View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3375_high_39 (Length: 239)

Name: NF3375_high_39
Description: NF3375
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3375_high_39
NF3375_high_39
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (85-231)||(32766217-32766364)
chr2 (85-231)||(31091506-31091652)
chr2 (89-231)||(32764940-32765081)
chr2 (85-231)||(21733750-21733899)
chr2 (88-228)||(31090165-31090305)
chr2 (133-231)||(14704052-14704149)
chr2 (85-231)||(17330209-17330355)
chr2 (86-224)||(24459432-24459570)
chr2 (90-231)||(34037652-34037793)
chr2 (89-231)||(2910102-2910244)
chr2 (88-229)||(40000315-40000456)
chr2 (85-231)||(24458058-24458204)
chr2 (85-229)||(39016364-39016506)
chr2 (85-224)||(5914978-5915117)
chr2 (108-231)||(17466807-17466930)
chr2 (86-231)||(7073638-7073783)
chr2 (85-229)||(2911468-2911616)
chr2 (94-221)||(38853762-38853889)
chr2 (119-229)||(33161799-33161909)
chr2 (107-224)||(5914324-5914441)
chr2 (119-228)||(7412124-7412233)
chr2 (139-231)||(17466093-17466185)
chr2 (89-216)||(34582664-34582791)
chr2 (134-228)||(37607149-37607243)
chr2 (85-231)||(39015003-39015149)
chr2 (148-231)||(38984967-38985051)
chr2 (85-231)||(31814323-31814467)
chr2 (80-197)||(8420006-8420123)
chr2 (89-221)||(38854791-38854923)
chr2 (89-221)||(31443234-31443365)
chr2 (156-231)||(39999022-39999096)
chr2 (174-228)||(10728990-10729044)
chr2 (174-220)||(26586285-26586331)
chr2 (137-198)||(12746213-12746274)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (85-231)||(32898424-32898570)
chr8 (85-231)||(35177393-35177539)
chr8 (85-231)||(35178784-35178929)
chr8 (86-231)||(10407563-10407708)
chr8 (89-231)||(5738002-5738144)
chr8 (80-231)||(1952949-1953099)
chr8 (89-231)||(5965421-5965563)
chr8 (79-186)||(41753990-41754097)
chr8 (85-231)||(41754776-41754919)
chr8 (148-231)||(45476223-45476306)
chr8 (133-231)||(28619035-28619133)
chr8 (85-231)||(30134564-30134710)
chr8 (148-231)||(5736903-5736986)
chr8 (157-231)||(45476542-45476616)
chr8 (89-231)||(59554-59696)
chr8 (150-231)||(10406269-10406350)
chr8 (139-231)||(28524810-28524902)
chr8 (89-221)||(43539107-43539239)
chr8 (155-222)||(32565696-32565763)
chr8 (138-192)||(41121160-41121214)
chr8 (133-198)||(12637770-12637835)
chr8 (179-231)||(41122730-41122782)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (85-229)||(10332984-10333128)
chr1 (85-231)||(9339644-9339790)
chr1 (85-231)||(32665749-32665895)
chr1 (85-231)||(7945533-7945679)
chr1 (85-231)||(10333165-10333311)
chr1 (86-226)||(7944156-7944294)
chr1 (85-224)||(5782412-5782551)
chr1 (88-231)||(6612420-6612563)
chr1 (85-231)||(9341004-9341150)
chr1 (85-231)||(22856678-22856824)
chr1 (85-231)||(52440539-52440684)
chr1 (85-231)||(52439477-52439619)
chr1 (89-229)||(8975161-8975301)
chr1 (86-230)||(34088449-34088585)
chr1 (170-231)||(22857558-22857619)
chr1 (138-231)||(6613957-6614051)
chr1 (138-228)||(50107185-50107275)
chr1 (85-195)||(3117647-3117757)
chr1 (89-228)||(11060766-11060905)
chr1 (168-231)||(32664585-32664647)
chr1 (114-224)||(5783095-5783205)
chr1 (134-196)||(25037925-25037987)
chr1 (134-196)||(25043137-25043199)
chr1 (97-189)||(44019996-44020088)
chr1 (117-228)||(11829939-11830050)
chr1 (89-231)||(1407642-1407784)
chr1 (170-231)||(534518-534579)
chr1 (182-231)||(33342511-33342560)
chr1 (97-197)||(1001164-1001264)
chr1 (85-145)||(2923861-2923921)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (84-231)||(4592858-4593005)
chr5 (85-231)||(2464667-2464813)
chr5 (85-231)||(8074449-8074594)
chr5 (85-229)||(546017-546160)
chr5 (85-231)||(9538028-9538174)
chr5 (85-231)||(21069287-21069433)
chr5 (86-231)||(19182949-19183094)
chr5 (80-231)||(28591092-28591244)
chr5 (85-230)||(2466753-2466899)
chr5 (24-157)||(13651173-13651305)
chr5 (85-231)||(14891126-14891268)
chr5 (119-231)||(32641705-32641817)
chr5 (85-229)||(40612640-40612784)
chr5 (85-231)||(25590429-25590574)
chr5 (86-231)||(19186199-19186344)
chr5 (88-231)||(9537024-9537166)
chr5 (85-224)||(16611726-16611865)
chr5 (124-231)||(32640325-32640432)
chr5 (85-231)||(8075812-8075958)
chr5 (124-231)||(544685-544792)
chr5 (89-231)||(31947016-31947158)
chr5 (120-221)||(19271375-19271476)
chr5 (91-231)||(16978996-16979136)
chr5 (89-181)||(18400192-18400284)
chr5 (127-231)||(28589739-28589843)
chr5 (95-193)||(13483029-13483126)
chr5 (150-196)||(14881010-14881056)
chr5 (135-231)||(4594080-4594174)
chr5 (148-192)||(13483174-13483218)
chr5 (138-230)||(35538281-35538373)
chr5 (147-226)||(18004698-18004777)
chr5 (89-228)||(26327054-26327193)
chr5 (85-131)||(24900411-24900457)
chr5 (177-231)||(40611350-40611404)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (86-231)||(44333138-44333281)
chr7 (82-231)||(48646044-48646193)
chr7 (85-231)||(48777254-48777401)
chr7 (85-231)||(7258273-7258419)
chr7 (85-231)||(44334429-44334574)
chr7 (89-231)||(7259663-7259805)
chr7 (89-231)||(43457459-43457601)
chr7 (85-231)||(48788651-48788797)
chr7 (88-229)||(46286504-46286645)
chr7 (85-229)||(48647424-48647568)
chr7 (80-231)||(10899052-10899203)
chr7 (85-231)||(35727697-35727842)
chr7 (85-231)||(42477379-42477524)
chr7 (88-231)||(30924988-30925130)
chr7 (85-231)||(35729065-35729211)
chr7 (117-228)||(34888905-34889016)
chr7 (90-224)||(8375569-8375703)
chr7 (89-231)||(12223678-12223820)
chr7 (85-231)||(39708101-39708247)
chr7 (138-231)||(13578300-13578392)
chr7 (85-231)||(8048763-8048909)
chr7 (99-209)||(8374926-8375036)
chr7 (85-195)||(45583682-45583792)
chr7 (140-231)||(45584475-45584566)
chr7 (86-231)||(19433913-19434058)
chr7 (75-231)||(12220011-12220166)
chr7 (135-231)||(44529076-44529172)
chr7 (85-231)||(5930112-5930257)
chr7 (134-226)||(44530595-44530687)
chr7 (147-231)||(32793231-32793315)
chr7 (89-159)||(385662-385732)
chr7 (89-187)||(34704911-34705009)
chr7 (119-228)||(2677768-2677877)
chr7 (128-186)||(10894391-10894449)
chr7 (89-166)||(21062819-21062896)
chr7 (168-229)||(46287385-46287446)
chr7 (119-231)||(7509450-7509562)
chr7 (137-221)||(8879532-8879616)
chr7 (174-226)||(24287567-24287619)
chr7 (176-231)||(33060899-33060954)
chr7 (45-83)||(33474296-33474334)
chr7 (133-215)||(33607618-33607700)
chr7 (174-231)||(30917800-30917857)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (86-231)||(48572984-48573129)
chr3 (79-231)||(36278944-36279096)
chr3 (85-212)||(17700516-17700643)
chr3 (80-231)||(55388066-55388217)
chr3 (89-212)||(17701917-17702040)
chr3 (85-231)||(52316977-52317123)
chr3 (85-230)||(52318297-52318442)
chr3 (85-197)||(19114531-19114643)
chr3 (87-231)||(20464069-20464213)
chr3 (85-224)||(33428421-33428560)
chr3 (85-224)||(47118037-47118176)
chr3 (82-224)||(45600925-45601066)
chr3 (85-198)||(2592019-2592132)
chr3 (126-231)||(36280296-36280401)
chr3 (85-229)||(2591625-2591769)
chr3 (124-231)||(53959079-53959186)
chr3 (85-231)||(3671037-3671182)
chr3 (85-231)||(34263803-34263949)
chr3 (133-231)||(48574438-48574536)
chr3 (90-231)||(50753820-50753961)
chr3 (85-226)||(48808362-48808505)
chr3 (87-231)||(55389448-55389592)
chr3 (85-224)||(47075337-47075476)
chr3 (119-208)||(11773053-11773142)
chr3 (85-224)||(19115133-19115271)
chr3 (80-197)||(49261550-49261664)
chr3 (85-231)||(53957673-53957817)
chr3 (139-221)||(40205934-40206016)
chr3 (96-162)||(19331117-19331183)
chr3 (139-228)||(40206919-40207009)
chr3 (112-186)||(47427885-47427959)
chr3 (174-231)||(48809634-48809690)
chr3 (89-232)||(26652583-26652725)
chr3 (176-231)||(36827454-36827509)
chr3 (103-231)||(612230-612358)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (85-224)||(53771035-53771174)
chr4 (85-231)||(42278047-42278193)
chr4 (86-231)||(47878463-47878608)
chr4 (89-228)||(47874566-47874704)
chr4 (85-231)||(31844720-31844865)
chr4 (90-221)||(26172931-26173062)
chr4 (85-224)||(48740006-48740145)
chr4 (85-231)||(26170638-26170784)
chr4 (79-231)||(39868914-39869064)
chr4 (85-194)||(54574423-54574532)
chr4 (85-231)||(4703196-4703342)
chr4 (133-231)||(50694795-50694893)
chr4 (103-231)||(21623096-21623224)
chr4 (84-224)||(53770330-53770470)
chr4 (139-229)||(4701817-4701907)
chr4 (133-231)||(21621869-21621967)
chr4 (85-231)||(31844934-31845080)
chr4 (95-228)||(42391868-42392003)
chr4 (99-224)||(26685408-26685528)
chr4 (85-221)||(44158502-44158638)
chr4 (85-188)||(19051253-19051356)
chr4 (146-231)||(19050297-19050382)
chr4 (134-193)||(54574822-54574881)
chr4 (174-228)||(32244361-32244415)
chr4 (174-231)||(24753540-24753597)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (87-231)||(79073-79217)
scaffold0039 (85-231)||(79662-79808)
scaffold0039 (90-166)||(74357-74433)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (86-198)||(116054-116166)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (85-231)||(30747997-30748143)
chr6 (85-224)||(31218953-31219092)
chr6 (89-224)||(31219146-31219281)
chr6 (85-231)||(23507947-23508092)
chr6 (89-221)||(12676459-12676591)
chr6 (114-228)||(24621104-24621218)
chr6 (108-159)||(6468832-6468883)
chr6 (39-84)||(19645948-19645993)
chr6 (183-231)||(10855902-10855950)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (89-230)||(5601-5742)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32766364 - 32766217
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32766364 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32766265  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32766264 tatcactttagtccttgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32766217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31091652 - 31091506
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31091652 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 31091553  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31091552 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31091506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 32764940 - 32765081
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32764940 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctagttgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 32765039  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32765040 actttaatccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 32765081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21733899 - 21733750
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcat---gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  21733899 gagcaaatagtcactctagtccctgactttgtacatcgttgtcacaaaggtccctgactcatcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttc 21733800  T
Q  182 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21733799 cgtcatcactttagttgttgcagttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 21733750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 31090165 - 31090305
Alignment:
Q  88 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31090165 caaatagtcaatttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtccttgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttat 31090264  T
Q  188 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
     | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  31090265 gattttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatga 31090305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 14704052 - 14704149
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14704052 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctcactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 14704149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17330355 - 17330209
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  17330355 gagcaaatagtcgctttagtccttgattctgcagctcactgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcatttccgt 17330256  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17330255 tatcactttagtccatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 17330209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24459570 - 24459432
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||    
T  24459570 agcaaagagtcactttggtccctgactctgcatctcgctgtcacataggtccctgaatcaggattaaatacaaataagtctctgaccctgcacttctatt 24459471  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  24459470 atcactttagtccctgacattaaaaaaatatgttaagtg 24459432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34037793 - 34037652
Alignment:
Q  90 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||| |  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||    
T  34037793 aatagtcactttagtccttgactctgcaccttgctgtcataaaggtccataactcaggattaaatacaaataagtctatgactctgcacttctgttatca 34037694  T
Q  190 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34037693 ctttagttcccgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 34037652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 2910102 - 2910244
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||| |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||    
T  2910102 aaataatcactttagtctttgattttgcagctcgctgtcacatagatccctgactcgggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcctttgtc 2910201  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2910202 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 2910244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40000456 - 40000315
Alignment:
Q  88 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  40000456 caaattgtcactttggtccctgactctgcacctcgctgttacatagatccctgattgaggattaaatacaaataagtctctaaccctgcacttccgttat 40000357  T
Q  188 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40000356 cactttattccctgacgttaagaaaatctgttaagtgatgat 40000315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 24458058 - 24458204
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||| | ||||| |||    
T  24458058 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctatcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtttctgactctacactttcgt 24458157  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  24458158 tatcactttagtctctaacgttaaaaaaatctattaagtgataatgt 24458204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39016506 - 39016364
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccct--gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||   || ||  |||||| |||||||||||||||||||    ||| |||||||||    
T  39016506 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacatacatctctctgactcaggattaaatacaaataagtc----actctgcacttcc 39016411  T
Q  183 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39016410 gttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 39016364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5915117 - 5914978
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || ||||  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5915117 gagcaaatagtcactttagtccatgactctgcacctcgctttcaaataggtctttgactcagaattaaatacaaagaagtcactaactctgcacttccgt 5915018  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||| ||| |||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  5915017 tatcaccttaatccccgacgttaaataattctgttaagtg 5914978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17466930 - 17466807
Alignment:
Q  108 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtta 207  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  17466930 tgactctgcacctcgctgtcacataagccgctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtctaagacgtta 17466831  T
Q  208 aaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  17466830 aataattctgttaagtgatgatgt 17466807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 7073638 - 7073783
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||| ||   |||| ||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  7073638 agcaaatagtcactttagtccttcattctgcagcttactgtcgcataggtctctgattcgggattaaatacaaataagtctctgattctgcacttccgtt 7073737  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  7073738 atcactttagtccctgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 7073783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2911616 - 2911468
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  | |||| |||| ||||||||  | || |||||||   ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  2911616 gagcaaatagtcactttggtctctggttctgcagctcgctgtcacataaggccatgactcaaagttaaatataaataagtctctgactttgcacttccgt 2911517  T
Q  185 tatcactt----tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||||||    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2911516 tatcactttagttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 2911468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Original strand, 38853762 - 38853889
Alignment:
Q  94 gtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 193  Q
    |||||||| |||||||||| | ||  || |||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  38853762 gtcactttggtccctgactctacacttcattgtcataaaggtctctgactcaggattaaatacaaagtagtccctaaatgtgcacttccgttatcaattt 38853861  T
Q  194 agtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||    
T  38853862 agtcactgacgttaaataattatgttaa 38853889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 33161799 - 33161909
Alignment:
Q  119 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 218  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || | |||||||| |||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  33161799 ctcgttgtcacaaaggtctctgccttaggattaaatgcaaagaagtctcagactatgtacttccgttatcactttagtccttgacgttaaataattttgt 33161898  T
Q  219 taagtgatgat 229  Q
    |||||||||||    
T  33161899 taagtgatgat 33161909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 5914324 - 5914441
Alignment:
Q  107 ctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtt 206  Q
    |||||| |||| |||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  5914324 ctgactttgcacctcgttgtgatataggtctctgactcacaattaaatacaaagaagtcagtgactttgcactcccgttatcactttagaccatgacgtt 5914423  T
Q  207 aaaaaattatgttaagtg 224  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  5914424 aaataattctgttaagtg 5914441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Original strand, 7412124 - 7412233
Alignment:
Q  119 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 218  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||    
T  7412124 ctcgttgtcacatagatctctgactcaagattaaatataaagaagtcactgatagtgcacttccgttatcactttagtccctaacattaaataattatgt 7412223  T
Q  219 taagtgatga 228  Q
    ||||||||||    
T  7412224 taagtgatga 7412233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 17466093 - 17466185
Alignment:
Q  139 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17466093 tgactcaggattaaatacaaagatatctctgactctgcacttccgttttcactttagtccctgacgtgaaacaattatgttaagtgatgatgt 17466185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34582791 - 34582664
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || | ||| |||  ||||  ||||||  |||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||    
T  34582791 aaatggtcacgttagtccctgactctgcaccttgctgttacaaaggtcattgactcgggattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcacttccgttatc 34582692  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattat 216  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34582691 actttagtccctgacgttaaataattat 34582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Original strand, 37607149 - 37607243
Alignment:
Q  134 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  37607149 gtccctaactcatgattaaatacaaggtagtcctttaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgacgttatataattatgttaactgatga 37607243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 39015003 - 39015149
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| | |    
T  39015003 gagcaaataatcacttttgtccctgactctgcacctcgctgccacatagatccttgactcaggattaaatacaaatacgtctttgactctgcactttcat 39015102  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| ||||||   |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39015103 tatcattttagtttctaacgttaaaaatatttgttaagtgatgatgt 39015149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38985051 - 38984967
Alignment:
Q  148 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaa-aaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38985051 attaaatacaaagaagtccttgactctgcacttccgttatcactttagtcactaacgttaaataaattatgttaagtgttgatgt 38984967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31814467 - 31814323
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||| ||| | |  |||| ||||||||  |||||||| ||| ||||   | ||| |||||||||||    
T  31814467 gagcaaatagtcactttagtcatttactctgcacctcgctgttaaa--ggtctctgactcagaattaaatataaagaagtttttgactctgcacttccgt 31814370  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31814369 tatcactttagtccctagcattaaataattctgttaagtgatgatgt 31814323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Original strand, 8420006 - 8420123
Alignment:
Q  80 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 179  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||    
T  8420006 aaaatgagtaaatggtcactttggtccctgactctgcatttcgcggtcacaaatgtccctgagtcaagattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcact 8420105  T
Q  180 tccgttatcactttagtc 197  Q
    || ||||||| |||||||    
T  8420106 tctgttatcagtttagtc 8420123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 38854791 - 38854923
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | |||||||  ||||||    
T  38854791 aaatagtcactttggtccctgactctacacttcgttgtcataaaggtctttgactcaggattaaatacaaagtagttcctaaatgtgcacttatgttatc 38854890  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    | |||||||  ||  |||||| |||||||||||    
T  38854891 aatttagtcactgaagttaaataattatgttaa 38854923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31443365 - 31443234
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||  ||||| || ||||||||||||  ||||||| |   |||||||  ||||||    
T  31443365 aaatggtcactttagtctctgactctgcatctcgttgtcacaaaagtcattgacttataattaaatacaaagtagtccctga-agtgcacttatgttatc 31443267  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    | ||||||| ||| | ||||||| || ||||||    
T  31443266 agtttagtctttgactttaaaaacttttgttaa 31443234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Original strand, 39999022 - 39999096
Alignment:
Q  156 caaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39999022 caaataagtccttgattttgcact-cggttatcactttaatctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 39999096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 228
Target Start/End: Original strand, 10728990 - 10729044
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10728990 tgcacttccgttatcagtttagcccctgacgttaaaaacttatgttaactgatga 10729044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26586331 - 26586285
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  26586331 tgcacttccgttatcactttagtctctggcgttaaataattatgtta 26586285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12746274 - 12746213
Alignment:
Q  137 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12746274 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcccttccgttatcactttagtcc 12746213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32898570 - 32898424
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32898570 gagcaaatagtcactttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32898471  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32898470 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32898424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 35177393 - 35177539
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35177393 gagcaaatagtcaatttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactccggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 35177492  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  35177493 tatcactttagtccctgacgttaaaataatctgttaagtgatgatgt 35177539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35178929 - 35178784
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  35178929 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacatcgctgtcatattggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgt 35178830  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35178829 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 35178784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10407708 - 10407563
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||  |||||||| ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10407708 agcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcactgtcacataggtcattgacttaggattaaacacaaataagtccataactttgcacttccgtt 10407609  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10407608 atcactttagttcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10407563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5738144 - 5738002
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   | ||| || ||||||||||||    
T  5738144 aaatggtcactttagttcctgactttgcatatcgttgtgacataggtccatgactcaagattaaatacaaagaagttattgactctgtacttccgttatc 5738045  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5738044 acttcagtctttggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 5738002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1953099 - 1952949
Alignment:
Q  80 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 179  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || | || |||||| | ||||| |||||||||||||  | ||| || |||    
T  1953099 aaaaagagtaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgttgtcatatagatctctgact-aggattacatacaaataagtctatgactctgtact 1953001  T
Q  180 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1953000 tccgttatcactttagtctctgacgttaaataaatctgttaagtgatgatgt 1952949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5965563 - 5965421
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||| || |||| |||| | | || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||    
T  5965563 aaatagtcatttcagtctctgattttacacctcgttgtcacaaatgtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctttgactctgcacttccgttatc 5965464  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||  || |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  5965463 actttagtctctgacgttaaatgattatgttaagtaatgatgt 5965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 186
Target Start/End: Original strand, 41753990 - 41754097
Alignment:
Q  79 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| | |||    
T  41753990 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctggttctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaacaagtccctgactctacac 41754089  T
Q  179 ttccgtta 186  Q
    || |||||    
T  41754090 tttcgtta 41754097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41754919 - 41754776
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||    
T  41754919 gagcaaatagtcactttaatcc-tgattctgcacctcgctgtcacatagatctctgactcaggattaaatacaaacaagttcctgactctacacttccgt 41754821  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41754820 tattactttag-ccctgccgttaaaaaa-actgttaagtgatgatgt 41754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Original strand, 45476223 - 45476306
Alignment:
Q  148 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45476223 attaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttatcactttagtctctcccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45476306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 28619035 - 28619133
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28619035 ggtccctgacccatgattaaatacaaagaaatcattgactctgcactttcgttatcactttagtctcggccgttaaataattttgttaagtgatgatgt 28619133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 30134564 - 30134710
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||||| ||    
T  30134564 gagcaaataatcactttagtccttaactctgcacctcgctgtcacaaaggtcccctactcatgattaaatacaaagaagtgtgtgactctgcacttctgt 30134663  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| |   |  ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30134664 tatcactttaatatctaacgttatataattatgttaggtgatgatgt 30134710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Original strand, 5736903 - 5736986
Alignment:
Q  148 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5736903 attaaatacaaagaaatctctaactctacactttcgttatcactttagtccctcacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 5736986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45476616 - 45476542
Alignment:
Q  157 aaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45476616 aaataagtcgctgactctgcacttctcttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 45476542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 59554 - 59696
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |  |||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| | |  | |  || || |||    
T  59554 aaatagtcactttagtccctgactttacacctcgctgtcactttagtccctgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgggtagatctgtcatc 59653  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  59654 agtttagtccttacaattaaaaaattatgttaaccgatgatgt 59696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Original strand, 10406269 - 10406350
Alignment:
Q  150 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||| ||| ||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10406269 taaataaaaacaagtctctgactctgcacttctattatcactttagtccctggtgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 28524810 - 28524902
Alignment:
Q  139 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  28524810 tgactcaggattaaatacaaagtaatccttgaatgtgcacttccgttatcattttagtctctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 28524902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 43539107 - 43539239
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||| |  ||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||| | | || |  || ||||||    
T  43539107 aaatagtcactttggtccctaactttgcacctcgctgtcactttagtccccgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgtgtatatctgttatc 43539206  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43539207 agtttaatccttaccgttaaaaaattctgttaa 43539239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32565763 - 32565696
Alignment:
Q  155 acaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaag 222  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  32565763 acaaagaagtcccaaattttgcactttcgttatcactttagtcattgatattaaataattatgttaag 32565696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 41121160 - 41121214
Alignment:
Q  138 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  |||||||||    
T  41121160 ctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgactatgcacttctattatcactt 41121214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12637835 - 12637770
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 198  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12637835 ggtccctaactcaggattgaatacaaagtagttcctgaatgtgcacttccgttatcactttagtcc 12637770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41122782 - 41122730
Alignment:
Q  179 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||| |||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41122782 ttccattatcattttagtgtttgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 41122730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Original strand, 10332984 - 10333128
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10332984 gagcaaatagtcactttagtccctgactttgcacctcgttgtcacataggtccttgattcaggattaaatataaataagtcccttactctgcacttccgt 10333083  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  10333084 tatcattttagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 10333128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 9339644 - 9339790
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  9339644 gagcaaatagtccctttagtccctgattctgcagctcgttgttacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccccgactctgcacttccgt 9339743  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9339744 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 9339790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32665895 - 32665749
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  32665895 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttgactctgcacttccgt 32665796  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  32665795 tatcactttagtccctggcgttacaaaaatctgttaagtgatgatgt 32665749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7945679 - 7945533
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7945679 gagcaaataatcattttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgt 7945580  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7945579 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgctaagtgatgatgt 7945533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10333311 - 10333165
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||| || || |||| | |||| |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10333311 gagcaaatagtcactataatctctgattctgcagctcgctgttacataggtctctgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgt 10333212  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10333211 tatcactttagtctctagcgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10333165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Original strand, 7944156 - 7944294
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  7944156 agcaaatagtcact--agtccctgattttgcaactcgctgtcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtccttgactctgcactttcgtt 7944253  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 226  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  7944254 atcaatttagtccctaacgttaaaaaaatatgttaagtgat 7944294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 5782412 - 5782551
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  5782412 gagcaaattgtcattttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgattatgcacttccct 5782511  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  5782512 tatcactttagtctctgacgttaaataattttattaagtg 5782551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Original strand, 6612420 - 6612563
Alignment:
Q  88 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  6612420 caaatagtcactttagtccctgactctgcacctcgctgttataaatgtctctgactcatgattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccattat 6612519  T
Q  188 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  6612520 cactttaatccctgacgttaaataattttgttaagtgattatgt 6612563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9341150 - 9341004
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||  ||  | | | ||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  9341150 gagcaaatagtcactttgatcatttattctgcatctcactatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactttgcacttctgt 9341051  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  9341050 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatctattaagtgatgatgt 9341004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 22856678 - 22856824
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22856678 gagcaaatggtcactttagtcactgactctgcaccacgttgttacaaagattcttgactcaggattaaatacaaagaagtctctaactctgcacttccgt 22856777  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22856778 tatcactttagtctccgacgttaaataattatgttaagtgattatgt 22856824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52440684 - 52440539
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  52440684 gagcaaataatcacattggtctctgactttgcacatcgctgtcacataggtccctgagtcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccat 52440585  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52440584 tatcactttagt-cttgacgttaaaaaaatgtgttaagtgatgatgt 52440539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 52439477 - 52439619
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||     || |||| ||||||    
T  52439477 gagcaaatagtcactttagcccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctggctcaggattaaatacagataagtc----tctctgcatttccgt 52439572  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52439573 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52439619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 8975161 - 8975301
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | | | ||||||| |||||||    
T  8975161 aaatggtcactttggtccctaactttgcaccttgttgtcacaaaggtccctgactcaagattaaatataaagtagtccatgaatatgcactttcgttatc 8975260  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8975261 actttagtctttggcgttaaataattttgttaattgatgat 8975301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34088585 - 34088449
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||        ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |    
T  34088585 agcaaattgtcactttagtccctgactctacatctcgctgtcacaaaggtc--------atgattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccact 34088494  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 230  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34088493 atcactttaatccttgacattaaataattatgttaagtgatgatg 34088449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22857619 - 22857558
Alignment:
Q  170 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22857619 actttgcacttccgttatcactttagtccatgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 22857558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6614051 - 6613957
Alignment:
Q  138 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcct-tgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6614051 ctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcagttatcattttagtcctccgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 6613957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50107275 - 50107185
Alignment:
Q  138 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50107275 ctgattcaggattaaatacaaaatagtctctgaatgtgcacttccgttatcactttagtccttggcgttaaataattatgttaactgatga 50107185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 3117647 - 3117757
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||  ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| | |||||||||    
T  3117647 gagcaaatagtcattttagtccctaactcttcacatcgttatcacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaaatctctgactctccacttccgt 3117746  T
Q  185 tatcactttag 195  Q
    |||||||||||    
T  3117747 tatcactttag 3117757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11060905 - 11060766
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| | |  |||||| |||||||    
T  11060905 aaatggtcactttgatccttgactatgcacctcgctgtcacaaaggtccatgactcaaaattaaatacaaaatagtccctgaatgggcactttcgttatc 11060806  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  11060805 actttagtccccgacgttaaataattctgttaactgatga 11060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Original strand, 32664585 - 32664647
Alignment:
Q  168 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  32664585 taactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgttaagaaaat-tgttaagtgatgatgt 32664647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5783205 - 5783095
Alignment:
Q  114 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 213  Q
    |||| |||| |||||||| | |||  ||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||    
T  5783205 tgcacctcgctgtcacatagatcctcgactcagaattaaatacaaagaagtccatgactctgcacttccgttatcactttagtcactagcgttaaataat 5783106  T
Q  214 tatgttaagtg 224  Q
    | |||||||||    
T  5783105 tctgttaagtg 5783095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 196
Target Start/End: Original strand, 25037925 - 25037987
Alignment:
Q  134 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25037925 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25037987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 196
Target Start/End: Original strand, 25043137 - 25043199
Alignment:
Q  134 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25043137 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25043199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 44019996 - 44020088
Alignment:
Q  97 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 189  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  44019996 actttggtccctgactttgcaactcgttgtcacaaaagtctctgactcaagattaaatataaagaagtctctgactctgcacttacgttatca 44020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Original strand, 11829939 - 11830050
Alignment:
Q  117 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 216  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  11829939 atctcgttgtcacaaaggtcactaactcaagattaaatacaaattagtccttgtatatgcatttccgttattagtttaggctttgacgttaaaaacttat 11830038  T
Q  217 gttaagtgatga 228  Q
    ||||| ||||||    
T  11830039 gttaactgatga 11830050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 1407642 - 1407784
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||| || |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||  |||  || | | |||||||  ||||||    
T  1407642 aaataatcactttcatctctgactctgcaccttgttgtcacaaaggtccatgacttatgactaaatataaagtagtttctgaatatgcacttatgttatc 1407741  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1407742 actttagtccctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 1407784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 534579 - 534518
Alignment:
Q  170 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  534579 actttacacttctgttatcactttagtccctaccgttaaaaaaatctgttaagttatgatgt 534518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Original strand, 33342511 - 33342560
Alignment:
Q  182 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342511 cgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 33342560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 1001164 - 1001264
Alignment:
Q  97 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 196  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||||||||||  |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  1001164 actttagtccatgactttgcacctcgttgccacaaaggtccatgactcgggattaaatacaaagtagtctctgaatgtgcacttctgttatcagtttagt 1001263  T
Q  197 c 197  Q
    |    
T  1001264 c 1001264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2923921 - 2923861
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactca 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| | |||||  |||||||||||||    
T  2923921 gagcaaatagtcactttagttcctaactttgcacctcgctatcacaaaggtccctgactca 2923861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 4592858 - 4593005
Alignment:
Q  84 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4592858 ggagcaaatagtcactttagtccctgattatgtagctcgctgtcacataagtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccg 4592957  T
Q  184 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4592958 ttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 4593005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 2464667 - 2464813
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2464667 gagcaaatagtcactttagtcactgattctgcagctcgctgtcatataggtccatgactcatgattaaatacaaataagtccctaactctgcacttacgt 2464766  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2464767 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 2464813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 8074449 - 8074594
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8074449 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctgtcacataagtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 8074548  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8074549 tatcactttagttcctgacgttaaaaaa-tcggttaagtgatgatgt 8074594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 546160 - 546017
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  546160 gagcaaatagtcactttagtccc-gattttgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacagataagtccttgactctgcacttccgt 546062  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  546061 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgat 546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9538174 - 9538028
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  9538174 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcatctcgttgtcatataggtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgattgtgcacttccgt 9538075  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9538074 tatcattttagtctctgatgttaaataattatgttaagtgattatgt 9538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 21069287 - 21069433
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  21069287 gagcaaatagtcactttagtctctgactctgcacctcgttgtcacagaggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccttgactctgcacttctgt 21069386  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    | |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21069387 tttcactttaatatatgccgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 21069433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 19182949 - 19183094
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  19182949 agcaaatagttactttagaacttgactttgcacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctgactctacacttccgtt 19183048  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19183049 atcactttagtccttgcgattaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 19183094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28591244 - 28591092
Alignment:
Q  80 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 179  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  28591244 aaaaagagcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccctgactctgcact 28591145  T
Q  180 tccgttatcactttagtccttgccgtta-aaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  28591144 tcctttatcactttagtccccgacgttacaaaaaatctgttaagtgatgatgt 28591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2466899 - 2466753
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2466899 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacctcgctatcacataggtcattgattcaggattaaataaaaataagtccctaactctgcacttccgt 2466800  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatg 230  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2466799 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatg 2466753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13651305 - 13651173
Alignment:
Q  24 tactagtattatgtatcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgt 123  Q
    ||||||||||||| |||||  | || | | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  13651305 tactagtattatggatcttactgacgaatgtcctcatggcaatggttaaggaaactaaaatgagcaaatagtcactttagtccttgactgtgcacct-gc 13651207  T
Q  124 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaataca 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13651206 tgtcacataggtccctgactcaggattaaataca 13651173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14891268 - 14891126
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |    ||||| || ||| | |||||||||    
T  14891268 gagcaaatagtcactttggtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatgc----aagtctctgactctacacttccgt 14891173  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891172 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 14891126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32641817 - 32641705
Alignment:
Q  119 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 218  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  32641817 ctcgttgtcacgtaggtcccttactcaagattaaatacaaataagttgctgactctgcacttccgttatcactttaatccctgacgttaaaaaaatatgt 32641718  T
Q  219 taagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||    
T  32641717 taagtgatgatgt 32641705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40612784 - 40612640
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||    
T  40612784 gagcaaatagtcactttagtccctgattttgcagctcactgtcacgtaggtccctgactcaggattaaatacagatattttcctgactctgcacttccgt 40612685  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    |||||||||| | | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40612684 tatcactttaattcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 40612640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 25590429 - 25590574
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||    
T  25590429 gagcaaatagtcactttgttttctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcg-gattaaatacaaataagtctctgattctgcacttctgt 25590527  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25590528 tatcactttaatctctgacgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 25590574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19186344 - 19186199
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    |||||||||||| ||||||| |   || ||||||||   ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||    
T  19186344 agcaaatagtcattttagtctcatgctctgcatctcccagtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacatttccgtt 19186245  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19186244 atcactttagtccttgtcgttaaaacaatctgttaagcgatgatgt 19186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Original strand, 9537024 - 9537166
Alignment:
Q  88 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  9537024 caaatggtgactttagtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgacttagaattaaatacaaagaagtca-tgactgtgcacttccattat 9537122  T
Q  188 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9537123 cactttagtcactgacgttaaataattatggtaagtgatgatgt 9537166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 16611726 - 16611865
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| | || | | |||||||||||    
T  16611726 gagcaaatggtcactttaattcttgactctacacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaagaagcctctgattatgcacttccgt 16611825  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  16611826 tatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaagtg 16611865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 32640325 - 32640432
Alignment:
Q  124 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 223  Q
    |||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  32640325 tgtcacataggaccataactcaggattaaatacaaataagtccctaactctaaacttctgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 32640424  T
Q  224 gatgatgt 231  Q
    ||||||||    
T  32640425 gatgatgt 32640432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8075958 - 8075812
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || | | ||||||| |||    
T  8075958 gagcaaatagtcgctttggtcattgactctgcacctcgctgttagatagatccctgattcaagattaaatacaaaaaagtatctgattctgcactttcgt 8075859  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  8075858 tatcactttagtccctgacgtttaaaaaatctgttaagtgatgatgt 8075812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 544685 - 544792
Alignment:
Q  124 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 223  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||   || | |||||||| ||||||||||    
T  544685 tgtcagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttataaatttagtttctgacattaaaaaaatatgttaagt 544784  T
Q  224 gatgatgt 231  Q
    ||| ||||    
T  544785 gattatgt 544792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31947158 - 31947016
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||  | ||||||| || | | ||| ||| |  |||||||||||| |||||  | ||| |  ||||||||||||    
T  31947158 aaatagtcactttagtctctgattctgcactttgttgtcatatagattccttacttaaaattaaatacaaacaagtctatgactctagacttccgttatc 31947059  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31947058 actttagtcactgctgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31947016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Original strand, 19271375 - 19271476
Alignment:
Q  120 tcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtt 219  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||  ||||| | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  19271375 tcgttgtcacaagtgtcccaggctcatgattaaatataaagtagtcctttaatgtgcacttccgttatcagtttagtccatgacgttaaaaatttatgtt 19271474  T
Q  220 aa 221  Q
    ||    
T  19271475 aa 19271476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 16978996 - 16979136
Alignment:
Q  91 atagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcac 190  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||  ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  16978996 atagtcactttagtccttgactttgcaccttgctgccacaaaggtcattgactcagaattaaatgcaaataagtccctaactctgtacttacgttatcat 16979095  T
Q  191 tttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||  |  ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16979096 tttagtctctaacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 16979136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 181
Target Start/End: Original strand, 18400192 - 18400284
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  18400192 aaatggtcactttagtccctgactctgcacctcactgtcacataggtccttgactcaggattaaataaaaagaagtcactgactctgcacttc 18400284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 28589739 - 28589843
Alignment:
Q  127 cacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 226  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   | |||||| |||||||||| || |||||||  || |||||||||| | |||||||||||    
T  28589739 cacataggtccctgactcataattaaatacaaatacatttttgactttgtacttccgttaccattttagtctctgacgttaaaaaaatctgttaagtgat 28589838  T
Q  227 gatgt 231  Q
    |||||    
T  28589839 gatgt 28589843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 13483029 - 13483126
Alignment:
Q  95 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 193  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13483029 tcactttagtccc-gactctgtatctcgcattcagataggttcctgactcatgattaaatataaagaagtctcttactctgcactttcgttatcacttt 13483126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 196
Target Start/End: Original strand, 14881010 - 14881056
Alignment:
Q  150 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 196  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14881010 taaacacaaataagtccctgactctgcacttccgttatcactttagt 14881056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4594174 - 4594080
Alignment:
Q  135 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4594174 tccctgactcaggattaaatacaaataagt-catgactctgcacttccattatcac-ttaatcccttacgttaaaaagatctgttaagtgatgatgt 4594080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13483218 - 13483174
Alignment:
Q  148 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 192  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13483218 attaaatacaaacaagtctctgactttgcacttccgttatcactt 13483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35538373 - 35538281
Alignment:
Q  138 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| | | | | ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  35538373 ctgactcgtgattaaatacaaagtagttcttcaatgtgcacttccgttatcactttaatccttaatgttaaataattctgttaactgatgatg 35538281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Original strand, 18004698 - 18004777
Alignment:
Q  147 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 226  Q
    ||||||||||||| | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  18004698 gattaaatacaaagaggtctatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgatgttaaatagttatgttaagtgat 18004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26327193 - 26327054
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| |||  |  || |   | ||||||||||| |||    
T  26327193 aaatagttattttggtcactgactctgcacctcgttgtcataagggctcctgactcaggattaaatataaaataacccttggatgtgcacttccgtaatc 26327094  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  26327093 agtttagtccttgacgttaaaaatttctgttaactgatga 26327054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24900457 - 24900411
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  24900457 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacat 24900411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 40611350 - 40611404
Alignment:
Q  177 acttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40611350 acttcccttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaggtgatgatgt 40611404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 44333138 - 44333281
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44333138 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgtt 44333237  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44333238 atcac--tagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 44333281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 48646044 - 48646193
Alignment:
Q  82 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 181  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48646044 aaggagtaaatagtcactttggtccctgactatgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttc 48646143  T
Q  182 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48646144 cgttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatattaagtgatgatgt 48646193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 48777254 - 48777401
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  48777254 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacataagtccctgactcatgattaaatacaaataattccctgactctgcacttccgt 48777353  T
Q  185 tatcactttagtccttgccg-ttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48777354 tatcactttagtccatgacgtttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 48777401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 7258273 - 7258419
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  7258273 gagcaaatagtcactttggtccctgactctacacctcgttgtcacataggtccctaactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgt 7258372  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7258373 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7258419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44334574 - 44334429
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  44334574 gagcaaatagtcactttagttcctgattctgcagctcgctgttacataggtccctgactcatgattaaatataaataagtccctgactctgcacttccat 44334475  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44334474 tatcactttagtccctgacattaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 44334429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7259805 - 7259663
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||||||||||||| || |||| | || | |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  7259805 aaatagtcactttaatcgctgattttgtagctcgctgtcacatgggtctctgattcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgttatc 7259706  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7259705 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7259663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 43457459 - 43457601
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  43457459 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcgcataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccccgactctgcacttccgttatc 43457558  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||| | || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  43457559 actttagttcatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 43457601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48788797 - 48788651
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  48788797 gagcaaatagtcactttgatccttgactttgcacctcgctgtcacataggtccctgactcataattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgt 48788698  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  48788697 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaggtgatgatgt 48788651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Original strand, 46286504 - 46286645
Alignment:
Q  88 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  46286504 caaatagtcactttagtccctgactcttcatctcgctgttagaaaggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttat 46286603  T
Q  188 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46286604 cactttaatctctaccgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 46286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48647568 - 48647424
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | || |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||    
T  48647568 gagcaaatagtcactttagaccctgattctacagctcgctatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctcactctgcacttttgt 48647469  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  48647468 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 48647424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10899203 - 10899052
Alignment:
Q  80 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 179  Q
    |||| ||| |||| || ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10899203 aaaatgagtaaattgttactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacatagatccttgacccaggattaaatacaaataagtctctgactctgcact 10899104  T
Q  180 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10899103 tccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10899052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 35727697 - 35727842
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  35727697 gagcaaacagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacatccgt 35727796  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35727797 tatcactttagtcc-tgacgttaaaaatctctgttaagtgatgatgt 35727842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 42477379 - 42477524
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42477379 gagcaaataatcaatttggtccttgactctgcacctcgttgtcgcataggtctctgactcaggattaaatacaaataagt-cctgactctgcacttccgt 42477477  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42477478 tatcattttaatccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 42477524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30925130 - 30924988
Alignment:
Q  88 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  30925130 caaatagtcactttaatccctgattctgcagctcccagtcacataggtccttgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgttat 30925031  T
Q  188 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
     |||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30925030 tactttagtctctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 30924988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35729211 - 35729065
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  35729211 gagcaaatagtcactttattccctgattttgcagctcgctgtcacataggtccttgacttaggattacatacaaataagtcactgactctgcacttccgc 35729112  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| |||||| || | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  35729111 tatcactgtagtccctgacattaaataaatctgttaagtgatgatgt 35729065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34889016 - 34888905
Alignment:
Q  117 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 216  Q
    |||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34889016 atctcgctgtcacaaaggtctctcactcatgattaaatataaagatgtccttaactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgtttaataattat 34888917  T
Q  217 gttaagtgatga 228  Q
    ||||||||||||    
T  34888916 gttaagtgatga 34888905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8375703 - 8375569
Alignment:
Q  90 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  8375703 aatagtcacattagtccctgacttcgcaccgcactgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaagaagtttctgactctgcacttccgttatca 8375604  T
Q  190 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
     ||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  8375603 atttagtccgcgacgttaaataattttgttaagtg 8375569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12223820 - 12223678
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||     
T  12223820 aaatggtcactttagtccctgacactgcacatcaatgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaagaagtccctgactctgcagttccgttatt 12223721  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12223720 actttagtcactgatgttaaataattctgttaagtgatgatgt 12223678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 39708101 - 39708247
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||  ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39708101 gagcatatagtcactttagtctctgactctgtacctcgccgtcacaaaggtccatgactcaagattgaatacaaagaagtcaccgactttgcacttccgt 39708200  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  39708201 tatcactttagtccgtgatgttaaataattatgttatgtgataatgt 39708247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13578392 - 13578300
Alignment:
Q  138 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13578392 ctgactcagaattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttatcactttagtcc-tgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 13578300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8048909 - 8048763
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||    
T  8048909 gagcaaatagtcactttaccctctgactctgcacctcgctgacacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaagtctccgactctgcacttccgt 8048810  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| || ||  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  8048809 tatcactttaatctttaacgttaaataattctattaagtgatgatgt 8048763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Original strand, 8374926 - 8375036
Alignment:
Q  99 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 198  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||     
T  8374926 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcagaattaaatacaaaaaagtttctgattttgcacttccgttatcactttagtct 8375025  T
Q  199 ttgccgttaaa 209  Q
    ||| |||||||    
T  8375026 ttgacgttaaa 8375036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 45583682 - 45583792
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  45583682 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagttcgctatcacataggtccctgactcagaattaaatacagataagttcctgattctgcacttccgt 45583781  T
Q  185 tatcactttag 195  Q
    |||||||||||    
T  45583782 tatcactttag 45583792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45584566 - 45584475
Alignment:
Q  140 gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45584566 gactcaggattaaatacaaataagccaatgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45584475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19434058 - 19433913
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| |||| | | ||||||||| ||  ||||| |  |||  ||||||| |||    
T  19434058 agcaaattgtcactttagtccctaactctccatctcgttgtcacaaaggtctctgatttaggattaaatataaggaagtcaccgactccgcacttcagtt 19433959  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19433958 atcactttagtctatggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 19433913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Original strand, 12220011 - 12220166
Alignment:
Q  75 aaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaacttt 174  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| |    
T  12220011 aaacaaaaatgagcaaatgatcactttagtgtctagctatgcacctcgttgtcacaaagattcctgactcaagattaaatagaaagaagtctctgactct 12220110  T
Q  175 gcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12220111 gcacttctgatatcactttagt-cttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 12220166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 44529076 - 44529172
Alignment:
Q  135 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  44529076 tccctgactcatgattaaatacaaataagtctccgactcaacacttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagcgatgatgt 44529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5930257 - 5930112
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| ||||  ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||  || |  | | || |||||||||||    
T  5930257 gagcaaatggtcactttagtctcttactttgcacttcgctatcacaaaggtccctaactcaggattaaatacaagaaattttcga-ctgtgcacttccgt 5930159  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5930158 tatcactttagtccctgccattaaataattctgttaagtgatgatgt 5930112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44530687 - 44530595
Alignment:
Q  134 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 226  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||    
T  44530687 gtccccgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtcattggcgttaagttattctgttaagtgat 44530595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 231
Target Start/End: Original strand, 32793231 - 32793315
Alignment:
Q  147 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||  | | | |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32793231 gattaaatacaaataagtcattgattctgcatttcggttatcactttagtctttggcgttaaataattatgttaactgatgatgt 32793315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 385732 - 385662
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 159  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  385732 aaatggtcactttggtccttgactctgcatctcgttgtcacagaggtccctaactcatgattgaatacaaa 385662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 34704911 - 34705009
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||    
T  34704911 aaatagtcactttagtctccgactctgcacctcgttgtcacaaaggcctctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactgtgtactttcgttat 34705009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2677877 - 2677768
Alignment:
Q  119 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 218  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||  ||    
T  2677877 ctcgttgtcacaaaggtctatgactcatgattaaatacaaagtattccctaaatgtgcactttcgttatcagtttagtccctcgcgttaaaaactttagt 2677778  T
Q  219 taagtgatga 228  Q
    ||| ||||||    
T  2677777 taactgatga 2677768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 186
Target Start/End: Original strand, 10894391 - 10894449
Alignment:
Q  128 acatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 186  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10894391 acataggtccctgactcaagattaaatataaataagtctctaattctgcacttccgtta 10894449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 166
Target Start/End: Original strand, 21062819 - 21062896
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  21062819 aaatggtcactttagtccctgactttgcacctcgctgtcataaaggtccttgactcaggattaaatacatagaagtcc 21062896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46287446 - 46287385
Alignment:
Q  168 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  46287446 taactctgcatttccgttatcactttagtctttggcgttaaaaaaatttgttaaatgatgat 46287385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7509562 - 7509450
Alignment:
Q  119 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 218  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||| |  | | |||||||||||||| ||||||  || || ||||||| |||| |||    
T  7509562 ctcgttgtcacaaaggtctttgattcatgattaaatataaagaagtctcagattctgcacttccgttattactttaacccctgacgttaaataattttgt 7509463  T
Q  219 taagtgatgatgt 231  Q
    |||||||| ||||    
T  7509462 taagtgattatgt 7509450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8879616 - 8879532
Alignment:
Q  137 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  8879616 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcatttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaa 8879532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 24287567 - 24287619
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 226  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24287567 tgcacttaagttatcactttagtccttgacgttaaataattatgttaattgat 24287619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Original strand, 33060899 - 33060954
Alignment:
Q  176 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  33060899 cacttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaaatgatgatgt 33060954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 33474296 - 33474334
Alignment:
Q  45 taaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaa 83  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33474296 taaccagtatcatcagggcaatggttaaggaaactaaaa 33474334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33607700 - 33607618
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaatta 215  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||    
T  33607700 ggtctctgattcaggattaaatacaaagaagtctctgattctgcacttccgttatcattttagaccctgacgttaaataatta 33607618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 30917800 - 30917857
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  30917800 tgcacttccattatcactttaatcctcgacgttaaataattatgctaactgatgatgt 30917857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 48572984 - 48573129
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  48572984 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagcctctgactctgcacttccgtt 48573083  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48573084 atcactttagtccttgacgttaaaaaaatttgttaagcgatgatgt 48573129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Original strand, 36278944 - 36279096
Alignment:
Q  79 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  36278944 taaatggagcaaatagtcactttagtccctgattatacagctcgttgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcac 36279043  T
Q  179 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36279044 ttccgttatcattttagtccctgacgttaaaaaattcttttaagtgatgatgt 36279096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 17700516 - 17700643
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17700516 gagcaaatagtcactttagtctttgactctgcacctcgttgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 17700615  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaa 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  17700616 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa 17700643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 55388066 - 55388217
Alignment:
Q  80 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  55388066 aaaatgagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttactgactctgcact 55388165  T
Q  180 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55388166 cccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 55388217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17702040 - 17701917
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17702040 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 17701941  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaa 212  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  17701940 actttagtccctgacgttaaaaaa 17701917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 52316977 - 52317123
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  52316977 gagcaaataatcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttaactctgcacctccgt 52317076  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52317077 tatcattttagtccatgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52317123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52318442 - 52318297
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |     
T  52318442 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacttcgctgtcacatagatccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttctga 52318343  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 230  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  52318342 tattactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatg 52318297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Original strand, 19114531 - 19114643
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19114531 gagcaaatgatcactttagtccctgactctgcacttcgttgtcacagaggtccctgactcaagattaaatacaaagaagtcactaactttgcacttccgt 19114630  T
Q  185 tatcactttagtc 197  Q
    |||||||||||||    
T  19114631 tatcactttagtc 19114643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Original strand, 20464069 - 20464213
Alignment:
Q  87 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 186  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20464069 gcaaatggacactttagtccccgactctgcacctcgttgtcacaaaggtccctggctcatgattaaatacaaagaagtccctgactctgcacttctgtta 20464168  T
Q  187 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20464169 tcactttagtccacgacgttaaataactctgttaagtgatgatgt 20464213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33428560 - 33428421
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||    
T  33428560 gagcaaatggtcactttcgtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagtccttgactctgcatttccgt 33428461  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  33428460 tgtcactttagtcctcagcgttaaataattatgttaagtg 33428421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47118176 - 47118037
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |||    
T  47118176 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcatataagtccccgactcaggattaaatgcaaagaagtctctgactctgcactttcgt 47118077  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  47118076 tatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagtg 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45601066 - 45600925
Alignment:
Q  82 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  45601066 aaggagcaaatcgtcactttagtccctgactctgtccctcgctgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaagaagt-cctgactctgcacttc 45600968  T
Q  182 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  45600967 cgttatcactttagtccacgacgttaaataattctgttaagtg 45600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2592132 - 2592019
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  2592132 gagcaaatagtcactttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactcaatacttccgt 2592033  T
Q  185 tatcactttagtcc 198  Q
    ||||||||||||||    
T  2592032 tatcactttagtcc 2592019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36280401 - 36280296
Alignment:
Q  126 tcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtga 225  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  36280401 tcacataggtctctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtga 36280302  T
Q  226 tgatgt 231  Q
    ||||||    
T  36280301 tgatgt 36280296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Original strand, 2591625 - 2591769
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  2591625 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccat 2591724  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
     ||||||||||||| ||  |||||   ||| ||||||||||||||    
T  2591725 gatcactttagtccctgatgttaagttattctgttaagtgatgat 2591769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53959186 - 53959079
Alignment:
Q  124 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 223  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  53959186 tgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagttcatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 53959087  T
Q  224 gatgatgt 231  Q
    ||||||||    
T  53959086 gatgatgt 53959079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 3671037 - 3671182
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||  | |||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||    
T  3671037 gagcatatagtcacttta-tccttgactttgcacctctctatcacaaaggtctctgactcagaattaaatacaaataagtctatgactctccacttccgt 3671135  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671136 tatcactttaatccctgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 3671182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 34263803 - 34263949
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  34263803 gagcaaatagtcactttggcccctgactctgcacctcgctgtcacagaggtccttgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccat 34263902  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34263903 tatcactttaatccctgacattaaaaaaatatgttaagggatgatgt 34263949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48574536 - 48574438
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||    
T  48574536 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcactttcgttatcactttagtccttgacgttaaaaaaatcttttaaatgatgatgt 48574438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 50753820 - 50753961
Alignment:
Q  90 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 189  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||  || ||| | |||||| |||||||    
T  50753820 aatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctaattcaggattaaatataaacaagtttctgactctacacttctgttatca 50753919  T
Q  190 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50753920 ctttagtccctgccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 50753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 226
Target Start/End: Original strand, 48808362 - 48808505
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcacttta--gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 182  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| | |||| |||| ||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48808362 gagcaaataatcactttatagtccctgattctgcagctcgctgttagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctaactctgcacttcc 48808461  T
Q  183 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 226  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||    
T  48808462 gttgtcactttagtcccggatgttaaaaaaatatgttaagtgat 48808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55389592 - 55389448
Alignment:
Q  87 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  55389592 gcaaatagtcactttggtccctaactctgcacctcgctgtcacataggtcattgactcaaaattaaatacaattaagtccctgactctacacttccgtta 55389493  T
Q  187 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||    ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  55389492 tcactttagtccccaacgttacaacaatatgttaagtgatgatgt 55389448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47075476 - 47075337
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||    
T  47075476 gagcaaatggtcactttaatccttgactctgcacctcgttgtcacataggtccgtcactcaagattaaatacaaagaaacccctgactctacacttccgt 47075377  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  47075376 tatcactttagtctctgacgttaaataattttgttaagtg 47075337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11773142 - 11773053
Alignment:
Q  119 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaa 208  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11773142 ctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccgttatcactttagtccctggcgttaa 11773053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19115271 - 19115133
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||    
T  19115271 gagcaaatagtcactttagttcgtgactctgcacctcgatgtcacataggtccttcactcaggattaaatacaaagaagt-catgactctgcacttccgt 19115173  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    | | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  19115172 ttttactttagtccctaacgttaaataattctgttaagtg 19115133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49261664 - 49261550
Alignment:
Q  80 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |   ||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| |||| |    
T  49261664 aaaaagagcaaatagtcactttagtccataattccacacattgttgtcacataggtccctgactcaggattaaataca---aagtctctaactctgcatt 49261568  T
Q  180 tccgttatcactttagtc 197  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49261567 tccgttatcactttagtc 49261550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 53957673 - 53957817
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |    
T  53957673 gagcaaatagtcactttagtacttgattctgcaactcgctgttacataggttcctgactcagga-taaatacaaataagtctatgactctgcacttccct 53957771  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    || || |||  ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53957772 taacaattt-ttccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 53957817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 40205934 - 40206016
Alignment:
Q  139 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| || | | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40205934 tgactcacgattaaaaacaaagtagtctctgaatgtgcacttccgttatcagtttagtcattggcgttaaaaaattatgttaa 40206016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 19331117 - 19331183
Alignment:
Q  96 cactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataa 162  Q
    |||||| || ||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19331117 cactttcgttcctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataa 19331183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40207009 - 40206919
Alignment:
Q  139 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt-ccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | | | |||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40207009 tgactcatgattaagtataaattagtccttgaatgtgcatttccgttatcagtttagtcccttaacgttaaaaaattatgttaactgatga 40206919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Original strand, 47427885 - 47427959
Alignment:
Q  112 tgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 186  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  47427885 tgtgcacctcgctgtcacataggtccttgactcaaaattaaatacaaagaagtccctgactgtgcacttacgtta 47427959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48809690 - 48809634
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48809690 tgcacttccgttatcactttagtccatgacg-taaaaaaatctgttaagtgatgatgt 48809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26652725 - 26652583
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||  ||||| | | | || |  || ||||||    
T  26652725 aaatagtcacttgggtccctgactttgcatctcgctgtcactttagtccctgacttaggataaaatacaaaatagtccatgaatgtgtatctctgttatc 26652626  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgtc 232  Q
    | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  26652625 agtttagtccttactgtt-aaaaattctgttaatcgatgatgtc 26652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36827509 - 36827454
Alignment:
Q  176 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36827509 cacttccgttatcactttagtctctgatgttaaataattttgttaagtgatgatgt 36827454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Original strand, 612230 - 612358
Alignment:
Q  103 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 202  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  | |||  || |||  |||||||||||| |||||| | | | || ||||  |||||||||||||| | |      
T  612230 gtccctgactatgcacctcgttgttacaaagatcctcgattcaaaattaaatacaaagaagtccgtgaatgtgtacttatgttatcactttagttcctca 612329  T
Q  203 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  612330 cattaaataattatgttaagtgatgatgt 612358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 53771174 - 53771035
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  53771174 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagcccctgactctgcacttccgt 53771075  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  53771074 tatcactttagtcattgacgttaaataattctgttaagtg 53771035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 42278047 - 42278193
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42278047 gagcaaatagtcactttagtccttgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcgggattaaatacaaataagttcctgactctgcacttccgt 42278146  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42278147 tatcactttaatccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 42278193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47878608 - 47878463
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  47878608 agcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgttacataggtccctgactctggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgtt 47878509  T
Q  186 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  47878508 atcactttagtccatgacgttaataaaatctgttaagcgatgatgt 47878463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Original strand, 47874566 - 47874704
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  47874566 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctatcacataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgttatc 47874665  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  47874666 actttagtcc-tgatgttaaaaaaatatgttaaatgatga 47874704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 31844720 - 31844865
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |    
T  31844720 gagcaaatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtccctaactctacacttccct 31844819  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||| |||  || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  31844820 tatcactttggtcactgtcgtttaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 31844865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26173062 - 26172931
Alignment:
Q  90 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 189  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||   ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  26173062 aatagtcactttagtccccaactatgcaccttactgtcagaaaggtccttgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgttatca 26172963  T
Q  190 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26172962 ctttagtccatgccgttaaaaaattatgttaa 26172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48740145 - 48740006
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||| ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  48740145 gagcaaatggtcactttagtccatgtctctgcacctcattgtcacgtagatccctgactcataattaaatacaaagaagtccccaactctgcacttctgt 48740046  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  48740045 tatcactttagtccctgacgttaaataattctgttaagtg 48740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 26170638 - 26170784
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||  |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  26170638 gagcaaatagttagtttagtctctgactttgcacctcgttgttacaaaagtatctgacttaagattaaatacaaataagttccttactctgcacttccat 26170737  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26170738 tatcactttagtccatgctgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 26170784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Original strand, 39868914 - 39869064
Alignment:
Q  79 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 178  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| |   ||| |||||    
T  39868914 taaaatgagtaaattgttactttagtctctgactctgcacctcgctgttacaaaggtccctgactcataattaaatacaaacaagttcg--actctgcac 39869011  T
Q  179 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39869012 ttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 39869064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Original strand, 54574423 - 54574532
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||| |||  | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  54574423 gagcaaatagtcattttgcttcctcactctgcatctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcttaactctgcacttccgt 54574522  T
Q  185 tatcacttta 194  Q
    ||||||||||    
T  54574523 tatcacttta 54574532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4703342 - 4703196
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||  | ||| | |||||||||    
T  4703342 gagcaaattgtcactttagttactgactctacatctcgctgtcacataggtccctaactcagaattaaatacaaagaagtctttgactgtacacttccgt 4703243  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4703242 tatcactttagtctctggcattaaataattctattaagtgatgatgt 4703196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 50694795 - 50694893
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50694795 ggtccctgactcaaaattaaatataaataagtttctgattctgcacttccgttatctctttagtccctgacgttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 50694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21623224 - 21623096
Alignment:
Q  103 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 202  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||  |     
T  21623224 gtccttgactctgcatctcgttgtcacaatgttccctgattcaggattaaatacaaaatagtccttgaatgtgcacttctgttatcactttagtccccga 21623125  T
Q  203 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21623124 cgttaaataattatgttaactaatgatgt 21623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 53770330 - 53770470
Alignment:
Q  84 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 183  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||     
T  53770330 ggagtaaatggtcactttagtctctgactctgcacctcgcattcacataggttcctgactcagaattaaatacaaagaagtctatgactctgcacttcca 53770429  T
Q  184 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  53770430 ttatcactctagtctctgccgttaaataattctgttaagtg 53770470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Original strand, 4701817 - 4701907
Alignment:
Q  139 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4701817 tgacttatgattaaatacaaagaagtccccgactatgcacttccgctatcactttagtccctgatgttaaataattctgttaagtgatgat 4701907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 21621869 - 21621967
Alignment:
Q  133 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21621869 ggtccctgactcaggattaaatacaaaatagtcattgaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgatgttaaataattatgttaactgatgatgt 21621967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31845080 - 31844934
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| || |     ||| | |||||||||    
T  31845080 gagcaaatactcactttagtttttgattttgcatcttgttgtcatataggtttctgactcaggattaaatacaaacaaattttagactctacacttccgt 31844981  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31844980 tatcattttcgtccttgcagttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31844934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42392003 - 42391868
Alignment:
Q  95 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcccta--actttgcacttccgttatcactt 192  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||| |||||| ||    
T  42392003 tcactttagtctctgactccgcacctcactgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaattagtccctaataatgtgcacttcctttatcagtt 42391904  T
Q  193 tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    ||||||  | ||||||||| || | |||| ||||||    
T  42391903 tagtcccagacgttaaaaacttctattaactgatga 42391868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26685528 - 26685408
Alignment:
Q  99 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 198  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||     ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26685528 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctcact-----ttaaatacatagaagtccttgactatgcacttccgttatcactttagtct 26685434  T
Q  199 ttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
     || | ||||| |||| |||||||||    
T  26685433 ctgacattaaataattctgttaagtg 26685408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 44158502 - 44158638
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||  ||    
T  44158502 gagcaaatggtcaatttagcccccgactctgcacctcgttgttacagaggttcctgactcaggattaaatacaaagaagtccctgactctatacttttgt 44158601  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||| |||||||||||    
T  44158602 tattactttaatccctaacgttaaataattatgttaa 44158638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19051356 - 19051253
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  19051356 gagcaaatggtcactttagtccctgactctacacctcgttggcacaaaggtcactgactcgagattaaatacaaagaagtctctgactctacactttcgt 19051257  T
Q  185 tatc 188  Q
    ||||    
T  19051256 tatc 19051253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Original strand, 19050297 - 19050382
Alignment:
Q  146 tgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19050297 tgattaaatacaaagaagtctcggactctgcacttccgttatcactttagtctccgacgttaaataattctattaagtgatgatgt 19050382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54574881 - 54574822
Alignment:
Q  134 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 193  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  54574881 gtccttgactcaggattaaatacaaataaatctctaactctgcacttctgttatcacttt 54574822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 228
Target Start/End: Original strand, 32244361 - 32244415
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32244361 tgcacttccgttatcactttggtccataacgttaaataattatgttaagtgatga 32244415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24753597 - 24753540
Alignment:
Q  174 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  24753597 tgcacttctgttatcactttagtcattcgcgttaaataattttgttaactgatgatgt 24753540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Original strand, 79073 - 79217
Alignment:
Q  87 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 186  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  79073 gcaaatagtcaatttagttcctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttgactcatgattaaataaaaagaagtccttgactttgcacctccgata 79172  T
Q  187 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  79173 tcactttagtctttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 79217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 79808 - 79662
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||| |||  |    
T  79808 gagcaaatagtcactttaatccctgactcggcacctcgttgttacataagttcctgactcatgattaaatacaaagaagtctttgactctgcatttctat 79709  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  79708 tatcattttagtctttgacgttaaataattttattaagtgatgatgt 79662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 74433 - 74357
Alignment:
Q  90 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 166  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  74433 aatagtcagtttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctaactcatgattaaatacaaagaagtcc 74357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Original strand, 116054 - 116166
Alignment:
Q  86 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  116054 agcaaatagtcactttagttcctcattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactatgcacttccgtt 116153  T
Q  186 atcactttagtcc 198  Q
    |||||||||||||    
T  116154 atcactttagtcc 116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 30747997 - 30748143
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  30747997 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcacctcgctgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacactttcgt 30748096  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  30748097 tatcactttagtcgctgccgttaaaaaaaactattaagtgatgatgt 30748143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 31218953 - 31219092
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  31218953 gagcaaatggtcactttaatctctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactctgcacttccgt 31219052  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| |||| | |||||||    
T  31219053 tatcactttaatccctgatgttaaataattctcttaagtg 31219092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31219281 - 31219146
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||   |||||||||||||    
T  31219281 aaatggtcactttaatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtcattaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactcgacacttccgttatc 31219182  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 224  Q
    |||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  31219181 actttagtctctgacgttaaataattctcttaagtg 31219146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 23507947 - 23508092
Alignment:
Q  85 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | || |||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||| |    
T  23507947 gagcaaatagtcactttagtctctg-ctctacacctccctgtcacataggttcctgattcaggattaaatacaaacaaatctatgactttacacttcctt 23508045  T
Q  185 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  23508046 tatcactttagtccctgtcgttaaatttttttgttaagtgataatgt 23508092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12676591 - 12676459
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||||  ||||||    
T  12676591 aaatagtcactttgatatctgactctgcacctcgttgtcacaatggtctctgtctcaggattaaatacaaagtagtctctaaatgtgcacttttgttatc 12676492  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 221  Q
    | |||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  12676491 agtttagtctctggcattaaaaatttatgttaa 12676459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 24621104 - 24621218
Alignment:
Q  114 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 213  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |  || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |    
T  24621104 tgcatctcgttatcataaaggtccttgactcatgattaaatacaaagaaatctctaaatgcgcgcttccgttatcagtttagtcattgacattaaaaact 24621203  T
Q  214 tatgttaagtgatga 228  Q
    | | |||| ||||||    
T  24621204 tctattaactgatga 24621218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6468883 - 6468832
Alignment:
Q  108 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 159  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6468883 tgactctgcatatcgctgtcacaaaggtccctgactcatgattaaatacaaa 6468832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Original strand, 19645948 - 19645993
Alignment:
Q  39 tcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaag 84  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19645948 tcttgctaaccattgtcctcagggcaatggttaaggaaactaaaag 19645993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 10855902 - 10855950
Alignment:
Q  183 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 231  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10855902 gttatcgctttagtccctgacgttaaataattatgttaagtgatcatgt 10855950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 230
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5742
Alignment:
Q  89 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 188  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||   ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  5601 aaattgtcactttagtcactcactttgcacctcgttgtgacaaatgtctctgactcagaattaaatacaaagaagtccctgactctacacttccgttatc 5700  T
Q  189 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 230  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5701 actttagtctctggcgttaaataattatgttatgtgatgatg 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University