View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3310_low_2 (Length: 3896)

Name: NF3310_low_2
Description: NF3310
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3310_low_2
NF3310_low_2
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (13-3896)||(48697876-48701759)
chr4 (13-3896)||(42266282-42270165)
chr4 (13-3896)||(30946238-30950121)
chr4 (4-1380)||(2001772-2003154)
chr4 (1633-3443)||(1999723-2001521)
chr4 (2581-3812)||(21513658-21514893)
chr4 (3494-3762)||(1999427-1999695)
chr4 (1176-1287)||(30165462-30165573)
chr4 (3812-3896)||(1979694-1979778)
chr4 (1021-1104)||(28608721-28608804)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (13-3896)||(27874764-27878647)
chr6 (4-1682)||(26976939-26978602)
chr6 (4-821)||(1472511-1473327)
chr6 (3397-3896)||(30967787-30968287)
chr6 (16-854)||(21964817-21965640)
chr6 (835-1724)||(18148080-18148970)
chr6 (3080-3363)||(30968283-30968566)
chr6 (3260-3792)||(8480108-8480640)
chr6 (1633-2073)||(8481374-8481814)
chr6 (1195-1391)||(8565162-8565358)
chr6 (136-258)||(18967120-18967241)
chr6 (3629-3896)||(23012182-23012438)
chr6 (2-87)||(18967256-18967341)
chr6 (1315-1516)||(8564961-8565161)
chr6 (3423-3665)||(8481005-8481247)
chr6 (2963-3043)||(8479998-8480078)
chr6 (3834-3883)||(16777060-16777109)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (13-3896)||(41718789-41722672)
chr5 (85-3746)||(34352542-34356200)
chr5 (2859-3352)||(31502110-31502590)
chr5 (3259-3762)||(23318806-23319308)
chr5 (1195-1503)||(7778168-7778475)
chr5 (4-89)||(34359375-34359460)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (4-3896)||(5819321-5823213)
chr3 (1554-3896)||(2814859-2817201)
chr3 (1572-3792)||(42585440-42587654)
chr3 (4-822)||(54544598-54545416)
chr3 (4-1488)||(42587735-42589219)
chr3 (413-770)||(25877805-25878161)
chr3 (90-535)||(25880583-25881030)
chr3 (363-558)||(25880372-25880567)
chr3 (3202-3665)||(47277022-47277494)
chr3 (3415-3753)||(25877355-25877693)
chr3 (219-328)||(25880239-25880348)
chr3 (3834-3883)||(5382624-5382673)
chr3 (3829-3883)||(13722392-13722446)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (13-3896)||(9440146-9444030)
chr8 (1572-3792)||(24596102-24598316)
chr8 (4-1488)||(24594537-24596021)
chr8 (3834-3883)||(87218-87267)
chr8 (3836-3883)||(19803179-19803226)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (4-3896)||(825858-829750)
chr2 (4-776)||(28714582-28715344)
chr2 (13-1106)||(13840984-13842061)
chr2 (2926-3896)||(13842766-13843735)
chr2 (2707-3091)||(15603853-15604237)
chr2 (2816-3193)||(15603315-15603691)
chr2 (1167-1527)||(13842065-13842424)
chr2 (2599-2869)||(13842485-13842755)
chr2 (3166-3303)||(15603691-15603828)
chr2 (1051-1090)||(17455350-17455389)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (2313-3896)||(8136818-8138402)
chr7 (398-1185)||(7506016-7506802)
chr7 (42-664)||(2324197-2324791)
chr7 (1152-1491)||(2324789-2325127)
chr7 (3562-3896)||(25441138-25441478)
chr7 (4-405)||(7504809-7505210)
chr7 (2118-2318)||(8134716-8134907)
chr7 (17-359)||(22509836-22510175)
chr7 (3834-3883)||(11712072-11712121)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (4-968)||(28081-29045)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (279-851)||(34972958-34973530)
chr1 (919-1363)||(34972298-34972738)
chr1 (1195-1370)||(11926865-11927040)
chr1 (13-161)||(41413635-41413783)
chr1 (13-162)||(34973592-34973743)
chr1 (1415-1516)||(11927124-11927225)
chr1 (3834-3883)||(2796411-2796460)
chr1 (3834-3883)||(42376095-42376144)
chr1 (3685-3761)||(46344296-46344372)
chr1 (3834-3883)||(14476165-14476214)
chr1 (3834-3883)||(23201147-23201196)
chr1 (3312-3380)||(46452552-46452619)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (3834-3883)||(28822-28871)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 3752; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 3752; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 3896
Target Start/End: Original strand, 48697876 - 48701759
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697876 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 48697975  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697976 tgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 48698075  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698076 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 48698175  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698176 tgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 48698275  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698276 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 48698375  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698376 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 48698475  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698476 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 48698575  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698576 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 48698675  T
Q  813 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698676 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 48698775  T
Q  913 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698776 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 48698875  T
Q  1013 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48698876 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaagatgtaaat 48698975  T
Q  1113 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 1212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698976 ccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 48699075  T
Q  1213 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 1312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699076 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 48699175  T
Q  1313 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699176 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 48699275  T
Q  1413 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgt 1512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48699276 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcatggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgcgt 48699375  T
Q  1513 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 1612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699376 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 48699475  T
Q  1613 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 1712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699476 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 48699575  T
Q  1713 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgta 1812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48699576 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgta 48699675  T
Q  1813 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 1912  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699676 catcacgtacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 48699775  T
Q  1913 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 2012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699776 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 48699875  T
Q  2013 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 2112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699876 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 48699975  T
Q  2113 gccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 2212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699976 gccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 48700075  T
Q  2213 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtg 2312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48700076 acatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattctggtg 48700175  T
Q  2313 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48700176 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 48700275  T
Q  2413 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 2512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48700276 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcctagtctttgatgccac 48700375  T
Q  2513 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctg 2612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48700376 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctg 48700475  T
Q  2613 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 2712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700476 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 48700575  T
Q  2713 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 2812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700576 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 48700675  T
Q  2813 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 2912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700676 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 48700775  T
Q  2913 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 3012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700776 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 48700875  T
Q  3013 tgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 3112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700876 tgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 48700975  T
Q  3113 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 3212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700976 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 48701075  T
Q  3213 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 3312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48701076 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagttatgttattatttgt 48701175  T
Q  3313 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 3412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701176 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 48701275  T
Q  3413 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 3512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701276 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 48701375  T
Q  3513 gtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 3612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701376 gtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 48701475  T
Q  3613 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 3712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48701476 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctagacaattatcttttcttaaa 48701575  T
Q  3713 attgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 3812  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701576 attgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 48701675  T
Q  3813 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701676 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 48701759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 3700; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 3896
Target Start/End: Complemental strand, 42270165 - 42266282
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42270165 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 42270066  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42270065 tgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 42269966  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269965 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 42269866  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269865 tgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 42269766  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269765 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 42269666  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269665 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 42269566  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269565 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 42269466  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 812  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269465 tgcatccctaagatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 42269366  T
Q  813 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42269365 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgctgtaatc 42269266  T
Q  913 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269265 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 42269166  T
Q  1013 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42269165 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaagatgtaaat 42269066  T
Q  1113 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 1212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269065 ccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 42268966  T
Q  1213 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 1312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268965 ttttacaaccagccttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 42268866  T
Q  1313 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268865 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 42268766  T
Q  1413 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgt 1512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  42268765 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgccaagatggtttctgcgtttgacgcgt 42268666  T
Q  1513 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 1612  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268665 tgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 42268566  T
Q  1613 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 1712  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268565 acaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 42268466  T
Q  1713 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgta 1812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42268465 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgta 42268366  T
Q  1813 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 1912  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268365 catcacatacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 42268266  T
Q  1913 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 2012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268265 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 42268166  T
Q  2013 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 2112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268165 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 42268066  T
Q  2113 gccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 2212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268065 gccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 42267966  T
Q  2213 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtg 2312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42267965 acatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattctggtg 42267866  T
Q  2313 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42267865 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 42267766  T
Q  2413 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 2512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42267765 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcctagtctttgatgccac 42267666  T
Q  2513 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctg 2612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42267665 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctg 42267566  T
Q  2613 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 2712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267565 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 42267466  T
Q  2713 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 2812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267465 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 42267366  T
Q  2813 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 2912  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267365 tggtcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 42267266  T
Q  2913 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 3012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267265 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 42267166  T
Q  3013 tgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 3112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267165 tgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 42267066  T
Q  3113 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 3212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267065 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 42266966  T
Q  3213 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 3312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266965 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 42266866  T
Q  3313 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 3412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42266865 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagctgtgagttga 42266766  T
Q  3413 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 3512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266765 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 42266666  T
Q  3513 gtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 3612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266665 gtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 42266566  T
Q  3613 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 3712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266565 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 42266466  T
Q  3713 attgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 3812  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266465 attgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaatttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 42266366  T
Q  3813 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266365 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 42266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 3620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 3896
Target Start/End: Original strand, 30946238 - 30950121
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946238 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 30946337  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946338 tgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 30946437  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946438 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgtaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 30946537  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946538 tgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 30946637  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946638 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 30946737  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946738 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 30946837  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946838 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 30946937  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30946938 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttattggggccta 30947037  T
Q  813 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 912  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947038 ccaccaatatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 30947137  T
Q  913 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947138 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 30947237  T
Q  1013 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30947238 ccttgttccttaaatccttccggttgaagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaagatgtaaat 30947337  T
Q  1113 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 1212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947338 ccaatgcagcacacattgccaacactactctaatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 30947437  T
Q  1213 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 1312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30947438 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttatatacccatttgtttccaatggcttttcgaccctttgga 30947537  T
Q  1313 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30947538 agttcaacaagctcccatgtcttgttcttacgtaaggcctccatttcttcatgtattgctgtcatccattgagaagcatctgaaccattcaacgcctcat 30947637  T
Q  1413 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgt 1512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30947638 gaaaagttgacggttcaccttcttcagctataagacaatatgcatcgtggcccgtcataacatagtctgattgccaagatggtttctgcgtctgacgcgt 30947737  T
Q  1513 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 1612  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30947738 tgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttctatctgc 30947837  T
Q  1613 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 1712  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947838 agaatagcagtctctttaaaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 30947937  T
Q  1713 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgta 1812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30947938 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctagactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgta 30948037  T
Q  1813 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 1912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30948038 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaatcaatcgtcgttgat 30948137  T
Q  1913 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 2012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948138 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccatttccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 30948237  T
Q  2013 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 2112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948238 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 30948337  T
Q  2113 gccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 2212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948338 gccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 30948437  T
Q  2213 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtg 2312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30948438 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctagaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattttggtg 30948537  T
Q  2313 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30948538 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 30948637  T
Q  2413 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 2512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948638 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 30948737  T
Q  2513 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctg 2612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30948738 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaaccgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctg 30948837  T
Q  2613 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 2712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948838 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcactgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 30948937  T
Q  2713 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 2812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948938 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 30949037  T
Q  2813 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 2912  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949038 tgatcatttcccatgtacactgatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 30949137  T
Q  2913 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 3012  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949138 tccatacatcgttgagttgtctttcgccttcagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 30949237  T
Q  3013 tgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 3112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30949238 tgttgtagcttcagaattcttctctccattcttcttattattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattattc 30949337  T
Q  3113 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 3212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949338 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 30949437  T
Q  3213 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 3312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949438 tctctgacctttcttccttattcttccgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 30949537  T
Q  3313 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 3412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30949538 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctggagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagctgtgagttga 30949637  T
Q  3413 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 3512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949638 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 30949737  T
Q  3513 gtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 3612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949738 gtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtctttttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 30949837  T
Q  3613 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 3712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949838 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 30949937  T
Q  3713 attgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 3812  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30949938 attgcccttatcttcaatttccatagggaaaattttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcattc 30950037  T
Q  3813 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30950038 aaactagaccggagtaataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 30950121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 712; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1380
Target Start/End: Complemental strand, 2003154 - 2001772
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  2003154 tcgaacaaaatggtattgaacatctatgtgttttgttctcgaatgaaagaatggattccttgcaatatgcaatgcactctaactgtcacaatacacaaca 2003055  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  2003054 atttgttgttgactgtgcccgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcatagctgccatatattcagcttctgtagtag 2002955  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    | |||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2002954 atagagctacgacagattgtaattttgacaaccaacttactgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttttatcaagatcacc 2002855  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  2002854 tgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatctcaggattctctta 2002755  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2002754 acagcatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatcatggcatacataa 2002655  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| | ||||||    
T  2002654 ggcttcccaccactgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcatactggaggataatttataattgataggaag 2002555  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  2002554 tggggtagatattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaaaacttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcctatcttttctatct 2002455  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  2002454 cgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggccccaagtccttcatatcgaactccctagccaattgtgcctttaattcttagacttgatctttgt 2002355  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2002354 tgggtcctaccaccaacatgtcatccacaaacaacaacaaaatgataaaatcattattaccaaacctattgtagtatgtacaatggtctgaattaagtct 2002255  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 1003  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2002254 gttgtatccaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcctattttagactgtacatagaattggtcaacctgcaaaccaag 2002155  T
Q  1004 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagca------tataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagct 1097  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |    
T  2002154 ttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggttggagcatatatatatatatttcttcttcaagctctccgtgaagaaaagcagtttttacatctaatt 2002055  T
Q  1098 gttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttc 1197  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||    
T  2002054 gttcaagatataaatcaaacgcagcacacatagccaaaactattctgatggtagtgagtctaacaactggggagaatatttcattgaaatcaatacattc 2001955  T
Q  1198 tttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggct 1297  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2001954 tttctgagcataccctttaaccaccaatcttgcacgatatcgttctacttgatcattactatctcgtttgatcttgtatacccatttgttcccgatggct 2001855  T
Q  1298 ttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatcca 1380  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2001854 ttccgacccttgggaagttgaacaagttcccaacttttgtttctatgtaaggcttccatttctttatgcattgctgccatcca 2001772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1633 - 3443
Target Start/End: Complemental strand, 2001521 - 1999723
Alignment:
Q  1633 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacat--ccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 1730  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  2001521 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccacaagcgat 2001422  T
Q  1731 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 1830  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |  || ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |||    
T  2001421 accccttcacgttgtcagcataacccaagaatatacaatttctagactttggatctagttttgttctttcttgggagttgttcattgcgtacacaataca 2001322  T
Q  1831 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 1930  Q
     || || ||||  |  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||     
T  2001321 tccgaacacatataaggaagaataatcaggtggctttccgttccaaatctccattggtgttttcaaaccaattgcggttgatggagatcgattgatcacg 2001222  T
Q  1931 taacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 2030  Q
    ||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||| ||| | |||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2001221 taataggcagttttcacagcttctgcccagaaagacttagccactcctgttgttctcaacatggctcttgttctatataggagagttatattcatccgct 2001122  T
Q  2031 ctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 2130  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||        |||| || ||||||||||||||| |    
T  2001121 ctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaattgtcttgtaataccttcatgtttgca--------gaaagtcaccatctacatattctgc 2001030  T
Q  2131 tccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttg 2230  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| | ||   ||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2001029 tccattgtttgttcttaagcactttattcttttactagtttcaagttccacgtgtgctttgaattccttgaatactgtaaacacatttgacttcttcttg 2000930  T
Q  2231 attgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaat 2330  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2000929 attgggtacacccataatctcctagagtggtcatcaataaatgacacaaaatattttgctcctcccatggatatttgtggcgactcccacacatcagaat 2000830  T
Q  2331 gtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttac 2430  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |     
T  2000829 gtattaagtcaagtatgtatttgcttctagtagttactatagaaaacttcaatctatgttgcttgcttgtcacacagtgctcacagaaagacaaattcat 2000730  T
Q  2431 tgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttct 2530  Q
    ||||||||||||  | || |||||  ||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  2000729 tgtcttgagcccaggtagaagattttgttccgcaagagctttcaaaccatgttccgacatatggcctagtttgtgatgccacaccattgtcatttcttct 2000630  T
Q  2531 tggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagat 2630  Q
    ||||||||| |  ||    ||||||  || ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  2000629 tggcttgctacaacagtcaatgcattagcatcttgcaatatatcccccacaagcatgtatagattatttgtgagcttttctgctttcatcaccacgaggt 2000530  T
Q  2631 tgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttac 2730  Q
    | || || |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  2000529 ttccctttactacttttaagtttccaccttgagtgtggatcttgcatccgaggtcatccaattgcccaatagacaataaattcttcttcaagtcctttat 2000430  T
Q  2731 atgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtac 2830  Q
     ||||| || ||||||||||| | || ||||||| ||||  |||||| | |||||||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||||| |     
T  2000429 gtgacgtaccccttgtattttgcgaatagtaccagcatgtgtctttattttgatagtaccaatcccaacaacttctaaagtgtgatcattgcccatgaat 2000330  T
Q  2831 acagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtc 2930  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||   |||||||||||| || ||||| || ||| | |||| ||||||  |||| ||||| |    
T  2000329 acagatcattccgagataggttcataggtgcaaaaccaatccttgtgtggagtcatatgtcatgtggcgcctaagtccactatccaaccatcattgag-c 2000231  T
Q  2931 gtcttt-cgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaat 3029  Q
    |  ||| | |||||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||      
T  2000230 gcatttccacctttagaactaattgctactctgctatacaagatttctccatcatctgaggtacttgcaacacaaccttgagaggttgacgcttctgatg 2000131  T
Q  3030 tcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttga 3129  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  2000130 tcttctctccattccttttgttgttccaacactccctcttataatgccctctcataccacaactgtagcatttgaaattcttccttctctgagattttga 2000031  T
Q  3130 cctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttcc 3229  Q
     |||||| ||| |||||||||||| |  || || || |||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||      ||| |||||||||||    
T  2000030 tctaccacgatcttgactcccactagatcctcgctctgttgatctgcctctcgccatcactaaagtctctgcttgcttt------tctaacctttcttcc 1999937  T
Q  3230 ttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagtt 3329  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| || || |   ||||||| |||||||||||||    
T  1999936 ttattcttgcgtctagattcttcttcaataattgcaccagcaacatcatcaaaatgaagagagtcagcaatattgtatattgtaatattgatgatgagtt 1999837  T
Q  3330 gatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcag 3429  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||     
T  1999836 gatcatatgaatcaggtaaactctgaagtagaagttctgcacgttcattttcagctattgtgaaatctgaggctgtgagttgaggaaatagtgtattcat 1999737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 2581 - 3812
Target Start/End: Original strand, 21513658 - 21514893
Alignment:
Q  2581 aagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccg 2680  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||| ||   |    
T  21513658 aagcatgtataaattacttgtcatcttttctgcttttatcaccacaagattatctttcaccacttttaagattccactttcatcatggatcttgcattag 21513757  T
Q  2681 agatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatc 2780  Q
    || | | ||||||     |  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||     
T  21513758 agttgacccaatttctttagcgacaataaattctttttgaacccatttacatgacttaccccatgtattttgcaaacaataccatcatgtatctttaatg 21513857  T
Q  2781 tgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtgg 2880  Q
    | |||||  |||||||| ||||||| |  | ||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  21513858 taatagtgacgactccaacaatttcaacagtatagtcattttatgtgtacacaattccttatgagatcagctaataagagaaaaatcaatctcagtgtag 21513957  T
Q  2881 agtcatgtgcca-------tgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggat 2973  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  21513958 agtcatgtgccaattgccatgttgcacctgaatccattatccaaatatcgttgagacttcttctacctttagaactagttattgcttcgctatacaagat 21514057  T
Q  2974 ttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacg 3073  Q
    ||| || |||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||  || | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||   ||      
T  21514058 ttcaccatcatctaaggtgcttccaatgcatccttgagatgttgaaacttcaaaagtattttctccatccttgttattattccaccactcctt---taaa 21514154  T
Q  3074 tgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatc 3173  Q
    || ||||||||||||  |   |||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||   || | ||  |||||||    
T  21514155 tgtcctttcatgccatgattttagcatttgagatccttccttctacgagattttgacctattatcattttgactcccactgcaacctcattttgttgatc 21514254  T
Q  3174 tgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgac 3273  Q
    || |||| || |||  |||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||  ||||| | ||| |    
T  21514255 tgtctcttgttatcaccaaagccagt--ttgcattgaactctctgacctttcttacttattcttgaatttggattcatcttcaagatttgcaacagcggc 21514352  T
Q  3274 atcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgc 3373  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |  |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  || ||||||||||| | | | |    
T  21514353 atcatcaaaatgaagggtatcaaccacattatcattgataatgttgacgatgagtttatcatacaaatctgataaaaactaaagtagaagtttaactctc 21514452  T
Q  3374 tcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaa 3473  Q
    ||| |||||| |||| ||||||  ||||  || |||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||   |   ||||||||| |||| |||    
T  21514453 tcactttccgttattctgaaatttgaagttgtaagttggaaaaataacgtatttagggtattgatgtgatatgttgttgtcttggattcactcattcgaa 21514552  T
Q  3474 gagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttc 3573  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  | |  ||||| |||| |||||| |||||    
T  21514553 gagtgtagagccttatttttaagaatattcagttgtgaagtaatttgacctcgttcaattttactagagtgcctcgtatctcatttgttgtctttttttc 21514652  T
Q  3574 --agcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaa 3671  Q
      |  ||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||  | |||||||||||||| |||||  ||||  |||    
T  21514653 ccaataatacttgacaatattgaatccaccattgcaaggtgcaaatttgcaacaacattgtcttcattttctttccacttttcatcagtcgtatccacaa 21514752  T
Q  3672 gtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctc 3771  Q
    || |||| | |||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21514753 gtttgccttttatcacgtttaggcaattattttttctcaaaattgcccttatctacaatttccacaaggaaaaatttctcccattgaacttctctatctc 21514852  T
Q  3772 aaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 3812  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21514853 aaatttcgttgccatggttttgcaccaaatatttttttttc 21514893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3494 - 3762
Target Start/End: Complemental strand, 1999695 - 1999427
Alignment:
Q  3494 aagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccg 3593  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||    
T  1999695 aagaaaattcttgtgtgaagtgacttgacctcgtacaatttaataagagcatcccatatctcctttgcagactttttctctggaatacttgacaataccg 1999596  T
Q  3594 agtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctag 3693  Q
    | |  |||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  1999595 aatttgccattgctaagtgcaaattggtaacagcgttgtcatccatctctttccacttttgatcagtgatatttgcaggtctgccatcaattgcatctag 1999496  T
Q  3694 gcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaactt 3762  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  1999495 gcaattgtcttttcttagaaccgcccttatctttaatttccaaagtgagaaattactcccattaaactt 1999427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1176 - 1287
Target Start/End: Complemental strand, 30165573 - 30165462
Alignment:
Q  1176 tctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgta 1275  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||| || |  |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  30165573 tctcatggaagtcaatacattctttttgagcatattatttgaccattagtcttgcacaatatatttccacttggtcattgccatcatgtgtgatcttgta 30165474  T
Q  1276 tacccatttgtt 1287  Q
    ||||||||||||    
T  30165473 tacccatttgtt 30165462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3812 - 3896
Target Start/End: Complemental strand, 1979778 - 1979694
Alignment:
Q  3812 caaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||| | | || ||||||||||||||    
T  1979778 caaactagactggaataattagaattcgtttatgatgtggaatattagtctaaactgcaaccatataacaaactaagatttttct 1979694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1104
Target Start/End: Original strand, 28608721 - 28608804
Alignment:
Q  1021 cttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaag 1104  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| || || ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  28608721 cttaaatccttctggttgaaccatgtagatctcttcatctaaatctccatgaagaaatgcagtctttacatccatttgttcaag 28608804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 3712; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 3712; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 3896
Target Start/End: Original strand, 27874764 - 27878647
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874764 atgatattgaatgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 27874863  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874864 tgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 27874963  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874964 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 27875063  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875064 tgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 27875163  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875164 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 27875263  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875264 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 27875363  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875364 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 27875463  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27875464 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcttggactcgatcttttttggggccta 27875563  T
Q  813 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 912  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27875564 ccaccaatatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgttcaatggtcttaactaagtctgttgtaatc 27875663  T
Q  913 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875664 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagactttacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 27875763  T
Q  1013 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875764 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaaacagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 27875863  T
Q  1113 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 1212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875864 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccgtagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 27875963  T
Q  1213 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 1312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875964 ttttacaaccagtcttgcacgattccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 27876063  T
Q  1313 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876064 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 27876163  T
Q  1413 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgt 1512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27876164 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcatggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgcgt 27876263  T
Q  1513 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 1612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876264 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 27876363  T
Q  1613 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 1712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876364 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 27876463  T
Q  1713 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgta 1812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27876464 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgta 27876563  T
Q  1813 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 1912  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876564 catcacgtacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 27876663  T
Q  1913 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 2012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876664 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 27876763  T
Q  2013 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 2112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876764 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 27876863  T
Q  2113 gccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 2212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876864 gccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 27876963  T
Q  2213 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtg 2312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27876964 acatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattctggtg 27877063  T
Q  2313 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27877064 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 27877163  T
Q  2413 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 2512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27877164 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcctagtctttgatgccac 27877263  T
Q  2513 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctg 2612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27877264 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctg 27877363  T
Q  2613 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 2712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877364 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 27877463  T
Q  2713 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 2812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877464 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 27877563  T
Q  2813 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 2912  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877564 tggtcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 27877663  T
Q  2913 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 3012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877664 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 27877763  T
Q  3013 tgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 3112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877764 tgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 27877863  T
Q  3113 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 3212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877864 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 27877963  T
Q  3213 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 3312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27877964 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagttatgttattatttgt 27878063  T
Q  3313 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 3412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878064 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 27878163  T
Q  3413 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 3512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878164 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 27878263  T
Q  3513 gtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 3612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878264 gtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 27878363  T
Q  3613 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 3712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27878364 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctagacaattatcttttcttaaa 27878463  T
Q  3713 attgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 3812  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878464 attgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 27878563  T
Q  3813 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878564 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 27878647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 1505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1682
Target Start/End: Original strand, 26976939 - 26978602
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976939 tcgaacaaaatgatattgaacacctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 26977038  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26977039 attttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcacccagatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttctgtcgttg 26977138  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977139 acagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 26977238  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977239 tgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 26977338  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977339 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 26977438  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977439 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 26977538  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977539 tggggtagagattggcttacaatcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 26977638  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26977639 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcttggacccgatctttgt 26977738  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977739 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 26977838  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 1003  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977839 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 26977938  T
Q  1004 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaa 1103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26977939 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaa 26978038  T
Q  1104 gatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 1203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978039 gatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacactactttgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 26978138  T
Q  1204 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 1303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978139 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccactttatcattgccattacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 26978238  T
Q  1304 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattca 1403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978239 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattca 26978338  T
Q  1404 acgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgt 1503  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26978339 acgcctcatgaaaatttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgccaagatggtttctgcgt 26978438  T
Q  1504 ctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttct 1603  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||               | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978439 ctgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttct---------------ggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttct 26978523  T
Q  1604 tccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagacta 1682  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978524 tccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagacta 26978602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 821
Target Start/End: Original strand, 1472511 - 1473327
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  1472511 tcgaacaaaatggtattgaacatctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattacatgcaatgtgcaatgcactctgactgtcacaatacacaaca 1472610  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    |||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |    
T  1472611 atttgttgttgactgtgcacgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcgtagctgccatatattcagcttctgtagtag 1472710  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    | |||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1472711 agagagctacgacaatt-gtaattttgacaaccaacttactgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttttatcaagatcacc 1472809  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||  | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  1472810 tgcaaaatctgaatcaacataacctttgacgataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatctcaggattctctta 1472909  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1472910 acagcatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctgaccttgtacatatcatggcatacataa 1473009  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| | ||||||    
T  1473010 ggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcataccggaagataatttataattgataggaag 1473109  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |  | ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  1473110 tggggtagatattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaaaacttttcggaaataatttctttgagaaagccaaatattcctatcttttctatct 1473209  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  1473210 cgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggacccaagtccttcatatcaaactccctggccaattgtgcctttaattcttggacttgatctttgt 1473309  T
Q  804 tggggcctaccaccaaca 821  Q
    |||| |||||||||||||    
T  1473310 tgggtcctaccaccaaca 1473327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3397 - 3896
Target Start/End: Complemental strand, 30968287 - 30967787
Alignment:
Q  3397 agaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaag 3496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30968287 agaagccatgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgattcgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaag 30968188  T
Q  3497 aatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagt 3596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968187 aatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagaatatcccagatctcctttaatgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagt 30968088  T
Q  3597 ccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggca 3696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30968087 ccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccgcttttcaacagtgatatctgcaggtctgccatctattgtgtctaggca 30967988  T
Q  3697 attatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacac 3796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30967987 attatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccacagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcgaatttcgctgccatggttttacac 30967888  T
Q  3797 caaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagttt-aaaccgcaaccacagagcatactaagatttttc 3895  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30967887 caaatatttttcattcaaactagaccagagtaataagaattcttttatgatgtggaagatcagtttaaaactccaaccacagagcatactaagatttttc 30967788  T
Q  3896 t 3896  Q
    |    
T  30967787 t 30967787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 21965640 - 21964817
Alignment:
Q  16 atattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgt 115  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||     
T  21965640 atattgaacgcctgtgtgctccgttcttgaatgaaaagttggattccttgaaatgtgcaaggtactctgactgtca--atacacaataattcgttgctgc 21965543  T
Q  116 ttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaa 215  Q
    || ||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||   ||||||| | |||||   |||| || |||||||||||||||||    
T  21965542 ttatgcctaagttgctcaattaaccttcgcatccaaatagtttccatgcatgctaaggtagctgtcttgtacgaagcttttgacgttgacagagctacaa 21965443  T
Q  216 ccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctga 315  Q
      |||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||    
T  21965442 tagtttgtaacttgggtaaccaacttactgctcatcttggaagcgtgaacacatatccaatagttgattttctattatcatgatcaagtgcaaaattcga 21965343  T
Q  316 atcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaa 415  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||| |||  ||||       ||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||  |    
T  21965342 atcaatataacccctgatagttaactttaatcctccgaaa-atattgcaa-------ggttcctttaatgtacctcttg-ttcttttaccaacattctga 21965252  T
Q  416 tgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccg 515  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21965251 tgctctttacc-gaatctgccataaaccgactaactactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttttacatatcatgacatacataaggcttccaaccg 21965153  T
Q  516 ccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagat 615  Q
    |  ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21965152 cgaatatatacgatactcgagacattttcatcctctcttcttcattgttaggactcataccgaaggataatttaaaattcacaagaagtggggtagagat 21965053  T
Q  616 tggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgc 715  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  21965052 tggctaacaatcttgcatttttaagcgtcacaagacttttcttagatagtgcttttgag--agctaaatcttcctatcttttctgtctcggtg-atgtac 21964956  T
Q  716 atccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggcctacca 815  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  21964955 atctctaaaatcttgtttattagtcccaagtctttcatattgaactccctagccaactatgtattcaattcatgaactaggtctttgttggggcctacca 21964856  T
Q  816 ccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaat 854  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21964855 ccaacatgtaatccacatacaacagtaaagtgataaaat 21964817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 835 - 1724
Target Start/End: Original strand, 18148080 - 18148970
Alignment:
Q  835 caacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatca 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  ||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18148080 caacagcaaaatgataaaatcattaccataaaaccttttgtagtatgtacaacagtgagaaattagtttgttgtaatcgaaactaattatgaaagaatca 18148179  T
Q  935 aatctcttgtaccaacatctgggcgcct-gctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttcc 1033  Q
    | | |||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||| |    
T  18148180 attgtcttgtaccaacctatgggcgccttgatttaaaccatacatagatttagttaacctgcaaaccaatttttcttttgcttattatttaaatgctttc 18148279  T
Q  1034 ggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgcca 1133  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||| |||| | | |||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18148280 gattggagcacatgaatttcttcttcaagctctctaggtagaaaaacactctttacatctaactattcaagatgtaaatccaatgcaacacacattgcca 18148379  T
Q  1134 acactactctg-atagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcac 1232  Q
    ||| ||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18148380 acattac-ctgtattgtagtgagtctaacaaccggagaaaatatctcattaaagtcaacaccttctgtctaagaatatccttttgcaactagtcttgcac 18148478  T
Q  1233 gataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgt 1332  Q
    ||||  |||| ||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18148479 gatattgttcaactagatcattacaatcatgtttgatctcgtatgttcatttctttccaatgtctttttgaccctttgaaagtttaacaagctcccatgt 18148578  T
Q  1333 cttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcacct 1432  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| | ||  ||  |||   ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  18148579 cttgtttctttgtagggcctccatttcttcatgcattattgtcatatatttaaaaaaatatgaattcttcaacgcctcttgaaaatttgaaggttcacct 18148678  T
Q  1433 tcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcat 1532  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||| | ||| |    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| |||    
T  18148679 tcttccattagaagacaatatgcattttggatcttcattacatattttgactattgagatggtttctgcgcctgacatgttgatcgacaggcaccaccat 18148778  T
Q  1533 tgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttaga 1632  Q
    ||||  ||| |||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |    
T  18148779 tgaccgcatttggttcttgcacatcgtgctctgattcagcttcagaagaatcactttccttgaatttttcttccatatgcactattgcaatctctttgaa 18148878  T
Q  1633 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccaca 1724  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18148879 agtgttgtcttttttatgctcactctacaactcattttctacaaagactacatccatgataacaacaaccttgcgggtagtggaatctcaca 18148970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3080 - 3363
Target Start/End: Complemental strand, 30968566 - 30968283
Alignment:
Q  3080 ttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctc 3179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  30968566 ttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcatcgagattttgaactaccatgattttgactcccactgaggacacgttccgttgatctgccta 30968467  T
Q  3180 tcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatc 3279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30968466 tcgtcatcgtcaaagcttctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcacaggcgacatcata 30968367  T
Q  3280 aaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaag 3363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968366 aaagtgaagagtatcagatatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaag 30968283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3260 - 3792
Target Start/End: Original strand, 8480108 - 8480640
Alignment:
Q  3260 attgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagta 3359  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8480108 attgcaccagcaacatcatcaaaatgaagagagtcaacaatattgttgtttgtaatgttgatgatgagttgatcatatgaatcaggtaaactctgaagta 8480207  T
Q  3360 gaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtgga 3459  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||| || |  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||   ||| || |    
T  8480208 gaagttctgcacgtttattttcagctatcatgaaatctgatgttgtgagctgagcaaatagtgtattcatggtgtttatgtgatttgttgtcgatatgta 8480307  T
Q  3460 ttcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctccttt 3559  Q
    ||||  |||| | |||||||| || || |  |||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||||| || | |  |||| |||||||| ||    
T  8480308 ttcattcattcggagagtgtaaagactccattttaagaaaattcttgtgtgaagtgacttcaccttgtacaatttaataataacatcctagatctccctt 8480407  T
Q  3560 gctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcag 3659  Q
    || | ||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||   | || |||||||||| |||||||||||  ||||    
T  8480408 gcagactttttctctgtaatacttgaaaataccgagtctgcaattgctaagtgcaaattggaaaaaacgttgtcatccatctttttccacttttaatcag 8480507  T
Q  3660 tgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaa 3759  Q
    |||||| ||||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| | || ||    
T  8480508 tgatatttgcatatctaccataaattgcatctaggcaattatcttttcttagaatcgcccttatctttaatttccacaatgaaaaattactctcattaaa 8480607  T
Q  3760 cttttctatctcaaatttcgctgccatggtttt 3792  Q
    ||| || || | |||||| | || |||||||||    
T  8480608 cttctcaatattaaattttgttgtcatggtttt 8480640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1633 - 2073
Target Start/End: Original strand, 8481374 - 8481814
Alignment:
Q  1633 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatac 1732  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  8481374 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatctctgccaacaacaagcttgcgaatagtgggatcccacaagcgatac 8481473  T
Q  1733 cccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaac 1832  Q
    ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||   ||| ||| | ||||||||| ||||||||  || ||||  ||| |    
T  8481474 cccttcatcttgtcagtataacccaagaatatacattttttagactttggatctgtctttgttctgtcttgggagatgtacatcctgtgcacaatacatc 8481573  T
Q  1833 caaaaacatgcagagaagaataatcta-ctggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacat 1931  Q
    | || ||||| |  || |||||| |||  ||| |||   ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| || ||||| || ||||    
T  8481574 cgaacacatgtaaggatgaataa-ctaggtggatttttgttccaaatctccatcggtgttttcaaaccaattgcagtttatggagatcgattgatcacat 8481672  T
Q  1932 aacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctc 2031  Q
    |||| ||  ||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||    
T  8481673 aacatgccattttcgcagcttttgccaaaaaagacttggccattcctgctgttctctgcataactcttgttttatctaggagagttttattcaatcgctc 8481772  T
Q  2032 tgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattg 2073  Q
    ||| | |||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  8481773 tgctataccattatgttgaggcgtatatggaactgtgaattg 8481814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1195 - 1391
Target Start/End: Complemental strand, 8565358 - 8565162
Alignment:
Q  1195 ttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatg 1294  Q
    ||||||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||   || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8565358 ttctttctgagcatattaatttaccacgagtcttggacgatacggtttcacttgatcacaaccctcacatttgatcttgtatatccatttgtttcgaatg 8565259  T
Q  1295 gctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcat 1391  Q
     ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8565258 actttttgaccttttggaagttcaacaagctcacatgtcttgtttctatgtaagtccttcatatcttcatgcattattatcatccattaagaagcat 8565162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18967241 - 18967120
Alignment:
Q  136 taacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaac 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  18967241 taacgtttgcatccaaatagcttcattgcatgcttgggtagctgcaatgtactcagcttctgtcgttgacagagctacaacag-ttgtaacttggataac 18967143  T
Q  236 caacttactgctcctcctgcaag 258  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18967142 caacttactgctcctcctgcaag 18967120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3629 - 3896
Target Start/End: Original strand, 23012182 - 23012438
Alignment:
Q  3629 ttatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttca 3728  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  23012182 ttatcttccatctctttcaacttttcttctgtgatatctacatgtgggc-atctattgcgtttaggaaattatcttttatcaaaattgccattatattca 23012280  T
Q  3729 atttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcttt---caaactagaccgga 3825  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||      |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||| |  |||    
T  23012281 atttccatagggaaaaatttctcccattcaact------tctcgaattttgctgtcatggttttataccaaatatttttatttctccaaactaaattgga 23012374  T
Q  3826 ataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||| || |||       ||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23012375 ataaaaaaaat-------tgatgtggaagatcaggctaaactgtaaccacaaagcatactaagttttttct 23012438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18967341 - 18967256
Alignment:
Q  2 tgtcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgact 87  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18967341 tgtcgaacaaaatgatatttaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagttggattccttgcaatgtgtaaggcactctgact 18967256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1315 - 1516
Target Start/End: Complemental strand, 8565161 - 8564961
Alignment:
Q  1315 ttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatga 1414  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||   |||  || |||||||| ||     
T  8565161 ttcaacaagctcagatgtcttgtttctatgtaagtccttcatatcttcatgcgttgttatcatccattaagaagcattttaactgtttaacgcctcttg- 8565063  T
Q  1415 aaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttg 1514  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| ||  || ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||| | ||||    
T  8565062 aaagttgaaggttcaccttgttcagttagaagactatatgaattgtgcctcatcgtaacatagtttgatttccaagatggtttttgcgtttgaggcgttg 8564963  T
Q  1515 at 1516  Q
    ||    
T  8564962 at 8564961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3423 - 3665
Target Start/End: Complemental strand, 8481247 - 8481005
Alignment:
Q  3423 tattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgac 3522  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||  |||| | |||||||||||||| || || ||||| ||| |  | || ||||| |||||    
T  8481247 tattcatggtgtttatgtgatttgttattgatatggattcattcattcggagagtgtagagcctccttttcaagaaaattattgtttgaagtgacttgac 8481148  T
Q  3523 ctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggca 3622  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||| || |   |||||| ||| | || | |||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  8481147 ctcgtacaatttaataagagtatcctagatctcccttgcagtcttattctatacaatacatgaaagtatcaagtctgccattgctaagtgaaaatcggca 8481048  T
Q  3623 acggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatat 3665  Q
    |   | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8481047 atatcgttgtcatccatctctttccacttttgatcagtgatat 8481005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2963 - 3043
Target Start/End: Original strand, 8479998 - 8480078
Alignment:
Q  2963 ctatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattc 3043  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  8479998 ctatacaagatttctccatcatctgaggtacttgcaacacaaccttgagaggttgatgcttctgatgtcttctctccattc 8480078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Original strand, 16777060 - 16777109
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16777060 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 16777109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 3700; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 3700; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 3896
Target Start/End: Complemental strand, 41722672 - 41718789
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722672 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 41722573  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722572 tgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 41722473  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722472 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 41722373  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722372 tgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 41722273  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722272 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 41722173  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722172 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 41722073  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41722072 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcatgtcttttctgtctcggtgaatt 41721973  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721972 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 41721873  T
Q  813 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41721872 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgctgtaatc 41721773  T
Q  913 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721772 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 41721673  T
Q  1013 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41721672 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaagatgtaaat 41721573  T
Q  1113 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 1212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721572 ccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 41721473  T
Q  1213 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 1312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721472 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 41721373  T
Q  1313 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721372 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 41721273  T
Q  1413 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgt 1512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41721272 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcatggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgcgt 41721173  T
Q  1513 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 1612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721172 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 41721073  T
Q  1613 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 1712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721072 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcag 41720973  T
Q  1713 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgta 1812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41720972 tgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgta 41720873  T
Q  1813 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 1912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41720872 catcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaatcaatcgccgttgat 41720773  T
Q  1913 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 2012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720772 ggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagga 41720673  T
Q  2013 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 2112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720672 gagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactc 41720573  T
Q  2113 gccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 2212  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720572 gccatctatatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcctagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaac 41720473  T
Q  2213 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtg 2312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41720472 acatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacaaaatatcttgctcctcctagagatatttctggtg 41720373  T
Q  2313 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41720372 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 41720273  T
Q  2413 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 2512  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720272 acaaaatggtaaatttactgccttgagcccgtgaaggagattgcgttccgcaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccac 41720173  T
Q  2513 atcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctg 2612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41720172 atcatcgttgtttcttcttggcttgatgctgcaactgatgcatcggcctcttgcaacgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctg 41720073  T
Q  2613 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 2712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720072 ctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaatt 41719973  T
Q  2713 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 2812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719972 cttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggca 41719873  T
Q  2813 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 2912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719872 tgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatta 41719773  T
Q  2913 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 3012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719772 tccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcctcgctatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgaga 41719673  T
Q  3013 tgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttc 3112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41719672 tgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttaatattcttc 41719573  T
Q  3113 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 3212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719572 tttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaac 41719473  T
Q  3213 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgt 3312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41719472 tctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagttatgttattatttgt 41719373  T
Q  3313 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 3412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719372 aatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttga 41719273  T
Q  3413 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 3512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719272 gaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgga 41719173  T
Q  3513 gtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 3612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719172 gtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtg 41719073  T
Q  3613 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaa 3712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41719072 caaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctagacaattatcttttcttaaa 41718973  T
Q  3713 attgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 3812  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718972 attgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttc 41718873  T
Q  3813 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718872 aaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 41718789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 3360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 3746
Target Start/End: Complemental strand, 34356200 - 34352542
Alignment:
Q  85 actgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34356200 actgtcacaatacacagtaattttctcttgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatg 34356101  T
Q  185 tactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34356100 tactcagcttctgtcgttgacagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagatt 34356001  T
Q  285 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34356000 ttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacatactgcaacacctaaggttcctttaat 34355901  T
Q  385 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355900 gtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgta 34355801  T
Q  485 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355800 catatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggata 34355701  T
Q  585 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355700 atttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaat 34355601  T
Q  685 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355600 cttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaat 34355501  T
Q  785 tcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtac 884  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34355500 tcctggactcgaactttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattgccatcaaaccttttgtagtacgtac 34355401  T
Q  885 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagattt 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34355400 aatggtctgaactaagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagattt 34355301  T
Q  985 ggtcaacctgcaaaccaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 1084  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355300 ggtcaacctgcaaaccaggttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatctaaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtc 34355201  T
Q  1085 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355200 tttacatccagctgttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgataatagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattga 34355101  T
Q  1185 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 1284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355100 agtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccattt 34355001  T
Q  1285 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 1384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355000 gtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattga 34354901  T
Q  1385 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgatt 1484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354900 gaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgatt 34354801  T
Q  1485 gccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatc 1584  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  34354800 gccaagacggtttctgcgtctgacgcgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatatggttcttgttctccgtgcatcggttcagcttcagaagaatc 34354701  T
Q  1585 actttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactaca 1684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354700 actttctttggatttttcttccatctgcattatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactaca 34354601  T
Q  1685 tccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggt 1784  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34354600 tccctgctaacaataaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacattttctgaactttgggt 34354501  T
Q  1785 ccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccat 1884  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354500 ccaacttcgttctgtcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaacacatgtagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccat 34354401  T
Q  1885 cggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgtt 1984  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34354400 tggtgtcttcaaatcaattgtcgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcctgctgtt 34354301  T
Q  1985 ttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaatac 2084  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354300 ttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccgcaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaatac 34354201  T
Q  2085 cctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttg 2184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34354200 cctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttg 34354101  T
Q  2185 tgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtat 2284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354100 tgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtat 34354001  T
Q  2285 cttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatc 2384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34354000 cttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttttagtagttactctagcaaacttcaatc 34353901  T
Q  2385 tatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttc 2484  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34353900 tatgttgcttgcttatcacacagtgctcacaaaatggtaaatttactgccttgagcccgtgaaggagattgcgttcagcaaggactttcaagccacgttc 34353801  T
Q  2485 tgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagc 2584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||    
T  34353800 tgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgctgtttcttcttggcttgatgctgcaactgatgcatcgacctcttgcaacgtatcccctagaagc 34353701  T
Q  2585 atgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagat 2684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353700 atgtatagattacttgtgatcttttctgcttttatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagat 34353601  T
Q  2685 catccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgat 2784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34353600 catccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaagagtaccatcatgcatctttaatctgat 34353501  T
Q  2785 agtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtc 2884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34353500 agtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtc 34353401  T
Q  2885 atgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcat 2984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34353400 atgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgttgcctcgctatacaggatttccccgtcat 34353301  T
Q  2985 ctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcat 3084  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34353300 ctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcaaaattcttctctccattcttcttgatattccaacactc---ctttacgtgccctttcat 34353204  T
Q  3085 gccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtc 3184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353203 gccacaaccgtaacatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactagggccacgttccgttgatctgcctctcgtc 34353104  T
Q  3185 atcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagt 3284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353103 atcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagt 34353004  T
Q  3285 gaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgc 3384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34353003 gaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattctccgc 34352904  T
Q  3385 tattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagc 3484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34352903 tattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagc 34352804  T
Q  3485 cttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttg 3584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34352803 cttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccaaatctcctttgccgtcttcttttcagcaatacttg 34352704  T
Q  3585 acaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctat 3684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34352703 acaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaggtctgccatctat 34352604  T
Q  3685 tgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaat 3746  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34352603 tgcgtctaagcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaat 34352542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2859 - 3352
Target Start/End: Original strand, 31502110 - 31502590
Alignment:
Q  2859 agtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgc 2958  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  31502110 agtaaaaccaatcttggtatggagtcatgttcgatgtcacacctgaatctattgtccatacatcgttgagtcgtctctcgcctttataactagttgttgc 31502209  T
Q  2959 ttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaa 3058  Q
    ||   |||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||| || ||   |||||||    
T  31502210 tttgatatcattgatttcattatcatctgaggtacttgcaacacatccttcagatgttaaagcttcaaaactcttctctccatttttattatcattccaa 31502309  T
Q  3059 cactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggc 3158  Q
    ||||| || |||| ||| ||| | || ||| |    |||||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||     
T  31502310 cactcattgtttaagtgacctcttataccatagttatagcatttgagattcatttttcttccaatttttgacctaccaagatattgactccctttggggt 31502409  T
Q  3159 cacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaag 3258  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  31502410 cacgttccgtttatatgcctctcgtcatcgttaaagcctctgctttctttgaactcttcgacctttcttccttattcttacatctagattcttcttcaag 31502509  T
Q  3259 gattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactc 3352  Q
     |||||  |  || |||||             ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31502510 aattgcctcaacgtcatca-------------tatcatctatattattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatcttgtaaactc 31502590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 3259 - 3762
Target Start/End: Complemental strand, 23319308 - 23318806
Alignment:
Q  3259 gattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagt 3358  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  23319308 gattgcatcagcaacatcatcaaaatgaagagagtcagcaatattgttgtttgtaatgttgatgatgagttgttcatatgaatgaggtaaactctgaagt 23319209  T
Q  3359 agaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtgg 3458  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||  ||| ||| || || ||||| |||| |||||| ||||| | ||| || |||||||  ||||  ||| |||    
T  23319208 agaagttttgcacgttcattttcagctatcatgacatctgaggctgtgagctgagcaaatagtgtatttatggtatttatgtgatttgttattgatatgg 23319109  T
Q  3459 attcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctt 3558  Q
    | |||  ||||   |||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||    
T  23319108 actcatacattcagagagtgtagaacctcctttttaagaaaattcttgcgtgaagtgatttgacctcgtacaatttaataagagcatcttagatctcctt 23319009  T
Q  3559 tgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtca 3658  Q
    ||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||  ||     
T  23319008 tgcagactttttctctgcaatacttgacaataccgagtttgtcattgctaagtgaaaattggcaacatcgttgtcatccatctctttccacttttgatcg 23318909  T
Q  3659 gtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttga 3758  Q
    |||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||   |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  23318908 gtgatatctgcaggttcaccatcaattgcgtctacgcaattttctttt-ttagaaccacccttatctttaatttccacagtgagaaattactcccattaa 23318810  T
Q  3759 actt 3762  Q
    ||||    
T  23318809 actt 23318806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1195 - 1503
Target Start/End: Original strand, 7778168 - 7778475
Alignment:
Q  1195 ttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatg 1294  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7778168 ttctttatgagcatattattttaccaccggtcttggacgatacggttccacttcatcactaccctcacatttgatcttgtatatccatttgtttcgaatg 7778267  T
Q  1295 gctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccg 1394  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||       
T  7778268 gctttttgaccttttgaaagttcaacaagatcacatgtcttgtttctatgtaagtccttcatatcttcatgcattgttatcatctattaagaagcatttt 7778367  T
Q  1395 aaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacgg 1494  Q
    |||  || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||  | |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  7778368 aactgtttaacgtctcttg-aaagttgaaggttcaccttcttcggttagaagacaatatgaattgtgcctcattataacatagtttgatttccaagatgg 7778466  T
Q  1495 tttctgcgt 1503  Q
    ||| |||||    
T  7778467 tttttgcgt 7778475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34359460 - 34359375
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgt 89  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34359460 tcgaacaaaatgatattgaacgccaatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgtaaggcactctgactgt 34359375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 3697; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 3697; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 3896
Target Start/End: Original strand, 5819321 - 5823213
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819321 tcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgcttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 5819420  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5819421 attttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccagatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttctgtcgttg 5819520  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819521 acagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 5819620  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819621 tgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 5819720  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819721 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 5819820  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819821 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 5819920  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819921 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 5820020  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820021 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 5820120  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820121 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 5820220  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 1003  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820221 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 5820320  T
Q  1004 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaa 1103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5820321 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaa 5820420  T
Q  1104 gatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 1203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820421 gatgtaaatccaacgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 5820520  T
Q  1204 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 1303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820521 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 5820620  T
Q  1304 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattca 1403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820621 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattca 5820720  T
Q  1404 acgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgt 1503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5820721 acgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgccaagatggtttctgcgt 5820820  T
Q  1504 ctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttct 1603  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820821 ttgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttct 5820920  T
Q  1604 tccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaacct 1703  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820921 tccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaacct 5821020  T
Q  1704 tgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttg 1803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5821021 tgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttg 5821120  T
Q  1804 ggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatc 1903  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821121 ggagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatc 5821220  T
Q  1904 gccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttc 2003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821221 gccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttc 5821320  T
Q  2004 tttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgc 2103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821321 tttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgc 5821420  T
Q  2104 tagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaat 2203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821421 tagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaat 5821520  T
Q  2204 actggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagata 2303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821521 actggaaacacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagata 5821620  T
Q  2304 tttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcac 2403  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5821621 attctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcac 5821720  T
Q  2404 acagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctt 2503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5821721 acagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcctagtctt 5821820  T
Q  2504 tgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtga 2603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5821821 tgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtga 5821920  T
Q  2604 tcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacaga 2703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821921 tcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacaga 5822020  T
Q  2704 caataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatt 2803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822021 caataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatt 5822120  T
Q  2804 tctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctg 2903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822121 tctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctg 5822220  T
Q  2904 aatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacaca 3003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822221 aatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcgctatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacaca 5822320  T
Q  3004 tccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttg 3103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822321 tccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttg 5822420  T
Q  3104 atattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgctt 3203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822421 atattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgctt 5822520  T
Q  3204 gctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgtt 3303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822521 gctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgtt 5822620  T
Q  3304 attatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagcc 3403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5822621 attatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagct 5822720  T
Q  3404 gtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattc 3503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822721 gtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattc 5822820  T
Q  3504 tgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccat 3603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822821 tgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccat 5822920  T
Q  3604 tgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatct 3703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5822921 tgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctagacaattatct 5823020  T
Q  3704 tttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatat 3803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823021 tttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatat 5823120  T
Q  3804 ttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823121 ttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 5823213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 2007; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1554 - 3896
Target Start/End: Original strand, 2814859 - 2817201
Alignment:
Q  1554 cttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctc 1653  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2814859 cttcgtgcactgattctgattctgaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaaatgctgtcatttttctgctc 2814958  T
Q  1654 actttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataa 1753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2814959 actttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggaccccacaggcgataccccttaacattgtcagcataa 2815058  T
Q  1754 cccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaat 1853  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2815059 cccaagaagatacatttcttagactttgggtccaactttgttctttcttgagagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgtagagaagaat 2815158  T
Q  1854 aatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttc 1953  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2815159 aatctactggctttcctttccacatctccataggagtcttcaaatcaatcaacgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttc 2815258  T
Q  1954 agcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggt 2053  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815259 tgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttatattcatccgctctgccacaccattctgctgaggt 2815358  T
Q  2054 gtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcact 2153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2815359 gtatgtgcaacagtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgtcatctacatattatcctccattatctatcctcaagcact 2815458  T
Q  2154 taattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttct 2253  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2815459 taatctttttcccagtttcaagctctatttgtgcttttaatgccttgaatactggaaacacaactgacttcttcttgattggttacacccataatcttct 2815558  T
Q  2254 ggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttg 2353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815559 ggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttg 2815658  T
Q  2354 cttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagat 2453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2815659 cttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctcacaaaatggtaaatttactgaattgagcccgtgaaggagat 2815758  T
Q  2454 tgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgc 2553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2815759 tgcgttccgcaaggactttcaagccacgttatgacatatggcctagtctttgatgccacgtcatcattgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgt 2815858  T
Q  2554 atccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagatt 2653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2815859 atccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcttttcactactttaaagatt 2815958  T
Q  2654 ccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttc 2753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815959 ccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttc 2816058  T
Q  2754 taacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctc 2853  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2816059 aaacagtacaatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatggtcatttcccatgtacactgatccttcagagataggctc 2816158  T
Q  2854 ataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagtt 2953  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  2816159 ataagagtaaaaccaatctcagtgtggagtcatgtgccatattgcacctgaatccattatcaagacatcgttgagtcgtctttcacctttagaattggtt 2816258  T
Q  2954 gctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatat 3053  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2816259 gctgcttcactatacaagattttcccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcaaaattcttctctccattcttcttgatat 2816358  T
Q  3054 tccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccact 3153  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2816359 tccaacactccttctttatgtgctctttcatgccacaactgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctagcatgattttgactcccact 2816458  T
Q  3154 ggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttct 3253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2816459 ggggccatgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcttggattcttct 2816558  T
Q  3254 tcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactct 3353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2816559 tcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactct 2816658  T
Q  3354 gaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacaga 3453  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2816659 aaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagctgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacgga 2816758  T
Q  3454 tgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatc 3553  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2816759 tgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattaaagtatcccagatc 2816858  T
Q  3554 tcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccactttt 3653  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2816859 tcctttgctgtcttcttttcttcaatacttgacaataccgagtccaccatatctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccactttt 2816958  T
Q  3654 cgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctccc 3753  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2816959 cgtcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaaaggaaaaatttctccc 2817058  T
Q  3754 gttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaa 3853  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2817059 gttgaacttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcattcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaa 2817158  T
Q  3854 gatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2817159 gatcagtttaaaccacaaccacatagcatactaagatttttct 2817201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 799; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1572 - 3792
Target Start/End: Complemental strand, 42587654 - 42585440
Alignment:
Q  1572 cttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttc 1671  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||   ||| |||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42587654 cttcagaagaatcatcttctttagacttcatttctatctccactgcagtagtttctttggcagtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttc 42587555  T
Q  1672 tgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttc 1771  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  42587554 tgcaaagactacatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccacaagcgataccctttcacgttgtcagcataacccaagaatatacatttt 42587455  T
Q  1772 ctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctt 1871  Q
    || |||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||| |  |||||||||||   ||||||||| |    
T  42587454 ctagactttggatctagctttgttctttcttgggagttgtacattgcgtacacagtacatccgaacacatgtaaggaagaataatcaggtggctttccgt 42587355  T
Q  1872 tccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggc 1971  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||| |||| || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    
T  42587354 tccaaatctccattggtgtttacaaaccaattgcggttgatggagatcgattgatcacgtaacaggcggttttcacagcttctgcccagaaagacttagc 42587255  T
Q  1972 cattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaat 2071  Q
    || | | |||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  42587254 cactactgctgttctcaacatggctcttgttttatctaagagagttctattcatccgctctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaat 42587155  T
Q  2072 tgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagttt 2171  Q
    || |||  ||||||||| ||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||  ||||||    
T  42587154 tgtcttgtaataccctcatgtttgcagaatgtcaaaaaatcaccatctacatattctcctccattgtctgttcttaagcactttattcttttaccagttt 42587055  T
Q  2172 caagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaa 2271  Q
    |||| || | ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||    
T  42587054 caagttccacttgtggtttgaattccttgaatacggtaaacacatttgacttcttcttgattgggtacacccataatctcctagagtgatcatcaataaa 42586955  T
Q  2272 tgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactcta 2371  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42586954 tgacacaaaatattttgctcctcccatggatatttgtggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtcaagtatgtatttgcttctagtagttactctg 42586855  T
Q  2372 gcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactt 2471  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||  | || |||||  ||||| ||||  |||    
T  42586854 gaaaacttcaatctatgttgcttgcttgtcacacagtgctcacagaaagacaaattcattgtcttgagcccaggtagaagattttgttccgcaagagctt 42586755  T
Q  2472 tcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgt 2571  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| | |||    ||||||  || |||||||||||    
T  42586754 tcaaaccacgttccgacatatggcctagtttatgatgccacaccattgtcgtttcttcttggctcgctacagcagtcaatgcattagcgtcttgcaatgt 42586655  T
Q  2572 atctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatc 2671  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  42586654 atcccccacaagcatgtatagattgttagtgagcttttctgctttcatcaccacgaggtttccctttactacttttaagtttccaccttcagtgtggatc 42586555  T
Q  2672 ttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgca 2771  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | || |||| |||||||      
T  42586554 ttgcacccgaggtcatccaattgcccaatagacaataaattattcttcaagtcctttacgtgacgtaccccttgtattttgcgaatagtatcatcatgtg 42586455  T
Q  2772 tctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatc 2871  Q
    |||||| | ||| |||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  42586454 tctttattttgacagtaccaatcccaacaacttctaaagtgtgatcattgcccatgaatacagattcttccgagataggttcataggtgcaaaaccaatc 42586355  T
Q  2872 tcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtcttt-cgcctttagaactagttgctgcttcactatacag 2970  Q
       | |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||  ||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||     
T  42586354 cttgcgtggagtcatatgccatgtggcacctgagtccactatccagccatcattgag-cgcatttccacctttagaactaattgctgctccgctatacaa 42586256  T
Q  2971 gatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttcttt 3070  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| | ||     
T  42586255 gatttctccatcatctcaggtacttgctacacaaccttgagaggttgacgcttctgatgtcttctcttcattccttttgttgttccaacactcccttttc 42586156  T
Q  3071 acgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttg 3170  Q
    |  |||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |  || || || ||||    
T  42586155 aaatgcccgctcatacgacaaccgtagcatttgaaattcttccttctctgaggttttgatctaccacgatcttgactcccactagatcctcgctctgttg 42586056  T
Q  3171 atctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggc 3270  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||    
T  42586055 atctgcctctcgccatcactaaagcctctgcttgcttt------tctaacctttcttccttattcttgcgtctagattcttcttcaataattgcaccagc 42585962  T
Q  3271 gacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagca 3370  Q
     ||||||||||| |||||||  ||| | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42585961 aacatcatcaaaatgaagagagtcaacaatattgttatttgtaatattgatgatgagttgatcatatgaatcaggtaaactctgaagtagaagttctgca 42585862  T
Q  3371 cgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccattt 3470  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||  ||| ||||||||  ||||     
T  42585861 cgttcattttcagctattgtgaaatctgaggctgtgagctgagcaaatagtgtattcatggtatttatgtgatttgttattgatatggattcattcattc 42585762  T
Q  3471 gaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttctt 3570  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  42585761 ggagagtgtagagcctcctttttaagaaaattcttgtgtgaagtgacttgacctcgtacaatttaataagagcatcccagatctcctttgcagacttttt 42585662  T
Q  3571 ttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgca 3670  Q
     || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42585661 ctctgcaatacttgataataccgaatctgccattgctaagtgcaaattggcaacaacgttgtcatccatctctttccacttttgatcagtgatatctgca 42585562  T
Q  3671 agtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatct 3770  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  42585561 ggtctgccatcaattgcatctaggcaattgtcttttcttagaactgcccttatctttaatttccacagtgagaaattactcccattaaacttctcaatct 42585462  T
Q  3771 caaatttcgctgccatggtttt 3792  Q
     |||||| | ||||||||||||    
T  42585461 taaattttgttgccatggtttt 42585440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 743; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 54545416 - 54544598
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  54545416 tcgaataaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagttgaattccttgcaatgtgcaatgcactctgactgtcacaatacacaata 54545317  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54545316 atttgttcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttctgtcgttg 54545217  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545216 acagagctacaacagtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctccggcaagtgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 54545117  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545116 tgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 54545017  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545016 acaacattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 54544917  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544916 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 54544817  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544816 tggggtagagattggcttacaatcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 54544717  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  54544716 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcttagacccgatctttgt 54544617  T
Q  804 tggggcctaccaccaacat 822  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54544616 tggggcctaccaccaacat 54544598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 738; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1488
Target Start/End: Complemental strand, 42589219 - 42587735
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  42589219 tcgaacaaaatggtattgaacacctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattccttgcaatgtgcaatgcactatgactgtcacaatacacaaca 42589120  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |    
T  42589119 atttgttgttgactgtgcccgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcgtagctgccatatattcagcttctgtagtag 42589020  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42589019 atagagctacgacagattgtaattttgacaaccaacttaccgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagcagtagatcttcttttatcaagatcacc 42588920  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| || |||||  |||||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  42588919 tgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgacacataatgcaacatctaaggttccttttatatatctcaggattctctta 42588820  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42588819 acagcatcccaatgttctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatcatggcatacataa 42588720  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| | ||||||    
T  42588719 ggcttcccaccactgatgcatagggtactcgagacatttctatcctctctgattcattgctaggattcatactggaggataatttataattgataggaag 42588620  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  42588619 tggggtagatattggcttacaatcttgcatgttgaagcgccgcanaacttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcctatcttttctatct 42588520  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  42588519 cgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggccccaagtccttcatatcgaactccctagccaattgtgcatttaattcttggacttgatctttgt 42588420  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42588419 tgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaacaacaaaatgataaaatcattattaccaaacctattgtagtatgtacaatggtctgaattaagtct 42588320  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 1003  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42588319 gttgtatccaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcctgttttagaccgtatagagatttggtcaacctgcaaaccaag 42588220  T
Q  1004 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaa 1103  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||    
T  42588219 ttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggttggagcatatatatttcttcttcaagctctccatgaagaaaagaagtttttacatctaattgttcaa 42588120  T
Q  1104 gatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 1203  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| || || |||| ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || ||||||||||| ||    
T  42588119 gatgtaaatcaaacgcaacacacatagctaaaactattctgatagttgtgagtctaacaactggggagaatattttattgaaatctataccttctttttg 42588020  T
Q  1204 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 1303  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42588019 agcataccctttaaccaccagtcttgcacgatatcgttctacttgatcattactatctcgtttgatcttgtatacctatttgttcccgatggctttccga 42587920  T
Q  1304 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaac--catt 1401  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  | |  | ||    
T  42587919 cccttgggaagttgaacaagttcccaagttttgtttctatgtaaggcttccatttcttcatgcattgctgccatccacagagaaacatcttagcttcttt 42587820  T
Q  1402 caacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcca 1488  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  42587819 ca--gcctcctgaaaggttgatggctccccatcttctgttaaaagacaatatgcatcatgagttgtcattacatagtctgaatgcca 42587735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 413 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 25878161 - 25877805
Alignment:
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25878161 caatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattgttctcactgcttgtgcaatgtctagtcttgtacatatcatgtcatacataagacttccca 25878062  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| | || || |||||||||    
T  25878061 ctgctgatgcatagggtacttgagacattttcatcctctccgcttcattgctaggattcagacttgaggataatttataattgatagaaaatggggtaga 25877962  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||| | || ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25877961 tattggcttacagtcttg-atgttgaagtgtagaaaaacttttcgtatataatttgtttgagaaagcaaaatcttcctatcttttctatctcggtgaatt 25877863  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagcca 770  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25877862 tgcatccttaaaatcttgttttctggcccagagtccttcatatcgaactccctagcca 25877805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25881030 - 25880583
Alignment:
Q  90 cacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactc 189  Q
    |||||||||||  ||||||||  || ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||| | | || || ||    
T  25881030 cacaatacacaacaatttgttgttgattgtgcctga-ttcttccattagcctttgtatccaaatagcttcctagcaagcttgcgtaggtacaatatattc 25880932  T
Q  190 cgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttctt 289  Q
     || | ||| || || ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25880931 agcatatgtagtagatagagcgacaacaatttgtaattttgacaaccaacttattgctcctcctgcaagtatgaacacataaccggtagtagattttttt 25880832  T
Q  290 tt---atcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc---tttaa 383  Q
    ||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||| | || ||  |||    ||||||||  |||||| |||||||| |   ||| |    
T  25880831 tttttatcaagatctcctgcaaaatctgaatctacataaccctttacaataaattccaatct---gaaacataatgcaacatctgaggtttcctttttta 25880735  T
Q  384 tgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgt 483  Q
    | || |||| |||||| |||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25880734 tatatctcacgattcttttaataacatctcaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattgctcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgt 25880635  T
Q  484 acatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcga 535  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25880634 acatatcatggcatacataaggtttcccaccgctgatgcataaggtactcga 25880583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 363 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25880567 - 25880372
Alignment:
Q  363 caacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgc 462  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||| |||||| || | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  25880567 caacatctgaggttccttttatatatctcaggattcttttgataccatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattacttccactgc 25880468  T
Q  463 ttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttc 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25880467 ttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgctgatgcataaggtactcgagacattttcatcctcttcgcttc 25880372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3202 - 3665
Target Start/End: Original strand, 47277022 - 47277494
Alignment:
Q  3202 ttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatc--agcta 3299  Q
    ||||||||||||||   || ||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||   |||||| || || |||| ||| ||  ||||     
T  47277022 ttgctttgaactctacaacatttcttatttattcttgcgtatggactcttcttcaagaattgcaccaaagacatcgtccaaatgaatagtctctcagctg 47277121  T
Q  3300 tgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttca--gcacgctcattttccgctattttgaaatca 3397  Q
      ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||| || | |||  |    
T  47277122 cattattgttggtaatgttgatgatgaggtgatcatacaaagatggttaactcagaagtagaagttcaacacacactcattttccgcttttctaaaacga 47277221  T
Q  3398 gaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaaga 3497  Q
    ||||  ||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||  |||   || |||||||||||| ||  || ||||||| | ||||  ||||| |    
T  47277222 gaagttgtgagatgagaaaattgcatattcaaggtgtt-atgtgatatgtt--tgacgtggattcacccgttcaaaaagtgtagtgtcttccttttaata 47277318  T
Q  3498 atattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtct---tcttttcagcaatacttgacaatac--- 3591  Q
    ||||| | ||||| | |||||  | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |   |||| |||  |||||||||||||||       
T  47277319 atattttattgtgaaatgattatatctcgtataattttattagagtatcacatatctcctttgttgtattaatcttctcataaatacttgacaatactgt 47277418  T
Q  3592 --cgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatat 3665  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47277419 gttgagcctgccattgctaggtgcaaattggcaacaataatatcatctatctctttccatttttcgtcaatgatat 47277494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3415 - 3753
Target Start/End: Complemental strand, 25877693 - 25877355
Alignment:
Q  3415 aaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagt 3514  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||| || |||||||| |||||  |||| |||    
T  25877693 aaatagtgtattcatggtgtttatgtgatttgttattgatatggattcattcattcaaagagtatagagcctcctttttaagaaaattcttgtgtgaagt 25877594  T
Q  3515 gatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgca 3614  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||    ||| || ||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  25877593 gacttgacctcgtacaatttaaaaagagcgtcccagatctcccttgaaaactttttctctccaatacttgacaatatcgagtctgccattactaagtgca 25877494  T
Q  3615 aattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaat 3714  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| | || ||||| | || |||| | ||||  |||||||||| ||     
T  25877493 aattggcaataacattgtcatccatctcttttcacttttgatcagtgatatttgcatgcctaccatcaactgtgtctcgacaatagtcttttcttagaac 25877394  T
Q  3715 tgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctccc 3753  Q
      |||||||||| ||||| || || || ||||| |||||    
T  25877393 atcccttatctttaattttcacagtgagaaattactccc 25877355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25880348 - 25880239
Alignment:
Q  219 tttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatc 318  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  25880348 tttgtaattttgacaaccaacttattgctcctcttgcaagtgtgaacacataaccggtattagatattcttttatcacgatcacctataaaatctgaatt 25880249  T
Q  319 aacataaccc 328  Q
    |||| |||||    
T  25880248 aacaaaaccc 25880239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Original strand, 5382624 - 5382673
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5382624 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 5382673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 3829 - 3883
Target Start/End: Original strand, 13722392 - 13722446
Alignment:
Q  3829 ataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  13722392 ataataattcttttctgatgtggaagatcagattaaactacaaccacagagcata 13722446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 3673; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 3673; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 3896
Target Start/End: Original strand, 9440146 - 9444030
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440146 atgatattgaatgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatatgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 9440245  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440246 tgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 9440345  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440346 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 9440445  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440446 tgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 9440545  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440546 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 9440645  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440646 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 9440745  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440746 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatt 9440845  T
Q  713 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440846 tgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggccta 9440945  T
Q  813 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaatc 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9440946 ccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgctgtaatc 9441045  T
Q  913 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441046 gaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt 9441145  T
Q  1013 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9441146 ccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatctagctgttcaagatgtaaat 9441245  T
Q  1113 ccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 1212  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441246 ccaacgaagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcc 9441345  T
Q  1213 ttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 1312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441346 ttttacaaccagccttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttgga 9441445  T
Q  1313 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441446 agttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcat 9441545  T
Q  1413 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgt 1512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  9441546 gaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgccaagatggtttctgcgtttgacgcgt 9441645  T
Q  1513 tgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 1612  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441646 tgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgc 9441745  T
Q  1613 actatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttct-gcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggca 1711  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441746 acaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttcttgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggca 9441845  T
Q  1712 gtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgt 1811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9441846 gtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgt 9441945  T
Q  1812 acatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttga 1911  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9441946 acatcacatacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcaccgttga 9442045  T
Q  1912 tggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagg 2011  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442046 tggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctagg 9442145  T
Q  2012 agagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaact 2111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442146 agagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaact 9442245  T
Q  2112 cgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaa 2211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442246 cgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaa 9442345  T
Q  2212 cacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggt 2311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9442346 cacatctgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagataattctggt 9442445  T
Q  2312 gactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgct 2411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9442446 gactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgct 9442545  T
Q  2412 cacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgcca 2511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9442546 cacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcctagtctttgatgcca 9442645  T
Q  2512 catcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttct 2611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9442646 catcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtgatcttttct 9442745  T
Q  2612 gctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaat 2711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442746 gctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaat 9442845  T
Q  2712 tcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggc 2811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442846 tcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggc 9442945  T
Q  2812 atgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatt 2911  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442946 atggtcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccatt 9443045  T
Q  2912 atccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgag 3011  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443046 atccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgag 9443145  T
Q  3012 atgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattctt 3111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443146 atgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattctt 9443245  T
Q  3112 ctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaa 3211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443246 ctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaa 9443345  T
Q  3212 ctctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttg 3311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443346 ctctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcattaaagtgaagagtatcagctatgttattatttg 9443445  T
Q  3312 taatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttg 3411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9443446 taatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagctgtgagttg 9443545  T
Q  3412 agaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgg 3511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443546 agaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtgg 9443645  T
Q  3512 agtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggt 3611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443646 agtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggt 9443745  T
Q  3612 gcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaa 3711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9443746 gcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgtaggtctgccatctattgcgtctagacaattatcttttcttaa 9443845  T
Q  3712 aattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcttt 3811  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443846 aattgcccttatcttcaatttccatagggaaaaatttctcccgttgaatttctctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttcttt 9443945  T
Q  3812 caaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443946 caaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 9444030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 775; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1572 - 3792
Target Start/End: Original strand, 24596102 - 24598316
Alignment:
Q  1572 cttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttc 1671  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||   ||| |||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24596102 cttcagaagaattatcttctttagatttcatttctatctccactgcagtagtttctttggcagtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttc 24596201  T
Q  1672 tgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttc 1771  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24596202 tgcaaagactacatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccataagcgataccctttcacgttgtcagcataacccaagaatatacatttt 24596301  T
Q  1772 ctggactttgggtccaacttcgttttttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctt 1871  Q
    || |||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||| |  |||||||||||   ||||||||| |    
T  24596302 ctagactttggatctagctttgttctttcttgggagttgtacattgcgtacacagtacatccgaacacatgtaaggaagaataatcaggtggctttccgt 24596401  T
Q  1872 tccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggc 1971  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||  || ||||| || || ||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24596402 tccaaatctccattggtgttttcaaaccaattgcggttgatgtagatcgattgatcacgtaataggcggttttcacagcttctgcccagaaagacttagc 24596501  T
Q  1972 cattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaat 2071  Q
    || |   |||||| ||| ||| |||||| || | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24596502 cactattgctgttctcaacatggctctttttttatttaagagagttctattcatccgctctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaat 24596601  T
Q  2072 tgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagttt 2171  Q
    || |||  ||||||||| ||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||  ||||||    
T  24596602 tgtcttgtaataccctcatgtttgcagaatgtcaaaaaatcaccatctacatattctcctccattgtctgttcttaagcactttattcttttaccagttt 24596701  T
Q  2172 caagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaa 2271  Q
    |||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||    
T  24596702 caagttccacttgtgctttgaattccttgaatactgtaaacacatttgacttcttcttgattgggtacacccataatctcctagagtgatcatcaataaa 24596801  T
Q  2272 tgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactcta 2371  Q
    |||||| || | | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24596802 tgacacaaaatgttttgctcctcccatggatatttgtggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtcaagtatgtatttgcttctagtagttactctg 24596901  T
Q  2372 gcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactt 2471  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  | || |||||  ||||| ||||  |||    
T  24596902 gaaaacttcaatctatgttgcttgcttgtcacacagtgctcacagaaagacaaattcactgtcttgagcccaggtagaagattttgttcctcaagagctt 24597001  T
Q  2472 tcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgt 2571  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| | |||    ||||||  || |||||||||||    
T  24597002 tcaaaccacgttccgatatatggcctagtttatgatgccacaccattgtcgtttcttcttggctcgctacagcagtcaatgcattagcatcttgcaatgt 24597101  T
Q  2572 atctcccagaagcatgtataaattacttgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatc 2671  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||| || || || || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||    
T  24597102 atcccccacaagcatgtatagattgtttgtgagcttttttgctttcatcaccacgaggtttccctttactacttttaagtttccaccttcagtgtgaatc 24597201  T
Q  2672 ttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgca 2771  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||      
T  24597202 ttgcacccgaggtcatccaattgcccaatagacaataaattcttcttcaagtcctttacgtgacgtaccccttgtattttgcgaatagtaccatcatgtg 24597301  T
Q  2772 tctttaatctgatagtaccgactccagcaatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatc 2871  Q
    |||||| | ||| |||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||||    
T  24597302 tctttattttgacagtaccaatcccaacaacttctaaagtgtgatcattgcccatgaatacagatccttccgagataggttcatagctgcaaaaccaatc 24597401  T
Q  2872 tcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatccagacatcgttgagtcgtcttt-cgcctttagaactagttgctgcttcactatacag 2970  Q
       | |||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||  |||| ||||| ||  ||| | ||||||| |||| ||| |||| | |||||||     
T  24597402 cttgcgtggagtcatattccatgtggcacctgagtccactatccaaccatcattgag-cgcatttccacctttagtactaattgatgctccgctatacaa 24597500  T
Q  2971 gatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttcttt 3070  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| | ||     
T  24597501 gatttctccatcatctgaggtacttgctacacaaccttgagaggttgacgcttctgatgtcttctcttcattccttttgttgttccaacactcccttttc 24597600  T
Q  3071 acgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttg 3170  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |  || || || ||||    
T  24597601 aaatgccctctcataccacaaccgtagcatttgaaattcttccttctctgaggttttgatctaccacgatcttgactcccactagatcctcgctctgttg 24597700  T
Q  3171 atctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggc 3270  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||    
T  24597701 atctgcctctcgccatcactaaagcctctgcttgcttt------tctaacctttcttccttattcttgcgtctagattcttcttcaataattgcaccagc 24597794  T
Q  3271 gacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagca 3370  Q
     ||||||||||| | | |||  | | | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24597795 aacatcatcaaaattatgagagttatcaatattgttatttgtaatattgatgatgagttgatcatatgaatcaggtaaactctgaagtagaagttctgca 24597894  T
Q  3371 cgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccattt 3470  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||  ||| ||||||||  ||||     
T  24597895 cgttcattttcagctattgtgaaatctgaggctgtgagctgagcaaatagtgtattcatggtatttatgtgatttgttattgatatggattcattcattc 24597994  T
Q  3471 gaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttctt 3570  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  24597995 ggagagtgtagagcctcctttttaagaaaattcttgtgtgaagtgacttgacctcgtacaatttaataagagcatcccagatctcctttgcagacttttt 24598094  T
Q  3571 ttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgca 3670  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  24598095 ctctgcaatacttgacaataccgaatctgccattgctaagtgcaaattggcaacagcgttgtcatccatctctttccacttttgatcggtgatatctgca 24598194  T
Q  3671 agtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatct 3770  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  24598195 ggtctgccatcaattgcatctaggcaattgtcttttcttagaatcgcccttatctttaatttccacagtgagaaattactcccattaaacttctcaatct 24598294  T
Q  3771 caaatttcgctgccatggtttt 3792  Q
     |||||| | ||||||||||||    
T  24598295 taaattttgttgccatggtttt 24598316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 745; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1488
Target Start/End: Original strand, 24594537 - 24596021
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  24594537 tcgaacaaaatggtattgaacacctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattccttgcaatgtgcaatgcactctgactgtcacaatacacaaca 24594636  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    |||||||  ||  |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |    
T  24594637 atttgttgttgactgtggccgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgtgtagctgccatatattcagcttctgtagtag 24594736  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    | |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24594737 atagagctacgacagattgtaattttgacaatcaacttatcgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttttatcaagatcacc 24594836  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  24594837 tgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatctcaggattctctta 24594936  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24594937 acaacatcccaatgttttttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtaaatatcatggcatacataa 24595036  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||| | ||||||    
T  24595037 ggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcatactggagaataatttataattgataggaag 24595136  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  24595137 tggggtagatattggcttacaatcttgcatgttgaagcgccgcaaaacttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcctatcttttctatct 24595236  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24595237 cgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggccccaagtccttcatattgaactctctagccaattgtgcctttaattcttggacttgatctttgt 24595336  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24595337 tgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaacaacaaaatgataaaatcattattaccaaacctattgtagtatgtacaatggtctgaattaagtct 24595436  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 1003  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24595437 gttgtatccaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcctgttttagaccgtacagagatttggtcaacttgcaaaccaag 24595536  T
Q  1004 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaa 1103  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||    
T  24595537 ttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggttggagcatatatatttcttcttcaagctctccatgaagaaaagcagtttttacatctaattgttcaa 24595636  T
Q  1104 gatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 1203  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  24595637 gatgtaaatcaaacgcaacacacatagccaaaactattctgatagttgtgagtctaacaactggggagaatatttcattgaaatctatactttctttctg 24595736  T
Q  1204 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 1303  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24595737 agcataccctttaaccaccagtcttgcacgatatcgttctatttgatcattactatctcgtttgatcttgtatacccatttgttcccgatggctttccga 24595836  T
Q  1304 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaac--catt 1401  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| || |  | ||    
T  24595837 cccttgggaagttaaacaagttcccaagttttgtttctatgtaaggcttccatttcttcatgcattgctgccatccacagagaaacatctgagcttcttt 24595936  T
Q  1402 caacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgcca 1488  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || || || |||||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  24595937 ca--gcctcctgaaaggttgatggctccccatcttcttttaaaagacaatatgcatcatgagttgtcattacatagtctgaatgcca 24596021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Complemental strand, 87267 - 87218
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  87267 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 87218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3836 - 3883
Target Start/End: Complemental strand, 19803226 - 19803179
Alignment:
Q  3836 ttcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19803226 ttcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 19803179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 3601; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 3601; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 3896
Target Start/End: Complemental strand, 829750 - 825858
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829750 tcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 829651  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  829650 attttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccagatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttctgtcgttg 829551  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  829550 acagagctacaacagtttgtaacttggataaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcctgatcacc 829451  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829450 tgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctggggttcctttaatgtacctcatgattctctta 829351  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829350 acaacattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 829251  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829250 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccacttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 829151  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  829150 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaaataattcttttgagaaagccaaatattcctgtcttttctgtct 829051  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829050 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 828951  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828950 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattatcatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 828851  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 1003  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828850 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccgtacagagatttggtcaacctgcaaaccaag 828751  T
Q  1004 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaa 1103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828750 ttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaa 828651  T
Q  1104 gatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 1203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828650 gatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctg 828551  T
Q  1204 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 1303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828550 agcatatccttttacaaccagtcttgcacgattccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccga 828451  T
Q  1304 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattca 1403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  828450 ccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatctggatcattca 828351  T
Q  1404 acgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgt 1503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  828350 acgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggctcgtcataacatagtctgattgccaagatggtttctgcgt 828251  T
Q  1504 ctgacgtgttgatcgacgaacaccatcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttct 1603  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828250 ctgacgcgttgatcgacgaacaccattattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttct 828151  T
Q  1604 tccatctgcactatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaacct 1703  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  828150 tccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactagatccctgctaacaacaacct 828051  T
Q  1704 tgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttttttcttg 1803  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  828050 tgcgggtagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttg 827951  T
Q  1804 ggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatc 1903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827950 ggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatc 827851  T
Q  1904 gccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttcagcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttc 2003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  827850 gccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttctgcacagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttc 827751  T
Q  2004 tttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgc 2103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827750 tttctaggagagttctattcatccgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgc 827651  T
Q  2104 tagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaat 2203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827650 tagaaactcgccatctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaat 827551  T
Q  2204 actggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagata 2303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827550 actggaaacacatccgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagata 827451  T
Q  2304 tttctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcac 2403  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  827450 attctggtgactcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcac 827351  T
Q  2404 acagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttctgacatatggcctagtctt 2503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  827350 acagtgctcacagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaaggagattgcgttccacaaggactttcaagccacgttcagacatatggcctagtctt 827251  T
Q  2504 tgatgccacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtga 2603  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  827250 tgatgtcacatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatcctcctcttgcaatgtatctcccagaagcatgtatagattacttgtga 827151  T
Q  2604 tcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacaga 2703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  827150 tcttttctgctttcatcaccacaagattacctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgaggtcatccaattgtccaacaga 827051  T
Q  2704 caataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatt 2803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827050 caataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatt 826951  T
Q  2804 tctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctg 2903  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826950 tctaatgcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagaaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctg 826851  T
Q  2904 aatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacaca 3003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826850 aatccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactggttgctgcttcgctatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacaca 826751  T
Q  3004 tccttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttg 3103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  826750 tccttgagatgttgaagcttcagaattcttctctccattcttcttgatattccaacattccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcattta 826651  T
Q  3104 atattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgctt 3203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826650 atattcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactgcggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgctt 826551  T
Q  3204 gctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgtt 3303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826550 gctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctagattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgtt 826451  T
Q  3304 attatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagcc 3403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  826450 attatttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagct 826351  T
Q  3404 gtgagttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattc 3503  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826350 gtgagttgagaaaatagcgtattaagggtgttgatgtgatctgttacggatgtggattcacccattcgaagagtgtagagccttctctttaagaatattc 826251  T
Q  3504 tgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccat 3603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826250 tgttgtggagtgatttgacctcgtacaattttattagtgtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccat 826151  T
Q  3604 tgctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatct 3703  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826150 tgctaggtgcaaattggcaacggaattatcatccatctctttccacttttcatcagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctaggcaattatct 826051  T
Q  3704 tttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatat 3803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826050 tttcttaaaattgcccttatcttcaatttccatagcgaaaaatttctcccgttgaacttctcaatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatat 825951  T
Q  3804 ttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825950 ttttctttcaaactagaccggaacaataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 825858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 28715344 - 28714582
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||          ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  28715344 tcgaacaaaatgatattgaacacctatgtgcttcatccttgaacgaaaagttggatt----------tgcaaggcactataactatcacaatacacagta 28715255  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28715254 atttgctcctgcttgtgcccgagtacctccattaacctttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtactcagcttctgacgttg 28715155  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28715154 acatagctacaacagtttgtaacttggataaccaacttactgctcctctcgcaagcatgaacacgtaaccagtaaaagattttctttcatcatgatcacc 28715055  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28715054 ggcaaaatctgaatcaacataacccatgacaattaactctgatcctccgaaacatattgcaacacatgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 28714955  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28714954 acaacattccaatgctctttataaggatctgtcataaaccgactaaccactcccactaattgtgcaatctctgatcttgtacatatcatggcatacataa 28714855  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||    
T  28714854 ggcttcccaccgccgatgcatacggtattcgagacatttacatcctctctgcttcattgctaggactcatacatgtggatagtttaaaattcatagaaag 28714755  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||    
T  28714754 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaagactttccttatacaattcttttgagaaaaccaaatctttctatcttttctatct 28714655  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtg 776  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28714654 cagtgaatttacatccctaaaatcttgtttgttggtcccaagtctttcatatcgaactccctaaccaactgtg 28714582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1106
Target Start/End: Original strand, 13840984 - 13842061
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| |      
T  13840984 atgatattgaacacttatgtgttttgtccttgaatgaaaaa-tgaatttcttgcaatgtgaaaggcattctaattgtcacaatacatagtaatttgatgt 13841082  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || || | || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  13841083 tgtttgtgcccaagttcctccattaacctttgcattcaaataacttccttgcaagcatgggaagatgccatgtactcagttt-tgtcgttgacaaagcta 13841181  T
Q  213 caaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatc 312  Q
    ||     || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||| ||||||   ||||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  13841182 ca-----ttctaacttggataaccaacttaccgctcctcgtataaacgtgaacacataatcagtag---attttatattatcatgatcacttgtaaaatc 13841273  T
Q  313 tgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattc 412  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| || || ||||  ||||  ||||||  |||     
T  13841274 tgaatcaacataacccttgtcatttaactctgatcctccgaaacatattgcaacacttgaggtttctttgatatatctcaaaattcatttaacaa-attt 13841372  T
Q  413 caatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttccca 512  Q
     || | | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13841373 aaaggatatttaccaggatatgccataaaccgactaaccactcccactatttgtgtagtgtctggtcttgtacatatcatggaatacataaggctttcca 13841472  T
Q  513 ccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtaga 612  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13841473 ccatcaatgcatacggtactcgagacatctccatcctcactacttcatttctaggactgatacctacgaataatttaaaattcacaggaagtgaggtaga 13841572  T
Q  613 gattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct-cggtgaat 711  Q
    |||| | ||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||| | |  |||||    
T  13841573 gattag-ttacaatcttgcatgttaaagtatcgcaagactttccatagataatcattttgagaaaggtaaatcttcttgtctttt-tgtatacaatgaat 13841670  T
Q  712 ttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgttggggcct 811  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| | |||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  13841671 ttgtatccttaaaatcttgtttgctggtcccaagtc----atatcgaacacactagccaattttgtctgcaattcctcgactcaatctttgttgggtcct 13841766  T
Q  812 accaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtctgttgtaat 911  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||   |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13841767 accaccaatatgtcgtccatacacaacaacaaaatgataaaatcgttatcataaaaaaatttgcagtacgtacaatggcctaaactcagtctgttgtaat 13841866  T
Q  912 cgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttcttt 1011  Q
      ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||   || |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13841867 gaaggctaattatcaaagaattaaatatcttgtagcaacatatggacacctgctttcagccgtacaaagatttagtcaacctacaaactaagttttcttt 13841966  T
Q  1012 tccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagat 1106  Q
    ||||| ||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13841967 tccttcttctttggatctttctggttggagcatataaatgtcttcttcaatttcaccatgaaaaaaagcagtctttacatctagttgttcaagat 13842061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2926 - 3896
Target Start/End: Original strand, 13842766 - 13843735
Alignment:
Q  2926 gagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgttgaagcttcg 3025  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||   |||| | |||||  || ||||   || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  13842766 gagttgtctttcgcctttataactagttgttgctttgttatatatgattttaccatcattcaagatactttcaacacatccttaagatgttgaagctgca 13842865  T
Q  3026 gaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttctttcttcgagatt 3125  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  13842866 gaagtcttctatcagttcttcttattattccaacactcagtctttaagtgccctctcagaccataattgtagcatttgagattcttccttcttcaatatt 13842965  T
Q  3126 ttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttc 3225  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13842966 tttatctaccatgattt-gacttccactgggatcacattatgttgatctgcctattgtcattgtcaaagcatctggttgctttgaactctcagacctttc 13843064  T
Q  3226 ttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttattatttgtaatgttgatgatg 3325  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| || |||| |||| || |  ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  13843065 ttccttattcttaggtctggattctactccaagaattgaactgttgacatcatcaaagtgaagagtgtcaactatattgttatttgtaatgttgatgatg 13843164  T
Q  3326 agttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtgagttgagaaaatagcgtat 3425  Q
    |||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  13843165 agttgatcatacaaatttgatatactatgaagtagaagttcaacatgctcattttctgctattatgaaatcagaagttgtaagttgagaaaatagtgtat 13843264  T
Q  3426 tcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgttgtggagtgatttgacctc 3525  Q
    ||| ||| || |||||||  ||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  13843265 tcaaggtcttaatgtgatatgttattgatgtggattcactcattctaagagtgtagagcctcccatttaagaatattatgttatgaagttatttgacctc 13843364  T
Q  3526 gtacaattttattagagtatcccagatc-tcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgctaggtgcaaattggcaac 3624  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  13843365 gtacaattttattagagtgtcctagatcttcctttgttgccttcttttcaacaatacttgacaatatcgagtctaccattgcaaggtgcaaattggcaac 13843464  T
Q  3625 ggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatc 3724  Q
      | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  13843465 aacgttatcatctatctctttttacttttcgtcagtgatatttgcaagtttgccatcaattgtgtctacacaattatcttttcttaaaattgcttgtatc 13843564  T
Q  3725 ttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaatatttttctttcaaactagaccgg 3824  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| || || | ||      
T  13843565 ttcaatttccaaagggaagaatttctcctgttgaacttttctatctcaaatttcgatgtcatggttttacaccaactttttttcttt-aagctggtccta 13843663  T
Q  3825 aataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | || |  ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  13843664 aataataagaatttttttttgatgtggaaaatcaatctatattgcaaccacataacatactaatatttttct 13843735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2707 - 3091
Target Start/End: Complemental strand, 15604237 - 15603853
Alignment:
Q  2707 taaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttct 2806  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15604237 taaattctttttcgacctctttacatgatgtactccttgtatttttcaaacagtatcatcatgaatctttaatctgatagtacctacttcagaaatttct 15604138  T
Q  2807 aaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaat 2906  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15604137 aaggcatgatcattttccatgtacactaatccttctgagatgggttcataagagtaaacccaatctcggtgcagagtcgtgtgccatgttacacctgaat 15604038  T
Q  2907 ccattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatcc 3006  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |   |||| || |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15604037 ccattatccagacatcgttgagtcgtgttccaaatttataaatagttgttgcttcgctatacaagattcccccatcatctgaggtacttgcaacacatcc 15603938  T
Q  3007 ttgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaa 3091  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  15603937 ttgagatgttgaagcttcataagtgttctctccattctttttattattccagcacaccttctttaagtgccctctcattccacaa 15603853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2816 - 3193
Target Start/End: Complemental strand, 15603691 - 15603315
Alignment:
Q  2816 tcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatccattatcc 2915  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||| ||| |||||||| |    
T  15603691 tcatttcccatgtccactgatcctactaagataggttcataagagtaaaacaaatctcggtgcggattcaagtgtcatgttacacttga-tccattattc 15603593  T
Q  2916 agacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatccttgagatgt 3015  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || || | | ||||||    
T  15603592 agacatcgttgagccgtcttccgcatttagaactagttgatgcttcgctatatagcatttccccgtcatatgaggtacttgcagcaaataccttagatgt 15603493  T
Q  3016 tgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatattcttcttt 3115  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| | ||||   || ||||| | ||| ||||||    
T  15603492 tgaagcttcagaagtcttctctccattctttttatgattccaatactcattctttaagtgtcctctcattctacaattataacattttagatttttcttt 15603393  T
Q  3116 cttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaa 3193  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  15603392 ctttgagattttgacctatcatgattttgactcctagtggagccaggttaggttgatcttcctcgtgtcatcgtcaaa 15603315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1167 - 1527
Target Start/End: Original strand, 13842065 - 13842424
Alignment:
Q  1167 gagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgttt 1266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||    
T  13842065 gagaaaatatctcattgaaatcaatacctcttttctgagtatatcctttgacaatcaatcttgcacgatatcgtctcacttgatcatttccatcacattt 13842164  T
Q  1267 gatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgc 1366  Q
     |||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13842165 tatcttgtatatccatttgttttcgatggattttcgagcctttagaagttcaacaagatctcttgtcttgtttctatgtaaggctttaatttcttcatgc 13842264  T
Q  1367 attgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttg 1466  Q
    | |  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| || || | || ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |    
T  13842265 act-ttttcatccattgagaagcatacgaacaattcaacacctcttgataatttaaaggctcatcttcttcagctagaagacaatatgcattgtggctcg 13842363  T
Q  1467 tcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttgatcgacgaacacc 1527  Q
     | | ||| ||||||||| | | || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13842364 ccgtgacagagtctgattactaggatggtttatgcatctgacgcattgatcgacgaacacc 13842424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2599 - 2869
Target Start/End: Original strand, 13842485 - 13842755
Alignment:
Q  2599 tgtgatcttttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtcca 2698  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||    
T  13842485 tgtgatcttttttgctttcatcaccagaagatttcctttcactactttcaagatgccactttcagtgtggatcacacactcgaggtcatctaattgtcca 13842584  T
Q  2699 acagacaataaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccag 2798  Q
    | ||| ||| ||| ||| || |  || |||||||| || ||  ||| ||||||   |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13842585 atagaaaatgaatcctttttaactccttttacatgtcgtaccacttttattttatgaacaatatcatcttgcatctttaatatgatagtaccgactccaa 13842684  T
Q  2799 caatttctaaggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaa 2869  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13842685 caatttctaaagcattgtaatttcccatgcacaatcatccttttcagataggctcataagagtaaaaccaa 13842755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3166 - 3303
Target Start/End: Complemental strand, 15603828 - 15603691
Alignment:
Q  3166 cgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctttgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgca 3265  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15603828 cgttgatatgcctttcgtcatcttcaaagcctctgcatgctttgaactctctggcctttcttccttattcttgcgcatggattcttcttcatggattgca 15603729  T
Q  3266 ccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgtt 3303  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15603728 ccggtaacatcgtcaaagttaagagtatcagctatgtt 15603691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1051 - 1090
Target Start/End: Original strand, 17455350 - 17455389
Alignment:
Q  1051 ttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttaca 1090  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17455350 ttcttcttcaagttctccatgaacaaaagcagtctttaca 17455389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 945; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 945; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2313 - 3896
Target Start/End: Original strand, 8136818 - 8138402
Alignment:
Q  2313 actcccacacatcagaatgtatcaagtctagtatgtgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttactcatcacacagtgctc 2412  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8136818 actcccacacatcataatggatcaagtctagtatatgtttgcttctagtagttactctagcaaacttcaatctatgttgcttgcttatcacacagtgctc 8136917  T
Q  2413 acagaatggtaaatttactgtcttgagcccgtgaa-ggagattgcgttccacaaggac-tttcaagccacgttctgacatatggcctagtctttgatgcc 2510  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||  |||| |||||| |||| | |||||||||||| |  ||| ||    
T  8136918 acagaatggtaagtttaccgtcttcagcctgtgaaaggagattgcgttccgcaaagaaatttccagccacattctaatatatggcctagtttgcgatacc 8137017  T
Q  2511 acatcatcgttgtttcttcttggcttgctgctgcaactgatgcatccgcctcttg---caatgtatctcccagaagcatgtataaattacttgtgatctt 2607  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||  |    |||||||         |||||||||| |||||||||||| ||    
T  8137018 acatcatcgttgtttctttttggcttgcaactgcaattgatgcatccgcctaatataacaatgta---------agcatgtatagattacttgtgatatt 8137108  T
Q  2608 ttctgctttcatcaccacaagattgcctttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaat 2707  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8137109 ttcttctttcatcaccacaagattgcatttcactactttcaagattccactttcagtgtggatcttacacccgagatcatccaattgtccaacagacaat 8137208  T
Q  2708 aaattcttcttcaacccctttacatgacgcactccttgtatttttctaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgactccagcaatttcta 2807  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8137209 aaattcttcttcaacccatttagatgatgtactccttgtatttttcgaacagtaccatcatgcatctttaatctgatagtaccgacttcagcaatttcta 8137308  T
Q  2808 aggcatgatcatttcccatgtacacagatccttctgagataggctcataagagtaaaaccaatctcggtgtggagtcatgtgccatgttgcacctgaatc 2907  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8137309 aggcatggtcatttcctatgtacattgatccttctgaaataggctcataagagtaaaaccaatctcgatgtggagtcatatgccatgttgcacctgaatc 8137408  T
Q  2908 cattatccagacatcgttgagtcgtctttcgcctttagaactagttgctgcttcactatacaggatttccccgtcatctgaggtacttgcaacacatcct 3007  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8137409 ctttatctagacatcgttgagtcatctttcgactttagaactagtcgcttcttcgctatgcaggagttccccgtcatctgagatacttgcaacacatcct 8137508  T
Q  3008 tgagatgttgaagcttcggaattcttctctccattcttcttgatattccaacactccttctttacgtgccctttcatgccacaaccgtagcatttgatat 3107  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  8137509 tgagatattgaagcttcataagtcttctctccattcttcttattattccaagactcattctttaagtgacctctcatgccacaattgtagcatttgagat 8137608  T
Q  3108 tcttctttcttcgagattttgacctaccatgattttgactcccactggggccacgttccgttgatctgcctctcgtcatcgtcaaagcctctgcttgctt 3207  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| ||| || ||||||||  ||||| | |||||||    
T  8137609 tcttctttcttcgagattttaaccgaccatgattttgattcccactagggaaacattccgttgatcttcctttcatcatcgtc-tagcctttacttgctt 8137707  T
Q  3208 tgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctggattcttcttcaaggattgcaccggcgacatcatcaaagtgaagagtatcagctatgttatta 3307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8137708 tgaactctctgacctttcttccttattcttgcgcctgaattcttcttcaagggttgcaccgacgacattatcaaagtgaagagtatcagctatgttatta 8137807  T
Q  3308 tttgtaatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcattttccgctattttgaaatcagaagccgtga 3407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||    
T  8137808 tttggaatgttgatgatgagttgatcatacaaatatggtaaactctgaagtagaagttccacacgctcattttccgctattttgaaattagaagttggga 8137907  T
Q  3408 gttgagaaaatagcgtattcagggtgttgatgtgatccgttacagatgtggattcacccatttgaagagtgtagagccttctctttaagaatattctgtt 3507  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8137908 ttttagaaaataccgtattcagggtgttgatgtgatctgttatgaatgtggattcacccattcgaagagtgtagagcctcctctttaagaatattctgtt 8138007  T
Q  3508 gtggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatcccagatctcctttgctgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattgct 3607  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8138008 gcggagtgatttgacctcgtacaattttattagagtatccccgatctcgtttgttgtcttcttttcagcaatacttgacaatacccagtctgccattgct 8138107  T
Q  3608 aggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtcagtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaatta-tctttt 3706  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  8138108 aggtgcaggttggcaacaacattatcttccatctttttccactttttgttagtgatatctgcaggtctgccatctattgcgtctatgcaattattttttt 8138207  T
Q  3707 cttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaa-----at 3801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  8138208 cttaaaattgcccttatcttcaatttcaatagggaaaaatttctctcgttgaacttctctatctaaaatttcgctgccatggttttacaccaattatttt 8138307  T
Q  3802 atttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||||||| |||||||| | |  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8138308 atttttctctcaaactatatcaaaatagtaagaattcttttatgatgtggaagttcagtctaaaccacaaccaaatagcatactaagatttttct 8138402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 1185
Target Start/End: Original strand, 7506016 - 7506802
Alignment:
Q  398 ctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcat 497  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7506016 ctcttaacaacatcccaatgctctttaccaggatccgccataaattgactagccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatcatggcat 7506115  T
Q  498 acataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcac 597  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |     
T  7506116 acataaggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctatctacttcattgctaggattcatactagaggataatttataattgat 7506215  T
Q  598 aggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtctttt 697  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| | || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7506216 aggaagtggggtagatattggcttacagttttgcatgttgaagcgccgcaaaatttttcgtaaataatttctttgagaaagccaaatattcctatctttt 7506315  T
Q  698 ctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgat 797  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  7506316 ctatctcgatgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctgaccccaagttcttcatatcgaactccctagccaattatgcctttaattcttggacttgat 7506415  T
Q  798 ctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaact 897  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  7506416 ctttgttgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaataacaaaatgataaaatcattatcaccaaacctattgtagtatgtacaatggtctgaatt 7506515  T
Q  898 aagtctgttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaa 997  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7506516 aagtctgttgtattcaaggctaactatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctaggcgcatgttttagaccgtacaaagatttggtcaacatgcaa 7506615  T
Q  998 accaagttttcttttccttgttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagct 1097  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  7506616 accaagttttcctttccttgttcttcaaaaccttctggtt-gagcatatatatttcttcttcaagctgtccatgaagaaaagcagtttttacatctaatt 7506714  T
Q  1098 gttcaagatgtaaatccaatgcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaa 1185  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7506715 gttcaagatgtaaatcaaacgcagcacacatagccaaaactattctgatggtaatgagtctaacaactggggagaatatttcattgaa 7506802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 42 - 664
Target Start/End: Original strand, 2324197 - 2324791
Alignment:
Q  42 ttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacct 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2324197 ttgaatgaaaagatggattccttgcaatgtccac------ctgactgccacaatacaaagtgattttctcctgcttgtgcccgagttcctccattaacct 2324290  T
Q  142 ttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaactt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  2324291 ttgcatccaaatagcttccttgcatgcttgggtagctgccatgtacttagcttctgtcgttgacaaagctacaacagtttgtaacttggataactaactt 2324390  T
Q  242 actgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaact 341  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||  || |||||||    
T  2324391 acaactcctcctgcaagtgtgaacacataactagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgactcaagaaatcccccaacggttaact 2324490  T
Q  342 ctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaa 441  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2324491 ctgatcctccgaaacatattgcaacacctgaggttccttttatatacatcatgattctcttaacagcattccaatgctctttaccaagatccgccataaa 2324590  T
Q  442 ccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatt 541  Q
    ||||| |||||                      ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  2324591 ccgaccaacca----------------------tggtcttgtgcataccatgacatacaaaaggcttcccaccacctatgcatacggtactcgagatatt 2324668  T
Q  542 tccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagc 641  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2324669 tccatcctctctgcttcattactaggactcatacttgaggataatttaaaattcaaaggaagtggggtagaggctggcttacagtcttgcatgttgaagc 2324768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1491
Target Start/End: Original strand, 2324789 - 2325127
Alignment:
Q  1152 taagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatc 1251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2324789 taagtctgacaaccgga-aaaatatctcatcaaagtcaataccttctttctgagtatatccttttaccatcaatcttgaacgataccgttccacttgatc 2324887  T
Q  1252 attgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcc 1351  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  2324888 atttccatcacgtttgatcttgtctatccatttgtttccaatggctttccgtccctttggaagttcaacaagttcccctatcttgtttctatgtaaggcc 2324987  T
Q  1352 tccatttcttcatgcattgctgtcatccattgagaagcatccgaaccattcaacgcctcatgaaaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaat 1451  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2324988 tccatttcttcaagcattgttgtcatccattgagaaacatctgaaccgttcaacgcctcttgaaaagttaaaggttcaccttcttcagttataagaccat 2325087  T
Q  1452 atgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaaga 1491  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  2325088 atgcatcgaggctcgtcataacatagtcggattaccaaga 2325127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3562 - 3896
Target Start/End: Complemental strand, 25441478 - 25441138
Alignment:
Q  3562 tgtcttcttttcagcaatacttgacaataccgagtccgccattg----ctaggtgcaaattggcaacggcattatcatccatctctttccacttttcgtc 3657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25441478 tgtcttcttttcagcaatacttgacaatactgagtccgtcattggcgtcgatgtgcaaattggcgacgacattatcatccatctctttccactttccgtc 25441379  T
Q  3658 agtgatatctgcaagtctgccatctattgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttg 3757  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  25441378 agtgatatctgcaggtctgacatctatcgcatctaggcaattatcttctcttaaaatttcccttatcttcaatttccataggaaaaaatttctcccattg 25441279  T
Q  3758 aacttttctatctcaaatttcgctgccatggttttacaccaaata--tttttctttcaaactagaccggaataataagaattcttttctgatgtggaaga 3855  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25441278 aacttctctatctcaaatttcgctgccatggtttttcaccaaatatgttttttcttcaaactagacaggaataataagaattcttttatgatgtgaaaga 25441179  T
Q  3856 tcagtttaaaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 3896  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25441178 tcagtttacaccgcaaccacagagcatactaagatttttct 25441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 405
Target Start/End: Original strand, 7504809 - 7505210
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || ||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  7504809 tcgaacaaaatggtattgaacatctatgtgttttgttctcgaatgaaagactggattccttgcaatgtgcaatgcactctgactgtcacaatacacaaca 7504908  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    |||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |    
T  7504909 atttgttgttgactgtgcacgagttcttccattagtctttgtatccaaatagcttccttgcaagcttgcgtagctgccatatattcagcttctgtagtag 7505008  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    | |||||||| ||   |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7505009 atagagctacgacaaattgtaattttgacaatcaacttaccgctcctcctgcaagtgtgaacacataaccagtagtagatcttcttttatcaagatcacc 7505108  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  7505109 tgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttccttttatatatctcaggattctctta 7505208  T
Q  404 ac 405  Q
    ||    
T  7505209 ac 7505210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2118 - 2318
Target Start/End: Original strand, 8134716 - 8134907
Alignment:
Q  2118 ctacatattctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttctcagtttcaagctctatttgtgctttgaatgccttgaatactggaaacacatc 2217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||    
T  8134716 ctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttctcaatttcacgctttatttgtgctttgaat---------actgaaaacacatc 8134806  T
Q  2218 cgacttcttcttgattgggtacacccataatcttctggaatagtcatcaatgaatgacacgaagtatcttgctcctcccagagatatttctggtgactcc 2317  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8134807 tgacttcttcttaattgggtacacccataatcttctggaatagtaatcaatgaatgagacgaaatatcttgcccctcccagagatatttctggtgactcc 8134906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22510175 - 22509836
Alignment:
Q  17 tattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcctgtt 116  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||||  |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  |    
T  22510175 tattgaacgcctttgtgcatcgtcttggaatacaaagttggattgcttgaaatgtgcaagacactctgactatcacaatacaaagtaatttgttgatact 22510076  T
Q  117 tgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagta-gctgccatgtactccgcttctgtcgttgacagagctacaa 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  | | ||||  || ||||||| ||   |||| | |||||||||||| |||    
T  22510075 tgtgcgcgagttcctccattaaccttatcatccaaatagcttccttgcaaacct-agtatacttccatgtattcaatttctcttgttgacagagcttcaa 22509977  T
Q  216 ccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttctttt--atcatgatcacctgcaaaatct 313  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||     ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22509976 caattggtaacttggacaaccaaattactgctcctcttacaaatgtgaa-----aaccaatagtatatatttttttcaatcatgatcaccttcaaaatct 22509882  T
Q  314 gaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacata 359  Q
    ||||||||||||| ||  |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  22509881 gaatcaacataacacctaatggttaactttgatcctccgaaacata 22509836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Complemental strand, 11712121 - 11712072
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11712121 aattattttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 11712072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 845; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 845; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 968
Target Start/End: Original strand, 28081 - 29045
Alignment:
Q  4 tcgaagaatatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 103  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28081 tcgaacaaaatgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagta 28180  T
Q  104 atttgttcctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttccttacatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 203  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28181 atttaatcctgcttgtgcacgagttcctccataaacctttgcaaccaaatagcttccttgcatgcttgagtagctgccatgtactccgcttctgtcgttg 28280  T
Q  204 acagagctacaaccgtttgtaacttggacaaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcatgatcacc 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28281 acagagctacaacagtttgtaacttggataaccaacttactgctcctcctgaaagtgtgaacacataatcagtagtagattttcttttatcatgatcacc 28380  T
Q  304 tgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 403  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28381 tacaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctctgaaacatattgcaacatccgaggttcctttaatgtacctcatgattctctta 28480  T
Q  404 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481 acagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataa 28580  T
Q  504 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaag 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28581 ggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacatgaggataatttaaaattcacaagaag 28680  T
Q  604 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28681 tggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaagccaaatcttcctgtcttttctgtct 28780  T
Q  704 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgccttcaattcctggactcgatctttgt 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28781 cggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaattgtgccttcaattcccggactcgacctttgt 28880  T
Q  804 tggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattaccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 903  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28881 tgggtcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataaaatcattgccatcaaaccttttgtagtacgtacaatggtctgaactaagtct 28980  T
Q  904 gttgtaatcgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgcttta 968  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28981 gttgtaattgaggctaattatgaaagaatcaaatctcttgcaccaacatctgggcgcctgcttta 29045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 279 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 34973530 - 34972958
Alignment:
Q  279 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataaccccagacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  34973530 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgaatcgacataacccctaacagttaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacctgaggttcc 34973431  T
Q  379 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 478  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  ||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||    
T  34973430 tttattgtacctcataattctatcgacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactctcgctgtttgttcaatgtcttgt 34973331  T
Q  479 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 578  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34973330 cttgtacatataaagacatacataaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 34973231  T
Q  579 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttagataattcttttgagaaag 678  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34973230 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttagataattcatttaagaaag 34973131  T
Q  679 ccaaatcttcctgtcttttctgtctcggtgaatttgcatccctaaaatcttgtttgctggtcccaagtctttcatatcgaactccctagccaactgtgcc 778  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  34973130 ccaaatcttcttgtcttttctgtcttggtgagtttgcatcgctaaaacctggtttgctagtcccaagtctttcatattgaattccctaaccaattgtgcc 34973031  T
Q  779 ttcaattcctggactcgatctttgttggggcctaccaccaacatgtcatccacatacaacagcaaaatgataa 851  Q
    |||||| | |||||   || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||    
T  34973030 ttcaatacttggacctaatatttgttggggcctaacaccaacatgtcgtccatatacaataacaaaataataa 34972958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 919 - 1363
Target Start/End: Complemental strand, 34972738 - 34972298
Alignment:
Q  919 aattatgaaagaatcaaatctcttgtaccaacatctgggcgcctgctttagaccatacagagatttggtcaacctgcaaaccaagttttctttt-ccttg 1017  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  34972738 aattacgaaagaatcaaatctcatgtaccaacatttgggtgcatgttttagatcgtacatagattcagtcaacctacaaaccaagttttttttttccttc 34972639  T
Q  1018 ttccttaaatccttccggttggagcatataaatttcttcttcaagttctccatgaagaaaagcagtctttacatccagctgttcaagatgtaaatccaat 1117  Q
    ||| || ||||||||| |||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  34972638 ttctttgaatccttccagttatagtatataaatttccttttcaagctctccatgaagaaaaacactctttgcatctagatgttcaagatgtaaatacaat 34972539  T
Q  1118 gcagcacacatcgccaacactactctgatagtagtaagtctgacaaccggagaaaatatctcattgaagtcaataccttctttctgagcatatcctttta 1217  Q
    ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |     ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34972538 gcaacacacatagccgccactactctgatagtagtaagtctaacaactg-----aataatacattgaagtcaataccttctttatgagcatatactttta 34972444  T
Q  1218 caaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatggctttccgaccctttggaagttc 1317  Q
    | |  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  34972443 ccagtagtcttgcatgatattgttccacttgatcattgtcacgacgtttgatcttgcatgcccatttgtttctaatgacttttcgaccctttggaagttc 34972344  T
Q  1318 aacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttca 1363  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  34972343 aacaagctatcatgtcttgtatctatataaggcttctatttcttca 34972298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1195 - 1370
Target Start/End: Original strand, 11926865 - 11927040
Alignment:
Q  1195 ttctttctgagcatatccttttacaaccagtcttgcacgataccgttccacttgatcattgccatcacgtttgatcttgtatacccatttgtttccaatg 1294  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11926865 ttctttctgagcatattattttaccaccggtcttggacgatacggttccacttgatcactaccctcacatttgatcttgtatatccatttgtttcgaatg 11926964  T
Q  1295 gctttccgaccctttggaagttcaacaagctcccatgtcttgttcctatgtaaggcctccatttcttcatgcattg 1370  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| | | |||||||||||||    
T  11926965 gctttctgaccttttggaagttcaacaagctcacatgtcttgtttctttgtaagtccttcgtatcttcatgcattg 11927040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 41413635 - 41413783
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaagctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgttcc 112  Q
    |||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||      
T  41413635 atgatattgaacgcctacatgccttgtccttgaatggaaggctggattacttgcaatgtgcaagacactctaactatcacaatatacaataatttgttat 41413734  T
Q  113 tgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttcct 161  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41413735 tgtctgtgtttgagttcctcaattaacatttgcatcaaaatagcttcct 41413783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34973743 - 34973592
Alignment:
Q  13 atgatattgaacgcctatgtgtttcgtccttgaatgaaaa--gctggattccttgcaatgtgcaaggcactctgactgtcacaatacacagtaatttgtt 110  Q
    |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||| | ||    
T  34973743 atgatattaaatgcctatttgcttcgtccttgaatgaaaaaagttggatttcatacaatgtgcaagacactttaactttcataatacacaataatgtctt 34973644  T
Q  111 cctgtttgtgcccgagttcctccattaacctttgcatccaaatagcttcctt 162  Q
      || ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34973643 gatgcttgtgtctaagtccctccattaacctttgcatccaaacagcttcctt 34973592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1415 - 1516
Target Start/End: Original strand, 11927124 - 11927225
Alignment:
Q  1415 aaagttgacggttcaccttcttcagttataagacaatatgcatcgtggcttgtcataacatagtctgattgccaagacggtttctgcgtctgacgtgttg 1514  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||  |||||    
T  11927124 aaagttgaaggttcaccttcttcggttagaagacaatatgaattgtgcctcatcataacatagtttgatttccaagatggtttttgcgtttgagttgttg 11927223  T
Q  1515 at 1516  Q
    ||    
T  11927224 at 11927225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Original strand, 2796411 - 2796460
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2796411 aattcttttctgatgtggaagatcacattaaactgcaaccacagagcata 2796460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Complemental strand, 42376144 - 42376095
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  42376144 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacaaagcata 42376095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3685 - 3761
Target Start/End: Original strand, 46344296 - 46344372
Alignment:
Q  3685 tgcgtctaggcaattatcttttcttaaaattgcccttatcttcaatttccaaagggaaaaatttctcccgttgaact 3761  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||||||||||  |||||||    
T  46344296 tgcgtctaggcaattatggtttcttaaaattgcatttatcttcgattttcacaaggaaaaatttctccaattgaact 46344372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Original strand, 14476165 - 14476214
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  14476165 aattcttttctgatgtggaagatccgattaaactgcaaccatagagcata 14476214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Complemental strand, 23201196 - 23201147
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  23201196 aattcttttctgatgtggaagatcatattaaactgcaaccacatagcata 23201147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3312 - 3380
Target Start/End: Complemental strand, 46452619 - 46452552
Alignment:
Q  3312 taatgttgatgatgagttgatcatacgaatctggtaaactctgaagtagaagttcagcacgctcatttt 3380  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46452619 taatgttgatgatgagttcatcatagga-tctaataaactatgaagtagaagtttagcacactcatttt 46452552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 42; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3834 - 3883
Target Start/End: Original strand, 28822 - 28871
Alignment:
Q  3834 aattcttttctgatgtggaagatcagtttaaaccgcaaccacagagcata 3883  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28822 aattcttttctgatgtggaagatcagattaaactgcaaccacagagcata 28871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University