View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3382_high_13 (Length: 245)

Name: NF3382_high_13
Description: NF3382
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3382_high_13
NF3382_high_13
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (21-234)||(17386326-17386539)
chr3 (21-218)||(14447010-14447207)
chr3 (21-234)||(3278039-3278252)
chr3 (21-208)||(10604018-10604205)
chr3 (21-222)||(13693448-13693649)
chr3 (21-218)||(20157901-20158098)
chr3 (21-207)||(12423834-12424020)
chr3 (21-218)||(4369243-4369440)
chr3 (21-218)||(22165779-22165976)
chr3 (21-218)||(16654258-16654456)
chr3 (23-217)||(12161540-12161734)
chr3 (24-162)||(18979465-18979603)
chr3 (30-217)||(3340668-3340855)
chr3 (62-222)||(13196861-13197021)
chr3 (35-217)||(13505991-13506173)
chr3 (30-217)||(15945139-15945326)
chr3 (23-222)||(13137601-13137800)
chr3 (23-222)||(15630388-15630587)
chr3 (53-222)||(7598969-7599138)
chr3 (53-222)||(12188507-12188676)
chr3 (53-222)||(12194921-12195090)
chr3 (53-222)||(13188849-13189018)
chr3 (127-218)||(10161663-10161754)
chr3 (127-218)||(15643727-15643818)
chr3 (153-222)||(10145724-10145793)
chr3 (162-222)||(16374911-16374971)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (24-234)||(25372396-25372606)
chr2 (21-218)||(24821559-24821751)
chr2 (25-222)||(25369017-25369214)
chr2 (53-234)||(24169953-24170134)
chr2 (145-222)||(17867491-17867568)
chr2 (30-217)||(23160851-23161038)
chr2 (30-217)||(23572108-23572295)
chr2 (30-217)||(27630058-27630245)
chr2 (23-222)||(13046-13245)
chr2 (23-222)||(22046092-22046291)
chr2 (23-222)||(25356095-25356294)
chr2 (128-217)||(116181-116270)
chr2 (127-218)||(16774305-16774396)
chr2 (127-218)||(24796770-24796861)
chr2 (162-222)||(27626316-27626376)
chr2 (38-105)||(116091-116158)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (21-234)||(10716-10929)
scaffold0059 (21-234)||(18717-18930)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (21-234)||(234469-234682)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (24-234)||(22289612-22289822)
chr8 (24-234)||(22830474-22830684)
chr8 (21-234)||(21942886-21943099)
chr8 (24-222)||(22368532-22368730)
chr8 (21-222)||(11348389-11348590)
chr8 (29-218)||(21100285-21100474)
chr8 (21-218)||(19766036-19766236)
chr8 (68-218)||(29333200-29333350)
chr8 (23-156)||(21267909-21268042)
chr8 (30-222)||(22034962-22035154)
chr8 (23-222)||(22101057-22101256)
chr8 (128-217)||(21826061-21826150)
chr8 (23-222)||(21380676-21380875)
chr8 (93-222)||(17132452-17132581)
chr8 (153-222)||(21954792-21954861)
chr8 (162-222)||(8313190-8313250)
chr8 (162-222)||(8324283-8324343)
chr8 (92-222)||(16420032-16420162)
chr8 (164-222)||(22097947-22098005)
chr8 (38-105)||(21825971-21826038)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (21-234)||(6455-6668)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (21-231)||(8651594-8651804)
chr1 (21-228)||(8948879-8949087)
chr1 (21-218)||(3988651-3988848)
chr1 (29-207)||(20072391-20072569)
chr1 (16-222)||(19877118-19877324)
chr1 (23-217)||(19783577-19783771)
chr1 (128-217)||(20392141-20392230)
chr1 (127-218)||(21800149-21800240)
chr1 (153-222)||(20236194-20236263)
chr1 (154-220)||(16383739-16383805)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (21-234)||(44003-44216)
scaffold0037 (21-234)||(51392-51605)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (16-234)||(18446772-18446990)
chr6 (23-217)||(21561926-21562120)
chr6 (53-222)||(18010461-18010630)
chr6 (127-218)||(20017715-20017806)
chr6 (127-218)||(22167030-22167121)
chr6 (153-222)||(8725433-8725502)
chr6 (162-222)||(24856676-24856736)
chr6 (127-218)||(22768605-22768696)
chr6 (127-208)||(20168881-20168962)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (16-218)||(21420-21622)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (16-222)||(20106840-20107046)
chr7 (21-222)||(15921433-15921633)
chr7 (24-218)||(16150978-16151172)
chr7 (21-222)||(824199-824400)
chr7 (21-222)||(15064333-15064534)
chr7 (23-234)||(48803279-48803490)
chr7 (23-217)||(16530589-16530783)
chr7 (23-217)||(16634879-16635073)
chr7 (23-217)||(16761252-16761446)
chr7 (53-222)||(13656546-13656715)
chr7 (23-222)||(16467047-16467246)
chr7 (127-218)||(13672505-13672596)
chr7 (23-222)||(18286208-18286407)
chr7 (127-218)||(18594744-18594835)
chr7 (127-218)||(18616849-18616940)
chr7 (162-222)||(8716586-8716646)
chr7 (162-222)||(14549818-14549878)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (21-218)||(12023-12220)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (21-218)||(20792258-20792455)
chr5 (24-218)||(20597315-20597509)
chr5 (24-218)||(20603612-20603806)
chr5 (21-218)||(26846209-26846406)
chr5 (24-218)||(20609931-20610125)
chr5 (23-218)||(18071455-18071650)
chr5 (21-234)||(22947000-22947213)
chr5 (29-218)||(23520623-23520812)
chr5 (23-217)||(25117622-25117816)
chr5 (23-217)||(25176713-25176907)
chr5 (23-222)||(21386881-21387077)
chr5 (30-218)||(20439639-20439827)
chr5 (23-222)||(23746634-23746833)
chr5 (23-222)||(22318916-22319114)
chr5 (127-218)||(24954652-24954743)
chr5 (162-222)||(15734256-15734316)
chr5 (162-222)||(25008215-25008275)
chr5 (162-222)||(20620885-20620945)
chr5 (30-105)||(30764692-30764767)
chr5 (168-200)||(30764599-30764631)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (21-218)||(3353161-3353358)
chr4 (21-203)||(15864074-15864256)
chr4 (30-217)||(15261535-15261722)
chr4 (23-105)||(16680939-16681021)
chr4 (127-218)||(13821557-13821648)
chr4 (162-222)||(22109682-22109742)
chr4 (153-222)||(15253058-15253127)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (21-218)||(22468-22665)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (24-222)||(132202-132400)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (21-218)||(23900-24097)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (21-222)||(7938-8138)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (21-218)||(121922-122119)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (21-218)||(709-906)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (23-232)||(32975-33184)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (44-222)||(1870-2046)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (21-218)||(19725-19913)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (33-218)||(8457-8642)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (23-217)||(3517-3711)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (21-222)||(5035-5236)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (16-222)||(253240-253460)
scaffold0004 (33-218)||(19423-19608)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (30-215)||(25859-26044)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (23-234)||(11112-11323)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (23-234)||(10000-10211)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (21-136)||(1733-1848)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (53-234)||(336-517)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (53-222)||(39166-39335)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (30-217)||(29060-29247)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (92-234)||(54893-55035)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (23-234)||(115226-115441)
scaffold0020 (23-234)||(119530-119745)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (23-220)||(423-620)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (30-217)||(24121-24308)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (154-236)||(21620-21702)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (23-222)||(12621-12820)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (23-188)||(4619-4785)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (153-222)||(4819-4888)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (162-222)||(1344-1404)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (53-186)||(41642-41775)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (23-90)||(49-116)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (52-135)||(50288-50371)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (53-135)||(32347-32429)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (21-66)||(20234-20279)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 17386326 - 17386539
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17386326 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtccacc 17386425  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17386426 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaaattaatatatgttggt 17386525  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    ||||||||||||||    
T  17386526 gaaggttcacaggt 17386539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14447207 - 14447010
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14447207 tgggggtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaatagacttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 14447108  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14447107 catgtcctacacactcaaactcgatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 14447010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 3278039 - 3278252
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3278039 tgggagtgggtgagaaccaagggataaacatgatcgagggaaacaatttgctaaacatagagaccctcatttctatgaatttcattaagcatcatccacc 3278138  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3278139 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgatgtatgttggt 3278238  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || |||||||||||    
T  3278239 gatggttcacaggt 3278252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10604205 - 10604018
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  10604205 tgggagtgggtgaggaccaagggattacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacc 10604106  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttg 208  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10604105 catgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttg 10604018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 13693448 - 13693649
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  13693448 tgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattgaggggaataataggcttaacatagagatccttgtctctatgaacttcattaaacctcgaccacc 13693547  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  13693548 catgacttatacactcaagctcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcagactaacaccgaggtggatgaaaatttgttgtatgttggt 13693647  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  13693648 ga 13693649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20158098 - 20157901
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  20158098 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaactttattaagcactgtccacc 20157999  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  20157998 catgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttatttgtacttcctaacccatcttggactaacaccgaggtgaaagaaaatttgttgtatgttg 20157901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12424020 - 12423834
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  12424020 tgggagtgggtgaggaccacgggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccgtccacc 12423921  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 207  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12423920 catgtcctacacattcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacacatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 12423834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 4369243 - 4369440
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  4369243 tgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaatcaataggctttacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccgtccacc 4369342  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4369343 catgtcctacacactcaaactcaatgtgcttattttaattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 4369440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22165976 - 22165779
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  || |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22165976 tgggagtgggtgaggaccaatggattaccaaaattgaggaaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacc 22165877  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22165876 catgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattataccttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 22165779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 16654258 - 16654456
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16654258 tgggagtgggtgaggaccaagggattactaaatttgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacc 16654357  T
Q  121 catgacctatacactcaaa-ctcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16654358 catgtcctacgcactcaaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgtaagaaaatttgttgtatgttg 16654456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12161734 - 12161540
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||  |  |||     
T  12161734 ggagtgagtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggttaaacatagagacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccct 12161635  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12161634 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgccttacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 12161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18979603 - 18979465
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18979603 gagttggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaatagggttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccgtccacccat 18979504  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattat 162  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18979503 gtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattat 18979465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3340855 - 3340668
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||     ||| |    ||    
T  3340855 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgttta 3340756  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3340755 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 3340668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13197021 - 13196861
Alignment:
Q  62 aacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatta 161  Q
    |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||     
T  13197021 aacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttc 13196922  T
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  13196921 tgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtga 13196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13506173 - 13505991
Alignment:
Q  35 gaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacac 134  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |     ||| |    |||||||    
T  13506173 gaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacac 13506074  T
Q  135 tcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13506073 tcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 13505991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 15945139 - 15945326
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||     ||| |    ||    
T  15945139 gtgaagaccaagggctatacaagattgagggaaacaataggctgaacatagaaacccttatctctatgaatttcattaaaactcgaatcccctttgttta 15945238  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||| ||||| || ||||| ||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15945239 tacgctcaagcttaatgtacctattttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 15945326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13137800 - 13137601
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  13137800 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccaccca 13137701  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13137700 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13137601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15630587 - 15630388
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  | |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15630587 ggagtgggtgaggaagatgggataaacacaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgcgatgaacttcattaagattcacccaccca 15630488  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15630487 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15630388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Original strand, 7598969 - 7599138
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||      
T  7598969 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccac 7599068  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7599069 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 7599138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12188676 - 12188507
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||      
T  12188676 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtataccac 12188577  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12188576 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtga 12188507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12195090 - 12194921
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||      
T  12195090 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtataccac 12194991  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12194990 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtga 12194921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13189018 - 13188849
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||      
T  13189018 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccac 13188919  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13188918 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13188849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10161754 - 10161663
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  10161754 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 10161663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Original strand, 15643727 - 15643818
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  15643727 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 15643818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Original strand, 10145724 - 10145793
Alignment:
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10145724 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 10145793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16374971 - 16374911
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  16374971 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttcttgtatgttggtga 16374911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25372606 - 25372396
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25372606 gagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggtttaacatatagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtccacccat 25372507  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25372506 gacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgatatatgttggtgaa 25372407  T
Q  224 ggttcacaggt 234  Q
    |||||||||||    
T  25372406 ggttcacaggt 25372396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24821751 - 24821559
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24821751 tgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaa-----agacccttatctctatgaacttcattaagcctcgtccacc 24821657  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24821656 catgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 24821559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25369214 - 25369017
Alignment:
Q  25 agtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatg 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25369214 agtgggtgaggacgaagggataaattcaattgagggcaacaataggcttaacatagggaccctcatttccatgaacttcattaagcgtcatccgcccatg 25369115  T
Q  125 acctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
     | ||| ||||||| |||||||||  | | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25369114 gcttatgcactcaagctcaatgtgattctattatttatgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagacaatttgttgtatgttggtga 25369017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 24169953 - 24170134
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || || |||     
T  24169953 attgagggaatcaataggctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtaccta 24170052  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 234  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  24170053 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaattttttgtatgttggtgatggttcacaggt 24170134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17867568 - 17867491
Alignment:
Q  145 tgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17867568 tgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 17867491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23161038 - 23160851
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |     ||| |    ||    
T  23161038 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgttta 23160939  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23160938 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 23160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23572295 - 23572108
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |     ||| |    ||    
T  23572295 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgttta 23572196  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23572195 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 23572108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 27630058 - 27630245
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |     ||| |    ||    
T  27630058 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgttta 27630157  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27630158 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 27630245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13245 - 13046
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||||||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  13245 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggaaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccaccca 13146  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13145 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22046291 - 22046092
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22046291 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccaccca 22046192  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22046191 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22046092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 25356095 - 25356294
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  25356095 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccaccca 25356194  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25356195 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 25356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 116181 - 116270
Alignment:
Q  128 tatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  116181 tatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaactcatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Original strand, 16774305 - 16774396
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16774305 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 16774396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24796861 - 24796770
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  24796861 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 24796770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 27626316 - 27626376
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27626316 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 27626376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 116091 - 116158
Alignment:
Q  38 caagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcat 105  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  116091 caagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 116158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 10716 - 10929
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10716 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacatcgtccacc 10815  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10816 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 10915  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || |||||||||||    
T  10916 gatggttcacaggt 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 18717 - 18930
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18717 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacatcgtccacc 18816  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18817 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 18916  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || |||||||||||    
T  18917 gatggttcacaggt 18930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 234682 - 234469
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  234682 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacatcgtccacc 234583  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  234582 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 234483  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || |||||||||||    
T  234482 gatggttcacaggt 234469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 22289612 - 22289822
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22289612 gagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaatcatcgtccacccat 22289711  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  22289712 gacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctatctcatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgat 22289811  T
Q  224 ggttcacaggt 234  Q
    |||||||||||    
T  22289812 ggttcacaggt 22289822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 22830474 - 22830684
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22830474 gagtgagtgagaaccaagggataaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtccacccat 22830573  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaa 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  22830574 gacatatacactcaaactcaatgtgcatattttaattatacttcctaacccatctcggactaataccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgat 22830673  T
Q  224 ggttcacaggt 234  Q
    |||||||||||    
T  22830674 ggttcacaggt 22830684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21943099 - 21942886
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||  |||||    
T  21943099 tgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacc 21943000  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  21942999 catggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggt 21942900  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || ||||| |||||    
T  21942899 gatggttcgcaggt 21942886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 22368532 - 22368730
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || | |   ||||||||    
T  22368532 gagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaaaaataggcttaacatagaggcccttatctctatgaactttataaaaccttgaccacccat 22368631  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22368632 ggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 22368730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11348590 - 11348389
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || | ||  |||||    
T  11348590 tgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctttgaaattcataaaacctcgaccacc 11348491  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11348490 catggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 11348391  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  11348390 ga 11348389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21100474 - 21100285
Alignment:
Q  29 ggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacct 128  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||| |||    
T  21100474 ggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgtcct 21100375  T
Q  129 atacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21100374 atacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 21100285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 19766036 - 19766236
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg---aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatcc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||| |     ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  19766036 tgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagaagaaaaaaaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcctcgtcc 19766135  T
Q  118 acccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19766136 acccatgtcctacacactcaaactaaatgtgcctattttgattttactttctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 19766235  T
Q  218 g 218  Q
    |    
T  19766236 g 19766236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 29333200 - 29333350
Alignment:
Q  68 aggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttc 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29333200 aggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatacttt 29333299  T
Q  168 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29333300 ctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 29333350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 21267909 - 21268042
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21267909 ggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacccttatttctatgaatttcattaagcatcatccaccca 21268008  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgtttt 156  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  21268009 tgacttatgcacttaaactcaacgtgcctctttt 21268042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22035154 - 22034962
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  22035154 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccacccatgactta 22035055  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    | ||||  | ||     | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22035054 tgcacttcagctttgcatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcgtactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22034962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22101256 - 22101057
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  22101256 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttactatgaatttcattaagattcacccaccca 22101157  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22101156 tgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttatacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22101057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 21826061 - 21826150
Alignment:
Q  128 tatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21826061 tatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 21826150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 21380676 - 21380875
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  21380676 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccaccca 21380775  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21380776 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccttctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 21380875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Original strand, 17132452 - 17132581
Alignment:
Q  93 ctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccga 192  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17132452 ctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccga 17132551  T
Q  193 ggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  17132552 ggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 17132581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Original strand, 21954792 - 21954861
Alignment:
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21954792 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 21954861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 8313190 - 8313250
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8313190 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8313250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8324343 - 8324283
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8324343 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8324283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16420162 - 16420032
Alignment:
Q  92 tctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccg 191  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16420162 tctatgaatttcattaagcttcatccatccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttatttctgcttcctaacccatcttggactaacaccg 16420063  T
Q  192 aggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||||| |  |||||| | |||||||||||    
T  16420062 aggtggaggcgaatttgttgtatgttggtga 16420032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 22097947 - 22098005
Alignment:
Q  164 cttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  22097947 cttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggagaatttgttgtatgttggtga 22098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 21825971 - 21826038
Alignment:
Q  38 caagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcat 105  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21825971 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 21826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 6455 - 6668
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6455 tgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttaattctatgaacttcattaagcatcgtccacc 6554  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6555 catgacctatacactcaaactcaatgtggctatattaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 6654  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || |||||||||||    
T  6655 gatggttcacaggt 6668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 8651594 - 8651804
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  8651594 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacctcgtccccc 8651693  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8651694 catggcctatacactcaaattcaatgtgcctattttaattatacttcctaacctatctcggactaacactgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 8651793  T
Q  221 gaaggttcaca 231  Q
    || ||||||||    
T  8651794 gatggttcaca 8651804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8949087 - 8948879
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaa-aagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccac 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |    
T  8949087 tgggagtggatgaagaccaagggataaaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagaccctcatctctatgaacttcattaaacctcgtcccc 8948988  T
Q  120 ccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttgg 219  Q
     |||| | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  8948987 acatggcatatacatttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggttgaagaaaatttgttgtatgttgg 8948888  T
Q  220 tgaaggttc 228  Q
    ||| |||||    
T  8948887 tgatggttc 8948879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 3988651 - 3988848
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  3988651 tgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaagcaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccgtccacc 3988750  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  3988751 catgtcctacacactcaaactcaatgtgtctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatatgttgtatgttg 3988848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20072569 - 20072391
Alignment:
Q  29 ggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacct 128  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||| |||    
T  20072569 ggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgtcct 20072470  T
Q  129 atacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 207  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072469 atacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 20072391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19877324 - 19877118
Alignment:
Q  16 gaaagtgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcat 115  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| | | ||||    
T  19877324 gaaattgggagtggatgagaaccaagggataaaccggattgagggcaacaatatgcttaacataccgaccctcatttctatgaacttcattcaacctcat 19877225  T
Q  116 ccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatg 215  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  19877224 ccacctatgaaatatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttctactttctaacctatctcggactaacaccgaggtggaagaaaacttgttgtatg 19877125  T
Q  216 ttggtga 222  Q
    |||||||    
T  19877124 ttggtga 19877118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 19783577 - 19783771
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||  |  |||     
T  19783577 ggagtgagtgaggaccaaggtataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaacttcataaaacctcgactcccct 19783676  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19783677 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactttctaacctatctctgactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 19783771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 20392141 - 20392230
Alignment:
Q  128 tatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20392141 tatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 20392230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21800240 - 21800149
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21800240 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 21800149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Original strand, 20236194 - 20236263
Alignment:
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20236194 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggagaaaaatttgttgtatgttggtga 20236263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16383805 - 16383739
Alignment:
Q  154 tttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16383805 tttgtttattcttcataacccacctcgaactgacaccggggtggaagaaaatttgctttattttggt 16383739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 44003 - 44216
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||    
T  44003 tgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacc 44102  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44103 catggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 44202  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || ||||| |||||    
T  44203 gatggttcgcaggt 44216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 51392 - 51605
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||    
T  51392 tgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacc 51491  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51492 catggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 51591  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || ||||| |||||    
T  51592 gatggttcgcaggt 51605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 18446772 - 18446990
Alignment:
Q  16 gaaagtgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcat 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      
T  18446772 gaaattgggagtgggtgaagaccaagggatcaacaagattgaggtaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcataaaacctcga 18446871  T
Q  116 ccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18446872 ccacccatggcctatacactcaaactcaatgtgcctgttttcattatacttcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatg 18446971  T
Q  216 ttggtgaaggttcacaggt 234  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  18446972 ttggtgatggttcgcaggt 18446990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21562120 - 21561926
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||| || | |   |  |||     
T  21562120 ggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacgcccttatttctatgaacttcataaaaccttgactcccct 21562021  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21562020 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatttcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 21561926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Original strand, 18010461 - 18010630
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | |||     
T  18010461 attgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcactccaacttaatataccta 18010560  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18010561 ttttctttctacttcctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 18010630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20017806 - 20017715
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20017806 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 20017715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22167121 - 22167030
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22167121 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 22167030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8725502 - 8725433
Alignment:
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8725502 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8725433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24856736 - 24856676
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24856736 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 24856676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22768696 - 22768605
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  | || ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22768696 ctatacactccaactgaatgtgcccatcttaattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 22768605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Original strand, 20168881 - 20168962
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttg 208  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  | |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20168881 ctatgcactccaactaaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccacctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttg 20168962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 21420 - 21622
Alignment:
Q  16 gaaagtgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcat 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  21420 gaaattgggagtgggtaaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccat 21519  T
Q  116 ccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatg 215  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  21520 ccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacactgaggtggaagaaaatttgttgtatg 21619  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  21620 ttg 21622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 20106840 - 20107046
Alignment:
Q  16 gaaagtgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcat 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | || |    
T  20106840 gaaattgggagtgggtgaagaccaggggataaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagagactctcatctctatgaacttcattaaacctcgt 20106939  T
Q  116 ccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatg 215  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20106940 ccccccatgacctatacacttaaactcaatgtgcccgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatg 20107039  T
Q  216 ttggtga 222  Q
    |||||||    
T  20107040 ttggtga 20107046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15921633 - 15921433
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||  |||||    
T  15921633 tgggagtgggtgaagaccaagggataacaa-gattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctttgaacttcataaaacctcgaccacc 15921535  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15921534 catggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 15921435  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  15921434 ga 15921433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16151172 - 16150978
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16151172 gagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccat 16151073  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16151072 gtcctacgcactcaaactccatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 16150978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 824199 - 824400
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||  |||||    
T  824199 tgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagaggcccttatctttatgaacttcataaaacctcgaccacc 824298  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  824299 catggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttttatattggt 824398  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  824399 ga 824400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 15064333 - 15064534
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||  |||||    
T  15064333 tgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctttgaacttcataaaacctcgaccacc 15064432  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15064433 catggcctatacacttaaacccaacgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 15064532  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  15064533 ga 15064534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48803490 - 48803279
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48803490 ggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaagcatcgtccaccca 48803391  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48803390 tgacttatgcacttaaactcaatgtgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 48803291  T
Q  223 aggttcacaggt 234  Q
     |||||||||||    
T  48803290 tggttcacaggt 48803279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 16530589 - 16530783
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||  |  |||     
T  16530589 ggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccct 16530688  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16530689 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16530783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16635073 - 16634879
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||  |  |||     
T  16635073 ggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccct 16634974  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16634973 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16634879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16761446 - 16761252
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| || | ||  |  |||     
T  16761446 ggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattaagggaaacaataggctaaacataaacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccct 16761347  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16761346 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16761252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Original strand, 13656546 - 13656715
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | |||     
T  13656546 attgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctc 13656645  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||    
T  13656646 ttttgtttctgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcgaatttgttgtatgttggtga 13656715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16467246 - 16467047
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16467246 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccaccca 16467147  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16467146 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcgtaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 16467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Original strand, 13672505 - 13672596
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  13672505 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 13672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 18286208 - 18286407
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18286208 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccaccca 18286307  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| | ||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18286308 tgacttatgcccttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 18286407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18594835 - 18594744
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18594835 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Original strand, 18616849 - 18616940
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18616849 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 18616940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 8716586 - 8716646
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8716586 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8716646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 14549818 - 14549878
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  14549818 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 14549878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 12023 - 12220
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12023 tgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacc 12122  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12123 catgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20792455 - 20792258
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20792455 tgggagtgggtgaggaccaagggagtacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacc 20792356  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20792355 catgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 20792258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20597509 - 20597315
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20597509 gagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccat 20597410  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20597409 gtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 20597315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20603806 - 20603612
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20603806 gagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccat 20603707  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20603706 gtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 20603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 26846209 - 26846406
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  26846209 tgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccgtccacc 26846308  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26846309 catgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatcttggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 26846406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20610125 - 20609931
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20610125 gagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccctatccacccat 20610026  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    | ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20610025 gtcctacgcactcaaactcaatatgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 20609931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 18071455 - 18071650
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18071455 ggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaccaataggcttaacataaagacccttctctttatgaacttcattaagccccatccaccca 18071554  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18071555 tgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 18071650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 22947000 - 22947213
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22947000 tgggagtgggtgaggaccaagggataaatcagattgagggcaacaataggcttaacatagagacccttatttctatgaacttcatcaagcctcatccgcc 22947099  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
      || | |||  |||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22947100 tgtggcatatgaactcaagctcaatgtgcctcttttatttatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggt 22947199  T
Q  221 gaaggttcacaggt 234  Q
    || ||| |||||||    
T  22947200 gatggtccacaggt 22947213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23520812 - 23520623
Alignment:
Q  29 ggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacct 128  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||| |||    
T  23520812 ggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgtcct 23520713  T
Q  129 atacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23520712 atacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 23520623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25117816 - 25117622
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||     |||     
T  25117816 ggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccct 25117717  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25117716 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 25117622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25176907 - 25176713
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||     |||     
T  25176907 ggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccct 25176808  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25176807 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 25176713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 21386881 - 21387077
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||| |||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  21386881 ggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaatagacttaacattgaaaccctcatttctatgaacttcattaagcatcgtccgccta 21386980  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  21386981 tggcatatgaactcaaactcaatgtgcctattttatttctacttcctaacc---cttggactaacaccgaggtggaagcaaattttttgtatgttggtga 21387077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20439827 - 20439639
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||     ||| |    ||    
T  20439827 gtgatgaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgttta 20439728  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    ||  ||||| || ||||||||   ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20439727 tatgctcaagcttaatgtgcccactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 20439639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 23746634 - 23746833
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  23746634 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttactatgaacttcattaagattcacccaccca 23746733  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  23746734 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 23746833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22319114 - 22318916
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  22319114 ggagtgggtgaggaagaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccacc-a 22319016  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  22319015 tgacctatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctatttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtga 22318916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24954743 - 24954652
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  24954743 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 24954652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 15734256 - 15734316
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15734256 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15734316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25008275 - 25008215
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25008275 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 25008215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 20620885 - 20620945
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  20620885 tacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 20620945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30764767 - 30764692
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcat 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  30764767 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatagctatgaatttcat 30764692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30764631 - 30764599
Alignment:
Q  168 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30764631 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 30764599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 3353161 - 3353358
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  3353161 tgggagtgggtgaagaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagccccgtccacc 3353260  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3353261 catgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 3353358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 15864074 - 15864256
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15864074 tgggagtgggtgaggactaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatttctatgaacttcattaagcatcatacacc 15864173  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaa 203  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15864174 catttcctacacactcaaactcaatgtgcctgttttaattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaa 15864256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15261722 - 15261535
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||   ||     ||| |    ||    
T  15261722 gtgaagaccaagggataaacaagatcgagggtaacaataggctgaacatagaaaccgttatctctatgaatttcataaaaactcgaatcccctttgttta 15261623  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15261622 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 15261535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 16680939 - 16681021
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcat 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16680939 ggagtgagtgaagaccaagggataaagaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcat 16681021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Original strand, 13821557 - 13821648
Alignment:
Q  127 ctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  13821557 ctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 13821648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 22109682 - 22109742
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22109682 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22109742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Original strand, 15253058 - 15253127
Alignment:
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15253058 ttttgtttctacttcctaatccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15253127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22665 - 22468
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | ||    
T  22665 tgggagagggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacctttatctttatgaacttcattaagccccgttcgcc 22566  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22565 catgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 22468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 132202 - 132400
Alignment:
Q  24 gagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccat 123  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| || | ||  ||||||||    
T  132202 gagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggtaacaataggcttaacatagaggcccttttctctttgaacttcataaaacctcgaccacccat 132301  T
Q  124 gacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  132302 ggcctatacacttaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 132400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 23900 - 24097
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||    
T  23900 tgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaattaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaggccccgtccacc 23999  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24000 catgtcttacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 24097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8138 - 7938
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  8138 tgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattaaggggaataataggcttaacatagagatccttgtctctatgaacttcattaaacctcgaccacc 8039  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  8038 catggcttatacactcaaa-tcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagctggaagaaaatttgttgtatgttggt 7940  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  7939 ga 7938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 121922 - 122119
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||    
T  121922 tgggagtgggtgaggaccaaggaattaccaaaattaagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacctcattaagcctcgtccacc 122021  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  122022 catgtcttacacactcaaactcaatgtgcctatattgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 122119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 709 - 906
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||    
T  709 tgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgaggaaattaataggcataacatagagacacttatctttatgaacttcattaggccccgtccacc 808  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  809 catgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33184 - 32975
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33184 ggagtgggtgaggacgaatggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatgaacttcattaagcatcgtccaccca 33085  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  33084 tgacttatgcactcaaactcaatatgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 32985  T
Q  223 aggttcacag 232  Q
     |||||||||    
T  32984 tggttcacag 32975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 222
Target Start/End: Original strand, 1870 - 2046
Alignment:
Q  44 ataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactca 143  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| || | ||  || |||||| | ||||||||||||||||    
T  1870 ataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttgtct--atgaacttcataaaacctcgaccccccatggcttatacactcaaactca 1967  T
Q  144 atgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1968 atgtgactgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19913 - 19725
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19913 tgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacat---------tatctctatgaacttcattaagcctcgtccacc 19823  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19822 catgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8642 - 8457
Alignment:
Q  33 aggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatac 132  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||| |||||||    
T  8642 aggaccaaggaattaaaaggatttagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatac 8543  T
Q  133 actcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||| |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8542 actcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3517
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||  |  |||     
T  3711 ggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaacttcataaaacctcgactcccct 3612  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3611 ttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5236 - 5035
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| || | ||  | |||    
T  5236 tgggagtgagtgaagaccaatggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaaactcttgtctctatgaacttcatcaaacctcgactacc 5137  T
Q  121 catgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    | |    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  5136 ctttgtttatacactcaaactcaacgtgcctattttaattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagagaatttgttgtatgttggt 5037  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  5036 ga 5035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 253460 - 253240
Alignment:
Q  16 gaaagtgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagac------cct--------tatctctatgaact 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      |||        | ||||||||||||    
T  253460 gaaattgggagtgggtgaggacctagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacaaggtgcctgtggaaactgtctctatgaact 253361  T
Q  102 tcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaaga 201  Q
    |||| || | ||  || ||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253360 tcataaaacctcgaccccccttggattatacactcaaactcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaaga 253261  T
Q  202 aaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  253260 aaatttgttgtatgttggtga 253240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19608 - 19423
Alignment:
Q  33 aggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatac 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||  |  ||| |    |||||    
T  19608 aggaccaagggataaacaagattgagggtaacaataggctaaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatac 19509  T
Q  133 actcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19508 actcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 19423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26044 - 25859
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||  |  ||| |    ||    
T  26044 gtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgttta 25945  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatg 215  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25944 tacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctgtatg 25859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 11112 - 11323
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  11112 ggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacactcatttctatgaatttcattaagcttcgtccaccca 11211  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  11212 tgacttatgcacttaaactaaatgtgccccttttgtttctactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcgaatttgttgtatgttggtga 11311  T
Q  223 aggttcacaggt 234  Q
     || ||||||||    
T  11312 tggatcacaggt 11323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 10000 - 10211
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||| |  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10000 ggagtgggtgaggacgaacggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccttcctttctatgaatttcattaagcttcatccaccca 10099  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| |||  | | ||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  10100 tgacatatgaaattaaactcaatatacctcttttgtttctacttcctgacccatctcggactaacactgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 10199  T
Q  223 aggttcacaggt 234  Q
     || ||||||||    
T  10200 tggatcacaggt 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 1733 - 1848
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1733 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaatcatcatacacc 1832  T
Q  121 catgacctatacactc 136  Q
    || | |||| ||||||    
T  1833 cacgtcctacacactc 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 336
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| | |||     
T  517 attgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatataccta 418  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 234  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  417 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39335 - 39166
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| || ||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || || |||     
T  39335 attgagggaaacaatagactaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctc 39236  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  39235 ttttgtttctacttcctaacccatcttggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 39166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 29060 - 29247
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||     ||| |    ||    
T  29060 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgttta 29159  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||| ||||| |||||||||||   ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29160 tacgctcaagctcaatgtgccaactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 29247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Original strand, 54893 - 55035
Alignment:
Q  92 tctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccg 191  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54893 tctatgaatttcataaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggattaacaccg 54992  T
Q  192 aggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 234  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  54993 aggtggaagcaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 55035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 115226 - 115441
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaata----ggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatcca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||    |||||| ||| || |||||  | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  115226 ggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaaccctcttttctatgaatttcattaagcttcatcca 115325  T
Q  119 cccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||| ||| |||| |||||   | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  115326 cccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggattaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttg 115425  T
Q  219 gtgaaggttcacaggt 234  Q
    |||| || ||||||||    
T  115426 gtgatggatcacaggt 115441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 119530 - 119745
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaata----ggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatcca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||    |||||| ||| || |||||  | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  119530 ggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaaccctcttttctatgaatttcattaagcttcatcca 119629  T
Q  119 cccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 218  Q
    |||||||| ||| |||| |||||   | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  119630 cccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggattaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttg 119729  T
Q  219 gtgaaggttcacaggt 234  Q
    |||| || ||||||||    
T  119730 gtgatggatcacaggt 119745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 423
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    |||| ||| ||||||| ||| | ||| || ||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  620 ggagtgggtgaagacaaagggataaatccaattgaggggaacaatatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcataaaacttcatccaccca 521  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 220  Q
    |||| ||| ||||  |||| ||  ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  520 tgacttatgcacttcaacttaacatgcttcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacacggaggtggaagcaaatttgttgtatgttggt 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 24121 - 24308
Alignment:
Q  30 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||| | || | ||     ||| |    ||    
T  24121 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcctaaaacctcgaatcccctttgttta 24220  T
Q  130 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 217  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24221 tacactcaagcttaatgtgcctattttgatattattacctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 24308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 21620 - 21702
Alignment:
Q  154 tttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggttc 236  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||    
T  21620 tttgattatctttcctaacccatctcggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatgttccacaggttc 21702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 12621 - 12820
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 122  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||   |||| ||| |||||||||||||  || || || ||| |  ||||||| |||||||||  ||| || ||||    
T  12621 ggagtgggtgaggaagaaggaataaaaccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacacttgttgctatgaatttcattaagattcacccgccca 12720  T
Q  123 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  12721 tgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaattagttgtatgttggtga 12820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4785 - 4619
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatc-atagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccc 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||||||||   || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4785 ggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaataggcttaaatattgaaacccttgtttctatgaatttcattaagcttcatccaccc 4686  T
Q  122 atgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaaca 188  Q
    ||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  4685 atgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggactaaca 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Original strand, 4819 - 4888
Alignment:
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4819 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1404
Alignment:
Q  162 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1344 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Original strand, 41642 - 41775
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 152  Q
    |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||  |||| |||| ||| | |||     
T  41642 attgagggaaacaacatgctcaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgaactccaacttaatataccta 41741  T
Q  153 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaa 186  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41742 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaa 41775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 116 - 49
Alignment:
Q  23 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttat 90  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  116 ggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttat 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 50371 - 50288
Alignment:
Q  52 gattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacact 135  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  50371 gattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcact 50288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32429 - 32347
Alignment:
Q  53 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacact 135  Q
    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32429 attgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcact 32347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20279 - 20234
Alignment:
Q  21 tgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  20279 tgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaatcgagggaaacaa 20234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University