View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3358_low_1 (Length: 356)
Name: NF3358_low_1
Description: NF3358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3358_low_1 |
 | |
|
| [»] scaffold0002 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6191989 - 6191663
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6191989 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
6191891 |
T |
|
| Q |
124 |
atgcnnnnnnnnnn-gttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatac |
222 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6191890 |
atgcaaaaaaaaaaagttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatac |
6191791 |
T |
|
| Q |
223 |
aatatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttca |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6191790 |
aatatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatgaaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttca |
6191691 |
T |
|
| Q |
323 |
gctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6191690 |
gctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
6191663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Original strand, 21872931 - 21873257
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21872931 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaattaagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataattttt |
21873029 |
T |
|
| Q |
124 |
atgcnnnnnnnnnngttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaataca |
223 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21873030 |
atgcaaaaaaaaa-gttatattatataattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaataca |
21873128 |
T |
|
| Q |
224 |
atatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaat--nnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21873129 |
atatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaataaaaaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttc |
21873228 |
T |
|
| Q |
322 |
agctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21873229 |
agctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
21873257 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Original strand, 483597 - 483922
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
483597 |
ggtgtaaatatttctcttaaatggcttatcaaataagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
483695 |
T |
|
| Q |
124 |
atgcnnnnnnnnnngttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaataca |
223 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
483696 |
atgcaaaaaaaaaagttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatatttcaatctataaaagagggatatgaataca |
483795 |
T |
|
| Q |
224 |
atatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcag |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
483796 |
atatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaataaaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcag |
483895 |
T |
|
| Q |
324 |
ctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
483896 |
ctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
483922 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 477077 - 477131
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctcttta |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
477077 |
ggtgtaaatatttctcttaaatggcttatcaaataagcttgacacctgctcttta |
477131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Original strand, 78139 - 78463
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78139 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
78237 |
T |
|
| Q |
124 |
atgcnnnnnnnnnngttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaataca |
223 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78238 |
atgcaaaaaaaaaa-ttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaataca |
78336 |
T |
|
| Q |
224 |
atatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcag |
323 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78337 |
atatagctaaaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaataaaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcag |
78436 |
T |
|
| Q |
324 |
ctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78437 |
ctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
78463 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Original strand, 7688168 - 7688495
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7688168 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
7688266 |
T |
|
| Q |
124 |
atgcnnnnnnnnnng---ttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaat |
220 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7688267 |
atgcaaaaaaagaagaagttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaat |
7688366 |
T |
|
| Q |
221 |
acaatatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagctt |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7688367 |
acaatatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaat-aaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagctt |
7688465 |
T |
|
| Q |
321 |
cagctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7688466 |
cagctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
7688495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16435364 - 16435038
Alignment:
| Q |
24 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttta |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435364 |
ggtgtaaatatttctattaaatggcttatcaattaagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttgt |
16435266 |
T |
|
| Q |
124 |
atgcnnnnnnnnnn-gttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatac |
222 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435265 |
atgcaaaaaaaaaaagttatattatataattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatac |
16435166 |
T |
|
| Q |
223 |
aatatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttca |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435165 |
aatatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaataaaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttca |
16435066 |
T |
|
| Q |
323 |
gctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435065 |
gctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
16435038 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 33259910 - 33260234
Alignment:
| Q |
28 |
taaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataattttaatgc |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33259910 |
taaatatttctattaaatggcttatcaattaagcttgacacctgctctttattttttttt-agtaacaaaatgaaaacaaattatggataatttttatgc |
33260008 |
T |
|
| Q |
128 |
nnnnnnnnnn-gttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatacaata |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33260009 |
aaaaaaaaaaagttatattatataattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatacaata |
33260108 |
T |
|
| Q |
227 |
tagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaat--nnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcagc |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33260109 |
tagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaataaaaaaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcagc |
33260208 |
T |
|
| Q |
325 |
tgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33260209 |
tgcaaaaagcatctcatttcatctca |
33260234 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 2947199 - 2947525
Alignment:
| Q |
28 |
taaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataattttaatgc |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2947199 |
taaatatttcttttaaatggcttatcaaataagcttga-acatgctctttattttttttttagtaacaaaatggaaacaaattatggataattttaatgc |
2947297 |
T |
|
| Q |
128 |
nnnnnnnnnn----gttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaataca |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2947298 |
aaaaaaaaaaaacagttatattatctaattggatattacataatcaatcctctatttcctacgccaatattccaatctataaaagaggcatatgaataca |
2947397 |
T |
|
| Q |
224 |
atatagctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaa-tnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttca |
322 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2947398 |
atatagttagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaacaaacaaaaaaatccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaggcttca |
2947497 |
T |
|
| Q |
323 |
gctgcaaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2947498 |
gctacaaaaagcatctcatttcatctca |
2947525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 9008786 - 9009103
Alignment:
| Q |
28 |
taaatatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctctttannnnnnnnnnagtaacaaaatgaaaacaaattatggataattttaatgc |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9008786 |
taaatatttgttttaaatggcttatcaaataagcttgacacatgctcttt---tcttttatattaataaaatgaaaacaaattatgaataattttaatgc |
9008882 |
T |
|
| Q |
128 |
nnnnnnnnnngttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctataaaagagggatatgaatacaatat |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9008883 |
caaaaaaaa-gttatattatctaattggatattacataatcaatcctcaattttccatgtcaatattctaatctataaaagagtcatatgaatacaatat |
9008981 |
T |
|
| Q |
228 |
agctagaaataatccaataaaacaactttaggcagaaatttcaaatnnnnnnnnnntccacagcaaaatcatcattgtaaatatgctaagcttcagctgc |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9008982 |
agctaggaatattccaataaaacaactttaggcagaaatttgaaa-caaaaaaaaatccacagcagaatcatcattgtaaatatgctaagcttcaactgc |
9009080 |
T |
|
| Q |
328 |
aaaaagcatctcatttcatctca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9009081 |
aaaaagcatctcatctcatctca |
9009103 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33818483 - 33818375
Alignment:
| Q |
95 |
aaaatgaaaacaaattatggataattttaatgcnnnnnnnnnngttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatatt |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
33818483 |
aaaatgaaaacaaat-atggataattttaatgccaaaaaagaagttatattatctaatttgatattacataatcaatcctcaacttttcacatcaatatt |
33818385 |
T |
|
| Q |
195 |
ccaatctata |
204 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
33818384 |
ccaatatata |
33818375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25034733 - 25034605
Alignment:
| Q |
138 |
gttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccacgccaatattccaatctata--aaagagggatatgaatacaatatagctagaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25034733 |
gttatattatctaatttgacattacataatcaatcctctgctttccacatcaatattcaaatatatataaaaaaggcatatgaatacaatatagctagga |
25034634 |
T |
|
| Q |
236 |
ataatccaataaaacaactttaggcagaa |
264 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
25034633 |
atgttccaataaaacatctttgggcagaa |
25034605 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4877073 - 4877026
Alignment:
| Q |
31 |
atatttctattaaatggcttatcaaataaggttgacacctgctcttta |
78 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4877073 |
atatttcttttaaatggcttatcaaataagcttgacacgtgctcttta |
4877026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Original strand, 25028011 - 25028057
Alignment:
| Q |
138 |
gttatattatctaattggatattacataatcaatcctctattttccac |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25028011 |
gttatattat-taatttgatattacataatcaatcctcaattttccac |
25028057 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11899491 - 11899417
Alignment:
| Q |
95 |
aaaatgaaaacaaattatggataattttaatgcnnnnnnnnnngttatattatctaattggatattacataatcaa |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11899491 |
aaaatgaaaacaaat-atggataattttcatgccaaaaaggaagttatattatctaatttgatattacataatcaa |
11899417 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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