View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3375_high_9 (Length: 380)

Name: NF3375_high_9
Description: NF3375
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3375_high_9
NF3375_high_9
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (35-291)||(18797356-18797612)
chr7 (35-349)||(30055498-30055812)
chr7 (49-303)||(38258562-38258816)
chr7 (35-303)||(7334811-7335078)
chr7 (35-303)||(27283761-27284029)
chr7 (35-303)||(37109889-37110159)
chr7 (35-303)||(10481621-10481890)
chr7 (35-303)||(31578940-31579213)
chr7 (35-303)||(32820929-32821197)
chr7 (35-303)||(17842460-17842730)
chr7 (35-303)||(24211758-24212026)
chr7 (35-297)||(9355702-9355964)
chr7 (43-303)||(21991653-21991913)
chr7 (35-303)||(23111207-23111477)
chr7 (35-295)||(11071231-11071488)
chr7 (38-295)||(37347047-37347303)
chr7 (35-303)||(15612635-15612902)
chr7 (38-295)||(41764957-41765214)
chr7 (35-287)||(32432485-32432737)
chr7 (35-303)||(5657357-5657625)
chr7 (38-303)||(43686058-43686322)
chr7 (37-293)||(10359092-10359348)
chr7 (35-297)||(48928173-48928434)
chr7 (38-287)||(4582952-4583201)
chr7 (35-303)||(6546536-6546804)
chr7 (35-303)||(8861302-8861570)
chr7 (35-227)||(15672635-15672830)
chr7 (35-303)||(33688138-33688406)
chr7 (35-303)||(22687256-22687516)
chr7 (40-295)||(38053511-38053741)
chr7 (35-303)||(12165769-12166028)
chr7 (38-295)||(31520620-31520859)
chr7 (35-287)||(29173573-29173807)
chr7 (92-303)||(27421313-27421523)
chr7 (35-245)||(44598741-44598951)
chr7 (35-303)||(25691420-25691689)
chr7 (68-297)||(48928473-48928701)
chr7 (35-212)||(37703374-37703551)
chr7 (90-227)||(37704250-37704387)
chr7 (35-255)||(43925167-43925380)
chr7 (35-256)||(46481005-46481218)
chr7 (35-303)||(12390525-12390774)
chr7 (131-303)||(44413351-44413523)
chr7 (35-303)||(26980340-26980591)
chr7 (35-297)||(35353131-35353393)
chr7 (35-194)||(26587968-26588119)
chr7 (35-297)||(32593082-32593326)
chr7 (35-128)||(44411416-44411509)
chr7 (215-304)||(34362205-34362293)
chr7 (39-115)||(37704387-37704463)
chr7 (199-297)||(26524367-26524465)
chr7 (35-107)||(34362054-34362126)
chr7 (206-252)||(34362149-34362195)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (35-303)||(10922765-10923033)
chr1 (35-303)||(32267072-32267340)
chr1 (35-303)||(8222169-8222434)
chr1 (35-297)||(15382977-15383239)
chr1 (35-305)||(37451322-37451591)
chr1 (35-303)||(18422689-18422957)
chr1 (35-303)||(19899639-19899907)
chr1 (35-303)||(51128897-51129165)
chr1 (35-347)||(30254419-30254729)
chr1 (35-297)||(30326822-30327084)
chr1 (35-303)||(28564653-28564919)
chr1 (35-303)||(32216093-32216361)
chr1 (35-303)||(23999385-23999653)
chr1 (46-303)||(15752067-15752324)
chr1 (35-303)||(28769691-28769959)
chr1 (35-303)||(46931449-46931715)
chr1 (35-303)||(2959786-2960054)
chr1 (35-303)||(9902924-9903192)
chr1 (35-303)||(27763181-27763448)
chr1 (35-291)||(10181877-10182134)
chr1 (35-303)||(38823252-38823520)
chr1 (35-349)||(37618771-37619079)
chr1 (37-263)||(25160710-25160936)
chr1 (35-267)||(27227355-27227587)
chr1 (35-297)||(4330324-4330587)
chr1 (35-303)||(16415683-16415952)
chr1 (35-284)||(27267070-27267318)
chr1 (35-303)||(238383-238650)
chr1 (35-303)||(27532851-27533118)
chr1 (35-287)||(47279243-47279495)
chr1 (35-294)||(42721086-42721342)
chr1 (37-284)||(47682366-47682614)
chr1 (35-303)||(27563775-27564043)
chr1 (35-270)||(7078933-7079168)
chr1 (35-297)||(15168133-15168402)
chr1 (37-303)||(34012254-34012515)
chr1 (35-297)||(40884857-40885119)
chr1 (35-305)||(3309184-3309459)
chr1 (37-294)||(33725472-33725729)
chr1 (35-295)||(41926209-41926462)
chr1 (35-297)||(14758085-14758338)
chr1 (35-303)||(3534970-3535229)
chr1 (35-303)||(39393421-39393690)
chr1 (63-303)||(48620675-48620906)
chr1 (35-303)||(1547325-1547577)
chr1 (35-297)||(31621419-31621685)
chr1 (35-303)||(11742238-11742488)
chr1 (35-246)||(22170806-22171017)
chr1 (38-148)||(1359808-1359918)
chr1 (35-260)||(38759610-38759839)
chr1 (35-148)||(48353736-48353848)
chr1 (199-284)||(21289729-21289814)
chr1 (35-127)||(21289817-21289906)
chr1 (246-303)||(30254896-30254952)
chr1 (215-259)||(1359933-1359977)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (35-303)||(43643476-43643744)
chr8 (35-284)||(1149513-1149762)
chr8 (35-303)||(10555085-10555351)
chr8 (35-303)||(37970400-37970668)
chr8 (35-303)||(23854312-23854580)
chr8 (35-303)||(1204968-1205236)
chr8 (35-307)||(16446756-16447028)
chr8 (35-303)||(36694847-36695115)
chr8 (37-303)||(30654466-30654732)
chr8 (35-303)||(27082719-27082987)
chr8 (35-297)||(9864195-9864457)
chr8 (35-295)||(6098394-6098659)
chr8 (35-303)||(12876150-12876419)
chr8 (35-303)||(31933767-31934035)
chr8 (35-270)||(7890838-7891073)
chr8 (35-297)||(16222910-16223172)
chr8 (39-303)||(8803702-8803959)
chr8 (35-262)||(35459592-35459819)
chr8 (35-303)||(38644019-38644287)
chr8 (35-303)||(40862460-40862728)
chr8 (35-303)||(5299827-5300095)
chr8 (35-303)||(11727065-11727333)
chr8 (39-303)||(13307664-13307927)
chr8 (37-354)||(34894958-34895269)
chr8 (139-303)||(1150090-1150254)
chr8 (35-272)||(39099000-39099237)
chr8 (35-219)||(4132567-4132750)
chr8 (35-228)||(33906328-33906521)
chr8 (35-303)||(465883-466141)
chr8 (35-268)||(1953869-1954104)
chr8 (35-265)||(44869576-44869806)
chr8 (60-227)||(41910895-41911061)
chr8 (87-287)||(43025759-43025959)
chr8 (152-284)||(41362575-41362707)
chr8 (35-148)||(1149801-1149910)
chr8 (151-303)||(34952028-34952180)
chr8 (35-118)||(35859160-35859243)
chr8 (35-114)||(12587812-12587891)
chr8 (35-194)||(18259233-18259388)
chr8 (35-162)||(24823275-24823394)
chr8 (67-144)||(7998478-7998555)
chr8 (151-227)||(7998411-7998488)
chr8 (45-109)||(34951948-34952012)
chr8 (35-79)||(33198067-33198111)
chr8 (37-114)||(34463704-34463778)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (35-303)||(25184155-25184423)
chr4 (35-297)||(879449-879711)
chr4 (35-291)||(37663642-37663898)
chr4 (35-346)||(19089354-19089664)
chr4 (35-297)||(50697290-50697552)
chr4 (35-303)||(55477792-55478064)
chr4 (35-297)||(19440549-19440811)
chr4 (35-295)||(42199779-42200040)
chr4 (35-303)||(32912481-32912749)
chr4 (35-303)||(35020936-35021204)
chr4 (35-303)||(17173332-17173600)
chr4 (35-303)||(34361393-34361660)
chr4 (35-303)||(17167755-17168023)
chr4 (35-296)||(6864084-6864345)
chr4 (35-305)||(23761112-23761381)
chr4 (38-295)||(36493593-36493849)
chr4 (35-303)||(3042653-3042929)
chr4 (35-294)||(5047867-5048125)
chr4 (35-303)||(34947996-34948266)
chr4 (35-297)||(28002887-28003149)
chr4 (35-269)||(33341475-33341708)
chr4 (35-273)||(55241006-55241243)
chr4 (41-305)||(25700963-25701228)
chr4 (35-303)||(29584101-29584367)
chr4 (35-229)||(1815417-1815611)
chr4 (35-297)||(38011902-38012164)
chr4 (66-284)||(4934134-4934353)
chr4 (35-303)||(7703559-7703819)
chr4 (35-303)||(47253791-47254050)
chr4 (35-303)||(27396658-27396926)
chr4 (35-295)||(46888059-46888318)
chr4 (35-274)||(9139316-9139539)
chr4 (35-296)||(37775718-37775968)
chr4 (37-303)||(49376009-49376275)
chr4 (35-347)||(37287732-37288038)
chr4 (35-293)||(32579496-32579756)
chr4 (35-291)||(50764784-50765030)
chr4 (35-225)||(17272084-17272274)
chr4 (68-297)||(35025530-35025751)
chr4 (37-273)||(32592165-32592392)
chr4 (90-303)||(54499193-54499408)
chr4 (35-303)||(30002542-30002793)
chr4 (35-288)||(33816417-33816687)
chr4 (35-303)||(4598035-4598292)
chr4 (35-197)||(46884015-46884171)
chr4 (35-151)||(7152105-7152221)
chr4 (35-147)||(26896285-26896397)
chr4 (139-303)||(39397960-39398115)
chr4 (35-109)||(4205220-4205294)
chr4 (35-109)||(39400244-39400318)
chr4 (240-303)||(4205158-4205221)
chr4 (41-104)||(56050171-56050234)
chr4 (253-303)||(4396368-4396418)
chr4 (35-79)||(35025467-35025511)
chr4 (260-303)||(53124329-53124372)
chr4 (35-74)||(23431826-23431865)
chr4 (233-303)||(23518402-23518472)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (35-353)||(7880-8197)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (35-349)||(22973947-22974260)
chr5 (35-303)||(31705477-31705744)
chr5 (35-303)||(22255223-22255492)
chr5 (35-303)||(22980835-22981103)
chr5 (35-303)||(38528102-38528369)
chr5 (73-356)||(14919431-14919714)
chr5 (35-303)||(699192-699460)
chr5 (35-291)||(5829955-5830202)
chr5 (35-291)||(7208729-7208984)
chr5 (35-295)||(24886154-24886397)
chr5 (68-303)||(27318385-27318620)
chr5 (38-303)||(23116090-23116355)
chr5 (35-303)||(30969189-30969457)
chr5 (35-303)||(31786511-31786779)
chr5 (35-295)||(12910400-12910665)
chr5 (35-303)||(17157896-17158163)
chr5 (35-283)||(35504427-35504675)
chr5 (35-305)||(43308525-43308786)
chr5 (35-297)||(33908281-33908543)
chr5 (35-303)||(19119901-19120169)
chr5 (35-297)||(5837603-5837865)
chr5 (35-303)||(27330348-27330614)
chr5 (35-295)||(35826351-35826608)
chr5 (38-303)||(36866804-36867069)
chr5 (38-287)||(40133443-40133692)
chr5 (35-266)||(15992405-15992636)
chr5 (37-303)||(36860465-36860732)
chr5 (35-303)||(8741750-8742020)
chr5 (37-303)||(35511349-35511610)
chr5 (90-284)||(23954709-23954904)
chr5 (35-305)||(25500791-25501061)
chr5 (35-284)||(21088631-21088880)
chr5 (35-303)||(1429027-1429278)
chr5 (35-303)||(7693272-7693531)
chr5 (87-303)||(26268116-26268332)
chr5 (35-295)||(39572869-39573121)
chr5 (35-303)||(9200275-9200534)
chr5 (35-303)||(32563191-32563450)
chr5 (35-297)||(8437014-8437275)
chr5 (36-227)||(35934013-35934205)
chr5 (35-288)||(6824346-6824599)
chr5 (35-223)||(13956227-13956415)
chr5 (35-303)||(15724532-15724798)
chr5 (103-295)||(5112247-5112438)
chr5 (35-304)||(42342774-42343031)
chr5 (37-297)||(14409208-14409453)
chr5 (35-197)||(2888310-2888472)
chr5 (35-287)||(22019690-22019933)
chr5 (133-303)||(28416490-28416660)
chr5 (35-131)||(25889584-25889680)
chr5 (35-194)||(25669737-25669886)
chr5 (35-303)||(8466787-8467036)
chr5 (190-291)||(25668703-25668804)
chr5 (261-303)||(22255617-22255659)
chr5 (208-293)||(11898054-11898139)
chr5 (250-303)||(13956425-13956478)
chr5 (100-148)||(11898151-11898199)
chr5 (260-303)||(26317774-26317817)
chr5 (260-302)||(5748478-5748520)
chr5 (38-79)||(28416419-28416460)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (35-297)||(42505950-42506212)
chr3 (35-303)||(48354974-48355242)
chr3 (35-303)||(26941135-26941403)
chr3 (39-295)||(4761527-4761784)
chr3 (35-303)||(40552134-40552402)
chr3 (35-307)||(3655077-3655349)
chr3 (35-303)||(46297637-46297905)
chr3 (35-303)||(47481555-47481823)
chr3 (35-297)||(21009677-21009939)
chr3 (35-297)||(34132974-34133236)
chr3 (35-307)||(39282682-39282953)
chr3 (35-253)||(46994536-46994754)
chr3 (35-305)||(54828576-54828845)
chr3 (35-303)||(37203100-37203369)
chr3 (35-295)||(52040797-52041058)
chr3 (35-284)||(24488837-24489086)
chr3 (35-303)||(54505841-54506108)
chr3 (35-303)||(37157741-37158009)
chr3 (35-303)||(2007966-2008233)
chr3 (35-297)||(53229027-53229290)
chr3 (35-297)||(7327357-7327619)
chr3 (35-297)||(22451007-22451269)
chr3 (46-295)||(11466865-11467114)
chr3 (38-303)||(3362286-3362553)
chr3 (35-303)||(4015493-4015760)
chr3 (35-291)||(24707990-24708246)
chr3 (35-306)||(32373502-32373771)
chr3 (38-303)||(22445943-22446207)
chr3 (35-297)||(33378660-33378922)
chr3 (35-224)||(33698265-33698454)
chr3 (134-303)||(51212955-51213124)
chr3 (35-222)||(22622593-22622780)
chr3 (35-303)||(11357256-11357508)
chr3 (35-303)||(29099388-29099647)
chr3 (35-303)||(44891539-44891798)
chr3 (35-303)||(45174536-45174807)
chr3 (37-274)||(43348320-43348556)
chr3 (37-287)||(21193655-21193906)
chr3 (87-303)||(35844359-35844575)
chr3 (35-297)||(43975767-43976025)
chr3 (164-295)||(20373300-20373431)
chr3 (35-295)||(25579780-25580040)
chr3 (40-304)||(38591726-38591994)
chr3 (35-303)||(44186392-44186644)
chr3 (50-297)||(27480252-27480516)
chr3 (35-242)||(29163912-29164110)
chr3 (35-132)||(51212646-51212743)
chr3 (35-210)||(1089819-1089994)
chr3 (35-229)||(36012244-36012440)
chr3 (112-263)||(53176127-53176278)
chr3 (35-274)||(14586555-14586784)
chr3 (56-179)||(20373140-20373263)
chr3 (35-303)||(40936024-40936274)
chr3 (95-227)||(11835562-11835695)
chr3 (40-148)||(11357030-11357138)
chr3 (35-126)||(50475021-50475112)
chr3 (35-131)||(53811609-53811701)
chr3 (260-302)||(41585407-41585449)
chr3 (261-303)||(33698221-33698263)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (35-303)||(19289216-19289484)
chr2 (35-303)||(43648138-43648406)
chr2 (35-303)||(33550880-33551147)
chr2 (38-303)||(37905750-37906017)
chr2 (35-297)||(11366274-11366536)
chr2 (35-295)||(3176989-3177249)
chr2 (36-297)||(4763679-4763940)
chr2 (51-303)||(17071646-17071898)
chr2 (35-303)||(2325271-2325531)
chr2 (35-305)||(4263969-4264240)
chr2 (35-287)||(44913719-44913974)
chr2 (51-295)||(17054005-17054249)
chr2 (56-295)||(29242052-29242291)
chr2 (35-246)||(41960939-41961150)
chr2 (38-287)||(4166980-4167229)
chr2 (35-303)||(26357619-26357887)
chr2 (40-248)||(45327817-45328025)
chr2 (40-295)||(36642036-36642293)
chr2 (35-303)||(33709125-33709393)
chr2 (35-297)||(31570627-31570889)
chr2 (35-303)||(4478411-4478675)
chr2 (87-303)||(19424573-19424789)
chr2 (35-303)||(27349841-27350099)
chr2 (35-226)||(31861971-31862162)
chr2 (35-274)||(39167262-39167495)
chr2 (35-296)||(35958958-35959202)
chr2 (35-303)||(43770741-43771000)
chr2 (35-303)||(33660270-33660529)
chr2 (92-291)||(33902120-33902319)
chr2 (35-247)||(18494174-18494385)
chr2 (87-295)||(41463795-41464003)
chr2 (41-303)||(44285991-44286253)
chr2 (37-244)||(41465602-41465809)
chr2 (35-303)||(13711506-13711769)
chr2 (35-274)||(5881610-5881839)
chr2 (35-274)||(7006831-7007053)
chr2 (35-303)||(19313894-19314157)
chr2 (59-204)||(18258204-18258349)
chr2 (35-148)||(19500808-19500921)
chr2 (200-245)||(41051263-41051308)
chr2 (175-226)||(19501773-19501823)
chr2 (35-79)||(41051193-41051237)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (35-291)||(408304-408559)
scaffold0002 (35-284)||(195-438)
scaffold0002 (111-303)||(94334-94526)
scaffold0002 (35-104)||(93975-94044)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (35-303)||(1945876-1946144)
chr6 (36-303)||(5627433-5627700)
chr6 (35-291)||(6091056-6091313)
chr6 (35-287)||(3879813-3880065)
chr6 (35-297)||(7234909-7235170)
chr6 (35-303)||(4318696-4318965)
chr6 (35-303)||(8513275-8513538)
chr6 (35-303)||(29182205-29182474)
chr6 (87-303)||(7055141-7055357)
chr6 (35-284)||(21016992-21017235)
chr6 (37-303)||(33892888-33893144)
chr6 (87-291)||(15491669-15491873)
chr6 (37-303)||(6088950-6089211)
chr6 (59-303)||(30353256-30353500)
chr6 (35-245)||(20768184-20768392)
chr6 (35-297)||(33618882-33619140)
chr6 (214-303)||(18498475-18498565)
chr6 (37-92)||(7054649-7054704)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (37-303)||(145893-146159)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (38-303)||(43999-44263)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (38-303)||(154524-154788)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (35-297)||(11955-12219)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (35-297)||(267331-267595)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (84-124)||(100948-100988)
scaffold0009 (254-303)||(42390-42439)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18797612 - 18797356
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18797612 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 18797513  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18797512 tgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattg 18797413  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18797412 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgtta 18797356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30055812 - 30055498
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30055812 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaag 30055713  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  30055712 tgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactg 30055613  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcact 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||        |||||||||| |||||||     
T  30055612 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcacc 30055513  T
Q  335 atagaattttccttt 349  Q
    |||||||||||||||    
T  30055512 atagaattttccttt 30055498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258562
Alignment:
Q  49 caacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  149 aggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtca 248  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  249 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 38258562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7335078 - 7334811
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  7335078 tctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaact-agttgatgatattatctgataatcttaag 7334980  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7334979 tgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactg 7334880  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  7334879 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaactt 7334811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27284029 - 27283761
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  27284029 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaag 27283930  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||    
T  27283929 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactg 27283830  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27283829 aacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 27283761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37110159 - 37109889
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37110159 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaag 37110060  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaagg--taagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  |     
T  37110059 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgac 37109960  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37109959 tgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 37109889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10481890 - 10481621
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10481890 tctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 10481791  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||    
T  10481790 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactg 10481691  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  10481690 aatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaactt 10481621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 31578940 - 31579213
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31578940 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaag 31579039  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  31579040 tgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactg 31579139  T
Q  235 aacttttgatgtcattgta-----caaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31579140 aacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 31579213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 32820929 - 32821197
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32820929 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaag 32821028  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||    
T  32821029 tgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactg 32821128  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32821129 aacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaactt 32821197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 17842460 - 17842730
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17842460 tctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaag 17842559  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaagg--taagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  |     
T  17842560 tgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgac 17842659  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17842660 tgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 17842730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24212026 - 24211758
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24212026 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttagg 24211927  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  24211926 tgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctg 24211827  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24211826 aacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 24211758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 9355702 - 9355964
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9355702 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaag 9355801  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||| |     
T  9355802 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaacta 9355901  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9355902 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgt 9355964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21991913 - 21991653
Alignment:
Q  43 tgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21991913 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacac 21991814  T
Q  143 tttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttg 242  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  21991813 tttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttg 21991714  T
Q  243 atgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21991713 atgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaactt 21991653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23111477 - 23111207
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23111477 tctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 23111378  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggta--agataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||   |    
T  23111377 tgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggt 23111278  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23111277 tgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaactt 23111207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11071488 - 11071231
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11071488 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 11071392  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11071391 tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactg 11071292  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  11071291 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagt 11071231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37347303 - 37347047
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37347303 agtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgt 37347204  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    |||||||||||  || |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||| | |||||    
T  37347203 tacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaac 37347105  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37347104 ttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagt 37347047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 15612635 - 15612902
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15612635 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 15612734  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||  | | ||    
T  15612735 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactg 15612834  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  15612835 aacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca-ctttgatgttatagtgttaactt 15612902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 41764957 - 41765214
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41764957 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 41765056  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    |||||||| || |||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||    
T  41765057 tacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggac 41765156  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41765157 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagt 41765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32432737 - 32432485
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32432737 tctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaag 32432638  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||    
T  32432637 tgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactg 32432538  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  32432537 aacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttgat 32432485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 5657357 - 5657625
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  5657357 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 5657456  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | |||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||    
T  5657457 tattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactg 5657556  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5657557 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 5657625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43686322 - 43686058
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43686322 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 43686223  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||  | | |||||    
T  43686222 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaac 43686123  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43686122 ttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaactt 43686058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 293
Target Start/End: Original strand, 10359092 - 10359348
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  10359092 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtg 10359191  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattaga-ttaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||    
T  10359192 ttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatcag-actga 10359290  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 293  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10359291 acttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctata 10359348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 48928173 - 48928434
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48928173 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 48928272  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
      ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||    
T  48928273 cattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactg 48928371  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48928372 aacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 48928434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4583201 - 4582952
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||| || || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4583201 agtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 4583102  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| | | |||||    
T  4583101 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaac 4583002  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4583001 ttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgat 4582952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6546804 - 6546536
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| | |||||    
T  6546804 tctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaag 6546705  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   | |     
T  6546704 tgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagta 6546605  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  6546604 aacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 6546536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8861570 - 8861302
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  8861570 tctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgag 8861471  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| | |||||||||||||| | | |     
T  8861470 tgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggactt 8861371  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8861370 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaactt 8861302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 15672635 - 15672830
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactatt---ttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15672635 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtctt 15672734  T
Q  132 aagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 227  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15672735 aagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 33688138 - 33688406
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||| |     
T  33688138 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgaa 33688237  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaatt 233  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  33688238 tgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagag-act 33688336  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33688337 gaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22687516 - 22687256
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||        |||||  |||||| ||| ||||||||| ||    
T  22687516 tctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca--------gagttgttgatatcatgagatagtcttgag 22687425  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  22687424 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactg 22687325  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22687324 aacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaactt 22687256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38053741 - 38053511
Alignment:
Q  40 taatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38053741 taatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 38053642  T
Q  140 cactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaactt 239  Q
    ||                 |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||| |||||||||| |||||||    
T  38053641 ca-----------------cttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaactt 38053567  T
Q  240 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38053566 ttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagt 38053511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12166028 - 12165769
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||         |    
T  12166028 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga---------g 12165938  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatac-tatgagaatt 233  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || | || ||    
T  12165937 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggactt 12165838  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  12165837 -aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaactt 12165769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 31520620 - 31520859
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31520620 agtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 31520719  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||                 |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| | | |||||    
T  31520720 taca-----------------cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaac 31520801  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  31520802 ttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagt 31520859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29173807 - 29173573
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29173807 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 29173709  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| ||||||                 | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||    
T  29173708 tgtaacactt-----------------aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactg 29173626  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  29173625 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 29173573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 303
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421523
Alignment:
Q  92 taacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagt 191  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  192 gtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    ||| || |||||||||||| | || |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtta 27421511  T
Q  292 tagtgtgaactt 303  Q
    |||||| |||||    
T  27421512 tagtgttaactt 27421523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44598951 - 44598741
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |    
T  44598951 tctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttagg 44598852  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||    
T  44598851 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattg 44598752  T
Q  235 aacttttgatg 245  Q
    || ||||||||    
T  44598751 aatttttgatg 44598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 25691420 - 25691689
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||    ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  25691420 tctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 25691519  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||    
T  25691520 tgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactg 25691619  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt-gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| |||  |||||||  | | ||||||||||||||||| |||||    
T  25691620 aactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaactt 25691689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 297
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928701
Alignment:
Q  68 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataaca 167  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaata 48928572  T
Q  168 aggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg 267  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  48928573 atgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtg 48928671  T
Q  268 ttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48928672 ctactcactacacttttgatgttatagtgt 48928701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 37703374 - 37703551
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37703374 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 37703473  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatga 212  Q
    || ||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37703474 tggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704250
Alignment:
Q  90 tttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  190 gtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 227  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatg 37704250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43925380 - 43925167
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||      ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  43925380 tctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaag 43925287  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||    
T  43925286 tattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactg 43925188  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtaca 255  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43925187 aacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Original strand, 46481005 - 46481218
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46481005 tctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaag 46481104  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||  ||||||||| || |||| ||||| ||||||||        ||||||||||||| | ||||    
T  46481105 tgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatc--------tgatgatactatggggattg 46481196  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaa 256  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  46481197 aatttttgatgtcattgtacaa 46481218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 12390525 - 12390774
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  12390525 tctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtga--gtcttaag 12390622  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||                 | || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |       
T  12390623 tgttacactt-----------------aaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacat 12390705  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12390706 aacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaactt 12390774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413523
Alignment:
Q  131 taagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgaga 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||       
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  231 attgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaactt 44413523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26980591 - 26980340
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26980591 tctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 26980492  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||                 | |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  26980491 tgttacactt-----------------aaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactg 26980409  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  26980408 aacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 26980340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35353393 - 35353131
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35353393 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaag 35353294  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||    |  |  | ||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |  |    
T  35353293 tgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctagtaa-tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacag 35353195  T
Q  235 -aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  35353194 aaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 35353131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 26587968 - 26588119
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||        |||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  26587968 tctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagtcttgag 26588059  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgta 194  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26588060 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 26588119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 32593082 - 32593326
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32593082 tctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 32593181  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||                 |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  || ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  32593182 tgttaca-----------------cttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtgag-actg 32593263  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||  ||   || ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  32593264 aacttttgataccaccatataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 44411416 - 44411509
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44411416 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362293
Alignment:
Q  215 tgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttt 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttt 34362293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37704463 - 37704387
Alignment:
Q  39 gtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgat 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37704463 gtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Original strand, 26524367 - 26524465
Alignment:
Q  199 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| | || |||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  26524367 tgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagtgt 26524465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 34362054 - 34362126
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagag 107  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||    
T  34362054 tctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaacagag 34362126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362195
Alignment:
Q  206 ctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgccattgt 34362195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10923033 - 10922765
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10923033 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaag 10922934  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10922933 tgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattg 10922834  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10922833 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 10922765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32267340 - 32267072
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32267340 tctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgag 32267241  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  32267240 tgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtg 32267141  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32267140 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaactt 32267072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8222434 - 8222169
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8222434 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaag 8222335  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8222334 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactg 8222235  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8222234 aacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 8222169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15383239 - 15382977
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15383239 tctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaag 15383140  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||    
T  15383139 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactg 15383040  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383039 aacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgt 15382977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37451591 - 37451322
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37451591 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 37451492  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  37451491 tgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactg 37451393  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37451392 aacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaacttta 37451322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18422957 - 18422689
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18422957 tctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaag 18422858  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  18422857 tgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactg 18422758  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18422757 aacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaactt 18422689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 19899639 - 19899907
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19899639 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaag 19899738  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  19899739 tgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttg 19899838  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19899839 aacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 19899907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51129165 - 51128897
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  51129165 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaat 51129066  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |  | ||    
T  51129065 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactg 51128966  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51128965 aacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 51128897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30254729 - 30254419
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  30254729 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaag 30254630  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  30254629 tgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactg 30254530  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcact 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |        ||||||||||||||||||     
T  30254529 aacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaag-tcattcttataacttcacc 30254432  T
Q  335 atagaattttcct 347  Q
    |||||||||||||    
T  30254431 atagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 30326822 - 30327084
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30326822 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaag 30326921  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  30326922 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactg 30327021  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30327022 aacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgt 30327084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 28564653 - 28564919
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  28564653 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt--taag 28564750  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||    
T  28564751 tgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactg 28564850  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28564851 aacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 28564919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32216361 - 32216093
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216361 tctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 32216262  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||    
T  32216261 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactg 32216162  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32216161 aacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaactt 32216093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23999653 - 23999385
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23999653 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 23999554  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||   ||    
T  23999553 tgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctg 23999454  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23999453 aacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaactt 23999385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15752324 - 15752067
Alignment:
Q  46 ttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 145  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15752324 ttgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacacttt 15752225  T
Q  146 gtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg 245  Q
     || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15752224 atggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 15752125  T
Q  246 tcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  15752124 ccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaactt 15752067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28769959 - 28769691
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28769959 tctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaag 28769860  T
Q  135 tgttacactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
     |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |      
T  28769859 cgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggacc 28769760  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28769759 gaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaactt 28769691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46931715 - 46931449
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46931715 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 46931616  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   ||    
T  46931615 tgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctg 46931518  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46931517 aatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 46931449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2960054 - 2959786
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  2960054 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaag 2959955  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  2959954 tgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactg 2959855  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2959854 aacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaactt 2959786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 9902924 - 9903192
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9902924 tctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaag 9903023  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  9903024 tgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattg 9903123  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9903124 aacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaactt 9903192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 27763181 - 27763448
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27763181 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaag 27763280  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  27763281 tattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctg 27763380  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27763381 gacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 27763448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Original strand, 10181877 - 10182134
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttaca-ggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10181877 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaa 10181976  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |    
T  10181977 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggact 10182076  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||    
T  10182077 gaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgtta 10182134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38823520 - 38823252
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  38823520 tctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 38823421  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| || || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  38823420 tgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattg 38823321  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38823320 aacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaactt 38823252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 349
Target Start/End: Original strand, 37618771 - 37619079
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||         |    
T  37618771 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatga---------g 37618861  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatg--atactatgagaat 232  Q
    ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||     
T  37618862 tgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaac 37618961  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg--ttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataactt 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |        |||||||||||||||    
T  37618962 tgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaaagtcattcttataactt 37619060  T
Q  331 cactatagaattttccttt 349  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  37619061 caccatagaattttccttt 37619079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25160936 - 25160710
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25160936 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtg 25160837  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  25160836 ttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaa 25160737  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtgg 263  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25160736 cttttgatgccattgtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 267
Target Start/End: Original strand, 27227355 - 27227587
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27227355 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaag 27227454  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  27227455 tgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 27227554  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg 267  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27227555 aacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4330587 - 4330324
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4330587 tctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 4330488  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||  | ||    
T  4330487 tgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactg 4330388  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  4330387 aacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgt 4330324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16415952 - 16415683
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16415952 tctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 16415853  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | ||||| | |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    ||    
T  16415852 tattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctg 16415753  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaaca-gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16415752 aacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaactt 16415683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 27267070 - 27267318
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27267070 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 27267169  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||    
T  27267170 tgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggt-agattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactg 27267268  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27267269 aacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttt 27267318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 238383 - 238650
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238383 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 238482  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||||||||| | | ||    
T  238483 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactg 238582  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||  |||||||| |||||    
T  238583 aacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaactt 238650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 27532851 - 27533118
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  27532851 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgag 27532950  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  27532951 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattg 27533049  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||  | | |||||||| |||||||| |||||    
T  27533050 aacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaactt 27533118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47279495 - 47279243
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  47279495 tctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaag 47279396  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || | ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  47279395 tgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 47279296  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  47279295 aactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 47279243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42721342 - 42721086
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |   ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  42721342 tctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaag 42721246  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  42721245 tgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattg 42721146  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatag 294  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  42721145 aacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatag 42721086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 284
Target Start/End: Original strand, 47682366 - 47682614
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  47682366 tagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtg 47682465  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  47682466 ttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaa 47682565  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggg-gtgttactcattacattttt 284  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  47682566 cttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttt 47682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 27563775 - 27564043
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  27563775 tctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaag 27563874  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||| | ||||||| ||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| ||    
T  27563875 tgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactg 27563974  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||    
T  27563975 aacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaactt 27564043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 270
Target Start/End: Original strand, 7078933 - 7079168
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7078933 tctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaag 7079032  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | ||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||    
T  7079033 tcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactg 7079132  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7079133 aacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgtta 7079168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15168402 - 15168133
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15168402 tctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaag 15168303  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  15168302 tgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactg 15168203  T
Q  235 aacttttgatg-------tcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||        ||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  15168202 aacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 15168133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 34012254 - 34012515
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     |||    
T  34012254 tagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtg 34012348  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||    
T  34012349 ttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaa 34012448  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  34012449 cttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaactt 34012515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40885119 - 40884857
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40885119 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 40885020  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||  |   |||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||  | | ||    
T  40885019 tgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactg 40884920  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  40884919 aacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgt 40884857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3309459 - 3309184
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  3309459 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaag 3309360  T
Q  135 tgttacact-----ttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatga 228  Q
    |||||||||     | ||||||||||||  ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3309359 tgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 3309260  T
Q  229 gaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
      ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3309259 agattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttta 3309184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725729
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaa 33725671  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatag 294  Q
    ||||||||| ||    | ||| |||||| || |||||| |||| |||||||| |||||    
T  33725672 cttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatag 33725729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41926462 - 41926209
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||      ||    
T  41926462 tctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaata------ag 41926370  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  | | ||    
T  41926369 tgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactg 41926270  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||    
T  41926269 aacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagt 41926209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14758338 - 14758085
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  14758338 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa- 14758240  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
            ||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| | | ||    
T  14758239 --------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactg 14758148  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14758147 aacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 14758085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3535229 - 3534970
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||         |||    
T  3535229 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt---------aag 3535139  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| || | | | ||    
T  3535138 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactg 3535039  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3535038 aacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 3534970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39393690 - 39393421
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||  | |||| || |||||||||||||    
T  39393690 tctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaag 39393591  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  39393590 tgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggatt 39393491  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||| || |||||||||| ||  || |||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  39393490 aaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 39393421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620675
Alignment:
Q  63 tacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgctta 162  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacactta 48620816  T
Q  163 taacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 262  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48620815 aaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtg 48620716  T
Q  263 gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  48620715 gggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaactt 48620675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1547577 - 1547325
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||        |||||  |||||| |||||||||| || ||    
T  1547577 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagttttgag 1547486  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||        ||||||||||||||| ||    
T  1547485 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctg--------atgatactatgagaactg 1547394  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  1547393 aacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaactt 1547325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 31621419 - 31621685
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatct-----ttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtc 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || ||||     |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  31621419 tctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtc 31621518  T
Q  130 ttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 229  Q
    |||||||| |||| || || ||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31621519 ttaagtgtcacac-ttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 31621617  T
Q  230 aattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
     | |||| |||||||| ||  ||||||| || |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31621618 gactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgt 31621685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 11742238 - 11742488
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||     
T  11742238 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaat 11742337  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  11742338 tgttacactt-----------------aaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactg 11742419  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||| |||||    
T  11742420 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaactt 11742488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22171017 - 22170806
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||| ||||||||| || |||||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22171017 tctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaag 22170918  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||    
T  22170917 tgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactg 22170818  T
Q  235 aacttttgatgt 246  Q
    ||||||||||||    
T  22170817 aacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 1359808 - 1359918
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1359808 agtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgt 1359907  T
Q  138 tacactttgtg 148  Q
    |||||||||||    
T  1359908 tacactttgtg 1359918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38759839 - 38759610
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||| || |  | |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||    
T  38759839 tctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatagtctcaag 38759740  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg-agaat- 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || ||| || |||||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||||| ||||||||| || | ||| |     
T  38759739 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagactg 38759640  T
Q  233 --tgaacttttgatgtcattgtacaaacag 260  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38759639 gctgaacttttgatgtcactgtacaaacag 38759610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 48353848 - 48353736
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  48353848 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-ag 48353750  T
Q  135 tgttacactttgtg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  48353749 tgttacactttgtg 48353736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21289814 - 21289729
Alignment:
Q  199 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21289814 tgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttt 21289729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21289906 - 21289817
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatag 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21289906 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30254952 - 30254896
Alignment:
Q  246 tcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30254952 tcattgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaactt 30254896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 259
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1359977
Alignment:
Q  215 tgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 259  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcattatacaaaca 1359977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 43643476 - 43643744
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43643476 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaag 43643575  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43643576 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattg 43643675  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43643676 aactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 43643744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 1149513 - 1149762
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  1149513 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaag 1149612  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  1149613 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacag 1149712  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1149713 aacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 10555085 - 10555351
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||    
T  10555085 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aag 10555182  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10555183 tgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattg 10555282  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10555283 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 10555351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 37970400 - 37970668
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37970400 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 37970499  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||    
T  37970500 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctg 37970599  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37970600 aacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 37970668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 23854312 - 23854580
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23854312 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaag 23854411  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  23854412 tgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactg 23854511  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23854512 aacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 23854580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1205236 - 1204968
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1205236 tctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaag 1205137  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1205136 tgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactg 1205037  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1205036 aacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaactt 1204968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Original strand, 16446756 - 16447028
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16446756 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaag 16446855  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | | |     
T  16446856 tgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggacta 16446955  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatc 307  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16446956 aacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatc 16447028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 36694847 - 36695115
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36694847 tctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 36694946  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  36694947 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactg 36695046  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36695047 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaactt 36695115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 30654466 - 30654732
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654466 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 30654565  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    ||||    
T  30654566 ttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaa 30654665  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30654666 cttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 30654732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 27082719 - 27082987
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082719 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaag 27082818  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||    
T  27082819 tgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactg 27082918  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27082919 aacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaactt 27082987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9864457 - 9864195
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9864457 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaag 9864358  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  9864357 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactg 9864258  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  9864257 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgt 9864195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Original strand, 6098394 - 6098659
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtc-----ggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtc 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6098394 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc 6098493  T
Q  130 ttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  6098494 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggg 6098593  T
Q  230 aattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  6098594 gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagt 6098659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12876419 - 12876150
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt-aa 133  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12876419 tctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaa 12876320  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  12876319 gtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 12876220  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||    
T  12876219 gaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaactt 12876150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 31933767 - 31934035
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||    
T  31933767 tctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaag 31933866  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |  | ||    
T  31933867 tgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactg 31933966  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  31933967 aacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaactt 31934035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 270
Target Start/End: Original strand, 7890838 - 7891073
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7890838 tctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaag 7890937  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |    
T  7890938 tgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccg 7891037  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  7891038 aacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtta 7891073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16223172 - 16222910
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16223172 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaag 16223073  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  16223072 tgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactg 16222973  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  16222972 aacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgt 16222910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 303
Target Start/End: Original strand, 8803702 - 8803959
Alignment:
Q  39 gtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8803702 gtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgtt 8803801  T
Q  139 acactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaact 238  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||          ||||||    
T  8803802 acactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaact 8803894  T
Q  239 tttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8803895 tttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 8803959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 35459592 - 35459819
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  35459592 tctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaag 35459691  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||| | | |||| | ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  35459692 tgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactg 35459791  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtg 262  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35459792 aacttttaatgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38644287 - 38644019
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||    
T  38644287 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgag 38644188  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||    
T  38644187 tgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactg 38644088  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38644087 aacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 38644019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40862728 - 40862460
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  40862728 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaag 40862629  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||  | |||||||||| ||||| | ||    
T  40862628 tgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatgag-actg 40862530  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca-tttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  40862529 aacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaactt 40862460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 5299827 - 5300095
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||  |||||| || ||||| |||||||    
T  5299827 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaag 5299926  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||    
T  5299927 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactg 5300026  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  5300027 aacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaactt 5300095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11727333 - 11727065
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11727333 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaag 11727234  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  11727233 tgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactg 11727134  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11727133 aacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaactt 11727065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13307927 - 13307664
Alignment:
Q  39 gtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 138  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13307927 gtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtt 13307829  T
Q  139 acactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaact 238  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||    
T  13307828 acactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaact 13307729  T
Q  239 tttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13307728 tttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 13307664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34895269 - 34894958
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     |||    
T  34895269 tagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtg 34895175  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||    
T  34895174 ttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaa 34895075  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactat 336  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||        ||||| | || ||||||| ||    
T  34895074 cttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaag-tcattttcatgacttcaccat 34894976  T
Q  337 agaattttcctttaaaaa 354  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34894975 agaattttcctttaaaaa 34894958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150254
Alignment:
Q  139 acactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaact 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  239 tttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaactt 1150254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Original strand, 39099000 - 39099237
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  39099000 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 39099099  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||    
T  39099100 tgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactg 39099199  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttact 272  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  39099200 aacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 219
Target Start/End: Original strand, 4132567 - 4132750
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4132567 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatg 4132666  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatg 219  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  4132667 tgttacactttgtggggtgttacactta-aacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33906521 - 33906328
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33906521 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 33906422  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatga 228  Q
    ||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33906421 tgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 33906328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 466141 - 465883
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  466141 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgtga---------g 466052  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||    
T  466051 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactg 465952  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  465951 aatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaactt 465883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 268
Target Start/End: Original strand, 1953869 - 1954104
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1953869 tctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaag 1953968  T
Q  135 tgttacactttgtgagg-tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgat-gatactatgagaat 232  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||       
T  1953969 tgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggc 1954068  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgt 268  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||    
T  1954069 tgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44869806 - 44869576
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||||||||    
T  44869806 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaag 44869707  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    |||||||||||||| ||    || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||    
T  44869706 tgttacactttgtggggaca-acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgatt 44869608  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44869607 gaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41911061
Alignment:
Q  60 acttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgc 159  Q
    ||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttgca-tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacac 41910993  T
Q  160 ttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 227  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910994 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 41911061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43025959 - 43025759
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||    
T  43025959 atctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagat 43025860  T
Q  187 taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    ||| |||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||| |||  ||| ||||||    
T  43025859 taaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttga 43025760  T
Q  287 t 287  Q
    |    
T  43025759 t 43025759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362575
Alignment:
Q  152 tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattg 251  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  252 tacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactacattttt 41362575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 1149801 - 1149910
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||||    
T  1149801 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaag 1149896  T
Q  135 tgttacactttgtg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  1149897 tgttacactttgtg 1149910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952180
Alignment:
Q  151 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcatt 250  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||| |    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  251 gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaactt 34952180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35859243 - 35859160
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35859243 tctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12587891 - 12587812
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatga 114  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12587891 tctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18259388 - 18259233
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |  || |||||||||||||   | ||  ||||||  |||||    |||| |    
T  18259388 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttagg 18259293  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgta 194  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  18259292 tgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 24823275 - 24823394
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||        |||||||||  |||||| |||||||| |||| ||    
T  24823275 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgataatcttgag 24823366  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgctta 162  Q
    | ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24823367 tattatactttgtggggtgttacactta 24823394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998478
Alignment:
Q  67 ggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998411
Alignment:
Q  151 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatg 7998411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 34951948 - 34952012
Alignment:
Q  45 cttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 109  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  34951948 cttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 34952012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 33198111 - 33198067
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttat 79  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33198111 tctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttat 33198067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34463778 - 34463704
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatga 114  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34463778 tagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25184423 - 25184155
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25184423 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaag 25184324  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25184323 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattg 25184224  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25184223 aactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 25184155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 879449 - 879711
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  879449 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaa 879548  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  879549 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagatta 879648  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879649 aacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 879711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Original strand, 37663642 - 37663898
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37663642 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaag 37663741  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  37663742 tgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 37663841  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37663842 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatgtta 37663898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Original strand, 19089354 - 19089664
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19089354 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaag 19089453  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  19089454 tgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 19089553  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcact 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||       || |||||||| |||||||     
T  19089554 aacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagtt-attcttatgacttcacc 19089652  T
Q  335 atagaattttcc 346  Q
    ||||||||||||    
T  19089653 atagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50697552 - 50697290
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacat-gcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50697552 tctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa 50697453  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50697452 gtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaatt 50697354  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  50697353 gaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgt 50697290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 55477792 - 55478064
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  55477792 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcag 55477891  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  55477892 tgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 55477991  T
Q  235 aacttttgatgtcattgt----acaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55477992 aacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 55478064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 19440549 - 19440811
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  19440549 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaag 19440648  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  19440649 ggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactg 19440748  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19440749 aacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgt 19440811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42200040 - 42199779
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttaca-ggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200040 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaa 42199941  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  42199940 gtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggct 42199841  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199840 gaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagt 42199779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 32912481 - 32912749
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32912481 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 32912580  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||   ||    
T  32912581 tgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctg 32912680  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32912681 aacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 32912749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 35020936 - 35021204
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35020936 tctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 35021035  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |       
T  35021036 tgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacga 35021135  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35021136 aacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaactt 35021204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17173600 - 17173332
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17173600 tctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 17173501  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||||   ||||    
T  17173500 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattg 17173401  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  17173400 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaactt 17173332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 34361393 - 34361660
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  34361393 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaag 34361492  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||||| ||||||   ||    
T  34361493 tgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgag-gctg 34361591  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34361592 aacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 34361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17168023 - 17167755
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17168023 tctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 17167924  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg-agaatt 233  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||     
T  17167923 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaat- 17167825  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  17167824 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaactt 17167755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6864345 - 6864084
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6864345 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag 6864246  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  6864245 tattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactg 6864146  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 296  Q
     ||||||||||  |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6864145 gacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtg 6864084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23761381 - 23761112
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||     
T  23761381 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaa 23761282  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  23761281 tgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactg 23761183  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23761182 aacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttta 23761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 36493593 - 36493849
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36493593 agtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgt 36493692  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    |||||||||||  || |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| | | |||||    
T  36493693 tacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaac 36493791  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  36493792 ttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagt 36493849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3042929 - 3042653
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3042929 tctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag 3042830  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgaga---- 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||  ||| |        
T  3042829 tgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactct 3042730  T
Q  231 ----attgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
        | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  3042729 aatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaactt 3042653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Original strand, 5047867 - 5048125
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5047867 tctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaag 5047966  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||| | ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  5047967 tgttacattttgcg-ggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactg 5048065  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatag 294  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  5048066 aacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatag 5048125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 34947996 - 34948266
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34947996 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaag 34948095  T
Q  135 t--gttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    |  ||||||||||||| |||||| | |||  |||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |     
T  34948096 tacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggac 34948195  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34948196 tgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 34948266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 28002887 - 28003149
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28002887 tctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaag 28002986  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  | ||    
T  28002987 tgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactg 28003086  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| | |||| |||||||| ||||||||    
T  28003087 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgt 28003149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33341708 - 33341475
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  33341708 tctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 33341609  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  33341608 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactg 33341510  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtt 269  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33341509 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 33341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Original strand, 55241006 - 55241243
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  55241006 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaag 55241105  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | |||||||||||||| | | ||    
T  55241106 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatggggactg 55241204  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 273  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  55241205 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 55241243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 305
Target Start/End: Original strand, 25700963 - 25701228
Alignment:
Q  41 aatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 140  Q
    ||||||||||| || || || |||| | ||||||||||| || |   ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25700963 aatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttac 25701062  T
Q  141 actttgtgagg-tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaactt 239  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  25701063 actttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 25701162  T
Q  240 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  25701163 ttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaacttta 25701228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 29584101 - 29584367
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  29584101 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 29584200  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| ||||||  || ||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  29584201 tgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactg 29584300  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29584301 aacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaactt 29584367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1815611 - 1815417
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1815611 tctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 1815512  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1815511 tgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgag 1815417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38012164 - 38011902
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38012164 tctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 38012065  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
     |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| | | ||    
T  38012064 cgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactg 38011965  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  38011964 aacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgt 38011902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 284
Target Start/End: Original strand, 4934134 - 4934353
Alignment:
Q  66 aggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataa 165  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||    
T  4934134 aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaa 4934233  T
Q  166 caaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggg 264  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | |||    
T  4934234 caaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggg 4934333  T
Q  265 gtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4934334 gtgttactcactacattttt 4934353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7703819 - 7703559
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7703819 tctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 7703720  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||        ||||||||||| | | ||    
T  7703719 tgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatggggactg 7703628  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7703627 aacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaactt 7703559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47254050 - 47253791
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  47254050 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 47253951  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||        ||||||||||||| | ||    
T  47253950 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatgaggactg 47253859  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  47253858 aacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaactt 47253791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27396926 - 27396658
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||||||    
T  27396926 tctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaag 27396827  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| ||||||| || | |||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |       
T  27396826 tgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacga 27396727  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||    
T  27396726 aacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaactt 27396658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Original strand, 46888059 - 46888318
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  46888059 tctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtct-aag 46888157  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||  |||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||| |||| | | ||    
T  46888158 tgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactg 46888257  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  46888258 aacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagt 46888318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9139539 - 9139316
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||||||                ||||||    
T  9139539 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttat----------------cttaag 9139456  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9139455 tgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattg 9139356  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 274  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9139355 aactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactca 9139316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37775968 - 37775718
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||         |    
T  37775968 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtga---------g 37775878  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||    |    
T  37775877 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--agggggg 37775780  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 296  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  37775779 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtg 37775718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49376275 - 49376009
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49376275 tagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtg 49376176  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    |||||| ||||| |||||    |||| | ||||| |  |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||    
T  49376175 ttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaa 49376076  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  49376075 cttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaactt 49376009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37288038 - 37287732
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  37288038 tctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaag 37287939  T
Q  135 tgttacactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    ||||||| ||||| | || ||||| |||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||        | |||||| |||||| ||    
T  37287938 tgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatgaggat 37287847  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttca 332  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |        ||||||| || ||||||    
T  37287846 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttca 37287747  T
Q  333 ctatagaattttcct 347  Q
    | |||||||||||||    
T  37287746 ccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32579756 - 32579496
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  32579756 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaag 32579657  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| | |     
T  32579656 agttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatgag-acta 32579558  T
Q  235 aacttttgatgtcattgt---acaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 293  Q
    ||||||||||| ||  ||   ||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  32579557 aacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttata 32579496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50765030 - 50764784
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||| | || ||    
T  50765030 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgag 50764931  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |          ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  50764930 tgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattg 50764841  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  50764840 aacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtta 50764784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17272274 - 17272084
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  17272274 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 17272175  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatacta 225  Q
    ||| ||||||  || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  17272174 tgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 297
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025751
Alignment:
Q  68 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataaca 167  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaaca 35025629  T
Q  168 aggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg 267  Q
    || || |||||||||| ||||| || |||| ||||||||        ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  35025630 agataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtg 35025721  T
Q  268 ttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
     |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  35025722 ctactcactacacttttgatgctatagtgt 35025751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32592392 - 32592165
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||  ||| || || |||         |||    
T  32592392 tagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatga---------gtg 32592302  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||    
T  32592301 ttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaa 32592202  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 273  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  32592201 cttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactc 32592165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Original strand, 54499193 - 54499408
Alignment:
Q  90 tttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagatta 188  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54499193 tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagatta 54499292  T
Q  189 agtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaattgaacttttgatgtcatt-gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    ||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  54499293 agtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagag-actgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttga 54499391  T
Q  287 tgttatagtgtgaactt 303  Q
    || |||||||| |||||    
T  54499392 tgctatagtgttaactt 54499408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 30002542 - 30002793
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  30002542 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------g 30002632  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||||||| ||  | ||    
T  30002633 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaagactg 30002724  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  30002725 aacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaactt 30002793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 288
Target Start/End: Original strand, 33816417 - 33816687
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33816417 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 33816516  T
Q  135 tgttacactttg-----------------tgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttga 217  Q
    ||||||||||||                 || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||    
T  33816517 tgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattga 33816616  T
Q  218 tgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 288  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||| ||  ||| ||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  33816617 tgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatg 33816687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4598292 - 4598035
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  4598292 tctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga---------g 4598202  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||| | | | ||    
T  4598201 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactg 4598103  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||    
T  4598102 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-ctttgatgttatagtgttaactt 4598035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Original strand, 46884015 - 46884171
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46884015 tctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaag 46884109  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtc 197  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  46884110 tgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtc 46884171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 151
Target Start/End: Original strand, 7152105 - 7152221
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7152105 tctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaag 7152204  T
Q  135 tgttacactttgtgagg 151  Q
    ||||| |||||||||||    
T  7152205 tgttatactttgtgagg 7152221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26896397 - 26896285
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacatttt-ggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  26896397 tctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaa 26896299  T
Q  134 gtgttacactttgt 147  Q
    ||||||||||||||    
T  26896298 gtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397960
Alignment:
Q  139 acactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaact 238  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||         ||||||||||  ||  | ||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  239 tttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaactt 39397960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4205294 - 4205220
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 109  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  4205294 tctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 4205220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39400318 - 39400244
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  39400318 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 39400244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205158
Alignment:
Q  240 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaactt 4205158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  41 aatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4396418 - 4396368
Alignment:
Q  253 acaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4396418 acaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 4396368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Original strand, 35025467 - 35025511
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttat 79  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35025467 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 35025511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53124372 - 53124329
Alignment:
Q  260 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53124372 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaactt 53124329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23431865 - 23431826
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactat 74  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23431865 tctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 303
Target Start/End: Original strand, 23518402 - 23518472
Alignment:
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  23518402 tgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaactt 23518472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8197 - 7880
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8197 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaag 8098  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  8097 tgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 7998  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcact 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||        ||||||||||||||||||     
T  7997 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaag-tcattcttataacttcacc 7899  T
Q  335 atagaattttcctttaaaa 353  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7898 atagaatttttctttaaaa 7880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 349
Target Start/End: Original strand, 22973947 - 22974260
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  22973947 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaag 22974046  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22974047 tgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattg 22974146  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcact 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |        ||||||| ||||||||||     
T  22974147 aacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaaaatcattctcataacttcacc 22974245  T
Q  335 atagaattttccttt 349  Q
    |||||||||||||||    
T  22974246 atagaattttccttt 22974260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 31705477 - 31705744
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31705477 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaag 31705576  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  31705577 tgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactg 31705675  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31705676 gacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 31705744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22255492 - 22255223
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  22255492 tctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaag 22255393  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  22255392 tgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactg 22255293  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacat-ttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  22255292 aacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaactt 22255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22981103 - 22980835
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981103 tctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 22981004  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  22981003 tgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactg 22980904  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||||| |||||    
T  22980903 aacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaactt 22980835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 38528102 - 38528369
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38528102 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaag 38528201  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  38528202 tgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actg 38528300  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38528301 aacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaactt 38528369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919714
Alignment:
Q  73 attttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggta 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggta 14919530  T
Q  173 agataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttact 272  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14919531 ggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttact 14919630  T
Q  273 cattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttcctttaaaaata 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||        | ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14919631 cattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcctttaaaaata 14919714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 699460 - 699192
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  699460 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 699361  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | ||||||||||||  ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||    
T  699360 tattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactg 699261  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||    
T  699260 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaactt 699192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5830202 - 5829955
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5830202 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaag 5830103  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||| | |     
T  5830102 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaa---------ttgatgatactatgaggacta 5830012  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5830011 aacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Original strand, 7208729 - 7208984
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  7208729 tctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaag 7208828  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  7208829 tgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactg 7208927  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  7208928 aacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgtta 7208984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24886397 - 24886154
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24886397 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 24886298  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||                 |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24886297 tgttacactt-----------------ataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactg 24886215  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886214 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 24886154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 303
Target Start/End: Original strand, 27318385 - 27318620
Alignment:
Q  68 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataaca 167  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  27318385 gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaata 27318484  T
Q  168 aggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27318485 aggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtg 27318584  T
Q  268 ttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  27318585 ttactcactacattttttatgttttagtgttaactt 27318620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 23116090 - 23116355
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23116090 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 23116189  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||    
T  23116190 tacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaac 23116289  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  23116290 ttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaactt 23116355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 30969189 - 30969457
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  30969189 tctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 30969288  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  30969289 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 30969388  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30969389 aacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 30969457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 31786511 - 31786779
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31786511 tctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaag 31786610  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31786611 tgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattg 31786710  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  31786711 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaactt 31786779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12910665 - 12910400
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12910665 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttagg 12910566  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||    
T  12910565 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactg 12910466  T
Q  235 aacttttgatgtc-----attgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||     | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12910465 aacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagt 12910400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 17157896 - 17158163
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  17157896 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaag 17157995  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  |  |    
T  17157996 tgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatga-cg 17158094  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17158095 aacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 17158163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35504675 - 35504427
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  35504675 tctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaag 35504576  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||    
T  35504575 tgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattg 35504476  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttt 283  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35504475 aacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 43308525 - 43308786
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||        |||||||||    
T  43308525 tctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat--------agtcttaag 43308616  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43308617 tgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactg 43308716  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43308717 aacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaacttta 43308786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33908543 - 33908281
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  33908543 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaag 33908444  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||    
T  33908443 tgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactg 33908344  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  33908343 aacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgt 33908281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19120169 - 19119901
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19120169 tctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 19120070  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||    
T  19120069 tgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactg 19119970  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19119969 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaactt 19119901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5837865 - 5837603
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || |  |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5837865 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 5837766  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||   | ||    
T  5837765 tgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactg 5837666  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  5837665 aaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgt 5837603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27330614 - 27330348
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  27330614 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 27330515  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| ||||||  || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  27330514 tgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactg 27330415  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27330414 aacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaactt 27330348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Original strand, 35826351 - 35826608
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  35826351 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaag 35826448  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  35826449 ggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactg 35826547  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35826548 aacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagt 35826608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36867069 - 36866804
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36867069 agtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 36866970  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||  | | |||||    
T  36866969 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaac 36866870  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  36866869 ttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaactt 36866804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40133692 - 40133443
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40133692 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 40133593  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||| | | |||||    
T  40133592 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaac 40133493  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40133492 ttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgat 40133443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 15992405 - 15992636
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  15992405 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaag 15992504  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| |||||||||| |||||| | || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  15992505 tgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactg 15992604  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15992605 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36860732 - 36860465
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  36860732 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtg 36860633  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgctt-ataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||| |||||||||| | | |||    
T  36860632 ttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactga 36860533  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||| |||||    
T  36860532 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaactt 36860465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 8741750 - 8742020
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatatt-atgtgatagtcttaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  8741750 tctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaa 8741849  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||   | |    
T  8741850 gtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagact 8741949  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8741950 gaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 8742020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 35511349 - 35511610
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     |||    
T  35511349 tagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtg 35511443  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  | ||||    
T  35511444 ttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaa 35511543  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  35511544 cttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaactt 35511610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 284
Target Start/End: Original strand, 23954709 - 23954904
Alignment:
Q  90 tttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23954709 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 23954808  T
Q  190 gtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtca-ttgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23954809 gtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatattttt 23954904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 25500791 - 25501061
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||| | ||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  25500791 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaag 25500890  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||  | | |     
T  25500891 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactt 25500990  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  25500991 aacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaacttta 25501061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 21088631 - 21088880
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |  |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21088631 tctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaag 21088730  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||| |||||||||| | | ||    
T  21088731 tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactg 21088830  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  21088831 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttt 21088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 1429027 - 1429278
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429027 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaag 1429126  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||                 |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||   | ||    
T  1429127 tgttaca-----------------cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactg 1429209  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  1429210 aatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaactt 1429278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7693531 - 7693272
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||         |    
T  7693531 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga---------g 7693441  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  7693440 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattg 7693341  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7693340 aacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 7693272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268116
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgat 26268233  T
Q  187 taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  26268232 taattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttga 26268133  T
Q  287 tgttatagtgtgaactt 303  Q
    || |||||||| |||||    
T  26268132 tgctatagtgttaactt 26268116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39573121 - 39572869
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||        |||||  |||||| ||||||||||||  ||    
T  39573121 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagtctcgag 39573030  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  39573029 tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactg 39572930  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  39572929 aacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagt 39572869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9200534 - 9200275
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  9200534 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------g 9200444  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |     
T  9200443 tgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggacta 9200344  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9200343 aacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 9200275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32563450 - 32563191
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  32563450 tctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------g 32563360  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | | | ||    
T  32563359 tgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactg 32563260  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32563259 aacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 32563191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8437275 - 8437014
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  8437275 tctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaag 8437176  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||| ||||| |||||    |||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  8437175 tgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactg 8437077  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  8437076 aacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgt 8437014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35934205 - 35934013
Alignment:
Q  36 ctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagt 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35934205 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagt 35934106  T
Q  136 gttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 227  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35934105 gttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 35934013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 288
Target Start/End: Original strand, 6824346 - 6824599
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||  | |  |||||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||    
T  6824346 tctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatctt-gacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtcttaag 6824443  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||  | ||    
T  6824444 tgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactg 6824543  T
Q  235 a--acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 288  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  6824544 aacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Original strand, 13956227 - 13956415
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||    
T  13956227 tctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaag 13956326  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatac 223  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13956327 tgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15724798 - 15724532
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||     
T  15724798 tctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaat 15724699  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    || ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  15724698 tgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactg 15724600  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||    
T  15724599 aac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaactt 15724532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 295
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112438
Alignment:
Q  103 cagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgtt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgtt 5112345  T
Q  203 aatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5112346 aatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagt 5112438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42343031 - 42342774
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||         |    
T  42343031 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga---------g 42342941  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag--aat 232  Q
    ||||||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |  |||    
T  42342940 tgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaag-taagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggaaat 42342842  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttt 304  Q
    |    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42342841 t----ttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatgttatagtattaacttt 42342774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Original strand, 14409208 - 14409453
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  14409208 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagag 14409307  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    |               ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  14409308 ta--------------gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaa 14409392  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||| ||  |||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14409393 cttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgt 14409453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Original strand, 2888310 - 2888472
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||    
T  2888310 tctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaag 2888409  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtc 197  Q
    ||||||||||| ||   |||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2888410 tgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22019933 - 22019690
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||         |    
T  22019933 tctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga---------g 22019843  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||| | | | |     
T  22019842 tgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggactt 22019743  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22019742 aacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgat 22019690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 303
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416660
Alignment:
Q  133 agtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |   ||    
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| ||||||||| |||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaactt 28416660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25889680 - 25889584
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 131  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  25889680 tctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25669886 - 25669737
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||         ||    
T  25669886 tctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------ag 25669796  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgta 194  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25669795 tgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8467036 - 8466787
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    | |||||| ||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  8467036 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgt-tacacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaag 8466938  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||                  ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||    
T  8466937 tgttaca-----------------tttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattg 8466855  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||  || |||||||| || ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8466854 aacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaactt 8466787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668703
Alignment:
Q  190 gtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgt 289  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  290 ta 291  Q
    ||    
T  25668704 ta 25668703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22255659 - 22255617
Alignment:
Q  261 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22255659 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 22255617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898054
Alignment:
Q  208 gatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 293  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctata 11898054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 303
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956478
Alignment:
Q  250 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaactt 13956478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898151
Alignment:
Q  100 aaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 148  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtg 11898151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 303
Target Start/End: Original strand, 26317774 - 26317817
Alignment:
Q  260 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26317774 gtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaactt 26317817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5748520 - 5748478
Alignment:
Q  260 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaact 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5748520 gtggggtgttactcattatatttttgacgttatagtgttaact 5748478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 79
Target Start/End: Original strand, 28416419 - 28416460
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttat 79  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  28416419 agtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttat 28416460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 42505950 - 42506212
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42505950 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaag 42506049  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  42506050 tgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 42506149  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42506150 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48355242 - 48354974
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48355242 tctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 48355143  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48355142 tgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactg 48355043  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  48355042 aacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaactt 48354974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 26941135 - 26941403
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  26941135 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaag 26941234  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| | ||    
T  26941235 tgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactg 26941334  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||    
T  26941335 aacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaactt 26941403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Original strand, 4761527 - 4761784
Alignment:
Q  39 gtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761527 gtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 4761626  T
Q  139 acactttgtgagg-tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    | |||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4761627 atactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaac 4761726  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4761727 ttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagt 4761784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 40552134 - 40552402
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  40552134 tctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaag 40552233  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  40552234 tgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactg 40552333  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40552334 aacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 40552402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Original strand, 3655077 - 3655349
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  3655077 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaag 3655176  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  3655177 tgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 3655276  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3655277 aacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatc 3655349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 46297637 - 46297905
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46297637 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 46297736  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||    
T  46297737 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactg 46297836  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  46297837 aacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaactt 46297905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47481823 - 47481555
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481823 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 47481724  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||   |     
T  47481723 tgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggcta 47481624  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47481623 aacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 47481555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 21009677 - 21009939
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21009677 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaag 21009776  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   ||    
T  21009777 tgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctg 21009876  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009877 aacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 21009939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34133236 - 34132974
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  34133236 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaag 34133137  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  34133136 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactg 34133037  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  34133036 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgt 34132974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39282953 - 39282682
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  39282953 tctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaag 39282854  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  39282853 tgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactg 39282754  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatc 307  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  39282753 aacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactca-cacagttttgatgttatagtgttaattttatc 39282682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Original strand, 46994536 - 46994754
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  46994536 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaag 46994635  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||    
T  46994636 tgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactg 46994735  T
Q  235 aacttttgatgtcattgta 253  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46994736 aacttttgatgtcattgta 46994754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 54828576 - 54828845
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  54828576 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttgatgatattatttgatagttttaag 54828675  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||  | ||    
T  54828676 tgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatg 54828775  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    || |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  54828776 aatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacattttt-atgttatagtgttaacttta 54828845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37203369 - 37203100
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttt-atgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37203369 tctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaa 37203270  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |    
T  37203269 gtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggact 37203170  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37203169 gaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 37203100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Original strand, 52040797 - 52041058
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52040797 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 52040896  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  52040897 tgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactg 52040996  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaaca-gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||| || | ||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52040997 aacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagt 52041058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 24488837 - 24489086
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24488837 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaag 24488936  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  24488937 tgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactg 24489036  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  24489037 aacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacattttt 24489086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54506108 - 54505841
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54506108 tctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaag 54506009  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  || |||||||||||||   ||    
T  54506008 tgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgag-gctg 54505910  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    || ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54505909 aatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 54505841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37158009 - 37157741
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttt-atgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37158009 tctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaa 37157910  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||  | |    
T  37157909 gtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgact 37157810  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37157809 gaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 37157741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2008233 - 2007966
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2008233 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 2008134  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  2008133 tgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattg 2008035  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||    
T  2008034 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaactt 2007966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 53229027 - 53229290
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53229027 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaag 53229126  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||    
T  53229127 tgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactg 53229226  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtg-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||  | |||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  53229227 aacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgt 53229290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 7327357 - 7327619
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7327357 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaag 7327456  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||   || |||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||    
T  7327457 tgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactg 7327556  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  7327557 aacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 7327619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22451269 - 22451007
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||     
T  22451269 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaa 22451170  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||    
T  22451169 tgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactg 22451070  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  22451069 aacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 22451007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11467114 - 11466865
Alignment:
Q  46 ttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 145  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11467114 ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 11467015  T
Q  146 gtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg 245  Q
    ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  11467014 gtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatg 11466915  T
Q  246 tcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
     || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  11466914 ccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagt 11466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3362553 - 3362286
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3362553 agtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgt 3362454  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagatta--agtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  3362453 tacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtga 3362354  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||    
T  3362353 acttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaactt 3362286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4015760 - 4015493
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||| ||||||||||||    
T  4015760 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaag 4015662  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | || || ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||    
T  4015661 tgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactg 4015562  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  4015561 aacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 4015493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Original strand, 24707990 - 24708246
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||    
T  24707990 tctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaag 24708089  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat--taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  24708090 tgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagac 24708189  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||    
T  24708190 tgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgatgtta 24708246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32373771 - 32373502
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  32373771 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 32373672  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||  |  | |    
T  32373671 tgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtgg 32373572  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttat 306  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  32373571 aacttttgatgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttat 32373502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 22445943 - 22446207
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  22445943 agtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgt 22446042  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatga-gaattgaa 236  Q
    || || |||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  22446043 tatacattgtga-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaa 22446141  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||    
T  22446142 cttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaactt 22446207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 33378660 - 33378922
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  33378660 tctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaag 33378759  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||    
T  33378760 tattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactg 33378859  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  33378860 aacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgt 33378922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33698454 - 33698265
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||    
T  33698454 tctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaag 33698355  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatact 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  33698354 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213124
Alignment:
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaactt 51213124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 222
Target Start/End: Original strand, 22622593 - 22622780
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22622593 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaag 22622692  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgata 222  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22622693 tgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 11357256 - 11357508
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11357256 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 11357355  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||                 |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  11357356 tgttaca-----------------cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactg 11357438  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||    
T  11357439 aacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaactt 11357508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29099647 - 29099388
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||          
T  29099647 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagt------ 29099554  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
       ||||||||||| |||||||| |||| || |||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| | | | ||    
T  29099553 ---tacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactg 29099457  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  29099456 aactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaactt 29099388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44891798 - 44891539
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  44891798 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 44891699  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| | | |     
T  44891698 tgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggacta 44891599  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |         |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44891598 aacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 44891539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45174807 - 45174536
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||||||||    
T  45174807 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattatagtcttaag 45174708  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | |    
T  45174707 tgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggact 45174608  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttact--cattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45174607 gaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaactt 45174536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43348556 - 43348320
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  43348556 tagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtg 43348457  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    | ||||||| || | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||    
T  43348456 tcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaaag-actgaa 43348358  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 274  Q
    ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||    
T  43348357 cttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctca 43348320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21193906 - 21193655
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt-aagt 135  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||    
T  21193906 tagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagt 21193807  T
Q  136 gttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    ||||  |||| ||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| | | |||    
T  21193806 gttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactga 21193707  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  21193706 acttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 21193655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844359
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaa-ttaga 185  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattaga 35844477  T
Q  186 ttaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttg 285  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35844476 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttg 35844377  T
Q  286 atgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||| |||||    
T  35844376 ttgttatagtgttaactt 35844359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 43975767 - 43976025
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag---agtttatgatattatgtgatagtctt 131  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||    |||| ||||||||||| ||||||       
T  43975767 tctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt--- 43975863  T
Q  132 aagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaa 231  Q
        |||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  43975864 ----gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgagga 43975959  T
Q  232 ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  43975960 ttaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 43976025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373431
Alignment:
Q  164 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  264 ggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagt 20373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25580040 - 25579780
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||| ||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  25580040 tctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaag 25579941  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||| |||| | | ||    
T  25579940 tgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactg 25579841  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||| |||  ||| |||||||| ||||||    
T  25579840 aacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagt 25579780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38591994 - 38591726
Alignment:
Q  40 taatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| || |  |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38591994 taatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtca 38591895  T
Q  140 cactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaactt 239  Q
    |  |||||| ||| |||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | | | |||||    
T  38591894 cgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaactt 38591795  T
Q  240 ttgatgtcattgtacaa----acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttt 304  Q
    |||||| ||||||||||    ||| || | ||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  38591794 ttgatgccattgtacaacaatacaatgagatgttactccctataattttgatgttatagtgttaacttt 38591726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 44186392 - 44186644
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||          
T  44186392 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt------ 44186485  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
              |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||    
T  44186486 ----------tgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactg 44186575  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  44186576 aacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 44186644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 297
Target Start/End: Original strand, 27480252 - 27480516
Alignment:
Q  50 aacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaga----gtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt- 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27480252 aacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttc 27480351  T
Q  145 ----tgtga--------ggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat 232  Q
        ||| |        |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | |     
T  27480352 tgggtgttacacttctgggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggac 27480451  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27480452 tgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgt 27480516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29164110 - 29163912
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  29164110 tctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------g 29164020  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  29164019 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactg 29163920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Original strand, 51212646 - 51212743
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctta 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51212646 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1089994 - 1089819
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  1089994 tctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaag 1089896  T
Q  135 tgttacactttgtgagg-tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgat 210  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  1089895 tgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgat 1089819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36012440 - 36012244
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaac-agagtttatgatattatgtgatagtcttaa 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  36012440 tctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaa 36012341  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 229  Q
    |||||||| |||||| | |||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36012340 gtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53176278 - 53176127
Alignment:
Q  112 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53176278 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 53176179  T
Q  212 agttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 263  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53176178 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 14586555 - 14586784
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||  ||         |    
T  14586555 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacga---------g 14586644  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | |       
T  14586645 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaa 14586744  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 274  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  14586745 aacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactca 14586784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 179
Target Start/End: Original strand, 20373140 - 20373263
Alignment:
Q  56 ttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgtt 155  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||    
T  20373140 ttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggatatt 20373239  T
Q  156 acgcttataacaaggtaagataaa 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  20373240 acgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40936274 - 40936024
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  40936274 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaag 40936175  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||                   || || ||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| | ||    
T  40936174 tgttacactta------------------aaaaaagttggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactg 40936093  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  40936092 aacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 40936024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 227
Target Start/End: Original strand, 11835562 - 11835695
Alignment:
Q  95 catgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaa-attagattaagtgt 193  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11835562 catgcaaatagagttgatgatatcatgtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgt 11835661  T
Q  194 agtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 227  Q
    | |  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  11835662 atttttgttaatatgataaattgatgatactatg 11835695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Original strand, 11357030 - 11357138
Alignment:
Q  40 taatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  | || || |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11357030 taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgtta 11357129  T
Q  140 cactttgtg 148  Q
    |||||||||    
T  11357130 cactttgtg 11357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 50475112 - 50475021
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgata 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  | |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  50475112 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 53811609 - 53811701
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 131  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||    
T  53811609 tctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgtgatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Original strand, 41585407 - 41585449
Alignment:
Q  260 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaact 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41585407 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698221
Alignment:
Q  261 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaactt 33698221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 19289216 - 19289484
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19289216 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 19289315  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  19289316 tgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaactt 19289415  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19289416 aacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaactt 19289484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 43648138 - 43648406
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43648138 tctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag 43648237  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  43648238 tgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactg 43648337  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43648338 aacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 43648406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 33550880 - 33551147
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  33550880 tctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaag 33550978  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |  |    
T  33550979 tgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccg 33551078  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33551079 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaactt 33551147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37906017 - 37905750
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37906017 agtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgt 37905918  T
Q  138 tacactttgtgagg--tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  37905917 tacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 37905818  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37905817 acttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaactt 37905750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 11366274 - 11366536
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11366274 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 11366373  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  11366374 tgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctg 11366473  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366474 aacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgt 11366536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3177249 - 3176989
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3177249 tctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 3177150  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  3177149 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactg 3177050  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  3177049 aacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagt 3176989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4763940 - 4763679
Alignment:
Q  36 ctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagt 135  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4763940 ctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagt 4763841  T
Q  136 gttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  4763840 gttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactga 4763741  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  4763740 acttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgt 4763679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071898
Alignment:
Q  51 acattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgag 150  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  151 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcatt 250  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  251 gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||| | || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaactt 17071898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 2325271 - 2325531
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  2325271 tctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaag 2325370  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||| | ||    
T  2325371 tgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactg 2325462  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  2325463 aacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaactt 2325531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 4263969 - 4264240
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgt-gatagtcttaa 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  4263969 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaa 4264068  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||| ||||||||   | |    
T  4264069 gtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagact 4264168  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  4264169 gaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttta 4264240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44913974 - 44913719
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44913974 tctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 44913875  T
Q  135 tgttacactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaat 232  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  44913874 tgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggat 44913775  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtacaaac-agtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  44913774 tgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgat 44913719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054249
Alignment:
Q  51 acattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgag 150  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  151 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcatt 250  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  |  | |||||||||||||||    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  251 gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagt 17054249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 29242052 - 29242291
Alignment:
Q  56 ttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgtt 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29242052 ttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgtt 29242151  T
Q  156 acgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtaca 255  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||  || ||||||    
T  29242152 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtaca 29242251  T
Q  256 aacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  29242252 aacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagt 29242291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41961150 - 41960939
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  41961150 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaag 41961051  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  41961050 tgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactg 41960951  T
Q  235 aacttttgatgt 246  Q
    ||||||||||||    
T  41960950 aacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4167229 - 4166980
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4167229 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 4167130  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| | | |||||    
T  4167129 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaac 4167030  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  4167029 ttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 4166980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26357887 - 26357619
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||    
T  26357887 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaag 26357788  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||| |  |||| |||| ||    
T  26357787 tgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactg 26357688  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26357687 aacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaactt 26357619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327817
Alignment:
Q  40 taatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  140 cactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaactt 239  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  240 ttgatgtca 248  Q
    |||||||||    
T  45327825 ttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642036
Alignment:
Q  40 taatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 139  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  140 cactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat--aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||||    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagt 36642036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 33709125 - 33709393
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  33709125 tctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 33709224  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  | |||||||||||||| | | ||    
T  33709225 tgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactg 33709324  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33709325 aacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaactt 33709393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 31570627 - 31570889
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  31570627 tctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaag 31570726  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | | ||    
T  31570727 tgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactg 31570826  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||    
T  31570827 aacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgt 31570889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4478675 - 4478411
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  4478675 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaag 4478576  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||     |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  4478575 tgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 4478481  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4478480 aaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 4478411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Original strand, 19424573 - 19424789
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19424573 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagat 19424672  T
Q  187 taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19424673 taagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttga 19424772  T
Q  287 tgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19424773 tgttatagtgttaactt 19424789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 27349841 - 27350099
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  27349841 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga---------g 27349931  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||    
T  27349932 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactg 27350030  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27350031 aacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaactt 27350099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31862162 - 31861971
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||  | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||    
T  31862162 tctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaag 31862063  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31862062 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 31861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 39167262 - 39167495
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  39167262 tctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt------ 39167355  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||    
T  39167356 tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactg 39167455  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39167456 aacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactca 39167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35959202 - 35958958
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  35959202 tctagtaatgcttgcaacatcttggacat----gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaac 35959107  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||             ||    
T  35959106 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctg 35959020  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35959019 aacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtg 35958958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 43770741 - 43771000
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||         |    
T  43770741 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------g 43770831  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || | | | ||    
T  43770832 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactg 43770931  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43770932 aacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 43771000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 33660270 - 33660529
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||          |    
T  33660270 tctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgg---------g 33660360  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||    
T  33660361 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactg 33660460  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33660461 aacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33660529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902120
Alignment:
Q  92 taacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagt 191  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  192 gtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgtta 33902120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 18494174 - 18494385
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  18494174 tctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaag 18494273  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| || ||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  18494274 tgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 18494372  T
Q  235 aacttttgatgtc 247  Q
    |||||||||||||    
T  18494373 aacttttgatgtc 18494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 295
Target Start/End: Original strand, 41463795 - 41464003
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  41463795 atctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatat 41463894  T
Q  187 taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    |||  ||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  41463895 taaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttga 41463994  T
Q  287 tgttatagt 295  Q
    | |||||||    
T  41463995 ttttatagt 41464003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44286253 - 44285991
Alignment:
Q  41 aatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 140  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44286253 aatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttac 44286154  T
Q  141 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttt 240  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| | | | ||||||    
T  44286153 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttt 44286054  T
Q  241 tgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||| || | ||||||||||| | | || |||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  44286053 tgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 44285991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41465809 - 41465602
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41465809 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtg 41465710  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||  | | ||||    
T  41465709 ttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaa 41465610  T
Q  237 cttttgat 244  Q
    ||||||||    
T  41465609 cttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13711769 - 13711506
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||     
T  13711769 tctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaac 13711670  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    | ||| ||||| || |||||||| |||| |||| |     ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| | | |     
T  13711669 tattatactttatggggtgttacacttaaaacatg-----ataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggacta 13711575  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  13711574 aacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 13711506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5881839 - 5881610
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||         |    
T  5881839 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga---------g 5881749  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| | | | |     
T  5881748 tgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactc 5881650  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5881649 aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactca 5881610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 7006831 - 7007053
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  7006831 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaag 7006930  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||                 |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||| ||| |     
T  7006931 tgttaca-----------------cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaacta 7007013  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 274  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  7007014 aacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactca 7007053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19314157 - 19313894
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggactta---caggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 131  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||       
T  19314157 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagt--- 19314061  T
Q  132 aagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaa 231  Q
        ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  19314060 ----gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-agga 19313966  T
Q  232 ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19313965 ctgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 19313894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Original strand, 18258204 - 18258349
Alignment:
Q  59 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 158  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  18258204 gacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttaca 18258303  T
Q  159 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaa 204  Q
    |||| || || ||| |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  18258304 cttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 19500808 - 19500921
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||    |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19500808 tctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaag 19500907  T
Q  135 tgttacactttgtg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  19500908 tgttacattttgtg 19500921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051308
Alignment:
Q  200 gttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 41051308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 19501773 - 19501823
Alignment:
Q  175 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19501773 ataaaattagattaaatgtagtt-tgttaatctgatgaattgatgatactat 19501823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Original strand, 41051193 - 41051237
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttat 79  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41051193 tctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttat 41051237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Original strand, 408304 - 408559
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  408304 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaag 408403  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  408404 tgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactg 408502  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  408503 aacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 438 - 195
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  438 tctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 345  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  344 tgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactg 245  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  244 aacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttt 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 303
Target Start/End: Original strand, 94334 - 94526
Alignment:
Q  111 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgat 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  94334 atgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcat 94433  T
Q  211 gagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    || ||||||||| |||| | |   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  94434 gaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaactt 94526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 93975 - 94044
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  93975 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaaca 94044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1946144 - 1945876
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1946144 tctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 1946045  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||   ||    
T  1946044 tgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctg 1945945  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1945944 aacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 1945876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5627700 - 5627433
Alignment:
Q  36 ctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagt 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5627700 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 5627601  T
Q  136 gttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||   |||    
T  5627600 attacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctga 5627501  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  5627500 acttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaactt 5627433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 291
Target Start/End: Original strand, 6091056 - 6091313
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt-aa 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6091056 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaa 6091155  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  6091156 gtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtact 6091255  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6091256 gaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgtta 6091313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Original strand, 3879813 - 3880065
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3879813 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 3879912  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  3879913 tgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattg 3880012  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgat 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  3880013 aacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgat 3880065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Original strand, 7234909 - 7235170
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7234909 tctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 7235008  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
     |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  7235009 cgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgag-actg 7235107  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7235108 aacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 7235170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Original strand, 4318696 - 4318965
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4318696 tctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 4318795  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||    
T  4318796 tgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggtt 4318895  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4318896 gaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 4318965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8513538 - 8513275
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8513538 tctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 8513439  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    |||||||||||||  ||||      ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||| | | |    
T  8513438 tgttacactttgtagggtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggact 8513345  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  8513344 gaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaactt 8513275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29182474 - 29182205
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  29182474 tctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 29182375  T
Q  135 tgttacactttgtgagg-tgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaatt 233  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||   | |    
T  29182374 tgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagact 29182275  T
Q  234 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29182274 gaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 29182205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055357
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat 186  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatat 7055240  T
Q  187 taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |    
T  7055241 taagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatatttttta 7055340  T
Q  287 tgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7055341 tgttatagtgttaactt 7055357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 21016992 - 21017235
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21016992 tctagtaatgcttgcaacatcttagac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 21017085  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  21017086 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactg 21017185  T
Q  235 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  21017186 aacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttt 21017235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 33892888 - 33893144
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||         |||    
T  33892888 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga---------gtg 33892978  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    |||||||||||| |||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||    
T  33892979 ttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaa 33893077  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33893078 cttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33893144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15491873 - 15491669
Alignment:
Q  87 atctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagat 186  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  15491873 atctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagat 15491774  T
Q  187 taagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttga 286  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  15491773 taagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttga 15491674  T
Q  287 tgtta 291  Q
    |||||    
T  15491673 tgtta 15491669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6089211 - 6088950
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  6089211 tagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtg 6089112  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga 235  Q
    ||| || ||||   |||      ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||   | |||    
T  6089111 ttataccttgtagagtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactga 6089018  T
Q  236 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6089017 acttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaactt 6088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353500
Alignment:
Q  59 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 158  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  159 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 258  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||   | |||||| | |||| || |||||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  259 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| | | ||||||   ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaactt 30353500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20768392 - 20768184
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||    
T  20768392 tctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaag 20768293  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  20768292 tgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactg 20768195  T
Q  235 aacttttgatg 245  Q
    |||||||||||    
T  20768194 aacttttgatg 20768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33619140 - 33618882
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaac-----atgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtc 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||     ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  33619140 tctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactc 33619041  T
Q  130 ttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 229  Q
    |||||||| ||||||   | |||||||| ||        |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33619040 ttaagtgtcacacttctag-ggtgttacact--------ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 33618950  T
Q  230 aattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    || ||||||||||||| ||  ||||||| | |||| || |||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  33618949 aactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgt 33618882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498475
Alignment:
Q  214 ttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaactt 18498475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 92
Target Start/End: Original strand, 7054649 - 7054704
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatcttt 92  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7054649 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 145893 - 146159
Alignment:
Q  37 tagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  145893 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 145992  T
Q  137 ttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaa 236  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||||    
T  145993 ttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaa 146092  T
Q  237 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  146093 cttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaactt 146159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44263 - 43999
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44263 agtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgt 44165  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  44164 tacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 44065  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  44064 tttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaactt 43999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 154524 - 154788
Alignment:
Q  38 agtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 137  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  154524 agtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgt 154622  T
Q  138 tacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaac 237  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  154623 tacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 154722  T
Q  238 ttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  154723 tttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaactt 154788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12219 - 11955
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  12219 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaag 12120  T
Q  135 tgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg 234  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  12119 tgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactg 12020  T
Q  235 aacttttgatgtcattg-tacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||  || || |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  12019 aacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgt 11955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 267595 - 267331
Alignment:
Q  35 tctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtc-ttaa 133  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  267595 tctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaa 267496  T
Q  134 gtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaat 232  Q
    ||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| ||| |     
T  267495 gtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagag-ac 267397  T
Q  233 tgaacttttgatgtcattgtac-aaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 297  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  267396 tgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 100988 - 100948
Alignment:
Q  84 ggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  100988 ggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42390
Alignment:
Q  254 caaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 303  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 42390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University