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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3347_low_1 (Length: 794)

Name: NF3347_low_1
Description: NF3347
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3347_low_1
NF3347_low_1
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (20-789)||(43483164-43483933)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 737; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 737; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 789
Target Start/End: Original strand, 43483164 - 43483933
Alignment:
Q  20 tgtcagaccaaagattttgatccaataactaatttttaacctatgatcctgattattttttgagaggaatatcatccatagattataagcacagttgata 119  Q
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T  43483164 tgtcagaccaaagattttgatccaataactaatttttaacctatgatccagattattttttgagaggaatatcatccatagattataagcacagttgata 43483263  T
Q  120 tgtattatctgatttccaaaaataagcatggcttgaaatctcaatcatggcttaattattttttcaattaatagaatcacaagacaaacagagtcctaaa 219  Q
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T  43483264 tgtattatctgatttccaaaaataagcatggcttgaaatctcaatcatggcttaattattttttcaattaatagaatcataagacaaacagagtcctaaa 43483363  T
Q  220 caggagtttctgtcaagtgaccgaacaggtttgagaagacaaaatccttagtctttggtgaatttagagacaaacattatcactaactaatatgcatgaa 319  Q
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T  43483364 caggagtttctgtcaagtgaccgaacaggtttgagaagacaaaatccttagtctttggtgaatttagagacaaacattatcactaactaatatgcatgga 43483463  T
Q  320 acagttagggaacaatattatatcaatatattagattaataggaagcagataatgatgataggaaaactaagatggctcaaatacacgtatatatacatt 419  Q
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T  43483464 acagttagggaacaatattatatcaatatattagattaataggaagcagataatgatgataggaaaactaagatggctcaaatacacgtatatatacatt 43483563  T
Q  420 ataggttgacattaattcatatatagcgatcatataannnnnnnattatcatttcagaaaaatataaatggcaatcgatttcaaaccagacaaaaatgat 519  Q
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T  43483564 ataggttgacattaattcatatatagcgatcatataatttttttattatcatttcagaaaaatataaatggcaatcgatttcaaaccagacaaaaatgat 43483663  T
Q  520 gttgaccctgcatggaccattagggtcatatacaatttaccaccatgatctattaatatacggacccaataattcatgacagttaacttaggtagctaga 619  Q
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T  43483664 gttgaccctgcatggaccattagggtcatatacaatttaccaccatgatctattaatatacggacccaataattcatgacagttaacttaggtagctaga 43483763  T
Q  620 aactgccaaaatgtgtctatatataggacctaaattaacatatccatatggtatattcagaaaaagagcaaatcatatactacacaagtctaaattgctt 719  Q
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T  43483764 aactgccaaaatgtgtctatatataggacctaaattaacatatccatatggtatattcagaaaaagagcaaatcatatactacacaagtctaaattgctt 43483863  T
Q  720 ttaacttttaagatggttgcttcacaaaacaaacgcattctacaagtgatttttgttctcctttgcttct 789  Q
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T  43483864 ttaacttttaagatggttgcttcacaaaacaaacgcattctacaagtgatttttgttctcctttgcttct 43483933  T

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