View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3376-Insertion-1 (Length: 1051)

Name: NF3376-Insertion-1
Description: NF3376
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3376-Insertion-1
NF3376-Insertion-1
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (8-985)||(32746953-32747924)
chr2 (71-985)||(32721676-32722600)
chr2 (71-985)||(32730131-32731055)
chr2 (70-334)||(32711144-32711395)
chr2 (569-691)||(32751795-32751916)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (466-693)||(3285776-3286006)
chr5 (90-379)||(3286104-3286406)
chr5 (182-339)||(3281957-3282117)
chr5 (843-898)||(3282572-3282627)
chr5 (802-840)||(3284216-3284254)
chr5 (542-691)||(3281510-3281659)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 893; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 893; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 985
Target Start/End: Original strand, 32746953 - 32747924
Alignment:
Q  8 atagttaaggcaaaaacggtcaaatatcttacaagtatgaggaaagaagctgtgnnnnnnnnttatctatgaaaggcagcaccttttaagaaaacactaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746953 atagttaaggcaaaaacggtcaaatatcttacaagtatgaggaaagaagctgtgaaaaaaaattatctatgaaaggcagcaccttttaagaaaacactaa 32747052  T
Q  108 ttgttaacgaatctatctgagaaatatagtattacggatttagtagaccaaatataataggaaagaacacaacatgtgtaatgctaaacaccattccttc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32747053 ttgttaacgaatctatctgagaaatatagtattacggatttagtagaccaaatataataggaaagaacacaacatgtgtaatgctaaacaccattccttt 32747152  T
Q  208 tacatctataggcagtttcttccagcaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcagcaatagtaaaaaatgatgcgtcacaactatgcttaacggt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32747153 tacatctataggcagtttcttccaacaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcagcaatagtaaaaaatgatgtgtcacaactatgcttaacggt 32747252  T
Q  308 gccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatctgcactccactaacacaagtcagcaatacaattcctgcacctaagagacactgaaagaggtaagga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747253 gccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatctgcactccactaacacaagtcagcaatacaattcctgcacctaagagacactgaaagaggtaagga 32747352  T
Q  408 gattcaggttcaaatcctataaactaagataactactaattactaatatttgcatatcgaaaaaagggaccatcctcgcctattgcagttggtataccaa 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747353 gattcaggttcaaatcctataaactaagataactact-------aatatttgcatatcgaaaaaagggaccatcctcgcctattgcagttggtataccaa 32747445  T
Q  508 atacatttactgaaattatgcagagaagatatccaagaggcttcatcacaaactgaccaacataagcagtcacaagtcctactggcctgtcaaatgcctc 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32747446 atacatttactgaaattatgcagagaagatatccaagaggcttcatcacaaactgaccaacataagcagtcacaagttctactggcctgttaaatgcctc 32747545  T
Q  608 aatgaagttctctttgcttgaattaacttcaactgcaaacatcaaagatcttagtgcaggagcatagtatctgcaagtaaatcatagatgtttacggaca 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747546 aatgaagttctctttgcttgaattaacttcaactgcaaacatcaaaaatcttagtgcaggagcatagtatctgcaagtaaatcatagatgtttacggaca 32747645  T
Q  708 ctttttctattagagaaaataacaacgatgttatgaaacgatattgtgcattcataaaagagatagacacgacagagttggtgggaatgaacaagtggat 807  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747646 ctttttctattagagaaaataacgacgatgttatgaaacgatattgtgcattcataaaagagatagacacgacagagttggtgggaatgaacaagtggat 32747745  T
Q  808 atggattttttattgggtcccctgatcaacataaattattaacaagagccaagacaaggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaataagttact 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747746 atggattttttattgggtcccctgatcaacataaattattaacaagagccaagacaaggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaataagttact 32747845  T
Q  908 tacgtaacacatgccactgtaggcacttgattgatgataatggag-aaacttgtacctgtctaaaagaaaattgtttgt 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747846 tacgtaacacatgccactgtaggcacttgattgatgataatggagaaaacttgtacctgtctaaaagaaaattgtttgt 32747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 699; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 985
Target Start/End: Original strand, 32721676 - 32722600
Alignment:
Q  71 tatctatgaaaggcagcaccttttaagaaaacactaattgttaacgaatctatctgagaaatatagtattacggatttagtag---accaaatataatag 167  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||    
T  32721676 tatctatgaaagacaacaccttttaagaaaacactaat-gttaacaaatccttctgagaaatatagtattacggatttagaagtaaactaaatgtaatag 32721774  T
Q  168 gaaagaacacaacatgtgtaatgctaaacaccattccttctacatctataggcagtttcttccagcaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcag 267  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32721775 gaacaagcacaacatgtgtaatgctaaacaccaatccttttacatctatagacagtttcttccagcaacattaataagagtgacatgacaaaaatcgcag 32721874  T
Q  268 caatagtaaaaaatgatgcgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatctgcactccactaacacaagtcagcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32721875 caatagtaaaaa-tgatgtgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatctgcactccactaacacaagtcagcaa 32721973  T
Q  368 tacaattcctgcacctaagagacactgaaagaggtaaggagattcaggttcaaatcctataaactaagataactactaattactaatatttgcatatcga 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32721974 tacaattcctgcacctaagagacactgaaagaggtaaggagattcaggttcaaatcctgtaaactaagataactactaattactaatatttgcatatcga 32722073  T
Q  468 aaaaagggaccatcctcgcctattgcagttggtataccaaatacatttactgaaattatgcagagaagatatccaagaggcttcatcacaaactgaccaa 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32722074 aaaaagggaccatcctcgcctatcgcagttggtataccaaatacatttactgaaattatgcagagaagatatccaagaggcttcatcgcaaactgaccaa 32722173  T
Q  568 cataagcagtcacaagtcctactggcctgtcaaatgcctcaatgaagttctctttgcttgaattaacttcaactgcaaacatcaaagatcttagtgcagg 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32722174 cataagcagtcacaagttctactggccagttaaatgcctcaatgaagttctcgtcgcttgaattaacttctactgcaaacatcaaaaatcttagtgcagg 32722273  T
Q  668 agcatagtatctgcaagtaaatcatagatgtttacggacactttttctattagagaaaataacaacgatgttatgaa----acgatattgtgcattcata 763  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||| |||||    
T  32722274 agcatagtatctgcatgtaaatcatagatgtttacggacactttttctattagagaaaataacgacgatgatatgaaatggacgatattgtgcaatcata 32722373  T
Q  764 aaagagatagacacgacagagttggtgggaatgaacaagtggatatggattttttattgggtcccctgatcaacataaattattaacaagagccaagaca 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32722374 aaagagatagacacgacagagttggtgggaatggacaagtggatatggattttttattgggtcccctgatcaacataaattattaacaagagccaagaaa 32722473  T
Q  864 aggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaataagttacttacgtaacacatgccactgtaggcac----ttgattgatgataatggag-aaactt 958  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32722474 aggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaataagttacgtacgtaacacatgtcactgcaggcacatgattgattgatgataatggtgaaaactt 32722573  T
Q  959 gtacctgtctaaaagaaaattgtttgt 985  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32722574 gtacctgtctaaaacaaaattgcttgt 32722600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 699; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 985
Target Start/End: Original strand, 32730131 - 32731055
Alignment:
Q  71 tatctatgaaaggcagcaccttttaagaaaacactaattgttaacgaatctatctgagaaatatagtattacggatttagtag---accaaatataatag 167  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||    
T  32730131 tatctatgaaagacaacaccttttaagaaaacactaat-gttaacaaatccttctgagaaatatagtattacggatttagaagtaaactaaatgtaatag 32730229  T
Q  168 gaaagaacacaacatgtgtaatgctaaacaccattccttctacatctataggcagtttcttccagcaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcag 267  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32730230 gaacaagcacaacatgtgtaatgctaaacaccaatccttttacatctatagacagtttcttccagcaacattaataagagtgacatgacaaaaatcgcag 32730329  T
Q  268 caatagtaaaaaatgatgcgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatctgcactccactaacacaagtcagcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32730330 caatagtaaaaa-tgatgtgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatctgcactccactaacacaagtcagcaa 32730428  T
Q  368 tacaattcctgcacctaagagacactgaaagaggtaaggagattcaggttcaaatcctataaactaagataactactaattactaatatttgcatatcga 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32730429 tacaattcctgcacctaagagacactgaaagaggtaaggagattcaggttcaaatcctgtaaactaagataactactaattactaatatttgcatatcga 32730528  T
Q  468 aaaaagggaccatcctcgcctattgcagttggtataccaaatacatttactgaaattatgcagagaagatatccaagaggcttcatcacaaactgaccaa 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32730529 aaaaagggaccatcctcgcctatcgcagttggtataccaaatacatttactgaaattatgcagagaagatatccaagaggcttcatcgcaaactgaccaa 32730628  T
Q  568 cataagcagtcacaagtcctactggcctgtcaaatgcctcaatgaagttctctttgcttgaattaacttcaactgcaaacatcaaagatcttagtgcagg 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32730629 cataagcagtcacaagttctactggccagttaaatgcctcaatgaagttctcgtcgcttgaattaacttctactgcaaacatcaaaaatcttagtgcagg 32730728  T
Q  668 agcatagtatctgcaagtaaatcatagatgtttacggacactttttctattagagaaaataacaacgatgttatgaa----acgatattgtgcattcata 763  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||| |||||    
T  32730729 agcatagtatctgcatgtaaatcatagatgtttacggacactttttctattagagaaaataacgacgatgatatgaaatggacgatattgtgcaatcata 32730828  T
Q  764 aaagagatagacacgacagagttggtgggaatgaacaagtggatatggattttttattgggtcccctgatcaacataaattattaacaagagccaagaca 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32730829 aaagagatagacacgacagagttggtgggaatggacaagtggatatggattttttattgggtcccctgatcaacataaattattaacaagagccaagaaa 32730928  T
Q  864 aggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaataagttacttacgtaacacatgccactgtaggcac----ttgattgatgataatggag-aaactt 958  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32730929 aggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaataagttacgtacgtaacacatgtcactgcaggcacatgattgattgatgataatggtgaaaactt 32731028  T
Q  959 gtacctgtctaaaagaaaattgtttgt 985  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32731029 gtacctgtctaaaacaaaattgcttgt 32731055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 334
Target Start/End: Original strand, 32711144 - 32711395
Alignment:
Q  70 ttatctatgaaaggcagcaccttttaagaaaacactaattgttaacgaatctatctgagaaatatagtattacggatttagtagaccaaatataatagga 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||    
T  32711144 ttatctatgaaaggcagcaccttttaagaaaacactaat-gttaacgaatctatctgagaaatatagta-----------gtagaccaaatgtaatagga 32711231  T
Q  170 aagaacacaacatgtgtaatgctaaacaccattccttctacatctataggcagtttcttccagcaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcagca 269  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32711232 aagagcaaaacatgtgtaatgctaaacaccattccttttacatctataggcagtttcttccagcaacattaataagagtgacatgacaaaaatcgcagca 32711331  T
Q  270 atagtaaaaaatgatgcgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagca 334  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32711332 atagt-aaaaatgatgtgtcacaactatgcttaatggtgccatttgtgggtcagatagaaaagca 32711395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 569 - 691
Target Start/End: Original strand, 32751795 - 32751916
Alignment:
Q  569 ataagcagtcacaagtcctactggcctgtcaaatgcctcaatgaagttctctttgcttgaattaacttcaactgcaaacatcaaagatcttagtgcagga 668  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||| || |||||  |||||||||| | |||||  ||||||  || ||  ||||||||||    
T  32751795 ataagcagtcacaagttctgctggctttt-aaatgcctcaatgatgtcctcttcacttgaattaagtccaactataaacatacaaaatactagtgcagga 32751893  T
Q  669 gcatagtatctgcaagtaaatca 691  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32751894 gcatagtatctgcaagtaaatca 32751916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 466 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 3286006 - 3285776
Alignment:
Q  466 gaaaaaagggaccatcctcgcctattgcagttggtataccaaatacatttactgaaattatgcagagaagatatccaaga---ggcttcatcacaaactg 562  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  3286006 gaaaaaagggaccatcctcacctatcgctgatggtagaccaaataaatttactgatattatgcaaagaagatatccaagaagaggcttcaccacaaactg 3285907  T
Q  563 accaacataagcagtcacaagtcctactggcctgtcaaatgcctcaatgaagttctctttgcttgaattaacttcaactgcaaacatcaaagatcttagt 662  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3285906 accaacataagcagtgacaagttctgctggcctgttaaatgcctcaaggaagtccttttcacttgaattaactccaactgcaaacatcaaatatcctagt 3285807  T
Q  663 gcaggagcatagtatctgcaagtaaatcata 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285806 gcaggagcatagtatctgcaagtaaatcata 3285776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3286406 - 3286104
Alignment:
Q  90 cttttaagaaaacactaattgttaacgaatctatctgagaaatatagtattacggattta---gtagaccaaatataataggaaagaacacaacatgtgt 186  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| ||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||   ||||||||||| |||||||||  | |||||  || ||    
T  3286406 cttttaagagaacacttat-gttaacaaatttatttgagaaatgtagttttaccgatttaaaagtagaccaaatgtaataggaacaagcacaatttgagt 3286308  T
Q  187 aatgctaaacaccattccttctacatctataggcagtttcttcc-----agcaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcagcaatagtaaaaaat 281  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||     |  |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||  | ||     
T  3286307 aatactaaacaccattccttttacatcaataggaagtctcttcccgataaaaaacaataataagagtggcgtgacaaaaaccgcagaaatagtggataac 3286208  T
Q  282 gatgcgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagcagcatatc--------tgcactccactaacacaagtcagcaatacaat 373  Q
    |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| || |        ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3286207 gat--gtcataactatgcttaatggtgccatttgtggatctgatagaaaagtagcgtaacttgagagttgtgctccactaacacaagccagcaatacaat 3286110  T
Q  374 tcctgc 379  Q
    ||||||    
T  3286109 tcctgc 3286104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3282117 - 3281957
Alignment:
Q  182 tgtgtaatgctaaacaccattccttctacatctataggcagtttcttcc-----agcaacattaataagagcgacgtgacaaaaatcgcagcaatagtaa 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     ||||||| ||||||||| |  ||||||||||  |||| |  |||      
T  3282117 tgtgtgatgctaaacaccattccttttacatctataggcagtctcttcccaatgagcaacagtaataagagtggtgtgacaaaaacagcagaagcagttg 3282018  T
Q  277 aaaatgatgcgtcacaactatgcttaacggtgccatttgtgggtcagatagaaaagcagcata 339  Q
    | | ||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  3282017 acagtgat--gtcattactatgcttaacggtgccatttctgggtcagttagaaaagtagcata 3281957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 843 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 3282627 - 3282572
Alignment:
Q  843 ttattaacaagagccaagacaaggaggctactctgcattcttgcagttggagaaaa 898  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  3282627 ttattagcaagagccagggcaaggaggctactttgcattcctgtagttggagaaaa 3282572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 802 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 3284254 - 3284216
Alignment:
Q  802 gtggatatggattttttattgggtcccctgatcaacata 840  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3284254 gtggatatggattatttattgggtcccttgatcaacata 3284216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 3281659 - 3281510
Alignment:
Q  542 aagaggcttcatcacaaactgaccaacataagcagtcacaagtcctactggcctgtcaaatgcctcaatgaagttctctttgcttgaattaacttcaact 641  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||  ||| | || | ||||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||  |||||    
T  3281659 aagaggcttcacaacaaactggccaaaataaccggtggcaatttctgccggcctattaaatgcctcaatgaagtccttttcacttgaattgaccccaact 3281560  T
Q  642 gcaaacatcaaagatcttagtgcaggagcatagtatctgcaagtaaatca 691  Q
    || ||||||||| | | || |||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  3281559 gcgaacatcaaaaaccctaatgcaggtgcaaagtatctgccagtatatca 3281510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University