View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3365_low_5 (Length: 631)

Name: NF3365_low_5
Description: NF3365
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3365_low_5
NF3365_low_5
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (11-612)||(7032075-7032664)
chr3 (15-558)||(34332651-34333194)
chr3 (56-533)||(40930389-40930866)
chr3 (15-558)||(2364038-2364581)
chr3 (275-558)||(7312797-7313080)
chr3 (275-558)||(19920065-19920348)
chr3 (275-558)||(10323407-10323690)
chr3 (279-416)||(29523723-29523860)
chr3 (279-416)||(11203844-11203981)
chr3 (279-416)||(12342204-12342340)
chr3 (279-416)||(33496572-33496709)
chr3 (15-130)||(7312538-7312653)
chr3 (468-557)||(963000-963089)
chr3 (279-416)||(19890703-19890840)
chr3 (468-527)||(3141066-3141125)
chr3 (18-133)||(10323832-10323947)
chr3 (279-348)||(7031063-7031132)
chr3 (465-526)||(48569907-48569968)
chr3 (234-357)||(2755822-2755945)
chr3 (279-361)||(963196-963278)
chr3 (468-548)||(2756056-2756136)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (15-558)||(235273-235818)
chr7 (54-558)||(17720435-17720939)
chr7 (15-558)||(47876744-47877287)
chr7 (16-558)||(11277088-11277630)
chr7 (69-554)||(37919359-37919844)
chr7 (275-558)||(4937964-4938247)
chr7 (57-558)||(29967778-29968278)
chr7 (279-417)||(18532653-18532791)
chr7 (497-535)||(27854301-27854339)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (54-558)||(9922401-9922905)
chr8 (15-558)||(13396149-13396692)
chr8 (15-554)||(41665209-41665748)
chr8 (8-558)||(8299557-8300107)
chr8 (16-558)||(32266326-32266866)
chr8 (15-558)||(7924147-7924690)
chr8 (15-558)||(171864-172407)
chr8 (264-416)||(13200133-13200285)
chr8 (279-403)||(20824321-20824445)
chr8 (240-526)||(13879355-13879641)
chr8 (279-412)||(2170367-2170500)
chr8 (279-416)||(17699507-17699644)
chr8 (8-133)||(20496838-20496963)
chr8 (16-142)||(32567517-32567643)
chr8 (279-416)||(37434157-37434294)
chr8 (465-514)||(25090598-25090647)
chr8 (279-346)||(34137011-34137078)
chr8 (269-326)||(2529901-2529958)
chr8 (274-346)||(43270470-43270542)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (15-459)||(18651169-18651613)
chr6 (15-558)||(24767265-24767803)
chr6 (186-556)||(2553569-2553939)
chr6 (273-558)||(21168218-21168503)
chr6 (15-348)||(12733886-12734219)
chr6 (15-147)||(21167986-21168118)
chr6 (275-416)||(21630085-21630226)
chr6 (55-149)||(5734486-5734580)
chr6 (279-416)||(17606312-17606449)
chr6 (279-357)||(17579118-17579196)
chr6 (279-417)||(20883010-20883148)
chr6 (468-548)||(13937914-13937994)
chr6 (279-403)||(17573646-17573770)
chr6 (279-393)||(10577250-10577364)
chr6 (477-527)||(18682401-18682451)
chr6 (497-538)||(33185678-33185719)
chr6 (279-427)||(15958780-15958928)
chr6 (279-357)||(13937725-13937803)
chr6 (465-511)||(14372874-14372920)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (15-558)||(42927892-42928435)
chr5 (54-558)||(28535511-28536015)
chr5 (54-558)||(35983627-35984131)
chr5 (16-558)||(23238145-23238688)
chr5 (15-558)||(30732150-30732693)
chr5 (254-558)||(31641512-31641815)
chr5 (17-558)||(12824962-12825503)
chr5 (15-558)||(27116997-27117540)
chr5 (275-558)||(42513741-42514024)
chr5 (15-357)||(19255159-19255502)
chr5 (16-362)||(8227788-8228134)
chr5 (54-149)||(25824811-25824906)
chr5 (275-416)||(27767063-27767204)
chr5 (279-416)||(33385352-33385489)
chr5 (240-526)||(27795469-27795755)
chr5 (279-416)||(25857402-25857539)
chr5 (279-416)||(8300160-8300297)
chr5 (279-357)||(10776789-10776867)
chr5 (15-133)||(42513481-42513599)
chr5 (8-133)||(3418537-3418662)
chr5 (468-548)||(24408142-24408222)
chr5 (279-416)||(18359070-18359207)
chr5 (468-535)||(18089620-18089687)
chr5 (468-527)||(33169872-33169931)
chr5 (15-130)||(12820213-12820328)
chr5 (279-357)||(33169683-33169761)
chr5 (275-307)||(12820036-12820068)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (15-558)||(19755023-19755571)
chr4 (15-558)||(19784235-19784783)
chr4 (15-514)||(7403674-7404177)
chr4 (15-558)||(15739982-15740525)
chr4 (15-558)||(47685731-47686274)
chr4 (15-558)||(23642427-23642970)
chr4 (225-558)||(1828376-1828709)
chr4 (275-558)||(47418825-47419108)
chr4 (275-425)||(13270860-13271010)
chr4 (15-183)||(20788491-20788658)
chr4 (279-416)||(12697838-12697975)
chr4 (279-416)||(45472687-45472824)
chr4 (264-416)||(55725664-55725816)
chr4 (15-133)||(13271152-13271270)
chr4 (280-417)||(8361126-8361263)
chr4 (279-416)||(20002750-20002887)
chr4 (269-526)||(54483027-54483284)
chr4 (15-131)||(159954-160070)
chr4 (279-514)||(2821917-2822152)
chr4 (468-527)||(46145889-46145948)
chr4 (480-523)||(48312321-48312364)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (78-558)||(41206840-41207320)
chr2 (15-425)||(4551930-4552340)
chr2 (269-357)||(12645551-12645639)
chr2 (224-336)||(15917624-15917736)
chr2 (279-526)||(40176693-40176940)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (275-558)||(11908941-11909224)
chr1 (8-558)||(35540803-35541353)
chr1 (275-558)||(6050624-6050907)
chr1 (15-472)||(51052241-51052698)
chr1 (279-416)||(16917787-16917924)
chr1 (56-149)||(6259619-6259712)
chr1 (279-416)||(43388392-43388529)
chr1 (471-557)||(2491429-2491515)
chr1 (15-115)||(26059652-26059752)
chr1 (15-149)||(4842165-4842299)
chr1 (279-348)||(47623123-47623192)
chr1 (15-120)||(13352075-13352180)
chr1 (468-520)||(31779477-31779529)
chr1 (497-557)||(22191618-22191678)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (69-558)||(3067-3556)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (15-558)||(105679-106222)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (51-412)||(11187-11548)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 504; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 612
Target Start/End: Original strand, 7032075 - 7032664
Alignment:
Q  11 cacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032075 cacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagat 7032174  T
Q  111 tgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032175 tgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacgg 7032274  T
Q  211 ccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgc 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032275 ccccgcaacctgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacaattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgc 7032374  T
Q  311 aaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactcca 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032375 aaggatagaaattttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaatta------------ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactcca 7032462  T
Q  411 cgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctcta 510  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032463 cgaacaaaatacccaccgtccagaattaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctcta 7032562  T
Q  511 ccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgccttctcaaaaactcaactctatcaaaatcaattttcacaaccgttaaaaccaaa 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7032563 ccaactcttcctcccaagcccacaaacgcctacgccaccgcaacaccttctcaaaaactcaactctatcaaaatcaattttcaccaccgttaaaaccaaa 7032662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 34333194 - 34332651
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||    
T  34333194 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatttgaagttgattgag 34333095  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||   | |||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  34333094 agtcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccc 34332995  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  34332994 acatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagcaagg 34332895  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| || | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34332894 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgta 34332795  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||||| |||  |||   ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34332794 cataatacccaccatcctgattaggtaaccaaagccatctgtctgacactgattcctgcaaagaaactgttagtaataaaaccctacactcctctaccaa 34332695  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34332694 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 34332651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 40930866 - 40930389
Alignment:
Q  56 ccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagac 155  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   | |    
T  40930866 ccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatccgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggc 40930767  T
Q  156 cataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagac 255  Q
    ||||| || || ||||| |  ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  40930766 cataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcgacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaaggc 40930667  T
Q  256 cacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactc 355  Q
    |||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  40930666 cacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactc 40930567  T
Q  356 caaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatcta 455  Q
    ||  ||  || | |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||  ||||  ||||||||||||||||    
T  40930566 catgttttgatgcaactgaggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacacaccatcctgatttggtaaccaaagccatcta 40930467  T
Q  456 tctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccac 533  Q
    | | |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40930466 tttgtcactgattcttgcaaagaaactgttagtaataaaaccctacactcctctaccaactcttcctcccaagcccac 40930389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 2364038 - 2364581
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| || |||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  2364038 gaaacacaaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 2364137  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || |||||||| | |||   |||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  2364138 agtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatccc 2364237  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  |  || ||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2364238 acatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaagg 2364337  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2364338 atagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 2364437  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2364438 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 2364537  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2364538 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 2364581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Original strand, 7312797 - 7313080
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||    
T  7312797 ttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 7312896  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7312897 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgca 7312996  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7312997 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 7313080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 19920348 - 19920065
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||| || | |  | |   ||    
T  19920348 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatgatggtgtaactgg 19920249  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19920248 ggcttctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgca 19920149  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||| ||| ||||    
T  19920148 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaacctcctacgacacctcaatgcct 19920065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10323690 - 10323407
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| | || |  | |   ||    
T  10323690 ttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatggtgtaactgg 10323591  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |  |   |||   |||| | ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  10323590 ggctgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtactgaatacccatcagcttgattaggtaactagagccatctatctaacactgaatcctgca 10323491  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10323490 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 10323407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29523860 - 29523723
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  29523860 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 29523761  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  29523760 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 29523723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 11203844 - 11203981
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  11203844 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 11203943  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||    
T  11203944 gttcctgtgatgtcaacaaatcatatacaccacgaaca 11203981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12342340 - 12342204
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  12342340 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaactttta-aagaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 12342242  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || ||| |||||    
T  12342241 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccatgaaca 12342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 33496572 - 33496709
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||   || ||| | | ||||    
T  33496572 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatattgatgaacatgaggtt 33496671  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || ||| |||||    
T  33496672 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccatgaaca 33496709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 7312538 - 7312653
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||   |||| ||| ||||| ||| |||    
T  7312538 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtgcaagaaagatcgtcgccctctcgaacaacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgag 7312637  T
Q  115 agtcgacccccaccac 130  Q
    ||||||| || |||||    
T  7312638 agtcgacacctaccac 7312653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 963089 - 963000
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcc 557  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||| || |||||    
T  963089 tcctgcaaagtaactgtaagtaataattccctacactcctctaccaattcttcctcccaaacccacaagcggcgacgccactgccacgcc 963000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 19890703 - 19890840
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  19890703 gtaggtaatcgatccctcaacaaccgcaatgcaaggatggaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 19890802  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
      ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  19890803 attcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaaca 19890840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 527
Target Start/End: Original strand, 3141066 - 3141125
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaa 527  Q
    |||||||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3141066 tcctgcaaagtaactgtaagtaatagttccctacactcctctaccaactcttcctcccaa 3141125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10323947 - 10323832
Alignment:
Q  18 acacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||    
T  10323947 acacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatcagaagttgattgagagt 10323848  T
Q  118 cgacccccaccactcc 133  Q
    |||| || ||||||||    
T  10323847 cgacacctaccactcc 10323832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7031132 - 7031063
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaa 348  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  7031132 gtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgccaaa 7031063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48569968 - 48569907
Alignment:
Q  465 gattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctccca 526  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  48569968 gattcctgcaaagagactgttagtagtaaagccctacactcctctaccaagtcctcctccca 48569907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 357
Target Start/End: Original strand, 2755822 - 2755945
Alignment:
Q  234 cgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaa 333  Q
    ||||| ||||||| ||| |  |||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |    
T  2755822 cgcgcctccaaagataagaccccacgacttgccaaattttatttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggta 2755921  T
Q  334 cctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  2755922 cctgtttgtgccaaatcaactcca 2755945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 963278 - 963196
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaatt 361  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  963278 gtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatatt 963196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 468 - 548
Target Start/End: Original strand, 2756056 - 2756136
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccac 548  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| || | |||||||    
T  2756056 tcctgcaaagtaagtgtaagtaatagttccctacactcctctacaaactcttcctcccaaacccacaagcggcgacgccac 2756136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 235818 - 235273
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||    
T  235818 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaatttgattgag 235719  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||| || || ||||| |  ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  | |    
T  235718 agtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctc 235619  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagat--tgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaa 312  Q
    |||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  235618 gcaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaa 235519  T
Q  313 ggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 412  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||  || | |   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  235518 ggatagagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 235419  T
Q  413 aacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctacc 512  Q
     ||| |||||||||| |||  ||||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  235418 tacagaatacccaccatcctgatttggtaaccaaagtcatctatctgtcactgattcctgtaaggaaactgttagtaataaaaccctacactcctctacc 235319  T
Q  513 aactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  235318 aacttttcctcccaagcccacaatcgctgacgccaccgcaacgcct 235273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 558
Target Start/End: Original strand, 17720435 - 17720939
Alignment:
Q  54 cgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcag 153  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||   |    
T  17720435 cgccctctcgaacatcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgcttgcaccaatg 17720534  T
Q  154 accataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaag 253  Q
     |||||| || || ||||| |  ||   ||| ||||||||| ||||||||||  |   ||| ||||| || ||||||  |||||| |||| ||||||||     
T  17720535 gccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcttcattcccacaactagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaat 17720634  T
Q  254 accacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaac 353  Q
     ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  17720635 gccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaac 17720734  T
Q  354 tccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatc 453  Q
    ||||| ||  || | |   | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||  | ||  |||||||| |||||    
T  17720735 tccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaacggaatacccatcatcctgagttggtaaccaaatccatc 17720834  T
Q  454 tatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaa 553  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  17720835 tatctgtcactgattcctgcaatgaaactgttagtaataaagccntaaactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaa 17720934  T
Q  554 cgcct 558  Q
    |||||    
T  17720935 cgcct 17720939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 47876744 - 47877287
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||    
T  47876744 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccatcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaataatctgaagttgattaag 47876843  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |      ||||| || || ||||| |  ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  47876844 agtcgacccctaccactcctagccatgcccgcatcaattgtcataatgcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccc 47876943  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
    ||| |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  47876944 gcatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagcaagg 47877043  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||  || | |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47877044 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccctattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataaactccacgta 47877143  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||||| |||  |||   ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  47877144 cataatacccaccatcctgattaggtaaccaaagtcatctgtctgtcactgattcctgcaaggaaactgttagtaataaaaccccacactcctctaccaa 47877243  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47877244 ctcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 47877287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 11277630 - 11277088
Alignment:
Q  16 aaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgaga 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||       || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  11277630 aaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgaatgaga 11277531  T
Q  116 gtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccg 215  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | |||||| || || ||| |    ||   | | ||||||||| |||||||||| |||  |||     
T  11277530 atcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaatttacacaagactaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccca 11277431  T
Q  216 caacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagga 315  Q
    || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  11277430 catccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaagga 11277331  T
Q  316 tagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaac 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |  | |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11277330 tagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtac 11277231  T
Q  416 aaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaac 515  Q
    | | |||||| | ||   |||   || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11277230 agagtacccatcatcatgattaggtacccaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactgttagcaataaagccctacactcctctaccaac 11277131  T
Q  516 tcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11277130 tcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 11277088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 554
Target Start/End: Original strand, 37919359 - 37919844
Alignment:
Q  69 cctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctga 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||   | |||||| || || |    
T  37919359 cctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaa 37919458  T
Q  169 aagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccag 268  Q
    ||||    ||   ||| || |||||| |||||||||| |||  ||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| || ||||     
T  37919459 aagttacacaagacaaaaataaatgattaacatcttcaacgttcccacaactagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaa 37919558  T
Q  269 attgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaaga 368  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||| || || | || |     
T  37919559 attattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttataccaaattaacttcatatgatgatgt 37919658  T
Q  369 atagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaa-taaccaaagccatctatctatcaccgat 467  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||| | | | |||| |||    
T  37919659 aattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatatactccacgcacagaatacccaccctcc-tgtttaggtaatcaaagccatatgtttgtcactgat 37919757  T
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaac 554  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37919758 tcctgcaaagaaactgttagtaataaaactctacactcctctaccaacttctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaac 37919844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 4938247 - 4937964
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||    
T  4938247 ttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactgg 4938148  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  4938147 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgagtcctgca 4938048  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4938047 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 4937964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 558
Target Start/End: Original strand, 29967778 - 29968278
Alignment:
Q  57 cctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagacc 156  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | || |||  | || || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||   | ||    
T  29967778 cctctcgaacaacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctaaggttgaatgagaatctactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggcc 29967877  T
Q  157 ataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagacc 256  Q
    ||||||| || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  ||| || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||    
T  29967878 ataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcc 29967977  T
Q  257 acgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcc 356  Q
    | | || |||| |||  |||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  29967978 atggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcctcaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcc 29968077  T
Q  357 aaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctat 456  Q
    | | || |  | |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||| | | ||   |||   || |||||||||||| |    
T  29968078 atactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtcagcatatcataggctccacgtacagagtacc-atcatcatgattaggtacccaaagccatctgt 29968176  T
Q  457 ctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgc 556  Q
    || |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  29968177 ctgtcactgattcctgcaaagaaactgttagcaataaagccctacactcctctaccaattcctcctctcaagcccataacctcctacgccaccgcaacgc 29968276  T
Q  557 ct 558  Q
    ||    
T  29968277 ct 29968278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 417
Target Start/End: Original strand, 18532653 - 18532791
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| | |  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  18532653 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcgagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 18532752  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaa 417  Q
    | || |||||||||| || |||||| || ||||||||||    
T  18532753 gttcatgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacaa 18532791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 27854339 - 27854301
Alignment:
Q  497 cctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaa 535  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27854339 cctaagctcctctaccaactcttcctcccaagcccacaa 27854301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 558
Target Start/End: Original strand, 9922401 - 9922905
Alignment:
Q  54 cgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcag 153  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  9922401 cgccctctcgaacatcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgctcgcaccaatg 9922500  T
Q  154 accataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaag 253  Q
     |||||| || || ||||| |  ||   ||| ||||||||| | |||||||| ||   ||| ||||  || ||||||  |||||| |||| ||||||||     
T  9922501 gccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaat 9922600  T
Q  254 accacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaac 353  Q
     ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  9922601 gccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaac 9922700  T
Q  354 tccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatc 453  Q
    ||||| ||  || | |   | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| | |||  | ||  |||||||| |||||    
T  9922701 tccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaacggaaaacccatcatcctgagttggtaaccaaatccatc 9922800  T
Q  454 tatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaa 553  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  9922801 tatctgtcactgattcctgcaatgaaactgttagtaataaagccctagactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaa 9922900  T
Q  554 cgcct 558  Q
    |||||    
T  9922901 cgcct 9922905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 13396149 - 13396692
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||||||    
T  13396149 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgag 13396248  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||||   | |||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  13396249 attcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccc 13396348  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13396349 acatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaagg 13396448  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| || | || | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13396449 atagatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgta 13396548  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||||| |||  |||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13396549 cagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaattgttagtaataaaaccctacactcctctaccaa 13396648  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13396649 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 13396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41665748 - 41665209
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||||||    
T  41665748 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagatcgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgag 41665649  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||   | |||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  41665648 attcaacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccc 41665549  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||   || | || |||| ||| ||||||||||||||| |||| || || | |||||| ||||||    
T  41665548 acatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagcaagg 41665449  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || | || | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  41665448 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccacata 41665349  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||||| |||  |||   ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41665348 cagaatacccaccctcctaattaggtaaccaaagtcatctgtctgtcactgattcctgtaaagaaactgttagtaataaaaccctacactcctctaccaa 41665249  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaac 554  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41665248 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaac 41665209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 558
Target Start/End: Original strand, 8299557 - 8300107
Alignment:
Q  8 cagcacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagta 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| |||||     
T  8299557 cagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagtt 8299656  T
Q  108 gattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcga 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | |||   |||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8299657 gattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaggacaaaaacaaatgagtaacatcttcga 8299756  T
Q  208 cggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgcca 307  Q
    |   ||| || |  |  |||||  | ||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8299757 caatcccacatccagcaacacataatcgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgcca 8299856  T
Q  308 tgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagact 407  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||||| |  | |   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299857 agcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccaaattatggtgtaattggggctactcctgtgatgtcagcatgtcatagact 8299956  T
Q  408 ccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcct 507  Q
    ||||| ||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8299957 ccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcct 8300056  T
Q  508 ctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8300057 ctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgccgacgccacctcaacgcct 8300107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 558
Target Start/End: Original strand, 32266326 - 32266866
Alignment:
Q  16 aaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgaga 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||       || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||    
T  32266326 aaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgaga 32266425  T
Q  116 gtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccg 215  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | ||| || || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||     
T  32266426 atcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccacaatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccca 32266525  T
Q  216 caacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagga 315  Q
    || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  32266526 catccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaagga 32266625  T
Q  316 tagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaac 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |  | |   | |||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||| ||    
T  32266626 tagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccaaattatggtgtaactgtggttgctcttgtgaagtcagca--tcataggctccacgtac 32266723  T
Q  416 aaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaac 515  Q
    | |||||||| | ||   |||   || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32266724 agaatacccatcatcatgattaggtacccaaagccatctgtctgacactgattcctgcaaagaaactgttagcaataaagccctacactcctctaccaac 32266823  T
Q  516 tcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    || |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32266824 tcctcctcccaggcccacaacctcctacgccaccgcaacgcct 32266866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 7924147 - 7924690
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || ||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  7924147 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgttgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 7924246  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || |||||||| | |||   |||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  7924247 agtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatccc 7924346  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  |  || ||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  7924347 acatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaagg 7924446  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7924447 atagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 7924546  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7924547 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 7924646  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7924647 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 7924690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 171864 - 172407
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  171864 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgcacaaaattatctgaagttgattgag 171963  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||||||||   | |||||| |||   ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||    ||    
T  171964 agtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcgtcaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattacc 172063  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||  ||||| | |||| || || ||   |||| ||  ||| |||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  172064 acagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgtcacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaagg 172163  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  ||| |  | |   ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  172164 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccattttatggtgtaactggttctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 172263  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||  ||||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  172264 cagaatacccatcatcattattaggtaaccatagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaactattagtaacaaagccctacactcctctaccaa 172363  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  172364 cttctcctcccaggcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 172407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Original strand, 13200133 - 13200285
Alignment:
Q  264 gccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattag 363  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||      
T  13200133 gccaaattgtattttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgccaaactaactccatatttt 13200232  T
Q  364 gaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    || ||| | | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  13200233 gatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacgaaca 13200285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 403
Target Start/End: Original strand, 20824321 - 20824445
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  20824321 gtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 20824420  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcata 403  Q
    | ||||||||||||| || ||||||    
T  20824421 gttcctgtgatgtcaacaagtcata 20824445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13879641 - 13879355
Alignment:
Q  240 tccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtt 339  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||  |  ||||| |||| ||  | |||||||||||| |||| ||    
T  13879641 tccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattggctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctatt 13879542  T
Q  340 tgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaa 439  Q
    ||||||| || ||||||| | |  || ||||  | ||||| || || |||||||  | |||||| || ||||||||| |||| |||||   |   |  ||    
T  13879541 tgtgccagactaactccatactttgatgaatctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacgaacagaatagccaccaatcgggtccaa 13879442  T
Q  440 taaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctccca 526  Q
    |||||| | |||||||||  | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  13879441 taaccacacccatctatcagtaacggattcctgcaaagagactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctccca 13879355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 412
Target Start/End: Original strand, 2170367 - 2170500
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  2170367 gtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 2170466  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 412  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  2170467 gttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 2170500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 17699507 - 17699644
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  17699507 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 17699606  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | || |||||||||| || |||||  || |||||||||    
T  17699607 gttcatgtgatgtcaacaagtcatgaacaccacgaaca 17699644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 20496838 - 20496963
Alignment:
Q  8 cagcacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagta 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| |||||     
T  20496838 cagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagtt 20496937  T
Q  108 gattgagagtcgacccccaccactcc 133  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  20496938 gattgagagtcgacacctaccactcc 20496963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32567643 - 32567517
Alignment:
Q  16 aaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgaga 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||       || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||    
T  32567643 aaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctcttgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgaga 32567544  T
Q  116 gtcgacccccaccactccgagccatgc 142  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32567543 atcgactcccaccactcctagccatgc 32567517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 37434157 - 37434294
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  37434157 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 37434256  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  37434257 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 37434294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 514
Target Start/End: Original strand, 25090598 - 25090647
Alignment:
Q  465 gattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25090598 gattcctgcaaagagactgttagtaataaagccctacactcctctaccaa 25090647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34137078 - 34137011
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgcca 346  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34137078 gtaggtaaacgatccatcataagccgccaagcaagaatagagactttgagaggtacctgtttatgcca 34137011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Original strand, 2529901 - 2529958
Alignment:
Q  269 attgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttg 326  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||    
T  2529901 attgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaactttg 2529958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 346
Target Start/End: Original strand, 43270470 - 43270542
Alignment:
Q  274 tttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgcca 346  Q
    |||| ||||| || |||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  43270470 ttttagtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 43270542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18651613 - 18651169
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18651613 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgag 18651514  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | |||||||| |||| |||    
T  18651513 agtcgaccccgaccactcctagccatgctcgcaccaatggcaataaggcgctaaaagttggacacacaaagaacaagtgattgacatcttcaacggtccc 18651414  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18651413 gcatccagagacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatcccacggttttccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaagg 18651314  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||  ||   |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18651313 atagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatctaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccatgta 18651214  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatcta 459  Q
    || |||||||||| |||  ||||  |||||| | |||||||||||    
T  18651213 cagaatacccaccatcctgatttggtaaccacaaccatctatcta 18651169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 24767803 - 24767265
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       ||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  24767803 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaaagaatgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 24767704  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || || ||||| || ||   ||| ||||||| | |||||||||| |||  |||    
T  24767703 agtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaattattaacatcttcaacgttccc 24767604  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
    |||||   | |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  24767603 gcaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagcaagg 24767504  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||  || | |    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24767503 atagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccatattttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 24767404  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||| | | |||  ||||  |||||| |||||||||| | ||||      || ||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24767403 cagaatacctatcatcctgatttggtaaccatagccatctatttgtcac-----tcttcaaggaaactgttagtaatacaaccctacactcctctaccaa 24767309  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  24767308 ctcttcctcccaagcccacaaccgtcgacgccaccgcaacgcct 24767265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 186 - 556
Target Start/End: Original strand, 2553569 - 2553939
Alignment:
Q  186 aacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggta 285  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||| || |  || |||||| || |||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  2553569 aacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggta 2553668  T
Q  286 accgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctg 385  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |  | |   |||| ||||| ||    
T  2553669 accgatctttcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcttg 2553768  T
Q  386 tgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgtt 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||   |||   ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  2553769 tgatgtcagcatatcatagactccacgtacagaatacccaccatcatgattaggtaatcaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactgtt 2553868  T
Q  486 agtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgc 556  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2553869 agtaataaagccctacactcctttaccaacttctactcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgc 2553939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 273 - 558
Target Start/End: Original strand, 21168218 - 21168503
Alignment:
Q  273 ttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatag 372  Q
    |||||||||||||| |||||   || ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||| |  | |       
T  21168218 ttttttgtaggtaatcgatcttgcaaaagtctccaagctaggatagatactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaact 21168317  T
Q  373 ggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctg 472  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||   |||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  21168318 ggggctgctcctgtgatgtcaacatatcatagactccacgtacagaatacccaccatcatgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactgattcctg 21168417  T
Q  473 caatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21168418 caaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 21168503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 12733886 - 12734219
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  12733886 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgag 12733985  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  || |||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  12733986 agtcgacccctaccactcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattccc 12734085  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || || || |||||  ||||| | |||| || || ||  |||||  |  ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12734086 acatctagaaacacataaccgctcctccagagatagaatgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaagg 12734185  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaa 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12734186 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaa 12734219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 21167986 - 21168118
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  21167986 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtctccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 21168085  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgca 147  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21168086 aatcgacccccaccactcctagccatgctcgca 21168118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21630226 - 21630085
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||  ||||||| |||  || ||| | |     
T  21630226 ttttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgccaaattaactccatattttgatgaacatga 21630127  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  21630126 ggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 21630085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5734580 - 5734486
Alignment:
Q  55 gccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcacc 149  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  5734580 gccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccttaccactccaagccatgctcgcacc 5734486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17606449 - 17606312
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | | ||    
T  17606449 gtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgagatt 17606350  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  17606349 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 17606312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17579196 - 17579118
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  17579196 gtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 17579118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20883148 - 20883010
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| | ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  20883148 gtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctatttatgccagattaactccatattttgatgaacatgtggtt 20883049  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaa 417  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20883048 gttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaa 20883010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 548
Target Start/End: Original strand, 13937914 - 13937994
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccac 548  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||    
T  13937914 tcctgcaaagtaactgtaagtaataattccctacactcctctaccaactcttcctcccaaacccacaagcggcgacgccac 13937994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17573770 - 17573646
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  ||  || | | ||||    
T  17573770 gtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgataaacatgaggtt 17573671  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcata 403  Q
    | ||||||||||||| || ||||||    
T  17573670 gttcctgtgatgtcaacaagtcata 17573646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10577364 - 10577250
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | |||  || ||| | | ||||    
T  10577364 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactctatattttgatgaacatgaggtt 10577265  T
Q  379 gctcctgtgatgtca 393  Q
    | |||||||||||||    
T  10577264 gttcctgtgatgtca 10577250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18682451 - 18682401
Alignment:
Q  477 gtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaa 527  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18682451 gtaactgtgagtaatagagccctacactcctctgccaactcttcctcccaa 18682401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 538
Target Start/End: Original strand, 33185678 - 33185719
Alignment:
Q  497 cctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacg 538  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33185678 cctacactcctctaccaactcttcctcccatgtccacaaacg 33185719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15958928 - 15958780
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||| || ||| ||| | |   |  |||    
T  15958928 gtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgccatattaacttcatatttggatgtaactgaagtt 15958829  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccacc 427  Q
    | ||||||||||||||||||||| | || || |||||  ||||||||||    
T  15958828 gttcctgtgatgtcagcatgtcagacacaccgcgaactgaatacccacc 15958780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 13937725 - 13937803
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13937725 gtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactcca 13937803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 465 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14372920 - 14372874
Alignment:
Q  465 gattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctac 511  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14372920 gattcctgcaaagaaactgtcagtaataaagccctacactcctctac 14372874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 42927892 - 42928435
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  42927892 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaatgaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 42927991  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || || ||||| || ||   ||||||||||||| | |||||||| |||  |||    
T  42927992 agtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcactaaaagttggacatgacaagaacaaatgattgacatcttcaacgttccc 42928091  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
    ||| |  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||  || | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  42928092 gcatccagagacacacaaccgcacctccaagggtaaaatgccacagtttgtcaaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaaacaagg 42928191  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||| ||| | |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42928192 atagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatttggatgtaactggggctgttcctgcgatgtcagcatgtcatagactccacgta 42928291  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||||| |||  ||||  |||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||   ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42928292 cagaatacccaccatcctgatttggtaaccacaaccatctatctgtcactgattcctgtaaaaaaacggtaagtaataaaaccctacactcctctaccaa 42928391  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  42928392 ctcttcctcccaagcccacaaccgccgacgccactgcaacgcct 42928435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 28536015 - 28535511
Alignment:
Q  54 cgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcag 153  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||   |    
T  28536015 cgccctctcgaacaaccagcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgcccgcaccattg 28535916  T
Q  154 accataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaag 253  Q
     |||||| || || ||||| |  ||   ||| |||||||||   |||||||| ||   ||| ||||  || ||||||  | |||| |||||||||||||     
T  28535915 gccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatctgcgcctccaaaggtaaaat 28535816  T
Q  254 accacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaac 353  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  28535815 gccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaac 28535716  T
Q  354 tccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatc 453  Q
    ||||  ||  || | |   | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||| ||| |||  | ||  ||||||||||||||    
T  28535715 tccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccatgtacagagtacctaccatcctgagttggtaaccaaagccatc 28535616  T
Q  454 tatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaa 553  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  28535615 tatctgtcattgattcctgcaatgaaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctctcaagcccacaaccacctacgccacctcaa 28535516  T
Q  554 cgcct 558  Q
    |||||    
T  28535515 cgcct 28535511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35984131 - 35983627
Alignment:
Q  54 cgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcag 153  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||   |    
T  35984131 cgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcataaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagtcatgcccgcaccattg 35984032  T
Q  154 accataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaag 253  Q
     |||||| || || ||||| |  ||   ||| ||||||||| | ||| |||| ||   ||| ||||   | |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  35984031 gccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacaacttctacattcccacaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaat 35983932  T
Q  254 accacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaac 353  Q
      || | || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||  |||    
T  35983931 gtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaac 35983832  T
Q  354 tccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatc 453  Q
    ||||  ||  || | |   | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||  ||||  |||||||||| |||    
T  35983831 tccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgtacagagtacccaccatcctgatttggtaaccaaagctatc 35983732  T
Q  454 tatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaa 553  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  35983731 tatctgtcactgattcctgtaatgaaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcctcctcctaagcccacaaccgcctacgccacctcaa 35983632  T
Q  554 cgcct 558  Q
    |||||    
T  35983631 cgcct 35983627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 558
Target Start/End: Original strand, 23238145 - 23238688
Alignment:
Q  16 aaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgaga 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||       || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||    
T  23238145 aaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatcagacgttgaatgaga 23238244  T
Q  116 gtcgac-ccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   | |||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  23238245 atcgactccccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccc 23238344  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  23238345 acatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagctaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaagg 23238444  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||| |  | |   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23238445 atagaaactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgttagcatatcatagactccacgta 23238544  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || | |||||| | ||   |||   || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23238545 cagagtacccatcatcatgattaggtacccaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactgttagcaataaagccctacactcctctaccaa 23238644  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23238645 ctcctcctccctggcccacaacctcctacgccaccgcaacgcct 23238688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30732693 - 30732150
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||| |||    
T  30732693 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgag 30732594  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || ||||| || | |||  ||||||||   | | |||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  30732593 agtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggctataatgcaccaaaagttgtacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatccc 30732494  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  30732493 acatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaag 30732394  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30732393 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 30732294  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30732293 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 30732194  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30732193 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 30732150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 254 - 558
Target Start/End: Original strand, 31641512 - 31641815
Alignment:
Q  254 accacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaac 353  Q
    |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||    
T  31641512 accacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaac 31641610  T
Q  354 tccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatc 453  Q
    ||||  ||  || | |   | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||| | |||  | ||  |||||||| |||||    
T  31641611 tccatgttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatatgctccacgaacggaatatccatcatcctgagttggtaaccaaatccatc 31641710  T
Q  454 tatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaa 553  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  31641711 tatctgtcactgattcctgcaatgaaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaa 31641810  T
Q  554 cgcct 558  Q
    |||||    
T  31641811 cgcct 31641815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 558
Target Start/End: Original strand, 12824962 - 12825503
Alignment:
Q  17 aacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagag 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||| |||||    
T  12824962 aacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagag 12825061  T
Q  117 tcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgc 216  Q
    ||||| || ||||| || | |||  ||||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||   ||| |    
T  12825062 tcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccac 12825161  T
Q  217 aacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggat 316  Q
    | |  || |||||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12825162 atccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggat 12825261  T
Q  317 agaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | | |||||||||||||| ||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12825262 acatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtgca 12825361  T
Q  417 aaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaact 516  Q
     |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12825362 gaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaact 12825461  T
Q  517 cttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12825462 cctcatcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 12825503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 27117540 - 27116997
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  27117540 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaaccgacataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgag 27117441  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||| ||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  27117440 agtcgacccctaccactcctaaccaatcccacaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattccc 27117341  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||  ||||| | |||| || || ||  ||||| ||  ||| |||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27117340 acagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaagg 27117241  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27117240 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggatctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 27117141  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||  ||||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27117140 cagaatacccatcatcattattaggtaaccatagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 27117041  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27117040 cccctcctcccaggcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 27116997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Original strand, 42513741 - 42514024
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||    
T  42513741 ttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactgg 42513840  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  42513841 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgagtcctgca 42513940  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42513941 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 42514024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19255502 - 19255159
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       ||||| |||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||    
T  19255502 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaatgatcgtcgcaatctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtttgag 19255403  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||| || |  ||||| || ||   ||||||||||||| | |||||||| |||  |||    
T  19255402 aatcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatgtccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgccc 19255303  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgc-atccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaag 313  Q
    ||| |  | ||||||| |||||||  ||||| || | ||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  19255302 gcatccagtgacacacaaccgcgcgctccaagggaataatgccacaatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaagcaag 19255203  T
Q  314 gatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| |||||||  |||||||    
T  19255202 gatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaattaactcca 19255159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Original strand, 8227788 - 8228134
Alignment:
Q  16 aaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgaga 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||       || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||    
T  8227788 aaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgaga 8227887  T
Q  116 gtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccg 215  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | |||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  | |     
T  8227888 atcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctca 8227987  T
Q  216 caacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagga 315  Q
    || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||   |||| || |||| |||  |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  8227988 catccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaagga 8228087  T
Q  316 tagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaatta 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||    
T  8228088 tagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaactccatatta 8228134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Original strand, 25824811 - 25824906
Alignment:
Q  54 cgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcacc 149  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25824811 cgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcacc 25824906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 27767063 - 27767204
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | |     
T  27767063 ttttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatga 27767162  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  27767163 ggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 27767204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33385489 - 33385352
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||||| | ||||    
T  33385489 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaatatgaggtt 33385390  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  33385389 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 33385352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 526
Target Start/End: Original strand, 27795469 - 27795755
Alignment:
Q  240 tccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtt 339  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||  ||| ||||| || ||||||||||  |  ||||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||    
T  27795469 tccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattggctttagtaggcaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctgtt 27795568  T
Q  340 tgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaa 439  Q
    ||||||| || ||||||| | | ||| ||||  | ||||| || || |||||||  | |||||| || ||||||||| |||| |||||   |   |  ||    
T  27795569 tgtgccagactaactccatacttggatgaatctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacgaacagaatagccaccaatcgggtccaa 27795668  T
Q  440 taaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctccca 526  Q
    |||||| | |||||||||  | || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27795669 taaccacacccatctatcagtaacggattcctccaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctccca 27795755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25857539 - 25857402
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  25857539 gtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacaagaggtt 25857440  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || ||||||  | |||||||||    
T  25857439 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccacgaaca 25857402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8300297 - 8300160
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  8300297 gtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 8300198  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || ||||||  | |||||||||    
T  8300197 gttcctgtgatgtcaacaggtcatatgcaccacgaaca 8300160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 10776789 - 10776867
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  10776789 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactcca 10776867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 42513481 - 42513599
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  42513481 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 42513580  T
Q  115 agtcgacccccaccactcc 133  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  42513581 agtcgacacctaccactcc 42513599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 3418537 - 3418662
Alignment:
Q  8 cagcacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagta 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| |||||     
T  3418537 cagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagtt 3418636  T
Q  108 gattgagagtcgacccccaccactcc 133  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  3418637 gattgagagtcgacacctaccactcc 3418662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 548
Target Start/End: Original strand, 24408142 - 24408222
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccac 548  Q
    |||||||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  24408142 tcctgcaaagtaactgtaagtaatagttccctacactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaagcgacgacgccac 24408222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18359207 - 18359070
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| | |  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  18359207 gtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaaggaacctgtttatgctagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 18359108  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  18359107 gttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaaca 18359070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18089687 - 18089620
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaa 535  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18089687 tcctgcaatgtaactgtaagtaaaagatccctacactcctctatcaacttttcctcccaagcccacaa 18089620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 527
Target Start/End: Original strand, 33169872 - 33169931
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaa 527  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33169872 tcctgcaaagtaactgtaagtaataattccctacactcctctaccaactcgtcctcccaa 33169931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12820328 - 12820213
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||       || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||| |||    
T  12820328 gaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgag 12820229  T
Q  115 agtcgacccccaccac 130  Q
    ||||||| || |||||    
T  12820228 agtcgacacctaccac 12820213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 33169683 - 33169761
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33169683 gtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactcca 33169761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12820068 - 12820036
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgcca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12820068 ttttgtaggtaaccgatccctcataagtcgcca 12820036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 19755023 - 19755571
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || |||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||    
T  19755023 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgag 19755122  T
Q  115 agtcgaccccca--ccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcc 212  Q
    | |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||   |||||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |    
T  19755123 attcgacccctataccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctc 19755222  T
Q  213 ccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagac---cacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatg 309  Q
    || || |  || |||||| ||||||| ||||||||||| | |    |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19755223 ccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaag 19755322  T
Q  310 caaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactcc 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || | || |||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19755323 caaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcatagacccc 19755422  T
Q  410 acgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctct 509  Q
    ||| ||| |||||||||| |||  |||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19755423 acgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactattagtaataaaaccctacactcctct 19755522  T
Q  510 accaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19755523 accaactcctcctcctaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 19755571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 19784783 - 19784235
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || |||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||    
T  19784783 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgag 19784684  T
Q  115 agtcgaccccca--ccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcc 212  Q
    | |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||   |||||||| || || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  |    
T  19784683 attcgacccctataccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctc 19784584  T
Q  213 ccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagac---cacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatg 309  Q
    || || |  || |||||| ||||||| ||||||||||| | |    |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19784583 ccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaag 19784484  T
Q  310 caaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactcc 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || | || |||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19784483 caaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcatagacccc 19784384  T
Q  410 acgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctct 509  Q
    ||| ||| |||||||||| |||  |||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19784383 acgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactattagtaataaaaccctacactcctct 19784284  T
Q  510 accaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19784283 accaactcctcctcctaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 19784235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 514
Target Start/End: Original strand, 7403674 - 7404177
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  7403674 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaaagaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 7403773  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||| || || ||||| || ||   ||| ||||||||| | |||||||| |||  |||    
T  7403774 agtcgacccctaccactccgagccatgcccacaccaatggccataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgttccc 7403873  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7403874 gcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccacggtttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaagg 7403973  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||  |||| || |||  || | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7403974 atagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 7404073  T
Q  415 caaaatacccaccgtccat----atttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctcta 510  Q
    || |||||||||| | |||    ||||  |||||| | |||||||| | |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  7404074 cagaatacccaccatgcatcctgatttggtaaccataaccatctatttgtcactgattcttgcaaggaaactgtaagtaataaaaccctacacttctcta 7404173  T
Q  511 ccaa 514  Q
    ||||    
T  7404174 ccaa 7404177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Original strand, 15739982 - 15740525
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  15739982 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtctccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 15740081  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||   | |||||| || |  |||||  | ||   ||| ||||||||| |||||||||  ||   |||    
T  15740082 aatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttagacaagacaaaaacaaatgattaacatctttaacattccc 15740181  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||  | | || ||| |||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||    
T  15740182 acacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggcttgtcaaattattttttgtaggtaaccgatctcgcaaaagtctccaagcaagg 15740281  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |  | |   |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  15740282 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtcaacatatcatagactccacgta 15740381  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||||| ||   |||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15740382 cagaatacccaccatcatgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactgattcctgcaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaa 15740481  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  15740482 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctatgccactgcaacgcct 15740525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 47686274 - 47685731
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || | |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  47686274 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtgaaagaaagaccgtcaccctcttgaacaacctgcataattaataaattgcaccaaatgatctgaagttgattgag 47686175  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||||||||   | |||||| || || ||||| |  ||   ||| |||||| ||| ||||||||||||   |||    
T  47686174 agtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaacgagaaacatcttcgacattccc 47686075  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||  ||||| | |||| || |||||  ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  47686074 acatccagaaacacataaccgctcctccacagataaaatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaagg 47685975  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||| |||| |  | |    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47685974 atagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaagtccagattatggtgtaacttgggctgctcttgtgatgtcagcatgtcgtagactccacgaa 47685875  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||   |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47685874 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccaaagccatctgtctatcaccgattcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 47685775  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| ||| ||||    
T  47685774 ctcctcctcccaagcccacagccgcccacgccacctcaatgcct 47685731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 23642970 - 23642427
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  23642970 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 23642871  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || |||||||| | |||   |||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  23642870 agtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatccc 23642771  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  |  || ||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  23642770 acatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaagg 23642671  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23642670 atagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 23642571  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23642570 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 23642471  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23642470 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 23642427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 225 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 1828709 - 1828376
Alignment:
Q  225 acacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactt 324  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| |||  ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1828709 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctccaagcaaggatagatactt 1828610  T
Q  325 tgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaataccc 424  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| || | |   |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||  |||||||    
T  1828609 tgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatatcataggctccacgtacggaataccc 1828510  T
Q  425 accgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcc 524  Q
    ||| ||   |||   ||||||||||||| | ||  |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  1828509 accatcatgattaggtaaccaaagccatttgtcagtcactgaatcctgcaaagaaactgttagtaataaagccctccactcctctaccaactcctcctcc 1828410  T
Q  525 caagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  1828409 caagcccacaaccgcctatgccaccacaacgcct 1828376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Original strand, 47418825 - 47419108
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| | || |  | |   ||    
T  47418825 ttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatggtgtaactgg 47418924  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |  |   |||   |||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  47418925 ggctgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtactgaatacccatcagcttgattaggtaaccagagccatctatctaacactgaatcctgca 47419024  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47419025 aagaaattgttagtaacaaagccctacactcctctaccacctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccaccgcaacgcct 47419108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13271010 - 13270860
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||    
T  13271010 ttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactgg 13270911  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaataccca 425  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13270910 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaataccca 13270860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20788658 - 20788491
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  20788658 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaa-gatcgttgccctctcgaacaacctacataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgag 20788560  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacacca 183  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   | |||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  20788559 agtcgaccccgaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcgctaaaagttggacacacca 20788491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 12697838 - 12697975
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  || | || |||  || ||| | | ||||    
T  12697838 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaatttcatattttgatgaacatgaggtt 12697937  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  12697938 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 12697975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472687
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | |||     
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtg 45472725  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  45472724 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 55725816 - 55725664
Alignment:
Q  264 gccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattag 363  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||      
T  55725816 gccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactccatatttt 55725717  T
Q  364 gaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    ||  || | | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||| |||||    
T  55725716 gataaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccatgaaca 55725664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13271270 - 13271152
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  13271270 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 13271171  T
Q  115 agtcgacccccaccactcc 133  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  13271170 agtcgacacctaccactcc 13271152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 417
Target Start/End: Original strand, 8361126 - 8361263
Alignment:
Q  280 taggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttg 379  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | |||||    
T  8361126 taggtaaacgattcctcagcagtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggttg 8361225  T
Q  380 ctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaa 417  Q
     |||||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  8361226 ttcctgtgatggcaacaaatcatatacaccacgaacaa 8361263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 20002750 - 20002887
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||||  ||||||| |||  ||  || | | ||||    
T  20002750 gtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaacttttaaaagaacctgtttatgccaaattaactccatattttgattaacatgaggtt 20002849  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | || |||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  20002850 gttcgtgtgatgtcaacatgtcataaacaccacgaaca 20002887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 54483284 - 54483027
Alignment:
Q  269 attgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaaga 368  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||  |  ||||| |||| ||  | |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |  || ||    
T  54483284 attggttttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatactttgatga 54483185  T
Q  369 atagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgatt 468  Q
    ||  | ||||| || || |||||||  | |||||| || |||| |||| |||| |||||   |  ||  |||||||| | |||||||||  | || ||||    
T  54483184 atctgaggttgttcatgcgatgtcaataagtcatataccccacaaacataatagccaccaatcggatccaataaccacacccatctatcagtaacggatt 54483085  T
Q  469 cctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctccca 526  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  54483084 cctgcaaagagactgttagtaataaacccctacactcctctaccaaatcctcctccca 54483027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 160070 - 159954
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  160070 gaaacacaaaacaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 159971  T
Q  115 agtcgacccccaccact 131  Q
    ||||||| || ||||||    
T  159970 agtcgacacctaccact 159954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 2822152 - 2821917
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||| ||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||  || ||||| | ||||    
T  2822152 gtaggtaagcgatccctcaacaatcgccaagcatggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagattaactccatattttgatgaatatgaggtt 2822053  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgt 478  Q
    | |||| |||||||| || |||||| || ||| |||||  ||| |||||   |  ||    |||||| | |||||| ||  | || ||||||||||| |     
T  2822052 gttcctatgatgtcaacaagtcatataccccatgaacagtatagccaccaatcggatccggtaaccacacccatctgtcagtaacagattcctgcaaaga 2821953  T
Q  479 aactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2821952 gactgttagtattaaagccctacactcctctaccaa 2821917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 527
Target Start/End: Original strand, 46145889 - 46145948
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaa 527  Q
    |||||||| |||||||| |||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  46145889 tcctgcaaagtaactgtaagtaatagttccctacactcctctgccaactcttcctcccaa 46145948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 523
Target Start/End: Original strand, 48312321 - 48312364
Alignment:
Q  480 actgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctc 523  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48312321 actgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctc 48312364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 558
Target Start/End: Original strand, 41206840 - 41207320
Alignment:
Q  78 ttaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggc 177  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |   | |||||| || |  ||||| || |    
T  41206840 ttaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtctgagagtcaacccctaccactccgagccatgcccgcatcaatggccataaggcaccaaaagttggac 41206939  T
Q  178 acaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttt 277  Q
    |   ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| |  | ||||||| ||||||| ||||| || | ||  |||||||| |||| ||| |||||    
T  41206940 aagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataatgccacgatttgccaaattattttt 41207039  T
Q  278 tgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||| | |   | ||     
T  41207040 tgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttggatgtaactgagga 41207139  T
Q  378 tgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatg 477  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||  || |  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  41207140 tgttcctgcgatgtcagcatgtcataaactccacatactgaatacccaccatcctgatctggtaaccacaaccatctatctgccactgattcctgcaagg 41207239  T
Q  478 taactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
     |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||  |||||||||    
T  41207240 aaactgtaaataataaaaccctacactcctctaccaactcttcctcccatgcccacaaccgacgacgccattgcaacgcct 41207320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 425
Target Start/End: Original strand, 4551930 - 4552340
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||| |||    
T  4551930 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgag 4552029  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || ||||| || | |||  ||||||||   |  ||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||| ||||||   |||    
T  4552030 agtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggtcataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacattttcgacaatccc 4552129  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4552130 acatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaagg 4552229  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4552230 atagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 4552329  T
Q  415 caaaataccca 425  Q
    || ||||||||    
T  4552330 cagaataccca 4552340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Original strand, 12645551 - 12645639
Alignment:
Q  269 attgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 357  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  12645551 attgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgccaaattaactcca 12645639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 15917624 - 15917736
Alignment:
Q  224 gacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaact 323  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||    
T  15917624 gacacacaaccgcacttccaaaggaataataccacgatttgccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagact 15917723  T
Q  324 ttgagaggaacct 336  Q
    || ||||||||||    
T  15917724 ttcagaggaacct 15917736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 526
Target Start/End: Original strand, 40176693 - 40176940
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||| | ||||    
T  40176693 gtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatattttgatgaatatgaggtt 40176792  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgt 478  Q
    | |||||||||||||  | |||||| || ||| ||||| |||| ||||    |  ||    |||||  | |||||| ||  |  | ||||||||||| |     
T  40176793 gttcctgtgatgtcaataagtcatataccccatgaacagaatagccacaaatcggatccggtaaccgcacccatctgtcagtatcagattcctgcaaaga 40176892  T
Q  479 aactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctccca 526  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  40176893 gactgttagtaataaagccctacactcctctaccaagtcctcctccca 40176940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 11909224 - 11908941
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||    
T  11909224 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaatgatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 11909125  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11909124 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtatagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgca 11909025  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11909024 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 11908941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 558
Target Start/End: Original strand, 35540803 - 35541353
Alignment:
Q  8 cagcacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagta 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| |||||     
T  35540803 cagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagtt 35540902  T
Q  108 gattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcga 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | |||   |||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35540903 gattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcga 35541002  T
Q  208 cggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgcca 307  Q
    |   ||| || |  |  || ||  | ||  | |||| || || ||  |||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35541003 caatcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgcca 35541102  T
Q  308 tgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagact 407  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541103 agcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagact 35541202  T
Q  408 ccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcct 507  Q
    ||||||||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35541203 ccacgaacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgattcctgcaaaaaaactgttagtaacaaagccctacactcct 35541302  T
Q  508 ctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  35541303 ctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgccgacgccacctcaacgcct 35541353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Original strand, 6050624 - 6050907
Alignment:
Q  275 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaataggg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   ||    
T  6050624 ttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactgg 6050723  T
Q  375 ggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 474  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  6050724 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgagtcctgca 6050823  T
Q  475 atgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6050824 aagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 6050907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Original strand, 51052241 - 51052698
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||| |||    
T  51052241 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgag 51052340  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || ||||| || | |||  ||||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  51052341 agtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatccc 51052440  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  || |||||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51052441 acatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaagg 51052540  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51052541 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 51052640  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctg 472  Q
    || |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  51052641 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctg 51052698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16917924 - 16917787
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | | ||||    
T  16917924 gtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacaagaggtt 16917825  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || ||||||  | |||||||||    
T  16917824 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccacgaaca 16917787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 6259619 - 6259712
Alignment:
Q  56 ccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcacc 149  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6259619 ccctctcgaacaacctacgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacc 6259712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 43388392 - 43388529
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggtt 378  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||  || ||| | |  |||    
T  43388392 gtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaagtt 43388491  T
Q  379 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaaca 416  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  43388492 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaaca 43388529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 557
Target Start/End: Original strand, 2491429 - 2491515
Alignment:
Q  471 tgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcc 557  Q
    ||||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||    
T  2491429 tgcaaagtaactgtaagtaatagtaccctacactcctctaccaactcttcctcccaagcccacaaacgacgacgccactgccacgcc 2491515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 26059652 - 26059752
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  26059652 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcaccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 26059751  T
Q  115 a 115  Q
    |    
T  26059752 a 26059752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 4842165 - 4842299
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || |||| |||| | || ||||| |||| ||||||||||    ||| ||| ||||| |||||||    
T  4842165 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaatgaataaattgctgacaatgatctgaagttgattgag 4842264  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcacc 149  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4842265 attcgacccctaccactcctagccatgcccgcacc 4842299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47623192 - 47623123
Alignment:
Q  279 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaa 348  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  47623192 gtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaa 47623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Original strand, 13352075 - 13352180
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||       || || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||     
T  13352075 gaaacacaaagcaaccaaataaagtgaaaaaatgaacgtcgctctctcgaacaacctgcataattaataaattacaaaaaatgatctgaagttgattgat 13352174  T
Q  115 agtcga 120  Q
    ||||||    
T  13352175 agtcga 13352180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 520
Target Start/End: Original strand, 31779477 - 31779529
Alignment:
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttc 520  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  31779477 tcctgcaatgtaactgtgagtaatagttccctacactcctctaccaactcttc 31779529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22191678 - 22191618
Alignment:
Q  497 cctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcc 557  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  22191678 cctacactcccctaccaactcctcctcccatgcccacaaccgcctacgccactgccacgcc 22191618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 558
Target Start/End: Original strand, 3067 - 3556
Alignment:
Q  69 cctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctga 168  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||   | |||||| || || |    
T  3067 cctgcgtaattgataaattgcaaaaaatgatctgagatagaatgagagtcgactcccaccactcctaaccatgctcgcaccattggccataatgcactaa 3166  T
Q  169 aagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccag 268  Q
    ||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  ||| || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||| | || ||||     
T  3167 aagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgccaa 3266  T
Q  269 attgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaaga 368  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |  |     
T  3267 attgcttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgt 3366  T
Q  369 atagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccatatttaa-taaccaaagccatctatctatcaccgat 467  Q
    |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| | || ||  |||  || |||||||||||| ||| |||| |||    
T  3367 aactagggttgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtactgagtacccatcatc-atggttaggtacccaaagccatctgtctgtcactgat 3465  T
Q  468 tcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaactcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3466 tcctgtaaagaaactgttagtaataaagccctacactcctctaccaactcctcctcccaggcccacaacctcctacgccaccgcaacgcct 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 106222 - 105679
Alignment:
Q  15 gaaacacaaagtaaccaaatcaagtgnnnnnnngatcgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||    
T  106222 gaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgag 106123  T
Q  115 agtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggcccc 214  Q
    ||||||| || |||||||| | |||   |||||||   | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  106122 agtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatccc 106023  T
Q  215 gcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaagg 314  Q
     || |  |  || ||  ||||| | |||| || || ||  |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  106022 acatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaagg 105923  T
Q  315 atagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaa 414  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| |||| |  | |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  105922 atagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgta 105823  T
Q  415 caaaatacccaccgtccatatttaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgcaatgtaactgttagtaataaagccctaaactcctctaccaa 514  Q
    || |||||||| | ||   |||   |||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  105822 cagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaactgttagtaacaaagccctacactcctctaccaa 105723  T
Q  515 ctcttcctcccaagtccacaaacgcctacgccaccgcaacgcct 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  105722 ctcctcctcccaagcccacaaccgcctacgccacctcaacgcct 105679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11187
Alignment:
Q  51 cgccgccctctcgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccg 150  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||     
T  11548 cgccgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcacca 11449  T
Q  151 cagaccataaagcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacttgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaa 250  Q
      | |||||| || |  ||||| |  ||   ||| |||||||||  ||||| ||||||   ||| || |  || |||||  ||||| | |||| || ||     
T  11448 tcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgaaaaacattttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatag 11349  T
Q  251 aagaccacgattcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtttgtgccaaacc 350  Q
    ||  ||||| || |||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  11348 aatgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 11249  T
Q  351 aactccaaattaggaagaatagggggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 412  Q
    || |||| |||| |  | |   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11248 aagtccagattatggtgtagctgggtctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 11187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University