Q  200 tatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  32140295 tatcaattcataaaa 32140309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17583339 - 17583556
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  17583339 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 17583438  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  17583439 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 17583538  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17583539 aatatcaattcataaaac 17583556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17591145 - 17591362
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  17591145 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 17591244  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  17591245 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 17591344  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17591345 aatatcaattcataaaac 17591362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19278755 - 19278538
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  19278755 acatgagtgagtagatttctccttctcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaattttatgtaacc 19278656  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278655 ctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 19278556  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19278555 aatatcaattcataaaac 19278538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22044115 - 22043898
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22044115 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22044016  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22044015 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22043916  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22043915 aatatcaattcataaaac 22043898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22288318 - 22288535
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22288318 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22288417  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22288418 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22288517  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22288518 aatatcaattcataaaac 22288535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22665822 - 22666039
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  22665822 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 22665921  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  22665922 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 22666021  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22666022 aatatcaattcataaaac 22666039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16769749 - 16769966
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16769749 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 16769848  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  16769849 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 16769948  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16769949 aatatcaattcataaaac 16769966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16776411 - 16776628
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16776411 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 16776510  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  16776511 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 16776610  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16776611 aatatcaattcataaaac 16776628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24794742 - 24794525
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24794742 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24794643  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24794642 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24794543  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24794542 aatatcaattcataaaac 24794525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24801451 - 24801234
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24801451 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24801352  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24801351 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24801252  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24801251 aatatcaattcataaaac 24801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24877627 - 24877844
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24877627 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24877726  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24877727 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24877826  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24877827 aatatcaattcataaaac 24877844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27628331 - 27628548
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  27628331 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 27628430  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  27628431 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 27628530  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27628531 aatatcaattcataaaac 27628548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27621686 - 27621903
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||    
T  27621686 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagctttaatcttatgtaacc 27621785  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  27621786 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 27621885  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27621886 aatatcaattcataaaac 27621903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33181802 - 33182017
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  33181802 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagacaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 33181901  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  33181902 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcgttaatccattataacaaa 33182001  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33182002 tattaattcataaaac 33182017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25144220 - 25144006
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  25144220 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 25144121  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  25144120 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 25144021  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  25144020 gttaattcataaaac 25144006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23139958 - 23139764
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||| ||    
T  23139958 agtgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaa---------------accctaatttc 23139874  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23139873 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcttaaatatcaa 23139774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23551748 - 23551554
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||| ||    
T  23551748 agtgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaa---------------accctaatttc 23551664  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23551663 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcttaaatatcaa 23551564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 25198600 - 25198732
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198600 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 25198699  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25198700 ttatccattatctcaaatatcaattcataaaac 25198732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 45706421 - 45706553
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45706421 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggaccaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 45706520  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45706521 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 45706553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 11391253 - 11391444
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattca 118  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  11391253 tcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccctaattttatgtaaccct----tctaatctaaattca 11391348  T
Q  119 ccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11391349 ccgttttaacatgaattaataattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 11391444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 11407914 - 11408105
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattca 118  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  11407914 tcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccctaattttatgtaaccct----tctaatctaaattca 11408009  T
Q  119 ccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11408010 ccgttttaacatgaattaataattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaac 11408105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11318156 - 11317941
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11318156 acatgagtgagtagatttcttatgtcttgggattgttggataggtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 11318057  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  11318056 attttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 11317957  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  11317956 tgttaattcataaaac 11317941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 23633909 - 23634075
Alignment:
Q  50 tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaa 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||   ||| | ||| || |||||||||||||    
T  23633909 tgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctaaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacttcttttatatggatcaaccattatcaaa 23634008  T
Q  149 ctgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23634009 ctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcataaaac 23634075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 23634131 - 23634262
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23634131 taatcttatgtaacactaatctctaatctaaattcactgctttaacatgaattaactattatcaaaccgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgt 23634230  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23634231 taatccatcatctcaaataccaattcataaaa 23634262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24172119 - 24172334
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  24172119 acatgagtgagtagacttcttatgtgttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 24172218  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  ||||    
T  24172219 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatgttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaattcattattccaaa 24172318  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  24172319 tgttaattcataaaac 24172334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24824940 - 24824753
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  24824940 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaaccctagt 24824841  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccat 190  Q
     |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24824840 ttctcttctaaattcactgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccat 24824753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16134157 - 16133947
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| ||| | |    
T  16134157 agtgagtatacttcttttgtcttgtgattgttgggtaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaactttatgtaactctagttt 16134058  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |    
T  16134057 ctcttctaaattcaccattttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatta 16133958  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  16133957 attcataaaac 16133947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Original strand, 25481506 - 25481703
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| | |    
T  25481506 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaatccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 25481605  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||    
T  25481606 ttcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatctttaatccattatcccaaatat 25481703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Original strand, 25489112 - 25489309
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| | |    
T  25489112 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaatccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 25489211  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||    
T  25489212 ttcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatctttaatccattatcccaaatat 25489309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24820555 - 24820343
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  24820555 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctcaatattatgtaaccctagt 24820456  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  24820455 ttctcttctaaattcaccgttttcacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaaatggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgt 24820356  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  24820355 taattcataaaac 24820343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25038777 - 25038686
Alignment:
Q  124 ttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25038777 ttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 25038686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17637445 - 17637315
Alignment:
Q  85 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17637445 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcgtaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttt 17637346  T
Q  185 atccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17637345 atccattattccaaatatcaattcataaaac 17637315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 539324 - 539534
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||  |||     
T  539324 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtttaaatgacataaccctaatcaaaccaagtcttgaaccctaattttatataaatctac 539423  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||| |    
T  539424 tttctaatctaaattcactgttttcacatgaattaacaattaccaaactgtagaagcgaaagtggagggctag-taattgttaattcatcatctcaaaca 539522  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  539523 tcaattcataaa 539534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20635786 - 20636001
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa--ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||  || |||| ||||||||||     
T  20635786 acataagtgagtagacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaatattatgtaacct 20635885  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  |||    
T  20635886 tagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatatcatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaa 20635985  T
Q  199 atatcaattcataaaa 214  Q
    || | |||||||||||    
T  20635986 atgttaattcataaaa 20636001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29577309 - 29577197
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  29577309 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaatccctaattttatgtaacctt 29577210  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
     || |||||||||    
T  29577209 gatttctaatcta 29577197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23698771 - 23698553
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||  ||    
T  23698771 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaactataaaccctaattttatataaatct 23698672  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    | | |||||||||| ||||  | |||||  |||||||||| | || ||||||   ||| ||||   |||||||| | || ||||| || |||||||||||    
T  23698671 attttctaatctaatttcattgtttttataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacacggagggttag-tatttgttaattcatcatctcaa 23698573  T
Q  199 atatcaattcataaaactaa 218  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  23698572 atatcaattcataaagctaa 23698553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 23704409 - 23704513
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23704409 agtgagtagcctcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatactaatcaaaccaagctctaaaccctaattttatgtaaccctaattt 23704508  T
Q  105 ctaat 109  Q
    |||||    
T  23704509 ctaat 23704513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25043075 - 25043007
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25043075 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 25043007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23614000 - 23613897
Alignment:
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23614000 taatctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaa 23613902  T
Q  206 ttcat 210  Q
    |||||    
T  23613901 ttcat 23613897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24610031 - 24609919
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  24610031 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacctaatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatgtaaatct 24609932  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  24609931 attttctaatcta 24609919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21344437 - 21344321
Alignment:
Q  9 gagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctcta 107  Q
    |||||||||  || ||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21344437 gagtagactcttcctgtcttgagattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttaggtaaccctaatttcta 21344338  T
Q  108 atctaaattcaccgtttt 125  Q
    |||| | |||||||||||    
T  21344337 atct-atttcaccgtttt 21344321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21373 - 21261
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||  |||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  21373 acatgagtgaatagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaataacgtaatgctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaacctt 21274  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    ||| |||||||||    
T  21273 aatttctaatcta 21261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24177640 - 24177562
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa 79  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24177640 acataagtgagtagactcttcttgtcttgggattgatggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaggtttaa 24177562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23084682 - 23084635
Alignment:
Q  167 agggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23084682 agggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 23084635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25858532 - 25858338
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaa-ccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattca 118  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || | | ||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| ||||    
T  25858532 tcttgtcttgggattgttcgataagtctaatgacgtaatcctaatcaaatcaaaccataaaccctaatattatataaatctactttctaatctaatttca 25858433  T
Q  119 ccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 213  Q
    ||| |||||  || ||||||| | || ||||||   ||| |||| |||||||||| | || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25858432 ccgtttttataataaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgtggagggttag-tatttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaa 25858338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 30949219 - 30949148
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30949219 acatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 30949148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19124286 - 19124141
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||   || | |    
T  19124286 agtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagtctcgaaccctaattttatgtaaatttatttt 19124188  T
Q  105 ctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    ||||||||| | ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  19124187 ctaatctaattccaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 19124141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Original strand, 15584001 - 15584081
Alignment:
Q  40 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| |||||    
T  15584001 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttcac 15584081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 22328620 - 22328688
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22328620 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgttatcctaatcaaaccaa 22328688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24366248 - 24366054
Alignment:
Q  20 tcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattca 118  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | |||| |||| |||| |||  ||| | |||||| ||| ||||    
T  24366248 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccttaattttatataaatctactttctaatataatttca 24366149  T
Q  119 ccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 213  Q
    ||| |||||  |||||||||| | || ||||||   ||| | || | |||||||| | || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24366148 ccgtttttataatgaattaacaaataacaaactcataaagcaaacgcggagggttag-tatttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaa 24366054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24371401 - 24371307
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  24371401 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacgtaatccctatcaaaccaagcctagaaccttaatcttatgtaa 24371307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41653575 - 41653450
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  41653575 acatgagtgagtagattcttcttatcttgggattgttggataagtctaatgatgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatct 41653476  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | | |||||||| |||||||||||    
T  41653475 actttgtaatctaatttcaccgtttt 41653450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 20852253 - 20852347
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  20852253 acatgagtgagtagaattct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 20852347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19012971 - 19012850
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||| |    
T  19012971 tgagtgagtagacttct-ttgtctcgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctatt 19012873  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
     |||||||||| |||| ||||||    
T  19012872 ttctaatctaatttcatcgtttt 19012850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23256976 - 23256868
Alignment:
Q  3 atgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||  |||     
T  23256976 atgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaacccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctat 23256879  T
Q  102 tctctaatcta 112  Q
    | |||||||||    
T  23256878 tttctaatcta 23256868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 23614054 - 23613996
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatc 59  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  23614054 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatcacataatc 23613996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22578286 - 22578215
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22578286 acatgagtgagtagaattct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagc 22578215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 13004613 - 13004707
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  13004613 acatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 13004707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31590475 - 31590354
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||   ||    
T  31590475 acatgagtgagcagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtagatct 31590378  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtt 123  Q
    | | ||||||||||  ||||||||    
T  31590377 attttctaatctaatctcaccgtt 31590354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23648802 - 23648851
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttc-tcttgtcttcggattttgggataagtctaa 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23648802 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaa 23648851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 24321923 - 24321995
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  24321923 acatgagtgtgtagacttctttt-tcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccatatcaaaccaagc 24321995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36130061 - 36129989
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  36130061 acatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagc 36129989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3174 - 2964
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  3174 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtatccctaatct 3075  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3074 ctaatctaaattcaccgttttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 2975  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  2974 attcataaaac 2964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23383 - 23593
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23383 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtataatgaaataatcctaatcaaaccaagctattagccctaatcttatgtaaccctaatct 23482  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23483 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcgcaaatatca 23582  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23583 attcataaaac 23593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 77960 - 78170
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  77960 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 78059  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  78060 ctaatctgaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatca 78159  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  78160 attcataaaac 78170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 18371 - 18548
Alignment:
Q  39 gataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaa 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18371 gataagtataatgaaataatcctaatcaaaccaagatattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaactaa 18470  T
Q  138 ccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18471 ccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcgcaaatattaattcataaaac 18548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 100569 - 100750
Alignment:
Q  39 gataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcacc--gttttaacatgaa 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||  |||||||||||   ||||||||||| |    
T  100569 gataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaactctagtttctcttctaaattcacatagttttaacatgga 100668  T
Q  134 ttaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  100669 ttaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttgatccattatcccaaatattaattcataaaac 100750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32258 - 32043
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32258 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 32159  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32158 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 32059  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  32058 tatcaattcataaaac 32043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 37111 - 37321
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  37111 agtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 37210  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37211 cttatctaaattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtagaaggtttgataataatttatccatcatctcaaatatca 37310  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  37311 attcataaaac 37321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8812 - 8602
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8812 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 8713  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8712 ctaatctaaattcaccaatttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattggtaatccatcatctcaaatatca 8613  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  8612 attcataaaac 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35009 - 34794
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35009 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 34910  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34909 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 34810  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  34809 tatcaattcataaaac 34794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 117896 - 118111
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  117896 acattagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatataaccct 117995  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  117996 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggcttgataattgttcgtccatcatctcaaa 118095  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  118096 tatcaattcataaaac 118111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 34102 - 34313
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  34102 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 34201  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34202 tctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 34301  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    || |||||||||    
T  34302 aaatcataaaac 34313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 111)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21734581 - 21734366
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21734581 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 21734482  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21734481 aatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 21734382  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  21734381 tatcaattcataaaac 21734366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23435449 - 23435664
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  23435449 acatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacgctaatcttatgtaaccct 23435548  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23435549 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 23435648  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  23435649 tatcaattcataaaac 23435664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23446816 - 23447031
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  23446816 acatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacgctaatcttatgtaaccct 23446915  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23446916 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 23447015  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  23447016 tatcaattcataaaac 23447031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41765751 - 41765536
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41765751 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 41765652  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765651 aattccttatctagattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 41765552  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  41765551 tatcaattcataaaac 41765536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7761074 - 7760864
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  7761074 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 7760975  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7760974 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 7760875  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  7760874 attcataaaac 7760864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15732070 - 15732280
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15732070 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15732169  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15732170 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15732269  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15732270 attcataaaac 15732280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 15736289 - 15736499
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  15736289 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 15736388  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15736389 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 15736488  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  15736489 attcataaaac 15736499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 18067360 - 18067570
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  18067360 agtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 18067459  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18067460 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 18067559  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  18067560 attcataaaac 18067570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 18073655 - 18073865
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  18073655 agtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 18073754  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073755 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 18073854  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  18073855 attcataaaac 18073865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20595289 - 20595079
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20595289 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20595190  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595189 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20595090  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20595089 attcataaaac 20595079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20790182 - 20789972
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20790182 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20790083  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790082 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20789983  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20789982 attcataaaac 20789972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20795963 - 20795753
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20795963 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20795864  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20795863 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20795764  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20795763 attcataaaac 20795753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21812219 - 21812009
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  21812219 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 21812120  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812119 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 21812020  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21812019 attcataaaac 21812009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23618435 - 23618225
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23618435 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23618336  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23618335 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23618236  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23618235 attcataaaac 23618225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 23684979 - 23685189
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23684979 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23685078  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23685079 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23685178  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23685179 attcataaaac 23685189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23849832 - 23849622
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23849832 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23849733  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23849732 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23849633  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23849632 attcataaaac 23849622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 34780438 - 34780648
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  34780438 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 34780537  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34780538 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 34780637  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  34780638 attcataaaac 34780648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14482506 - 14482721
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14482506 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccct 14482605  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14482606 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 14482705  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  14482706 tatcaattcataaaac 14482721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42789799 - 42789584
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccta-atcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  42789799 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttgatcttatgtaaccct 42789700  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42789699 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 42789600  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||| ||||||    
T  42789599 tatcaattcgtaaaac 42789584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20601575 - 20601365
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20601575 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20601476  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20601475 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20601376  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20601375 attcataaaac 20601365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20607866 - 20607656
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20607866 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20607767  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20607766 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20607667  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20607666 attcataaaac 20607656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20614203 - 20613993
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  20614203 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 20614104  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20614103 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 20614004  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20614003 attcataaaac 20613993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23973169 - 23972959
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  23973169 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 23973070  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23973069 cttatctatattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 23972970  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  23972969 attcataaaac 23972959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18483666 - 18483449
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  18483666 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaacc 18483567  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  18483566 ctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatagttgttaattcatcatctca 18483467  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18483466 aatatcaattcataaaac 18483449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 24935600 - 24935810
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  24935600 agtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 24935699  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24935700 cttatctaaattcaccgctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 24935799  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  24935800 attcataaaac 24935810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 24941292 - 24941502
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||      
T  24941292 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaatcttaatcttatgtaaccctaattc 24941391  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24941392 cttatctaaattcaccgctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 24941491  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  24941492 attcataaaac 24941502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20245681 - 20245897
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20245681 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccc 20245780  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20245781 taattcgtaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggttggataattgttaatccatcatctcaa 20245880  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  20245881 atatcaattcataaaac 20245897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26848395 - 26848610
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  26848395 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaatcct 26848494  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848495 aattccttatcttaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 26848594  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  26848595 tatcaattcataaaac 26848610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 30729966 - 30730181
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30729966 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagcctaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 30730065  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30730066 aattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatcttaaa 30730165  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  30730166 tatcaattcataaaac 30730181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28834867 - 28834657
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  28834867 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 28834768  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28834767 cttatctaaattcatcgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 28834668  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  28834667 attcataaaac 28834657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 6406389 - 6406606
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |    
T  6406389 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaaatcttaatcttatgtaatc 6406488  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6406489 ctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctca 6406588  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6406589 aatatcaattcataaaac 6406606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20832431 - 20832219
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  20832431 agtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattt 20832332  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttg--ataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832331 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgatataattgtttatccatcatctcaaatat 20832232  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  20832231 caattcataaaac 20832219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 23771055 - 23771263
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23771055 tgagaagacttttcttgtctggggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttct 23771154  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23771155 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 23771254  T
Q  207 tcataaaac 215  Q
    |||||||||    
T  23771255 tcataaaac 23771263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 24220499 - 24220711
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  24220499 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcatatgtaaccctaat 24220598  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24220599 ttccaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatat 24220698  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  24220699 caattcataaaac 24220711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18613236 - 18613037
Alignment:
Q  17 ttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaat 115  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18613236 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcctatctaaat 18613137  T
Q  116 tcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613136 tcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 18613037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 3388149 - 3388366
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaacc 97  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  3388149 acatcagtgagtagaattctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctcttaaaccttaatcttatgtaacc 3388248  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3388249 ctaatttctaatataaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctca 3388348  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3388349 aatatcaattcataaaac 3388366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12322460 - 12322673
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12322460 acatgagtgaatagacttcttttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaccctaatcttatgtaacc-ta 12322558  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12322559 gtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtagaagcgaaagtggaggatttgataattgttaattcatcatctcaaat 12322658  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  12322659 atcaattcataaaac 12322673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20915915 - 20915705
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  20915915 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaatt 20915816  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20915815 tctaatgtaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaaaccatcatctcaaatatc 20915716  T
Q  204 aattcataaaa 214  Q
    |||||||||||    
T  20915715 aattcataaaa 20915705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25891321 - 25891104
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25891321 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 25891222  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25891221 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 25891122  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25891121 aatatcaattcataaaac 25891104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20571414 - 20571198
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  20571414 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggatggttggataagtctaaatgacatgatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacc 20571315  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20571314 ctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatgaacgattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctca 20571215  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  20571214 aatatcaattcataaaa 20571198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 22143133 - 22143349
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  22143133 catgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 22143232  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22143233 taatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaa 22143332  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  22143333 atatcaattcataaaac 22143349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23343509 - 23343297
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23343509 agtgagtagaattcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 23343410  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23343409 ctctaatctaaattcatcgctttaacatgaattaaccattatcaaactgcggaaacgaaagtggagggtttgataattattaatccatcatctcaaatat 23343310  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  23343309 caattcataaaac 23343297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31057675 - 31057463
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31057675 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaaccctaat 31057576  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057575 ttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 31057476  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  31057475 caattcataaaac 31057463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 13910135 - 13910358
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13910135 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 13910234  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13910235 ctaatttcttatctaaattgaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 13910334  T
Q  198 aatatcaattcataaaactaaaat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  13910335 aatatcaattcataaaacaaaaat 13910358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20449796 - 20449579
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20449796 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaacgaagctctaagccttaatcttatgtaacc 20449697  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20449696 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 20449597  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20449596 aatatcaattcataaaac 20449579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22323573 - 22323356
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22323573 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacctaatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22323474  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22323473 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccatcatctca 22323374  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22323373 aatatcaattcataaaac 22323356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23267815 - 23268032
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23267815 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 23267914  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23267915 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgacaattgtttatacatcatctca 23268014  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23268015 aatatcaattcataaaac 23268032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23600111 - 23599894
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23600111 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaacc 23600012  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  23600011 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcattcca 23599912  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23599911 aatatcaattcataaaac 23599894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33701617 - 33701834
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  33701617 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcgttaatcttatgtaacc 33701716  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33701717 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 33701816  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33701817 aatatcaattcataaaac 33701834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 24214876 - 24215088
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  24214876 agtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatcatatgtaaccctaat 24214975  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24214976 ctccaatctaaattcatcactttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatat 24215075  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  24215076 caattcataaaac 24215088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20444307 - 20444097
Alignment:
Q  8 tgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  20444307 tgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaattt 20444208  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20444207 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgtttattcatcatctcaaatatca 20444108  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20444107 attcataaaac 20444097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22856283 - 22856500
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22856283 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22856382  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22856383 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 22856482  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22856483 aatatcaattcataaaac 22856500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25006284 - 25006067
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25006284 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 25006185  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  25006184 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 25006085  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25006084 aatatcaattcataaaac 25006067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25577617 - 25577401
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  25577617 acattagtgagtagacttctcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 25577518  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  25577517 taatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 25577418  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  25577417 atatcaattcataaaac 25577401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5078172 - 5077955
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttg-tcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5078172 acatgagtgagtagacttctctttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 5078073  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5078072 ctaatttcttatctaagttcaccgctttaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccattatctca 5077973  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5077972 aatatcaattcataaaac 5077955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20802248 - 20802465
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20802248 acatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaaacgaagctctaagccttaatcttatgtaacc 20802347  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20802348 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 20802447  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20802448 aatatcaattcataaaac 20802465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30759139 - 30758922
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30759139 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 30759040  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  30759039 ctaatttctcatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 30758940  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30758939 aatatcaattcataaaac 30758922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30769244 - 30769027
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  30769244 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaatctctaagccttaatcttatgtaacc 30769145  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  30769144 ctaatttctcatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 30769045  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30769044 aatatcaattcataaaac 30769027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26842939 - 26843154
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| |||    
T  26842939 acattagtaagtagacttctcttgtctttgaattgttggataagtataatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaatcttaatcttatgtaatcct 26843038  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||  || |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26843039 aattccttatcttaattcaccgctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 26843138  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  26843139 tatcaattcataaaac 26843154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16104210 - 16103993
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16104210 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 16104111  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  16104110 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 16104011  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16104010 aatatcaattcataaaac 16103993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18772321 - 18772104
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  18772321 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 18772222  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  18772221 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 18772122  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18772121 aatatcaattcataaaac 18772104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21729956 - 21730173
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  21729956 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 21730055  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  21730056 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 21730155  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21730156 aatatcaattcataaaac 21730173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29052988 - 29052772
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  29052988 acatgagtgagtagacttctctttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagtcaagctctaagccttaatcatatgtaacc 29052889  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29052888 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttt-ataattgtttatccatcatctca 29052790  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29052789 aatatcaattcataaaac 29052772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20616449 - 20616665
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20616449 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 20616548  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  20616549 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 20616648  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  20616649 aatatcaattcataaaa 20616665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22316966 - 22316750
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22316966 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacctaatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 22316867  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22316866 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaaatggagggtttgataatttttcatccatcatctca 22316767  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  22316766 aatatcaattcataaaa 22316750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21389796 - 21390009
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaac-cctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21389796 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagccttaaatcctaatcttatgtaaccct 21389895  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  21389896 agtatctaatataaattcacccttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaattggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaa 21389994  T
Q  200 tatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  21389995 tatcaattcataaaa 21390009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9728866 - 9728649
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  9728866 acatgagtgagtaaacttctctttgtattgagattgttggataagtctaaatgatataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaacc 9728767  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9728766 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaagatttaataattgtttatccatcatctca 9728667  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9728666 aatatcaattcataaaac 9728649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18611157 - 18610940
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  18611157 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagtcctaagccttaatcttatgtaacc 18611058  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  18611057 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 18610958  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18610957 aatatcaattcataaaac 18610940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24952649 - 24952432
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24952649 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24952550  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24952549 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24952450  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24952449 aatatcaattcataaaac 24952432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24969314 - 24969097
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24969314 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 24969215  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  24969214 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 24969115  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24969114 aatatcaattcataaaac 24969097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25115279 - 25115062
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25115279 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 25115180  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  25115179 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccattattcca 25115080  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  25115079 aatatcaattcatcaaac 25115062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25174371 - 25174154
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25174371 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 25174272  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  25174271 ctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccattattcca 25174172  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  25174171 aatatcaattcatcaaac 25174154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25202020 - 25202237
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  25202020 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 25202119  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  25202120 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 25202219  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25202220 aatatcaattcataaaac 25202237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25266175 - 25266392
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  25266175 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 25266274  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  25266275 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 25266374  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25266375 aatatcaattcataaaac 25266392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 21273778 - 21273954
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  21273778 agtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctagcgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatataaccctagtttc 21273877  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  21273878 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcaaaagtggagtgtttgataattgt 21273954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 21382403 - 21382627
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccc-taatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||    
T  21382403 acatgagtgagtagacttctcttatcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagccttaaaccgtaatcttatgtaaccct 21382502  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||| || ||  ||||| || || ||||||||||||    
T  21382503 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcaaaagtggaagggttagtaattattaattcatcatctcaaa 21382602  T
Q  200 tatcaattcataaaactaaaattga 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21382603 tatcaattcataaaacgaaagttga 21382627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20169431 - 20169222
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  20169431 agtgagtagactattcttgtcttcggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaattt 20169332  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  || |||||| || ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  20169331 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattataaaattgtagaagcgaaagcggggggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatca 20169233  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    ||||| |||||    
T  20169232 attcagaaaac 20169222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23626805 - 23626594
Alignment:
Q  9 gagtagacttctct-tgtcttcggattttgggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatctta-tgtaaccctaatc 103  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  23626805 gagtagacttctccctgtcttgggaatgttggataagtctaaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaagccctaatcttaatgtaaccctaatt 23626706  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  23626705 tcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcattccaaatatc 23626606  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  23626605 aattcataaaac 23626594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26780674 - 26780891
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  26780674 acatgagtgagtagacttctccttgtcttggtattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaatccaagttctaagccttaatcttatgtaacc 26780773  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  26780774 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacattgatcaaccattatcaaattgttgaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 26780873  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26780874 aatatcaattcataaaac 26780891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35307609 - 35307395
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35307609 catgagtgagtagacttcctgtgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 35307510  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  35307509 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatttcaaat 35307410  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  35307409 gttaattcataaaac 35307395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25741810 - 25742025
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  25741810 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 25741909  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  25741910 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 25742009  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | |||||| |||||    
T  25742010 tgttaattcagaaaac 25742025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 20967869 - 20968079
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| | |    
T  20967869 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatccttatcaagccaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 20967968  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||| | |    
T  20967969 ctcttataaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataatcgttaatccattatttcaaatgtta 20968068  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  20968069 attcataaaac 20968079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 21833089 - 21833267
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  21833089 ggataagtctaatgacatattcctaataaaatcaagccttaaaccccaatcttatgtaaccctagtttctaatctgaatttaccgtctttacatgaatta 21833188  T
Q  137 accattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833189 accattatcaaactgtagaagcgaaaatgaacggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 21833267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25122248 - 25122043
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||            ||||||||||||||||    
T  25122248 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcct-----------taatcttatgtaaccc 25122160  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  25122159 taatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatacattattccaa 25122060  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  25122059 atatcaattcataaaac 25122043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25181339 - 25181134
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||            ||||||||||||||||    
T  25181339 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcct-----------taatcttatgtaaccc 25181251  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  25181250 taatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatacattattccaa 25181151  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  25181150 atatcaattcataaaac 25181134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 23743341 - 23743527
Alignment:
Q  30 ggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatctt-atgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaac 128  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  23743341 ggattttgggttaattttaataacataatcctaatcaaaccagactttaaccttaatttttatgtaaccctaattccttatctaaattccccgctttaac 23743440  T
Q  129 atgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    | | || |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23743441 agggatcaaccattatcaaactggggaaagaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatccataaaac 23743527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 23756880 - 23757014
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  23756880 acatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtcataaccctaatcttatgtaacccta 23756979  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 135  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756980 gtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 23757014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 23822336 - 23822470
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  23822336 acatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtcataaccctaatcttatgtaacccta 23822435  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 135  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23822436 gtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 23822470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28621937 - 28621767
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||    
T  28621937 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccctaagccttaatcttatgtaacc 28621838  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggag 168  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28621837 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 28621767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21400938 - 21400807
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21400938 acattagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaacc 21400839  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaaca 129  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21400838 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaaca 21400807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23582956 - 23582761
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataat-cctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaac 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||    
T  23582956 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacattattcctaatcaaaccaagctctaagcccctatctaatgtaac 23582857  T
Q  97 cctaatctctaatct-aaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatc 191  Q
    |||||  ||| |||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23582856 cctaacttcttatctgaaattccccgtcttaacatgtatcaaccattatcatactgtgaaaacaaatatggagggtttgataactgttaatccatc 23582761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 22948699 - 22948808
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22948699 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctattcaaaccaagctttaaacccaaattttatgtaaccctaat 22948798  T
Q  103 ctctaatcta 112  Q
     |||||||||    
T  22948799 ttctaatcta 22948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 22942489 - 22942598
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  22942489 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctagtcaaaccaaactttaaaccctaattttatgcaaccctaat 22942588  T
Q  103 ctctaatcta 112  Q
     |||||||||    
T  22942589 ttctaatcta 22942598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31758079 - 31757954
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  31758079 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaattttatataaatct 31757980  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  31757979 actttctaatctaatttcaccgtttt 31757954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20724810 - 20724698
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20724810 acatgagtgagtagactcttcttatcttgtgattgttggataagtctaatgacattatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaattttatgtaaccct 20724711  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  20724710 actttctaatcta 20724698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22000293 - 22000233
Alignment:
Q  155 aaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000293 aaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 22000233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 12410655 - 12410801
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||| | |    
T  12410655 agtgagtagactcttcttgtcatgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctacttt 12410754  T
Q  105 ctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  12410755 ctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaagtatcaaact 12410801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2953497 - 2953372
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||  ||    
T  2953497 acatgagtcagtagactcttcttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatataaatct 2953398  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||| ||||    
T  2953397 actttctaatctaatttcaccatttt 2953372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 22170910 - 22171035
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  22170910 acatgagtgagtagactcttcttgtcttggaatttttggatgagtctaatgaattaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatct 22171009  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  22171010 attttctaatctaaattcaccgtttt 22171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17408657 - 17408585
Alignment:
Q  38 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatctctaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17408657 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaacccagctttaaaccctaattttatgtaaccttaatttctaat 17408585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 15059739 - 15059811
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15059739 gtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaa 15059811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Original strand, 24165383 - 24165503
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||| | |||| |||  ||| | |    
T  24165383 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagttttatataaatctacttt 24165482  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  24165483 ctaatctaatttcaccgtttt 24165503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34223083 - 34223012
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34223083 acatgagtgagtggactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 34223012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 16677202 - 16677327
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| | | |||||||| ||||||||  ||    
T  16677202 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgatataatccctatcaaaccaagcatcttaccctaattttatgtaaatct 16677301  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||| ||| |||||| ||||    
T  16677302 attttctaatataacttcaccatttt 16677327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 20738479 - 20738604
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  |||  ||    
T  20738479 acataagtgagtagattcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttacataaatct 20738578  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||||||||||    
T  20738579 actttctaatctaatttcaccgtttt 20738604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 24166389 - 24166483
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  24166389 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttaggattgttggatgagtcgaatgacctaatccctatcaaaccaagcctggaaccctaatcttatgtaa 24166483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 31414744 - 31414811
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31414744 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaa 31414811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 23114384 - 23114508
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||   |    
T  23114384 acatgagtgagtagacttct-ttgttttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaaatat 23114482  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||    
T  23114483 attttctaatctaatttcatcgtttt 23114508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20103884 - 20103739
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagc-tttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||  |||||| ||  |||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||   || | ||    
T  20103884 tgagtagactcttcttgtattgagattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgaaccctaattttatataaatttactttc 20103785  T
Q  106 taatctaaattcaccgtt-ttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||    
T  20103784 taatctaatttcaccgttattataatgaattaacaaatatcaaact 20103739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34222930 - 34222882
Alignment:
Q  165 ggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 213  Q
    |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34222930 ggagggtttagtaattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaa 34222882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23029528 - 23029418
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||||| ||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||    
T  23029528 acatgagtgagt-gacttct-ttgtcttgggattgttggatgactctaatgacctaatccctattaaaccaagcctagaaccctaatcttatgtaaatct 23029431  T
Q  100 aatctctaatcta 112  Q
    | | |||||||||    
T  23029430 attttctaatcta 23029418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 8866 - 9076
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  8866 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 8965  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8966 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 9065  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9066 attcataaaac 9076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 16392 - 16602
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  16392 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 16491  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 16591  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  16592 attcataaaac 16602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17608 - 17398
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  17608 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccctaatct 17509  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17508 ctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 17409  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  17408 attcataaaac 17398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14538 - 14328
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  14538 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 14439  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14438 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 14339  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  14338 attcataaaac 14328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49986 - 49776
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  49986 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 49887  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49886 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 49787  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  49786 attcataaaac 49776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31045 - 30985
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatccta 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  31045 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacctaatccta 30985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31816 - 31756
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatccta 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||| ||||||||    
T  31816 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtcaaatgacctaatccta 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33341 - 33131
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  33341 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 33242  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33241 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 33142  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  33141 attcataaaac 33131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 110680 - 110896
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  110680 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccc 110779  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  110780 taatctctaatctaaattcaccgtattaacatgaaaaaaacattatcaaactatgaaaacaaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcacaa 110879  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||| ||||||||||||    
T  110880 atataaattcataaaac 110896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 369470 - 369260
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  369470 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 369371  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369370 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 369271  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  369270 attcataaaac 369260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24276 - 24174
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  24276 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 24177  T
Q  98 cta 100  Q
    |||    
T  24176 cta 24174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 38200 - 38408
Alignment:
Q  8 tgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctct 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  38200 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 38299  T
Q  107 aatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 206  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38300 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgcaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 38399  T
Q  207 tcataaaac 215  Q
    |||||||||    
T  38400 tcataaaac 38408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1295 - 1080
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1295 acattagtgagtatacatctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 1196  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1195 aatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgttcgtccatcatctcaaa 1096  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  1095 tatcaattcataaaac 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 13353 - 13567
Alignment:
Q  3 atgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  13353 atgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataactcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaacccta 13452  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13453 atctctaatctaaattcaccgtcttaacatgaattaacctttatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 13552  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  13553 atcaattcataaaac 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14144 - 13922
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14144 acatgagtgagtagacttctcttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaacca 14045  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14044 taatctctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattatcaagttgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaa 13945  T
Q  199 atatcaattcataaaactaaaat 221  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  13944 atatcagttcataaaacgaaaat 13922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6448 - 6231
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccta-atcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  6448 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaattaaaccaagctttaaacctttatcttatgtaacc 6349  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6348 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactctggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctca 6249  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6248 aatatcaattcataaaac 6231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 162603 - 162820
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  162603 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 162702  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162703 ctgatttctaatctaaattcaccgttttaacatgggttaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 162802  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  162803 aatatcaattcataaaac 162820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 163881 - 163668
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt--aaccctaatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  163881 agtgagttgacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaaccttaatcttatgtaaccctaa 163782  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  163781 tctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggttttgataattgttaatccatcatctcaaata 163682  T
Q  202 tcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  163681 tcaattcataaaac 163668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 172865 - 173070
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||| | | |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||  ||||||||  |||| |||  ||    
T  172865 acatgagtgagtagactgttcttgtattgggaatgttggatgagtctaatgacctaattctaatcaaaccatgcctcgaaccctaaatttatataaatct 172964  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||   ||| ||| | ||||||||| | || ||||| || ||||||| |||    
T  172965 actttctaatctaatttcaccgttttcataatgaattaacaagtatcaaactcataaagcgacaatggagggttag-tacttgttaattcatcatcacaa 173063  T
Q  199 atatcaa 205  Q
    |||||||    
T  173064 atatcaa 173070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18895 - 18684
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  18895 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcgaaatgacataattctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 18796  T
Q  104 tctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18795 tctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatc 18696  T
Q  204 aattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||    
T  18695 aattcataaaac 18684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13176 - 13391
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13176 acatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattatttgataagtctaatgaaataatcctaaccaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccct 13275  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13276 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaataaaacattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 13375  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  13376 tatcaattcataaaac 13391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5510 - 5724
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5510 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtttaaattacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 5609  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5610 ctaatctctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatccatcatctca 5709  T
Q  198 aatatcaattcataa 212  Q
    |||||||||||||||    
T  5710 aatatcaattcataa 5724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 800 - 1010
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  800 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 899  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  900 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 999  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  1000 attcataaaac 1010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5851 - 6068
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  5851 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaattaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaact 5950  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5951 ctaatttctaacctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaaggggagggtttgataattgttaatccattatctca 6050  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6051 aatatcaattcataaaac 6068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 424983 - 424771
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  424983 agtgagtagactccttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 424884  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  424883 ctctaatctaaatttaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatggttaatccatcatctcaaatat 424784  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  424783 caattcataaaac 424771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 159194 - 159409
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  159194 acatgagtgagtagacttcttatgtcctgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtaaagccttaaaccttaatattatgtaactct 159293  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||   ||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  159294 agtttcacttctaaattcactgttttaacatgggttaaatattatcagattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 159393  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  159394 tgttaattcataaaac 159409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 520875 - 521026
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||   |    
T  520875 acatgagtgagtagactcttcttgtcttaggaatgttggatgagtctaatgactaaatcttaatcataccaagcctcgaaccttaattttatgtaaattt 520974  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    | | |||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  520975 actttctaatctaatttcactgtttttataatgaattaacaaatatcaaact 521026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 82567 - 82444
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   |||| ||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  82567 acatgtgtgagtagacttct-ttgtcttgggattgatggatgagtttaatgacctaatccctatacaaccaagctttgaaccctaattttatgtaaatct 82469  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||| | |||||||||||    
T  82468 attttctaatct-atttcaccgtttt 82444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19559 - 19774
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  19559 acattagtgagtagatttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccct 19658  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19659 aatatctaatctaaattaaccgctttaacattgattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 19758  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  19759 tatcaattcataaaac 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 56651 - 56428
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  56651 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatataaac 56552  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  56551 ctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatatca 56452  T
Q  198 aatatcaattcataaaactaaaat 221  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  56451 aatgtcaattcataaaacgaaaat 56428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 72131 - 71998
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  72131 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 72032  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatg 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  72031 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 71998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 48912 - 49124
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  48912 tgagtgagtagacttctcttgccttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctattcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaatcctaa 49011  T
Q  102 tctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49012 tttctaatctaaattcaccggtttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtatgataattgttaatccatcatctcaaata 49111  T
Q  202 tcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  49112 tcaattcataaaa 49124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 13848 - 14060
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13848 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 13947  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13948 ttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 14047  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  14048 caattcataaaac 14060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 117878 - 118093
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  117878 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 117977  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  117978 aatttcttatctgaattcaccatcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 118077  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  118078 tatcaattcataaaac 118093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 124122 - 124337
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  124122 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 124221  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  124222 aatttcttatctgaattcaccatcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 124321  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  124322 tatcaattcataaaac 124337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2382 - 2165
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  2382 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 2283  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2282 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgtttatccatcatctca 2183  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2182 aatatcaattcataaaac 2165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 300128 - 299911
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  300128 acattagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 300029  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  300028 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 299929  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  299928 aatatcaattcataaaac 299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14130 - 13914
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  14130 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 14031  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 13931  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  13930 aatatcaattcataaaa 13914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1323
Description:

Target: scaffold1323; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 643 - 448
Alignment:
Q  22 ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 119  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  643 ttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatgctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 544  T
Q  120 cgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  543 cgttttaacatgaagtaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatttcaattcataaaac 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 3345 - 3560
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  3345 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaaactttaaaacttaatcttatgtaaccct 3444  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3445 aatttcttatctaaattcactgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccaccatctcaaa 3544  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||| |||||    
T  3545 tatcaattcagaaaac 3560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12505 - 12290
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12505 acatgagtgcgtagatttctcttgtcatggcattgttagataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccct 12406  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12405 agtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaatctgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 12306  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||    
T  12305 tatcaatttataaaac 12290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12301 - 12087
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12301 acatgagtgagtagacacttcttgtcttgggattattggataagtctaatggcaaaatccaaatcaaaccaagctttaaaccctaatcttatgtaatcct 12202  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12201 agtttctaatctaaattcacttttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaa 12102  T
Q  200 tatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  12101 tatcaattcataaaa 12087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7800 - 7583
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  7800 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 7701  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    || || ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7700 ctgatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctca 7601  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7600 aatatcaattcataaaac 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 1763 - 1659
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  1763 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagcgctaagccttaatcttatgtaacc 1664  T
Q  98 ctaat 102  Q
    |||||    
T  1663 ctaat 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15230 - 15447
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15230 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 15329  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15330 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 15429  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15430 aatatcaattcataaaac 15447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 704
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  921 acatgagtgagtagacttttctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 822  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  821 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatgcatcatctca 722  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  721 aatatcaattcataaaac 704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 186367 - 186584
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  186367 acatgagtgagtagacttctctttgtcatgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 186466  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  186467 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccataatctca 186566  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  186567 aatatcaattcataaaac 186584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 50012 - 50079
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataa-gtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 72  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50012 agtgagtagactcttcttatcttgggattgttggataaagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 50079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 1907 - 2111
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1907 agtgagtagactttttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttcaaccttaatcttatgtaaccctaatct 2006  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2007 ctaatctaaattcaccgctataacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaaatcgagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatca 2106  T
Q  205 attca 209  Q
    |||||    
T  2107 attca 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 42867 - 43043
Alignment:
Q  40 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  42867 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaac 42966  T
Q  139 cattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42967 cattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 43043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24602 - 24818
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  24602 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 24701  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24702 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcattcca 24801  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  24802 aatatcaattcataaaa 24818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 30672 - 30889
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30672 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 30771  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30772 ctaatttcttatctcaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcattcca 30871  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30872 aatatcaattcataaaac 30889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10743 - 10525
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaac 96  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  10743 acatgactgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaaatgacgtaatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaac 10644  T
Q  97 cctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 196  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643 cctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 10544  T
Q  197 aaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10543 aaatatcaattcataaaac 10525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2385 - 2168
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  2385 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 2286  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2285 ctaatttcttatctaaattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactacgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcaacgca 2186  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2185 aatatcaattcataaaac 2168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2097
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2313 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 2214  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  2213 taatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaa 2114  T
Q  199 atatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  2113 atatcaattcataaaac 2097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21655 - 21443
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21655 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataattctgaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 21556  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21555 ttcttatctaaagtcaccggtttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 21456  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||    
T  21455 caattcataaaac 21443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 26802 - 26709
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaac 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26802 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 26709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0760 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0760
Description:

Target: scaffold0760; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6188 - 5972
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtcta-atgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  6188 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctagatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgcaacc 6089  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  6088 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaatgtggagggtttgataattgtttatccattatttca 5989  T
Q  198 aatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  5988 aatatcaattcataaaa 5972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0624 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0624
Description:

Target: scaffold0624; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 4804 - 5002
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |               ||||||||    
T  4804 acatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctat---------------taacccta 4888  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4889 atctctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8784 - 8575
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || | |    
T  8784 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtcttaaaccctaattttatgtaaccatagttt 8685  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  8684 ctaatctaaattcaccattttaacatgaattaacaattatcaaactgtaaaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatca 8586  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  8585 attcataaaac 8575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1807 - 2024
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  1807 acatgagtgagcagacttctccttgtcttgggattgttgggtaagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 1906  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  1907 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcca 2006  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2007 aatatcaattcataaaac 2024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3010 - 2793
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3010 acattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 2911  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||    
T  2910 ctaatttcttatctaaattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataactgtttacgcaccatctca 2811  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2810 aatatcaattcataaaac 2793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5400 - 5617
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  5400 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 5499  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  5500 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 5599  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5600 aatatcaattcataaaac 5617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14577 - 14362
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |    
T  14577 acatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacatattcctaataaaaccaagccttaaaccccaatcttatgtaacctt 14478  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14477 agtttctaatctgaattcaccgtctttacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaaatgtacggtttgataattgttaatccatcatctcaaa 14378  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  14377 tatcaattcataaaac 14362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1777 - 1994
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  1777 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 1876  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  1877 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 1976  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1977 aatatcaattcataaaac 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4069 - 4286
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  4069 acatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaacc 4168  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 197  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||    
T  4169 ctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcca 4268  T
Q  198 aatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4269 aatatcaattcataaaac 4286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1644 - 1430
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1644 acatgagtgactagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccct 1545  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  1544 aatttctaatctaaattcattgttataacatgaattaacaataatcaaactgtagaagcgaaaatggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaa 1446  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||    
T  1445 tatcaattaataaaac 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3021 - 2807
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3021 acatgagtgactagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccct 2922  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  2921 aatttctaatctaaattcattgttataacatgaattaacaataatcaaactgtagaagcgaaaatggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaa 2823  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||| |||||||    
T  2822 tatcaattaataaaac 2807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9778 - 9568
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  9778 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaagccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctagttt 9679  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |    
T  9678 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgaagaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatta 9579  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9578 attcataaaac 9568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 6542 - 6752
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  6542 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctagttt 6641  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |    
T  6642 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatta 6741  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  6742 attcataaaac 6752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 11156 - 11366
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  11156 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctagttt 11255  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |    
T  11256 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatta 11355  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  11356 attcataaaac 11366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 418 - 636
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaa-accaagctttaaccct-aatcttatgtaac 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  418 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcatgaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 517  T
Q  97 cctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 196  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  518 cctaatttcttatctaaattcacctctttaccatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattattcc 617  T
Q  197 aaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||    
T  618 aaatatcaattcataaaac 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 9151 - 9361
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  9151 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctagttt 9250  T
Q  105 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |    
T  9251 ctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatta 9350  T
Q  205 attcataaaac 215  Q
    |||||||||||    
T  9351 attcataaaac 9361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 70501 - 70376
Alignment:
Q  89 tatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcc 188  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  70501 tatntaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatcc 70402  T
Q  189 atcatctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  70401 atcatctcaaatatcaattcataaaa 70376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 9638 - 9802
Alignment:
Q  7 gtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  9638 gtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcc 9737  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggaggg 170  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9738 ttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg 9802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21629 - 21415
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  21629 catgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 21530  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  21529 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 21430  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  21429 gttaattcataaaac 21415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 121682 - 121901
Alignment:
Q  3 atgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  121682 atgagtcagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaagtcaagctctaagccttaattttatgtaaccct 121781  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121782 aatttcttatctaaattcaccgatttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 121881  T
Q  200 tat----caattcataaaac 215  Q
    |||    |||||||||||||    
T  121882 tatatatcaattcataaaac 121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 60809 - 60665
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  60809 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctatttaccttattcttatgtaaccc 60710  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccatta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60709 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccatta 60665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 139
Target Start/End: Original strand, 60613 - 60646
Alignment:
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaacc 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  60613 taatctaaattcaccattttaacatgaattaacc 60646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2143 - 1971
Alignment:
Q  48 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaa----ccatt 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||    
T  2143 aatgacataatcctaatcgaaccaagttttaaaccctaattttatgtaactctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaattaaccatt 2044  T
Q  143 atcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2043 aacaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccattatttcaaatatcaattcataaaac 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1243 - 1451
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1243 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 1342  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  1343 aatttctaatctaaattcaccattttcacatgaattaacaattatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaa 1441  T
Q  200 tatcaattcat 210  Q
    | |||||||||    
T  1442 t-tcaattcat 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5563 - 5778
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  5563 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 5662  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  5663 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattttcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataatcgttaatccattattccaaa 5762  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  5763 tgttaattcataaaac 5778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 27503 - 27715
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27503 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagt 27602  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  27603 ttcccttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgt 27702  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  27703 taattcataaaac 27715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 39499 - 39711
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  39499 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagt 39598  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     ||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  39599 ttcccttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgt 39698  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  39699 taattcataaaac 39711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 1517 - 1696
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1517 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccct 1616  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataat 179  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1617 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataat 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 337 - 122
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| || || | |||| ||||||||||||    
T  337 acatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataataaagtcaagccttcaatcttaatattatgtaaccct 238  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  237 agtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactctggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 138  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  137 tattaattcataaaac 122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 84205 - 83990
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | ||| ||||||||||||    
T  84205 acatgagtgagtagacttcttttatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaacgttaatattatgtaaccct 84106  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
    | | |||  | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  84105 actttctcttataaattaaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaa 84006  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||| ||||    
T  84005 tgttaattcatgaaac 83990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 48528 - 48740
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||| |    
T  48528 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaagcttatgtaaccctagt 48627  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||  || || |    
T  48628 ttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtgtaggctttgataatcgttaatccattattccagatgt 48727  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  48728 taattcataaaac 48740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 105074 - 104942
Alignment:
Q  83 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  105074 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccactttaacatggatcaatcagtatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgt 104975  T
Q  183 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104974 ttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 104942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 19491 - 19705
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  19491 catgagtgagtagactttttatgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatataacccta 19590  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     |  ||  | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  19591 gttactcttttaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 19690  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  19691 gttaattcataaaac 19705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 26320 - 26534
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  26320 catgagtgagtagactttttatgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatataacccta 26419  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     |  ||  | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  26420 gttactcttttaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 26519  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  26520 gttaattcataaaac 26534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25495 - 25343
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25495 acatgagtgagtagacttttccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 25396  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaact 150  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  25395 ctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaact 25343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 23277 - 23491
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa-tcttatgtaacccta 100  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||| | | |||| ||||||||    
T  23277 catgagtgagtaggcttcttatgtcttggggttgttggataagtctaatgacataatcctaattaagtcaagccttaaaccttagtattatataacccta 23376  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 200  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  23377 gtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaat 23476  T
Q  201 atcaattcataaaac 215  Q
     | ||||||||||||    
T  23477 gttaattcataaaac 23491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 17175 - 17344
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctct-tgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  17175 acatgagtgagtagacttctctatgtcttaggattgttgaataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 17274  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtgga 167  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17275 ctaatttcttatcaaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 17344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 215
Target Start/End: Original strand, 21385 - 21420
Alignment:
Q  180 tgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21385 tgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 21420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 215
Target Start/End: Original strand, 25582 - 25617
Alignment:
Q  180 tgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25582 tgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 25617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18721 - 18509
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  18721 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctcaatattatgtaaccctagt 18622  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |    
T  18621 ttctcttctaaattcaccgttttcacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaaatggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgt 18522  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  18521 taattcataaaac 18509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 18980 - 19195
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaacccta 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  18980 catgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaacccta 19079  T
Q  101 atctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaa 199  Q
     | |||  |||||||||| || |||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||   |||    
T  19080 gtttctcttctaaattcatcgtttttaacatggattaaatattatctaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataatcgttaatccatcattctaaa 19179  T
Q  200 tatcaattcataaaac 215  Q
    | | ||||||||||||    
T  19180 tgttaattcataaaac 19195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 4926 - 5120
Alignment:
Q  23 tgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccc-taatctctaatctaaattcacc 120  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || ||| ||| ||||||||||| || | |||  ||||||||||||    
T  4926 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagcctcaaaccttaatattatgtaacccctagtttctcttctaaattcacc 5025  T
Q  121 gttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  5026 gttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccataattccaaatattaattcataaaac 5120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 169314 - 169103
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| || | | || |||||||| |    
T  169314 tgagtgagtagacttcttatgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctgatcaagtcaagccttaaaccttagtataatataaccctagt 169215  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 202  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||| |    
T  169214 ttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaa-atttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtatgataatcgttgatccatcattccaaatgt 169116  T
Q  203 caattcataaaac 215  Q
     ||||||||||||    
T  169115 taattcataaaac 169103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17844 - 17730
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  17844 acatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaacac 17745  T
Q  99 taatctctaatctaa 113  Q
    |||||||||||||||    
T  17744 taatctctaatctaa 17730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1753 - 1538
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa--ccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||  || |||| ||||||||||     
T  1753 acataagtgagtagacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaatattatgtaacct 1654  T
Q  99 taatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 198  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  |||    
T  1653 tagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatatcatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaa 1554  T
Q  199 atatcaattcataaaa 214  Q
    || | |||||||||||    
T  1553 atgttaattcataaaa 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 104 - 2
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  104 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 5  T
Q  100 aat 102  Q
    |||    
T  4 aat 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37907 - 37742
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  37907 agtgagtagacttctcttgttttgggattgtttgataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaacattaaaccttaatcttatgtaaccctagt 37808  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggag 168  Q
     |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37807 ttctcttctaaattcacagttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 37742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44251 - 44058
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 105  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||            |||||   ||||||||| |     
T  44251 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaaatcaag------------tctta---aaccctaatttt 44167  T
Q  106 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  || ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  44166 taatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaaatatcaaattgtagaagcgaaagtggagggttag-taattattaattcatcatctcaaatatcaa 44068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 3449 - 3572
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  3449 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 3548  T
Q  98 ctaatctctaatctaaattcaccg 121  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  3549 ctaatttcttatctaaattcaccg 3572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22604 - 22526
Alignment:
Q  136 aaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22604 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatcccaaatatcaattcataaaa 22526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 61978 - 62142
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaa--tcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  | || | || ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  61978 agtgagtagacttctctt-tcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaattgaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagt 62076  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggag 168  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  62077 ttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaactggag 62142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19909
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaccctaatcttatgtaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19802 acatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccc 19901  T
Q  99 taatctct 106  Q
    ||||||||    
T  19902 taatctct 19909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Original strand, 74174 - 74301
Alignment:
Q  88 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 187  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  74174 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcgttaatc 74273  T
Q  188 catcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||| ||  ||||| | ||||||||||||    
T  74274 cattattccaaatgttaattcataaaac 74301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33906 - 33802
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctc-ttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  33906 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 33807  T
Q  98 ctaat 102  Q
    |||||    
T  33806 ctaat 33802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22383 - 22173
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| |||| |||  ||| |    
T  22383 tgagtgagtagacacttcttgtcttgggattgatggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctact 22284  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | || ||||||   ||| ||| ||||||||||| | || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22283 ttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaaataccaaactcataaaccgacagtggagggttag-tatttgttaattcatcatcacaaata 22185  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  22184 tcaattcataaa 22173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6968 - 6759
Alignment:
Q  6 agtgagtagactt-ctcttgtcttcgg-attttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaa--ccctaatcttatgtaa-ccc 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| |||    
T  6968 agtgagtagactttctcttgtctttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagactttaaacccttaatcttatgtaacccc 6869  T
Q  99 taatctctaatct-aaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaact-gtgaaaac-gaaagtggaggg-tttgat-aattg-tttatccatc 191  Q
    ||||  || |||| |||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  6868 taattccttatctaaaattcaccgctttaaatatggatcaaccattatcaaactagtggaaacggaaagtggagggttttgataaattgttttatccatc 6769  T
Q  192 atctcaaata 201  Q
    ||||||||||    
T  6768 atctcaaata 6759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 47834 - 48029
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct--cttgt-cttcgg-attttgggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaacc-aagctttaa-ccctaatcttatg 92  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||    
T  47834 acatgagtgagtagacttctttcttgttcttgggtattgttggataagtctaaattgacataatcctaatcaaaccaaagccctaagccttaatcttatg 47933  T
Q  93 -taaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacat-gaattaacca-ttatc-aaactgtgaaaacgaaagtgg-agggtttgataattgtt 183  Q
     |||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47934 ttaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatttaaccatttatcaaaactgtggaaacgaaagtggtagggtttgataattgtt 48029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8977 - 8915
Alignment:
Q  109 tctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggt 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8977 tctaaattgaccgttttaacatgagttaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggt 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9043 - 8977
Alignment:
Q  10 agtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct 75  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9043 agtagaattctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct 8977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6665 - 6455
Alignment:
Q  4 tgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccctaatcttatgtaaccctaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||  | | |    
T  6665 tgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagcctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatccact 6566  T
Q  103 ctctaatctaaattcaccgtttt-aacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaata 201  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||   ||| |||| | |||||| | | || ||||| || ||||||| ||||||    
T  6565 ttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttgttaattcatcatcacaaata 6467  T
Q  202 tcaattcataaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  6466 tcaattcataaa 6455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 49820 - 49945
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaac-caagctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || | | ||||||||| |||| |||  ||    
T  49820 acataagtgagtagacctttcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaactaaaccataaaccctaattttatataaatct 49919  T
Q  100 aatctctaatctaaattcaccgtttt 125  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||    
T  49920 actttctaatctaatttcactgtttt 49945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 38664 - 38773
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaaccct 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  38664 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcatattcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaaccct 38762  T
Q  100 aatctctaatc 110  Q
    | | |||||||    
T  38763 attttctaatc 38773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9178 - 8971
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacc-ctaatcttatgtaaccctaatct 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| | ||||| |||| |||  ||| | |    
T  9178 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataaatctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaactctaattttatataaatctacttt 9079  T
Q  105 ctaatctaaattcaccg-ttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 203  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||||||| | || ||||||   ||| |||| | |||||||| | || || || || ||||||| ||||||||    
T  9078 ctaatctaaattcactgtttttataatgaattaacaaataccaaact-caaaagcgaacgcggagggttag-tattttttaattcatcatcacaaatatc 8981  T
Q  204 aattcataaa 213  Q
    ||||||||||    
T  8980 aattcataaa 8971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0855
Description:

Target: scaffold0855; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 3596 - 3690
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  3596 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0847
Description:

Target: scaffold0847; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 3761 - 3855
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  3761 acatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 1777 - 1871
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaccctaatcttatgtaa 95  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||    
T  1777 acatgagtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctatgaccctaattttatgtaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 69
Target Start/End: Original strand, 21308 - 21371
Alignment:
Q  6 agtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 69  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21308 agtgagtagactcttcttgttttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 21371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45058 - 45016
Alignment:
Q  172 ttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45058 ttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 45016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 4654 - 4719
Alignment:
Q  2 catgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaa 67  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4654 catgagtgagtagacttcttttgacttgggattgttggataagtctaatgatgtaatcctaatcaa 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 3972 - 4040
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctctt-gtcttcggattttgggataagtctaa-tgacataatcctaatcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3972 acatgagtgagtagacttctttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 4040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 21448 - 21511
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaat 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21448 acatgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataggtctaatgatgtaatcctaat 21511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1559
Description:

Target: scaffold1559; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1601
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  1529 acatgagtgagtagaattct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 1601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 21748 - 21797
Alignment:
Q  25 tcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21748 tcttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 21797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 14218 - 14291
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttctcttgtcttcggattttgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 74  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  14218 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacctaatccctatcgaaccaagc 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1317 - 1288
Alignment:
Q  186 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317 tccatcatctcaaatatcaattcataaaac 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 5215 - 5264
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa 49  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  5215 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaa 5264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 33773 - 33822
Alignment:
Q  1 acatgagtgagtagacttct-cttgtcttcggattttgggataagtctaa 49  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  33773 acatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaa 33822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University