View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3359_low_7 (Length: 250)

Name: NF3359_low_7
Description: NF3359
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3359_low_7
NF3359_low_7
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (11-224)||(14422697-14422910)
chr8 (11-215)||(144397-144601)
chr8 (11-219)||(18594536-18594744)
chr8 (11-219)||(24113166-24113374)
chr8 (11-219)||(33278399-33278607)
chr8 (11-219)||(39206585-39206793)
chr8 (13-214)||(2042526-2042727)
chr8 (11-220)||(29938059-29938268)
chr8 (11-219)||(6144273-6144481)
chr8 (12-219)||(39218776-39218983)
chr8 (11-216)||(13110406-13110611)
chr8 (11-219)||(10836755-10836963)
chr8 (11-213)||(34679457-34679659)
chr8 (11-220)||(35118031-35118240)
chr8 (12-221)||(41575510-41575719)
chr8 (11-219)||(22260630-22260838)
chr8 (11-218)||(34842365-34842572)
chr8 (12-224)||(44804945-44805157)
chr8 (15-222)||(38167159-38167366)
chr8 (12-225)||(4035840-4036053)
chr8 (11-219)||(7774763-7774971)
chr8 (11-217)||(7791412-7791618)
chr8 (11-216)||(34998896-34999101)
chr8 (11-223)||(8021714-8021918)
chr8 (11-220)||(5320562-5320771)
chr8 (11-219)||(7811994-7812202)
chr8 (14-219)||(33287040-33287233)
chr8 (11-219)||(36491156-36491364)
chr8 (11-214)||(42571598-42571798)
chr8 (14-216)||(28639280-28639484)
chr8 (62-219)||(40117903-40118060)
chr8 (12-215)||(66180-66384)
chr8 (79-219)||(26783801-26783941)
chr8 (14-139)||(9807339-9807464)
chr8 (74-219)||(2322075-2322220)
chr8 (131-216)||(9806875-9806960)
chr8 (90-213)||(5005171-5005294)
chr8 (74-216)||(39220258-39220400)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (11-216)||(16069356-16069561)
chr5 (14-250)||(1165604-1165840)
chr5 (14-219)||(1579036-1579241)
chr5 (14-219)||(1605574-1605779)
chr5 (11-224)||(9008057-9008270)
chr5 (11-219)||(27679169-27679377)
chr5 (11-215)||(31883148-31883352)
chr5 (11-219)||(33491196-33491404)
chr5 (15-219)||(27420858-27421062)
chr5 (11-213)||(3386486-3386688)
chr5 (12-222)||(5202969-5203179)
chr5 (11-219)||(8374339-8374546)
chr5 (11-215)||(24105671-24105875)
chr5 (11-214)||(16737447-16737650)
chr5 (11-225)||(35782644-35782858)
chr5 (11-216)||(3921584-3921789)
chr5 (11-219)||(4120937-4121145)
chr5 (11-219)||(19358526-19358734)
chr5 (11-219)||(33991140-33991348)
chr5 (11-219)||(38598450-38598658)
chr5 (11-219)||(20992146-20992354)
chr5 (14-220)||(31410475-31410681)
chr5 (11-182)||(26602942-26603113)
chr5 (11-174)||(27025001-27025164)
chr5 (84-224)||(20992354-20992498)
chr5 (78-211)||(33284642-33284775)
chr5 (11-68)||(35420424-35420481)
chr5 (83-207)||(31638157-31638281)
chr5 (18-49)||(27024822-27024853)
chr5 (187-220)||(26603108-26603141)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (11-222)||(38055151-38055362)
chr4 (11-219)||(45424522-45424730)
chr4 (11-219)||(54189542-54189750)
chr4 (11-221)||(19913618-19913828)
chr4 (11-219)||(53717452-53717660)
chr4 (20-219)||(50055098-50055297)
chr4 (11-217)||(1756752-1756958)
chr4 (12-226)||(20877037-20877251)
chr4 (13-219)||(23776449-23776655)
chr4 (11-224)||(31969673-31969886)
chr4 (11-216)||(35490761-35490966)
chr4 (11-219)||(15241016-15241224)
chr4 (11-219)||(28032700-28032908)
chr4 (11-219)||(44784905-44785113)
chr4 (11-218)||(11639566-11639773)
chr4 (11-218)||(40428708-40428915)
chr4 (11-217)||(54412627-54412833)
chr4 (11-219)||(6688615-6688817)
chr4 (11-219)||(2481396-2481604)
chr4 (11-219)||(27488636-27488844)
chr4 (11-219)||(37464718-37464926)
chr4 (13-219)||(48909843-48910049)
chr4 (11-216)||(1617084-1617289)
chr4 (11-219)||(6611348-6611556)
chr4 (11-219)||(44379175-44379383)
chr4 (11-218)||(47632032-47632240)
chr4 (11-219)||(50353798-50354006)
chr4 (14-219)||(23704200-23704405)
chr4 (11-219)||(14987789-14987997)
chr4 (11-215)||(16700782-16700986)
chr4 (11-215)||(53875658-53875862)
chr4 (10-231)||(8932165-8932386)
chr4 (11-212)||(27583620-27583821)
chr4 (14-215)||(43289951-43290152)
chr4 (11-219)||(27536092-27536296)
chr4 (14-216)||(30423556-30423757)
chr4 (12-218)||(37968746-37968952)
chr4 (11-215)||(19164961-19165164)
chr4 (11-220)||(33703837-33704046)
chr4 (11-219)||(15669180-15669388)
chr4 (14-222)||(52139197-52139405)
chr4 (11-221)||(8591080-8591290)
chr4 (11-212)||(40680026-40680227)
chr4 (12-219)||(53353052-53353267)
chr4 (11-215)||(30171581-30171785)
chr4 (11-219)||(55344813-55345021)
chr4 (11-207)||(38071314-38071504)
chr4 (45-213)||(28360433-28360602)
chr4 (20-217)||(44375844-44376041)
chr4 (14-219)||(16703822-16704023)
chr4 (11-139)||(23269034-23269162)
chr4 (72-219)||(50053440-50053587)
chr4 (11-98)||(53408137-53408225)
chr4 (131-216)||(23265865-23265950)
chr4 (11-74)||(23261874-23261937)
chr4 (74-219)||(44548192-44548338)
chr4 (74-150)||(51780769-51780845)
chr4 (11-114)||(9595890-9595982)
chr4 (11-60)||(50055301-50055350)
chr4 (11-77)||(48748197-48748263)
chr4 (163-219)||(9595975-9596030)
chr4 (11-45)||(55344681-55344715)
chr4 (72-125)||(55344724-55344777)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (11-219)||(25897371-25897579)
chr1 (11-219)||(33510481-33510689)
chr1 (11-217)||(26663257-26663463)
chr1 (11-219)||(29288146-29288352)
chr1 (11-219)||(39260346-39260554)
chr1 (11-224)||(20089463-20089676)
chr1 (12-213)||(29078519-29078720)
chr1 (11-220)||(42370795-42371004)
chr1 (11-220)||(970524-970735)
chr1 (11-219)||(1168500-1168708)
chr1 (11-219)||(52753147-52753355)
chr1 (12-219)||(16052093-16052300)
chr1 (11-213)||(38829072-38829274)
chr1 (11-219)||(26580270-26580478)
chr1 (11-219)||(41928495-41928703)
chr1 (11-219)||(52696788-52696996)
chr1 (11-224)||(12682812-12683025)
chr1 (11-216)||(19715161-19715366)
chr1 (11-219)||(1940747-1940955)
chr1 (12-216)||(8079710-8079914)
chr1 (11-215)||(8120870-8121074)
chr1 (12-216)||(46760966-46761170)
chr1 (11-222)||(15203106-15203317)
chr1 (11-217)||(5215384-5215590)
chr1 (11-216)||(7145207-7145412)
chr1 (14-219)||(1170447-1170652)
chr1 (11-219)||(2347653-2347862)
chr1 (11-219)||(32671576-32671784)
chr1 (11-215)||(46409436-46409642)
chr1 (11-219)||(17591688-17591893)
chr1 (11-215)||(43905655-43905859)
chr1 (11-219)||(13996723-13996931)
chr1 (11-219)||(40092488-40092696)
chr1 (16-217)||(6765458-6765659)
chr1 (11-220)||(51359217-51359425)
chr1 (14-214)||(15717787-15717986)
chr1 (11-222)||(23498454-23498665)
chr1 (11-200)||(17587505-17587694)
chr1 (11-215)||(49146173-49146377)
chr1 (11-182)||(40149497-40149668)
chr1 (14-216)||(2473722-2473924)
chr1 (11-219)||(15554152-15554352)
chr1 (50-218)||(29695673-29695842)
chr1 (12-215)||(38171833-38172023)
chr1 (74-202)||(23322903-23323031)
chr1 (87-219)||(52086264-52086396)
chr1 (145-224)||(5675097-5675176)
chr1 (82-219)||(5217855-5217991)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (16-219)||(22956-23159)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (11-218)||(20346487-20346694)
chr7 (11-219)||(43067963-43068171)
chr7 (11-224)||(22649684-22649897)
chr7 (11-224)||(33359080-33359293)
chr7 (11-219)||(24792322-24792530)
chr7 (11-219)||(30181014-30181222)
chr7 (11-224)||(42204147-42204361)
chr7 (11-216)||(5280861-5281066)
chr7 (11-219)||(6394749-6394957)
chr7 (11-219)||(12101168-12101376)
chr7 (11-219)||(42964986-42965194)
chr7 (13-216)||(3511324-3511527)
chr7 (11-216)||(9452591-9452796)
chr7 (11-214)||(1803029-1803232)
chr7 (12-219)||(36890821-36891027)
chr7 (11-217)||(7164184-7164390)
chr7 (11-224)||(12097580-12097793)
chr7 (11-224)||(15655905-15656118)
chr7 (11-219)||(933283-933491)
chr7 (11-220)||(25748484-25748693)
chr7 (11-215)||(4477311-4477515)
chr7 (11-215)||(42673467-42673667)
chr7 (11-219)||(33846519-33846722)
chr7 (11-214)||(38866547-38866750)
chr7 (11-224)||(4347266-4347478)
chr7 (11-219)||(32041540-32041748)
chr7 (11-218)||(8630665-8630872)
chr7 (13-212)||(43156718-43156917)
chr7 (11-217)||(46134294-46134500)
chr7 (11-216)||(46891329-46891535)
chr7 (11-222)||(17753595-17753806)
chr7 (13-182)||(48865665-48865837)
chr7 (11-182)||(16894497-16894668)
chr7 (72-219)||(19828268-19828415)
chr7 (11-219)||(43021570-43021774)
chr7 (122-219)||(37704978-37705075)
chr7 (82-225)||(43405012-43405155)
chr7 (74-224)||(37005864-37006014)
chr7 (74-221)||(36849590-36849737)
chr7 (74-219)||(15655465-15655610)
chr7 (82-222)||(30075292-30075429)
chr7 (83-212)||(20163824-20163953)
chr7 (123-201)||(27691428-27691506)
chr7 (187-224)||(16894663-16894700)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (11-224)||(26946876-26947089)
chr6 (11-219)||(3347523-3347731)
chr6 (11-219)||(2837544-2837752)
chr6 (11-219)||(6086599-6086807)
chr6 (18-219)||(16307015-16307216)
chr6 (11-224)||(30691845-30692058)
chr6 (11-219)||(21893454-21893662)
chr6 (11-219)||(26704339-26704547)
chr6 (11-219)||(18613537-18613745)
chr6 (11-226)||(9459555-9459770)
chr6 (11-216)||(17261073-17261278)
chr6 (11-215)||(34887292-34887496)
chr6 (11-222)||(20726787-20726994)
chr6 (11-219)||(11167239-11167447)
chr6 (11-216)||(28199508-28199714)
chr6 (11-222)||(3955769-3955977)
chr6 (11-208)||(1153603-1153800)
chr6 (12-219)||(35198283-35198489)
chr6 (16-214)||(30698934-30699132)
chr6 (11-148)||(33464399-33464536)
chr6 (55-219)||(52835-52999)
chr6 (11-125)||(53001-53115)
chr6 (140-216)||(33463703-33463779)
chr6 (83-211)||(12835055-12835183)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (11-224)||(25999377-25999590)
chr3 (11-219)||(37698129-37698337)
chr3 (11-224)||(8042596-8042809)
chr3 (11-219)||(22174976-22175184)
chr3 (11-222)||(25494271-25494482)
chr3 (12-219)||(42307892-42308099)
chr3 (11-224)||(15520128-15520341)
chr3 (11-219)||(50528923-50529131)
chr3 (11-222)||(38856084-38856295)
chr3 (12-219)||(46452149-46452356)
chr3 (11-213)||(21581042-21581244)
chr3 (11-224)||(12117644-12117857)
chr3 (11-219)||(20842334-20842542)
chr3 (16-216)||(32244117-32244317)
chr3 (12-219)||(24835686-24835893)
chr3 (11-219)||(29445482-29445690)
chr3 (12-219)||(15520630-15520837)
chr3 (12-218)||(20699144-20699350)
chr3 (11-209)||(42104957-42105155)
chr3 (11-219)||(38933940-38934147)
chr3 (11-219)||(35226441-35226649)
chr3 (11-219)||(54534314-54534520)
chr3 (11-219)||(54870160-54870368)
chr3 (11-213)||(44609319-44609521)
chr3 (11-216)||(32359256-32359461)
chr3 (11-219)||(2895179-2895391)
chr3 (12-220)||(26122807-26123015)
chr3 (11-219)||(53028219-53028419)
chr3 (12-192)||(44688782-44688961)
chr3 (11-213)||(48924989-48925189)
chr3 (11-219)||(34700335-34700543)
chr3 (11-180)||(16354379-16354548)
chr3 (61-218)||(35643212-35643369)
chr3 (79-213)||(50529827-50529961)
chr3 (14-190)||(12915930-12916105)
chr3 (12-99)||(24366143-24366230)
chr3 (85-224)||(49128038-49128177)
chr3 (11-92)||(13696914-13696995)
chr3 (163-219)||(24366086-24366142)
chr3 (11-59)||(50528868-50528916)
chr3 (186-216)||(40240485-40240515)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (11-219)||(10235-10443)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (11-222)||(3873244-3873455)
chr2 (11-222)||(31517215-31517426)
chr2 (11-219)||(18806884-18807092)
chr2 (11-219)||(33906047-33906255)
chr2 (11-219)||(26323186-26323394)
chr2 (11-216)||(850997-851202)
chr2 (11-215)||(42937720-42937925)
chr2 (11-219)||(6174828-6175036)
chr2 (11-219)||(30270679-30270887)
chr2 (12-219)||(39635449-39635656)
chr2 (11-216)||(28329839-28330042)
chr2 (11-216)||(4016039-4016244)
chr2 (31-219)||(1108277-1108464)
chr2 (11-219)||(2178769-2178977)
chr2 (11-219)||(4232142-4232350)
chr2 (16-224)||(19901143-19901350)
chr2 (14-203)||(19383938-19384127)
chr2 (11-215)||(1482903-1483106)
chr2 (11-219)||(5733396-5733604)
chr2 (19-212)||(16066302-16066495)
chr2 (11-215)||(16588776-16588980)
chr2 (13-217)||(30420181-30420373)
chr2 (15-220)||(429812-430017)
chr2 (11-218)||(44947549-44947749)
chr2 (84-219)||(42446642-42446777)
chr2 (74-180)||(22101210-22101316)
chr2 (76-215)||(3585291-3585430)
chr2 (83-223)||(12517256-12517395)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (11-219)||(36702-36910)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (11-218)||(3708-3915)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (12-216)||(145246-145450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (11-219)||(6-214)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-216)||(6-212)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (11-217)||(295-501)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14422910 - 14422697
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14422910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 14422811  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  14422810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatcca 14422711  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||||||||    
T  14422710 aacggggccataat 14422697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 144601 - 144397
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144601 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 144502  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  144501 atgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatcca 144402  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  144401 aacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18594744 - 18594536
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18594744 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18594645  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18594644 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 18594545  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  18594544 aacggggcc 18594536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 24113166 - 24113374
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24113166 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24113265  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24113266 atgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 24113365  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  24113366 aacggggcc 24113374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33278607 - 33278399
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33278607 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33278508  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||    
T  33278507 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatcca 33278408  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  33278407 aacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39206793 - 39206585
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39206793 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 39206694  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39206693 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 39206594  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  39206593 aacggggcc 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 2042526 - 2042727
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2042526 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 2042625  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2042626 gaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 2042725  T
Q  213 cg 214  Q
    ||    
T  2042726 cg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29938268 - 29938059
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29938268 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29938169  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29938168 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 29938069  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    ||||||||||    
T  29938068 aacggggcca 29938059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 6144273 - 6144481
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6144273 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagctt 6144372  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6144373 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatcca 6144472  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  6144473 aacggggcc 6144481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39218983 - 39218776
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  39218983 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 39218884  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39218883 tgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39218784  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  39218783 acggggcc 39218776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13110611 - 13110406
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13110611 cagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13110512  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13110511 attaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 13110412  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  13110411 aacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 10836755 - 10836963
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10836755 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 10836854  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10836855 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 10836954  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||| ||||    
T  10836955 aacgaggcc 10836963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 34679457 - 34679659
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34679457 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 34679556  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  34679557 atgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 34679656  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  34679657 aac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 35118031 - 35118240
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35118031 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 35118130  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35118131 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 35118230  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    ||||||||||    
T  35118231 aacggggcca 35118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41575719 - 41575510
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  41575719 agagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 41575620  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41575619 tgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaa 41575520  T
Q  212 acggggccat 221  Q
    |||| |||||    
T  41575519 acggagccat 41575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 22260630 - 22260838
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22260630 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22260729  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  22260730 atgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 22260829  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  22260830 aacggggcc 22260838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 34842365 - 34842572
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34842365 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 34842464  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34842465 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 34842564  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    ||||||||    
T  34842565 aacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 44804945 - 44805157
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  44804945 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 44805044  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  44805045 tgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaa 44805144  T
Q  212 acggggccataat 224  Q
    | | |||||||||    
T  44805145 atgaggccataat 44805157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167366
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  115 aactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||     
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaaca 38167358  T
Q  215 gggccata 222  Q
    ||||||||    
T  38167359 gggccata 38167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4036053 - 4035840
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4036053 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 4035954  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||    
T  4035953 tgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaa 4035854  T
Q  212 acggggccataatt 225  Q
    |||||||| |||||    
T  4035853 acggggccttaatt 4035840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7774971 - 7774763
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  7774971 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagctt 7774872  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  7774871 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatcta 7774772  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||| ||||    
T  7774771 aacgaggcc 7774763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7791618 - 7791412
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  7791618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7791519  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  7791518 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcca 7791419  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  7791418 aacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 34998896 - 34999101
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34998896 cagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 34998995  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||    
T  34998996 atgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatcca 34999095  T
Q  211 aacggg 216  Q
     |||||    
T  34999096 tacggg 34999101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8021918 - 8021714
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8021918 cagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 8021827  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  8021826 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 8021727  T
Q  211 aacggggccataa 223  Q
    |||||| ||||||    
T  8021726 aacgggaccataa 8021714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5320771 - 5320562
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |    
T  5320771 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaactt 5320672  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  5320671 atgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 5320572  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    ||||||||||    
T  5320571 aacggggcca 5320562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7812202 - 7811994
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  7812202 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7812103  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  7812102 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaa 7812003  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  7812002 aacggggcc 7811994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287233
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcta------------gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33287127  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287128 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 33287227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36491364 - 36491156
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  36491364 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagtt 36491265  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36491264 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatcca 36491165  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    || ||||||    
T  36491164 aatggggcc 36491156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42571798 - 42571598
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |    
T  42571798 cagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagctt 42571701  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  42571700 atgaaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 42571602  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  42571601 aacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28639484 - 28639280
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28639484 agagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 28639387  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggct----tatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||    |||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |    
T  28639386 aaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattc 28639287  T
Q  210 aaacggg 216  Q
    |||||||    
T  28639286 aaacggg 28639280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 219
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118060
Alignment:
Q  62 gagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaa 161  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  162 ggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 40118060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66384
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgga-gggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatcta 66379  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  66380 aacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 219
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783941
Alignment:
Q  79 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  179 aagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 26783941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9807464 - 9807339
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9807464 agagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9807365  T
Q  114 aaactatgataaactatttttattta 139  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  9807364 aagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 219
Target Start/End: Original strand, 2322075 - 2322220
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||    
T  2322075 aaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgttag 2322174  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||||||  | | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2322175 tagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcc 2322220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  131 ttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  90 aaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacata 189  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| | ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  190 agctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||| || ||||| ||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39220400 - 39220258
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    |||||||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| |   |||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| | ||||   |    
T  39220400 aaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacatatggatg 39220301  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 216  Q
    ||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39220300 tagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16069561 - 16069356
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16069561 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16069462  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069461 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 16069362  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  16069361 aacggg 16069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 1165604 - 1165840
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  1165604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 1165703  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1165704 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaag 1165803  T
Q  214 ggggccataatttcattatttaattttgtttgttatt 250  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165804 agggtcataatttcattatttaattttgtttgttatt 1165840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579036
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1579042  T
Q  214 ggggcc 219  Q
    ||||||    
T  1579041 ggggcc 1579036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605779
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1605773  T
Q  214 ggggcc 219  Q
    ||||||    
T  1605774 ggggcc 1605779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 9008057 - 9008270
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9008057 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9008156  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9008157 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 9008256  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  9008257 aacggggccttaat 9008270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 27679169 - 27679377
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27679169 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 27679268  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27679269 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 27679368  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  27679369 aacggggcc 27679377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31883352 - 31883148
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31883352 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 31883253  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31883252 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatcca 31883153  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  31883152 aacgg 31883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 33491196 - 33491404
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  33491196 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagctt 33491295  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  33491296 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 33491395  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  33491396 aacggggcc 33491404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27421062 - 27420858
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27421062 gagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 27420963  T
Q  115 aactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27420962 aactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 27420863  T
Q  215 gggcc 219  Q
    |||||    
T  27420862 gggcc 27420858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 3386486 - 3386688
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3386486 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3386585  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  3386586 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 3386685  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  3386686 aac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5203179 - 5202969
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  5203179 agagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 5203080  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5203079 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaa 5202980  T
Q  212 acggggccata 222  Q
    |||||||||||    
T  5202979 acggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 8374339 - 8374546
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8374339 cagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8374437  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  8374438 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatcca 8374537  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  8374538 aacggggcc 8374546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 24105671 - 24105875
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24105671 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24105770  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24105771 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 24105870  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  24105871 aacgg 24105875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 16737447 - 16737650
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16737447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16737546  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||    
T  16737547 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattca 16737646  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  16737647 aacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 35782644 - 35782858
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcc 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35782644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagct 35782742  T
Q  110 tatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  35782743 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatcc 35782842  T
Q  210 aaacggggccataatt 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  35782843 aaacggggccttaatt 35782858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3921789 - 3921584
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3921789 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3921690  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  3921689 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatcca 3921590  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  3921589 aacggg 3921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4121145 - 4120937
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4121145 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 4121046  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||    
T  4121045 atgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattcca 4120946  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  4120945 aacggggcc 4120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19358734 - 19358526
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19358734 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagctt 19358635  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  19358634 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatcca 19358535  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  19358534 aacggggcc 19358526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33991348 - 33991140
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33991348 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 33991249  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||    
T  33991248 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattca 33991149  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  33991148 aacggggcc 33991140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 38598450 - 38598658
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38598450 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38598549  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  38598550 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatcca 38598649  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  38598650 aaccgggcc 38598658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 20992146 - 20992354
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20992146 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagctt 20992245  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20992246 atgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattca 20992345  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  20992346 aacggggcc 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31410681 - 31410475
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  31410681 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttata 31410582  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  31410581 aaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaac 31410482  T
Q  214 ggggcca 220  Q
    | |||||    
T  31410481 gcggcca 31410475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Original strand, 26602942 - 26603113
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  26602942 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagttt 26603041  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26603042 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27025164 - 27025001
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27025164 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagctt 27025065  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagt 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  27025064 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992498
Alignment:
Q  84 cttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  184 ----tacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataat 224  Q
        ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggccttaat 20992498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 211
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  78 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtaga 177  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  178 taagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 35420424 - 35420481
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggta 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35420424 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggta 35420481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  183 ctacataagctcaaaataagtcaat 207  Q
      |||||| |  |||||||||||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  18 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 26603108 - 26603141
Alignment:
Q  187 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcca 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26603108 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 26603141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38055362 - 38055151
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38055362 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38055263  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38055262 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 38055163  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||||||||    
T  38055162 aacggggccata 38055151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 45424522 - 45424730
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45424522 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 45424621  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45424622 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatcca 45424721  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  45424722 aacggggcc 45424730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54189750 - 54189542
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54189750 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 54189651  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  54189650 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54189551  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  54189550 aacggggcc 54189542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 19913618 - 19913828
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19913618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19913717  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19913718 atgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 19913817  T
Q  211 aacggggccat 221  Q
    |||||||||||    
T  19913818 aacggggccat 19913828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 53717452 - 53717660
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  53717452 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagctt 53717551  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  53717552 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 53717651  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  53717652 aacggggcc 53717660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055297
Alignment:
Q  20 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaacta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  120 tgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50055297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 1756752 - 1756958
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1756752 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1756851  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  1756852 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 1756951  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  1756952 aacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20877251 - 20877037
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20877251 agagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 20877152  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20877151 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20877052  T
Q  212 acggggccataattt 226  Q
    ||||| || ||||||    
T  20877051 acgggaccttaattt 20877037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 23776449 - 23776655
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23776449 gagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 23776548  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23776549 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 23776648  T
Q  213 cggggcc 219  Q
    |||||||    
T  23776649 cggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31969886 - 31969673
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31969886 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 31969787  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  31969786 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattca 31969687  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    |||||| |||||||    
T  31969686 aacgggaccataat 31969673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 35490761 - 35490966
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  35490761 cagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 35490860  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  35490861 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 35490960  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  35490961 aacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 15241016 - 15241224
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15241016 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 15241115  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  15241116 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 15241215  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||| ||||    
T  15241216 aacgaggcc 15241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 28032700 - 28032908
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032700 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 28032799  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28032800 atgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcta 28032899  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  28032900 aacagggcc 28032908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 44784905 - 44785113
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44784905 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 44785004  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  44785005 atgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 44785104  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  44785105 aacggggcc 44785113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 11639566 - 11639773
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11639566 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 11639665  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  11639666 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatcca 11639765  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    ||||||||    
T  11639766 aacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 40428708 - 40428915
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  40428708 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagctt 40428807  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  40428808 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattca 40428907  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    ||||||||    
T  40428908 aacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54412833 - 54412627
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  54412833 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagctt 54412734  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  54412733 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54412634  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  54412633 aacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 6688615 - 6688817
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6688615 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca---- 6688710  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6688711 --gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatcca 6688808  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  6688809 aacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 2481396 - 2481604
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2481396 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagctt 2481495  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2481496 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 2481595  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  2481596 aacggggcc 2481604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 27488636 - 27488844
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27488636 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 27488735  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||    
T  27488736 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatcca 27488835  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  27488836 aacggggcc 27488844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37464926 - 37464718
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37464926 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 37464827  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  37464826 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 37464727  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  37464726 aacggggcc 37464718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48910049 - 48909843
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  48910049 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttat 48909950  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48909949 gaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaa 48909850  T
Q  213 cggggcc 219  Q
    | |||||    
T  48909849 cagggcc 48909843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1617289 - 1617084
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  1617289 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 1617190  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  1617189 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 1617090  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  1617089 aacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 6611348 - 6611556
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |    
T  6611348 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagctt 6611447  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  6611448 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatcca 6611547  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  6611548 aacggggcc 6611556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 44379175 - 44379383
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  44379175 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 44379274  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44379275 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatcca 44379374  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  44379375 aacagggcc 44379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47632240 - 47632032
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  47632240 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 47632141  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaaca-cttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  47632140 atgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatcc 47632041  T
Q  210 aaacggggc 218  Q
    |||||||||    
T  47632040 aaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50354006 - 50353798
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50354006 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50353907  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||    
T  50353906 atgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatcca 50353807  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  50353806 aacggggcc 50353798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 23704200 - 23704405
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23704200 agagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23704299  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23704300 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaac 23704399  T
Q  214 ggggcc 219  Q
     |||||    
T  23704400 agggcc 23704405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14987997 - 14987789
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14987997 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 14987898  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14987897 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 14987798  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  14987797 aacggggcc 14987789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16700986 - 16700782
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16700986 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 16700887  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16700886 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 16700787  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  16700786 aacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53875862 - 53875658
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  53875862 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctt 53875763  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  53875762 ataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatcca 53875663  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  53875662 aacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 8932165 - 8932386
Alignment:
Q  10 gcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8932165 gcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagct 8932264  T
Q  110 tatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  8932265 tatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatcc 8932364  T
Q  210 aaacggggccataatttcatta 231  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  8932365 aaacggggccttaatttgatta 8932386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 27583620 - 27583821
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27583620 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 27583719  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583720 atgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 27583819  T
Q  211 aa 212  Q
    ||    
T  27583820 aa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 43289951 - 43290152
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43289951 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 43290050  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  43290051 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaac 43290150  T
Q  214 gg 215  Q
    ||    
T  43290151 gg 43290152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 27536092 - 27536296
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27536092 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 27536191  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||    ||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  27536192 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatcca 27536287  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  27536288 aacggggcc 27536296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 30423556 - 30423757
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30423556 agagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatg 30423654  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30423655 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaac 30423754  T
Q  214 ggg 216  Q
    |||    
T  30423755 ggg 30423757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 37968746 - 37968952
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37968746 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 37968845  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  37968846 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaa 37968945  T
Q  212 acggggc 218  Q
    | |||||    
T  37968946 atggggc 37968952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 19164961 - 19165164
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19164961 cagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagctt 19165058  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaaca-cttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19165059 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 19165158  T
Q  210 aaacgg 215  Q
    ||||||    
T  19165159 aaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33704046 - 33703837
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33704046 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 33703947  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  |    
T  33703946 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaattaa 33703847  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    |||| |||||    
T  33703846 aacgaggcca 33703837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15669388 - 15669180
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  15669388 cagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagctt 15669289  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  15669288 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 15669189  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  15669188 aacggggcc 15669180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52139405 - 52139197
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52139405 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 52139306  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||   | ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  52139305 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaac 52139206  T
Q  214 ggggccata 222  Q
    ||| |||||    
T  52139205 gggaccata 52139197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 8591080 - 8591290
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8591080 cagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagctt 8591179  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   ||||||||| || |||||| ||||||||||| |||  ||    
T  8591180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtca 8591279  T
Q  211 aacggggccat 221  Q
    |||||| ||||    
T  8591280 aacgggaccat 8591290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 40680026 - 40680227
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40680026 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 40680125  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  40680126 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatcca 40680225  T
Q  211 aa 212  Q
    ||    
T  40680226 aa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 53353267 - 53353052
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  53353267 agagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcag 53353168  T
Q  108 cctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcc----tacataagctcaaaataagt 203  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||    ||  |||||||||||||||     
T  53353167 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagc 53353068  T
Q  204 caatccaaacggggcc 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  53353067 caatccaaacggggcc 53353052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30171785 - 30171581
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  30171785 cagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagctt 30171686  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  30171685 atgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 30171586  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  30171585 aacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 55344813 - 55345021
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |      
T  55344813 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactc 55344912  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  55344913 atgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattca 55345012  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  55345013 aacggggcc 55345021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 38071314 - 38071504
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38071314 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38071407  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38071408 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  45 agctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttattta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  144 tccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375844
Alignment:
Q  20 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaacta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  120 tgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |  |||  || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16704023 - 16703822
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16704023 agagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16703924  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||    
T  16703923 aaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaac 16703828  T
Q  214 ggggcc 219  Q
    | ||||    
T  16703827 gaggcc 16703822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 23269034 - 23269162
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23269034 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 23269133  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttattta 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269134 atgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50053587 - 50053440
Alignment:
Q  72 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgag 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  50053587 tgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatggg 50053488  T
Q  172 agtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50053487 agtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50053440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 53408225 - 53408137
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgg-agggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408225 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265950
Alignment:
Q  131 ttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 23265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 23261874 - 23261937
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctga 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23261874 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 219
Target Start/End: Original strand, 44548192 - 44548338
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || | ||| ||| | ||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  44548192 aaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgttag 44548291  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataa-gtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  44548292 tagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcc 44548338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 150
Target Start/End: Original strand, 51780769 - 51780845
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaac 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51780769 aaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 9595890 - 9595982
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9595890 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagt-----------ttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 9595978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 50055350 - 50055301
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055350 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 48748263 - 48748197
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaa 77  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748263 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 9595975 - 9596030
Alignment:
Q  163 gcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9595975 gcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggcc 9596030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 45
Target Start/End: Original strand, 55344681 - 55344715
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344681 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  72 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataa 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25897579 - 25897371
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25897579 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25897480  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25897479 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatcca 25897380  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  25897379 aacggggcc 25897371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33510689 - 33510481
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33510689 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33510590  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  33510589 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatcca 33510490  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  33510489 aacggggcc 33510481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26663463 - 26663257
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26663463 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagctt 26663364  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26663363 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 26663264  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  26663263 aacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29288352 - 29288146
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29288352 cagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29288255  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29288254 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 29288155  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  29288154 aacggggcc 29288146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 39260346 - 39260554
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  39260346 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 39260445  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39260446 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 39260545  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  39260546 aacggggcc 39260554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20089676 - 20089463
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20089676 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 20089577  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20089576 atgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 20089477  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  20089476 aacggggccttaat 20089463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29078720 - 29078519
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29078720 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctta 29078621  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29078620 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 29078521  T
Q  212 ac 213  Q
    ||    
T  29078520 ac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 42370795 - 42371004
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  42370795 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 42370894  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42370895 atgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatcca 42370994  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    ||||||||||    
T  42370995 aacggggcca 42371004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 970524 - 970735
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  970524 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctt 970623  T
Q  111 atgaaac--tatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatc 208  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  970624 atgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 970723  T
Q  209 caaacggggcca 220  Q
    ||||||||||||    
T  970724 caaacggggcca 970735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1168708 - 1168500
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1168708 cagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1168609  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1168608 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 1168509  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  1168508 aacggggcc 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 52753147 - 52753355
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  52753147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 52753246  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  52753247 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 52753346  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  52753347 aacggggcc 52753355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16052300 - 16052093
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16052300 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctta 16052201  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16052200 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 16052101  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  16052100 acggggcc 16052093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38829274 - 38829072
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38829274 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagctt 38829175  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38829174 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatcca 38829075  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  38829074 aac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 26580270 - 26580478
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26580270 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26580369  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26580370 atgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 26580469  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  26580470 aacggggcc 26580478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 41928495 - 41928703
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41928495 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 41928594  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  41928595 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatcca 41928694  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  41928695 aacggggcc 41928703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52696996 - 52696788
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52696996 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 52696897  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  52696896 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 52696797  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  52696796 aacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12683025 - 12682812
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12683025 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 12682926  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12682925 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatcca 12682826  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||| ||||| ||||    
T  12682825 aacagggccctaat 12682812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 19715161 - 19715366
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19715161 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19715260  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  19715261 atgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatcca 19715360  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  19715361 aacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 1940747 - 1940955
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  1940747 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaactt 1940846  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  1940847 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 1940946  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  1940947 aacggggcc 1940955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 8079710 - 8079914
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8079710 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagctta 8079809  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8079810 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 8079909  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  8079910 acggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8121074 - 8120870
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8121074 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagctt 8120975  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  8120974 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 8120875  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  8120874 aacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46761170 - 46760966
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  46761170 agagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttta 46761071  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  46761070 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaa 46760971  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  46760970 acggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15203317 - 15203106
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  15203317 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 15203218  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  15203217 atgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattca 15203118  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||||||||    
T  15203117 aacggggccata 15203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5215590 - 5215384
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5215590 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 5215491  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5215490 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 5215391  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  5215390 aacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7145412 - 7145207
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7145412 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7145313  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctc-aaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||    
T  7145312 atgaaactatgataaactatttttgtttattta-cccaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatcc 7145214  T
Q  210 aaacggg 216  Q
    |||||||    
T  7145213 aaacggg 7145207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 1170447 - 1170652
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1170447 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 1170546  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1170547 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaac 1170646  T
Q  214 ggggcc 219  Q
    ||||||    
T  1170647 ggggcc 1170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2347862 - 2347653
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  2347862 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagct 2347763  T
Q  110 tatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||    
T  2347762 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatcc 2347663  T
Q  210 aaacggggcc 219  Q
    ||||||||||    
T  2347662 aaacggggcc 2347653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32671784 - 32671576
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32671784 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 32671685  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  32671684 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatcca 32671585  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  32671584 aacggggcc 32671576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46409642 - 46409436
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagc 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46409642 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagc 46409543  T
Q  109 ctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatc 208  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46409542 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 46409443  T
Q  209 caaacgg 215  Q
    |||||||    
T  46409442 caaacgg 46409436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17591893 - 17591688
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17591893 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 17591794  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  17591793 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagcc-acataagctc--aataagccaatcca 17591697  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  17591696 aacggggcc 17591688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43905859 - 43905655
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43905859 cagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 43905760  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  43905759 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatcca 43905660  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  43905659 aacgg 43905655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 13996723 - 13996931
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13996723 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13996822  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||    
T  13996823 atgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatcca 13996922  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  13996923 aacagggcc 13996931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40092696 - 40092488
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40092696 cagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 40092597  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  40092596 atgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatcca 40092497  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  40092496 aacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6765659 - 6765458
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  6765659 agaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaa 6765560  T
Q  116 actatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6765559 aatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgg 6765460  T
Q  216 gg 217  Q
    ||    
T  6765459 gg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 51359217 - 51359425
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  51359217 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcacctt 51359316  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  51359317 atgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatcca 51359415  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    ||||||||||    
T  51359416 aacggggcca 51359425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15717986 - 15717787
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15717986 agagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatg 15717887  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15717886 aaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaac 15717788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23498665 - 23498454
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |    
T  23498665 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaactt 23498566  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||    
T  23498565 atgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattca 23498466  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||| ||||||||    
T  23498465 aacagggccata 23498454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 17587505 - 17587694
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17587505 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17587604  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaata 200  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17587605 atgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49146377 - 49146173
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  49146377 cagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 49146278  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||  |||||||    
T  49146277 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatcca 49146178  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  49146177 aacgg 49146173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40149668 - 40149497
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  40149668 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 40149569  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40149568 ataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2473924 - 2473722
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  2473924 agagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 2473825  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||    
T  2473824 aaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaac 2473725  T
Q  214 ggg 216  Q
    |||    
T  2473724 ggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 15554152 - 15554352
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  15554152 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagttt 15554251  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||   |||     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||    
T  15554252 atgaa---atg-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatcca 15554343  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  15554344 aacggggcc 15554352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  50 cttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaa 149  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  150 cacttttaaaaaggc-ttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 218  Q
    ||| ||||||||    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38172023 - 38171833
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||              |||||||||| ||    
T  38172023 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagctta 38171937  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||  ||||||||||||||| |||    
T  38171936 tgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaa 38171837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 202
Target Start/End: Original strand, 23322903 - 23323031
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    |||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||| | ||||| |||    
T  23322903 aaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagtttatgggag 23323002  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataag 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23323003 tagataagcctatataagctcaaaataag 23323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086264
Alignment:
Q  87 attaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctac 186  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| || ||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  187 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcc 52086264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675097
Alignment:
Q  145 ccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataat 224  Q
    |||||||  ||| |||| |||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggccttaat 5675097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Original strand, 5217855 - 5217991
Alignment:
Q  82 ggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataag 181  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |   |||| ||||||||||| ||||| |||||    ||| |||  |||||||  ||||||||||    
T  5217855 ggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagcttatgttagtagataag 5217953  T
Q  182 cctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |   |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5217954 ctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcc 5217991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23159
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  116 actatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 23155  T
Q  216 ggcc 219  Q
    ||||    
T  23156 ggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20346694 - 20346487
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20346694 cagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 20346595  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20346594 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 20346495  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    ||||||||    
T  20346494 aacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 43067963 - 43068171
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  43067963 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagctt 43068062  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43068063 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatcca 43068162  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  43068163 aacggggcc 43068171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 22649684 - 22649897
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22649684 cagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22649783  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  22649784 atgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 22649883  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||||||||    
T  22649884 aacggggccataat 22649897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 33359080 - 33359293
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33359080 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33359179  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33359180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 33359279  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||||||||    
T  33359280 aacggggccataat 33359293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 24792322 - 24792530
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24792322 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 24792421  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||    
T  24792422 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatcca 24792521  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  24792522 aacggggcc 24792530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 30181014 - 30181222
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30181014 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30181113  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  30181114 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 30181213  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  30181214 aacggggcc 30181222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42204361 - 42204147
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42204361 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42204262  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaaca-cttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42204261 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 42204162  T
Q  210 aaacggggccataat 224  Q
    |||||||||| ||||    
T  42204161 aaacggggccttaat 42204147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5281066 - 5280861
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5281066 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 5280967  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  5280966 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 5280867  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  5280866 aacggg 5280861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6394957 - 6394749
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  6394957 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 6394858  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  6394857 atgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatcta 6394758  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  6394757 aacggggcc 6394749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 12101168 - 12101376
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12101168 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 12101267  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  12101268 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 12101367  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    || ||||||    
T  12101368 aatggggcc 12101376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 42964986 - 42965194
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42964986 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42965085  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42965086 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 42965185  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    || ||||||    
T  42965186 aaaggggcc 42965194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511324
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaa 3511328  T
Q  213 cggg 216  Q
    ||||    
T  3511327 cggg 3511324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9452796 - 9452591
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  9452796 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagctt 9452697  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  9452696 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatcca 9452597  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  9452596 aacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1803232 - 1803029
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  1803232 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagctt 1803133  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1803132 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 1803033  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  1803032 aacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 36890821 - 36891027
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  36890821 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaactta 36890920  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36890921 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaa 36891019  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  36891020 acggggcc 36891027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7164390 - 7164184
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7164390 cagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7164291  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  7164290 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 7164191  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  7164190 aacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 12097580 - 12097793
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  12097580 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagctt 12097679  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| |||||||    
T  12097680 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatcca 12097779  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    || |||||| ||||    
T  12097780 aatggggccctaat 12097793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15656118 - 15655905
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15656118 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 15656019  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15656018 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 15655919  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  15655918 aacggggccttaat 15655905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 933491 - 933283
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  933491 cagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 933392  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||    
T  933391 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattca 933292  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  933291 aacagggcc 933283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25748693 - 25748484
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25748693 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25748594  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |  | ||||||||||  |||| |||||||    
T  25748593 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatcca 25748494  T
Q  211 aacggggcca 220  Q
    ||||||||||    
T  25748493 aacggggcca 25748484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 4477311 - 4477515
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4477311 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 4477410  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4477411 atgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 4477510  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  4477511 aacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42673667 - 42673467
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42673667 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42673568  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42673567 atgaaactatgataagctgtttttatttac----ccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatcca 42673472  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  42673471 aacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 33846519 - 33846722
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  33846519 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 33846613  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33846614 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 33846713  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  33846714 aacggggcc 33846722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38866750 - 38866547
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38866750 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagctt 38866651  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  38866650 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatcca 38866551  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  38866550 aacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4347478 - 4347266
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4347478 cagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4347380  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4347379 atgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatcca 4347280  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  4347279 aacggggccttaat 4347266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32041748 - 32041540
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  32041748 cagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagctt 32041649  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  32041648 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatcca 32041549  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  32041548 aacggggcc 32041540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8630872 - 8630665
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8630872 cagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8630773  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||   ||||||    
T  8630772 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatcca 8630673  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    ||||||||    
T  8630672 aacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43156917 - 43156718
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||    
T  43156917 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttat 43156818  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43156817 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 46134294 - 46134500
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |    
T  46134294 cagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagctt 46134393  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46134394 atgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatcca 46134493  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  46134494 aacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 46891329 - 46891535
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  46891329 cagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagctt 46891428  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaaca-cttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46891429 ataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatcc 46891528  T
Q  210 aaacggg 216  Q
    |||||||    
T  46891529 aaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17753806 - 17753595
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17753806 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17753707  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||    
T  17753706 atgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatcca 17753607  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  17753606 aacggggtcata 17753595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48865837 - 48865665
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48865837 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 48865738  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacactttt---aaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||  |||||||||||    
T  48865737 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Original strand, 16894497 - 16894668
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16894497 cagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16894596  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16894597 atgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 16894668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828268
Alignment:
Q  72 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgag 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  172 agtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcc 19828268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 43021570 - 43021774
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    |   ||||||| |||||||||| |    
T  43021570 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttag----accgaaatatgccataagcagctt 43021665  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||   |||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||    
T  43021666 atgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatcca 43021765  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    || ||||||    
T  43021766 aatggggcc 43021774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704978
Alignment:
Q  122 ataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcc 37704978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43405155 - 43405012
Alignment:
Q  82 ggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataag 181  Q
    ||||||||||||||| | | || || | ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43405155 ggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataag 43405056  T
Q  182 cctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataatt 225  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43405055 ccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggccttaatt 43405012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 224
Target Start/End: Original strand, 37005864 - 37006014
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||  |||||   ||    
T  37005864 aaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaacttatagaag 37005963  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataat 224  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37005964 tagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagccttaat 37006014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849737
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | |||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccat 221  Q
    |||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggccat 36849737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 219
Target Start/End: Original strand, 15655465 - 15655610
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||    
T  15655465 aaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagacttatgttag 15655564  T
Q  174 tagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    |||| ||||  ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||    
T  15655565 tagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcc 15655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 30075292 - 30075429
Alignment:
Q  82 ggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataag 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||   | | ||| ||||||||  |||||||||     
T  30075292 ggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggcttatgttagtagataaa 30075388  T
Q  182 cctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccata 222  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30075389 ctcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163824
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| | |||||| | || | ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  183 ctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
      | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaa 20163824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691506
Alignment:
Q  123 taaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataa 201  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataa 27691506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 224
Target Start/End: Original strand, 16894663 - 16894700
Alignment:
Q  187 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataat 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16894663 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaat 16894700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 26946876 - 26947089
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26946876 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 26946975  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  26946976 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 26947075  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  26947076 aacggggccctaat 26947089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 3347523 - 3347731
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3347523 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 3347622  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3347623 atgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 3347722  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  3347723 aacggggcc 3347731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2837752 - 2837544
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  2837752 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctc 2837653  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2837652 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 2837553  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  2837552 aacggggcc 2837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 6086599 - 6086807
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6086599 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 6086698  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6086699 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 6086798  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  6086799 aacggggcc 6086807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 16307015 - 16307216
Alignment:
Q  18 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaac 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16307015 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16307114  T
Q  118 tatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307115 tatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 16307214  T
Q  218 cc 219  Q
    ||    
T  16307215 cc 16307216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30692058 - 30691845
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30692058 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30691959  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  30691958 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 30691859  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    |||| |||| ||||    
T  30691858 aacgaggccctaat 30691845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21893662 - 21893454
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21893662 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21893563  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21893562 atgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatcca 21893463  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  21893462 aacggggcc 21893454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 26704339 - 26704547
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26704339 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26704438  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  26704439 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatcca 26704538  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  26704539 aacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18613745 - 18613537
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18613745 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18613646  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18613645 atggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatcca 18613546  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  18613545 aacggggcc 18613537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9459770 - 9459555
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9459770 cagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9459671  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  | |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  9459670 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatcca 9459571  T
Q  211 aacggggccataattt 226  Q
    ||||||||| ||||||    
T  9459570 aacggggccctaattt 9459555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 17261073 - 17261278
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17261073 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 17261172  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17261173 atgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 17261272  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  17261273 aacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 34887292 - 34887496
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  34887292 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 34887391  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34887392 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatcca 34887491  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  34887492 aacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20726994 - 20726787
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20726994 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 20726895  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  20726894 atgaaactatgataagttatttttatttac----ccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 20726799  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||||||||    
T  20726798 aacggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11167447 - 11167239
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11167447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 11167348  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  11167347 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatcca 11167248  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  11167247 aacggggcc 11167239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 28199508 - 28199714
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  28199508 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 28199606  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagta---gataagcctacataagctcaaaataagtcaat 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28199607 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg-gagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaat 28199705  T
Q  208 ccaaacggg 216  Q
    |||||||||    
T  28199706 ccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 3955769 - 3955977
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  3955769 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagttt 3955865  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3955866 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 3955965  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  3955966 aacggggtcata 3955977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1153800 - 1153603
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1153800 cagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1153701  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1153700 atgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35198489 - 35198283
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  35198489 agagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 35198390  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  35198389 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaa 35198291  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  35198290 acggggcc 35198283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699132
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  116 actatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||   | || ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 33464536 - 33464399
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33464536 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33464437  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33464436 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52835
Alignment:
Q  55 taagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacactt 154  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  155 ttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 53115 - 53001
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  53115 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 53016  T
Q  111 atgaaactatgataa 125  Q
    |||||||||||||||    
T  53015 atgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463703
Alignment:
Q  140 tttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 216  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 33463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12835183 - 12835055
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacac-ttttaaaaaggcttatgagagtagataag 181  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||  ||||  | |||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  12835183 gcttattaaaatattgcttaagcagcttatgaaattagtataagttcttttgattaatgtatccaaacactttttacaaaagcttatgttagtagataag 12835084  T
Q  182 cctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
      ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  12835083 tttacataagct-taaataagccaatccaa 12835055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25999590 - 25999377
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25999590 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25999491  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25999490 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 25999391  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||||||||    
T  25999390 aacggggccataat 25999377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 37698129 - 37698337
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37698129 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 37698228  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37698229 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 37698328  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  37698329 aacggggcc 37698337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8042809 - 8042596
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8042809 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8042710  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||    
T  8042709 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatcca 8042610  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  8042609 aacggggccttaat 8042596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 22174976 - 22175184
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22174976 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22175075  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22175076 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 22175175  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  22175176 aacggggcc 22175184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 25494271 - 25494482
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25494271 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25494370  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25494371 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatcca 25494470  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||||||||    
T  25494471 aacggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 42307892 - 42308099
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42307892 agagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 42307991  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42307992 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42308091  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  42308092 acggggcc 42308099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 15520128 - 15520341
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15520128 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 15520227  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15520228 atgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 15520327  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  15520328 aacggggccttaat 15520341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50529131 - 50528923
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50529131 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50529032  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  50529031 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 50528932  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  50528931 aacggggcc 50528923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38856295 - 38856084
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38856295 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38856196  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  38856195 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 38856096  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  38856095 aacggggtcata 38856084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 46452149 - 46452356
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  46452149 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactta 46452248  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||    
T  46452249 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 46452348  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  46452349 acggggcc 46452356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21581244 - 21581042
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21581244 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21581145  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21581144 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 21581045  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  21581044 aac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 12117644 - 12117857
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  12117644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 12117743  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12117744 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 12117843  T
Q  211 aacggggccataat 224  Q
    ||||||||| ||||    
T  12117844 aacggggccttaat 12117857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 20842334 - 20842542
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  20842334 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagctt 20842433  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  20842434 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 20842533  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  20842534 aacggggcc 20842542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244117
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  116 actatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 32244118  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  32244117 g 32244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 24835686 - 24835893
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  24835686 agagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 24835785  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24835786 tgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaa 24835885  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  24835886 acggggcc 24835893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29445690 - 29445482
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  29445690 cagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagctt 29445591  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  29445590 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 29445491  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  29445490 aacggggcc 29445482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15520837 - 15520630
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520837 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 15520738  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15520737 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520638  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  15520637 acggggcc 15520630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20699350 - 20699144
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20699350 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 20699251  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20699250 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20699151  T
Q  212 acggggc 218  Q
    |||||||    
T  20699150 acggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 42104957 - 42105155
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  42104957 cagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 42105056  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42105057 atgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38934147 - 38933940
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  38934147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagctt 38934048  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38934047 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagcc-acataagctcaaaataagccaatcca 38933949  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  38933948 aacggggcc 38933940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35226649 - 35226441
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35226649 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 35226550  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  35226549 atgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatcca 35226450  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  35226449 aacagggcc 35226441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 54534314 - 54534520
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  54534314 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagctt 54534412  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  54534413 at-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54534511  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  54534512 aacggggcc 54534520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 54870160 - 54870368
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  54870160 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 54870259  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||    
T  54870260 atgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatcca 54870359  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  54870360 aacggggcc 54870368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 44609319 - 44609521
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44609319 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 44609418  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  44609419 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 44609518  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  44609519 aac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32359461 - 32359256
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32359461 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 32359362  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  | |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  32359361 atgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatcca 32359262  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  32359261 aacggg 32359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2895391 - 2895179
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895391 cagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 2895292  T
Q  107 gcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaa 206  Q
    || ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2895291 gcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaa 2895192  T
Q  207 tccaaacggggcc 219  Q
    | |||| ||||||    
T  2895191 ttcaaatggggcc 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26123015 - 26122807
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  26123015 agagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 26122916  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26122915 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 26122816  T
Q  212 acggggcca 220  Q
    || ||||||    
T  26122815 actgggcca 26122807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 53028419 - 53028219
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  53028419 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 53028320  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||        || | ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53028319 atgaaaatatgataagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 53028228  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  53028227 aacagggcc 53028219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44688961 - 44688782
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44688961 agagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatat-gcataagcagctta 44688863  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagc 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  44688862 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 48924989 - 48925189
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |    
T  48924989 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagctt 48925088  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||| || | |||| ||| ||||||| |||||||    
T  48925089 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatcca 48925186  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  48925187 aac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34700543 - 34700335
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34700543 cagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 34700444  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||  ||||| |    
T  34700443 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatcta 34700344  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  34700343 aacggggcc 34700335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16354548 - 16354379
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  16354548 cagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagctt 16354449  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataa 180  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16354448 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643212
Alignment:
Q  61 ggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaa 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  161 aggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 218  Q
    |||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 213
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  79 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagat 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  179 aagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaac 213  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12916105 - 12915930
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  12916105 agagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatg 12916006  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataa 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  12916005 aaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatg-gagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24366230 - 24366143
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366230 agagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128038
Alignment:
Q  85 ttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcct 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  185 acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataat 224  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggccttaat 49128038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13696995 - 13696914
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaa 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13696995 cagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366086
Alignment:
Q  163 gcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcc 24366086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 50528868 - 50528916
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc 59  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528868 cagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40240515 - 40240485
Alignment:
Q  186 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240515 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 40240485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10443 - 10235
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10443 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 10344  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  10343 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatcca 10244  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  10243 aacggggcc 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 3873244 - 3873455
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3873244 cagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3873343  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3873344 atgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 3873443  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    |||| |||||||    
T  3873444 aacgaggccata 3873455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 31517215 - 31517426
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31517215 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 31517314  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  31517315 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatcca 31517414  T
Q  211 aacggggccata 222  Q
    ||||||||||||    
T  31517415 aacggggccata 31517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 18806884 - 18807092
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18806884 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 18806983  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  18806984 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatcca 18807083  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  18807084 aacggggcc 18807092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 33906047 - 33906255
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33906047 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33906146  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33906147 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatcca 33906246  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    ||| |||||    
T  33906247 aacagggcc 33906255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 26323186 - 26323394
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26323186 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26323285  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  26323286 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatcca 26323385  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  26323386 aacggggcc 26323394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 851202 - 850997
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  851202 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 851103  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    || ||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  851102 ataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatcca 851003  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  851002 aacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42937925 - 42937720
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42937925 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagct 42937826  T
Q  110 tatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  42937825 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatcc 42937726  T
Q  210 aaacgg 215  Q
    ||||||    
T  42937725 aaacgg 42937720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 6174828 - 6175036
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |    
T  6174828 cagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagctt 6174927  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  6174928 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 6175027  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  6175028 aacggggcc 6175036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 30270679 - 30270887
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  30270679 cagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 30270778  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||||||    
T  30270779 atgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatcca 30270878  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  30270879 aacggggcc 30270887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39635656 - 39635449
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  39635656 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagctta 39635557  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  39635556 tgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaa 39635457  T
Q  212 acggggcc 219  Q
    ||||||||    
T  39635456 acggggcc 39635449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 28329839 - 28330042
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28329839 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 28329936  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28329937 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 28330036  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  28330037 aacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4016244 - 4016039
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4016244 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4016145  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  4016144 atgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 4016045  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  4016044 aacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108277
Alignment:
Q  31 tacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  131 ttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 1108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 2178769 - 2178977
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2178769 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 2178868  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||    
T  2178869 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatcca 2178968  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  2178969 aacggggcc 2178977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 4232142 - 4232350
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  4232142 cagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagctt 4232241  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  4232242 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatcca 4232341  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  4232342 aacggggcc 4232350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 19901143 - 19901350
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  19901143 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaa 19901242  T
Q  116 actatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 215  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19901243 actatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19901341  T
Q  216 ggccataat 224  Q
    |||| ||||    
T  19901342 ggccttaat 19901350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 19383938 - 19384127
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  19383938 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatg 19384037  T
Q  114 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  19384038 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataagt 19384127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 1482903 - 1483106
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1482903 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1483002  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  1483003 atgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatg-gagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaa 1483101  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  1483102 aacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5733604 - 5733396
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  5733604 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 5733505  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |    
T  5733504 atgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatcta 5733405  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    || ||||||    
T  5733404 aatggggcc 5733396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 16066302 - 16066495
Alignment:
Q  19 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaact 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16066302 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 16066401  T
Q  119 atgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16066402 atgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 16588776 - 16588980
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16588776 cagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 16588875  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  16588876 atgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatcca 16588975  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  16588976 aacgg 16588980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 30420181 - 30420373
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30420181 gagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagc------------tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 30420268  T
Q  113 gaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 212  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30420269 gaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 30420368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 430017 - 429812
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  430017 gagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatga 429918  T
Q  115 aactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 214  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||  ||| ||||||    
T  429917 aattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacg 429818  T
Q  215 gggcca 220  Q
    | ||||    
T  429817 gagcca 429812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 44947549 - 44947749
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||        |||||||||||||||||| |    
T  44947549 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagctt 44947641  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  44947642 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaataca 44947741  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    || |||||    
T  44947742 aatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 42446642 - 42446777
Alignment:
Q  84 cttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  | |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||      
T  42446642 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagtt 42446741  T
Q  184 tacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 219  Q
      ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  42446742 cgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcc 42446777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagag 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  | |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  174 tagataa 180  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3585430 - 3585291
Alignment:
Q  76 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagta 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||  |||     
T  3585430 aattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggtttatgttagtg 3585331  T
Q  176 gataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 215  Q
    |||||  | |||||||||   |||||| | ||||||||||    
T  3585330 gataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517395
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcctatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 182  Q
    |||| ||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||  || ||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  183 ctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccataa 223  Q
      |||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  12517356 tcacataagct-taaataagccaatccaaacaggcccataa 12517395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36910 - 36702
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 36811  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  36810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 36711  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  36710 aacggggcc 36702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3915 - 3708
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3915 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3816  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  3815 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatcca 3716  T
Q  211 aacggggc 218  Q
    ||||||||    
T  3715 aacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 145246 - 145450
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagccta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  145246 agagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 145345  T
Q  112 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  145346 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 145445  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  145446 acggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 6 - 214
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagctt 105  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||| |||| ||    
T  106 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaataca 205  T
Q  211 aacggggcc 219  Q
    |||||||||    
T  206 aacggggcc 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 6 - 212
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 104  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagta---gataagcctacataagctcaaaataagtcaat 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  105 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg-gagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaat 203  T
Q  208 ccaaacggg 216  Q
    |||||||||    
T  204 ccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 295 - 501
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  295 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 394  T
Q  111 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  395 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcca 494  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  495 aacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University