View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3307_low_16 (Length: 368)

Name: NF3307_low_16
Description: NF3307
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3307_low_16
NF3307_low_16
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (18-358)||(8041290-8041630)
chr4 (18-351)||(8410968-8411301)
chr4 (18-353)||(8035881-8036213)
chr4 (68-356)||(8416620-8416908)
chr4 (18-351)||(9138481-9138814)
chr4 (64-356)||(8359042-8359325)
chr4 (64-325)||(8356024-8356282)
chr4 (64-230)||(8354614-8354777)
chr4 (64-327)||(43144381-43144641)
chr4 (211-352)||(8404113-8404254)
chr4 (170-327)||(9576915-9577072)
chr4 (68-126)||(8403967-8404025)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (58-352)||(33084168-33084454)
chr2 (149-272)||(24845330-24845452)
chr2 (68-126)||(24844593-24844651)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (156-352)||(5476606-5476802)
chr7 (64-126)||(5476502-5476564)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8041630 - 8041290
Alignment:
Q  18 aaatccgctactctctttgaaaattaaagagtatggaaattgtccaaaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8041630 aaatccgctactctctttgaaaattaatgggtatggaaggtgtccaaaatctgagttacttcctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgag 8041531  T
Q  118 ctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttg 217  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8041530 ctttgttattatagttggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttg 8041431  T
Q  218 caactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8041430 caactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatattttggttctcgatagctgttctttgattgaggatgcacaagtcctctg 8041331  T
Q  318 catatctaatcagacattatccaatttgactatatcctatg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8041330 catatctaatcagacattatccaatttgactataacctatg 8041290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 351
Target Start/End: Original strand, 8410968 - 8411301
Alignment:
Q  18 aaatccgctactctctttgaaaattaaagagtatggaaattgtccaaaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8410968 aaatccactactctctttgaaaattaatgggtatggaaagtgtccaaaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgag 8411067  T
Q  118 ctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  8411068 ctttgttattatagtaggtatgacgggcatgcaaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaaatttttcaactttgttg 8411167  T
Q  218 caactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||     ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8411168 caactcacaatcattgtgctgacccttttccaaaatgtcatgtgctgaagactttggtgctcaggtattgttctttgattgaagatgcacaagtcctctg 8411267  T
Q  318 catatctaatcagacattatccaatttgactata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8411268 catatctaatcagacattatccagtttgactata 8411301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8036213 - 8035881
Alignment:
Q  18 aaatccgctactctctttgaaaattaaagagtatggaaattgtccaaaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8036213 aaatccactactctctttgaaaattaatgggtatgggaagtgtccaaaatctgagttactccctttaatctttggctctcattctttgacatttcttgat 8036114  T
Q  118 ctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttg 217  Q
    |||| ||||   |||||| || ||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||    
T  8036113 ctttgttat---agtaggaataacacggatacaaagtgtccaaaatctcttcacttgcctgcattaagaaccttgcatcttaaatatttcaagtttgttg 8036017  T
Q  218 caactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8036016 caactcacaatcattgtgctgacccctttcaaaactgtcatgtgttgaatattttggttctcgatagctgttctttgattgaggatgcacaagtcctctg 8035917  T
Q  318 catatctaatcagacattatccaatttgactatatc 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8035916 catatctaatcagacactatccaatttgactatatc 8035881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 68 - 356
Target Start/End: Original strand, 8416620 - 8416908
Alignment:
Q  68 ctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaatctct 167  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8416620 ctgagatactcccgttaatctttggctctcactctttgacatttcttgagctttcttattatagtaggtatgactggtatgcgaagtgtccaaaatctct 8416719  T
Q  168 tcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| |||||    
T  8416720 tcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaaattttttaactttgttgcaactcacgatcattgtgctgagcccttttcaaactgtcatgtgctgaat 8416819  T
Q  268 actttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatatccta 356  Q
    ||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8416820 actttggttatcagtggttgttctttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatatccta 8416908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9138814 - 9138481
Alignment:
Q  18 aaatccgctactctctttgaaaattaaagagtatggaaattgtccaaaatctgagtta---ctccctttaatctttggctctcactctttgacatttctt 114  Q
    |||||| || |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9138814 aaatccacttctctctttgaaaatttttgggtatgcaaagtgtccaaaatctgagttattactccctttactctttggctctcgctctttgacatttctt 9138715  T
Q  115 gatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttg 214  Q
    || ||||||||||   ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||   ||||    
T  9138714 gacctttcttatt---gtatgaaaaacgggtatgcaaagtgtccaaaatctcttcacataccagcattaagaaccttgcatcttcaatggttccactttg 9138618  T
Q  215 ttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcct 314  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9138617 ttgcaactcacgatcactgtgctgacccctttccaaactgtcacgtgttgaatactttggttctcattgcttgttctttgattgaggatgcacaagtcct 9138518  T
Q  315 ctgcatatctaatcagacattatccaatttgactata 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9138517 ctgcatatctaatcagacactatccaatttgactata 9138481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8359325 - 8359042
Alignment:
Q  64 aaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaat 163  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  8359325 aaatatgagttcctccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgagctttctt-------tagtta--acgggtatgcgaagtgtccaaaat 8359235  T
Q  164 ctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgtt 263  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  8359234 ctcttcacctgcctgcattaagaaccttgcatcttaaatgcttcaactttgttacaactcactatcactgtgctgaccccttttcaaactgtcatgtgtt 8359135  T
Q  264 gaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatatccta 356  Q
    ||| ||||||   ||| |   ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359134 gaacactttgcagctcaagtattgttctttgattgatgatgcacaaatcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatatccta 8359042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8356282 - 8356024
Alignment:
Q  64 aaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  | ||||| |||   |||||| ||| | ||  || |  |||||||||||    
T  8356282 aaatctgagttactccctttaatctcgacctctcactctttgacatttctcaagctttcatat---agtaggcatggctgggttgtagtgtgtccaaaat 8356186  T
Q  164 ctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgtt 263  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | | | |||  ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  8356185 ctcttcaatttcctgcattaagaactttgcatctcgaatgtgtcaactttgttgcaactcaccatcactatgccgaccctttttcaaactgtcatgagtt 8356086  T
Q  264 gaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatcta 325  Q
     ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8356085 aaatactttggtacttgatgattgtaaattgattgaggacgcacaagtcctttgcatatcta 8356024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8354777 - 8354614
Alignment:
Q  64 aaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| || ||  | |  |||||||||||||||    
T  8354777 aaatccgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatct---ttgttatagtaggaataacacggagacaaagtgtccaaaat 8354681  T
Q  164 ctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatca 230  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | | |||  ||||||||||||||| ||||    
T  8354680 ctcttcacttgcctgcagtaagaaccttgcatctcaaatgtgtcaactttgttgcaactcaccatca 8354614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43144641 - 43144381
Alignment:
Q  64 aaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaagtgtccaaaat 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  | ||||| |||    || || ||  ||||  ||||  |||||||||||    
T  43144641 aaatctgatttactccctttaatctcagtctctcactctttgacatttctcaagctttcatatg---gtcggaatttcggggttgcagtgtgtccaaaat 43144545  T
Q  164 ctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgtt 263  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||| |||| || | | |||  ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  43144544 ctctacgcttgcctgcattaagaactttgtatctcaaatatgtcaactttgttgcaacacaccatcactatgctgaccctttttcaaactgtcatgagtt 43144445  T
Q  264 gaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaat 327  Q
     |||| |||||| ||    | ||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43144444 aaataatttggtacttagggattgttctttgattcaggatgcaaaagtcctttgcatatctaat 43144381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 352
Target Start/End: Original strand, 8404113 - 8404254
Alignment:
Q  211 tttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaag 310  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||| || ||| |||||  ||| | ||||||||||||||| |||     ||||  ||||||||||||||||||||    
T  8404113 tttgttgcaactcacgatcactatgttgatcccttttcaaaccttcatgcgttgaatactttggtgctcaggttttgtgatttgattgaggatgcacaag 8404212  T
Q  311 tcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  8404213 tcctctgcatatctaatcagacactgtccagtttgactatat 8404254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9577072 - 9576915
Alignment:
Q  170 acttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgtcacgtgttgaatac 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||   |||| ||||||| ||| ||| |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  9577072 acttgcctgcattaagaaccttgcatcttgaatacttctactttgctgcaactaacagtcactgtgctgatcccttttcgaactgtctcgtgttgaatac 9576973  T
Q  270 tttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaat 327  Q
     ||||| |||| |  ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9576972 attggtgctcggttattgttgtttgattaaggaaacacaagtcctctgcatatctaat 9576915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Original strand, 8403967 - 8404025
Alignment:
Q  68 ctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttat 126  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8403967 ctgagttactacctttaatcttaacctctcactctttgacatttcttgagctttcttat 8404025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 352
Target Start/End: Original strand, 33084168 - 33084454
Alignment:
Q  58 tgtccaaaatctgagttac----tccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttattatagtaggtatgacgggtatgcaaag 153  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||| ||     ||||||||    
T  33084168 tgtccaaaatctgagttacgtactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgagctttcttat-------ggtagga-----atgcaaag 33084255  T
Q  154 tgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaact 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33084256 tgtccaaaatctcttcacttgcctgcattaagaaccttgcatcttcaatttttcaacttctttgcaactcacaatcattgtgctgacccctttccaaact 33084355  T
Q  254 gtcacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33084356 gtcacgtgttgaatactttggttctcagtggttgttctttgattgaggatgcacaagtcctctacatgtctaatcagacactatccaatttgactatat 33084454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 272
Target Start/End: Original strand, 24845330 - 24845452
Alignment:
Q  149 caaagtgtccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttcc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | | |||  ||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||| |    
T  24845330 caaagtgtccaaaatctcttcacttgcctgcagtaagaaccttgcatctcaaatgtgtcaactttgtagcaactcaccatcactatgctga-cctttttc 24845428  T
Q  249 aaactgtcacgtgttgaatacttt 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24845429 aaactgtcatgtgttaaatacttt 24845452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Original strand, 24844593 - 24844651
Alignment:
Q  68 ctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttat 126  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24844593 ctgagttactctcttcaatctttggctctcattctttgacatttcttgatctttcttat 24844651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 352
Target Start/End: Original strand, 5476606 - 5476802
Alignment:
Q  156 tccaaaatctcttcacttacctgcattaagaaccttgcatcttaattttttcagatttgttgcaactcacaatcattgtgctgacccttttccaaactgt 255  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||| | |   |||  ||||||||||||| | |||| | || ||| || ||| |||||  |    
T  5476606 tccaaaatctctacatttgcctgcattaagaactttacatcttgaatacgtcaactttgttgcaactcgcgatcactatgttgatcccttttcaaacctt 5476705  T
Q  256 cacgtgttgaatactttggttctcgatggttgtattttgattgaggatgcacaagtcctctgcatatctaatcagacattatccaatttgactatat 352  Q
    || | ||||||||||||||| |||    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5476706 catgcgttgaatactttggtgctcaggtgttgttatttgattgaggatgcactagtcctctgcatatctaatcagacactgtccaatttgactatat 5476802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 126
Target Start/End: Original strand, 5476502 - 5476564
Alignment:
Q  64 aaatctgagttactccctttaatctttggctctcactctttgacatttcttgatctttcttat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  5476502 aaatctgatttactccctttaattttagcctctaactccttgacattccttgagctttcttat 5476564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University