View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3310_low_1 (Length: 4359)

Name: NF3310_low_1
Description: NF3310
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3310_low_1
NF3310_low_1
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (1-4359)||(41718789-41723147)
chr5 (548-4209)||(34352542-34356200)
chr5 (1-268)||(41718154-41718421)
chr5 (260-552)||(34359375-34359667)
chr5 (3322-3815)||(31502110-31502590)
chr5 (3722-4225)||(23318806-23319308)
chr5 (1658-1966)||(7778168-7778475)
chr5 (1-34)||(34352226-34352259)
chr5 (1-34)||(34359934-34359967)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (261-4359)||(48697661-48701759)
chr4 (251-4359)||(42266282-42270390)
chr4 (261-4359)||(30946023-30950121)
chr4 (354-1843)||(2001772-2003267)
chr4 (2096-3906)||(1999723-2001521)
chr4 (3044-4275)||(21513658-21514893)
chr4 (3957-4225)||(1999427-1999695)
chr4 (1-102)||(48702127-48702228)
chr4 (1-102)||(48697438-48697539)
chr4 (4-102)||(30945803-30945901)
chr4 (12-102)||(30950517-30950607)
chr4 (1639-1750)||(30165462-30165573)
chr4 (4275-4359)||(1979694-1979778)
chr4 (1-33)||(24520331-24520363)
chr4 (1484-1567)||(28608721-28608804)
chr4 (1-32)||(42265883-42265914)
chr4 (1-32)||(42270602-42270633)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (251-4359)||(27874539-27878647)
chr6 (248-2145)||(26976720-26978602)
chr6 (354-1284)||(1472398-1473327)
chr6 (3860-4359)||(30967787-30968287)
chr6 (394-1317)||(21964817-21965725)
chr6 (1298-2187)||(18148080-18148970)
chr6 (3543-3826)||(30968283-30968566)
chr6 (263-550)||(18967256-18967543)
chr6 (3723-4255)||(8480108-8480640)
chr6 (2096-2536)||(8481374-8481814)
chr6 (1658-1854)||(8565162-8565358)
chr6 (599-721)||(18967120-18967241)
chr6 (4092-4359)||(23012182-23012438)
chr6 (1778-1979)||(8564961-8565161)
chr6 (3886-4128)||(8481005-8481247)
chr6 (4-102)||(27879036-27879134)
chr6 (260-376)||(21966493-21966604)
chr6 (260-320)||(30968569-30968629)
chr6 (3426-3506)||(8479998-8480078)
chr6 (4297-4346)||(16777060-16777109)
chr6 (258-295)||(1472341-1472378)
chr6 (1-34)||(26976437-26976470)
chr6 (1-33)||(1234680-1234712)
chr6 (1-32)||(27874296-27874327)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (248-4359)||(5819102-5823213)
chr3 (2017-4359)||(2814859-2817201)
chr3 (251-1285)||(54544598-54545632)
chr3 (2035-4255)||(42585440-42587654)
chr3 (354-1951)||(42587735-42589332)
chr3 (876-1233)||(25877805-25878161)
chr3 (553-998)||(25880583-25881030)
chr3 (826-1021)||(25880372-25880567)
chr3 (3665-4128)||(47277022-47277494)
chr3 (3878-4216)||(25877355-25877693)
chr3 (1-102)||(2817557-2817658)
chr3 (682-791)||(25880239-25880348)
chr3 (4297-4346)||(5382624-5382673)
chr3 (4292-4346)||(13722392-13722446)
chr3 (1-34)||(5818819-5818852)
chr3 (258-295)||(42589352-42589389)
chr3 (1-33)||(5823581-5823613)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (251-4359)||(9439921-9444030)
chr8 (354-1951)||(24594424-24596021)
chr8 (2035-4255)||(24596102-24598316)
chr8 (4297-4346)||(87218-87267)
chr8 (4299-4346)||(19803179-19803226)
chr8 (258-295)||(24594367-24594404)
chr8 (1-33)||(9439678-9439710)
chr8 (1-33)||(9444398-9444430)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (259-4359)||(825858-829958)
chr2 (259-1239)||(28714582-28715550)
chr2 (258-1569)||(13840763-13842061)
chr2 (3389-4359)||(13842766-13843735)
chr2 (3170-3554)||(15603853-15604237)
chr2 (3279-3656)||(15603315-15603691)
chr2 (1630-1990)||(13842065-13842424)
chr2 (3062-3332)||(13842485-13842755)
chr2 (3629-3766)||(15603691-15603828)
chr2 (1-102)||(5198961-5199062)
chr2 (1514-1553)||(17455350-17455389)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (263-1431)||(27877-29045)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (2776-4359)||(8136818-8138402)
chr7 (263-1127)||(2323956-2324791)
chr7 (861-1648)||(7506016-7506802)
chr7 (1615-1954)||(2324789-2325127)
chr7 (4025-4359)||(25441138-25441478)
chr7 (354-868)||(7504696-7505210)
chr7 (256-822)||(22509836-22510398)
chr7 (2581-2781)||(8134716-8134907)
chr7 (355-484)||(37957033-37957162)
chr7 (4297-4346)||(11712072-11712121)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (742-1314)||(34972958-34973530)
chr1 (1382-1826)||(34972298-34972738)
chr1 (1658-1833)||(11926865-11927040)
chr1 (393-625)||(34973592-34973826)
chr1 (469-624)||(41413628-41413783)
chr1 (1878-1979)||(11927124-11927225)
chr1 (4297-4346)||(2796411-2796460)
chr1 (4297-4346)||(42376095-42376144)
chr1 (4148-4224)||(46344296-46344372)
chr1 (4297-4346)||(14476165-14476214)
chr1 (4297-4346)||(23201147-23201196)
chr1 (3775-3843)||(46452552-46452619)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (4297-4346)||(28822-28871)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 4163; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 4163; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 4359
Target Start/End: Complemental strand, 41723147 - 41718789
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723147 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 41723048  T
Q  101 attaccatagataatagccaaactgccaaccaatttatgttgacaatgttggcaccgaaaatctgaatggtaaattgcaaagcccttttgtcaaacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41723047 attaccatagataatagccaaactgccaaccaatttatgttgacaatgttggcaccgaaaatctgaatggtaaattgcaaaacccttttgtcaaacatgt 41722948  T
Q  201 attactgccatgtgaaaacatatcaacaaaaggtgactttatggcttatgtgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722947 attactgccatgtgaaaacatatcaacaaaaggtgactttatggcttatgtgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttc 41722848  T
Q  301 caaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41722847 caaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatcgacaccatacaaacttatcagcgttgatcggctttgtcat 41722748  T
Q  401 tacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttc 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41722747 tacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttc 41722648  T
Q  501 gtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccatta 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41722647 gtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccatta 41722548  T
Q  601 acctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaacca 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722547 acctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaacca 41722448  T
Q  701 acttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagtt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41722447 acttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagtt 41722348  T
Q  801 aactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgcca 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722347 aactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgcca 41722248  T
Q  901 taaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgaga 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722247 taaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgaga 41722148  T
Q  1001 catttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttg 1100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722147 catttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttg 41722048  T
Q  1101 aagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctg 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722047 aagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcatgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctg 41721948  T
Q  1201 gtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaa 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721947 gtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaa 41721848  T
Q  1301 cagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaat 1400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721847 cagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgctgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaat 41721748  T
Q  1401 ctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggtt 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721747 ctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggtt 41721648  T
Q  1501 ggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacac 1600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41721647 ggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaagatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacac 41721548  T
Q  1601 tactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgatac 1700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721547 tactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgatac 41721448  T
Q  1701 cgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgt 1800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721447 cgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgt 41721348  T
Q  1801 tcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttc 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721347 tcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttc 41721248  T
Q  1901 agttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgaca 2000  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41721247 agttataagacaatatgcatcatggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccatcattgaca 41721148  T
Q  2001 tcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgc 2100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721147 tcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgc 41721048  T
Q  2101 tgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatacccctt 2200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721047 tgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatacccctt 41720948  T
Q  2201 aacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaa 2300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720947 aacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaa 41720848  T
Q  2301 acatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacagg 2400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720847 acatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacagg 41720748  T
Q  2401 cggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccac 2500  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720747 cggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccac 41720648  T
Q  2501 accattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattg 2600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  41720647 accattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctatatattctcctccatta 41720548  T
Q  2601 tctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggt 2700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720547 tctgtcctcaagcacttaattttcttcctagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggt 41720448  T
Q  2701 acacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaa 2800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720447 acacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacaaaatatcttgctcctcctagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaa 41720348  T
Q  2801 gtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttg 2900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41720347 gtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctcacaaaatggtaaatttactgccttg 41720248  T
Q  2901 agcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttg 3000  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720247 agcccgtgaaggagattgcgttccgcaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttg 41720148  T
Q  3001 ctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgccttt 3100  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720147 atgctgcaactgatgcatcggcctcttgcaacgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgccttt 41720048  T
Q  3101 cactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgc 3200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720047 cactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgc 41719948  T
Q  3201 actccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatc 3300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719947 actccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatc 41719848  T
Q  3301 cttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttc 3400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719847 cttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttc 41719748  T
Q  3401 gcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctct 3500  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41719747 gcctttagaactggttgctgcctcgctatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctct 41719648  T
Q  3501 ccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccat 3600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719647 ccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttaatattcttctttcttcgagattttgacctaccat 41719548  T
Q  3601 gattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattctt 3700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719547 gattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattctt 41719448  T
Q  3701 gcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatac 3800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719447 gcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagttatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatac 41719348  T
Q  3801 gaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttga 3900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719347 gaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttga 41719248  T
Q  3901 tgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttat 4000  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719247 tgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttat 41719148  T
Q  4001 tagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatcc 4100  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719147 tagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatcc 41719048  T
Q  4101 atctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaa 4200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41719047 atctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctagacaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccata 41718948  T
Q  4201 gggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaatt 4300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718947 gggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaatt 41718848  T
Q  4301 cttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718847 cttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 41718789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 3360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 548 - 4209
Target Start/End: Complemental strand, 34356200 - 34352542
Alignment:
Q  548 actgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatg 647  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34356200 actgtcacaatacacagtaattttctcttgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatg 34356101  T
Q  648 tactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 747  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34356100 tactcagcttctgtcgttgacagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 34356001  T
Q  748 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaat 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34356000 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacatactgcaacacctaaggttcctttaat 34355901  T
Q  848 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355900 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 34355801  T
Q  948 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 1047  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355800 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 34355701  T
Q  1048 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 1147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355700 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 34355601  T
Q  1148 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 1247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355600 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 34355501  T
Q  1248 tcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtac 1347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34355500 tcctggactcgaactttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattgccatcaaaccttttgtagtacgtac 34355401  T
Q  1348 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagattt 1447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34355400 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagattt 34355301  T
Q  1448 ggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 1547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355300 ggtcaacctgcaaaccaggttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatctaaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 34355201  T
Q  1548 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 1647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355200 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgataatagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 34355101  T
Q  1648 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 1747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355100 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 34355001  T
Q  1748 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 1847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355000 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 34354901  T
Q  1848 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgatt 1947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354900 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgatt 34354801  T
Q  1948 gccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatc 2047  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  34354800 gccaagacggtttctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatatggttcttgttctccgtgcatcggttcagcttcagaagaatc 34354701  T
Q  2048 actttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactaca 2147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354700 actttctttggatttttcttccatctgcattatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactaca 34354601  T
Q  2148 tccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggt 2247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34354600 tccctgctaacaataaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacattttctgaactttgggt 34354501  T
Q  2248 ccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccat 2347  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354500 ccaacttcgttctgtcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaacacatgtagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccat 34354401  T
Q  2348 cggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgtt 2447  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34354400 tggtgtcttcaaatcaattgtcgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcctgctgtt 34354301  T
Q  2448 ttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaatac 2547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354300 ttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccgcaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaatac 34354201  T
Q  2548 cctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttg 2647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34354200 cctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttg 34354101  T
Q  2648 tgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtat 2747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354100 tgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtat 34354001  T
Q  2748 cttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatc 2847  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34354000 cttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttttagtagttactctagcaaacttcaatc 34353901  T
Q  2848 tatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttc 2947  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34353900 tatgttgcttgcttatcacacagtgctcacaaaatggtaaatttactgccttgagcccgtgaaggagattgcgttcagcaaggactttcaagccacgttc 34353801  T
Q  2948 tgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagc 3047  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||    
T  34353800 tgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgctgtttcttcttggcttgatgctgcaactgatgcatcgacctcttgcaacgtatcccctagaagc 34353701  T
Q  3048 atgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagat 3147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353700 atgtatagattacttgtgatcttttctgcttttatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagat 34353601  T
Q  3148 catccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgat 3247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34353600 catccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaagagtaccatcatgcatctttaatctgat 34353501  T
Q  3248 agtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtc 3347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34353500 agtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtc 34353401  T
Q  3348 atgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcat 3447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34353400 atgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgttgcctcgctatacaggatttccccgtcat 34353301  T
Q  3448 ctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcat 3547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34353300 ctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcaaaattcttctctccattcttcttgatattccaacactc---ctttacgtgccctttcat 34353204  T
Q  3548 gccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtc 3647  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353203 gccacaaccgtaacatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactagggccacgttccgttgatctgcctctcgtc 34353104  T
Q  3648 atcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagt 3747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353103 atcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagt 34353004  T
Q  3748 gaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgc 3847  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34353003 gaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattctccgc 34352904  T
Q  3848 tattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagc 3947  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34352903 tattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagc 34352804  T
Q  3948 cttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttg 4047  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34352803 cttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccaaatctcctttgccgtcttcttttcagcaatacttg 34352704  T
Q  4048 acaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctat 4147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34352703 acaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaggtctgccatctat 34352604  T
Q  4148 tgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaat 4209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34352603 tgcgtctaagcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaat 34352542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41718421 - 41718154
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718421 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 41718322  T
Q  101 attaccatagataatagccaaactgccaaccaatttatgttgacaatgttggcaccgaaaatctgaatggtaaattgcaaagcccttttgtcaaacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41718321 attaccatagataatagccaaactgccaaccaatttatgttgacaatgttggcaccgaaaatctgaatggtaaattgcaaaacccttttgtcaaacatgt 41718222  T
Q  201 attactgccatgtgaaaacatatcaacaaaaggtgactttatggcttatgtgttcacacatgttcaca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718221 attactgccatgtgaaaacatatcaacaaaaggtgactttatggcttatgtgttcacacatgttcaca 41718154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 260 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 34359667 - 34359375
Alignment:
Q  260 atgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34359667 atgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcattcaaagtatctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggat 34359568  T
Q  360 cgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctcta 459  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  34359567 cgacaccatataaacttgtcagcgttgatcggctttgtcattacatccgctaggttatcattggtgtgaatcttttgcatatccacgcttccctcctcca 34359468  T
Q  460 ctacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgt 552  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34359467 ctacttctcgaacaaaatgatattgaacgccaatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgtaaggcactctgactgt 34359375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3322 - 3815
Target Start/End: Original strand, 31502110 - 31502590
Alignment:
Q  3322 agtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgc 3421  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  31502110 agtaaaaccaatcttggtatggagtcatgttcgatgtcacacctgaatctattgtccatacatcgttgagtcgtctctcgcctttataactagttgttgc 31502209  T
Q  3422 ttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaa 3521  Q
    ||   |||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||| || ||   |||||||    
T  31502210 tttgatatcattgatttcattatcatctgaggtacttgcaacacatccttcagatgttaaagcttcaaaactcttctctccatttttattatcattccaa 31502309  T
Q  3522 cactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggc 3621  Q
    ||||| || |||| ||| ||| | || ||| |    |||||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||     
T  31502310 cactcattgtttaagtgacctcttataccatagttatagcatttgagattcatttttcttccaatttttgacctaccaagatattgactccctttggggt 31502409  T
Q  3622 cacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaag 3721  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  31502410 cacgttccgtttatatgcctctcgtcatcgttaaagcctctgctttctttgaactcttcgacctttcttccttattcttacatctagattcttcttcaag 31502509  T
Q  3722 gattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactc 3815  Q
     |||||  |  || |||||             ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31502510 aattgcctcaacgtcatca-------------tatcatctatattattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatcttgtaaactc 31502590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 3722 - 4225
Target Start/End: Complemental strand, 23319308 - 23318806
Alignment:
Q  3722 gattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagt 3821  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  23319308 gattgcatcagcaacatcatcaaaatgaagagagtcagcaatattgttgtttgtaatgttgatgatgagttgttcatatgaatgaggtaaactctgaagt 23319209  T
Q  3822 agaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtgg 3921  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||  ||| ||| || || ||||| |||| |||||| ||||| | ||| || |||||||  ||||  ||| |||    
T  23319208 agaagttttgcacgttcattttcagctatcatgacatctgaggctgtgagctgagcaaatagtgtatttatggtatttatgtgatttgttattgatatgg 23319109  T
Q  3922 attcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctt 4021  Q
    | |||  ||||   |||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||    
T  23319108 actcatacattcagagagtgtagaacctcctttttaagaaaattcttgcgtgaagtgatttgacctcgtacaatttaataagagcatcttagatctcctt 23319009  T
Q  4022 tgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtca 4121  Q
    ||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||  ||     
T  23319008 tgcagactttttctctgcaatacttgacaataccgagtttgtcattgctaagtgaaaattggcaacatcgttgtcatccatctctttccacttttgatcg 23318909  T
Q  4122 gtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttga 4221  Q
    |||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||   |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  23318908 gtgatatctgcaggttcaccatcaattgcgtctacgcaattttctttt-ttagaaccacccttatctttaatttccacagtgagaaattactcccattaa 23318810  T
Q  4222 actt 4225  Q
    ||||    
T  23318809 actt 23318806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1658 - 1966
Target Start/End: Original strand, 7778168 - 7778475
Alignment:
Q  1658 ttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatg 1757  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7778168 ttctttatgagcatattattttaccaccggtcttggacgatacggttccacttcatcactaccctcacatttgatcttgtatatccatttgtttcgaatg 7778267  T
Q  1758 gctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccg 1857  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||       
T  7778268 gctttttgaccttttgaaagttcaacaagatcacatgtcttgtttctatgtaagtccttcatatcttcatgcattgttatcatctattaagaagcatttt 7778367  T
Q  1858 aaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacgg 1957  Q
    |||  || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||  | |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  7778368 aactgtttaacgtctcttg-aaagttgaaggttcaccttcttcggttagaagacaatatgaattgtgcctcattataacatagtttgatttccaagatgg 7778466  T
Q  1958 tttctgcgt 1966  Q
    ||| |||||    
T  7778467 tttttgcgt 7778475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 34352259 - 34352226
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34352259 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 34352226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 34359967 - 34359934
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34359967 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 34359934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 3939; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 3939; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 261 - 4359
Target Start/End: Original strand, 48697661 - 48701759
Alignment:
Q  261 tgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697661 tgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagctctcaaaatctctctaccttgccgacttcggttgctacgtttccaataggccatacgaggatc 48697760  T
Q  361 gacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctac 460  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697761 gacaccatacaaacttatcagcgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctac 48697860  T
Q  461 tacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatac 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48697861 tacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatac 48697960  T
Q  561 acagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctg 660  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697961 acagtaatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctg 48698060  T
Q  661 tcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatg 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698061 tcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatg 48698160  T
Q  761 atcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgatt 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698161 atcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgatt 48698260  T
Q  861 ctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcat 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698261 ctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcat 48698360  T
Q  961 acataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcac 1060  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698361 acataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcac 48698460  T
Q  1061 aggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctttt 1160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698461 aggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctttt 48698560  T
Q  1161 ctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgat 1260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698561 ctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgat 48698660  T
Q  1261 ctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaact 1360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698661 ctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaact 48698760  T
Q  1361 aagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaa 1460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48698761 aagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaa 48698860  T
Q  1461 accaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagct 1560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48698861 accaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagct 48698960  T
Q  1561 gttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttc 1660  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698961 gttcaagatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttc 48699060  T
Q  1661 tttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggct 1760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699061 tttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggct 48699160  T
Q  1761 ttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaac 1860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699161 ttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaac 48699260  T
Q  1861 cattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggttt 1960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699261 cattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcatggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggttt 48699360  T
Q  1961 ctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggat 2060  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699361 ctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggat 48699460  T
Q  2061 ttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaa 2160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699461 ttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaa 48699560  T
Q  2161 caaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgtttt 2260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48699561 caaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttct 48699660  T
Q  2261 ttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaa 2360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699661 ttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaa 48699760  T
Q  2361 tcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctc 2460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699761 tcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctc 48699860  T
Q  2461 ttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttaca 2560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699861 ttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttaca 48699960  T
Q  2561 aaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgcc 2660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699961 aaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgcc 48700060  T
Q  2661 ttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctccca 2760  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700061 ttgaatactggaaacacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctccca 48700160  T
Q  2761 gagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttact 2860  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48700161 gagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgct 48700260  T
Q  2861 catcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcct 2960  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48700261 tatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcct 48700360  T
Q  2961 agtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattac 3060  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48700361 agtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattac 48700460  T
Q  3061 ttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtcc 3160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700461 ttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtcc 48700560  T
Q  3161 aacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactcca 3260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700561 aacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactcca 48700660  T
Q  3261 gcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttg 3360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700661 gcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttg 48700760  T
Q  3361 cacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgc 3460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700761 cacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgc 48700860  T
Q  3461 aacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtag 3560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700861 aacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtag 48700960  T
Q  3561 catttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcct 3660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700961 catttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcct 48701060  T
Q  3661 ctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagc 3760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48701061 ctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagt 48701160  T
Q  3761 tatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatca 3860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701161 tatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatca 48701260  T
Q  3861 gaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaaga 3960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48701261 gaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaaga 48701360  T
Q  3961 atattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtc 4060  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701361 atattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtc 48701460  T
Q  4061 cgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaa 4160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  48701461 cgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctagacaa 48701560  T
Q  4161 ttatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacacc 4260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701561 ttatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacacc 48701660  T
Q  4261 aaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701661 aaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 48701759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 3857; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 251 - 4359
Target Start/End: Complemental strand, 42270390 - 42266282
Alignment:
Q  251 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggcca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42270390 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagtattcaaagtctctctaccttgccaactctagttgctacgtttccaataggcca 42270291  T
Q  351 tacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttc 450  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42270290 tacaaagatcgacaccatataaacttgtcagtgttgatcgactttgtcattgcatctgctaggttatcattagtgtgaatcttctgcatatccacgcttc 42270191  T
Q  451 cctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgact 550  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42270190 cttcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgact 42270091  T
Q  551 gtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtac 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42270090 gtcacaatacacagtaatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtac 42269991  T
Q  651 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269990 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 42269891  T
Q  751 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269890 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 42269791  T
Q  851 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269790 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 42269691  T
Q  951 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 1050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269690 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 42269591  T
Q  1051 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 1150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269590 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 42269491  T
Q  1151 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcc 1250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269490 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaagatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcc 42269391  T
Q  1251 tggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaat 1350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269390 tggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaat 42269291  T
Q  1351 ggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggt 1450  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42269290 ggtctgaactaagtctgctgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggt 42269191  T
Q  1451 caacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtcttt 1550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269190 caacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtcttt 42269091  T
Q  1551 acatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagt 1650  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269090 acatctagctgttcaagatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagt 42268991  T
Q  1651 caataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtt 1750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268990 caataccttctttctgagcatatccttttacaaccagccttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtt 42268891  T
Q  1751 tccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaa 1850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268890 tccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaa 42268791  T
Q  1851 gcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcc 1950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42268790 gcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgcc 42268691  T
Q  1951 aagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcact 2050  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42268690 aagatggtttctgcgtttgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcact 42268591  T
Q  2051 ttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatcc 2150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268590 ttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactacatcc 42268491  T
Q  2151 ctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtcca 2250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268490 ctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtcca 42268391  T
Q  2251 acttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcgg 2350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268390 acttcgttctttcttgggagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcgg 42268291  T
Q  2351 tgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttc 2450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268290 tgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttc 42268191  T
Q  2451 agcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccct 2550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268190 agcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccct 42268091  T
Q  2551 cttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgc 2650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42268090 cttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgc 42267991  T
Q  2651 tttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatctt 2750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267990 tttgaatgccttgaatactggaaacacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatctt 42267891  T
Q  2751 gctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctat 2850  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267890 gctcctcccagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctat 42267791  T
Q  2851 gttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctga 2950  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42267790 gttgcttgcttatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcaga 42267691  T
Q  2951 catatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatg 3050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267690 catatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatg 42267591  T
Q  3051 tataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcat 3150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267590 tatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcat 42267491  T
Q  3151 ccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagt 3250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267490 ccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagt 42267391  T
Q  3251 accgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatg 3350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42267390 accgactccagcaatttctaaggcatggtcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatg 42267291  T
Q  3351 tgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctg 3450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267290 tgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctg 42267191  T
Q  3451 aggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgcc 3550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267190 aggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgcc 42267091  T
Q  3551 acaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatc 3650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267090 acaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatc 42266991  T
Q  3651 gtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaa 3750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266990 gtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaa 42266891  T
Q  3751 gagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctat 3850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266890 gagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctat 42266791  T
Q  3851 tttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagcctt 3950  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42266790 tttgaaatcagaagctgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagcctt 42266691  T
Q  3951 ctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgaca 4050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266690 ctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgaca 42266591  T
Q  4051 ataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgc 4150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42266590 ataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgc 42266491  T
Q  4151 gtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatg 4250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42266490 gtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaatttctctatctcaaatttcgctgccatg 42266391  T
Q  4251 gttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaa 4350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266390 gttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaa 42266291  T
Q  4351 gatttttct 4359  Q
    |||||||||    
T  42266290 gatttttct 42266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 3799; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 261 - 4359
Target Start/End: Original strand, 30946023 - 30950121
Alignment:
Q  261 tgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatc 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946023 tgttcacagtctcccacttaaagtcacttttgtgagctctcaaaatctctctaccttaccgacttcggttgctacgtttccaataggccatacgaggatc 30946122  T
Q  361 gacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctac 460  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946123 gacaccatacaaacttatcagcgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctac 30946222  T
Q  461 tacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatac 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946223 tacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatac 30946322  T
Q  561 acagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctg 660  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946323 acagtaatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctg 30946422  T
Q  661 tcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatg 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946423 tcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgtaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatg 30946522  T
Q  761 atcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgatt 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946523 atcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgatt 30946622  T
Q  861 ctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcat 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946623 ctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcat 30946722  T
Q  961 acataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcac 1060  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946723 acataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcac 30946822  T
Q  1061 aggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctttt 1160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946823 aggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctttt 30946922  T
Q  1161 ctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgat 1260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946923 ctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgat 30947022  T
Q  1261 ctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaact 1360  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947023 ctttattggggcctaccaccaatatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaact 30947122  T
Q  1361 aagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaa 1460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30947123 aagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaa 30947222  T
Q  1461 accaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagct 1560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30947223 accaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttgaagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagct 30947322  T
Q  1561 gttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttc 1660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947323 gttcaagatgtaaatccaatgcagcacacattgccaacactactctaatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttc 30947422  T
Q  1661 tttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggct 1760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30947423 tttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttatatacccatttgtttccaatggct 30947522  T
Q  1761 ttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaac 1860  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30947523 tttcgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcttacgtaaggcctccatttcttcatgtattgctgtcatccattgagaagcatctgaac 30947622  T
Q  1861 cattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggttt 1960  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30947623 cattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagctataagacaatatgcatcgtggcccgtcataacatagtctgattgccaagatggttt 30947722  T
Q  1961 ctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggat 2060  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947723 ctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggat 30947822  T
Q  2061 ttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaa 2160  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947823 ttttcttctatctgcagaatagcagtctctttaaaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaa 30947922  T
Q  2161 caaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgtttt 2260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30947923 caaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctagactttgggtccaacttcgttct 30948022  T
Q  2261 ttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaa 2360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30948023 ttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaa 30948122  T
Q  2361 tcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctc 2460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30948123 tcaatcgtcgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccatttccgctgttttcagcatagctc 30948222  T
Q  2461 ttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttaca 2560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948223 ttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttaca 30948322  T
Q  2561 aaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgcc 2660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948323 aaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgcc 30948422  T
Q  2661 ttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctccca 2760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948423 ttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctagaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctccca 30948522  T
Q  2761 gagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttact 2860  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30948523 gagataattttggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgct 30948622  T
Q  2861 catcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcct 2960  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948623 tatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcct 30948722  T
Q  2961 agtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattac 3060  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30948723 agtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaaccgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattac 30948822  T
Q  3061 ttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtcc 3160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948823 ttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcactgtggatcttacacccgagatcatccaattgtcc 30948922  T
Q  3161 aacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactcca 3260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948923 aacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactcca 30949022  T
Q  3261 gcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttg 3360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949023 gcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacactgatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttg 30949122  T
Q  3361 cacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgc 3460  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949123 cacctgaatccattatccatacatcgttgagttgtctttcgccttcagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgc 30949222  T
Q  3461 aacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtag 3560  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949223 aacacatccttgagatgttgtagcttcagaattcttctctccattcttcttattattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtag 30949322  T
Q  3561 catttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcct 3660  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949323 catttgatattattctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcct 30949422  T
Q  3661 ctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagc 3760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949423 ctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttccgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagc 30949522  T
Q  3761 tatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatca 3860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949523 tatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctggagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatca 30949622  T
Q  3861 gaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaaga 3960  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30949623 gaagctgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaaga 30949722  T
Q  3961 atattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtc 4060  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949723 atattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtctttttttcagcaatacttgacaataccgagtc 30949822  T
Q  4061 cgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaa 4160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30949823 cgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggcaa 30949922  T
Q  4161 ttatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacacc 4260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949923 ttatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaattttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacacc 30950022  T
Q  4261 aaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30950023 aaatatttttcattcaaactagaccggagtaataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 30950121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 745; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1843
Target Start/End: Complemental strand, 2003267 - 2001772
Alignment:
Q  354 gaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccct 453  Q
    |||||||||||||||  ||| || |||   ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  2003267 gaggatcgacaccatgtaaatttgtcaacattgattgactttgtcataacatctgctaaattgtctttggtgtgaattttctgcatatcaacactccctt 2003168  T
Q  454 cctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtc 553  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || || || ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2003167 tctctaccacttctcgaacaaaatggtattgaacatctatgtgttttgttctcgaatgaaagaatggattccttgcaatatgcaatgcactctaactgtc 2003068  T
Q  554 acaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactcc 653  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| || ||     
T  2003067 acaatacacaacaatttgttgttgactgtgcccgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcatagctgccatatattca 2002968  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
    |||||||| || || |||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2002967 gcttctgtagtagatagagctacgacagattgtaattttgacaaccaacttactgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttt 2002868  T
Q  754 tatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacct 853  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || ||    
T  2002867 tatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatct 2002768  T
Q  854 catgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatc 953  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2002767 caggattctcttaacagcatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatc 2002668  T
Q  954 atggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaa 1053  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||     
T  2002667 atggcatacataaggcttcccaccactgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcatactggaggataatttat 2002568  T
Q  1054 aattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcct 1153  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2002567 aattgataggaagtggggtagatattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaaaacttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcct 2002468  T
Q  1154 gtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctgg 1253  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |    
T  2002467 atcttttctatctcgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggccccaagtccttcatatcgaactccctagccaattgtgcctttaattcttag 2002368  T
Q  1254 actcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggt 1353  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2002367 acttgatctttgttgggtcctaccaccaacatgtcatccacaaacaacaacaaaatgataaaatcattattaccaaacctattgtagtatgtacaatggt 2002268  T
Q  1354 ctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaa 1453  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||    
T  2002267 ctgaattaagtctgttgtatccaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcctattttagactgtacatagaattggtcaa 2002168  T
Q  1454 cctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagca------tataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 1547  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  2002167 cctgcaaaccaagttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggttggagcatatatatatatatttcttcttcaagctctccgtgaagaaaagcagtt 2002068  T
Q  1548 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 1647  Q
    |||||||| |  |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  2002067 tttacatctaattgttcaagatataaatcaaacgcagcacacatagccaaaactattctgatggtagtgagtctaacaactggggagaatatttcattga 2001968  T
Q  1648 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 1747  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2001967 aatcaatacattctttctgagcataccctttaaccaccaatcttgcacgatatcgttctacttgatcattactatctcgtttgatcttgtatacccattt 2001868  T
Q  1748 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatcca 1843  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2001867 gttcccgatggctttccgacccttgggaagttgaacaagttcccaacttttgtttctatgtaaggcttccatttctttatgcattgctgccatcca 2001772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2096 - 3906
Target Start/End: Complemental strand, 2001521 - 1999723
Alignment:
Q  2096 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacat--ccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 2193  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  2001521 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccacaagcgat 2001422  T
Q  2194 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 2293  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |  || ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |||    
T  2001421 accccttcacgttgtcagcataacccaagaatatacaatttctagactttggatctagttttgttctttcttgggagttgttcattgcgtacacaataca 2001322  T
Q  2294 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 2393  Q
     || || ||||  |  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||     
T  2001321 tccgaacacatataaggaagaataatcaggtggctttccgttccaaatctccattggtgttttcaaaccaattgcggttgatggagatcgattgatcacg 2001222  T
Q  2394 taacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 2493  Q
    ||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||| ||| | |||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2001221 taataggcagttttcacagcttctgcccagaaagacttagccactcctgttgttctcaacatggctcttgttctatataggagagttatattcatccgct 2001122  T
Q  2494 ctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 2593  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||        |||| || ||||||||||||||| |    
T  2001121 ctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaattgtcttgtaataccttcatgtttgca--------gaaagtcaccatctacatattctgc 2001030  T
Q  2594 tccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttg 2693  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| | ||   ||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2001029 tccattgtttgttcttaagcactttattcttttactagtttcaagttccacgtgtgctttgaattccttgaatactgtaaacacatttgacttcttcttg 2000930  T
Q  2694 attgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaat 2793  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2000929 attgggtacacccataatctcctagagtggtcatcaataaatgacacaaaatattttgctcctcccatggatatttgtggcgactcccacacatcagaat 2000830  T
Q  2794 gtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttac 2893  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |     
T  2000829 gtattaagtcaagtatgtatttgcttctagtagttactatagaaaacttcaatctatgttgcttgcttgtcacacagtgctcacagaaagacaaattcat 2000730  T
Q  2894 tgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttct 2993  Q
    ||||||||||||  | || |||||  ||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  2000729 tgtcttgagcccaggtagaagattttgttccgcaagagctttcaaaccatgttccgacatatggcctagtttgtgatgccacaccattgtcatttcttct 2000630  T
Q  2994 tggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagat 3093  Q
    ||||||||| |  ||    ||||||  || ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  2000629 tggcttgctacaacagtcaatgcattagcatcttgcaatatatcccccacaagcatgtatagattatttgtgagcttttctgctttcatcaccacgaggt 2000530  T
Q  3094 tgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttac 3193  Q
    | || || |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  2000529 ttccctttactacttttaagtttccaccttgagtgtggatcttgcatccgaggtcatccaattgcccaatagacaataaattcttcttcaagtcctttat 2000430  T
Q  3194 atgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtac 3293  Q
     ||||| || ||||||||||| | || ||||||| ||||  |||||| | |||||||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||||| |     
T  2000429 gtgacgtaccccttgtattttgcgaatagtaccagcatgtgtctttattttgatagtaccaatcccaacaacttctaaagtgtgatcattgcccatgaat 2000330  T
Q  3294 acagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtc 3393  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||   |||||||||||| || ||||| || ||| | |||| ||||||  |||| ||||| |    
T  2000329 acagatcattccgagataggttcataggtgcaaaaccaatccttgtgtggagtcatatgtcatgtggcgcctaagtccactatccaaccatcattgag-c 2000231  T
Q  3394 gtcttt-cgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaat 3492  Q
    |  ||| | |||||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||      
T  2000230 gcatttccacctttagaactaattgctactctgctatacaagatttctccatcatctgaggtacttgcaacacaaccttgagaggttgacgcttctgatg 2000131  T
Q  3493 tcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttga 3592  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  2000130 tcttctctccattccttttgttgttccaacactccctcttataatgccctctcataccacaactgtagcatttgaaattcttccttctctgagattttga 2000031  T
Q  3593 cctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttcc 3692  Q
     |||||| ||| |||||||||||| |  || || || |||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||      ||| |||||||||||    
T  2000030 tctaccacgatcttgactcccactagatcctcgctctgttgatctgcctctcgccatcactaaagtctctgcttgcttt------tctaacctttcttcc 1999937  T
Q  3693 ttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagtt 3792  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| || || |   ||||||| |||||||||||||    
T  1999936 ttattcttgcgtctagattcttcttcaataattgcaccagcaacatcatcaaaatgaagagagtcagcaatattgtatattgtaatattgatgatgagtt 1999837  T
Q  3793 gatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcag 3892  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||     
T  1999836 gatcatatgaatcaggtaaactctgaagtagaagttctgcacgttcattttcagctattgtgaaatctgaggctgtgagttgaggaaatagtgtattcat 1999737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3044 - 4275
Target Start/End: Original strand, 21513658 - 21514893
Alignment:
Q  3044 aagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccg 3143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||| ||   |    
T  21513658 aagcatgtataaattacttgtcatcttttctgcttttatcaccacaagattatctttcaccacttttaagattccactttcatcatggatcttgcattag 21513757  T
Q  3144 agatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatc 3243  Q
    || | | ||||||     |  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||     
T  21513758 agttgacccaatttctttagcgacaataaattctttttgaacccatttacatgacttaccccatgtattttgcaaacaataccatcatgtatctttaatg 21513857  T
Q  3244 tgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtgg 3343  Q
    | |||||  |||||||| ||||||| |  | ||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  21513858 taatagtgacgactccaacaatttcaacagtatagtcattttatgtgtacacaattccttatgagatcagctaataagagaaaaatcaatctcagtgtag 21513957  T
Q  3344 agtcatgtgcca-------tgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggat 3436  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  21513958 agtcatgtgccaattgccatgttgcacctgaatccattatccaaatatcgttgagacttcttctacctttagaactagttattgcttcgctatacaagat 21514057  T
Q  3437 ttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacg 3536  Q
    ||| || |||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||  || | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||   ||      
T  21514058 ttcaccatcatctaaggtgcttccaatgcatccttgagatgttgaaacttcaaaagtattttctccatccttgttattattccaccactcctt---taaa 21514154  T
Q  3537 tgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatc 3636  Q
    || ||||||||||||  |   |||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||   || | ||  |||||||    
T  21514155 tgtcctttcatgccatgattttagcatttgagatccttccttctacgagattttgacctattatcattttgactcccactgcaacctcattttgttgatc 21514254  T
Q  3637 tgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgac 3736  Q
    || |||| || |||  |||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||  ||||| | ||| |    
T  21514255 tgtctcttgttatcaccaaagccagt--ttgcattgaactctctgacctttcttacttattcttgaatttggattcatcttcaagatttgcaacagcggc 21514352  T
Q  3737 atcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgc 3836  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |  |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  || ||||||||||| | | | |    
T  21514353 atcatcaaaatgaagggtatcaaccacattatcattgataatgttgacgatgagtttatcatacaaatctgataaaaactaaagtagaagtttaactctc 21514452  T
Q  3837 tcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaa 3936  Q
    ||| |||||| |||| ||||||  ||||  || |||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||   |   ||||||||| |||| |||    
T  21514453 tcactttccgttattctgaaatttgaagttgtaagttggaaaaataacgtatttagggtattgatgtgatatgttgttgtcttggattcactcattcgaa 21514552  T
Q  3937 gagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttc 4036  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  | |  ||||| |||| |||||| |||||    
T  21514553 gagtgtagagccttatttttaagaatattcagttgtgaagtaatttgacctcgttcaattttactagagtgcctcgtatctcatttgttgtctttttttc 21514652  T
Q  4037 --agcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaa 4134  Q
      |  ||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||  | |||||||||||||| |||||  ||||  |||    
T  21514653 ccaataatacttgacaatattgaatccaccattgcaaggtgcaaatttgcaacaacattgtcttcattttctttccacttttcatcagtcgtatccacaa 21514752  T
Q  4135 gtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctc 4234  Q
    || |||| | |||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21514753 gtttgccttttatcacgtttaggcaattattttttctcaaaattgcccttatctacaatttccacaaggaaaaatttctcccattgaacttctctatctc 21514852  T
Q  4235 aaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 4275  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21514853 aaatttcgttgccatggttttgcaccaaatatttttttttc 21514893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3957 - 4225
Target Start/End: Complemental strand, 1999695 - 1999427
Alignment:
Q  3957 aagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccg 4056  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||    
T  1999695 aagaaaattcttgtgtgaagtgacttgacctcgtacaatttaataagagcatcccatatctcctttgcagactttttctctggaatacttgacaataccg 1999596  T
Q  4057 agtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctag 4156  Q
    | |  |||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  1999595 aatttgccattgctaagtgcaaattggtaacagcgttgtcatccatctctttccacttttgatcagtgatatttgcaggtctgccatcaattgcatctag 1999496  T
Q  4157 gcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaactt 4225  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  1999495 gcaattgtcttttcttagaaccgcccttatctttaatttccaaagtgagaaattactcccattaaactt 1999427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 48702127 - 48702228
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||    
T  48702127 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcattt 48702226  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  48702227 at 48702228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 48697438 - 48697539
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||    
T  48697438 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaataatgcaagggacatgctatttatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcattt 48697537  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  48697538 at 48697539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 30945803 - 30945901
Alignment:
Q  4 ttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcatttat 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||||    
T  30945803 ttgttctggtgttgttactaatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcatttat 30945901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 102
Target Start/End: Original strand, 30950517 - 30950607
Alignment:
Q  12 gtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcatttat 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||||    
T  30950517 gtgttgttactaatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcatttat 30950607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1639 - 1750
Target Start/End: Complemental strand, 30165573 - 30165462
Alignment:
Q  1639 tctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgta 1738  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||| || |  |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  30165573 tctcatggaagtcaatacattctttttgagcatattatttgaccattagtcttgcacaatatatttccacttggtcattgccatcatgtgtgatcttgta 30165474  T
Q  1739 tacccatttgtt 1750  Q
    ||||||||||||    
T  30165473 tacccatttgtt 30165462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4275 - 4359
Target Start/End: Complemental strand, 1979778 - 1979694
Alignment:
Q  4275 caaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||| | | || ||||||||||||||    
T  1979778 caaactagactggaataattagaattcgtttatgatgtggaatattagtctaaactgcaaccatataacaaactaagatttttct 1979694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 24520331 - 24520363
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24520331 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 24520363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1484 - 1567
Target Start/End: Original strand, 28608721 - 28608804
Alignment:
Q  1484 cttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaag 1567  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| || || ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  28608721 cttaaatccttctggttgaaccatgtagatctcttcatctaaatctccatgaagaaatgcagtctttacatccatttgttcaag 28608804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 42265914 - 42265883
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42265914 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggat 42265883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 42270633 - 42270602
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42270633 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggat 42270602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 3869; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 3869; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 251 - 4359
Target Start/End: Original strand, 27874539 - 27878647
Alignment:
Q  251 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggcca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27874539 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagtattcaaagtctctctaccttgccaactctagttgctacgtttccaataggcca 27874638  T
Q  351 tacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttc 450  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27874639 tacaaagatcgacaccatataaacttgtcagtgttgatcgactttgtcattgcatctgctaggttatcattagtgtgaatcttctgcatatccacgcttc 27874738  T
Q  451 cctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgact 550  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27874739 cttcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaatgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgact 27874838  T
Q  551 gtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtac 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27874839 gtcacaatacacagtaatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtac 27874938  T
Q  651 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874939 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 27875038  T
Q  751 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875039 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 27875138  T
Q  851 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875139 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 27875238  T
Q  951 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 1050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875239 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 27875338  T
Q  1051 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 1150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875339 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 27875438  T
Q  1151 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcc 1250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27875439 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattct 27875538  T
Q  1251 tggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaat 1350  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27875539 tggactcgatcttttttggggcctaccaccaatatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgttcaat 27875638  T
Q  1351 ggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggt 1450  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27875639 ggtcttaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagactttacagagatttggt 27875738  T
Q  1451 caacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtcttt 1550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27875739 caacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaaacagtcttt 27875838  T
Q  1551 acatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagt 1650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27875839 acatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccgtagaaaatatctcattgaagt 27875938  T
Q  1651 caataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtt 1750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875939 caataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgattccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtt 27876038  T
Q  1751 tccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaa 1850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876039 tccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaa 27876138  T
Q  1851 gcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcc 1950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876139 gcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcatggcttgtcataacatagtctgattgcc 27876238  T
Q  1951 aagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcact 2050  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876239 aagacggtttctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcact 27876338  T
Q  2051 ttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatcc 2150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876339 ttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatcc 27876438  T
Q  2151 ctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtcca 2250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876439 ctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtcca 27876538  T
Q  2251 acttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcgg 2350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876539 acttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcgg 27876638  T
Q  2351 tgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttc 2450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876639 tgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttc 27876738  T
Q  2451 agcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccct 2550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876739 agcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccct 27876838  T
Q  2551 cttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgc 2650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27876839 cttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgc 27876938  T
Q  2651 tttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatctt 2750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876939 tttgaatgccttgaatactggaaacacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatctt 27877038  T
Q  2751 gctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctat 2850  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877039 gctcctcccagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctat 27877138  T
Q  2851 gttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctga 2950  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27877139 gttgcttgcttatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcaga 27877238  T
Q  2951 catatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatg 3050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877239 catatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatg 27877338  T
Q  3051 tataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcat 3150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877339 tatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcat 27877438  T
Q  3151 ccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagt 3250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877439 ccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagt 27877538  T
Q  3251 accgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatg 3350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27877539 accgactccagcaatttctaaggcatggtcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatg 27877638  T
Q  3351 tgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctg 3450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877639 tgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctg 27877738  T
Q  3451 aggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgcc 3550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877739 aggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgcc 27877838  T
Q  3551 acaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatc 3650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877839 acaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatc 27877938  T
Q  3651 gtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaa 3750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877939 gtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaa 27878038  T
Q  3751 gagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctat 3850  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878039 gagtatcagttatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctat 27878138  T
Q  3851 tttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagcctt 3950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27878139 tttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagcctt 27878238  T
Q  3951 ctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgaca 4050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878239 ctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgaca 27878338  T
Q  4051 ataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgc 4150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27878339 ataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgc 27878438  T
Q  4151 gtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatg 4250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27878439 gtctagacaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatg 27878538  T
Q  4251 gttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaa 4350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878539 gttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaa 27878638  T
Q  4351 gatttttct 4359  Q
    |||||||||    
T  27878639 gatttttct 27878647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 1676; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 248 - 2145
Target Start/End: Original strand, 26976720 - 26978602
Alignment:
Q  248 atgtgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaatagg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26976720 atgtgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcattcaaagtttctctactttgccaacttcagttgctacgtttccaatagg 26976819  T
Q  348 ccatacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacac 447  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  26976820 ccatacgaggatcgacaccatataaacttgtcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctaggttatcattagtgtgaatcttttgcatatccacgc 26976919  T
Q  448 ttccctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctg 547  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976920 ttccctcctccactacttctcgaacaaaatgatattgaacacctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctg 26977019  T
Q  548 actgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatg 647  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26977020 actgtcacaatacacagtaattttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcacccagatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatg 26977119  T
Q  648 tactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 747  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977120 tactcagcttctgtcgttgacagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 26977219  T
Q  748 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaat 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977220 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaat 26977319  T
Q  848 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977320 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 26977419  T
Q  948 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 1047  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977420 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 26977519  T
Q  1048 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 1147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977520 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacaatcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 26977619  T
Q  1148 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 1247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977620 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 26977719  T
Q  1248 tcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtac 1347  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977720 tcttggacccgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtac 26977819  T
Q  1348 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagattt 1447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26977820 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagattt 26977919  T
Q  1448 ggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 1547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977920 ggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 26978019  T
Q  1548 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 1647  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978020 tttacatctagctgttcaagatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacactactttgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 26978119  T
Q  1648 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 1747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26978120 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccactttatcattgccattacgtttgatcttgtatacccattt 26978219  T
Q  1748 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 1847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978220 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 26978319  T
Q  1848 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgatt 1947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26978320 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaatttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgatt 26978419  T
Q  1948 gccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatc 2047  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||               | ||||||||||||||||||    
T  26978420 gccaagatggtttctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttct---------------ggttcagcttcagaagaatc 26978504  T
Q  2048 actttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagacta 2145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978505 actttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagacta 26978602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1284
Target Start/End: Original strand, 1472398 - 1473327
Alignment:
Q  354 gaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccct 453  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |  |    
T  1472398 gaggatcgacaccatgtaaatttgtcagcattgattgactttgtcataacatctgctaaattgtctttggtgtgaattttctgcatatcaacactccttt 1472497  T
Q  454 cctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtc 553  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || || || ||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1472498 tctctactacttctcgaacaaaatggtattgaacatctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattacatgcaatgtgcaatgcactctgactgtc 1472597  T
Q  554 acaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactcc 653  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  1472598 acaatacacaacaatttgttgttgactgtgcacgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcgtagctgccatatattca 1472697  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
    |||||||| || || |||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1472698 gcttctgtagtagagagagctacgacaatt-gtaattttgacaaccaacttactgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttt 1472796  T
Q  754 tatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacct 853  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || ||    
T  1472797 tatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacgataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatct 1472896  T
Q  854 catgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatc 953  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1472897 caggattctcttaacagcatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctgaccttgtacatatc 1472996  T
Q  954 atggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaa 1053  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||     
T  1472997 atggcatacataaggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcataccggaagataatttat 1473096  T
Q  1054 aattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcct 1153  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |  | ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1473097 aattgataggaagtggggtagatattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaaaacttttcggaaataatttctttgagaaagccaaatattcct 1473196  T
Q  1154 gtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctgg 1253  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  1473197 atcttttctatctcgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggacccaagtccttcatatcaaactccctggccaattgtgcctttaattcttgg 1473296  T
Q  1254 actcgatctttgttggggcctaccaccaaca 1284  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1473297 acttgatctttgttgggtcctaccaccaaca 1473327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3860 - 4359
Target Start/End: Complemental strand, 30968287 - 30967787
Alignment:
Q  3860 agaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaag 3959  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30968287 agaagccatgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgattcgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaag 30968188  T
Q  3960 aatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagt 4059  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968187 aatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagaatatcccagatctcctttaatgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagt 30968088  T
Q  4060 ccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggca 4159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30968087 ccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccgcttttcaacagtgatatctgcaggtctgccatctattgtgtctaggca 30967988  T
Q  4160 attatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacac 4259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30967987 attatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccacagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcgaatttcgctgccatggttttacac 30967888  T
Q  4260 caaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagttt-aaaccgcaaccacagagcatactaagatttttc 4358  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30967887 caaatatttttcattcaaactagaccagagtaataagaattcttttatgatgtggaagatcagtttaaaactccaaccacagagcatactaagatttttc 30967788  T
Q  4359 t 4359  Q
    |    
T  30967787 t 30967787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 394 - 1317
Target Start/End: Complemental strand, 21965725 - 21964817
Alignment:
Q  394 ttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctat 493  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |    
T  21965725 ttgtcattacatcttctaggttatcattggtgtgagcattctgcatatccacccttcattccttcactacttctcaaacaaaataatattgaacgcctgt 21965626  T
Q  494 gtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcc 593  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||| || ||||  |||| |    
T  21965625 gtgctccgttcttgaatgaaaagttggattccttgaaatgtgcaaggtactctgactgtca--atacacaataattcgttgctgcttatgcctaagttgc 21965528  T
Q  594 tccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttgg 693  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||   ||||||| | |||||   |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21965527 tcaattaaccttcgcatccaaatagtttccatgcatgctaaggtagctgtcttgtacgaagcttttgacgttgacagagctacaatagtttgtaacttgg 21965428  T
Q  694 acaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccca 793  Q
      |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  21965427 gtaaccaacttactgctcatcttggaagcgtgaacacatatccaatagttgattttctattatcatgatcaagtgcaaaattcgaatcaatataacccct 21965328  T
Q  794 gacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccgga 893  Q
    || |||||||| | ||||||||||| |||  ||||       ||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||||| | |    
T  21965327 gatagttaactttaatcctccgaaa-atattgcaa-------ggttcctttaatgtacctcttg-ttcttttaccaacattctgatgctctttacc-gaa 21965238  T
Q  894 tccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggta 993  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||  ||||| ||    
T  21965237 tctgccataaaccgactaactactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttttacatatcatgacatacataaggcttccaaccgcgaatatatacgata 21965138  T
Q  994 ctcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttg 1093  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21965137 ctcgagacattttcatcctctcttcttcattgttaggactcataccgaaggataatttaaaattcacaagaagtggggtagagattggctaacaatcttg 21965038  T
Q  1094 catgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttg 1193  Q
    ||| || ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  21965037 catttttaagcgtcacaagacttttcttagatagtgcttttgag--agctaaatcttcctatcttttctgtctcggtg-atgtacatctctaaaatcttg 21964941  T
Q  1194 tttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatcca 1293  Q
    |||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21964940 tttattagtcccaagtctttcatattgaactccctagccaactatgtattcaattcatgaactaggtctttgttggggcctaccaccaacatgtaatcca 21964841  T
Q  1294 catacaacagcaaaatgataaaat 1317  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  21964840 catacaacagtaaagtgataaaat 21964817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1298 - 2187
Target Start/End: Original strand, 18148080 - 18148970
Alignment:
Q  1298 caacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatca 1397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  ||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18148080 caacagcaaaatgataaaatcattaccataaaaccttttgtagtatgtacaacagtgagaaattagtttgttgtaatcgaaactaattatgaaagaatca 18148179  T
Q  1398 aatctcttgtaccaacatctgggcgcct-gctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttcc 1496  Q
    | | |||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||| |    
T  18148180 attgtcttgtaccaacctatgggcgccttgatttaaaccatacatagatttagttaacctgcaaaccaatttttcttttgcttattatttaaatgctttc 18148279  T
Q  1497 ggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgcca 1596  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||| |||| | | |||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18148280 gattggagcacatgaatttcttcttcaagctctctaggtagaaaaacactctttacatctaactattcaagatgtaaatccaatgcaacacacattgcca 18148379  T
Q  1597 acactactctg-atagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcac 1695  Q
    ||| ||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18148380 acattac-ctgtattgtagtgagtctaacaaccggagaaaatatctcattaaagtcaacaccttctgtctaagaatatccttttgcaactagtcttgcac 18148478  T
Q  1696 gataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgt 1795  Q
    ||||  |||| ||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18148479 gatattgttcaactagatcattacaatcatgtttgatctcgtatgttcatttctttccaatgtctttttgaccctttgaaagtttaacaagctcccatgt 18148578  T
Q  1796 cttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcacct 1895  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| | ||  ||  |||   ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  18148579 cttgtttctttgtagggcctccatttcttcatgcattattgtcatatatttaaaaaaatatgaattcttcaacgcctcttgaaaatttgaaggttcacct 18148678  T
Q  1896 tcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcat 1995  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||| | ||| |    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| |||    
T  18148679 tcttccattagaagacaatatgcattttggatcttcattacatattttgactattgagatggtttctgcgcctgacatgttgatcgacaggcaccaccat 18148778  T
Q  1996 tgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttaga 2095  Q
    ||||  ||| |||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |    
T  18148779 tgaccgcatttggttcttgcacatcgtgctctgattcagcttcagaagaatcactttccttgaatttttcttccatatgcactattgcaatctctttgaa 18148878  T
Q  2096 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccaca 2187  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18148879 agtgttgtcttttttatgctcactctacaactcattttctacaaagactacatccatgataacaacaaccttgcgggtagtggaatctcaca 18148970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3543 - 3826
Target Start/End: Complemental strand, 30968566 - 30968283
Alignment:
Q  3543 ttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctc 3642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  30968566 ttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcatcgagattttgaactaccatgattttgactcccactgaggacacgttccgttgatctgccta 30968467  T
Q  3643 tcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatc 3742  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30968466 tcgtcatcgtcaaagcttctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcacaggcgacatcata 30968367  T
Q  3743 aaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaag 3826  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968366 aaagtgaagagtatcagatatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaag 30968283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 263 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 18967543 - 18967256
Alignment:
Q  263 ttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatcga 362  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  18967543 ttcacaatctcccacttaaagctacttttgcgagcttccaaaatctctctaccttacccattcatgttgctatgttttcaataggccataggaggatcga 18967444  T
Q  363 caccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctacta 462  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18967443 caccatataaacttgtcagcattgattggttttgtcatcacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctccacta 18967344  T
Q  463 cttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgact 550  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18967343 cttgtcgaacaaaatgatatttaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagttggattccttgcaatgtgtaaggcactctgact 18967256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3723 - 4255
Target Start/End: Original strand, 8480108 - 8480640
Alignment:
Q  3723 attgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagta 3822  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8480108 attgcaccagcaacatcatcaaaatgaagagagtcaacaatattgttgtttgtaatgttgatgatgagttgatcatatgaatcaggtaaactctgaagta 8480207  T
Q  3823 gaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtgga 3922  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||| || |  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||   ||| || |    
T  8480208 gaagttctgcacgtttattttcagctatcatgaaatctgatgttgtgagctgagcaaatagtgtattcatggtgtttatgtgatttgttgtcgatatgta 8480307  T
Q  3923 ttcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctccttt 4022  Q
    ||||  |||| | |||||||| || || |  |||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||||| || | |  |||| |||||||| ||    
T  8480308 ttcattcattcggagagtgtaaagactccattttaagaaaattcttgtgtgaagtgacttcaccttgtacaatttaataataacatcctagatctccctt 8480407  T
Q  4023 gctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcag 4122  Q
    || | ||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||   | || |||||||||| |||||||||||  ||||    
T  8480408 gcagactttttctctgtaatacttgaaaataccgagtctgcaattgctaagtgcaaattggaaaaaacgttgtcatccatctttttccacttttaatcag 8480507  T
Q  4123 tgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaa 4222  Q
    |||||| ||||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| | || ||    
T  8480508 tgatatttgcatatctaccataaattgcatctaggcaattatcttttcttagaatcgcccttatctttaatttccacaatgaaaaattactctcattaaa 8480607  T
Q  4223 cttttctatctcaaatttcgctgccatggtttt 4255  Q
    ||| || || | |||||| | || |||||||||    
T  8480608 cttctcaatattaaattttgttgtcatggtttt 8480640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2096 - 2536
Target Start/End: Original strand, 8481374 - 8481814
Alignment:
Q  2096 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatac 2195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  8481374 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatctctgccaacaacaagcttgcgaatagtgggatcccacaagcgatac 8481473  T
Q  2196 cccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaac 2295  Q
    ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||   ||| ||| | ||||||||| ||||||||  || ||||  ||| |    
T  8481474 cccttcatcttgtcagtataacccaagaatatacattttttagactttggatctgtctttgttctgtcttgggagatgtacatcctgtgcacaatacatc 8481573  T
Q  2296 caaaaacatgcagagaagaataatcta-ctggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacat 2394  Q
    | || ||||| |  || |||||| |||  ||| |||   ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| || ||||| || ||||    
T  8481574 cgaacacatgtaaggatgaataa-ctaggtggatttttgttccaaatctccatcggtgttttcaaaccaattgcagtttatggagatcgattgatcacat 8481672  T
Q  2395 aacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctc 2494  Q
    |||| ||  ||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||    
T  8481673 aacatgccattttcgcagcttttgccaaaaaagacttggccattcctgctgttctctgcataactcttgttttatctaggagagttttattcaatcgctc 8481772  T
Q  2495 tgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattg 2536  Q
    ||| | |||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  8481773 tgctataccattatgttgaggcgtatatggaactgtgaattg 8481814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1658 - 1854
Target Start/End: Complemental strand, 8565358 - 8565162
Alignment:
Q  1658 ttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatg 1757  Q
    ||||||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||   || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8565358 ttctttctgagcatattaatttaccacgagtcttggacgatacggtttcacttgatcacaaccctcacatttgatcttgtatatccatttgtttcgaatg 8565259  T
Q  1758 gctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcat 1854  Q
     ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8565258 actttttgaccttttggaagttcaacaagctcacatgtcttgtttctatgtaagtccttcatatcttcatgcattattatcatccattaagaagcat 8565162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 599 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18967241 - 18967120
Alignment:
Q  599 taacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaac 698  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  18967241 taacgtttgcatccaaatagcttcattgcatgcttgggtagctgcaatgtactcagcttctgtcgttgacagagctacaacag-ttgtaacttggataac 18967143  T
Q  699 caacttactgctcctcctgcaag 721  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18967142 caacttactgctcctcctgcaag 18967120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4092 - 4359
Target Start/End: Original strand, 23012182 - 23012438
Alignment:
Q  4092 ttatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttca 4191  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  23012182 ttatcttccatctctttcaacttttcttctgtgatatctacatgtgggc-atctattgcgtttaggaaattatcttttatcaaaattgccattatattca 23012280  T
Q  4192 atttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcttt---caaactagaccgga 4288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||      |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||| |  |||    
T  23012281 atttccatagggaaaaatttctcccattcaact------tctcgaattttgctgtcatggttttataccaaatatttttatttctccaaactaaattgga 23012374  T
Q  4289 ataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||| || |||       ||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23012375 ataaaaaaaat-------tgatgtggaagatcaggctaaactgtaaccacaaagcatactaagttttttct 23012438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1778 - 1979
Target Start/End: Complemental strand, 8565161 - 8564961
Alignment:
Q  1778 ttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatga 1877  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||   |||  || |||||||| ||     
T  8565161 ttcaacaagctcagatgtcttgtttctatgtaagtccttcatatcttcatgcgttgttatcatccattaagaagcattttaactgtttaacgcctcttg- 8565063  T
Q  1878 aaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttg 1977  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| ||  || ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||| | ||||    
T  8565062 aaagttgaaggttcaccttgttcagttagaagactatatgaattgtgcctcatcgtaacatagtttgatttccaagatggtttttgcgtttgaggcgttg 8564963  T
Q  1978 at 1979  Q
    ||    
T  8564962 at 8564961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3886 - 4128
Target Start/End: Complemental strand, 8481247 - 8481005
Alignment:
Q  3886 tattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgac 3985  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||  |||| | |||||||||||||| || || ||||| ||| |  | || ||||| |||||    
T  8481247 tattcatggtgtttatgtgatttgttattgatatggattcattcattcggagagtgtagagcctccttttcaagaaaattattgtttgaagtgacttgac 8481148  T
Q  3986 ctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggca 4085  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||| || |   |||||| ||| | || | |||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  8481147 ctcgtacaatttaataagagtatcctagatctcccttgcagtcttattctatacaatacatgaaagtatcaagtctgccattgctaagtgaaaatcggca 8481048  T
Q  4086 acggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatat 4128  Q
    |   | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8481047 atatcgttgtcatccatctctttccacttttgatcagtgatat 8481005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 27879036 - 27879134
Alignment:
Q  4 ttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcatttat 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||||    
T  27879036 ttgttctggtgttgttactaatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcatttat 27879134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21966604 - 21966493
Alignment:
Q  260 atgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactcc-agttgctacgtttccaataggccatacgagga 358  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |      ||||||||||    
T  21966604 atgttcacaatatcccacttacagccacttttgtaagatttcaaaatctctctaccttgccaactccttattgctacgtttcaa------catacgagga 21966511  T
Q  359 tcgacaccatacaaactt 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21966510 tcgacaccatacaaactt 21966493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30968629 - 30968569
Alignment:
Q  260 atgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgcc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  30968629 atgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcactcaaaatctctctaccttgcc 30968569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3426 - 3506
Target Start/End: Original strand, 8479998 - 8480078
Alignment:
Q  3426 ctatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattc 3506  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  8479998 ctatacaagatttctccatcatctgaggtacttgcaacacaaccttgagaggttgatgcttctgatgtcttctctccattc 8480078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Original strand, 16777060 - 16777109
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16777060 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 16777109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 295
Target Start/End: Original strand, 1472341 - 1472378
Alignment:
Q  258 acatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtga 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1472341 acatcttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtga 1472378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 26976437 - 26976470
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976437 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 26976470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 1234712 - 1234680
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1234712 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 1234680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 27874296 - 27874327
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874296 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggat 27874327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 3856; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 3856; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 248 - 4359
Target Start/End: Original strand, 5819102 - 5823213
Alignment:
Q  248 atgtgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaatagg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5819102 atgtgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagttacttttgtgagcattcaaagtttctctactttgccaacttcagttgctacgtttccaatagg 5819201  T
Q  348 ccatacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacac 447  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5819202 ccatacgaggatcgacgccatataaacttgtcagtgttgatcggctttgtcattacaactgctaggttatcattagtgtgaatcttttgcatatccacgc 5819301  T
Q  448 ttccctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctg 547  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819302 ttccctcctccactacttctcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctg 5819401  T
Q  548 actgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatg 647  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5819402 actgtcacaatacacagtaattttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccagatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatg 5819501  T
Q  648 tactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 747  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819502 tactcagcttctgtcgttgacagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 5819601  T
Q  748 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaat 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819602 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaat 5819701  T
Q  848 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819702 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 5819801  T
Q  948 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 1047  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819802 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 5819901  T
Q  1048 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 1147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819902 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 5820001  T
Q  1148 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 1247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820002 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 5820101  T
Q  1248 tcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtac 1347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820102 tcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtac 5820201  T
Q  1348 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagattt 1447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5820202 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagattt 5820301  T
Q  1448 ggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 1547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820302 ggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 5820401  T
Q  1548 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 1647  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820402 tttacatctagctgttcaagatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 5820501  T
Q  1648 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 1747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820502 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 5820601  T
Q  1748 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 1847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820602 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 5820701  T
Q  1848 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgatt 1947  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5820702 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgatt 5820801  T
Q  1948 gccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatc 2047  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5820802 gccaagatggtttctgcgtttgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatc 5820901  T
Q  2048 actttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactaca 2147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820902 actttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactaca 5821001  T
Q  2148 tccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggt 2247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821002 tccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggt 5821101  T
Q  2248 ccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccat 2347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821102 ccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccat 5821201  T
Q  2348 cggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgtt 2447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821202 cggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgtt 5821301  T
Q  2448 ttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaatac 2547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821302 ttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaatac 5821401  T
Q  2548 cctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttg 2647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5821402 cctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttg 5821501  T
Q  2648 tgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtat 2747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821502 tgctttgaatgccttgaatactggaaacacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtat 5821601  T
Q  2748 cttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatc 2847  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821602 cttgctcctcccagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatc 5821701  T
Q  2848 tatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttc 2947  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821702 tatgttgcttgcttatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttc 5821801  T
Q  2948 tgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagc 3047  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821802 agacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagc 5821901  T
Q  3048 atgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagat 3147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821902 atgtatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagat 5822001  T
Q  3148 catccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgat 3247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822002 catccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgat 5822101  T
Q  3248 agtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtc 3347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5822102 agtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtc 5822201  T
Q  3348 atgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcat 3447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5822202 atgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcgctatacaggatttccccgtcat 5822301  T
Q  3448 ctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcat 3547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822302 ctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcat 5822401  T
Q  3548 gccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtc 3647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822402 gccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtc 5822501  T
Q  3648 atcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagt 3747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822502 atcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagt 5822601  T
Q  3748 gaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgc 3847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822602 gaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgc 5822701  T
Q  3848 tattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagc 3947  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5822702 tattttgaaatcagaagctgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagc 5822801  T
Q  3948 cttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttg 4047  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822802 cttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttg 5822901  T
Q  4048 acaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctat 4147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5822902 acaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctat 5823001  T
Q  4148 tgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgcc 4247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5823002 tgcgtctagacaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgcc 5823101  T
Q  4248 atggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatac 4347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823102 atggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatac 5823201  T
Q  4348 taagatttttct 4359  Q
    ||||||||||||    
T  5823202 taagatttttct 5823213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 2007; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2017 - 4359
Target Start/End: Original strand, 2814859 - 2817201
Alignment:
Q  2017 cttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctc 2116  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2814859 cttcgtgcactgattctgattctgaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaaatgctgtcatttttctgctc 2814958  T
Q  2117 actttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataa 2216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2814959 actttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggaccccacaggcgataccccttaacattgtcagcataa 2815058  T
Q  2217 cccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaat 2316  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2815059 cccaagaagatacatttcttagactttgggtccaactttgttctttcttgagagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgtagagaagaat 2815158  T
Q  2317 aatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttc 2416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2815159 aatctactggctttcctttccacatctccataggagtcttcaaatcaatcaacgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttc 2815258  T
Q  2417 agcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggt 2516  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815259 tgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttatattcatccgctctgccacaccattctgctgaggt 2815358  T
Q  2517 gtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcact 2616  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2815359 gtatgtgcaacagtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgtcatctacatattatcctccattatctatcctcaagcact 2815458  T
Q  2617 taattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttct 2716  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2815459 taatctttttcccagtttcaagctctatttgtgcttttaatgccttgaatactggaaacacaactgacttcttcttgattggttacacccataatcttct 2815558  T
Q  2717 ggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttg 2816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815559 ggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttg 2815658  T
Q  2817 cttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagat 2916  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2815659 cttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctcacaaaatggtaaatttactgaattgagcccgtgaaggagat 2815758  T
Q  2917 tgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgc 3016  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2815759 tgcgttccgcaaggactttcaagccacgttatgacatatggcctagtctttgatgccacgtcatcattgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgt 2815858  T
Q  3017 atccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagatt 3116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2815859 atccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcttttcactactttaaagatt 2815958  T
Q  3117 ccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttc 3216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815959 ccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttc 2816058  T
Q  3217 taacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctc 3316  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2816059 aaacagtacaatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatggtcatttcccatgtacactgatccttcagagataggctc 2816158  T
Q  3317 ataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagtt 3416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  2816159 ataagagtaaaaccaatctcagtgtggagtcatgtgccatattgcacctgaatccattatcaagacatcgttgagtcgtctttcacctttagaattggtt 2816258  T
Q  3417 gctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatat 3516  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2816259 gctgcttcactatacaagattttcccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcaaaattcttctctccattcttcttgatat 2816358  T
Q  3517 tccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccact 3616  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2816359 tccaacactccttctttatgtgctctttcatgccacaactgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctagcatgattttgactcccact 2816458  T
Q  3617 ggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttct 3716  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2816459 ggggccatgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcttggattcttct 2816558  T
Q  3717 tcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactct 3816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2816559 tcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactct 2816658  T
Q  3817 gaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacaga 3916  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2816659 aaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagctgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacgga 2816758  T
Q  3917 tgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatc 4016  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2816759 tgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattaaagtatcccagatc 2816858  T
Q  4017 tcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccactttt 4116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2816859 tcctttgctgtcttcttttcttcaatacttgacaataccgagtccaccatatctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccactttt 2816958  T
Q  4117 cgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctccc 4216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2816959 cgtcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaaaggaaaaatttctccc 2817058  T
Q  4217 gttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaa 4316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2817059 gttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcattcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaa 2817158  T
Q  4317 gatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2817159 gatcagtttaaaccacaaccacatagcatactaagatttttct 2817201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 903; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 251 - 1285
Target Start/End: Complemental strand, 54545632 - 54544598
Alignment:
Q  251 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggcca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54545632 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcattcaaagcctctctaccttgccaacttcagttgctatgtttccaataggcca 54545533  T
Q  351 tacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttc 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54545532 tacgaggatcgacaccatataaacttgtcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctaggttatcattagtgtgaatcttctgcatatccacgcttc 54545433  T
Q  451 cctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgact 550  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54545432 cttcctctactacttctcgaataaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagttgaattccttgcaatgtgcaatgcactctgact 54545333  T
Q  551 gtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtac 650  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  54545332 gtcacaatacacaataatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtac 54545233  T
Q  651 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 750  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545232 tcagcttctgtcgttgacagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctccggcaagtgtgaacacataaccagtagtagattttc 54545133  T
Q  751 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545132 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 54545033  T
Q  851 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 950  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545032 cctcatgattctcttaacaacattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 54544933  T
Q  951 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 1050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544932 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 54544833  T
Q  1051 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 1150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544832 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacaatcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 54544733  T
Q  1151 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcc 1250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54544732 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattct 54544633  T
Q  1251 tggactcgatctttgttggggcctaccaccaacat 1285  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544632 tagacccgatctttgttggggcctaccaccaacat 54544598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 799; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2035 - 4255
Target Start/End: Complemental strand, 42587654 - 42585440
Alignment:
Q  2035 cttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttc 2134  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||   ||| |||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42587654 cttcagaagaatcatcttctttagacttcatttctatctccactgcagtagtttctttggcagtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttc 42587555  T
Q  2135 tgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttc 2234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  42587554 tgcaaagactacatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccacaagcgataccctttcacgttgtcagcataacccaagaatatacatttt 42587455  T
Q  2235 ctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctt 2334  Q
    || |||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||| |  |||||||||||   ||||||||| |    
T  42587454 ctagactttggatctagctttgttctttcttgggagttgtacattgcgtacacagtacatccgaacacatgtaaggaagaataatcaggtggctttccgt 42587355  T
Q  2335 tccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggc 2434  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||| |||| || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    
T  42587354 tccaaatctccattggtgtttacaaaccaattgcggttgatggagatcgattgatcacgtaacaggcggttttcacagcttctgcccagaaagacttagc 42587255  T
Q  2435 cattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaat 2534  Q
    || | | |||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  42587254 cactactgctgttctcaacatggctcttgttttatctaagagagttctattcatccgctctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaat 42587155  T
Q  2535 tgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagttt 2634  Q
    || |||  ||||||||| ||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||  ||||||    
T  42587154 tgtcttgtaataccctcatgtttgcagaatgtcaaaaaatcaccatctacatattctcctccattgtctgttcttaagcactttattcttttaccagttt 42587055  T
Q  2635 caagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaa 2734  Q
    |||| || | ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||    
T  42587054 caagttccacttgtggtttgaattccttgaatacggtaaacacatttgacttcttcttgattgggtacacccataatctcctagagtgatcatcaataaa 42586955  T
Q  2735 tgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactcta 2834  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42586954 tgacacaaaatattttgctcctcccatggatatttgtggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtcaagtatgtatttgcttctagtagttactctg 42586855  T
Q  2835 gcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactt 2934  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||  | || |||||  ||||| ||||  |||    
T  42586854 gaaaacttcaatctatgttgcttgcttgtcacacagtgctcacagaaagacaaattcattgtcttgagcccaggtagaagattttgttccgcaagagctt 42586755  T
Q  2935 tcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgt 3034  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| | |||    ||||||  || |||||||||||    
T  42586754 tcaaaccacgttccgacatatggcctagtttatgatgccacaccattgtcgtttcttcttggctcgctacagcagtcaatgcattagcgtcttgcaatgt 42586655  T
Q  3035 atctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatc 3134  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  42586654 atcccccacaagcatgtatagattgttagtgagcttttctgctttcatcaccacgaggtttccctttactacttttaagtttccaccttcagtgtggatc 42586555  T
Q  3135 ttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgca 3234  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | || |||| |||||||      
T  42586554 ttgcacccgaggtcatccaattgcccaatagacaataaattattcttcaagtcctttacgtgacgtaccccttgtattttgcgaatagtatcatcatgtg 42586455  T
Q  3235 tctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatc 3334  Q
    |||||| | ||| |||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  42586454 tctttattttgacagtaccaatcccaacaacttctaaagtgtgatcattgcccatgaatacagattcttccgagataggttcataggtgcaaaaccaatc 42586355  T
Q  3335 tcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtcttt-cgcctttagaactagttgctgcttcactatacag 3433  Q
       | |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||  ||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||     
T  42586354 cttgcgtggagtcatatgccatgtggcacctgagtccactatccagccatcattgag-cgcatttccacctttagaactaattgctgctccgctatacaa 42586256  T
Q  3434 gatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttcttt 3533  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| | ||     
T  42586255 gatttctccatcatctcaggtacttgctacacaaccttgagaggttgacgcttctgatgtcttctcttcattccttttgttgttccaacactcccttttc 42586156  T
Q  3534 acgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttg 3633  Q
    |  |||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |  || || || ||||    
T  42586155 aaatgcccgctcatacgacaaccgtagcatttgaaattcttccttctctgaggttttgatctaccacgatcttgactcccactagatcctcgctctgttg 42586056  T
Q  3634 atctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggc 3733  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||    
T  42586055 atctgcctctcgccatcactaaagcctctgcttgcttt------tctaacctttcttccttattcttgcgtctagattcttcttcaataattgcaccagc 42585962  T
Q  3734 gacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagca 3833  Q
     ||||||||||| |||||||  ||| | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42585961 aacatcatcaaaatgaagagagtcaacaatattgttatttgtaatattgatgatgagttgatcatatgaatcaggtaaactctgaagtagaagttctgca 42585862  T
Q  3834 cgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccattt 3933  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||  ||| ||||||||  ||||     
T  42585861 cgttcattttcagctattgtgaaatctgaggctgtgagctgagcaaatagtgtattcatggtatttatgtgatttgttattgatatggattcattcattc 42585762  T
Q  3934 gaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttctt 4033  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  42585761 ggagagtgtagagcctcctttttaagaaaattcttgtgtgaagtgacttgacctcgtacaatttaataagagcatcccagatctcctttgcagacttttt 42585662  T
Q  4034 ttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgca 4133  Q
     || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42585661 ctctgcaatacttgataataccgaatctgccattgctaagtgcaaattggcaacaacgttgtcatccatctctttccacttttgatcagtgatatctgca 42585562  T
Q  4134 agtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatct 4233  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  42585561 ggtctgccatcaattgcatctaggcaattgtcttttcttagaactgcccttatctttaatttccacagtgagaaattactcccattaaacttctcaatct 42585462  T
Q  4234 caaatttcgctgccatggtttt 4255  Q
     |||||| | ||||||||||||    
T  42585461 taaattttgttgccatggtttt 42585440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 767; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1951
Target Start/End: Complemental strand, 42589332 - 42587735
Alignment:
Q  354 gaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccct 453  Q
    ||||||| |||||||  ||| || ||||  ||||| | ||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  42589332 gaggatctacaccatgtaaatttgtcagcattgattgactttgtcataatatctgctaaattgtctttggtgtgaattttctgcatatcaacactccctt 42589233  T
Q  454 cctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtc 553  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42589232 tctctaccacttctcgaacaaaatggtattgaacacctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattccttgcaatgtgcaatgcactatgactgtc 42589133  T
Q  554 acaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactcc 653  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  42589132 acaatacacaacaatttgttgttgactgtgcccgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcgtagctgccatatattca 42589033  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
    |||||||| || || |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42589032 gcttctgtagtagatagagctacgacagattgtaattttgacaaccaacttaccgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagcagtagatcttcttt 42588933  T
Q  754 tatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacct 853  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| || |||||  |||||| || |||||||||| || || ||    
T  42588932 tatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgacacataatgcaacatctaaggttccttttatatatct 42588833  T
Q  854 catgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatc 953  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42588832 caggattctcttaacagcatcccaatgttctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatc 42588733  T
Q  954 atggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaa 1053  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||     
T  42588732 atggcatacataaggcttcccaccactgatgcatagggtactcgagacatttctatcctctctgattcattgctaggattcatactggaggataatttat 42588633  T
Q  1054 aattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcct 1153  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  42588632 aattgataggaagtggggtagatattggcttacaatcttgcatgttgaagcgccgcanaacttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcct 42588533  T
Q  1154 gtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctgg 1253  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  42588532 atcttttctatctcgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggccccaagtccttcatatcgaactccctagccaattgtgcatttaattcttgg 42588433  T
Q  1254 actcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggt 1353  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42588432 acttgatctttgttgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaacaacaaaatgataaaatcattattaccaaacctattgtagtatgtacaatggt 42588333  T
Q  1354 ctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaa 1453  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  42588332 ctgaattaagtctgttgtatccaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcctgttttagaccgtatagagatttggtcaa 42588233  T
Q  1454 cctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttaca 1553  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42588232 cctgcaaaccaagttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggttggagcatatatatttcttcttcaagctctccatgaagaaaagaagtttttaca 42588133  T
Q  1554 tccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaa 1653  Q
    || |  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || || |||| ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || |    
T  42588132 tctaattgttcaagatgtaaatcaaacgcaacacacatagctaaaactattctgatagttgtgagtctaacaactggggagaatattttattgaaatcta 42588033  T
Q  1654 taccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttcc 1753  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42588032 taccttctttttgagcataccctttaaccaccagtcttgcacgatatcgttctacttgatcattactatctcgtttgatcttgtatacctatttgttccc 42587933  T
Q  1754 aatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagca 1853  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  42587932 gatggctttccgacccttgggaagttgaacaagttcccaagttttgtttctatgtaaggcttccatttcttcatgcattgctgccatccacagagaaaca 42587833  T
Q  1854 tccgaac--cattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcca 1951  Q
    ||  | |  | ||||  ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  42587832 tcttagcttctttca--gcctcctgaaaggttgatggctccccatcttctgttaaaagacaatatgcatcatgagttgtcattacatagtctgaatgcca 42587735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 876 - 1233
Target Start/End: Complemental strand, 25878161 - 25877805
Alignment:
Q  876 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 975  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25878161 caatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattgttctcactgcttgtgcaatgtctagtcttgtacatatcatgtcatacataagacttccca 25878062  T
Q  976 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 1075  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| | || || |||||||||    
T  25878061 ctgctgatgcatagggtacttgagacattttcatcctctccgcttcattgctaggattcagacttgaggataatttataattgatagaaaatggggtaga 25877962  T
Q  1076 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 1175  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||| | || ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25877961 tattggcttacagtcttg-atgttgaagtgtagaaaaacttttcgtatataatttgtttgagaaagcaaaatcttcctatcttttctatctcggtgaatt 25877863  T
Q  1176 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagcca 1233  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25877862 tgcatccttaaaatcttgttttctggcccagagtccttcatatcgaactccctagcca 25877805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 553 - 998
Target Start/End: Complemental strand, 25881030 - 25880583
Alignment:
Q  553 cacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactc 652  Q
    |||||||||||  ||||||||  || ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||| | | || || ||    
T  25881030 cacaatacacaacaatttgttgttgattgtgcctga-ttcttccattagcctttgtatccaaatagcttcctagcaagcttgcgtaggtacaatatattc 25880932  T
Q  653 cgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttctt 752  Q
     || | ||| || || ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25880931 agcatatgtagtagatagagcgacaacaatttgtaattttgacaaccaacttattgctcctcctgcaagtatgaacacataaccggtagtagattttttt 25880832  T
Q  753 tt---atcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc---tttaa 846  Q
    ||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||| | || ||  |||    ||||||||  |||||| |||||||| |   ||| |    
T  25880831 tttttatcaagatctcctgcaaaatctgaatctacataaccctttacaataaattccaatct---gaaacataatgcaacatctgaggtttcctttttta 25880735  T
Q  847 tgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgt 946  Q
    | || |||| |||||| |||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25880734 tatatctcacgattcttttaataacatctcaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattgctcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgt 25880635  T
Q  947 acatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcga 998  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25880634 acatatcatggcatacataaggtttcccaccgctgatgcataaggtactcga 25880583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 826 - 1021
Target Start/End: Complemental strand, 25880567 - 25880372
Alignment:
Q  826 caacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgc 925  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||| |||||| || | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  25880567 caacatctgaggttccttttatatatctcaggattcttttgataccatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattacttccactgc 25880468  T
Q  926 ttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttc 1021  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25880467 ttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgctgatgcataaggtactcgagacattttcatcctcttcgcttc 25880372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 3665 - 4128
Target Start/End: Original strand, 47277022 - 47277494
Alignment:
Q  3665 ttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatc--agcta 3762  Q
    ||||||||||||||   || ||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||   |||||| || || |||| ||| ||  ||||     
T  47277022 ttgctttgaactctacaacatttcttatttattcttgcgtatggactcttcttcaagaattgcaccaaagacatcgtccaaatgaatagtctctcagctg 47277121  T
Q  3763 tgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttca--gcacgctcattttccgctattttgaaatca 3860  Q
      ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||| || | |||  |    
T  47277122 cattattgttggtaatgttgatgatgaggtgatcatacaaagatggttaactcagaagtagaagttcaacacacactcattttccgcttttctaaaacga 47277221  T
Q  3861 gaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaaga 3960  Q
    ||||  ||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||  |||   || |||||||||||| ||  || ||||||| | ||||  ||||| |    
T  47277222 gaagttgtgagatgagaaaattgcatattcaaggtgtt-atgtgatatgtt--tgacgtggattcacccgttcaaaaagtgtagtgtcttccttttaata 47277318  T
Q  3961 atattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtct---tcttttcagcaatacttgacaatac--- 4054  Q
    ||||| | ||||| | |||||  | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |   |||| |||  |||||||||||||||       
T  47277319 atattttattgtgaaatgattatatctcgtataattttattagagtatcacatatctcctttgttgtattaatcttctcataaatacttgacaatactgt 47277418  T
Q  4055 --cgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatat 4128  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47277419 gttgagcctgccattgctaggtgcaaattggcaacaataatatcatctatctctttccatttttcgtcaatgatat 47277494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3878 - 4216
Target Start/End: Complemental strand, 25877693 - 25877355
Alignment:
Q  3878 aaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagt 3977  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||| || |||||||| |||||  |||| |||    
T  25877693 aaatagtgtattcatggtgtttatgtgatttgttattgatatggattcattcattcaaagagtatagagcctcctttttaagaaaattcttgtgtgaagt 25877594  T
Q  3978 gatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgca 4077  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||    ||| || ||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  25877593 gacttgacctcgtacaatttaaaaagagcgtcccagatctcccttgaaaactttttctctccaatacttgacaatatcgagtctgccattactaagtgca 25877494  T
Q  4078 aattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaat 4177  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| | || ||||| | || |||| | ||||  |||||||||| ||     
T  25877493 aattggcaataacattgtcatccatctcttttcacttttgatcagtgatatttgcatgcctaccatcaactgtgtctcgacaatagtcttttcttagaac 25877394  T
Q  4178 tgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctccc 4216  Q
      |||||||||| ||||| || || || ||||| |||||    
T  25877393 atcccttatctttaattttcacagtgagaaattactccc 25877355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 2817557 - 2817658
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||    
T  2817557 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatgtatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcattt 2817656  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  2817657 at 2817658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 682 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 25880348 - 25880239
Alignment:
Q  682 tttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatc 781  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  25880348 tttgtaattttgacaaccaacttattgctcctcttgcaagtgtgaacacataaccggtattagatattcttttatcacgatcacctataaaatctgaatt 25880249  T
Q  782 aacataaccc 791  Q
    |||| |||||    
T  25880248 aacaaaaccc 25880239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Original strand, 5382624 - 5382673
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5382624 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 5382673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4292 - 4346
Target Start/End: Original strand, 13722392 - 13722446
Alignment:
Q  4292 ataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  13722392 ataataattcttttctgatgtggaagatcagattaaactacaaccacagagcata 13722446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 5818819 - 5818852
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5818819 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatga 5818852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42589389 - 42589352
Alignment:
Q  258 acatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtga 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42589389 acatcttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtga 42589352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 5823581 - 5823613
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823581 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 5823613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 3838; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 3838; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 251 - 4359
Target Start/End: Original strand, 9439921 - 9444030
Alignment:
Q  251 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggcca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9439921 tgttcacacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagtattcaaagtctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggcca 9440020  T
Q  351 tacgaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttc 450  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9440021 tacgaagatcgacaccatataaacttgtcagtgttgatcgactttgtcattgcatctgctaggttatcattagtgtgaatcttctgcatatccacgcttc 9440120  T
Q  451 cctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgact 550  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9440121 cttcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaatgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgact 9440220  T
Q  551 gtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtac 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9440221 gtcacaatacacagtaatttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtac 9440320  T
Q  651 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440321 tccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttc 9440420  T
Q  751 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440421 ttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgta 9440520  T
Q  851 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440521 cctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacat 9440620  T
Q  951 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 1050  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440621 atcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatt 9440720  T
Q  1051 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 1150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440721 taaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatctt 9440820  T
Q  1151 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcc 1250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440821 cctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcc 9440920  T
Q  1251 tggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaat 1350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440921 tggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaat 9441020  T
Q  1351 ggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggt 1450  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9441021 ggtctgaactaagtctgctgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggt 9441120  T
Q  1451 caacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtcttt 1550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441121 caacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtcttt 9441220  T
Q  1551 acatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagt 1650  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441221 acatctagctgttcaagatgtaaatccaacgaagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagt 9441320  T
Q  1651 caataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtt 1750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441321 caataccttctttctgagcatatccttttacaaccagccttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtt 9441420  T
Q  1751 tccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaa 1850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441421 tccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaa 9441520  T
Q  1851 gcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcc 1950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9441521 gcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgcc 9441620  T
Q  1951 aagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcact 2050  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9441621 aagatggtttctgcgtttgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcact 9441720  T
Q  2051 ttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttct-gcaaagactacatc 2149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9441721 ttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttcttgcaaagactacatc 9441820  T
Q  2150 cctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtcc 2249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441821 cctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtcc 9441920  T
Q  2250 aacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcg 2349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441921 aacttcgttctttcttgggagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcg 9442020  T
Q  2350 gtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgtttt 2449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442021 gtgtcttcaaatcaatcaccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgtttt 9442120  T
Q  2450 cagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccc 2549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442121 cagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccc 9442220  T
Q  2550 tcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtg 2649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9442221 tcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtg 9442320  T
Q  2650 ctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatct 2749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442321 ctttgaatgccttgaatactggaaacacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatct 9442420  T
Q  2750 tgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatcta 2849  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442421 tgctcctcccagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatcta 9442520  T
Q  2850 tgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctg 2949  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9442521 tgttgcttgcttatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcag 9442620  T
Q  2950 acatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcat 3049  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442621 acatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcat 9442720  T
Q  3050 gtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatca 3149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442721 gtatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatca 9442820  T
Q  3150 tccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatag 3249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442821 tccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatag 9442920  T
Q  3250 taccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcat 3349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9442921 taccgactccagcaatttctaaggcatggtcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcat 9443020  T
Q  3350 gtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatct 3449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443021 gtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatct 9443120  T
Q  3450 gaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgc 3549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443121 gaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgc 9443220  T
Q  3550 cacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcat 3649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443221 cacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcat 9443320  T
Q  3650 cgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtga 3749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9443321 cgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcattaaagtga 9443420  T
Q  3750 agagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgcta 3849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443421 agagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgcta 9443520  T
Q  3850 ttttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagcct 3949  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9443521 ttttgaaatcagaagctgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagcct 9443620  T
Q  3950 tctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgac 4049  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443621 tctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgac 9443720  T
Q  4050 aataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattg 4149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9443721 aataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgtaggtctgccatctattg 9443820  T
Q  4150 cgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccat 4249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9443821 cgtctagacaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaatttctctatctcaaatttcgctgccat 9443920  T
Q  4250 ggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatacta 4349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443921 ggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatacta 9444020  T
Q  4350 agatttttct 4359  Q
    ||||||||||    
T  9444021 agatttttct 9444030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 778; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1951
Target Start/End: Original strand, 24594424 - 24596021
Alignment:
Q  354 gaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccct 453  Q
    ||||||| |||||||  ||| || ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  24594424 gaggatctacaccatgtaaatttgtcagcattgattgactttgtcataacatctgctaaattgtctttggtgtgaattttctgcatatcaacactccctt 24594523  T
Q  454 cctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtc 553  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24594524 tctctaccacttctcgaacaaaatggtattgaacacctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattccttgcaatgtgcaatgcactctgactgtc 24594623  T
Q  554 acaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactcc 653  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  24594624 acaatacacaacaatttgttgttgactgtggccgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgtgtagctgccatatattca 24594723  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
    |||||||| || || |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24594724 gcttctgtagtagatagagctacgacagattgtaattttgacaatcaacttatcgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttt 24594823  T
Q  754 tatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacct 853  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || ||    
T  24594824 tatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatct 24594923  T
Q  854 catgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatc 953  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24594924 caggattctcttaacaacatcccaatgttttttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtaaatatc 24595023  T
Q  954 atggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaa 1053  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||     
T  24595024 atggcatacataaggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcatactggagaataatttat 24595123  T
Q  1054 aattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcct 1153  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24595124 aattgataggaagtggggtagatattggcttacaatcttgcatgttgaagcgccgcaaaacttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcct 24595223  T
Q  1154 gtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctgg 1253  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  24595224 atcttttctatctcgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggccccaagtccttcatattgaactctctagccaattgtgcctttaattcttgg 24595323  T
Q  1254 actcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggt 1353  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24595324 acttgatctttgttgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaacaacaaaatgataaaatcattattaccaaacctattgtagtatgtacaatggt 24595423  T
Q  1354 ctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaa 1453  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24595424 ctgaattaagtctgttgtatccaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcctgttttagaccgtacagagatttggtcaa 24595523  T
Q  1454 cctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttaca 1553  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24595524 cttgcaaaccaagttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggttggagcatatatatttcttcttcaagctctccatgaagaaaagcagtttttaca 24595623  T
Q  1554 tccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaa 1653  Q
    || |  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  24595624 tctaattgttcaagatgtaaatcaaacgcaacacacatagccaaaactattctgatagttgtgagtctaacaactggggagaatatttcattgaaatcta 24595723  T
Q  1654 taccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttcc 1753  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24595724 tactttctttctgagcataccctttaaccaccagtcttgcacgatatcgttctatttgatcattactatctcgtttgatcttgtatacccatttgttccc 24595823  T
Q  1754 aatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagca 1853  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  24595824 gatggctttccgacccttgggaagttaaacaagttcccaagttttgtttctatgtaaggcttccatttcttcatgcattgctgccatccacagagaaaca 24595923  T
Q  1854 tccgaac--cattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcca 1951  Q
    || || |  | ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |||||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  24595924 tctgagcttctttca--gcctcctgaaaggttgatggctccccatcttcttttaaaagacaatatgcatcatgagttgtcattacatagtctgaatgcca 24596021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 775; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2035 - 4255
Target Start/End: Original strand, 24596102 - 24598316
Alignment:
Q  2035 cttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttc 2134  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||   ||| |||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24596102 cttcagaagaattatcttctttagatttcatttctatctccactgcagtagtttctttggcagtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttc 24596201  T
Q  2135 tgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttc 2234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24596202 tgcaaagactacatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccataagcgataccctttcacgttgtcagcataacccaagaatatacatttt 24596301  T
Q  2235 ctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctt 2334  Q
    || |||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||| |  |||||||||||   ||||||||| |    
T  24596302 ctagactttggatctagctttgttctttcttgggagttgtacattgcgtacacagtacatccgaacacatgtaaggaagaataatcaggtggctttccgt 24596401  T
Q  2335 tccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggc 2434  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||  || ||||| || || ||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24596402 tccaaatctccattggtgttttcaaaccaattgcggttgatgtagatcgattgatcacgtaataggcggttttcacagcttctgcccagaaagacttagc 24596501  T
Q  2435 cattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaat 2534  Q
    || |   |||||| ||| ||| |||||| || | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24596502 cactattgctgttctcaacatggctctttttttatttaagagagttctattcatccgctctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaat 24596601  T
Q  2535 tgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagttt 2634  Q
    || |||  ||||||||| ||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||  ||||||    
T  24596602 tgtcttgtaataccctcatgtttgcagaatgtcaaaaaatcaccatctacatattctcctccattgtctgttcttaagcactttattcttttaccagttt 24596701  T
Q  2635 caagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaa 2734  Q
    |||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||    
T  24596702 caagttccacttgtgctttgaattccttgaatactgtaaacacatttgacttcttcttgattgggtacacccataatctcctagagtgatcatcaataaa 24596801  T
Q  2735 tgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactcta 2834  Q
    |||||| || | | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24596802 tgacacaaaatgttttgctcctcccatggatatttgtggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtcaagtatgtatttgcttctagtagttactctg 24596901  T
Q  2835 gcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactt 2934  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  | || |||||  ||||| ||||  |||    
T  24596902 gaaaacttcaatctatgttgcttgcttgtcacacagtgctcacagaaagacaaattcactgtcttgagcccaggtagaagattttgttcctcaagagctt 24597001  T
Q  2935 tcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgt 3034  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| | |||    ||||||  || |||||||||||    
T  24597002 tcaaaccacgttccgatatatggcctagtttatgatgccacaccattgtcgtttcttcttggctcgctacagcagtcaatgcattagcatcttgcaatgt 24597101  T
Q  3035 atctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatc 3134  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||| || || || || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||    
T  24597102 atcccccacaagcatgtatagattgtttgtgagcttttttgctttcatcaccacgaggtttccctttactacttttaagtttccaccttcagtgtgaatc 24597201  T
Q  3135 ttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgca 3234  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||      
T  24597202 ttgcacccgaggtcatccaattgcccaatagacaataaattcttcttcaagtcctttacgtgacgtaccccttgtattttgcgaatagtaccatcatgtg 24597301  T
Q  3235 tctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatc 3334  Q
    |||||| | ||| |||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||||    
T  24597302 tctttattttgacagtaccaatcccaacaacttctaaagtgtgatcattgcccatgaatacagatccttccgagataggttcatagctgcaaaaccaatc 24597401  T
Q  3335 tcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtcttt-cgcctttagaactagttgctgcttcactatacag 3433  Q
       | |||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||  |||| ||||| ||  ||| | ||||||| |||| ||| |||| | |||||||     
T  24597402 cttgcgtggagtcatattccatgtggcacctgagtccactatccaaccatcattgag-cgcatttccacctttagtactaattgatgctccgctatacaa 24597500  T
Q  3434 gatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttcttt 3533  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| | ||     
T  24597501 gatttctccatcatctgaggtacttgctacacaaccttgagaggttgacgcttctgatgtcttctcttcattccttttgttgttccaacactcccttttc 24597600  T
Q  3534 acgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttg 3633  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |  || || || ||||    
T  24597601 aaatgccctctcataccacaaccgtagcatttgaaattcttccttctctgaggttttgatctaccacgatcttgactcccactagatcctcgctctgttg 24597700  T
Q  3634 atctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggc 3733  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||    
T  24597701 atctgcctctcgccatcactaaagcctctgcttgcttt------tctaacctttcttccttattcttgcgtctagattcttcttcaataattgcaccagc 24597794  T
Q  3734 gacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagca 3833  Q
     ||||||||||| | | |||  | | | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24597795 aacatcatcaaaattatgagagttatcaatattgttatttgtaatattgatgatgagttgatcatatgaatcaggtaaactctgaagtagaagttctgca 24597894  T
Q  3834 cgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccattt 3933  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||  ||| ||||||||  ||||     
T  24597895 cgttcattttcagctattgtgaaatctgaggctgtgagctgagcaaatagtgtattcatggtatttatgtgatttgttattgatatggattcattcattc 24597994  T
Q  3934 gaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttctt 4033  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  24597995 ggagagtgtagagcctcctttttaagaaaattcttgtgtgaagtgacttgacctcgtacaatttaataagagcatcccagatctcctttgcagacttttt 24598094  T
Q  4034 ttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgca 4133  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  24598095 ctctgcaatacttgacaataccgaatctgccattgctaagtgcaaattggcaacagcgttgtcatccatctctttccacttttgatcggtgatatctgca 24598194  T
Q  4134 agtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatct 4233  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  24598195 ggtctgccatcaattgcatctaggcaattgtcttttcttagaatcgcccttatctttaatttccacagtgagaaattactcccattaaacttctcaatct 24598294  T
Q  4234 caaatttcgctgccatggtttt 4255  Q
     |||||| | ||||||||||||    
T  24598295 taaattttgttgccatggtttt 24598316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Complemental strand, 87267 - 87218
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  87267 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 87218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4299 - 4346
Target Start/End: Complemental strand, 19803226 - 19803179
Alignment:
Q  4299 ttcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19803226 ttcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 19803179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 295
Target Start/End: Original strand, 24594367 - 24594404
Alignment:
Q  258 acatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtga 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24594367 acatcttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtga 24594404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 9439678 - 9439710
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9439678 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 9439710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 9444398 - 9444430
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444398 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatg 9444430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 3749; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 3749; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 4359
Target Start/End: Complemental strand, 829958 - 825858
Alignment:
Q  259 catgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgagga 358  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  829958 catgttcacaatatcccacttaaagctacttttgtgagcattcaaagtctctctaccttgccaactccagttgctatgtttccaataggccatacgagga 829859  T
Q  359 tcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctct 458  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||    
T  829858 tcgacaccatataaacttgtcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctaggttatcattagtgtgaatcttctacatatccacgcttccttcctct 829759  T
Q  459 actacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaat 558  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829758 actacttctcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaat 829659  T
Q  559 acacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttc 658  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  829658 acacagtaattttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccagatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttc 829559  T
Q  659 tgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatca 758  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  829558 tgtcgttgacagagctacaacagtttgtaacttggataaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcc 829459  T
Q  759 tgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatga 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  829458 tgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctggggttcctttaatgtacctcatga 829359  T
Q  859 ttctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggc 958  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829358 ttctcttaacaacattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggc 829259  T
Q  959 atacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattc 1058  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829258 atacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccacttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattc 829159  T
Q  1059 acaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctt 1158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  829158 acaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaaataattcttttgagaaagccaaatattcctgtctt 829059  T
Q  1159 ttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcg 1258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829058 ttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcg 828959  T
Q  1259 atctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaa 1358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828958 atctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattatcatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaa 828859  T
Q  1359 ctaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgc 1458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  828858 ctaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgc 828759  T
Q  1459 aaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccag 1558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828758 aaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccag 828659  T
Q  1559 ctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaatacct 1658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828658 ctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaatacct 828559  T
Q  1659 tctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatgg 1758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828558 tctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgattccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatgg 828459  T
Q  1759 ctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccga 1858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  828458 ctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatctgg 828359  T
Q  1859 accattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggt 1958  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  828358 atcattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgccaagatggt 828259  T
Q  1959 ttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttgg 2058  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  828258 ttctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttgg 828159  T
Q  2059 atttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaac 2158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  828158 atttttcttccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactagatccctgctaac 828059  T
Q  2159 aacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgtt 2258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828058 aacaaccttgcgggtagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgtt 827959  T
Q  2259 ttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttca 2358  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827958 ctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttca 827859  T
Q  2359 aatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagc 2458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  827858 aatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcacagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataac 827759  T
Q  2459 tcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgttta 2558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827758 tcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgttta 827659  T
Q  2559 caaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatg 2658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827658 caaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatg 827559  T
Q  2659 ccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcc 2758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827558 ccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcc 827459  T
Q  2759 cagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgctta 2858  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  827458 cagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttg 827359  T
Q  2859 ctcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggc 2958  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  827358 cttatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggc 827259  T
Q  2959 ctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaatt 3058  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  827258 ctagtctttgatgtcacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatcctcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagatt 827159  T
Q  3059 acttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgt 3158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  827158 acttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattacctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgaggtcatccaattgt 827059  T
Q  3159 ccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactc 3258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827058 ccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactc 826959  T
Q  3259 cagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgt 3358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826958 cagcaatttctaatgcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgt 826859  T
Q  3359 tgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtactt 3458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826858 tgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcgctatacaggatttccccgtcatctgaggtactt 826759  T
Q  3459 gcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgt 3558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826758 gcaacacatccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacattccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgt 826659  T
Q  3559 agcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagc 3658  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826658 agcatttaatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactgcggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagc 826559  T
Q  3659 ctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatca 3758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826558 ctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctagattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatca 826459  T
Q  3759 gctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaat 3858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826458 gctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaat 826359  T
Q  3859 cagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaa 3958  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  826358 cagaagctgtgagttgagaaaatagcgtattaagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaa 826259  T
Q  3959 gaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgag 4058  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826258 gaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgag 826159  T
Q  4059 tccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggc 4158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  826158 tccgccattgctaggtgcaaattggcaacggaattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggc 826059  T
Q  4159 aattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttaca 4258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  826058 aattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagcgaaaaatttctcccgttgaacttctcaatctcaaatttcgctgccatggttttaca 825959  T
Q  4259 ccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttc 4358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825958 ccaaatatttttctttcaaactagaccggaacaataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttc 825859  T
Q  4359 t 4359  Q
    |    
T  825858 t 825858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 1239
Target Start/End: Complemental strand, 28715550 - 28714582
Alignment:
Q  259 catgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgagga 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||  | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  28715550 catgttcacaatctcccacttaaagctacattttttagaattcaaaatctctctacctcgccaacttccgttgctacattttcaataggccatatgagga 28715451  T
Q  359 tcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctct 458  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||     
T  28715450 tcgacactatagaaacttgtcagcattgatcgactttgtcattacatctgctaggttatcattggtgtgaatcttatgcatattcacact-ccctcctcc 28715352  T
Q  459 actacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaat 558  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||          ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28715351 ac-actactcgaacaaaatgatattgaacacctatgtgcttcatccttgaacgaaaagttggatt----------tgcaaggcactataactatcacaat 28715263  T
Q  559 acacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28715262 acacagtaatttgctcctgcttgtgcccgagtacctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttc 28715163  T
Q  659 tgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatca 758  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28715162 tgacgttgacatagctacaacagtttgtaacttggataaccaacttactgctcctctcgcaagcatgaacacgtaaccagtaaaagattttctttcatca 28715063  T
Q  759 tgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatga 858  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28715062 tgatcaccggcaaaatctgaatcaacataacccatgacaattaactctgatcctccgaaacatattgcaacacatgaggttcctttaatgtacctcatga 28714963  T
Q  859 ttctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggc 958  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28714962 ttctcttaacaacattccaatgctctttataaggatctgtcataaaccgactaaccactcccactaattgtgcaatctctgatcttgtacatatcatggc 28714863  T
Q  959 atacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattc 1058  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28714862 atacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtattcgagacatttacatcctctctgcttcattgctaggactcatacatgtggatagtttaaaattc 28714763  T
Q  1059 acaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctt 1158  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  28714762 atagaaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaagactttccttatacaattcttttgagaaaaccaaatctttctatctt 28714663  T
Q  1159 ttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtg 1239  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28714662 ttctatctcagtgaatttacatccctaaaatcttgtttgttggtcccaagtctttcatatcgaactccctaaccaactgtg 28714582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 1569
Target Start/End: Original strand, 13840763 - 13842061
Alignment:
Q  258 acatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacg--- 354  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||        
T  13840763 acatgtttacaatctctcacttaaatctacttttgtgagcttctaaaatttctctgccttgccaactcttgttgctatgtttccaataggtcatacttcc 13840862  T
Q  355 -aggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccct 453  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||  |||| |||||| |    
T  13840863 caggatcgacgccatacaaacttattagcattgatcggttttgtcaccacatccgttaggttatcacttgtctgaatcttctgcacatccatacttcctt 13840962  T
Q  454 cctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtc 553  Q
    | || |||||||   ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  13840963 cgtcgactactttt-gaacaaaatgatattgaacacttatgtgttttgtccttgaatgaaaaa-tgaatttcttgcaatgtgaaaggcattctaattgtc 13841060  T
Q  554 acaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactcc 653  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || || | || ||||||||||||     
T  13841061 acaatacatagtaatttgatgttgtttgtgcccaagttcctccattaacctttgcattcaaataacttccttgcaagcatgggaagatgccatgtactca 13841160  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
    | || ||||||||||| |||||||     || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||| ||||||   ||||| | |    
T  13841161 gttt-tgtcgttgacaaagctaca-----ttctaacttggataaccaacttaccgctcctcgtataaacgtgaacacataatcagtag---attttatat 13841251  T
Q  754 tatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacct 853  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| || || ||    
T  13841252 tatcatgatcacttgtaaaatctgaatcaacataacccttgtcatttaactctgatcctccgaaacatattgcaacacttgaggtttctttgatatatct 13841351  T
Q  854 catgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatc 953  Q
    ||  ||||  ||||||  |||  || | | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13841352 caaaattcatttaacaa-atttaaaggatatttaccaggatatgccataaaccgactaaccactcccactatttgtgtagtgtctggtcttgtacatatc 13841450  T
Q  954 atggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaa 1053  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||    
T  13841451 atggaatacataaggctttccaccatcaatgcatacggtactcgagacatctccatcctcactacttcatttctaggactgatacctacgaataatttaa 13841550  T
Q  1054 aattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcct 1153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| |    
T  13841551 aattcacaggaagtgaggtagagattag-ttacaatcttgcatgttaaagtatcgcaagactttccatagataatcattttgagaaaggtaaatcttctt 13841649  T
Q  1154 gtcttttctgtct-cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctg 1252  Q
    ||||||| ||| | |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| | |||||||| | || || ||||||||     
T  13841650 gtctttt-tgtatacaatgaatttgtatccttaaaatcttgtttgctggtcccaagtc----atatcgaacacactagccaattttgtctgcaattcctc 13841744  T
Q  1253 gactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatgg 1352  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||||||||||    
T  13841745 gactcaatctttgttgggtcctaccaccaatatgtcgtccatacacaacaacaaaatgataaaatcgttatcataaaaaaatttgcagtacgtacaatgg 13841844  T
Q  1353 tctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtca 1452  Q
     || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||   || |||| |||||| ||||    
T  13841845 cctaaactcagtctgttgtaatgaaggctaattatcaaagaattaaatatcttgtagcaacatatggacacctgctttcagccgtacaaagatttagtca 13841944  T
Q  1453 acctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttac 1552  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13841945 acctacaaactaagttttcttttccttcttctttggatctttctggttggagcatataaatgtcttcttcaatttcaccatgaaaaaaagcagtctttac 13842044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3389 - 4359
Target Start/End: Original strand, 13842766 - 13843735
Alignment:
Q  3389 gagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcg 3488  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||   |||| | |||||  || ||||   || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  13842766 gagttgtctttcgcctttataactagttgttgctttgttatatatgattttaccatcattcaagatactttcaacacatccttaagatgttgaagctgca 13842865  T
Q  3489 gaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagatt 3588  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  13842866 gaagtcttctatcagttcttcttattattccaacactcagtctttaagtgccctctcagaccataattgtagcatttgagattcttccttcttcaatatt 13842965  T
Q  3589 ttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttc 3688  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13842966 tttatctaccatgattt-gacttccactgggatcacattatgttgatctgcctattgtcattgtcaaagcatctggttgctttgaactctcagacctttc 13843064  T
Q  3689 ttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatg 3788  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| || |||| |||| || |  ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  13843065 ttccttattcttaggtctggattctactccaagaattgaactgttgacatcatcaaagtgaagagtgtcaactatattgttatttgtaatgttgatgatg 13843164  T
Q  3789 agttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtat 3888  Q
    |||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  13843165 agttgatcatacaaatttgatatactatgaagtagaagttcaacatgctcattttctgctattatgaaatcagaagttgtaagttgagaaaatagtgtat 13843264  T
Q  3889 tcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctc 3988  Q
    ||| ||| || |||||||  ||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  13843265 tcaaggtcttaatgtgatatgttattgatgtggattcactcattctaagagtgtagagcctcccatttaagaatattatgttatgaagttatttgacctc 13843364  T
Q  3989 gtacaattttattagagtatcccagatc-tcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaac 4087  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  13843365 gtacaattttattagagtgtcctagatcttcctttgttgccttcttttcaacaatacttgacaatatcgagtctaccattgcaaggtgcaaattggcaac 13843464  T
Q  4088 ggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatc 4187  Q
      | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  13843465 aacgttatcatctatctctttttacttttcgtcagtgatatttgcaagtttgccatcaattgtgtctacacaattatcttttcttaaaattgcttgtatc 13843564  T
Q  4188 ttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccgg 4287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| || || | ||      
T  13843565 ttcaatttccaaagggaagaatttctcctgttgaacttttctatctcaaatttcgatgtcatggttttacaccaactttttttcttt-aagctggtccta 13843663  T
Q  4288 aataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | || |  ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  13843664 aataataagaatttttttttgatgtggaaaatcaatctatattgcaaccacataacatactaatatttttct 13843735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3170 - 3554
Target Start/End: Complemental strand, 15604237 - 15603853
Alignment:
Q  3170 taaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttct 3269  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15604237 taaattctttttcgacctctttacatgatgtactccttgtatttttcaaacagtatcatcatgaatctttaatctgatagtacctacttcagaaatttct 15604138  T
Q  3270 aaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaat 3369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15604137 aaggcatgatcattttccatgtacactaatccttctgagatgggttcataagagtaaacccaatctcggtgcagagtcgtgtgccatgttacacctgaat 15604038  T
Q  3370 ccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatcc 3469  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |   |||| || |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15604037 ccattatccagacatcgttgagtcgtgttccaaatttataaatagttgttgcttcgctatacaagattcccccatcatctgaggtacttgcaacacatcc 15603938  T
Q  3470 ttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaa 3554  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  15603937 ttgagatgttgaagcttcataagtgttctctccattctttttattattccagcacaccttctttaagtgccctctcattccacaa 15603853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3279 - 3656
Target Start/End: Complemental strand, 15603691 - 15603315
Alignment:
Q  3279 tcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatcc 3378  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||| ||| |||||||| |    
T  15603691 tcatttcccatgtccactgatcctactaagataggttcataagagtaaaacaaatctcggtgcggattcaagtgtcatgttacacttga-tccattattc 15603593  T
Q  3379 agacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgt 3478  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || || | | ||||||    
T  15603592 agacatcgttgagccgtcttccgcatttagaactagttgatgcttcgctatatagcatttccccgtcatatgaggtacttgcagcaaataccttagatgt 15603493  T
Q  3479 tgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttcttt 3578  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| | ||||   || ||||| | ||| ||||||    
T  15603492 tgaagcttcagaagtcttctctccattctttttatgattccaatactcattctttaagtgtcctctcattctacaattataacattttagatttttcttt 15603393  T
Q  3579 cttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaa 3656  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  15603392 ctttgagattttgacctatcatgattttgactcctagtggagccaggttaggttgatcttcctcgtgtcatcgtcaaa 15603315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1630 - 1990
Target Start/End: Original strand, 13842065 - 13842424
Alignment:
Q  1630 gagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgttt 1729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||    
T  13842065 gagaaaatatctcattgaaatcaatacctcttttctgagtatatcctttgacaatcaatcttgcacgatatcgtctcacttgatcatttccatcacattt 13842164  T
Q  1730 gatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgc 1829  Q
     |||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13842165 tatcttgtatatccatttgttttcgatggattttcgagcctttagaagttcaacaagatctcttgtcttgtttctatgtaaggctttaatttcttcatgc 13842264  T
Q  1830 attgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttg 1929  Q
    | |  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| || || | || ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |    
T  13842265 act-ttttcatccattgagaagcatacgaacaattcaacacctcttgataatttaaaggctcatcttcttcagctagaagacaatatgcattgtggctcg 13842363  T
Q  1930 tcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacacc 1990  Q
     | | ||| ||||||||| | | || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13842364 ccgtgacagagtctgattactaggatggtttatgcatctgacgcattgatcgacgaacacc 13842424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3062 - 3332
Target Start/End: Original strand, 13842485 - 13842755
Alignment:
Q  3062 tgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtcca 3161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||    
T  13842485 tgtgatcttttttgctttcatcaccagaagatttcctttcactactttcaagatgccactttcagtgtggatcacacactcgaggtcatctaattgtcca 13842584  T
Q  3162 acagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccag 3261  Q
    | ||| ||| ||| ||| || |  || |||||||| || ||  ||| ||||||   |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13842585 atagaaaatgaatcctttttaactccttttacatgtcgtaccacttttattttatgaacaatatcatcttgcatctttaatatgatagtaccgactccaa 13842684  T
Q  3262 caatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaa 3332  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13842685 caatttctaaagcattgtaatttcccatgcacaatcatccttttcagataggctcataagagtaaaaccaa 13842755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3629 - 3766
Target Start/End: Complemental strand, 15603828 - 15603691
Alignment:
Q  3629 cgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgca 3728  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15603828 cgttgatatgcctttcgtcatcttcaaagcctctgcatgctttgaactctctggcctttcttccttattcttgcgcatggattcttcttcatggattgca 15603729  T
Q  3729 ccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgtt 3766  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15603728 ccggtaacatcgtcaaagttaagagtatcagctatgtt 15603691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 5198961 - 5199062
Alignment:
Q  1 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttataggaccgtaaaagccatgcctcaaccattttcattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||| || |||||    
T  5198961 tacttgttcttgtgttgttactgatttgggatgagtagaatggtgcaagggacatgctatttatactagtgaaagagccatgccccaaccaattgcattt 5199060  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  5199061 at 5199062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1514 - 1553
Target Start/End: Original strand, 17455350 - 17455389
Alignment:
Q  1514 ttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttaca 1553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17455350 ttcttcttcaagttctccatgaacaaaagcagtctttaca 17455389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 973; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 973; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 263 - 1431
Target Start/End: Original strand, 27877 - 29045
Alignment:
Q  263 ttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatcga 362  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27877 ttcacaatctcccacttaaagctacttttgcgagcttccaaaatctctttaccttgcccattcatgttgctacgtttccaataggccataggaggatcga 27976  T
Q  363 caccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctacta 462  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27977 caccatataaacttgtcagcattgattggttttgtaatcacatctactagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctccacta 28076  T
Q  463 cttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacac 562  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28077 cttctcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacac 28176  T
Q  563 agtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtc 662  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28177 agtaatttaatcctgcttgtgcacgagttcctccataaacctttgcaaccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtc 28276  T
Q  663 gttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgat 762  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28277 gttgacagagctacaacagtttgtaacttggataaccaacttactgctcctcctgaaagtgtgaacacataatcagtagtagattttcttttatcatgat 28376  T
Q  763 cacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattct 862  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28377 cacctacaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctctgaaacatattgcaacatccgaggttcctttaatgtacctcatgattct 28476  T
Q  863 cttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatac 962  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28477 cttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatac 28576  T
Q  963 ataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacag 1062  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28577 ataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacatgaggataatttaaaattcacaa 28676  T
Q  1063 gaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttct 1162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28677 gaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttct 28776  T
Q  1163 gtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatct 1262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28777 gtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaattgtgccttcaattcccggactcgacct 28876  T
Q  1263 ttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaa 1362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877 ttgttgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattgccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaa 28976  T
Q  1363 gtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgcttta 1431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28977 gtctgttgtaattgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgcaccaacatctgggcgcctgcttta 29045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 945; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 945; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2776 - 4359
Target Start/End: Original strand, 8136818 - 8138402
Alignment:
Q  2776 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2875  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8136818 actcccacacatcataatggatcaagtctagtatatgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 8136917  T
Q  2876 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaa-ggagattgcgttccacaaggac-tttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgcc 2973  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||  |||| |||||| |||| | |||||||||||| |  ||| ||    
T  8136918 acagaatggtaagtttaccgtcttcagcctgtgaaaggagattgcgttccgcaaagaaatttccagccacattctaatatatggcctagtttgcgatacc 8137017  T
Q  2974 acatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttg---caatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatctt 3070  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||  |    |||||||         |||||||||| |||||||||||| ||    
T  8137018 acatcatcgttgtttctttttggcttgcaactgcaattgatgcatccgcctaatataacaatgta---------agcatgtatagattacttgtgatatt 8137108  T
Q  3071 ttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaat 3170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8137109 ttcttctttcatcaccacaagattgcatttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaat 8137208  T
Q  3171 aaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttcta 3270  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8137209 aaattcttcttcaacccatttagatgatgtactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgacttcagcaatttcta 8137308  T
Q  3271 aggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatc 3370  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8137309 aggcatggtcatttcctatgtacattgatccttctgaaataggctcataagagtaaaaccaatctcgatgtggagtcatatgccatgttgcacctgaatc 8137408  T
Q  3371 cattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatcct 3470  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8137409 ctttatctagacatcgttgagtcatctttcgactttagaactagtcgcttcttcgctatgcaggagttccccgtcatctgagatacttgcaacacatcct 8137508  T
Q  3471 tgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatat 3570  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  8137509 tgagatattgaagcttcataagtcttctctccattcttcttattattccaagactcattctttaagtgacctctcatgccacaattgtagcatttgagat 8137608  T
Q  3571 tcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctt 3670  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| ||| || ||||||||  ||||| | |||||||    
T  8137609 tcttctttcttcgagattttaaccgaccatgattttgattcccactagggaaacattccgttgatcttcctttcatcatcgtc-tagcctttacttgctt 8137707  T
Q  3671 tgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttatta 3770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8137708 tgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctgaattcttcttcaagggttgcaccgacgacattatcaaagtgaagagtatcagctatgttatta 8137807  T
Q  3771 tttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtga 3870  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||    
T  8137808 tttggaatgttgatgatgagttgatcatacaaatatggtaaactctgaagtagaagttccacacgctcattttccgctattttgaaattagaagttggga 8137907  T
Q  3871 gttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgtt 3970  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8137908 ttttagaaaataccgtattcagggtgttgatgtgatctgttatgaatgtggattcacccattcgaagagtgtagagcctcctctttaagaatattctgtt 8138007  T
Q  3971 gtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgct 4070  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8138008 gcggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatccccgatctcgtttgttgtcttcttttcagcaatacttgacaatacccagtctgccattgct 8138107  T
Q  4071 aggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaatta-tctttt 4169  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  8138108 aggtgcaggttggcaacaacattatcttccatctttttccactttttgttagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctatgcaattattttttt 8138207  T
Q  4170 cttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaa-----at 4264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  8138208 cttaaaattgcccttatcttcaatttcaatagggaaaaatttctctcgttgaacttctctatctaaaatttcgctgccatggttttacaccaattatttt 8138307  T
Q  4265 atttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||||||| |||||||| | |  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8138308 atttttctctcaaactatatcaaaatagtaagaattcttttatgatgtggaagttcagtctaaaccacaaccaaatagcatactaagatttttct 8138402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 263 - 1127
Target Start/End: Original strand, 2323956 - 2324791
Alignment:
Q  263 ttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacgaggatcga 362  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2323956 ttcacaatctcccacttaaagccacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgcccattcatgttgctacgtttccaatagtccatacgatgatcga 2324055  T
Q  363 caccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctacta 462  Q
    ||||||| ||||||   ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2324056 caccatataaacttggtagcattgattggctttgtcatcacatctgctagggtatcattggtgtggatcttctgcatatccacacttccctcctttacta 2324155  T
Q  463 cttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacac 562  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| |||||||||     
T  2324156 cttctcgaacaaaatgatat-gaacgtcaatgttctttgtctttgaatgaaaagatggattccttgcaatgtccac------ctgactgccacaatacaa 2324248  T
Q  563 agtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtc 662  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  2324249 agtgattttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtacttagcttctgtc 2324348  T
Q  663 gttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgat 762  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2324349 gttgacaaagctacaacagtttgtaacttggataactaacttacaactcctcctgcaagtgtgaacacataactagtagtagattttcttttatcatgat 2324448  T
Q  763 cacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattct 862  Q
    |||||||||||||||| |||| | | ||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  2324449 cacctgcaaaatctgactcaagaaatcccccaacggttaactctgatcctccgaaacatattgcaacacctgaggttccttttatatacatcatgattct 2324548  T
Q  863 cttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatac 962  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||                      ||||||||| |||| |||| |||||    
T  2324549 cttaacagcattccaatgctctttaccaagatccgccataaaccgaccaacca----------------------tggtcttgtgcataccatgacatac 2324626  T
Q  963 ataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacag 1062  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2324627 aaaaggcttcccaccacctatgcatacggtactcgagatatttccatcctctctgcttcattactaggactcatacttgaggataatttaaaattcaaag 2324726  T
Q  1063 gaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataa 1127  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  2324727 gaagtggggtagaggctggcttacagtcttgcatgttgaagcgttagaagactttccttagataa 2324791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 861 - 1648
Target Start/End: Original strand, 7506016 - 7506802
Alignment:
Q  861 ctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcat 960  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7506016 ctcttaacaacatcccaatgctctttaccaggatccgccataaattgactagccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatcatggcat 7506115  T
Q  961 acataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcac 1060  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |     
T  7506116 acataaggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctatctacttcattgctaggattcatactagaggataatttataattgat 7506215  T
Q  1061 aggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctttt 1160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| | || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7506216 aggaagtggggtagatattggcttacagttttgcatgttgaagcgccgcaaaatttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcctatctttt 7506315  T
Q  1161 ctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgat 1260  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  7506316 ctatctcgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctgaccccaagttcttcatatcgaactccctagccaattatgcctttaattcttggacttgat 7506415  T
Q  1261 ctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaact 1360  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  7506416 ctttgttgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaataacaaaatgataaaatcattatcaccaaacctattgtagtatgtacaatggtctgaatt 7506515  T
Q  1361 aagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaa 1460  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7506516 aagtctgttgtattcaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcatgttttagaccgtacaaagatttggtcaacatgcaa 7506615  T
Q  1461 accaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagct 1560  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  7506616 accaagttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggtt-gagcatatatatttcttcttcaagctgtccatgaagaaaagcagtttttacatctaatt 7506714  T
Q  1561 gttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaa 1648  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7506715 gttcaagatgtaaatcaaacgcagcacacatagccaaaactattctgatggtaatgagtctaacaactggggagaatatttcattgaa 7506802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1615 - 1954
Target Start/End: Original strand, 2324789 - 2325127
Alignment:
Q  1615 taagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatc 1714  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2324789 taagtctgacaaccgga-aaaatatctcatcaaagtcaataccttctttctgagtatatccttttaccatcaatcttgaacgataccgttccacttgatc 2324887  T
Q  1715 attgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcc 1814  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  2324888 atttccatcacgtttgatcttgtctatccatttgtttccaatggctttccgtccctttggaagttcaacaagttcccctatcttgtttctatgtaaggcc 2324987  T
Q  1815 tccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaat 1914  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2324988 tccatttcttcaagcattgttgtcatccattgagaaacatctgaaccgttcaacgcctcttgaaaagttaaaggttcaccttcttcagttataagaccat 2325087  T
Q  1915 atgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaaga 1954  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  2325088 atgcatcgaggctcgtcataacatagtcggattaccaaga 2325127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4025 - 4359
Target Start/End: Complemental strand, 25441478 - 25441138
Alignment:
Q  4025 tgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattg----ctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtc 4120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25441478 tgtcttcttttcagcaatacttgacaatactgagtccgtcattggcgtcgatgtgcaaattggcgacgacattatcatccatctctttccactttccgtc 25441379  T
Q  4121 agtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttg 4220  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  25441378 agtgatatctgcaggtctgacatctatcgcatctaggcaattatcttctcttaaaatttcccttatcttcaatttccataggaaaaaatttctcccattg 25441279  T
Q  4221 aacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaata--tttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaaga 4318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25441278 aacttctctatctcaaatttcgctgccatggtttttcaccaaatatgttttttcttcaaactagacaggaataataagaattcttttatgatgtgaaaga 25441179  T
Q  4319 tcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 4359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25441178 tcagtttacaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 25441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 354 - 868
Target Start/End: Original strand, 7504696 - 7505210
Alignment:
Q  354 gaggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccct 453  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || |    
T  7504696 gaggatcgacaccatgtaaatttgtcagtattgattgactttgtcataacatctgctaaattgtctttggtgtgaattttttgcatatcaacactccctt 7504795  T
Q  454 cctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtc 553  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7504796 tctctaccacttctcgaacaaaatggtattgaacatctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattccttgcaatgtgcaatgcactctgactgtc 7504895  T
Q  554 acaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactcc 653  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  7504896 acaatacacaacaatttgttgttgactgtgcacgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcgtagctgccatatattca 7504995  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
    |||||||| || || |||||||| ||   |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7504996 gcttctgtagtagatagagctacgacaaattgtaattttgacaatcaacttaccgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttt 7505095  T
Q  754 tatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacct 853  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || ||    
T  7505096 tatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatct 7505195  T
Q  854 catgattctcttaac 868  Q
    || ||||||||||||    
T  7505196 caggattctcttaac 7505210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 256 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 22510398 - 22509836
Alignment:
Q  256 acacatgttcacaatctcccacttaaagtcacttttgtgagcttccaaaatctctctaccttgccaactccagttgctacgtttccaataggccatacga 355  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||  | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |       
T  22510398 acacatgttcactatctc--aattaaagctatttttgggagctttcaaaatatctctaccttgccaactcctgtttctatgttttgaataggccacagag 22510301  T
Q  356 ggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcgg-ctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctc 454  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| | |||||  | |||| |||| ||||||||| | |||||||  || ||||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  22510300 ggattgacaccatataaacttatcaatattgattagactttttcatcacatctgcttggttatcatcagtttgaatcttcggcatatccacatgtccctc 22510201  T
Q  455 ctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtca 554  Q
    ||| || |||     || |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  22510200 ctccacaactaatacaaaaaaatggtattgaacgcctttgtgcatcgtcttggaatacaaagttggattgcttgaaatgtgcaagacactctgactatca 22510101  T
Q  555 caatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagta-gctgccatgtactcc 653  Q
    ||||||| |||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  | | ||||  || ||||||| ||     
T  22510100 caatacaaagtaatttgttgatacttgtgcgcgagttcctccattaaccttatcatccaaatagcttccttgcaaacct-agtatacttccatgtattca 22510002  T
Q  654 gcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttt 753  Q
      |||| | |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||     ||||| ||||| || || |||    
T  22510001 atttctcttgttgacagagcttcaacaattggtaacttggacaaccaaattactgctcctcttacaaatgtgaa-----aaccaatagtatatatttttt 22509907  T
Q  754 t--atcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacata 822  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  22509906 tcaatcatgatcaccttcaaaatctgaatcaacataacacctaatggttaactttgatcctccgaaacata 22509836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2581 - 2781
Target Start/End: Original strand, 8134716 - 8134907
Alignment:
Q  2581 ctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatc 2680  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||    
T  8134716 ctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttctcaatttcacgctttatttgtgctttgaat---------actgaaaacacatc 8134806  T
Q  2681 cgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcc 2780  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8134807 tgacttcttcttaattgggtacacccataatcttctggaatagtaatcaatgaatgagacgaaatatcttgcccctcccagagatatttctggtgactcc 8134906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 37957162 - 37957033
Alignment:
Q  355 aggatcgacaccatacaaacttatcagtgttgatcggctttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctc 454  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   || || | ||||||||| |||  |||||||  ||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  37957162 aggatcgacatcatataaacttatcaccattaattgactttgtcatcacacttgctagacaatctttattgtgaatctattgcatgtccacacttccttc 37957063  T
Q  455 ctctactacttcgcgaacaaaatgatattg 484  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37957062 ctctactacttcgcaaacataatgatattg 37957033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Complemental strand, 11712121 - 11712072
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11712121 aattattttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 11712072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 742 - 1314
Target Start/End: Complemental strand, 34973530 - 34972958
Alignment:
Q  742 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 841  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  34973530 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgaatcgacataacccctaacagttaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacctgaggttcc 34973431  T
Q  842 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 941  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  ||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||    
T  34973430 tttattgtacctcataattctatcgacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactctcgctgtttgttcaatgtcttgt 34973331  T
Q  942 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 1041  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34973330 cttgtacatataaagacatacataaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 34973231  T
Q  1042 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaag 1141  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34973230 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttagataattcatttaagaaag 34973131  T
Q  1142 ccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgcc 1241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  34973130 ccaaatcttcttgtcttttctgtcttggtgagtttgcatcgctaaaacctggtttgctagtcccaagtctttcatattgaattccctaaccaattgtgcc 34973031  T
Q  1242 ttcaattcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataa 1314  Q
    |||||| | |||||   || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||    
T  34973030 ttcaatacttggacctaatatttgttggggcctaacaccaacatgtcgtccatatacaataacaaaataataa 34972958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1382 - 1826
Target Start/End: Complemental strand, 34972738 - 34972298
Alignment:
Q  1382 aattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt-ccttg 1480  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  34972738 aattacgaaagaatcaaatctcatgtaccaacatttgggtgcatgttttagatcgtacatagattcagtcaacctacaaaccaagttttttttttccttc 34972639  T
Q  1481 ttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaatccaat 1580  Q
    ||| || ||||||||| |||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  34972638 ttctttgaatccttccagttatagtatataaatttccttttcaagctctccatgaagaaaaacactctttgcatctagatgttcaagatgtaaatacaat 34972539  T
Q  1581 gcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcctttta 1680  Q
    ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |     ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34972538 gcaacacacatagccgccactactctgatagtagtaagtctaacaactg-----aataatacattgaagtcaataccttctttatgagcatatactttta 34972444  T
Q  1681 caaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttc 1780  Q
    | |  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  34972443 ccagtagtcttgcatgatattgttccacttgatcattgtcacgacgtttgatcttgcatgcccatttgtttctaatgacttttcgaccctttggaagttc 34972344  T
Q  1781 aacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttca 1826  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  34972343 aacaagctatcatgtcttgtatctatataaggcttctatttcttca 34972298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1658 - 1833
Target Start/End: Original strand, 11926865 - 11927040
Alignment:
Q  1658 ttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatg 1757  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11926865 ttctttctgagcatattattttaccaccggtcttggacgatacggttccacttgatcactaccctcacatttgatcttgtatatccatttgtttcgaatg 11926964  T
Q  1758 gctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattg 1833  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| | | |||||||||||||    
T  11926965 gctttctgaccttttggaagttcaacaagctcacatgtcttgtttctttgtaagtccttcgtatcttcatgcattg 11927040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 393 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 34973826 - 34973592
Alignment:
Q  393 tttgtcattacatctgctagattatcattggtgtgaatcttctgcatgtccacacttccctcctctactacttcgcgaacaaaatgatattgaacgccta 492  Q
    |||||| | ||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||| || |||||    
T  34973826 tttgtcgtcacatcttttaggttatcattagtgtgaatcttcagcatatccacacttctctcttccactacttctcaaataaaatgatattaaatgccta 34973727  T
Q  493 tgtgcttcgtccttgaatg--aaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagt 590  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |||||| | | ||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||| | ||  || ||||| |  |||    
T  34973726 tttgcttcgtccttgaatgaaaaaagttggatttcatacaatgtgcaagacactttaactttcataatacacaataatgtcttgatgcttgtgtctaagt 34973627  T
Q  591 tcctccattaacctttgcatccaaatagcttcctt 625  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34973626 ccctccattaacctttgcatccaaacagcttcctt 34973592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 469 - 624
Target Start/End: Original strand, 41413628 - 41413783
Alignment:
Q  469 gaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaat 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  41413628 gaacaaaatgatattgaacgcctacatgccttgtccttgaatggaaggctggattacttgcaatgtgcaagacactctaactatcacaatatacaataat 41413727  T
Q  569 ttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttcct 624  Q
    |||||  ||| ||||   ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41413728 ttgttattgtctgtgtttgagttcctcaattaacatttgcatcaaaatagcttcct 41413783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1878 - 1979
Target Start/End: Original strand, 11927124 - 11927225
Alignment:
Q  1878 aaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttg 1977  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||  |||||    
T  11927124 aaagttgaaggttcaccttcttcggttagaagacaatatgaattgtgcctcatcataacatagtttgatttccaagatggtttttgcgtttgagttgttg 11927223  T
Q  1978 at 1979  Q
    ||    
T  11927224 at 11927225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Original strand, 2796411 - 2796460
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2796411 aattcttttctgatgtggaagatcacattaaactgcaaccacagagcata 2796460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Complemental strand, 42376144 - 42376095
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  42376144 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacaaagcata 42376095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4148 - 4224
Target Start/End: Original strand, 46344296 - 46344372
Alignment:
Q  4148 tgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaact 4224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||||||||||  |||||||    
T  46344296 tgcgtctaggcaattatggtttcttaaaattgcatttatcttcgattttcacaaggaaaaatttctccaattgaact 46344372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Original strand, 14476165 - 14476214
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  14476165 aattcttttctgatgtggaagatccgattaaactgcaaccatagagcata 14476214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Complemental strand, 23201196 - 23201147
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  23201196 aattcttttctgatgtggaagatcatattaaactgcaaccacatagcata 23201147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3775 - 3843
Target Start/End: Complemental strand, 46452619 - 46452552
Alignment:
Q  3775 taatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcatttt 3843  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46452619 taatgttgatgatgagttcatcatagga-tctaataaactatgaagtagaagtttagcacactcatttt 46452552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 42; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4297 - 4346
Target Start/End: Original strand, 28822 - 28871
Alignment:
Q  4297 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 4346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28822 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 28871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University