View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3379_low_5 (Length: 394)

Name: NF3379_low_5
Description: NF3379
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3379_low_5
NF3379_low_5
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (11-380)||(2561-2930)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (11-380)||(34489-34858)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (11-380)||(8421868-8422237)
chr8 (11-380)||(32430877-32431246)
chr8 (11-380)||(7341759-7342128)
chr8 (11-380)||(32376920-32377289)
chr8 (11-380)||(30303622-30303991)
chr8 (11-373)||(43371447-43371806)
chr8 (11-376)||(2145018-2145380)
chr8 (11-376)||(35964765-35965126)
chr8 (140-376)||(43683256-43683492)
chr8 (108-376)||(7169661-7169922)
chr8 (168-376)||(22581991-22582199)
chr8 (166-376)||(22585851-22586062)
chr8 (27-127)||(43686418-43686515)
chr8 (230-274)||(17317379-17317423)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (11-380)||(30788219-30788588)
chr7 (11-380)||(43622147-43622516)
chr7 (11-380)||(45765059-45765428)
chr7 (11-378)||(616763-617130)
chr7 (11-376)||(18107068-18107433)
chr7 (11-376)||(15067569-15067934)
chr7 (11-376)||(42501087-42501452)
chr7 (11-376)||(47062564-47062926)
chr7 (11-376)||(10707697-10708060)
chr7 (11-346)||(12116418-12116750)
chr7 (27-376)||(8401200-8401546)
chr7 (27-304)||(43826697-43826971)
chr7 (342-376)||(12113572-12113606)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (11-380)||(19071669-19072038)
chr4 (11-376)||(3405470-3405835)
chr4 (27-376)||(4977977-4978323)
chr4 (11-372)||(4769814-4770172)
chr4 (11-376)||(38462856-38463218)
chr4 (11-376)||(4977435-4977796)
chr4 (201-376)||(51643023-51643198)
chr4 (209-373)||(17238850-17239014)
chr4 (276-376)||(9891817-9891917)
chr4 (11-111)||(9891702-9891802)
chr4 (27-211)||(11503202-11503383)
chr4 (294-376)||(11503387-11503470)
chr4 (230-294)||(13896850-13896914)
chr4 (318-376)||(6183670-6183728)
chr4 (231-288)||(20970619-20970675)
chr4 (242-294)||(17497455-17497507)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (11-380)||(211453-211822)
chr2 (11-380)||(5348847-5349216)
chr2 (11-380)||(10622466-10622835)
chr2 (11-380)||(41561692-41562061)
chr2 (11-380)||(38947443-38947812)
chr2 (11-376)||(7264660-7265025)
chr2 (11-376)||(39795650-39796015)
chr2 (11-376)||(27274376-27274741)
chr2 (11-376)||(24751339-24751704)
chr2 (11-376)||(28347416-28347778)
chr2 (11-376)||(9655835-9656197)
chr2 (27-376)||(24604108-24604454)
chr2 (27-376)||(24940669-24941015)
chr2 (11-332)||(1097889-1098207)
chr2 (27-376)||(45477053-45477400)
chr2 (31-376)||(11691849-11692191)
chr2 (27-376)||(12906511-12906857)
chr2 (11-373)||(41006998-41007357)
chr2 (27-373)||(43948305-43948647)
chr2 (11-376)||(34919801-34920163)
chr2 (50-376)||(437028-437362)
chr2 (11-213)||(3801745-3801947)
chr2 (209-376)||(3797817-3797984)
chr2 (50-376)||(17996206-17996517)
chr2 (230-376)||(25618105-25618251)
chr2 (230-376)||(24683970-24684115)
chr2 (227-294)||(28422550-28422617)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (11-380)||(38774126-38774495)
chr1 (11-380)||(44467262-44467631)
chr1 (11-380)||(20351136-20351505)
chr1 (11-380)||(3946473-3946842)
chr1 (11-376)||(29354704-29355069)
chr1 (11-376)||(13631096-13631461)
chr1 (11-376)||(5079615-5079980)
chr1 (83-380)||(3991357-3991654)
chr1 (11-376)||(12648595-12648960)
chr1 (11-376)||(50115782-50116144)
chr1 (11-370)||(37016594-37016950)
chr1 (27-373)||(51663954-51664297)
chr1 (27-376)||(13175477-13175823)
chr1 (11-376)||(38690958-38691320)
chr1 (27-373)||(36074820-36075164)
chr1 (27-376)||(19497483-19497829)
chr1 (11-175)||(41455517-41455681)
chr1 (11-282)||(46974844-46975112)
chr1 (11-87)||(3984794-3984870)
chr1 (290-376)||(46976765-46976851)
chr1 (230-376)||(32105687-32105833)
chr1 (230-294)||(27283960-27284024)
chr1 (119-169)||(32105897-32105947)
chr1 (318-376)||(25232218-25232273)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (11-380)||(1610763-1611132)
chr6 (11-376)||(28357998-28358363)
chr6 (11-376)||(31148002-31148364)
chr6 (11-376)||(18607676-18608031)
chr6 (27-376)||(21357369-21357715)
chr6 (27-376)||(23961351-23961697)
chr6 (52-376)||(254427-254751)
chr6 (317-376)||(34110720-34110779)
chr6 (230-294)||(26684103-26684167)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (11-380)||(3950423-3950792)
chr3 (11-380)||(30945654-30946023)
chr3 (11-376)||(8158999-8159364)
chr3 (11-380)||(6742567-6742936)
chr3 (11-376)||(13745737-13746102)
chr3 (11-376)||(16446300-16446665)
chr3 (11-376)||(36815532-36815897)
chr3 (11-376)||(14400237-14400602)
chr3 (11-376)||(48248885-48249247)
chr3 (11-376)||(46991264-46991627)
chr3 (27-376)||(21954258-21954604)
chr3 (11-376)||(29949664-29950026)
chr3 (11-376)||(29998818-29999180)
chr3 (27-376)||(6503974-6504320)
chr3 (27-376)||(77039-77385)
chr3 (27-195)||(7839292-7839456)
chr3 (227-291)||(4511042-4511106)
chr3 (228-274)||(24148288-24148334)
chr3 (230-274)||(40467305-40467349)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (11-372)||(28884458-28884819)
chr5 (11-376)||(38858206-38858571)
chr5 (11-376)||(11031468-11031833)
chr5 (11-376)||(27865861-27866226)
chr5 (11-380)||(37818889-37819258)
chr5 (11-376)||(7019982-7020347)
chr5 (11-373)||(13566126-13566488)
chr5 (11-376)||(25895113-25895478)
chr5 (11-384)||(1037031-1037404)
chr5 (11-300)||(34079460-34079749)
chr5 (11-376)||(4198922-4199284)
chr5 (11-376)||(7799034-7799387)
chr5 (80-337)||(18536395-18536651)
chr5 (50-374)||(20287985-20288311)
chr5 (227-292)||(25054192-25054257)
chr5 (230-291)||(27012749-27012810)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (11-376)||(15373-15738)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (11-84)||(25254-25327)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (228-293)||(2101-2166)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (236-274)||(1188-1226)


Alignment Details
Target: scaffold0494 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 2561 - 2930
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 2660  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 2760  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2761 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 2860  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2861 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 2930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 34489 - 34858
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34489 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 34588  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34589 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 34688  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34689 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 34788  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34789 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8422237 - 8421868
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422237 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 8422138  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422137 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 8422038  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422037 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 8421938  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421937 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 8421868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32431246 - 32430877
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431246 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 32431147  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431146 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 32431047  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431046 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 32430947  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32430946 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 32430877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 7341759 - 7342128
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341759 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 7341858  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341859 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 7341958  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7341959 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggcccat 7342058  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7342059 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 7342128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32377289 - 32376920
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377289 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgatcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 32377190  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377189 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 32377090  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377089 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 32376990  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376989 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 32376920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30303991 - 30303622
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303991 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 30303892  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303891 aagttatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgtattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 30303792  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30303791 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaaaaacagggtcgaatcggcccat 30303692  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303691 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 30303622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 43371447 - 43371806
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  |||||||    
T  43371447 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttggcaagaagataatgagggcatgga 43371543  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  43371544 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccat 43371643  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  43371644 gaccaccttgaatgaagtgaaggaaaaaattgtgagggcatggagagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaatagggtcgaatcggctcat 43371743  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43371744 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttggaagaaaata 43371806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2145380 - 2145018
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||  | |||||    
T  2145380 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcacgatgttgtcaagaagataatgagggaatgga 2145284  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||  |||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||    
T  2145283 aagctatggttgaattgcccacttaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgtcat 2145184  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  2145183 gaccaccttgaatgcagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacatggtcgaatcggctcat 2145084  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2145083 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttaggtacttgttgggagaaaatacat 2145018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35965126 - 35964765
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  || |||||||||||||  ||||| |    
T  35965126 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcttttggaa---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcacgatgctgtcaagaagataatgagggcatgaa 35965030  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||| |||    
T  35965029 aagctatggttgaatcgtccactcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgattttccaattttcaaaaattatgtcat 35964930  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  35964929 gatcaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttgatttcaggaccacgaaca-ggtcgaatcagctcat 35964831  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35964830 gctttattgaagaaatactttgacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 35964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 140 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43683492 - 43683256
Alignment:
Q  140 ttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43683492 ttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattaagtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaa 43683393  T
Q  240 ttgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatag 339  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43683392 tagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcatgacaaccaacagggtcgaatctgcttatgctttattgaagaaatatttggacaatag 43683293  T
Q  340 tgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43683292 tgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 43683256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 7169661 - 7169922
Alignment:
Q  108 ggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgc 207  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  || |||||||    
T  7169661 ggaaagctatggttgaatcgcacactcaataattatatgcaaatgcattagtggagttccaagatacatgtaatgatttcccaattttcttaaattatgc 7169760  T
Q  208 catgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcc 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||      ||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  7169761 catgaccaccttggaagaagtgaaggagaaaatagtgagggcat------acc-tgggttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggct 7169853  T
Q  308 catgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169854 catgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7169922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 376
Target Start/End: Original strand, 22581991 - 22582199
Alignment:
Q  168 aagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgtt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22581991 aagattcatgtagtgatttcccaattttcctaaattatgccatgactaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacataccatgtgtt 22582090  T
Q  268 gcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggag 367  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22582091 gcatcttgtttgcagaatcaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggag 22582190  T
Q  368 aaaatacat 376  Q
    |||||||||    
T  22582191 aaaatacat 22582199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 166 - 376
Target Start/End: Original strand, 22585851 - 22586062
Alignment:
Q  166 caaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22585851 caaagattcatgtagtgatttcccaattttcctaaattatgccatgactaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacataccatgtg 22585950  T
Q  266 ttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtac-ttgttgg 364  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22585951 ttgcatcttggttgcagaatcaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtactttgttgg 22586050  T
Q  365 gagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||    
T  22586051 gagaaaatacat 22586062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 43686515 - 43686418
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  43686515 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 43686419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 17317379 - 17317423
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctt 274  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17317379 aaggaaaaaatagtgagggcatggacataccgtgtgttgcatctt 17317423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 30788219 - 30788588
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788219 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 30788318  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788319 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 30788418  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788419 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 30788518  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788519 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 30788588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43622516 - 43622147
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622516 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 43622417  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622416 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 43622317  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622316 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 43622217  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622216 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 43622147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 45765059 - 45765428
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765059 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 45765158  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765159 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 45765258  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765259 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 45765358  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765359 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 45765428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 617130 - 616763
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617130 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 617031  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617030 aagctatggttgaatcgcccacttaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 616931  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  616930 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaatagggtcgaatcggcccat 616831  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  616830 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatca 616763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 18107068 - 18107433
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18107068 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgagctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 18107167  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107168 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 18107267  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107268 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 18107367  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107368 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 18107433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 15067569 - 15067934
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15067569 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 15067668  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15067669 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttttagattatgccat 15067768  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067769 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 15067868  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067869 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtggatgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 15067934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 42501087 - 42501452
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42501087 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 42501186  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42501187 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattataccat 42501286  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42501287 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcatgaccacaaacatggtcgaatcggcccat 42501386  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501387 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 42501452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 47062564 - 47062926
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||| ||||||||||||  | |||||    
T  47062564 caaaggtgcgtcttggattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtggagaagataatgagggtatgga 47062660  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||| |||    
T  47062661 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccacttttcaataattatgtcat 47062760  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  47062761 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 47062860  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47062861 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtaggtgatttgggtacttgttggaagaaaatacat 47062926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10708060 - 10707697
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10708060 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgaaggcatgga 10707964  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  10707963 atgctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttccaaaattatgccat 10707864  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacaggg-tcgaatcggccca 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||    
T  10707863 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgcgttgcatctatgttgcaggaccaccaacagggataaaatcggctca 10707764  T
Q  310 tgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707763 tgctttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 10707697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12116750 - 12116418
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||    ||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  12116750 caaaggtgcgtcttcgattgtaaatatcctttggga---aaaaaggataggaaagaggcgaaacgtcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcataga 12116654  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  12116653 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatttgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtggtgatttcccacttttcaaacattatgccat 12116554  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  12116553 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgctgcatcttggttgcaggaccactaacagggtagaatcggctcat 12116454  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggt 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12116453 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggt 12116418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 8401200 - 8401546
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||   ||   ||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  8401200 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacatgacgatgttgtcaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 8401296  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||  || | |||| ||||||||||||| |||||    
T  8401297 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatttttgtagtgattttccacttttcctaaagtatgtcatgaccaccttgaatgaa 8401396  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||  | | |||||    
T  8401397 atgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcagaaccaccaacatggtagaatcagctcatgctttagtaatgaaat 8401496  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8401497 atttggacaatagtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaatacat 8401546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43826971 - 43826697
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  43826971 attgtaaatatcttttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatggtgtgaagaagataatgaatgcatggaaagttatggttgaatc 43826875  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||  ||||  || | |||||||||||| ||||| |||||    
T  43826874 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatgtttgtagtgatttcccgcttttcctaaagtatgccatgaccgccttgaatgaa 43826775  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcg 304  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || || |||||||| ||||||    
T  43826774 gtgaaggagaaaatagcgagggcatggacagaccatgcgttgcatcttggttgtagaactaccaacagggtagaatcg 43826697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12113606 - 12113572
Alignment:
Q  342 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12113606 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 12113572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19072038 - 19071669
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072038 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 19071939  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071938 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 19071839  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071838 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 19071739  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071738 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 19071669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 3405470 - 3405835
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3405470 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 3405569  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3405570 aagctatggttgaatcgcccactcgacagttatatccaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgtcat 3405669  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3405670 gactaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaatagggtcgaatcggcccat 3405769  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405770 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 3405835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4978323 - 4977977
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  4978323 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 4978227  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  4978226 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagtttcaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgacatgaccaccttgaatgaa 4978127  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  4978126 gtgaaggacaaaattttgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccagcagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaagt 4978027  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978026 atttggtcaatagtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 4977977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Original strand, 4769814 - 4770172
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||| |||| ||  |||||||    
T  4769814 caaatgtgtgtcttagattgtaaatatcctttggaa---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacatcgcgatgttgtgaagaaaataacgagggcatgga 4769910  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||   | |||||| |||    
T  4769911 aagctatggttgaatcgcccactcaagatttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattaatgtagtgatttcccacttttccaaaattatgtcat 4770010  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  4770011 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacaaggtcgaatcggctcat 4770110  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaat 372  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4770111 gctttagtgaagaaatatttggacaacagtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaat 4770172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38463218 - 38462856
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  38463218 caaaggtgcgtcttagattttaaatatcctttggga---aaaagggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatgaa 38463122  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||   | ||||||||||    
T  38463121 aagctatggtcgaattgcccactcaagagttatatgcaaatgcatcagtggagttccaaaattcatgtagtgatttctcacttttcaaaaattatgccat 38463022  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  38463021 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccagcaacatggtcgaatcggctcat 38462922  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38462921 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtactttttgggagaaaatacat 38462856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 4977435 - 4977796
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| || |  ||||| || |||||||||||    |||||||    
T  4977435 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaatgatgggaaagaggtgagaaaccacgatgttgtcaagaagataattgg-gcatgga 4977530  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||   | |||||| |||    
T  4977531 aagctatggttgaatcggccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaatattcatgtagtgatttctcacttttaaaaaattatgtcat 4977630  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4977631 gaccaccttgaatgaagtgaatgacaaaattgtgagggcatggacagactgtgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 4977730  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4977731 gctttattgaagaaatatttggacaatagtatgggtgatttgtgtacttgttgggagaaaatacat 4977796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 51643198 - 51643023
Alignment:
Q  201 attatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcga 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  51643198 attatgccatgaccaccttaaatgaaatgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagagtaga 51643099  T
Q  301 atcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51643098 atcgactcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtaggtgatttgtgtacttgttgggagaaaatacat 51643023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17239014 - 17238850
Alignment:
Q  209 atgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggccc 308  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  17239014 atgaccaccttgaaagaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggctc 17238915  T
Q  309 atgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17238914 atgctttagtaaagaaatatttggacaatagcgtgggtgttttgggtacttgttgggagaaaata 17238850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 276 - 376
Target Start/End: Original strand, 9891817 - 9891917
Alignment:
Q  276 gttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaataca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891817 gttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaataca 9891916  T
Q  376 t 376  Q
    |    
T  9891917 t 9891917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 9891702 - 9891802
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9891702 caaaggcgtgtcttggattgtaaatatcttttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgcggtgaagaagataatgaaggcatgga 9891801  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  9891802 a 9891802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 11503202 - 11503383
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    ||||||||||| |||||||    ||||| ||||||||||||||||    ||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  11503202 attgtaaatattctttggga---aaaaacgatgggaaagaggtgaaatctcacgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 11503298  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatg 211  Q
     |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  11503299 gcccactcaagagttatatgaaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagcgatttcccacttttcaaaaattatgccatg 11503383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 376
Target Start/End: Original strand, 11503387 - 11503470
Alignment:
Q  294 gggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttg-ttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11503387 gggtcgaatcagctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgtttgggagaaaatacat 11503470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13896914 - 13896850
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacag 294  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  13896914 aaggaaaaaattgtgaaggcatggacataccgtgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaacag 13896850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Original strand, 6183670 - 6183728
Alignment:
Q  318 tgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||| |||  ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6183670 tgaagaaatatttgagcaatagtgctggtgatttggatgcttgttgggagaaaatacat 6183728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20970675 - 20970619
Alignment:
Q  231 aggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccac 288  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  20970675 aggacaaaatagtgagg-catggacataccttgtgttgcatcttgggtgcaggaccac 20970619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 17497455 - 17497507
Alignment:
Q  242 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacag 294  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  17497455 gtgagggcatggacataccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacag 17497507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 211822 - 211453
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211822 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 211723  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211722 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 211623  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211622 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 211523  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211522 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 211453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 5348847 - 5349216
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348847 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 5348946  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348947 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 5349046  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349047 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 5349146  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349147 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 5349216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10622835 - 10622466
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622835 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 10622736  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622735 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 10622636  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622635 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 10622536  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622535 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 10622466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 41561692 - 41562061
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561692 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 41561791  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561792 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 41561891  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561892 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 41561991  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561992 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 41562061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 38947443 - 38947812
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947443 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaaggggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 38947542  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947543 aagctatggttgaatcgcccaatcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 38947642  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947643 gaacaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 38947742  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947743 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 38947812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 7264660 - 7265025
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7264660 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 7264759  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7264760 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttctcaatttttgtagattatgccat 7264859  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7264860 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggcccat 7264959  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264960 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7265025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 39795650 - 39796015
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39795650 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggatagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 39795749  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795750 aagctatggttgaatcgcccactcaatagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 39795849  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39795850 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagagcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccacaaacagagtcgaatcggcccat 39795949  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795950 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 39796015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27274741 - 27274376
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  27274741 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgttgtcaagaagataatgaaggcatgga 27274642  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27274641 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgaaaattatgccat 27274542  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27274541 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcat 27274442  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274441 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 27274376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 24751339 - 24751704
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  24751339 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgttttcaagaagataatgaaggcatgga 24751438  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24751439 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgaaaattatgccat 24751538  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24751539 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcat 24751638  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751639 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 24751704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28347778 - 28347416
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  28347778 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcaagaagataatgagggcatgga 28347682  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||    
T  28347681 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgaattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgtcat 28347582  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  28347581 gaccaccttgaatgaattgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtcttgcatcttggttgcaggaccaccaatagggtcgaatcggctcat 28347482  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28347481 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 28347416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 9655835 - 9656197
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||   |||| || |||||||||||||  |||||||    
T  9655835 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaagtgagtaatcccaatgttgtcaagaagataatgacggcatgga 9655931  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  9655932 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccat 9656031  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9656032 gaccaccttgaatgaagtgaaagacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 9656131  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9656132 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 9656197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24604454 - 24604108
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaa-cgcatggaaaactatggttgaat 125  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||    
T  24604454 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttctcaagaagataatgaggcgcatgcaaagctatgattgaat 24604358  T
Q  126 ctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatga 225  Q
    | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||    
T  24604357 cgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagttatttcccacttttcaaa-attatgccatgaccaccttgaatga 24604259  T
Q  226 agtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24604258 agtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggactaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaa 24604159  T
Q  326 tacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604158 tatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 24604108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24941015 - 24940669
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaa-cgcatggaaaactatggttgaat 125  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||    
T  24941015 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttctcaagaagataatgaggcgcatgcaaagctatgattgaat 24940919  T
Q  126 ctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatga 225  Q
    | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||    
T  24940918 cgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagttatttcccacttttcaaa-attatgccatgaccaccttgaatga 24940820  T
Q  226 agtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24940819 agtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggactaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaa 24940720  T
Q  326 tacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24940719 tatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 24940669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1098207 - 1097889
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  1098207 caaaggtgtgtcttagattgtaaacatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgttgtcaagaagataatgagggcatgga 1098111  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||    
T  1098110 aaactatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattaatggagttccaagattcatgtagtgatttcccaattttcaaaaattatgtcat 1098011  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1098010 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattggtagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 1097911  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttgg 332  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  1097910 gctttattgaagaaatatttgg 1097889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 45477053 - 45477400
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  45477053 attgtaaatatcctttgggaa--aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgtgatgttgtgaagaagataataagggcatggaaaactatggttgaatc 45477150  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  45477151 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttctcacttttccaaaattatgccatgaccaccttgaatgaa 45477250  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  45477251 gtgaaggagaaaatagcgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttagtgaataaat 45477350  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45477351 atttggaaaatagtgtgggtgatttgggtacttgtttggagaaaatacat 45477400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11692191 - 11691849
Alignment:
Q  31 taaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctccc 130  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||    
T  11692191 taaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcaatgttgtcaagaagataatgagagcatggaaagttatggttgaatcgccc 11692095  T
Q  131 aatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtga 230  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11692094 actcaagagttatatgcaaatgcattagtggagctccaagatgtttgtagtgatttcccacttttcctaaagtatgccatgaccaccttgaatgaagtga 11691995  T
Q  231 aggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatactt 330  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  11691994 aggagaaaatagttagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtgaagaaatattt 11691895  T
Q  331 ggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691894 ggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 11691849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12906857 - 12906511
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  12906857 attgtaaatatcctttcgga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 12906761  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     || | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  12906760 gcctactcaagagttatatgcaaatgcattggtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttccaaaattatgccatgaccaccttgaatgaa 12906661  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||    
T  12906660 gtgaaggagaaaatagtgagggcatggacatatcatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggttgaatcggctcatgttttagtgaagaaat 12906561  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906560 atttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 12906511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41007357 - 41006998
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   ||||  |||| ||||||||||||||||   |||| |    
T  41007357 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttgggac---aaaaggatgggaaagaggtgaaacatcgcaatgttgtgaagaagataatgaggacatgaa 41007261  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||   | ||||||||||    
T  41007260 aaactatggttgaatcgcccactcaagagttatatgtaaatgcattagtggagttccaagattcatgatgtgttttcccacttttcaaaaattatgccat 41007161  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
     | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  41007160 aatcaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggatcaccaacagggttgaatcggctcat 41007061  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007060 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 41006998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43948647 - 43948305
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||  ||||| |||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||    
T  43948647 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcacgatgttgtgaagaagataatgggggcatggaaagttatggttgaatc 43948551  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  43948550 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatatagtgattctccacttttcaaa-attatgccatgaccaccttgaatgaa 43948452  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43948451 gtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaat 43948352  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43948351 atttgggcaatagtgtgggtgatttgggtacttgttaggagaaaata 43948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34920163 - 34919801
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||     || ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  34920163 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggaa---aaaaaggatgggaaagaggtgaaaccacgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatgga 34920067  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||   | |||||| |||    
T  34920066 aagctatggttgaatcgcccactcaaaagttatatgcaaatgtattagtggagttccaagattcatgcagtgattttccacttttccaaaattatgtcat 34919967  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  34919966 gaccatattgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagagcatggacagaccatgcgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtagaatcggctcat 34919867  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34919866 gctttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 34919801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 437028 - 437362
Alignment:
Q  50 aaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgc-- 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||      
T  437028 aaaaatgatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaa 437127  T
Q  148 ------aaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaatt 241  Q
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  437128 taatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaata 437227  T
Q  242 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 341  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||  | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  437228 gtgagggcatggacatatcatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacatggttgaatcttctcatgttttattgaagaaatatttggacaatagtg 437327  T
Q  342 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  437328 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 437362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3801947 - 3801745
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3801947 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgagaaagaggtgagcaatcgcgaagtggtgaagaagataatgaaggcatgga 3801848  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3801847 aatctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgtcat 3801748  T
Q  211 gac 213  Q
    |||    
T  3801747 gac 3801745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 209 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3797984 - 3797817
Alignment:
Q  209 atgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggccc 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3797984 atgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggctc 3797885  T
Q  309 atgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797884 atgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 3797817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17996517 - 17996206
Alignment:
Q  50 aaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaa 149  Q
    |||||| ||||||| |||||||   || | ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  17996517 aaaaagaatgggaaggaggtgaaacatggtgatgtagtgaagaagataacgagcacatggaaaactattgttgaatcgcccactcaagagttatatgcaa 17996418  T
Q  150 atgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggc 249  Q
    |||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||               |||    
T  17996417 atgcattattggagttccaagatgtttgtagtgatttcccaattttcctaacctatgccatgaccaccttggatgaagtgaa---------------ggc 17996333  T
Q  250 atggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17996332 atggacagaccatgtgttgcatcttgattgcagaacgaccaaccgggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaataatgtgggtgat 17996233  T
Q  350 ttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17996232 ttgggtactttttgggagaaaatacat 17996206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25618251 - 25618105
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatact 329  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||  | |||| ||| |    
T  25618251 aaggataaaatagtgagggcatggaaagaccatgtgttgcatcttggctgcataaccaccaacagagttgaatcagctcatactttagtaaagatatatt 25618152  T
Q  330 tggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25618151 tgagtaatagtgtgggtgatctgggtacttgttgggagaaaatacat 25618105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 376
Target Start/End: Original strand, 24683970 - 24684115
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatact 329  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||  ||| |||| |   ||||||||||| |    
T  24683970 aaggaaaaaatagtgagggcatggacacaccgtgtcttgcatcttagttgcagaaccacaaacaaagttgaaggggctcatggtaaattgaagaaatatt 24684069  T
Q  330 tggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||| |||||||||    
T  24684070 tgagcaatagtgtggatgatttaagta-ttgttaggataaaatacat 24684115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28422617 - 28422550
Alignment:
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacag 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  28422617 gtgaaggacaaaatagtgagggcatggatagaccttgtgttacatcttgggtgtaggaccacaaacag 28422550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38774495 - 38774126
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774495 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 38774396  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774395 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 38774296  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774295 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 38774196  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774195 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 38774126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 44467262 - 44467631
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467262 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 44467361  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467362 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 44467461  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467462 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 44467561  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467562 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 44467631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 20351136 - 20351505
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20351136 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaatataatgaacgcatgga 20351235  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351236 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 20351335  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351336 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtattgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 20351435  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351436 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 20351505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3946842 - 3946473
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946842 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggacgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 3946743  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3946742 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttctcaatttttgtagattatgccat 3946643  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946642 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatagacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 3946543  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3946542 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgagagaaaatacatcaca 3946473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29355069 - 29354704
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29355069 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 29354970  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354969 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 29354870  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354869 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 29354770  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354769 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 29354704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 13631096 - 13631461
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13631096 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 13631195  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631196 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatattcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 13631295  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13631296 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggcccat 13631395  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13631396 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgctgggagaaaatacat 13631461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 5079615 - 5079980
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5079615 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 5079714  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079715 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 5079814  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5079815 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgaaggcatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggctcat 5079914  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079915 gctttgttgaagaaataattggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 5079980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 83 - 380
Target Start/End: Original strand, 3991357 - 3991654
Alignment:
Q  83 gtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991357 gtggtgaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtg 3991456  T
Q  183 atttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3991457 atttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcag 3991556  T
Q  283 gaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991557 gaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 3991654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12648960 - 12648595
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  12648960 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcacgatgttgtcaagaagataatgagggcatgga 12648861  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12648860 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgaaaattatgccat 12648761  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12648760 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattatgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcat 12648661  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648660 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 12648595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50116144 - 50115782
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||  |||||||    
T  50116144 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaataggtgagtaatcgcgatattgtcaagaagataatgagggcatgga 50116048  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  50116047 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttctaagattcatttagtgatttcccaatttttttatattatgtcat 50115948  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | | |||    
T  50115947 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccactaacagggtcgatttgtctcat 50115848  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50115847 gcttttttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 50115782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 370
Target Start/End: Original strand, 37016594 - 37016950
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  37016594 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagagctgagtaatcgcgatgttgtcaagaagataatgagggcatgga 37016690  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||   | |||||| |||    
T  37016691 aagctatggttgaatcgcccactcagcagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgcagtaattttccaattttcaaaaattatgtcat 37016790  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  37016791 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgttagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 37016890  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaa 370  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37016891 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaa 37016950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Original strand, 51663954 - 51664297
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    | | ||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  51663954 attgtagatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctagcgatgctgtgaagaagataatgatggcatggaaagctatggttgaatc 51664050  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  51664051 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaa 51664150  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||    
T  51664151 gtgaaggagaaaatagtgaaggcatggacaaaccatatgttgcatcttggttgcaggaccactaacagggtcgaatcggctcatgctttattggataaat 51664250  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51664251 atttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 51664297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 13175477 - 13175823
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||    ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13175477 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggagaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaaactatggttgaatc 13175573  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
      ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  13175574 gtccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttccaaaattatgcaatgaccaccttgaatgaa 13175673  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||   || ||||||||  |||||||||    
T  13175674 gtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaagaccatcaacagggtcgaactagctcatgctttagtgaagaaat 13175773  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175774 atttggacaatggtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 13175823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38691320 - 38690958
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  38691320 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagacgtgaatcctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatgga 38691224  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||| |||    
T  38691223 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatttgcaaatgcattagtggagttccaagattcatttagtgatttcccacttttcaaaaattatgtcat 38691124  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||    
T  38691123 gaccaccttgaatgaagtgaaggaaaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagagtagaataggctcat 38691024  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | | | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691023 gttctatggaagaaatattttgacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 38690958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36075164 - 36074820
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||     
T  36075164 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatt 36075068  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  36075067 gcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtggtaatttcccacttttccaaaattatgccatgaccaccttgaatgaa 36074968  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacaggg-tcgaatcggcccatgctttgttgaagaaa 325  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  36074967 gtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgcgttgcatctatgttgcaggaccaccaacagggataaaatcggctcatgctttagtgaagaaa 36074868  T
Q  326 tacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074867 tatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 36074820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19497829 - 19497483
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||    
T  19497829 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatggaaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatgaaaagttatggttgaatc 19497733  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     | || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| | |||    
T  19497732 gcacactcaagagttatatggaaatgcattagtggagttcctagatgcatgtagtgatttcccacttttcctaaattatgccatgaccaccttgaaagaa 19497633  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||    
T  19497632 gtgaaggagaaaatagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggtggcagaaccaccaacagggtagaataggctcatgctttagtaaagaaat 19497533  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497532 ttttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 19497483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 41455517 - 41455681
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41455517 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtcaagaagataatgaaggcatgga 41455616  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattca 175  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455617 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattca 41455681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 46974844 - 46975112
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  46974844 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcacgatgttgtgaagaagataacgagggcatgga 46974940  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    ||  |||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  46974941 aagttatggttgaaacgcccactcaagagttatttgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccat 46975040  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcag 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46975041 gaccaccttgaatgaagtgaagaagaaaatagtgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcag 46975112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 3984794 - 3984870
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984794 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggt 3984870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Original strand, 46976765 - 46976851
Alignment:
Q  290 aacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46976765 aacaaggtagaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 46976851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32105833 - 32105687
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatact 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | | ||| ||||| ||||| || |||  ||| |||||| |  | |||||||| |    
T  32105833 aaggacgaaatagtgagggcatggacatatcatgtcttgcatcttggatacagaaccaccaacagagttgaaggggctcatgctataataaagaaatatt 32105734  T
Q  330 tggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32105733 cgagcaataatgtgggtgatttgggtacttgctgagagaaaatacat 32105687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Original strand, 27283960 - 27284024
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacag 294  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  27283960 aaggacaaattagtgagggcatggacggaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacag 27284024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32105947 - 32105897
Alignment:
Q  119 gttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaa 169  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32105947 gttgaatcacccacacaagaattatatgcaattgcattagtggagttcaaa 32105897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Original strand, 25232218 - 25232273
Alignment:
Q  318 tgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25232218 tgaagaaatatttgagcaatagtgtggatgatttgggtac---ttgggagaaaatacat 25232273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1611132 - 1610763
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611132 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 1611033  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1611032 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgtcat 1610933  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610932 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 1610833  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610832 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 1610763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 28357998 - 28358363
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28357998 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtcaagaagataatgaaggcatgga 28358097  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28358098 aagctatggttgaatcgtccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgtcat 28358197  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28358198 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcgactcat 28358297  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358298 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 28358363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 31148002 - 31148364
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||    
T  31148002 caaaggtgcgtcttagattgcaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcaagaagatattgagggcatgga 31148098  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   | | |||| |||    
T  31148099 aagctatagttgaatcgcccactcgacagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgattttccaattttcaaaaaatatgtcat 31148198  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||     
T  31148199 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaagagggtcgaatcagctcac 31148298  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31148299 gatttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 31148364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 18607676 - 18608031
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  18607676 caaagatgtgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaatgatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatgga 18607772  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  18607773 aagctatggttgaatcacccaatcaagagttatatggaaatgcattagtggagttagaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccat 18607872  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  18607873 gaccaccttgaatgaagtgaagga-------gtgagggcatgaacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaactgggtcgaatcggctcat 18607965  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607966 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 18608031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21357715 - 21357369
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  21357715 attgtaaatatccttcggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 21357619  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| | |||    
T  21357618 gcacactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatgcatgtagtgatttcccacttttcctaaattatgccatgaccaccttgaaagaa 21357519  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    |||||||    
T  21357518 gtgaaagagaaaatagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttaggaaagaaat 21357419  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21357418 atttggacaataatgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 21357369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23961697 - 23961351
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23961697 attgtaaatatccttcggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 23961601  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| | |||    
T  23961600 gcacactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatgcatgtagtgatttcccacttttcctaaattatgccatgaccaccttgaaagaa 23961501  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    |||||||    
T  23961500 gtgaaagagaaaatagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttaggaaagaaat 23961401  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961400 atttggacaataatgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 23961351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 254751 - 254427
Alignment:
Q  52 aaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaat 151  Q
    |||||||||||||||| |||   || |  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||  ||| |||||||| |||| |||| ||||| ||| || |    
T  254751 aaaggatgggaaagagatgaaacatggtaatgtagtgaagaagataatgagagcatgggaagttattgttgaatcacccattcaaaaattaaatgaaagt 254652  T
Q  152 gcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcat 251  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||  |||||| ||||  ||| ||   || |||||| ||||||||||||  || ||||| |||||  |||| ||||    
T  254651 gcattagtggagttccaaaatgtttgtcatgattttccaaagtttataacctaggccatggccaccttggatgttgttaaggagaaaataatgagagcat 254552  T
Q  252 ggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgattt 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||| |  | || ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  254551 ggacagactatgtgttgcatcttggatgcagaaccaccaacaaggtagaattggctcatgctatagtaaataaatatttgagcaatagtgtgggtgattt 254452  T
Q  352 gggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  254451 gggtacttgttgggagaaaatacat 254427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34110779 - 34110720
Alignment:
Q  317 ttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34110779 ttgaagaaatatttgagcaatagtgtggatgatttggatacttgttgggagaaaatacat 34110720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26684167 - 26684103
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacag 294  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  26684167 aaggacaaaataatgagggcatggacagaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacag 26684103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 3950423 - 3950792
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950423 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 3950522  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950523 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 3950622  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3950623 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggcccat 3950722  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950723 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 3950792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30946023 - 30945654
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946023 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 30945924  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945923 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 30945824  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945823 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 30945724  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945723 gctttgttgaagaaatactttgacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 30945654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8159364 - 8158999
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159364 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 8159265  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8159264 aagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttctcaatttttgtagattatgccat 8159165  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159164 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 8159065  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159064 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 8158999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 6742567 - 6742936
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742567 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaacgaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 6742666  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742667 aaattatggttgaatctcctaatcaataattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 6742766  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742767 gaccatcttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 6742866  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742867 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 6742936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13746102 - 13745737
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13746102 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 13746003  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746002 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 13745903  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745902 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 13745803  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745802 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 13745737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 16446300 - 16446665
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16446300 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 16446399  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446400 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatattcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 16446499  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16446500 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggcccat 16446599  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16446600 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgctgggagaaaatacat 16446665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36815897 - 36815532
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  36815897 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgttgtcaagaagataatgaaggcatgga 36815798  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815797 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 36815698  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36815697 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcat 36815598  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815597 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 36815532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 14400237 - 14400602
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  14400237 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaataggtgagcaatcgcgatgttgtcaagaagataatgaaggcatgga 14400336  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14400337 aagctatggttgaatcacccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgaaaattatgccat 14400436  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14400437 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattatgagggcatagaaagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcat 14400536  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400537 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 14400602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48249247 - 48248885
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  48249247 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcaagaagataatgagggcatgga 48249151  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  48249150 aagctatggttgaatcacccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccaattttcaaaaattatgccat 48249051  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  48249050 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacaaggtcgaatcggctcat 48248951  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48248950 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaatacat 48248885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 46991627 - 46991264
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  46991627 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttagga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcaagaagataatgagggcatgga 46991531  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtaga-ttatgcca 209  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||    
T  46991530 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattaatggagttccaagattcatgtagtgatttcccaattttaaaaaaattatgcca 46991431  T
Q  210 tgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggccca 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46991430 tgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaattgtgagggcatggacaggccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctca 46991331  T
Q  310 tgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991330 tgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 46991264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21954604 - 21954258
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  21954604 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttatcaagaacataatgagagcatggaaagctattgttgaatc 21954508  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  21954507 gcccactcaacatttatatgcaattgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccaattttcaaaaattataccatgaccaccttgaatgaa 21954408  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21954407 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgaaggaccacaaacagagtcgaatcggcacatgctttattgaagaaat 21954308  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21954307 aattggacaataatgtgagtaatttgggtacttgttgggagaaaatacat 21954258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 29949664 - 29950026
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  29949664 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaataagataatgagggcatgga 29949760  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  29949761 aatctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttctaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccat 29949860  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||    
T  29949861 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtagggccaccaacagggttgaatcggctcat 29949960  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29949961 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggcacttgttgggagaaaatacat 29950026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 29998818 - 29999180
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  29998818 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtgaataagataatgagggcatgga 29998914  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  29998915 aatctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttctaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattatgccat 29999014  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||    
T  29999015 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtagggccaccaacagggttgaatcggctcat 29999114  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29999115 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggcacttgttgggagaaaatacat 29999180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6504320 - 6503974
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||    
T  6504320 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcaagaagataatgaggaaatggaaatctatggttgaatc 6504224  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  6504223 gcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcctaattttaaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaa 6504124  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  6504123 gtgaaggacaaaattgtgagggcatagacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaacaacaggttcaaattggctcatgctttattgaagaaat 6504024  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504023 atttggacaatagagtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 6503974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 77385 - 77039
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  77385 attgtaaatatcctttggga---aaaaaggatggaaaagaggtgagtaatcgtgatggtgtcaagaagatcatgagggcatggaaagctatggttgaatc 77289  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaa 226  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||||||| |||||    
T  77288 tcccactcaagagttatatgtaaatgcattagtggagttccaagatgcttgtagtgatttcccacctttcctaaagtatgccatgaccaccttgaatgaa 77189  T
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaat 326  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  77188 gtgaaggagaaaatagtgagggcatggacataccgtgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaat 77089  T
Q  327 acttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77088 atttggacaatagtgcgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 77039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Original strand, 7839292 - 7839456
Alignment:
Q  27 attgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    ||| ||||| || || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  7839292 attgtaaatatcctttggg----aaaaaggataggaaagaggtgaaacctcgcgatgttgtcaataagataatgagggcatggaaagctatggttgaatc 7839387  T
Q  127 tcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttt 195  Q
     |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7839388 gcccagtcaagagttttatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccactttt 7839456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 291
Target Start/End: Original strand, 4511042 - 4511106
Alignment:
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  4511042 gtgaaggacaaaatagtgagagcatggacagactttctgttacatcttgggtgcaggaccacaaa 4511106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Original strand, 24148288 - 24148334
Alignment:
Q  228 tgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctt 274  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24148288 tgaaggaaaaaattgtgagagcatggacataccatgtgatgcatctt 24148334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40467349 - 40467305
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctt 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  40467349 aaggacaaaatagtgagggcatggacggaccttgtgttacatctt 40467305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28884819 - 28884458
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28884819 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 28884720  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884719 aaactatggttgaatcgcccactcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtattgatttcccaatttttgtagattatgccat 28884620  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884619 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 28884520  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884519 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaat 28884458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38858571 - 38858206
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38858571 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgaa 38858472  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38858471 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgtcat 38858372  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38858371 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccacaaacagagtcgaatcggcccat 38858272  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858271 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 38858206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11031833 - 11031468
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11031833 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaagacatgga 11031734  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031733 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 11031634  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11031633 gaccaccttgaatgaagtgaaggaaaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccacaaacagagtcaaatcggcccat 11031534  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031533 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 11031468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27866226 - 27865861
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27866226 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgtgatgtggtcaagaagataatgaaggcatgga 27866127  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866126 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 27866027  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27866026 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcaaatcggctcat 27865927  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27865926 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 27865861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 37819258 - 37818889
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  37819258 caaaggtgtgtcttggattgtaaatatcatttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaaaaagataatgaagacatgga 37819159  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819158 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 37819059  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37819058 gaacaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcat 37818959  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818958 gctttgttgaagaaatacttggaaaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 37818889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7020347 - 7019982
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7020347 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 7020248  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7020247 aagctatggttgaatcgcccactcaacggttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttcggtagattatgccat 7020148  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7020147 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcat 7020048  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020047 gcattattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7019982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13566488 - 13566126
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  13566488 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttggattttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtcatgaagataatgaaggcatgga 13566389  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13566388 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgaaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccattttttgtagattatgccat 13566289  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13566288 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcat 13566189  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 373  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566188 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 13566126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25895478 - 25895113
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  25895478 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggcgagcaatcgcgatgttgtcaagaagataatgaaggcatgga 25895379  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25895378 aagctatggttgaatcggccactcaacatttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgaaaattatgccat 25895279  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  25895278 gactaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacatggtcgaatcggctcat 25895179  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25895178 gctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtagttgttgggagaaaatacat 25895113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Original strand, 1037031 - 1037404
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||| |    
T  1037031 caaagatgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgttgtcaagaagataatgtaggcatgaa 1037130  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  1037131 aagctatggttgaatcacccactcaaaagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcctgtagtgatttcccaattttcaaaaattatgccat 1037230  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1037231 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcat 1037330  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacaggtt 384  Q
     |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1037331 actttattgaagacatacttggataatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacaggtt 1037404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Original strand, 34079460 - 34079749
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34079460 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtcaagaagataatgaaggcatgga 34079559  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34079560 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgattttccaatttttgtagattatgccat 34079659  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcga 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34079660 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcga 34079749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4199284 - 4198922
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  4199284 caaaggtgcgtcttagattataaatatcctttggga---aaaaatgatgggaaagaggtgaaatctcgcgatgttgtgaagatgataatgagagcatgga 4199188  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||   ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   | ||||||||||    
T  4199187 aagctatggttgaattgtccattcaagagttatatgcaaatacattagtggagttccaagattcatgtagtgatttctcacttttaaaaaattatgccat 4199088  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4199087 gaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 4198988  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4198987 gctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgagagaaaatacat 4198922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7799387 - 7799034
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | || |         |||||||    
T  7799387 caaaggtgcgtcttagattgtaaatatcctttggga---aaaaaggatgggaaagaggtgagtaatcgcgatgttgtcatgagg---------gcatgga 7799300  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   | ||||||| ||    
T  7799299 aagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcaagtagtgatttctcacttttcaaaaattatgcaat 7799200  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7799199 gaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcat 7799100  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799099 gctttattgaagaaatatttggacaatattgtgggtaatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7799034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18536651 - 18536395
Alignment:
Q  80 gatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgta 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18536651 gatgttgtgaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatttgcaaatgtattagtggagttccaagattcatgta 18536552  T
Q  180 gtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttg 279  Q
    ||||||||||| |||    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18536551 gtgatttcccactttccaaaaattatgccatgaccacattgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatgaacagaccatatgttgcatcttggttg 18536452  T
Q  280 caggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaat 337  Q
    ||||||||| |||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18536451 caggaccac-aacgaggtagaaacggctcatgctttattgaagaaatatttggacaat 18536395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 374
Target Start/End: Original strand, 20287985 - 20288311
Alignment:
Q  50 aaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctc--ccaatcaacaattatatgc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||   || | ||||| || |||||||||||||  |  ||| ||  |||  ||||||| |  ||| |||| |||||||| |    
T  20287985 aaaaaggatgggaaagaggtgaaacatggtgatgtagttaagaagataatgagagtgtggtaagttattattgaatcacacccactcaagaattatattc 20288084  T
Q  148 aaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||  ||   ||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||    
T  20288085 aaatgcattagtggagttcaaaaatgtttgtaatgattttccaattttcctaacctatgccatgtctaccttggatgttgttaaggagaaaatagtgagg 20288184  T
Q  248 gcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttgga-caatagtgtgggt 346  Q
    ||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |||  | || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20288185 gcatggataaaccatgtgttatatcttggttgcagaaccaccaatagggtagaatcggctcatgatttagtaaataaata-ttggagcaatagtgtgggt 20288283  T
Q  347 gatttgggtacttgttgggagaaaatac 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20288284 gatttgggtacttgttgggagaaaatac 20288311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 25054192 - 25054257
Alignment:
Q  227 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaac 292  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  25054192 gtgaatgacaaaatagtgagagcatggacagagcttgtgttacatcttgggtgcaggaccacaaac 25054257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27012810 - 27012749
Alignment:
Q  230 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaa 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||| | || |||||||||||    
T  27012810 aaggacaaaatagtgagggcatggacggacctagtgttacatcttgggtgtaggaccacaaa 27012749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15373
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgtggtgaagaagataatgaacgcatgga 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15738 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcatttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgtggtgaagaagataatgaaggcatgga 15639  T
Q  111 aaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccat 210  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15638 aagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattactggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattgtgccat 15539  T
Q  211 gaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccat 310  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15538 gaccaccttgaatgaagtgaaagacaaaattgtgagggaatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcat 15439  T
Q  311 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15438 gctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 15373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25327 - 25254
Alignment:
Q  11 caaaggtgtgtcttgaattgtaaatatcctttgggctttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgggatgt 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25327 caaaggtgtgtcttagattgtaaatatcctttgggttttaaaaaggatgggaaagaggtgagcaatcgcgatgt 25254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2166 - 2101
Alignment:
Q  228 tgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaaca 293  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  2166 tgaaggacaaaatagtgagggtatggacagaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaaca 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 1188
Alignment:
Q  236 aaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1226 aaaatagtgagggcatggacagaccatgtcttgcatctt 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University