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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3388-Insertion-4 (Length: 440)
Name: NF3388-Insertion-4
Description: NF3388
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3388-Insertion-4 |
 |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12931024 - 12930597
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
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| T |
12931024 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaa---tgaacaccaatatttaacgt |
12930928 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
12930927 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
12930828 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12930827 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
12930728 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattg |
407 |
Q |
| |
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|
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| T |
12930727 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttcaata |
12930628 |
T |
 |
| Q |
408 |
atgaagcttgtattttctttgagcttcggat |
438 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
12930627 |
ctgaagcttgtattttctttgagcttcggat |
12930597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12935770 - 12935343
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935770 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaa---tgaacaccaatatttaacgt |
12935674 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12935673 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
12935574 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12935573 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
12935474 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattg |
407 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12935473 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttcaata |
12935374 |
T |
 |
| Q |
408 |
atgaagcttgtattttctttgagcttcggat |
438 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935373 |
ctgaagcttgtattttctttgagcttcggat |
12935343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Original strand, 26504945 - 26505063
Alignment:
| Q |
90 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatatt |
189 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |
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|
| T |
26504945 |
aacatcaatatttaacgtg-aataccgtctaataacaaggcaaaac-cacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatatt |
26505042 |
T |
 |
| Q |
190 |
ctctccactctcttacacaca |
210 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| |||||| |
|
|
| T |
26505043 |
ctttcaactctctttcacaca |
26505063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15589060 - 15588948
Alignment:
| Q |
88 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaata |
187 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| | |
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|
| T |
15589060 |
tgaacatcaatatttattttgaaaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaaca |
15588961 |
T |
 |
| Q |
188 |
ttctctccactct |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
15588960 |
ttttctccactct |
15588948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34907487 - 34907060
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907487 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaa---tgaacaccaatatttaacgt |
34907391 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34907390 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
34907291 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34907290 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
34907191 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattg |
407 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34907190 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttcaata |
34907091 |
T |
 |
| Q |
408 |
atgaagcttgtattttctttgagcttcggat |
438 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907090 |
ctgaagcttgtattttctttgagcttcggat |
34907060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14179040 - 14178641
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14179040 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaa--tgaacaccaatatttaacgt |
14178943 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14178942 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
14178843 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14178842 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
14178743 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattg |
407 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178742 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttcattg |
14178643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14174286 - 14173887
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174286 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagtgataaaaaaaa--tgaacaccaatatttaacgt |
14174189 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14174188 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
14174089 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14174088 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
14173989 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattg |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173988 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaaactttgtattttcacttctgcttcattg |
14173889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Original strand, 28611584 - 28611977
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611584 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaa--tgaacaccaatatttaacgt |
28611681 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28611682 |
gaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
28611781 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28611782 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
28611881 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611882 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttc |
28611977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Original strand, 28606822 - 28607215
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606822 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatt--aacaccaatatttaacgt |
28606919 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28606920 |
gaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
28607019 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28607020 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
28607119 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607120 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttc |
28607215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44161933 - 44161543
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161933 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaa--tgaacaccaatatttaacgt |
44161836 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161835 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctctccactctcttacac |
44161738 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
44161737 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggt |
44161638 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgt-attttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161637 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctct--acacacagaagctttgtgtttttcacttctgcttc |
44161543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11104813 - 11104397
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
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| T |
11104813 |
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11104719 |
T |
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| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
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| T |
11104718 |
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11104620 |
T |
 |
| Q |
208 |
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307 |
Q |
| |
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| T |
11104619 |
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11104521 |
T |
 |
| Q |
308 |
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407 |
Q |
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| T |
11104520 |
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11104424 |
T |
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| Q |
408 |
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433 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
11104423 |
ttgaagctttgtattttctttgagctt |
11104397 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 48826729 - 48827000
Alignment:
| Q |
19 |
tgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
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| T |
48826729 |
tgtaaattaaaatttcaaaattcaa--gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaa----gaacaccaatatttaacgtggaaaatcctc |
48826822 |
T |
 |
| Q |
119 |
taataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagagat |
218 |
Q |
| |
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| T |
48826823 |
taataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctcttcgctctcttacacacacaagagat |
48826921 |
T |
 |
| Q |
219 |
acaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata |
297 |
Q |
| |
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|
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| T |
48826922 |
acaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata |
48827000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 270
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726446
Alignment:
| Q |
109 |
gaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacaca |
208 |
Q |
| |
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|
| T |
24726288 |
gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctcttaccga |
24726387 |
T |
 |
| Q |
209 |
cacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatttta |
270 |
Q |
| |
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||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |
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|
| T |
24726388 |
cac--gagatacactatattgttttccgtgagacc-actcctattcaaatgttattatttta |
24726446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 48708086 - 48708256
Alignment:
| Q |
19 |
tgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctc |
118 |
Q |
| |
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| T |
48708086 |
tgtaaattaaaattccaaaatataaaagaaattgaatcttacaacgcagtggtggcgataaaa-----ttaaataccaatatttaacatgaaaaactcta |
48708180 |
T |
 |
| Q |
119 |
taataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctc |
194 |
Q |
| |
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| T |
48708181 |
taatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctctc |
48708256 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 404
Target Start/End: Original strand, 37040442 - 37040836
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
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| T |
37040442 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaa--tgaacaccaatatttaacgt |
37040539 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
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| T |
37040540 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttctccactctctcacac |
37040639 |
T |
 |
| Q |
208 |
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307 |
Q |
| |
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| T |
37040640 |
acacaagagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
37040739 |
T |
 |
| Q |
308 |
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404 |
Q |
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| T |
37040740 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttca |
37040836 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15290567 - 15290195
Alignment:
| Q |
19 |
tgtaaattaaaattccaaaatccaaaa-gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgtggaaaaccct |
117 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15290567 |
tgtaaattaaaatttcaaaatccaaaaagagattggatcttgcagcgcagccttagcgataaaaaaaa--tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccct |
15290470 |
T |
 |
| Q |
118 |
ctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagaga |
217 |
Q |
| |
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| T |
15290469 |
ctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagaga |
15290370 |
T |
 |
| Q |
218 |
tacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgatgtatttttcc |
317 |
Q |
| |
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| T |
15290369 |
tacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctattattt--cagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattttt-c |
15290274 |
T |
 |
| Q |
318 |
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401 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290273 |
cacactttctggatttagtcaacactctat------tctcacacacttct--acacacagaagcttttttgtattttcacttctgct |
15290195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12099336 - 12098925
Alignment:
| Q |
17 |
agtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgtggaaaaccc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||| |
|
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| T |
12099336 |
agtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagatatgatcttgcagctcaccgatagcgataaaaa-----tgaaaagcaatattttacgtgaaaaaccc |
12099242 |
T |
 |
| Q |
117 |
tctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagag |
216 |
Q |
| |
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| T |
12099241 |
tctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctccactctcttacacgcacaagag |
12099142 |
T |
 |
| Q |
217 |
atacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgatgtatttttc |
316 |
Q |
| |
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| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||| |
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|
| T |
12099141 |
acacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagatgatactcactcaatctatttt-- |
12099044 |
T |
 |
| Q |
317 |
ccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattgatgaagc-t |
415 |
Q |
| |
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| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||| | ||| | |
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|
| T |
12099043 |
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12098948 |
T |
 |
| Q |
416 |
tgtattttctttgagcttcggat |
438 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12098947 |
tgtattttctttgagcttcggat |
12098925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 145 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12081936
Alignment:
| Q |
145 |
aaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacct |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaaagagatacaatatagtgtttctaatgagactc |
12082129 |
T |
 |
| Q |
245 |
acttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactc |
344 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12082128 |
gctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacactc |
12082030 |
T |
 |
| Q |
345 |
tatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattgatgaagc-ttgtattttctttgagcttcggataa |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
12082029 |
taattttctgatcacacacttctacaca---aaaaactttgtatcttcacttatgcttcaatactaaagctttgtattttctttgagctttggataa |
12081936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 2757370 - 2757448
Alignment:
| Q |
154 |
aaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagagatacaatatagtgttt |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757370 |
aaaatattccactatatttaaaaatattgcactattctctccactctctttcacactcaagagatacaatatagtgttt |
2757448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15302960 - 15302900
Alignment:
| Q |
343 |
tctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15302960 |
tctatttttgctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcaattctgcttc |
15302900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12084723 - 12084666
Alignment:
| Q |
20 |
gtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgat |
77 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12084723 |
gtaaattaaaatttcaaaatccaatagacattggatcttgtagcgcaacggtagcgat |
12084666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 403
Target Start/End: Original strand, 29106903 - 29107282
Alignment:
| Q |
17 |
agtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgtggaaaaccc |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29106903 |
agtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaa-----tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccc |
29106997 |
T |
 |
| Q |
117 |
tctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagag |
216 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29106998 |
tctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagag |
29107097 |
T |
 |
| Q |
217 |
atacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata-cccacccgatgtattttt |
315 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29107098 |
atacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatgataccccacccaatgtattttt |
29107196 |
T |
 |
| Q |
316 |
cccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29107197 |
cccacactctctggatttactcaaca--ctattttttctctcacacacttctacatacagagaagctttgtatttccacttctgcttc |
29107282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Original strand, 42911009 - 42911399
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
42911009 |
cttaacgcaagtggaaattaaaattttaaaatccaaaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaa-----tgaacaccaatatttaacat |
42911103 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42911104 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctccactctctcacac |
42911202 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
42911203 |
acacaaaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatgatacccacccagt |
42911302 |
T |
 |
| Q |
308 |
gtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgt-attttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42911303 |
gtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacagaagctttgtgtttttcacttctgcttc |
42911399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Original strand, 38997230 - 38997320
Alignment:
| Q |
89 |
gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaata |
179 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |
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|
| T |
38997230 |
gaacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Original strand, 38994723 - 38994779
Alignment:
| Q |
16 |
tagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggta |
72 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38994723 |
tagtgtaaattaaaattccaaaacccaaacaaaattggatcttgcagtgcagcggta |
38994779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8539532 - 8539139
Alignment:
| Q |
8 |
cttaacgttagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatnnnnnnnnnttgaacaccaatatttaacgt |
107 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8539532 |
cttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaattctaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtaacaataaaaaa----tgaacatcaatatttaacgt |
8539437 |
T |
 |
| Q |
108 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaatattacaatattctctccactctcttacac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8539436 |
ggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctccactctcttacac |
8539337 |
T |
 |
| Q |
208 |
acacaagagatacaatat---agtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccaccc |
304 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
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| T |
8539336 |
acacaagagatacaatattatagtgtttcc-gtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagagatgatacccatcc |
8539238 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttc |
403 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8539237 |
gatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttc |
8539139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 214 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302118
Alignment:
| Q |
214 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgatgtattt |
313 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
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| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
 |
| Q |
314 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgctt |
402 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
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| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttatgctt |
51302118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 51302994 - 51302937
Alignment:
| Q |
17 |
agtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
74 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302994 |
agtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaacagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
51302937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51302344 - 51302304
Alignment:
| Q |
88 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
51302344 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
51302304 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 179
Target Start/End: Original strand, 2100290 - 2100379
Alignment:
| Q |
87 |
ttgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaatgaata |
179 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
2100290 |
ttgaacatcaatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaa---cggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Original strand, 2100726 - 2100771
Alignment:
| Q |
175 |
gaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagagatac |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2100726 |
gaatattacaatattctctccactctcttacatacacaagagatac |
2100771 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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