View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3340-Insertion-2 (Length: 1122)

Name: NF3340-Insertion-2
Description: NF3340
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3340-Insertion-2
NF3340-Insertion-2
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (452-1086)||(5164799-5165446)
chr6 (546-1057)||(25942276-25942789)
chr6 (546-1048)||(13879356-13879859)
chr6 (7-387)||(5164358-5164734)
chr6 (546-1057)||(17693912-17694425)
chr6 (546-985)||(22350032-22350470)
chr6 (689-826)||(33331247-33331384)
chr6 (689-826)||(14738373-14738510)
chr6 (689-824)||(9035448-9035583)
chr6 (729-813)||(16553567-16553651)
chr6 (729-813)||(16630123-16630207)
chr6 (729-813)||(34165775-34165859)
chr6 (729-816)||(5408262-5408349)
chr6 (729-816)||(5412587-5412674)
chr6 (729-816)||(26067631-26067718)
chr6 (890-983)||(9035648-9035740)
chr6 (729-817)||(12158206-12158294)
chr6 (729-813)||(16651828-16651912)
chr6 (14-69)||(10145749-10145804)
chr6 (729-816)||(33309845-33309932)
chr6 (550-600)||(24432343-24432393)
chr6 (729-815)||(30444250-30444336)
chr6 (8-69)||(13353225-13353286)
chr6 (8-69)||(13740940-13741001)
chr6 (8-69)||(13746440-13746501)
chr6 (993-1057)||(22351363-22351428)
chr6 (8-69)||(33796350-33796411)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (510-1048)||(44015690-44016229)
chr7 (546-1057)||(25351959-25352472)
chr7 (510-1048)||(7070412-7070951)
chr7 (546-1048)||(25406031-25406534)
chr7 (546-1048)||(3323848-3324351)
chr7 (689-825)||(18412807-18412943)
chr7 (689-825)||(21988069-21988205)
chr7 (689-825)||(5817987-5818124)
chr7 (689-826)||(16884076-16884213)
chr7 (689-826)||(24262124-24262261)
chr7 (689-826)||(12405486-12405623)
chr7 (689-825)||(21645174-21645310)
chr7 (689-825)||(49090826-49090962)
chr7 (729-816)||(48490293-48490380)
chr7 (707-825)||(9185959-9186077)
chr7 (729-813)||(6593726-6593810)
chr7 (729-813)||(18391364-18391448)
chr7 (729-817)||(13289735-13289823)
chr7 (729-816)||(1048525-1048612)
chr7 (729-816)||(6047449-6047536)
chr7 (8-67)||(6782885-6782944)
chr7 (729-816)||(7093697-7093784)
chr7 (729-816)||(7350887-7350974)
chr7 (729-816)||(22135768-22135855)
chr7 (710-753)||(23083723-23083766)
chr7 (729-804)||(31157521-31157596)
chr7 (729-816)||(38394949-38395036)
chr7 (729-816)||(40550795-40550882)
chr7 (729-816)||(47675330-47675417)
chr7 (8-69)||(43085536-43085597)
chr7 (8-69)||(47710467-47710528)
chr7 (8-69)||(47722123-47722184)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (546-1057)||(22625040-22625553)
chr3 (510-1070)||(47881913-47882475)
chr3 (510-1048)||(29912980-29913519)
chr3 (546-1048)||(10611838-10612341)
chr3 (546-1048)||(10204752-10205255)
chr3 (546-1048)||(6303928-6304431)
chr3 (546-1048)||(10897622-10898125)
chr3 (546-1057)||(16458073-16458585)
chr3 (554-1048)||(54189127-54189621)
chr3 (546-1048)||(10097867-10098359)
chr3 (689-825)||(16263512-16263648)
chr3 (689-826)||(8516243-8516380)
chr3 (689-826)||(32479489-32479626)
chr3 (689-825)||(28489976-28490112)
chr3 (729-816)||(29811757-29811844)
chr3 (717-813)||(10210092-10210188)
chr3 (729-816)||(7763159-7763246)
chr3 (707-818)||(9602655-9602766)
chr3 (729-816)||(27421573-27421660)
chr3 (689-825)||(3324350-3324486)
chr3 (729-813)||(4599912-4599996)
chr3 (729-813)||(9635316-9635400)
chr3 (729-813)||(10057136-10057220)
chr3 (729-813)||(10059358-10059442)
chr3 (729-813)||(10061580-10061664)
chr3 (729-813)||(10063802-10063886)
chr3 (729-813)||(10066024-10066108)
chr3 (729-816)||(4309746-4309833)
chr3 (729-816)||(18098407-18098494)
chr3 (680-759)||(20630996-20631075)
chr3 (729-816)||(43227012-43227099)
chr3 (729-818)||(5192814-5192903)
chr3 (729-810)||(23199331-23199412)
chr3 (9-69)||(2806285-2806345)
chr3 (729-813)||(5259515-5259599)
chr3 (729-816)||(5192585-5192672)
chr3 (729-816)||(5898344-5898431)
chr3 (729-816)||(6065029-6065116)
chr3 (729-816)||(32891978-32892065)
chr3 (729-816)||(37407577-37407664)
chr3 (729-811)||(6717406-6717488)
chr3 (9-67)||(13574922-13574980)
chr3 (8-69)||(8018992-8019053)
chr3 (740-813)||(22834212-22834285)
chr3 (8-69)||(34610585-34610646)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (546-1057)||(20053821-20054334)
chr2 (546-1057)||(22716294-22716807)
chr2 (546-1048)||(2736822-2737325)
chr2 (546-1048)||(39680663-39681166)
chr2 (510-1057)||(28456527-28457077)
chr2 (527-804)||(17932982-17933260)
chr2 (923-1069)||(10941949-10942096)
chr2 (923-1069)||(10947818-10947965)
chr2 (689-826)||(19348426-19348563)
chr2 (689-825)||(25402799-25402935)
chr2 (689-818)||(10446246-10446375)
chr2 (8-67)||(8424912-8424971)
chr2 (729-816)||(35217206-35217293)
chr2 (729-816)||(36560377-36560464)
chr2 (8-69)||(10570994-10571055)
chr2 (8-69)||(14466409-14466470)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (510-1057)||(16932-17481)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (510-1048)||(28891381-28891920)
chr8 (546-1048)||(16756321-16756824)
chr8 (546-1048)||(28328525-28329028)
chr8 (510-1070)||(33033235-33033796)
chr8 (510-1048)||(15945272-15945811)
chr8 (719-1014)||(4819474-4819769)
chr8 (801-1057)||(21034475-21034732)
chr8 (510-765)||(26269331-26269587)
chr8 (510-687)||(21038408-21038586)
chr8 (689-825)||(18853965-18854101)
chr8 (689-826)||(10685065-10685202)
chr8 (689-826)||(35744539-35744676)
chr8 (689-825)||(26300487-26300623)
chr8 (729-817)||(31577530-31577618)
chr8 (689-825)||(23800319-23800455)
chr8 (717-813)||(41366174-41366270)
chr8 (729-816)||(15069578-15069665)
chr8 (729-817)||(17848536-17848624)
chr8 (729-816)||(4732546-4732633)
chr8 (729-816)||(27827996-27828083)
chr8 (729-816)||(34255698-34255785)
chr8 (729-816)||(43080613-43080700)
chr8 (690-816)||(28314855-28314981)
chr8 (8-69)||(3157558-3157619)
chr8 (740-813)||(5591776-5591849)
chr8 (8-69)||(11232193-11232254)
chr8 (8-69)||(11232428-11232489)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (546-1057)||(15312925-15313438)
chr4 (514-1070)||(16633084-16633642)
chr4 (510-804)||(4559067-4559362)
chr4 (905-1048)||(4558925-4559068)
chr4 (689-825)||(5147050-5147186)
chr4 (689-777)||(21549539-21549627)
chr4 (707-826)||(9225205-9225324)
chr4 (729-813)||(5136983-5137067)
chr4 (729-813)||(7123599-7123683)
chr4 (729-813)||(8394309-8394393)
chr4 (717-816)||(4588840-4588939)
chr4 (729-812)||(5206856-5206939)
chr4 (737-816)||(5872703-5872782)
chr4 (729-816)||(22781973-22782060)
chr4 (689-804)||(38983911-38984026)
chr4 (729-816)||(52094555-52094642)
chr4 (729-810)||(12740925-12741006)
chr4 (729-810)||(12749131-12749212)
chr4 (8-69)||(35796976-35797037)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (546-1057)||(9522332-9522845)
chr1 (510-1048)||(2400249-2400788)
chr1 (545-1069)||(14997632-14998153)
chr1 (689-826)||(41397388-41397525)
chr1 (689-825)||(19359640-19359776)
chr1 (729-809)||(3805367-3805447)
chr1 (717-816)||(27338357-27338456)
chr1 (717-816)||(28222602-28222701)
chr1 (689-777)||(9024649-9024737)
chr1 (689-825)||(47099620-47099756)
chr1 (729-804)||(8348307-8348382)
chr1 (731-810)||(13126975-13127054)
chr1 (729-816)||(16227124-16227211)
chr1 (729-816)||(28202936-28203022)
chr1 (729-816)||(28841378-28841465)
chr1 (729-816)||(31658092-31658179)
chr1 (729-816)||(47178318-47178405)
chr1 (729-816)||(51750993-51751080)
chr1 (8-70)||(26177167-26177229)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (510-1048)||(10627976-10628515)
chr5 (546-1046)||(25446106-25446607)
chr5 (511-1070)||(31781485-31782048)
chr5 (583-986)||(28788401-28788805)
chr5 (689-826)||(27448971-27449108)
chr5 (689-826)||(31397793-31397930)
chr5 (689-826)||(33790464-33790601)
chr5 (689-826)||(37557425-37557562)
chr5 (689-825)||(24556387-24556523)
chr5 (689-825)||(24597419-24597555)
chr5 (717-816)||(13694322-13694421)
chr5 (689-826)||(43596270-43596407)
chr5 (689-826)||(43629064-43629201)
chr5 (729-813)||(16408226-16408310)
chr5 (729-813)||(16545331-16545415)
chr5 (729-813)||(29721266-29721350)
chr5 (729-813)||(40381007-40381091)
chr5 (729-816)||(6746024-6746111)
chr5 (729-816)||(31543689-31543776)
chr5 (689-754)||(34841764-34841830)
chr5 (729-845)||(32584715-32584831)
chr5 (729-816)||(10750654-10750741)
chr5 (729-816)||(15356085-15356172)
chr5 (729-816)||(20505442-20505529)
chr5 (729-816)||(23666002-23666089)
chr5 (987-1057)||(28787006-28787077)
chr5 (8-69)||(1564566-1564627)
chr5 (8-69)||(15480583-15480644)
chr5 (8-69)||(25258300-25258361)
chr5 (8-69)||(25322090-25322151)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (546-756)||(50267-50478)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (689-825)||(1656-1792)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (689-826)||(678-815)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (689-826)||(15110-15247)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (8-69)||(51260-51321)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (689-826)||(149756-149893)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (689-825)||(3996-4132)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (689-825)||(18741-18877)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (729-816)||(115491-115578)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (729-816)||(580-667)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (729-816)||(72753-72840)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (732-816)||(254-338)
[»] scaffold0400 (1 HSPs)
scaffold0400 (8-67)||(3869-3928)
[»] scaffold0365 (1 HSPs)
scaffold0365 (8-67)||(4513-4572)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (729-816)||(23082-23169)
[»] scaffold0519 (2 HSPs)
scaffold0519 (8-69)||(1940-2001)
scaffold0519 (8-69)||(2175-2236)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 452 - 1086
Target Start/End: Original strand, 5164799 - 5165446
Alignment:
Q  452 ctaacacaacttacctacttcgatttttccaaaaagtttacccttattcaatattcag------------acggatgaactatcacttccattgccgttt 539  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5164799 ctaacacaacttatctacatcgatttttccaaaaagtttacccttattcaatattcaattcaatatctgaacggatgaactaccacttccattgccattt 5164898  T
Q  540 ctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctgg 639  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  5164899 ctctgaggacaatccttcttgaagtgatatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccaccaccctacgacctaaactttgacttgg 5164998  T
Q  640 aattcttgctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaac 739  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164999 aattcttgcttttccatttcccgtgttttcacttctctcccttgagactttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaac 5165098  T
Q  740 tctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaag 839  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5165099 tctttggttctcaaagatgcttgaactttctccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaaggatcaaggtaaag 5165198  T
Q  840 cacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattat 939  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5165199 cacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgatccattat 5165298  T
Q  940 aggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccac 1039  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  5165299 aggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcggacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccac 5165398  T
Q  1040 atagacac-acagtagtcttcctggctacctcactcgaaacctaatcc 1086  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5165399 atagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgaaaccttatcc 5165446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 25942789 - 25942276
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25942789 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 25942690  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25942689 tgcctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 25942590  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  25942589 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 25942490  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25942489 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 25942390  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  25942389 ttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 25942290  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  25942289 cacagcagtagtct 25942276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 13879859 - 13879356
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13879859 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 13879760  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879759 tgcctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 13879660  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  13879659 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 13879560  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  13879559 aataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 13879460  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  13879459 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 13879360  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  13879359 caca 13879356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 7 - 387
Target Start/End: Original strand, 5164358 - 5164734
Alignment:
Q  7 acaatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaagacaaaatatcgattatcaattataacatcgtttttctc 106  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164358 acaattctcacctcacaaattagttttgtgaggttgtattatgctcaagcacaatttctaagacaaaatatcgattatcaattataacatcgtttttctc 5164457  T
Q  107 aaactgacactcaattaatatcggctggttggtatttggaaaatttgccatcttacttgcaatgtgatatctgattaatttctccacaatgtttacgtat 206  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5164458 aaac-gacactcaattaatatcatctggttggtatttggaaaatttgccaacttacttgcaatgtgatatctgataaatttctccacaatgtttacgtat 5164556  T
Q  207 catgaacgtcatgaatgccttaaacaatttcattggaatacaaccttgaatcaggaatttagttgatattattattttatcaatatcgtacgcaatttat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164557 catgaacgtcatgaatgccttaaacaatttcattcgaatacaaccttgaatcaggaatttagttga---tattattttatcaatatcgtacgcaatttat 5164653  T
Q  307 tatctccacttatccaaaccaaaatatgagcatgtgaaagccttctttcctagaattaaattgcgtacatacctaagcaca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5164654 tatctccacttatccaaaccaaaatatgagcatgtgaaagccttctttcctagaattcaattgcgtacatacctaaacaca 5164734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Original strand, 17693912 - 17694425
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17693912 ggacaatctttcttttagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttatttccatcacccttctacctagactttgacctggaattct 17694011  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17694012 tgcctttcccttttcctcttttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactcttt 17694111  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  17694112 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 17694211  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  17694212 agtaggtgtaagtctttatccttgtcttctagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 17694311  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||| ||||| |   ||||| ||||||||||||||||    
T  17694312 ttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgtttcagacattttctatgtgccaaagacttggttatgtataattaatcaagtttattccacataga 17694411  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  17694412 cacagcagtagtct 17694425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 546 - 985
Target Start/End: Original strand, 22350032 - 22350470
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22350032 ggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttatttccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 22350131  T
Q  646 tg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    || ||||  | |||||| | |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22350132 tgtctttcccttttcctctattttgacttctcccccttgagacattaaagccttctccactatcatcaactttcaactctttgaacttggtcaactcttt 22350231  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||    
T  22350232 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgataatgccatctttgccataaatcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcatac 22350331  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||      
T  22350332 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatagg-- 22350429  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcaga 985  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22350430 ttgactccaccattcggtaaaagtagatttgttgtctcaga 22350470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 33331384 - 33331247
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  33331384 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 33331285  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33331284 ccttaccataaagaatggtatccttgaaatgctcaaag 33331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 14738510 - 14738373
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| |||    
T  14738510 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagcagtgccct 14738411  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  14738410 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 14738373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 689 - 824
Target Start/End: Original strand, 9035448 - 9035583
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||  || |||||||||||||| || || ||| |||||||  ||||||  || ||||||||  |||| ||||    
T  9035448 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggttaattccttggttttcaaagccacttgaaactcctccaaagtagtagtttcct 9035547  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaa 824  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  9035548 cctttccataaaggatgatatccttaaaattctcaa 9035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 16553651 - 16553567
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16553651 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16553567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 16630207 - 16630123
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16630207 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16630123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 34165859 - 34165775
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34165859 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 34165775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 5408262 - 5408349
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5408262 acttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5408349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 5412587 - 5412674
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5412587 acttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5412674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 26067631 - 26067718
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26067631 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 26067718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 983
Target Start/End: Original strand, 9035648 - 9035740
Alignment:
Q  890 ttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttca 983  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||| || |||||||| | | |  ||||||||||||||||||    
T  9035648 ttcgccaaatca-caagaatcttgttgaatttcgtcaattgctttgtgataggtttagactccaccatcttgaatcagtagagttgttgtttca 9035740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 729 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 12158294 - 12158206
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 817  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| || || || |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12158294 acttggtcaactccttggttctcaaagccgtttgaacatcttctaaggtgacagtgccttctttgccataaatcattgtatcctcgaaa 12158206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 16651912 - 16651828
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16651912 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16651828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10145804 - 10145749
Alignment:
Q  14 tcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10145804 tcacctcacaagtcagttttgtagggttgtgttaggctcaaccacaatttctaaga 10145749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 33309932 - 33309845
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33309932 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 33309845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 550 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 24432393 - 24432343
Alignment:
Q  550 aatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttg 600  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  24432393 aatccttcttgaagtgacattgtttgtgacaaagaaagcatttatactttg 24432343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 30444336 - 30444250
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttga 815  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  30444336 acttggtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcgttga 30444250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 13353225 - 13353286
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  13353225 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 13353286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 13740940 - 13741001
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  13740940 caatcctcacttcacaagtcggttttgtggggttgtgttaggcccaaccacaatttctaaga 13741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 13746440 - 13746501
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  13746440 caatcctcacttcacaagtcggttttgtggggttgtgttaggcccaaccacaatttctaaga 13746501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 993 - 1057
Target Start/End: Original strand, 22351363 - 22351428
Alignment:
Q  993 tatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtct 1057  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22351363 tatgtgccaaagatttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtct 22351428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 33796350 - 33796411
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  33796350 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 33796411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Original strand, 44015690 - 44016229
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44015690 acggatggattaccacttccattgccctttctctccggacaatccttcttgaagtggcctggattgtgacaaataaaatatttgtactgtgttttattac 44015789  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44015790 caccacccttcgacctagactttgacctgaaattcttgcctttcccatttcctctgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 44015889  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  44015890 atcaaccttcaactctttgaacttagttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataata 44015989  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44015990 tccttgaaattctcaaagaacttaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataa 44016089  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  44016090 tcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccactattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggactt 44016189  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44016190 ggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacaca 44016229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 25352472 - 25351959
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25352472 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 25352373  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352372 tgcctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 25352273  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  25352272 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 25352173  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25352172 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 25352073  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  25352072 ttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 25351973  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  25351972 cacagcagtagtct 25351959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 7070951 - 7070412
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7070951 acggatgaacttccacctccattgtcctttctctccggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgc 7070852  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7070851 catcacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttcccttttcctttgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 7070752  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7070751 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagta 7070652  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7070651 tccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataa 7070552  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||    
T  7070551 tcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacattgcctatgtgccaaagactt 7070452  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    ||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  7070451 ggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacaca 7070412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 25406534 - 25406031
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25406534 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 25406435  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406434 tgcctttcccttttcctctgttgtgacttctcccccttgagatattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 25406335  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  25406334 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 25406235  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25406234 aataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 25406135  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  25406134 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 25406035  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  25406034 caca 25406031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Original strand, 3323848 - 3324351
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3323848 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 3323947  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||  |||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323948 tgcctttcccttttcccttgttgtgacttctcccccttgagatattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 3324047  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3324048 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 3324147  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  3324148 aataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 3324247  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  3324248 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 3324347  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  3324348 caca 3324351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 18412807 - 18412943
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  18412807 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 18412906  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18412907 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 18412943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 21988069 - 21988205
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||  ||||| |||    
T  21988069 ttcaagccttcaccaccttcatccaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacttccttcaaagtagtagtgccct 21988168  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  21988169 ctttaccataaaggatggtatccgtgaaatgctcaaa 21988205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 5818124 - 5817987
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  5818124 ttcaagccttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgtacctcctccaaagtagtggtgccct 5818025  T
Q  789 -ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5818024 ccttttccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 5817987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 16884076 - 16884213
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  16884076 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 16884175  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16884176 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 16884213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 24262261 - 24262124
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  24262261 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 24262162  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  24262161 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 24262124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 12405486 - 12405623
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  12405486 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattttttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 12405585  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  12405586 ccttaccataaatgatggtatccttgaaatgctcaaag 12405623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 21645174 - 21645310
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  21645174 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 21645273  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||  || |||||||| |||| ||||||    
T  21645274 ccttaccataaatgatggtatccttaaaatgctcaaa 21645310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 49090826 - 49090962
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||  |||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  49090826 ttcaagtcttcaccaccttcatcaaccttcaagtcattgaacttggtcaattccttgtttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccct 49090925  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  49090926 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 49090962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 48490380 - 48490293
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48490380 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 48490293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 707 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 9186077 - 9185959
Alignment:
Q  707 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattg 806  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||  ||||| |||| || |||||||| ||      
T  9186077 tcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaccttctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatga 9185978  T
Q  807 tatccttgaaattctcaaa 825  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  9185977 tatccttgaaatgctcaaa 9185959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Original strand, 6593726 - 6593810
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6593726 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 6593810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Original strand, 18391364 - 18391448
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18391364 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 18391448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 729 - 817
Target Start/End: Original strand, 13289735 - 13289823
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 817  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  13289735 acttggtcaactccttggttctcaaagttgtttgaacttcttccaatgtgacagtgccttctttgccatagaacatggtatccatgaaa 13289823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 1048525 - 1048612
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1048525 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 1048612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 6047536 - 6047449
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  6047536 acttggtaaactcgttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatatagaatggtatccttgaa 6047449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 6782885 - 6782944
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaa 67  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6782885 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggctcaaccacgatttctaa 6782944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 7093697 - 7093784
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7093697 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 7093784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 7350887 - 7350974
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7350887 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 7350974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 22135855 - 22135768
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22135855 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 22135768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 753
Target Start/End: Original strand, 23083723 - 23083766
Alignment:
Q  710 tcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaa 753  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083723 tcaaccttcaagttgttgaacttggttaactctttcgttctcaa 23083766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 804
Target Start/End: Original strand, 31157521 - 31157596
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcat 804  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| |||||    
T  31157521 acttggtcaactccttagttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 31157596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 38395036 - 38394949
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  38395036 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 38394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 40550882 - 40550795
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40550882 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 40550795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 47675330 - 47675417
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  47675330 acttggtcaactccctggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccacagagcatggtatccttgaa 47675417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43085597 - 43085536
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  43085597 caatcctcacctcacaagttggttttgtggggttgtgttaagctcaaccacgatttctaaga 43085536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 47710467 - 47710528
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  47710467 caatcctcacctcacaagccagttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 47710528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 47722123 - 47722184
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  47722123 caatcctcacctcacaagccagttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 47722184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Original strand, 22625040 - 22625553
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22625040 ggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 22625139  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22625140 tgcctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 22625239  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22625240 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 22625339  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  22625340 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 22625439  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  22625440 ttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 22625539  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  22625540 cacagcagtagtct 22625553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 510 - 1070
Target Start/End: Original strand, 47881913 - 47882475
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47881913 acggatggattaccactttcattgccttttctctccggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattac 47882012  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttt-tcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47882013 caccacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttctcatttcctctgttttgacttcttccccttgagacattcaagccttctccactatc 47882112  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  47882113 atcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagta 47882212  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47882213 tccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcccacagtaggtgtaaggctttatcatcgtcttccagattaacatctatgttctccaaatcatcaataa 47882312  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  47882313 tcttattgaactccgtctgttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaaggactt 47882412  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacac-acagtagtcttcctggctacctc 1070  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  47882413 ggtcatgtacaatgaatcaagtttatttcacatagacacaacagtagtctcccttgctacctc 47882475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Original strand, 29912980 - 29913519
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29912980 acggatggattaccacctccattgccctttctttccggacaatcctttttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgc 29913079  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29913080 catcacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttcccttttcctctgttttgacttctctcccttgagacattcaagccttctccactatc 29913179  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  29913180 ttcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctatttgccataaagcatagta 29913279  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29913280 tccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacggtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataa 29913379  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  29913380 tcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagactt 29913479  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29913480 ggtcatgtataatgaatcaagtttattcctcatagacaca 29913519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Original strand, 10611838 - 10612341
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10611838 ggacaatctttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttatttccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 10611937  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10611938 tgcctttcccttttcctctgttttgacttcttccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaaatctttgaacttggtcaactcttt 10612037  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10612038 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccgtctttgccatagagcatagtatcctttaaattctcaaaggaccaaggtaaagcacac 10612137  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  10612138 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 10612237  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  10612238 ttgactccaccatttgataaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 10612337  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  10612338 caca 10612341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Original strand, 10204752 - 10205255
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10204752 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 10204851  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | || || |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204852 tgcctttcccttttcctctgttctgacgtcacccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 10204951  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  10204952 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacac 10205051  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  10205052 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 10205151  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  10205152 ttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 10205251  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  10205252 caca 10205255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 6304431 - 6303928
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6304431 ggacaatcctttttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 6304332  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304331 tgcctttcccttttcctttgttgtgacttctcccccttgagatattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 6304232  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6304231 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 6304132  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  6304131 aataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 6304032  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  6304031 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 6303932  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  6303931 caca 6303928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 10898125 - 10897622
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10898125 ggacaatccttcttgaagtgagctggattgtgacaaataaaacatttgtactatgttttattgccatcagccttcgacctagactttgacctggaattct 10898026  T
Q  646 tgctttttcatttcctg-tgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||  || | | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10898025 tgcctttcccttttcttctgctctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactcttt 10897926  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  10897925 ggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 10897826  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||    
T  10897825 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcgattataggtt 10897726  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  10897725 ttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgcctatgggccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 10897626  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  10897625 caca 10897622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 16458585 - 16458073
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16458585 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaatatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 16458486  T
Q  646 tg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    || ||||  | |||||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16458485 tgtctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaact-ttt 16458387  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16458386 ggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 16458287  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||    
T  16458286 agtaggtgtaaggatttatcttcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgctagttgctccattataggtt 16458187  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  16458186 ttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 16458087  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  16458086 cacagcagtagtct 16458073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 554 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 54189621 - 54189127
Alignment:
Q  554 cttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgcttttt 653  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54189621 cttcttgaagtgaccag-attatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttc 54189523  T
Q  654 cattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctca 752  Q
    | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  54189522 ccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctca 54189423  T
Q  753 aagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtg 852  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |||||    
T  54189422 aagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaacaggtg 54189323  T
Q  853 taagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattcc 952  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  54189322 taaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactcc 54189223  T
Q  953 accatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54189222 accattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacaca 54189127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Original strand, 10097867 - 10098359
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10097867 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 10097966  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     | ||       |||||||||||||||    
T  10097967 tgcctttcccttttcctctgttctgacttcacccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaa-----agctg------cttggttaactcttt 10098055  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  10098056 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacac 10098155  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10098156 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaactccgtcaattgctccattataggtt 10098255  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  10098256 ttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 10098355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 16263512 - 16263648
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||  ||    
T  16263512 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgctct 16263611  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16263612 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 16263648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 8516243 - 8516380
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  8516243 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 8516342  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  8516343 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 8516380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 32479489 - 32479626
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  32479489 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 32479588  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  32479589 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 32479626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 28490112 - 28489976
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  28490112 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 28490013  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28490012 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 28489976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 29811844 - 29811757
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29811844 acttggtcaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgtcttatttgccatagagcatggtatccttgaa 29811757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 10210188 - 10210092
Alignment:
Q  717 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10210188 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10210092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 7763246 - 7763159
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7763246 acttggttaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 7763159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 707 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 9602766 - 9602655
Alignment:
Q  707 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattg 806  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||| || |||||||| || |    
T  9602766 tcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatgg 9602667  T
Q  807 tatccttgaaat 818  Q
    ||||||||||||    
T  9602666 tatccttgaaat 9602655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 27421660 - 27421573
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27421660 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttctttcaaagtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 27421573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 3324486 - 3324350
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||  |||| || || ||||||||  | ||| | |    
T  3324486 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaacgcctcttggacctcctccaaagtagtggtgcctt 3324387  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  3324386 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 3324350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Original strand, 4599912 - 4599996
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4599912 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 4599996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Original strand, 9635316 - 9635400
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9635316 acttggtcaactcattggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 9635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 10057220 - 10057136
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10057220 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10057136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 10059442 - 10059358
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10059442 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10059358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 10061664 - 10061580
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10061664 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10061580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 10063886 - 10063802
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10063886 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10063802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 10066108 - 10066024
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10066108 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10066024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 4309746 - 4309833
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4309746 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatggtatctttgaa 4309833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 18098407 - 18098494
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18098407 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 18098494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 680 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 20631075 - 20630996
Alignment:
Q  680 cttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgc 759  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||| |||||||| |||||    
T  20631075 cttgagacactcaagccttcaccactatcatcaaccttcaagtctctcaactcgattaactctttagttctcaatgctgc 20630996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 43227099 - 43227012
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43227099 acttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttctttgccatagagcatggtatctttgaa 43227012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 5192903 - 5192814
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaat 818  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5192903 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaaat 5192814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 810
Target Start/End: Original strand, 23199331 - 23199412
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 810  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  23199331 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 23199412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2806345 - 2806285
Alignment:
Q  9 aatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  2806345 aatcctcacctcacaagccagttttgtggggttttgttaggccccaacacaatttctaaga 2806285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Original strand, 5259515 - 5259599
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5259515 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5259599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 5192672 - 5192585
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5192672 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 5192585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 5898431 - 5898344
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  5898431 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagaatggtatctttgaa 5898344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 6065029 - 6065116
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6065029 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 6065116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 32892065 - 32891978
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||  |||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  32892065 acttggtcaactccttggttctcaaagccggttgaacttcttccaaggtggcagtgccttctttcccatagagcatggtatccttgaa 32891978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 37407664 - 37407577
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  37407664 acttggtcaactccttggttcttaaagccggttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 37407577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 6717488 - 6717406
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcc 811  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  6717488 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcc 6717406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13574980 - 13574922
Alignment:
Q  9 aatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaa 67  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  13574980 aatcctcacctcacaagccagttttgtggggttgtgttaggcccaaccacaatttctaa 13574922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 8018992 - 8019053
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  8018992 caatcctcacctcacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccacaatttctaaga 8019053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 813
Target Start/End: Original strand, 22834212 - 22834285
Alignment:
Q  740 tctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22834212 tctttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 22834285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 34610585 - 34610646
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34610585 caatcctcacctcacaagtcggttttgtggggttgtgttagacccaaccacaatttctaaga 34610646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Original strand, 20053821 - 20054334
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20053821 ggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 20053920  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20053921 tgcctttcccttttcctctattttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 20054020  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  20054021 ggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 20054120  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  20054121 agtaggtgtaaggctttatgctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 20054220  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  20054221 ttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 20054320  T
Q  1045 cac-acagtagtct 1057  Q
    ||| ||||||||||    
T  20054321 cacaacagtagtct 20054334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Original strand, 22716294 - 22716807
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22716294 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaatatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 22716393  T
Q  646 tg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    || ||||  | |||||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22716394 tgtctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaacttttt 22716493  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22716494 ggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 22716593  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  22716594 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 22716693  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  22716694 ttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 22716793  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  22716794 cacagcagtagtct 22716807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 2737325 - 2736822
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2737325 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 2737226  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737225 tgcctttcccttttcctctgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 2737126  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  2737125 ggttctcaaagctgcttaaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacac 2737026  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  2737025 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 2736926  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  2736925 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaaattgcctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 2736826  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  2736825 caca 2736822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 39681166 - 39680663
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39681166 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 39681067  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39681066 tgcctttcccttttcctttgttgtgacttctcccccttgagatattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 39680967  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  39680966 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 39680867  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  39680866 aataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgtcaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 39680767  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  39680766 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggcactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 39680667  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  39680666 caca 39680663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 510 - 1057
Target Start/End: Original strand, 28456527 - 28457077
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |  || | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28456527 acggatgaactaccacttccatttccttccctctcaggacaatcattcttgaagtgacctagattgtgacaaataaaaaatttgtactttgttttattac 28456626  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  28456627 caccacccctcgacctatactttgacctagaattcttgtctttcccatttcctctattttcacttctccccctcgagacattcaagccttcttcactatc 28456726  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |  |||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28456727 atcaaccttcaactcctttaatttggttagctctttggttctcaaaaccacttggacatcctccaaagtgctagtgccctctttgccataaagcattgta 28456826  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtg-taagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaata 907  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28456827 tccttgaaattatcaaaggacctaggtaaaacacacagtagggggtaaggatttatcctcatcttccatatttacatctatgttctccaaatcatcaata 28456926  T
Q  908 atcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggact 1007  Q
    ||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  28456927 atcttattgaactccgtcagttattccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagaattgttgtttcagacattgtctatgtgacaaggact 28457026  T
Q  1008 tggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacac-acagtagtct 1057  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28457027 tggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagaaacaacagtagtct 28457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 527 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 17933260 - 17932982
Alignment:
Q  527 tccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaaccta 626  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | | |||    
T  17933260 tccattgccctttctttccggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgatcta 17933161  T
Q  627 gactttgacctggaattcttgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctt 725  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17933160 gactttgacctggaattcttgcctttcccttttcctctgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctt 17933061  T
Q  726 tgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcat 804  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17933060 tgaacttggtcaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 17932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 923 - 1069
Target Start/End: Original strand, 10941949 - 10942096
Alignment:
Q  923 gtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatgg 1022  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||| ||||  |    
T  10941949 gtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctacgtgccaaagactttgtcatatacaatg 10942048  T
Q  1023 aatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtcttcctggctacct 1069  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  10942049 aatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctacct 10942096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 923 - 1069
Target Start/End: Original strand, 10947818 - 10947965
Alignment:
Q  923 gtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatgg 1022  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||| ||||  |    
T  10947818 gtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctacgtgccaaagactttgtcatatacaatg 10947917  T
Q  1023 aatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtcttcctggctacct 1069  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  10947918 aatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctacct 10947965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 19348426 - 19348563
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  19348426 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 19348525  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19348526 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 19348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 25402799 - 25402935
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  25402799 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttggacctcttccaaagtagtagtgccct 25402898  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  25402899 ccttaccataaaggatggtatccttaaaatgctcaaa 25402935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 10446375 - 10446246
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  | |||||||||||| || ||||||||||| || || ||  |||||||||| ||||| || || | ||||||  | ||| |||    
T  10446375 ttcaagccttcaccacctttatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttgattctcaaagccgcttggacctccttcaaagtagtggtgccct 10446276  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaat 818  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||    
T  10446275 ccttaccataaaggatggtatccttgaaat 10446246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 8424912 - 8424971
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaa 67  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8424912 caatcatcacctcacaaaccagttttgtggggttgtgttaagctcaaccacgatttctaa 8424971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 35217206 - 35217293
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  35217206 acttggtcaaatccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 35217293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 36560377 - 36560464
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  36560377 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 36560464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 10570994 - 10571055
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  10570994 caatcttcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggctcaaccacgatttctaaga 10571055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14466470 - 14466409
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  14466470 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 14466409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 510 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 17481 - 16932
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17481 acggatggattaccacttccattgccctttctctccggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattat 17382  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17381 caccacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttcccttttcctctgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 17282  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  17281 atcaaccttcaaatctttgaacttggtcaattctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtaatagtgccctctttgccatagagcatagta 17182  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17181 tccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcaccaaatcatcaataa 17082  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||    
T  17081 tcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagactt 16982  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtct 1057  Q
    ||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16981 ggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagtct 16932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 28891920 - 28891381
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28891920 acggatgaattaccacctccattgtcctttctctctggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgc 28891821  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||| | | |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  28891820 catcacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttcccttttcctctgttctgatttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 28891721  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  28891720 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgctctctttgccataaagcatagta 28891621  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28891620 tccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatccttgtcttccagattaacatctatgttcgcgaaatcatcaataa 28891521  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  28891520 tcttattgaactccttcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagactt 28891421  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    ||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  28891420 ggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacaca 28891381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Original strand, 16756321 - 16756824
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16756321 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 16756420  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756421 tgcctttcccttttcctttgttgtgacttctcccccttgagatattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 16756520  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16756521 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 16756620  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  16756621 aataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 16756720  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  16756721 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 16756820  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  16756821 caca 16756824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 546 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 28329028 - 28328525
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28329028 ggacaatccttcttaaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 28328929  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28328928 tgcctttcccttttcctttgttgtgacttctcccccttgagatattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 28328829  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  28328828 ggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 28328729  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28328728 aataggtgtaagactttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 28328629  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  28328628 ttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggcactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacataga 28328529  T
Q  1045 caca 1048  Q
    ||||    
T  28328528 caca 28328525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 510 - 1070
Target Start/End: Complemental strand, 33033796 - 33033235
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  33033796 acggatggattaccacttccattgccctttctctccggacaatccttcttgaagtgacttggattgcgacaaataaaacatttgtattgtgttttattgc 33033697  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  ||||||   ||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33033696 caccacccttggacctagactttgacctaaaattcttgcctttcccatttcctttcttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 33033597  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33033596 attaaccttcaactctttgatcttggttaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccttctttgccataaagcattgta 33033497  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33033496 tccttgaaattctcaaataacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcatcttccagatttacatctatgttcgccaaatcatcaataa 33033397  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  33033396 tcttattgaactccgtcagttgctccattataagtttcgactccaccattcggtaaaagta-agttgttgcttcagacattgtctatgtgccaaggactt 33033298  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtcttcctggctacctc 1070  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  33033297 ggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacagtagtagtctcccttgctacctc 33033235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 15945811 - 15945272
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15945811 acggatgaactaccacttccattgccatatctctcaggacaatccttcttgaagtgacctggagtgtgacaaataaaacatgtgtactttgttttatcac 15945712  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||  |||||||| ||||||| |||| || |||| ||| | ||||||| |||||||||| |     |||||||  |||||||||||||||| |||    
T  15945711 caccacccgtcaacctaggctttgacttggattttttgcctttcccatttcctctgttttcactccgt---cttgagagattcaagccttctccactatc 15945615  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15945614 attaaccttcaactccttgaatttggttagctttttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcattgta 15945515  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    | |||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15945514 ttcttgaaattctcaaaggacctaggtaattcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattcacatctatgttctccaaatcatcaataa 15945415  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgatt---ccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatgga 1005  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  15945414 tcttattgaactccgtcagtttctccattataggttttgagtacgccaccattcagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaagga 15945315  T
Q  1006 cttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15945314 cttggtcatgtacgatgaatcatgtttattccacatagacaca 15945272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 719 - 1014
Target Start/End: Original strand, 4819474 - 4819769
Alignment:
Q  719 aactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaat 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4819474 aactctttgaacttggttaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaat 4819573  T
Q  819 tctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaa 918  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4819574 tctcaaaggacctaggtaaagcacacattaggtgtaagtctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaa 4819673  T
Q  919 tttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcat 1014  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||    
T  4819674 ctccgtcatttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcat 4819769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 801 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 21034732 - 21034475
Alignment:
Q  801 gcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatc 900  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21034732 gcatagtatccttgaaattctcaagggacctaggtaaagcacacagtaggtgaaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatc 21034633  T
Q  901 atcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgcc 1000  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21034632 atcaataatcttaatgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagtcattgtctatgtgcc 21034533  T
Q  1001 atggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtct 1057  Q
    |  |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21034532 aaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtct 21034475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 510 - 765
Target Start/End: Original strand, 26269331 - 26269587
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  26269331 acggatggattaccacttccattgcccattctctctggacaatccttcttgaagtgacctagattgtgacaaataaaacatttgtaccaagttttattac 26269430  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  26269431 caccacccttggacctagactttgacctggaattcttgtctttcccatttcctctgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 26269530  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaac 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26269531 atcaaccttcaactctttgaacttgatcaactctttggttctcaaagcttcttgaac 26269587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 510 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 21038586 - 21038408
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21038586 acggatggattaccacctccattgccctttctctccgtacaatccttcttgaagtgacctggattatggcaaataaaacatttgtactatgttttatttc 21038487  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagac 687  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  21038486 catcacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttcccttttcctctgttttgacttctcccccttgagac 21038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 18854101 - 18853965
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  18854101 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 18854002  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  18854001 ccttaccataaaggatggtatccctgaaatgctcaaa 18853965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 10685202 - 10685065
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  10685202 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 10685103  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  10685102 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 10685065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 35744539 - 35744676
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  35744539 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 35744638  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  35744639 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 35744676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 26300487 - 26300623
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||| |||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  26300487 ttcaagccttcactaccttcatcaatcttcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 26300586  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  26300587 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 26300623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 729 - 817
Target Start/End: Original strand, 31577530 - 31577618
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 817  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  31577530 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 31577618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 23800455 - 23800319
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  23800455 ttcaagccttcaccaccttcatcaactttcaagtccttgaacttggtcaatttcttggttctcaaagccgtttggacctcctccaaagtagtggtgccct 23800356  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  23800355 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 23800319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 717 - 813
Target Start/End: Original strand, 41366174 - 41366270
Alignment:
Q  717 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  41366174 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttttttgccatagagcatggtatcctt 41366270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 15069665 - 15069578
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15069665 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 15069578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 729 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 17848624 - 17848536
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 817  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | | || ||||||||||||  |||||||||||    
T  17848624 acttggtttgctccttggttctcaaagcagcttgaacttcttccaaggtgacagtgcctttttagccataaagcatgatatccttgaaa 17848536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 4732633 - 4732546
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4732633 acttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgctatagagcatggtatccttgaa 4732546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 27828083 - 27827996
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27828083 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatatagcatggtatctttgaa 27827996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 34255698 - 34255785
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  34255698 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 34255785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 43080700 - 43080613
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43080700 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 43080613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 816
Target Start/End: Original strand, 28314855 - 28314981
Alignment:
Q  690 tcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctc 789  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||  | || |||||||||||  | || |||||||   ||||||| ||||| |||||||||| | | || ||    
T  28314855 tcaagccttcaccactatcatcaaccttcaagcccttcaacttggttaatgccttagttctcagctctgcttggacttcctccaaagtgacaatatcttc 28314954  T
Q  790 tttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||| ||||  ||||| |||| ||||||    
T  28314955 tttcccattgagcatggtattcttgaa 28314981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3157619 - 3157558
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  3157619 caatcctcacctcacaagccagttttgtggggttgtgttaggctcaaccaccatttataaga 3157558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 5591849 - 5591776
Alignment:
Q  740 tctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5591849 tctttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5591776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11232254 - 11232193
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  11232254 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 11232193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11232489 - 11232428
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  11232489 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 11232428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 15313438 - 15312925
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  15313438 ggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacttggaattct 15313339  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15313338 tgcctttcccttttcctctgttttgatttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaagtctttgaacttggtcaactcttt 15313239  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  15313238 ggttatcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacac 15313139  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  15313138 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtaagttgctccattataggtt 15313039  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||    
T  15313038 ttgactccatcattcgataaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataataaatcaagtttattccacataga 15312939  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  15312938 cacagcagtagtct 15312925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 514 - 1070
Target Start/End: Complemental strand, 16633642 - 16633084
Alignment:
Q  514 atgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtc 613  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||       
T  16633642 atgaactaccacttccattgccctttctctttggacaatctttcttgaagtgacctggattgtgagaaataaaacatttgtactttattttattaccaca 16633543  T
Q  614 accctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatca 712  Q
    ||||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  16633542 acccttcgacctagactttgacatgaaattcttgccatttctatttcctcagttttcacttctcccccttgagacattcaagccttatccactatcatca 16633443  T
Q  713 accttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcct 812  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16633442 accttcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttagacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcattgtattct 16633343  T
Q  813 tgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatctt 912  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16633342 tgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcgtcgtcgtccaaattcaaatctatgttcgccaaatcatcaataatctt 16633243  T
Q  913 attgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtc 1012  Q
    |||||| | | ||| || ||||||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16633242 attgaactccatcagttactccattgtgggttttgactccaccattcggtataagtagagttgttgtttcaaacattgtgtatgtgccaaggacttggtc 16633143  T
Q  1013 atgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtcttcctggctacctc 1070  Q
    |||||||  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  16633142 atgtacaatgaatcaattttatttcacatagacacatcagtagtctcccttgctgcctc 16633084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 510 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 4559362 - 4559067
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4559362 acggatggattaccacttccattgccctttctctctggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtattgtgttttattac 4559263  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4559262 caacacccttcgacctagactttgacatggaattcttgcctttcccatttcctctgttttgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 4559163  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcat 804  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4559162 attaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctcttttccataaagcat 4559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 905 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 4559068 - 4558925
Alignment:
Q  905 ataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatgg 1004  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |     
T  4559068 ataatcttattgaacttcgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtaccaagt 4558969  T
Q  1005 acttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4558968 acttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacaca 4558925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 5147050 - 5147186
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||    
T  5147050 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattgtttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtagtagtgccct 5147149  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5147150 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 5147186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 21549627 - 21549539
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagt 777  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  21549627 ttcaagccttcgccactttcttcaaccttcaaatccttgaacttggttaactccttggttctcaaaggtgcttgaacctcctccaaagt 21549539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 707 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 9225324 - 9225205
Alignment:
Q  707 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattg 806  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||| || |||||||| || |    
T  9225324 tcatcaaccttcatgtcattgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatgg 9225225  T
Q  807 tatccttgaaattctcaaag 826  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9225224 tatccttgaaatgctcaaag 9225205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 5137067 - 5136983
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5137067 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5136983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 7123683 - 7123599
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7123683 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 7123599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 8394393 - 8394309
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8394393 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 8394309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 4588939 - 4588840
Alignment:
Q  717 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  |||| |||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4588939 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcgttcatggtgacagtgtcttatttgcaatagagcatggtatccttgaa 4588840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 812
Target Start/End: Original strand, 5206856 - 5206939
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcct 812  Q
    ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  5206856 acttggtcaacttcttggttcttaaagctgcttggacttcctccaaggtgatagtgtcttcttttccatagaggatggtatcct 5206939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 737 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 5872782 - 5872703
Alignment:
Q  737 aactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  5872782 aactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 5872703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 22781973 - 22782060
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22781973 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 22782060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 804
Target Start/End: Original strand, 38983911 - 38984026
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||| || |||    
T  38983911 ttcaagcctttaccactatcatcaacattcaagtcattggacttgagtaactcattcgttctcaacaccgcttggacctcttccaaggtgataatgccct 38984010  T
Q  789 ctttgccataaagcat 804  Q
     ||| |||||||||||    
T  38984011 atttaccataaagcat 38984026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 52094555 - 52094642
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  52094555 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 52094642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 729 - 810
Target Start/End: Original strand, 12740925 - 12741006
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 810  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  12740925 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 12741006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 729 - 810
Target Start/End: Original strand, 12749131 - 12749212
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 810  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  12749131 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 12749212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 35797037 - 35796976
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||||||    
T  35797037 caatcctcacctcacaaaccagttttgtggggttgtgttaagcccaactaccatttctaaga 35796976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 546 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 9522845 - 9522332
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  9522845 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctagaattct 9522746  T
Q  646 tg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    || ||||  | |||||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522745 tggctttcccttttcctctgttatgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 9522646  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  9522645 ggttcttaaagctgcttgcacttcctccaaagtgatagtgccctttttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaagacctaggtaaagcacac 9522546  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9522545 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaacttcgtcagttgctccattataggtt 9522446  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  9522445 ttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 9522346  T
Q  1045 caca-cagtagtct 1057  Q
    |||| |||||||||    
T  9522345 cacagcagtagtct 9522332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Original strand, 2400249 - 2400788
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2400249 acggatggattaccacttccattgccctttctctccggacagtccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattac 2400348  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2400349 caccacccttcgacctagactttgacctggaattcttgcctttcccatttcctctgttttgatttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 2400448  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  2400449 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttttcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccatctttgccataaagcatagta 2400548  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2400549 tccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcgtcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataa 2400648  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    | |||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  2400649 ttttattgaactctgtcagttgctccattatagattttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagactt 2400748  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
     ||||||||    |||| | |||||||||| |||||||||    
T  2400749 agtcatgtattatgaattaagtttattccatatagacaca 2400788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 545 - 1069
Target Start/End: Complemental strand, 14998153 - 14997632
Alignment:
Q  545 aggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattc 644  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  |||||| | || |||||||||||||| | |||    
T  14998153 aggacaattcttcttgaagtgacctgaagtgtgacaaataaaacatttgt---ttgttttatcaccaccacccttcgacatagactttgacctgaatttc 14998057  T
Q  645 ttg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctt 743  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  14998056 ttgtcttttccatttcctctgttgtcaattctctcccttgagacattcaagccttctccactatcatcaacctttaactccttgaatttggttagctctt 14997957  T
Q  744 tcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcaca 843  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  14997956 tggttctcaaagccgcttagacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcaca 14997857  T
Q  844 cagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggt 943  Q
    || |||||||||| ||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  14997856 caataggtgtaaggctttatcttcatcttccagatttacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggt 14997757  T
Q  944 tttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatag 1043  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||    
T  14997756 tttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtaca--aaatcaagtctattccacatag 14997659  T
Q  1044 acac-acagtagtcttcctggctacct 1069  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  14997658 acacaacagtagtctcccttgctacct 14997632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 41397388 - 41397525
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  41397388 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 41397487  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  41397488 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 41397525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 19359776 - 19359640
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||  ||||| |||    
T  19359776 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaactcctccaaagtagtagtgccct 19359677  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  19359676 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 19359640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 809
Target Start/End: Original strand, 3805367 - 3805447
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtat 809  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3805367 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttctaaggtgacagtgtcttctttgccatagagcatggtat 3805447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 816
Target Start/End: Original strand, 27338357 - 27338456
Alignment:
Q  717 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27338357 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatagagcatggtatctttgaa 27338456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 816
Target Start/End: Original strand, 28222602 - 28222701
Alignment:
Q  717 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  28222602 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcctgaacttcttccaaggtgacagtgccttcttttccatatagcatggtatccttgaa 28222701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 689 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 9024737 - 9024649
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagt 777  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||  ||||  || |||||||||||    
T  9024737 ttcaagccttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttaaacttggtcaattctttggttctcaaagtcgcttagacctcatccaaagt 9024649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 47099756 - 47099620
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||  ||||| || || |||| |||  | ||  |||    
T  47099756 ttcaagccttcaccaccttcttcaaccttcaagtccttgaacttggttaattccttggttctcaaagtcgcttggacctcctccagagtagtggttccct 47099657  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  47099656 ccttaccataaatgatggtatccttgaaatgctcaaa 47099620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 804
Target Start/End: Original strand, 8348307 - 8348382
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcat 804  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||| | | ||||||||| |||||    
T  8348307 acttggttaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataatagtgccttatttgccatagagcat 8348382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 731 - 810
Target Start/End: Original strand, 13126975 - 13127054
Alignment:
Q  731 ttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 810  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||  | ||||||||||| ||||| |||||    
T  13126975 ttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtaccttctttgccatagagcatggtatc 13127054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 16227211 - 16227124
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16227211 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 16227124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 28202936 - 28203022
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28202936 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcatccaaggt-acagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 28203022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 28841465 - 28841378
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28841465 acttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttccttgccatagagcatggtatctttgaa 28841378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 31658179 - 31658092
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31658179 acttggtcaattccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 31658092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 47178405 - 47178318
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  47178405 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaatgtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 47178318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 51751080 - 51750993
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  51751080 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 51750993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 26177167 - 26177229
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaagac 70  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  26177167 caatcctcacctcaaaaaccagttttgtggggttgtgttaggcccaaccacgatttctaagac 26177229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-170; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 510 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 10628515 - 10627976
Alignment:
Q  510 acggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattac 609  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10628515 acggatgaattaccacttccattgcccttcctctcaggacaatccttcttgaagtgatctatgttgtgacaaataaaacatttgtactttgttttatgac 10628416  T
Q  610 cgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  10628415 caccacccttcgacctagactttgacctggaattcttgccttttccatttcctctgttttcacttctccctcttgagacattcaagccttctccactatc 10628316  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10628315 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgtcctctttgccataaaggattgta 10628216  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    |||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  | |||||| |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  10628215 tccttgaaattctcaaatgacataggtaaagcacacagtaggtctaaggctttatcctcgtaatccagatttacatctataatcgccaaatcaacaataa 10628116  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggactt 1008  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  10628115 tcttattgaactccgtcagttgctccattatcggttttgactccaccattcggttaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggactt 10628016  T
Q  1009 ggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca 1048  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10628015 ggtcatgcacaatgaatcaagtttattccacatagacaca 10627976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 546 - 1046
Target Start/End: Complemental strand, 25446607 - 25446106
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25446607 ggacaatccttcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 25446508  T
Q  646 tgctttttcattt-cctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    ||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  25446507 tgcctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaactttaactctttgaacttggttaacttttt 25446408  T
Q  745 cgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacac 844  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  25446407 ggttcttaaagctgtttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacac 25446308  T
Q  845 agtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggtt 944  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25446307 agtaggtgtaaggctttatcctcgtcttctagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggtt 25446208  T
Q  945 ttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacataga 1044  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  25446207 ttgactccacctttcgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttgatcatgtataatgaatcaagtttattccacataga 25446108  T
Q  1045 ca 1046  Q
    ||    
T  25446107 ca 25446106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 511 - 1070
Target Start/End: Original strand, 31781485 - 31782048
Alignment:
Q  511 cggatgaactatcacttccattgccgtttctatgaggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattacc 610  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || || | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31781485 cggatgaactaccactgccattgcccttcctctcatgacaatcattcttgaagtgacctggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaca 31781584  T
Q  611 gtcaccctacaacctagacttt-gacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatc 708  Q
      |||||| |   ||||||||| ||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  31781585 accacccttcggactagacttttgaccatgaattcttacatttcccatttcctctgttttcacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatc 31781684  T
Q  709 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 808  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31781685 atcaaccttcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaccttcctccaaagtgatagtgccctctttgccaaaactctttgta 31781784  T
Q  809 tccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataa 908  Q
    | |||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31781785 ttcttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcatacaacaggtgtaaggctttatcctcgtcttccatatttacatctatgttcgccaaatcatcaataa 31781884  T
Q  909 tcttattgaatttcgtcaattgctccattatagg-ttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggact 1007  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||    
T  31781885 tcttattgaattccgtcagttgcttcattattggtttttgactcgaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgtccaggact 31781984  T
Q  1008 tggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacac-acagtagtcttcctggctacctc 1070  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  31781985 tggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgctacctc 31782048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 583 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 28788805 - 28788401
Alignment:
Q  583 taaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattcttgctttttc-atttcctgtgttttcacttctcttcct 681  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||| ||||||   |||    
T  28788805 taaaacatttgtactctgttttattaccaccatccttcgacctagactttgatctggaatttttgcctttcccatttcctctgttttgacttcttcccct 28788706  T
Q  682 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 781  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28788705 tgagacattcaagccttctccactatcctcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 28788606  T
Q  782 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 881  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  28788605 gtgtcttctttgccataaagcataatatccttgaaattttcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 28788506  T
Q  882 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 981  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||  ||||||||||    
T  28788505 catctatgttcgccaaatcatcaaaaatcttattaaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccgttcgataaaagtatggttgttgttt 28788406  T
Q  982 cagat 986  Q
    |||||    
T  28788405 cagat 28788401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 27448971 - 27449108
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||    
T  27448971 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgtcct 27449070  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  27449071 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 27449108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 31397930 - 31397793
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  31397930 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 31397831  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  31397830 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 31397793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 33790464 - 33790601
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  33790464 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 33790563  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33790564 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 33790601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 37557562 - 37557425
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  37557562 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 37557463  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37557462 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 37557425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 24556523 - 24556387
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||  | ||| |||    
T  24556523 ttcaagccttcaccaacatcatcaacctttaagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgccct 24556424  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24556423 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 24556387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 24597555 - 24597419
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||  | ||| |||    
T  24597555 ttcaagccttcaccaacatcatcaacctttaagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgccct 24597456  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24597455 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 24597419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 717 - 816
Target Start/End: Original strand, 13694322 - 13694421
Alignment:
Q  717 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  13694322 tcaactccttgaacttggttaactcattggtcctcaaagccgcttggacttccttcaaagtgacaatgtcttctttgccatagagcatggcatccttgaa 13694421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 43596270 - 43596407
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||| |||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  43596270 ttcaagccttcactaccttcatcaatcttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 43596369  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43596370 ccttaccataaaggatggtattcttgaaatgctcaaag 43596407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Original strand, 43629064 - 43629201
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||| |||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  43629064 ttcaagccttcactaccttcatcaatcttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 43629163  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43629164 ccttaccataaaggatggtattcttgaaatgctcaaag 43629201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 16408310 - 16408226
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16408310 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16408226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 16545415 - 16545331
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16545415 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16545331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 29721350 - 29721266
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29721350 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 29721266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 40381091 - 40381007
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 813  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40381091 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 40381007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 6746111 - 6746024
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6746111 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 6746024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 31543776 - 31543689
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31543776 acttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 31543689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 689 - 754
Target Start/End: Original strand, 34841764 - 34841830
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaacctt-caactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaa 754  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34841764 ttcaagccttcaccactttcatcaacctttcaaatctttgaacttggttaactccttggttctcaaa 34841830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 729 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 32584831 - 32584715
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaa 828  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||||  | || |||||||||| ||| |||||| ||||   ||||||  |    
T  32584831 acttggttaactctttggttctcaattccgcttggacttcctcaaaggtgatagttccttccttgccataaatcatggtatccatgaaggactcaaaaga 32584732  T
Q  829 tcaaggtaaagcacaca 845  Q
    || ||||||||||||||    
T  32584731 tctaggtaaagcacaca 32584715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 10750741 - 10750654
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10750741 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 10750654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 15356085 - 15356172
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15356085 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 15356172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 20505442 - 20505529
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  20505442 acttggtcaactccttagttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatagagcatagtatctttgaa 20505529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 23666089 - 23666002
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23666089 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23666002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 987 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 28787077 - 28787006
Alignment:
Q  987 attgtttatgtgccatggacttggtcatgtacatggaatcaggtttattccacatagacaca-cagtagtct 1057  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28787077 attgtctatgtgccaaagacttggccatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtct 28787006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1564627 - 1564566
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  1564627 caatcctcacatcacaagacagttttgtggggttgtgttaggctcaaccacgatttctaaga 1564566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 15480583 - 15480644
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  15480583 caatcctcacctcacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccacaatttctaaga 15480644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25258361 - 25258300
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  25258361 caatcctcacctcacaagtcggttttgtggggttgtgttaaactcaaccacgatttctaaga 25258300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25322151 - 25322090
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  25322151 caatcctcacctcacaagtcggttttgtggggttgtgttaaactcaaccacgatttctaaga 25322090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 546 - 756
Target Start/End: Original strand, 50267 - 50478
Alignment:
Q  546 ggacaatccttcttgaagtgacatggattgtgacaaataaaacatttgtactttgttttattaccgtcaccctacaacctagactttgacctggaattct 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50267 ggacaatccttcttgaagtgacctggattatgactaataaaacatttgtactgtgttttattgccatcacccttcgacctagactttgacctggaattct 50366  T
Q  646 tg-ctttttcatttcctgtgttttcacttctcttccttgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 744  Q
    || ||||  | |||||| |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50367 tgcctttcccttttcctctgttctgacttctcccccttgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactcttt 50466  T
Q  745 cgttctcaaagc 756  Q
     |||||||||||    
T  50467 ggttctcaaagc 50478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1792
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  1656 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctctaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccct 1755  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1756 ctttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 1792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 815 - 678
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  815 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaactgggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 716  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  715 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 15247 - 15110
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  15247 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 15148  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15147 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 15110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 51260 - 51321
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51260 caatcctcacctcacaagtcagttttgtggggttgtgttatgctcaatcacaatttctaaga 51321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 149893 - 149756
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  149893 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttagttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 149794  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 826  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  149793 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 45; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 4132 - 3996
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  4132 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 4033  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  4032 ccttaccataaaagatggtatccttgaaatgctcaaa 3996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 45; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 18877 - 18741
Alignment:
Q  689 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 788  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  18877 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattcgttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 18778  T
Q  789 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 825  Q
    | || |||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  18777 ccttaccataaaggatggtatccttaaaatgctcaaa 18741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 115578 - 115491
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  115578 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 115491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 580
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  667 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Original strand, 72753 - 72840
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  72753 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 72840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 732 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 254
Alignment:
Q  732 tggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| | ||   ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  338 tggtcaactctttggttctcaaagttgattgaacttcttccaaggtgacactgcgttctttgccatagagcatggtatccttgaa 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 3869 - 3928
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaa 67  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  3869 caatcctcacctcacaagccagttttgtggggttgtgttaggcacaaccacaatttctaa 3928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4572
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaa 67  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  4513 caatcctcacctcacaagccagttttgtggggttgtgttaggcacaaccacaatttctaa 4572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 23169 - 23082
Alignment:
Q  729 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 816  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23169 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 1940 - 2001
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  1940 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 2175 - 2236
Alignment:
Q  8 caatcctcaccttacaaatcagttttgtggggttttgttatgctcaagcacaatttctaaga 69  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  2175 caatcctcaccttacaagccggttttgtggggttgtgttaggcccaaccaccatttctaaga 2236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University