View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3365_low_2 (Length: 805)

Name: NF3365_low_2
Description: NF3365
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3365_low_2
NF3365_low_2
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (22-393)||(5163565-5163918)
chr6 (153-403)||(5889108-5889358)
chr6 (105-403)||(5883851-5884143)
chr6 (578-795)||(5165273-5165491)
chr6 (113-384)||(5853709-5853974)
chr6 (113-403)||(5881135-5881419)
chr6 (149-397)||(5821423-5821671)
chr6 (113-383)||(5830769-5831033)
chr6 (153-403)||(5761857-5762106)
chr6 (578-794)||(25942203-25942420)
chr6 (578-794)||(17694281-17694498)
chr6 (578-794)||(13879273-13879490)
chr6 (641-794)||(22351348-22351501)
chr6 (223-341)||(2715409-2715531)
chr6 (26-65)||(5881478-5881517)
chr6 (22-74)||(5884186-5884237)
chr6 (26-65)||(5762193-5762232)
chr6 (26-65)||(5831095-5831134)
chr6 (26-65)||(5854036-5854075)
[»] scaffold0087 (10 HSPs)
scaffold0087 (113-403)||(40862-41146)
scaffold0087 (161-403)||(30829-31071)
scaffold0087 (160-403)||(20481-20724)
scaffold0087 (153-403)||(13423-13672)
scaffold0087 (153-383)||(34841-35070)
scaffold0087 (26-65)||(41205-41244)
scaffold0087 (26-65)||(13759-13798)
scaffold0087 (26-65)||(20824-20863)
scaffold0087 (26-65)||(31172-31211)
scaffold0087 (26-65)||(35164-35203)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (578-793)||(47882318-47882534)
chr3 (578-794)||(22625409-22625626)
chr3 (578-794)||(10612207-10612424)
chr3 (578-794)||(10897539-10897756)
chr3 (578-794)||(29913385-29913602)
chr3 (578-790)||(54189048-54189261)
chr3 (590-794)||(16458000-16458205)
chr3 (578-794)||(6303845-6304062)
chr3 (578-794)||(10205121-10205338)
chr3 (578-794)||(10098225-10098442)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (578-794)||(33033175-33033391)
chr8 (587-794)||(21034402-21034610)
chr8 (588-794)||(28891298-28891505)
chr8 (578-794)||(16756690-16756907)
chr8 (578-794)||(28328442-28328659)
chr8 (578-791)||(15945189-15945409)
chr8 (578-677)||(4819669-4819769)
chr8 (440-509)||(32211224-32211293)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (578-794)||(44016095-44016312)
chr7 (578-794)||(25351886-25352103)
chr7 (578-794)||(7070329-7070546)
chr7 (578-794)||(25405948-25406165)
chr7 (578-794)||(3324217-3324434)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (578-794)||(20054190-20054407)
chr2 (578-794)||(22716663-22716880)
chr2 (578-795)||(28456933-28457151)
chr2 (578-794)||(2736739-2736956)
chr2 (578-794)||(39680580-39680797)
chr2 (586-750)||(10941948-10942113)
chr2 (586-750)||(10947817-10947982)
chr2 (440-509)||(22985792-22985861)
chr2 (440-509)||(37781103-37781172)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (587-794)||(4558842-4559050)
chr4 (590-794)||(15312852-15313057)
chr4 (588-795)||(16633023-16633231)
chr4 (419-505)||(26633303-26633389)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (578-794)||(16859-17076)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (587-794)||(9522259-9522467)
chr1 (578-794)||(2400654-2400871)
chr1 (578-795)||(14997570-14997786)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (578-795)||(31781890-31782109)
chr5 (578-795)||(10627892-10628110)
chr5 (578-794)||(25446021-25446238)
chr5 (648-791)||(28786936-28787079)
chr5 (587-648)||(28788402-28788464)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (713-794)||(16601-16682)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5163918 - 5163565
Alignment:
Q  22 ccctaagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcattcttcatctacactggtaacatgtgtgtcatggctatctccagggcgaagatttat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5163918 ccctaagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcattcttcatctacactggtaacatgtgtgtcatggctatctccagggcaaagatttat 5163819  T
Q  122 gagtggttgtccacaaagtcactcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttg 221  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5163818 gagtggctgtccacaaagtcattcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttg 5163719  T
Q  222 ttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaaca 321  Q
    |||||                  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5163718 ttgaa------------------aagaaatgtcaaatttgaaaagtttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaaca 5163637  T
Q  322 ttttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaata 393  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5163636 ttttcatatgaccaatgttgttgggaatgaatcctgtgagaatattccctaaaaggtttaaaccaactaata 5163565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Original strand, 5889108 - 5889358
Alignment:
Q  153 ttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatg 252  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5889108 ttccccacgtatgtagaaggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttattgaaagacaagttcatgtaactaagaaatg 5889207  T
Q  253 tcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  5889208 tcaaatttgaaaagcttgttggcattttacccgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacatttccatatgaccaatgtttttgggaattaa 5889307  T
Q  353 tcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    || |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5889308 tcctgtgagatgatttcctgaaaggttcaaatcaactaataccacaagttt 5889358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5884143 - 5883851
Alignment:
Q  105 ccagggcgaagatttatgagtggttgtccacaaagtcactcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||      |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5884143 ccagggcaaagatttatgagcggttgtccacaaagtcgattat------tccccacatatgaagaggaatcaaaagtttgtagttgagtgcttagtggaa 5884050  T
Q  205 ttttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5884049 ttttgccttctaagttgttgaacgacaggttcatgtaaccaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattctacccgaaagatggtttcttgacaa 5883950  T
Q  305 gtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5883949 gtcaagtgattctaacattttcatatgaccaatgttgttgggaatcattcctgtgagattattccctgaaaggtttaaaccaactaatgcaacaagttt 5883851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 578 - 795
Target Start/End: Original strand, 5165273 - 5165491
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5165273 ttgaatttcgtcaattgatccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcggacattgtctatgtgccaaggacttggtca 5165372  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5165373 tgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgaaaccttatccccaagacaaagaatgatagcactgac 5165472  T
Q  777 cgctttatcattcatctca 795  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5165473 cgctttatcattcatctca 5165491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 113 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5853974 - 5853709
Alignment:
Q  113 aagatttatgagtggttgtccacaaagtcactcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgcct 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||      |||| ||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5853974 aagatttatgagtggtggtccacaaagtcgattat------tccccacatatgaataggaatcaaaagtttgtagctgagtgcttattggaattttgcct 5853881  T
Q  213 tctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5853880 tctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagagatgttaaatttgaaaagcttgttggcattctaccagaaagatggtttcttgacaaatcgagcg 5853781  T
Q  313 attccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaac 384  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5853780 attctaacattttcatatgaccaatgttattgggaattaatcctgtgagattattccttgaaaggtttaaac 5853709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 113 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5881419 - 5881135
Alignment:
Q  113 aagatttatgagtggttgtccacaaagtcactcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgcct 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  5881419 aagatttatgagtggctgtccacaaagtcc------actgttccccacatatgcagagggatgaaaagtttgtagttgagtacctagtggaattttccct 5881326  T
Q  213 tctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtg 312  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | ||    
T  5881325 tctaaattgttgaacgacaggttcatgtaaccaagaaatgtcaaacttgaaaagcttgttggcattttaccgtagagatgatttcttgacaagtccaatg 5881226  T
Q  313 attccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  5881225 attctaacattttcatatgaccaatgtttttgggaattaatcctgtgagatgatttcctgaaaggtctaaaccaactaatgccacgagttt 5881135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 149 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 5821671 - 5821423
Alignment:
Q  149 actgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaaga 248  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5821671 actgttccccacatatgaagatggatcaaaagtttgtagttgagtgcttagtggaattttcccttctaaattgttgaatgacaggttcatgtaaccaaga 5821572  T
Q  249 aatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaa 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  5821571 aatgtcaaacttgaaaagcttgttggcattttaccgtagagatgatttcttgacaagtccaatgattctaaactttccatatgaccaatgttgctaggaa 5821472  T
Q  349 tgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccac 397  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5821471 tgaatcctgtgagattattccttgaaaggtttaaaccaactaataccac 5821423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 113 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5831033 - 5830769
Alignment:
Q  113 aagatttatgagtggttgtccacaaagtcactcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgcct 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||      |||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  5831033 aagatttatgagtggtggtccacaaagtcgattat------tccccacatatgaataggaatcaaaagtttgtagttgagtgcttactggaattttgccg 5830940  T
Q  213 tctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtg 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830939 tctaagttattgaaagacaagttcatgttattaagaaatgtcaaatttgaaaagctcgttggcattctaccagaaagatggtttcttgacaagtcgagtg 5830840  T
Q  313 attccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaa 383  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5830839 attctaacctttccatatgaccaatgttgctaggaatgattcctgtgagattattccttgaaaggtttaaa 5830769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5762106 - 5761857
Alignment:
Q  153 ttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatg 252  Q
    ||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5762106 ttcccaacatatgatgaggggccaaaagtttgtagttgagtgcttatgggaatattgccttctaagttgttgaaa-acaagttcatgtgactaagaaatg 5762008  T
Q  253 tcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  5762007 tcaaatttgaaaagcttgttggcattctacctgaaagatggtttattgacaagtcgagtgattgtaaacttttcatatgaccaatgttgctaggaataaa 5761908  T
Q  353 tcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||| |||||    
T  5761907 tcctgtgagattattccatgaaaggtttaaagcagctaatgccacgagttt 5761857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25942420 - 25942203
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  25942420 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 25942321  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  25942320 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 25942221  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25942220 cgctttatcattcatctc 25942203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 17694281 - 17694498
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |    
T  17694281 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgtttcagacattttctatgtgccaaagacttggtta 17694380  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  17694381 tgtataattaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 17694480  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17694481 cgctttatcattcatctc 17694498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13879490 - 13879273
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  13879490 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 13879391  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  13879390 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 13879291  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13879290 cgccttatcattcatctc 13879273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 641 - 794
Target Start/End: Original strand, 22351348 - 22351501
Alignment:
Q  641 gtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcga 740  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |    
T  22351348 gtttccgacattgactatgtgccaaagatttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaa 22351447  T
Q  741 caccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatcattcatctc 794  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22351448 caccttatccccaagacatagaatgatagcactgatcgctttatcattcatctc 22351501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Original strand, 2715409 - 2715531
Alignment:
Q  223 tgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttg----acaagtcgagtgattcca 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||   ||||||  |||||||    | |||||||| ||||| |    
T  2715409 tgaaagacaagttcatgtaacttatgaatgtcaaattagcaaagcttgttggcattctacaataaagataatttcttgatatataagtcgagcgattcta 2715508  T
Q  319 acattttcatatgacaaatgttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2715509 acattttcatatgacaaatgttg 2715531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5881517 - 5881478
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881517 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 5881478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5884237 - 5884186
Alignment:
Q  22 ccctaagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcattcttcatct 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5884237 ccctaaggtaacataaaacccaaaggttatgagcttatcttca-tcttcatct 5884186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5762232 - 5762193
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5762232 aagctaacataaaacccaaaggttatgagcttatcttcat 5762193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5831134 - 5831095
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5831134 aagctaacataaaacccaaaggttatgagcttatcttcat 5831095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5854075 - 5854036
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5854075 aagctaacataaaacccaaaggttatgagcttatcttcat 5854036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 10)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41146 - 40862
Alignment:
Q  113 aagatttatgagtggttgtccacaaagtcactcataactgttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgcct 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41146 aagatttatgagtggctgtccacaaagtcc------actgttcccgacatatgtagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttacct 41053  T
Q  213 tctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtg 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41052 tctaagttgttgaacgacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatacgaaaagcttggtggcattctcccagaaagatggtttcttgacaagtcaagtg 40953  T
Q  313 attccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    |||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40952 attctaatgtttccatatgaccaatgttgttgggaattaatcctgtgagattattccttgaaaggtttaaaccagctaatgccacaagttt 40862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31071 - 30829
Alignment:
Q  161 atatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaattt 260  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31071 atatgtagatggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaatttttccttctaagttgttgaaagacaagtccatgtaactaagaaatgtcaaattt 30972  T
Q  261 gaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtga 360  Q
    |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||  ||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  30971 gttaagctcgttggcattctacctgaaatatgttttcttgataagtctagtgattctaatctttccatatgaccaatgttgctaggaatgaatcctgtga 30872  T
Q  361 gaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  30871 gattattccatgaaaggtttaaaccagctaatgccacgagttt 30829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20724 - 20481
Alignment:
Q  160 catatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatgtcaaatt 259  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20724 catatgtagatggaccaaaagattgtagttgagtgcatagtggaatttttccttctaagttgttgaaagacaagtccatgtaactaagaaatgtcaaatt 20625  T
Q  260 tgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaatcttgtg 359  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  20624 tgagaagctcgtcggcattctaccagaaatatgatttcttgagaagtcaagtgattctaacctttccatatgaccaatgttgctaggaatgaatcctgtg 20525  T
Q  360 agaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  20524 agattattccatgaaaggtttaaaccagctaatgccacgagttt 20481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13672 - 13423
Alignment:
Q  153 ttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatg 252  Q
    ||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13672 ttcccaacatatgatgaggggccaaaagtttgtagttgagtgcttatgggaatattgccttctaagttgttgaaa-acaagttcatgtgactaagaaatg 13574  T
Q  253 tcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  13573 tcaaatttgaaaagcttgttggcattctacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattgtaaactttccatatgaccaatgttgctaggaataaa 13474  T
Q  353 tcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaaccaactaataccacaagttt 403  Q
    || | ||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||    
T  13473 tcctttgagattattccatgaaaggttgaaagcagctaatgccacgagttt 13423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35070 - 34841
Alignment:
Q  153 ttcccgacatatgcagagggatcaaaagattgtagttgagtgcttagtggaattttgccttctaagttgttgaaagacaagttcatgtaactaagaaatg 252  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  35070 ttccccacatatgaataggaatcaaaat-ttgtagttgagtgcttactggaattttgtcgtctaagttattgaaagacaagttcatgttattaagagatg 34972  T
Q  253 tcaaatttgaaaagcttgttggcattttacctgaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattccaacattttcatatgacaaatgttgttgggaatgaa 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||| | |||||||     
T  34971 tcaaatttgaaaagctcgttggcattctaccagaaagatggtttcttgacaagtcgagtgattctaacctttccatatgaccaattttgctaggaatgat 34872  T
Q  353 tcttgtgagaatattccctgaaaggtttaaa 383  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34871 tcctgtgagattattccttgaaaggtttaaa 34841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41244 - 41205
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41244 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 41205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13798 - 13759
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13798 aagctaacataaaacccaaaggttatgagcttatcttcat 13759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20863 - 20824
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20863 aagctaacataaaacccaaaggttattagcttatcttcat 20824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 31211 - 31172
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31211 aagctaacataaaacccaaaggttattagcttatcttcat 31172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35203 - 35164
Alignment:
Q  26 aagctaacataaaacccaatggttatgagcttatcttcat 65  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35203 aagctaacataaaacccaaatgttatgagcttatcttcat 35164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 578 - 793
Target Start/End: Original strand, 47882318 - 47882534
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47882318 ttgaactccgtctgttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaaggacttggtca 47882417  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||     
T  47882418 tgtacaatgaatcaagtttatttcacatagacacaacagtagtctcccttgctacctctctcaacaccttatccccaagacacaaaatgatagcactgac 47882517  T
Q  777 cgctttatcattcatct 793  Q
    |||||||||||||||||    
T  47882518 cgctttatcattcatct 47882534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 22625409 - 22625626
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  22625409 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 22625508  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  22625509 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctatcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 22625608  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22625609 cgctttatcattcatctc 22625626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 10612207 - 10612424
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10612207 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatttgataaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 10612306  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||     
T  10612307 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgatacttttctcaacaccttatccccaaaacacagaatgatagcgctgac 10612406  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10612407 cgctttatcattcatctc 10612424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10897756 - 10897539
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||    
T  10897756 ttgaactccgtcagttgctcgattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgcctatgggccaaagacttggtca 10897657  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  10897656 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 10897557  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10897556 cgctttatcattcatctc 10897539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 29913385 - 29913602
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  29913385 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 29913484  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |     
T  29913485 tgtataatgaatcaagtttattcctcatagacacagcagtagactcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctaac 29913584  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  29913585 cgccttatcattcatctc 29913602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 578 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 54189261 - 54189048
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  54189261 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 54189162  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||     
T  54189161 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtttcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacataatgatagcgctgac 54189062  T
Q  777 cgctttatcattca 790  Q
    ||| ||||||||||    
T  54189061 cgccttatcattca 54189048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 590 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16458205 - 16458000
Alignment:
Q  590 agttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaataaat 688  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||    
T  16458205 agttgctccattataggttttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaat 16458106  T
Q  689 caagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatcatt 788  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16458105 caagcttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcatt 16458006  T
Q  789 catctc 794  Q
    ||||||    
T  16458005 catctc 16458000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 6304062 - 6303845
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  6304062 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 6303963  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||     
T  6303962 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgttgac 6303863  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  6303862 cgccttatcattcatctc 6303845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 10205121 - 10205338
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  10205121 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 10205220  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  10205221 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcccctcttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 10205320  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10205321 cgccttatcattcatctc 10205338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 10098225 - 10098442
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  10098225 ttgaactccgtcaattgctccattataggttttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 10098324  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||     
T  10098325 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagccccccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacaaaatgatagcgctgac 10098424  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10098425 cgccttatcattcatctc 10098442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 33033391 - 33033175
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33033391 ttgaactccgtcagttgctccattataagtttcgactccaccattcggtaaaagta-agttgttgcttcagacattgtctatgtgccaaggacttggtca 33033293  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  33033292 tgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacagtagtagtctcccttgctacctctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcactgac 33033193  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33033192 cgctttatcattcatctc 33033175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 587 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21034610 - 21034402
Alignment:
Q  587 gtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaata 685  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||     
T  21034610 gtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagtcattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatg 21034511  T
Q  686 aatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatc 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  21034510 aatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctcttaacaccttatccccaagccacaaaatgatagcactgaccgctttatc 21034411  T
Q  786 attcatctc 794  Q
    |||||||||    
T  21034410 attcatctc 21034402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 588 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 28891505 - 28891298
Alignment:
Q  588 tcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaataa 686  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |    
T  28891505 tcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatga 28891406  T
Q  687 atcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatca 786  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  28891405 atcaagcttattccacatagacacagcattagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatca 28891306  T
Q  787 ttcatctc 794  Q
    ||||||||    
T  28891305 ttcatctc 28891298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 16756690 - 16756907
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  16756690 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 16756789  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  16756790 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 16756889  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16756890 cgccttatcattcatctc 16756907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 28328659 - 28328442
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||    
T  28328659 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggcactgtctatgtgccaaagacttggtca 28328560  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  28328559 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 28328460  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  28328459 cgccttatcattcatctc 28328442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15945409 - 15945189
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgatt---ccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttgg 673  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15945409 ttgaactccgtcagtttctccattataggttttgagtacgccaccattcagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggacttgg 15945310  T
Q  674 tcatgtacaataaatcaagtttattccacatagacac---aacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagc 770  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||||| | | || |||||||  ||||||| | |||||| ||    
T  15945309 tcatgtacgatgaatcatgtttattccacatagacacagtagtagtagtctcccttgatacctctcccaactccttatctccaagacacaaaatgatggc 15945210  T
Q  771 actgaacgctttatcattcat 791  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  15945209 actgaccactttatcattcat 15945189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 578 - 677
Target Start/End: Original strand, 4819669 - 4819769
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  4819669 ttgaactccgtcatttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 4819768  T
Q  677 t 677  Q
    |    
T  4819769 t 4819769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Original strand, 32211224 - 32211293
Alignment:
Q  440 tgagcaatattgacagaaaacatgaacgtgtctagctctggttgaaaagaataagagatatcaagagaaa 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32211224 tgagcaatattgacaggaaacatgaatacctctagctttgatcgaaaagaataagtgatatcaagagaaa 32211293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 44016095 - 44016312
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44016095 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccactattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggacttggtca 44016194  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||     
T  44016195 tgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtttcccttgctacctctctcaacaccttatcccaaagacatagaatgatagaactgac 44016294  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44016295 cgctttatcattcatctc 44016312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25352103 - 25351886
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  25352103 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 25352004  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  25352003 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 25351904  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25351903 cgctttatcattcatctc 25351886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7070546 - 7070329
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  7070546 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacattgcctatgtgccaaagacttggtca 7070447  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  7070446 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 7070347  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7070346 cgccttatcattcatctc 7070329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25406165 - 25405948
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  25406165 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 25406066  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  25406065 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 25405966  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  25405965 cgccttatcattcatctc 25405948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 3324217 - 3324434
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  3324217 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 3324316  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| || ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  3324317 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctccctttatacttctctcaacaccttgtccccaagacacagaatgatagcgctgac 3324416  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  3324417 cgccttatcattcatctc 3324434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 20054190 - 20054407
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  20054190 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 20054289  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  20054290 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 20054389  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20054390 cgctttatcattcatctc 20054407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 22716663 - 22716880
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  22716663 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtca 22716762  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  22716763 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 22716862  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22716863 cgctttatcattcatctc 22716880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 578 - 795
Target Start/End: Original strand, 28456933 - 28457151
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  28456933 ttgaactccgtcagttattccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagaattgttgtttcagacattgtctatgtgacaaggacttggtca 28457032  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  28457033 tgtacaatgaatcaagtttattccacatagaaacaacagtagtctctcatgttacctctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatggcactgat 28457132  T
Q  777 cgctttatcattcatctca 795  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28457133 cgctttatcattcatctca 28457151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2736956 - 2736739
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  2736956 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaaattgcctatgtgccaaagacttggtca 2736857  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  2736856 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctttcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 2736757  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  2736756 cgccttatcattcatctc 2736739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 39680797 - 39680580
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||    
T  39680797 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggcactgtctatgtgccaaagacttggtca 39680698  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||     
T  39680697 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccctaagacacagaatgatagcgctgac 39680598  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
     || ||||||||||||||    
T  39680597 tgccttatcattcatctc 39680580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 586 - 750
Target Start/End: Original strand, 10941948 - 10942113
Alignment:
Q  586 tgtcagttgctccattatatgttttgattccaccttcg-gtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaat 684  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| ||||||    
T  10941948 tgtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctacgtgccaaagactttgtcatatacaat 10942047  T
Q  685 aaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcc 750  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  10942048 gaatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctacctttctcaacaccttatcc 10942113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 586 - 750
Target Start/End: Original strand, 10947817 - 10947982
Alignment:
Q  586 tgtcagttgctccattatatgttttgattccaccttcg-gtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaat 684  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| ||||||    
T  10947817 tgtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctacgtgccaaagactttgtcatatacaat 10947916  T
Q  685 aaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcc 750  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  10947917 gaatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctacctttctcaacaccttatcc 10947982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22985861 - 22985792
Alignment:
Q  440 tgagcaatattgacagaaaacatgaacgtgtctagctctggttgaaaagaataagagatatcaagagaaa 509  Q
    ||||||||||||| || |||||||||    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22985861 tgagcaatattgataggaaacatgaatacctctagctttgatcgaaaagaataagtgatatcaagagaaa 22985792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Original strand, 37781103 - 37781172
Alignment:
Q  440 tgagcaatattgacagaaaacatgaacgtgtctagctctggttgaaaagaataagagatatcaagagaaa 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    |||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37781103 tgagcaatattgacaggaaacatgaatacctctaactttgatcgaaaagaataagtgatatcaagagaaa 37781172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 587 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4559050 - 4558842
Alignment:
Q  587 gtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaata 685  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||     
T  4559050 gtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtaccaagtacttggtcatgtacaatg 4558951  T
Q  686 aatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatc 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||    
T  4558950 aatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttcctacctctctccacaccttatccccaagacacagaatgatagcactaacctctttatc 4558851  T
Q  786 attcatctc 794  Q
    |||||||||    
T  4558850 attcatctc 4558842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 590 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15313057 - 15312852
Alignment:
Q  590 agttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaataaat 688  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  15313057 agttgctccattataggttttgactccatcattcgataaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataataaat 15312958  T
Q  689 caagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatcatt 788  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15312957 caagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacatcttatctccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcatt 15312858  T
Q  789 catctc 794  Q
    ||||||    
T  15312857 catctc 15312852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 588 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 16633231 - 16633023
Alignment:
Q  588 tcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaataa 686  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16633231 tcagttactccattgtgggttttgactccaccattcggtataagtagagttgttgtttcaaacattgtgtatgtgccaaggacttggtcatgtacaatga 16633132  T
Q  687 atcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatca 786  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  16633131 atcaattttatttcacatagacacatcagtagtctcccttgctgcctctctcaacaccttatccccaatacacagaatgatggcactgaccgcttcatca 16633032  T
Q  787 ttcatctca 795  Q
    |||||||||    
T  16633031 ttcatctca 16633023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 505
Target Start/End: Original strand, 26633303 - 26633389
Alignment:
Q  419 cacttatttcaacatttgttatgagcaatattgacagaaaacatgaacgtgtctagctctggttgaaaagaataagagatatcaaga 505  Q
    |||||||||||||   | ||||||  ||||||||||  ||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  26633303 cacttatttcaaccccttttatgaagaatattgacaagaaacatgaatgtctctaactctgatcgaaaagaataagtgatatcaaga 26633389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17076 - 16859
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  17076 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtca 16977  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||      
T  16976 tgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttgtccccaagacacagaatgatagcactggc 16877  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16876 cgctttatcattcatctc 16859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 587 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9522467 - 9522259
Alignment:
Q  587 gtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaata 685  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||     
T  9522467 gtcagttgctccattataggttttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatg 9522368  T
Q  686 aatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatc 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  9522367 aatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatc 9522268  T
Q  786 attcatctc 794  Q
    |||||||||    
T  9522267 attcatctc 9522259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 2400654 - 2400871
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  2400654 ttgaactctgtcagttgctccattatagattttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttagtca 2400753  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    ||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||     
T  2400754 tgtattatgaattaagtttattccatatagacacaacagtagtttcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatatcactgac 2400853  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2400854 cgctttatcattcatctc 2400871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 578 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 14997786 - 14997570
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14997786 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggacttggtca 14997687  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |     
T  14997686 tgtacaa--aatcaagtctattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctatctcaataccttatccccaagacacataatgatggcactaac 14997589  T
Q  777 cgctttatcattcatctca 795  Q
    | | |||||||||||||||    
T  14997588 cacgttatcattcatctca 14997570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 578 - 795
Target Start/End: Original strand, 31781890 - 31782109
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgtttt-gattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtc 675  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  31781890 ttgaattccgtcagttgcttcattattggtttttgactcgaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgtccaggacttggtc 31781989  T
Q  676 atgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactga 775  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  31781990 atgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgctacctctctcaacaccttatccccaagacacagaacgatggcactga 31782089  T
Q  776 acgctttatcattcatctca 795  Q
     |||||||||||||||||||    
T  31782090 tcgctttatcattcatctca 31782109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 578 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 10628110 - 10627892
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10628110 ttgaactccgtcagttgctccattatcggttttgactccaccattcggttaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaggacttggtca 10628011  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  10628010 tgcacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgctaactctctctataccgtatccccaagacacagaatgatggcactgac 10627911  T
Q  777 cgctttatcattcatctca 795  Q
     ||||||||||||||||||    
T  10627910 agctttatcattcatctca 10627892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25446238 - 25446021
Alignment:
Q  578 ttgaattctgtcagttgctccattatatgttttgattccacctt-cggtaatagtatagttgttgtttcagacattgtctatgtgctaagcacttggtca 676  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||    
T  25446238 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccacctttcgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttgatca 25446139  T
Q  677 tgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaa 776  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  25446138 tgtataatgaatcaagtttattccacatagacatagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgac 25446039  T
Q  777 cgctttatcattcatctc 794  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  25446038 cgccttatcattcatctc 25446021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 648 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 28787079 - 28786936
Alignment:
Q  648 acattgtctatgtgctaagcacttggtcatgtacaataaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacctta 747  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  28787079 acattgtctatgtgccaaagacttggccatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacctta 28786980  T
Q  748 tcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatcattcat 791  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28786979 tccccaagacacagaatgatagcactgaccgctttatcattcat 28786936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28788464 - 28788402
Alignment:
Q  587 gtcagttgctccattatatgttttgattccacc-ttcggtaatagtatagttgttgtttcaga 648  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28788464 gtcagttgctccattataggttttgactccaccgttcgataaaagtatggttgttgtttcaga 28788402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 713 - 794
Target Start/End: Original strand, 16601 - 16682
Alignment:
Q  713 cagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcctcaagacaaagaatgatagcactgaacgctttatcattcatctc 794  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16601 cagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 16682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University